View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16322_low_2 (Length: 360)

Name: NF16322_low_2
Description: NF16322
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16322_low_2
NF16322_low_2
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (9-358)||(45367972-45368321)
chr2 (9-358)||(11992454-11992802)
chr2 (9-358)||(41763389-41763745)
chr2 (10-358)||(2610114-2610461)
chr2 (9-358)||(4807178-4807526)
chr2 (15-358)||(451976-452312)
chr2 (9-355)||(3865661-3866006)
chr2 (9-358)||(8180366-8180714)
chr2 (28-358)||(30743209-30743538)
chr2 (9-358)||(24583954-24584302)
chr2 (99-358)||(38453058-38453315)
chr2 (44-307)||(3244034-3244293)
chr2 (9-222)||(41197576-41197792)
chr2 (150-302)||(13148953-13149106)
chr2 (42-242)||(6238135-6238334)
chr2 (9-158)||(23997402-23997551)
chr2 (174-305)||(37281746-37281878)
chr2 (149-302)||(17581112-17581262)
chr2 (9-127)||(38429700-38429818)
chr2 (270-356)||(12475031-12475115)
chr2 (149-289)||(14769943-14770090)
chr2 (149-295)||(33594757-33594904)
chr2 (149-286)||(12904624-12904762)
chr2 (9-137)||(36183257-36183385)
chr2 (240-358)||(13592930-13593044)
chr2 (242-296)||(876778-876833)
chr2 (196-296)||(7135220-7135321)
chr2 (167-305)||(28317383-28317517)
chr2 (149-293)||(6465370-6465515)
chr2 (149-257)||(7292673-7292782)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (9-358)||(27450521-27450869)
chr4 (9-358)||(23906649-23906997)
chr4 (9-358)||(435815-436163)
chr4 (44-358)||(48174476-48174789)
chr4 (9-358)||(31960162-31960510)
chr4 (44-358)||(1777398-1777711)
chr4 (44-344)||(33226809-33227108)
chr4 (44-358)||(56374876-56375189)
chr4 (88-358)||(48622954-48623223)
chr4 (9-358)||(53707380-53707728)
chr4 (28-358)||(39708043-39708373)
chr4 (28-341)||(16002532-16002842)
chr4 (15-288)||(50286625-50286899)
chr4 (42-344)||(47265583-47265886)
chr4 (9-287)||(1211738-1212017)
chr4 (9-218)||(43433643-43433852)
chr4 (9-233)||(46583172-46583396)
chr4 (149-305)||(17666526-17666680)
chr4 (9-230)||(41009698-41009922)
chr4 (157-293)||(54787741-54787878)
chr4 (217-296)||(10775975-10776055)
chr4 (166-289)||(1629084-1629208)
chr4 (90-254)||(54914618-54914781)
chr4 (72-296)||(39754782-39755007)
chr4 (149-303)||(17667817-17667969)
chr4 (210-296)||(30807244-30807331)
chr4 (168-295)||(7092719-7092847)
chr4 (158-270)||(52280695-52280807)
chr4 (42-255)||(55578722-55578932)
chr4 (200-293)||(42037510-42037604)
chr4 (9-206)||(35690042-35690238)
chr4 (157-222)||(45185477-45185542)
chr4 (163-294)||(20917630-20917762)
chr4 (136-267)||(3273098-3273229)
chr4 (208-358)||(41427425-41427574)
chr4 (247-305)||(55768963-55769022)
chr4 (247-305)||(55833219-55833278)
chr4 (228-305)||(30853053-30853131)
chr4 (149-267)||(8917815-8917938)
chr4 (29-111)||(11389552-11389634)
chr4 (44-133)||(52569898-52569987)
chr4 (15-83)||(26037836-26037904)
chr4 (15-63)||(27983080-27983128)
chr4 (9-93)||(45205196-45205280)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (9-358)||(25190965-25191313)
chr3 (9-352)||(38849686-38850028)
chr3 (44-358)||(51448092-51448405)
chr3 (44-358)||(47542094-47542407)
chr3 (44-286)||(28245093-28245336)
chr3 (29-343)||(27917173-27917486)
chr3 (9-172)||(5168599-5168762)
chr3 (77-358)||(29817091-29817370)
chr3 (9-190)||(52138553-52138734)
chr3 (224-358)||(52138414-52138547)
chr3 (124-266)||(54425369-54425511)
chr3 (191-358)||(19757654-19757820)
chr3 (9-176)||(53519353-53519520)
chr3 (191-358)||(19736752-19736914)
chr3 (165-295)||(26489964-26490095)
chr3 (163-305)||(48221421-48221564)
chr3 (136-298)||(30345175-30345334)
chr3 (233-358)||(9258469-9258589)
chr3 (172-295)||(30724311-30724435)
chr3 (77-212)||(3186500-3186635)
chr3 (9-122)||(43695113-43695226)
chr3 (227-296)||(46145799-46145869)
chr3 (170-292)||(44395080-44395200)
chr3 (186-292)||(32490249-32490356)
chr3 (247-296)||(1470683-1470733)
chr3 (163-292)||(15750888-15751018)
chr3 (65-182)||(40674517-40674634)
chr3 (44-108)||(54278855-54278919)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (9-358)||(38606592-38606939)
chr7 (9-358)||(32630193-32630529)
chr7 (44-358)||(46356234-46356547)
chr7 (9-358)||(36651580-36651928)
chr7 (69-358)||(37616502-37616790)
chr7 (9-358)||(33350154-33350502)
chr7 (9-358)||(31004810-31005157)
chr7 (9-351)||(11593552-11593894)
chr7 (9-358)||(36869637-36869985)
chr7 (15-358)||(39906729-39907075)
chr7 (100-358)||(48918974-48919231)
chr7 (9-230)||(43281389-43281610)
chr7 (9-358)||(49028853-49029210)
chr7 (9-256)||(35906549-35906796)
chr7 (44-193)||(34869170-34869319)
chr7 (180-353)||(24177714-24177886)
chr7 (9-231)||(33072666-33072888)
chr7 (9-203)||(7272780-7272973)
chr7 (150-296)||(24550178-24550320)
chr7 (28-180)||(23404181-23404333)
chr7 (9-159)||(12841623-12841773)
chr7 (162-295)||(21517826-21517959)
chr7 (213-296)||(43793592-43793676)
chr7 (43-206)||(7189615-7189777)
chr7 (149-289)||(18637233-18637371)
chr7 (149-289)||(18650668-18650806)
chr7 (162-253)||(23087603-23087694)
chr7 (167-289)||(18608199-18608319)
chr7 (210-281)||(5843105-5843177)
chr7 (210-289)||(18626559-18626639)
chr7 (137-208)||(33139006-33139077)
chr7 (29-95)||(47235600-47235666)
chr7 (27-131)||(13859372-13859476)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (9-358)||(42854352-42854709)
chr8 (50-358)||(36565630-36565937)
chr8 (9-358)||(15215619-15215966)
chr8 (44-358)||(12492225-12492538)
chr8 (84-358)||(4032917-4033190)
chr8 (77-358)||(8879850-8880130)
chr8 (97-358)||(36544738-36544998)
chr8 (15-295)||(18124825-18125103)
chr8 (9-218)||(37077490-37077699)
chr8 (9-197)||(39946603-39946791)
chr8 (42-230)||(25299950-25300138)
chr8 (135-305)||(13984672-13984842)
chr8 (42-230)||(25288613-25288803)
chr8 (88-230)||(25439249-25439391)
chr8 (15-132)||(18752227-18752344)
chr8 (149-302)||(28300596-28300747)
chr8 (157-293)||(19293776-19293913)
chr8 (136-290)||(30113671-30113827)
chr8 (167-305)||(41444809-41444949)
chr8 (161-305)||(29735454-29735592)
chr8 (141-255)||(35601686-35601799)
chr8 (149-305)||(33830721-33830875)
chr8 (149-296)||(38667205-38667351)
chr8 (149-358)||(25985128-25985334)
chr8 (158-344)||(18849624-18849797)
chr8 (136-298)||(13589084-13589247)
chr8 (44-151)||(36395336-36395443)
chr8 (86-303)||(6510841-6511059)
chr8 (213-290)||(45332039-45332117)
chr8 (28-172)||(2796326-2796470)
chr8 (119-182)||(10824546-10824609)
chr8 (162-240)||(6986525-6986603)
chr8 (158-255)||(35601501-35601598)
chr8 (247-295)||(43732230-43732279)
chr8 (151-192)||(43732355-43732396)
chr8 (162-215)||(13172147-13172200)
chr8 (268-296)||(3285135-3285163)
chr8 (318-358)||(13984216-13984256)
chr8 (128-231)||(44681543-44681644)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (9-358)||(9706362-9706710)
chr6 (9-358)||(5631403-5631752)
chr6 (9-358)||(10100205-10100553)
chr6 (19-358)||(5258508-5258846)
chr6 (9-357)||(20427984-20428331)
chr6 (9-358)||(33495793-33496118)
chr6 (9-197)||(607905-608093)
chr6 (45-285)||(2689313-2689554)
chr6 (9-191)||(14030558-14030740)
chr6 (149-358)||(27790742-27790950)
chr6 (42-220)||(6056151-6056329)
chr6 (77-199)||(30679218-30679340)
chr6 (136-277)||(26291444-26291586)
chr6 (235-305)||(3632653-3632724)
chr6 (274-360)||(30670472-30670556)
chr6 (15-108)||(30031091-30031184)
chr6 (167-264)||(6641916-6642013)
chr6 (9-75)||(35043789-35043855)
chr6 (9-122)||(28085197-28085310)
chr6 (310-358)||(2680698-2680746)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (9-358)||(32083093-32083441)
chr1 (44-358)||(8671506-8671819)
chr1 (9-358)||(1210331-1210679)
chr1 (44-358)||(51441148-51441460)
chr1 (9-358)||(43240729-43241077)
chr1 (44-356)||(51601646-51601957)
chr1 (44-358)||(49347776-49348090)
chr1 (9-262)||(30202478-30202731)
chr1 (15-288)||(19936175-19936450)
chr1 (42-344)||(34827483-34827784)
chr1 (98-303)||(27445537-27445743)
chr1 (43-358)||(37463249-37463558)
chr1 (9-188)||(8391525-8391706)
chr1 (10-211)||(22089826-22090027)
chr1 (9-214)||(9592463-9592668)
chr1 (151-305)||(32066761-32066913)
chr1 (9-149)||(15085728-15085868)
chr1 (9-143)||(696069-696203)
chr1 (136-290)||(51234267-51234421)
chr1 (154-295)||(7921574-7921716)
chr1 (149-296)||(28528227-28528375)
chr1 (162-305)||(35828894-35829038)
chr1 (171-296)||(6640772-6640898)
chr1 (159-292)||(52739965-52740098)
chr1 (9-233)||(46226630-46226853)
chr1 (162-305)||(12807587-12807732)
chr1 (161-357)||(52421017-52421210)
chr1 (119-256)||(21275588-21275725)
chr1 (243-295)||(40419328-40419381)
chr1 (236-304)||(46226887-46226956)
chr1 (171-296)||(3877495-3877621)
chr1 (211-298)||(16142399-16142487)
chr1 (165-268)||(11331568-11331666)
chr1 (165-268)||(11489589-11489687)
chr1 (240-302)||(52641033-52641093)
chr1 (156-233)||(52640920-52640997)
chr1 (244-302)||(16273415-16273471)
chr1 (77-171)||(52831830-52831924)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (42-358)||(3301435-3301750)
chr5 (63-358)||(3394297-3394593)
chr5 (9-358)||(1274851-1275199)
chr5 (9-358)||(12492735-12493083)
chr5 (9-358)||(10638883-10639231)
chr5 (15-358)||(28977211-28977553)
chr5 (9-358)||(20318577-20318921)
chr5 (9-358)||(1287937-1288285)
chr5 (9-358)||(2075822-2076170)
chr5 (86-358)||(24178110-24178381)
chr5 (137-344)||(16347879-16348084)
chr5 (162-358)||(27302451-27302643)
chr5 (9-197)||(34272768-34272956)
chr5 (135-298)||(36200426-36200590)
chr5 (9-160)||(16347726-16347877)
chr5 (165-296)||(43558318-43558450)
chr5 (9-215)||(27622-27828)
chr5 (208-305)||(17341748-17341846)
chr5 (166-244)||(43423578-43423656)
chr5 (149-256)||(20077305-20077413)
chr5 (270-356)||(27518-27602)
chr5 (149-289)||(38578992-38579130)
chr5 (77-296)||(3096828-3097041)
chr5 (242-356)||(23979820-23979930)
chr5 (214-296)||(6368478-6368561)
chr5 (210-296)||(21915532-21915619)
chr5 (235-305)||(37124207-37124278)
chr5 (157-219)||(28676253-28676314)
chr5 (235-295)||(25937719-25937780)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (44-343)||(2653-2951)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (44-358)||(31054-31367)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (9-307)||(82356-82655)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (91-358)||(12028-12294)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (224-300)||(5834-5911)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (117-230)||(41-156)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (118-256)||(87066-87204)
scaffold0045 (252-357)||(88514-88618)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (166-296)||(9303-9434)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 45367972 - 45368321
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45367972 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaatcgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgttgtccgata 45368071  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
    |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368072 aaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 45368171  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaccc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368172 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaatttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaccc 45368271  T
Q  309 acacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368272 acacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 45368321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 11992454 - 11992802
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11992454 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcccatcactccgtaccatacaacattgccggtcagactgctgtccgata 11992553  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11992554 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 11992653  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11992654 gcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacc 11992753  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11992754 --cacttctctttttactgaagttacattccatatacttcgtcttgcttct 11992802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 41763389 - 41763745
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||| || | | |||||    
T  41763389 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggtctgattgttcttcgata 41763488  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttc--------aaccacccagcttgaatacgataat 200  Q
     ||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||    
T  41763489 gaactttccttttagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaagttttcaaccacccagcttgaatacgatgat 41763588  T
Q  201 ttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41763589 ttacatctgcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaatcgtgcaacttggggtatgatataatctccaactttcacctccaa 41763688  T
Q  300 ggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41763689 ggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 41763745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2610461 - 2610114
Alignment:
Q  10 catcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataa 109  Q
    |||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | | ||||||||| |||||||||     
T  2610461 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccagtctgactgttgtccgatag 2610362  T
Q  110 aacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctg 209  Q
    ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2610361 aactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcataaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggtttacatctg 2610262  T
Q  210 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaccc 308  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2610261 cttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc- 2610163  T
Q  309 acacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      |||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2610162 -tacttctccttctgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttct 2610114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4807526 - 4807178
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  4807526 acatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgctcaacactctgtgtcatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgata 4807427  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  4807426 gaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccatcttgaatacgatggcttacatct 4807327  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807326 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 4807227  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4807226 --tacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 4807178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Original strand, 451976 - 452312
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 114  Q
    ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  451976 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatagaactt 452075  T
Q  115 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 214  Q
    | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  452076 tcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttct 452175  T
Q  215 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacact 313  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||   |||    
T  452176 atttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca------acctccaaggtagacc--tact 452267  T
Q  314 tctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  452268 tctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 452312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3866006 - 3865661
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  3866006 acatcatcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtctgactgttgtccgata 3865907  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  3865906 gaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcacacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttacattt 3865807  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3865806 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagttattgaaaccgtgtaacttgggatacaatatgatctccaactttcacctccaaggtaga-- 3865709  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgct 355  Q
    |  ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3865708 cgtacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgct 3865661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8180714 - 8180366
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||  |  |||||||||| |||||||||    
T  8180714 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgctggtctgactgatgtccgata 8180615  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  8180614 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaactcttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 8180515  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180514 gcttctatttctccgtcattttataagaaggacccaaaatatttaaaccgtgtaacttggagtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 8180415  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8180414 --tacttctccttccactgaaattacattccatatactctgtcttgcttct 8180366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30743538 - 30743209
Alignment:
Q  28 acttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 127  Q
    |||||||| | || |||||||||| |||| |||  | | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||| ||||    
T  30743538 acttacttgattctcgtgttggcttttaatcgcctaactctccgtaccatacaacatcgtcggtctgaccgctatccggtaaaactttcctttcaactta 30743439  T
Q  128 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 227  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||    
T  30743438 agtggtactttcttatcacacaaaacacatgaggctcttctcaatttcaatcactcagcttgaatacgatgatttatatctacttctatttatccgtcat 30743339  T
Q  228 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttg 326  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||    
T  30743338 tttgtactattgacctaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatggtatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--aatttctccttttgctg 30743241  T
Q  327 aagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  30743240 aagttacattccatatactctgtctttcttct 30743209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 24583954 - 24584302
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || ||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| |||||||||  | || ||  | |    
T  24583954 acatcttcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattttgtaccatacaacatcgtcggtctggatactatctaaca 24584053  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||| ||||    
T  24584054 gaacttttctttcaacttaagtggtattttcttttcgcacaaaacacacgaggctattctccatttccaccacccagcttgaatatgatggcttaaatct 24584153  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24584154 gcctatatttctccatcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgcggtctgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga-- 24584251  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24584252 cataattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgtttct 24584302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 358
Target Start/End: Original strand, 38453058 - 38453315
Alignment:
Q  99 ctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgata 198  Q
    |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38453058 ctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatg 38453157  T
Q  199 atttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctcc 297  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38453158 gcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtatgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcc 38453257  T
Q  298 aaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||    ||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38453258 aaggtagac---tacttctccttccgctgatgttacattccatatactccgtcttgcttct 38453315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 307
Target Start/End: Original strand, 3244034 - 3244293
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| |||||||| |  || ||||||||||| | |||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||||||  ||||||||    
T  3244034 tgttgactcttaactgtccaacactccgtaccattcaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacataagtggtactttcttat 3244133  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  3244134 cgcacaaaacacctgaggctcatctccatttctaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 3244233  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3244234 aagatatttaaaccgtgtaacttgg----gatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc 3244293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 41197576 - 41197792
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  41197576 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacattgctggtctgactgttgttcgata 41197675  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatac---gataatttaca 205  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||| |||    
T  41197676 gaactttcctttcagcttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatgattcaca 41197775  T
Q  206 tctgcttctatttctcc 222  Q
    | |||||||||||||||    
T  41197776 tatgcttctatttctcc 41197792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13149106 - 13148953
Alignment:
Q  150 aaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagata 249  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||    
T  13149106 aaacacctgaagctcttcttcatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttgtatctacttctatttctccgtcattttgtactatggacctgagata 13149007  T
Q  250 tttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149006 tttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 13148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 242
Target Start/End: Original strand, 6238135 - 6238334
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctt 141  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||  ||  ||||| |||||||||| |||| ||    
T  6238135 cgtgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgtcagtctaactgttgtccgatagaattttcttttcaacttaagtggtatttt-tt 6238233  T
Q  142 atcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggac 241  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  6238234 atcacacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttacatatgtttttatttctccgacattttgtactatggac 6238333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23997551 - 23997402
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23997551 acatcttcatctccgttacacttacttggctctcgtgttgactcttaactgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcggtcttactgttgtccgata 23997452  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctg 158  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23997451 gaactttcctttcagcttaagtggtattttctcatcgcacaaaacacctg 23997402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37281878 - 37281746
Alignment:
Q  174 tcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtat 272  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  37281878 tcaaccacccaacttgaataggatgatttacatctacttctatttctccttcattttatactatggagctaagatatttaaaatgtgtaacttggggtat 37281779  T
Q  273 gatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37281778 gacatgatctcaaactttcacctccaaggtaga 37281746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17581262 - 17581112
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||| ||||||||     
T  17581262 aaaacacctgagactcttctccatttgaaccatccaacttgaatatgaggatttacatctgcttttatttctttgtcattttgtacaatgaacccaaga- 17581164  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 302  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  17581163 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctctaactttcacttctaaggt 17581112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38429818 - 38429700
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  38429818 acatcctcatctccgctacacttactctactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctgata 38429719  T
Q  109 aaacctttctttcagctta 127  Q
     ||| || |||| ||||||    
T  38429718 gaactttccttttagctta 38429700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 270 - 356
Target Start/End: Original strand, 12475031 - 12475115
Alignment:
Q  270 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgctt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12475031 tatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgctt 12475115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14770090 - 14769943
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc-agcttgaatacgata-----atttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacc 242  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     |||||||| |||||  |||||||  |  ||||||| ||||| ||    
T  14770090 aaaacaccttacactcttctccatttcaaccaccccagcttgaatatgatataatgatttacatatgcttgaatttctctgttgttttgtactatggccc 14769991  T
Q  243 caagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 289  Q
     |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14769990 taagatatttaaaccgtgtaacttatgctatgatatgatctccaactt 14769943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Original strand, 33594757 - 33594904
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||  ||| |||||    
T  33594757 aaaacacctaagacactcctccatctcaaccacccagtttgaatttgatgttttacatctccttctatttctccgacgttttgtactatatacctaagat 33594856  T
Q  249 atttaaaccgtgtaact-tgggtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    |||||||| |||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33594857 atttaaactgtgtaaatgctggtatgatatgaactccaactttcacct 33594904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12904762 - 12904624
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||| || | | |||||||| |||||||| ||| ||| | | ||    
T  12904762 aaaacacctgagacactcgtttatttcaaccacctaacttgaattctatggtttacatctcctccaacttctccattattttgtactatagacaccatat 12904663  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaa 286  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12904662 atttaaaccgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaa 12904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36183385 - 36183257
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  36183385 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgttgtccgata 36183286  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttt 137  Q
     ||| || |||||| ||||||| ||||||    
T  36183285 gaactttcctttcaacttaagtagttttt 36183257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 358
Target Start/End: Original strand, 13592930 - 13593044
Alignment:
Q  240 acccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattcca 339  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |   |||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  13592930 acccaagatatctaaactgtgtaacttc--tatgatatgatcttcaactttcacctctaagtttgaac--tacttcgtcttttgttgaagttacattaca 13593025  T
Q  340 tataccccgtcttgcttct 358  Q
     |||||  |||||||||||    
T  13593026 cataccatgtcttgcttct 13593044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 876833 - 876778
Alignment:
Q  242 ccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  876833 ccaacatatttaaactgtgtaacttgtggtaggatatgatctccaactttcacctc 876778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 296
Target Start/End: Original strand, 7135220 - 7135321
Alignment:
Q  196 ataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 294  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  ||  ||||||| | |||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  7135220 ataatttacttctacttctatttctttattgttttgtactgtggacccaagactttttaactgtgtaacttgtggtatgatatgatatctaaatttcacc 7135319  T
Q  295 tc 296  Q
    ||    
T  7135320 tc 7135321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28317517 - 28317383
Alignment:
Q  167 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 266  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || | ||  | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||  ||||| |||    
T  28317517 ctccgtttcaaccactcagcttggattcaatggtatacatctacttctttttatccatcattttgtactacagatccaaaatatataaattgtgtacctt 28317418  T
Q  267 gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28317417 g----tgatatgatctccaactttcacctctaagctaga 28317383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6465515 - 6465370
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  ||| |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||    |||| ||    
T  6465515 aaaacagctaagactcttctccatctcagccacctgacttgaatttgatgatttgcatatgcttcaatttctcagtcattttgtagtataatgccaaaat 6465416  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcac 293  Q
    ||| |||  |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  6465415 attaaaattgtgtaacttgtgttttaatatgatctccaactttcac 6465370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7292782 - 7292673
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga-cccaaga 247  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||| ||  |||  ||||||||| |||||||| | || ||| |||||| ||| || ||| |||    
T  7292782 aaaacacctgagtcactccttcatttcaaccacccaacttggatttgatggtttacatctccttctattcccccgtcagtttgtactatagaccccgaga 7292683  T
Q  248 tatttaaacc 257  Q
    ||||||||||    
T  7292682 tatttaaacc 7292673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 27450521 - 27450869
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27450521 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctgata 27450620  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27450621 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 27450720  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27450721 gcttctatttctccatcattttgcactatggacccaagatatgtaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtatacc 27450820  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27450821 --cacttctccttttgctgaagttacattccaaatactccgtcttgcttct 27450869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 23906649 - 23906997
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  23906649 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 23906748  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23906749 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 23906848  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906849 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 23906948  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23906949 --tacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 23906997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 436163 - 435815
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  436163 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 436064  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  436063 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccactcagcttgaatacgatgacttacatct 435964  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  435963 gcttctatttctccgtcattttatacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 435864  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  435863 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcgtgcttct 435815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 48174476 - 48174789
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  48174476 tgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 48174575  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||    
T  48174576 tgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcactttgtacgaaggaccc 48174675  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  48174676 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatat 48174773  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  48174774 actccgtcttgcttct 48174789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 31960162 - 31960510
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  31960162 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgata 31960261  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  31960262 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 31960361  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960362 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 31960461  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31960462 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttct 31960510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 1777398 - 1777711
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  1777398 tgttgactcttaacctttcaacactccgtatcatacaacaacgtcggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 1777497  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||    
T  1777498 cgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatttgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggaccc 1777597  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  1777598 aagatatttaaaacgtgtaacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatat 1777695  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||| ||||||||    
T  1777696 actccgtattgcttct 1777711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33227108 - 33226809
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  33227108 tgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 33227009  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  33227008 cgtacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 33226909  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  33226908 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttgtccttccgctgaagttacattccatat 33226811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 56375189 - 56374876
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||||| | | || ||||||  |||||||||  ||||||||    
T  56375189 tgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaataacgctggtctgactgctgtccgatagatctttcctttcaaattaagtggtactttcttat 56375090  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  56375089 cgcacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttatatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 56374990  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  56374989 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgctctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatat 56374892  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  56374891 actccgtcttgcttct 56374876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 358
Target Start/End: Original strand, 48622954 - 48623223
Alignment:
Q  88 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48622954 cggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggcttttctccatttcaaccacccagct 48623053  T
Q  188 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 286  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  48623054 tgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaatttggggtatgatatgctctccaa 48623153  T
Q  287 ctttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48623154 ctttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 48623223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 53707728 - 53707380
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || |||||  |||| |||| ||  | ||||| || ||||| ||||||    
T  53707728 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctctaccatacatcaacgccggtcggaatgctggccgata 53707629  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  53707628 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgagtctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 53707529  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53707528 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttagaccgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc 53707429  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  53707428 --tacttctccttccactgaagttacattcgatatactccgtcttgcttct 53707380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39708373 - 39708043
Alignment:
Q  28 acttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 127  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| || |||||| ||||    
T  39708373 acttacttgattctcgtgttgcctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcgatcggactgttgcccgatagaactttcctttcaactta 39708274  T
Q  128 agtggttttttcttatcgcacaaaac-acctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatca 226  Q
    ||||||  ||||||||| || ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  39708273 agtggtactttcttatcacaaaaaaccacctaaggctcttatccatttcaaccatccagcttgaatacgaggatttacacctgcttctatttctccgtca 39708174  T
Q  227 ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgtt 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   | ||||||||||| |    
T  39708173 ttttgtactatcgacccaagatatttaaaccgcataacttgaggtataatatgatctccaaatttcacctccaagatagacc--taattctccttttgct 39708076  T
Q  326 gaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39708075 gaagttatattccatatactccgtcttgcttct 39708043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16002842 - 16002532
Alignment:
Q  28 acttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 127  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||| | || |||| ||| | | ||||||| |  ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  16002842 acttacttgattctcgtgttgactcttaacctcccaacacttcgttcat-acaacatcgctggtctaactgatgtctgataaaacttttctttgaactta 16002744  T
Q  128 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 227  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16002743 agtggtactttcttatcacacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccactcagcttaaatacgatgatttacatctgcttctatgtctccgtcat 16002644  T
Q  228 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttg 326  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||| |     
T  16002643 tttgtactatggaaccaagat-tttaaaccgtgtaatttggggtatgatatgatttccaacttttacctccaaggtaga--ctaacttctccttttgcta 16002547  T
Q  327 aagttacattccata 341  Q
    |||||| ||||||||    
T  16002546 aagttatattccata 16002532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50286899 - 50286625
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 114  Q
    ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||  |||| |||||| | ||||||||| ||| |    
T  50286899 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtatcatacaacaacgtcgatctgacggttgtccgatagaactt 50286800  T
Q  115 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 214  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  50286799 tcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgtgactcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttct 50286700  T
Q  215 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaact 288  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50286699 atttctccgtcattttgtacgaaggacacaatatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaact 50286625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Original strand, 47265583 - 47265886
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttt---tt 138  Q
    ||||||| ||||||||||  ||  |||  ||||| |||||||| |  |||||||||| |||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||||  |   ||    
T  47265583 cgtgttgactcttaaccgtccaatactttgtaccatacaacatcgctggtctgactgttgtcagatagaactttcatttcaacttaagtggtactacttt 47265682  T
Q  139 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatg 238  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  47265683 cttatcgcacaaaacacctaaggctcttcttcatttcaatcacccagcttgaa-acgatggcttacatttgcttctatttctccgtcattttatactatg 47265781  T
Q  239 gacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattc 337  Q
    || |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||     
T  47265782 gatccaagatatttaaactatgtaacttggggtatgatatgacctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacattt 47265879  T
Q  338 catatac 344  Q
    |||||||    
T  47265880 catatac 47265886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 287
Target Start/End: Original strand, 1211738 - 1212017
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  1211738 acatcctcatatccgctacacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacactctgtaccacacaacatcaccggtctgactgttgtccgata 1211837  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  1211838 gaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcatacaaaacatttgaggctcttctccatttcaactacctaacttgaatacgatgatttacacct 1211937  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac-ttgggtatgatatgatctccaac 287  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1211938 gcttctatttctctgttattttgtactatggacacaagatatttaaactatgtaacgtaaggtatgatatgatctccaac 1212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43433852 - 43433643
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  43433852 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgattgctgtccgata 43433753  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43433752 gaactttcctttcaacttaagtgacactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaatcacccagcttgaatacgatggtttacatct 43433653  T
Q  209 gcttctattt 218  Q
    ||||||||||    
T  43433652 gcttctattt 43433643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 46583172 - 46583396
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||| |||    
T  46583172 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacagcgccgatctgactgctgtccaata 46583271  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  46583272 gaactttcctttcaaattaagtgatactttcttatcgcacaaaatacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 46583371  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgta 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  46583372 gcttctatttctccgtcattttgta 46583396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 17666526 - 17666680
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||| | || |||||||||    
T  17666526 aaaacacatgatgctcttctccatttcaacaatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttcttcgacattttgtactttgaacccaagat 17666625  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  17666626 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctctaacgttcacctctaagataga 17666680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 41009698 - 41009922
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||| | || | ||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||| |  ||||||| || ||||| |||    
T  41009698 acatcctcatttccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaatcgcccaacactccgtactatacaacatcgctggtctgattgttgtccaata 41009797  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagact---cttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttaca 205  Q
     ||| ||| |  || |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  41009798 gaacttttttcccaacttaagtggtattttcttatcatacaaatcacctcagattaatcttctccatttcaaccacctaacttgaatacgaagatttaca 41009897  T
Q  206 tctgcttctatttctccatcatttt 230  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  41009898 tttgcttctatttctccgtcatttt 41009922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 293
Target Start/End: Original strand, 54787741 - 54787878
Alignment:
Q  157 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  54787741 tgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaaac 54787840  T
Q  257 cgtgtaa-cttgggtatgatatgatctccaactttcac 293  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  54787841 cgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 54787878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 10775975 - 10776055
Alignment:
Q  217 ttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10775975 ttctccatcattttgtattatagacccaagatatttaaaccatgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcccctc 10776055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1629208 - 1629084
Alignment:
Q  166 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaact 265  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||  |||||||    
T  1629208 tctccatttcaaccactcaagttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcgttttatactatgaattcaagatatttaaactatgtaact 1629109  T
Q  266 tg-ggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    || || | ||||||||||| |||||    
T  1629108 tgtggcacgatatgatctcaaactt 1629084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Original strand, 54914618 - 54914781
Alignment:
Q  90 gtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttg 189  Q
    |||||||| ||| |||||| ||  || |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||  || || |||||||||||||||||     |||    
T  54914618 gtctgactcctgaccgatagaattttcctttcaacttaagtggtattttcttatcacataaaacaccaaag-cttttctccatttcaaccacatgatttg 54914716  T
Q  190 aatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaa 254  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  54914717 aatacaaggatttacatctgtttctatttctccatcattttataccatggacccaagatatttaa 54914781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 296
Target Start/End: Original strand, 39754782 - 39755007
Alignment:
Q  72 taccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctcca 171  Q
    |||| |||||||| |||||||  || | |||| |||||||   ||| |||| |||||||||| |||||  ||| || ||||||| |||| | ||  | ||    
T  39754782 taccgtacaacatcgtcggtcataccgttgtctgataaaataattccttcaacttaagtggtattttcgcatcacataaaacacttgaggcactggttca 39754881  T
Q  172 tttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggt 270  Q
    ||||||||||  | |||| || | || |||||||||| |||||||||||   || ||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||    
T  39754882 tttcaaccactaaacttggattcaatgatttacatctccttctatttctttgtcgttttgtactatagacccatgatatttaaagtgtgtgacttgtggt 39754981  T
Q  271 atgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  39754982 atgatatgatcttcaactttcacctc 39755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 303
Target Start/End: Original strand, 17667817 - 17667969
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||   |||||||||| |||| |||||| ||    
T  17667817 aaaacacctgaagtttttctctatttataccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcgtttatttctaagtcattttgtactatgaacccaatat 17667916  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggta 303  Q
    ||||||||  | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17667917 atttaaactatataactt--gtatgatatgatatccaactttcacctctaaggta 17667969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 210 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30807331 - 30807244
Alignment:
Q  210 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30807331 cttctatttctcagtcattttgtactatagactccaaacatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctc 30807244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 7092719 - 7092847
Alignment:
Q  168 tccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt- 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||| ||||||| | | | ||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  7092719 tccatttcaaccacccaacttgaataatatgatgtacatctgcatctatttattcgttattttatactatagacccacaatatttaaaccgtgtaattta 7092818  T
Q  267 gggtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7092819 agatatgatatgatcttcaactttcacct 7092847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 270
Target Start/End: Original strand, 52280695 - 52280807
Alignment:
Q  158 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaacc 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| | |||||||| | | ||||||| ||||||||| |    
T  52280695 gagacccttctccatttcaaccacacaacgtgaatacgattatttacacttgcttcagtttctcctttattttgtactttagacccaaaatatttaaatc 52280794  T
Q  258 gtgtaacttgggt 270  Q
    ||||||| |||||    
T  52280795 gtgtaacctgggt 52280807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 55578932 - 55578722
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctt 141  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  || ||| || |||||| |   | ||       
T  55578932 cgtgttggttcttaaccgcccaacacttcataccatacaacattgttggtctgactgttgtccgatagaattttccttccaacttaagcgacatgtt--- 55578836  T
Q  142 atcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggac 241  Q
    ||| || |||||| ||||   |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||  ||||||| || ||| ||     
T  55578835 atcacataaaacatctgaagatcttctccattttaaccacctaacttaaatacgatgatttatgtatgcttctatttctcagtcattttatactatagat 55578736  T
Q  242 ccaagatatttaaa 255  Q
    ||||||||||||||    
T  55578735 ccaagatatttaaa 55578722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42037604 - 42037510
Alignment:
Q  200 tttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcac 293  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  42037604 tttacatctccttatatttctcagtcattttgtactatagattcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgggatgatatgatcttcaaatttcac 42037510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35690238 - 35690042
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | |||||| |||||||| | || || ||| || | |||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  35690238 acatcctcatctcggctacacttacttgattctcatgttggttcttaaccacacaacattccatatcatacaacatcgtcggtctaactgttgtctgata 35690139  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 206  Q
     ||  || || ||| |||||  ||   ||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35690138 gaattttcctctcaacttaaacggcactttcttatcacataaaacacccgc-actcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatttacat 35690042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 222
Target Start/End: Original strand, 45185477 - 45185542
Alignment:
Q  157 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctcc 222  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45185477 tgaggctcttctccctttcaaccactaagcttgaatacaatgatttacatctgcttctatttctcc 45185542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20917762 - 20917630
Alignment:
Q  163 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 262  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||| |||| | |||||| || |||||||||||| |  |||| || |||||| |   ||||||||||| |||||    
T  20917762 tcttctccattttaaccatctagattgaattcgatgacttacatatgtttctatttctccgttgttttatactatggagctcggatatttaaactgtgta 20917663  T
Q  263 actt-gggtatgatatgatctccaactttcacc 294  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20917662 acttatggtatgatatgatcttcaactttcacc 20917630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3273229 - 3273098
Alignment:
Q  136 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 235  Q
    |||| |||| || ||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||| || |||||||||||||   || ||||||| |    
T  3273229 tttcgtatcacataaaacaaatgaggctcatctccatttcaaccatccaacttgaattcgatggtttatatttgcttctatttctttgtcgttttgtact 3273130  T
Q  236 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg 267  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  3273129 atggacctaagatgtttaaattgtgtaacttg 3273098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41427574 - 41427425
Alignment:
Q  208 tgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac 306  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||     
T  41427574 tgcttatatttctccgtcattctgtactatgagcacaagatatttaagtcgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaattttcacttttaaggtagaa 41427475  T
Q  307 ccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |   |||||   ||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  41427474 c--tacttcgttttttgctgaaattacatttcatataccatgtcttgcttct 41427425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 305
Target Start/End: Original strand, 55768963 - 55769022
Alignment:
Q  247 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55768963 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtaga 55769022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 305
Target Start/End: Original strand, 55833219 - 55833278
Alignment:
Q  247 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55833219 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtaga 55833278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30853131 - 30853053
Alignment:
Q  228 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  30853131 tttgtactatggacccaagatatttaaactgtgtagcttgtggtatgacatgttctccaaatttcaactctaagctaga 30853053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 267
Target Start/End: Original strand, 8917815 - 8917938
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat-----tatggaccc 243  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||  | ||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||      ||| ||||    
T  8917815 aaaacacttgaggctcttctcaatttcaattatccaacttgaaaacgatgatttatgtctgcttttatttctctgtcattttgtataattaaatgaaccc 8917914  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaacttg 267  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  8917915 aatatatttaaactgtgtaacttg 8917938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11389634 - 11389552
Alignment:
Q  29 cttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaa 111  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  11389634 cttactttattctcgagttggttcttaaccgcccaacactactttccatacaacattgtcggtcttacaactgtccgataaaa 11389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 133
Target Start/End: Original strand, 52569898 - 52569987
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggt 133  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||    
T  52569898 tgttgactcttaaccgaacaacactccgtaccatacaacaacaccggtctgactgttgtccaatagaactttcctttcaacttaagtggt 52569987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Original strand, 26037836 - 26037904
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaaca 83  Q
    ||||||||| |  |||||||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  26037836 tcatctccgctccacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtatcatacaaca 26037904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27983128 - 27983080
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctca 63  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  27983128 tcatctccgctacacttactttactctcatgttgactcttaaccgctca 27983080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Original strand, 45205196 - 45205280
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtct 93  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||| | || |||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  45205196 acatcctcatctccgctacgcttacttgattctcgtgttggttcttaactgcccaacactccgtaccatacaacatcgccggtct 45205280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25191313 - 25190965
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||| |||||    
T  25191313 acatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgactcttaacagcccaacactctgtaccatacaacatttccggtctgactattgttcgata 25191214  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25191213 gaaccttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacattt 25191114  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191113 gcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggctatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 25191014  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25191013 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 25190965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38850028 - 38849686
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || ||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  38850028 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacatcgtcggtgtgactgttgtccgata 38849929  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  38849928 aaaaatttctttcaacttaagtggtactttgttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatct 38849829  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38849828 gcttctatttctccgtcattttgtactgtggacccaagatatttaaaccgtgtaaattgaggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 38849729  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtctt 352  Q
       ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  38849728 --tacttctccttttgatgtagttacattccatatactccgtctt 38849686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 51448092 - 51448405
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  51448092 tgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 51448191  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  51448192 cgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 51448291  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  51448292 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacatttcatat 51448389  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  51448390 actccgtcttgcttct 51448405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 47542094 - 47542407
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  47542094 tgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcagaccgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 47542193  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  47542194 cgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 47542293  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||     
T  47542294 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgaaatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattccatac 47542391  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  47542392 actccgtcttgcttct 47542407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28245336 - 28245093
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28245336 tgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccgtacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 28245237  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||    
T  28245236 cgcacaaaacaactgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccatcattttgtacgaaggatcc 28245137  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28245136 aagatatttaagccgtgtaacttggggtattatatgatctccaa 28245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27917486 - 27917173
Alignment:
Q  29 cttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaa 128  Q
    ||||||| | || ||| |||| ||||||| || || ||||  ||||| |||||||| | |||| |||||| ||| ||||| ||  |||| |||| |||||    
T  27917486 cttacttgattctcgttttggttcttaactgcacatcactttgtaccatacaacatcgccggtgtgactgatgttcgatagaatttttcattcaacttaa 27917387  T
Q  129 gtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatt 228  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  27917386 gtggtacttttttatcacataaaacacatgaggctcttctctatttcagctacccaacttgaatacgatgatttatatatgcttatatttctccgtcatt 27917287  T
Q  229 ttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttga 327  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   | ||||||||||  |||    
T  27917286 ttgtactatggactcaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcaccttcaaggtagaac--tagttctccttttactga 27917189  T
Q  328 agttacattccatata 343  Q
    ||||||| ||||||||    
T  27917188 agttacaatccatata 27917173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5168762 - 5168599
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5168762 acatcctcatctccgctacacttactttactctcatgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgata 5168663  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccat 172  Q
     ||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5168662 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccat 5168599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29817370 - 29817091
Alignment:
Q  77 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 176  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||  ||||||||| |||||| | |  ||||||||| || ||||||    ||||| ||||| ||||||    
T  29817370 tacaacattatcggtctaactgttgtccggtagaaattttctttcaacttaagcgttactttcttatcacataaaacataacagactattctctatttca 29817271  T
Q  177 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgat 275  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  29817270 accacccaacttgaatacgatgatttacatctgccgttatttatccgtcattttgtactatgg-tcaaagatatttgaaccgtgtaacttatggtatgat 29817172  T
Q  276 atgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  29817171 atgatctccaactttcacctccaagatagaac--aacttcaccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttgattct 29817091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52138734 - 52138553
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | | ||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  52138734 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatcttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 52138635  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 190  Q
     ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138634 gaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcgcacaagacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 52138553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 52138547 - 52138414
Alignment:
Q  224 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctcctttt 322  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||      
T  52138547 tcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttcc 52138450  T
Q  323 gttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52138449 gctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 52138414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Original strand, 54425369 - 54425511
Alignment:
Q  124 cttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctcca 223  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  54425369 cttaagtggtactttcttatcacacaaaacacatgagactctttttcatttcaaccgcctagcttaaatacgatgatttacatatgcttctatttctccg 54425468  T
Q  224 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 266  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54425469 tcattttttactatggatccaagatatttaaaccgtgtaactt 54425511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19757820 - 19757654
Alignment:
Q  191 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19757820 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19757721  T
Q  290 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||||||  |   ||||  ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19757720 tcacctccaaggtaggac--tactttgccttttgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttct 19757654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53519520 - 53519353
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| |||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  53519520 acatcctcatttccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcttaacactccgtacaacacaacattgccgatctgactgctgtccgata 53519421  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 176  Q
     |   || |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53519420 gatttttcctttaagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttca 53519353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19736914 - 19736752
Alignment:
Q  191 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactt 289  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19736914 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatgga----agatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19736819  T
Q  290 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||||||  | || ||   ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19736818 tcacctccaaggtaggactactct--gccttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttct 19736752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26490095 - 26489964
Alignment:
Q  165 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 264  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  26490095 ttcttcatctcaaccactcaacttcaatatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttatatcatggaaccaagatatttaaatcatgtaac 26489996  T
Q  265 ttgg-gtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26489995 ttggagtatgatatgatctcccactttcacct 26489964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48221564 - 48221421
Alignment:
Q  163 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 262  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||    
T  48221564 tcttcttcatttcaaccatccagtttgaattcgatgatttacatatgcttctacttctctgtcattttgtactatgaatccaagatatttaaaatgtgta 48221465  T
Q  263 acttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  48221464 acttgtggtatgatatgatcttcaactttcacctctaagataga 48221421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30345334 - 30345175
Alignment:
Q  136 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || || || ||||||||  || ||||||| |    
T  30345334 tttcttatcgcataaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatactatgatttatatatgtttttatttctctttctttttgtact 30345235  T
Q  236 atggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctcca 298  Q
    ||| |||    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  30345234 atgaacc----atatttaaaccttgtagcttggggtatgatatgagcttccactttcacctcca 30345175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9258589 - 9258469
Alignment:
Q  233 attatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||| |||    ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9258589 attatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatatctaatgttcacctctaag----acctac--ttctccttttgttgaagtt 9258496  T
Q  332 acattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9258495 acattccatatactccgtcttgcttct 9258469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 30724311 - 30724435
Alignment:
Q  172 tttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggt 270  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||   ||    
T  30724311 tttctaccacccaacttgaattcgataatttacatatcattctatttctcacttattttgtaatatgtatccaagatatctaaactgtgtaacttatagt 30724410  T
Q  271 atgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  30724411 atgatatgatctccaacgttcacct 30724435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3186635 - 3186500
Alignment:
Q  77 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 176  Q
    |||||||| || |||  ||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||| |  ||||||||| |  ||||||| ||| | | |||| |||||||    
T  3186635 tacaacatcgttggtgggactgttgtccgatataactttcctttcaacttaagtgatactttcttatcacctaaaacacatgaaaatattcttcatttca 3186536  T
Q  177 accacccagcttgaatacgataatttacatctgctt 212  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3186535 accacccaacttgaatacgatgttttacatctgctt 3186500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 43695113 - 43695226
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| | || ||||||   ||| |||| | || ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  43695113 acatcctcatctctgttacacttacttgattctcgtgttaattctcaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgccggtctaactgctgtccgata 43695212  T
Q  109 aaacctttctttca 122  Q
     ||| |||||||||    
T  43695213 gaacttttctttca 43695226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46145869 - 46145799
Alignment:
Q  227 ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  46145869 ttttgtactatggactcaaaatatttaaaccgtataacttgtggtatgacataatctccaactttaacctc 46145799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 44395200 - 44395080
Alignment:
Q  170 catttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-g 268  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||   ||||||||||  |  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  44395200 catttcaaccacttaacttgaattcgatggtttacatct---tctatttctctgttgtttagtactatggacccgagatatttaaatcgtgtaacttgcg 44395104  T
Q  269 gtatgatatgatctccaactttca 292  Q
     | || ||||||||||||||||||    
T  44395103 ttgtggtatgatctccaactttca 44395080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 292
Target Start/End: Original strand, 32490249 - 32490356
Alignment:
Q  186 cttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctcc 284  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  |||||||| | | || | || || ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  32490249 cttgaattcgatagtttatatctagttctattttttcgtcgtcttataatatagacccaagaaatttaaattgtgtaacttgtggtatgatatgatcttc 32490348  T
Q  285 aactttca 292  Q
    ||||||||    
T  32490349 aactttca 32490356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 1470683 - 1470733
Alignment:
Q  247 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1470683 atatttaaaccatgcaacttttggtatgatatgatctccaactttcacctc 1470733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15751018 - 15750888
Alignment:
Q  163 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 262  Q
    |||||| ||||||||||||| | | ||| || |||  ||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||||| |||||| || |||||| | ||||    
T  15751018 tcttcttcatttcaaccacctaacatgagtatgatgttttacatatgcttcgatgtctccttcgttttgcattatgaacccaaaatgtttaaatcatgta 15750919  T
Q  263 acttg-ggtatgatatgatctccaactttca 292  Q
    | ||| | | | |||||||||||||||||||    
T  15750918 atttgagatgtcatatgatctccaactttca 15750888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 182
Target Start/End: Original strand, 40674517 - 40674634
Alignment:
Q  65 cactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactc 164  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |||| ||| | | ||||| ||  || |||||| |||||||| |  ||||||||| || |||||| || ||||||    
T  40674517 cactccgtactatacaacattgttgatctgcctgatattcgatagaattttcctttcaacttaagtgatactttcttatcacataaaacatctcagactc 40674616  T
Q  165 ttctccatttcaaccacc 182  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  40674617 ttccccacttcaaccacc 40674634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 54278919 - 54278855
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  54278919 tgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaacaacgctggtctgactgctgtccgata 54278855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38606939 - 38606592
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38606939 acattatcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgata 38606840  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38606839 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggtttacatct 38606740  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38606739 gcttctatttcttcgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcacct-caaggtagacc 38606641  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      ||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38606640 --cacttctccttttgcaaaaattacattccatatactccgtcttgcttct 38606592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32630529 - 32630193
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32630529 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgtcggtctgattgatgtccgata 32630430  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |             
T  32630429 gaactttcctttcagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacactcgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatga--------- 32630339  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
       | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32630338 ---tgtaattctccatcattttgtaatatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 32630242  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32630241 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 32630193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 46356234 - 46356547
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  46356234 tgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaatgccggtctgactactgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagtactttcttat 46356333  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  46356334 cgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggaccc 46356433  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  46356434 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatat 46356531  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  46356532 actccgtcttgcttct 46356547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36651928 - 36651580
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  36651928 acatcctcatctctgttacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggattgctgtccgata 36651829  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  36651828 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 36651729  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36651728 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgcgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 36651629  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       |||||| |||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36651628 --tacttcttcttccgctgaagttccattccatatactccgtcttgcttct 36651580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 69 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37616790 - 37616502
Alignment:
Q  69 ccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttct 168  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37616790 ccgtaccatacaacaatgtcggtctgactgctggccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttct 37616691  T
Q  169 ccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-g 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37616690 ccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttgg 37616591  T
Q  268 ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37616590 ggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 37616502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 33350154 - 33350502
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  33350154 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 33350253  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  33350254 gaactttcctgtcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 33350353  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33350354 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaagaccctagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 33350453  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       |||||| |||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33350454 --tacttcttcttccgctgaagttacattccatatacttcgtcttgcttct 33350502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31005157 - 31004810
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  31005157 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 31005058  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  31005057 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatct 31004958  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004957 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggagccaagatatttaaa-cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 31004859  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  31004858 --tacttctccttccgctgaagtaacattccatatactctgtcttgcttct 31004810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11593894 - 11593552
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||  | |||||  |||| |||||||||    
T  11593894 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgttgtccgata 11593795  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  11593794 gaactttcctttcaacttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 11593695  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11593694 gcttctatttctccatcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtctaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc 11593595  T
Q  308 cacacttctccttt-tgttgaagttacattccatataccccgtct 351  Q
       |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11593594 --tacttctcctttccgctgaagttacatttcatatactccgtct 11593552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 36869637 - 36869985
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||| ||||||  |||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  36869637 acatcctcatctctgctacacttacttgattcacgtgttgactcttagtcgctcaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgttgtccgata 36869736  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  36869737 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacccctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 36869836  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||      
T  36869837 gcttttatttcttcgtcattttgtactatggatccaagatatttaaaccgcgtaatttggggtatgatatgctctccaactttcacctccagggtaga-- 36869934  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    || ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  36869935 catactttcccttttcctgaagttacattccatatactatgtcttgcttct 36869985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Original strand, 39906729 - 39907075
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 114  Q
    ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||| |||  | ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  39906729 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaatcgcctaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactt 39906828  T
Q  115 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccattt----caaccacccagcttgaatacgataatttacatctgc 210  Q
    | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||   || ||||| |    
T  39906829 tcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccaaccacccagcttgaatacgatggcttgcatctac 39906928  T
Q  211 ttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaccca 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39906929 ttctatttctccgtcattttgtacgaatgacccaagatatttaaaccgtgtaacatgggatatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc-- 39907026  T
Q  310 cacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
     ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39907027 tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 39907075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48919231 - 48918974
Alignment:
Q  100 tgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataa 199  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48919231 tgtccgatataaccttcctttcaacttaaggggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatga 48919132  T
Q  200 tttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctcca 298  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  48919131 ttcacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggatccaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtgtaatatgatctcctacttttaccttca 48919032  T
Q  299 aggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    | |||||||   |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48919031 atgtagacc--tacttctccatttgctgaagtcacattccatatactccgtcttgcttct 48918974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43281610 - 43281389
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43281610 acatcctcatccccgctacacttactttactcttgcgttggctcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtccgata 43281511  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43281510 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacgcctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 43281411  T
Q  209 gcttctatttctccatcatttt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  43281410 gcttctatttctccgtcatttt 43281389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49029210 - 49028853
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||    ||||  |||||||||||||||    
T  49029210 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacaccggttggactgctgtccgata 49029111  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--------------cccagcttgaatac 194  Q
     ||| || ||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||              ||||||||||||||    
T  49029110 gaactttcctttca-----agtggtattttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaaccacaaccaaccacccagcttgaatac 49029016  T
Q  195 gataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcac 293  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49029015 gatggcatacatctgcttctatttctccatcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatctgatctccaactttcac 49028916  T
Q  294 ctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49028915 ctccaaggtagacc--tacttctccttcccctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 49028853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Original strand, 35906549 - 35906796
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||| | || ||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  35906549 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 35906648  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  35906649 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaagatcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 35906748  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  35906749 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 35906796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34869319 - 34869170
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34869319 tgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 34869220  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaata 193  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34869219 cgcacaaaacgcctgaggctcttctccaattcaaccacccagcttgaata 34869170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 353
Target Start/End: Original strand, 24177714 - 24177886
Alignment:
Q  180 acccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatg 278  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24177714 acccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactattgacccgtgatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatg 24177813  T
Q  279 atctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttg 353  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24177814 atctccaaccttcatctacaagctagacc--tacttcttcttttgctgaagttacattccatatactccatcttg 24177886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33072888 - 33072666
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||||||||||| | || ||||| || | || | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  | |||||| |||| |||||||||    
T  33072888 acatcatcatctctgctacacttatttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacaacgccggtctaactgttgtccgata 33072789  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||    
T  33072788 gaactttccttttaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttacatct 33072689  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttg 231  Q
    ||||||| || ||| ||||||||    
T  33072688 gcttctaattatccgtcattttg 33072666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7272973 - 7272780
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| | || |||||||||||| |||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7272973 acatcctcatctccggtacacttacttgattctcgtgttggctctcaaccgcccaacactctgtatcatacaacattgtcggtttgactgctgaccgata 7272874  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataattta 203  Q
     ||| || || ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7272873 caactttcctctcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaatacctgaggct-ttctcaatctcaaccacccagcttgaatacgatgattta 7272780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 296
Target Start/End: Original strand, 24550178 - 24550320
Alignment:
Q  150 aaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagata 249  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||| |||||||  ||||||    
T  24550178 aaacacgtgagaccctcctccatttcaaccacccaacttgaattcaacaatttacatctccttctattaatccgtcgttttgtaatatggactaaagata 24550277  T
Q  250 tttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||||| |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24550278 tttaaatcgtgtaact----tatgatatgatcttcaactttcacctc 24550320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23404333 - 23404181
Alignment:
Q  28 acttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 127  Q
    |||||||| | || |||| ||||| |||||||| ||  ||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||| ||||    
T  23404333 acttacttgattctcgtgctggcttttaaccgcccaaaacttcgtaccatacaatatcgtcggtctgactgttgtccgatagaattttcctttcaactta 23404234  T
Q  128 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca 180  Q
    ||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23404233 agtggtcctttcttatctcagaaaacacctgaggctcttctccattttaacca 23404181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 12841623 - 12841773
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||| |||||    
T  12841623 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcagactgctgtacgata 12841722  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctga 159  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12841723 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctga 12841773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 295
Target Start/End: Original strand, 21517826 - 21517959
Alignment:
Q  162 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 261  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |  ||||||| | ||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  21517826 ctcttctcgatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatatgttattatttcttcgtca-tttgtactatgaatccaagatatttaaactgtgt 21517924  T
Q  262 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    || ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  21517925 aaattgaggtatcatgtggtctccaactttcacct 21517959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 43793592 - 43793676
Alignment:
Q  213 ctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43793592 ctatttcttcgtcattttgtactatagacccaagatatttaaaatgtgtaactagtggtatgatatgatctctaactttcacctc 43793676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 206
Target Start/End: Original strand, 7189615 - 7189777
Alignment:
Q  43 gtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctta 142  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||  | |||||||  ||||||  |  |||||||    
T  7189615 gtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccatacaacatcgtcggtctgactactgtct-ataaaatttctctttcaatttaagtaatactttctta 7189713  T
Q  143 tcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 206  Q
    ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||| || ||||||||    
T  7189714 tcaaataaaacacctgagacttttctccatttcaaccactcaacataaatacaatgatttacat 7189777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18637371 - 18637233
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||    
T  18637371 aaaacacatgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagat 18637275  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18637274 atttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18637233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18650806 - 18650668
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||    
T  18650806 aaaacacatgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagat 18650710  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18650709 atttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 253
Target Start/End: Original strand, 23087603 - 23087694
Alignment:
Q  162 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatattta 253  Q
    ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| || ||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  23087603 ctcttttccatttcaaccatctaacttgaatacaatgatttacatacacttttatttctccttcattttgtactatgaacccaagagattta 23087694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 289
Target Start/End: Original strand, 18608199 - 18608319
Alignment:
Q  167 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 266  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  ||||||||||||  |||||||||    
T  18608199 ctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaaaatgtgtaactt 18608295  T
Q  267 g-ggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  18608296 gtgatatgatatgatctccaactt 18608319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5843177 - 5843105
Alignment:
Q  210 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatc 281  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5843177 cttcgatttcttcatcgttttgtattataaacctaaaatatttaaatcgtgtaacttgtggtatgatatgatc 5843105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18626639 - 18626559
Alignment:
Q  210 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||  ||  ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18626639 cttctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18626559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33139077 - 33139006
Alignment:
Q  137 ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
    |||||| ||||||| |||| | |  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  33139077 ttcttagcgcacaatacacattaagctcttctccatttcaatcacccaacatgaatacgatgatttacatct 33139006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 47235666 - 47235600
Alignment:
Q  29 cttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctga 95  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||| ||||||| ||||||    
T  47235666 cttactttattcacgtgttggttctttaccgctcaacactccgtctcatacagcattgtcagtctga 47235600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 13859372 - 13859476
Alignment:
Q  27 tacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctt 126  Q
    ||||||||| | || ||||||  ||||||||||| || || ||||||||  |||||| || |||||| |||||||| | ||| ||| || |||||| |||    
T  13859372 tacttacttgattctcgtgttaactcttaaccgcccaacattccgtaccaaacaacactgccggtctaactgctgttcaatagaactttcctttcaactt 13859471  T
Q  127 aagtg 131  Q
    |||||    
T  13859472 aagtg 13859476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 42854352 - 42854709
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854352 acatcgtcatctccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 42854451  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42854452 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 42854551  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42854552 gcttctatttctcaaacattttgtacgatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacc 42854651  T
Q  308 cac----actt---ctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||     |||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42854652 cacttctccttttgctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 42854709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 358
Target Start/End: Original strand, 36565630 - 36565937
Alignment:
Q  50 ctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcaca 149  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  36565630 ctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcaca 36565729  T
Q  150 aaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagata 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  36565730 aaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagata 36565829  T
Q  250 tttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccg 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |      
T  36565830 tttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgttgaagttacatttcatatactcta 36565927  T
Q  349 tcttgcttct 358  Q
    ||||||||||    
T  36565928 tcttgcttct 36565937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 15215619 - 15215966
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15215619 acatcctcatctccgcttcacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattttcggtctgactactgttcgata 15215718  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15215719 gaactttcctttcagcttaagtgatactttcttaccgcacaagacactggaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatgatttacatct 15215818  T
Q  209 gc-ttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac-ttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac 306  Q
    || ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15215819 gctttctatttct--gtcactttgtactatggacccaatatatttaaaccgtgtaactttgggtatgatatgatctccaactttcacctccatggtagac 15215916  T
Q  307 ccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  15215917 c--cacttctccttttgctgaagttacatttcatgtactccgtcttgcttct 15215966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 12492225 - 12492538
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||||  | ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  12492225 tgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatgcaacaacgccggtcggacggctgtccgatagaactttcctttcatcttaagtggtactttcttat 12492324  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  12492325 cgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccaacctgaatacgatagcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 12492424  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  12492425 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttatccttccgctgaagttacattccatat 12492522  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  12492523 actccgtcttgcttct 12492538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 84 - 358
Target Start/End: Original strand, 4032917 - 4033190
Alignment:
Q  84 ttgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc 183  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4032917 ttgtcggtctgactgttgtccgataaaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccc 4033016  T
Q  184 agcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatct 282  Q
    | |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4033017 aacttgaatatgatgatttacatatgcttttatttctccatcattgtgtactatgaacccaagatacttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatct 4033116  T
Q  283 ccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4033117 ccaactttcatctccaaggtagacc--ttctactccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgtttct 4033190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 77 - 358
Target Start/End: Original strand, 8879850 - 8880130
Alignment:
Q  77 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 176  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  8879850 tacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggttcttctctatttca 8879949  T
Q  177 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgat 275  Q
    |||| ||| | ||||||||||  | | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8879950 accatccaacatgaatacgatgctattcatctggttctatttctccttcattttgtactatgagcccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgat 8880049  T
Q  276 atgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  8880050 atgattttcaactttcaccttcacggtcgacc--tacttctccttttgctgaagttacatttcatgtactccgtcttgcttct 8880130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36544998 - 36544738
Alignment:
Q  97 tgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacga 196  Q
    |||| ||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36544998 tgctatccgatagaactttcttttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttatccatttcaaccacccaacttgaatacga 36544899  T
Q  197 taatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36544898 tgacttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagccccatgatatttaaaccttgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 36544799  T
Q  296 ccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||||||||   ||||||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36544798 ccaaggtagacc--tacttctccttccgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttct 36544738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18125103 - 18124825
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 114  Q
    ||||||||| || |||||||| | || | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  18125103 tcatctccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgttggtctgactgttgtccgatagaactt 18125004  T
Q  115 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 214  Q
    | |||||| || |||||||  ||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  18125003 tcctttcaact-aagtggtactttcttatcacataaaacacctgaggtttttctccatttcaaccattcagcttgaattcgatgagttacatctgcttct 18124905  T
Q  215 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  18124904 atttctccatcattttgtattatgga--caaaatatttaaaccatataacttaggatatggtatgatctcaaacttttacct 18124825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37077699 - 37077490
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||| || |    
T  37077699 acatcctcatctccgccacacttacttgattctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacagcatcgacggtctgactgttgtctgaca 37077600  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| |  |||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||     
T  37077599 taacttccctttcaacttaagtggtacttacttatcacacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacttagcttgaatacgatgatttacatcg 37077500  T
Q  209 gcttctattt 218  Q
    ||||||||||    
T  37077499 gcttctattt 37077490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39946791 - 39946603
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || ||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  39946791 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgctgtccgata 39946692  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 197  Q
     ||| || ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39946691 gaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccatccagcttgaatacgat 39946603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25300138 - 25299950
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctt 141  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| | |||||  |||| |||  |||| ||| || |||||| ||||| ||||  ||||||    
T  25300138 cgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaattggtactttctt 25300039  T
Q  142 atcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25300038 atcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccatcatttt 25299950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13984842 - 13984672
Alignment:
Q  135 ttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat 234  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||     
T  13984842 ttttcttatcacataaaacacttgaggctcttcttcatttcaaccatccaacttaaatacgatgatttacatctgcttttatttctttgtcatttt-tac 13984744  T
Q  235 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  13984743 tatggacccaagatatttaaaccgtgtatcttggggtatgatatgatcttcttctttcaccttcaaggtaga 13984672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25288803 - 25288613
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctt 141  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| | |||||  |||| |||  |||| ||| || |||||| ||||| ||||  ||||||    
T  25288803 cgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaattggtactttctt 25288704  T
Q  142 atcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--cccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  25288703 atcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccgtcatttt 25288613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25439391 - 25439249
Alignment:
Q  88 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 187  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  25439391 cggtctgactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccatcctgct 25439292  T
Q  188 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 230  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25439291 tgcatacgatgatttacatatgcttctatttctccgtcatttt 25439249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 18752227 - 18752344
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 114  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  18752227 tcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgtccagcactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactt 18752326  T
Q  115 ttctttcagcttaagtgg 132  Q
    | |||| |||||||||||    
T  18752327 tcctttgagcttaagtgg 18752344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 302
Target Start/End: Original strand, 28300596 - 28300747
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    |||||| | ||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  28300596 aaaacatccgagtctcttctccaatttaaccatccaacttgaatacgatgatgtacatctgcttttatatctcagtcattttgtaccatgaacccaagat 28300695  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 302  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28300696 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctccagctttcacctctaaggt 28300747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 293
Target Start/End: Original strand, 19293776 - 19293913
Alignment:
Q  157 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19293776 tgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaaac 19293875  T
Q  257 cgtgtaa-cttgggtatgatatgatctccaactttcac 293  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  19293876 cgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 19293913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 290
Target Start/End: Original strand, 30113671 - 30113827
Alignment:
Q  136 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttc-tatttctccatcattttgtat 234  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  30113671 tttcttatcacataaaacacctgcgactcttctccatttcaaccatttagcttgaatacaatgatttacatctgcttcttttttctccgtcattttatat 30113770  T
Q  235 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaacttt 290  Q
    ||  ||  |||||||||| |||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30113771 tacagattcaagatatttgaactatataatttggagtatgatatgatctccaacttt 30113827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 305
Target Start/End: Original strand, 41444809 - 41444949
Alignment:
Q  167 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatta-tggacccaagatatttaaaccgtgtaact 265  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  41444809 ctccatttcaaccaccttgcttgtattcaatgatttacacttgcttctatttctacatcattttgtatcattgaacccaagatatttaaaccaagtaact 41444908  T
Q  266 tg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  41444909 tgtggtatgatatgatctccacctttcacctctaagttaga 41444949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29735592 - 29735454
Alignment:
Q  161 actcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||        |||||| |||     
T  29735592 actcatctccatttcaaccacccaacttgaataagatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttgaactatggac-------gtttaaatcgta 29735500  T
Q  261 taactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29735499 taacttggggtatgatatgatctcccactttcacctccatggtaga 29735454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35601799 - 35601686
Alignment:
Q  141 tatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga 240  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35601799 tatcacacaaaacacttgagagtcttctccatttctatcacccaa-ttgaattcgataatttacatctacgtctatttctctgtcattttgtattatgga 35601701  T
Q  241 cccaagatatttaaa 255  Q
     ||||||||||||||    
T  35601700 tccaagatatttaaa 35601686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 33830721 - 33830875
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||    
T  33830721 aaaacacttgagactcttcaacattttaaccatccaacttgaacacgatgatttacatatgcttttatttcttcgtcattttgtacaatggacccaaaat 33830820  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  33830821 atttaaactgtgtaactt--atatgataagatatccaactttcatgtctaaggtaga 33830875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38667351 - 38667205
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| | || |||| ||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  38667351 aaaacacattaggctctactctatttcaaccatccaactttaatacgatgatttacatcttcttttatttctctatcgttttgtactatgaacccaagat 38667252  T
Q  249 attt-aaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38667251 atttaaaactttgtaactt--gtatgatatgatctccaagtttcacctc 38667205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25985334 - 25985128
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||| |||||  ||| || | ||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| || |||| ||    
T  25985334 aaaacacttgaggcactcctccatttcaactacccattttggattcaatggtttacatctccttctatttctccatatttttgtactatagatccaatat 25985235  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatacccc 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||   |  |||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |     
T  25985234 atttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatga--tccaactttcacctctaagctaga--aatgcttcgcctcttgctaaacttacattccatatactct 25985139  T
Q  348 gtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||    
T  25985138 gtcttgcttct 25985128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 344
Target Start/End: Original strand, 18849624 - 18849797
Alignment:
Q  158 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaacc 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||       ||||||||||||||    
T  18849624 gagactcttatccatttcaaccacccagcttg-----gatgatttacatttgcttctatttctccgtcactttatacta-------aagatatttaaacc 18849711  T
Q  258 gtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatac 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | | |   ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18849712 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaatttttacctctaaggcataac--tacttcaccttttgttgacgttatattccatatac 18849797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13589247 - 13589084
Alignment:
Q  136 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 235  Q
    |||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |    
T  13589247 tttcttatagcataaaacacatcaggctcttctccatttcaaccatccaccttgaatatggtgattttcatatgcttctatttcttcatcattttatact 13589148  T
Q  236 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctcca 298  Q
    |  ||||||| || |||  | | ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  13589147 aacgacccaatatttttgtatcatgtaacttgggatttgatatgatctctcactttcacctcca 13589084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 151
Target Start/End: Original strand, 36395336 - 36395443
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  36395336 tgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 36395435  T
Q  144 cgcacaaa 151  Q
    ||||||||    
T  36395436 cgcacaaa 36395443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 303
Target Start/End: Original strand, 6510841 - 6511059
Alignment:
Q  86 gtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca-caaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 184  Q
    ||||||||||||  |||| | || ||| || |||||| ||||||  ||  ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6510841 gtcggtctgactaatgtctgttagaactttcctttcaacttaagcagtactttcttatcacatcaaaccacatgagactcttctccatttcaaccactca 6510940  T
Q  185 gcttgaatacgataattta-catctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctc 283  Q
     ||||||| | || |||||  | ||||||| |||||||| ||| ||| || || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||  | || ||||||     
T  6510941 acttgaatgcaatgatttatgacctgcttccatttctccttcactttatactacggatccaagatatttataccatgtaacttggg-gttatgtgatctt 6511039  T
Q  284 caactttcacctccaaggta 303  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  6511040 caacctttacctccaaggta 6511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 290
Target Start/End: Original strand, 45332039 - 45332117
Alignment:
Q  213 ctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaacttt 290  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45332039 ctatttctccaccgttttgtactatgaagccaggatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgacatgatctccaacttt 45332117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2796470 - 2796326
Alignment:
Q  28 acttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 127  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||| | ||  |||| ||||| || ||||  |||||||| |||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||    
T  2796470 acttacttgattctcgtgttgactcttaaccacccaagactcggtaccatataacaacgtcggtctaactgttgtccaatataactttcctttcaactta 2796371  T
Q  128 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccat 172  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  2796370 agtggtactttcttatcgcacagaacaccgaaggctcttctccat 2796326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Original strand, 10824546 - 10824609
Alignment:
Q  119 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 182  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10824546 ttcaacttaactggtattttcgtatcacataaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 10824609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6986603 - 6986525
Alignment:
Q  162 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga 240  Q
    ||||||| ||||||   ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6986603 ctcttcttcatttcggtcactcagattgaattcgataatttacatatgcttcgatttctctatcattttgtattatgga 6986525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35601598 - 35601501
Alignment:
Q  158 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaa 255  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| | || || |||| | | || ||||||||||||||    
T  35601598 gagactattctccatttcaatcacccggattgaattcgataatttacatctacgtctctttcttcgtcgttgtgtactttagatccaagatatttaaa 35601501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 43732230 - 43732279
Alignment:
Q  247 atatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43732230 atatttaaaccgtgttacttgtgctatgatatgatctccaactttcacct 43732279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43732396 - 43732355
Alignment:
Q  151 aacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43732396 aacacttgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaat 43732355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Original strand, 13172147 - 13172200
Alignment:
Q  162 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttcta 215  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  13172147 ctcttctctatttcaaccaccctgcttgaatacaatgattcacatttgcttcta 13172200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3285163 - 3285135
Alignment:
Q  268 ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285163 ggtatgatatgatctccaactttcacctc 3285135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13984256 - 13984216
Alignment:
Q  318 cttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13984256 cttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttct 13984216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 231
Target Start/End: Original strand, 44681543 - 44681644
Alignment:
Q  128 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 227  Q
    |||||| ||||| |||| || | ||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  44681543 agtggtattttcgtatcacatagaacacttgatgctcttctccatttcaaacactcaacttgaatacgctgatttaca--tacttctttttctccatcgt 44681640  T
Q  228 tttg 231  Q
    ||||    
T  44681641 tttg 44681644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9706710 - 9706362
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9706710 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccacctaacacttcgtaccatacaacattgccggtctgactgctgttcgata 9706611  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9706610 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgatgctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacacct 9706511  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9706510 gcttctatttctccatcattttgtaccatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtatacc 9706411  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9706410 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccatcttgcttct 9706362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5631752 - 5631403
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5631752 acatcctcatcttcgctacacttactttactctcgcgttggctcttaaccgcccaacactccataccatacaacattgtcggtctgactgttgtccgata 5631653  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5631652 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 5631553  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggaccc-aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5631552 gcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctctaactttcacctgcaaggtagac 5631453  T
Q  307 ccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  5631452 c--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttct 5631403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 10100205 - 10100553
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10100205 acatcctcatctccgctacacttacttgactctcgtcttggctcttaacctcccaacactccgtaccatacaacatcgtcggtctgactactgtccgata 10100304  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  10100305 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatctcacaaaacacatgaggctcttctccattccaaccacccagcttgaatacgatgatttatatca 10100404  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100405 gcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 10100504  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10100505 --tacttctcattttgctaaagttacattccatatactccgtcttgcttct 10100553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 5258508 - 5258846
Alignment:
Q  19 ctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttct 118  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  5258508 ctccgctacacttactttgctctcgtgttggctcttcgccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactttcct 5258607  T
Q  119 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctattt 218  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5258608 ttcagcttaagtggtactttctcatcgcaaaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatgtacatcagcttctattt 5258707  T
Q  219 ctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctc 317  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5258708 ctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacc--cacttctc 5258805  T
Q  318 cttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  5258806 cttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttct 5258846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Original strand, 20427984 - 20428331
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||  ||||||||| |  || |||||||||||| |||    
T  20427984 acatcctcatctccgctacacttatttgactctcgtgttggctcttaaccacccaacactctgtactatacaacatttttagtttgactgctgtccaata 20428083  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20428084 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttggatacgatgatttacatct 20428183  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20428184 gcttctatttttccgtcgttttgtactgtggacccaatatatttaaaccgcgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctcctaggtagacc 20428283  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 357  Q
       | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20428284 --taattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 20428331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33496118 - 33495793
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || | |||||| | |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||  ||    
T  33496118 acatcatcatctccgttacacttacttgattctcatgttggtttttaaccgtccaacactctgtaccatacaacattgcaggtctgactgttgtccttta 33496019  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
    ||             ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |    
T  33496018 aa-------------cttaagtggtactttcttatcacacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccatccagcttgaatatgatgagttacatat 33495932  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaccc 308  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  33495931 gcttctatttctccgttattttgtactatggacccaagat---------gtgtaactagggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc- 33495842  T
Q  309 acacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33495841 -tacttctccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttgcttct 33495793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 608093 - 607905
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  608093 acatcctcatctccgctacacttactttattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtacaatacaacattgccggtctgactgctgtccgata 607994  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 197  Q
     ||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  607993 gaacttttctttcagtttaagtggtcatgtcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 607905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2689554 - 2689313
Alignment:
Q  45 gttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatc 144  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  2689554 gttggctgttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcgacggtctgactgctgtccgattgaactttcctttcaacttaagtagtgctttcttatc 2689455  T
Q  145 gcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccca 244  Q
     ||||||| || |||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  2689454 acacaaaatacatgaggcacttctccatttcaatcatccagcttgactacgatgatttacatctgattctatttctccgtcgttttgtactatagaccca 2689355  T
Q  245 agatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 285  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2689354 aaatatttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctcca 2689313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14030740 - 14030558
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||    
T  14030740 acatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgctagtttgactgttgtccgata 14030641  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 191  Q
     ||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14030640 gaactttcatttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactattctccatttcaaccacccagtttgaa 14030558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27790950 - 27790742
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| | || ||| ||||| |  ||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||    
T  27790950 aaaacacttgaggctcttctctatttcaaccactcaactttattatgatgatttagacttgcttctatttatgcgtcattttgtactatggatccaagat 27790851  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatatacccc 347  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||| || |||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27790850 atttaaaccatgtaatttggagtattttatgacctcccaccttcacctccatggtagaac--tacttatccttttgttgaagttacactccatataccct 27790753  T
Q  348 gtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||    
T  27790752 gtcttgcttct 27790742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 6056151 - 6056329
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctt 141  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||   | |||||| ||||| || | |||||||    
T  6056151 cgtgttggttcttaaccacccaacactccgtatcatataacattgtcggtctgaccgttgtccgatagaattatcctttcaacttaaatgatattttctt 6056250  T
Q  142 atcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttct 220  Q
    |||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6056251 atcgcataaaacacttgaagctcttctacatttcaaccacccaacttgcctacgatattttacatatgcttctatttct 6056329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30679340 - 30679218
Alignment:
Q  77 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 176  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30679340 tacaacatcgtcggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaacttatgtggtactttcttatcgctcaaaacacctgagcctcttctctatttca 30679241  T
Q  177 accacccagcttgaatacgataa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  30679240 accacccaacttgaatacgataa 30679218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26291586 - 26291444
Alignment:
Q  136 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 235  Q
    ||||||||| || |||| || ||||  | |||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||||| || |    
T  26291586 tttcttatcacataaaatacatgaggttattctacatttcaaccatccaacttgaatacgttgatttgcgtatgcttctatttctccatcattttctact 26291487  T
Q  236 atggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatat 277  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26291486 atggactcaagatatttaaacggtgtaacttagggtatgatat 26291444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3632724 - 3632653
Alignment:
Q  235 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3632724 tatggatccaagatatttaaatcgtgtaatttagggtatgatatgatctccaactttcacctcaaaggtaga 3632653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30670556 - 30670472
Alignment:
Q  274 atatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttcttc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30670556 atatgatctccaactttcacctccaaggtatacctac--ttctccttttgctaaagatacattctatatactccgtcttgcttcttc 30670472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30031184 - 30031091
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||||||| || ||| |||| | || | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  30031184 tcatctccgctacactaacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcattggtctgactgctgtccgata 30031091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 6641916 - 6642013
Alignment:
Q  167 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 264  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||  |||||| |||||||    
T  6641916 ctccatttcaaccacccaactttaattcaatggtttacatctccttctatttctctctcattttgtactatagccctaagatgcttaaactgtgtaac 6642013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Original strand, 35043789 - 35043855
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtacc 75  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  35043789 acatcttcatctccgctacacttacttgactctcatgttggctcttaaccgtccaacactccgtacc 35043855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28085310 - 28085197
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||    
T  28085310 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttagccgcccaacactccgtaccatacagcaacaccggtctgactgctgtccgata 28085211  T
Q  109 aaacctttctttca 122  Q
     ||| || ||||||    
T  28085210 gaactttcctttca 28085197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 358
Target Start/End: Original strand, 2680698 - 2680746
Alignment:
Q  310 cacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  2680698 cacttctccttttgctgaaattacatttcatatactctgtcttgcttct 2680746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 32083093 - 32083441
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32083093 acatcctcatctccgctacacatactttactctcgtgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctgata 32083192  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32083193 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcatagaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacattt 32083292  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32083293 gcctctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaattgtgcaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 32083392  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32083393 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 32083441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8671819 - 8671506
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||  || || | |||||| |||||||  | ||||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8671819 tgttgactcttaaccgtccaacatttcgtaccatacaacaacgccggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 8671720  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||    
T  8671719 cgcacaaaacacctgagtctcttctccattttaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggaccc 8671620  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8671619 aagatatttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattccatat 8671522  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  8671521 actccgtcttgcttct 8671506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1210679 - 1210331
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||||||||    
T  1210679 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgctgtccgata 1210580  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1210579 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctcaggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 1210480  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210479 gcttttatttctccatcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 1210380  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1210379 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 1210331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 51441148 - 51441460
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  51441148 tgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 51441247  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||    
T  51441248 cgca-aaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttagatctgcttctatttctccgtcattttgtatgaaagaccc 51441346  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  51441347 aagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcaccttcaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatat 51441444  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || |||||||||||||    
T  51441445 actccgtcttgcttct 51441460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 43240729 - 43241077
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||| | || ||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  43240729 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacctcccaacactccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 43240828  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  43240829 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 43240928  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43240929 gcttccatttctccgtcattttgtacgaaggatccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagatc 43241028  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43241029 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 43241077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51601957 - 51601646
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||| ||  ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  51601957 tgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactactgtccgatagaactttcatttcaacttaaggggtactttcttat 51601858  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  51601857 cgaacaaaacacctgagactcttctctatttccaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 51601758  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  51601757 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatat 51601660  T
Q  343 accccgtcttgctt 356  Q
    || |||||||||||    
T  51601659 actccgtcttgctt 51601646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Original strand, 49347776 - 49348090
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||| |   || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  49347776 tgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaaggttggtcggactgctgtccgatagatttttcctttcaacttaagtggtactttcttat 49347875  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  49347876 cgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacacctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 49347975  T
Q  244 aagatatttaaacc-gtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccata 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  49347976 aagatatttaaaccagtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattcgata 49348073  T
Q  342 taccccgtcttgcttct 358  Q
    ||| |||||||||||||    
T  49348074 tactccgtcttgcttct 49348090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 30202478 - 30202731
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  30202478 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccacacaacaacgccggtcggactgttgtccgata 30202577  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  30202578 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccggcttgaatacgatggcttacatct 30202677  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  30202678 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgta 30202731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19936450 - 19936175
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 114  Q
    ||||||||| ||| |||| || | || | |||||| |||||||||| || |||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| ||  |    
T  19936450 tcatctccgctatgcttatttgattctcatgttggttcttaaccgcccaacactctataccctataacattgctggtctaactgctgtccgatataattt 19936351  T
Q  115 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 214  Q
    | ||||||  ||||| |||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19936350 tcctttcattttaagcggtactttcttatcacataaaacacttgaggttcttatccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatatgcttct 19936251  T
Q  215 atttctccatca-ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaact 288  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19936250 atttctccttcatttttgtattatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaact 19936175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Original strand, 34827483 - 34827784
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctt 141  Q
    |||||||| |||||||||  || ||||| ||||| |||||||| || | |||||||| ||||| ||| ||  || ||||||  |||||  ||  ||||||    
T  34827483 cgtgttggttcttaaccgaacaacactctgtaccatacaacatcgttgatctgactgttgtccaatataattttcctttcaatttaagcagtactttctt 34827582  T
Q  142 atcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggac 241  Q
    ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34827583 atcacataaaacacatgaggctcttctccatttcaaccattcaacttgaatacaatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggac 34827682  T
Q  242 ccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccat 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   | |  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34827683 ccaagatatttaaaccttgtaacttagggtatgatatgatctcccactttcacctccatcatgggac--cacttcttcttttgatgaagttacattccat 34827780  T
Q  341 atac 344  Q
    ||||    
T  34827781 atac 34827784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27445743 - 27445537
Alignment:
Q  98 gctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 197  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| || |||||||  |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27445743 gctgcccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcacataaaacactcggaactcttctccatttcaaccaaccaacttgaatacgat 27445644  T
Q  198 aatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27445643 gatttacatctgcttctatttctccatcattttgtactatggacccaacataattaaaccgtgtaacttggggtatgataagatctccaactttcacctg 27445544  T
Q  297 caaggta 303  Q
    |||||||    
T  27445543 caaggta 27445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 358
Target Start/End: Original strand, 37463249 - 37463558
Alignment:
Q  43 gtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctta 142  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| |||| |||| ||  || |||||| |||||   ||  |||||||    
T  37463249 gtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccatacaacattgctagtctgactgttgtctgatagaattttcctttcaacttaatcagtgctttctta 37463348  T
Q  143 tcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacc 242  Q
    ||  ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  37463349 tc--acctaacacctaaggctcttctccatatcaaccacctagcttaaatacaatgatatacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggact 37463446  T
Q  243 caagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccata 341  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  37463447 caagatatttaaactgtgtaactcggagtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga-----actccggcttttgctgaagttacattccata 37463541  T
Q  342 taccccgtcttgcttct 358  Q
    ||| | |||||| ||||    
T  37463542 tactctgtcttgtttct 37463558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8391706 - 8391525
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttaca--acattgtcggtctgactgctgtccga 106  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  8391706 acatcttcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatatacgacattgccggtctgactgctgtccga 8391607  T
Q  107 taaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 188  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8391606 taaaacattcctttaagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagctt 8391525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22090027 - 22089826
Alignment:
Q  10 catcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataa 109  Q
    |||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||  | ||||| |||||||||||||||     
T  22090027 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccacacaacaacgccggtcggactgctgtccgatag 22089928  T
Q  110 aacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctg 209  Q
    ||| || |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22089927 aactttcctttcaacttaagtggtattttcttattgcacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctg 22089828  T
Q  210 ct 211  Q
    ||    
T  22089827 ct 22089826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9592668 - 9592463
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | |||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  9592668 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgattcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcagtctgactattgtccgata 9592569  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||    
T  9592568 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacctct 9592469  T
Q  209 gcttct 214  Q
    ||||||    
T  9592468 gcttct 9592463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Original strand, 32066761 - 32066913
Alignment:
Q  151 aacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatat 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  32066761 aacacctgaggctcttctccattttaaccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaatat 32066860  T
Q  251 ttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32066861 ttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctccaattttcacctctaaggtaga 32066913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15085868 - 15085728
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  15085868 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctgata 15085769  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcaca 149  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15085768 gaactttcctttcagcttaagtggtgctttcttatcgcaca 15085728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 696203 - 696069
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  696203 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccacccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgctgtccgata 696104  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  696103 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttat 696069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 51234421 - 51234267
Alignment:
Q  136 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 235  Q
    |||| |||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  51234421 tttcgtatcacataaaagacctgaggctattctccatttcaaccacccaacttgaatttgatgatttacatctgcttcaatttctccatcattttgcact 51234322  T
Q  236 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaacttt 290  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51234321 atggactcaagatatttaaactatgaaacttgtttatgatatgatctccaacttt 51234267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7921716 - 7921574
Alignment:
Q  154 acctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatattta 253  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  7921716 acctgagaccctcatccatttcaacaacccaacttgaattcgatggtttacatctccttctatttctcaatcgttttgtactatggatccaagatatata 7921617  T
Q  254 aaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7921616 aatcgtgtaacttgtggtaagatatgatctccaactttcacct 7921574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28528375 - 28528227
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| | || ||||  |||||| || |||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  28528375 aaaacacctgaggcactcctcaatttcaaccacccagctcggattcgatggtttacacctccttctatttctccattgttttgtaacatagacccaagat 28528276  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28528275 atttaaactgtgtaacttgtggtatgctatgatctccaactttcacctc 28528227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 305
Target Start/End: Original strand, 35828894 - 35829038
Alignment:
Q  162 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 261  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||| | | ||    
T  35828894 ctcttttccatttcaaccacacagatcgaattcgatgatttacatatgcttctatttctccgtcgctttgtactatggacccaagatgtttaagcagcgt 35828993  T
Q  262 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35828994 aacttgtggtatgatatgatctctagctttcacctccaaggtaga 35829038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6640898 - 6640772
Alignment:
Q  171 atttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-gg 269  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6640898 atttcaaccacccaacttggatccaatggtttacacctccttctatttctccataattttgtactatagactcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgg 6640799  T
Q  270 tatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||    
T  6640798 tgtaatatgatctctaactttcacctc 6640772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 292
Target Start/End: Original strand, 52739965 - 52740098
Alignment:
Q  159 agactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccg 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||| ||||| ||||||    
T  52739965 agactcttctccatttcaaccatccaacttgagtaagatgacttacatctacttctatttctccgtcactttgtactataggtccaaaatattcaaaccg 52740064  T
Q  259 tgtaacttgggtatgatatgatctccaactttca 292  Q
    || |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  52740065 tgcaacttaagcatgatatgatctccaactttca 52740098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 46226630 - 46226853
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||| | ||||  ||||| || | |||||| |||||||| |||  | |||| | |||| ||||    
T  46226630 acatcatcatctccgctaaacttacttgattctcgtgttggttgttaattgctcaacatttcgtaccatacaacatcgtcactatgacagttgtctgata 46226729  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||  ||||||||| ||||||   |  ||||||| | || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  46226730 gaatttttctttcaacttaagcactactttcttagcacataaaacacttgatgctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacaat-atttacatct 46226828  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgta 233  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  46226829 gcttttgtttctccatcattttgta 46226853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 305
Target Start/End: Original strand, 12807587 - 12807732
Alignment:
Q  162 ctcttctccatttcaa-ccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 260  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||||||||| |||||||||||| | || |||| || |||||| ||||||||||||||  |||    
T  12807587 ctcttctccatttcaaaccacctagaataaattcgatgatttacatcagcttctatttcttcgtcgttttatactatggatccaagatatttaaattgtg 12807686  T
Q  261 taacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12807687 taacttgtagtatgatacgatcctcaactttcacctctaaggtaga 12807732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52421210 - 52421017
Alignment:
Q  161 actcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||   || ||||||| ||  |||||||| |||||||| | ||    
T  52421210 actcttctctatttcaaccacccaacttgaattcgatgattaacatatgcttttatttctatgtc-ttttgtactaaagacccaagctatttaaa-cttg 52421113  T
Q  261 taacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 357  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||   | ||||| ||||||| |||| || |||| |||||| |  ||||||||||    
T  52421112 taacttgtggcatgatatgatctctaactttcacctataaggtaga--gatacttcaccttttgctgaaattccatttcatatatcatgtcttgcttc 52421017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21275725 - 21275588
Alignment:
Q  119 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctattt 218  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  | ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | || |||||||||  ||| ||| |    
T  21275725 ttcagcttaagtggtactttcttatcaaataaagcacatgagactcttctttatttcaaccactcagcttggattcaatgatttacatcaacttttatat 21275626  T
Q  219 ctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 256  Q
    |||  || ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  21275625 ctctgtcgttttgcactatcgacccaagatatttaaac 21275588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40419381 - 40419328
Alignment:
Q  243 caagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419381 caagatatttaaactgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 40419328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 304
Target Start/End: Original strand, 46226887 - 46226956
Alignment:
Q  236 atggacccaagatatttaaaccgtgtaact-tgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtag 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46226887 atggacccaagatatttaaaccgtgtaactcaaggtatggtatgatctccaacttgcacctccaaagtag 46226956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3877621 - 3877495
Alignment:
Q  171 atttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-gg 269  Q
    ||||||| ||||||  ||||||  ||| | ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |     
T  3877621 atttcaagcacccatattgaatttgatgaattatatttgcttctatttctccatcgttttatattatggacccatgatatttaaattgtgtaatttgtga 3877522  T
Q  270 tatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  3877521 aatgatataatctccaatttttacctc 3877495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 298
Target Start/End: Original strand, 16142399 - 16142487
Alignment:
Q  211 ttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacctcca 298  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||    
T  16142399 ttctttttcttcgtcattttgtattatgaacccaagatatttaaaatgtgtcacttgggatatgatatgccctcccaccttcacctcca 16142487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 268
Target Start/End: Original strand, 11331568 - 11331666
Alignment:
Q  165 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 264  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11331568 ttctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgcttctatttctctgtcatt-----ttatggaccaaatatatttaaatcgtgtaac 11331662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 268
Target Start/End: Original strand, 11489589 - 11489687
Alignment:
Q  165 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 264  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11489589 ttctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgcttctatttctctgtcatt-----ttatggaccaaatatatttaaatcgtgtaac 11489683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 302
Target Start/End: Original strand, 52641033 - 52641093
Alignment:
Q  240 acccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 302  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52641033 acccaatatatttaaattgtgtaacttg--tatgatatgatctccaactttcacctctaaggt 52641093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 52640920 - 52640997
Alignment:
Q  156 ctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgta 233  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  52640920 ctgaggctcttcttcatttcaacaattcaacttgaatacgataatttacatatgcttttatctctctgtcattttgta 52640997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Original strand, 16273415 - 16273471
Alignment:
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 302  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16273415 aagatatttaaattgtgtaacttg--tatgatatgatctccaactttcatctctaaggt 16273471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 52831924 - 52831830
Alignment:
Q  77 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctcca 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  |||||||||  |||| ||    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  52831924 tacaacattgtcggtctaactgtcgtccgatacaatttttctttcaatttaaatgacactttcttatcgcataaaacacatgaggctcttctcca 52831830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 42 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3301750 - 3301435
Alignment:
Q  42 cgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctt 141  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||||  |||||||||  ||||||    
T  3301750 cgtgttggctcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcagtctgactactgtccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttctt 3301651  T
Q  142 atcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggac 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  3301650 atcgcacaaaacacctgaggctcatctctatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttgcatctgcttctatttctccttcatttggtactatggac 3301551  T
Q  242 ccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3301550 ccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccat 3301453  T
Q  341 ataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3301452 atactccgtcttgcttct 3301435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 63 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3394593 - 3394297
Alignment:
Q  63 agcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttct---ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctga 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3394593 agcactccgtactatacaacattgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctga 3394494  T
Q  160 gactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgt 259  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3394493 ggctcatctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgt 3394394  T
Q  260 gtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3394393 gtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaa-ttacattccatatactctgtcttgcttct 3394297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1275199 - 1274851
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | ||| ||||||| | || | ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  1275199 acatcctcatctctgctatgcttacttgattctcatgttgactcgtaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgata 1275100  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1275099 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccttaggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 1275000  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1274999 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtagacc 1274900  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1274899 --tacttctcctttcgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 1274851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 12492735 - 12493083
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  12492735 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaaagccggtcggactgctgtccgata 12492834  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  12492835 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 12492934  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12492935 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaacttttacctccaaggtagagc 12493034  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12493035 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 12493083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10639231 - 10638883
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  10639231 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttcaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgttcgata 10639132  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  10639131 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 10639032  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10639031 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacc 10638932  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10638931 --tacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtctttcttct 10638883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Original strand, 28977211 - 28977553
Alignment:
Q  15 tcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 114  Q
    ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| || ||||| ||||||||| ||| |    
T  28977211 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcgttcggactgatgtccgatagaactt 28977310  T
Q  115 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 214  Q
    | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  28977311 tcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctacttct 28977410  T
Q  215 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacact 313  Q
    ||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||    
T  28977411 attactccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtgacttggggtatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacc--tact 28977508  T
Q  314 tctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28977509 tctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 28977553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20318921 - 20318577
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| |||||||    
T  20318921 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcgcaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctatccgata 20318822  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  20318821 taactttcctttcaacttaagtggta----cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 20318726  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20318725 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaac 20318626  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
       ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20318625 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 20318577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 1287937 - 1288285
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | || || ||||||||| |||||    
T  1287937 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccgatcggactgctgttcgata 1288036  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||    
T  1288037 gaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttacatct 1288136  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1288137 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggactcaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga-- 1288234  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |  ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1288235 cttacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 1288285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 2075822 - 2076170
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  2075822 acatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 2075921  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  2075922 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttcttcatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatct 2076021  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2076022 gcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaac 2076121  T
Q  308 cacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
        |||||||||  | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  2076122 --tgcttctccttccgctgaagttacattccatgtactctgtcttgcttct 2076170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24178381 - 24178110
Alignment:
Q  86 gtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccag 185  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  24178381 gtcggtctgactgctgcccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccaa 24178282  T
Q  186 cttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcc 284  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24178281 cttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatctttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctcc 24178182  T
Q  285 aactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24178181 aactttcacttccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttct 24178110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 137 - 344
Target Start/End: Original strand, 16347879 - 16348084
Alignment:
Q  137 ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatta 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  16347879 ttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccta-cttgaatacgatgatttacatacgcttttatttctccgtcattttgtacta 16347977  T
Q  237 tggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacat 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  16347978 tggacacaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacat 16348075  T
Q  336 tccatatac 344  Q
    | |||||||    
T  16348076 ttcatatac 16348084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 358
Target Start/End: Original strand, 27302451 - 27302643
Alignment:
Q  162 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 261  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27302451 ctcttttccatttcaaccactcaacttgaatacgatgatttacatct---tctatttctccgccgttttgtattatggacacaagatatttaaaccgtgt 27302547  T
Q  262 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  27302548 agtttgaggtatgatatgatctccaacactcaccttcaaggtagaac--tactttaccttttgttgaagttacattccatatactcagtcttgtttct 27302643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34272956 - 34272768
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || | | ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||     
T  34272956 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggccggactgctgtccgatt 34272857  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 197  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34272856 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccattttaaccacccaacttgaatacgat 34272768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36200590 - 36200426
Alignment:
Q  135 ttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat 234  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||   ||||||||||     
T  36200590 ttttcttatcacataaaacacatgagtctcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgctactatttctatgtcattttgtac 36200491  T
Q  235 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctcca 298  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36200490 tatgaacccaaaatatttaaacggtgtaacttgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 36200426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 16347726 - 16347877
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||    
T  16347726 acatcctcatctccgctacacttacttaactctcgtgttggctcttaaccgctcaacactccgtaccatacaatatcgtcggtctgagtgttgtccgata 16347825  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgag 160  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16347826 gaactttcctttcaacttaagtggtaatttcttattgcacaaatcacatgag 16347877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 296
Target Start/End: Original strand, 43558318 - 43558450
Alignment:
Q  165 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 264  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43558318 ttctccatttccactaccctgcttgaattcgatgatttacatctgcttctatttctctgtggttttgtacaatggacctaagatatttaaatcgtgtaac 43558417  T
Q  265 ttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43558418 ttgtggtatgctatgatctccaactttcacctc 43558450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27828 - 27622
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | || | |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  |||| ||||    
T  27828 acatcctcatctccgttatgcttacttaattctcatgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcgtctgtccgactattgtcagata 27729  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||  || |||||| ||||||||||  ||||||||| |  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |    
T  27728 gaattttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacgtaaaacactcgagactcttctctatttccaccacccaacttgaatatgatgatttacattt 27629  T
Q  209 gcttcta 215  Q
    | |||||    
T  27628 gattcta 27622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 305
Target Start/End: Original strand, 17341748 - 17341846
Alignment:
Q  208 tgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17341748 tgcttctatttctctatcattttctactatggacccaatatatttaaaccatgtaatttcaggtatgatatgatctccaacttccacctccaaggtaga 17341846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Original strand, 43423578 - 43423656
Alignment:
Q  166 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccca 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  43423578 tctccatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctgtttctccgtcattttgtactacggaccca 43423656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 256
Target Start/End: Original strand, 20077305 - 20077413
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat-tatggacccaaga 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |    
T  20077305 aaaacacctgaggctcttctccatttcaaccatccaacctgaaaatgatgatttgcatctgctttaatttctccgtcattttgtataaatgaacccaaaa 20077404  T
Q  248 tatttaaac 256  Q
    |||||||||    
T  20077405 tatttaaac 20077413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27602 - 27518
Alignment:
Q  270 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgctt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |   ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  27602 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggcataac--tacttcgcctattgttgaagttacattccctatactctgtcttgctt 27518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 289
Target Start/End: Original strand, 38578992 - 38579130
Alignment:
Q  149 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 248  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||   ||||| |||  || |||||||||| |||  || ||||||    
T  38578992 aaaacacatgaggcactcctccatttcaaccactcagcttggattcgatcgtttacat---cttctgttttcccgtcattttgtactatcaactcaagat 38579088  T
Q  249 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  38579089 atttaaactgtgtaacttgtgctataatatgatctccaactt 38579130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3097041 - 3096828
Alignment:
Q  77 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 176  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||  ||| || ||||||||| || ||||  |||||||||    
T  3097041 tacaacatcgtcggtcttaccgttgttcgataaaaa-tttccttcaacttaagcggtattttcacatcacataaaacacctaaggctctcatccatttca 3096943  T
Q  177 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgat 275  Q
    |||||||| |||||||  |||  |||| |||  ||| ||| ||      |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||    
T  3096942 accacccaacttgaatttgatggtttatatccccttatatgtc------attttgtactataaacccaagatatttaaaccatgtaacttgtgctgagat 3096849  T
Q  276 atgatctccaactttcacctc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  3096848 atgatctctaactttcacctc 3096828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23979930 - 23979820
Alignment:
Q  242 ccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccata 341  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   ||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  23979930 ccaagatatctaaattgtgtaacttc--tatgatatgatctccaactttcacctctaaggttgaac--tactttgtcttttgttgaagttacattacata 23979835  T
Q  342 taccccgtcttgctt 356  Q
    ||||  |||||||||    
T  23979834 taccatgtcttgctt 23979820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Original strand, 6368478 - 6368561
Alignment:
Q  214 tatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6368478 tatttctccgtcgttttgtactatagatacaagatatttaaattgtgtaacttgtggtatgttatgatctccatctttcacctc 6368561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21915619 - 21915532
Alignment:
Q  210 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21915619 cttctatttcttcgttattttgtactattgaaccaatatatttaaaccgtgtaacttgtattatgatataatctcgaactttcacctc 21915532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37124278 - 37124207
Alignment:
Q  235 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 305  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37124278 tatggactcaagctatttaaacaatgtaacttgttgtatgatttgatctccaactttcacctctaaggtaga 37124207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28676314 - 28676253
Alignment:
Q  157 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttc 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  28676314 tgagattcttctccatttcaaccacaca-cttgaatacgatgatttgcatatgcttctatttc 28676253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25937780 - 25937719
Alignment:
Q  235 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggta-tgatatgatctccaactttcacct 295  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25937780 tatggacccaagatatttaatttgtgtaatttggggaatgatatgatctccaactttcacct 25937719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 343
Target Start/End: Original strand, 2653 - 2951
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  2653 tgttgactcttaaccgcccaacactccataccatacaacaacgtcagtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 2752  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||    
T  2753 cgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggaccc 2852  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  2853 aagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaatgtaga--ctgacttctccttccgctgaagttacattccatat 2950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31367 - 31054
Alignment:
Q  44 tgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 143  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  31367 tgttgactcttaaccacccaacactccgtaccgtacaacaccgccggtctgactgctgttcgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttat 31268  T
Q  144 cgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccc 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  31267 cgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcctacatctacttttatttctccgtcattttgtacgaaggaccc 31168  T
Q  244 aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  31167 aagatgtttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatat 31070  T
Q  343 accccgtcttgcttct 358  Q
    || | |||||||||||    
T  31069 actcagtcttgcttct 31054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 82655 - 82356
Alignment:
Q  9 acatcatcatctccgttatacttactttactcacgtgttggctcttaaccgctcagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 108  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||| | || | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  82655 acatcctcatctccgctgcacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaagatcgtcggtctgactgttgtccgata 82556  T
Q  109 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 208  Q
     ||| || |||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82555 gaactttcctttcaacttaaggagtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctctttcccattgcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 82456  T
Q  209 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 307  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  82455 gcttctatttctccgtcattttttactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatataatctccaactttcgcctccaaggcagacc 82356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 358
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12294
Alignment:
Q  91 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 190  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12028 tctgattgctgaccgataaaactttccttttaacttaagaggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggttcttctccatttcaacgacccagcttaa 12127  T
Q  191 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 289  Q
    |||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12128 atacgatggcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 12227  T
Q  290 tcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttct 358  Q
    ||||| | ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  12228 tcaccgcgaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacattctatataatccgtcttacttct 12294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5911 - 5834
Alignment:
Q  224 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacctccaag 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5911 tcattttgtattgtggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaag 5834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 41 - 156
Alignment:
Q  117 ctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--cccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 214  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  41 ctttcaacttaattggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttct 140  T
Q  215 atttctccatcatttt 230  Q
    ||||| || |||||||    
T  141 atttccccgtcatttt 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 87066 - 87204
Alignment:
Q  118 tttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatt 217  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||| ||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| | | | |||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  87066 tttcaacttaagtgatactttcttattgcataaaacccccgaggcttttctccatttcaaccatcaaacatgaatatgatgagttacatctgattctatt 87165  T
Q  218 tctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 256  Q
    |||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  87166 tctccgacattttatactatggacccaagatatttaaac 87204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Original strand, 88514 - 88618
Alignment:
Q  252 taaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtc 350  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  88514 taaaccatgtaacttgaagtatggtatgatttccatctttcatctccaaggtaaacctac--ttctccttttgctgaagttacattccatatactctgtc 88611  T
Q  351 ttgcttc 357  Q
    |||||||    
T  88612 ttgcttc 88618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9434 - 9303
Alignment:
Q  166 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaact 265  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| | ||  ||||||||| |||| |||||| |||| |||| || |||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  9434 tctccctttcaactacccagtttgaatcctatgttttacatctccttccatttcttcatcgttttataatataaacctaagatatttaaatcgtgtaact 9335  T
Q  266 -tgggtatgatatgatctccaactttcacctc 296  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9334 aataatatgatatgatctccaacttttacctc 9303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University