View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16325_low_1 (Length: 220)

Name: NF16325_low_1
Description: NF16325
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16325_low_1
NF16325_low_1
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (2-212)||(25601911-25602124)
chr2 (2-144)||(28974003-28974149)
chr2 (2-135)||(32465822-32465958)
chr2 (9-143)||(27261761-27261899)
chr2 (1-143)||(271126-271271)
chr2 (1-143)||(22580005-22580151)
chr2 (1-122)||(4448279-4448402)
chr2 (2-141)||(22274681-22274822)
chr2 (2-143)||(23836852-23836996)
chr2 (4-133)||(36890834-36890966)
chr2 (2-141)||(22283914-22284055)
chr2 (1-143)||(24571438-24571583)
chr2 (1-139)||(25305405-25305546)
chr2 (2-132)||(6879404-6879537)
chr2 (132-206)||(67859-67933)
chr2 (32-134)||(19433512-19433614)
chr2 (2-133)||(25876066-25876200)
chr2 (1-133)||(67958-68093)
chr2 (33-138)||(722356-722461)
chr2 (32-129)||(19666498-19666595)
chr2 (32-122)||(3421-3510)
chr2 (1-122)||(31146326-31146450)
chr2 (2-133)||(9653051-9653186)
chr2 (1-133)||(23821751-23821886)
chr2 (1-133)||(23830830-23830965)
chr2 (132-190)||(7321586-7321644)
chr2 (32-107)||(24294703-24294778)
chr2 (100-141)||(12728352-12728393)
chr2 (100-141)||(24686036-24686077)
chr2 (100-141)||(34824435-34824476)
chr2 (2-107)||(21274204-21274312)
chr2 (112-141)||(42178236-42178265)
chr2 (145-213)||(14906587-14906655)
chr2 (145-213)||(20015059-20015127)
chr2 (145-213)||(23820119-23820187)
chr2 (1-96)||(43645896-43645994)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (2-212)||(34395144-34395357)
chr4 (2-143)||(16732124-16732269)
chr4 (2-143)||(23270081-23270225)
chr4 (2-143)||(44055871-44056015)
chr4 (2-141)||(25119362-25119505)
chr4 (2-133)||(14951728-14951862)
chr4 (45-141)||(5682728-5682824)
chr4 (2-143)||(21959610-21959755)
chr4 (2-108)||(55376744-55376853)
chr4 (2-143)||(53907846-53907987)
chr4 (2-94)||(820063-820154)
chr4 (2-133)||(53704880-53705014)
chr4 (1-108)||(13809656-13809766)
chr4 (1-143)||(18494474-18494620)
chr4 (1-96)||(45459001-45459099)
chr4 (1-133)||(15044794-15044929)
chr4 (1-133)||(15109495-15109630)
chr4 (1-108)||(27960963-27961072)
chr4 (2-143)||(30457859-30458003)
chr4 (132-195)||(34177767-34177830)
chr4 (2-108)||(44346818-44346927)
chr4 (1-144)||(14901187-14901333)
chr4 (32-139)||(41166126-41166233)
chr4 (4-121)||(12837349-12837468)
chr4 (32-122)||(19821956-19822046)
chr4 (4-107)||(30232645-30232751)
chr4 (141-200)||(19559422-19559481)
chr4 (49-143)||(47535243-47535337)
chr4 (17-122)||(37957187-37957295)
chr4 (1-133)||(52265654-52265789)
chr4 (32-134)||(7964891-7964993)
chr4 (2-77)||(8872618-8872699)
chr4 (2-146)||(15272467-15272615)
chr4 (100-141)||(18168930-18168971)
chr4 (132-162)||(9795314-9795344)
chr4 (1-134)||(18276399-18276535)
chr4 (50-119)||(15013480-15013549)
chr4 (145-213)||(10488610-10488678)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-212)||(29978-30191)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-212)||(253135-253349)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (2-212)||(41506964-41507177)
chr8 (64-212)||(24929018-24929165)
chr8 (2-143)||(41246614-41246758)
chr8 (1-143)||(20573338-20573483)
chr8 (93-195)||(2544855-2544957)
chr8 (2-143)||(20647976-20648121)
chr8 (2-143)||(20654052-20654197)
chr8 (2-141)||(24717017-24717159)
chr8 (1-107)||(21680994-21681103)
chr8 (2-133)||(20481571-20481705)
chr8 (32-143)||(20567338-20567449)
chr8 (32-143)||(20573531-20573642)
chr8 (1-144)||(23837153-23837299)
chr8 (1-143)||(39446912-39447057)
chr8 (2-144)||(19993201-19993346)
chr8 (41-143)||(20567188-20567290)
chr8 (1-108)||(38533640-38533750)
chr8 (2-143)||(37611624-37611768)
chr8 (2-103)||(22234950-22235054)
chr8 (44-122)||(29759919-29759997)
chr8 (2-133)||(274409-274543)
chr8 (2-133)||(641306-641440)
chr8 (2-133)||(827112-827246)
chr8 (132-212)||(23217924-23218004)
chr8 (2-133)||(16039036-16039170)
chr8 (1-139)||(21198298-21198439)
chr8 (5-122)||(22735988-22736108)
chr8 (1-134)||(5854579-5854715)
chr8 (132-206)||(22981244-22981318)
chr8 (32-129)||(23226256-23226353)
chr8 (20-122)||(25122513-25122618)
chr8 (2-125)||(39115249-39115375)
chr8 (32-143)||(31194504-31194615)
chr8 (47-143)||(17285223-17285319)
chr8 (132-212)||(22321574-22321654)
chr8 (34-129)||(23149751-23149846)
chr8 (1-134)||(26011459-26011595)
chr8 (145-213)||(5238135-5238203)
chr8 (145-213)||(24661395-24661463)
chr8 (1-134)||(33528391-33528526)
chr8 (100-141)||(15319414-15319455)
chr8 (100-141)||(15499783-15499824)
chr8 (100-141)||(22006513-22006554)
chr8 (100-141)||(22089049-22089090)
chr8 (2-34)||(20561778-20561810)
chr8 (153-201)||(21259637-21259685)
chr8 (32-108)||(23152013-23152089)
chr8 (145-213)||(43685594-43685662)
chr8 (110-141)||(13662530-13662561)
chr8 (1-134)||(15933263-15933399)
chr8 (112-141)||(3431548-3431577)
chr8 (112-141)||(13721195-13721224)
chr8 (57-122)||(15969796-15969860)
chr8 (132-213)||(22907516-22907597)
chr8 (32-129)||(33611233-33611330)
chr8 (50-106)||(38635846-38635902)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (32-212)||(24377-24557)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (2-212)||(2031697-2031910)
chr5 (2-143)||(21906675-21906817)
chr5 (2-122)||(1168351-1168474)
chr5 (110-212)||(17471854-17471956)
chr5 (2-143)||(11337333-11337476)
chr5 (1-122)||(19405514-19405638)
chr5 (1-122)||(23466434-23466558)
chr5 (2-133)||(20712042-20712176)
chr5 (2-135)||(21397053-21397192)
chr5 (15-143)||(24475539-24475667)
chr5 (2-122)||(11342661-11342785)
chr5 (1-134)||(11584016-11584152)
chr5 (1-133)||(23493885-23494020)
chr5 (132-212)||(25004863-25004943)
chr5 (4-122)||(28261498-28261619)
chr5 (2-143)||(21646886-21647030)
chr5 (1-95)||(24183278-24183372)
chr5 (2-143)||(4865218-4865363)
chr5 (1-122)||(7728397-7728521)
chr5 (1-133)||(3673828-3673963)
chr5 (1-133)||(21650661-21650796)
chr5 (2-133)||(21204891-21205026)
chr5 (1-125)||(19862183-19862310)
chr5 (57-143)||(16595463-16595550)
chr5 (1-134)||(21616981-21617117)
chr5 (1-133)||(5450989-5451124)
chr5 (145-213)||(20623017-20623085)
chr5 (145-213)||(21233675-21233743)
chr5 (100-141)||(1219775-1219816)
chr5 (100-141)||(22883339-22883380)
chr5 (32-129)||(29917935-29918032)
chr5 (5-131)||(432431-432560)
chr5 (48-122)||(32966343-32966417)
chr5 (52-129)||(6456594-6456671)
chr5 (112-141)||(9730650-9730679)
chr5 (1-133)||(21222754-21222889)
chr5 (112-141)||(23514521-23514550)
chr5 (32-96)||(23981696-23981760)
chr5 (145-213)||(25900552-25900620)
chr5 (145-213)||(37052792-37052860)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-212)||(4831-5042)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (32-212)||(3406-3586)
scaffold0160 (2-119)||(1-121)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (76-212)||(1286-1422)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (2-212)||(11855-12068)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (71-212)||(13838783-13838923)
chr3 (2-141)||(17956139-17956281)
chr3 (1-133)||(14295404-14295539)
chr3 (1-143)||(35123652-35123797)
chr3 (2-143)||(13817471-13817612)
chr3 (1-143)||(55440995-55441141)
chr3 (3-133)||(14298388-14298520)
chr3 (3-133)||(14304015-14304147)
chr3 (1-126)||(11329107-11329235)
chr3 (1-126)||(14528158-14528286)
chr3 (1-126)||(17139481-17139609)
chr3 (2-143)||(22144419-22144563)
chr3 (2-143)||(50112198-50112342)
chr3 (2-133)||(30152908-30153042)
chr3 (125-212)||(15468630-15468717)
chr3 (125-212)||(22275088-22275175)
chr3 (32-134)||(19946664-19946765)
chr3 (1-133)||(14301031-14301166)
chr3 (2-134)||(7853948-7854082)
chr3 (1-121)||(14059359-14059482)
chr3 (2-133)||(17523036-17523170)
chr3 (2-134)||(33341847-33341981)
chr3 (132-212)||(48421624-48421704)
chr3 (2-143)||(16996206-16996349)
chr3 (2-133)||(45581597-45581731)
chr3 (5-108)||(53898605-53898710)
chr3 (2-133)||(54423979-54424112)
chr3 (2-144)||(317655-317800)
chr3 (2-108)||(16182092-16182201)
chr3 (2-143)||(19570835-19570978)
chr3 (2-94)||(12349877-12349971)
chr3 (1-133)||(12488872-12489007)
chr3 (2-134)||(54685456-54685590)
chr3 (2-143)||(6146893-6147036)
chr3 (2-143)||(6154478-6154621)
chr3 (1-126)||(12560382-12560510)
chr3 (2-107)||(17100645-17100753)
chr3 (2-107)||(17101330-17101438)
chr3 (1-107)||(12349685-12349799)
chr3 (2-133)||(54038279-54038413)
chr3 (2-133)||(3992515-3992650)
chr3 (52-133)||(28558172-28558253)
chr3 (5-88)||(8631801-8631887)
chr3 (1-108)||(16880114-16880224)
chr3 (2-143)||(17191500-17191641)
chr3 (132-212)||(18969968-18970048)
chr3 (2-133)||(23492339-23492473)
chr3 (2-133)||(38167880-38168014)
chr3 (1-108)||(3578082-3578189)
chr3 (32-143)||(17204656-17204767)
chr3 (132-212)||(39656390-39656467)
chr3 (132-201)||(14177158-14177227)
chr3 (1-144)||(15876023-15876169)
chr3 (16-91)||(17938582-17938660)
chr3 (32-122)||(38811188-38811278)
chr3 (2-94)||(2844196-2844291)
chr3 (2-100)||(19260986-19261087)
chr3 (32-122)||(47784927-47785017)
chr3 (2-146)||(53770993-53771141)
chr3 (2-94)||(16261458-16261553)
chr3 (32-119)||(3576618-3576705)
chr3 (32-129)||(12952934-12953031)
chr3 (38-122)||(17960499-17960583)
chr3 (1-95)||(11061152-11061249)
chr3 (50-134)||(1990767-1990852)
chr3 (32-129)||(9590934-9591031)
chr3 (32-141)||(16934162-16934270)
chr3 (100-141)||(49232396-49232437)
chr3 (1-128)||(39656497-39656627)
chr3 (1-134)||(34559864-34560000)
chr3 (32-129)||(6228805-6228902)
chr3 (19-119)||(14080489-14080592)
chr3 (145-213)||(2449385-2449453)
chr3 (88-132)||(11196444-11196488)
chr3 (113-141)||(16821099-16821127)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (47-212)||(171794-171958)
scaffold0001 (47-212)||(177497-177661)
scaffold0001 (2-143)||(70769-70913)
scaffold0001 (1-122)||(60784-60907)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (47-212)||(271914-272078)
scaffold0009 (1-146)||(69409-69558)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (2-143)||(109609-109754)
scaffold0035 (2-143)||(118110-118255)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (2-143)||(11287372-11287517)
chr7 (1-143)||(15822577-15822722)
chr7 (1-134)||(7284206-7284341)
chr7 (2-133)||(26070411-26070545)
chr7 (2-133)||(26094198-26094332)
chr7 (1-143)||(49047820-49047966)
chr7 (2-122)||(126392-126515)
chr7 (2-122)||(45452313-45452435)
chr7 (1-143)||(13274742-13274888)
chr7 (1-108)||(16570152-16570262)
chr7 (1-108)||(16595400-16595510)
chr7 (1-126)||(12248267-12248395)
chr7 (2-143)||(39046770-39046914)
chr7 (32-143)||(17224118-17224229)
chr7 (44-141)||(1937200-1937297)
chr7 (2-143)||(35094773-35094916)
chr7 (2-133)||(111424-111557)
chr7 (2-143)||(12758944-12759087)
chr7 (1-133)||(13377495-13377630)
chr7 (2-143)||(143601-143739)
chr7 (2-133)||(3894991-3895125)
chr7 (2-133)||(32494201-32494335)
chr7 (2-144)||(47289736-47289881)
chr7 (2-107)||(3049575-3049683)
chr7 (1-133)||(12369986-12370121)
chr7 (132-200)||(13352011-13352079)
chr7 (2-126)||(2028893-2029021)
chr7 (2-142)||(44865184-44865330)
chr7 (1-134)||(16915074-16915210)
chr7 (1-134)||(48356609-48356745)
chr7 (2-94)||(2190341-2190436)
chr7 (138-206)||(15977975-15978043)
chr7 (2-146)||(42056444-42056592)
chr7 (145-213)||(15441711-15441779)
chr7 (145-213)||(30262276-30262344)
chr7 (32-134)||(14272066-14272168)
chr7 (132-213)||(7292896-7292977)
chr7 (1-130)||(13320984-13321116)
chr7 (32-107)||(31501165-31501240)
chr7 (112-141)||(371048-371077)
chr7 (112-141)||(14251165-14251194)
chr7 (100-141)||(15951046-15951087)
chr7 (153-206)||(18151494-18151547)
chr7 (145-213)||(11516275-11516343)
chr7 (29-129)||(14935333-14935433)
chr7 (29-129)||(15362926-15363026)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (2-143)||(132397-132541)
scaffold0021 (3-126)||(11660-11786)
scaffold0021 (132-201)||(22186-22255)
scaffold0021 (2-101)||(88273-88375)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (2-134)||(3265-3399)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (2-134)||(31176-31311)
scaffold0120 (2-134)||(21477-21612)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (2-141)||(35015312-35015454)
chr6 (1-122)||(31628245-31628369)
chr6 (2-143)||(32898746-32898890)
chr6 (44-141)||(19983491-19983588)
chr6 (1-143)||(18381829-18381974)
chr6 (1-108)||(18432634-18432744)
chr6 (48-134)||(18583299-18583384)
chr6 (32-134)||(18823576-18823677)
chr6 (32-134)||(18839431-18839532)
chr6 (1-94)||(16086022-16086118)
chr6 (2-143)||(25744360-25744504)
chr6 (2-133)||(18777112-18777246)
chr6 (6-143)||(22440890-22441030)
chr6 (1-129)||(18398909-18399039)
chr6 (1-108)||(25367383-25367493)
chr6 (1-126)||(28195239-28195367)
chr6 (138-212)||(15889840-15889914)
chr6 (2-133)||(18570246-18570379)
chr6 (2-143)||(13014856-13015000)
chr6 (2-146)||(15742375-15742525)
chr6 (1-94)||(16106526-16106617)
chr6 (132-206)||(25640683-25640757)
chr6 (2-133)||(18002651-18002784)
chr6 (2-125)||(26089710-26089835)
chr6 (2-146)||(23994875-23995023)
chr6 (32-122)||(25919590-25919680)
chr6 (132-197)||(15005034-15005099)
chr6 (139-212)||(22585681-22585754)
chr6 (139-212)||(22590512-22590585)
chr6 (1-143)||(21623124-21623269)
chr6 (1-134)||(22361911-22362047)
chr6 (1-133)||(25651203-25651338)
chr6 (19-119)||(33324673-33324776)
chr6 (1-129)||(33538515-33538646)
chr6 (19-119)||(35136176-35136279)
chr6 (59-121)||(15740207-15740269)
chr6 (47-133)||(17083373-17083459)
chr6 (2-39)||(18583380-18583417)
chr6 (100-138)||(16556394-16556432)
chr6 (100-138)||(16632950-16632988)
chr6 (19-119)||(16887956-16888059)
chr6 (100-141)||(22225993-22226034)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (96-206)||(13537-13647)
scaffold0032 (2-133)||(55546-55681)
scaffold0032 (47-122)||(93967-94042)
scaffold0032 (32-119)||(104802-104889)
scaffold0032 (132-206)||(116284-116358)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (2-143)||(254961-255105)
scaffold0011 (2-143)||(261567-261711)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (2-133)||(723-857)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (2-133)||(665-799)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (2-143)||(85287-85432)
scaffold0014 (1-143)||(159257-159400)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (1-134)||(110-245)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (2-143)||(5393-5537)
scaffold0480 (4-126)||(9031-9156)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (2-141)||(166419-166554)
scaffold0016 (2-141)||(162333-162476)
scaffold0016 (32-143)||(116693-116804)
scaffold0016 (2-143)||(164171-164315)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (2-133)||(1347-1481)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (2-141)||(6238-6380)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (1-108)||(1308-1418)
scaffold0359 (2-143)||(11801-11942)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (2-141)||(31435-31577)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (2-141)||(41267-41409)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (1-143)||(35522465-35522610)
chr1 (1-143)||(51627810-51627956)
chr1 (2-133)||(15861581-15861713)
chr1 (2-133)||(22366985-22367119)
chr1 (6-143)||(21718184-21718324)
chr1 (2-141)||(44035126-44035267)
chr1 (2-144)||(49967606-49967750)
chr1 (1-95)||(9784246-9784343)
chr1 (32-143)||(13377020-13377131)
chr1 (32-143)||(20177131-20177242)
chr1 (2-133)||(41212035-41212172)
chr1 (2-133)||(21859977-21860111)
chr1 (2-143)||(22403257-22403401)
chr1 (2-133)||(35054722-35054856)
chr1 (4-99)||(27329904-27330002)
chr1 (32-144)||(41229119-41229231)
chr1 (57-122)||(22829629-22829694)
chr1 (17-143)||(36356455-36356581)
chr1 (19-126)||(22143525-22143635)
chr1 (33-122)||(27674774-27674862)
chr1 (1-39)||(9784207-9784245)
chr1 (17-122)||(19603074-19603182)
chr1 (100-141)||(18060013-18060054)
chr1 (50-127)||(21194986-21195063)
chr1 (145-213)||(51452540-51452608)
chr1 (1-95)||(37234006-37234103)
chr1 (1-39)||(16645975-16646013)
chr1 (112-141)||(21650307-21650336)
chr1 (32-128)||(17608899-17608995)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (6-143)||(8942-9083)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (2-140)||(22650-22791)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (6-135)||(973-1105)
scaffold0673 (2-140)||(6992-7136)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-122)||(9914-10038)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (1-134)||(260-395)
scaffold0310 (1-38)||(6554-6591)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-134)||(24925-25059)
scaffold0158 (1-93)||(25218-25312)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (2-143)||(38254-38398)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (2-141)||(606-747)
scaffold0342 (1-133)||(5906-6041)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (2-143)||(32159-32303)
scaffold0091 (2-143)||(42000-42144)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (2-143)||(14833-14974)
scaffold0083 (26-143)||(14173-14290)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (1-143)||(1871-2017)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (1-143)||(33874-34019)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-108)||(3310-3420)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-143)||(30999-31145)
scaffold0031 (1-41)||(70674-70714)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-143)||(109545-109691)
scaffold0022 (2-122)||(112692-112812)
scaffold0022 (1-122)||(103068-103192)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-143)||(76993-77138)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-122)||(11714-11837)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (140-212)||(1017-1089)
scaffold0483 (1-143)||(6617-6762)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (140-212)||(45804-45876)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (2-133)||(12675-12809)
scaffold0039 (2-133)||(19056-19190)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (132-206)||(159-233)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (132-206)||(1629-1703)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (2-133)||(10121-10255)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (4-87)||(7581-7667)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-143)||(35435-35579)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (32-126)||(7807-7901)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (2-133)||(15618-15755)
scaffold0077 (29-129)||(6514-6614)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (48-144)||(4262-4358)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (2-133)||(9662-9796)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (2-133)||(94941-95075)
scaffold0037 (2-133)||(24875-25009)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (2-126)||(17559-17686)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (2-133)||(146567-146701)
scaffold0025 (32-129)||(85503-85600)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (1-143)||(265-410)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (2-124)||(6698-6823)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (32-134)||(28501-28603)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (2-107)||(79856-79964)
scaffold0034 (4-133)||(46131-46263)
scaffold0034 (5-95)||(40662-40755)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (2-133)||(1133-1268)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (2-133)||(13541-13676)
scaffold0251 (2-133)||(21515-21650)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (2-133)||(14914-15049)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (5-146)||(7175-7319)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (2-122)||(48124-48247)
scaffold0068 (2-122)||(61572-61695)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (5-133)||(193645-193777)
scaffold0004 (5-107)||(186683-186789)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-133)||(2462-2597)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (2-124)||(183-308)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (2-95)||(33666-33762)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (32-134)||(43978-44080)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (32-133)||(2421-2522)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (132-212)||(3969-4049)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (1-127)||(2497-2626)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (55-133)||(22715-22793)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (139-201)||(44249-44311)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (132-206)||(5936-6010)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (19-119)||(10642-10745)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (32-108)||(8001-8077)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (4-133)||(4529-4661)
scaffold0447 (4-133)||(9143-9275)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (32-133)||(7137-7238)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (19-115)||(70470-70569)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (32-119)||(5162-5249)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (110-141)||(29122-29153)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (32-119)||(79519-79606)
scaffold0028 (4-39)||(89618-89653)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-119)||(197399-197520)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (32-126)||(11067-11161)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (111-141)||(39606-39636)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-134)||(30985-31121)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (34-95)||(5961-6022)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (34-95)||(22600-22661)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (47-108)||(3318-3379)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (100-141)||(39063-39104)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (100-141)||(154262-154303)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (145-213)||(22588-22656)
scaffold0141 (145-213)||(26843-26911)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (145-213)||(1729-1797)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25602124 - 25601911
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25602124 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatcatggcttaggtttgcatgattcatgatttgttg 25602025  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25602024 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 25601925  T
Q  199 gttaattgatgatg 212  Q
    |||||||| |||||    
T  25601924 gttaattgttgatg 25601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28974149 - 28974003
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28974149 tgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 28974050  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatta 144  Q
     |||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  28974049 atgagaaatgagatgttgttggtgttttagtgaaaattggtgaatta 28974003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32465958 - 32465822
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32465958 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttg 32465859  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaatt 135  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||    
T  32465858 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatt 32465822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27261899 - 27261761
Alignment:
Q  9 tgataagtttcatgatcaattgat---gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27261899 tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaagaa 27261800  T
Q  106 atggattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaatt 143  Q
    |||   ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  27261799 atgagatgttgttggtgttttggtgaaacttggtgaatt 27261761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 271271 - 271126
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  271271 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagcttgggtttgcatgattcatgatttg-t 271173  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    |||||| ||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  271172 gttgaggaatgagatgttgttggtgctttggtgaaaattggtgaatt 271126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 22580005 - 22580151
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22580005 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 22580104  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    || ||||||||   ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  22580105 gtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaaattggtgaatt 22580151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 4448279 - 4448402
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4448279 ttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-t 4448377  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||| |||||   |||||||||||    
T  4448378 gttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22274822 - 22274681
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22274822 tgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatagatggcttgggtt-gcatgattcatgaattgttg 22274724  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274723 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22274681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 23836852 - 23836996
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23836852 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcttgatttgttg 23836951  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  23836952 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 23836996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Original strand, 36890834 - 36890966
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36890834 aattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcttgatttgttgtt 36890933  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  36890934 gagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 36890966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22284055 - 22283914
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||| | |   ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  22284055 tgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgatgatacatggcttgggtt-gcatgattcatgaattgctg 22283957  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22283956 ttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22283914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 24571438 - 24571583
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  24571438 ttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataactcatg-cttggctatgtatgattcatgatttgtt 24571536  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24571537 gttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaaattggtgaatt 24571583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25305546 - 25305405
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||   ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  25305546 ttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgtggctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgtt 25305447  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtg 139  Q
    | |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25305446 gatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcgaaattggtg 25305405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6879537 - 6879404
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||| || |||||||    
T  6879537 tgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataatacatgtcttgggtttaaataattcttggtttgttg 6879438  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaa 132  Q
    ||||||| ||   ||||||||||| ||| |||||    
T  6879437 ttgagaattgagatgttgttggtgttttggtgaa 6879404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 67933 - 67859
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  67933 aattggtgatttatgacatgttgttgttgtaatatgatggaatgtatgattataatttgtcgttgtggttaattg 67859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 19433512 - 19433614
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  19433512 tgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaa 19433611  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  19433612 aat 19433614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 25876066 - 25876200
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||  | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||     
T  25876066 tgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggcttgtta 25876165  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  25876166 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 25876200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 68093 - 67958
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| || | |||||||||||| || | ||| |||||||||||| |    
T  68093 ttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggcttgcgtgttcataattcatgatttgat 67994  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  67993 gatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaa 67958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 722461 - 722356
Alignment:
Q  33 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaa 132  Q
    |||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||  ||||| ||    
T  722461 gttgctgctaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaa 722362  T
Q  133 attggt 138  Q
    ||||||    
T  722361 attggt 722356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19666595 - 19666498
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19666595 tgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgttttgatgatgagaaatggattgttgttgttggttttgt 19666498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 122
Target Start/End: Original strand, 3421 - 3510
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  3421 tgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatga-ttgtagatgagaaatgagttgttgttggtg 3510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 31146326 - 31146450
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  31146326 ttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgttactgttgctaagtgatgttgttgatgataaatcatggcctaggtgtgcataattcatgaattgtt 31146425  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    | ||| |||||  || |||||||||    
T  31146426 ggtgataaatgagttattgttggtg 31146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 9653051 - 9653186
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||   ||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  9653051 tgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 9653150  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  9653151 gttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 9653186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 23821751 - 23821886
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||   ||||||| || || |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |    
T  23821751 ttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgat 23821850  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | || |||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  23821851 gatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtgaaa 23821886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 23830830 - 23830965
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||   ||||||| || || |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |    
T  23830830 ttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgat 23830929  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | || |||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  23830930 gatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtgaaa 23830965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7321644 - 7321586
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttg 190  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  7321644 aattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattttgatggaatgcatgattataagttg 7321586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 24294703 - 24294778
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 107  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  24294703 tgttgttgctaagtgatgatgttgatgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgtggatgagaaat 24294778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12728393 - 12728352
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728393 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 12728352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 24686036 - 24686077
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24686036 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 24686077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34824476 - 34824435
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824476 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 34824435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Original strand, 21274204 - 21274312
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  21274204 tgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttggg-tagcatgattcataattttgtt 21274302  T
Q  98 gttgagaaat 107  Q
    |||| |||||    
T  21274303 gttgtgaaat 21274312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 42178236 - 42178265
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178236 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 42178265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 14906587 - 14906655
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  14906587 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 14906655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20015127 - 20015059
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  20015127 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 20015059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23820187 - 23820119
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  23820187 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 23820119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 43645994 - 43645896
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 96  Q
    ||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||   ||||||| || |||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  43645994 ttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgt 43645896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34395357 - 34395144
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34395357 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatgatttgttg 34395258  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34395257 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgcttgatcataagttgtgattgtg 34395158  T
Q  199 gttaattgatgatg 212  Q
    |||||||| |||||    
T  34395157 gttaattgttgatg 34395144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16732269 - 16732124
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt---tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732269 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 16732170  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  16732169 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaacttggtgaatt 16732124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 23270081 - 23270225
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23270081 tgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtgg 23270180  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  23270181 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttcgtgaaaatggtgaatt 23270225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44056015 - 44055871
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgt---catgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44056015 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttg 44055916  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  44055915 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 44055871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 25119362 - 25119505
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt-gtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25119362 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatgatacatggcttgggtttgcatgattcataattttgtt 25119461  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119462 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 25119505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14951862 - 14951728
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||   ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951862 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 14951763  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14951762 ttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaa 14951728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Original strand, 5682728 - 5682824
Alignment:
Q  45 tcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682728 tcatattgttgatgatgatatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 5682824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 21959610 - 21959755
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  21959610 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggcttgcatgattcatagtttgtgg 21959709  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaatt 143  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  21959710 ttgagaaattaaatgttgttggtgtttgagtgaaacttggtgaatt 21959755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 55376744 - 55376853
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatg---tcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55376744 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 55376843  T
Q  99 ttgagaaatg 108  Q
    ||||||||||    
T  55376844 ttgagaaatg 55376853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 53907846 - 53907987
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  53907846 tgaattgtgaaatgtttcatgatcaattgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttg 53907945  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||   ||||||||||| |||  ||||| || ||||||    
T  53907946 agaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgatgaatt 53907987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 820063 - 820154
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  820063 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattt 820154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 53704880 - 53705014
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  53704880 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttg 53704979  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  53704980 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 53705014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 13809656 - 13809766
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  13809656 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggatatgcatgattcatgattggtt 13809755  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||    
T  13809756 gttgagaaatg 13809766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 18494474 - 18494620
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg---ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||   |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18494474 ttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatgacttgtt 18494573  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18494574 gttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 18494620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 45459001 - 45459099
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45459001 ttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 45459099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15044929 - 15044794
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  15044929 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 15044830  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||  |||||||||| || ||| ||||||    
T  15044829 gatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15109495 - 15109630
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  15109495 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 15109594  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||  |||||||||| || ||| ||||||    
T  15109595 gatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15109630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27961072 - 27960963
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |   || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  27961072 ttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atgatttatt 27960974  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||    
T  27960973 gttgagaaatg 27960963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30458003 - 30457859
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  30458003 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcattattttgtt 30457905  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
     | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  30457904 atagagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 30457859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 34177767 - 34177830
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggtt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34177767 aattggtgaattatgacttgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggtt 34177830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 44346927 - 44346818
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  44346927 tgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttg 44346828  T
Q  99 ttgagaaatg 108  Q
    ||||||||||    
T  44346827 ttgagaaatg 44346818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14901333 - 14901187
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||   ||||||| || ||| ||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  14901333 ttgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgttgttgctaagtgatgctgttgttgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgat 14901234  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14901233 gatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaattggtaaatta 14901187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Original strand, 41166126 - 41166233
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| | | ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41166126 tgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgttgtgggtggttttgtga 41166225  T
Q  132 aattggtg 139  Q
    ||||||||    
T  41166226 aattggtg 41166233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Original strand, 12837349 - 12837468
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12837349 aattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-t 12837447  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggt 121  Q
    |||||||   |||||||||||    
T  12837448 gagaaataagttgttgttggt 12837468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 122
Target Start/End: Original strand, 19821956 - 19822046
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||    
T  19821956 tgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtg 19822046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Original strand, 30232645 - 30232751
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  30232645 aattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcattattcataatttgttgtt 30232744  T
Q  101 gagaaat 107  Q
    | |||||    
T  30232745 gtgaaat 30232751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19559481 - 19559422
Alignment:
Q  141 attatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19559481 attatgacatgttgttgttgaattgtgatggaatgcatgattataagttgtggttgtggt 19559422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 143
Target Start/End: Original strand, 47535243 - 47535337
Alignment:
Q  49 gttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47535243 gttgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaattggtgaatt 47535337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 37957187 - 37957295
Alignment:
Q  17 ttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 113  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | || ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||    
T  37957187 ttcatgttcaattgatgtggttgctgctaagtgatgttgttattgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttg 37957286  T
Q  114 ttgttggtg 122  Q
    |||||||||    
T  37957287 ttgttggtg 37957295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 52265654 - 52265789
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattga---tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||| || || ||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |    
T  52265654 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgat 52265753  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | || |||||   ||| ||||| |||||| ||||||    
T  52265754 gatgtgaaataagttgatgttgttggtttggtgaaa 52265789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 7964891 - 7964993
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  7964891 tgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaa 7964990  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  7964991 aat 7964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 8872618 - 8872699
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat------gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 77  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8872618 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataactcatggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 15272467 - 15272615
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |   || ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  15272467 tgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 15272566  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    |||| |||||   ||||||||| | |||| |||||| |||  |||||||    
T  15272567 gttgtgaaataagttgttgttgttagtttggtgaaaatggataattatg 15272615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18168971 - 18168930
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18168971 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 18168930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9795344 - 9795314
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795344 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaa 9795314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18276535 - 18276399
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |   | || || |||||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||      
T  18276535 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatgatttgac 18276436  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  18276435 gatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaat 18276399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Original strand, 15013480 - 15013549
Alignment:
Q  50 ttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 119  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  15013480 ttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttg 15013549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10488678 - 10488610
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  10488678 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 10488610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30191 - 29978
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30191 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 30092  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30091 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgttgttgtg 29992  T
Q  199 gttaattgatgatg 212  Q
    |||||||| |||||    
T  29991 gttaattgttgatg 29978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 253135 - 253349
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  253135 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataattcaaggcttgggtttgcatgattcatgatttctt 253234  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgt 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  253235 gatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtgggttt 253334  T
Q  198 ggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  253335 ggttaattgttgatg 253349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 41506964 - 41507177
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506964 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 41507063  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41507064 ttgagaaatggattgttgttggtggtttagtggaattggtgagttatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 41507163  T
Q  199 gttaattgatgatg 212  Q
    |||||||| |||||    
T  41507164 gttaattgttgatg 41507177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 212
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929165
Alignment:
Q  64 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaa 163  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaa 24929116  T
Q  164 tatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24929117 tatgatggaatgcatgatcataagttctggttgtggttaattgttgatg 24929165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41246758 - 41246614
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41246758 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttg 41246659  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  41246658 ttgagaaatgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 41246614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 20573338 - 20573483
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573338 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-t 20573436  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  20573437 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtgaatt 20573483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2544957 - 2544855
Alignment:
Q  93 ttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtg 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2544957 ttgttgttgagaaatggactgttgttagtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaatatgatggtatgcataatcataagttgtg 2544858  T
Q  193 gtt 195  Q
    |||    
T  2544857 gtt 2544855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 20647976 - 20648121
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt---tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20647976 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 20648075  T
Q  99 ttgagaaatg-gattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaatt 143  Q
    | ||||| || |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  20648076 tggagaagtgagatt-ttgttggtgttttggtgaaacttggtgaatt 20648121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 20654052 - 20654197
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt---tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20654052 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattcattgcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 20654151  T
Q  99 ttgagaaatg-gattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaatt 143  Q
    | ||||| || |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  20654152 tggagaagtgagatt-ttgttggtgttttggtgaaacttggtgaatt 20654197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 24717017 - 24717159
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24717017 tgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcataatttgttg 24717116  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24717117 ttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaattggtgaa 24717159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21681103 - 21680994
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21681103 ttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 21681004  T
Q  98 gttgagaaat 107  Q
    || |||||||    
T  21681003 gtggagaaat 21680994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20481705 - 20481571
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20481705 tgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 20481606  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  20481605 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 20481571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 20567338 - 20567449
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg- 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||     
T  20567338 tgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtga 20567436  T
Q  131 aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||||    
T  20567437 aaattggtgaatt 20567449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 20573531 - 20573642
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg- 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||     
T  20573531 tgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtga 20573629  T
Q  131 aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||||    
T  20573630 aaattggtgaatt 20573642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23837299 - 23837153
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||   ||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  23837299 ttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgtt 23837200  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
    | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23837199 gatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatta 23837153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 39446912 - 39447057
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39446912 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttgtt 39447010  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  39447011 gttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaaattggtgaatt 39447057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 19993201 - 19993346
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||    
T  19993201 tgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggctagggtttgcataattcttggattgttg 19993300  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  19993301 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatta 19993346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 20567188 - 20567290
Alignment:
Q  41 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  20567188 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtg 20567286  T
Q  140 aatt 143  Q
    ||||    
T  20567287 aatt 20567290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38533750 - 38533640
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38533750 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgtt 38533651  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    | |||||||||    
T  38533650 gatgagaaatg 38533640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37611768 - 37611624
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  37611768 tgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgtt 37611670  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
     | |||||||| | ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  37611669 atggagaaatgaaatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 37611624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 103
Target Start/End: Original strand, 22234950 - 22235054
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||    
T  22234950 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggattgggtttgcataattcttggtttgttg 22235049  T
Q  99 ttgag 103  Q
    |||||    
T  22235050 ttgag 22235054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29759997 - 29759919
Alignment:
Q  44 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29759997 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtg 29759919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 274543 - 274409
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  274543 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttg 274444  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  274443 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 274409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 641306 - 641440
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  641306 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttg 641405  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  641406 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 641440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 827112 - 827246
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  827112 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttg 827211  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  827212 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 827246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23218004 - 23217924
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23218004 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaaatgtgatggaatgcatgattataagttgtagttgtggttgattgttgatg 23217924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 16039036 - 16039170
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  16039036 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatttatggcttggatatgcatgattcataatttgttg 16039135  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  16039136 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 16039170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 21198298 - 21198439
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||   ||||||| || |||||| || | || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||     
T  21198298 ttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgctgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtg 21198397  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtg 139  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  21198398 gatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaattggtg 21198439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 22735988 - 22736108
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||    
T  22735988 attgtgataagattcatgttcaattgatgttgttcttgctaactgatgttgttgttgttaattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatg 22736087  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtg 122  Q
    | |||||  ||||||||||||    
T  22736088 aaaaatgagttgttgttggtg 22736108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5854715 - 5854579
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  5854715 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 5854616  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  5854615 gatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaat 5854579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22981318 - 22981244
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  22981318 aattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattttgatggaatgcatgattataagttgttgttgtggttgattg 22981244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 23226256 - 23226353
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    |||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23226256 tgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgttgttgttggttttgt 23226353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  20 atgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    ||||||||| |||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||   ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  116 gttggtg 122  Q
    |||||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39115375 - 39115249
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||    
T  39115375 tgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatgacttgtgtatgcatgattcataatttattg 39115276  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggtt 125  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  39115275 ttgagaaataaattgttattgttggtt 39115249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 31194504 - 31194615
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    |||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||  ||||| |    
T  31194504 tgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaa 31194603  T
Q  132 aattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||||    
T  31194604 aattggtgaatt 31194615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17285319 - 17285223
Alignment:
Q  47 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  17285319 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaattggtgaatt 17285223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 22321574 - 22321654
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  22321574 aattggtgaattataacatgttattgttaaattgtgatggaatgcatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatg 22321654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23149846 - 23149751
Alignment:
Q  34 ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||| || ||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  23149846 ttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgt 23149751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26011595 - 26011459
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  26011595 ttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 26011496  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| |   ||||||||| ||||||||| ||||    
T  26011495 gatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaat 26011459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5238203 - 5238135
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  5238203 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 5238135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 24661395 - 24661463
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  24661395 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 24661463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33528526 - 33528391
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||   ||| |  || || ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  33528526 ttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt-ttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 33528428  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  33528427 gatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaat 33528391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 15319414 - 15319455
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319414 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 15319455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 15499783 - 15499824
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499783 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 15499824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 22006513 - 22006554
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006513 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22006554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 22089049 - 22089090
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089049 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22089090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 34
Target Start/End: Original strand, 20561778 - 20561810
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 34  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561778 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 21259637 - 21259685
Alignment:
Q  153 tgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggtt 201  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21259637 tgttgttgaattttgatggaatgcatgattataagttgttgttgtggtt 21259685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Original strand, 23152013 - 23152089
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  23152013 tgttgttgctatgtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgataaatg 23152089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43685662 - 43685594
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||| ||||||    
T  43685662 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgt 43685594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 141
Target Start/End: Original strand, 13662530 - 13662561
Alignment:
Q  110 attgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662530 attgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15933399 - 15933263
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| |   | | ||||||||||      
T  15933399 ttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatgatttgaa 15933300  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15933299 gatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaat 15933263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 3431548 - 3431577
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431548 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 3431577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 13721195 - 13721224
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721195 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13721224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15969860 - 15969796
Alignment:
Q  57 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |  ||||||||  ||||||||||||    
T  15969860 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatga-ttgtagaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 22907516 - 22907597
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||| ||||||    
T  22907516 aattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgt 22907597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 33611233 - 33611330
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||||| || ||||| ||   ||||||||| |||||||||    
T  33611233 tgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgtgtgttcataaatcatgatttgatgatgagatataagttgttgttgttggttttgt 33611330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 38635846 - 38635902
Alignment:
Q  50 ttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaa 106  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  38635846 ttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcataatttgttgatgagaaa 38635902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Original strand, 24377 - 24557
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  24377 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttaaaga 24476  T
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24477 aattggtgaattaagacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 24557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2031910 - 2031697
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031910 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 2031811  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031810 ttgagaaatggattgttgttggtggtttaatggaattggtgagttatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtg 2031711  T
Q  199 gttaattgatgatg 212  Q
    |||||||| |||||    
T  2031710 gttaattgttgatg 2031697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21906817 - 21906675
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21906817 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggctg 21906718  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaatt 143  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  21906717 agaaatgaaatgttgttggtgtttgggtgaaacttggtgaatt 21906675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 1168351 - 1168474
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168351 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 1168450  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  1168451 ttgagaaatgagatgttgttggtg 1168474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 212
Target Start/End: Original strand, 17471854 - 17471956
Alignment:
Q  110 attgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatg 209  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17471854 attgttgttggtgttttggtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttg 17471953  T
Q  210 atg 212  Q
    |||    
T  17471954 atg 17471956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 11337333 - 11337476
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  11337333 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatggcttgagtttacatgattcatga-ttgttg 11337431  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11337432 ttgagaaatgagatgttgttggt-gttttgtgaaaattggtgaatt 11337476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19405638 - 19405514
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19405638 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 19405539  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    || ||||||||   |||||||||||    
T  19405538 gtggagaaatgagatgttgttggtg 19405514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23466558 - 23466434
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23466558 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||| ||||   |||||||||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20712176 - 20712042
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20712176 tgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 20712077  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  20712076 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 20712042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21397192 - 21397053
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt------gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21397192 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttg 21397093  T
Q  96 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaatt 135  Q
    || ||||||||||   |||| |||||| ||| ||||||||    
T  21397092 ttattgagaaatgagatgttcttggtgttttggtgaaatt 21397053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24475667 - 24475539
Alignment:
Q  15 gtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgt 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   |||    
T  24475667 gtttcatgatcaattgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgt 24475568  T
Q  115 tgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  24475567 tgttggtgttttggtgaaaatgatgaatt 24475539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11342785 - 11342661
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat----gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |      ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342785 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 11342686  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11342685 gttgagaaatggattgttgttggtg 11342661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11584152 - 11584016
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-tttgcatgattcatgatttgt 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11584152 ttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggttttgcatgattcatga-ttgt 11584054  T
Q  97 tgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  11584053 tgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaat 11584016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23494020 - 23493885
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |    
T  23494020 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgat 23493921  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  23493920 gatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 23493885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25004943 - 25004863
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25004943 aattggtgatttatgacatgttgttgttggaatatgatgaaatgcatgattataagttgtggttgtggttaattgttgatg 25004863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28261619 - 28261498
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  28261619 aattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgtt 28261520  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||||   |||||||||||    
T  28261519 gagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 21646886 - 21647030
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||    
T  21646886 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatgttgatgataattcatggcttgggtttgtataattattggtttgttg 21646985  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  21646986 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgatgaatt 21647030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 24183278 - 24183372
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg---ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183278 ttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtcatgtt---gatgataattaatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 24183372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4865363 - 4865218
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataatt-catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  4865363 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatttcatggcttgggtttgcataattcttgaattgtt 4865264  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||| |||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  4865263 gttgagagatgaggtgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 4865218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7728521 - 7728397
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  7728521 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgcttgggtgtgcataattcatgaattgtt 7728422  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    | ||||| |||   |||||||||||    
T  7728421 ggtgagagatgaggtgttgttggtg 7728397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3673963 - 3673828
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  | || ||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||| |||||| |    
T  3673963 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcacgatttgat 3673864  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  3673863 gatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 3673828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21650796 - 21650661
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| |  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  21650796 ttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgtt 21650697  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    || | |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  21650696 gtggtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 21650661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21205026 - 21204891
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  21205026 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 21204927  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  21204926 gttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 21204891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19862310 - 19862183
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||   ||| || || || ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |    
T  19862310 ttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgat 19862211  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggtt 125  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||    
T  19862210 gatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16595550 - 16595463
Alignment:
Q  57 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  16595550 tgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaaattggtgaatt 16595463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21617117 - 21616981
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |    
T  21617117 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgat 21617018  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| ||   |||||| | ||||||||| ||||    
T  21617017 gatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaat 21616981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 5450989 - 5451124
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||   ||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |   ||| | |||||||||| |    
T  5450989 ttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcttggcttggatgatcataaatcatgatttgat 5451088  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  5451089 gatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 5451124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20623085 - 20623017
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  20623085 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 20623017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 21233675 - 21233743
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  21233675 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 21233743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 1219775 - 1219816
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219775 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 1219816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 22883339 - 22883380
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883339 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22883380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29918032 - 29917935
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||| | |||||||||    
T  29918032 tgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttgt 29917935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 432560 - 432431
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| |||| |||||||||| | ||| ||| |||||||| |  ||    
T  432560 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcctggcttgggtattcataatttatgatttgatcatg 432461  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||   ||||||||  |||||||||||    
T  432460 agaaataagttgttgttattggttttgtga 432431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Original strand, 32966343 - 32966417
Alignment:
Q  48 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||    
T  32966343 tgttgttattgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtg 32966417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6456671 - 6456594
Alignment:
Q  52 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||   ||||||||| || ||||||    
T  6456671 gttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttgt 6456594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 9730650 - 9730679
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730650 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 9730679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 21222754 - 21222889
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||   || ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||| || | ||| | |||||| ||| |    
T  21222754 ttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggattgagtgttcataaatcatgacttgat 21222853  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | |||||| |   ||||||||  |||||||||||||    
T  21222854 gatgagaattcagttgttgttattggttttgtgaaa 21222889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23514550 - 23514521
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514550 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 23514521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 23981696 - 23981760
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 96  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||    
T  23981696 tgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataactcatgatttgt 23981760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 25900552 - 25900620
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  25900552 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 25900620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37052860 - 37052792
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  37052860 tgacatgttgttgttgagttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 37052792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5042 - 4831
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |    
T  5042 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggttgttcataattcatgatttgct 4943  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgt 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4942 gatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgtt---gttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggttgt 4846  T
Q  198 ggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||| |||||    
T  4845 ggttaattgttgatg 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3586 - 3406
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  3586 tgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggtttagtgg 3487  T
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3486 aattggtgagttatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 3406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 121 - 1
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  121 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttg 22  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttg 119  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21 ttgagaaatggattgttgttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1286
Alignment:
Q  76 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatg 1323  T
Q  176 catgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1322 catgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 1286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 11855 - 12068
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |    
T  11855 tgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatggttcatgattggt-g 11953  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgt 197  Q
    ||||||||||   |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11954 ttgagaaatgagatgtttttggtgttttggtgaaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggttgt 12053  T
Q  198 ggttaattgatgatg 212  Q
    | ||||||| |||||    
T  12054 gtttaattgttgatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13838923 - 13838783
Alignment:
Q  71 ttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatg 170  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13838923 ttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttgttgttgaaatatgatg 13838825  T
Q  171 gaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13838824 gaatgaatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 13838783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 17956139 - 17956281
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956139 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttg 17956238  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956239 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 17956281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14295539 - 14295404
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295539 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 14295440  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  14295439 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 14295404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35123797 - 35123652
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35123797 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatgatttg-t 35123699  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35123698 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtgaatt 35123652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13817612 - 13817471
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  13817612 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttg 13817513  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  13817512 agaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 13817471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 55440995 - 55441141
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  55440995 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgatttttt 55441094  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  55441095 gttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 55441141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14298520 - 14298388
Alignment:
Q  3 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgcta---tgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14298520 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgt 14298422  T
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  14298421 tgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 14298388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14304147 - 14304015
Alignment:
Q  3 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgcta---tgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14304147 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-tgt 14304049  T
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  14304048 tgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 14304015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 11329107 - 11329235
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11329107 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 11329206  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    | |||||||||   |||||||||| ||||    
T  11329207 gatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 14528158 - 14528286
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14528158 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaattcatggcttgggtatgaatgattcatgatttgtt 14528257  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||    
T  14528258 gttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17139609 - 17139481
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17139609 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 17139510  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    |||| ||||||   |||||||||| ||||    
T  17139509 gttgcgaaatgagatgttgttggtagttt 17139481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 22144419 - 22144563
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22144419 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataatacatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtgg 22144518  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22144519 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 22144563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 50112198 - 50112342
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  50112198 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgttt 50112297  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   || | |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  50112298 ttgagaaatgagatgctattggtgttttggtgaaatttgtgaatt 50112342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30153042 - 30152908
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153042 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 30152943  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30152942 ttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaa 30152908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Original strand, 15468630 - 15468717
Alignment:
Q  125 tttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15468630 tttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgtatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 15468717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22275175 - 22275088
Alignment:
Q  125 tttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22275175 tttgtgaaattagtgaattatgacatgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 22275088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19946765 - 19946664
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  19946765 tgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaa 19946667  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  19946666 aat 19946664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14301166 - 14301031
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14301166 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattattcatgtctttggtttgcatgattcatgttttgtt 14301067  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  14301066 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 14301031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7854082 - 7853948
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7854082 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtttgcatgaatcatga-ttgttg 7853984  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  7853983 ttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 7853948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14059359 - 14059482
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14059359 ttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgtt 14059458  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggt 121  Q
    | |||||||||   ||||||||||    
T  14059459 gatgagaaatgagatgttgttggt 14059482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 17523036 - 17523170
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtca-tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17523036 tgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgatttatgatttg-t 17523134  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  17523135 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 17523170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33341981 - 33341847
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33341981 tgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 33341883  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  33341882 ttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 33341847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48421704 - 48421624
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48421704 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataaattgtggttgtggttaattgttgatg 48421624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 16996206 - 16996349
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  16996206 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataattcttggtttgttg 16996305  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  16996306 ttgagaaatgagttg-tgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 16996349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45581731 - 45581597
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45581731 tgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 45581632  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  45581631 ttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaa 45581597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 53898605 - 53898710
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  53898605 attgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtttgcaagattcatgattt-atgttg 53898703  T
Q  102 agaaatg 108  Q
    |||||||    
T  53898704 agaaatg 53898710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 54424112 - 54423979
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  54424112 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt- 54424014  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
     ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  54424013 atgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 54423979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 317655 - 317800
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||    
T  317655 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgtataattcttggtttgttg 317754  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
    | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  317755 tggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatta 317800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 16182092 - 16182201
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  16182092 tgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggattgttg 16182191  T
Q  99 ttgagaaatg 108  Q
    ||||||||||    
T  16182192 ttgagaaatg 16182201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 19570835 - 19570978
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||    
T  19570835 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataattcttg-gttgttg 19570933  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||  ||||| || ||||||    
T  19570934 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgatgaatt 19570978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 12349877 - 12349971
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12349877 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattt 12349971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 12488872 - 12489007
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |    
T  12488872 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcataattcatgatttaat 12488971  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | || |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  12488972 gatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 12489007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 54685456 - 54685590
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  54685456 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttggatttgcatgattcatga-ttgttg 54685554  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  54685555 ttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaat 54685590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 6146893 - 6147036
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg---ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |     
T  6146893 tgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattcatggcttgggttt-catgattcatgattttgta 6146991  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  6146992 tggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 6147036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 6154478 - 6154621
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |     
T  6154478 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcataattttgta 6154576  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | ||||||||   ||||||||||| |||  || || |||||||||    
T  6154577 tggagaaatgagatgttgttggtgttttgatggaaatggtgaatt 6154621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 12560382 - 12560510
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||   ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12560382 ttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggtatgcatgattcatgatttgat 12560481  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||    
T  12560482 gttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17100753 - 17100645
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17100753 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 17100654  T
Q  99 ttgagaaat 107  Q
    ||| |||||    
T  17100653 ttgtgaaat 17100645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17101438 - 17101330
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17101438 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 17101339  T
Q  99 ttgagaaat 107  Q
    ||| |||||    
T  17101338 ttgtgaaat 17101330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 12349685 - 12349799
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattga---tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg-----ggtttgcatgattcatgat 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||| ||    
T  12349685 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatcatggcttggccatggtttgcatgattcataat 12349784  T
Q  93 ttgttgttgagaaat 107  Q
    ||| || ||||||||    
T  12349785 ttgatgatgagaaat 12349799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 54038279 - 54038413
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54038279 tgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 54038378  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  54038379 ttaagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaa 54038413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3992650 - 3992515
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  3992650 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 3992551  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  3992550 gttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 3992515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28558253 - 28558172
Alignment:
Q  52 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||    
T  28558253 gttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgtttgtttggtgaaa 28558172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 8631887 - 8631801
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattca 88  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8631887 attgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16880224 - 16880114
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  16880224 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattatt 16880125  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    | ||| |||||    
T  16880124 ggtgataaatg 16880114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17191641 - 17191500
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||   |||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  17191641 tgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttg 17191542  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
     |||||||||    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17191541 atgagaaatg---agttgttggtggttttgtaaagttggtgaatt 17191500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18970048 - 18969968
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18970048 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattctgatggaaagcatgattataagttgtggttgtggttgattgttgatg 18969968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23492473 - 23492339
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  23492473 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttg 23492374  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  23492373 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 23492339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38168014 - 38167880
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38168014 tgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 38167915  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| || ||| ||||||    
T  38167914 ttgtgaaataagttgttgttgttgttttggtgaaa 38167880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3578189 - 3578082
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattga--tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | || |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3578189 ttgaattgcgataagtttcatgatcaattgatttgttgttgctaagtcatgttgttgattaaaaat--tggcttaggtatgcatgattcatgatttgttg 3578092  T
Q  99 ttgagaaatg 108  Q
    | ||| ||||    
T  3578091 tggaggaatg 3578082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17204767 - 17204656
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |    
T  17204767 tgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaa 17204668  T
Q  132 aattggtgaatt 143  Q
    | ||||||||||    
T  17204667 agttggtgaatt 17204656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39656467 - 39656390
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39656467 aattggtgaattatgacatgttgttc---aaatatgatggcatgcatgattataagttgtggttgtggttaattgttgatg 39656390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 201
Target Start/End: Original strand, 14177158 - 14177227
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggtt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14177158 aattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgtgatggaatgcatgattataagttgtggttgtggtt 14177227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15876169 - 15876023
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||     
T  15876169 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatgatttgtg 15876070  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
    | |||||||||  ||| ||||||| |||| || ||| | ||||||||    
T  15876069 gatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaaattgtgaatta 15876023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17938660 - 17938582
Alignment:
Q  16 tttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17938660 tttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattcatggcttgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 122
Target Start/End: Original strand, 38811188 - 38811278
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || | |||||||  ||||||||||||    
T  38811188 tgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttgttgttggtg 38811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2844291 - 2844196
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2844291 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 2844196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 19260986 - 19261087
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||  | ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19260986 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 19261085  T
Q  99 tt 100  Q
    ||    
T  19261086 tt 19261087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 122
Target Start/End: Original strand, 47784927 - 47785017
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||||| || || ||||||||| | || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  47784927 tgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtg 47785017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 53771141 - 53770993
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  53771141 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 53771042  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    |||| |||||   ||||||||| | |||| |||||| |||  |||||||    
T  53771041 gttgtgaaataagttgttgttgttagtttggtgaaaatggataattatg 53770993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16261553 - 16261458
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16261553 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 16261458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Original strand, 3576618 - 3576705
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 119  Q
    ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  3576618 tgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttg 3576705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12953031 - 12952934
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  12953031 tgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 12952934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Original strand, 17960499 - 17960583
Alignment:
Q  38 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||| || ||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  17960499 tgctaagtgatgttgttattaataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtg 17960583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 11061152 - 11061249
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  11061152 ttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttg 11061249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1990852 - 1990767
Alignment:
Q  50 ttgttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  1990852 ttgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 1990767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 9590934 - 9591031
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    |||||||| || || || |||||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9590934 tgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 9591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 141
Target Start/End: Original strand, 16934162 - 16934270
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | || ||| ||||||||||| | ||| | ||||||||  |||| |||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16934162 tgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtattcataaatcatgattgtttgt-gagaaataagatgttgttggtggttttgtga 16934260  T
Q  132 aattggtgaa 141  Q
    ||||||||||    
T  16934261 aattggtgaa 16934270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 49232437 - 49232396
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232437 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 49232396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39656627 - 39656497
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt---tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||   |||||||| || || |||||| |||| |||||||| || ||  | ||| |||||||||||| |    
T  39656627 ttgaattgttgtaagattcatgttcaattgatgtggttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttaggggttcataattcatgatttgat 39656528  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttg 128  Q
    | ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  39656527 gatgagaaataagttgttgttgttggttttg 39656497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34560000 - 34559864
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| || |||||||||   ||||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||||| |    
T  34560000 ttgaattatgatgagattcatgttcgattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgat 34559901  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34559900 gatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaat 34559864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 6228805 - 6228902
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||| |   ||||||||| |||||||||    
T  6228805 tgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgt 6228902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14080592 - 14080489
Alignment:
Q  19 catgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    |||| |||||||||||||||   || | || ||||||||| |||| ||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||  |||||    
T  14080592 catgttcaattgatgttgttattgcgaagtaatgttgttgttgatgatttacggcttgggtattcataattcatgatttggtgatgagaaatgagttgtt 14080493  T
Q  116 gttg 119  Q
    ||||    
T  14080492 gttg 14080489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 2449385 - 2449453
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  2449385 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 2449453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 11196444 - 11196488
Alignment:
Q  88 atgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  11196444 atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaa 11196488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16821127 - 16821099
Alignment:
Q  113 gttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821127 gttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 16821099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 171958 - 171794
Alignment:
Q  47 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    ||||||| | |||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  171958 atgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcat-attcatgatttgttgttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattaca 171860  T
Q  147 acatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  171859 acatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 171794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 177661 - 177497
Alignment:
Q  47 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    ||||||| | |||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  177661 atgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcat-attcatgatttgttgttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattaca 177563  T
Q  147 acatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  177562 acatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 177497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 70769 - 70913
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  70769 tgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatggtttgttg 70868  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  70869 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 70913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 60907 - 60784
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  60907 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatgatttg-t 60809  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    || ||||||||   |||||||||||    
T  60808 gtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 272078 - 271914
Alignment:
Q  47 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    ||||||| | |||| | |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  272078 atgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcat-attcatgaattgttatagagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaattaag 271980  T
Q  147 acatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  271979 acatgtagttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 271914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 69558 - 69409
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  69558 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 69459  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattgg-tgaattatg 146  Q
    | |||||| ||   |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||    
T  69458 gatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttgaattatg 69409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 109609 - 109754
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  109609 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggattgcatgattcatgatttgttg 109708  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  109709 ttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 109754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 118110 - 118255
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  118110 tgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggggttgcatgattcatgatttgttg 118209  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  118210 ttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 118255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11287517 - 11287372
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11287517 tgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 11287418  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11287417 ttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 11287372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 15822577 - 15822722
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15822577 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtg 15822676  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15822677 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 15822722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 7284206 - 7284341
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7284206 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattcatggcttgagtttgcatgattcatga-ttgtt 7284304  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  7284305 gttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaat 7284341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 26070411 - 26070545
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26070411 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg 26070510  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||   ||||||||| | |||| ||||||    
T  26070511 ttgagaaataagttgttgttgttagtttggtgaaa 26070545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 26094198 - 26094332
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26094198 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg 26094297  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||   ||||||||| | |||| ||||||    
T  26094298 ttgagaaataagttgttgttgttagtttggtgaaa 26094332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 49047820 - 49047966
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49047820 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 49047919  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||| |   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  49047920 gttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaaattggtgaatt 49047966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 126515 - 126392
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126515 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 126416  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  126415 ttgagaaatggattgttgttggtg 126392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 45452313 - 45452435
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattga---tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45452313 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttg-tg 45452411  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    | ||||||||   |||||||||||    
T  45452412 tggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13274888 - 13274742
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  13274888 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctttggtatgcatgattcatgttttgtt 13274789  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  13274788 gttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaaattggtgaatt 13274742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16570152 - 16570262
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16570152 ttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 16570251  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||    
T  16570252 gttgagaaatg 16570262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16595510 - 16595400
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16595510 ttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 16595411  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||    
T  16595410 gttgagaaatg 16595400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 12248267 - 12248395
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12248267 ttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgcatgacttgggtatgcatgattcatgatttgtt 12248366  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||    
T  12248367 gttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 39046770 - 39046914
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  39046770 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttgatctgttg 39046869  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||  ||||| || ||||||    
T  39046870 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgatgaatt 39046914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 17224118 - 17224229
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  17224118 tgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaa 17224217  T
Q  132 aattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||||    
T  17224218 aattggtgaatt 17224229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 141
Target Start/End: Original strand, 1937200 - 1937297
Alignment:
Q  44 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1937200 gtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaattgatgaa 1937297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35094916 - 35094773
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaat--tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 99  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35094916 tgaattgttaaatgtttcatgatcaatgttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcataattcttgatttgttgt 35094817  T
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||   ||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  35094816 tgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgatgaatt 35094773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 111424 - 111557
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  111424 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattca-aatttgttg 111522  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  111523 ttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaa 111557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12759087 - 12758944
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  12759087 tgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtttgcaggatttatgatttg-tg 12758989  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | ||||||||   ||||||||||| |||  | ||| |||||||||    
T  12758988 tggagaaatgagatgttgttggtgttttgataaaaatggtgaatt 12758944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13377630 - 13377495
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  13377630 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 13377531  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  13377530 gatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 13377495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 143739 - 143601
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgtt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |     
T  143739 tgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt---aagtcatgttgttaatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatg 143644  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  143643 gagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 143601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3895125 - 3894991
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3895125 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 3895026  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||  ||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  3895025 ttgtaaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 3894991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 32494201 - 32494335
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |   ||||| |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  32494201 tgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgataattcatggcttgtgtatgcatgattcataatttgttg 32494300  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  32494301 ttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaa 32494335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47289881 - 47289736
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgc---tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  47289881 tgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattcatggcttgtg-ttgcatgattcatgattttgtt 47289783  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
     | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  47289782 atggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatta 47289736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3049683 - 3049575
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3049683 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 3049584  T
Q  99 ttgagaaat 107  Q
    ||| |||||    
T  3049583 ttgtgaaat 3049575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 12369986 - 12370121
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||||||| || |||||||  || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12369986 ttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattcatggcttaggtatgcatgattcatgatttgtt 12370085  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
     |||||||||   |||| |||| |||||| ||||||    
T  12370086 attgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaa 12370121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13352079 - 13352011
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13352079 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgggatggaatgcatgattataagttgtggttgtggt 13352011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2029021 - 2028893
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| || || ||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2029021 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgacttgggtatgcatgattcataattttgtt 2028922  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    |||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  2028921 gttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44865330 - 44865184
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat------gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |      ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  44865330 tgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgatttt 44865232  T
Q  95 gttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaat 142  Q
    ||| | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  44865231 gttatggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaat 44865184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 16915074 - 16915210
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  16915074 ttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 16915173  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    |  ||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  16915174 gaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaat 16915210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48356745 - 48356609
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |    
T  48356745 ttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 48356646  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  48356645 gatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaat 48356609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 2190341 - 2190436
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2190341 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 2190436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Original strand, 15977975 - 15978043
Alignment:
Q  138 tgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15977975 tgaattatgacatgttgttgttgaattgtggttgaatacatgattataagttgtggttgttgttaattg 15978043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 42056444 - 42056592
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || || || |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  42056444 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 42056543  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    |||| |||||   ||||||||| | |||| |||||| |||  |||||||    
T  42056544 gttgtgaaataagttgttgttgttagtttggtgaaaatggataattatg 42056592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 15441711 - 15441779
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  15441711 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 15441779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 30262276 - 30262344
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||    
T  30262276 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 30262344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 14272066 - 14272168
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    |||||||||||  | || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||  |||||| |||||||||||| |    
T  14272066 tgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtaa 14272165  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  14272166 aat 14272168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7292977 - 7292896
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7292977 aattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatgt 7292896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13321116 - 13320984
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||||||||||   |||| ||  | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  13321116 ttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcac-attcatgaattgat 13321018  T
Q  98 gttgagaaat-ggattgttgttggtggttttgtg 130  Q
    | |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  13321017 gatgagaatttggattgttgttggtgtttttgtg 13320984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31501240 - 31501165
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 107  Q
    |||||||| ||||  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||    
T  31501240 tgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgagtcatgatttgatgatgagaaat 31501165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 371077 - 371048
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371077 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 371048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 14251165 - 14251194
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251165 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 14251194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 15951046 - 15951087
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15951046 tgagaaataaattgttgttggtggttttctgaaattggtgaa 15951087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Original strand, 18151494 - 18151547
Alignment:
Q  153 tgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    |||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18151494 tgttgttgaattgtgattgaatacatgattataagttgtggttgtggttgattg 18151547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11516343 - 11516275
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||| ||| || |||||||| |||| ||||||    
T  11516343 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgattgttgatgt 11516275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14935433 - 14935333
Alignment:
Q  29 tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttg 128  Q
    ||||||||||| || |  || |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  14935433 tgatgttgttgttaagagatattgttgttgaagattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttg 14935334  T
Q  129 t 129  Q
    |    
T  14935333 t 14935333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15363026 - 15362926
Alignment:
Q  29 tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttg 128  Q
    ||||||||||| || |  || |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  15363026 tgatgttgttgttaagagatattgttgttgaagattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttg 15362927  T
Q  129 t 129  Q
    |    
T  15362926 t 15362926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 132397 - 132541
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  132397 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttg 132496  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  132497 ttgagaaatgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 132541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11786 - 11660
Alignment:
Q  3 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11786 gaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataattcatggcttggttatgcatgattcatgatttgttgt 11687  T
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    |||||||||   |||||||||||||||    
T  11686 tgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 201
Target Start/End: Original strand, 22186 - 22255
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22186 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggttgtggtt 22255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 88375 - 88273
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt---tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| || || ||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  88375 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttggcttgggtatgcatgatccataatttgttg 88276  T
Q  99 ttg 101  Q
    |||    
T  88275 ttg 88273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3399 - 3265
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3399 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 3301  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  3300 ttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 3265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31311 - 31176
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31311 tgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgaattgttg 31212  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  31211 ttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 31176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21612 - 21477
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21612 tgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgaattgttg 21513  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21512 ttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 21477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 35015312 - 35015454
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015312 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 35015411  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015412 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 35015454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31628369 - 31628245
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31628369 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 31628270  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    || ||||||||   |||||||||||    
T  31628269 gtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32898890 - 32898746
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32898890 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattaatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttg 32898791  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   || |||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  32898790 ttgagaaatgagatgatgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 32898746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 141
Target Start/End: Original strand, 19983491 - 19983588
Alignment:
Q  44 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983491 gtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 19983588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 18381829 - 18381974
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||   ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  18381829 ttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgtt 18381928  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18381929 gatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 18381974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18432744 - 18432634
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatg---ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  18432744 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattaatggtttatt 18432645  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    ||||| |||||    
T  18432644 gttgaaaaatg 18432634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18583384 - 18583299
Alignment:
Q  48 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  18583384 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 18583299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 18823576 - 18823677
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |    
T  18823576 tgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaa 18823674  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  18823675 aat 18823677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 18839431 - 18839532
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |    
T  18839431 tgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaa 18839529  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  18839530 aat 18839532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16086118 - 16086022
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16086118 ttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatgattt 16086022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 25744360 - 25744504
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  25744360 tgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttg 25744459  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||| ||||    
T  25744460 tagagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtaaatt 25744504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18777246 - 18777112
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18777246 tgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 18777147  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  18777146 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 18777112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22441030 - 22440890
Alignment:
Q  6 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |    
T  22441030 ttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatgg 22440932  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||   ||||||||||| |||  ||||| | |||||||    
T  22440931 agaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaattgtgaatt 22440890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18399039 - 18398909
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  18399039 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattg-t 18398941  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    | | |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  18398940 gataagaaatgagttgttgttgttggttttgt 18398909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 25367383 - 25367493
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25367383 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatgaattgtt 25367482  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    | |||||||||    
T  25367483 gatgagaaatg 25367493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 28195239 - 28195367
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataag-tttcatgatcaattgatgt---tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 96  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |    
T  28195239 ttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttat 28195337  T
Q  97 tgttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  28195338 tgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Original strand, 15889840 - 15889914
Alignment:
Q  138 tgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15889840 tgaattatgacatgttgttgatgaattgtgatggaatgcatgattataagttgtggttgtggttgattgttgatg 15889914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18570379 - 18570246
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt---tgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||| || || ||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18570379 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcctgggtatgcatgattcataatttgttg 18570280  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||  | |||||||| |||||| ||||||    
T  18570279 ttgtgaaat-aagtgttgttgttggtttggtgaaa 18570246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 13014856 - 13015000
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  13014856 tgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattcgtggcttggg-ttgcatgattcttgattttgtt 13014954  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
     | ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| | |||||||    
T  13014955 atggagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaattgtgaatt 13015000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 15742375 - 15742525
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat------gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |      || ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15742375 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttg 15742474  T
Q  96 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    |||||| |||||   ||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||    
T  15742475 ttgttgtgaaataagttgttgttgctggtttggtgaaaatggataattatg 15742525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16106617 - 16106526
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |     |||||||||||||||||||    
T  16106617 ttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgac-----tttgcatgattcatgattt 16106526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Original strand, 25640683 - 25640757
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25640683 aattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattttgatggaatgcatgattataagttgttgttgtggttgattg 25640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 18002651 - 18002784
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || | ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  18002651 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcat-acttgttg 18002749  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  18002750 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 18002784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26089835 - 26089710
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  26089835 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcat-aattgttg 26089737  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggtt 125  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||    
T  26089736 ttgtgaaataagttgttgttgttggtt 26089710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23995023 - 23994875
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  23995023 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 23994924  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    |||| |||||   ||||||||| | |||| |||||| |||  |||||||    
T  23994923 gttgtgaaataagttgttgttgttagtttggtgaaaatggataattatg 23994875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25919680 - 25919590
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||    
T  25919680 tgttgttgctatatgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtg 25919590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 197
Target Start/End: Original strand, 15005034 - 15005099
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15005034 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgtgatagaatgaatgattataagttgtggttgt 15005099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 22585681 - 22585754
Alignment:
Q  139 gaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  22585681 gaattatgacatgttgttgttgaattgtgatgcaatgcatgattataagttgtggttatagttgattgttgatg 22585754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 22590512 - 22590585
Alignment:
Q  139 gaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  22590512 gaattatgacatgttgttgttgaattgtgatgcaatgcatgattataagttgtggttatagttgattgttgatg 22590585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21623269 - 21623124
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || |||||||||   ||||||| || |||||| || | || | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||     
T  21623269 ttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtcatggcttgggtattcataattcatgatttgtg 21623170  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | ||| |||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  21623169 gatgaaaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaattggtgaatt 21623124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22361911 - 22362047
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||   ||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |    
T  22361911 ttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgat 22362010  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||    
T  22362011 gatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaat 22362047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25651338 - 25651203
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | |    
T  25651338 ttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgattggat 25651239  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | |||||| |   ||||||||| |||||||||||||    
T  25651238 gatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaa 25651203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 33324776 - 33324673
Alignment:
Q  19 catgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    |||| |||||||||||||||   |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||    
T  33324776 catgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgtt 33324677  T
Q  116 gttg 119  Q
    ||||    
T  33324676 gttg 33324673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 33538515 - 33538646
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||   |||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||||| |    
T  33538515 ttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgat 33538614  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    | |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  33538615 gatgagaaatgagttgttgttgttggttttgt 33538646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 35136176 - 35136279
Alignment:
Q  19 catgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    |||| |||||||||||||||   |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||    
T  35136176 catgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgtt 35136275  T
Q  116 gttg 119  Q
    ||||    
T  35136276 gttg 35136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740207
Alignment:
Q  59 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggt 121  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggt 15740207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 133
Target Start/End: Original strand, 17083373 - 17083459
Alignment:
Q  47 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || | |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  17083373 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaa 17083459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18583417 - 18583380
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 39  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18583417 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttg 18583380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 16556394 - 16556432
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggt 138  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556394 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggt 16556432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Original strand, 16632950 - 16632988
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggt 138  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632950 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggt 16632988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 16887956 - 16888059
Alignment:
Q  19 catgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||   |||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||    
T  16887956 catgttcaattgattttgttgtcactatgtgatgttattgttaatgattcatggcttgggtatacataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgtt 16888055  T
Q  116 gttg 119  Q
    ||||    
T  16888056 gttg 16888059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 22225993 - 22226034
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225993 tgagaaataaattcttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 22226034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Original strand, 13537 - 13647
Alignment:
Q  96 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13537 ttgttgagaaatggattgttgttagtggttttgtgaaattggtgaattacgacatgttcttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataaattgtggtt 13636  T
Q  196 gtggttaattg 206  Q
    |||||||||||    
T  13637 gtggttaattg 13647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 55681 - 55546
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55681 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 55582  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||  ||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  55581 gttgtaaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 55546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 122
Target Start/End: Original strand, 93967 - 94042
Alignment:
Q  47 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  93967 atgttgttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaatgagatgttgttggtg 94042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Original strand, 104802 - 104889
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 119  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||| |||||  |||||||||    
T  104802 tgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttg 104889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Original strand, 116284 - 116358
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||  | || | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  116284 aattgatgaattgtgacatgttgttattgatttgtggttgaatacatgattataagttgtggttgttgttaattg 116358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 254961 - 255105
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  254961 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgttg 255060  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  255061 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaatt 255105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 261567 - 261711
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  261567 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgttg 261666  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  261667 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaatt 261711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 723 - 857
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  723 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttgttg 822  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  823 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 665 - 799
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  665 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttgttg 764  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  765 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 85432 - 85287
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85432 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatgatttgttg 85333  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa-ttggtgaatt 143  Q
    ||||||||||    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  85332 ttgagaaatgagacgttgttggtgttttggtgaaacttggtgaatt 85287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 159400 - 159257
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  159400 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgataatttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtt 159301  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  159300 gagaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 159257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 245 - 110
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  245 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 147  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  146 gctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaat 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 5393 - 5537
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5393 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatggtttgttg 5492  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5493 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 5537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 9031 - 9156
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9031 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgtt 9130  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    ||||||||   |||||| ||||||||    
T  9131 gagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 166419 - 166554
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||    || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166419 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtta----atattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 166514  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166515 aaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 166554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 162333 - 162476
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat----gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |      ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162333 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 162432  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162433 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 162476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 116693 - 116804
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  116693 tgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggttttgtaa 116792  T
Q  132 aattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||||    
T  116793 aattggtgaatt 116804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 164315 - 164171
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  164315 tgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttg 164216  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   || |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  164215 ttgagaaatgagatggtgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 164171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1481 - 1347
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1481 tgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 1382  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  1381 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6380
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6238 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttg 6337  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6338 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 6380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 1308
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 1319  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||    
T  1318 gttgagaaatg 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 11801 - 11942
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgtt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |     
T  11801 tgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataactcatgattttgttatg 11899  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  11900 gagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtgaatt 11942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 31435 - 31577
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31435 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttg 31534  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 31577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41409 - 41267
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41409 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttg 41310  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41309 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 41267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 35522465 - 35522610
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35522465 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg-t 35522563  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  35522564 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaattggtgaatt 35522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 51627810 - 51627956
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  51627810 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgct 51627909  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  51627910 gttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaaattggtgaatt 51627956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 15861581 - 15861713
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat-gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861581 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgatgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 15861680  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15861681 gagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaa 15861713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22367119 - 22366985
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367119 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttg 22367020  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22367019 ttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaa 22366985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21718324 - 21718184
Alignment:
Q  6 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  21718324 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-gttgttcttga 21718226  T
Q  103 gaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    ||||||   ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  21718225 gaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaattggtgaatt 21718184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 44035126 - 44035267
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44035126 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgatgata-atggcttgagtttgcatgattcataatttgttg 44035224  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44035225 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgcaattggtgaa 44035267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 49967750 - 49967606
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  49967750 tgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcattgcttcggtttgcatgattcatg-gttgttg 49967652  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
    ||||| ||||   ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  49967651 ttgaggaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatta 49967606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 9784246 - 9784343
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9784246 ttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatgatttg 9784343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Original strand, 13377020 - 13377131
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13377020 tgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgttgttggcggttttgtga 13377119  T
Q  132 aattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||||    
T  13377120 aattggtgaatt 13377131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20177242 - 20177131
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20177242 tgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttgtga 20177143  T
Q  132 aattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||||    
T  20177142 aattggtgaatt 20177131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41212172 - 41212035
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat------gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  41212172 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttg 41212073  T
Q  96 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||    
T  41212072 ttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaa 41212035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21860111 - 21859977
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |   ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21860111 tgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggctcgggtttgcatgattcataatttgttg 21860012  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  21860011 ttgagaaatgaattgttgttgttggtttggtgaaa 21859977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 22403257 - 22403401
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22403257 tgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttt-catgattcatgattttgtt 22403355  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
     | ||||||||   ||||||||||  |||  ||||| |||||||||    
T  22403356 atggagaaatgagatgttgttggtattttgatgaaaatggtgaatt 22403401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35054856 - 35054722
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35054856 tgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 35054757  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| | |||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  35054756 ttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 35054722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Original strand, 27329904 - 27330002
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27329904 aattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgt 27330002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 144
Target Start/End: Original strand, 41229119 - 41229231
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| || |    
T  41229119 tgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtagtttggtaa 41229218  T
Q  132 aattggtgaatta 144  Q
    |||||||||||||    
T  41229219 aattggtgaatta 41229231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 122
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829694
Alignment:
Q  57 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtg 22829694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Original strand, 36356455 - 36356581
Alignment:
Q  17 ttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||    |    
T  36356455 ttcatgttcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgatgatttatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatg---ag 36356551  T
Q  114 ttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  36356552 ttgttggtagtttggtaaaattggtgaatt 36356581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Original strand, 22143525 - 22143635
Alignment:
Q  19 catgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  22143525 catgctcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatgatgagaaatcgattgtt 22143624  T
Q  116 gttggtggttt 126  Q
    |||| ||||||    
T  22143625 gttgttggttt 22143635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27674862 - 27674774
Alignment:
Q  33 gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  27674862 gttgttgttaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattt-ttgatgagaaatgagttgttgttggtg 27674774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 9784207 - 9784245
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784207 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 9784245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19603182 - 19603074
Alignment:
Q  17 ttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattg 113  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | || |||| |||  |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  19603182 ttcatgttcaattgatgtagttgctgctaagtgatgtggttattgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg 19603083  T
Q  114 ttgttggtg 122  Q
    |||||||||    
T  19603082 ttgttggtg 19603074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 18060013 - 18060054
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18060013 tgagaaataaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 18060054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21195063 - 21194986
Alignment:
Q  50 ttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtttt 127  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  21195063 ttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttt 21194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51452608 - 51452540
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  51452608 tgacatgttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 51452540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 37234006 - 37234103
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattga---tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||   ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||    
T  37234006 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttg 37234103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16646013 - 16645975
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 39  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16646013 ttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 16645975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 21650307 - 21650336
Alignment:
Q  112 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650307 tgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 21650336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17608995 - 17608899
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttg 128  Q
    |||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |  |||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  17608995 tgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttg 17608899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9083 - 8942
Alignment:
Q  6 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9083 ttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttga 8984  T
Q  103 gaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    ||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8983 gaaatgagatgttgttggtggtttggtgaaaattggtgaatt 8942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22650
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22791 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtta 22692  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtga 140  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22691 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 135
Target Start/End: Original strand, 973 - 1105
Alignment:
Q  6 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  973 ttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttga 1072  T
Q  103 gaaatggattgttgttggtggttttgtgaaatt 135  Q
    ||||||   ||||||||||| ||| ||||||||    
T  1073 gaaatgagatgttgttggtgatttggtgaaatt 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 6992 - 7136
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat------gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  6992 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttg 7091  T
Q  96 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtga 140  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| |||  ||||| ||||||    
T  7092 ttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggtga 7136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10038 - 9914
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10038 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 9939  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    || ||||||||   |||||||||||    
T  9938 gtggagaaatgagatgttgttggtg 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 260 - 395
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  260 ttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 358  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||| ||||    
T  359 gttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaat 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 6554 - 6591
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 38  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6554 ttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgtt 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25059 - 24925
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25059 ttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatga-ttgtt 24962  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  24961 gttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 24925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25312 - 25218
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25312 ttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgatt 25218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38398 - 38254
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38398 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcataacttgggtttgcatgattcatggtttgttg 38299  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   || |||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  38298 ttgagaaatgagatgatgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 38254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 606 - 747
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgt---catgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  606 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattaataatttgttg 705  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  706 ttgagaaatggattattgttggtggttttgtg-aattggtgaa 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6041 - 5906
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||| |    
T  6041 ttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataatccatgatttgat 5942  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | || |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  5941 gatgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32303 - 32159
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||    
T  32303 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttg 32204  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  32203 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 32159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 42000 - 42144
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||    
T  42000 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttg 42099  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  42100 ttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatt 42144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14974 - 14833
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  14974 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttg 14875  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||   ||||||||||| |||  ||||| |||| ||||    
T  14874 agaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatggttaatt 14833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14290 - 14173
Alignment:
Q  26 aattgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggtt 125  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  14290 aattgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttt 14191  T
Q  126 ttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    |  ||||| |||| ||||    
T  14190 tgatgaaaatggttaatt 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1871
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2017 ttgatttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgtt 1918  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtg-aaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  1917 gttgagaaatgagatgttgttagtggtttggtgaaaattggtgaatt 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 33874 - 34019
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33874 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttgtt 33972  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  33973 gttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaaattggtgaatt 34019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3310
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3420 ttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 3321  T
Q  98 gttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||    
T  3320 gttgagaaatg 3310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31145 - 30999
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31145 ttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgacttgtt 31046  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  31045 gttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaaattggtgaatt 30999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 70714 - 70674
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70714 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct 70674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 109691 - 109545
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  109691 ttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatgatttgtt 109592  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgt-gaaattggtgaatt 143  Q
    | |||||||||   |||||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  109591 gatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaaattggtgaatt 109545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Original strand, 112692 - 112812
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |   ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112692 tgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgttgttgat---aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 112788  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  112789 ttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 103068 - 103192
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||   ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  103068 ttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgtt 103167  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    | ||| |||||  ||||||||||||    
T  103168 ggtgataaatgagttgttgttggtg 103192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 76993 - 77138
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||||||||||   ||||||| || || |||||  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  76993 ttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgtt 77092  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77093 gatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 77138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 11714 - 11837
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  11714 ttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcatgatttg-t 11812  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
    || ||||||||   |||||||||||    
T  11813 gtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 1017 - 1089
Alignment:
Q  140 aattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1017 aattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggttgtggttaattgttgatg 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6762 - 6617
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||   | || ||||| ||| |||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  6762 ttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttactcctaagtgatgtttttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgtt 6663  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  6662 gatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggtgaatt 6617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 45804 - 45876
Alignment:
Q  140 aattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45804 aattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggttgtggttaattgttgatg 45876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 12675 - 12809
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12675 tgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 12774  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  12775 ttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaa 12809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 19056 - 19190
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19056 tgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 19155  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  19156 ttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaa 19190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 159
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  233 aattgttgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggttgtgattaattg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Original strand, 1629 - 1703
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1629 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgattataagttgtggttgtgattaattg 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 10121 - 10255
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10121 tgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 10220  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  10221 ttgtgaaataagttgttgttgatggtttggtgaaa 10255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7667 - 7581
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 87  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7667 aattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 7581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35579 - 35435
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||   ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  35579 ttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgtt 35480  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35479 gatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaattggtgaatt 35435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7901 - 7807
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  7901 tgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 15618 - 15755
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat------gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |      |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  15618 tgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttt 15717  T
Q  96 ttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  15718 ttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaa 15755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6614 - 6514
Alignment:
Q  29 tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttg 128  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| | |||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  6614 tgatgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttaggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttg 6515  T
Q  129 t 129  Q
    |    
T  6514 t 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4262
Alignment:
Q  48 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatta 144  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  4358 tgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaatta 4262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 9662 - 9796
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || | ||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9662 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 9761  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  9762 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 9796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 95075 - 94941
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   | || ||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  95075 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttg 94976  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  94975 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 94941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 24875 - 25009
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  24875 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcttggcttgggtattcatgattcataatttgttg 24974  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  24975 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 25009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 17559 - 17686
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  17559 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttg 17658  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    ||| |||||   ||||||||| ||||||    
T  17659 ttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 146701 - 146567
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  146701 tgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttt 146602  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  146601 ttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 146567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 85600 - 85503
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 129  Q
    ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  85600 tgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatggtttgttgatgaaaaataggttgttgttgttggttttgt 85503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 410 - 265
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||   ||| || ||||| ||| |||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  410 ttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgtt 311  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 143  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  310 gatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggtgaatt 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Original strand, 6698 - 6823
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgat---gttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6698 tgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 6797  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggt 124  Q
    ||| |||||   ||||||||| ||||    
T  6798 ttgtgaaataagttgttgttgttggt 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28603 - 28501
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  28603 tgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaa 28504  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  28503 aat 28501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 79964 - 79856
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  79964 tgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttg 79865  T
Q  99 ttgagaaat 107  Q
    ||| |||||    
T  79864 ttgtgaaat 79856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 46263 - 46131
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |  |    
T  46263 aattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgataat 46164  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  46163 gtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 46131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 40755 - 40662
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  40755 attgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttg 40662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 1133 - 1268
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  1133 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 1232  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  1233 gttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 13541 - 13676
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13541 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 13640  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  13641 gttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 13676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 21515 - 21650
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  21515 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 21614  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||| |||||   ||||||||| | |||| ||||||    
T  21615 gttgtgaaataagttgttgttgttagtttggtgaaa 21650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15049 - 14914
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  15049 tgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgtt 14950  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  14949 gttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 7175 - 7319
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgct---atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttg 101  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   | || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| ||    
T  7175 attgtgataagaatcatgttcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgaattgttgatg 7274  T
Q  102 agaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattatg 146  Q
    |||||||  ||||   || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7275 agaaatgagttgtgaatgatggttttgtaaaattggtgaattatg 7319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48247 - 48124
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||   |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  48247 tgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgtt 48149  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
     | ||||||||   |||||||||||    
T  48148 atggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 61695 - 61572
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgtt 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||   |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  61695 tgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgtt 61597  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtg 122  Q
     | ||||||||   |||||||||||    
T  61596 atggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 193645 - 193777
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  193645 attgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgtt 193744  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  193745 gcgaaataagttgttgttgttggtttcgtgaaa 193777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 186683 - 186789
Alignment:
Q  5 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tttgttgtt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  186683 attgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgtt 186782  T
Q  101 gagaaat 107  Q
    | |||||    
T  186783 gtgaaat 186789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 2462 - 2597
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| |||| |    
T  2462 ttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggcgttcataattcatgttttgat 2561  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  2562 gatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Original strand, 183 - 308
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttg 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||    
T  183 tgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgagtatgcatgattcataatttattg 282  T
Q  99 ttgagaaatggattgttgttggtggt 124  Q
    ||| |||||   ||||||||| ||||    
T  283 ttgtgaaataagttgttgttgttggt 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33762 - 33666
Alignment:
Q  2 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt---gttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || || |||||| |||| |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  33762 tgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctagggtgttcataattcatgatttg 33666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 134
Target Start/End: Original strand, 43978 - 44080
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  43978 tgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaa 44077  T
Q  132 aat 134  Q
    |||    
T  44078 aat 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2522 - 2421
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||| | ||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  2522 tgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattccttatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtga 2423  T
Q  132 aa 133  Q
    ||    
T  2422 aa 2421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 3969 - 4049
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatg 212  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  3969 aattgatgaattacgacatgttgttattgaattgtgatggaatgcataattataagttgtggttgtgcttgattgttgatg 4049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2626 - 2497
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    ||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||   |||| || || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||||| |    
T  2626 ttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgat 2527  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggtttt 127  Q
    | |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  2526 gatgagaaatgacttgttgttgttggtttt 2497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 133
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22793
Alignment:
Q  55 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 22793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Original strand, 44249 - 44311
Alignment:
Q  139 gaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggtt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  44249 gaattatgacatgttgttgttgaattgtgatgggatgcatgattacaagttgtggttgaggtt 44311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6010 - 5936
Alignment:
Q  132 aattggtgaattatgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattg 206  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  6010 aattgatgatttatgacatgttgtagttgaattgtgatcgaatgcatgattgtaagttgtggttgtggttgattg 5936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 10745 - 10642
Alignment:
Q  19 catgatcaattgatgttgtt---gctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    |||| |||||||||||||||   |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||| ||||| ||||||    
T  10745 catgttcaattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgaaaaatgaattgtt 10646  T
Q  116 gttg 119  Q
    ||||    
T  10645 gttg 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 8077 - 8001
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  8077 tgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatg 8001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4661 - 4529
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||| || |    
T  4661 aattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgat 4562  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  4561 gtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 4529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9275 - 9143
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtt 100  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||   ||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||| || |    
T  9275 aattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgat 9176  T
Q  101 gagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaa 133  Q
    | |||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  9175 gtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaa 9143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7238 - 7137
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtga 131  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||| || || |||||   ||||||||| |||||| ||||    
T  7238 tgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggtttggtga 7139  T
Q  132 aa 133  Q
    ||    
T  7138 aa 7137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 115
Target Start/End: Original strand, 70470 - 70569
Alignment:
Q  19 catgatcaattgatgttg---ttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 115  Q
    |||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  70470 catgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcttggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgggttgtt 70569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5249 - 5162
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 119  Q
    |||||||||||||| || |||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||| |||||  |||||||||    
T  5249 tgttgttgctatgtgatattgttgttggtgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgttg 5162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 29153 - 29122
Alignment:
Q  110 attgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29153 attgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 29122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 79606 - 79519
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttg 119  Q
    ||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||  |||||||||    
T  79606 tgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgttg 79519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 39
Target Start/End: Original strand, 89618 - 89653
Alignment:
Q  4 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 39  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  89618 aattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttg 89653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 197399 - 197520
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattga---tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||   ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | ||||| |||| |    
T  197399 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatcatgctttgat 197498  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttg 119  Q
    | |||||| ||  |||||||||    
T  197499 gatgagaattgagttgttgttg 197520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11161 - 11067
Alignment:
Q  32 tgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||| | |||   |||||||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  11161 tgttgttgctatgtgatgttgttgtttatgattcatggcttaggtgttcatagatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 11067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39636 - 39606
Alignment:
Q  111 ttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39636 ttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 39606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31121 - 30985
Alignment:
Q  1 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg---ctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtt 97  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| || ||  ||||| |||| |||||||||||| || | ||| | ||| |||||| |    
T  31121 ttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatactgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcaagatttgat 31022  T
Q  98 gttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 134  Q
    | |||||| ||  ||||||||| || |||||| ||||    
T  31021 gatgagaattgagttgttgttgttgcttttgtaaaat 30985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6022 - 5961
Alignment:
Q  34 ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  6022 ttgttgctaagtgatgttgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttg 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Original strand, 22600 - 22661
Alignment:
Q  34 ttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 95  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22600 ttgttgctaagtgatgttgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttg 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 108
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3379
Alignment:
Q  47 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 108  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  3318 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattttttattgtgaaatg 3379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39104 - 39063
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39104 tgagaaataaattgttgttgatggttttgtgaaattggtgaa 39063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Original strand, 154262 - 154303
Alignment:
Q  100 tgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 141  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  154262 tgagaaataaattgttgatggtggttttgtgaaattggtgaa 154303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22656 - 22588
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  22656 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 22588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26911 - 26843
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  26911 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 26843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 213
Target Start/End: Original strand, 1729 - 1797
Alignment:
Q  145 tgacatgttgttgttgaaatatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgatgatgt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||| || |||| ||| |||||||||||    
T  1729 tgacatgttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 1797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University