View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16330_high_8 (Length: 353)

Name: NF16330_high_8
Description: NF16330
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16330_high_8
NF16330_high_8
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (1-348)||(23573615-23573962)
chr5 (1-348)||(21984471-21984818)
chr5 (4-343)||(23440101-23440440)
chr5 (1-348)||(26738871-26739218)
chr5 (1-340)||(25423062-25423401)
chr5 (4-341)||(18775653-18775990)
chr5 (4-348)||(23516417-23516761)
chr5 (1-348)||(22134541-22134888)
chr5 (1-348)||(14999905-15000252)
chr5 (1-348)||(22333053-22333400)
chr5 (1-348)||(40708653-40709000)
chr5 (1-348)||(34566367-34566714)
chr5 (27-340)||(20798659-20798972)
chr5 (1-348)||(16356375-16356722)
chr5 (1-348)||(27685566-27685913)
chr5 (10-348)||(19769842-19770180)
chr5 (10-348)||(27610236-27610574)
chr5 (1-338)||(23471102-23471439)
chr5 (1-348)||(27518280-27518627)
chr5 (1-348)||(37291662-37292009)
chr5 (1-348)||(41770715-41771062)
chr5 (10-348)||(27668656-27668994)
chr5 (17-348)||(22348314-22348643)
chr5 (1-348)||(29476239-29476586)
chr5 (5-335)||(20468275-20468605)
chr5 (1-233)||(20573394-20573626)
chr5 (71-341)||(21498209-21498479)
chr5 (1-206)||(21343666-21343871)
chr5 (19-335)||(23442472-23442788)
chr5 (10-335)||(21890938-21891263)
chr5 (29-291)||(21564189-21564451)
chr5 (7-328)||(37545682-37546004)
chr5 (7-328)||(14887177-14887498)
chr5 (7-300)||(25847936-25848229)
chr5 (7-282)||(24798629-24798904)
chr5 (7-328)||(20342143-20342464)
chr5 (7-343)||(21404715-21405035)
chr5 (10-335)||(24735790-24736115)
chr5 (10-335)||(24749733-24750058)
chr5 (204-348)||(21339452-21339596)
chr5 (10-326)||(22461816-22462132)
chr5 (10-282)||(24737017-24737289)
chr5 (10-335)||(22236099-22236424)
chr5 (7-280)||(22502540-22502813)
chr5 (7-328)||(23080275-23080596)
chr5 (10-293)||(28923989-28924272)
chr5 (7-328)||(22381060-22381381)
chr5 (7-254)||(21662300-21662546)
chr5 (10-293)||(28895163-28895446)
chr5 (10-328)||(20773624-20773942)
chr5 (10-328)||(20821317-20821635)
chr5 (28-254)||(21665761-21665986)
chr5 (28-328)||(17269519-17269819)
chr5 (150-337)||(11210871-11211058)
chr5 (150-314)||(21937388-21937552)
chr5 (7-80)||(21625397-21625470)
chr5 (228-328)||(23503525-23503625)
chr5 (150-314)||(24581215-24581379)
chr5 (150-314)||(27011088-27011252)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (4-348)||(12497811-12498155)
chr3 (1-348)||(9522279-9522626)
chr3 (1-348)||(17489410-17489757)
chr3 (1-348)||(16492404-16492751)
chr3 (4-341)||(14876729-14877066)
chr3 (4-348)||(16370976-16371320)
chr3 (1-348)||(10905770-10906117)
chr3 (1-348)||(15208451-15208798)
chr3 (1-341)||(16691720-16692060)
chr3 (4-348)||(16807149-16807493)
chr3 (1-348)||(10005160-10005507)
chr3 (1-340)||(15348476-15348815)
chr3 (1-342)||(48425007-48425348)
chr3 (1-348)||(13252250-13252597)
chr3 (1-348)||(15589615-15589962)
chr3 (1-348)||(16635333-16635680)
chr3 (1-348)||(26792622-26792969)
chr3 (1-348)||(43162657-43163004)
chr3 (10-348)||(53385241-53385579)
chr3 (1-348)||(20062277-20062624)
chr3 (19-348)||(15247725-15248054)
chr3 (1-348)||(15725157-15725503)
chr3 (4-348)||(15402733-15403077)
chr3 (4-348)||(16412505-16412849)
chr3 (10-348)||(5425153-5425490)
chr3 (10-348)||(6600316-6600654)
chr3 (10-348)||(16756808-16757146)
chr3 (4-348)||(15338832-15339176)
chr3 (10-293)||(15227228-15227511)
chr3 (28-335)||(15953193-15953500)
chr3 (7-328)||(47123520-47123841)
chr3 (5-328)||(10383543-10383866)
chr3 (5-335)||(14571422-14571752)
chr3 (131-348)||(15015967-15016184)
chr3 (19-293)||(13972387-13972661)
chr3 (10-335)||(13322877-13323202)
chr3 (10-335)||(18134571-18134896)
chr3 (54-300)||(12850539-12850785)
chr3 (10-320)||(10420285-10420595)
chr3 (19-293)||(14086261-14086535)
chr3 (7-281)||(16329938-16330212)
chr3 (10-327)||(12360775-12361092)
chr3 (10-334)||(11303999-11304323)
chr3 (7-282)||(11961312-11961587)
chr3 (28-328)||(8759314-8759614)
chr3 (28-328)||(13941621-13941921)
chr3 (28-328)||(41177119-41177419)
chr3 (28-293)||(16381197-16381459)
chr3 (167-337)||(18748401-18748571)
chr3 (19-328)||(16836742-16837045)
chr3 (10-136)||(31945051-31945177)
chr3 (150-314)||(8274656-8274820)
chr3 (10-134)||(31689049-31689173)
chr3 (150-337)||(16742937-16743124)
chr3 (10-328)||(44776826-44777144)
chr3 (150-328)||(15576469-15576647)
chr3 (229-314)||(17192892-17192977)
chr3 (150-314)||(13975302-13975466)
chr3 (167-348)||(21686681-21686862)
chr3 (10-58)||(12854360-12854408)
chr3 (1-45)||(320793-320836)
chr3 (290-338)||(14183145-14183193)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-348)||(20249806-20250153)
chr1 (1-348)||(17045071-17045418)
chr1 (1-348)||(21747491-21747837)
chr1 (1-348)||(20136734-20137081)
chr1 (1-341)||(50620307-50620647)
chr1 (6-348)||(19106328-19106670)
chr1 (1-348)||(33391085-33391432)
chr1 (1-348)||(51333549-51333896)
chr1 (10-348)||(16350655-16350993)
chr1 (1-348)||(21830259-21830606)
chr1 (1-348)||(16078708-16079036)
chr1 (1-348)||(21836906-21837253)
chr1 (5-335)||(19760935-19761265)
chr1 (15-348)||(16369267-16369600)
chr1 (10-348)||(41354525-41354863)
chr1 (1-218)||(50612602-50612819)
chr1 (10-335)||(19664945-19665270)
chr1 (7-328)||(37677041-37677363)
chr1 (7-300)||(31550285-31550578)
chr1 (28-320)||(20940147-20940439)
chr1 (4-146)||(21163239-21163381)
chr1 (10-335)||(19854279-19854604)
chr1 (7-299)||(20294374-20294666)
chr1 (10-326)||(20856839-20857155)
chr1 (10-328)||(22433192-22433510)
chr1 (7-328)||(20075135-20075456)
chr1 (124-335)||(41307904-41308115)
chr1 (130-300)||(11382679-11382849)
chr1 (28-282)||(20244183-20244437)
chr1 (7-203)||(20395194-20395390)
chr1 (54-335)||(20835957-20836241)
chr1 (150-337)||(20914315-20914502)
chr1 (7-86)||(24476942-24477021)
chr1 (150-314)||(20831482-20831646)
chr1 (150-281)||(46518826-46518957)
chr1 (150-212)||(22142233-22142295)
chr1 (227-319)||(20184364-20184456)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (1-341)||(30313578-30313918)
chr8 (1-348)||(19977974-19978321)
chr8 (1-348)||(21922162-21922509)
chr8 (4-341)||(16408479-16408816)
chr8 (1-348)||(15533387-15533734)
chr8 (4-348)||(21166964-21167308)
chr8 (1-348)||(21250949-21251295)
chr8 (1-348)||(32600151-32600498)
chr8 (6-348)||(22046385-22046727)
chr8 (1-341)||(22164625-22164965)
chr8 (1-348)||(21394292-21394639)
chr8 (1-348)||(21788785-21789132)
chr8 (1-348)||(23650048-23650395)
chr8 (1-341)||(22133475-22133815)
chr8 (10-348)||(17674450-17674788)
chr8 (1-348)||(19112697-19113044)
chr8 (1-348)||(20018177-20018524)
chr8 (1-348)||(22120601-22120948)
chr8 (1-348)||(22987208-22987555)
chr8 (10-348)||(19485297-19485635)
chr8 (1-301)||(22032039-22032339)
chr8 (7-335)||(20396565-20396893)
chr8 (5-267)||(23948900-23949162)
chr8 (1-233)||(15441188-15441420)
chr8 (139-348)||(22377880-22378089)
chr8 (139-348)||(22384055-22384264)
chr8 (29-335)||(21681910-21682216)
chr8 (7-328)||(6679124-6679445)
chr8 (28-293)||(20388133-20388398)
chr8 (7-328)||(6603671-6603992)
chr8 (7-299)||(804149-804441)
chr8 (10-300)||(20010375-20010665)
chr8 (10-335)||(21324849-21325175)
chr8 (10-299)||(1266255-1266544)
chr8 (10-335)||(20007866-20008191)
chr8 (7-328)||(14565155-14565476)
chr8 (10-335)||(23654943-23655268)
chr8 (10-328)||(22061880-22062198)
chr8 (10-300)||(19851427-19851717)
chr8 (10-300)||(19857463-19857753)
chr8 (10-329)||(31416920-31417239)
chr8 (1-266)||(16265127-16265392)
chr8 (7-269)||(28982370-28982632)
chr8 (7-269)||(28987590-28987852)
chr8 (7-328)||(12304771-12305092)
chr8 (10-335)||(21840433-21840758)
chr8 (7-328)||(29303873-29304194)
chr8 (7-204)||(27347239-27347436)
chr8 (28-328)||(31571289-31571589)
chr8 (232-326)||(23949158-23949252)
chr8 (150-328)||(20652780-20652958)
chr8 (151-335)||(22051020-22051204)
chr8 (150-317)||(21196960-21197127)
chr8 (270-348)||(18856853-18856931)
chr8 (298-348)||(22040163-22040213)
chr8 (150-314)||(21850798-21850962)
chr8 (150-314)||(16877556-16877720)
chr8 (150-314)||(22982592-22982756)
chr8 (150-337)||(22315347-22315534)
chr8 (160-236)||(19863223-19863299)
chr8 (160-236)||(19867860-19867936)
chr8 (202-314)||(22283204-22283316)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (4-348)||(21325790-21326134)
chr2 (4-348)||(24675064-24675408)
chr2 (4-348)||(22756987-22757331)
chr2 (4-348)||(24708006-24708350)
chr2 (1-348)||(23188580-23188927)
chr2 (1-303)||(23138609-23138911)
chr2 (1-303)||(23550399-23550701)
chr2 (16-348)||(23063664-23063996)
chr2 (1-348)||(16924832-16925179)
chr2 (1-348)||(16998572-16998919)
chr2 (1-348)||(16981724-16982071)
chr2 (1-348)||(17063289-17063636)
chr2 (1-348)||(24261942-24262289)
chr2 (1-348)||(27370841-27371188)
chr2 (1-348)||(9609708-9610055)
chr2 (1-348)||(24709605-24709952)
chr2 (4-348)||(24878519-24878863)
chr2 (1-348)||(10868422-10868769)
chr2 (1-348)||(27217588-27217935)
chr2 (1-343)||(22325385-22325727)
chr2 (10-348)||(44386093-44386431)
chr2 (4-340)||(21145562-21145898)
chr2 (1-348)||(17066950-17067294)
chr2 (1-242)||(27377101-27377342)
chr2 (87-343)||(24825811-24826067)
chr2 (7-334)||(30211455-30211782)
chr2 (5-293)||(23087026-23087314)
chr2 (7-328)||(31830236-31830557)
chr2 (12-338)||(45529100-45529420)
chr2 (7-328)||(11358418-11358739)
chr2 (7-328)||(1063329-1063650)
chr2 (7-280)||(20832563-20832836)
chr2 (1-335)||(23293530-23293864)
chr2 (10-335)||(23276357-23276682)
chr2 (10-169)||(41609047-41609206)
chr2 (19-293)||(27365658-27365932)
chr2 (30-269)||(24653946-24654185)
chr2 (7-91)||(24833354-24833438)
chr2 (28-281)||(27787340-27787593)
chr2 (28-215)||(24944966-24945153)
chr2 (28-328)||(12573952-12574252)
chr2 (252-313)||(27368391-27368452)
chr2 (150-314)||(22276000-22276164)
chr2 (169-337)||(25128387-25128555)
chr2 (150-314)||(24831745-24831909)
chr2 (150-328)||(24570212-24570390)
chr2 (150-314)||(12640477-12640641)
chr2 (229-337)||(23817588-23817696)
chr2 (1-35)||(23599843-23599877)
chr2 (4-36)||(45676685-45676717)
chr2 (13-56)||(17967574-17967617)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (7-342)||(278823-279158)
scaffold0005 (1-335)||(164709-165043)
scaffold0005 (1-348)||(308631-308978)
scaffold0005 (10-335)||(260289-260614)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (1-341)||(15154652-15154992)
chr7 (2-338)||(17319-17655)
chr7 (4-348)||(11553095-11553439)
chr7 (1-343)||(14037737-14038079)
chr7 (1-343)||(14347767-14348109)
chr7 (4-348)||(12687434-12687778)
chr7 (1-348)||(8707535-8707882)
chr7 (4-348)||(14954553-14954897)
chr7 (1-348)||(8198558-8198905)
chr7 (1-348)||(15161050-15161397)
chr7 (1-348)||(11237206-11237553)
chr7 (1-348)||(14332327-14332674)
chr7 (1-348)||(18551751-18552098)
chr7 (10-348)||(10870934-10871272)
chr7 (1-348)||(44791344-44791691)
chr7 (1-348)||(13685993-13686341)
chr7 (10-348)||(18177681-18178019)
chr7 (10-342)||(23516768-23517100)
chr7 (1-337)||(15203809-15204145)
chr7 (58-335)||(15624539-15624816)
chr7 (10-334)||(15102586-15102910)
chr7 (10-293)||(12206826-12207109)
chr7 (10-335)||(19147151-19147476)
chr7 (10-335)||(20746550-20746875)
chr7 (10-328)||(8212119-8212437)
chr7 (7-328)||(49152238-49152559)
chr7 (7-343)||(21661900-21662233)
chr7 (7-328)||(11306254-11306575)
chr7 (10-299)||(14264264-14264553)
chr7 (10-329)||(16072284-16072603)
chr7 (10-335)||(11388412-11388736)
chr7 (28-335)||(16950455-16950762)
chr7 (184-343)||(35964848-35965007)
chr7 (10-335)||(13665493-13665813)
chr7 (209-338)||(11772244-11772373)
chr7 (28-335)||(14286360-14286667)
chr7 (250-348)||(9596236-9596334)
chr7 (7-328)||(13021294-13021615)
chr7 (28-335)||(6413469-6413776)
chr7 (7-328)||(12455640-12455960)
chr7 (28-328)||(18053944-18054244)
chr7 (10-299)||(14129813-14130102)
chr7 (10-299)||(14433631-14433920)
chr7 (28-281)||(23199781-23200034)
chr7 (28-281)||(23505908-23506161)
chr7 (28-335)||(1391-1698)
chr7 (28-299)||(26288057-26288327)
chr7 (7-328)||(26118596-26118896)
chr7 (1-54)||(12254325-12254378)
chr7 (150-314)||(14936426-14936590)
chr7 (139-337)||(4439996-4440194)
chr7 (150-314)||(7823979-7824143)
chr7 (150-314)||(12368603-12368767)
chr7 (150-314)||(27107801-27107965)
chr7 (28-143)||(15340454-15340569)
chr7 (160-274)||(41213-41327)
chr7 (150-314)||(15364019-15364183)
chr7 (150-337)||(21674537-21674724)
chr7 (298-336)||(5764720-5764758)
chr7 (252-337)||(17923862-17923947)
chr7 (10-89)||(15479368-15479447)
chr7 (231-300)||(12456940-12457009)
chr7 (167-328)||(45146652-45146812)
chr7 (227-311)||(17145288-17145372)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-348)||(648-995)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-340)||(5995-6334)
scaffold0120 (28-335)||(1524-1831)
scaffold0120 (150-337)||(22815-23002)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (1-348)||(7090374-7090720)
chr4 (4-348)||(16355169-16355513)
chr4 (1-348)||(16252169-16252516)
chr4 (4-348)||(14680511-14680855)
chr4 (1-335)||(14652249-14652583)
chr4 (4-348)||(12523620-12523964)
chr4 (25-338)||(15149740-15150053)
chr4 (1-341)||(18227177-18227517)
chr4 (1-348)||(18297146-18297493)
chr4 (1-348)||(8386353-8386700)
chr4 (1-348)||(23955688-23956035)
chr4 (1-341)||(40472981-40473321)
chr4 (1-348)||(12476541-12476888)
chr4 (1-348)||(14303702-14304048)
chr4 (1-348)||(27711277-27711624)
chr4 (1-348)||(29039128-29039475)
chr4 (10-348)||(19778517-19778855)
chr4 (9-348)||(14851090-14851429)
chr4 (7-341)||(14159439-14159773)
chr4 (10-348)||(14266623-14266961)
chr4 (1-348)||(8053347-8053694)
chr4 (1-257)||(15364327-15364583)
chr4 (10-335)||(15003361-15003686)
chr4 (1-173)||(14927158-14927330)
chr4 (7-328)||(3264798-3265119)
chr4 (7-328)||(11207235-11207556)
chr4 (7-328)||(29453541-29453862)
chr4 (195-348)||(16676427-16676580)
chr4 (7-335)||(15070360-15070688)
chr4 (10-335)||(15245874-15246199)
chr4 (10-335)||(16145862-16146187)
chr4 (7-328)||(44661870-44662191)
chr4 (204-341)||(1640156-1640293)
chr4 (7-328)||(20890930-20891250)
chr4 (7-326)||(33222865-33223184)
chr4 (10-300)||(1649309-1649599)
chr4 (160-293)||(15415065-15415198)
chr4 (124-335)||(15359087-15359298)
chr4 (1-79)||(18607823-18607901)
chr4 (28-328)||(51606185-51606485)
chr4 (47-173)||(18164348-18164474)
chr4 (153-314)||(55375376-55375537)
chr4 (150-314)||(13247735-13247899)
chr4 (132-299)||(16752665-16752832)
chr4 (133-328)||(27900459-27900654)
chr4 (28-239)||(42702871-42703082)
chr4 (150-314)||(14997406-14997570)
chr4 (10-97)||(15415214-15415301)
chr4 (150-314)||(9290925-9291089)
chr4 (150-314)||(16445230-16445394)
chr4 (167-337)||(12132404-12132574)
chr4 (150-314)||(15293175-15293339)
chr4 (10-62)||(15359327-15359379)
chr4 (220-338)||(8706078-8706196)
chr4 (250-335)||(15077825-15077910)
chr4 (130-337)||(9849473-9849680)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (3-348)||(65379-65724)
scaffold0042 (4-200)||(39924-40120)
scaffold0042 (248-348)||(39806-39906)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (1-342)||(22078823-22079164)
chr6 (1-341)||(12497831-12498171)
chr6 (1-341)||(12510730-12511070)
chr6 (4-348)||(19864495-19864839)
chr6 (1-341)||(27331569-27331909)
chr6 (1-341)||(27392309-27392649)
chr6 (4-348)||(25765419-25765762)
chr6 (4-348)||(16963496-16963840)
chr6 (1-348)||(23078274-23078621)
chr6 (4-348)||(1543213-1543557)
chr6 (1-341)||(12505160-12505500)
chr6 (1-348)||(25609990-25610337)
chr6 (1-348)||(22762584-22762931)
chr6 (1-348)||(16626846-16627193)
chr6 (1-348)||(18408072-18408419)
chr6 (1-348)||(29592049-29592396)
chr6 (10-348)||(28263326-28263664)
chr6 (10-348)||(28342075-28342413)
chr6 (1-348)||(24313297-24313644)
chr6 (7-348)||(16927769-16928110)
chr6 (4-348)||(25112360-25112704)
chr6 (1-348)||(2874932-2875279)
chr6 (1-280)||(21833178-21833457)
chr6 (4-348)||(5839348-5839692)
chr6 (10-348)||(27187250-27187588)
chr6 (10-348)||(27261652-27261990)
chr6 (10-348)||(28292501-28292839)
chr6 (18-348)||(18197676-18198006)
chr6 (4-212)||(17032370-17032578)
chr6 (7-300)||(21471412-21471705)
chr6 (10-282)||(25750623-25750895)
chr6 (29-335)||(22796774-22797080)
chr6 (28-300)||(25768023-25768295)
chr6 (7-328)||(24364223-24364544)
chr6 (10-328)||(15459150-15459468)
chr6 (7-328)||(10468998-10469319)
chr6 (4-128)||(22433805-22433929)
chr6 (19-293)||(14131363-14131637)
chr6 (10-332)||(18794504-18794826)
chr6 (10-293)||(19879112-19879395)
chr6 (19-293)||(21564316-21564590)
chr6 (46-335)||(34645728-34646017)
chr6 (75-335)||(17415365-17415625)
chr6 (10-328)||(8766297-8766615)
chr6 (202-302)||(11291818-11291918)
chr6 (21-293)||(11287782-11288054)
chr6 (254-348)||(22433927-22434021)
chr6 (21-293)||(11280689-11280961)
chr6 (103-335)||(14381609-14381841)
chr6 (124-335)||(18800870-18801081)
chr6 (151-274)||(25750901-25751024)
chr6 (10-115)||(1640613-1640718)
chr6 (28-293)||(27560801-27561066)
chr6 (28-328)||(28282962-28283262)
chr6 (139-281)||(1640715-1640857)
chr6 (150-337)||(15078504-15078691)
chr6 (150-337)||(25743227-25743414)
chr6 (150-314)||(16098004-16098168)
chr6 (150-314)||(18571605-18571769)
chr6 (150-337)||(18838048-18838235)
chr6 (150-314)||(1648947-1649111)
chr6 (150-314)||(16382536-16382700)
chr6 (150-314)||(21413101-21413265)
chr6 (150-314)||(23996202-23996366)
chr6 (154-337)||(16233167-16233350)
chr6 (10-97)||(18787702-18787789)
chr6 (229-317)||(25655516-25655604)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-348)||(14332-14679)
scaffold0044 (1-348)||(592-939)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-342)||(1111-1452)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-348)||(9315-9662)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-343)||(32744-33086)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-343)||(448031-448373)
scaffold0001 (1-312)||(162085-162396)
scaffold0001 (28-335)||(90932-91239)
scaffold0001 (150-274)||(78690-78814)
scaffold0001 (118-193)||(175352-175427)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (4-348)||(33560-33904)
scaffold0109 (1-348)||(8568-8915)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-348)||(4392-4739)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-348)||(229015-229362)
scaffold0012 (1-348)||(219404-219751)
scaffold0012 (150-314)||(33016-33180)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-334)||(16959-17292)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-341)||(15465-15804)
scaffold0333 (206-341)||(15832-15967)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-348)||(5193-5540)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (4-348)||(64018-64362)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-348)||(681-1027)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-348)||(127186-127533)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (5-348)||(6348-6691)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (42-341)||(49506-49805)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (4-348)||(14852-15196)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (4-348)||(43129-43473)
scaffold0028 (11-341)||(8467-8797)
scaffold0028 (195-329)||(13832-13966)
scaffold0028 (19-293)||(50556-50830)
scaffold0028 (150-314)||(106594-106758)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (10-348)||(109798-110136)
scaffold0029 (10-293)||(112540-112823)
scaffold0029 (10-293)||(96044-96327)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (4-341)||(7352-7689)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-338)||(26530-26867)
scaffold0011 (10-299)||(148551-148840)
scaffold0011 (10-335)||(195703-196027)
scaffold0011 (10-200)||(68575-68765)
scaffold0011 (150-314)||(121971-122135)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (4-348)||(5989-6333)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (3-332)||(3114-3443)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-348)||(4004-4351)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (4-348)||(810-1153)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (4-348)||(180192-180536)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-338)||(16462-16799)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-291)||(26-316)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (10-348)||(395-733)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (5-335)||(15079-15409)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (2-340)||(14012-14350)
scaffold0106 (10-319)||(31391-31700)
scaffold0106 (247-348)||(17660-17761)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (5-335)||(111997-112327)
scaffold0004 (7-300)||(203503-203796)
scaffold0004 (7-328)||(385797-386118)
scaffold0004 (28-335)||(322703-323010)
scaffold0004 (10-335)||(117549-117874)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (3-332)||(979-1307)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (4-293)||(27942-28231)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-348)||(6909-7258)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-343)||(16408-16750)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (5-343)||(252-590)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (7-335)||(116905-117233)
scaffold0037 (150-314)||(98136-98300)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (93-348)||(7854-8109)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (28-338)||(1-311)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (5-343)||(12969-13307)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (94-348)||(21932-22186)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (7-335)||(25719-26047)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (7-338)||(5588-5918)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (7-335)||(886-1214)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (7-343)||(86496-86832)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (154-340)||(7522-7708)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (106-343)||(9047-9284)
scaffold0507 (1-104)||(6949-7052)
scaffold0507 (151-317)||(351-517)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (4-212)||(16932-17140)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (7-338)||(25068-25399)
scaffold0234 (134-281)||(16225-16372)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (10-293)||(10781-11064)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (130-348)||(767-985)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (28-335)||(47123-47430)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (28-335)||(2750-3057)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (10-335)||(79-404)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (19-335)||(26132-26448)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (28-335)||(3874-4181)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (28-278)||(28826-29076)
scaffold0064 (28-278)||(40817-41067)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (10-335)||(18537-18862)
scaffold0326 (10-61)||(3629-3680)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (39-335)||(4760-5056)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (19-299)||(19973-20253)
scaffold0298 (10-334)||(13362-13686)
scaffold0298 (10-334)||(17132-17456)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (19-300)||(7071-7352)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-335)||(27500-27825)
scaffold0139 (10-335)||(1149-1473)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (10-335)||(39720-40045)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (10-335)||(13901-14226)
scaffold0034 (64-328)||(4960-5224)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (19-335)||(21671-21987)
scaffold0235 (227-314)||(26004-26091)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (10-329)||(3872-4191)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (28-335)||(51863-52170)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (10-335)||(9779-10099)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (10-335)||(14067-14391)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (10-328)||(10090-10408)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (10-335)||(18830-19155)
scaffold0090 (112-335)||(23094-23317)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (28-300)||(5949-6220)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (10-329)||(25871-26190)
scaffold0113 (7-299)||(16654-16946)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (28-335)||(37201-37508)
scaffold0026 (124-329)||(38180-38385)
scaffold0026 (124-300)||(27372-27548)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (19-300)||(1204-1485)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (10-335)||(27207-27531)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (73-298)||(58443-58668)
scaffold0058 (29-328)||(19120-19419)
scaffold0058 (7-62)||(59045-59100)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (10-334)||(10869-11193)
scaffold0124 (19-334)||(400-715)
scaffold0124 (150-314)||(7831-7995)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (28-335)||(5002-5309)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (10-329)||(14257-14576)
scaffold0203 (10-173)||(9039-9202)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (10-328)||(61220-61538)
scaffold0067 (28-328)||(67608-67908)
scaffold0067 (10-328)||(52186-52504)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (43-193)||(4567-4717)
scaffold0023 (229-348)||(4441-4560)
scaffold0023 (4-89)||(36992-37077)
scaffold0023 (28-80)||(18993-19045)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (10-335)||(49033-49358)
scaffold0053 (10-299)||(57853-58141)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (19-237)||(1167-1385)
scaffold0165 (1-58)||(26198-26255)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (7-300)||(16748-17041)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (10-335)||(42333-42658)
scaffold0010 (10-335)||(47399-47724)
scaffold0010 (131-209)||(2252-2330)
scaffold0010 (48-90)||(2202-2244)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (7-280)||(38942-39215)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (10-293)||(172-455)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (10-328)||(6164-6483)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (10-328)||(49214-49532)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (7-328)||(26239-26560)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-293)||(509-792)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (19-293)||(33719-33993)
scaffold0076 (150-314)||(40379-40543)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (10-317)||(20103-20410)
scaffold0114 (10-328)||(43486-43804)
scaffold0114 (10-328)||(44498-44816)
scaffold0114 (10-193)||(36036-36219)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (28-173)||(2028-2173)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-89)||(6245-6333)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (28-328)||(248612-248912)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (28-335)||(12781-13088)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (28-335)||(7238-7543)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (28-208)||(13380-13560)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (10-239)||(4235-4464)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (30-328)||(42784-43082)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (244-348)||(3706-3810)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (19-188)||(136109-136278)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (151-282)||(1916-2047)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (150-337)||(1052-1239)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (150-337)||(8216-8403)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (130-335)||(5314-5519)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (184-328)||(1241-1385)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (150-314)||(46275-46439)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (160-335)||(1-176)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (150-337)||(14644-14831)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (150-337)||(14778-14965)
scaffold0132 (228-337)||(43737-43846)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (287-348)||(12745-12806)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (136-337)||(13015-13216)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (150-314)||(3280-3444)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (134-314)||(28287-28467)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (150-281)||(964-1095)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (19-86)||(45835-45902)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (150-328)||(393-571)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (153-314)||(23518-23679)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (4-53)||(7498-7547)
scaffold0101 (244-320)||(5467-5543)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (150-314)||(3896-4060)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (167-337)||(9125-9295)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (10-86)||(886-962)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (150-314)||(14758-14922)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (247-335)||(3355-3443)
scaffold0222 (10-86)||(3517-3593)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (181-337)||(13403-13559)
scaffold0021 (252-337)||(71442-71527)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (150-274)||(24001-24125)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (150-281)||(10476-10607)
scaffold0447 (150-281)||(5862-5993)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (227-314)||(26178-26265)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (252-337)||(8889-8974)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (10-79)||(9200-9269)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (150-281)||(8471-8602)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-97)||(17428-17515)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (227-337)||(1422-1532)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (150-314)||(3965-4129)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (130-328)||(10870-11068)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23573615 - 23573962
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  23573615 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 23573714  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23573715 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 23573814  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  23573815 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 23573914  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23573915 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 23573962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21984818 - 21984471
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |    
T  21984818 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgat 21984719  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21984718 acgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagt 21984619  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  21984618 gactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 21984519  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21984518 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 21984471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 343
Target Start/End: Original strand, 23440101 - 23440440
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
T  23440101 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgatacg 23440200  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23440201 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgac 23440300  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  23440301 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 23440400  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23440401 atcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 23440440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26739218 - 26738871
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  26739218 ctttagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgat 26739119  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  26739118 acgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagt 26739019  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  26739018 gaccctcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 26738919  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  26738918 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcct 26738871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 25423062 - 25423401
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |    
T  25423062 ctttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgat 25423161  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  25423162 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagt 25423261  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  25423262 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 25423361  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatct 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  25423362 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 25423401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 18775653 - 18775990
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||     
T  18775653 tggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataca 18775752  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18775753 tcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 18775852  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | ||||||    
T  18775853 tctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttga 18775952  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18775953 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 18775990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 23516417 - 23516761
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |    
T  23516417 tggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatg 23516516  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23516517 ccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 23516616  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  23516617 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 23516716  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || |||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  23516717 atgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctggtcct 23516761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 22134541 - 22134888
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22134541 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 22134640  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  22134641 aagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagt 22134740  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  22134741 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 22134840  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22134841 tgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22134888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15000252 - 14999905
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15000252 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 15000153  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15000152 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 15000053  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  15000052 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 14999953  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  14999952 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14999905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22333400 - 22333053
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22333400 ctttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 22333301  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22333300 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 22333201  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||    
T  22333200 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctct 22333101  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22333100 tggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22333053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 40708653 - 40709000
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40708653 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 40708752  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  40708753 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 40708852  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  40708853 gactctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 40708952  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  40708953 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 40709000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 34566367 - 34566714
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  34566367 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 34566466  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  34566467 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 34566566  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  34566567 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 34566666  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  34566667 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 34566714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 27 - 340
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798972
Alignment:
Q  27 aacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  127 atatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctcctt 226  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  227 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 326  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20798958  T
Q  327 ctgttgaacaatct 340  Q
    ||| ||||||||||    
T  20798959 ctgctgaacaatct 20798972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16356375 - 16356722
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  16356375 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 16356474  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  16356475 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 16356574  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  16356575 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 16356674  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16356675 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16356722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27685913 - 27685566
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27685913 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 27685814  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  27685813 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 27685714  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||    
T  27685713 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctct 27685614  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27685613 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27685566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 19769842 - 19770180
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  19769842 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 19769941  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19769942 ttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19770041  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  19770042 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 19770141  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  19770142 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19770180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 27610236 - 27610574
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27610236 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 27610335  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27610336 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27610435  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| ||||||    
T  27610436 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatc 27610535  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27610536 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27610574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 23471102 - 23471439
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  23471102 ctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgat 23471201  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||    
T  23471202 acgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagt 23471301  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||||||| |||| |    
T  23471302 gactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgt 23471401  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  23471402 tgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaat 23471439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 27518280 - 27518627
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  27518280 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 27518379  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27518380 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 27518479  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  27518480 gactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 27518579  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27518580 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27518627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37292009 - 37291662
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37292009 ctttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 37291910  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  37291909 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagt 37291810  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||    
T  37291809 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctct 37291710  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37291709 tggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 37291662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 41770715 - 41771062
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  41770715 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 41770814  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41770815 aagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 41770914  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||    
T  41770915 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctct 41771014  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  41771015 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 41771062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27668994 - 27668656
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  27668994 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27668895  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27668894 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27668795  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  27668794 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 27668695  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27668694 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27668656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348643
Alignment:
Q  17 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaac 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  117 tctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacg 216  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  217 tggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactt 316  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactt 22348611  T
Q  317 tctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  22348612 tctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 22348643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29476586 - 29476239
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29476586 ctttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 29476487  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||  | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||    
T  29476486 aagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagt 29476387  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||| |||    
T  29476386 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctct 29476287  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29476286 tggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcct 29476239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20468605 - 20468275
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  20468605 ggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgc 20468506  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    ||| ||  | | ||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20468505 cactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 20468406  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  20468405 ctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgga 20468306  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  20468305 tcaacttaacattctcagtagtttgctgaac 20468275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 20573394 - 20573626
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20573394 ctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 20573493  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||    
T  20573494 acgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagt 20573593  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaa 233  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20573594 gactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 71 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498209
Alignment:
Q  71 tcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgactt 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  171 caaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 270  Q
    |||  | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  271 tgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 21498209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21343871 - 21343666
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21343871 ctttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 21343772  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21343771 acgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagt 21343672  T
Q  201 gactct 206  Q
    ||||||    
T  21343671 gactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442472
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||||| || ||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| ||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  319 tcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||    
T  23442488 tctgtagtctgatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890938
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||| || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtctgatgaac 21890938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564189
Alignment:
Q  29 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |||| |||||| || |||||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  129 atgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 228  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||  |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttc 291  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttc 21564189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37546004 - 37545682
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  37546004 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 37545905  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  37545904 cagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37545805  T
Q  207 ca-aaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaat 305  Q
    || |||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||||| ||||||   ||    
T  37545804 cagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttat 37545705  T
Q  306 catcttaactttctcagtagtct 328  Q
    || | | ||||||||||||||||    
T  37545704 caaccttactttctcagtagtct 37545682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14887498 - 14887177
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  14887498 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14887399  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  14887398 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14887299  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  14887298 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 14887199  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  14887198 aacctgactttctcagtagtct 14887177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 25847936 - 25848229
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||    
T  25847936 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgcca 25848035  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25848036 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 25848135  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| || || || || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  25848136 caaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 25848229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798629
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 282  Q
    || ||| || || || || ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 24798629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 20342143 - 20342464
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  20342143 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 20342242  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20342243 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactct 20342342  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  20342343 cagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 20342442  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  20342443 aacctgactttctcagtagtct 20342464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21405035
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |  |||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     ||||| || || |||||||                 || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||  ||||    
T  21404915 aaaaaacacatgatctcctt----------------gttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatc 21404998  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21404999 aacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctg 21405035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735790
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
     || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||   |||| |    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24735816  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||| || || |||||||| |||||    
T  24735815 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24735790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749733
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
     || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||   |||| |    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24749759  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||| || || |||||||| |||||    
T  24749758 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24749733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339452
Alignment:
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 21339452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462132
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || || || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || ||   |||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  310 ttaactttctcagtagt 326  Q
    || |||||||| |||||    
T  22462116 ttgactttctctgtagt 22462132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737017
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 282  Q
     || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgc 24737017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22236424 - 22236099
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || | ||| |    
T  22236424 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactg 22236325  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22236324 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 22236225  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   | ||||    
T  22236224 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatc 22236125  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  22236124 ttgactttctctgtagtctgatgaac 22236099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502813
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || ||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 280  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 22502813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080275
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||  || ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||| ||||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||    |||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatc 23080297  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  23080296 atcttgactttctcagtagtct 23080275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28924272 - 28923989
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||| |    
T  28924272 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacag 28924173  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  28924172 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 28924073  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  28924072 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381381
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 22381359  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    || || || |||||||||||||    
T  22381360 attttgaccttctcagtagtct 22381381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21662546 - 21662300
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||    
T  21662546 atcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtca 21662447  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
      || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||||| || ||||| || || ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  21662446 ttgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactct 21662348  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 254  Q
     | ||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662347 tagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28895446 - 28895163
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||  |    
T  28895446 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagag 28895347  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  28895346 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 28895247  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  28895246 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28895163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 20773624 - 20773942
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||| |    
T  20773624 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacag 20773723  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| || ||||| || || |||| |||||| || ||||     
T  20773724 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcag 20773823  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || ||| | ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || |||  |||||||    
T  20773824 aaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 20773923  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || |||||||| |||||||    
T  20773924 ttgactttctctgtagtct 20773942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821635
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||  |||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 20821616  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
     |||||||||| |||||||    
T  20821617 ctaactttctctgtagtct 20821635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||  || ||||||||||||||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||||  ||||||||| || | |||||||||||| || ||||| || || ||||||||  ||| |||||||||||| | ||| || || ||| ||||    
T  21665886 tctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 254  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269519
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || ||||||||||| |  || || || |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 17269520  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  17269519 t 17269519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11211058 - 11210871
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||| ||     
T  11211058 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctc 11210959  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  11210958 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaa 11210871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21937552 - 21937388
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || || ||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  21937552 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 21937453  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  21937452 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 21937388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Original strand, 21625397 - 21625470
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatg 80  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21625397 atcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 328
Target Start/End: Original strand, 23503525 - 23503625
Alignment:
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||    
T  23503525 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtc 23503624  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  23503625 t 23503625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 24581215 - 24581379
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || || | ||| ||||| || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  24581215 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctc 24581314  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  24581315 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24581379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 27011088 - 27011252
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || |||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  27011088 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctc 27011187  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  27011188 ctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 27011252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 12497811 - 12498155
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  12497811 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 12497910  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12497911 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 12498010  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12498011 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 12498110  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12498111 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 12498155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 9522279 - 9522626
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9522279 ctttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggt 9522378  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522379 acgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 9522478  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  9522479 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttct 9522578  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9522579 tgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 9522626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 17489410 - 17489757
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |    
T  17489410 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgat 17489509  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17489510 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 17489609  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  17489610 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 17489709  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  17489710 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 17489757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16492751 - 16492404
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  16492751 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 16492652  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492651 acgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 16492552  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  16492551 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 16492452  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16492451 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 16492404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14877066 - 14876729
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||    
T  14877066 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacg 14876967  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14876966 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaac 14876867  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  14876866 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 14876767  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14876766 atcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctc 14876729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 16370976 - 16371320
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  16370976 tggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacg 16371075  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16371076 ccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgac 16371175  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  16371176 tctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 16371275  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16371276 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16371320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 10905770 - 10906117
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10905770 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 10905869  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10905870 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 10905969  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  10905970 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 10906069  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  10906070 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10906117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 15208451 - 15208798
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  15208451 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgat 15208550  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    || ||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15208551 actccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagt 15208650  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  15208651 gactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttct 15208750  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  15208751 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15208798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 16691720 - 16692060
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  16691720 ctttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgat 16691819  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16691820 atgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 16691919  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  16691920 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctct 16692019  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16692020 tgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctc 16692060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16807493 - 16807149
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16807493 tggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 16807394  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16807393 ccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgac 16807294  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  16807293 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttga 16807194  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16807193 atcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16807149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 10005160 - 10005507
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10005160 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggt 10005259  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10005260 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 10005359  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  10005360 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 10005459  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  10005460 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10005507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15348815 - 15348476
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  15348815 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 15348716  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15348715 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 15348616  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  15348615 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 15348516  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatct 340  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15348515 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 15348476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 48425007 - 48425348
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48425007 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 48425106  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  48425107 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 48425206  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  48425207 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 48425306  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctct 342  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  48425307 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 48425348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 13252250 - 13252597
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13252250 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggt 13252349  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13252350 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 13252449  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||    
T  13252450 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctct 13252549  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  13252550 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13252597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15589962 - 15589615
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  15589962 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 15589863  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15589862 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 15589763  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  15589762 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 15589663  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15589662 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15589615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16635333 - 16635680
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  16635333 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 16635432  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  16635433 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 16635532  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  16635533 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 16635632  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16635633 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16635680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26792969 - 26792622
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26792969 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggt 26792870  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  26792869 aagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagt 26792770  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  26792769 gactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 26792670  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  26792669 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 26792622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 43162657 - 43163004
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  43162657 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 43162756  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  43162757 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 43162856  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  43162857 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 43162956  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  43162957 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43163004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53385579 - 53385241
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  53385579 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 53385480  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  | || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53385479 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 53385380  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  53385379 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 53385280  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  53385279 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 53385241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20062624 - 20062277
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  20062624 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 20062525  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  20062524 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagt 20062425  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  20062424 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 20062325  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  20062324 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 20062277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 348
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248054
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttc 318  Q
     ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttc 15248024  T
Q  319 tcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  15248025 tcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15248054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15725503 - 15725157
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15725503 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 15725404  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||    
T  15725403 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 15725304  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||    
T  15725303 gactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctct 15725204  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15725203 tggatcatccgaa-tttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 15725157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15403077 - 15402733
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  15403077 tggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 15402978  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  15402977 ccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 15402878  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||     
T  15402877 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgg 15402778  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15402777 atcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15402733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16412849 - 16412505
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  16412849 tggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16412750  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  16412749 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16412650  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||||     
T  16412649 tctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttgg 16412550  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16412549 atcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16412505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5425490 - 5425153
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  5425490 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 5425391  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  5425390 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctc-a 5425292  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  5425291 aagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 5425192  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  5425191 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 5425153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 6600316 - 6600654
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  6600316 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 6600415  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||| ||||| | || ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6600416 tcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 6600515  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  6600516 aaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 6600615  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  6600616 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 6600654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16757146 - 16756808
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  16757146 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16757047  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16757046 tcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16756947  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| | |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  16756946 aaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 16756847  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16756846 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 15338832 - 15339176
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |    
T  15338832 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 15338931  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  15338932 ctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 15339031  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||     
T  15339032 tctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttgg 15339131  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15339132 atcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcct 15339176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227511
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||||||||  | || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcat 15227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953193
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||| |||||| | ||||| |||||| || ||||| ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 15953201  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  15953200 tgatgaac 15953193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 47123520 - 47123841
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  47123520 atcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 47123619  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47123620 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 47123719  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  47123720 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 47123819  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  47123820 aacctgactttctcagtagtct 47123841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 328
Target Start/End: Original strand, 10383543 - 10383866
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||  || ||    
T  10383543 ggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgc 10383642  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    ||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||     
T  10383643 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgacc 10383742  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    |||| ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |    
T  10383743 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctctta 10383842  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||| | | ||||||||||||||||    
T  10383843 tcaacctgactttctcagtagtct 10383866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 335
Target Start/End: Original strand, 14571422 - 14571752
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||  || ||    
T  14571422 ggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgc 14571521  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    ||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  14571522 cactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaact 14571621  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||   |    
T  14571622 ctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatcttttctctta 14571721  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  14571722 tcatcttgactttctccgtggtctgatgaac 14571752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15015967
Alignment:
Q  131 gatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 230  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |  ||||| ||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  231 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgt 330  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||   ||||| |||||| ||||| ||||| |||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgt 15015985  T
Q  331 tgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  15015984 tgaacaatttctggtcct 15015967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972387
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||| || |||||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 13972387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322877
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| | |  |  || ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||  || ||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||  |||||   ||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatc 13322903  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  13322902 ttgactttctctgtagtctgatgaac 13322877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134571
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||||||  | || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   |||||     
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcatt 18134597  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || ||||| || |||||||| |||||    
T  18134596 ttgactttatctgtagtctgatgaac 18134571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12850785 - 12850539
Alignment:
Q  54 aaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctagga 153  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||||||  | |||    
T  12850785 aaacacatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcgga 12850686  T
Q  154 gtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 253  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || | ||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||| | ||||||||||||||  | ||| | ||||    
T  12850685 gtcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgct 12850586  T
Q  254 tatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12850585 tgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttct 12850539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10420595 - 10420285
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||  |||||||| |    
T  10420595 acatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 10420496  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | || |||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  10420495 ttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 10420396  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| || |||  |||||||    
T  10420395 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 10420296  T
Q  310 ttaactttctc 320  Q
     | ||||||||    
T  10420295 ctgactttctc 10420285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086535
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  || ||||| ||||| ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14086535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329938
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctg 16329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360775
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||  | || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||  |||| || ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||    ||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 12360793  T
Q  310 ttaactttctcagtagtc 327  Q
    || |||||||| ||||||    
T  12360792 ttgactttctctgtagtc 12360775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11304323 - 11303999
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||      
T  11304323 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacta 11304224  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||    |||||||     
T  11304223 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcag 11304124  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  11304123 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 11304024  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaa 334  Q
    || || ||||| |||| ||| ||||    
T  11304023 tttaccttctccgtagcctgatgaa 11303999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961312
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    |  | |||||||| || || || |||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| || ||||  ||||  |||| ||||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 282  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11961312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759314
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 8759315  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  8759314 t 8759314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941921
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 13941920  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  13941921 t 13941921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177419
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 41177418  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  41177419 t 41177419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381197
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||||||||  || || || |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| || || || ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
      ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||||||| || |||||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcat 16381197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 337
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748571
Alignment:
Q  167 acttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| || || || ||  ||||||||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  267 cttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaa 18748571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16837045 - 16836742
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |      | || ||||| ||| | ||||  || | |||||| ||||  |    
T  16837045 ggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagt------ggtgtggtggcaaaccaactctatatgtcaccgttccaatcc 16836952  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  16836951 tctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatg 16836852  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttc 318  Q
     || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||  || ||||||| |||||    |||||||| || |||    
T  16836851 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttc 16836752  T
Q  319 tcagtagtct 328  Q
    ||||| ||||    
T  16836751 tcagtcgtct 16836742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 31945051 - 31945177
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||   || ||||| |    
T  31945051 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 31945150  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacg 136  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31945151 ttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8274820 - 8274656
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  8274820 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 8274721  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  8274720 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 8274656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31689173 - 31689049
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||| | ||||  || ||||| |    
T  31689173 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactg 31689074  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgata 134  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31689073 ttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16743124 - 16742937
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  ||||| |||||| ||| |||||     
T  16743124 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctc 16743025  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  16743024 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 16742937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 44776826 - 44777144
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||    
T  44776826 acatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccg 44776925  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | || |  || || || || |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| |     
T  44776926 ttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttag 44777025  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || ||||| ||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  44777026 aaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 44777125  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || ||||| || |||||||    
T  44777126 ttgactttttctgtagtct 44777144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 328
Target Start/End: Original strand, 15576469 - 15576647
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  15576469 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 15576568  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| ||||||  || | ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||    
T  15576569 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 15576647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 314
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192977
Alignment:
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 17192977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13975466 - 13975302
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| | || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  13975466 aggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 13975367  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| ||||||  |  | ||||| || || ||||||||||||||    
T  13975366 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 13975302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686862
Alignment:
Q  167 acttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 266  Q
    |||||||||| ||||||||| | || ||| || | ||||| |||||||| || || ||  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  267 cttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||| |    ||| ||  || ||||||| ||||| |||| ||||||||| || || ||||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  21686781 cttcttcttactttgagactctttcatcttttcctgaaacatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaatttctggtcct 21686862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 12854408 - 12854360
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaca 58  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854408 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaaca 12854360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 320793 - 320836
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 45  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320793 ctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14183193 - 14183145
Alignment:
Q  290 tcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  14183193 tcatcttttcctgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaat 14183145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 20249806 - 20250153
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20249806 ctttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggt 20249905  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20249906 acgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagt 20250005  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  20250006 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 20250105  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  20250106 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcct 20250153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17045418 - 17045071
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  17045418 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 17045319  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  17045318 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagt 17045219  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  17045218 gactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 17045119  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17045118 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 17045071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21747491 - 21747837
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21747491 ctttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggt 21747590  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21747591 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagt 21747690  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  21747691 gactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 21747789  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21747790 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 21747837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 20136734 - 20137081
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || |    
T  20136734 ctttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgat 20136833  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20136834 acgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 20136933  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  20136934 gactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctct 20137033  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  20137034 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 20137081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50620647 - 50620307
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  50620647 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgat 50620548  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  50620547 atgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagt 50620448  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| |    
T  50620447 gactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgt 50620348  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  50620347 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctc 50620307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 19106328 - 19106670
Alignment:
Q  6 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||    
T  19106328 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgcc 19106427  T
Q  106 accgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19106428 accgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactc 19106527  T
Q  206 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaat 305  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19106528 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 19106627  T
Q  306 catcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  19106628 catcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19106670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33391432 - 33391085
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  33391432 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 33391333  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33391332 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 33391233  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  33391232 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 33391133  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  33391132 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 33391085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 51333896 - 51333549
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51333896 ctttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 51333797  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  51333796 aagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 51333697  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  51333696 gactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 51333597  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  51333596 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 51333549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16350993 - 16350655
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  16350993 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16350894  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16350893 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16350794  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  16350793 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16350694  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  16350693 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 16350655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21830259 - 21830606
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21830259 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 21830358  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21830359 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 21830458  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  21830459 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 21830558  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |  ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21830559 tagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 21830606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16079036 - 16078708
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  16079036 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 16078937  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16078936 acgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 16078837  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||                   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  16078836 gactctcaaaaacacgtggtctccttc-------------------ctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 16078756  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16078755 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16078708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21836906 - 21837253
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  21836906 ctttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 21837005  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21837006 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 21837105  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||    
T  21837106 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctct 21837205  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21837206 tggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 21837253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19761265 - 19760935
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  19761265 ggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgc 19761166  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19761165 caccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgact 19761066  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  19761065 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgga 19760966  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  19760965 tcaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 19760935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369600
Alignment:
Q  15 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtccca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  115 actctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaata 214  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  215 cgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttac 16369566  T
Q  315 tttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
     || ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16369567 cttttcaatagtttgttgaacaatctctggtcct 16369600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41354863 - 41354525
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  41354863 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 41354764  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41354763 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 41354664  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  41354663 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 41354564  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  41354563 tgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 41354525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50612819 - 50612602
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  50612819 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgat 50612720  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  50612719 atgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagt 50612620  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtg 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50612619 gactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664945
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19664971  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  19664970 ttgactttctctgtagtctgatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 37677041 - 37677363
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||    
T  37677041 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 37677140  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  37677141 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37677240  T
Q  207 caa-aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaat 305  Q
    ||| ||| || || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    ||    
T  37677241 caagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttat 37677340  T
Q  306 catcttaactttctcagtagtct 328  Q
    || | | ||||||||||||||||    
T  37677341 caacctgactttctcagtagtct 37677363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550285
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttct 31550285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940147
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| || || ||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || || || ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctc 320  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||||||| ||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 20940147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 21163239 - 21163381
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  21163239 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtaag 21163338  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaa 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21163339 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854604
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19854578  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  19854579 ttgactttctctgtagtctgatgaac 19854604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 299
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294666
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    || ||| || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 20294666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856839
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || || || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||   |||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatc 20856856  T
Q  310 ttaactttctcagtagt 326  Q
    || |||||||| |||||    
T  20856855 ttgactttctccgtagt 20856839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22433510 - 22433192
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  22433510 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 22433411  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |  |||| || || || || ||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22433410 ttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22433311  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
     || || || || || || |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  22433310 gaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 22433211  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||| || |||||||    
T  22433210 ttaactttttctgtagtct 22433192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075135
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||   || ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || || ||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     | ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||| |  ||||||| |||||    |||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcatcttttcccttatc 20075157  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  20075156 aacctgactttctcagtagtct 20075135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 335
Target Start/End: Original strand, 41307904 - 41308115
Alignment:
Q  124 gatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctc 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| |||| |||||| || |||| ||| || |||||||    
T  41307904 gatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctc 41308003  T
Q  224 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagt 323  Q
    | ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   || || || |||||||| ||    
T  41308004 cctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgt 41308103  T
Q  324 agtctgttgaac 335  Q
    |||||| |||||    
T  41308104 agtctgatgaac 41308115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Original strand, 11382679 - 11382849
Alignment:
Q  130 tgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || || || || || |    
T  11382679 tgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcct 11382778  T
Q  230 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  11382779 gaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 11382849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 282
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244437
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| || || || |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 282  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20395390 - 20395194
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  20395390 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20395291  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    |  | |||||||| || || || ||||||||||| || ||  |||||||||| ||| | ||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||    
T  20395290 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20836241 - 20835957
Alignment:
Q  54 aaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctagga 153  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  | |||    
T  20836241 aaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttgga 20836142  T
Q  154 gtcaacttcttt---gacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 250  Q
    |||||||||||    ||||| || |  ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || || | ||||| |||  | || | ||    
T  20836141 gtcaacttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaac 20836042  T
Q  251 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  20836041 gcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 20835957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 20914315 - 20914502
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  20914315 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 20914414  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    |  |||| |||||||||||| | || ||||||  || | ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  20914415 catttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 20914502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Original strand, 24476942 - 24477021
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 86  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24476942 atcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtgg 24477021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20831646 - 20831482
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  20831646 aggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 20831547  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  20831546 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 20831482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Original strand, 46518826 - 46518957
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  46518826 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctc 46518925  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  46518926 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctg 46518957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22142295 - 22142233
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  22142295 aggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaa 22142233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 319
Target Start/End: Original strand, 20184364 - 20184456
Alignment:
Q  227 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttct 319  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||| || | ||||||  |||||  ||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  20184364 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatcttcactttct 20184456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30313918 - 30313578
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  30313918 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 30313819  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30313818 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 30313719  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30313718 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctct 30313619  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30313618 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 30313578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 19977974 - 19978321
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |    
T  19977974 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgtt 19978073  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19978074 acgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 19978173  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  19978174 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 19978273  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19978274 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 19978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21922509 - 21922162
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21922509 ctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggt 21922410  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21922409 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagt 21922310  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  21922309 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttct 21922210  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21922209 tgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 21922162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16408816 - 16408479
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16408816 tggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 16408717  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16408716 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgac 16408617  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16408616 tctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttga 16408517  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16408516 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16408479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 15533387 - 15533734
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  15533387 ctttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 15533486  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  15533487 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagt 15533586  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||    
T  15533587 gactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 15533686  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15533687 tgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 15533734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21167308 - 21166964
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  21167308 tggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacg 21167209  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21167208 ccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 21167109  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  21167108 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 21167009  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21167008 atcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 21166964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21250949 - 21251295
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  21250949 ctttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 21251048  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251049 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 21251148  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | | |||    
T  21251149 gactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttca-tctctct 21251247  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21251248 ttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 21251295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 32600151 - 32600498
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |    
T  32600151 ctttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgat 32600250  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32600251 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 32600350  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  32600351 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctct 32600450  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  32600451 tgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctggtcct 32600498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 348
Target Start/End: Original strand, 22046385 - 22046727
Alignment:
Q  6 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  22046385 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgcc 22046484  T
Q  106 accgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046485 accgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactc 22046584  T
Q  206 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaat 305  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22046585 tcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaat 22046684  T
Q  306 catcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22046685 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22046727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22164965 - 22164625
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  22164965 ctttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 22164866  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22164865 gcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagt 22164766  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||| ||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  22164765 gactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 22164666  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22164665 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22164625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21394639 - 21394292
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  21394639 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggt 21394540  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21394539 acgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagt 21394440  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  21394439 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctct 21394340  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||    
T  21394339 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcct 21394292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21789132 - 21788785
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  21789132 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggt 21789033  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21789032 acgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagt 21788933  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  21788932 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctct 21788833  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||    
T  21788832 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcct 21788785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23650048 - 23650395
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  23650048 ctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgat 23650147  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  23650148 aagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagt 23650247  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| || || |||    
T  23650248 gactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctct 23650347  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  23650348 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 23650395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22133815 - 22133475
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |    
T  22133815 ctttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgat 22133716  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22133715 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagt 22133616  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    | |||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  22133615 gtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 22133516  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22133515 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22133475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17674788 - 17674450
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17674788 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 17674689  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17674688 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17674589  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  17674588 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 17674489  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  17674488 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17674450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 19112697 - 19113044
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19112697 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 19112796  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19112797 aagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 19112896  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  19112897 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 19112996  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  19112997 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcct 19113044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20018524 - 20018177
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  20018524 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 20018425  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20018424 aagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 20018325  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  20018324 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 20018225  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  20018224 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 20018177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22120948 - 22120601
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22120948 ctttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 22120849  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | |  ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  22120848 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagt 22120749  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||    
T  22120748 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctct 22120649  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22120648 tggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcct 22120601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 22987208 - 22987555
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22987208 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 22987307  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||    
T  22987308 acgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagt 22987407  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||    
T  22987408 gactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctct 22987507  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  22987508 tgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcct 22987555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19485635 - 19485297
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  19485635 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 19485536  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19485535 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19485436  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  19485435 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 19485336  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | |||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  19485335 tgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 19485297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 22032039 - 22032339
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  22032039 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgat 22032138  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22032139 acgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 22032238  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  22032239 gactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 22032338  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  22032339 t 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396565
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    |  |  ||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatc 20396594  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20396593 aacttaaccttctcagtagtttgttgaac 20396565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 267
Target Start/End: Original strand, 23948900 - 23949162
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23948900 ggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgc 23948999  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    |||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  23949000 caccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgact 23949099  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 267  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949100 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 15441188 - 15441420
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    || || |    
T  15441188 ctttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgat 15441287  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  15441288 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagt 15441387  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaa 233  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  15441388 gactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 139 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377880
Alignment:
Q  139 ccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaa 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  239 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22377890  T
Q  339 ctctgctcct 348  Q
     |||| ||||    
T  22377889 ttctggtcct 22377880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 139 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384055
Alignment:
Q  139 ccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaa 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  239 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22384065  T
Q  339 ctctgctcct 348  Q
     |||| ||||    
T  22384064 ttctggtcct 22384055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21682216 - 21681910
Alignment:
Q  29 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| || ||||| || || |||||    
T  21682216 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 21682117  T
Q  129 atgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 228  Q
     |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  21682116 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 21682017  T
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  21682016 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 21681917  T
Q  329 gttgaac 335  Q
    | |||||    
T  21681916 gatgaac 21681910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 6679124 - 6679445
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  6679124 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6679223  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  6679224 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6679323  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  6679324 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 6679423  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  6679424 aacctgactttctcagtagtct 6679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388398
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||  || | ||| ||||||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | | ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcat 20388398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 6603671 - 6603992
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  6603671 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6603770  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| ||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  6603771 ctgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6603870  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  6603871 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 6603970  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  6603971 aacctgactttctcagtagtct 6603992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 804441 - 804149
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  804441 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 804342  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  804341 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 804242  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  804241 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttc 804149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010375
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 20010375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324849
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-gatgcggtggtaaatccactcggtacgccacc 108  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||| | ||||  || |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  109 gtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 208  Q
    || ||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  209 aaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcat 308  Q
     |||||| || || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||   |||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcat 21324876  T
Q  309 cttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21324875 cttgactttctctgtagtctgatgaac 21324849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266544
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 1266544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008191
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20008165  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  20008166 tttaccttctccgtagtctgatgaac 20008191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 14565155 - 14565476
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  14565155 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14565254  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  14565255 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14565354  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  14565355 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 14565454  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  14565455 aacctgactttctcagtagtct 14565476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 23654943 - 23655268
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |   ||  |||| |    
T  23654943 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactg 23655042  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | | ||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  23655043 ttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23655142  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |  || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  23655143 aaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 23655242  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  23655243 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 23655268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22062198 - 22061880
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  22062198 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 22062099  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22062098 ttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 22061999  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |   ||||||    
T  22061998 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatc 22061899  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || |||||||| |||||||    
T  22061898 ttgactttctctgtagtct 22061880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851717
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| || || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 19851717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857753
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| || || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 19857753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416920
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||| || || | |||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||  |||||    ||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatcatc 31416940  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctg 329  Q
    || |||||||||||||||||    
T  31416939 ttgactttctcagtagtctg 31416920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16265392 - 16265127
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  |    
T  16265392 ctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctat 16265293  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| || ||  |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  16265292 atgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagt 16265193  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 266  Q
    ||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265192 gaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 28982370 - 28982632
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  28982370 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28982469  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| ||| || || || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  28982470 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28982569  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 269  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982570 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 28987590 - 28987852
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  28987590 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28987689  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| ||| || || || |||||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  28987690 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28987789  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 269  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987790 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305092
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | ||  |||| || || || || ||||||||||| || ||  |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     | ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 12305070  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  12305071 aacctgactttctcagtagtct 12305092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 21840433 - 21840758
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  ||||| ||| ||||| |    
T  21840433 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 21840532  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||  || | ||| ||||| || | |||||| ||||| |     
T  21840533 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttag 21840632  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| || |||| || ||||||   ||||||    
T  21840633 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatc 21840732  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  21840733 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 21840758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303873
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| ||| || || || ||||||||||| || |   | |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 29303895  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||  | ||||||||||||||||    
T  29303894 attctgactttctcagtagtct 29303873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 27347239 - 27347436
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |||   || ||||    
T  27347239 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgcca 27347338  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    | |||||||| || || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27347339 ctgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571289
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||| ||||| ||| | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||| || || || ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 31571290  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  31571289 t 31571289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 232 - 326
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949252
Alignment:
Q  232 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 326  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagt 23949252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20652958 - 20652780
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||| | ||| |||||     
T  20652958 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctc 20652859  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | ||||| |||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20652858 ctcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtct 20652780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 151 - 335
Target Start/End: Original strand, 22051020 - 22051204
Alignment:
Q  151 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 250  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||||| || || || ||||||||||||||  | || || |    
T  22051020 ggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctcc 22051119  T
Q  251 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||    |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  22051120 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaac 22051204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21197127 - 21196960
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||  || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || || ||| | |||||||||| ||| |||||     
T  21197127 aggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctc 21197028  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaacttt 317  Q
    | |||||||||||||||| | || | ||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21197027 ctcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 21196960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 348
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856931
Alignment:
Q  270 ttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18856931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 348
Target Start/End: Original strand, 22040163 - 22040213
Alignment:
Q  298 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22040163 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22040213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21850962 - 21850798
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| | || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||  |     
T  21850962 aggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatc 21850863  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21850862 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 21850798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16877720 - 16877556
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || || ||||| ||||| ||| | || ||||| || || || |||||  | |||||||||| ||| || ||     
T  16877720 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctc 16877621  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  16877620 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16877556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 22982592 - 22982756
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||| ||||| || | ||||| |||||  | || || ||  | |||||||||| ||||||||      
T  22982592 aggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcac 22982691  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  22982692 cttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaac 22982756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 22315347 - 22315534
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| || || ||||| || |||||| | ||||||||||| || || || ||  | ||||||||||  || || ||     
T  22315347 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctc 22315446  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||    
T  22315447 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaa 22315534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 236
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863299
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactc 236  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactc 19863299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 236
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19867936
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactc 236  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactc 19867936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 314
Target Start/End: Original strand, 22283204 - 22283316
Alignment:
Q  202 actctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttctt 301  Q
    ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |  ||||||||||||||||| |  | ||||||  ||||| ||||||| || |    
T  22283204 actcttaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctacctactctgagacactctcattttctcct 22283303  T
Q  302 gaatcatcttaac 314  Q
    |||||||||||||    
T  22283304 gaatcatcttaac 22283316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21326134 - 21325790
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  21326134 tggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 21326035  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326034 ccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21325935  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  21325934 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 21325835  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21325834 atcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcct 21325790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 24675064 - 24675408
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  24675064 tggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacg 24675163  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24675164 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgac 24675263  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  24675264 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttga 24675363  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24675364 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 24675408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22757331 - 22756987
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  22757331 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 22757232  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22757231 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 22757132  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  22757131 tctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 22757032  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22757031 atcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcct 22756987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24708350 - 24708006
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  24708350 tggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 24708251  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24708250 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 24708151  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  24708150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 24708051  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24708050 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtcct 24708006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23188580 - 23188927
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  23188580 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgat 23188679  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23188680 acgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 23188779  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  23188780 gactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 23188879  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23188880 tgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 23188927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 23138609 - 23138911
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  23138609 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgat 23138708  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23138709 atgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagt 23138808  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23138809 gactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23138908  T
Q  301 tga 303  Q
    |||    
T  23138909 tga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 23550399 - 23550701
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  23550399 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgat 23550498  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23550499 atgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagt 23550598  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23550599 gactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23550698  T
Q  301 tga 303  Q
    |||    
T  23550699 tga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 348
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063996
Alignment:
Q  16 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaa 115  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  116 ctctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatac 215  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  216 gtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||     
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 23063963  T
Q  316 ttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  23063964 ttctcggtagtttgttcaacaatctctggtcct 23063996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16924832 - 16925179
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16924832 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 16924931  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16924932 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 16925031  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  16925032 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 16925131  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16925132 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16925179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16998572 - 16998919
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16998572 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 16998671  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16998672 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 16998771  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  16998772 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 16998871  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16998872 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16998919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16981724 - 16982071
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16981724 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 16981823  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16981824 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 16981923  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  16981924 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 16982023  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16982024 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16982071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 17063289 - 17063636
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17063289 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 17063388  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17063389 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 17063488  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  17063489 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 17063588  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  17063589 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17063636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24261942 - 24262289
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24261942 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 24262041  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24262042 aagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 24262141  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  24262142 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 24262241  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  24262242 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24262289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 27370841 - 27371188
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27370841 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggt 27370940  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  27370941 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagt 27371040  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  27371041 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 27371140  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27371141 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 9609708 - 9610055
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  9609708 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 9609807  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  9609808 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 9609907  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  9609908 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 9610007  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  9610008 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 9610055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24709605 - 24709952
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | || |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24709605 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 24709704  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24709705 aagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 24709804  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  24709805 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 24709904  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  24709905 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24709952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24878863 - 24878519
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  24878863 tggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaag 24878764  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  24878763 ccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgac 24878664  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  24878663 tctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 24878564  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  24878563 atcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24878519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 10868422 - 10868769
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10868422 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 10868521  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10868522 aagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 10868621  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  10868622 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctct 10868721  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  10868722 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10868769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 27217588 - 27217935
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27217588 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 27217687  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  27217688 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagt 27217787  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  27217788 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 27217887  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  27217888 tgtatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcct 27217935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22325727 - 22325385
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  22325727 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 22325628  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22325627 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 22325528  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  22325527 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 22325428  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22325427 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 22325385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44386431 - 44386093
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44386431 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 44386332  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44386331 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 44386232  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||| ||||||    
T  44386231 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatc 44386132  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  44386131 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44386093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21145898 - 21145562
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  21145898 tggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataag 21145799  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  21145798 ccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgac 21145699  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  21145698 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 21145599  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatct 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||    
T  21145598 atcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatct 21145562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 17066950 - 17067294
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||      
T  17066950 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgta 17067046  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17067047 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 17067146  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  17067147 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 17067246  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  17067247 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17067294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27377342 - 27377101
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || || |    
T  27377342 ctttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgat 27377243  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27377242 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 27377143  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatc 242  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27377142 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24826067 - 24825811
Alignment:
Q  87 taaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaaca 186  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24826067 taaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaaca 24825968  T
Q  187 ccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccaca 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  24825967 ccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacg 24825868  T
Q  287 ctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  24825867 ctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctg 24825811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211455
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    ||  ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||  ||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatc 30211483  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaa 334  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||    
T  30211482 aacttaaccttctcagtagtctgttgaa 30211455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 23087026 - 23087314
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  23087026 ggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgc 23087125  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||||    
T  23087126 cactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgact 23087225  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  23087226 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcat 23087314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 31830236 - 31830557
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  31830236 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 31830335  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31830336 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 31830435  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  31830436 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 31830535  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  31830536 aacctgactttctcagtagtct 31830557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 338
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529420
Alignment:
Q  12 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtc 111  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  112 ccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 211  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || |||||||  |||||||| || |  || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  212 atacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatctt 311  Q
    | || |||      |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||  ||||| |||    
T  45529300 acacatgg------tcttcaaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaactt 45529393  T
Q  312 aactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45529394 aaccttcttagtagtctgttgaacaat 45529420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358418
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||| | || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 11358440  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  11358439 aacctgactttctcagtagtct 11358418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 1063329 - 1063650
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  1063329 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgcca 1063428  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| ||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  1063429 cagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 1063528  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  || |||| ||||||   |||    
T  1063529 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatc 1063628  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  1063629 aaccttactttctcagtagtct 1063650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Original strand, 20832563 - 20832836
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  20832563 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20832662  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20832663 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20832762  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 280  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20832763 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 20832836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 23293530 - 23293864
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||  |    
T  23293530 ctttgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctat 23293629  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | ||||| || ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||    
T  23293630 atgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 23293729  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
     ||||||| |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23293730 aactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23293829  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
       |||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  23293830 ctgatcatcttgactttctctatagtctgatgaac 23293864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 23276357 - 23276682
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  23276357 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23276456  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| || ||||| |||||  ||| |||||| | |||||     
T  23276457 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcag 23276556  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  23276557 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 23276656  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
     | |||||||| |||||||| |||||    
T  23276657 atgactttctccgtagtctgatgaac 23276682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41609206 - 41609047
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  41609206 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggtaagccaccg 41609107  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgact 169  Q
    | |||||||||||| | || |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  41609106 ttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365658
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||| || |||||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    |||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||| ||||| || || ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 27365658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  30 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatata 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || |||||  |  | || ||     
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  130 tgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 229  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  230 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 269  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833354
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaat 24833354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 281
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787593
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 27787593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 215
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945153
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| || |  || |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatac 215  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatac 24945153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574252
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||||||||  || || || |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  || || || || | |||||| || || || ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 12574251  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  12574252 t 12574252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  252 cttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 22276000 - 22276164
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  22276000 aggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 22276099  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  22276100 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 337
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128555
Alignment:
Q  169 ttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||| || || || ||  ||||||||||||  || || || |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  269 tttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||| ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  25128487 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaa 25128555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24831909 - 24831745
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || || || ||||||| |||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||  |     
T  24831909 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgtt 24831810  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  24831809 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24831745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24570390 - 24570212
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| || ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  24570390 aggagtcaacttccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 24570291  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | |||||||||||| ||||| | || ||||||  ||  |||||| || |||||| |||||||||| || || |||||||    
T  24570290 ctcttatcatgatagctcttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtct 24570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12640641 - 12640477
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || || ||||| ||||| ||| | || ||||| || || || |||||  | |||||||||| ||| || ||     
T  12640641 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctc 12640542  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  12640541 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 12640477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23817696 - 23817588
Alignment:
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23817696 tgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaactttttccgtagtct 23817597  T
Q  329 gttgaacaa 337  Q
     ||| ||||    
T  23817596 cttgcacaa 23817588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 23599843 - 23599877
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactt 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599843 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 45676717 - 45676685
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttc 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676717 tggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967574
Alignment:
Q  13 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaa 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatgaaa 17967574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 279158 - 278823
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  279158 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 279059  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  279058 ccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactct 278959  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  278958 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatc 278859  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctct 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  278858 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 278823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 165043 - 164709
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  165043 ctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgat 164944  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  164943 acgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagt 164844  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  164843 gactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 164744  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  164743 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 164709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 308631 - 308978
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  308631 ctttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 308730  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  308731 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 308830  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  308831 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 308930  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  308931 tggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 308978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 260289 - 260614
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||   ||||  || |||||||    
T  260289 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccg 260388  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | | ||  || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  260389 ttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 260488  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||    ||||||    
T  260489 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 260588  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || |||||||| ||||| |||||    
T  260589 ttgaccttctcagtcgtctgatgaac 260614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15154992 - 15154652
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15154992 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggt 15154893  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15154892 aagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 15154793  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  15154792 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttct 15154693  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15154692 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15154652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17655 - 17319
Alignment:
Q  2 tttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  17655 tttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgata 17556  T
Q  102 cgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17555 cgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtg 17456  T
Q  202 actctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttctt 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  17455 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 17356  T
Q  302 gaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17355 gaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 17319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11553439 - 11553095
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  11553439 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataag 11553340  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  11553339 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgac 11553240  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11553239 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttga 11553140  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  11553139 atcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11553095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 14037737 - 14038079
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14037737 ctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 14037836  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  14037837 acgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagt 14037936  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  14037937 gactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttct 14038036  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14038037 tgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 14347767 - 14348109
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14347767 ctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 14347866  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  14347867 acgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagt 14347966  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  14347967 gactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttct 14348066  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14348067 tgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14348109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 12687434 - 12687778
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  12687434 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataag 12687533  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  12687534 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12687633  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12687634 tcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 12687733  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12687734 atcatcttaactttctcagtagtctgttggacaatctctggtcct 12687778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 8707535 - 8707882
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8707535 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 8707634  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8707635 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 8707734  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  8707735 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 8707834  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8707835 tggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 8707882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 14954553 - 14954897
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |    
T  14954553 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataag 14954652  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14954653 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgac 14954752  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  14954753 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 14954852  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  14954853 atcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcct 14954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 8198558 - 8198905
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8198558 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 8198657  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8198658 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 8198757  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  8198758 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 8198857  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  8198858 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8198905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15161397 - 15161050
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15161397 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 15161298  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15161297 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 15161198  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||    
T  15161197 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctct 15161098  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15161097 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15161050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11237553 - 11237206
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11237553 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 11237454  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11237453 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 11237354  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| | |||    
T  11237353 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctct 11237254  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  11237253 tggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11237206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 14332327 - 14332674
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14332327 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggt 14332426  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14332427 aagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 14332526  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  14332527 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 14332626  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  14332627 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 14332674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18552098 - 18551751
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18552098 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 18551999  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18551998 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 18551899  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  18551898 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 18551799  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18551798 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18551751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 10870934 - 10871272
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10870934 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10871033  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10871034 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10871133  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  10871134 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 10871233  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  10871234 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10871272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44791691 - 44791344
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  44791691 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 44791592  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  44791591 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 44791492  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  44791491 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 44791392  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  44791391 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44791344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 13685993 - 13686341
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg-aaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcgg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  13685993 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcgg 13686092  T
Q  100 tacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggag 199  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  13686093 taagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 13686192  T
Q  200 tgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  13686193 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctc 13686292  T
Q  300 ttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  13686293 ttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13686341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 18177681 - 18178019
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  18177681 acatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18177780  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  18177781 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaa 18177880  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||    
T  18177881 gaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatc 18177980  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18177981 taaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18178019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23517100 - 23516768
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  23517100 acatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 23517001  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23517000 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 23516901  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| | ||||||    
T  23516900 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatc 23516801  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctct 342  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23516800 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 23516768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15203809 - 15204145
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15203809 ctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 15203908  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    || | ||||| |||| |||||| |  || |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  |||    
T  15203909 actctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagt 15204008  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||     
T  15204009 gactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttca 15204108  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    || |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  15204109 tggatcaacttaaccttctctgtagtttgctgaacaa 15204145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 58 - 335
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624816
Alignment:
Q  58 acatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtca 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  158 acttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 257  Q
    | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  258 atgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || ||||||| || ||||| |||| |||||| |||| |||||| || |||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaac 15624816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15102910 - 15102586
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  15102910 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15102811  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15102810 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaa 15102711  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||    
T  15102710 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatc 15102611  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaa 334  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  15102610 ttgactttctctgtagtctgatgaa 15102586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206826
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |  ||||||| || ||||| || |||| |||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12206826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147476
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 19147450  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  19147451 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 19147476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746875
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20746849  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  20746850 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 20746875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212119
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||| |    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaac 8212138  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
     | ||||||||||||||||    
T  8212137 ctgactttctcagtagtct 8212119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 49152238 - 49152559
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  49152238 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 49152337  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  49152338 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 49152437  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  49152438 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 49152537  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  49152538 aacctgactttctcagtagtct 49152559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662233
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||    ||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    ||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    |||||| || ||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||  ||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatc 21662196  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    | |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  21662197 aacttaacattttcattagtctgttgaacaatgtctg 21662233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11306575 - 11306254
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  11306575 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11306476  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  11306475 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 11306376  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  11306375 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 11306276  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  11306275 aacctgactttctcagtagtct 11306254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14264553 - 14264264
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  14264553 acatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 14264454  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14264453 ttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcag 14264354  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  14264353 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 14264264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072284
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 16072304  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctg 329  Q
    || || |||||  |||||||    
T  16072303 ttgaccttctccatagtctg 16072284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388412
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
     || || || ||||| |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||   |||| |    
T  11388536 gaacacatgatctcc-tcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 11388438  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||| || || |||||||| |||||    
T  11388437 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 11388412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950455
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||| | ||||  || ||||| || ||||| ||||| || |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    |||||||| |||||||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 16950463  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  16950462 tgatgaac 16950455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35965007 - 35964848
Alignment:
Q  184 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcc 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  35965007 acactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgcg 35964908  T
Q  284 acactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    || | ||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35964907 acgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctg 35964848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665813
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 13665787  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| ||||| || |||||    
T  13665788 ttgactttctctgtagtttgatgaac 13665813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11772373 - 11772244
Alignment:
Q  209 aaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||  |||||||||||||    
T  11772373 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcat 11772274  T
Q  309 cttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11772273 cttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 11772244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286360
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||  || |  || |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||    |||||||| || |||||||| |||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 14286368  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  14286367 tgatgaac 14286360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 348
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596334
Alignment:
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 9596334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021615
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || ||||| || || || || |||||||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| || |||   || || |||| ||||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 13021593  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  13021594 atcttgaccttctcagtagtct 13021615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 6413469 - 6413776
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| || || || |    
T  6413469 acatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaa 6413568  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||| || |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  6413569 tctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctc 6413668  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||||||| |||||||||||||||    
T  6413669 ctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 6413768  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  6413769 tgatgaac 6413776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455960
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||| | | ||  || ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || | |||||| || || || |||||| ||||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    |||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 12455938  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  12455939 accttgactttctcagtagtct 12455960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053944
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||| || || || ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 18053945  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  18053944 t 18053944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14129813 - 14130102
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||| ||    
T  14129813 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14129912  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||  || ||  | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||  ||||  ||||| ||||| ||    
T  14129913 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14130012  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  14130013 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 14130102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 14433631 - 14433920
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||| ||    
T  14433631 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14433730  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||  || ||  | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||  ||||  ||||| ||||| ||    
T  14433731 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14433830  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  14433831 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 14433920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199781
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || | || ||| || |  || || || |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 23199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505908
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || | || ||| || |  || || || |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 23505908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1391
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||  || ||||| |||||  | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| || ||| ||| ||| ||| || || || || ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||  || ||||||| |||||    |||||||| || ||||||||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtc 1399  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  1398 tgatgaac 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288057
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || | ||| ||||| || |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctc 26288128  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
     ||||| || ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  26288127 ctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 26288057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118596
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||                    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaa---------------- 26118813  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
         |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  26118812 -----ccaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26118718  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  |||||||  |||||   |||    
T  26118717 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctcttatc 26118618  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  26118617 aacctgactttctcagtagtct 26118596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 12254378 - 12254325
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatga 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254378 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatga 12254325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 14936426 - 14936590
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||| || || || ||  | ||||||||||  || |||||     
T  14936426 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctc 14936525  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  14936526 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 14936590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 337
Target Start/End: Original strand, 4439996 - 4440194
Alignment:
Q  139 ccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaa 238  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||| |||  | ||||||||||| || || || ||  | ||||||||||    
T  4439996 ccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaa 4440095  T
Q  239 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
      || || || | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  4440096 tgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 4440194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 7823979 - 7824143
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  7823979 aggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 7824078  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  7824079 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7824143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12368767 - 12368603
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  | |||||||  |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| |||| ||| |||||     
T  12368767 aggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctc 12368668  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12368667 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaac 12368603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27107965 - 27107801
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  27107965 aggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 27107866  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  27107865 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 27107801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 143
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||||| ||||  || || || |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  128 tatgatacggaccaat 143  Q
    | ||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41213
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 259  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  260 gataactcttttgtc 274  Q
    |||| ||||| ||||    
T  41227 gatagctcttctgtc 41213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 15364019 - 15364183
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| || |||||||| |||||| || | ||||||||||| || || || ||  | ||||||||||  || |||||     
T  15364019 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctc 15364118  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  15364119 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15364183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21674724 - 21674537
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||| |  | ||||||||||| || || || ||  ||||||| ||||  || || ||     
T  21674724 aggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctc 21674625  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| || |||||||||||||||  ||| || ||||||| ||| ||||    
T  21674624 ctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctcttgcacaa 21674537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 336
Target Start/End: Original strand, 5764720 - 5764758
Alignment:
Q  298 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaaca 336  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5764720 tcttgaatcattttaactttctcagtagtctgttgaaca 5764758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Original strand, 17923862 - 17923947
Alignment:
Q  252 cttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    |||||||||| ||||||| || | | ||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||    
T  17923862 cttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaa 17923947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479368
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 89  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaa 15479368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457009
Alignment:
Q  231 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttct 12457009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 328
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146812
Alignment:
Q  167 acttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || | | ||||||||| || || || ||  |||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  267 cttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||| | |  ||||||  || ||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtct 45146812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17145372 - 17145288
Alignment:
Q  227 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatctt 311  Q
    |||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||||||||| || | ||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  17145372 cttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatctt 17145288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 648 - 995
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || || |    
T  648 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgat 747  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  748 acgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 847  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  848 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttct 947  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  948 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6334
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5995 ctttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 6094  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6095 acgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgt 6194  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||    
T  6195 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctct 6294  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatct 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  6295 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 6334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1524
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||  |||||| || ||| |  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    |||||||| ||||||||  |||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtc 1532  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  1531 tgatgaac 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 22815 - 23002
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| |  |||||||| |||||| || | ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  22815 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 22914  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  22915 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 23002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 7090374 - 7090720
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7090374 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 7090473  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7090474 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagt 7090572  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||    
T  7090573 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctct 7090672  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  7090673 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 7090720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16355513 - 16355169
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16355513 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 16355414  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16355413 ccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 16355314  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  16355313 tctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 16355214  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16355213 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16252516 - 16252169
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |    
T  16252516 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgat 16252417  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16252416 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagt 16252317  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||    
T  16252316 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctct 16252217  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16252216 tgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcct 16252169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 14680511 - 14680855
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  14680511 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 14680610  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14680611 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgac 14680710  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14680711 tctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttga 14680810  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14680811 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14680855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 14652249 - 14652583
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  14652249 ctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgat 14652348  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  14652349 acgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagt 14652448  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  14652449 gactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 14652548  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14652549 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 14652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 12523620 - 12523964
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  12523620 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacg 12523719  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  12523720 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12523819  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12523820 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 12523919  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  12523920 atcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12523964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149740
Alignment:
Q  25 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  125 atatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctcc 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  225 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagta 324  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaata 15149754  T
Q  325 gtctgttgaacaat 338  Q
    ||||| ||||||||    
T  15149753 gtctgctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18227517 - 18227177
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  18227517 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgat 18227418  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18227417 acgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 18227318  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  18227317 gactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 18227218  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  18227217 tgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctc 18227177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 18297146 - 18297493
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18297146 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 18297245  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18297246 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 18297345  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  18297346 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 18297445  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18297446 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18297493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 8386353 - 8386700
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8386353 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 8386452  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8386453 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 8386552  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  8386553 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 8386652  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  8386653 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8386700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23955688 - 23956035
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  23955688 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 23955787  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23955788 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 23955887  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  23955888 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 23955987  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  23955988 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 23956035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 40472981 - 40473321
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40472981 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 40473080  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||| ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  40473081 aagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 40473180  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||    
T  40473181 gactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctct 40473280  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40473281 tgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 40473321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 12476541 - 12476888
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12476541 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggt 12476640  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12476641 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 12476740  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  12476741 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 12476840  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  12476841 tggatcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12476888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14304048 - 14303702
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14304048 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 14303949  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  14303948 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 14303850  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||    
T  14303849 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctct 14303750  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14303749 tggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14303702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 27711277 - 27711624
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  27711277 ctttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 27711376  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27711377 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagt 27711476  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  27711477 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 27711576  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27711577 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27711624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29039475 - 29039128
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  29039475 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 29039376  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  29039375 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagt 29039276  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  29039275 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 29039176  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  29039175 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29039128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19778855 - 19778517
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  19778855 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccg 19778756  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19778755 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19778656  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||    
T  19778655 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 19778556  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  19778555 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19778517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14851429 - 14851090
Alignment:
Q  9 cacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccacc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14851429 cacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacc 14851330  T
Q  109 gtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 208  Q
    || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  14851329 gttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaa 14851230  T
Q  209 aaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcat 308  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||    
T  14851229 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcat 14851130  T
Q  309 cttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14851129 cttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcct 14851090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 14159439 - 14159773
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14159439 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagcca 14159538  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  14159539 ccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactct 14159638  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    ||  || || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  14159639 caggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatc 14159738  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14159739 atcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctc 14159773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14266961 - 14266623
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14266961 acatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 14266862  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  14266861 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaa 14266762  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||   ||||||    
T  14266761 aaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatc 14266662  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  14266661 tgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14266623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8053694 - 8053347
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  8053694 ctttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggt 8053595  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8053594 aagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 8053495  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  8053494 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 8053395  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  8053394 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 8053347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 15364327 - 15364583
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15364327 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 15364426  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15364427 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 15364526  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364527 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003361
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15003387  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  15003386 ttgactttctccgtagtctgatgaac 15003361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14927330 - 14927158
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14927330 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagt 14927231  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaa 173  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14927230 acgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaa 14927158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3265119 - 3264798
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  3265119 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 3265020  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  3265019 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 3264920  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  3264919 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 3264820  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  3264819 aacctgactttctcagtagtct 3264798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11207556 - 11207235
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  11207556 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 11207457  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11207456 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 11207357  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  11207356 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 11207257  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  11207256 aacctgactttctcagtagtct 11207235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29453862 - 29453541
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  29453862 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 29453763  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  29453762 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 29453663  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  29453662 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 29453563  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  29453562 aaccttactttctcagtagtct 29453541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676427
Alignment:
Q  195 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcatt 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  295 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16676427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070688
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||| ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||  | | |||||||||| |  |||||||  | || || ||||| |||| ||||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15070659  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15070660 atcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 15245874 - 15246199
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| ||||| |    
T  15245874 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactg 15245973  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || | ||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||| || |||||||     
T  15245974 ttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcag 15246073  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  15246074 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15246173  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||  |||||||| |||||    
T  15246174 tttaccttcttcgtagtctgatgaac 15246199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146187
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    |||| |    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcacc 16146161  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  16146162 ttgactttctccgtagtctgatgaac 16146187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661870
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | |||||||  || || |||||||| |||| |||||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 44661892  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  44661891 aacctgactttctcagtagtct 44661870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 204 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640156
Alignment:
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 1640156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891250
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||| |||  |  || ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttgg-aaacccatcctatatgcca 20891028  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || ||||| || || || || ||||||| |||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 20891228  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  20891229 aacctgactttctcagtagtct 20891250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 326
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223184
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| |  || || |||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 33223164  T
Q  307 atcttaactttctcagtagt 326  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  33223165 aacttgactttctcagtagt 33223184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649309
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||  || ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||  || || ||||| |||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 1649309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415065
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 259  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  260 gataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 15415065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15359298 - 15359087
Alignment:
Q  124 gatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctc 223  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||  |||||| || ||||    
T  15359298 gatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctc 15359199  T
Q  224 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagt 323  Q
    | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| || ||||| ||    
T  15359198 cctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgt 15359099  T
Q  324 agtctgttgaac 335  Q
    |||||| |||||    
T  15359098 agtctgatgaac 15359087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 18607901 - 18607823
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18607901 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606185
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 51606186  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  51606185 t 51606185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164348
Alignment:
Q  47 acacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaa 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  147 tctaggagtcaacttctttgacttcaa 173  Q
      | ||||||| |||||| ||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaa 18164348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375376
Alignment:
Q  153 agtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 252  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  253 ttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaac 55375376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 13247735 - 13247899
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  | ||||||||  ||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||||||     
T  13247735 aggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctc 13247834  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || |||||||||||||||||    
T  13247835 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 13247899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 299
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752832
Alignment:
Q  132 atacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttga 231  Q
    |||||||||||| ||  | ||||| |||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || || || || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  232 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 16752832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 328
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900654
Alignment:
Q  133 tacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaa 232  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||  |||| |||||| || |||| ||| || || || || || ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  233 actcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 27900654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703082
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| || | ||| || || |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 42703070  T
Q  228 ttgaaactcaag 239  Q
    ||||||||||||    
T  42703071 ttgaaactcaag 42703082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 14997406 - 14997570
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || |||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  14997406 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 14997505  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14997506 ctcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaac 14997570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415214
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactc 97  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactc 15415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 9290925 - 9291089
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  | |||||| | ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  9290925 aggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 9291024  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  9291025 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 9291089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16445394 - 16445230
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || || || |||||||||||| | || || ||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  16445394 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctc 16445295  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  16445294 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16445230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132404
Alignment:
Q  167 acttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||| || || || ||  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  267 cttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    ||| || | ||| ||  || | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 12132404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15293339 - 15293175
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || || || ||| |||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  15293339 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctc 15293240  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  15293239 cttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15293175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359327
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatc 62  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatc 15359327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 338
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706196
Alignment:
Q  220 tctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttct 319  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||   || | ||||||||| |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  320 cagtagtctgttgaacaat 338  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaat 8706196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 335
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15077910
Alignment:
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15077910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9849680 - 9849473
Alignment:
Q  130 tgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 229  Q
    ||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  |    ||||||||||| |  || |||||  |||    
T  9849680 tgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccgactt 9849581  T
Q  230 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 329  Q
    |||| |||| ||| || ||  | ||||||||| ||||||| |  | ||||| | |  ||||||| || || |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  9849580 gaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagtctg 9849481  T
Q  330 ttgaacaa 337  Q
     |||||||    
T  9849480 ctgaacaa 9849473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 348
Target Start/End: Original strand, 65379 - 65724
Alignment:
Q  3 ttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  65379 ttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataa 65478  T
Q  103 gccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtga 202  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  65479 gccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtga 65578  T
Q  203 ctctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttg 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  65579 ctctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttg 65678  T
Q  303 aatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  65679 aatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 65724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40120 - 39924
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  ||||    
T  40120 tggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacg 40021  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40020 ccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39806
Alignment:
Q  248 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcc 39807  T
Q  348 t 348  Q
    |    
T  39806 t 39806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22079164 - 22078823
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22079164 ctttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 22079065  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22079064 acgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagt 22078965  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||    
T  22078964 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttct 22078865  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctct 342  Q
     ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22078864 ggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctct 22078823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 12497831 - 12498171
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  12497831 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 12497930  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  12497931 acgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagt 12498030  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  12498031 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 12498130  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12498131 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12498171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12511070 - 12510730
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  12511070 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 12510971  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  12510970 acgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagt 12510871  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  12510870 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 12510771  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12510770 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12510730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 19864495 - 19864839
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  19864495 tggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 19864594  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19864595 ccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgac 19864694  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  19864695 tctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 19864794  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  19864795 atcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcct 19864839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27331909 - 27331569
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27331909 ctttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 27331810  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27331809 acgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagt 27331710  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  27331709 gactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttct 27331610  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27331609 tgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27331569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27392649 - 27392309
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27392649 ctttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 27392550  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27392549 acgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagt 27392450  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  27392449 gactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttct 27392350  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27392349 tgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27392309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25765762 - 25765419
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||     
T  25765762 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataca 25765663  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  25765662 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcaca-gcgtgac 25765564  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  25765563 tctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttga 25765464  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25765463 atcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 25765419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16963840 - 16963496
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||    
T  16963840 tggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacg 16963741  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16963740 ccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 16963641  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  16963640 tctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 16963541  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16963540 atcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 16963496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23078274 - 23078621
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  23078274 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 23078373  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  23078374 acgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagt 23078473  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||    
T  23078474 gactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttct 23078573  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  23078574 tgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 23078621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1543557 - 1543213
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1543557 tggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 1543458  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  1543457 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgac 1543358  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  1543357 tctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttga 1543258  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  1543257 atcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 1543213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 12505160 - 12505500
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  12505160 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 12505259  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  12505260 acgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagt 12505359  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  12505360 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctct 12505459  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12505460 tgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctc 12505500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25610337 - 25609990
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || || |    
T  25610337 ctttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgat 25610238  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  25610237 acgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgt 25610138  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| || |||    
T  25610137 gactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 25610038  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  25610037 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 25609990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22762931 - 22762584
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  22762931 ctttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgat 22762832  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22762831 acgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 22762732  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | | |||||||| || |||    
T  22762731 gactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctct 22762632  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  22762631 tgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcct 22762584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16627193 - 16626846
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  16627193 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggt 16627094  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16627093 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 16626994  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  16626993 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 16626894  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  16626893 tggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcct 16626846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18408419 - 18408072
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |    
T  18408419 ctttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgat 18408320  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  18408319 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagt 18408220  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||||| || |||    
T  18408219 tactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctct 18408120  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18408119 tgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 18408072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29592396 - 29592049
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  29592396 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggt 29592297  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29592296 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 29592197  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  29592196 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 29592097  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  29592096 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29592049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28263664 - 28263326
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  28263664 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 28263565  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28263564 tcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 28263465  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  28263464 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 28263365  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  28263364 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28263326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28342413 - 28342075
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  28342413 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 28342314  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28342313 tcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 28342214  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  28342213 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 28342114  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  28342113 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28342075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24313644 - 24313297
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24313644 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 24313545  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24313544 aagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 24313445  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  24313444 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 24313345  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  24313344 tggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24313297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16928110 - 16927769
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |  || |||||||    
T  16928110 atcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaagacgatacgcca 16928011  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16928010 ccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactct 16927911  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  16927910 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatc 16927811  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16927810 atctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 16927769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 25112360 - 25112704
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  25112360 tggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 25112459  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  25112460 ccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 25112559  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  25112560 tctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttga 25112659  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||    
T  25112660 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcct 25112704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2875279 - 2874932
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2875279 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 2875180  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  2875179 aagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 2875080  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||    
T  2875079 gactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctct 2874980  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  2874979 tggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 2874932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21833457 - 21833178
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  21833457 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 21833358  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21833357 acgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagt 21833258  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 280  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833257 gactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 21833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5839692 - 5839348
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  5839692 tggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacg 5839593  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  5839592 ccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgac 5839493  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |    
T  5839492 tctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaa 5839393  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5839392 atcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 5839348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 27187250 - 27187588
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27187250 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccg 27187349  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27187350 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27187449  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  27187450 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 27187549  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27187550 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27187588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27261990 - 27261652
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  27261990 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccg 27261891  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27261890 ttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27261791  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  27261790 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 27261691  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  27261690 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27261652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28292839 - 28292501
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  28292839 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 28292740  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||  | || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28292739 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 28292640  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  28292639 aaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatc 28292540  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  28292539 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28292501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197676
Alignment:
Q  18 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaact 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||   || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  118 ctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgt 217  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| |||||| |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  218 ggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaacttt 317  Q
    | | ||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttacctt 18197707  T
Q  318 ctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  18197706 ctcagtagtctgttaaacaatcgctggtcct 18197676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 17032370 - 17032578
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17032370 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 17032469  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  17032470 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgac 17032569  T
Q  204 tctcaaaaa 212  Q
    |||||||||    
T  17032570 tctcaaaaa 17032578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471705
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || ||||| || |||||| |||||||  | |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||| ||||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 21471705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Original strand, 25750623 - 25750895
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  25750623 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 25750722  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||||||||     
T  25750723 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcag 25750822  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 282  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25750823 aaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 25750895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796774
Alignment:
Q  29 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| || ||||| || || |||||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  129 atgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 228  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||| || ||||||| |||||    ||||||||||| ||||| |||||||    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtct 22796781  T
Q  329 gttgaac 335  Q
    | |||||    
T  22796780 gatgaac 22796774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768295
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | || ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 25768295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364544
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||  | |||||||  || || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 24364522  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  24364523 aacctgactttctcagtagtct 24364544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459468
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| || |||  |||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 15459449  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
     | |||||||| |||||||    
T  15459450 ctgactttctccgtagtct 15459468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10468998
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 10469020  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  10469019 aacctgactttctcagtagtct 10468998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 22433805 - 22433929
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  22433805 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 22433904  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatat 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  22433905 ccaccgttccaactctttccgatat 22433929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131363
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||  || ||||| || |||||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||||||||| |||| ||| || ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 332
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794826
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
     || || || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||   |||| |    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 18794803  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttg 332  Q
    ||||| || || |||||||||||    
T  18794804 ttaaccttttctgtagtctgttg 18794826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879395
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| |  || ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| | || |||||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcat 19879395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564316
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || || ||| ||||||  |||||||| || ||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcat 21564316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645728
Alignment:
Q  46 gacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataa 145  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | | ||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  146 atctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 245  Q
    |  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  246 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||   |||| |||||| || || ||||| ||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaac 34645728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415625
Alignment:
Q  75 aagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaa 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  175 gctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 274  Q
    || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  275 gactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    |||||| | || ||||||| |||||    |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 17415625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766297
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |  |||| || ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| | || | ||||| ||||||   ||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatc 8766316  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || |||||||| |||||||    
T  8766315 ttgactttctctgtagtct 8766297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 302
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  202 actctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttctt 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  302 g 302  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287782
Alignment:
Q  21 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctt 120  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||| |||| |  || ||||| || ||||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  121 tccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggt 220  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||| ||||||||||| || || || |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  221 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 348
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434021
Alignment:
Q  254 tatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22434021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280689
Alignment:
Q  21 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctt 120  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||| |||| |  || ||||| || ||||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  121 tccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggt 220  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||  |||| ||||| |||| ||| |||| |||||| || || || |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  221 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14381841 - 14381609
Alignment:
Q  103 gccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtga 202  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |    
T  14381841 gccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 14381742  T
Q  203 ctctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttg 302  Q
    | |||| |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||      
T  14381741 ccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctct 14381642  T
Q  303 aatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
     |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14381641 tatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 14381609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 335
Target Start/End: Original strand, 18800870 - 18801081
Alignment:
Q  124 gatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctc 223  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  | ||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || || |    
T  18800870 gatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccc 18800969  T
Q  224 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagt 323  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  18800970 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 18801069  T
Q  324 agtctgttgaac 335  Q
    |||||| |||||    
T  18801070 agtctgatgaac 18801081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 274
Target Start/End: Original strand, 25750901 - 25751024
Alignment:
Q  151 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 250  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25750901 ggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 25751000  T
Q  251 gcttatcatgataactcttttgtc 274  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751001 gcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 115
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640718
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 1640712  T
Q  110 tcccaa 115  Q
    ||||||    
T  1640713 tcccaa 1640718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560801
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || |||||||| ||||  || || || |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 27560801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28282962
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||  || ||||||||||| |  || || || |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||| ||||| ||  | |||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||| || || || ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 28282963  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  28282962 t 28282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 281
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640857
Alignment:
Q  139 ccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaa 238  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  239 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 1640857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15078691 - 15078504
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || || ||  | |||||||| | ||| |||||     
T  15078691 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctc 15078592  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
      |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| |||||| | ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  15078591 ttcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 15078504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25743414 - 25743227
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| |||||| || |  | |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  25743414 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 25743315  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || || |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  25743314 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 25743227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 16098004 - 16098168
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  16098004 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 16098103  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||   || ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  16098104 ctcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaac 16098168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 18571605 - 18571769
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||||| || |||||| | |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  18571605 aggagtctacttcctatacttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 18571704  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  18571705 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaac 18571769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18838235 - 18838048
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  | |||||||| ||||||||| | || | |||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  18838235 aggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 18838136  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| | |  ||||||  || | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  18838135 ctcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 18838048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1649111 - 1648947
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  1649111 aggagtcaacttcccacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 1649012  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1649011 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 1648947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16382700 - 16382536
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  16382700 aggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 16382601  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  16382600 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16382536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21413265 - 21413101
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||| ||| || |  || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  21413265 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 21413166  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21413165 ctcttatcatgataactcttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaac 21413101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 23996202 - 23996366
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || |||| |||| | || || ||||| ||||| || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  23996202 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctc 23996301  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  23996302 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 23996366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 337
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233350
Alignment:
Q  154 gtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 253  Q
    ||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || || ||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  254 tatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||  || | ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 16233350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787789
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactc 97  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactc 18787789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 317
Target Start/End: Original strand, 25655516 - 25655604
Alignment:
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaacttt 317  Q
    ||||||||||  || ||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25655516 tgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 14332 - 14679
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  14332 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgat 14431  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14432 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagt 14531  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  14532 gactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 14631  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14632 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 592 - 939
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  592 ctttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggt 691  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  692 aagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagt 791  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  792 gactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 891  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  892 tggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcct 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 1111 - 1452
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 1210  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  1211 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagt 1310  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  1311 gactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatct 1410  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctct 342  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1411 tgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctct 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 9315 - 9662
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9315 ctttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 9414  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9415 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 9514  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| || |||    
T  9515 gactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctct 9614  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  9615 tgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctctggtcct 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33086 - 32744
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33086 ctttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 32987  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  32986 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagt 32887  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||    
T  32886 gactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttct 32787  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  32786 tgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctg 32744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 448031 - 448373
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  448031 ctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgat 448130  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  448131 gcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagt 448230  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  448231 gactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttct 448330  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  448331 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 448373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 162085 - 162396
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  162085 ctttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggt 162184  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  162185 acgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagt 162284  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  162285 gactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcactctttct 162384  T
Q  301 tgaatcatctta 312  Q
    | ||||||||||    
T  162385 taaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90932
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | | ||| |||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||  |||||| ||||||| ||| || || ||||| ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 90940  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  90939 tgatgaac 90932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 78814 - 78690
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || |||||| || | ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  78814 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 78715  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtc 274  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  78714 ctcttatcatgataactcttctgtc 78690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  118 ctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtca 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33904 - 33560
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  33904 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacg 33805  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    |||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  33804 ccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 33705  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  33704 tttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttga 33605  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33604 atcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 33560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 8568 - 8915
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  8568 ctttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 8667  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  8668 acgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagt 8767  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  8768 gactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 8867  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8868 tgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4739 - 4392
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  4739 ctttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgat 4640  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  4639 acgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagt 4540  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||    
T  4539 gactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctct 4440  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4439 tgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 4392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 229015 - 229362
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||    
T  229015 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggt 229114  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||||    
T  229115 acgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagt 229214  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  229215 gactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 229314  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  229315 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 229362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 219751 - 219404
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |    
T  219751 ctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgat 219652  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  219651 acgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagt 219552  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  219551 gactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 219452  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  219451 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcct 219404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33180 - 33016
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  33180 aggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 33081  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33080 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 16959 - 17292
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  16959 ctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgat 17058  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||    
T  17059 acgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagt 17158  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17159 gactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttct 17258  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaa 334  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17259 tgaatcatcttaaccttcacagtagtttgttgaa 17292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 15465 - 15804
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |    
T  15465 ctttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgat 15563  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  15564 atgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaat 15663  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  15664 gactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 15763  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15764 tgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15967
Alignment:
Q  206 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  306 catcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 5193 - 5540
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  5193 ctttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgat 5292  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5293 acgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 5392  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  5393 gactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 5492  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  5493 tgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 5540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 64362 - 64018
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  64362 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacg 64263  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  64262 ccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgac 64163  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  64162 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 64063  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  64062 atcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcct 64018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1027 - 681
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  1027 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgat 928  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  927 acgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagg 828  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || |||    
T  827 gactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctct 729  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  728 tgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 127533 - 127186
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  127533 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 127434  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  127433 acgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagt 127334  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| || |||    
T  127333 gactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctct 127234  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  127233 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 127186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Original strand, 6348 - 6691
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||  |    
T  6348 ggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatatac 6447  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6448 caccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 6547  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||    
T  6548 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaa 6647  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  6648 tcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 42 - 341
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49805
Alignment:
Q  42 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggacca 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  142 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  242 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 14852 - 15196
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14852 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacg 14951  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14952 ccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 15051  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    | |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  15052 tatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttga 15151  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  15152 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 43129 - 43473
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  43129 tggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatg 43228  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  43229 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgac 43328  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  43329 tctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttga 43428  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  43429 atcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 341
Target Start/End: Original strand, 8467 - 8797
Alignment:
Q  11 catgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  8467 catgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccaccct 8566  T
Q  111 cccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaa 210  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8567 tccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaa 8666  T
Q  211 aatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatct 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  8667 aatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 8766  T
Q  311 taactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8767 gaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13966
Alignment:
Q  195 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcatt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  295 ttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 329  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagtctg 13966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50556
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  || ||||| ||||| ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||| | ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 50556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 106758 - 106594
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||  | |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  106758 aggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 106659  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |  ||||||| || || ||||||||| ||||    
T  106658 ctcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaac 106594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 110136 - 109798
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  110136 acatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 110037  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  110036 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 109937  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  109936 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 109837  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  109836 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 109798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112823
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| |  || ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     || || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 112823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 96327 - 96044
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||  |||||||| |    
T  96327 acatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 96228  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||||    
T  96227 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaa 96128  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  96127 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 96044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 7352 - 7689
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  7352 tggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaag 7451  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  7452 ccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 7551  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  7552 tctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 7651  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctc 341  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7652 atcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctc 7689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26867 - 26530
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  26867 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 26768  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26767 acgccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagt 26668  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  26667 aactctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 26568  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26567 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 26530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148840
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || ||  |||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    |||||| || || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 148840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 196027 - 195703
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  196027 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 195928  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||  | || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  195927 ttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 195828  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | || ||||||| || |||   ||||||    
T  195827 aaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatc 195729  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  195728 ttgactttctctgtagtctgatgaac 195703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 68765 - 68575
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  68765 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 68666  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||    
T  68665 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 122135 - 121971
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  122135 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 122036  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || |||||||| |||||    
T  122035 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaac 121971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 5989 - 6333
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||    
T  5989 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacg 6088  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6089 ccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgac 6188  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  6189 tcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 6288  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  6289 atcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcct 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 332
Target Start/End: Original strand, 3114 - 3443
Alignment:
Q  3 ttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtac 102  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  3114 ttggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatac 3213  T
Q  103 gccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtga 202  Q
    |||||||| |||| ||||||  |||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3214 gccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtga 3313  T
Q  203 ctctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttg 302  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  3314 ctctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttg 3413  T
Q  303 aatcatcttaactttctcagtagtctgttg 332  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3414 gatcatcttaaccttctcagtagtttgttg 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 4004 - 4351
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |    
T  4004 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgat 4103  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4104 acgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagt 4203  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  4204 gactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 4303  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||| ||||    
T  4304 tggatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacgatttctggtcct 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1153 - 810
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  | ||||| ||      
T  1153 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaactcgatatt 1054  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    ||||| | ||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1053 ccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 954  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| || ||||||    
T  953 tctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttga 855  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  854 atcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Original strand, 180192 - 180536
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  180192 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacg 180291  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    |||| || | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  180292 ccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaac 180391  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttga 303  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  180392 tctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttga 180491  T
Q  304 atcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  180492 atcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcct 180536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16799 - 16462
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16799 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgat 16700  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  16699 acgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagt 16600  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |    
T  16599 gactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttat 16500  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16499 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 16462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 316 - 26
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  316 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgat 217  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  216 acgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagt 117  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttc 291  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  116 gactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Original strand, 395 - 733
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  395 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactg 494  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  495 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 594  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||| ||||||    
T  595 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatc 694  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  695 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15079
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15409 ggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 15310  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15309 caccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 15210  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    |||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |    
T  15209 ctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttgga 15110  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15109 tcaacttaaccttctcagtagtttgttgaac 15079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Original strand, 14012 - 14350
Alignment:
Q  2 tttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggta 101  Q
    |||||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  14012 tttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgata 14111  T
Q  102 cgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14112 cgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtg 14211  T
Q  202 actctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttctt 301  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||    
T  14212 actatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctt 14311  T
Q  302 gaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatct 340  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||    
T  14312 gaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatct 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 31391 - 31700
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  31391 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 31490  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||  || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| || ||| |||||||     
T  31491 ttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcag 31590  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  31591 aaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 31690  T
Q  310 ttaactttct 319  Q
    || |||||||    
T  31691 ttgactttct 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 348
Target Start/End: Original strand, 17660 - 17761
Alignment:
Q  247 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctc 346  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtc 17759  T
Q  347 ct 348  Q
    ||    
T  17760 ct 17761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 335
Target Start/End: Original strand, 111997 - 112327
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  111997 ggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 112096  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  112097 caccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 112196  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  || |||| |||||||| |    
T  112197 ctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttgga 112296  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  112297 tcaacttaaccttctcaatagtttgttgaac 112327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 203796 - 203503
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||    
T  203796 atcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 203697  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  203696 ctgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactct 203597  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  203596 tagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 203503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386118
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || ||||| || || | ||| |||||  | ||||||||||||||  ||||||| || |  || ||||| |||  ||||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || |||||  || ||||| ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||   |||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 386096  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||| ||||| |||||||    
T  386097 atcttaaccttctccgtagtct 386118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 322703 - 323010
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||  || ||||| || || ||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || || || ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtc 323002  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  323003 tgatgaac 323010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 117549 - 117874
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  117549 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 117648  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||  |||| |||||| || ||||     
T  117649 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcag 117748  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||| || |||   ||||||    
T  117749 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatc 117848  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| ||||| || |||||    
T  117849 ttgactttctccgtagtatgatgaac 117874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 332
Target Start/End: Original strand, 979 - 1307
Alignment:
Q  3 ttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtac 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  979 ttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtac 1078  T
Q  103 gccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtga 202  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  1079 gccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtga 1178  T
Q  203 ctctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttg 302  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||     
T  1179 ctctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctt- 1277  T
Q  303 aatcatcttaactttctcagtagtctgttg 332  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  1278 aatcgtcttaaccttctcagtagtttgttg 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 27942 - 28231
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  27942 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacg 28041  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28042 ccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaac 28141  T
Q  204 tctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28142 tctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 6909 - 7258
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaga-tgcggtggtaaatccactcgg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  6909 ctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcgg 7008  T
Q  100 tacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggag 199  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  7009 taagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggag 7108  T
Q  200 tgactctcaaaaat-acgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcatttttt 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  7109 tgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 7208  T
Q  299 cttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||  ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  7209 cttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 7258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16750 - 16408
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  | |    
T  16750 ctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgat 16651  T
Q  101 acgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagt 200  Q
    |||||||| | |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  16650 acgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagt 16551  T
Q  201 gactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  16550 gaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttct 16451  T
Q  301 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16450 tgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 252
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
    |||| | ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 291  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  290 tcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttctg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116905
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatc 116934  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  116933 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 116905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 98136 - 98300
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || |||| |||| | || || ||||| ||||| || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  98136 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactc 98235  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  98236 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 98300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8109
Alignment:
Q  93 cactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtc 192  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  193 acaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttca 292  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  293 ttttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 8109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 338
Target Start/End: Original strand, 1 - 311
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  | ||||||||||||||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |  || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtc 300  T
Q  328 tgttgaacaat 338  Q
    || ||||||||    
T  301 tgctgaacaat 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13307 - 12969
Alignment:
Q  5 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgc 104  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||| ||||||  |||||    
T  13307 ggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgc 13208  T
Q  105 caccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgact 204  Q
     ||| | || | |||||| ||||| ||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13207 taccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 13108  T
Q  205 ctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaa 304  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  13107 ctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 13008  T
Q  305 tcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  13007 tcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctg 12969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 94 - 348
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22186
Alignment:
Q  94 actcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtca 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  194 caggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  294 tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
     || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcct 22186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25719
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  |  |||| |  ||| |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     |||||||| |||| |||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||     
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatt 25748  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  25747 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 25719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5588
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | |||||||||||||  || |||||||||| |||| |||| || |||| ||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||  ||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 5620  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    | |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  5619 aacttaaccttctctgttgtttgttgaacaat 5588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 886 - 1214
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||| || |||||||| |||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatc 1185  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
      |||||  ||||||||||| || |||||    
T  1186 cacttaatcttctcagtagtttgctgaac 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86496
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || | |||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||| ||||||   |||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatc 86533  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  86532 aacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctg 86496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 340
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7708
Alignment:
Q  154 gtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  254 tatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatct 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9284
Alignment:
Q  106 accgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactc 205  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  206 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaat 305  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  306 catcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctg 9284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 6949 - 7052
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |    
T  6949 ctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaacccactcgat 7048  T
Q  101 acgc 104  Q
    ||||    
T  7049 acgc 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 351
Alignment:
Q  151 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 250  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || ||||||| ||| |||||| | |||||||| || || || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  251 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaacttt 317  Q
     |||||||||||||||||| || | ||||||  |  ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 16932 - 17140
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacg 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||    
T  16932 tggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacg 17031  T
Q  104 ccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 203  Q
    |||||||   ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  17032 ccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 17131  T
Q  204 tctcaaaaa 212  Q
    |||||||||    
T  17132 tctcaaaaa 17140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25068
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
     | ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||     
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatt 25100  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtctgttgaacaat 338  Q
    | |||||| || || |||||||| ||||||||    
T  25099 agcttaaccttttctgtagtctggtgaacaat 25068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16372 - 16225
Alignment:
Q  134 acggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaa 233  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||| || | |||||| ||||||||| | || || ||||| || || || ||  |||||||    
T  16372 acggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaacttgaaa 16273  T
Q  234 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
     || | ||| || || | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16272 gtctatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 16225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10781
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 10781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 767
Alignment:
Q  130 tgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 229  Q
    |||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  230 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  330 ttgaacaatctctgctcct 348  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcct 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47430
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || | |||||| || |||| ||| || || ||||| ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 47422  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  47423 tgatgaac 47430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3057
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || | ||| ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||    |||||||| |||||||| || |||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtc 3049  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  3050 tgatgaac 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 79 - 404
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |  ||||||| |||||    ||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatc 378  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  379 ttgactttctctgtagtctgatgaac 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26448
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || |||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttc 318  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| || |||| || ||||||   |||||||| || |||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttc 26431  T
Q  319 tcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||    
T  26432 tccgtagtctgatgaac 26448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4181
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||||||| ||| ||| || || ||||| ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| | || ||||||| ||||||   |||||||| || ||||| ||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtc 4173  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  4174 tgatgaac 4181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28826
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||  || ||||||  || ||||| ||||||||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 278  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40817
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||  || ||||||  || ||||| ||||||||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 278  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 40817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18862 - 18537
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  18862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactg 18763  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | | ||| || || ||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  18762 ttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 18663  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   ||||||    
T  18662 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatc 18563  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  18562 ttgactttctccgtagtctgatgaac 18537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3680 - 3629
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacat 61  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3680 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacat 3629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5056
Alignment:
Q  39 aagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacgga 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  139 ccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaa 238  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  239 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20253
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || |||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttc 20253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13686 - 13362
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  13686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13587  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  13586 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 13487  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  13486 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 13387  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaa 334  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  13386 ttgactttctctgtagtctgatgaa 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17456 - 17132
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  17456 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 17357  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  17356 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 17257  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  17256 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 17157  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaa 334  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  17156 ttgactttctctgtagtctgatgaa 17132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7071
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || |||||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| || || |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
     ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttct 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27825
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| | |||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 27799  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  27800 ttgactttctctgtagtctgatgaac 27825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1473 - 1149
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||   ||| | |||   || ||||| |    
T  1473 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactg 1374  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||| ||| |||||     
T  1373 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcag 1275  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  1274 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 1175  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||  |||||||| |||||    
T  1174 ttgactttcttcgtagtctgatgaac 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 39720 - 40045
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  39720 acatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 39819  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  39820 ttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 39919  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   || |||    
T  39920 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttataatc 40019  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||    
T  40020 ttgactttctcgttagtctgatgaac 40045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14226 - 13901
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||  || ||||| |    
T  14226 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactg 14127  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  14126 ttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 14027  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    ||||||    
T  14026 aaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 13927  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  13926 ttgactttctcagtagtctgatgaac 13901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4960
Alignment:
Q  64 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttct 163  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  164 ttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 263  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  264 actcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 4960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21671
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | |||||||| | |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttc 318  Q
    ||  || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    |||||||| ||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  319 tcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21687 tcagtagtctgatgaac 21671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 314
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26091
Alignment:
Q  227 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 26091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4191
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||| | |||  ||| ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||||   ||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatc 4171  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctg 329  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4172 ttgactttctccgtagtctg 4191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51863
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| || || ||||| ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |  ||||||| ||||||   |||||||| || ||||| |||||     
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtt 51871  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  51870 tgatgaac 51863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 9779 - 10099
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  9779 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 9878  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| | || |||||| |||||||     
T  9879 ttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcag 9978  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||| |     | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  9979 aaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 10073  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  10074 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 10099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 14067 - 14391
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||||| |    
T  14067 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 14166  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||| ||||| |  |||| ||| |||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14167 ttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcag 14265  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  14266 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 14365  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  14366 ttgacattctccgtagtctgatgaac 14391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10090
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| || |||   ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatc 10109  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || |||||||| |||||||    
T  10108 ttgactttctctgtagtct 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19155
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
     || || |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||| | |||||  |||| |    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaac 19129  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||  || || ||||||||||||||    
T  19130 ttaatcttttctgtagtctgttgaac 19155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 335
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23317
Alignment:
Q  112 ccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 211  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  212 atacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatctt 311  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||| | |||||  |||| |||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaactt 23293  T
Q  312 aactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||  || || ||||||||||||||    
T  23294 aatcttttctgtagtctgttgaac 23317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5949
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| || |||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | || || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||  |||| ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttct 5949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25871
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||    ||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatc 25891  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctg 329  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  25890 tttaccttctccgtagtctg 25871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 299
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16946
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || |  || ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    |  | ||||| || || || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |  ||||||| |||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttc 16946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37508
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||| |||||||| | ||| || || ||||   |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtc 37500  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  37501 tgatgaac 37508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38385 - 38180
Alignment:
Q  124 gatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctc 223  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||    
T  38385 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 38286  T
Q  224 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagt 323  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  38285 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 38186  T
Q  324 agtctg 329  Q
    ||||||    
T  38185 agtctg 38180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27548 - 27372
Alignment:
Q  124 gatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctc 223  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||    
T  27548 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 27449  T
Q  224 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  27448 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttct 27372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1204
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | | |   || ||||| || ||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttct 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27531
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| | || |||||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || | ||| |||||||| |||||  | || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |  | ||||||| ||||||   ||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatc 27505  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  27506 ttgactttctccgtagtctgatgaac 27531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58443
Alignment:
Q  73 gaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttca 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  173 aagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 272  Q
      ||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  273 tcgactctgccacactttcatttttt 298  Q
    || ||| ||| || ||||||| ||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcatctttt 58443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19419
Alignment:
Q  29 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| || ||||||||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  129 atgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 228  Q
     ||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||||||| |||||||| |||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtct 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59045
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatc 62  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatc 59045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 10869 - 11193
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  10869 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 10968  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  10969 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 11068  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||    
T  11069 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 11168  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaa 334  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  11169 ttgactttctctgtagtctgatgaa 11193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 400
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || ||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || || | |||||| ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttc 318  Q
     || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   |||||||| ||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttc 416  T
Q  319 tcagtagtctgttgaa 334  Q
    || |||||||| ||||    
T  415 tctgtagtctgatgaa 400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7995 - 7831
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  7995 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctc 7896  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  7895 ctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5002
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||||  || ||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||  | |  || ||||| |||| |||||||| ||||| ||| || || ||||| ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| || ||||| || |||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtc 5010  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  5009 tgatgaac 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14257
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctg 329  Q
    || ||| ||||  |||||||    
T  14276 ttgactatctctatagtctg 14257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaa 173  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 61538 - 61220
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  61538 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 61439  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  ||| |||||| || ||||     
T  61438 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 61339  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   ||||||    
T  61338 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatc 61239  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || |||||||| |||||||    
T  61238 ttgactttctctgtagtct 61220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67608
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| || ||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  ||| |||||| || |||| |||||| || || || ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtc 67609  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  67608 t 67608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 52504 - 52186
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  52504 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 52405  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  ||| |||||| || ||||     
T  52404 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 52305  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   ||||||    
T  52304 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatc 52205  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || |||||||| |||||||    
T  52204 ttgactttctctgtagtct 52186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  43 tgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaa 142  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  143 taaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtca 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 229 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4441
Alignment:
Q  229 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagttt 4461  T
Q  329 gttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  4460 gttgaacaatttctggtcct 4441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 37077 - 36992
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 89  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37077 tggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaa 36992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatg 80  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49358 - 49033
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||| | |    
T  49358 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctg 49259  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| ||| || |||||||     
T  49258 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcag 49159  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |  ||||||| ||||||   ||||||    
T  49158 aaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatc 49059  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  49058 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 49033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 58141 - 57853
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||||    
T  58141 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccg 58042  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||  || || || || |||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  58041 ttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 57942  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttc 299  Q
    |||||| || || || |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  57941 aaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttc 57853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | |  ||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  219 gtctccttcttgaaactca 237  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 26255 - 26198
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaca 58  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26255 ctttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatgaaaca 26198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16748
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || |||||||| || || || | |||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttct 300  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |  ||||||| ||||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttct 16748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42658 - 42333
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  42658 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 42559  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || | ||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  42558 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 42459  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||| ||||||   ||||||    
T  42458 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatc 42359  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  42358 ttgactttctctgtagtctgatgaac 42333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47724 - 47399
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  47724 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 47625  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||||||| || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||   ||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  47624 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 47525  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||| ||||||   ||||||    
T  47524 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatc 47425  T
Q  310 ttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  47424 ttgactttctctgtagtctgatgaac 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 209
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  131 gatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 90
Target Start/End: Original strand, 2202 - 2244
Alignment:
Q  48 cacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaa 90  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2202 cacatgagacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaa 2244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39215 - 38942
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||    
T  39215 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 39116  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||  |||||||||||||| | |||||||| || || || ||||| |||| ||||||||||||    
T  39115 ctgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactct 39016  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 280  Q
    || ||| || || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39015 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 38942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 172 - 455
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||| | ||||  || ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| || ||||| | ||| |||| |||||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
    ||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6483
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | | ||| ||| | | ||  || ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  210 -aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcat 308  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || |||   |||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcat 6463  T
Q  309 cttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6464 cttgactttctcagtagtct 6483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49214
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||| |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 49233  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    || ||||| || |||||||    
T  49232 ttgactttttctgtagtct 49214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 328
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26560
Alignment:
Q  7 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgcca 106  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||  || ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  107 ccgtcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 206  Q
    | || || || || || || || ||||||||||| || ||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  207 caaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatc 306  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||    |||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 26538  T
Q  307 atcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  26539 aacctaactttctcagtagtct 26560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 509 - 792
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||| |||||  | |||||||||||||| || || || || |  || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcat 792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33719
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  || ||||| ||||| ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 218  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || || || || ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  219 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat 293  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 33719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 40379 - 40543
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  40379 aggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 40478  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  40479 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 40543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 317
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20410
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatc 20402  T
Q  310 ttaacttt 317  Q
    || |||||    
T  20403 ttgacttt 20410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 43486 - 43804
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  43486 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacag 43585  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| || ||||| || || |||| |||||| || ||||     
T  43586 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcag 43685  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | |||||||| | || ||||||| ||||||   ||||||    
T  43686 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatc 43785  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||| || |||||||    
T  43786 ttaactttttctgtagtct 43804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Original strand, 44498 - 44816
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  44498 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacag 44597  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| || ||||| || || |||| |||||| || ||||     
T  44598 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcag 44697  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatc 309  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | |||||||| | || ||||||| ||||||   ||||||    
T  44698 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatc 44797  T
Q  310 ttaactttctcagtagtct 328  Q
    |||||||| || |||||||    
T  44798 ttaactttttctgtagtct 44816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtca 193  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2028
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaa 173  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaa 2028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 6245 - 6333
Alignment:
Q  1 ctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6245 ctttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 328
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248912
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || |||||  | |||||| | || || |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || || || ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||    |||||||| ||||||| |||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtc 248911  T
Q  328 t 328  Q
    |    
T  248912 t 248912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12781
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||| ||| |||||||| ||||  || || || |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | | |||||||||||| ||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||| | || ||||||| |||||    |||||||| || |||||||| |||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 12789  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  12788 tgatgaac 12781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7238
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || |||||   ||| || |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaacc--ttctgaaa 7446  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 227  Q
    | |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||  ||| || ||| || |||| |||||| || || || ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||| |    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagac 7246  T
Q  328 tgttgaac 335  Q
    || |||||    
T  7245 tgatgaac 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  28 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | ||| || ||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  128 tatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 208  Q
    | ||||||  |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4464 - 4235
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 109  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| |    
T  4464 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 4365  T
Q  110 tcccaactctttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 209  Q
    | ||||| || |  || || ||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  4364 ttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 4265  T
Q  210 aaatacgtggtctccttcttgaaactcaag 239  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||    
T  4264 aaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 328
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43082
Alignment:
Q  30 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactctttccgatata 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || |||||  | || || ||     
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  130 tgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 229  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| || || || || || |    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  230 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtct 43082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3706
Alignment:
Q  244 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T
Q  344 ctcct 348  Q
     ||||    
T  3710 gtcct 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 136109 - 136278
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgtcccaactc 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||  || ||||| || |||||||    
T  136109 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactc 136208  T
Q  119 tttccgatatatgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacacc 188  Q
    | || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||    
T  136209 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 282
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2047
Alignment:
Q  151 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  251 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 282  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgc 2047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1239 - 1052
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || || ||  |  ||||||||| |||||||||     
T  1239 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctc 1140  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  1139 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8403
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  8216 aggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 8315  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | ||||||||||||| |||| |||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  8316 ctcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 8403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 335
Target Start/End: Original strand, 5314 - 5519
Alignment:
Q  130 tgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 229  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || || || || |    
T  5314 tgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcct 5413  T
Q  230 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcat-tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||| || |||||||| ||||    
T  5414 gaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttcct-tatcatcttgaccttctcagtcgtct 5512  T
Q  329 gttgaac 335  Q
    | |||||    
T  5513 gatgaac 5519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1241
Alignment:
Q  184 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcc 283  Q
    ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  284 acactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    || ||||||| || ||   ||||||||| |||||||| |||||||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtct 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 46275 - 46439
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| || |||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  46275 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 46374  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  46375 ctcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 46439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 335
Target Start/End: Original strand, 1 - 176
Alignment:
Q  160 ttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 259  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  260 gataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    | |||||||| || |||||||   || ||||||| ||||||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14831
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| || || || ||  | ||||||||||  || || ||     
T  14644 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctc 14743  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||    
T  14744 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctcttgcacaa 14831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 14778 - 14965
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||||||| | || || ||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  14778 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 14877  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    | ||||||||||||||| || |||| ||||||  |||| ||||| || || | |||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  14878 ctcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 14965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 337
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43846
Alignment:
Q  228 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 327  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtc 43836  T
Q  328 tgttgaacaa 337  Q
    | ||| ||||    
T  43837 tcttgcacaa 43846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 12745 - 12806
Alignment:
Q  287 ctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaatctctgctcct 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12745 ctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 12806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Original strand, 13015 - 13216
Alignment:
Q  136 ggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaact 235  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||| || || || || ||  | |||||||    
T  13015 ggaccaaaaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaact 13114  T
Q  236 caagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||| ||| ||    
T  13115 caatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtctcttgcac 13214  T
Q  336 aa 337  Q
    ||    
T  13215 aa 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 3280 - 3444
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| || || || ||  | |||||||| |  || |||||     
T  3280 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctc 3379  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |||||||||||||||||    
T  3380 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 3444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28287
Alignment:
Q  134 acggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaa 233  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| |||||| || | || |||||||| || || || ||| |||| ||    
T  28467 acggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaa 28368  T
Q  234 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||  |  | ||||| || |||||||||||||||||    
T  28367 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 28287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1095 - 964
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  1095 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 996  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  995 ctcttatcatgataactcttatgtctactctg 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45902
Alignment:
Q  19 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtgg 45902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 571 - 393
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  ||| |||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||  | ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  571 aggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 472  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||    
T  471 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23679
Alignment:
Q  153 agtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 252  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||| || |||||| || | || |||||||| ||||| || |   |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  253 ttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || || ||||||||||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7498
Alignment:
Q  4 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7547 tggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5467
Alignment:
Q  244 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctc 320  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||| ||||||||    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4060 - 3896
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||| || |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||  |  | |||||||||| ||| |||||     
T  4060 aggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctc 3961  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || || ||||||||||||||    
T  3960 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 337
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9295
Alignment:
Q  167 acttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 266  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  267 cttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    ||| | || ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaa 9295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 886
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 86  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgg 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14922 - 14758
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||  |||||| || | || |||||||| || || || ||  | ||||| |||| ||| |||||     
T  14922 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctc 14823  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || |||||||||||||||||    
T  14822 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 14758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 3355
Alignment:
Q  247 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaac 335  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaac 3355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3517
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 86  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  3593 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtgg 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 337
Target Start/End: Original strand, 13403 - 13559
Alignment:
Q  181 ccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||| | || |||||    
T  13403 ccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatctactct 13502  T
Q  281 gccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    |  || ||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  13503 gagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaa 13559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71527
Alignment:
Q  252 cttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 71527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 274
Target Start/End: Original strand, 24001 - 24125
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  24001 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 24100  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtc 274  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  24101 ctcttatcatgataactcttctgtc 24125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Original strand, 10476 - 10607
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||||| || |||||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||     
T  10476 aggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 10575  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10576 ctcttatcatgataactcttctgtctactctg 10607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Original strand, 5862 - 5993
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||||| || |||||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  ||||| |||||| ||| |||||     
T  5862 aggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctc 5961  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5962 ctcttatcatgataactcttctgtctactctg 5993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26178
Alignment:
Q  227 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 26178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8974 - 8889
Alignment:
Q  252 cttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttgaacaa 337  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  8974 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaa 8889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Original strand, 9200 - 9269
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagat 79  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9200 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagat 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Original strand, 8471 - 8602
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||||| || |||||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  ||||| |||||| ||| |||||     
T  8471 aggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctc 8570  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 281  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8571 ctcttatcatgataactcttctgtctactctg 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 17515 - 17428
Alignment:
Q  10 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactc 97  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17515 acatgagttgaatccgaaacacacttcggaagttatgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaacatgcgatggtaaacccactc 17428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1422
Alignment:
Q  227 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 326  Q
    |||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||| | || ||||||  || ||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 1433  T
Q  327 ctgttgaacaa 337  Q
    || ||| ||||    
T  1432 ctcttgcacaa 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4129 - 3965
Alignment:
Q  150 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 249  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| || |||||||| |||||   | | ||||||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| |||||     
T  4129 aggagtcaaattcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 4030  T
Q  250 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaac 314  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||| ||  || | ||||| || || ||||||||||||||    
T  4029 ctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 3965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 328
Target Start/End: Original strand, 10870 - 11068
Alignment:
Q  130 tgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttctt 229  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||  |||| || ||| || || | ||| || || || || || |    
T  10870 tgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcct 10969  T
Q  230 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgccacactttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 328  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||   || | ||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  10970 gaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 11068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University