View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16320_low_2 (Length: 370)

Name: NF16320_low_2
Description: NF16320
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16320_low_2
NF16320_low_2
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (6-362)||(12497799-12498155)
chr3 (13-362)||(14876729-14877078)
chr3 (6-362)||(16370964-16371320)
chr3 (6-362)||(17489401-17489757)
chr3 (6-362)||(9522270-9522626)
chr3 (6-362)||(16492404-16492760)
chr3 (6-362)||(16807149-16807505)
chr3 (13-362)||(16691711-16692060)
chr3 (6-350)||(10905773-10906117)
chr3 (14-362)||(15348476-15348824)
chr3 (6-350)||(10005163-10005507)
chr3 (12-350)||(48425010-48425348)
chr3 (6-350)||(13252253-13252597)
chr3 (6-350)||(15589615-15589959)
chr3 (6-350)||(16635336-16635680)
chr3 (6-350)||(43162660-43163004)
chr3 (6-362)||(15402733-15403089)
chr3 (6-362)||(15725157-15725512)
chr3 (6-362)||(16412505-16412861)
chr3 (6-350)||(20062277-20062621)
chr3 (6-362)||(53385241-53385597)
chr3 (6-355)||(26792622-26792971)
chr3 (6-362)||(5425153-5425508)
chr3 (6-362)||(15208442-15208798)
chr3 (6-362)||(15338820-15339176)
chr3 (6-362)||(6600298-6600654)
chr3 (6-362)||(16756808-16757164)
chr3 (6-335)||(15247725-15248054)
chr3 (54-344)||(15227228-15227518)
chr3 (61-335)||(13972387-13972661)
chr3 (19-326)||(15953193-15953500)
chr3 (19-344)||(18134571-18134896)
chr3 (26-361)||(47123506-47123841)
chr3 (19-344)||(13322877-13323202)
chr3 (26-361)||(10383531-10383866)
chr3 (19-362)||(14571409-14571752)
chr3 (6-223)||(15015967-15016184)
chr3 (34-362)||(10420285-10420613)
chr3 (19-326)||(8759307-8759614)
chr3 (19-326)||(13941621-13941928)
chr3 (19-326)||(41177119-41177426)
chr3 (20-362)||(11303999-11304341)
chr3 (61-347)||(16329926-16330212)
chr3 (27-344)||(12360775-12361092)
chr3 (61-335)||(14086261-14086535)
chr3 (61-296)||(12850546-12850781)
chr3 (19-362)||(44776808-44777151)
chr3 (72-347)||(11961312-11961587)
chr3 (54-326)||(16381190-16381459)
chr3 (61-249)||(16836777-16836965)
chr3 (40-203)||(8274656-8274819)
chr3 (220-362)||(31689049-31689191)
chr3 (26-203)||(16742946-16743123)
chr3 (218-362)||(31945033-31945177)
chr3 (26-203)||(15576470-15576647)
chr3 (40-125)||(17192892-17192977)
chr3 (26-187)||(18748401-18748562)
chr3 (40-203)||(13975302-13975465)
chr3 (40-102)||(6712666-6712728)
chr3 (85-187)||(21686681-21686783)
chr3 (85-203)||(6153141-6153259)
chr3 (309-365)||(320781-320836)
chr3 (301-362)||(12854365-12854426)
chr3 (16-53)||(14183145-14183182)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (6-362)||(24675052-24675408)
chr2 (6-362)||(22756987-22757343)
chr2 (6-362)||(24708006-24708362)
chr2 (6-362)||(21325790-21326146)
chr2 (6-362)||(23188571-23188927)
chr2 (51-362)||(23138600-23138911)
chr2 (51-362)||(23550390-23550701)
chr2 (6-350)||(16924835-16925179)
chr2 (6-350)||(16998575-16998919)
chr2 (6-362)||(24878519-24878875)
chr2 (6-350)||(16981727-16982071)
chr2 (6-350)||(17063292-17063636)
chr2 (6-338)||(23063664-23063996)
chr2 (6-362)||(24709596-24709952)
chr2 (6-362)||(44386093-44386449)
chr2 (14-356)||(21145562-21145904)
chr2 (6-350)||(9609711-9610055)
chr2 (6-362)||(24261933-24262289)
chr2 (6-362)||(27370832-27371188)
chr2 (11-362)||(22325385-22325736)
chr2 (6-350)||(27217591-27217935)
chr2 (6-350)||(10868425-10868769)
chr2 (6-350)||(17066953-17067294)
chr2 (112-362)||(27377101-27377351)
chr2 (11-260)||(24825811-24826060)
chr2 (54-362)||(23087013-23087321)
chr2 (20-347)||(30211455-30211782)
chr2 (26-361)||(31830222-31830557)
chr2 (61-335)||(27365658-27365932)
chr2 (19-344)||(23293539-23293864)
chr2 (26-347)||(11358418-11358739)
chr2 (19-362)||(23276339-23276682)
chr2 (16-342)||(45529100-45529420)
chr2 (61-361)||(20832549-20832849)
chr2 (26-361)||(1063315-1063650)
chr2 (19-326)||(27787340-27787647)
chr2 (185-362)||(41609047-41609224)
chr2 (85-324)||(24653946-24654185)
chr2 (19-326)||(12573952-12574259)
chr2 (41-102)||(27368391-27368452)
chr2 (40-203)||(22276001-22276164)
chr2 (139-326)||(24944966-24945153)
chr2 (26-185)||(25128387-25128546)
chr2 (269-347)||(24833360-24833438)
chr2 (26-187)||(24570212-24570373)
chr2 (40-203)||(12640477-12640640)
chr2 (26-125)||(23817597-23817696)
chr2 (318-362)||(45676685-45676729)
chr2 (40-187)||(22762127-22762274)
chr2 (40-203)||(24831745-24831908)
chr2 (319-362)||(23599834-23599877)
chr2 (40-104)||(14708908-14708972)
chr2 (301-341)||(17967577-17967617)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (6-362)||(23573606-23573962)
chr5 (11-362)||(23440089-23440440)
chr5 (6-362)||(23516405-23516761)
chr5 (13-362)||(18775641-18775990)
chr5 (6-362)||(21984471-21984827)
chr5 (14-327)||(20798659-20798972)
chr5 (6-362)||(22134532-22134888)
chr5 (6-362)||(14999905-15000261)
chr5 (6-362)||(22333053-22333409)
chr5 (14-362)||(25423053-25423401)
chr5 (6-348)||(26738871-26739213)
chr5 (6-362)||(19769824-19770180)
chr5 (6-362)||(27610218-27610574)
chr5 (6-350)||(40708656-40709000)
chr5 (6-362)||(27668656-27669012)
chr5 (6-362)||(27685566-27685922)
chr5 (6-350)||(34566370-34566714)
chr5 (6-350)||(16356378-16356722)
chr5 (6-362)||(27518271-27518627)
chr5 (6-362)||(37291662-37292018)
chr5 (6-362)||(41770706-41771062)
chr5 (16-362)||(23471093-23471439)
chr5 (6-337)||(22348314-22348643)
chr5 (6-362)||(29476239-29476595)
chr5 (19-362)||(20468275-20468618)
chr5 (13-283)||(21498209-21498479)
chr5 (148-350)||(21343666-21343868)
chr5 (121-362)||(20573385-20573626)
chr5 (19-335)||(23442472-23442788)
chr5 (19-344)||(21890938-21891263)
chr5 (28-344)||(22461816-22462132)
chr5 (19-365)||(22236099-22236445)
chr5 (54-362)||(28923982-28924290)
chr5 (54-325)||(21564180-21564451)
chr5 (26-362)||(20773606-20773942)
chr5 (61-361)||(25847922-25848222)
chr5 (54-362)||(28895156-28895464)
chr5 (26-361)||(14887177-14887512)
chr5 (19-344)||(24735790-24736115)
chr5 (19-344)||(24749733-24750058)
chr5 (26-361)||(37545682-37546018)
chr5 (26-361)||(20342129-20342464)
chr5 (66-344)||(24737011-24737289)
chr5 (26-347)||(23080275-23080596)
chr5 (26-344)||(20821317-20821635)
chr5 (61-347)||(22381060-22381346)
chr5 (61-347)||(24798618-24798904)
chr5 (6-150)||(21339452-21339596)
chr5 (61-347)||(22502540-22502826)
chr5 (19-326)||(17269512-17269819)
chr5 (11-347)||(21404715-21405035)
chr5 (100-362)||(21662300-21662561)
chr5 (100-326)||(21665761-21665986)
chr5 (26-203)||(11210880-11211057)
chr5 (40-203)||(27011089-27011252)
chr5 (26-187)||(23503464-23503625)
chr5 (40-203)||(21937388-21937551)
chr5 (40-203)||(24581216-24581379)
chr5 (274-362)||(21625382-21625470)
chr5 (34-183)||(25244546-25244695)
chr5 (34-183)||(25308698-25308847)
chr5 (61-95)||(21831964-21831998)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (6-362)||(65369-65724)
scaffold0042 (154-362)||(39924-40132)
scaffold0042 (6-106)||(39806-39906)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (12-360)||(278823-279171)
scaffold0005 (19-362)||(164709-165052)
scaffold0005 (6-362)||(308622-308978)
scaffold0005 (19-362)||(260271-260614)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (6-362)||(16355169-16355525)
chr4 (6-362)||(16252169-16252525)
chr4 (6-362)||(12523608-12523964)
chr4 (6-362)||(7090365-7090720)
chr4 (6-362)||(14680499-14680855)
chr4 (16-329)||(15149740-15150053)
chr4 (13-362)||(18227177-18227526)
chr4 (19-362)||(14652240-14652583)
chr4 (6-350)||(23955691-23956035)
chr4 (6-350)||(18297149-18297493)
chr4 (6-362)||(19778517-19778873)
chr4 (13-362)||(14159424-14159773)
chr4 (13-362)||(40472972-40473321)
chr4 (6-350)||(8386356-8386700)
chr4 (6-362)||(14303702-14304057)
chr4 (6-362)||(27711268-27711624)
chr4 (6-350)||(12476544-12476888)
chr4 (6-362)||(14851090-14851446)
chr4 (6-350)||(29039128-29039472)
chr4 (6-362)||(14266623-14266979)
chr4 (6-362)||(8053347-8053703)
chr4 (97-350)||(15364330-15364583)
chr4 (19-344)||(15003361-15003686)
chr4 (174-362)||(14927151-14927339)
chr4 (26-361)||(3264798-3265133)
chr4 (6-157)||(16676427-16676578)
chr4 (26-361)||(11207235-11207570)
chr4 (19-344)||(16145862-16146187)
chr4 (19-347)||(15070360-15070688)
chr4 (19-362)||(15245856-15246199)
chr4 (26-361)||(29453541-29453876)
chr4 (61-344)||(1649316-1649599)
chr4 (28-347)||(33222865-33223184)
chr4 (26-347)||(44661870-44662191)
chr4 (19-326)||(51606178-51606485)
chr4 (61-347)||(20890930-20891215)
chr4 (13-150)||(1640156-1640293)
chr4 (55-194)||(15415059-15415198)
chr4 (19-245)||(15359087-15359313)
chr4 (40-203)||(13247736-13247899)
chr4 (275-362)||(18607823-18607910)
chr4 (26-221)||(27900459-27900654)
chr4 (115-326)||(42702871-42703082)
chr4 (61-222)||(16752665-16752826)
chr4 (26-187)||(12132413-12132574)
chr4 (40-201)||(55375376-55375537)
chr4 (17-225)||(9849473-9849681)
chr4 (40-203)||(9290926-9291089)
chr4 (40-203)||(14997407-14997570)
chr4 (165-307)||(18164332-18164474)
chr4 (40-203)||(16445230-16445393)
chr4 (40-203)||(15293175-15293338)
chr4 (269-344)||(15415226-15415301)
chr4 (16-134)||(8706078-8706196)
chr4 (19-104)||(15077825-15077910)
chr4 (11-194)||(18550049-18550234)
chr4 (26-187)||(16685361-16685522)
chr4 (330-362)||(15351934-15351966)
chr4 (40-187)||(12342881-12343028)
chr4 (235-362)||(15319515-15319642)
chr4 (291-344)||(15359326-15359379)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (13-362)||(30313578-30313927)
chr8 (6-362)||(21166964-21167320)
chr8 (6-362)||(19977965-19978321)
chr8 (13-362)||(16408479-16408828)
chr8 (6-362)||(15533378-15533734)
chr8 (13-362)||(22164625-22164974)
chr8 (6-362)||(32600142-32600498)
chr8 (13-362)||(22133475-22133824)
chr8 (6-362)||(22046372-22046727)
chr8 (6-362)||(21250940-21251295)
chr8 (6-362)||(21922162-21922518)
chr8 (6-362)||(21394292-21394648)
chr8 (6-362)||(21788785-21789141)
chr8 (6-362)||(23650039-23650395)
chr8 (6-362)||(17674450-17674806)
chr8 (6-350)||(19112700-19113044)
chr8 (53-362)||(22032030-22032339)
chr8 (6-362)||(20018177-20018533)
chr8 (6-362)||(22120601-22120957)
chr8 (6-362)||(19485297-19485653)
chr8 (6-362)||(22987199-22987555)
chr8 (19-347)||(20396565-20396893)
chr8 (121-362)||(15441179-15441420)
chr8 (87-362)||(23948887-23949162)
chr8 (6-215)||(22377880-22378089)
chr8 (6-215)||(22384055-22384264)
chr8 (19-362)||(21681910-21682253)
chr8 (54-326)||(20388133-20388405)
chr8 (61-344)||(1266255-1266538)
chr8 (19-344)||(21324849-21325175)
chr8 (26-361)||(6679110-6679445)
chr8 (61-344)||(20010382-20010665)
chr8 (61-361)||(804155-804455)
chr8 (26-362)||(22061880-22062216)
chr8 (61-344)||(19851427-19851710)
chr8 (61-344)||(19857463-19857746)
chr8 (19-362)||(23654925-23655268)
chr8 (25-344)||(31416920-31417239)
chr8 (19-344)||(20007866-20008191)
chr8 (19-326)||(31571282-31571589)
chr8 (61-361)||(14565141-14565441)
chr8 (26-361)||(6603657-6603992)
chr8 (19-362)||(21840415-21840758)
chr8 (61-347)||(29303908-29304194)
chr8 (88-362)||(16265127-16265401)
chr8 (61-347)||(12304771-12305057)
chr8 (26-203)||(20652780-20652957)
chr8 (85-361)||(28982356-28982632)
chr8 (85-361)||(28987576-28987852)
chr8 (23-122)||(23949158-23949257)
chr8 (150-361)||(27347225-27347436)
chr8 (37-203)||(21196960-21197126)
chr8 (61-205)||(22051018-22051162)
chr8 (6-84)||(18856853-18856931)
chr8 (40-203)||(22982593-22982756)
chr8 (40-203)||(16877556-16877719)
chr8 (6-57)||(22040162-22040213)
chr8 (13-194)||(19863223-19863404)
chr8 (13-194)||(19867860-19868041)
chr8 (40-203)||(21850798-21850961)
chr8 (40-187)||(22315364-22315511)
chr8 (40-152)||(22283204-22283316)
chr8 (40-102)||(23157472-23157534)
chr8 (34-184)||(25282307-25282457)
chr8 (330-362)||(22179309-22179341)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (6-362)||(14323-14679)
scaffold0044 (6-362)||(583-939)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (6-362)||(19864483-19864839)
chr6 (13-360)||(12497824-12498171)
chr6 (13-360)||(12510730-12511077)
chr6 (6-362)||(25765419-25765774)
chr6 (6-362)||(16963496-16963852)
chr6 (13-360)||(12505153-12505500)
chr6 (6-356)||(1543213-1543563)
chr6 (6-362)||(16927769-16928125)
chr6 (13-362)||(27331569-27331918)
chr6 (13-362)||(27392309-27392658)
chr6 (6-362)||(5839348-5839704)
chr6 (6-362)||(25609990-25610346)
chr6 (12-362)||(22078823-22079173)
chr6 (6-362)||(16626846-16627202)
chr6 (6-362)||(25112348-25112704)
chr6 (6-362)||(18408072-18408428)
chr6 (6-362)||(23078265-23078621)
chr6 (6-362)||(24313297-24313653)
chr6 (6-362)||(28263326-28263682)
chr6 (6-362)||(28342075-28342431)
chr6 (6-350)||(29592049-29592393)
chr6 (68-362)||(21833172-21833466)
chr6 (6-362)||(2874932-2875288)
chr6 (6-362)||(27187232-27187588)
chr6 (6-362)||(27261652-27262008)
chr6 (6-362)||(28292501-28292857)
chr6 (6-362)||(22762584-22762940)
chr6 (142-362)||(17032358-17032578)
chr6 (6-336)||(18197676-18198006)
chr6 (61-347)||(21471412-21471698)
chr6 (67-362)||(25750605-25750900)
chr6 (26-344)||(15459150-15459468)
chr6 (61-326)||(25768023-25768288)
chr6 (227-362)||(22433793-22433928)
chr6 (61-335)||(14131363-14131637)
chr6 (26-347)||(10468998-10469319)
chr6 (19-362)||(22796774-22797117)
chr6 (26-347)||(24364223-24364544)
chr6 (61-308)||(34645770-34646017)
chr6 (61-344)||(18794504-18794787)
chr6 (61-344)||(19879112-19879395)
chr6 (19-326)||(27560759-27561066)
chr6 (61-335)||(21564316-21564590)
chr6 (52-152)||(11291818-11291918)
chr6 (26-344)||(8766297-8766615)
chr6 (6-100)||(22433927-22434021)
chr6 (61-333)||(11287782-11288054)
chr6 (19-279)||(17415365-17415625)
chr6 (61-333)||(11280689-11280961)
chr6 (19-242)||(18800858-18801081)
chr6 (19-251)||(14381609-14381841)
chr6 (54-215)||(1640715-1640876)
chr6 (40-187)||(18571622-18571769)
chr6 (19-326)||(28282955-28283262)
chr6 (26-203)||(25743236-25743413)
chr6 (80-204)||(25750900-25751024)
chr6 (40-203)||(16098005-16098168)
chr6 (40-203)||(16382536-16382699)
chr6 (26-203)||(15078513-15078690)
chr6 (37-185)||(25655456-25655604)
chr6 (40-203)||(23996203-23996366)
chr6 (26-203)||(18838057-18838234)
chr6 (40-187)||(1648947-1649094)
chr6 (269-344)||(1640613-1640688)
chr6 (40-187)||(21413101-21413248)
chr6 (26-200)||(16233167-16233341)
chr6 (278-344)||(18787702-18787768)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (6-362)||(639-995)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (6-362)||(64018-64374)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (6-362)||(17045071-17045427)
chr1 (6-362)||(19106314-19106670)
chr1 (6-362)||(20249797-20250153)
chr1 (6-362)||(20136725-20137081)
chr1 (6-362)||(21747482-21747837)
chr1 (13-362)||(50620307-50620656)
chr1 (6-362)||(16350655-16351011)
chr1 (6-362)||(33391085-33391441)
chr1 (6-362)||(16078708-16079045)
chr1 (6-362)||(51333549-51333905)
chr1 (6-362)||(21830250-21830606)
chr1 (6-362)||(21836897-21837253)
chr1 (19-362)||(19760935-19761278)
chr1 (6-339)||(16369267-16369600)
chr1 (6-362)||(41354525-41354881)
chr1 (136-362)||(50612602-50612828)
chr1 (19-344)||(19664945-19665270)
chr1 (34-326)||(20940147-20940439)
chr1 (19-344)||(19854279-19854604)
chr1 (61-361)||(37677027-37677328)
chr1 (208-362)||(21163227-21163381)
chr1 (28-344)||(20856839-20857155)
chr1 (61-347)||(31550292-31550578)
chr1 (61-347)||(20294374-20294660)
chr1 (26-362)||(22433192-22433528)
chr1 (61-347)||(20075170-20075456)
chr1 (19-296)||(20835957-20836237)
chr1 (61-225)||(11382678-11382842)
chr1 (19-243)||(41307891-41308115)
chr1 (72-326)||(20244183-20244437)
chr1 (151-361)||(20395194-20395404)
chr1 (26-203)||(20914316-20914493)
chr1 (40-203)||(20831482-20831645)
chr1 (40-203)||(46518827-46518990)
chr1 (269-362)||(24476927-24477020)
chr1 (34-187)||(21202371-21202524)
chr1 (37-102)||(22135645-22135710)
chr1 (142-203)||(22142233-22142294)
chr1 (35-127)||(20184364-20184456)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (16-362)||(17319-17665)
chr7 (13-362)||(15154652-15155001)
chr7 (6-362)||(11553095-11553451)
chr7 (6-362)||(12687422-12687778)
chr7 (6-362)||(14954541-14954897)
chr7 (6-350)||(8198561-8198905)
chr7 (6-362)||(8707526-8707882)
chr7 (6-362)||(10870916-10871272)
chr7 (6-362)||(14332318-14332674)
chr7 (6-362)||(15161050-15161406)
chr7 (6-362)||(11237206-11237562)
chr7 (6-362)||(18551751-18552107)
chr7 (6-362)||(18177663-18178019)
chr7 (11-362)||(14037728-14038079)
chr7 (11-362)||(14347758-14348109)
chr7 (6-350)||(44791344-44791688)
chr7 (12-362)||(23516768-23517118)
chr7 (6-362)||(13685984-13686341)
chr7 (17-362)||(15203800-15204145)
chr7 (19-296)||(15624539-15624816)
chr7 (19-344)||(12206784-12207109)
chr7 (20-362)||(15102586-15102928)
chr7 (19-344)||(19147151-19147476)
chr7 (19-344)||(20746550-20746875)
chr7 (61-344)||(8212154-8212437)
chr7 (61-362)||(14264270-14264571)
chr7 (61-361)||(11306289-11306589)
chr7 (26-361)||(49152224-49152559)
chr7 (61-344)||(16072320-16072603)
chr7 (19-344)||(11388412-11388736)
chr7 (19-344)||(13665493-13665813)
chr7 (19-326)||(16950455-16950762)
chr7 (11-347)||(21661900-21662233)
chr7 (19-326)||(18053937-18054244)
chr7 (6-104)||(9596236-9596334)
chr7 (11-179)||(35964848-35965016)
chr7 (19-326)||(14286360-14286667)
chr7 (55-326)||(23199763-23200034)
chr7 (55-326)||(23505890-23506161)
chr7 (19-365)||(6413430-6413776)
chr7 (16-145)||(11772244-11772373)
chr7 (26-347)||(13021294-13021615)
chr7 (61-362)||(14129795-14130096)
chr7 (61-362)||(14433613-14433914)
chr7 (26-347)||(12455640-12455960)
chr7 (19-326)||(1391-1698)
chr7 (40-187)||(14936443-14936590)
chr7 (61-326)||(26288063-26288327)
chr7 (26-242)||(26118596-26118812)
chr7 (40-203)||(12368603-12368766)
chr7 (26-203)||(4440008-4440185)
chr7 (301-362)||(12254326-12254387)
chr7 (11-194)||(41144-41327)
chr7 (40-203)||(7823980-7824143)
chr7 (40-187)||(15364036-15364183)
chr7 (40-203)||(27107801-27107964)
chr7 (42-203)||(21674562-21674723)
chr7 (26-187)||(45146652-45146812)
chr7 (211-326)||(15340454-15340569)
chr7 (28-185)||(12193654-12193811)
chr7 (26-102)||(17923862-17923938)
chr7 (269-347)||(26118818-26118896)
chr7 (235-344)||(15479338-15479447)
chr7 (43-183)||(17145288-17145428)
chr7 (18-104)||(5764672-5764758)
chr7 (61-123)||(12456940-12457002)
chr7 (26-102)||(13378879-13378955)
chr7 (61-125)||(15340590-15340654)
chr7 (23-124)||(20466941-20467041)
chr7 (159-187)||(13353247-13353275)
chr7 (330-362)||(13634038-13634070)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (6-362)||(5977-6333)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (6-362)||(33560-33916)
scaffold0109 (6-362)||(8559-8915)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (6-362)||(4392-4748)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (6-362)||(180180-180536)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (6-362)||(810-1165)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (6-362)||(127186-127542)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (6-362)||(219404-219760)
scaffold0012 (6-362)||(229006-229362)
scaffold0012 (40-203)||(33016-33179)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (14-362)||(5986-6334)
scaffold0120 (19-326)||(1524-1831)
scaffold0120 (26-203)||(22816-22993)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (11-362)||(32744-33095)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (6-356)||(109798-110148)
scaffold0029 (26-362)||(96009-96345)
scaffold0029 (61-344)||(112540-112823)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (6-356)||(43123-43473)
scaffold0028 (13-362)||(8448-8797)
scaffold0028 (25-157)||(13834-13966)
scaffold0028 (61-335)||(50556-50830)
scaffold0028 (40-203)||(106594-106757)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (6-362)||(6335-6691)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (6-362)||(681-1036)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (6-362)||(5184-5540)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (12-362)||(1102-1452)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (13-362)||(7340-7689)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (6-362)||(9306-9662)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (6-362)||(14840-15196)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (28-362)||(16950-17284)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (13-362)||(15456-15804)
scaffold0333 (13-148)||(15832-15967)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (6-362)||(377-733)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (61-362)||(27930-28231)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (63-362)||(26-325)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (14-362)||(14002-14350)
scaffold0106 (35-362)||(31373-31700)
scaffold0106 (6-107)||(17660-17761)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (42-362)||(162076-162396)
scaffold0001 (11-362)||(448022-448373)
scaffold0001 (19-326)||(90932-91239)
scaffold0001 (26-203)||(78636-78813)
scaffold0001 (161-236)||(175352-175427)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (28-362)||(3995-4329)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (16-350)||(26530-26864)
scaffold0011 (19-362)||(195703-196045)
scaffold0011 (61-344)||(148551-148834)
scaffold0011 (161-362)||(68582-68783)
scaffold0011 (40-203)||(121971-122134)
scaffold0011 (40-102)||(180147-180209)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (19-362)||(15079-15422)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (6-362)||(6900-7258)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (16-362)||(16462-16808)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (28-350)||(3115-3437)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (19-362)||(111984-112327)
scaffold0004 (61-362)||(203510-203811)
scaffold0004 (19-326)||(322703-323010)
scaffold0004 (19-361)||(117532-117874)
scaffold0004 (26-347)||(385797-386118)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (16-326)||(1-311)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (28-362)||(968-1301)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (11-349)||(252-590)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (6-260)||(7855-8109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (19-347)||(116905-117233)
scaffold0037 (40-203)||(98137-98300)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (13-312)||(49506-49805)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (6-260)||(21932-22186)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (11-362)||(16408-16759)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (11-362)||(12969-13320)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (19-347)||(886-1214)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (19-347)||(25719-26047)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (142-362)||(16920-17140)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (14-200)||(7522-7708)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (6-224)||(767-985)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (11-248)||(9047-9284)
scaffold0507 (269-362)||(6940-7033)
scaffold0507 (37-203)||(351-517)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (16-347)||(5588-5918)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (16-347)||(25068-25399)
scaffold0234 (61-220)||(16213-16372)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (54-344)||(10774-11064)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (19-335)||(26132-26448)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (11-347)||(86496-86832)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (19-362)||(13901-14244)
scaffold0034 (26-290)||(4960-5224)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (19-326)||(47123-47430)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (26-344)||(10090-10408)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (19-344)||(79-404)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (19-344)||(27500-27825)
scaffold0139 (19-362)||(1149-1491)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (19-326)||(3874-4181)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (55-326)||(28805-29076)
scaffold0064 (55-326)||(40796-41067)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (61-335)||(19973-20247)
scaffold0298 (20-362)||(13362-13704)
scaffold0298 (20-362)||(17132-17474)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (19-335)||(21671-21987)
scaffold0235 (40-127)||(26004-26091)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (19-362)||(18537-18880)
scaffold0326 (301-362)||(3637-3698)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (19-326)||(2750-3057)
scaffold0035 (13-188)||(13189-13364)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (61-335)||(7078-7352)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (19-315)||(4760-5056)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (61-281)||(58448-58668)
scaffold0058 (26-325)||(19120-19419)
scaffold0058 (289-347)||(59042-59100)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (19-362)||(9761-10099)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (19-362)||(14049-14391)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (19-362)||(42333-42676)
scaffold0010 (19-362)||(47399-47742)
scaffold0010 (145-223)||(2252-2330)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (20-362)||(10851-11193)
scaffold0124 (20-335)||(400-715)
scaffold0124 (40-203)||(7831-7994)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (19-344)||(27207-27531)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (25-344)||(3872-4191)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (26-344)||(6164-6483)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (25-344)||(14257-14576)
scaffold0203 (181-344)||(9039-9202)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (19-362)||(39702-40045)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (19-326)||(51863-52170)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (19-326)||(37201-37508)
scaffold0026 (25-245)||(38180-38400)
scaffold0026 (65-245)||(27383-27563)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (54-344)||(172-462)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (61-344)||(25907-26190)
scaffold0113 (61-347)||(16654-16940)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (61-335)||(1211-1485)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (61-326)||(5956-6220)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (19-326)||(5002-5309)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (26-344)||(49214-49532)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (161-311)||(4567-4717)
scaffold0023 (247-362)||(36974-37089)
scaffold0023 (6-125)||(4441-4560)
scaffold0023 (274-326)||(18993-19045)
scaffold0023 (55-107)||(58972-59024)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (61-362)||(57859-58159)
scaffold0053 (19-362)||(49033-49376)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (26-362)||(61220-61556)
scaffold0067 (26-362)||(52186-52522)
scaffold0067 (26-326)||(67608-67908)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (61-344)||(509-792)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (61-344)||(18830-19113)
scaffold0090 (61-242)||(23094-23275)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (61-361)||(38929-39229)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (19-326)||(12781-13088)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (37-344)||(20103-20410)
scaffold0114 (26-359)||(43471-43804)
scaffold0114 (26-359)||(44483-44816)
scaffold0114 (161-344)||(36036-36219)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (117-335)||(1167-1385)
scaffold0165 (301-362)||(26203-26264)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (61-347)||(16755-17041)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (26-347)||(26239-26560)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (61-335)||(33719-33993)
scaffold0076 (40-203)||(40380-40543)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-326)||(248612-248912)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (6-110)||(3706-3810)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (19-326)||(7238-7543)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (115-362)||(4235-4482)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (26-324)||(42784-43082)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (26-203)||(8217-8394)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (166-362)||(136082-136278)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (176-326)||(2023-2173)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (25-203)||(1916-2094)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (26-187)||(1061-1222)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (26-187)||(14661-14822)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (40-201)||(23518-23679)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (61-225)||(5313-5477)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (6-74)||(12738-12806)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (146-326)||(13380-13560)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (40-220)||(28287-28467)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (269-360)||(6238-6329)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (40-203)||(46276-46439)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (26-187)||(9125-9286)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (26-170)||(1241-1385)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (40-203)||(3281-3444)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (40-203)||(14758-14921)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (26-203)||(393-570)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (26-203)||(13030-13207)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (301-362)||(7498-7559)
scaffold0101 (34-110)||(5467-5543)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (40-203)||(3896-4059)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (19-194)||(1-176)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (49-203)||(940-1094)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (26-187)||(8898-9059)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (26-203)||(14779-14956)
scaffold0132 (26-126)||(43737-43837)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (19-107)||(3355-3443)
scaffold0222 (238-362)||(3487-3611)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (40-203)||(24002-24165)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (26-179)||(13397-13550)
scaffold0021 (26-102)||(71442-71518)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (55-187)||(10493-10625)
scaffold0447 (55-187)||(5879-6011)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (227-335)||(45835-45943)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (40-187)||(3965-4112)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (26-127)||(1431-1532)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (55-187)||(8488-8620)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (40-127)||(26178-26265)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (26-251)||(10843-11068)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (40-200)||(10781-10941)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (269-344)||(887-962)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (275-362)||(9182-9269)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (37-92)||(14370-14425)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (40-102)||(18332-18394)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12498155 - 12497799
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498155 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 12498056  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498055 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 12497956  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12497955 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgt 12497856  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497855 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 12497799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 14876729 - 14877078
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876729 gagattgttcagcagactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 14876828  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876829 accttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 14876928  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14876929 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 14877028  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14877029 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 14877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16371320 - 16370964
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371320 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16371221  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371220 aggaaagatcttgaatttcaagaagaagactacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16371121  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16371120 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggacggtggcgtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgtcgttttccatgt 16371021  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371020 gtcgcaacttcggaagtatgttctagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16370964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17489757 - 17489401
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489757 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17489658  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489657 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 17489558  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  17489557 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 17489458  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17489457 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 17489401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9522626 - 9522270
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9522626 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 9522527  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522526 agaaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 9522427  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  9522426 gatttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgt 9522327  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9522326 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 9522270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16492404 - 16492760
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492404 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16492503  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16492504 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccga 16492603  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  16492604 gatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgt 16492703  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16492704 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16492760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16807149 - 16807505
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||     
T  16807149 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgc 16807248  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16807249 agaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctga 16807348  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16807349 gatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgttttccatgt 16807448  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807449 gtcgcaacttcggaattatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16807505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16692060 - 16691711
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |    
T  16692060 gagattgttcagcagactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaagg 16691961  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691960 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 16691861  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    |||  |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  16691860 tgggtcgtatcaaatatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcacaa 16691761  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16691760 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16691711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10906117 - 10905773
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906117 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10906018  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10906017 agaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10905918  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  10905917 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 10905818  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10905817 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 10905773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Original strand, 15348476 - 15348824
Alignment:
Q  14 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348476 agattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 15348575  T
Q  114 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  15348576 tcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcatt 15348675  T
Q  214 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaac 313  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  15348676 ggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaac 15348775  T
Q  314 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15348776 ttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15348824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10005507 - 10005163
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005507 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10005408  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10005407 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10005308  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  10005307 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 10005208  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10005207 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 10005163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48425348 - 48425010
Alignment:
Q  12 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425348 agagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 48425249  T
Q  112 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 211  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  48425248 gatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 48425149  T
Q  212 ttggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 311  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  48425148 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 48425049  T
Q  312 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48425048 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 48425010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13252597 - 13252253
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252597 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 13252498  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252497 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 13252398  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  13252397 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 13252298  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13252297 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 13252253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 15589615 - 15589959
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589615 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15589714  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15589715 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15589814  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  15589815 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 15589914  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15589915 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 15589959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16635680 - 16635336
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635680 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16635581  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16635580 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16635481  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16635480 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16635381  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16635380 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16635336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43163004 - 43162660
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163004 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 43162905  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43162904 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 43162805  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  43162804 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 43162705  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43162704 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 43162660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 15402733 - 15403089
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15402733 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 15402832  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15402833 agaaaagattttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15402932  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15402933 tgttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 15403032  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15403033 gtcgcaacttcgaaagtatgttccagatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15403089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 15725157 - 15725512
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725157 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaa-ttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15725255  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15725256 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 15725355  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  15725356 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15725455  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15725456 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 15725512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16412505 - 16412861
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16412505 aggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgt 16412604  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16412605 aggaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16412704  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |  | || ||||||||    
T  16412705 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttggacaacgttttccatgt 16412804  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16412805 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 16412861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 20062277 - 20062621
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062277 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 20062376  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20062377 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 20062476  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  20062477 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 20062576  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20062577 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 20062621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 53385241 - 53385597
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385241 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 53385340  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  53385341 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccga 53385440  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  53385441 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 53385540  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  53385541 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagcgacgatgt 53385597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 355
Target Start/End: Original strand, 26792622 - 26792971
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792622 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 26792721  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26792722 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 26792821  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  26792822 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 26792921  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtg 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26792922 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtg 26792971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 5425153 - 5425508
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425153 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 5425252  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5425253 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgcttt-gagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 5425351  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  5425352 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 5425451  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  5425452 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 5425508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15208798 - 15208442
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15208798 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15208699  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  15208698 aggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccga 15208599  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || |||  |||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  15208598 ggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggagtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgt 15208499  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15208498 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 15208442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15339176 - 15338820
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15339176 aggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 15339077  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15339076 agaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15338977  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| || |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15338976 agttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 15338877  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15338876 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15338820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6600654 - 6600298
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600654 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 6600555  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6600554 agaaaagatcttgaattcaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 6600455  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| | |  |||| |||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  6600454 agttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 6600355  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  6600354 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 6600298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16756808 - 16757164
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16756808 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 16756907  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16756908 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 16757007  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||  | |  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16757008 agttcattggtccatatcatattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 16757107  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16757108 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtcattcagagtgacgatgt 16757164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15248054 - 15247725
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15248054 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15247955  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||| |   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15247954 aggaaaaacaatgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccga 15247855  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | | ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15247854 ggtgtattggtccgtattagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 15247755  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15247754 gtcgcaacttcggaaatatgttctggatcc 15247725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15227518 - 15227228
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15227518 agagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 15227419  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |    
T  15227418 actcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcat 15227319  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15227318 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15227228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 13972387 - 13972661
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  13972387 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 13972486  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  13972487 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 13972586  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  13972587 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatcc 13972661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 15953193 - 15953500
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  15953193 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 15953292  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||| | |||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |    
T  15953293 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttc 15953392  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15953393 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15953492  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  15953493 aagtatgt 15953500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 18134571 - 18134896
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  18134571 gttcatcagactacagataaagtcaaaatgatcggagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 18134670  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || |  |||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  18134671 agtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 18134770  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18134771 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 18134870  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  18134871 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 18134896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47123841 - 47123506
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  47123841 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttca 47123742  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  47123741 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 47123642  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||| |||||    
T  47123641 atttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaggtatg 47123542  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  47123541 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 47123506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 13322877 - 13323202
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13322877 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttg 13322976  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
     |||||| || |||||||| || ||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  13322977 ggtttcaggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 13323076  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||  || ||  ||||||| ||||| ||  |  |||| ||  |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  13323077 gtatcagatattggagaggattggaacagtggcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtattccatgtgtcgcagcttcgg 13323176  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  13323177 aagtatgtagcggatccgtcgcatgt 13323202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10383866 - 10383531
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10383866 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 10383767  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10383766 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcag 10383667  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  10383666 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 10383567  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  10383566 ttgcggatccttctcatgtgatcccgagggatgatg 10383531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14571752 - 14571409
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| || |  ||||    
T  14571752 gttcatcagaccacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttg 14571653  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  14571652 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtcc 14571553  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  14571552 ttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 14571453  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||| ||  ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14571452 aagtacgtagcggatccttcgcatgttatcccgagagatgatgt 14571409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 15015967 - 15016184
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15015967 aggaccagaaattgttcaacaaactacagagaaggttaagttgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgt 15016066  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||||  | |||||||    
T  15016067 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggatgagcactaaagtcgaagaaactaactccga 15016166  T
Q  206 gatttattggtccgtatc 223  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  15016167 ggtttattgctccgtatc 15016184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 362
Target Start/End: Original strand, 10420285 - 10420613
Alignment:
Q  34 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 133  Q
    |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  10420285 gagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtg 10420384  T
Q  134 accacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcaga 233  Q
    | || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||| | |||||    
T  10420385 atcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcaga 10420484  T
Q  234 aagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 333  Q
    |||||| ||||| ||||||||  || |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| || |||    
T  10420485 aagagtcggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgat 10420584  T
Q  334 ccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    || || ||||| || | ||| ||||||||    
T  10420585 ccttcacatgttattccgagagatgatgt 10420613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 8759307 - 8759614
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  8759307 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 8759406  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  8759407 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 8759506  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||    
T  8759507 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaactgcgg 8759606  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  8759607 aagtatgt 8759614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13941928 - 13941621
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  13941928 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 13941829  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  13941828 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 13941729  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  13941728 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 13941629  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  13941628 aagtatgt 13941621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41177426 - 41177119
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  41177426 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 41177327  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  41177326 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 41177227  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  41177226 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 41177127  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  41177126 aagtatgt 41177119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 11303999 - 11304341
Alignment:
Q  20 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 119  Q
    |||| ||| |||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | ||||||    
T  11303999 ttcatcaggctacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttga 11304098  T
Q  120 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 219  Q
    ||||||||| || || || |||||| |||||||    | | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  11304099 gtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccg 11304198  T
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| ||||||| || |||||||  ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||| ||    
T  11304199 tatcagatatcagagagggttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcaga 11304298  T
Q  320 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  11304299 agtatgtagcggatccttcgcatgttattcctagtgatgatgt 11304341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Original strand, 16329926 - 16330212
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  16329926 atgaaagcttcacagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 16330025  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  16330026 tgacaggtgttggacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagt 16330125  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16330126 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgat 16330212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 344
Target Start/End: Original strand, 12360775 - 12361092
Alignment:
Q  27 gactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaa 126  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||     
T  12360775 gactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcag 12360874  T
Q  127 gaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagt 226  Q
    || || || || |||||| ||||||| |||  | ||||  |||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || |||||||||||||||     
T  12360875 gagggtgatcatgtatttctgagagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaga 12360974  T
Q  227 tatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    | ||||| |  |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12360975 tttcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 12361074  T
Q  327 tccggatccatctcatgt 344  Q
      ||||||| || |||||    
T  12361075 agcggatccttcgcatgt 12361092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14086535 - 14086261
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  14086535 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 14086436  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||  | ||    
T  14086435 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 14086336  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  14086335 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 14086261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 296
Target Start/End: Original strand, 12850546 - 12850781
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  |||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||||| ||    
T  12850546 atgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagtcactcctg 12850645  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12850646 tgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagt 12850745  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 296  Q
     || ||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12850746 gggtttgccaccacatctttggaatttgcatgatgt 12850781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44777151 - 44776808
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || || |  ||||    
T  44777151 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttg 44777052  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||| ||||| || || || |||||| | ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||||| ||    
T  44777051 agttccaagagggtgatcatgtatttctaagagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggccc 44776952  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||  | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||  | |||    
T  44776951 gtatcagatttcagagaggatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcgg 44776852  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  44776851 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 44776808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 347
Target Start/End: Original strand, 11961312 - 11961587
Alignment:
Q  72 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 171  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | ||||  ||||     
T  11961312 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgagtgta 11961411  T
Q  172 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcac 271  Q
     ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||  ||  | |    
T  11961412 cgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggcttatagagttgatttgcccc 11961511  T
Q  272 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  11961512 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 11961587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 326
Target Start/End: Original strand, 16381190 - 16381459
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || || |||||||| |||||     
T  16381190 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca---gagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaagagtt 16381286  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||  |||| |||||||| |    
T  16381287 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcat 16381386  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    |  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  16381387 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagcttcggaaatatgt 16381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 249
Target Start/End: Original strand, 16836777 - 16836965
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||       
T  16836777 atgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 16836876  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtg 249  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||    
T  16836877 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtg 16836965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 8274656 - 8274819
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  8274656 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 8274755  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  8274756 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 8274819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 362
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689191
Alignment:
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 31689148  T
Q  320 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31689149 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 31689191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 16742946 - 16743123
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||    
T  16742946 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtca 16743045  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || || |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16743046 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945033
Alignment:
Q  218 cgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcg 317  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 31945078  T
Q  318 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31945077 gaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 31945033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15576647 - 15576470
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  15576647 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 15576548  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
     |  || || || || |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15576547 ggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15576470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17192977 - 17192892
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  17192977 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 17192892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18748562 - 18748401
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || ||  |  ||||||||||    
T  18748562 agactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagaacattgagtttca 18748463  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    ||  || || || || ||||| ||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18748462 agttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgctttgaagt 18748401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 13975302 - 13975465
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  13975302 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcatctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 13975401  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  13975402 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcc 13975465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 102
Target Start/End: Original strand, 6712666 - 6712728
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  6712666 gttaagatgattcaaaagaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataag 6712728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21686783 - 21686681
Alignment:
Q  85 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 184  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||  || || || |||||||| ||||| | |||||| || | |||||||||||||||||    
T  21686783 aagagttatcattataagaggagaaaagatattcagtttcaagttggtgatcatgtattttttagagtgaatcatgtaaccgatgttggacgtgctttga 21686684  T
Q  185 agt 187  Q
    |||    
T  21686683 agt 21686681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 6153141 - 6153259
Alignment:
Q  85 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 184  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||  || || || || ||| ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  6153141 aagagttatcatgataagaggagaaaggatattaagtttcaagttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgctttga 6153240  T
Q  185 agtcaaagaagttgactcc 203  Q
    |||  |  |||||||||||    
T  6153241 agtgcagaaagttgactcc 6153259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 320836 - 320781
Alignment:
Q  309 gcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  320836 gcaacttcggaagtatgctccggatccatctc-cgtgatccaaagagatgatgtcca 320781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Original strand, 12854365 - 12854426
Alignment:
Q  301 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  12854365 catgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 12854426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Original strand, 14183145 - 14183182
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattca 53  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14183145 attgttcagcagactattgagaaggttaagatgattca 14183182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24675408 - 24675052
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675408 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24675309  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675308 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 24675209  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24675208 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgt 24675109  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675108 gtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 24675052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 22756987 - 22757343
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22756987 aggaccagagattgttcaacagattactgagaaagttaaggtgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 22757086  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22757087 aggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccga 22757186  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22757187 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 22757286  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757287 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22757343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 24708006 - 24708362
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  24708006 aggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaaatatcatgataagcgc 24708105  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24708106 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccta 24708205  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24708206 gattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgacgttttccatgt 24708305  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24708306 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccacagtgatgatgt 24708362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 21325790 - 21326146
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21325790 aggaccagagattgttcaacaaaccactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21325889  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325890 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 21325989  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21325990 gatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgt 21326089  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326090 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21326146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23188927 - 23188571
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23188927 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaaatagattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 23188828  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23188827 aggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaa 23188728  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23188727 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 23188628  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23188627 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23188571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23138911 - 23138600
Alignment:
Q  51 tcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgaga 150  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23138911 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23138812  T
Q  151 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtgg 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23138811 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23138712  T
Q  251 cgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    | || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138711 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23138612  T
Q  351 gagtgatgatgt 362  Q
     |||||||||||    
T  23138611 aagtgatgatgt 23138600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23550701 - 23550390
Alignment:
Q  51 tcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgaga 150  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23550701 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23550602  T
Q  151 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtgg 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23550601 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23550502  T
Q  251 cgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    | || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550501 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23550402  T
Q  351 gagtgatgatgt 362  Q
     |||||||||||    
T  23550401 aagtgatgatgt 23550390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16925179 - 16924835
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925179 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16925080  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16925079 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16924980  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16924979 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16924880  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16924879 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16924835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16998919 - 16998575
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998919 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16998820  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16998819 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16998720  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16998719 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16998620  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16998619 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16998575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 24878519 - 24878875
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878519 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24878618  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24878619 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 24878718  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||| |    
T  24878719 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatct 24878818  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24878819 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcaagtaatccagagtgacgatgt 24878875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16982071 - 16981727
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982071 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16981972  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16981971 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16981872  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16981871 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16981772  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16981771 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16981727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17063636 - 17063292
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063636 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17063537  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17063536 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17063437  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  17063436 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 17063337  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17063336 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 17063292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23063996 - 23063664
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23063996 aggaccagagattgttgaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgt 23063897  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063896 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23063797  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23063796 gatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 23063697  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatc 338  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  23063696 gtcgcaacttcagaagtatgtaccagatccatc 23063664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24709952 - 24709596
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709952 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24709853  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24709852 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24709753  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| |  | || ||||||||    
T  24709752 agttcattggtccgtattagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgtacaacgttttccatgt 24709653  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24709652 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24709596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 44386093 - 44386449
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386093 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 44386192  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44386193 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 44386292  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
     ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  44386293 aattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 44386392  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  44386393 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 44386449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 356
Target Start/End: Original strand, 21145562 - 21145904
Alignment:
Q  14 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 113  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145562 agattgtccagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 21145661  T
Q  114 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  21145662 tcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttatt 21145761  T
Q  214 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaac 313  Q
    | || ||||||| |||  ||||||||||||||| |||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  21145762 gatctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaac 21145861  T
Q  314 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21145862 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 21145904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9610055 - 9609711
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610055 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 9609956  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9609955 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 9609856  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  9609855 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 9609756  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9609755 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 9609711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24262289 - 24261933
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262289 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24262190  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24262189 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24262090  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  24262089 agttcattggtctgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 24261990  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24261989 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24261933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27371188 - 27370832
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27371188 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgt 27371089  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27371088 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27370989  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27370988 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27370889  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27370888 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27370832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Original strand, 22325385 - 22325736
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325385 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 22325484  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||     
T  22325485 agatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttc 22325584  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || |||||||||||||    
T  22325585 attggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgc 22325684  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22325685 aacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22325736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27217935 - 27217591
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217935 aggaccagagatttttcagcaaactactgagaaagttcagatgatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27217836  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27217835 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 27217736  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  27217735 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 27217636  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27217635 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 27217591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10868769 - 10868425
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10868769 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgt 10868670  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10868669 aggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10868570  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  10868569 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 10868470  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10868469 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 10868425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17067294 - 17066953
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067294 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17067195  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17067194 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17067095  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |  ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||  | || || |||||    
T  17067094 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa-ttgca-cacgtttttcatgt 17066997  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17066996 gtcgc-acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 17066953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 112 - 362
Target Start/End: Original strand, 27377101 - 27377351
Alignment:
Q  112 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377101 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 27377200  T
Q  212 ttggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 311  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27377201 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 27377300  T
Q  312 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27377301 acttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 27377351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 24825811 - 24826060
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24825811 cagaaattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaa 24825910  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24825911 agaccttgagttttaggaaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggttt 24826010  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  24826011 attggttcgtatcagatatcagaaagaattgggacggtggcgtatcgagt 24826060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23087321 - 23087013
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23087321 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 23087222  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  23087221 actcttgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgt 23087122  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 353  Q
    |  ||||  | ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||  ||    
T  23087121 atagagtgtgtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatcccaag 23087022  T
Q  354 tgatgatgt 362  Q
     ||||||||    
T  23087021 agatgatgt 23087013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Original strand, 30211455 - 30211782
Alignment:
Q  20 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 119  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  30211455 ttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttga 30211554  T
Q  120 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 219  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||| |||    
T  30211555 gtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccg 30211654  T
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| | || |||| ||||||   ||| |||||   ||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  30211655 tatcagatttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgga 30211754  T
Q  320 agtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30211755 agtatgttttggatcaatctcatgtgat 30211782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31830557 - 31830222
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31830557 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttca 31830458  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31830457 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 31830358  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  31830357 atttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 31830258  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  31830257 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 31830222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 27365658 - 27365932
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||| |     
T  27365658 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactccta 27365757  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  27365758 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 27365857  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||    
T  27365858 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccgaatcc 27365932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23293864 - 23293539
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  23293864 gttcatcagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 23293765  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  23293764 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 23293665  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23293664 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23293565  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  23293564 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 23293539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Original strand, 11358418 - 11358739
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11358418 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 11358517  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11358518 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 11358617  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| | |||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11358618 atttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11358717  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  11358718 ttgcggatccttctcatgtgat 11358739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23276682 - 23276339
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  23276682 gttcatcagactacggagaaagtcatgatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 23276583  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| ||||| | |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||| |  || ||||||||    
T  23276582 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtcc 23276483  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23276482 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcga 23276383  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  23276382 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 23276339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45529420 - 45529100
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  45529420 attgttcaacagactactaagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatc 45529321  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    |||||||| ||||      ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| |||||||     
T  45529320 ttgagtttgaaga------ccatgtgtttatgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattga 45529227  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
     || |||||| | || ||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||| ||| |||||||| ||| || | |||||| || |||||||| ||||||    
T  45529226 cccatatcagatttcggaaagagttgggacggttgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaactt 45529127  T
Q  316 cggaagtatgttccggatccatctcat 342  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  45529126 cggaagcatgtttcagatccctctcat 45529100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20832849 - 20832549
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  20832849 atgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 20832750  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  20832749 tgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 20832650  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  20832649 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 20832550  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  20832549 g 20832549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1063650 - 1063315
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1063650 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 1063551  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  1063550 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 1063451  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  1063450 atttcagagagaattggtactgtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 1063351  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  1063350 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 1063315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27787647 - 27787340
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  27787647 gttcaggagactacagaaaaagtcaaggtgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 27787548  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  27787547 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 27787448  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  27787447 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 27787348  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  27787347 aagtatgt 27787340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 185 - 362
Target Start/End: Original strand, 41609047 - 41609224
Alignment:
Q  185 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 284  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||    
T  41609047 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaa 41609146  T
Q  285 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  41609147 tttgcacaatgttttccacgtgtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41609224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24654185 - 24653946
Alignment:
Q  85 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| ||||    
T  24654185 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattga 24654086  T
Q  185 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 284  Q
    |||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||  |  |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  24654085 agtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 24653986  T
Q  285 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 324  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24653985 cttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 24653946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12574259 - 12573952
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  ||||    
T  12574259 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttg 12574160  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | || || || |   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  12574159 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 12574060  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||  |||| |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||  | |||    
T  12574059 gtatcagatttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcgg 12573960  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  12573959 aagtatgt 12573952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 102
Target Start/End: Original strand, 27368391 - 27368452
Alignment:
Q  41 ttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368391 ttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 27368452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22276164 - 22276001
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  22276164 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 22276065  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  22276064 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcc 22276001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24945153 - 24944966
Alignment:
Q  139 gtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagag 238  Q
    |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||| | || |    
T  24945153 gtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagaggg 24945054  T
Q  239 ttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24945053 ttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 24944966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25128546 - 25128387
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| |  | || || ||  ||||||||||    
T  25128546 agactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgatgaaaggaggaaggacattgagtttca 25128447  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 185  Q
    ||  || || || || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25128446 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccatgtgactggtgttggacgcgctttgaa 25128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 24833360 - 24833438
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24833360 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgat 24833438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 24570212 - 24570373
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  24570212 agactacggaaaaggttaagatgaatcaagagaagatgaaaacgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 24570311  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     |  || || || ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24570312 ggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 24570373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 12640477 - 12640640
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  ||||| || |    
T  12640477 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 12640576  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | || ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  12640577 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12640640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Original strand, 23817597 - 23817696
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  23817597 agactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttca 23817696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 362
Target Start/End: Original strand, 45676685 - 45676729
Alignment:
Q  318 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676685 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 45676729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Original strand, 22762127 - 22762274
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||| |  || || || |    
T  22762127 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtaggaagaagagttatcatgacaagaggatgaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22762226  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | ||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  22762227 tgtttttgagagtgaatcatgtaactggtgttagtcgtggtttgaagt 22762274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 24831745 - 24831908
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  24831745 gttaagatgattcaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 24831844  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || | ||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24831845 tgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24831908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23599877 - 23599834
Alignment:
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23599877 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23599834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14708972 - 14708908
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 104  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14708972 gttaagatgatccagaagaagatgaaagcatcgtggagtagacagaagagttatcatgataagcg 14708908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 341
Target Start/End: Original strand, 17967577 - 17967617
Alignment:
Q  301 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctca 341  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17967577 catgtgtcccaacttcgaaagtatgttcccgatccatctca 17967617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23573962 - 23573606
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23573962 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 23573863  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573862 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23573763  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23573762 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 23573663  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23573662 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23573606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23440440 - 23440089
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23440440 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaa 23440341  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23440340 agatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagattt 23440241  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  23440240 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattccatgtgtcgc 23440141  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440140 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 23440089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23516761 - 23516405
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516761 aggaccagagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatcattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23516662  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516661 agaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23516562  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23516561 gatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgt 23516462  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516461 gtcgcaacttcggaagtatttcccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 23516405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18775990 - 18775641
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18775990 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagg 18775891  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775890 atcttgagtttcaggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 18775791  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18775790 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 18775691  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775690 cttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 18775641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 21984471 - 21984827
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21984471 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgt 21984570  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984571 aggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 21984670  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  21984671 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 21984770  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21984771 gtcgcaacttcagaggtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20798972 - 20798659
Alignment:
Q  14 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20798972 agattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaaga 20798873  T
Q  114 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798872 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 20798773  T
Q  214 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaac 313  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20798772 ggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcatatcgattgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaac 20798673  T
Q  314 ttcggaagtatgtt 327  Q
    ||||||| ||||||    
T  20798672 ttcggaaatatgtt 20798659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22134888 - 22134532
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22134888 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgc 22134789  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22134788 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 22134689  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  22134688 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22134589  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22134588 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22134532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 14999905 - 15000261
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999905 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgt 15000004  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15000005 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15000104  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  15000105 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15000204  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15000205 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15000261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 22333053 - 22333409
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333053 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22333152  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333153 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 22333252  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  22333253 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22333352  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22333353 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22333409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25423401 - 25423053
Alignment:
Q  14 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 113  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25423401 agattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaaga 25423302  T
Q  114 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25423301 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttatt 25423202  T
Q  214 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaac 313  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  25423201 ggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgttgcaac 25423102  T
Q  314 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25423101 ttcggaactatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25423053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 26738871 - 26739213
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738871 aggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 26738970  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26738971 agaaaagaccttgagtttcaagaaagagatcatatatttttgagggtcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 26739070  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  26739071 ggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgt 26739170  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26739171 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatc 26739213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19770180 - 19769824
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770180 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19770081  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19770080 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19769981  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  19769980 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 19769881  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19769880 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19769824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27610574 - 27610218
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610574 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27610475  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27610474 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27610375  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27610374 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27610275  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27610274 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27610218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40709000 - 40708656
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709000 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 40708901  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40708900 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccgcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 40708801  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  40708800 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 40708701  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40708700 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 40708656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 27668656 - 27669012
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668656 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27668755  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27668756 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27668855  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  27668856 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccacgt 27668955  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27668956 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27669012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 27685566 - 27685922
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685566 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27685665  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27685666 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27685765  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||| ||    
T  27685766 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccacgt 27685865  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27685866 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27685922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34566714 - 34566370
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566714 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 34566615  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34566614 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 34566515  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  34566514 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 34566415  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34566414 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 34566370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16356722 - 16356378
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356722 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16356623  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16356622 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16356523  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | ||  |||||||    
T  16356522 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttctccatgt 16356423  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16356422 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16356378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27518627 - 27518271
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518627 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27518528  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27518527 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27518428  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27518427 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27518328  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27518327 gtcacaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27518271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 37291662 - 37292018
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37291662 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgt 37291761  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  37291762 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccga 37291861  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  37291862 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 37291961  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  37291962 gtctcaacttcgaaagtaagttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 37292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41771062 - 41770706
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771062 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 41770963  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41770962 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 41770863  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  41770862 agttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 41770763  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41770762 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 41770706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23471439 - 23471093
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  23471439 attgttcaacaaactattgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagacc 23471340  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  23471339 ttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattgg 23471240  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23471239 tccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 23471140  T
Q  316 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23471139 cggaagtatgttccggatccatcacatgtgatccaaagagatgatgt 23471093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22348643 - 22348314
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22348643 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgt 22348544  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22348543 agaaaa--tcttgagtttcgggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 22348446  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  22348445 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22348346  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 337  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22348345 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccat 22348314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 29476239 - 29476595
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476239 aggaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29476338  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29476339 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacga 29476438  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  29476439 agttcattggtccatatcaggtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29476538  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29476539 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 29476595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 20468275 - 20468618
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20468275 gttcagcaaactactgagaatgttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttg 20468374  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20468375 aatttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtcc 20468474  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    || |||| ||| ||||||| | | ||| ||||||||  |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20468475 gtgtcagatattagaaagaatagaaacagtggcgtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 20468574  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  20468575 aagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 20468618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Original strand, 21498209 - 21498479
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  21498209 gagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatag 21498308  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    |  | ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498309 acatcgagtttcaagagggagatcatgtagttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 21498408  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcga 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  21498409 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 350
Target Start/End: Original strand, 21343666 - 21343868
Alignment:
Q  148 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacgg 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21343666 agagtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 21343765  T
Q  248 tggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21343766 tggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 21343865  T
Q  348 cca 350  Q
    |||    
T  21343866 cca 21343868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573385
Alignment:
Q  121 tttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 220  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  221 atcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaa 320  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20573427  T
Q  321 gtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20573426 gtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 20573385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 23442472 - 23442788
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||    
T  23442472 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttg 23442571  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||| |  || ||||||||    
T  23442572 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtcc 23442671  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  ||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23442672 gtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23442771  T
Q  319 aagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||||  |||||||    
T  23442772 aagtatgtagcggatcc 23442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 21890938 - 21891263
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  21890938 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 21891037  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || | | |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21891038 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtcc 21891137  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  21891138 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21891237  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  21891238 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 21891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22462132 - 22461816
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |    
T  22462132 actacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcagg 22462033  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 227  Q
    |||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || ||| |    
T  22462032 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 22461933  T
Q  228 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 327  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||     
T  22461932 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 22461833  T
Q  328 ccggatccatctcatgt 344  Q
    || ||||| || |||||    
T  22461832 ccagatccttcgcatgt 22461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 22236099 - 22236445
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  22236099 gttcatcagactacagagaaagtcaagatggtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 22236198  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  22236199 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 22236298  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  22236299 gtatcagatatcagagagggttggaacagtgtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 22236398  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 365  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| |||||||||||    
T  22236399 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagggatgatgtcca 22236445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 362
Target Start/End: Original strand, 28923982 - 28924290
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||     
T  28923982 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagtt 28924081  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  28924082 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgt 28924181  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 353  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || | |||    
T  28924182 atagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgag 28924281  T
Q  354 tgatgatgt 362  Q
     ||||||||    
T  28924282 agatgatgt 28924290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 325
Target Start/End: Original strand, 21564180 - 21564451
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  21564180 agagaagacgaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtc 21564279  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||| |||| || |||||| | || ||||| |    
T  21564280 actcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggcat 21564379  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
    |  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21564380 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21564451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20773942 - 20773606
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||    
T  20773942 agactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttca 20773843  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     ||||| | ||| || ||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| ||||||    
T  20773842 ggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcag 20773743  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  20773742 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20773643  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  20773642 taccagatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 20773606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25848222 - 25847922
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||| |     
T  25848222 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtcactcctt 25848123  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  25848122 tgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatacagagt 25848023  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  25848022 tggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgttgcggatccttcacatgtgattccgagggatgat 25847923  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  25847922 g 25847922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 362
Target Start/End: Original strand, 28895156 - 28895464
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||     
T  28895156 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagtt 28895255  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  28895256 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactctggcgt 28895355  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 353  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || | |||    
T  28895356 atagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgag 28895455  T
Q  354 tgatgatgt 362  Q
     ||||||||    
T  28895456 agatgatgt 28895464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 14887177 - 14887512
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14887177 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 14887276  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14887277 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 14887376  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  14887377 atttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14887476  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  14887477 ttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatg 14887512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 24735790 - 24736115
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24735790 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttg 24735889  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24735890 agtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 24735989  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||    
T  24735990 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 24736089  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  24736090 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 24736115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 24749733 - 24750058
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24749733 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttg 24749832  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24749833 agtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 24749932  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||    
T  24749933 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 24750032  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  24750033 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 24750058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 37545682 - 37546018
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37545682 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 37545781  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttt-tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 224  Q
     || || || || || |||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  37545782 ggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 37545881  T
Q  225 gttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 324  Q
    | | || || |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  37545882 gatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtat 37545981  T
Q  325 gttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  37545982 gttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 37546018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20342464 - 20342129
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20342464 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 20342365  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     ||  | || || || ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  20342364 ggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 20342265  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20342264 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20342165  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  20342164 ttgcggatccttcacatgtgattccgagggatgatg 20342129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 24737011 - 24737289
Alignment:
Q  66 agcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgact 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| | ||||     
T  24737011 agcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacg 24737110  T
Q  166 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggat 265  Q
    ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || |    
T  24737111 ggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtt 24737210  T
Q  266 tatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24737211 tgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 24737289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Original strand, 23080275 - 23080596
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||||||    
T  23080275 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttca 23080374  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  23080375 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 23080474  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23080475 atttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcggaagtatg 23080574  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  23080575 tagcggatccttcacatgtgat 23080596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20821635 - 20821317
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  20821635 agactacagagaaagttaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaagaccttgaatttca 20821536  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     ||||| || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  20821535 ggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 20821436  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | |||||||| |||||||| ||||||||  || |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  20821435 atttcagaaagggttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20821336  T
Q  326 ttccggatccatctcatgt 344  Q
    | || ||||| || |||||    
T  20821335 tacctgatccttcgcatgt 20821317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22381346 - 22381060
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||       
T  22381346 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccga 22381247  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||  ||||    
T  22381246 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacggtggcttatagagt 22381147  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  22381146 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcagatccgtcacatgtgat 22381060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Original strand, 24798618 - 24798904
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || || || || || ||| |||||||||||| |     
T  24798618 atgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctt 24798717  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  24798718 tgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagt 24798817  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24798818 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 24798904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 150
Target Start/End: Original strand, 21339452 - 21339596
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339452 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 21339551  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgaga 150  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21339552 aggaaagaccttgagtttcaagaacgagaccaagtatttttgaga 21339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22502826 - 22502540
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  22502826 atgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 22502727  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  22502726 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagt 22502627  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22502626 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 22502540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 17269512 - 17269819
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  17269512 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 17269611  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  17269612 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 17269711  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||  | || |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||    
T  17269712 gtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtatttcacgtgtcacaactccgg 17269811  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  17269812 aagtatgt 17269819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21405035 - 21404715
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21405035 cagacattgttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaatatgaaggtgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 21404936  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
                     ||||||| || || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||| | |||    
T  21404935 c----------------aaggagatcatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggttt 21404852  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    |||||  |||||||| | || ||||||||||| || || |||||  |||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  21404851 attggctcgtatcagatttcggaaagagttgggacagttgcgtatagagtgggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcac 21404752  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21404751 aacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgat 21404715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 362
Target Start/End: Original strand, 21662300 - 21662561
Alignment:
Q  100 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21662300 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21662399  T
Q  200 ctccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 299  Q
    || |||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  |||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21662400 cttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21662498  T
Q  300 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
     || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  21662499 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgtatcggatccatcgcatgtgattccgagggatgatgt 21662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 326
Target Start/End: Original strand, 21665761 - 21665986
Alignment:
Q  100 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21665761 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21665860  T
Q  200 ctccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 299  Q
    || |||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||  |||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21665861 cttcgaggtttattggt-tgtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21665959  T
Q  300 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
     || ||||||||||||||||| |||||    
T  21665960 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgt 21665986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 11210880 - 11211057
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  11210880 agactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttca 11210979  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || || |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  11210980 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 11211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27011252 - 27011089
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  27011252 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27011153  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  27011152 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 27011089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23503625 - 23503464
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  23503625 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 23503526  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    |   || || || || ||||| || || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23503525 aattggtgatcatgtgttttttagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtcctttgaagt 23503464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 21937388 - 21937551
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  21937388 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21937487  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||| || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21937488 tgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 21937551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24581379 - 24581216
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  24581379 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 24581280  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||| | || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24581279 tgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24581216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21625470 - 21625382
Alignment:
Q  274 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  21625470 catctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactttgaaagtatgtagtggatccttcgcatgtgattccgagagatgatgt 21625382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Original strand, 25244546 - 25244695
Alignment:
Q  34 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 133  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    | ||| | ||| ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||||    
T  25244546 gagaatgttaagatgattcagaagaagatgaaagcgcgtgacagtaggcaagagagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggag 25244645  T
Q  134 accacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 183  Q
    | || || ||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25244646 atcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25244695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Original strand, 25308698 - 25308847
Alignment:
Q  34 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 133  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    | ||| | ||| ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||||    
T  25308698 gagaatgttaagatgattcagaagaagatgaaagcgcgtgacagtaggcaagagagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggag 25308797  T
Q  134 accacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 183  Q
    | || || ||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25308798 atcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 95
Target Start/End: Original strand, 21831964 - 21831998
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21831964 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatca 21831998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 65724 - 65369
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65724 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 65625  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65624 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 65525  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  65524 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 65425  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65424 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca-agtgatgatgt 65369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 362
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40132
Alignment:
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 353  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccagag 40123  T
Q  354 tgatgatgt 362  Q
    |||||||||    
T  40124 tgatgatgt 40132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 106
Target Start/End: Original strand, 39806 - 39906
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39806 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 39905  T
Q  106 a 106  Q
    |    
T  39906 a 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 360
Target Start/End: Original strand, 278823 - 279171
Alignment:
Q  12 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278823 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 278922  T
Q  112 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278923 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 279022  T
Q  212 ttggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 311  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  279023 taggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgca 279122  T
Q  312 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  279123 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgat 279171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 164709 - 165052
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164709 gttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttg 164808  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  164809 agtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtcc 164908  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||    
T  164909 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcgg 165008  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  165009 aagtatgttccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 165052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 308978 - 308622
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308978 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 308879  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  308878 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaa 308779  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  308778 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 308679  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  308678 gtcgtaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 308622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 260614 - 260271
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  260614 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttg 260515  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  260514 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 260415  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||  || |||||||||| ||  ||||| | ||  ||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  260414 gtatcagatttcagagaggattagaacggtggcatatagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcgg 260315  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  260314 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 260271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16355169 - 16355525
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  16355169 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaataattatcatgataagcgc 16355268  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355269 aggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16355368  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16355369 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgt 16355468  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355469 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16355525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16252169 - 16252525
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252169 aggaccagagattcttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16252268  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252269 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16252368  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16252369 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 16252468  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16252469 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16252525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12523964 - 12523608
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12523964 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgt 12523865  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12523864 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 12523765  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  12523764 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgt 12523665  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12523664 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12523608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7090720 - 7090365
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7090720 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 7090621  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090620 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 7090521  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  7090520 gatttattgct-cgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 7090422  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7090421 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 7090365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14680855 - 14680499
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14680855 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14680756  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14680755 aggaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccga 14680656  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14680655 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 14680556  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680555 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Original strand, 15149740 - 15150053
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15149740 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatc 15149839  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15149840 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 15149939  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15149940 tccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 15150039  T
Q  316 cggaagtatgttcc 329  Q
    ||||||||||||||    
T  15150040 cggaagtatgttcc 15150053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 18227177 - 18227526
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  18227177 gagattgttcagaagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaga 18227276  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18227277 atcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttat 18227376  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18227377 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 18227476  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18227477 cttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 18227526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14652583 - 14652240
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14652583 gttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttg 14652484  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14652483 agtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtcc 14652384  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||    
T  14652383 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcgg 14652284  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14652283 aagtatgttccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 14652240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23956035 - 23955691
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956035 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23955936  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23955935 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 23955836  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  23955835 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgt 23955736  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23955735 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 23955691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18297493 - 18297149
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297493 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18297394  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18297393 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 18297294  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  18297293 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 18297194  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18297193 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 18297149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 19778517 - 19778873
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778517 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19778616  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19778617 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19778716  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  19778717 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 19778816  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19778817 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19778873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14159773 - 14159424
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159773 gagattgttcaacagactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaag 14159674  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || || ||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14159673 atcttgaatttcaaggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttat 14159574  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  14159573 tggtccatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcggaa 14159474  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14159473 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgatgt 14159424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40473321 - 40472972
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40473321 gagattgttcagcaaactactgagaaagttcaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaag 40473222  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  40473221 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 40473122  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  40473121 tggtctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaa 40473022  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40473021 cttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 40472972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8386700 - 8386356
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386700 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8386601  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8386600 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8386501  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  8386500 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 8386401  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8386400 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 8386356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 14303702 - 14304057
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303702 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14303801  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303802 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccga 14303900  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  14303901 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 14304000  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14304001 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 14304057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27711624 - 27711268
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711624 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27711525  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27711524 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27711425  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27711424 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27711325  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  27711324 gtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcaaagtgacgatgt 27711268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12476888 - 12476544
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476888 aggaccagagattgttcagcaaactactgaggaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 12476789  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12476788 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 12476689  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  12476688 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 12476589  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12476588 atcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 12476544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 14851090 - 14851446
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851090 aggaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14851189  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14851190 aggaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccga 14851289  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14851290 ggtttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgt 14851389  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  14851390 gtcgcaaattcggaagtatgttccggatccatctcatgtgctcccaagagatgatgt 14851446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 29039128 - 29039472
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039128 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29039227  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29039228 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 29039327  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  29039328 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29039427  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29039428 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 29039472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 14266623 - 14266979
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266623 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14266722  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14266723 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 14266822  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  14266823 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 14266922  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  14266923 gtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 14266979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 8053347 - 8053703
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8053347 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 8053446  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8053447 agaagagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8053546  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  8053547 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacgatggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 8053646  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8053647 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 8053703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 97 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15364583 - 15364330
Alignment:
Q  97 gataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15364583 gataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 15364484  T
Q  197 tgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 296  Q
    |||| ||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | ||    
T  15364483 tgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgt 15364384  T
Q  297 cttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15364383 tttccatatgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 15364330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 15003361 - 15003686
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||    
T  15003361 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttg 15003460  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  15003461 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatcc 15003560  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15003561 atatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15003660  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  15003661 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 15003686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 174 - 362
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927339
Alignment:
Q  174 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccg 273  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||    
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  274 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14927339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 3264798 - 3265133
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3264798 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 3264897  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3264898 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 3264997  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  3264998 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 3265097  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  3265098 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 3265133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 16676427 - 16676578
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16676427 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16676526  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 157  Q
    || || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16676527 aggaaggatcttgagtttcagcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 16676578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 11207235 - 11207570
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11207235 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 11207334  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11207335 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 11207434  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11207435 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11207534  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  11207535 ttgcggatccttcacatgtgataccgagggatgatg 11207570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16146187 - 16145862
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  16146187 gttcatcagactacggagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 16146088  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || |  || || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  16146087 agtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 16145988  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16145987 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtgtcgcagcttcgg 16145888  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  16145887 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 16145862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15070688 - 15070360
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  15070688 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttg 15070589  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||  |||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||    
T  15070588 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtcc 15070489  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     || ||| |||  || ||||||||||| ||||| ||| | || || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15070488 ataccagatatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15070389  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |||||||   ||||||| || ||||||||    
T  15070388 aagtatgcagcggatccttcgcatgtgat 15070360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15246199 - 15245856
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||||||  |||| || ||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |   |||    
T  15246199 gttcatcagactacgaagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttg 15246100  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || ||||| || |||||| ||||||| || | | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  15246099 agtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 15246000  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |    
T  15245999 gtatcagataacagagagggttggaacagtggcatacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 15245900  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15245899 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 15245856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Original strand, 29453541 - 29453876
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29453541 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 29453640  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  29453641 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 29453740  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  29453741 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 29453840  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  29453841 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 29453876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Original strand, 1649316 - 1649599
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||| | ||||| |||| |     
T  1649316 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagttactccta 1649415  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| ||  ||||    
T  1649416 tgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgtggcatatagagt 1649515  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| || |||||    
T  1649516 tgggttgccacctcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctacggaagtatgtagcggatccttcacatgt 1649599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33223184 - 33222865
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  33223184 actactgagaaagtcaagttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcagg 33223085  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 227  Q
    | || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |  || ||||||||||||||| |    
T  33223084 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatcagat 33222985  T
Q  228 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 327  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  33222984 ttcaaagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgta 33222885  T
Q  328 ccggatccatctcatgtgat 347  Q
     ||||||| || ||||||||    
T  33222884 gcggatccttcacatgtgat 33222865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Original strand, 44661870 - 44662191
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44661870 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 44661969  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| |||||||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  44661970 ggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 44662069  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  44662070 atttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 44662169  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  44662170 ttgcggatccttctcatgtgat 44662191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 51606178 - 51606485
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||    
T  51606178 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttg 51606277  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||||||    
T  51606278 agtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtcc 51606377  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  51606378 gtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 51606477  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  51606478 aagtatgt 51606485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20891215 - 20890930
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  20891215 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 20891116  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  | |     
T  20891115 tgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatag-ga 20891017  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  || | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20891016 tgggtttccaacacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 20890930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Original strand, 1640156 - 1640293
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1640156 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcataggaaag 1640255  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgaga 150  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  1640256 accttgagttccaagaaggagatcatgtatttttgaga 1640293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 15415059 - 15415198
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15415059 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtca 15415158  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 194  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15415159 ctcttgtgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaa 15415198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Original strand, 15359087 - 15359313
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||    
T  15359087 gttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttg 15359186  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||  |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || |||||||     
T  15359187 agtttcaagagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtct 15359286  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaac 245  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  15359287 gtatcagatatcagagagggttggaac 15359313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13247899 - 13247736
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  || || || |    
T  13247899 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttcaagttggtgatcatg 13247800  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    |||||||||| || | ||||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  13247799 tatttttgagggtgaatcatgtgatcggtgttggtcttgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13247736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 275 - 362
Target Start/End: Original strand, 18607823 - 18607910
Alignment:
Q  275 atctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18607823 atctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgaagatgt 18607910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27900654 - 27900459
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27900654 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 27900555  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgta 221  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | ||||  |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  27900554 ggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgta 27900459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 42703082 - 42702871
Alignment:
Q  115 cttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 214  Q
    |||||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||    
T  42703082 cttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattg 42702983  T
Q  215 gtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaact 314  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  42702982 gtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaact 42702883  T
Q  315 tcggaagtatgt 326  Q
    ||||||||||||    
T  42702882 tcggaagtatgt 42702871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16752826 - 16752665
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||       
T  16752826 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 16752727  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtat 222  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  16752726 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 12132413 - 12132574
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| | || ||||||| |||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  12132413 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 12132512  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    ||  || || || || |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132513 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 201
Target Start/End: Original strand, 55375376 - 55375537
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  55375376 gttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 55375475  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 201  Q
    | |||||||| || | || ||| ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||    
T  55375476 tgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagctttgaagtgtatgaagttgact 55375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Original strand, 9849473 - 9849681
Alignment:
Q  17 ttgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 116  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |  | ||||||| ||||||||| |  || || ||| |    
T  9849473 ttgttcagcagactatggagaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcatcgtagagtaggtagaagagttgtcatgataaacagaggaaggatat 9849572  T
Q  117 tgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 216  Q
    ||| |||||||  ||||| ||  | |||||||||||    |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||    
T  9849573 tgaatttcaagtcggagatcaaatgtttttgagagttgacctagtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtccaagaagttgacaccgtgttttattggt 9849672  T
Q  217 ccgtatcag 225  Q
    || ||||||    
T  9849673 ccttatcag 9849681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9291089 - 9290926
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  9291089 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcagg 9290990  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    |||||||||| || | || |||||| | |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  9290989 tatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 9290926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14997570 - 14997407
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  14997570 gttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 14997471  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14997470 tgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14997407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Original strand, 18164332 - 18164474
Alignment:
Q  165 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttgga 264  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  18164332 tggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 18164431  T
Q  265 ttatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgt 307  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18164432 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgt 18164474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 16445230 - 16445393
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  16445230 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16445329  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||| || || | || ||||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16445330 tgttttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16445393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 15293175 - 15293338
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  15293175 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 15293274  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || ||||| ||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15293275 tgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15293338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 15415226 - 15415301
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15415226 caccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15415301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8706196 - 8706078
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||| | ||   ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  8706196 attgttcaccagactatagaaaaagttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagacc 8706097  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggaga 134  Q
    |||| ||| | ||||||||    
T  8706096 ttgaatttaaggaaggaga 8706078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15077910 - 15077825
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 104  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15077910 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 18550049 - 18550234
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattc--aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaga 108  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||   ||||| ||||||||| || || | | |||||||||| |||||||||||||| ||     
T  18550049 cagagattgttcagcagacgacagaaaaagtcaaaatgattcgagagagagaatgaaagcatcacaaaatagacaaaagagctatcatgataagcgaagg 18550148  T
Q  109 aaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 194  Q
    |||    | |||||||| ||| |  | ||  | ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18550149 aaatcattggagtttcaggaaaggtatcatttgtttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 18550234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16685522 - 16685361
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| | || || | ||||||||||||| | |  || ||| || | |||||    
T  16685522 agactacgaagaaagttaagatgattcaggagaagatgagagcgtctcagagtaggcagaaaatttatcatgataagaggatgaaggatatttaatttca 16685423  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    ||  || || || |  ||||||||||| | |||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  16685422 agttggtgatcatgggtttttgagagtgaatcatgtaaccggtgttgggtgtgctttgaagt 16685361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 362
Target Start/End: Original strand, 15351934 - 15351966
Alignment:
Q  330 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351934 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 15351966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Original strand, 12342881 - 12343028
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||| | || ||  || |||||||||| |  || || || |    
T  12342881 gttaagatgattcaagagaatataagggcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaagaatattgagtttcaggttggtgatcatg 12342980  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    ||||||| |||||   || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  12342981 tattttttagagtgtatcctgtaaccgatgttagacgtgctttgaagt 12343028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15319642 - 15319515
Alignment:
Q  235 agagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 334  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||  || | |||||||| ||| |||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||  ||||||    
T  15319642 agagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccagcacatctttcaaatctgcatgatgtgtttcctgtgtcacaacttcagaagtatgtagcggatc 15319543  T
Q  335 catctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15319542 cttcgcatgttattccgagagatgatgt 15319515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 344
Target Start/End: Original strand, 15359326 - 15359379
Alignment:
Q  291 tgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15359326 tgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15359379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 30313578 - 30313927
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  30313578 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 30313677  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313678 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 30313777  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30313778 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 30313877  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30313878 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 30313927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 21166964 - 21167320
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166964 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 21167063  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21167064 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 21167163  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21167164 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 21167263  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167264 gtcgcaacttcgaaaatatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21167320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19978321 - 19977965
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978321 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19978222  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978221 agaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 19978122  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  19978121 gatttattggtccgtatcagatatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgt 19978022  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19978021 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 19977965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 16408479 - 16408828
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16408479 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 16408578  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408579 atcttaagttccaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 16408678  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16408679 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 16408778  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16408779 cttcggaagtgtgtcccggatctatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15533734 - 15533378
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15533734 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15533635  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15533634 aggaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 15533535  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15533534 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgt 15533435  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533434 gtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15533378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 22164625 - 22164974
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22164625 gagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaag 22164724  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22164725 atcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttat 22164824  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22164825 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaa 22164924  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22164925 cttcggaagtatgtcccggatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22164974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32600498 - 32600142
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32600498 aggaccagagattgttcagtagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgc 32600399  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32600398 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 32600299  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  32600298 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 32600199  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600198 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatctatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 32600142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 22133475 - 22133824
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22133475 gagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaag 22133574  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133575 atcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 22133674  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22133675 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaa 22133774  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22133775 cttcggaagtatgtcccgaatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22133824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22046727 - 22046372
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22046727 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgc 22046628  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046627 aggaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccga 22046528  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22046527 ggtttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 22046428  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22046427 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat-caaagtgatgatgt 22046372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21251295 - 21250940
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21251295 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattaaagagaga-tgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgt 21251197  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251196 aggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 21251097  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21251096 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 21250997  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21250996 gtcgcaacttcggaagtatgtaccagatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21250940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 21922162 - 21922518
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21922162 aggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgt 21922261  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21922262 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccga 21922361  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| || || || |||||    
T  21922362 gatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgt 21922461  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21922462 gtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatccaaagcgatgatgt 21922518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 21394292 - 21394648
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21394292 aggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21394391  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21394392 atgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccga 21394491  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||    
T  21394492 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgt 21394591  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21394592 gtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21394648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 21788785 - 21789141
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21788785 aggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21788884  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21788885 atgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccga 21788984  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||    
T  21788985 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgt 21789084  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21789085 gtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21789141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23650395 - 23650039
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23650395 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 23650296  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23650295 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 23650196  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||    
T  23650195 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgt 23650096  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23650095 gttgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatccaaagtgataatgt 23650039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 17674450 - 17674806
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674450 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17674549  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17674550 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17674649  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  17674650 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 17674749  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  17674750 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 17674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19113044 - 19112700
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113044 aggaccagagattattcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19112945  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19112944 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19112845  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  19112844 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 19112745  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19112744 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 19112700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22032339 - 22032030
Alignment:
Q  53 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  22032339 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagt 22032240  T
Q  153 cactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcg 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  22032239 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcg 22032140  T
Q  253 taccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaga 352  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22032139 tatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgtttcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaa 22032040  T
Q  353 gtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||    
T  22032039 gtgatgatgt 22032030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 20018177 - 20018533
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20018177 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgt 20018276  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20018277 agaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 20018376  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  20018377 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 20018476  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20018477 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 20018533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 22120601 - 22120957
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120601 aggatcagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22120700  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||    
T  22120701 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcga 22120800  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |  | || ||||||||    
T  22120801 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgaacaacgttttccatgt 22120900  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22120901 gtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22120957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 19485297 - 19485653
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485297 aggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19485396  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  19485397 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcga 19485496  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  19485497 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 19485596  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19485597 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19485653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22987555 - 22987199
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    ||||||| | |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22987555 aggagcataaattgttcaacaaactattgagaaagataatatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22987456  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22987455 aggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctga 22987356  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || ||  | |||||    
T  22987355 agtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaatacatgt 22987256  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22987255 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 22987199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 20396565 - 20396893
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20396565 gttcaacaaactactgagaaggttaagttgatgcgagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttg 20396664  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||     
T  20396665 agtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgactctaagatttattggtct 20396764  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||    
T  20396765 gtatcagatatcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaacttcgg 20396864  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20396865 aagtgtgtttcggatccatctcatgtgat 20396893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15441420 - 15441179
Alignment:
Q  121 tttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 220  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441420 tttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 15441321  T
Q  221 atcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaa 320  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15441320 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaa 15441221  T
Q  321 gtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15441220 gtatgttttggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15441179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23949162 - 23948887
Alignment:
Q  87 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaag 186  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  23949162 gagttattatgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaa 23949063  T
Q  187 tcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatt 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  23949062 tcaaagaagttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatt 23948963  T
Q  287 tgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||||||    
T  23948962 ttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatcagtctcatgtgatcccaagagatgatgt 23948887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 22377880 - 22378089
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377880 aggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22377979  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22377980 aggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22378079  T
Q  206 gatttattgg 215  Q
    ||||||||||    
T  22378080 gatttattgg 22378089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 215
Target Start/End: Original strand, 22384055 - 22384264
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384055 aggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22384154  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22384155 aggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22384254  T
Q  206 gatttattgg 215  Q
    ||||||||||    
T  22384255 gatttattgg 22384264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 21681910 - 21682253
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  21681910 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 21682009  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  21682010 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 21682109  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21682110 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21682209  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||   ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  21682210 aagtatgaaacggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 21682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20388405 - 20388133
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  20388405 agagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtc 20388306  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||| || |||| || |||||||| || ||| | |    
T  20388305 actctagtgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacat 20388206  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    |  |||| || ||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20388205 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgtgtttaatgtgtcgcaatttcggaagtatgt 20388133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1266538 - 1266255
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||| ||||||| ||||       
T  1266538 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactccga 1266439  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  1266438 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagt 1266339  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  1266338 tggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaacggatccttcgcatgt 1266255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 21324849 - 21325175
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  21324849 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttg 21324948  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  21324949 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 21325048  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatc-tttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcg 317  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21325049 gtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 21325148  T
Q  318 gaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||    
T  21325149 gaagtatgtagcggatccttcgcatgt 21325175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6679445 - 6679110
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6679445 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 6679346  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6679345 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 6679246  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6679245 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6679146  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  6679145 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 6679110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Original strand, 20010382 - 20010665
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||       
T  20010382 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccga 20010481  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| || || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  20010482 tgacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagt 20010581  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  20010582 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 20010665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Original strand, 804155 - 804455
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  804155 atgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 804254  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||| ||  ||||    
T  804255 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagt 804354  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  804355 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 804454  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  804455 g 804455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 22061880 - 22062216
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22061880 agactacagagaaagtcaagatgatcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttca 22061979  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||     
T  22061980 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaa 22062079  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     ||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22062080 atatcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22062179  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22062180 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 22062216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19851710 - 19851427
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||       
T  19851710 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgt 19851611  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||  |||    
T  19851610 tgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagt 19851511  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  19851510 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgt 19851427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19857746 - 19857463
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||       
T  19857746 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgt 19857647  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||| |||  |||    
T  19857646 tgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagt 19857547  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  19857546 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgt 19857463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23655268 - 23654925
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  23655268 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 23655169  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| ||  | ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  23655168 agtttcaagacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 23655069  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||  ||   | | || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23655068 gtatcagatatcagagagggtttgaacagtggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23654969  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  23654968 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 23654925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 344
Target Start/End: Original strand, 31416920 - 31417239
Alignment:
Q  25 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaa--tgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||    
T  31416920 cagactactgagaaagtcaagatgat--aagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtt 31417017  T
Q  123 tcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtat 222  Q
    ||| || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  31417018 tcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtat 31417117  T
Q  223 cagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagt 322  Q
     || | |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  31417118 tagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactacggaagt 31417217  T
Q  323 atgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||  ||||||| || |||||    
T  31417218 atgtagcggatccttcgcatgt 31417239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20008191 - 20007866
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  20008191 gttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 20008092  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| |  || ||||||||    
T  20008091 agttccaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtcc 20007992  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20007991 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 20007892  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  20007891 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 20007866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 31571282 - 31571589
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  31571282 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 31571381  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  31571382 agtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggccc 31571481  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  31571482 gtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 31571581  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  31571582 aagtatgt 31571589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14565441 - 14565141
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  14565441 atgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 14565342  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  14565341 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 14565242  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  14565241 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatttgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 14565142  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  14565141 g 14565141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6603992 - 6603657
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6603992 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 6603893  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||     
T  6603892 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaa 6603793  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6603792 atttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6603693  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  6603692 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 6603657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21840758 - 21840415
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  ||||    
T  21840758 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttg 21840659  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| | ||||| |||| | | || ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21840658 agtttcaagagggagatcatgtgtttctaagagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 21840559  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21840558 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtattccacgtgtcgcaacttcgg 21840459  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  21840458 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 21840415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Original strand, 29303908 - 29304194
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||       
T  29303908 atgaaagcttcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaa 29304007  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |   | || |||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||    
T  29304008 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaacagtggcttatagagt 29304107  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||   |||||| || ||||||||    
T  29304108 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttaggaagtatgtagaggatccttcacatgtgat 29304194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 362
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265401
Alignment:
Q  88 agttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  188 caaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaattt 287  Q
    | | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  288 gcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  16265327 gcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcaaagggatgatgt 16265401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12305057 - 12304771
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||| |     
T  12305057 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctt 12304958  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || |||| ||| ||||| ||  ||||    
T  12304957 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacagtggcatatagagt 12304858  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12304857 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 12304771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 20652780 - 20652957
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||||||    
T  20652780 agactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtggacagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttca 20652879  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20652880 agttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20652957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28982632 - 28982356
Alignment:
Q  85 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 184  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28982632 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28982533  T
Q  185 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 284  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  28982532 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28982433  T
Q  285 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
     ||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  28982432 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 28982356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28987852 - 28987576
Alignment:
Q  85 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 184  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28987852 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28987753  T
Q  185 agtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 284  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  28987752 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28987653  T
Q  285 tttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
     ||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  28987652 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 28987576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23949257 - 23949158
Alignment:
Q  23 agcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23949257 agcaaactactgagaaagttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27347436 - 27347225
Alignment:
Q  150 agtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtg 249  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || ||||| || |||    
T  27347436 agtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtg 27347337  T
Q  250 gcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 349  Q
    || ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |    
T  27347336 gcatataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattc 27347237  T
Q  350 agagtgatgatg 361  Q
     ||| |||||||    
T  27347236 cgagggatgatg 27347225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 203
Target Start/End: Original strand, 21196960 - 21197126
Alignment:
Q  37 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||| || |    
T  21196960 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagagttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatc 21197059  T
Q  137 acgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | || ||||||||||| | || ||| ||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  21197060 atgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgactcc 21197126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22051162 - 22051018
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||| || || || |||||||||| ||| ||||       
T  22051162 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccga 22051063  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22051062 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccga 22051018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18856931 - 18856853
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 84  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18856931 aggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 18856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22982756 - 22982593
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||| |  || || || |    
T  22982756 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22982657  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
      ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  22982656 cgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgtgctttgaagtgtcagaagttgactcc 22982593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 16877556 - 16877719
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  ||||| || |    
T  16877556 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 16877655  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | || ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16877656 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16877719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22040213 - 22040162
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagag 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040213 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagag 22040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19863404 - 19863223
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || ||||||| ||||| ||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||||  | || |||     
T  19863404 gagattgttcagcagacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagacagaagagctatcatgataaaagaaggaaat 19863305  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 194  Q
       | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19863304 cattggagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 19863223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19868041 - 19867860
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||||||||| || || || || || ||||||| ||||| ||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||||  | || |||     
T  19868041 gagattgttcagcagacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagacagaagagctatcatgataaaagaaggaaat 19867942  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 194  Q
       | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19867941 cattggagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtctaagaa 19867860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 21850798 - 21850961
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  21850798 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21850897  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| |||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  21850898 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcc 21850961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22315511 - 22315364
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || |    
T  22315511 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 22315412  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | ||||||||||| | || ||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22315411 tgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgtgctttgaagt 22315364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22283316 - 22283204
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| |  | |||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  22283316 gttaagatgattcaggagaaaatgagagtgtctcagagtaggtagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 22283217  T
Q  140 tatttttgagagt 152  Q
    ||||||| |||||    
T  22283216 tatttttaagagt 22283204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 102
Target Start/End: Original strand, 23157472 - 23157534
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | || | | ||||||||||||||||    
T  23157472 gttaagatgattcaagagaatatgaaagcatctcagaatagatagaggagttatcatgataag 23157534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25282457 - 25282307
Alignment:
Q  34 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 133  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||| | |||| | || |||||||||||| ||||| | || || ||  | ||||||||||  || |    
T  25282457 gagaaggttaagatcattcaagagaagatgagagtgtctcggagtaggcagaagagttatcataataagaggaggaaggacatcgagtttcaagttggtg 25282358  T
Q  134 accacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 184  Q
    | || || ||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  25282357 atcatgtgtttttgagagtgaatcatgtaaccagtgttggacgtactttga 25282307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 362
Target Start/End: Original strand, 22179309 - 22179341
Alignment:
Q  330 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22179309 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 22179341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14679 - 14323
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14679 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14580  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14579 aggaaggatcttgagtttcaggaaggataccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 14480  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14479 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtcttccatgt 14380  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14379 gtcgaaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 939 - 583
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  939 aggaccagagattgttcagcagactagtaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgt 840  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  839 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 740  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  739 agttcattggtccatatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 640  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  639 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19864839 - 19864483
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19864839 aggaccagagattggtcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgc 19864740  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864739 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 19864640  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19864639 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgt 19864540  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864539 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 19864483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12498171 - 12497824
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12498171 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12498072  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12498071 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12497972  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12497971 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12497872  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12497871 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12497824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 360
Target Start/End: Original strand, 12510730 - 12511077
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12510730 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12510829  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12510830 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12510929  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12510930 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12511029  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12511030 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 25765419 - 25765774
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25765419 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 25765518  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765519 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgcttttgagagtcacgc-tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 25765617  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25765618 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtgttccatgt 25765717  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765718 gtcgtaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 25765774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16963496 - 16963852
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16963496 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16963595  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16963596 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccga 16963695  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16963696 gatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggcgtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtattacatgt 16963795  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963796 gtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16963852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12505500 - 12505153
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12505500 gagattgttcatcatactactgagaatgttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12505401  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12505400 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12505301  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12505300 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12505201  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12505200 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12505153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 356
Target Start/End: Original strand, 1543213 - 1543563
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1543213 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgc 1543312  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1543313 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 1543412  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  1543413 agttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 1543512  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1543513 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 1543563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16927769 - 16928125
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16927769 aggaccagagattgttcagcagactacagggaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgc 16927868  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927869 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16927968  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||    
T  16927969 gatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatattacatgt 16928068  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16928069 gtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatacagagtgatgatgt 16928125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 27331569 - 27331918
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27331569 gagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaag 27331668  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27331669 accttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttat 27331768  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  27331769 tggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaa 27331868  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27331869 cttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27331918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 27392309 - 27392658
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27392309 gagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaag 27392408  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27392409 accttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttat 27392508  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  27392509 tggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaa 27392608  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27392609 cttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27392658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 5839348 - 5839704
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5839348 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtcaagatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgc 5839447  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  5839448 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtttttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgacttcga 5839547  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5839548 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgttttccatgt 5839647  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5839648 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 5839704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 25609990 - 25610346
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25609990 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 25610089  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25610090 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccga 25610189  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  25610190 gatttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtttcatgt 25610289  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25610290 gtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25610346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 362
Target Start/End: Original strand, 22078823 - 22079173
Alignment:
Q  12 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 111  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22078823 agagattgttcaacaaaccactgagaaggttaagatgattccagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaa 22078922  T
Q  112 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22078923 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagattta 22079022  T
Q  212 ttggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||    
T  22079023 ttcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtagca 22079122  T
Q  312 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22079123 acttcggaagtatgttcctgatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22079173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16626846 - 16627202
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626846 aggaccagagattgttcagcaaactattgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16626945  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16626946 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16627045  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  16627046 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 16627145  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16627146 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 16627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25112704 - 25112348
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25112704 aggaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgt 25112605  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25112604 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccga 25112505  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25112504 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 25112405  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25112404 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 25112348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 18408072 - 18408428
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18408072 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagataattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgt 18408171  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18408172 aggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagagtaactcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 18408271  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||    
T  18408272 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtttcatgt 18408371  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18408372 gtcgcaacttcgaaagtatgcaccggattcatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 18408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23078621 - 23078265
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078621 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23078522  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23078521 aggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgactccga 23078422  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||| || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || || || |||||    
T  23078421 gatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattacatgt 23078322  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23078321 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23078265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 24313297 - 24313653
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24313297 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcat 24313396  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24313397 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24313496  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  24313497 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 24313596  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24313597 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24313653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 28263326 - 28263682
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263326 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 28263425  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28263426 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 28263525  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28263526 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28263625  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28263626 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 28342075 - 28342431
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342075 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 28342174  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28342175 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 28342274  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28342275 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28342374  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28342375 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28342431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 29592049 - 29592393
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592049 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29592148  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29592149 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 29592248  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  29592249 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29592348  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29592349 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 29592393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Original strand, 21833172 - 21833466
Alignment:
Q  68 cgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactgg 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  21833172 cgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactgg 21833271  T
Q  168 tgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggatta 267  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  21833272 tgttggaggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggatta 21833371  T
Q  268 tcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21833372 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 21833466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 2874932 - 2875288
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874932 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 2875031  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2875032 agaaaagattttgagtttcaagaaggagaccacgagtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccga 2875131  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  2875132 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 2875231  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2875232 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 2875288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27187588 - 27187232
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27187588 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcga 27187489  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27187488 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 27187389  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
     ||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27187388 aattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 27187289  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27187288 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27187232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 27261652 - 27262008
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27261652 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcga 27261751  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27261752 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 27261851  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
     ||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27261852 aattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 27261951  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27261952 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27262008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 28292501 - 28292857
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28292501 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgt 28292600  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28292601 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccga 28292700  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28292701 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28292800  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28292801 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28292857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 22762584 - 22762940
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22762584 aggaccagagattgttcaacaaattacttagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgt 22762683  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22762684 aggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccga 22762783  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||||||   ||| || |||||    
T  22762784 gatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgt 22762883  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22762884 gtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccctcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22762940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17032578 - 17032358
Alignment:
Q  142 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttg 241  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17032578 tttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttg 17032479  T
Q  242 gaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctca 341  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032478 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctca 17032379  T
Q  342 tgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  17032378 tgtgatccagagtgacgatgt 17032358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 336
Target Start/End: Original strand, 18197676 - 18198006
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18197676 aggaccagcgattgtttaacagactactgagaaggtaaagatgatttaagaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18197775  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
     | ||||| ||| |||||||||| ||| | || |||||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18197776 cggaaagaccttaagtttcaagagggatatcatgtatttctgaaagtcactcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccga 18197875  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | |||||||||| |||| || |||| |||||| ||  ||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18197876 ggtttattggtctgtataagatatcggaaagaatttaaacagtggcgtatcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 18197975  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatcca 336  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18197976 ttcgcaacttcggaagtatgttctggatcca 18198006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21471698 - 21471412
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |     
T  21471698 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactccta 21471599  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  21471598 tgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagt 21471499  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  21471498 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 21471412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25750900 - 25750605
Alignment:
Q  67 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactg 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||| |    
T  25750900 gcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgg 25750801  T
Q  167 gtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggatt 266  Q
    ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||    
T  25750800 gtgtaagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggttt 25750701  T
Q  267 atcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  25750700 gccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcatcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 25750605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15459468 - 15459150
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15459468 agactacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttca 15459369  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     ||||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  15459368 ggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 15459269  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | ||||||||||    
T  15459268 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtatcacagttgcggaagtatg 15459169  T
Q  326 ttccggatccatctcatgt 344  Q
    | || ||||| || |||||    
T  15459168 tacctgatccttcgcatgt 15459150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25768288 - 25768023
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |     
T  25768288 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactctta 25768189  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  25768188 tgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagt 25768089  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
     || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  25768088 gggtttgccaccacatctttccaatttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcagcttcggaagtatgt 25768023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 227 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22433928 - 22433793
Alignment:
Q  227 tatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22433928 tatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 22433829  T
Q  327 tccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433828 tccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22433793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 14131363 - 14131637
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||| |     
T  14131363 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactccta 14131462  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  14131463 tgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagt 14131562  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||    
T  14131563 gggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcagttacggaagtatgtaacggatcc 14131637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Original strand, 10468998 - 10469319
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10468998 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 10469097  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  10469098 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 10469197  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  10469198 atttcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 10469297  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  10469298 tagcggatccttcacatgtgat 10469319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 22796774 - 22797117
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    || || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  22796774 gttcatcagactacagagaaggttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 22796873  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||     
T  22796874 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtct 22796973  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||  |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22796974 gtatcatatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 22797073  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||   ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22797074 aagtatgcagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 22797117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24364544 - 24364223
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24364544 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 24364445  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  24364444 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 24364345  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24364344 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 24364245  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  24364244 ttgcggatccttctcatgtgat 24364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 308
Target Start/End: Original strand, 34645770 - 34646017
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||| |     
T  34645770 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactccta 34645869  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||  || |    
T  34645870 tgacaggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaat 34645969  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtc 308  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  34645970 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtc 34646017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18794787 - 18794504
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  18794787 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 18794688  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||  | || |||||||| ||||| || |||||    
T  18794687 tgacaggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagt 18794588  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| || |||||    
T  18794587 gggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacgaaagtatgtaccggatccgtcgcatgt 18794504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19879395 - 19879112
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  19879395 atgaaagggtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 19879296  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    || | ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||  | ||    
T  19879295 tggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 19879196  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19879195 gggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 19879112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 27560759 - 27561066
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  27560759 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 27560858  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  27560859 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 27560958  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||    
T  27560959 gtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagttgcgg 27561058  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  27561059 aagtatgt 27561066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 21564316 - 21564590
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  21564316 atgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctt 21564415  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||||||  ||||    
T  21564416 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcgtatagagt 21564515  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  | || ||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  21564516 gggtttgccgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacggaagtatgtaccggatcc 21564590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11291918 - 11291818
Alignment:
Q  52 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11291918 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 11291819  T
Q  152 t 152  Q
    |    
T  11291818 t 11291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 344
Target Start/End: Original strand, 8766297 - 8766615
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8766297 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 8766396  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| || |||  | ||||  | || |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  8766397 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 8766496  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8766497 atttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8766596  T
Q  326 ttccggatccatctcatgt 344  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  8766597 tagcggatccttcgcatgt 8766615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22434021 - 22433927
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434021 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 22433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 333
Target Start/End: Original strand, 11287782 - 11288054
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| | |     
T  11287782 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcaccccta 11287881  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||  | ||    
T  11287882 tgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 11287981  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 333  Q
     || ||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||    
T  11287982 gggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggat 11288054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17415625 - 17415365
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||    
T  17415625 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttg 17415526  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17415525 agtttcaagagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 17415426  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctt 279  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||||||||||    
T  17415425 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 333
Target Start/End: Original strand, 11280689 - 11280961
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||| | |     
T  11280689 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagaatcacaccta 11280788  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||  | ||    
T  11280789 tgacaggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 11280888  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggat 333  Q
     || ||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||    
T  11280889 gggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggat 11280961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18801081 - 18800858
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  18801081 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 18800982  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||||| |||| | |||| |||||  ||||||  |||||||| ||| |||||||| | |  || ||||||||    
T  18800981 agtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgacttcaaagttcattggtcc 18800882  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttgg 242  Q
     |||||| ||||||| || |||||    
T  18800881 atatcagatatcagagagggttgg 18800858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 14381609 - 14381841
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  14381609 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttg 14381708  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  14381709 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 14381808  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggc 251  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| |||||    
T  14381809 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggc 14381841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1640876 - 1640715
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||| | ||||||    
T  1640876 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaagagtc 1640777  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    || | |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1640776 acccctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttattgg 1640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18571769 - 18571622
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  18571769 gttaagatgattcaggagaaaaggaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 18571670  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    |||||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18571669 tatttttgagggtgaatcatgtgaccgatgttggtcgtgctttgaagt 18571622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 28282955 - 28283262
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  28282955 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 28283054  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||| ||    
T  28283055 agtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggccc 28283154  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||  | || |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  | |||    
T  28283155 gtatcagatttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcacgatgtgtttcacgtgtcacagttgcgg 28283254  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  28283255 aagtatgt 28283262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 25743236 - 25743413
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  25743236 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 25743335  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || || |||||||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25743336 agttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 25743413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750900
Alignment:
Q  80 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 179  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  180 tttgaagtcaaagaagttgactccg 204  Q
     ||||| || ||||||| |||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagtggactccg 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16098168 - 16098005
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  16098168 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 16098069  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16098068 tgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 16382536 - 16382699
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  16382536 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16382635  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  16382636 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 16382699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 15078513 - 15078690
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || ||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| | ||||||||    
T  15078513 agactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttca 15078612  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
     |  || || || |||||||||||| | | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15078613 ggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15078690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25655604 - 25655456
Alignment:
Q  37 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || |    
T  25655604 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatc 25655505  T
Q  137 acgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 185  Q
    | || ||||||||||| | ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  25655504 atgtgtttttgagagtgaatctgataactggtgttggtcgtgctttgaa 25655456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23996366 - 23996203
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  23996366 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 23996267  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23996266 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23996203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 18838057 - 18838234
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  18838057 agactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtacatagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 18838156  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || || |||||| | || | || |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  18838157 agttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 18838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Original strand, 1648947 - 1649094
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  1648947 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 1649046  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1649047 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagt 1649094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1640688 - 1640613
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  1640688 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtacgtagcggatccttcacatgt 1640613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Original strand, 21413101 - 21413248
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||      
T  21413101 gttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcagagtagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcata 21413200  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | || ||| |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21413201 tgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 21413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16233341 - 16233167
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  16233341 agactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 16233242  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 200  Q
    ||  || || || || ||||| || || | || |||||| || ||||| ||||| |||||||  | |||||||||    
T  16233241 agttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgttgaagtgtaggaagttgac 16233167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18787768 - 18787702
Alignment:
Q  278 tttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||    
T  18787768 tttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatccttcgcatgt 18787702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 995 - 639
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  995 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcat 896  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  895 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 796  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  795 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 696  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  695 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 64018 - 64374
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64018 aggaccagatattgttcagcagactactgagaaaattaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgt 64117  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  64118 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtga 64217  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  64218 gattcattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgt 64317  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64318 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 64374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 17045071 - 17045427
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17045071 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 17045170  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17045171 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 17045270  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  17045271 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 17045370  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17045371 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 17045427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19106670 - 19106314
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19106670 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgg 19106571  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19106570 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccga 19106471  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  19106470 agtttattggtccatatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 19106371  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19106370 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatctagagtgacgatgt 19106314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20250153 - 20249797
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20250153 aggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 20250054  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20250053 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcgttgaagtcaaagaagttgactccga 20249954  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
     |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20249953 aatttattgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 20249854  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20249853 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 20249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20137081 - 20136725
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20137081 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 20136982  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20136981 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 20136882  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20136881 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgtatcgtgttggtttaccacggcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 20136782  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20136781 gtcgcaacttcggaagtatgtttttgatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 20136725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21747837 - 21747482
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21747837 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgt 21747738  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21747737 agaaa-gatcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccga 21747639  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21747638 gatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 21747539  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21747538 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtaatccaaagtgatgatgt 21747482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 50620307 - 50620656
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50620307 gagattgttcaataaactactgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaag 50620406  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50620407 accttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttat 50620506  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  50620507 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaa 50620606  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50620607 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 50620656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16350655 - 16351011
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350655 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16350754  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16350755 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16350854  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16350855 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 16350954  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  16350955 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagaatgacgatgt 16351011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 33391085 - 33391441
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391085 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 33391184  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33391185 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 33391284  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  33391285 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 33391384  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33391385 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 33391441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 16078708 - 16079045
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16078708 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16078807  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||                   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16078808 ag-------------------gaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 16078888  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16078889 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 16078988  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16078989 gtcgcaactacggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16079045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 51333549 - 51333905
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333549 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 51333648  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51333649 agaaaagatcttgagttccaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 51333748  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  51333749 agttcattggtccgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 51333848  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51333849 gtcgcaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 51333905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21830606 - 21830250
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21830606 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 21830507  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21830506 ggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 21830407  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  21830406 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 21830307  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21830306 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21830250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21837253 - 21836897
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21837253 aggaccagagattgttcaacaaactactgagacagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgt 21837154  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21837153 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 21837054  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  21837053 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 21836954  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21836953 gtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21836897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 19760935 - 19761278
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19760935 gttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 19761034  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19761035 agtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggacc 19761134  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  19761135 gtatcagatatccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtatcgcaacttcgg 19761234  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  19761235 tagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 19761278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16369600 - 16369267
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||| || || |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16369600 aggaccagagattgttcaacaaactattgaaaaggtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgt 16369501  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16369500 aggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcga 16369401  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16369400 ggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 16369301  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatct 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369300 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatct 16369267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 41354525 - 41354881
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354525 aggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 41354624  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41354625 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcga 41354724  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  41354725 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 41354824  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  41354825 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41354881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 136 - 362
Target Start/End: Original strand, 50612602 - 50612828
Alignment:
Q  136 cacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50612602 cacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaa 50612701  T
Q  236 gagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50612702 gagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatcc 50612801  T
Q  336 atctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  50612802 atctcatgtgatccaaagtgatgatgt 50612828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 19664945 - 19665270
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||    
T  19664945 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttg 19665044  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  19665045 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtcc 19665144  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19665145 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 19665244  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  19665245 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 19665270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 326
Target Start/End: Original strand, 20940147 - 20940439
Alignment:
Q  34 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 133  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || |    
T  20940147 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtg 20940246  T
Q  134 accacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcaga 233  Q
    | || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||    
T  20940247 atcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaga 20940346  T
Q  234 aagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
     || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20940347 gagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 20940439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19854604 - 19854279
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  19854604 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 19854505  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||     
T  19854504 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtct 19854405  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  19854404 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgg 19854305  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  19854304 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 19854279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37677328 - 37677027
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattt-ttgagagtcactcat 159  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || ||| ||||| ||||||| |    
T  37677328 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcct 37677229  T
Q  160 gtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgag 259  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||| |||    
T  37677228 ttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagag 37677129  T
Q  260 ttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 359  Q
    |||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||    
T  37677128 ttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatga 37677029  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  37677028 tg 37677027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21163381 - 21163227
Alignment:
Q  208 tttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgt 307  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21163381 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgt 21163282  T
Q  308 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163281 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21163227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 344
Target Start/End: Original strand, 20856839 - 20857155
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| |||||| |    
T  20856839 actacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcagg 20856938  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 227  Q
    |||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| || ||| |    
T  20856939 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 20857038  T
Q  228 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 327  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||     
T  20857039 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 20857138  T
Q  328 ccggatccatctcatgt 344  Q
    || ||||| || |||||    
T  20857139 ccagatccttcgcatgt 20857155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Original strand, 31550292 - 31550578
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  31550292 atgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 31550391  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  31550392 tgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 31550491  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31550492 tggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 31550578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20294660 - 20294374
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  20294660 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 20294561  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  20294560 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 20294461  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20294460 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgat 20294374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 22433192 - 22433528
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  22433192 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttca 22433291  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || ||| ||||||||    
T  22433292 ggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcag 22433391  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22433392 atttcagagagggttgcaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22433491  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22433492 tagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 22433528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Original strand, 20075170 - 20075456
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| | || ||||||| |     
T  20075170 atgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctt 20075269  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||   |||    
T  20075270 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagt 20075369  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  20075370 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcagatccttcgcatgtgat 20075456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Original strand, 20835957 - 20836237
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |  |||     
T  20835957 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggccctta 20836056  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc---aaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    ||||| | || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||| | || |||||    |||||||||||||| |  || |||||    
T  20836057 agttttaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattgg 20836156  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 296  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20836157 tccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 20836237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11382842 - 11382678
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||||||||||| |     
T  11382842 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctt 11382743  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  11382742 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 11382678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41308115 - 41307891
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    ||||    
T  41308115 gttcatcagactacggagaaagtcaaaataataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttg 41308016  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  41308015 agtttcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtcc 41307916  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttgga 243  Q
    ||||||| |||| || || ||||||    
T  41307915 gtatcagatatctgagagggttgga 41307891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244183
Alignment:
Q  72 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 171  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||| || |||| | |||| |||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  172 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcac 271  Q
    |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| |||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  272 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 20244183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 361
Target Start/End: Original strand, 20395194 - 20395404
Alignment:
Q  151 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtgg 250  Q
    ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||    
T  20395194 gtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtgg 20395293  T
Q  251 cgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    | ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |     
T  20395294 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattcc 20395393  T
Q  351 gagtgatgatg 361  Q
    ||| |||||||    
T  20395394 gagggatgatg 20395404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20914493 - 20914316
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  20914493 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttca 20914394  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || ||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20914393 agttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20914316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 20831482 - 20831645
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  20831482 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 20831581  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  20831582 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 20831645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 46518990 - 46518827
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  46518990 gttaagatgattcaggagaagattaagacgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 46518891  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46518890 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46518827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24477020 - 24476927
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  24477020 caccacatctctcgaattttcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccctcgcatgtgattccgagagatgatgt 24476927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Original strand, 21202371 - 21202524
Alignment:
Q  34 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggag 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  | || |||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||| |  || |    
T  21202371 gagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagaaggcagaagagttatcatgataagaggacaaaggatattgagtttcaggttggtg 21202470  T
Q  134 accacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | ||  | ||||||||||| | || | | || |||||||||||| |||||||||    
T  21202471 atcatatgtttttgagagtgaatcctataaccggtgttggacgtactttgaagt 21202524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 102
Target Start/End: Original strand, 22135645 - 22135710
Alignment:
Q  37 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  22135645 aaagttaagatgattcaggggaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataag 22135710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 203
Target Start/End: Original strand, 22142233 - 22142294
Alignment:
Q  142 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22142233 tttttgagagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 22142294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20184456 - 20184364
Alignment:
Q  35 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||  || ||| |||||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  20184456 agaaagtgaagatgatccaagagaagatgtgagtgtctcagagtaggcagaagagttataatgataagaggaggaaagatattgagtttcaag 20184364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Original strand, 17319 - 17665
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  17319 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatc 17418  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17419 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 17518  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17519 cccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 17618  T
Q  316 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17619 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaactgatgatgt 17665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 15154652 - 15155001
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154652 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 15154751  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154752 atcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 15154851  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  15154852 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgcaa 15154951  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15154952 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15155001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 11553095 - 11553451
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11553095 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgc 11553194  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11553195 agaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 11553294  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11553295 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgacgttttccatgt 11553394  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11553395 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 11553451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12687778 - 12687422
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12687778 aggaccagagattgtccaacagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 12687679  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12687678 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 12687579  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  12687578 agtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgcacgacgttttccatgt 12687479  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12687478 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12687422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14954897 - 14954541
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14954897 aggaccagagattgtccagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14954798  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  14954797 agaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaa 14954698  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14954697 agtttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgttttccatgt 14954598  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14954597 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14954541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8198905 - 8198561
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198905 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8198806  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8198805 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8198706  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  8198705 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 8198606  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8198605 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 8198561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8707882 - 8707526
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707882 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8707783  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8707782 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8707683  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  8707682 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 8707583  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8707582 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 8707526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10871272 - 10870916
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871272 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10871173  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10871172 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10871073  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  10871072 ggttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 10870973  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10870972 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 10870916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14332674 - 14332318
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14332674 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 14332575  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14332574 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 14332475  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  14332474 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 14332375  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14332374 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14332318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 15161050 - 15161406
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161050 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15161149  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15161150 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15161249  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  15161250 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15161349  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15161350 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15161406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 11237206 - 11237562
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237206 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 11237305  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11237306 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 11237405  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  11237406 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 11237505  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11237506 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 11237562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 18551751 - 18552107
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551751 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18551850  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18551851 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccga 18551950  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  18551951 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 18552050  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18552051 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 18552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18178019 - 18177663
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178019 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtttagatgattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18177920  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18177919 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 18177820  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  18177819 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 18177720  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18177719 gtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 18177663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14038079 - 14037728
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14038079 cagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 14037980  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14037979 agaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagattt 14037880  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14037879 attggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgc 14037780  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14037779 aacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14037728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14348109 - 14347758
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14348109 cagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 14348010  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14348009 agaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagattt 14347910  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14347909 attggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgc 14347810  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14347809 aacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14347758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 44791344 - 44791688
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791344 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 44791443  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44791444 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccga 44791543  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  44791544 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 44791643  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44791644 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 44791688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 362
Target Start/End: Original strand, 23516768 - 23517118
Alignment:
Q  12 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516768 agagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 23516867  T
Q  112 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 211  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23516868 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 23516967  T
Q  212 ttggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 311  Q
    ||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  23516968 ttggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 23517067  T
Q  312 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  23517068 acttcggaagtatattccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 23517118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13686341 - 13685984
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686341 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 13686242  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13686241 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 13686142  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatg-tcttccatg 304  Q
      || ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||  | | | |||||||    
T  13686141 agttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgcacaacgtttttccatg 13686042  T
Q  305 tgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13686041 tgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 13685984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15204145 - 15203800
Alignment:
Q  17 ttgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15204145 ttgttcagcaaactacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacct 15204046  T
Q  117 tgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15204045 tgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgttggccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggt 15203946  T
Q  217 ccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttc 316  Q
    | ||||||| |  |||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15203945 ctgtatcagattacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 15203846  T
Q  317 ggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  15203845 ggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcgaaagagatgatgt 15203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15624816 - 15624539
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  15624816 gttcatcaaactacttagaaggttaagttgatccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttg 15624717  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  15624716 agtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttc 15624617  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 296  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15624616 atatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 15624539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 12206784 - 12207109
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||||||||| || || || ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  12206784 gttcagcagactacagaaaaggtcaaattgataaaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatctta 12206883  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |    
T  12206884 agtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttc 12206983  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||| ||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12206984 gtaccagatatctgagagagttgcaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 12207083  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  12207084 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 12207109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 15102586 - 15102928
Alignment:
Q  20 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 119  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||    
T  15102586 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttga 15102685  T
Q  120 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 219  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||    
T  15102686 gtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccg 15102785  T
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15102786 tatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 15102885  T
Q  320 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15102886 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 15102928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19147476 - 19147151
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  19147476 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttg 19147377  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19147376 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 19147277  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19147276 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 19147177  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  19147176 aagtatgtagcggatccttcacatgt 19147151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20746875 - 20746550
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  20746875 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttg 20746776  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20746775 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 20746676  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  20746675 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 20746576  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  20746575 aagtatgtagcggatccttcacatgt 20746550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Original strand, 8212154 - 8212437
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  8212154 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 8212253  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  8212254 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 8212353  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8212354 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcaacttcggaagtatgttgcggatccttctcatgt 8212437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 362
Target Start/End: Original strand, 14264270 - 14264571
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| |     
T  14264270 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccta 14264369  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||    
T  14264370 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatatagagt 14264469  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
     || ||  |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  14264470 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcctgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 14264569  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  14264570 gt 14264571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Original strand, 11306289 - 11306589
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  11306289 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 11306388  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||    
T  11306389 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagt 11306488  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  11306489 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgat 11306588  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  11306589 g 11306589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49152559 - 49152224
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  49152559 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttca 49152460  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  49152459 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 49152360  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  49152359 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 49152260  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  49152259 ttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatg 49152224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Original strand, 16072320 - 16072603
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| |     
T  16072320 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactccta 16072419  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| | |  |||    
T  16072420 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagt 16072519  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  16072520 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 16072603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 11388412 - 11388736
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||   |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || | ||    
T  11388412 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatg 11388511  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11388512 agtttcaaga-ggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 11388610  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||    
T  11388611 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 11388710  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  11388711 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 11388736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13665813 - 13665493
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |  ||||    
T  13665813 gttcatcaaactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttg 13665714  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || |     ||    
T  13665713 agtttcaagaggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----cc 13665619  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  13665618 gtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgg 13665519  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  13665518 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 13665493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 16950455 - 16950762
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||    
T  16950455 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatg 16950554  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  16950555 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 16950654  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  16950655 gtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttcgg 16950754  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  16950755 aagtatgt 16950762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21662233 - 21661900
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| || |||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21662233 cagacattgttcaacagactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 21662134  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
     |||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||| | | | || ||||||||||| ||  | || ||||||||  | |||||||| |||    
T  21662133 ggatcttgagtttc---aaggagaccatgtgtttttgagagtcacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaactccgaggttt 21662037  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  |||| |||||    || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |    
T  21662036 attggcccgtatcagatttcgcaaagagttggggcggttgcgtataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcac 21661937  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |||| |  ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21661936 aactacaaaagtatgtttcatatccatctcatgtgat 21661900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 18053937 - 18054244
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  ||||    
T  18053937 gttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttg 18054036  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||||| ||    
T  18054037 agtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggccc 18054136  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  18054137 gtatcagatttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcgg 18054236  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  18054237 aagtatgt 18054244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9596334 - 9596236
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596334 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 35964848 - 35965016
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35964848 cagacattgttcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 35964947  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 179  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  35964948 ggatcttgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactagtgtatgacgtgc 35965016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 14286360 - 14286667
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    || || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||    
T  14286360 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttg 14286459  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||     
T  14286460 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtct 14286559  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||| | ||  ||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14286560 gtatcagatttcatataggattggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 14286659  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  14286660 aagtatgt 14286667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 23199763 - 23200034
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| | ||||| |    
T  23199763 gagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtga 23199862  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgta 254  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||| || | ||    
T  23199863 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacata 23199962  T
Q  255 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
      ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  23199963 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23200034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 23505890 - 23506161
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| | ||||| |    
T  23505890 gagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtga 23505989  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgta 254  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||| || | ||    
T  23505990 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacata 23506089  T
Q  255 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
      ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  23506090 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23506161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6413776 - 6413430
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   |||    
T  6413776 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttg 6413677  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || |||||| |    
T  6413676 agtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttc 6413577  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    | ||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |    
T  6413576 gaatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcag 6413477  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 365  Q
    ||||||||   |||||| || ||||| || | ||| |||||||||||    
T  6413476 aagtatgtagtggatccttcgcatgttattccgagagatgatgtcca 6413430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 145
Target Start/End: Original strand, 11772244 - 11772373
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11772244 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaatgatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacc 11772343  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttt 145  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11772344 ttgagtttcaagaaggagatcatgtatttt 11772373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13021615 - 13021294
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  || ||||||||    
T  13021615 agactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttca 13021516  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||| | |||| || ||   |||||| |||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  13021515 agacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcag 13021416  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13021415 atttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13021316  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |  ||||||  || ||||||||    
T  13021315 tagcggatctttcacatgtgat 13021294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14130096 - 14129795
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||       
T  14130096 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccga 14129997  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||| |||| ||  ||||    
T  14129996 tgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagt 14129897  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  14129896 tggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 14129797  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  14129796 gt 14129795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14433914 - 14433613
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || |||||||| ||||| ||||       
T  14433914 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagttactccga 14433815  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||| |||| ||  ||||    
T  14433814 tgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcatatagagt 14433715  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  14433714 tggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 14433615  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  14433614 gt 14433613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12455960 - 12455640
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||    
T  12455960 agactactgagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttca 12455861  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |  || ||||||| |||||||    
T  12455860 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatcag 12455761  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| |||||| |||| ||||| ||  || |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12455760 atttcagagagagttagaacagtggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcggaagtatg 12455662  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  12455661 tagcggatccttcacatgtgat 12455640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 1391 - 1698
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||    || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |  ||||    
T  1391 gttcatcagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttg 1490  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || || ||| ||| ||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||     
T  1491 agtttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtct 1590  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | | |||||| ||||||||  |||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  1591 gtatcagatttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagcttcgg 1690  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||| ||||    
T  1691 aaggatgt 1698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14936590 - 14936443
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || || |    
T  14936590 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 14936491  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14936490 tgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 14936443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 326
Target Start/End: Original strand, 26288063 - 26288327
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || || ||||| || || || || || ||| |||| || |||| |     
T  26288063 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactccta 26288161  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||    
T  26288162 tgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaacagtggcatatagagt 26288261  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    ||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  26288262 tggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgaaaatatgt 26288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Original strand, 26118596 - 26118812
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaa--atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 123  Q
    |||||||||||||||| | | ||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||    
T  26118596 agactactgagaaagtcaggttgat--aagagaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagttt 26118693  T
Q  124 caagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 223  Q
    || || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  26118694 caggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatc 26118793  T
Q  224 agttatcagaaagagttgg 242  Q
    || | ||||| ||||||||    
T  26118794 agatttcagatagagttgg 26118812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 12368603 - 12368766
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  || || ||||    
T  12368603 gttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgactttcaggttggtgatcacg 12368702  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||||||||| | || ||||||  ||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  12368703 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccagtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12368766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4440185 - 4440008
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  4440185 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 4440086  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
     |  || || || || ||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4440085 ggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 4440008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Original strand, 12254326 - 12254387
Alignment:
Q  301 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12254326 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 12254387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 41144 - 41327
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || | |||||  ||| |||||||||| || || | | |||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  41144 cagagattgttcagcagacgaccgagaaggtcaaaacgattcgggaggaaatgaaagcatcacaaattagacagaagagctatcatgataaacgaagaaa 41243  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 194  Q
    | |  | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  41244 ataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgctttgaagtctaagaa 41327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7824143 - 7823980
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  7824143 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7824044  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  7824043 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 7823980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15364183 - 15364036
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  || || || |    
T  15364183 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 15364084  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | ||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15364083 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 15364036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 27107801 - 27107964
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  27107801 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27107900  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  27107901 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 27107964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 203
Target Start/End: Original strand, 21674562 - 21674723
Alignment:
Q  42 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgta 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |||| |||||||  || || || ||     
T  21674562 taagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgaatttcaagttggtgatcatgtg 21674661  T
Q  142 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21674662 tttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcc 21674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45146812 - 45146652
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||| ||||||    
T  45146812 agactacggaaaatgttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtaaatagaagagttatcattataagagtaggaaggacattgtgtttca 45146713  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    ||  || || || || ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45146712 agttggtgatcatgtgtttttgagaatgaatcatg-gactggtgttggacgtgctttgaagt 45146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15340569 - 15340454
Alignment:
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  15340569 attggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcac 15340470  T
Q  311 aacttcggaagtatgt 326  Q
    | ||||||||||||||    
T  15340469 agcttcggaagtatgt 15340454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12193811 - 12193654
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| | || ||||||||||||| |||| | || || ||  |||| ||||| |    
T  12193811 actacggagaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgttaagaggaggaatgacattgattttcagg 12193712  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 185  Q
      || || || ||||||||||| || | || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  12193711 ttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaa 12193654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17923938 - 17923862
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| ||||||||||    
T  17923938 agactacggaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagaataggcagaagagttgtcatgataag 17923862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Original strand, 26118818 - 26118896
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26118818 caccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 26118896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 344
Target Start/End: Original strand, 15479338 - 15479447
Alignment:
Q  235 agagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 334  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||    
T  15479338 agagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacatgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatc 15479437  T
Q  335 catctcatgt 344  Q
    | || |||||    
T  15479438 cttcgcatgt 15479447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 183
Target Start/End: Original strand, 17145288 - 17145428
Alignment:
Q  43 aagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtat 142  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  ||||  || || |    
T  17145288 aagatgattcaagaaaatatgaaagcttctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggagctcatgtgt 17145387  T
Q  143 ttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 183  Q
    |||| ||||| | | |||| || ||||||||||||| ||||    
T  17145388 ttttaagagtgaataatgtaaccggtgttggacgtgttttg 17145428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5764758 - 5764672
Alignment:
Q  18 tgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| || ||||| |   | || ||||||||||||| ||||||    
T  5764758 tgttcaacagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaggatgaaggcatcgcaaatcaggcagaagagttatcatggtaagcg 5764672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12457002 - 12456940
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 123  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12457002 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13378955 - 13378879
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  13378955 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagcgttattatgataag 13378879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15340654 - 15340590
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  15340654 atgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttca 15340590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20467041 - 20466941
Alignment:
Q  23 agcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 122  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||  || |||||| | || || ||||||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  20467041 agcagactacaga-aaggttatgatgattcaggagaagatgaaagaatctcagagtaggcagaatagttatcatgataagcggaggaaggatattgagtt 20466943  T
Q  123 tc 124  Q
    ||    
T  20466942 tc 20466941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13353275 - 13353247
Alignment:
Q  159 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353275 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 13353247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 362
Target Start/End: Original strand, 13634038 - 13634070
Alignment:
Q  330 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13634038 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 13634070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 5977
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6333 aggaccagagattgtgcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgc 6234  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6233 aggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgtttttaagagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 6134  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6133 gatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatggtggcgtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 6034  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6033 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 5977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 33560 - 33916
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33560 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 33659  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33660 aggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 33759  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33760 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 33859  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33860 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 33916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8915 - 8559
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8915 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8816  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8815 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccga 8716  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  8715 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgt 8616  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8615 gtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 8559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 4392 - 4748
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 4491  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4492 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccga 4591  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4592 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgt 4691  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4692 gtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 4748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 180536 - 180180
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180536 aggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 180437  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  180436 agaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttgactccga 180337  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  180336 gatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaacagtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaattttcatgatgtctttcaagt 180237  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  180236 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgttgatgt 180180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 810 - 1165
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  810 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgt 909  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgt-tttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 1008  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||  || |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  1009 gatttattggtccgtatcagatataagaaaaagatggaaaggtggaatatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgt 1108  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 127186 - 127542
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  127186 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 127285  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  127286 aggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 127385  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  127386 gatttattgatccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtgtttcatgt 127485  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127486 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 127542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 219404 - 219760
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219404 aggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 219503  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  219504 aggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccga 219603  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  219604 ggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 219703  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  219704 atcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 219760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 229362 - 229006
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  229362 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgt 229263  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  229262 agaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 229163  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||    
T  229162 gatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgcacgatatgtttcatgt 229063  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  229062 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 229006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 33016 - 33179
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  33016 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 33115  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33116 tgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 33179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6334 - 5986
Alignment:
Q  14 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 113  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6334 agattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaaga 6235  T
Q  114 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6234 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcacacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttatt 6135  T
Q  214 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaac 313  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  6134 ggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgtcgcaac 6035  T
Q  314 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6034 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 5986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 1524 - 1831
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |  ||||    
T  1524 gttcatcagactagagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttg 1623  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| |  | ||| || ||||||  |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  1624 agtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtcc 1723  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1724 gtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 1823  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  1824 aagtatgt 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22993 - 22816
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  22993 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 22894  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22893 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 22816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Original strand, 32744 - 33095
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32744 cagaaattgttcaacaaactactaagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 32843  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32844 agatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagattt 32943  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32944 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgc 33043  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33044 aacttcggaagtatgttacggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 33095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 356
Target Start/End: Original strand, 109798 - 110148
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109798 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 109897  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  109898 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 109997  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  109998 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgt 110097  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  110098 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccctctcatgtaattcagagtga 110148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 96009 - 96345
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  96009 agactacggagaaagttagggtgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttca 96108  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || || ||||| ||||||    
T  96109 ggaaggtgaccatgtttttttgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcag 96208  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  96209 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 96308  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  96309 tacctgatccttcacatgttattccgagagatgatgt 96345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 112823 - 112540
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  112823 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 112724  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||  | ||    
T  112723 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 112624  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  112623 gggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 112540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43473 - 43123
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  43473 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgc 43374  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43373 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 43274  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  43273 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 43174  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43173 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 43123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8797 - 8448
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8797 gagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaag 8698  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  8697 atcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 8598  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  8597 tggtccgtatcagatattggaaagagttggaagggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaa 8498  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  8497 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgaaatctagagtgacgatgt 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13966 - 13834
Alignment:
Q  25 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 124  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  13966 cagactactaagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttt 13867  T
Q  125 aagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 157  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13866 aggaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 13834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 50556 - 50830
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  50556 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 50655  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||  | ||    
T  50656 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 50755  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||||| ||||||||    
T  50756 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgtagttgcggaagtatgtaccggatcc 50830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 106594 - 106757
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  106594 gttaggatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 106693  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| |||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||    
T  106694 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcc 106757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6691 - 6335
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6691 aggaccagagattgttcagcaaactacagagaaggttaagatgattcaagagtagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgt 6592  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6591 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 6492  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||    
T  6491 gatttattggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggtatatcgagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgt 6392  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  6391 gtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatcctaggtgatgatgt 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Original strand, 681 - 1036
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  681 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 780  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  781 aggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttt-gagagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 879  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  880 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtttcatgt 979  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  980 ggagcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtggtgatgt 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5540 - 5184
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  5540 aggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgc 5441  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5440 aggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccga 5341  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  5340 gatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 5241  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5240 gtcgcaacttcgtaattatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1452 - 1102
Alignment:
Q  12 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 111  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||    
T  1452 agagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaa 1353  T
Q  112 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1352 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 1253  T
Q  212 ttggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 311  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||    
T  1252 ttgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttttatgtgttgca 1153  T
Q  312 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1152 acttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7689 - 7340
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7689 gagactgttcaacagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaag 7590  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  7589 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 7490  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  7489 tggtccgtatcagatattggagagagttggaacggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaa 7390  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7389 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9662 - 9306
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662 aggaccagagattgtttaacaaactaccgagtaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 9563  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9562 aggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactccta 9463  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||    
T  9462 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtttcatgt 9363  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9362 gtcgcaacttcgaaagtatgttctagatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 9306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15196 - 14840
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  15196 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacatatgagttatcatgataagctt 15097  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15096 aggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccga 14997  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14996 ggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 14897  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14896 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagagatgatgt 14840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17284 - 16950
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17284 actactgtgaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaag 17185  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17184 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagat 17085  T
Q  228 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17084 atcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 16985  T
Q  328 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16984 ctggatgcatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15804 - 15456
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  15804 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaat 15705  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15704 acctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgacagtcattcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttat 15605  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  15604 tggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcgagtaggtttaccaccacat-tttcgaatttgcacgatgtgtttcatgggtcgcaa 15506  T
Q  313 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15505 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 15456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15967 - 15832
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  15967 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaat 15868  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 148  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15867 acctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 377
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  733 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 634  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  633 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 534  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 305  Q
     ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  533 aattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 434  T
Q  306 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  433 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 61 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 27930
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||  |    
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 27932  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  27931 gt 27930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 63 - 362
Target Start/End: Original strand, 26 - 325
Alignment:
Q  63 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  26 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtg 125  T
Q  163 actggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttg 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  126 actggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtga 225  T
Q  263 gattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  226 gtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14350 - 14002
Alignment:
Q  14 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 113  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14350 agattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagaga 14251  T
Q  114 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14250 tcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttatt 14151  T
Q  214 ggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaac 313  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||    
T  14150 ggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaac 14051  T
Q  314 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||| ||||||||| | | ||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  14050 ttccgaagtatgtacagaatccattccatgtgatccaaactgatgatgt 14002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31700 - 31373
Alignment:
Q  35 agaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggaga 134  Q
    ||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||| |    
T  31700 agaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggata 31601  T
Q  135 ccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaa 234  Q
     || || ||| ||||||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| ||     
T  31600 tcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgat 31501  T
Q  235 agagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatc 334  Q
    ||  ||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31500 aggtttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttttttgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatc 31401  T
Q  335 catctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31400 cttcgcatgttattccgagagatgatgt 31373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17761 - 17660
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17761 aggaccagagattgttcagcagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttataatgataagcgt 17662  T
Q  106 ag 107  Q
    ||    
T  17661 ag 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 42 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 162396 - 162076
Alignment:
Q  42 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgta 141  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  162396 taagatgatttaagaaagagtgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgta 162297  T
Q  142 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttg 241  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  162296 tttttgagagtcactcctatgactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttg 162197  T
Q  242 gaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctca 341  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  162196 gaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatgttccggatccatccca 162097  T
Q  342 tgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  162096 tgtgatccaaagtgatgatgt 162076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 448373 - 448022
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  448373 cagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaa 448274  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  448273 agaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactattgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgaggttt 448174  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| | | ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  448173 attggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgc 448074  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  448073 aacttcggaagtattttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 448022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 90932 - 91239
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  90932 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 91031  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| |  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||    
T  91032 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtcc 91131  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     ||| || |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  91132 atattagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactgcgg 91231  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  91232 aagtatgt 91239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 78636 - 78813
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||  |||| ||||| || || |||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  78636 agactacggaaaaggttatgatgattcagtagaagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 78735  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || || ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  78736 agttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 78813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 175427 - 175352
Alignment:
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaag 236  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  175427 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaag 175352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4329 - 3995
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  4329 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaag 4230  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 227  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  4229 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagat 4130  T
Q  228 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 327  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4129 atcagaaaggattggaacggtggcgtatcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatttgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 4030  T
Q  328 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4029 ccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 3995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 350
Target Start/End: Original strand, 26530 - 26864
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  26530 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagacc 26629  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26630 ttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattgg 26729  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  26730 cccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtttgatgtgtcgcaactt 26829  T
Q  316 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 26864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 195703 - 196045
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  195703 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 195802  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  195803 agtttcaggagggtgatcatgt-tttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtcc 195901  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  195902 gtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 196001  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  196002 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 196045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 148834 - 148551
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| || || || |||||| ||||||| |||| |     
T  148834 atgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctgagagttactccta 148735  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  148734 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagagggttggaacagtggcatacagagt 148635  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  148634 aggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 148551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 362
Target Start/End: Original strand, 68582 - 68783
Alignment:
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  68582 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagt 68681  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  68682 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 68781  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  68782 gt 68783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 121971 - 122134
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  121971 gttaacatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 122070  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  122071 tatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 122134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 180209 - 180147
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  180209 gttaagatgattcaggagaagatgaagtcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 180147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 15079 - 15422
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15079 gttcaacaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 15178  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||     
T  15179 agtttcaggaaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtct 15278  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15279 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15378  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15379 aagtatgtttcggatccatctcatgtcatcccaagagatgatgt 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7258 - 6900
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7258 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 7159  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgt-atttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccg 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7158 ggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccg 7059  T
Q  205 agatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgca-tctttcgaatttgcatgatgtcttccat 303  Q
    |  || |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||  | || ||||||    
T  7058 aagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgcacaacgttttccat 6959  T
Q  304 gtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6958 gtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 6900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 362
Target Start/End: Original strand, 16462 - 16808
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16462 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagacc 16561  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  16562 ttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactgg 16661  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |   |||||    
T  16662 tccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatatgttccatgtattaaaactt 16761  T
Q  316 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16762 cagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3115
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  3437 actactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagtttcaag 3338  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 227  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  3337 aaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgtatcagat 3238  T
Q  228 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 327  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3237 atttgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 3138  T
Q  328 ccggatccatctcatgtgatcca 350  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  3137 ccggatccatcttacgtgatcca 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 112327 - 111984
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  112327 gttcaacaaactattgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttg 112228  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  112227 agtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtcc 112128  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  112127 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 112028  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  112027 aagtatgtttcggatccatctcatgtgatcccaagagatgatgt 111984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 362
Target Start/End: Original strand, 203510 - 203811
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||    
T  203510 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagagtcactcttg 203609  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  203610 tgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggcatatagagt 203709  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
     || ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  203710 gggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtattggatccatcgcatgtgattccgagggatgat 203809  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  203810 gt 203811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 323010 - 322703
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  323010 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 322911  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  322910 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 322811  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| ||||||| || ||||||||  |||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  322810 atatcagatatcagagagggttggaacaatggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 322711  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  322710 aagtatgt 322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 117874 - 117532
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  117874 gttcatcatactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 117775  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  117774 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 117675  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  117674 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 117575  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 361  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| |||||||    
T  117574 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 117532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 386118 - 385797
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  386118 agactacggagaaggttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttca 386019  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
    ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||| |  ||| ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||| | || |||    
T  386018 agagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccag 385919  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     |||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  385918 atatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 385819  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  385818 tagcggatccttcgcatgtgat 385797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 1
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  311 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgagtcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatc 212  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    ||||||||||||| ||  | || || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  211 ttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagagtcaatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattgg 112  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  111 tccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggcatatcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 12  T
Q  316 cggaagtatgt 326  Q
    |||||||||||    
T  11 cggaagtatgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 968
Alignment:
Q  28 actactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  1301 actactgagaaggttaagacgatt-aagaaaaagtgaaatcgtcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaag 1203  T
Q  128 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagtt 227  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1202 aaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggat 1103  T
Q  228 atcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgtt 327  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1102 atcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgtaacgcaacttcgaaagtatgtt 1003  T
Q  328 ccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1002 ctggatccatcttatgtgatccaaggtgatgatgt 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 252 - 590
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||    
T  252 cagaaattgtacagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaa 351  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  352 agacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcaatcctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagattt 451  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  452 attggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgc 551  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 349  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  552 aacttcggaagtatgttatggatccatctcatgtgatcc 590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8109 - 7855
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8109 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 8010  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8009 aggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 7910  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7909 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 7855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 116905 - 117233
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  116905 gttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttg 117004  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  117005 agtttcaagaaagagaacaagtatttttgagagtcactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtcc 117104  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  117105 gtatcaaatatcagaaagaattgtaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcgg 117204  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  117205 aagtatgtttcagatctatctcatgtgat 117233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 98300 - 98137
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || ||||    
T  98300 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 98201  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  98200 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 98137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49805 - 49506
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49805 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaag 49706  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49705 accttgagtttcaagaaggagaccacatattttttagagtcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttat 49606  T
Q  213 tggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaa 312  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  49605 tggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaa 49506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22186 - 21932
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22186 aggaccagagattgttcagcagactattgagaaagttaaaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgc 22087  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22086 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 21987  T
Q  206 gatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21986 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Original strand, 16408 - 16759
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16408 cagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggga 16507  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
     ||||||   |||||||||||||| || |||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16508 ggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggtcactccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagattt 16607  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |  || || ||| |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  16608 attggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggcgtatcatgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtttcatgtgtcgc 16707  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16708 aacttcggaagtatgttcgggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Original strand, 12969 - 13320
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12969 cagaaattcttcagcaaactactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 13068  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  13069 agatcttgaatttcaagaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagattt 13168  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||  |||| || ||| |||| || |||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13169 attagttcgtatcagatatcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccacaacttttgaatttacatgatgtgtttcatgtgtcgc 13268  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  13269 aacttcagaagtatttttcggatccatctcatatgatcctaagagatgatgt 13320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1214 - 886
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||  ||| ||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1214 gttcagcaaactactgagaagattaagtggatccaagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 1115  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1114 agtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtcc 1015  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||    
T  1014 atatcagatatcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaactttgg 915  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  914 aagtatgtttcggatccatctcatgtgat 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 25719 - 26047
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||    
T  25719 gttcagcaaactactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttg 25818  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | |||| ||  |||||||||||    
T  25819 agtttcaggaaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtcc 25918  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  25919 gtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgg 26018  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26019 aagtatgtttcggatccatctcatgtgat 26047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 142 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17140 - 16920
Alignment:
Q  142 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||     
T  17140 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagttt 17041  T
Q  242 gaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctca 341  Q
     ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17040 taacggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatttca 16941  T
Q  342 tgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16940 tgtgatccagagtgatgatgt 16920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7708 - 7522
Alignment:
Q  14 agattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7708 agattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaaga 7609  T
Q  114 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608 tcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 767 - 985
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  767 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 866  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 205  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  867 agaaaagatcttgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccga 966  T
Q  206 gatttattggtccgtatca 224  Q
      || ||||||||||||||    
T  967 agttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9284 - 9047
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9284 cagaaattgttcaacaaactgctgagaaggttaagataatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaa 9185  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184 agaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 9085  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggt 248  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9084 attggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggt 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7033 - 6940
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7033 caccgcatgtttcgaatttgcatgatgtgtttcaagtgtcacaacttagaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 6940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 203
Target Start/End: Original strand, 351 - 517
Alignment:
Q  37 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  || || |    
T  351 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatc 450  T
Q  137 acgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | || || |||||||| | || ||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  451 atgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 5588 - 5918
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  5588 attgttcaacaaacaacagagaaggttaagttgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatc 5686  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| |||| |||    
T  5687 ttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatgg 5786  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
    | |||||||  | ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  5787 ttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcgtatagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacat 5886  T
Q  316 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5887 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 25068 - 25399
Alignment:
Q  16 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 115  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||| | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  25068 attgttcaccagactacagaaaaggttaagctaataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatc 25167  T
Q  116 ttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgg 215  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  25168 ttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattgg 25267  T
Q  216 tccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
      |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25268 ctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 25367  T
Q  316 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25368 cggaagtatgtatcggatccatcacatgtgat 25399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 220
Target Start/End: Original strand, 16213 - 16372
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| | || |||||||  || || || || ||||| || || | || ||    
T  16213 atgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatatagactttcaagttggggatcatgtgtttttaagggtgaatcctg 16312  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 220  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  16313 tgaccggtgtttgtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgttttattggaccgt 16372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 344
Target Start/End: Original strand, 10774 - 11064
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10774 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagagtc 10873  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||| ||||| |    
T  10874 actcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggcat 10973  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |  |||| |  ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  10974 atagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgt 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26448 - 26132
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||    
T  26448 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttg 26349  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26348 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 26249  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26248 gtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 26149  T
Q  319 aagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||||  |||||||    
T  26148 aagtatgtagcggatcc 26132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Original strand, 86496 - 86832
Alignment:
Q  11 cagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  86496 cagacatttttcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaa 86595  T
Q  111 agatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 210  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  ||||| |||| |||    
T  86596 ggatcttgagtttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggttt 86695  T
Q  211 attggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgc 310  Q
    ||||| ||||||||  | || |||||||||||  |||| |||||  |||| || ||| ||||||| ||||||||  | |||||||| || |||||||| |    
T  86696 attggcccgtatcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaactttcgaacctacatgatgtgtttcatgtgtcac 86795  T
Q  311 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  86796 aacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgat 86832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 13901 - 14244
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  13901 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 14000  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| || || || || ||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||    
T  14001 agtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtcc 14100  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14101 gtatcagatatcagaaaggattggaacagtggcatatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 14200  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  14201 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 14244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Original strand, 4960 - 5224
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4960 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 5059  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || |  || || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  5060 ggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 5159  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgca 290  Q
     ||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||    
T  5160 atatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 47430 - 47123
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  47430 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttg 47331  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||| || |||| | | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  47330 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtcc 47231  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47230 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 47131  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  47130 aagtatgt 47123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 344
Target Start/End: Original strand, 10090 - 10408
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10090 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 10189  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||||||    
T  10190 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatcag 10289  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
       ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  10290 agttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 10389  T
Q  326 ttccggatccatctcatgt 344  Q
    | |||||||| || |||||    
T  10390 taccggatccttcgcatgt 10408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 79
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |  ||||    
T  404 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttg 305  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  304 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 205  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  204 gtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 105  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    || |||||  ||||||| || |||||    
T  104 aaatatgtagcggatccttcgcatgt 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27825 - 27500
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  27825 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 27726  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  27725 agtttcaggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27626  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    |||| || ||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  27625 gtataagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 27526  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  27525 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 27500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 1149 - 1491
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  1149 gttcatcagactacgaagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 1248  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||| ||| || | |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1249 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccga-agttattggtcc 1347  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||   ||| || ||   ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1348 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 1447  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  1448 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4181 - 3874
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  4181 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttg 4082  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4081 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 3982  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3981 atatcagatatctgagagtgttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 3882  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  3881 aagtatgt 3874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 28805 - 29076
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28805 gagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtca 28904  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgta 254  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| | || || |||||||| || ||||| ||    
T  28905 ctcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcata 29004  T
Q  255 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
      |||| || |   || | ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  29005 tagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 29076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 40796 - 41067
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40796 gagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtca 40895  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgta 254  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| | || || |||||||| || ||||| ||    
T  40896 ctcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcata 40995  T
Q  255 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
      |||| || |   || | ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  40996 tagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 41067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20247 - 19973
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| |     
T  20247 atgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactccta 20148  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||| ||| ||||    
T  20147 tgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatacagagt 20048  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20047 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 19973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 13362 - 13704
Alignment:
Q  20 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 119  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  13362 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 13461  T
Q  120 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 219  Q
    |||||| || || || || |||||| | ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  13462 gtttcaggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 13561  T
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13562 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 13661  T
Q  320 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  13662 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 13704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 17132 - 17474
Alignment:
Q  20 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 119  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  17132 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 17231  T
Q  120 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 219  Q
    |||||| || || || || |||||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  17232 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 17331  T
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17332 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 17431  T
Q  320 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  17432 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 17474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 21671 - 21987
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  21671 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 21770  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||    
T  21771 agtttcaagagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtcc 21870  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    |||| || |||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21871 gtataagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21970  T
Q  319 aagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||||  |||||||    
T  21971 aagtatgtagcggatcc 21987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26091 - 26004
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26091 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 18537 - 18880
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  18537 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 18636  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||      
T  18637 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggttt 18736  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18737 gtatcagatatcagagagggttagaacagtggcatacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 18836  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  18837 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatgt 18880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Original strand, 3637 - 3698
Alignment:
Q  301 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  3637 catgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatgt 3698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3057 - 2750
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    || || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  3057 gttcatcagacaacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 2958  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |  || ||||||||    
T  2957 agtttcaagagggatatcatgtatttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtcc 2858  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2857 gtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 2758  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  2757 aagtatgt 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 13189 - 13364
Alignment:
Q  13 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 112  Q
    |||||||||||||| || || || || || || ||||||| ||||| ||||||||| || || ||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||     
T  13189 gagattgttcagcaaacgaccgaaaaggtcaaaatgattcgagagagaatgaaagcatcacaaagtagacagaagagctatcatgataaacgaaggaaat 13288  T
Q  113 atcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc 188  Q
       | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  13289 cattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcaatccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtc 13364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 7078 - 7352
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| || || ||| |||| || |||| |     
T  7078 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactccta 7177  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  7178 tgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcttacagagt 7277  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  7278 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatcc 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5056 - 4760
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  5056 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 4957  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||    
T  4956 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtcc 4857  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaactt 315  Q
    |||| || |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4856 gtataagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 4760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 281
Target Start/End: Original strand, 58448 - 58668
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  58448 atgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactcatg 58547  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||||| |||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||  ||||    
T  58548 tgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatagagt 58647  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttc 281  Q
     || ||| |||||||||||||    
T  58648 gggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19419 - 19120
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  19419 agactacagagaaagtcaagatgatcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttca 19320  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  19319 ggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcag 19220  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     |||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19219 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 59042 - 59100
Alignment:
Q  289 catgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  59042 catgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggatgtatgtttcggatccatctcatgtgat 59100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 9761
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |     | ||    
T  10099 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtg 10005  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10004 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 9905  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9904 ttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 9805  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  9804 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 9761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14391 - 14049
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||    
T  14391 gttcatcagactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcatagaaaggcccttg 14292  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |    
T  14291 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactccgaagtttatcggttc 14192  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    |||  || |||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  14191 gtactagatatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 14093  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  14092 aagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagggatgatgt 14049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 42333 - 42676
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  42333 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 42432  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  42433 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 42532  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42533 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 42632  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  42633 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 42676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 47399 - 47742
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  47399 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 47498  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||  ||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  47499 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 47598  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47599 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 47698  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  47699 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 47742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2252
Alignment:
Q  145 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatc 223  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2330 ttgagagtcactctagtgataggtgttggacgtgcattgaaatcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtatc 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11193 - 10851
Alignment:
Q  20 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 119  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  11193 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 11094  T
Q  120 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 219  Q
    |||||| || || || || |||||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  11093 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 10994  T
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10993 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 10894  T
Q  320 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  10893 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 400 - 715
Alignment:
Q  20 ttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 119  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  400 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 499  T
Q  120 gtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccg 219  Q
    |||||| || || || || |||||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||    
T  500 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 599  T
Q  220 tatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgga 319  Q
    |||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  600 tatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 699  T
Q  320 agtatgttccggatcc 335  Q
    |||||||  |||||||    
T  700 agtatgtagcggatcc 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 7831 - 7994
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  || || || |    
T  7831 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7930  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7931 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 7994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27531 - 27207
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |  ||||    
T  27531 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtaggaaggc-cttg 27433  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    | |||||||| ||| | || |||||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  27432 aatttcaagagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27333  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27332 gtatcagatatcagagagggttggaaccgtggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 27233  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    || |||||  ||||||| || |||||    
T  27232 aaatatgtagcggatccttcgcatgt 27207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4191 - 3872
Alignment:
Q  25 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 124  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  4191 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 4092  T
Q  125 aagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 224  Q
    |||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||    
T  4091 aagatggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatca 3992  T
Q  225 gttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 324  Q
    | |||| || || |||||||| ||||| |||  |||||  ||  | || |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3991 gatatctgagagggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 3892  T
Q  325 gttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  3891 gtagcggatccttcgcatgt 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6483 - 6164
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6483 agactactgagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 6384  T
Q  126 agaaggagaccacgtattt-ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 224  Q
     ||||| ||||| || |||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| |||||    
T  6383 ggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatca 6284  T
Q  225 gttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 324  Q
    | | ||||||||| ||||||| ||||| ||  || |||| ||  || | | |||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||    
T  6283 gatttcagaaagatttggaactgtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtat 6184  T
Q  325 gttccggatccatctcatgt 344  Q
    || || ||||| || |||||    
T  6183 gtaccagatccttcgcatgt 6164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 344
Target Start/End: Original strand, 14257 - 14576
Alignment:
Q  25 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 124  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||     
T  14257 cagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttt 14356  T
Q  125 aagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 224  Q
    | || || || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  14357 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 14456  T
Q  225 gttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 324  Q
    | | ||||| || |||||||| ||||| ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14457 gatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtat 14556  T
Q  325 gttccggatccatctcatgt 344  Q
    || |||||||| || |||||    
T  14557 gtaccggatccttcgcatgt 14576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 344
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9202
Alignment:
Q  181 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatcttt 280  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||   |||||| ||  |||| |||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  281 cgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 9202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40045 - 39702
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||    
T  40045 gttcatcagactaacgagaaagtcaagattataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttg 39946  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  39945 agtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 39846  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||| | |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  39845 gtatccgatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgg 39746  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| || | ||| ||||||||    
T  39745 aagtatgtagcggatccttctcatgttattccgagagatgatgt 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 51863 - 52170
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  51863 gttcatcaaactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 51962  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  51963 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtcc 52062  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  52063 atatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 52162  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  52163 aagtatgt 52170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37508 - 37201
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |   |||    
T  37508 gttcatcagactacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattg 37409  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||   |||| || || ||| | |||||||| | | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  37408 agtttcaagggagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtct 37309  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  37308 atatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgttacatgtctcgcaacttcgg 37209  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  37208 aagtatgt 37201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 38180 - 38400
Alignment:
Q  25 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  ||||||||||    
T  38180 cagactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 38279  T
Q  125 aagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatca 224  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  38280 aagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatca 38379  T
Q  225 gttatcagaaagagttggaac 245  Q
    | |||| || || ||||||||    
T  38380 gatatctgagagggttggaac 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 245
Target Start/End: Original strand, 27383 - 27563
Alignment:
Q  65 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgac 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| | ||||    
T  27383 aagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgac 27482  T
Q  165 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaac 245  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||    
T  27483 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaac 27563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 462 - 172
Alignment:
Q  54 agagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||     
T  462 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttttctgagggtt 363  T
Q  154 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgt 253  Q
    |||| | |||| ||| | |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |    
T  362 actcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaactgtggcat 263  T
Q  254 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |  ||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  262 atagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Original strand, 25907 - 26190
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| ||||||| |||| |     
T  25907 atgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactccta 26006  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  26007 tgacgggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagt 26106  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  26107 gggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaacttcggaaatatgtagcggatccttcgcatgt 26190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16940 - 16654
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  16940 atgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 16841  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||  ||||| ||  | ||    
T  16840 tgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatagtgt 16741  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16740 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 16654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 1211 - 1485
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| |     
T  1211 atgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactccta 1310  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||   | |    
T  1311 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcataaaaaat 1410  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1411 aggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 326
Target Start/End: Original strand, 5956 - 6220
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  || || ||| |||| || |||| |     
T  5956 atgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggttactccta 6055  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  6056 tgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcatatagagt 6155  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
     || ||  |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6156 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgt-tttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 5002 - 5309
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  5002 gttcatcagaccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 5101  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||| |||||| | |||| ||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5102 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttc 5201  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| ||||  | || ||||||||  |||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5202 gtatcagatatctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 5301  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  5302 aagtatgt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 344
Target Start/End: Original strand, 49214 - 49532
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49214 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 49313  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
    ||| || || || || ||| |||| |||| || | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  49314 agagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 49413  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49414 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagcttcggaagtatg 49513  T
Q  326 ttccggatccatctcatgt 344  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  49514 tagcggatccttcgcatgt 49532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4717
Alignment:
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgca 311  Q
     || ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatctgtcgca 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 362
Target Start/End: Original strand, 36974 - 37089
Alignment:
Q  247 gtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtga 346  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36974 gtggcgtatctagttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctgatgtga 37073  T
Q  347 tccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||| |||||||||    
T  37074 tccagaatgatgatgt 37089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 125
Target Start/End: Original strand, 4441 - 4560
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4441 aggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 4540  T
Q  106 agaaaagatcttgagtttca 125  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4541 aggaaagatctcgagtttca 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 326
Target Start/End: Original strand, 18993 - 19045
Alignment:
Q  274 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18993 catctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 19045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 59024 - 58972
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 107  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  59024 gagaagatgaaagcgtcgtagagtagacaaaagcgttatcatgatcagcgtag 58972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 362
Target Start/End: Original strand, 57859 - 58159
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||       
T  57859 atgaaagcgtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 57957  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||||||| ||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| ||  ||||    
T  57958 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagt 58057  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  58058 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 58157  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  58158 gt 58159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 49033 - 49376
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  49033 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 49132  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    |||||||||| ||| | || || ||| ||||||| || | | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  49133 agtttcaagagggaaatcatgtgtttctgagagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtcc 49232  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| | ||| |||  ||| || ||  |||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  49233 gtatcagatatctgagagggttggaacagcggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 49332  T
Q  319 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  49333 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 49376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 61220 - 61556
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  61220 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 61319  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  61320 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 61419  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     ||||  |||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  61420 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 61519  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  61520 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 61556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 52186 - 52522
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  52186 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 52285  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  52286 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 52385  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     ||||  |||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  52386 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 52485  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  52486 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 52522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Original strand, 67608 - 67908
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  67608 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 67707  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || |||||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  67708 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 67807  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     ||||  |||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  67808 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 67907  T
Q  326 t 326  Q
    |    
T  67908 t 67908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 792 - 509
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||| |     
T  792 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagttactccta 693  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| ||  |||| || || || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||    
T  692 tgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagtggcttacagagt 593  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  592 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcggaacttccaaagtatgtagcggatccttcacatgt 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19113 - 18830
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |     
T  19113 atgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactccta 19014  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || |||||||| || ||||||||  ||||    
T  19013 tgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagt 18914  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
     || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| || |||||    
T  18913 gggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattgtggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 18830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23275 - 23094
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |     
T  23275 atgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactccta 23176  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttgg 242  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || ||||||||    
T  23175 tgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgg 23094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 361
Target Start/End: Original strand, 38929 - 39229
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| |||||||||||| |     
T  38929 atgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctt 39028  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||  ||||    
T  39029 tgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagt 39128  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    ||| ||  |||| ||||||| ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  39129 tggtttgccaccacatctttagaacttgcacgaagtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcagagggatgat 39228  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  39229 g 39229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 12781 - 13088
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    || || |||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  12781 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttg 12880  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||||||||||| ||||   |||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||  || ||||||||    
T  12881 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtcc 12980  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    |||| || | ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  12981 gtattagatttcagagaggattggaacggtggcatacagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcgg 13080  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  13081 aagtatgt 13088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20410 - 20103
Alignment:
Q  37 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacc 136  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || || |    
T  20410 aaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatc 20311  T
Q  137 acgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaag 236  Q
    | || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| ||    
T  20310 atgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagag 20211  T
Q  237 agttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcca 336  Q
     |||||||  ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||     
T  20210 tgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatcct 20111  T
Q  337 tctcatgt 344  Q
    || |||||    
T  20110 tcgcatgt 20103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43804 - 43471
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  43804 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 43705  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  43704 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 43605  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  43604 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 43505  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 359  Q
    |  ||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  43504 tagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 43471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44816 - 44483
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||| || |||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  44816 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 44717  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  44716 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 44617  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44616 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 44517  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 359  Q
    |  ||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  44516 tagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 44483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36036
Alignment:
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || || |||||||||||| | ||||| || |||||||  ||||| ||  ||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 36036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1167
Alignment:
Q  117 tgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggt 216  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  217 ccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttc 316  Q
    | ||||||| ||||  | || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  317 ggaagtatgttccggatcc 335  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  1185 ggaagtatgtagcggatcc 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Original strand, 26203 - 26264
Alignment:
Q  301 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26203 catgtatcgtaacttcggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 26264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 347
Target Start/End: Original strand, 16755 - 17041
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||||| |     
T  16755 atgaaagcttcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 16854  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || |||||||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  16855 tgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagt 16954  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16955 tggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgat 17041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26560 - 26239
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||||||||||||| | ||||    || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| | ||||||||||||    
T  26560 agactactgagaaagttaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttca 26461  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  26460 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcag 26361  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| || || ||||| ||||| ||  ||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  26360 atttcagagagggtgggaacagtggcttatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 26261  T
Q  326 ttccggatccatctcatgtgat 347  Q
    |  ||||||  || ||||||||    
T  26260 tggcggatctttcgcatgtgat 26239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 335
Target Start/End: Original strand, 33719 - 33993
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||| |     
T  33719 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 33818  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagt 260  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||  | ||    
T  33819 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 33918  T
Q  261 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatcc 335  Q
     || ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  33919 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 33993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40543 - 40380
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  40543 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 40444  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  40443 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 40380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 248912 - 248612
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  248912 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 248813  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  248812 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 248713  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 325  Q
     | ||||| | ||||||||  ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  248712 atttcagagaaagttggaaaagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 248613  T
Q  326 t 326  Q
    |    
T  248612 t 248612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3810
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 105  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3706 aggaccagagatagttcagcaaactaacgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 3805  T
Q  106 agaaa 110  Q
    |||||    
T  3806 agaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 7238 - 7543
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||     
T  7238 gttcatcagtctacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggccctta 7337  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtcc 218  Q
    ||||||| || || || || |||||| |||| || |||  | |||  ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||    
T  7338 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 7437  T
Q  219 gtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcgg 318  Q
    ||||||| | ||||||   |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  7438 gtatcagatttcagaa--ggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 7535  T
Q  319 aagtatgt 326  Q
    ||||||||    
T  7536 aagtatgt 7543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 362
Target Start/End: Original strand, 4235 - 4482
Alignment:
Q  115 cttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattg 214  Q
    |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || |    
T  4235 cttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 4334  T
Q  215 gtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaact 314  Q
    ||||||||||| | ||| | || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4335 gtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 4434  T
Q  315 tcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  4435 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 4482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43082 - 42784
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  43082 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 42983  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| | || ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  42982 ggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 42883  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 324  Q
     | ||||| |  |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  42882 atttcagagaaggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtat 42784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8394 - 8217
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  8394 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtctcagagtagacagaagacttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 8295  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  8294 agttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcc 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136082
Alignment:
Q  166 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggat 265  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| |    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  266 tatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||| ||| ||||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcggatgttatcccgagagatgatgt 136082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 326
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2173
Alignment:
Q  176 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgca 275  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  276 tctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2094 - 1916
Alignment:
Q  25 cagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaa--tgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 122  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  ||||||||    
T  2094 cagactacggagagggtcaagatgat--aagagaaaaggtgaaagcgacgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtt 1997  T
Q  123 tcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    |||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1996 tcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcc 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1222
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  1061 agactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttct 1160  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     |  || || || |||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1161 ggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 1222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14822 - 14661
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  14822 agactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 14723  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     |  || || || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14722 ggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23679 - 23518
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||   | || ||||    
T  23679 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttagtgatcacg 23580  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 201  Q
    | |||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  23579 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgact 23518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5313
Alignment:
Q  61 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||       
T  5477 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 5378  T
Q  161 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5377 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12806 - 12738
Alignment:
Q  6 aggagcagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgca 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12806 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgca 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 326
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13560
Alignment:
Q  146 tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagttatcagaaagagttggaac 245  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||  ||||||| |||| || || ||||||||    
T  13380 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaac 13479  T
Q  246 ggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
     ||| | ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13480 agtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 13560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 28287 - 28467
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||| || || |    
T  28287 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatg 28386  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 220  Q
    | |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  28387 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcctcgatttgttggaccgt 28467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6329 - 6238
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 360  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6329 caccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 46439 - 46276
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |    
T  46439 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 46340  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | || ||| || |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46339 tgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9286 - 9125
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||    
T  9286 agactacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagatgagaaaggatattgagtttca 9187  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     |  || || || ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9186 ggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Original strand, 1241 - 1385
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1241 agactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 1340  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgt 170  Q
     ||||| ||||| || ||| |||| || |||| | |||| |||||    
T  1341 ggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3444 - 3281
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |  || || || |    
T  3444 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatg 3345  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||||||||| | || |||||| ||| |||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3344 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 3281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 14758 - 14921
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  || || || |    
T  14758 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatg 14857  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | |||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14858 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 393 - 570
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  393 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 492  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || |  || || |||||||| || | || |||||| |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  493 agttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcc 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13030
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  13207 agactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 13108  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
     |  || || || || || |||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13107 ggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Original strand, 7498 - 7559
Alignment:
Q  301 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7498 catgtgtcgcaacttcggaagtttgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 7559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 110
Target Start/End: Original strand, 5467 - 5543
Alignment:
Q  34 gagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 110  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5467 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 5543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 3896 - 4059
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |    
T  3896 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatg 3995  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  3996 tgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 1
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 118  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   ||| || |||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  176 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 77  T
Q  119 agtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 194  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  76 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 940 - 1094
Alignment:
Q  49 attcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 148  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || |||||||    
T  940 attcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttga 1039  T
Q  149 gagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1040 gggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Original strand, 8898 - 9059
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  ||||||||||    
T  8898 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 8997  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     |  || || ||  | |||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  8998 ggttggtgatcatctgtttttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgctttgaagt 9059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14956 - 14779
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  14956 agactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 14857  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    ||  || || || || ||||| || || | || ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14856 agttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 43837 - 43737
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  43837 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 43738  T
Q  126 a 126  Q
    |    
T  43737 a 43737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3443
Alignment:
Q  19 gttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3355 gttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 362
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3611
Alignment:
Q  238 gttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 337  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatgtagcggatcctt 3586  T
Q  338 ctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    | ||||| || | ||| ||||||||    
T  3587 cacatgttattccgagagatgatgt 3611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24165 - 24002
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  24165 gttaagatgattcaggagaagattaaagcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 24066  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 203  Q
    | ||||| ||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24065 tgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13550 - 13397
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||    
T  13550 agactacagaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttca 13451  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 179  Q
     |  || || |||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||| |||||    
T  13450 ggttggtgatcacgtattcttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgc 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 71518 - 71442
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  71518 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 71442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10625 - 10493
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || |||||||| || |    
T  10625 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 10526  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10525 atcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6011 - 5879
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  || || || || |||||||| || |    
T  6011 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 5912  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5911 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45943 - 45835
Alignment:
Q  227 tatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 326  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45943 tatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 45844  T
Q  327 tccggatcc 335  Q
      |||||||    
T  45843 agcggatcc 45835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Original strand, 3965 - 4112
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  3965 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaaagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 4064  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
    | ||||||||||| | |   ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4065 tgtttttgagagtgaatttggtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 4112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1532
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||    
T  1431 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttca 1530  T
Q  126 ag 127  Q
    ||    
T  1531 ag 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8488
Alignment:
Q  55 gagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtca 154  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  || || || || |||||||| || |    
T  8620 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 8521  T
Q  155 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 187  Q
     || | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8520 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Original strand, 26178 - 26265
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 127  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26178 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11068 - 10843
Alignment:
Q  26 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 125  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  11068 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 10969  T
Q  126 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 225  Q
     || || || || || ||| | || || |||  | ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  10968 ggagggtgatcatgtgtttcttagggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 10869  T
Q  226 ttatcagaaagagttggaacggtggc 251  Q
     | ||||| ||  ||||||| |||||    
T  10868 atttcagagaggattggaacagtggc 10843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10941 - 10781
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| | || |||||||| ||||||||| | || || ||  |||||||||| |  || || || |    
T  10941 gttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcatagtaggcagaagagttaccatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 10842  T
Q  140 tatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 200  Q
    | ||||||||||| | |  ||| || ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  10841 tgtttttgagagtgaattttgtaaccggtgttggacgtgctttcaagtgttagaagttgac 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 887 - 962
Alignment:
Q  269 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 344  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  887 caccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatccttcacatgt 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9269 - 9182
Alignment:
Q  275 atctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  9269 atctttcgaatttgcatgatgtggttcatatgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 9182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14425 - 14370
Alignment:
Q  37 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagtta 92  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  14425 aaagttaagatgaatcaagagaaaatgaaagcatctcagagtagacagaagagtta 14370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18394 - 18332
Alignment:
Q  40 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 102  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||    
T  18394 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataag 18332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University