View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16324_low_3 (Length: 238)

Name: NF16324_low_3
Description: NF16324
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16324_low_3
NF16324_low_3
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (11-229)||(22356078-22356297)
chr4 (11-174)||(10487149-10487313)
chr4 (11-174)||(16329438-16329602)
chr4 (11-174)||(18246668-18246832)
chr4 (11-174)||(19999005-19999170)
chr4 (49-174)||(14994678-14994804)
chr4 (1-175)||(16521265-16521441)
chr4 (1-150)||(5684408-5684558)
chr4 (15-174)||(15138077-15138238)
chr4 (11-174)||(47355803-47355968)
chr4 (13-174)||(26678522-26678685)
chr4 (73-176)||(109958-110062)
chr4 (11-176)||(15274274-15274441)
chr4 (11-174)||(14950498-14950663)
chr4 (80-176)||(10642587-10642684)
chr4 (73-206)||(12901359-12901491)
chr4 (80-176)||(9293925-9294022)
chr4 (1-176)||(15211815-15211994)
chr4 (102-211)||(44054304-44054406)
chr4 (73-179)||(8874080-8874186)
chr4 (11-174)||(13049678-13049843)
chr4 (91-174)||(8372951-8373035)
chr4 (73-203)||(21961155-21961286)
chr4 (11-174)||(26337963-26338128)
chr4 (108-172)||(7134088-7134152)
chr4 (80-176)||(16366360-16366456)
chr4 (73-211)||(12837914-12838047)
chr4 (80-174)||(18167195-18167291)
chr4 (80-173)||(53909430-53909523)
chr4 (79-155)||(44345259-44345335)
chr4 (101-176)||(7848827-7848902)
chr4 (80-160)||(15288611-15288691)
chr4 (80-160)||(15295778-15295858)
chr4 (81-211)||(33738608-33738731)
chr4 (95-155)||(54119904-54119964)
chr4 (97-176)||(13244766-13244845)
chr4 (79-155)||(43283041-43283119)
chr4 (73-175)||(14899948-14900053)
chr4 (79-211)||(45460609-45460746)
chr4 (79-150)||(52267123-52267196)
chr4 (73-125)||(12245848-12245900)
chr4 (73-125)||(15852912-15852964)
chr4 (115-176)||(16521203-16521265)
chr4 (73-125)||(34197761-34197813)
chr4 (79-149)||(18496063-18496134)
chr4 (79-173)||(30236145-30236243)
chr4 (73-118)||(27959560-27959605)
chr4 (80-157)||(41257951-41258033)
chr4 (73-125)||(37958653-37958705)
chr4 (111-155)||(53706515-53706559)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (1-174)||(33316086-33316260)
chr6 (13-174)||(10487364-10487526)
chr6 (13-174)||(16377801-16377963)
chr6 (13-174)||(16385125-16385287)
chr6 (11-174)||(25174040-25174204)
chr6 (11-174)||(27655600-27655764)
chr6 (1-150)||(16827382-16827531)
chr6 (80-221)||(18825419-18825560)
chr6 (80-229)||(18843480-18843629)
chr6 (1-150)||(4989406-4989555)
chr6 (11-174)||(14628124-14628289)
chr6 (1-211)||(25745818-25746028)
chr6 (49-174)||(1651500-1651626)
chr6 (11-174)||(23976053-23976218)
chr6 (74-211)||(18775650-18775787)
chr6 (1-176)||(19984709-19984886)
chr6 (11-174)||(26088319-26088484)
chr6 (1-159)||(16650749-16650908)
chr6 (73-174)||(1659285-1659387)
chr6 (11-174)||(29870988-29871153)
chr6 (1-175)||(1554324-1554498)
chr6 (80-176)||(18004634-18004731)
chr6 (1-159)||(16557519-16557678)
chr6 (11-174)||(16230065-16230230)
chr6 (73-176)||(22428649-22428752)
chr6 (74-176)||(18128755-18128856)
chr6 (11-174)||(23993645-23993810)
chr6 (1-175)||(16238848-16239022)
chr6 (73-149)||(15861243-15861319)
chr6 (73-174)||(11214623-11214726)
chr6 (73-203)||(16105004-16105135)
chr6 (6-159)||(16642519-16642673)
chr6 (73-176)||(31626912-31627015)
chr6 (80-211)||(25646517-25646641)
chr6 (80-174)||(22227260-22227356)
chr6 (95-175)||(13622798-13622878)
chr6 (80-176)||(18422208-18422304)
chr6 (80-172)||(35017302-35017394)
chr6 (80-174)||(17343846-17343942)
chr6 (95-171)||(18740861-18740937)
chr6 (80-160)||(18088371-18088451)
chr6 (109-150)||(32896497-32896538)
chr6 (127-211)||(32896418-32896495)
chr6 (80-160)||(19608922-19609002)
chr6 (73-125)||(18383276-18383328)
chr6 (73-124)||(34965471-34965522)
chr6 (73-157)||(22846613-22846702)
chr6 (73-125)||(33323337-33323389)
chr6 (79-149)||(15738687-15738759)
chr6 (73-125)||(16889338-16889390)
chr6 (80-124)||(19852796-19852840)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-176)||(22368108-22368284)
chr5 (13-174)||(21933795-21933957)
chr5 (13-174)||(21939965-21940127)
chr5 (13-174)||(35580735-35580897)
chr5 (11-174)||(10831-10995)
chr5 (11-174)||(21075122-21075286)
chr5 (11-176)||(16534785-16534951)
chr5 (13-174)||(37010799-37010961)
chr5 (11-174)||(29192251-29192415)
chr5 (11-174)||(37051465-37051629)
chr5 (11-174)||(21235039-21235204)
chr5 (11-174)||(25901959-25902123)
chr5 (11-174)||(20615093-20615257)
chr5 (1-176)||(1221355-1221531)
chr5 (49-168)||(35792802-35792921)
chr5 (1-150)||(110608-110757)
chr5 (1-176)||(10779803-10779979)
chr5 (10-174)||(9732299-9732464)
chr5 (1-150)||(11213226-11213376)
chr5 (11-176)||(22884816-22884982)
chr5 (108-229)||(25211623-25211737)
chr5 (108-229)||(25275775-25275889)
chr5 (11-174)||(19498280-19498445)
chr5 (73-211)||(21661310-21661448)
chr5 (11-174)||(11341116-11341281)
chr5 (11-174)||(4201599-4201764)
chr5 (73-211)||(4863703-4863841)
chr5 (73-211)||(27185420-27185558)
chr5 (11-174)||(43445390-43445555)
chr5 (11-174)||(25425102-25425267)
chr5 (11-174)||(24594981-24595146)
chr5 (11-174)||(27008492-27008657)
chr5 (11-159)||(23327449-23327598)
chr5 (95-168)||(18779788-18779861)
chr5 (95-176)||(23510393-23510475)
chr5 (80-176)||(1170320-1170416)
chr5 (80-176)||(21653051-21653147)
chr5 (80-150)||(24470735-24470805)
chr5 (95-176)||(17473566-17473647)
chr5 (80-149)||(28258026-28258094)
chr5 (80-176)||(21392603-21392699)
chr5 (97-155)||(11582340-11582398)
chr5 (80-160)||(7424098-7424178)
chr5 (73-125)||(23492527-23492579)
chr5 (73-124)||(21615537-21615588)
chr5 (74-124)||(19860758-19860808)
chr5 (73-125)||(7727102-7727154)
chr5 (73-125)||(13793654-13793706)
chr5 (79-176)||(24184867-24184966)
chr5 (73-125)||(32967764-32967816)
chr5 (73-125)||(37189720-37189772)
chr5 (79-157)||(3672419-3672499)
chr5 (79-176)||(23453356-23453456)
chr5 (79-176)||(23460600-23460700)
chr5 (79-176)||(23464861-23464961)
chr5 (81-157)||(5452432-5452513)
chr5 (73-157)||(24227059-24227148)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (79-229)||(30141308-30141458)
chr3 (13-174)||(1469168-1469330)
chr3 (11-174)||(2450840-2451004)
chr3 (11-174)||(18909169-18909333)
chr3 (11-174)||(22273524-22273688)
chr3 (1-175)||(44227903-44228079)
chr3 (49-168)||(16259530-16259649)
chr3 (1-174)||(16819386-16819561)
chr3 (11-176)||(49230690-49230856)
chr3 (73-211)||(319200-319338)
chr3 (1-176)||(33340318-33340496)
chr3 (49-174)||(15613543-15613669)
chr3 (49-174)||(23081716-23081842)
chr3 (49-174)||(12266041-12266167)
chr3 (11-174)||(16745683-16745848)
chr3 (49-176)||(23490981-23491110)
chr3 (1-150)||(17913755-17913905)
chr3 (73-176)||(19945105-19945208)
chr3 (1-176)||(2048536-2048713)
chr3 (49-174)||(15470015-15470141)
chr3 (49-174)||(15574524-15574650)
chr3 (11-174)||(27839184-27839349)
chr3 (1-174)||(15939965-15940140)
chr3 (11-174)||(8269915-8270080)
chr3 (11-174)||(8277026-8277191)
chr3 (11-174)||(8305835-8306000)
chr3 (11-174)||(30151813-30151978)
chr3 (80-176)||(25057248-25057345)
chr3 (11-174)||(53769137-53769302)
chr3 (73-168)||(8630324-8630419)
chr3 (82-176)||(19262602-19262697)
chr3 (11-159)||(41268734-41268883)
chr3 (11-159)||(45859512-45859661)
chr3 (73-176)||(10737034-10737138)
chr3 (73-176)||(50113714-50113818)
chr3 (14-159)||(13956320-13956466)
chr3 (14-159)||(13977153-13977299)
chr3 (73-174)||(14846237-14846339)
chr3 (79-176)||(17957994-17958092)
chr3 (80-211)||(30204840-30204962)
chr3 (18-159)||(55314874-55315016)
chr3 (80-211)||(17099058-17099182)
chr3 (71-176)||(51160058-51160163)
chr3 (95-174)||(18905354-18905434)
chr3 (80-176)||(19572429-19572525)
chr3 (74-176)||(7852276-7852379)
chr3 (73-176)||(12351432-12351535)
chr3 (80-176)||(6148456-6148550)
chr3 (80-176)||(11813308-11813404)
chr3 (73-174)||(5227195-5227298)
chr3 (78-173)||(19230531-19230626)
chr3 (105-176)||(45581311-45581382)
chr3 (159-221)||(38166422-38166484)
chr3 (80-176)||(16183664-16183760)
chr3 (80-176)||(22145881-22145977)
chr3 (80-175)||(15860807-15860902)
chr3 (73-125)||(15874685-15874737)
chr3 (73-125)||(48420192-48420244)
chr3 (73-124)||(5229669-5229720)
chr3 (79-175)||(14287500-14287598)
chr3 (73-176)||(47786457-47786563)
chr3 (102-176)||(11062712-11062788)
chr3 (73-125)||(12490325-12490377)
chr3 (73-176)||(14060829-14060935)
chr3 (73-124)||(38812583-38812634)
chr3 (73-124)||(47983419-47983470)
chr3 (73-124)||(47992706-47992757)
chr3 (73-124)||(48001993-48002044)
chr3 (73-124)||(48011279-48011330)
chr3 (79-124)||(14523004-14523049)
chr3 (80-124)||(9592349-9592393)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (11-174)||(5236674-5236838)
chr8 (13-174)||(272718-272880)
chr8 (13-174)||(642969-643131)
chr8 (13-174)||(828775-828937)
chr8 (11-174)||(24662760-24662924)
chr8 (11-174)||(43684133-43684297)
chr8 (80-229)||(24108244-24108386)
chr8 (1-158)||(24387213-24387371)
chr8 (49-174)||(24547703-24547829)
chr8 (11-174)||(3433089-3433254)
chr8 (11-174)||(21853409-21853574)
chr8 (79-176)||(22909144-22909241)
chr8 (13-174)||(21846006-21846169)
chr8 (1-159)||(22089947-22090106)
chr8 (1-158)||(24930620-24930779)
chr8 (1-176)||(29758769-29758946)
chr8 (73-211)||(37605427-37605566)
chr8 (1-159)||(15320563-15320722)
chr8 (1-159)||(15500932-15501091)
chr8 (79-174)||(23509397-23509493)
chr8 (11-174)||(16874452-16874617)
chr8 (80-176)||(22008138-22008235)
chr8 (1-176)||(16203842-16204018)
chr8 (80-176)||(13664295-13664392)
chr8 (80-176)||(13723570-13723667)
chr8 (11-159)||(16675839-16675988)
chr8 (11-159)||(224676-224825)
chr8 (11-159)||(738299-738448)
chr8 (11-159)||(862194-862343)
chr8 (73-149)||(270245-270321)
chr8 (73-149)||(645599-645675)
chr8 (73-149)||(831334-831410)
chr8 (11-159)||(701089-701238)
chr8 (73-147)||(41244135-41244209)
chr8 (101-207)||(20655685-20655793)
chr8 (80-176)||(19994801-19994897)
chr8 (80-176)||(22323101-22323196)
chr8 (80-155)||(24719076-24719151)
chr8 (80-155)||(25120938-25121013)
chr8 (95-173)||(43375200-43375278)
chr8 (79-155)||(16416736-16416812)
chr8 (79-155)||(20480092-20480168)
chr8 (73-157)||(25294488-25294574)
chr8 (73-157)||(25756477-25756563)
chr8 (73-125)||(39448413-39448465)
chr8 (80-126)||(23116418-23116464)
chr8 (79-176)||(17731115-17731215)
chr8 (73-125)||(21192337-21192389)
chr8 (73-125)||(21696081-21696133)
chr8 (73-157)||(37655237-37655326)
chr8 (73-123)||(21199764-21199814)
chr8 (80-124)||(22498901-22498945)
chr8 (73-125)||(23835741-23835792)
chr8 (80-124)||(33170786-33170830)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (11-174)||(14907952-14908116)
chr2 (13-174)||(5889812-5889974)
chr2 (13-174)||(11232767-11232929)
chr2 (13-174)||(22514614-22514776)
chr2 (13-174)||(28777215-28777377)
chr2 (11-174)||(19888292-19888456)
chr2 (11-174)||(20013601-20013765)
chr2 (11-174)||(23818658-23818822)
chr2 (11-176)||(12643539-12643705)
chr2 (1-174)||(21140355-21140529)
chr2 (1-174)||(21276031-21276205)
chr2 (1-174)||(22692768-22692943)
chr2 (1-174)||(22697415-22697590)
chr2 (11-174)||(12637678-12637843)
chr2 (1-158)||(22282613-22282772)
chr2 (11-174)||(3800626-3800791)
chr2 (11-174)||(34822676-34822841)
chr2 (46-174)||(24828110-24828239)
chr2 (46-174)||(24832562-24832691)
chr2 (1-158)||(22273380-22273539)
chr2 (11-174)||(12726531-12726696)
chr2 (11-174)||(23773015-23773180)
chr2 (73-211)||(6877884-6878015)
chr2 (1-159)||(24687172-24687331)
chr2 (73-176)||(8886610-8886713)
chr2 (11-174)||(8942124-8942289)
chr2 (73-176)||(22861957-22862060)
chr2 (11-159)||(17398109-17398258)
chr2 (73-176)||(15631865-15631969)
chr2 (76-176)||(43644556-43644656)
chr2 (78-211)||(25877615-25877741)
chr2 (79-211)||(36892358-36892483)
chr2 (71-176)||(20629007-20629113)
chr2 (73-175)||(25600431-25600533)
chr2 (95-176)||(461140-461221)
chr2 (104-174)||(25211358-25211429)
chr2 (95-175)||(24966692-24966772)
chr2 (73-157)||(19435060-19435146)
chr2 (95-173)||(9654505-9654583)
chr2 (73-125)||(4878-4930)
chr2 (73-125)||(19670731-19670783)
chr2 (73-125)||(23823110-23823162)
chr2 (73-125)||(23825054-23825106)
chr2 (73-125)||(23832189-23832241)
chr2 (73-125)||(24296174-24296226)
chr2 (73-125)||(25304089-25304141)
chr2 (73-124)||(19658471-19658522)
chr2 (73-176)||(24088963-24089069)
chr2 (79-176)||(22581586-22581686)
chr2 (73-124)||(43641348-43641399)
chr2 (95-176)||(720836-720920)
chr2 (80-124)||(22137424-22137468)
chr2 (80-124)||(24272580-24272624)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (13-174)||(37768-37930)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (13-174)||(7821406-7821568)
chr7 (13-174)||(7828717-7828879)
chr7 (13-174)||(27103066-27103228)
chr7 (13-174)||(27110414-27110576)
chr7 (13-174)||(27175098-27175260)
chr7 (13-174)||(38785158-38785320)
chr7 (11-174)||(15443076-15443240)
chr7 (11-174)||(16416949-16417113)
chr7 (95-229)||(7291204-7291337)
chr7 (11-174)||(11514604-11514768)
chr7 (11-174)||(30263641-30263805)
chr7 (1-176)||(369365-369541)
chr7 (5-176)||(15952606-15952778)
chr7 (1-211)||(3893532-3893742)
chr7 (1-176)||(32496063-32496241)
chr7 (11-175)||(10988092-10988258)
chr7 (14-174)||(18255343-18255505)
chr7 (1-174)||(26010699-26010874)
chr7 (73-207)||(12753321-12753456)
chr7 (73-175)||(1938358-1938460)
chr7 (11-174)||(13757060-13757225)
chr7 (78-174)||(15518442-15518539)
chr7 (1-175)||(15761877-15762051)
chr7 (83-211)||(112899-113027)
chr7 (73-174)||(2436110-2436212)
chr7 (11-174)||(25293795-25293960)
chr7 (80-174)||(2192357-2192453)
chr7 (80-174)||(16480587-16480683)
chr7 (11-149)||(42057680-42057819)
chr7 (73-176)||(45453844-45453946)
chr7 (11-159)||(13912630-13912779)
chr7 (98-176)||(122980-123059)
chr7 (80-176)||(13867687-13867783)
chr7 (97-176)||(11582551-11582630)
chr7 (80-174)||(18981568-18981664)
chr7 (73-211)||(26071855-26071986)
chr7 (73-211)||(26095642-26095773)
chr7 (113-176)||(2024939-2025002)
chr7 (98-168)||(11285628-11285698)
chr7 (82-155)||(15824105-15824178)
chr7 (80-211)||(44863588-44863712)
chr7 (80-155)||(142062-142137)
chr7 (97-176)||(13038825-13038904)
chr7 (73-123)||(3058582-3058632)
chr7 (79-176)||(12545402-12545500)
chr7 (95-173)||(36051071-36051149)
chr7 (97-155)||(47288170-47288228)
chr7 (80-160)||(15925789-15925869)
chr7 (1-117)||(2027095-2027212)
chr7 (118-176)||(3055194-3055253)
chr7 (95-150)||(16210210-16210265)
chr7 (73-157)||(9058224-9058313)
chr7 (73-125)||(13388488-13388540)
chr7 (73-124)||(4483269-4483320)
chr7 (5-63)||(15525997-15526056)
chr7 (80-140)||(9322663-9322726)
chr7 (80-173)||(12249770-12249865)
chr7 (73-125)||(13376195-13376247)
chr7 (73-125)||(15914024-15914076)
chr7 (101-176)||(16571771-16571848)
chr7 (101-176)||(16593814-16593891)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (13-174)||(17003302-17003464)
chr1 (11-174)||(51451090-51451254)
chr1 (11-174)||(41392929-41393093)
chr1 (1-176)||(22352602-22352779)
chr1 (73-211)||(35053275-35053413)
chr1 (1-158)||(44036411-44036570)
chr1 (49-174)||(45050164-45050290)
chr1 (73-176)||(15863011-15863114)
chr1 (11-174)||(17147258-17147423)
chr1 (58-174)||(35935143-35935260)
chr1 (79-170)||(22250620-22250711)
chr1 (77-211)||(5676197-5676331)
chr1 (11-174)||(7642105-7642270)
chr1 (11-174)||(22034325-22034490)
chr1 (5-155)||(20929969-20930121)
chr1 (11-174)||(20826744-20826909)
chr1 (80-176)||(22365156-22365253)
chr1 (1-174)||(22226459-22226632)
chr1 (11-159)||(5073823-5073972)
chr1 (11-159)||(18602566-18602715)
chr1 (80-211)||(2422732-2422856)
chr1 (73-176)||(20444215-20444318)
chr1 (73-176)||(37846058-37846161)
chr1 (80-176)||(9785898-9785994)
chr1 (80-211)||(22407893-22408017)
chr1 (80-176)||(49966056-49966152)
chr1 (97-176)||(20895406-20895485)
chr1 (95-176)||(20529979-20530060)
chr1 (80-160)||(21651601-21651682)
chr1 (79-176)||(22836909-22837008)
chr1 (79-176)||(20956625-20956725)
chr1 (79-176)||(27673258-27673357)
chr1 (95-155)||(21857977-21858037)
chr1 (73-176)||(41217920-41218024)
chr1 (95-160)||(29137312-29137376)
chr1 (73-126)||(37235553-37235606)
chr1 (73-125)||(13378353-13378405)
chr1 (73-125)||(19601703-19601755)
chr1 (73-125)||(21193689-21193741)
chr1 (73-125)||(36357929-36357981)
chr1 (11-50)||(22029299-22029338)
chr1 (73-124)||(38035213-38035264)
chr1 (80-122)||(18505814-18505856)
chr1 (161-206)||(5676341-5676386)
chr1 (80-124)||(5471983-5472027)
chr1 (80-124)||(22144991-22145035)
chr1 (79-176)||(35524080-35524179)
chr1 (80-124)||(41213266-41213310)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (11-174)||(25382-25546)
scaffold0141 (11-174)||(21127-21291)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (11-174)||(3090-3254)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (11-174)||(5661-5825)
scaffold0003 (1-158)||(217256-217414)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (79-229)||(33707-33850)
scaffold0184 (1-158)||(32698-32857)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (79-229)||(38994-39137)
scaffold0078 (1-158)||(39987-40146)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (1-174)||(558-733)
scaffold0269 (80-173)||(3426-3519)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-174)||(4320-4495)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-174)||(6655-6830)
scaffold0022 (1-174)||(58942-59117)
scaffold0022 (73-125)||(106512-106564)
scaffold0022 (80-124)||(130410-130454)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (5-168)||(109592-109756)
scaffold0032 (73-175)||(54118-54221)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (1-174)||(15922-16097)
scaffold0396 (73-175)||(13782-13884)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (73-211)||(60010-60148)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-175)||(34811-34987)
scaffold0023 (49-174)||(155905-156031)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-176)||(4256-4434)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-176)||(49096-49274)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (49-150)||(128892-128993)
scaffold0028 (80-155)||(90599-90674)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-174)||(106479-106654)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-176)||(270597-270775)
scaffold0009 (73-207)||(236621-236755)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-149)||(5105-5254)
scaffold0266 (79-155)||(12786-12862)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (73-211)||(56375-56513)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (11-174)||(17606-17771)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (73-169)||(855-951)
scaffold0383 (73-176)||(5704-5807)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-159)||(29846-30005)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (1-158)||(7477-7635)
scaffold0498 (114-158)||(7318-7362)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (73-176)||(12669-12772)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-176)||(2637-2817)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (81-211)||(19825-19955)
scaffold0195 (81-180)||(17772-17871)
scaffold0195 (73-125)||(8242-8294)
scaffold0195 (73-125)||(13631-13683)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (73-176)||(1365-1469)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (73-176)||(11611-11715)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-174)||(9432-9607)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (79-164)||(17061-17146)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (83-176)||(249140-249233)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (73-158)||(197681-197766)
scaffold0004 (80-124)||(84943-84987)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-138)||(41222-41361)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (1-158)||(129706-129865)
scaffold0008 (80-155)||(21054-21129)
scaffold0008 (81-155)||(28644-28718)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (73-203)||(7875-8006)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-173)||(145012-145185)
scaffold0025 (1-173)||(147271-147444)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (73-176)||(14147-14252)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (82-174)||(1-94)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (73-203)||(4572-4703)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (95-174)||(77900-77979)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (102-177)||(66337-66412)
scaffold0037 (79-176)||(26414-26511)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (73-176)||(138398-138501)
scaffold0021 (79-176)||(76758-76855)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (73-174)||(14779-14881)
scaffold0225 (73-174)||(28300-28402)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (73-174)||(51511-51613)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (80-177)||(1045-1142)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (73-176)||(27043-27148)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (79-176)||(256558-256655)
scaffold0011 (95-176)||(125007-125088)
scaffold0011 (81-175)||(72012-72106)
scaffold0011 (81-175)||(76393-76487)
scaffold0011 (80-171)||(192983-193074)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (80-176)||(18056-18152)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (73-176)||(3130-3233)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (80-211)||(31181-31305)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (73-149)||(6044-6120)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (79-155)||(163827-163903)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (73-174)||(35-138)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (79-155)||(7224-7300)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (97-173)||(40006-40082)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (11-122)||(66955-67067)
scaffold0044 (117-176)||(94696-94755)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (80-171)||(712-803)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (80-175)||(1509-1604)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (73-176)||(3096-3199)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (80-155)||(28253-28328)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (79-150)||(72104-72175)
scaffold0001 (147-211)||(75527-75591)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (80-149)||(3706-3775)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (80-173)||(30998-31091)
scaffold0049 (86-140)||(44639-44693)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (81-176)||(7013-7108)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (97-180)||(15022-15105)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (97-155)||(6326-6384)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (80-150)||(13433-13503)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (73-176)||(68796-68901)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (103-176)||(15833-15906)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (80-160)||(15530-15610)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (73-150)||(37959-38036)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (95-155)||(6824-6884)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (80-176)||(20905-21001)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (73-149)||(3887-3965)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (95-176)||(19246-19327)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (73-125)||(7256-7308)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (1-115)||(1-116)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (74-176)||(8547-8651)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (73-157)||(3242-3331)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (109-172)||(24878-24942)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (78-125)||(4949-4996)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (101-176)||(1824-1902)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (101-176)||(145336-145413)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (80-124)||(212-256)
scaffold0786 (80-124)||(5267-5311)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (80-124)||(3800-3844)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (73-125)||(71871-71923)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (73-125)||(78425-78477)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (73-125)||(33993-34045)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 22356078 - 22356297
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356078 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 22356176  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22356177 catgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgt 22356276  T
Q  209 ttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  22356277 ttgacacatgtgattgatgat 22356297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10487313 - 10487149
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10487313 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 10487214  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10487213 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 10487149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 16329438 - 16329602
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16329438 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 16329537  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16329538 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 16329602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18246832 - 18246668
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246832 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcagaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 18246733  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18246732 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18246668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19999170 - 19999005
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcg-aaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19999170 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggc-atcggaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 19999072  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19999071 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19999005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14994804 - 14994678
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14994804 ccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgag 14994705  T
Q  149 tcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||    
T  14994704 tcttatgtgaaatttgtgattggtgat 14994678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16521441 - 16521265
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  16521441 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttgtccatcggaggtgacgaccttttgaaga 16521343  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga-gtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||| ||||    
T  16521342 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgatggcttattttgaaatgtgattggagatt 16521265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 5684408 - 5684558
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgag-ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  5684408 aaagagttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagtccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 5684506  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684507 tttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 5684558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Original strand, 15138077 - 15138238
Alignment:
Q  15 ttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15138077 ttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatg 15138175  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  15138176 catttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 15138238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 47355968 - 47355803
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47355968 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 47355870  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  47355869 catgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 47355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26678685 - 26678522
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaagg-tgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678685 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaagatgacgaccttgttgagatttggtaccaca 26678587  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26678586 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 26678522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 110062 - 109958
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  110062 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 109963  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  109962 gattg 109958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 15274274 - 15274441
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcg-aaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15274274 actcttttacttcgagattattgtaaggtaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcggaaggtgacaaccttgttgagatttggtacca 15274372  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  15274373 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattg 15274441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14950663 - 14950498
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14950663 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtatgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 14950565  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  14950564 catgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattggtgat 14950498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10642684 - 10642587
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  10642684 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattg 10642587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 12901359 - 12901491
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12901359 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttg-aaatgtgattggtg 12901457  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgat 206  Q
    |||||||| | |||  |||||| |||||||||||    
T  12901458 attggtgattgtgtacgaataactgtgaattgat 12901491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9294022 - 9293925
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    
T  9294022 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattg 9293925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15211994 - 15211815
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttg-a 96  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||| |||| ||| |    
T  15211994 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgtcctttttgga 15211896  T
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  15211895 tatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattg 15211815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44054406 - 44054304
Alignment:
Q  102 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       ||| ||||||| ||||||    
T  44054406 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg-------tgtatgaataactgtgaa 44054314  T
Q  202 ttgatgtttg 211  Q
    ||||||||||    
T  44054313 ttgatgtttg 44054304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Original strand, 8874080 - 8874186
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||    
T  8874080 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtggttagtg 8874179  T
Q  173 attggtg 179  Q
    |||||||    
T  8874180 attggtg 8874186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 13049678 - 13049843
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13049678 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 13049776  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  13049777 catgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 13049843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8373035 - 8372951
Alignment:
Q  91 tgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  8373035 tgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8372951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Original strand, 21961155 - 21961286
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcat-atttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| || ||    
T  21961155 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgtttagt 21961254  T
Q  172 gattggtgagtatgtgtgaataattgtgaatt 203  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| | ||||||    
T  21961255 gattggtgattgtgtatgaataactatgaatt 21961286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26338128 - 26337963
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  26338128 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 26338030  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||| ||||  ||||||||||||||    
T  26338029 catacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagttctatgtgaattatgtgattggtgat 26337963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 172
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134152
Alignment:
Q  108 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtg 7134152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 16366360 - 16366456
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||| |||||||    
T  16366360 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattagtgattg 16366456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 12837914 - 12838047
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattg 169  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  12837914 catcgaaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtc-tttttgatatatgtgattg 12838012  T
Q  170 gtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||||||       ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12838013 gtgattg-------tgtatgaataattgtgaattgatatttg 12838047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18167291 - 18167195
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  18167291 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 18167195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Original strand, 53909430 - 53909523
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  53909430 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtga 53909523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44345335 - 44345259
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44345335 aggtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 44345259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848827
Alignment:
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttgaaattgtgagtggtgattg 7848827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Original strand, 15288611 - 15288691
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  15288611 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 15288691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Original strand, 15295778 - 15295858
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  15295778 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 15295858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33738731 - 33738608
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtga 180  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||        
T  33738731 gtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattg---- 33738636  T
Q  181 gtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
       ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33738635 ---tgtatgaataattgtgaattgatatttg 33738608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 54119904 - 54119964
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  54119904 gagatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt 54119964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13244845 - 13244766
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  13244845 gatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 13244766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 43283041 - 43283119
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43283041 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 43283119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14900053 - 14899948
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattg 169  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  14900053 catcggaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattg 14899954  T
Q  170 gtgatt 175  Q
     |||||    
T  14899953 atgatt 14899948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Original strand, 45460609 - 45460746
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatat-ttgaaaa-tgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||    
T  45460609 aggtgacgaccttgaggtgatatggtaccgcatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaactgtgattggtgat 45460708  T
Q  175 t-ggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    | ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45460709 ttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttg 45460746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Original strand, 52267123 - 52267196
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  52267123 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 12245848 - 12245900
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12245848 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 12245900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 15852912 - 15852964
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15852912 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 15852964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16521265 - 16521203
Alignment:
Q  115 tttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga-gtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||| |||||    
T  16521265 tttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgatggcttattttgaaatgtgattggagattg 16521203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 34197761 - 34197813
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34197761 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 34197813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 149
Target Start/End: Original strand, 18496063 - 18496134
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa-taagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  18496063 aggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaactaggtgcacatcatgacatgagt 18496134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 30236145 - 30236243
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatat-ttga-aaatgtgattggtga 173  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  30236145 aggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaattgtgattggtga 30236243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27959605 - 27959560
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcattta 118  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  27959605 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcattta 27959560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Original strand, 41257951 - 41258033
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---tgacatgagtcatatttg 157  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  41257951 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 41258033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 37958653 - 37958705
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37958653 catcgaaggtgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 37958705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706559
Alignment:
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 53706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 33316086 - 33316260
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33316086 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatt 33316185  T
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  33316186 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 33316260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10487526 - 10487364
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10487526 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 10487427  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  10487426 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 10487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 16377801 - 16377963
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377801 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 16377900  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16377901 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 16385125 - 16385287
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385125 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 16385224  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16385225 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16385287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25174204 - 25174040
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174204 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 25174105  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25174104 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25174040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 27655600 - 27655764
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655600 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 27655699  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27655700 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 27655764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16827382 - 16827531
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16827382 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgttgggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatt 16827481  T
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16827482 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtc 16827531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 18825419 - 18825560
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18825419 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 18825518  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtga 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18825519 attatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtga 18825560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 18843480 - 18843629
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18843480 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 18843579  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18843580 attatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgattgatgat 18843629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4989555 - 4989406
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4989555 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagat 4989457  T
Q  100 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989456 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 4989406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 14628124 - 14628289
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14628124 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 14628222  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  14628223 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 14628289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 25745818 - 25746028
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagc-cttacatgcgatgttgacttgtc-catcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||| | ||||||| |||||||   ||||  |||||| |||||||||||||  | |    
T  25745818 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgttt--ttgttgcatcgagggtgacgaccttgaggtg 25745914  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattg 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  25745915 atttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataattg 25746014  T
Q  198 tgaattgatgtttg 211  Q
    || |||||||||||    
T  25746015 tgcattgatgtttg 25746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 1651500 - 1651626
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1651500 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgag 1651599  T
Q  149 tcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  1651600 tcttatgtgaaattcgtgattggtgat 1651626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23976218 - 23976053
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23976218 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 23976120  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23976119 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23976053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18775787 - 18775650
Alignment:
Q  74 atcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18775787 atcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaaatgtgaatggtga 18775688  T
Q  174 ttggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18775687 ttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttg 18775650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 19984709 - 19984886
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| | ||     
T  19984709 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgt-gatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggat 19984806  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  19984807 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattg 19984886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26088484 - 26088319
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088484 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 26088386  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26088385 catgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 26088319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 16650749 - 16650908
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  16650749 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 16650847  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  16650848 tttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 16650908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Original strand, 1659285 - 1659387
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggt 171  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1659285 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggt 1659384  T
Q  172 gat 174  Q
    |||    
T  1659385 gat 1659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 29870988 - 29871153
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29870988 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 29871086  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  29871087 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 29871153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1554498 - 1554324
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || |||||| |||||| |  || || |||||||||||||||||| | ||||    
T  1554498 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggaga 1554402  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgatt 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  1554401 tttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 1554324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 18004634 - 18004731
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  18004634 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattg 18004731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 16557519 - 16557678
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  16557519 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 16557617  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  16557618 tttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 16557678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16230230 - 16230065
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16230230 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 16230132  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  16230131 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 16230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22428752 - 22428649
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  22428752 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtg 22428653  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  22428652 attg 22428649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18128856 - 18128755
Alignment:
Q  74 atcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    |||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  18128856 atcgaaggtgacgaactggaggtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatg-aaatgtgattggtga 18128758  T
Q  174 ttg 176  Q
    |||    
T  18128757 ttg 18128755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23993810 - 23993645
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23993810 actcttttactttgaaattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23993712  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  23993711 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23993645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16239022 - 16238848
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttg-ag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||| |  || || |||| ||||||||||||| ||| ||    
T  16239022 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgt-gttttatc-atcggaggtgacgacctttttggag 16238926  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  16238925 attttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 16238848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15861319 - 15861243
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15861319 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11214726 - 11214623
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattgg 170  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||     
T  11214726 catcggaggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattga 11214627  T
Q  171 tgat 174  Q
    ||||    
T  11214626 tgat 11214623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16105135 - 16105004
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcat-atttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||    
T  16105135 catcgaaggtgacgaccttgaggttatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgattagt 16105036  T
Q  172 gattggtgagtatgtgtgaataattgtgaatt 203  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| | ||||||    
T  16105035 gattggtgattgtgtatgaataactatgaatt 16105004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 159
Target Start/End: Original strand, 16642519 - 16642673
Alignment:
Q  6 gttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttgg 103  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16642519 gttgaattctttgacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgacctggttgagatttgg 16642617  T
Q  104 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  16642618 taccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 16642673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31627015 - 31626912
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  31627015 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtg 31626916  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  31626915 attg 31626912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Original strand, 25646517 - 25646641
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | || |||||||||||||       
T  25646517 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatttgattggtgattg--- 25646613  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
        |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25646614 ----tgtgtgaatagttgtgaattgatatttg 25646641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Original strand, 22227260 - 22227356
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22227260 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 13622798 - 13622878
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  13622798 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 13622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18422304 - 18422208
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||    
T  18422304 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattg 18422208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 35017302 - 35017394
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||    
T  35017302 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtg 35017394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Original strand, 17343846 - 17343942
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||    
T  17343846 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtgat 17343942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 18740937 - 18740861
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  18740937 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggt 18740861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Original strand, 18088371 - 18088451
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  18088371 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 18088451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896497
Alignment:
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 32896497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32896495 - 32896418
Alignment:
Q  127 taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||       ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32896495 taagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattggtgattg-------tgtatgaataactgtgaattgatgtttg 32896418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19609002 - 19608922
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||    
T  19609002 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgtatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 19608922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 18383276 - 18383328
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18383276 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 18383328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34965522 - 34965471
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34965522 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 34965471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22846702 - 22846613
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---tgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  22846702 catcgaaggtgacgaccttgcggtgatttggtactacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 22846613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33323389 - 33323337
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33323389 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccaaatgcatttatgtgtca 33323337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15738759 - 15738687
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||||||    
T  15738759 aggtgacgacgttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatgatgacatgagt 15738687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 16889338 - 16889390
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16889338 catcgaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcacttatgtgtca 16889390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19852840 - 19852796
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19852840 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 19852796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 22368108 - 22368284
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22368108 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggggtgagccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatt 22368207  T
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22368208 tggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattg 22368284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 21933795 - 21933957
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21933795 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 21933894  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21933895 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21933957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 21939965 - 21940127
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21939965 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 21940064  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21940065 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21940127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35580897 - 35580735
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580897 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 35580798  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35580797 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 35580735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10995 - 10831
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10995 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 10896  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  10895 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 21075122 - 21075286
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21075122 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 21075221  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21075222 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21075286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16534951 - 16534785
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16534951 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 16534852  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||    
T  16534851 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattggagattg 16534785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 37010799 - 37010961
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37010799 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagctttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 37010898  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  37010899 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37010961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 29192251 - 29192415
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29192251 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 29192350  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  29192351 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgat 29192415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37051629 - 37051465
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37051629 actcttttacttcgagattattgtgaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 37051530  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  37051529 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 37051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 21235039 - 21235204
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga-tttggtaccac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21235039 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagattttggtaccgc 21235138  T
Q  110 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  21235139 atacatttatgtgtccataagtgcatatcataacatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 21235204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 25901959 - 25902123
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  25901959 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttatagagatttggtaccgca 25902058  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  25902059 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 25902123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20615257 - 20615093
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  20615257 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgtgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgtagagatttggtagcgca 20615158  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  20615157 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 20615093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1221355 - 1221531
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  1221355 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaacttgttgaga 1221453  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1221454 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattg 1221531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 168
Target Start/End: Original strand, 35792802 - 35792921
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35792802 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 35792901  T
Q  149 tcatatttgaaaatgtgatt 168  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  35792902 tcttatttggaaatgtgatt 35792921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 110608 - 110757
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  110608 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagat 110706  T
Q  100 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110707 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 110757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10779803 - 10779979
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcg-aaggtgacgaccttgttgagat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |  || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10779803 aaagggttgagctcttttactttgagattattgtaaggcaggtgtgagccttacatacgatgtgcaagtggc-atcggaaggtgacgaccttgttgagat 10779901  T
Q  100 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10779902 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattg 10779979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 9732299 - 9732464
Alignment:
Q  10 aactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732299 aactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 9732397  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  9732398 catgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattggtgat 9732464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11213226 - 11213376
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  11213226 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 11213324  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11213325 tttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 11213376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 22884816 - 22884982
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22884816 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcaaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 22884914  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  22884915 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattg 22884982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211737
Alignment:
Q  108 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgat-------tatgtgtgaataattgtgaattgatg 25211715  T
Q  208 tttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  25211716 tttgacacatgtgattgatgat 25211737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 229
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275889
Alignment:
Q  108 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgat-------tatgtgtgaataattgtgaattgatg 25275867  T
Q  208 tttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  25275868 tttgacacatgtgattgatgat 25275889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19498445 - 19498280
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcg-aaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498445 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggc-atcggaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 19498347  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19498346 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 21661310 - 21661448
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  21661310 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtg 21661409  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21661410 attggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttg 21661448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11341281 - 11341116
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341281 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 11341183  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  11341182 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11341116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 4201599 - 4201764
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201599 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgac-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 4201697  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  4201698 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 4201764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4863841 - 4863703
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  4863841 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtg 4863742  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  4863741 attggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttg 4863703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 27185420 - 27185558
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27185420 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtg 27185519  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  27185520 attgataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttg 27185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 43445390 - 43445555
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43445390 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 43445488  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  43445489 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtgat 43445555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25425267 - 25425102
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425267 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 25425169  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25425168 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25425102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24595146 - 24594981
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24595146 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 24595048  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  24595047 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 24594981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27008657 - 27008492
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27008657 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacct 27008559  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  27008558 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 27008492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23327598 - 23327449
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23327598 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23327500  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  23327499 catgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 23327449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Original strand, 18779788 - 18779861
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgatt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18779788 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgatt 18779861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23510475 - 23510393
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23510475 gagatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattg 23510393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 1170320 - 1170416
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  1170320 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 1170416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 21653051 - 21653147
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  21653051 ggtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttattgataaatgtgattggtgattg 21653147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24470805 - 24470735
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24470805 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtc 24470735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 17473566 - 17473647
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  17473566 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 17473647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28258094 - 28258026
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28258094 ggtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagt 28258026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21392699 - 21392603
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||    
T  21392699 ggtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattg 21392603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11582398 - 11582340
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  11582398 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt 11582340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7424178 - 7424098
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  7424178 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 7424098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23492579 - 23492527
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23492579 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 23492527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21615588 - 21615537
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21615588 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 21615537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19860808 - 19860758
Alignment:
Q  74 atcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19860808 atcgaaggtgacgaccttggggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 19860758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7727154 - 7727102
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7727154 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttacgtgtca 7727102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13793706 - 13793654
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13793706 catcaaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 13793654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 24184867 - 24184966
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||    
T  24184867 aggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaagtgtgattggtgattg 24184966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 32967764 - 32967816
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32967764 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 32967816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 37189720 - 37189772
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37189720 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacttgcatttatgtgtca 37189772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3672499 - 3672419
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||  | ||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3672499 aggtgacgaccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactagatgcatatcaagacatgagtcttatttg 3672419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23453456 - 23453356
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||    
T  23453456 aggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 23453357  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  23453356 g 23453356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23460700 - 23460600
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||    
T  23460700 aggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 23460601  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  23460600 g 23460600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23464961 - 23464861
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || || || ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||    
T  23464961 aggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 23464862  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  23464861 g 23464861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 5452432 - 5452513
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---tgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  5452432 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 5452513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Original strand, 24227059 - 24227148
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---tgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  24227059 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 24227148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30141458 - 30141308
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggt 178  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30141458 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggt 30141359  T
Q  179 gagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30141358 gagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgattgatgat 30141308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 1469168 - 1469330
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1469168 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 1469267  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  1469268 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 1469330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 2450840 - 2451004
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450840 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 2450939  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2450940 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 2451004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18909333 - 18909169
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909333 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 18909234  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18909233 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18909169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22273688 - 22273524
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273688 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 22273589  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22273588 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44228079 - 44227903
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  44228079 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 44227981  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  44227980 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 44227903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16259649 - 16259530
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16259649 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatggg 16259550  T
Q  149 tcatatttgaaaatgtgatt 168  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  16259549 tcttatttggaaatgtgatt 16259530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16819561 - 16819386
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || |  |  ||||||||||||||||||||||    
T  16819561 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgcaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgttgagat 16819462  T
Q  100 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16819461 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 16819386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49230856 - 49230690
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49230856 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgacgttgttgagatttggtacca 49230758  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  49230757 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattg 49230690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 319200 - 319338
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  319200 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgcgattggtg 319299  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  319300 attggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttg 319338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33340496 - 33340318
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  33340496 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 33340398  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  33340397 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattg 33340318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15613669 - 15613543
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15613669 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgag 15613570  T
Q  149 tcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  15613569 tcttatgtgaaattcgtgattggtgat 15613543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 23081716 - 23081842
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23081716 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgag 23081815  T
Q  149 tcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  23081816 tcttatgtgaaattcgtgattggtgat 23081842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 12266041 - 12266167
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12266041 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgag 12266140  T
Q  149 tcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||||| || |||||||||||    
T  12266141 tcttatgtgaaatatttgattggtgat 12266167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 16745683 - 16745848
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745683 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 16745782  T
Q  110 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16745783 atgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 16745848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23491110 - 23490981
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 147  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23491110 ccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 23491011  T
Q  148 gtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  23491010 gtcttgtttgataaatgtgattggtgattg 23490981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 17913755 - 17913905
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  17913755 aaagggttaagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacgtacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 17913853  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17913854 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 17913905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19945208 - 19945105
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19945208 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtg 19945109  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  19945108 attg 19945105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2048713 - 2048536
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| |  ||    
T  2048713 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgt-gagttgttccatcgaaggtgacgaccttttgaag 2048616  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  2048615 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattg 2048536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 15470015 - 15470141
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15470015 ccttacatacgatgttgacttgtccatcggagatgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataag 15470114  T
Q  149 tcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||    
T  15470115 tcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15470141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15574650 - 15574524
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15574650 ccttacatgcgactttaacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgag 15574551  T
Q  149 tcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  15574550 tcttatgtgaaattcgtgattggtgat 15574524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27839349 - 27839184
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27839349 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 27839251  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27839250 catgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgatgat 27839184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 15939965 - 15940140
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||    
T  15939965 aaagggctgaacttttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtctatcggaggtgacgaccttttggaga 15940063  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||   ||||||||||||||    
T  15940064 tttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgat 15940140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 8269915 - 8270080
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8269915 actcttttacttcgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 8270013  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  8270014 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 8270080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 8277026 - 8277191
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8277026 actcttttacttcgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 8277124  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  8277125 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 8277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 8305835 - 8306000
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8305835 actcttttacttcgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacattcggtgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 8305933  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  8305934 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 8306000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30151978 - 30151813
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  30151978 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 30151880  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  30151879 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 30151813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25057345 - 25057248
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  25057345 ggtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattg 25057248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53769302 - 53769137
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  53769302 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 53769204  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  53769203 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 53769137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8630419 - 8630324
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgatt 168  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  8630419 catcgaaggtgacgacctggaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgatt 8630324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262697
Alignment:
Q  82 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattg 19262697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41268883 - 41268734
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  41268883 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 41268785  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  41268784 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 41268734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45859661 - 45859512
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  45859661 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 45859563  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  45859562 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 45859512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10737138 - 10737034
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  10737138 catcgaaggtggcgaccttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggt 10737039  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  10737038 gattg 10737034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 50113714 - 50113818
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  50113714 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 50113813  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  50113814 gattg 50113818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 13956320 - 13956466
Alignment:
Q  14 cttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13956320 cttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcat 13956418  T
Q  112 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  13956419 gcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 13956466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 13977153 - 13977299
Alignment:
Q  14 cttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13977153 cttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcat 13977251  T
Q  112 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  13977252 gcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 13977299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Original strand, 14846237 - 14846339
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | | |||||||||||    
T  14846237 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggt 14846336  T
Q  172 gat 174  Q
    |||    
T  14846337 gat 14846339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 17957994 - 17958092
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  17957994 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgattg 17958092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30204962 - 30204840
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       
T  30204962 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcattt--gtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg--- 30204868  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
        ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30204867 ----tgtatgaataattgtgaattgatatttg 30204840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 55315016 - 55314874
Alignment:
Q  18 tacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55315016 tacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcat 55314918  T
Q  116 ttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  55314917 ttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 55314874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17099182 - 17099058
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||       
T  17099182 ggtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg--- 17099086  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17099085 ----tgtgtgaataattgtgaattgatatttg 17099058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Original strand, 51160058 - 51160163
Alignment:
Q  71 tccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattgg 170  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||   | ||||||||||    
T  51160058 tccatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgattgg 51160157  T
Q  171 tgattg 176  Q
    ||||||    
T  51160158 tgattg 51160163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Original strand, 18905354 - 18905434
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  18905354 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18905434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 19572429 - 19572525
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| |||||||||    
T  19572429 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgagtggtgattg 19572525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7852379 - 7852276
Alignment:
Q  74 atcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcat-atttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  7852379 atcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattggtg 7852280  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  7852279 attg 7852276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 12351432 - 12351535
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||| |||||    
T  12351432 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccagtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtcttgttttgaaatgtgactggtg 12351531  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  12351532 attg 12351535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 6148456 - 6148550
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  6148456 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatgtgattggtgattg 6148550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11813404 - 11813308
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||    
T  11813404 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgctgattg 11813308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5227298 - 5227195
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattgg 170  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |    
T  5227298 catcgaatgtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgattag 5227199  T
Q  171 tgat 174  Q
    ||||    
T  5227198 tgat 5227195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19230626 - 19230531
Alignment:
Q  78 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  19230626 aaggtgacgacgttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgataaatgtgattggtga 19230531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581311
Alignment:
Q  105 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 45581311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38166484 - 38166422
Alignment:
Q  159 aaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtga 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38166484 aaatgtgattggtgattggtgattatgtatgaataattatgaattgatgtttggcacatgtga 38166422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 16183664 - 16183760
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||    
T  16183664 ggtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattg 16183760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 22145881 - 22145977
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  22145881 ggtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 22145977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Original strand, 15860807 - 15860902
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  15860807 ggtgacgaccctttggagatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 15860902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15874737 - 15874685
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15874737 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 15874685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48420244 - 48420192
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48420244 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 48420192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 5229669 - 5229720
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5229669 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 5229720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14287598 - 14287500
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  14287598 aggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgatt 14287500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 47786457 - 47786563
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattg 169  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  47786457 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattg 47786556  T
Q  170 gtgattg 176  Q
    |||||||    
T  47786557 gtgattg 47786563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 176
Target Start/End: Original strand, 11062712 - 11062788
Alignment:
Q  102 ggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  11062712 ggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcaggacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattg 11062788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 12490325 - 12490377
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12490325 catcgaaggtgacgaccttgagatgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 12490377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 14060829 - 14060935
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattg 169  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  14060829 catcaaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtaaaatgtaattg 14060928  T
Q  170 gtgattg 176  Q
     ||||||    
T  14060929 atgattg 14060935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 38812583 - 38812634
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38812583 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtacgacatgcatatatgtgtc 38812634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 47983470 - 47983419
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47983470 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtc 47983419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 47992757 - 47992706
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47992757 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtc 47992706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48002044 - 48001993
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48002044 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtc 48001993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48011330 - 48011279
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48011330 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtc 48011279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 14523004 - 14523049
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14523004 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 14523049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 9592349 - 9592393
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9592349 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 9592393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5236838 - 5236674
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236838 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 5236739  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  5236738 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 272718 - 272880
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272718 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 272817  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  272818 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 272880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 643131 - 642969
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  643131 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 643032  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  643031 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 828937 - 828775
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828937 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 828838  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  828837 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 828775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 24662760 - 24662924
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24662760 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 24662859  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  24662860 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 24662924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43684297 - 43684133
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43684297 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtactgca 43684198  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  43684197 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 43684133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 24108244 - 24108386
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  24108244 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgat----- 24108338  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24108339 --tatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgtttgatgat 24108386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 24387213 - 24387371
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  24387213 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgacctt-ttgag 24387310  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24387311 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 24387371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24547829 - 24547703
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24547829 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgag 24547730  T
Q  149 tcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  24547729 tcttatgtgaaattcgtgattggtgat 24547703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 3433089 - 3433254
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3433089 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 3433187  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  3433188 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3433254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 21853409 - 21853574
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21853409 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 21853507  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21853508 catgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21853574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 22909144 - 22909241
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22909144 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaaatgtgattgatgattg 22909241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 21846006 - 21846169
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846006 tcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 21846104  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21846105 tgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21846169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 22089947 - 22090106
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  22089947 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 22090045  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  22090046 tttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 22090106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 24930620 - 24930779
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| || | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  24930620 aaagagttgagctcttttacttcagagattat-gtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 24930718  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24930719 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 24930779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29758946 - 29758769
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||| || |||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  29758946 aaagggttgagctcttttacttcggagatt-ttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgt-gatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggag 29758849  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  29758848 atttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattg 29758769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37605566 - 37605427
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgac-gaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  37605566 catcgaaggtgacagaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgat 37605467  T
Q  172 gattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  37605466 gattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 37605427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 15320563 - 15320722
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  15320563 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 15320661  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  15320662 tttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 15320722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 15500932 - 15501091
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  15500932 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 15501030  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  15501031 tttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 15501091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23509493 - 23509397
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23509493 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 16874452 - 16874617
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16874452 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 16874550  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  16874551 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 16874617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 22008138 - 22008235
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  22008138 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattg 22008235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 16203842 - 16204018
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttg-tccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||| || |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16203842 aaagggttgagctcttttacttcagagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgt-gaattgatccatcgaaggtgacgaccttttggag 16203939  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  16203940 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 16204018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 13664295 - 13664392
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13664295 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattg 13664392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 13723570 - 13723667
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13723570 ggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattg 13723667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 16675839 - 16675988
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16675839 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 16675937  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  16675938 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 16675988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 224676 - 224825
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  224676 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 224774  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  224775 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 224825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 738299 - 738448
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  738299 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 738397  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  738398 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 738448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 862194 - 862343
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  862194 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 862292  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  862293 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 862343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 270321 - 270245
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  270321 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagt 270245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Original strand, 645599 - 645675
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  645599 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagt 645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Original strand, 831334 - 831410
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  831334 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagt 831410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 701089 - 701238
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  701089 actcttttgcttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 701187  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  701188 catgcatttttttgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 701238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41244209 - 41244135
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41244209 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatga 41244135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 20655685 - 20655793
Alignment:
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||    
T  20655685 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataactgt 20655784  T
Q  199 gaattgatg 207  Q
    |||||||||    
T  20655785 gaattgatg 20655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 19994801 - 19994897
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||    
T  19994801 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattg 19994897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 22323101 - 22323196
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||||||    
T  22323101 ggtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgataaatgtgtttggtgattg 22323196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 24719076 - 24719151
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24719076 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 24719151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25121013 - 25120938
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25121013 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 25120938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 173
Target Start/End: Original strand, 43375200 - 43375278
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  43375200 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtga 43375278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16416812 - 16416736
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16416812 aggtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 16416736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20480168 - 20480092
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||| |||  | |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20480168 aggtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 20480092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25294574 - 25294488
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| |||  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25294574 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatttg 25294488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25756563 - 25756477
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| |||  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25756563 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatttg 25756477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 39448413 - 39448465
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39448413 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 39448465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Original strand, 23116418 - 23116464
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa 126  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23116418 ggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaa 23116464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 17731115 - 17731215
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||    
T  17731115 aggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 17731214  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  17731215 g 17731215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 21192337 - 21192389
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    |||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21192337 catcgaaggtgacgaccttaaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 21192389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21696133 - 21696081
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21696133 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtca 21696081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Original strand, 37655237 - 37655326
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---tgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  37655237 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggcaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 37655326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 123
Target Start/End: Original strand, 21199764 - 21199814
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgt 123  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21199764 catcgaaggtgacgagcttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgt 21199814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 22498901 - 22498945
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22498901 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 22498945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23835792 - 23835741
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||    
T  23835792 catcgaaggtgacgaccttgaggtg-ttcggtaccacatgcatttatgtgtca 23835741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33170830 - 33170786
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33170830 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 33170786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 14907952 - 14908116
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14907952 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 14908051  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  14908052 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 5889812 - 5889974
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5889812 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 5889911  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  5889912 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5889974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 11232767 - 11232929
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232767 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 11232866  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  11232867 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 22514614 - 22514776
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22514614 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 22514713  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  22514714 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22514776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 28777215 - 28777377
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28777215 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 28777314  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28777315 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 28777377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 19888292 - 19888456
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19888292 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 19888391  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19888392 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19888456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20013765 - 20013601
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20013765 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 20013666  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  20013665 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 20013601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23818822 - 23818658
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23818822 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 23818723  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  23818722 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23818658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 12643539 - 12643705
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643539 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgcgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 12643637  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12643638 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattg 12643705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21140529 - 21140355
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcg-aaggtgacgaccttgttgagat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |  || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21140529 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagccttacatacgatgtgcaagtggc-atcggaaggtgacgaccttgttgagat 21140431  T
Q  100 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  21140430 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 21140355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 21276031 - 21276205
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcg-aaggtgacgaccttgttgagat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |  || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21276031 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagccttacatacgatgtgcaagtggc-atcggaaggtgacgaccttgttgagat 21276129  T
Q  100 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  21276130 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 21276205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22692943 - 22692768
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  22692943 aaagggttgagctcttttacttcggagatt-ttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttatggaga 22692845  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  22692844 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22692768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22697590 - 22697415
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  22697590 aaagggttgagctcttttacttcggagatt-ttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttatggaga 22697492  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  22697491 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 12637678 - 12637843
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637678 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 12637776  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12637777 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 12637843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22282772 - 22282613
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  22282772 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 22282674  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22282673 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 22282613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 3800626 - 3800791
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3800626 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 3800724  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  3800725 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3800791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34822841 - 34822676
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822841 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 34822743  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  34822742 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 34822676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 24828110 - 24828239
Alignment:
Q  46 gagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacat 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24828110 gagccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacaaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacat 24828209  T
Q  146 gagtcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  24828210 gagtcttatgtgaaattcgtgattggtgat 24828239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 24832562 - 24832691
Alignment:
Q  46 gagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacat 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24832562 gagccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacaaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacat 24832661  T
Q  146 gagtcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  24832662 gagtcttatgtgaaattcgtgattggtgat 24832691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22273539 - 22273380
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  22273539 aaagagttgagctcttttacttaagagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 22273441  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22273440 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 22273380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12726696 - 12726531
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726696 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 12726598  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  12726597 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 12726531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23773180 - 23773015
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23773180 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23773082  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  23773081 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23773015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6878015 - 6877884
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    |||||||||||||||| |||  | |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6878015 catcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtg 6877916  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    ||||       ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6877915 attg-------tgtatgaataattgtgaattgatgtttg 6877884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 24687172 - 24687331
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggt-gacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| || ||||||||||||||||    
T  24687172 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaagttgacgaccttgttgaga 24687270  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  24687271 tttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 24687331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8886713 - 8886610
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  |||||||||||    
T  8886713 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatgtgtgattggtg 8886614  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  8886613 attg 8886610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8942289 - 8942124
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8942289 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 8942191  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  8942190 agtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8942124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22862060 - 22861957
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||    
T  22862060 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaagtgtgattggtg 22861961  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  22861960 attg 22861957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 17398109 - 17398258
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17398109 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 17398207  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  17398208 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 17398258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15631969 - 15631865
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    |||| ||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15631969 catcaaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattggt 15631870  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  15631869 gattg 15631865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Original strand, 43644556 - 43644656
Alignment:
Q  76 cgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  43644556 cgaaggtgacgatcttttggagatttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgatt 43644655  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  43644656 g 43644656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 211
Target Start/End: Original strand, 25877615 - 25877741
Alignment:
Q  78 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattgg 177  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||   | ||||||||||||||||     
T  25877615 aaggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg- 25877713  T
Q  178 tgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
          ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25877714 ------tgtatgaataattgtgaattgatatttg 25877741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 211
Target Start/End: Original strand, 36892358 - 36892483
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggt 178  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||      
T  36892358 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg-- 36892455  T
Q  179 gagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
         ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36892456 -----tgtatgaataattgtgaattgatatttg 36892483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 176
Target Start/End: Original strand, 20629007 - 20629113
Alignment:
Q  71 tccatcgaaggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattg 169  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||   | |||||||||    
T  20629007 tccattgaaggtgacgatctttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttattgatatatgtgattg 20629106  T
Q  170 gtgattg 176  Q
    |||||||    
T  20629107 gtgattg 20629113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25600533 - 25600431
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||   ||||||| ||||||    
T  25600533 catcgaaggtgacgaccttgaggtaatatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttggtg 25600434  T
Q  173 att 175  Q
    |||    
T  25600433 att 25600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 461221 - 461140
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  461221 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 461140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211358
Alignment:
Q  104 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaattcgtgattggtgat 25211358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24966772 - 24966692
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||   | |||||||||||||||    
T  24966772 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttattgatatatgtgattggtgatt 24966692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Original strand, 19435060 - 19435146
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19435060 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatttg 19435146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 173
Target Start/End: Original strand, 9654505 - 9654583
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  9654505 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttattgatatatgtgattggtga 9654583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 4878 - 4930
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4878 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 4930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 19670731 - 19670783
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19670731 catcgaaggtgacgaccttgaggagattcggcaccacatgcatttatgtgtca 19670783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 23823110 - 23823162
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23823110 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 23823162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 23825054 - 23825106
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23825054 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 23825106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 23832189 - 23832241
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23832189 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 23832241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 24296174 - 24296226
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24296174 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 24296226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25304141 - 25304089
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25304141 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 25304089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19658522 - 19658471
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19658522 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 19658471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 24088963 - 24089069
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattg 169  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||    
T  24088963 catcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattg 24089062  T
Q  170 gtgattg 176  Q
     ||||||    
T  24089063 atgattg 24089069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 22581586 - 22581686
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||    
T  22581586 aggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 22581685  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  22581686 g 22581686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 43641399 - 43641348
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43641399 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtc 43641348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 720920 - 720836
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| || ||||| |||| |  ||||||||||| ||||||    
T  720920 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattg 720836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 22137424 - 22137468
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22137424 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 22137468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24272624 - 24272580
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24272624 ggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 24272580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37930 - 37768
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37930 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 37831  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  37830 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7821568 - 7821406
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7821568 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 7821469  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  7821468 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7821406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7828879 - 7828717
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7828879 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 7828780  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  7828779 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 27103066 - 27103228
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27103066 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 27103165  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27103166 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 27110414 - 27110576
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27110414 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 27110513  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27110514 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27110576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27175260 - 27175098
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27175260 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 27175161  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  27175160 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 38785158 - 38785320
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38785158 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 38785257  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  38785258 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 38785320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 15443076 - 15443240
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15443076 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 15443175  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  15443176 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 15443240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16417113 - 16416949
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417113 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgcccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 16417014  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  16417013 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 16416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7291337 - 7291204
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7291337 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-tgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataa 7291239  T
Q  195 ttgtgaattgatgtttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7291238 ttgtgaattgatgtttgacacatgtgattgatgat 7291204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11514768 - 11514604
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11514768 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgtagagatttggtaccgca 11514669  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  11514668 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 11514604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 30263641 - 30263805
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30263641 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttatatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacaaccttgttgagatttggtaccgca 30263740  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  30263741 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 30263805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 369541 - 369365
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  369541 aaagggttgagctcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagat 369443  T
Q  100 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  369442 ttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattg 369365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 15952606 - 15952778
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttg 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15952606 ggttgaactcttttactttgagattattgtaaggcagatgtgagcccttacatttgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagacttg 15952704  T
Q  103 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15952705 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattggagattg 15952778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3893742 - 3893532
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagc-cttacatgcgatgttgacttgtc-catcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||| | ||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||  | |    
T  3893742 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgttt--ttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtg 3893646  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattg 197  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  3893645 atccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataattg 3893546  T
Q  198 tgaattgatgtttg 211  Q
    || |||||||||||    
T  3893545 tgcattgatgtttg 3893532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 32496063 - 32496241
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  32496063 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaacgcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 32496161  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  32496162 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattg 32496241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10988258 - 10988092
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10988258 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 10988160  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  10988159 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 10988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 18255343 - 18255505
Alignment:
Q  14 cttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacat 111  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18255343 cttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 18255441  T
Q  112 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  18255442 gcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18255505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 26010699 - 26010874
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  26010699 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 26010797  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  26010798 tttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 26010874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12753456 - 12753321
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcat-atttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||    
T  12753456 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattggt 12753357  T
Q  172 gattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatg 207  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  12753356 gattggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatg 12753321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 1938358 - 1938460
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||    
T  1938358 catcaaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaacgtgattggtg 1938457  T
Q  173 att 175  Q
    |||    
T  1938458 att 1938460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13757225 - 13757060
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13757225 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 13757127  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  13757126 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 13757060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 174
Target Start/End: Original strand, 15518442 - 15518539
Alignment:
Q  78 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  15518442 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 15518539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 15761877 - 15762051
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || |||||| |||||| |  || || |||||||||||||||||| | ||||    
T  15761877 aaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgt-gttttatc-atcgaaggtgacgaccttttggaga 15761973  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgatt 175  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  15761974 tttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 15762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 211
Target Start/End: Original strand, 112899 - 113027
Alignment:
Q  83 gacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagt 182  Q
    ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  112899 gacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattggtgattgataatt 112998  T
Q  183 atgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
      || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  112999 gcgtatgaataaatgtgaattgttgtttg 113027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2436212 - 2436110
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggt 171  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  2436212 catcaaaggtgacgacctttttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggt 2436113  T
Q  172 gat 174  Q
    |||    
T  2436112 gat 2436110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 25293795 - 25293960
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25293795 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 25293893  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  25293894 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 25293960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Original strand, 2192357 - 2192453
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  2192357 ggtgacgacctttttggaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 2192453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Original strand, 16480587 - 16480683
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  16480587 ggtgacgacctttttggagatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 16480683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Original strand, 42057680 - 42057819
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  42057680 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 42057778  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  42057779 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 45453844 - 45453946
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    |||||||||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  45453844 catcgaaggtgatgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttg-aattgtgattggtg 45453942  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  45453943 attg 45453946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 13912630 - 13912779
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13912630 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 13912728  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  13912729 catgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 13912779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122980
Alignment:
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggggattg 122980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 13867687 - 13867783
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||    
T  13867687 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattg 13867783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 11582551 - 11582630
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  11582551 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 11582630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Original strand, 18981568 - 18981664
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  18981568 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 18981664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 26071855 - 26071986
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  26071855 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtg 26071954  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    ||||       ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26071955 attg-------tgtatgaataattgtgaattgatatttg 26071986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 26095642 - 26095773
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  26095642 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtg 26095741  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    ||||       ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26095742 attg-------tgtatgaataattgtgaattgatatttg 26095773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2025002 - 2024939
Alignment:
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  2025002 catttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattg 2024939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11285698 - 11285628
Alignment:
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgatt 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  11285698 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgatt 11285628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824178
Alignment:
Q  82 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 15824178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44863712 - 44863588
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||       
T  44863712 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattg--- 44863616  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
        ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44863615 ----tgtatgaataattgtgaattgatatttg 44863588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 142137 - 142062
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  142137 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 142062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 13038825 - 13038904
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||   | ||||||||||||||||    
T  13038825 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttattgatatatgtgattggtgattg 13038904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3058632 - 3058582
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgt 123  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3058632 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgt 3058582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 12545402 - 12545500
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagattt-ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  12545402 aggtgacgaccttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttattgataaatgtggttggtgattg 12545500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36051149 - 36051071
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  36051149 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttattgatatatgtgattggtga 36051071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47288228 - 47288170
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47288228 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 47288170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15925869 - 15925789
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  15925869 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 15925789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2027212 - 2027095
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||| || |||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  2027212 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgt-gagttgttccatcggaggtgacgaccttttcgag 2027115  T
Q  98 atttggtaccacatgcattt 117  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2027114 atttggtaccacatgcattt 2027095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3055253 - 3055194
Alignment:
Q  118 atgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  3055253 atgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattg 3055194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16210265 - 16210210
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16210265 gagatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtc 16210210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Original strand, 9058224 - 9058313
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatca---tgacatgagtcatatttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  9058224 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatttg 9058313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13388540 - 13388488
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13388540 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 13388488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4483320 - 4483269
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4483320 catcgaaggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 4483269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 15525997 - 15526056
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgag-ccttacatgcgatgt 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  15525997 ggttaaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgt 15526056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Original strand, 9322663 - 9322726
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc---aataagtgcatatcat 140  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||    
T  9322663 ggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtccggattaagtgcatatcat 9322726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Original strand, 12249770 - 12249865
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    ||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  12249770 ggtgacgactttgaagtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatttcgaaatgtgattagtga 12249865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13376247 - 13376195
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13376247 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccatatgcatttatgtgtca 13376195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 15914024 - 15914076
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15914024 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 15914076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 16571771 - 16571848
Alignment:
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| | |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  16571771 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattg 16571848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16593891 - 16593814
Alignment:
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| | |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  16593891 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattg 16593814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17003464 - 17003302
Alignment:
Q  13 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003464 tcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatg 17003365  T
Q  113 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17003364 catttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17003302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 51451254 - 51451090
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51451254 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 51451155  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  51451154 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 51451090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41393093 - 41392929
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41393093 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 41392994  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  41392993 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 41392929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22352779 - 22352602
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  22352779 aaagggttgagctctcttacttcagagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggaga 22352681  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  22352680 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattg 22352602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35053413 - 35053275
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  35053413 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtg 35053314  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
     ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35053313 tttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttg 35053275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 44036411 - 44036570
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtg-agccttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||    
T  44036411 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgaccttttggag 44036509  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44036510 atttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 44036570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45050290 - 45050164
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45050290 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgag 45050191  T
Q  149 tcatatttgaaaat-gtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  45050190 tcttatgtgaaattcgtgattggtgat 45050164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 15863011 - 15863114
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15863011 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggag 15863110  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  15863111 attg 15863114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17147423 - 17147258
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147423 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 17147325  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17147324 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 17147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Original strand, 35935143 - 35935260
Alignment:
Q  58 cgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  35935143 cgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtc 35935242  T
Q  158 aaaat-gtgattggtgat 174  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  35935243 aaattcgtgattggtgat 35935260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 170
Target Start/End: Original strand, 22250620 - 22250711
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattgg 170  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22250620 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttggaaatgtgattgg 22250711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 211
Target Start/End: Original strand, 5676197 - 5676331
Alignment:
Q  77 gaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  5676197 gaaggtgacgaccttgaggtgatacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtaattg 5676296  T
Q  177 gtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||| | ||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  5676297 gtgattgtgtatgaataattatgtattgatatttg 5676331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 7642105 - 7642270
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgag-ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7642105 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagtccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 7642203  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  7642204 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtgat 7642270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22034490 - 22034325
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22034490 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 22034392  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  22034391 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 22034325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20930121 - 20929969
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtc-catcgaaggtgacgaccttgttgagattt 101  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20930121 ggttgagctcttttactttggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttacatcggaggtgacgaccttttggagattt 20930023  T
Q  102 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20930022 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 20929969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 20826744 - 20826909
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20826744 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 20826842  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  20826843 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 20826909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22365253 - 22365156
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22365253 ggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattg 22365156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22226632 - 22226459
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||| |  || || |||| ||||||||||||| | ||||    
T  22226632 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgt-gttttatc-atcggaggtgacgaccttttggaga 22226536  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  22226535 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 22226459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 5073823 - 5073972
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5073823 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 5073921  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  5073922 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 5073972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 18602566 - 18602715
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18602566 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 18602664  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  18602665 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 18602715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Original strand, 2422732 - 2422856
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       
T  2422732 ggtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg--- 2422828  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
        ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2422829 ----tgtatgaataattgtgaattgatatttg 2422856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20444318 - 20444215
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  20444318 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtg 20444219  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  20444218 attg 20444215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 37846058 - 37846161
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  37846058 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtg 37846157  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  37846158 attg 37846161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 9785898 - 9785994
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  9785898 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 9785994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Original strand, 22407893 - 22408017
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||       
T  22407893 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttattgatatatgtgattggtgattg--- 22407989  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22407990 ----tgtgtgaataattgtgaattgatatttg 22408017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49966152 - 49966056
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  49966152 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 49966056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 20895406 - 20895485
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  20895406 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 20895485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20530060 - 20529979
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  20530060 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 20529979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Original strand, 21651601 - 21651682
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  21651601 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 21651682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 22836909 - 22837008
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||    
T  22836909 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgatgattg 22837008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 20956625 - 20956725
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||    
T  20956625 aggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 20956724  T
Q  176 g 176  Q
    |    
T  20956725 g 20956725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27673357 - 27673258
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgatt 175  Q
    |||||||| |||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  27673357 aggtgacgcccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtc-tatttgataaatgtgattgatgatt 27673259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21858037 - 21857977
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  21858037 gagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt 21857977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41218024 - 41217920
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcat-atttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||| || ||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  41218024 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgtatatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattggt 41217925  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  41217924 gattg 41217920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29137376 - 29137312
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  29137376 gagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 29137312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 126
Target Start/End: Original strand, 37235553 - 37235606
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37235553 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaa 37235606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 13378353 - 13378405
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13378353 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttaggtgtca 13378405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19601755 - 19601703
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19601755 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatatgtca 19601703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21193741 - 21193689
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21193741 catcgaaggtgacaaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtca 21193689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 36357929 - 36357981
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36357929 catcgaagatgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 36357981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 22029338 - 22029299
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22029338 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcc 22029299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 38035213 - 38035264
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38035213 catcgaatgtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtc 38035264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18505856 - 18505814
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtg 122  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18505856 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtg 18505814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 5676341 - 5676386
Alignment:
Q  161 atgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgat 206  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  5676341 atgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgat 5676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 5471983 - 5472027
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5471983 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 5472027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 22144991 - 22145035
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22144991 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 22145035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 35524080 - 35524179
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||| |||||||||| | |||  || |||||||||||||||    
T  35524080 aggtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcacgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattg 35524179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 41213266 - 41213310
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41213266 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 41213310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25546 - 25382
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25546 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 25447  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  25446 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 25382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21291 - 21127
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21291 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatatggtaccgca 21192  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  21191 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3254
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3090 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgca 3189  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3190 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5825 - 5661
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5825 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagccttacatgcgatgttgacttgcccatcggaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaca 5726  T
Q  111 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  5725 tgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 217256 - 217414
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  217256 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgg-ggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 217353  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  217354 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 217414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33850 - 33707
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggt 178  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  33850 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattg-------gt 33758  T
Q  179 gagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33757 gagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgattgatgat 33707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 32698 - 32857
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  32698 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 32796  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32797 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 32857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 229
Target Start/End: Original strand, 38994 - 39137
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggt 178  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||    
T  38994 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaat-------gtgattggt 39086  T
Q  179 gagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgaatgatgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39087 gagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttgacacatgtgattgatgat 39137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40146 - 39987
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  40146 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 40048  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40047 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 558
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  733 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 635  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  634 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgat 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3519 - 3426
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  3519 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtga 3426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4495 - 4320
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  4495 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggaga 4397  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  4396 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 6655 - 6830
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  6655 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggaga 6753  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  6754 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 6830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 58942 - 59117
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |    
T  58942 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttgtccatcggaggtgacgacctttttaaaa 59040  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  59041 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 59117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 106512 - 106564
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  106512 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 106564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 130454 - 130410
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  130454 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 130410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Original strand, 109592 - 109756
Alignment:
Q  5 ggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttg 102  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  109592 ggttgatctcttttacttcggagattat-gtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttg 109690  T
Q  103 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgatt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  109691 gtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgatt 109756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 54221 - 54118
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  54221 catcgaaagtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggt 54122  T
Q  172 gatt 175  Q
    ||||    
T  54121 gatt 54118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16097 - 15922
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  16097 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggaga 15999  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  15998 tttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 13782 - 13884
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||   ||||||| ||||||    
T  13782 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttggtg 13881  T
Q  173 att 175  Q
    |||    
T  13882 att 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 60148 - 60010
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  60148 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtg 60049  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  60048 attggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttg 60010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34987 - 34811
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  34987 aaaggattgaactcttttacttcgatattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 34889  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  34888 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 34811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 155905 - 156031
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  155905 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgag 156004  T
Q  149 tcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    || ||| ||| | ||||||||||||||    
T  156005 tcttatgtgacatatgtgattggtgat 156031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4434
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  4256 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 4354  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4355 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattg 4434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 49096 - 49274
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  49096 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggag 49194  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  49195 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattg 49274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 128993 - 128892
Alignment:
Q  49 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  128993 ccttacatgcgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgag 128894  T
Q  149 tc 150  Q
    ||    
T  128893 tc 128892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Original strand, 90599 - 90674
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  90599 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt 90674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 106654 - 106479
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  106654 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttgtccatcggaggtgacgaccttttggaga 106556  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||   ||||||||||||||    
T  106555 tttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgat 106479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 270775 - 270597
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| | |||    
T  270775 aaagggttgagctcttttatttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgatcttttggag 270677  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  270676 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattg 270597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 236755 - 236621
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  236755 catcgaaggtgacgacctagaggtgataaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtg 236656  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatg 207  Q
    |||||||| | | | ||||||| |||| |||||||    
T  236655 attggtgattgtctatgaataactgtggattgatg 236621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 5105 - 5254
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| |  |||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  5105 aaagggttgagctcttttactttggagattat-gtaaggcggcagtgaacccttacatacgatgtttacttgtccatcggaggtgacgaccttttggaga 5203  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5204 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 12786 - 12862
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12786 aggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 12862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 56513 - 56375
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  56513 catcgaatgtgacgaccttttggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgttg 56414  T
Q  173 attggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    | || ||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  56413 aatgatgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttg 56375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 17606 - 17771
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgagatttggtacca 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17606 actcttttactttgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 17704  T
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17705 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 951 - 855
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattg 169  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  951 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattg 855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5807 - 5704
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  5807 catcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattggtg 5708  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  5707 attg 5704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30005 - 29846
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaa-ggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  30005 aaagagttgaactcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggc-atcgaaaggtgacgaccttgttgaga 29907  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  29906 tttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaa 29846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7635 - 7477
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| || ||| || |||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||    
T  7635 aaagggttgaactcttttactttggagattat-gtaaggctggggtgaacccttatatacgatgttgacttgtccatcagaggtgatgaccttttggaga 7537  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7536 tttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttga 7477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7362 - 7318
Alignment:
Q  114 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7362 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 7318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12772 - 12669
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12772 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaaatgtgattggtg 12673  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  12672 attg 12669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 2637 - 2817
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||    
T  2637 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgaccttttggag 2735  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtg--catatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  2736 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattg 2817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19955 - 19825
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtga 180  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19955 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtga 19856  T
Q  181 gtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
     | ||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  19855 ttgtgaatgaatatttgtgaattgatatttg 19825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17871 - 17772
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtga 180  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17871 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtga 17772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 8242 - 8294
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8242 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 8294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 13631 - 13683
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13631 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtca 13683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 1365 - 1469
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggt 171  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1365 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 1464  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  1465 gattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 11611 - 11715
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  11611 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggt 11710  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  11711 gattg 11715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 9432 - 9607
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgaga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||| || ||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  9432 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcggggttgaacccttacatatgatattgacatgtccatcggaggtgatgaccttttggaga 9530  T
Q  99 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  9531 tttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17146 - 17061
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgt 164  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17146 aggtgatgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgt 17061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 176
Target Start/End: Original strand, 249140 - 249233
Alignment:
Q  83 gacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  249140 gacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 249233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Original strand, 197681 - 197766
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  197681 catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 197766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 84987 - 84943
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  84987 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 84943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41361 - 41222
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  41361 aaagggttgagctcttttacttcgtagattat-gtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcggaggtgacgaccttttggag 41263  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatc 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41262 atttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatc 41222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 129706 - 129865
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| | ||||||| |||| |||||| |||||| ||| || | |||    
T  129706 aaagagttgagctcttttactttggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacaatgttgagttgttccatcggaggtgaagacgttttggag 129804  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  129805 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttga 129865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21129 - 21054
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21129 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 21054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28718 - 28644
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28718 gtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 28644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8006 - 7875
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcat-atttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||    
T  8006 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgagtggt 7907  T
Q  172 gattggtgagtatgtgtgaataattgtgaatt 203  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| | ||||||    
T  7906 gattggtgattgtgtatgaataactatgaatt 7875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 145185 - 145012
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  145185 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgt-gagttgttccatcgaaggtgacgaccttttggag 145088  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  145087 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattggtga 145012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 147444 - 147271
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||| | |||    
T  147444 aaagggttgagctcttttacttcggagattat-gtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgt-gagttgttccatcgaaggtgatgaccttttggag 147347  T
Q  98 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  147346 atttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattggtga 147271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14252 - 14147
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatat-ttgaaaa-tgtgattgg 170  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  14252 catcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattgg 14153  T
Q  171 tgattg 176  Q
    ||||||    
T  14152 tgattg 14147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  82 tgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa-atgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4703 - 4572
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcat-atttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| | |||||||||||    
T  4703 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattggt 4604  T
Q  172 gattggtgagtatgtgtgaataattgtgaatt 203  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| | ||||||    
T  4603 gattggtgaatgtgtatgaataactatgaatt 4572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 77979 - 77900
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  77979 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgat 77900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 66337 - 66412
Alignment:
Q  102 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||    
T  66337 ggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattttgaagtgtgattggtgattgg 66412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 26414 - 26511
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  26414 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 26511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 138398 - 138501
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  138398 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtg 138497  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  138498 attg 138501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 76855 - 76758
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  76855 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 76758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14881 - 14779
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  14881 catcggaggtgacgaccttttggagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggt 14782  T
Q  172 gat 174  Q
    |||    
T  14781 gat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28402 - 28300
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  28402 catcggaggtgacgaccttttggagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggt 28303  T
Q  172 gat 174  Q
    |||    
T  28302 gat 28300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 51613 - 51511
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggt 171  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  51613 catcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggt 51514  T
Q  172 gat 174  Q
    |||    
T  51513 gat 51511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Original strand, 1045 - 1142
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattgg 177  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  1045 ggtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgg 1142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27148 - 27043
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatat-ttgaaaa-tgtgattgg 170  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  27148 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattgg 27049  T
Q  171 tgattg 176  Q
    ||||||    
T  27048 tgattg 27043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 176
Target Start/End: Original strand, 256558 - 256655
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  256558 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 256655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 125007 - 125088
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||||||    
T  125007 gagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg 125088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Original strand, 72012 - 72106
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  72012 gtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 175
Target Start/End: Original strand, 76393 - 76487
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  76393 gtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 76487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 193074 - 192983
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggt 171  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||    
T  193074 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggt 192983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18152 - 18056
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  18152 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattg 18056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3233 - 3130
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||   ||||||| ||||||    
T  3233 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttattgataaatgtggttggtg 3134  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  3133 attg 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31305 - 31181
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtg 179  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||       
T  31305 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattg--- 31209  T
Q  180 agtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
        ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31208 ----tgtatgaataattgtgaattgatatttg 31181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6120 - 6044
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6120 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagt 6044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 163903 - 163827
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  163903 aggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 163827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 138 - 35
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattgg 170  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||| ||||    
T  138 catcggaggtgacgacctttttggagaattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttgg 39  T
Q  171 tgat 174  Q
    ||||    
T  38 tgat 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7300 - 7224
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7300 aggtgacgaccttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 7224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40082 - 40006
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  40082 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtga 40006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 66955 - 67067
Alignment:
Q  11 actcttttacttcgagattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgtccatcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||  |  || | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66955 actcttttacttcgagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacaatcgatgtgcaagtggcaacgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctc 67054  T
Q  110 atgcatttatgtg 122  Q
    |||||||||||||    
T  67055 atgcatttatgtg 67067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 94755 - 94696
Alignment:
Q  117 tatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  94755 tatgggtcactaggtgcatatcatgacatgagtcttatatataaatgtgattggtgattg 94696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 803 - 712
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggt 171  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  803 ggtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttattgatatatgtgattggt 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1604 - 1509
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgatt 175  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  1604 ggtgacgaccctttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3199 - 3096
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtg 172  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  3199 catcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattggtg 3100  T
Q  173 attg 176  Q
    ||||    
T  3099 attg 3096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28328 - 28253
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28328 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 28253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Original strand, 72104 - 72175
Alignment:
Q  79 aggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  72104 aggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 72175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 211
Target Start/End: Original strand, 75527 - 75591
Alignment:
Q  147 agtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtgagtatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 211  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  75527 agtcttatttggaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttg 75591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 149
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3775
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3706 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagt 3775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31091 - 30998
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtga 173  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  31091 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtga 30998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44693 - 44639
Alignment:
Q  86 gaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcat 140  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44693 gaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcat 44639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 176
Target Start/End: Original strand, 7013 - 7108
Alignment:
Q  81 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||    
T  7013 gtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattg 7108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Original strand, 15022 - 15105
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattggtga 180  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||| |||||||| ||||    
T  15022 gattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatacatgtgactggtgatttgtga 15105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Original strand, 6326 - 6384
Alignment:
Q  97 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6326 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttatt 6384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 13433 - 13503
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  13433 ggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtc 13503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 68901 - 68796
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattgg 170  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||  || |||||||||    
T  68901 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattgg 68802  T
Q  171 tgattg 176  Q
    ||||||    
T  68801 tgattg 68796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15906
Alignment:
Q  103 gtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattcataaatgtggttggtgattg 15906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Original strand, 15530 - 15610
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttg-agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaa 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  15530 ggtgacgacctttttggagattcggtaccacatgcatt-atgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaa 15610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 38036 - 37959
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtc 150  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38036 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 37959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6884
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  6824 gagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttatt 6884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 20905 - 21001
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |   | ||||||||||||||||    
T  20905 ggtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaatgatatatgtgattggtgattg 21001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Original strand, 3887 - 3965
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagt 149  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||    
T  3887 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagt 3965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 19246 - 19327
Alignment:
Q  95 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttga-aaatgtgattggtgattg 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  19246 gagatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtc-tttttgatatatgtgattggtgattg 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 7256 - 7308
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7256 catcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 7308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 116 - 1
Alignment:
Q  1 aaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcagaggtgagcc-ttacatgcgatgttgacttgt-ccatcgaaggtgacgaccttgttgag 97  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |  |||| || |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||| | |||    
T  116 aaagggttgagcttttttacttcggagattat-gtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgt-gatttgttccatcgaaggtgacgagcttttggag 19  T
Q  98 atttggtaccacatgcat 115  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18 atttggtaccacatgcat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8651 - 8547
Alignment:
Q  74 atcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggt 171  Q
    |||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||  || || |||||||    
T  8651 atcggaggtgacggccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgagattggt 8552  T
Q  172 gattg 176  Q
    |||||    
T  8551 gattg 8547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3331 - 3242
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc--aataagtgcatatcatg---acatgagtcatatttg 157  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  3331 catcgaaggtgacgacctagaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatttg 3242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 172
Target Start/End: Original strand, 24878 - 24942
Alignment:
Q  109 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaa-aatgtgattggtg 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  24878 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtg 24942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 125
Target Start/End: Original strand, 4949 - 4996
Alignment:
Q  78 aaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4949 aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgtca 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1902 - 1824
Alignment:
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttg-aaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||    
T  1902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattg 1824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 145413 - 145336
Alignment:
Q  101 tggtaccacatgcatttatgtgtcaa--taagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||    
T  145413 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgagtagtgattg 145336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 256 - 212
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  256 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5311 - 5267
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5311 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 5267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3844 - 3800
Alignment:
Q  80 ggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtc 124  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3844 ggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtc 3800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 71871 - 71923
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  71871 catcgaatgtgacgaccttgaggtgatttggtaccacaggcatttatgcgtca 71923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Original strand, 78425 - 78477
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  78425 catcgaaggtgacaaccttgaggtgattcagtaccacatgcatttatgtgtca 78477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 34045 - 33993
Alignment:
Q  73 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtca 125  Q
    |||||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34045 catcgaaggtgacgactttgaggtgattcggtaccacatgtatttatgtgtca 33993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University