View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16333_low_3 (Length: 343)

Name: NF16333_low_3
Description: NF16333
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16333_low_3
NF16333_low_3
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-334)||(35203678-35204011)
chr6 (1-327)||(13880979-13881305)
chr6 (1-334)||(25943902-25944235)
chr6 (1-334)||(17692467-17692803)
chr6 (3-328)||(22348592-22348913)
chr6 (64-326)||(14739769-14740034)
chr6 (64-119)||(33333483-33333538)
chr6 (64-113)||(24433733-24433782)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (1-334)||(54190741-54191074)
chr3 (1-334)||(29911568-29911901)
chr3 (1-327)||(10096421-10096747)
chr3 (1-327)||(10203307-10203633)
chr3 (1-334)||(16459697-16460030)
chr3 (1-327)||(10610387-10610714)
chr3 (1-334)||(10899242-10899575)
chr3 (1-333)||(22623594-22623926)
chr3 (47-334)||(6305544-6305831)
chr3 (1-327)||(47880503-47880829)
chr3 (64-326)||(1308496-1308761)
chr3 (64-228)||(3325833-3326000)
chr3 (64-228)||(22170603-22170770)
chr3 (66-312)||(8514721-8514970)
chr3 (66-312)||(32477967-32478216)
chr3 (166-312)||(2674431-2674577)
chr3 (66-119)||(2674627-2674680)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-334)||(9523961-9524294)
chr1 (6-334)||(2396875-2397203)
chr1 (64-113)||(41395876-41395925)
chr1 (64-113)||(19369098-19369147)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (1-334)||(25447720-25448054)
chr5 (64-326)||(43594746-43595011)
chr5 (64-326)||(43627540-43627805)
chr5 (64-326)||(27447448-27447713)
chr5 (64-228)||(24557879-24558046)
chr5 (64-228)||(24598911-24599078)
chr5 (64-228)||(28835927-28836094)
chr5 (64-228)||(37558897-37559064)
chr5 (64-119)||(33788981-33789036)
chr5 (66-119)||(31399399-31399452)
chr5 (64-119)||(28805129-28805184)
chr5 (166-228)||(31399287-31399349)
chr5 (166-228)||(33789086-33789148)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (1-334)||(25407647-25407980)
chr7 (1-334)||(3322403-3322736)
chr7 (1-334)||(7072284-7072617)
chr7 (1-334)||(44012146-44012478)
chr7 (239-334)||(25353585-25353680)
chr7 (64-326)||(24263520-24263785)
chr7 (64-326)||(9187342-9187607)
chr7 (64-326)||(18411282-18411547)
chr7 (166-312)||(16882657-16882803)
chr7 (64-113)||(24272313-24272362)
chr7 (64-119)||(21986545-21986600)
chr7 (158-228)||(24272195-24272265)
chr7 (66-119)||(16882554-16882607)
chr7 (64-113)||(21642312-21642361)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (1-334)||(2738438-2738771)
chr2 (1-334)||(20052376-20052708)
chr2 (1-334)||(39684480-39684813)
chr2 (1-334)||(22714849-22715182)
chr2 (1-328)||(17934323-17934650)
chr2 (138-327)||(45569630-45569819)
chr2 (64-326)||(25393511-25393776)
chr2 (64-312)||(19346903-19347154)
chr2 (158-228)||(39485516-39485586)
chr2 (64-109)||(31058583-31058628)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-334)||(4814841-4815174)
chr8 (1-334)||(28892997-28893330)
chr8 (1-334)||(28330128-28330461)
chr8 (1-334)||(16754875-16755208)
chr8 (1-328)||(21039670-21039996)
chr8 (74-327)||(25682552-25682805)
chr8 (1-334)||(33034874-33035206)
chr8 (1-334)||(15946896-15947229)
chr8 (64-341)||(26298998-26299278)
chr8 (64-326)||(10686461-10686726)
chr8 (64-312)||(18867881-18868132)
chr8 (64-119)||(35743014-35743069)
chr8 (166-312)||(35743119-35743265)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (1-334)||(759-1092)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (1-326)||(15314557-15314883)
chr4 (1-334)||(36769823-36770156)
chr4 (65-334)||(4567572-4567841)
chr4 (1-334)||(47564946-47565279)
chr4 (1-334)||(16634724-16635039)
chr4 (64-312)||(9226612-9226863)
chr4 (64-312)||(18858201-18858452)
chr4 (64-326)||(16626190-16626454)
chr4 (64-113)||(5145533-5145582)
chr4 (64-92)||(41899769-41899797)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (1-334)||(18559-18892)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (224-334)||(49044-49154)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (64-326)||(16506-16771)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (64-334)||(133-406)
scaffold0006 (64-334)||(8289-8562)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (158-228)||(34732-34802)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 35203678 - 35204011
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35203678 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaattttctctgtccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 35203777  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35203778 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 35203877  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35203878 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 35203977  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35203978 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 35204011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13881305 - 13880979
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881305 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 13881206  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13881205 aagtaacatccctgcttataataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 13881106  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13881105 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtgtcccactccaaacc 13881006  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccct 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13881005 tccataggtgtcttgagatctatccct 13880979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25944235 - 25943902
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25944235 tcatcagtgataggctccacctaaaactgaattttttctatcttcgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 25944136  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25944135 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacattt 25944036  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25944035 cacagctctagcatcaagtttgtctagtctcacatgagcaaatgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 25943936  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  25943935 tccataggtgtcttgagatctatctctgttgatg 25943902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 17692467 - 17692803
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17692467 tcattagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctatccccgttttcgagcttgtatctaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 17692566  T
Q  101 aagtaacatccc---tgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacaca 197  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17692567 aagtaacatcccccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacaacctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaataca 17692666  T
Q  198 cttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaa 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17692667 cttcacagctctaacatcaagtttgtcttgtctgacatgagcaaacgctaaagccccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaa 17692766  T
Q  298 acctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  17692767 acctccatatgtgtcttaagatctatccctgttgatg 17692803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 22348592 - 22348913
Alignment:
Q  3 atcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaa 102  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348592 atcagtggtaggctccacctcaaattgaattttctctatccccgtttctgaacttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaa 22348691  T
Q  103 gtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||     ||| ||||||||    
T  22348692 gtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttaaggataacc----taaatacacttca 22348787  T
Q  203 cagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctc 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| |||    
T  22348788 cagctctagcatcaagtttatcttgtctgacatgagaaaatgctaaagctccgaaaaccttcaagttagagtagcctactggtctcccactccaaatctc 22348887  T
Q  303 cataggtgtcctgagatctatccctg 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  22348888 cataggtgtcttgagatctatccctg 22348913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14740034 - 14739769
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  14740034 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 14739935  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  14739934 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 14739835  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  14739834 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 14739769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 33333538 - 33333483
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33333538 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttat 33333483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24433782 - 24433733
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccct 113  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24433782 aggtctttagacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccct 24433733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54191074 - 54190741
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54191074 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaattttctctatccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 54190975  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54190974 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 54190875  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54190874 cacagctctagcatcaagtttgtcttgtctgacatgagcaaacgctaaagctccgaaaacttttaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 54190775  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  54190774 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 54190741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 29911568 - 29911901
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29911568 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctatccccgttttcgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 29911667  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29911668 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 29911767  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29911768 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgagcaaacgctaaagctccgaagattttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 29911867  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  29911868 tccataggtgtcttgagatctatccttgttgatg 29911901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 10096421 - 10096747
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10096421 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 10096520  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10096521 aagtaacatccctgcttataataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 10096620  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10096621 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtgtcccactccaaacc 10096720  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccct 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10096721 tccataggtgtcttgagatctatccct 10096747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 10203307 - 10203633
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10203307 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttatgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 10203406  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10203407 aagtaacatccctgtttataataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 10203506  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10203507 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 10203606  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccct 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10203607 tccataggtgtcttgagatctatccct 10203633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16460030 - 16459697
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460030 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctgtccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 16459931  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16459930 aagtaacatccctgcttatgataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaagataacccatgaaaatacactt 16459831  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16459830 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcatgacatgcgcaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 16459731  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  16459730 tccataggtgtgttgagatctatccctgttgatg 16459697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 10610387 - 10610714
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctct-atcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatca 99  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10610387 tcattagtggtaggctccacctcaaactgaattttcttttatccccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatca 10610486  T
Q  100 aaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10610487 aaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacact 10610586  T
Q  200 tcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10610587 tcacagctctagcatcaagtttgtcttgtctgacatgagcaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaac 10610686  T
Q  300 ctccataggtgtcctgagatctatccct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10610687 ctccataggtgtcttgagatctatccct 10610714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10899575 - 10899242
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10899575 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctgtccccgtttccgagcttgcatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 10899476  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10899475 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 10899376  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10899375 cacagctctagcatcaagtttgtcttgtctgacatgagcaaatgctaaagctctgaaaacttttaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 10899276  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10899275 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 10899242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 22623594 - 22623926
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22623594 tcatcagtgataggttccacctcaaactgaattttctctgtccccgttttcgagcttatatccaagtctttgcacttcatccccattcgggtctcatcaa 22623693  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22623694 aagtaacatccctgcttattataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 22623793  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  22623794 catagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgagcaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaaac 22623893  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgat 333  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  22623894 tccataggtgttttgagatctatccctgttgat 22623926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6305831 - 6305544
Alignment:
Q  47 tttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccat 146  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6305831 tttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgattctccaggttccat 6305732  T
Q  147 ccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgct 246  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  6305731 cttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgct 6305632  T
Q  247 aaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6305631 aaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 6305544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 47880503 - 47880829
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  47880503 tcatcactggtaggctccaccacaaactgaattttctctaccccagtttctaagcttgtatccaggtctttatacttcatcttcatgcgggtctcatcaa 47880602  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47880603 aagtaacatccttgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccatagtctgtaacctttcacaccttcaggatatcccatgaaaatacactt 47880702  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47880703 cacagctctagaatcaagtttgtcctgtctgacataagcaaatgctaaagctccaaaaactttcaaattagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 47880802  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccct 327  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||    
T  47880803 tacataggtgtcttgagatctatccct 47880829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Original strand, 1308496 - 1308761
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  1308496 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 1308595  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  1308596 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 1308695  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  1308696 cttcaaagaagagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 1308761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3326000 - 3325833
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   |||| |   |||    
T  3326000 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagacttttgatcctccactagattccaattttcacaacttgt 3325901  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||  ||||||||    
T  3325900 aacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcatgtcttgc 3325833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22170770 - 22170603
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  22170770 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 22170671  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  22170670 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 22170603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 312
Target Start/End: Original strand, 8514721 - 8514970
Alignment:
Q  66 gtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttga---tcctctaggttccatccttcatagtctgtaa 162  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  | | ||||   ||| |||| |||||   | || |   ||||     
T  8514721 gtctttacacttcatccccatccgggtctcatcgaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcttccactagattccaatttccacaacttgtat 8514820  T
Q  163 cctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactt 262  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| || |    
T  8514821 cccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaacct 8514920  T
Q  263 tcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
    ||||    || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8514921 tcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 8514970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 312
Target Start/End: Original strand, 32477967 - 32478216
Alignment:
Q  66 gtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttga---tcctctaggttccatccttcatagtctgtaa 162  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  | | ||||   ||| |||| |||||   | || |   ||||     
T  32477967 gtctttacacttcatccccatccgggtctcatcgaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcttccactagattccaatttccacaacttgtat 32478066  T
Q  163 cctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactt 262  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| || |    
T  32478067 cccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaacct 32478166  T
Q  263 tcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
    ||||    || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  32478167 tcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 32478216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2674577 - 2674431
Alignment:
Q  166 ttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttca 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| || ||||    
T  2674577 ttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaaccttca 2674478  T
Q  266 agttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
    |    || || || |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2674477 aagaggagtaatccgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 2674431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2674680 - 2674627
Alignment:
Q  66 gtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  2674680 gtctttacacttcatccccattcgggtctcatcgaaggtaacatccctacttat 2674627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9524294 - 9523961
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9524294 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 9524195  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9524194 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 9524095  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9524094 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 9523995  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9523994 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 9523961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Original strand, 2396875 - 2397203
Alignment:
Q  6 agtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagta 105  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2396875 agtggtaggctccacctcaaactgaattttctcttcccccatttctgagcttgtgtccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagta 2396974  T
Q  106 acatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacag 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2396975 acatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacactttcaggataacccatgaaaatacacttcacag 2397074  T
Q  206 ctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccat 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2397075 ctctagcatcaagtttgtcctgcttgacatgagcaaatgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctactggtctcccactccaaacctccat 2397174  T
Q  306 aggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||||    
T  2397175 aggtgttttgagatctatccatgttgatg 2397203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 41395876 - 41395925
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccct 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41395876 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccct 41395925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19369147 - 19369098
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19369147 aggtctttacacttaatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccct 19369098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25448054 - 25447720
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25448054 tcatcaatgataggctccacctcaaactgaattttctctatccccatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 25447955  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacacc-ttcaggataacccatgaaaacacact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25447954 aagtaacatccctgcttataataaattttgatccttcaggttccatcttccacagtctataacctttcacacctttcaggataacccatgaaaatacact 25447855  T
Q  200 tcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25447854 tcacagctctagcatcaagtttgtcttgtctgacatgagcaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaac 25447755  T
Q  300 ctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25447754 ctccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 25447720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Original strand, 43594746 - 43595011
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  43594746 aggtctttgcacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 43594845  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  43594846 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 43594945  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  43594946 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 43595011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Original strand, 43627540 - 43627805
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  43627540 aggtctttgcacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 43627639  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  43627640 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 43627739  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  43627740 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 43627805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Original strand, 27447448 - 27447713
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  27447448 aggtctttacacttcatcctcatacgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaaggctcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 27447547  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  27447548 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 27447647  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27447648 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 27447713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24558046 - 24557879
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctc---taggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || |  | |||||||||||   ||| |||||   | || |   |||    
T  24558046 aggtctttacacttcatccccatacgagtctcatcaaaggtaacgtccctgctaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 24557947  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  24557946 aacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 24557879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24599078 - 24598911
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctc---taggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || |  | |||||||||||   ||| |||||   | || |   |||    
T  24599078 aggtctttacacttcatccccatacgagtctcatcaaaggtaacgtccctgctaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 24598979  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  24598978 aacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 24598911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Original strand, 28835927 - 28836094
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  28835927 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 28836026  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  28836027 aacccttctcaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 28836094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37559064 - 37558897
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  37559064 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcacgactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 37558965  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  37558964 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 37558897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Original strand, 33788981 - 33789036
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33788981 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttat 33789036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31399452 - 31399399
Alignment:
Q  66 gtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31399452 gtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttat 31399399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28805184 - 28805129
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28805184 aggtctttacacttcatcctcatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttat 28805129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31399349 - 31399287
Alignment:
Q  166 ttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  31399349 ttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 31399287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Original strand, 33789086 - 33789148
Alignment:
Q  166 ttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  33789086 ttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 33789148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25407980 - 25407647
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25407980 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctatccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgtgggtctcatcaa 25407881  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25407880 aagtaacatccctgcttataataatttttgatcctctaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 25407781  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25407780 cacagctctagcatcaagtttgtcttgtctgacatgagcaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctacccgtctcccactccaaacc 25407681  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25407680 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 25407647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 3322403 - 3322736
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3322403 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaatttttcctgtccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 3322502  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3322503 aagtaacatccctgcttataataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 3322602  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3322603 caccgctctagcatcaagtttgtcttgcctgatatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 3322702  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3322703 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 3322736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7072617 - 7072284
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7072617 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaattttctctgtccccgtttccgagcttgtatccatgtctttgcacttcatctccatgcgggtctcatcaa 7072518  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7072517 aagtaacatccctgcttataataaattttgatccaccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 7072418  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7072417 cacaactctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaatgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 7072318  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7072317 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 7072284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 44012146 - 44012478
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44012146 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctatacccccgtttctgagtttgtttccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 44012245  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44012246 aagtaacatccctgcttataataaattttgatccttcaggttccatcttccacagtttgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 44012345  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44012346 cacaactctagcatcaagtttgtcctgtctgacatgagcaaatgctaaagctcc-aaaactttcaaattagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 44012444  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    || ||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  44012445 tctataagtgtcttcaaatctatccctgttgatg 44012478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 239 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25353680 - 25353585
Alignment:
Q  239 caaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25353680 caaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaacggtctcccactccaaacctccatagctgtcctgagatctatccctgttgatg 25353585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24263785 - 24263520
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  24263785 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 24263686  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  24263685 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 24263586  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  24263585 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 24263520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9187607 - 9187342
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctc---taggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |  | |||||||||||   ||| |||||   | || ||  |||    
T  9187607 aggtctttactcttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccatactaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacagcttgt 9187508  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| || || ||    
T  9187507 aacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccaaaaac 9187408  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  9187407 cttcaaagatgagtagtttgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 9187342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Original strand, 18411282 - 18411547
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  18411282 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 18411381  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | |  ||||| || || ||    
T  18411382 accccttcacaccttccggataacaaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgtcaaagctccaaaaac 18411481  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  18411482 cttcaaagaagagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 18411547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 16882657 - 16882803
Alignment:
Q  166 ttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttca 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| || ||||    
T  16882657 ttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaaccttca 16882756  T
Q  266 agttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
    |    || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16882757 aagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 16882803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24272362 - 24272313
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccct 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24272362 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccct 24272313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Original strand, 21986545 - 21986600
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21986545 aggtctttacacttcatccccatccgagtctcatcaaaggtaacatccctacttat 21986600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24272265 - 24272195
Alignment:
Q  158 tgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||||    
T  24272265 tgtaacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaatcttgtcttgc 24272195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 119
Target Start/End: Original strand, 16882554 - 16882607
Alignment:
Q  66 gtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16882554 gtctttacacttcatccccatctgggtctcatcgaaggtaacatccctacttat 16882607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 21642312 - 21642361
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccct 113  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21642312 aggtctttacacatcatccccatacgggtctcatcgaaggtaacatccct 21642361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2738771 - 2738438
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738771 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttccgagcttgcatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 2738672  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2738671 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttctcaccttcaggataacccatgaaaatacactt 2738572  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2738571 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccgatctcccactccaaacc 2738472  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2738471 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 2738438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 20052376 - 20052708
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20052376 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctatccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 20052475  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20052476 aagtaacatccctgcttataataaattttgattctccaggttccatcttccacggtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 20052575  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20052576 cacagctctagcatcaagtttgtcttgtctgacatgagcaaacgctaaagc-tcgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 20052674  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20052675 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 20052708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39684813 - 39684480
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39684813 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 39684714  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39684713 aagtaacatccctgcttataataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 39684614  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39684613 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtcttccggtcttccactccaaacc 39684514  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39684513 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 39684480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 22714849 - 22715182
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22714849 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctatccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 22714948  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22714949 aagtaacatccctgcttatgataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaagataacccatgaaaatacactt 22715048  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22715049 cacagctctagcatcaagtttgtcttgaatgacatgagaaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 22715148  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22715149 tccataggtgtgttgagatctatccctgttgatg 22715182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17934650 - 17934323
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17934650 tcatcaatggtaggctccacctcaaactgaattttctctatccccgtttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatacgggtctcatcaa 17934551  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17934550 aagtaacatccctgcttataataaattttgattctctaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 17934451  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17934450 cacatatctagcatcaagtttgtcttgtctgacatgggcaaatgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 17934351  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctg 328  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17934350 tccataggtgtcttgagacctatccctg 17934323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 45569819 - 45569630
Alignment:
Q  138 aggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataa 237  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  45569819 aggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgatatgg 45569720  T
Q  238 tcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccct 327  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45569719 gcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtcttccactccaaacctccataggtgtcttgagttctatccct 45569630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Original strand, 25393511 - 25393776
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  25393511 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 25393610  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||| | ||    
T  25393611 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgtgcatatgccaaagctccgtaaac 25393710  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  25393711 cttcaaagatgagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 25393776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Original strand, 19346903 - 19347154
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttga---tcctctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||   ||| |||| |||||   |||| |   | |    
T  19346903 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcttccactagattccaattttcacaacttat 19347002  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  19347003 atcccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 19347102  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
     |||||    || || || |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19347103 cttcaaagaggagtaatccgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 19347154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39485586 - 39485516
Alignment:
Q  158 tgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  39485586 tgtaacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgc 39485516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 109
Target Start/End: Original strand, 31058583 - 31058628
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31058583 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacat 31058628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 4814841 - 4815174
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4814841 tcatcagtgatagggtccacctcaaactgaattttctctgtccccgtttccgagcttgcatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 4814940  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4814941 aagtaacatccctgcttatgataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 4815040  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4815041 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgttaaagctctgaagactttcaagttagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 4815140  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4815141 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 4815174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28893330 - 28892997
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28893330 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 28893231  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28893230 aagtaacatccctgcttatgataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 28893131  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28893130 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 28893031  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28893030 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 28892997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28330461 - 28330128
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28330461 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctctgtccccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcattaa 28330362  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28330361 aagtaacatccctgcttataataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacacctttaggataacccatgaaaatacactt 28330262  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28330261 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtcttccactccaaacc 28330162  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28330161 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 28330128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 16754875 - 16755208
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16754875 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaagtttctttgtccccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccattcgggtctcatcaa 16754974  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16754975 aagtaacatccctgcttattataaattttgattctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 16755074  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16755075 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctgccggtcttccactccaaacc 16755174  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  16755175 tccataggtgtcttgagatctatccttgttgatg 16755208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21039996 - 21039670
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21039996 tcatcagtggtaggctccacctcaaattgaattttctctatctccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcggatcttatcaa 21039897  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21039896 aagtaacatacctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtttgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 21039797  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||| | ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21039796 cacagctctagcatcaag-ttgtcttgtctgacatgagcaaatgctaaagctctgaaaacattcaagttagagtagtctaccggtctcccactacaaacc 21039698  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctg 328  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21039697 tccataggtgtcttgagatatatccctg 21039670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 74 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25682805 - 25682552
Alignment:
Q  74 acttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacacc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  25682805 acttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacacc 25682706  T
Q  174 ttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagat 273  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25682705 ttcaagataacccatgaaaatacacttcacagctttagcatcaagtttgtcttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagag 25682606  T
Q  274 tagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccct 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25682605 tagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcttgagatctatccct 25682552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33035206 - 33034874
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33035206 tcatcagcggtaggctccacctcaaactgaattttctctacccccatttctgagcttgttcccaggtctttccacttcatccccttgcgggtctcatcaa 33035107  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33035106 aagta-catccctgcttataataaattttgatcctccaagttcgatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 33035008  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||| |||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33035007 cacaactctagcatcaagtttgtcctgtctgacatgagaaaatgctaaagctctaaaaacttttaagttagagtagtctgccggtctcccactccaaacc 33034908  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  33034907 ttcataggtgtcttcagatctatccctgttgatg 33034874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15947229 - 15946896
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||  |   |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15947229 tcatcagtggtaggctccaccttaaactgaattttatgtactcatgtttctgagcttgtttccaggtttttgcacttcatactcatacgggtctcatcaa 15947130  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |  | |   |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  15947129 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccatgttttatcttcaacaacttgtaacctttcacaccttcaagataaccaataaaaacacactt 15947030  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||     
T  15947029 cacaactctagcatcaagtttgtcatgtttgacacgtgcaaatgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctggcagtctcccactccaaaca 15946930  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  15946929 tccataggtgtcttgagatttatccatgttgatg 15946896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 341
Target Start/End: Original strand, 26298998 - 26299278
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  26298998 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 26299097  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  26299098 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 26299197  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatgtccatct 341  Q
     |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||| ||||||    
T  26299198 cttcaaagaagagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccccgttgatggccatct 26299278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10686726 - 10686461
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  10686726 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 10686627  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  10686626 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 10686527  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  10686526 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 10686461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18868132 - 18867881
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  18868132 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 18868033  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  18868032 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 18867933  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18867932 attcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 18867881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Original strand, 35743014 - 35743069
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttat 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35743014 aggtctttacacttcatccccattcgggtctcatcaaaggtaacatccctacttat 35743069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 35743119 - 35743265
Alignment:
Q  166 ttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttca 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| || ||||    
T  35743119 ttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaaccttca 35743218  T
Q  266 agttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
    |    || || || |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35743219 aagaggagtaatccgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 35743265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 759 - 1092
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  759 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaattttctctgtccctgttttcgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 858  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  859 aagtaacatccttgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacattt 958  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  959 tacagctctagcatcaagtttgtcttgcctaacatgggcaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacc 1058  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1059 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15314883 - 15314557
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15314883 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctatccccgtttctgagcttgtatctaggtctttgcacttcatccccatgtgggtctcatcaa 15314784  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15314783 aaataacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacctttcacaccttcaggataactcatgaaaatacactt 15314684  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagt-ctgccggtctcccactccaaac 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  15314683 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacatgagaaaacgctaaagctccgaaaactttcaagttagagtagtcctaccggtctcccactccaaac 15314584  T
Q  300 ctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  15314583 atccataggtgtcttgagatctatccc 15314557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36770156 - 36769823
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36770156 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctacccctgtttctgagcttgtttccgggtttttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 36770057  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36770056 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtttgtaacctttcacaccttcagaataacccatgaaaatacactt 36769957  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||     
T  36769956 cacaactctagcatcaagtatgtcctgtctgacataagcaaatgctaaagctccaaaaactttcaaattagagtagtttcccggtctcccactccaaaca 36769857  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36769856 ttcataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 36769823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 65 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4567841 - 4567572
Alignment:
Q  65 ggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacc 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  4567841 ggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctgtaacc 4567742  T
Q  165 tttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  4567741 tttcacaccttcaggataacccatgaaaatacacttcacaactctagcatcaagtttgtcctgtctgacatgagcaaatgctaaagctccgaaaactttc 4567642  T
Q  265 aagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  4567641 aaattagagtagtctgccgatctcccactccaaacctccataggtgtcttgagatctatccatgttgatg 4567572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47565279 - 47564946
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47565279 tcatcagtggtaggctccacctcaaactgaattttctctacccccgtttctgagcttgtttccaggtctttgcacttcattcacatgcgggtctcatcaa 47565180  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47565179 aagtaacatctctacttataataaattttgatccttcaggttccatcttccacagtttgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaatacactt 47565080  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  47565079 cacaactctagcatcaagtttgtcctgtctagcatgagcaaatgctaaagctccaaaaactttcaaattagagtagtctgtcggtctcccactccaaacg 47564980  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  47564979 tccataggtgtcttgagatttatccctgttgatg 47564946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16635039 - 16634724
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |  ||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16635039 tcatcagtggtaggatccacctcaaactgaattttttgtgcccccatttataagcttgtttccaggtctttgcacttcatccccatacgggcctcatcaa 16634940  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||                    
T  16634939 aagtaacatccatgcttataataaattttgatcctctaggttccatcttccacagtttgtaacctttcacaccttcaggataac---------------- 16634856  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
       | ||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16634855 --taactctagcatcaagtttgtcctgtttgacatgagcaaatgctaaagctccgaaaactttcaaattagagtagtttgccggtctcccactccaaacc 16634758  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||||    
T  16634757 tccataggtgtcttaagatctatccttgttgatg 16634724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9226863 - 9226612
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  9226863 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 9226764  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  9226763 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 9226664  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9226663 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 9226612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Original strand, 18858201 - 18858452
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  18858201 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 18858300  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  18858301 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 18858400  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtc 312  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18858401 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtc 18858452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16626454 - 16626190
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   | || |    ||    
T  16626454 aggtcttt-cacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaactcgt 16626356  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    |||| |||| |||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | |  ||||| | ||| ||    
T  16626355 aacccttcagaccttccggataaccaatgaagatacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgtcaaagctcagaaaac 16626256  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  16626255 cttcaaagaagagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 16626190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 113
Target Start/End: Original strand, 5145533 - 5145582
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccct 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  5145533 aggtctttacacttcatccctatacgggtctcatcaaaggtaatatccct 5145582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 92
Target Start/End: Original strand, 41899769 - 41899797
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggt 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41899769 aggtctttgcacttcatccccatgcgggt 41899797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18892 - 18559
Alignment:
Q  1 tcatcagtgataggctccaactcaaactgaattttctctatcccgatttccgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18892 tcatcagtgataggctccacctcaaactgaattttctcttcctccgtttctgagcttgtatccaggtctttgcacttcatccccatacgggtctcatcaa 18793  T
Q  101 aagtaacatccctgcttataataaattttgatcctctaggttccatccttcatagtctgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacactt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18792 aagtgacatccctgcttataataaattttgatcctccaggttccatcttccacagtctataacctttcacagcttcaggataacccatgaaaatacactt 18693  T
Q  201 cacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  18692 cacagctctagcatcaagtttgtcctgtctaacatgggcaaacgctaaagctccgaaaactttcaaattagagtagtttgccggcctcccactccaaacc 18593  T
Q  301 tccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18592 tccataggtgtcttgagatctatccctgttgatg 18559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 334
Target Start/End: Original strand, 49044 - 49154
Alignment:
Q  224 cttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagactttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctat 323  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  49044 cttgcctgacatgggcaaacgctaaagctccgaagactttcaagttagagtagtctaccggtctcccactccaaacctccataggtgtctcgagatctat 49143  T
Q  324 ccctgatgatg 334  Q
    ||||| |||||    
T  49144 ccctgttgatg 49154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16771 - 16506
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  | | ||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  16771 aggtctttacacttcatccccatccgggtctcatcaaaggtaacatccctacttatcaagactcttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 16672  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  16671 accccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 16572  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccc 326  Q
     |||||    || || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  16571 cttcaaagaggagtaatctgccggtttcccactccatacctccataggtgtcttgaagtctatccc 16506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 334
Target Start/End: Original strand, 133 - 406
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  133 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaatcaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 232  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  233 aacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 332  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
     |||||    || || ||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||| |||||    
T  333 cttcaaagatgagtaatctgccgctttcccactccatacttccataggtgtcttgaagtctattcctgttgatg 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 334
Target Start/End: Original strand, 8289 - 8562
Alignment:
Q  64 aggtctttgcacttcatccccatgcgggtctcatcaaaagtaacatccctgcttataataaattttgatcct---ctaggttccatccttcatagtctgt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |  | ||||||||||   |||| |||||   | || |   |||    
T  8289 aggtctttacacttcatccccatacgggtctcatcaaaggtaacatccctactaattaagacttttgatcctccactagattccaatttccacaacttgt 8388  T
Q  161 aacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgcctgacataatcaaacgctaaagcaccgaagac 260  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||| ||   || | || ||||| ||||| ||    
T  8389 aacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcaaagctctaggctcaagcttgtcttgcttgatatgcgcatatgccaaagctccgaaaac 8488  T
Q  261 tttcaagttagattagtctgccggtctcccactccaaacctccataggtgtcctgagatctatccctgatgatg 334  Q
     |||||    || || ||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||  ||||| |||| |||||    
T  8489 cttcaaagatgagtaatctgccgctttcccactccatacttccataggtgtcttgaagtctattcctgttgatg 8562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 228
Target Start/End: Original strand, 34732 - 34802
Alignment:
Q  158 tgtaacctttcacaccttcaggataacccatgaaaacacacttcacagctctagcatcaagtttgtcttgc 228  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  34732 tgtaacccttcacaccttccggataaccaatgaagacacatttcacagctctagccttaagcttgtcttgc 34802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University