View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16339_low_4 (Length: 220)

Name: NF16339_low_4
Description: NF16339
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16339_low_4
NF16339_low_4
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (9-220)||(256615-256827)
scaffold0011 (9-139)||(72191-72317)
scaffold0011 (9-139)||(76572-76698)
scaffold0011 (9-138)||(125173-125298)
scaffold0011 (9-142)||(192768-192897)
scaffold0011 (179-220)||(125048-125089)
scaffold0011 (181-220)||(72067-72106)
scaffold0011 (181-220)||(76448-76487)
scaffold0011 (187-220)||(192985-193018)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (9-220)||(26071918-26072131)
chr7 (9-220)||(26095705-26095918)
chr7 (9-220)||(44863443-44863656)
chr7 (9-220)||(15824159-15824371)
chr7 (9-220)||(47287976-47288189)
chr7 (9-220)||(141869-142081)
chr7 (9-201)||(7286328-7286522)
chr7 (9-201)||(12545607-12545802)
chr7 (9-200)||(18305642-18305831)
chr7 (9-200)||(13867887-13868080)
chr7 (9-202)||(7290908-7291102)
chr7 (9-201)||(2192606-2192799)
chr7 (9-201)||(369143-369336)
chr7 (9-201)||(14253071-14253263)
chr7 (9-201)||(16480836-16481029)
chr7 (9-201)||(15952859-15953050)
chr7 (9-193)||(3893381-3893573)
chr7 (9-193)||(12753172-12753358)
chr7 (9-220)||(49049509-49049723)
chr7 (9-193)||(112986-113168)
chr7 (9-220)||(15629004-15629218)
chr7 (24-197)||(15762262-15762429)
chr7 (109-220)||(1938421-1938532)
chr7 (9-78)||(16571983-16572053)
chr7 (9-78)||(16593609-16593679)
chr7 (104-201)||(2024757-2024858)
chr7 (111-220)||(45453907-45454016)
chr7 (9-220)||(13272976-13273190)
chr7 (127-201)||(12545553-12545627)
chr7 (108-218)||(16571810-16571921)
chr7 (108-218)||(16593741-16593852)
chr7 (9-73)||(2024692-2024757)
chr7 (9-193)||(16416509-16416684)
chr7 (127-199)||(16480710-16480782)
chr7 (9-84)||(45455505-45455581)
chr7 (109-220)||(10862572-10862683)
chr7 (127-199)||(2192480-2192552)
chr7 (140-220)||(12249828-12249908)
chr7 (172-220)||(18305498-18305546)
chr7 (9-201)||(11582659-11582840)
chr7 (145-220)||(15952738-15952813)
chr7 (179-220)||(11285619-11285660)
chr7 (179-220)||(11582590-11582631)
chr7 (179-220)||(13867743-13867784)
chr7 (145-217)||(2024904-2024976)
chr7 (97-201)||(122854-122951)
chr7 (9-138)||(13038989-13039114)
chr7 (179-220)||(32496200-32496242)
chr7 (179-220)||(13038864-13038905)
chr7 (9-80)||(16209975-16210045)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (9-220)||(5845-6057)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (9-216)||(36892419-36892628)
chr2 (9-220)||(25877673-25877882)
chr2 (9-200)||(42180210-42180402)
chr2 (9-201)||(21276342-21276535)
chr2 (9-195)||(24966425-24966609)
chr2 (24-192)||(12638003-12638171)
chr2 (9-194)||(21140139-21140325)
chr2 (9-213)||(28972272-28972480)
chr2 (9-220)||(7319718-7319932)
chr2 (9-201)||(12643812-12644000)
chr2 (109-201)||(25600309-25600401)
chr2 (91-220)||(6877821-6877952)
chr2 (91-201)||(15631702-15631812)
chr2 (9-194)||(269422-269608)
chr2 (9-220)||(31889-32102)
chr2 (9-95)||(4450084-4450171)
chr2 (9-220)||(24573107-24573320)
chr2 (9-201)||(3801123-3801306)
chr2 (9-201)||(38706810-38706993)
chr2 (9-201)||(34822315-34822498)
chr2 (9-220)||(8886450-8886650)
chr2 (9-220)||(22581645-22581858)
chr2 (127-220)||(12643665-12643758)
chr2 (148-220)||(43644616-43644688)
chr2 (127-194)||(12637873-12637940)
chr2 (9-95)||(22691823-22691910)
chr2 (9-95)||(22696470-22696557)
chr2 (9-95)||(25600173-25600260)
chr2 (9-80)||(8941712-8941784)
chr2 (9-80)||(19888848-19888920)
chr2 (126-194)||(22691690-22691758)
chr2 (126-194)||(22696337-22696405)
chr2 (24-201)||(25210909-25211076)
chr2 (127-194)||(34822578-34822645)
chr2 (9-78)||(6877721-6877791)
chr2 (93-201)||(20629142-20629243)
chr2 (93-201)||(43644713-43644814)
chr2 (129-201)||(25211108-25211180)
chr2 (127-194)||(3800822-3800889)
chr2 (9-201)||(9654615-9654792)
chr2 (9-81)||(22654339-22654412)
chr2 (179-220)||(461139-461180)
chr2 (127-201)||(3800969-3801043)
chr2 (9-78)||(22273164-22273233)
chr2 (127-220)||(24089028-24089120)
chr2 (127-201)||(24089074-24089146)
chr2 (147-200)||(461007-461060)
chr2 (187-220)||(9654546-9654579)
chr2 (179-220)||(20629073-20629114)
chr2 (93-138)||(23806359-23806404)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (9-220)||(25120745-25120957)
chr8 (9-192)||(37605283-37605467)
chr8 (9-169)||(41243948-41244109)
chr8 (9-200)||(18610428-18610620)
chr8 (9-201)||(41508927-41509122)
chr8 (9-196)||(24719328-24719513)
chr8 (9-201)||(13664550-13664743)
chr8 (9-201)||(13723825-13724018)
chr8 (9-190)||(22008366-22008548)
chr8 (9-201)||(22909342-22909535)
chr8 (9-220)||(19994857-19995078)
chr8 (9-201)||(24108465-24108657)
chr8 (9-193)||(20655756-20655943)
chr8 (9-220)||(20479893-20480111)
chr8 (9-201)||(23509068-23509261)
chr8 (24-201)||(22323225-22323398)
chr8 (9-200)||(269950-270138)
chr8 (9-200)||(645782-645970)
chr8 (9-200)||(831517-831705)
chr8 (9-200)||(16043054-16043245)
chr8 (9-220)||(16416537-16416755)
chr8 (9-162)||(17343480-17343632)
chr8 (9-200)||(16041378-16041569)
chr8 (9-127)||(6776303-6776422)
chr8 (9-201)||(43375310-43375493)
chr8 (110-220)||(17731174-17731286)
chr8 (9-218)||(38531882-38532093)
chr8 (93-220)||(16203978-16204098)
chr8 (9-201)||(3433535-3433718)
chr8 (9-218)||(18768481-18768691)
chr8 (9-71)||(28543151-28543213)
chr8 (108-213)||(28543270-28543377)
chr8 (127-199)||(13664424-13664496)
chr8 (127-199)||(13723699-13723771)
chr8 (127-190)||(23509315-23509378)
chr8 (9-138)||(23631046-23631173)
chr8 (9-193)||(28835980-28836155)
chr8 (127-194)||(3433285-3433352)
chr8 (9-81)||(39448573-39448646)
chr8 (9-64)||(17731331-17731387)
chr8 (97-201)||(29758643-29758740)
chr8 (9-50)||(21695899-21695941)
chr8 (179-220)||(22008194-22008236)
chr8 (179-220)||(29758768-29758810)
chr8 (186-220)||(41244112-41244146)
chr8 (127-192)||(3433390-3433455)
chr8 (187-220)||(24719132-24719165)
chr8 (187-220)||(43375241-43375274)
chr8 (188-220)||(270226-270258)
chr8 (188-220)||(645662-645694)
chr8 (188-220)||(831397-831429)
chr8 (152-220)||(24108300-24108368)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (9-220)||(31626739-31626952)
chr6 (9-220)||(25646573-25646786)
chr6 (9-201)||(35017451-35017645)
chr6 (9-200)||(35011124-35011316)
chr6 (9-201)||(18128340-18128532)
chr6 (9-201)||(18578834-18579027)
chr6 (9-195)||(13622937-13623121)
chr6 (9-193)||(18775506-18775691)
chr6 (9-200)||(19627498-19627690)
chr6 (24-201)||(14628368-14628545)
chr6 (9-201)||(18004857-18005050)
chr6 (9-201)||(23975708-23975902)
chr6 (9-201)||(18843708-18843900)
chr6 (9-185)||(13016528-13016702)
chr6 (32-192)||(33316422-33316582)
chr6 (9-193)||(16104850-16105037)
chr6 (9-141)||(23151706-23151839)
chr6 (75-201)||(18825647-18825774)
chr6 (9-220)||(22428473-22428689)
chr6 (9-220)||(32896282-32896486)
chr6 (24-197)||(1553946-1554113)
chr6 (9-213)||(18397163-18397371)
chr6 (9-193)||(25745987-25746160)
chr6 (9-138)||(16827873-16828003)
chr6 (108-220)||(25369071-25369184)
chr6 (154-220)||(18422182-18422248)
chr6 (9-89)||(17787746-17787827)
chr6 (127-194)||(23975956-23976023)
chr6 (127-199)||(14628316-14628388)
chr6 (9-80)||(25173518-25173590)
chr6 (24-201)||(4989004-4989171)
chr6 (141-195)||(16238711-16238765)
chr6 (9-201)||(18740645-18740828)
chr6 (127-201)||(4989201-4989275)
chr6 (9-78)||(18422115-18422185)
chr6 (131-192)||(33316292-33316353)
chr6 (181-220)||(16238848-16238887)
chr6 (131-201)||(16827663-16827733)
chr6 (187-220)||(18740863-18740896)
chr6 (181-220)||(13622839-13622878)
chr6 (127-185)||(18004770-18004827)
chr6 (179-220)||(19984845-19984887)
chr6 (9-201)||(19984915-19985096)
chr6 (127-201)||(25173731-25173805)
chr6 (9-80)||(18835474-18835544)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (9-220)||(17098913-17099126)
chr3 (9-220)||(30204696-30204908)
chr3 (9-201)||(11812801-11812994)
chr3 (9-220)||(6148512-6148723)
chr3 (9-220)||(51160123-51160335)
chr3 (9-201)||(38166213-38166407)
chr3 (9-201)||(18737974-18738167)
chr3 (9-201)||(19944805-19944998)
chr3 (9-201)||(7851683-7851877)
chr3 (9-201)||(30140984-30141177)
chr3 (9-193)||(319297-319486)
chr3 (9-217)||(50113780-50113991)
chr3 (9-217)||(22145940-22146145)
chr3 (14-192)||(12796728-12796908)
chr3 (9-220)||(19572485-19572693)
chr3 (9-201)||(17936455-17936649)
chr3 (9-220)||(16183720-16183945)
chr3 (9-201)||(16819043-16819234)
chr3 (9-220)||(14287323-14287539)
chr3 (9-213)||(11199207-11199415)
chr3 (9-220)||(47786522-47786735)
chr3 (66-197)||(8630101-8630232)
chr3 (9-193)||(35121921-35122105)
chr3 (9-117)||(54045594-54045703)
chr3 (9-220)||(12351495-12351709)
chr3 (104-201)||(13815973-13816070)
chr3 (9-194)||(14296730-14296917)
chr3 (9-194)||(14302357-14302544)
chr3 (9-142)||(17958169-17958303)
chr3 (36-197)||(54686551-54686707)
chr3 (108-220)||(11062748-11062861)
chr3 (9-84)||(11062944-11063020)
chr3 (36-197)||(9304664-9304819)
chr3 (9-142)||(25057035-25057166)
chr3 (9-84)||(14523202-14523278)
chr3 (9-95)||(13815856-13815943)
chr3 (9-201)||(19230318-19230499)
chr3 (127-201)||(11813179-11813253)
chr3 (9-84)||(17536847-17536923)
chr3 (9-193)||(18908679-18908854)
chr3 (9-193)||(22273034-22273209)
chr3 (134-201)||(7851968-7852035)
chr3 (127-201)||(18908892-18908966)
chr3 (24-201)||(49230262-49230429)
chr3 (127-199)||(11813048-11813120)
chr3 (9-141)||(23490768-23490898)
chr3 (131-194)||(16819292-16819355)
chr3 (9-84)||(53900388-53900463)
chr3 (111-220)||(15516035-15516144)
chr3 (127-201)||(7851857-7851931)
chr3 (9-131)||(33340038-33340155)
chr3 (133-220)||(14060894-14060980)
chr3 (133-220)||(17137827-17137913)
chr3 (9-194)||(19262733-19262907)
chr3 (9-67)||(12563338-12563397)
chr3 (145-220)||(49230655-49230730)
chr3 (129-195)||(14523088-14523154)
chr3 (9-81)||(39654163-39654237)
chr3 (179-217)||(45581310-45581348)
chr3 (179-220)||(11813307-11813348)
chr3 (179-219)||(17958052-17958093)
chr3 (127-195)||(7852223-7852291)
chr3 (133-220)||(12563193-12563281)
chr3 (9-79)||(14061039-14061110)
chr3 (181-220)||(15860863-15860902)
chr3 (127-201)||(2451155-2451229)
chr3 (179-220)||(17913891-17913933)
chr3 (127-201)||(22273247-22273321)
chr3 (127-201)||(49230509-49230583)
chr3 (145-194)||(2451035-2451084)
chr3 (93-142)||(10736904-10736953)
chr3 (93-142)||(45581181-45581230)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (9-220)||(22407949-22408162)
chr1 (9-220)||(2422788-2422997)
chr1 (9-201)||(41217544-41217739)
chr1 (9-193)||(5676350-5676535)
chr1 (9-200)||(20252342-20252534)
chr1 (9-201)||(9786123-9786315)
chr1 (9-185)||(35053141-35053308)
chr1 (9-194)||(35524165-35524350)
chr1 (72-201)||(22250776-22250905)
chr1 (137-220)||(49966013-49966096)
chr1 (9-181)||(18505646-18505817)
chr1 (9-194)||(21716430-21716624)
chr1 (9-220)||(51658043-51658255)
chr1 (35-201)||(20895514-20895660)
chr1 (127-201)||(41217793-41217867)
chr1 (109-220)||(22836968-22837078)
chr1 (9-201)||(15863325-15863508)
chr1 (9-201)||(21857753-21857934)
chr1 (9-201)||(17146820-17147003)
chr1 (127-190)||(5676293-5676355)
chr1 (127-199)||(22352498-22352570)
chr1 (127-201)||(15863221-15863295)
chr1 (9-201)||(22352285-22352468)
chr1 (127-220)||(20956684-20956776)
chr1 (179-220)||(20895445-20895486)
chr1 (9-142)||(22364943-22365074)
chr1 (145-220)||(15863074-15863149)
chr1 (41-154)||(20589963-20590078)
chr1 (9-58)||(22080190-22080240)
chr1 (179-220)||(20444214-20444255)
chr1 (179-220)||(20529978-20530019)
chr1 (187-220)||(20929955-20929988)
chr1 (179-220)||(37846121-37846162)
chr1 (93-131)||(20444085-20444123)
chr1 (93-131)||(20529825-20529863)
chr1 (179-220)||(22352601-22352643)
chr1 (179-220)||(9785954-9785995)
chr1 (179-220)||(27673257-27673298)
chr1 (93-138)||(37846241-37846286)
chr1 (111-154)||(27673216-27673260)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (9-220)||(31038-31249)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (9-220)||(138461-138673)
scaffold0021 (9-220)||(76589-76798)
scaffold0021 (113-213)||(10003-10105)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (9-220)||(12837979-12838192)
chr4 (9-201)||(18166874-18167067)
chr4 (9-201)||(34393385-34393580)
chr4 (9-201)||(53909555-53909750)
chr4 (9-200)||(19699414-19699606)
chr4 (9-200)||(19709999-19710191)
chr4 (9-201)||(7134310-7134503)
chr4 (9-201)||(8372607-8372800)
chr4 (9-220)||(44345057-44345278)
chr4 (9-201)||(15274470-15274663)
chr4 (9-220)||(33738477-33738676)
chr4 (9-201)||(26678179-26678370)
chr4 (9-185)||(45460713-45460894)
chr4 (9-220)||(16366416-16366624)
chr4 (9-193)||(21961253-21961440)
chr4 (9-203)||(53706635-53706828)
chr4 (9-201)||(22356424-22356616)
chr4 (9-220)||(44054168-44054372)
chr4 (9-193)||(12901455-12901631)
chr4 (9-182)||(20813715-20813890)
chr4 (9-190)||(47355509-47355688)
chr4 (9-220)||(13244606-13244806)
chr4 (9-154)||(18294600-18294746)
chr4 (9-220)||(13811344-13811558)
chr4 (9-220)||(30236204-30236411)
chr4 (9-201)||(15211515-15211698)
chr4 (9-89)||(8874265-8874346)
chr4 (127-183)||(34393610-34393666)
chr4 (91-193)||(55378542-55378646)
chr4 (127-194)||(8372854-8372921)
chr4 (127-194)||(18167097-18167164)
chr4 (127-220)||(15211762-15211856)
chr4 (9-142)||(9293712-9293843)
chr4 (9-142)||(10642374-10642505)
chr4 (9-201)||(19998517-19998700)
chr4 (131-194)||(26678428-26678491)
chr4 (127-193)||(19998907-19998973)
chr4 (127-192)||(19998780-19998845)
chr4 (126-194)||(13751910-13751978)
chr4 (9-80)||(18246178-18246250)
chr4 (127-191)||(47355705-47355769)
chr4 (9-201)||(16520801-16520985)
chr4 (9-142)||(54120066-54120195)
chr4 (16-82)||(55378691-55378757)
chr4 (93-194)||(109828-109922)
chr4 (169-220)||(53706540-53706591)
chr4 (127-220)||(7134116-7134208)
chr4 (127-192)||(16521015-16521080)
chr4 (187-220)||(53909486-53909519)
chr4 (127-201)||(18246391-18246465)
chr4 (9-62)||(18496280-18496334)
chr4 (109-153)||(43283140-43283185)
chr4 (14-73)||(5684742-5684802)
chr4 (110-220)||(18496121-18496233)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (9-220)||(37760-37973)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (9-193)||(236412-236597)
scaffold0009 (9-201)||(270329-270515)
scaffold0009 (127-220)||(270545-270638)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (9-201)||(27950-28145)
scaffold0116 (127-220)||(28179-28272)
scaffold0116 (127-201)||(28125-28199)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (9-220)||(21392432-21392643)
chr5 (9-201)||(34937571-34937764)
chr5 (9-193)||(21661407-21661593)
chr5 (9-201)||(10307-10500)
chr5 (9-201)||(10780112-10780305)
chr5 (9-201)||(43445708-43445901)
chr5 (9-201)||(28257781-28257970)
chr5 (9-201)||(22885041-22885234)
chr5 (9-195)||(25211796-25211982)
chr5 (9-195)||(25275948-25276134)
chr5 (9-198)||(17473704-17473892)
chr5 (24-192)||(19497952-19498120)
chr5 (9-220)||(4863551-4863778)
chr5 (9-201)||(11579922-11580113)
chr5 (9-193)||(27185517-27185699)
chr5 (9-200)||(23986165-23986359)
chr5 (9-151)||(1171320-1171464)
chr5 (9-201)||(9732592-9732782)
chr5 (9-201)||(1221638-1221826)
chr5 (9-220)||(23453184-23453397)
chr5 (9-220)||(23460428-23460641)
chr5 (9-220)||(23464689-23464902)
chr5 (129-220)||(1170376-1170467)
chr5 (127-220)||(11582266-11582359)
chr5 (9-220)||(24184926-24185137)
chr5 (9-201)||(29192671-29192857)
chr5 (16-197)||(17907853-17908030)
chr5 (9-201)||(35793162-35793345)
chr5 (127-201)||(10554-10628)
chr5 (127-220)||(1221491-1221584)
chr5 (127-194)||(9732495-9732562)
chr5 (9-213)||(11338584-11338802)
chr5 (9-169)||(24470555-24470712)
chr5 (9-201)||(25944566-25944750)
chr5 (9-201)||(11340599-11340782)
chr5 (9-201)||(18780052-18780235)
chr5 (127-194)||(11341018-11341085)
chr5 (24-201)||(110990-111157)
chr5 (127-193)||(19498182-19498248)
chr5 (9-201)||(16534391-16534574)
chr5 (24-80)||(25424680-25424736)
chr5 (127-191)||(25944472-25944536)
chr5 (127-199)||(43445582-43445654)
chr5 (127-201)||(22368337-22368411)
chr5 (127-199)||(10780011-10780082)
chr5 (9-80)||(22368602-22368674)
chr5 (145-220)||(22884942-22885017)
chr5 (179-220)||(17473607-17473648)
chr5 (145-196)||(16534750-16534801)
chr5 (131-201)||(110888-110957)
chr5 (9-81)||(7726919-7726993)
chr5 (127-185)||(29192583-29192641)
chr5 (179-220)||(21653107-21653148)
chr5 (104-141)||(21653228-21653265)
chr5 (187-220)||(24470716-24470749)
chr5 (152-220)||(25211651-25211719)
chr5 (152-220)||(25275803-25275871)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (9-200)||(3055-3248)
scaffold0269 (9-201)||(281-477)
scaffold0269 (187-220)||(3430-3463)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (9-200)||(30650-30843)
scaffold0049 (187-220)||(31002-31035)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (9-201)||(13548-13740)
scaffold0359 (151-220)||(13489-13557)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (9-220)||(20860-21073)
scaffold0008 (9-220)||(28450-28663)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (9-218)||(535-745)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (9-201)||(4638-4831)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (9-201)||(49478-49671)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (9-200)||(26451-26642)
scaffold0138 (9-220)||(15061-15271)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (9-201)||(21633-21827)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (9-201)||(156183-156376)
scaffold0023 (9-201)||(85966-86149)
scaffold0023 (127-194)||(156062-156129)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (9-220)||(7068-7287)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (25-201)||(7453-7631)
scaffold0622 (124-201)||(7682-7759)
scaffold0622 (127-193)||(7842-7908)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (9-192)||(2474-2658)
scaffold0342 (9-220)||(4078-4289)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (9-217)||(1104-1307)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (11-201)||(77600-77793)
scaffold0034 (107-154)||(35999-36047)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (9-192)||(14849-15032)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (9-200)||(17735-17928)
scaffold0292 (179-220)||(18055-18096)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (9-195)||(499-683)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (24-201)||(29653-29830)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (9-201)||(33395-33580)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (9-201)||(39264-39449)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (12-201)||(6984-7175)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (9-158)||(23040-23190)
scaffold0158 (9-77)||(16376-16445)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (40-199)||(94335-94495)
[»] scaffold0195 (5 HSPs)
scaffold0195 (9-201)||(17526-17716)
scaffold0195 (9-201)||(19556-19746)
scaffold0195 (126-193)||(19799-19866)
scaffold0195 (9-81)||(8466-8539)
scaffold0195 (9-81)||(13855-13928)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (9-220)||(12488-12709)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (12-185)||(68597-68773)
scaffold0031 (9-213)||(30314-30519)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (66-201)||(16826-16961)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (9-193)||(59865-60051)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (116-216)||(26475-26575)
scaffold0037 (9-183)||(66415-66592)
scaffold0037 (9-78)||(26590-26660)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (91-220)||(3762-3893)
scaffold0673 (9-95)||(3927-4014)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (9-201)||(2907-3101)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (9-201)||(9930-10122)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (9-142)||(4425-4561)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (9-194)||(113965-114150)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (9-220)||(19287-19489)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (9-220)||(1652-1865)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (9-201)||(90802-91018)
scaffold0028 (127-220)||(90655-90748)
scaffold0028 (127-201)||(128730-128804)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (66-201)||(21158-21288)
scaffold0039 (127-201)||(21030-21104)
scaffold0039 (179-220)||(20961-21002)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (9-193)||(13964-14153)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (108-201)||(13914-14007)
scaffold0396 (9-84)||(14078-14154)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (9-201)||(6410-6583)
scaffold0407 (9-105)||(22-119)
scaffold0407 (179-220)||(6365-6406)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (9-181)||(56206-56370)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (9-193)||(75550-75727)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (67-190)||(25594-25718)
scaffold0134 (127-191)||(25735-25799)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (9-213)||(3188-3395)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (16-220)||(6123-6329)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (36-197)||(44288-44443)
scaffold0066 (36-182)||(52457-52597)
[»] scaffold0447 (5 HSPs)
scaffold0447 (127-201)||(2737-2811)
scaffold0447 (127-201)||(2865-2939)
scaffold0447 (134-201)||(2616-2683)
scaffold0447 (127-201)||(2993-3067)
scaffold0447 (9-95)||(2475-2561)
[»] scaffold0383 (6 HSPs)
scaffold0383 (134-201)||(5480-5547)
scaffold0383 (127-201)||(5601-5675)
scaffold0383 (9-201)||(328-511)
scaffold0383 (9-95)||(5339-5425)
scaffold0383 (127-201)||(641-715)
scaffold0383 (145-220)||(813-888)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (127-201)||(109897-109971)
scaffold0032 (93-201)||(54011-54112)
scaffold0032 (147-200)||(110002-110055)
scaffold0032 (145-220)||(109724-109799)
scaffold0032 (181-220)||(54118-54158)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (125-201)||(15935-16011)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (36-131)||(12989-13085)
scaffold0130 (9-80)||(31120-31192)
scaffold0130 (127-185)||(31333-31391)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (110-194)||(31925-32010)
scaffold0103 (9-84)||(31776-31850)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (9-81)||(144987-145060)
scaffold0014 (127-220)||(145283-145376)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (93-220)||(249193-249313)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (9-201)||(804-987)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (9-201)||(2899-3083)
scaffold0597 (127-220)||(2776-2869)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (9-201)||(27169-27352)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (9-80)||(15167-15239)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (9-95)||(4639-4725)
scaffold0450 (126-194)||(4528-4596)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (127-220)||(3952-4044)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (24-89)||(26889-26954)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (9-64)||(8387-8443)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (9-193)||(5221-5396)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (9-142)||(1298-1427)
scaffold1140 (181-220)||(1509-1548)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (9-201)||(264-448)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (9-81)||(7416-7489)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (9-201)||(6934-7115)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (147-201)||(144926-144980)
scaffold0025 (147-201)||(147185-147239)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (9-81)||(2438-2511)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (187-220)||(12843-12876)
scaffold0266 (187-220)||(5241-5274)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (9-80)||(37627-37697)
scaffold0106 (187-220)||(40010-40043)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (9-50)||(7299-7341)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (93-142)||(11796-11845)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (9-81)||(72093-72166)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (191-220)||(163817-163846)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (126-213)||(2901-2989)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (126-213)||(26604-26692)


Alignment Details
Target: scaffold0011 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 256827 - 256615
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256827 acatcatcataatccaaataacagttaatatgaatatttcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 256728  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  256727 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 256628  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  256627 ctcatgtcatgat 256615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 72317 - 72191
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  72317 acatcatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 72225  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcac 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  72224 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcac 72191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 76698 - 76572
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  76698 acatcatcataatccaaataacagttatcaagaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 76606  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcac 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  76605 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcac 76572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 125298 - 125173
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  125298 acatcatcataatctaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 125206  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatca 138  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  125205 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatca 125173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 192768 - 192897
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  192768 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 192860  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  192861 accccaatatctcacatcaataatcatcaattacatg 192897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 125089 - 125048
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  125089 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 125048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 72106 - 72067
Alignment:
Q  181 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  72106 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 72067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 76487 - 76448
Alignment:
Q  181 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  76487 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 76448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 192985 - 193018
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  192985 caatcacatatatcaataagactcatgccatgat 193018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26072131 - 26071918
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26072131 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26072032  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26072031 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 26071932  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  26071931 actcatgtcatgat 26071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26095918 - 26095705
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26095918 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26095819  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26095818 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 26095719  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  26095718 actcatgtcatgat 26095705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 44863443 - 44863656
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  44863443 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacttatacttacatcaaaa 44863542  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44863543 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataag 44863642  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  44863643 actcatgtcatgat 44863656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15824371 - 15824159
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824371 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 15824272  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  15824271 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacataatcaccaaacacatacatcaataaga 15824172  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  15824171 ctcatgtcatgat 15824159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 47287976 - 47288189
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  47287976 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcgtacatatacttacatcaaaa 47288075  T
Q  108 -cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  47288076 acccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaattacatacatcaataag 47288175  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  47288176 actcatgtcatgat 47288189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 141869 - 142081
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141869 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaatcatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 141968  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  141969 cccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaattattcatacacaataaccaatcacatacatcaataaga 142068  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  142069 ctcatgtcatgat 142081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7286522 - 7286328
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7286522 acatcatcataatcaacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 7286423  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7286422 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7286328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12545802 - 12545607
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  12545802 acatcatcatagtccacattacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcttatacatatacttacatcaaaa 12545703  T
Q  107 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12545702 accccaatatctcacatcaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 12545607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18305831 - 18305642
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||| |||||    
T  18305831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacaccaaac 18305735  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18305734 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcgtcaatcacatatatc 18305642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13868080 - 13867887
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  13868080 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcataa 13867981  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
     | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13867980 tctcaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaatcacatatatc 13867887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 7290908 - 7291102
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  7290908 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 7291007  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa 202  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  7291008 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcaa 7291102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2192799 - 2192606
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  2192799 acattatcataatccaaataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 2192700  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  2192699 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 2192606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 369143 - 369336
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  369143 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatacatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 369242  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  369243 cccaatatctcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatca 369336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14253263 - 14253071
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  14253263 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 14253164  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  14253163 cccaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatg-acaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 14253071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16481029 - 16480836
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  16481029 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacatgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 16480930  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16480929 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 16480836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15953050 - 15952859
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15953050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 15952953  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  15952952 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 15952859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 3893381 - 3893573
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata------cttaca 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||      ||||||    
T  3893381 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcataaatatatatatacttaca 3893479  T
Q  102 tcaaa-ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3893480 tcaaaaccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcac 3893573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 12753172 - 12753358
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| |     
T  12753172 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacaaata-atacttatatcacat 12753270  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
     | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12753271 tctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaatttgcagttattcatacacagtcaccaatcac 12753358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49049723 - 49049509
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||| | |||  || |    
T  49049723 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatatattcatac--cata 49049626  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||| | |||| |||||| | ||||||    
T  49049625 atcccaatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacactaatcattcacatttcatcaat 49049526  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  49049525 aagactcatgtcatgat 49049509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 113168 - 112986
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |   | ||||   ||||||||||||||     
T  113168 acatcatcataatccaaataacatttagcatgaatatttcaaaataaacattatgcacttgatcaatagtagt---cacatatcaatacttacatcaaaa 113072  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  113071 ctcaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatgaacaaacaacaattcacatttattcatacgcaattatcaatcac 112986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 15629004 - 15629218
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |  ||| |||| | |||  || |    
T  15629004 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaatcataatatccatatatatattcatac--cata 15629101  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||    
T  15629102 atcccaatatcttacatcaattaatcaccaatcagatgtgttatgaacaatcatcaactcacatttattcatgcacaatcatcattcacatttcaccaat 15629201  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  15629202 aagactcatgtcatgat 15629218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15762429 - 15762262
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacat 122  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15762429 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaatatctcacat 15762330  T
Q  123 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
    ||||||||| | ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15762329 caataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 15762262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1938532 - 1938421
Alignment:
Q  109 ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac 208  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| | | | ||||||||    
T  1938532 ccaatatctcacatcaataaccaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaatacacaattatgcatacgtaatcaccaatcacgtttctaaataagac 1938433  T
Q  209 tcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||    
T  1938432 tcatgtcatgat 1938421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16572053 - 16571983
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 78  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16572053 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16571983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 16593609 - 16593679
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 78  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16593609 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 201
Target Start/End: Original strand, 2024757 - 2024858
Alignment:
Q  104 aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca----catgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2024757 aaaccgcaatatctcacatcaataatcaccaatcaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcatcaatcatatacat 2024856  T
Q  200 ca 201  Q
    ||    
T  2024857 ca 2024858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45454016 - 45453907
Alignment:
Q  111 aatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagact 209  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||    
T  45454016 aatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcaca-attcaaataagact 45453918  T
Q  210 catgtcatgat 220  Q
    |||||||||||    
T  45453917 catgtcatgat 45453907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 13272976 - 13273190
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    ||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | || | |||  || |    
T  13272976 acatcatcataattcacataacagttgacaagaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatacattcatac--cata 13273073  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  |||| |||| ||| ||||||||||| |||||| | | ||||    
T  13273074 atcccgatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtctggaacaatcatcaaatcacatttatccatgcacaatcatcattcacatttcaccaat 13273173  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  13273174 aagactcatgtcatgat 13273190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12545627 - 12545553
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12545627 aatcaccaatcacatatatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcccatatatca 12545553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16571921 - 16571810
Alignment:
Q  108 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  16571921 cccaatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataag 16571822  T
Q  207 actcatgtcatg 218  Q
    ||| ||||||||    
T  16571821 acttatgtcatg 16571810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 218
Target Start/End: Original strand, 16593741 - 16593852
Alignment:
Q  108 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  16593741 cccaatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataag 16593840  T
Q  207 actcatgtcatg 218  Q
    ||| ||||||||    
T  16593841 acttatgtcatg 16593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Original strand, 2024692 - 2024757
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa 73  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2024692 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 16416509 - 16416684
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  16416509 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 16416605  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16416606 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 16416684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16480782 - 16480710
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  16480782 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattccttcacaatcaccaatcacaaatat 16480710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 45455581 - 45455505
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 84  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45455581 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatttaattcaaaaatcatatacttgatcaataatgatattc 45455505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10862683 - 10862572
Alignment:
Q  109 ccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataag 206  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10862683 ccaatatcttacattaagtaaccaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaa-ccacattta-tcatgaacaatcatcaatcacatttcaccaataag 10862586  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||| ||||||||||    
T  10862585 acttatgtcatgat 10862572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2192552 - 2192480
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||    
T  2192552 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattccttcacaatcaccaataacaaatat 2192480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12249908 - 12249828
Alignment:
Q  140 atgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  12249908 atgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacattcactaatcacatttcgaaataagactcatgtcatgat 12249828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18305546 - 18305498
Alignment:
Q  172 ttcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305546 ttcataaacaatcaccaaccacatatatcaataagactcatgtcatgat 18305498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11582840 - 11582659
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||||| |||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  11582840 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatagttcaatt--aacatcatgcatttgattaataataat-----cacacattaatacttacatcac 11582748  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||       |||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
T  11582747 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatca-------catggacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaaccacatttatca 11582659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15952813 - 15952738
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  15952813 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacattttcaaataagactcatgtcatgat 15952738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 11285619 - 11285660
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11285619 acaatcattaatcacatttatcaataagactcatgtcatgat 11285660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11582631 - 11582590
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11582631 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 11582590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13867784 - 13867743
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13867784 acaatcaccaaccacatatatcaataagactcatgtcatgat 13867743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Original strand, 2024904 - 2024976
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcat 217  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  2024904 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcat 2024976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 122854 - 122951
Alignment:
Q  97 ttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 196  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||| |||| ||||     
T  122854 ttacatcacacctcaatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaactattaattcacaatcaccaattacatt 122946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13039114 - 13038989
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||| ||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  13039114 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatccataataat-----cacacattaatacttacatcac 13039022  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatca 138  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13039021 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatca 13038989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32496242 - 32496200
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32496242 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgat 32496200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13038905 - 13038864
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13038905 acaatcaccaatcacatatatcaataaaactcatgccatgat 13038864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 16209975 - 16210045
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  16209975 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattc--tattaacatcatgcatttgatcaataataat 16210045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 5845 - 6057
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5845 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgtatttgatcaataataacattctcatacatatagttacattaaac 5944  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5945 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaaa 6044  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  6045 ctcatgtcatgat 6057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36892628 - 36892419
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36892628 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 36892529  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36892528 ccccaatagcttacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 36892429  T
Q  207 actcatgtca 216  Q
    ||||||||||    
T  36892428 actcatgtca 36892419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25877882 - 25877673
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
T  25877882 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatacttacatcaatc 25877786  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25877785 cccaatatctcgcatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 25877686  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    ||||| |||||||    
T  25877685 ctcatatcatgat 25877673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42180402 - 42180210
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  42180402 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 42180303  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42180302 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 42180210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21276535 - 21276342
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| || |   |||||||||||||||    
T  21276535 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataagcatcatgcatttgatcaataatcatattcccacatcaatacttacatcaaac 21276436  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  21276435 cccaatatctcacatcgataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 21276342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 24966425 - 24966609
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  24966425 acatcatcataatccaaataaaagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 24966521  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24966522 cccaatatctcacattaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacat 24966609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12638171 - 12638003
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 123  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12638171 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaaccccaatgtctcacatc 12638072  T
Q  124 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12638071 aataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 12638003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 21140139 - 21140325
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  21140139 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 21140238  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  21140239 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtataaggaacaaatatcaattcacaagtattcatttacaatcatcaatcaca 21140325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 28972272 - 28972480
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || | |  ||    
T  28972272 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaat-taaacatcatgtacttgatcaataataatattcacacatatatacatataccataa 28972370  T
Q  106 accccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
      ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||    
T  28972371 ttcccaaaatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcctgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 28972470  T
Q  204 aagactcatg 213  Q
    ||||||||||    
T  28972471 aagactcatg 28972480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 7319718 - 7319932
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | | || |||| | |||  || |    
T  7319718 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacgtatatattcatac--cata 7319815  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | | ||||    
T  7319816 atcccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacattcattcatacacaatcatcattcacatttcaccaat 7319915  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  7319916 aagactcatgtcatgat 7319932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12644000 - 12643812
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||    
T  12644000 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaac 12643906  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12643905 cccaatgtctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcatatacatca 12643812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Original strand, 25600309 - 25600401
Alignment:
Q  109 ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25600309 ccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 25600401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 220
Target Start/End: Original strand, 6877821 - 6877952
Alignment:
Q  91 atatacttacatcaaaccccaa-tatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatca 188  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6877821 atatacttacatcaaaacccaaatatctgacattaataaatcaccattcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatcacca 6877920  T
Q  189 atcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  6877921 atcacatttccaaataagactcatgtcatgat 6877952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 201
Target Start/End: Original strand, 15631702 - 15631812
Alignment:
Q  91 atatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || ||||||    
T  15631702 atatacttacatcaaactccaatatctcacatcaataatctccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaacttacaattattcatacaccattatcaat 15631801  T
Q  191 cacatatatca 201  Q
    || ||||||||    
T  15631802 catatatatca 15631812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 269422 - 269608
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||  |||||| || | ||  |    
T  269422 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattaaatataaacatcatgaatttgatcaataacaatattcacat--atatacatataccatga 269519  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
     | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| || |||||| | ||||||||    
T  269520 tctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatatatttatgcacaattaccaatcaca 269608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32102 - 31889
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgat-caataataatattctcatacatatacttacatcaaa 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||||||| | |||| |||| | ||| |  ||    
T  32102 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaattcgataataatat-cacatatatattcatac-tataa 32005  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 204  Q
       |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  32004 tttcaatatctcacatcaaataatcaccagtcacatatgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaata 31905  T
Q  205 agactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  31904 agactcatgtcatgat 31889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4450171 - 4450084
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4450171 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattctcatatatata 4450084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24573320 - 24573107
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||  ||||||| ||   || | ||||| | |||  | |    
T  24573320 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgtatttaatccgataataaaat---cacaaatatattcacactata 24573224  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| || ||||||| |||||||||| | | ||||    
T  24573223 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatgcacaatcttcaatcacatttcaccaat 24573124  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  24573123 aagactcatgtcatgat 24573107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3801306 - 3801123
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  3801306 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 3801210  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  3801209 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 3801123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38706993 - 38706810
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata-tacttacatcaaa 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | | |||   || ||||||||||| |    
T  38706993 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcaca 38706898  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38706897 caccaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatca 38706810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 34822315 - 34822498
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  34822315 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 34822411  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  34822412 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 34822498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 8886450 - 8886650
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||| |||||||     
T  8886450 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacatcaatacctacatcac 8886542  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
    || |||||||||  ||||||||||||  |||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8886543 actccaatatctcgcatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcactcacaatcaccaatcacacatatcaataa 8886635  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  8886636 gactcatgtcatgat 8886650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22581858 - 22581645
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||  ||||||||||   || | ||||| | |||  | |    
T  22581858 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatttatttaatccgataataatat---cacaaatatattcacactata 22581762  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || | | ||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  22581761 atctcaatatctcacgtcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcatattcatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 22581662  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  22581661 aagactcatgtcatgat 22581645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12643758 - 12643665
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  12643758 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcagaaatattcatacacaatcaccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgat 12643665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43644688 - 43644616
Alignment:
Q  148 tgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43644688 tgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcaataagactcatgtcatgat 43644616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12637940 - 12637873
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12637940 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 12637873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22691910 - 22691823
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22691910 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22691823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22696557 - 22696470
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22696557 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22696470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 25600173 - 25600260
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  25600173 acatcatcataatccacataacagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattcacacacatata 25600260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 8941712 - 8941784
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8941712 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 8941784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19888920 - 19888848
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19888920 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 19888848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22691758 - 22691690
Alignment:
Q  126 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22691758 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 22691690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22696405 - 22696337
Alignment:
Q  126 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  22696405 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 22696337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 25210909 - 25211076
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 123  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  25210909 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacaccccgatatctcacatc 25211005  T
Q  124 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | || ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  25211006 agtattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 25211076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Original strand, 34822578 - 34822645
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34822578 aatcaccaattacatgtatcatgaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 34822645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 6877721 - 6877791
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 78  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  6877721 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcatacacttgaacaataata 6877791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20629243 - 20629142
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||       ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20629243 atacttacatcacaccccattatctcacatcaataattatcaatcacatg-------aacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatca 20629151  T
Q  193 catatatca 201  Q
    ||| |||||    
T  20629150 catttatca 20629142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43644814 - 43644713
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43644814 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcgcaattattcattcacaatcaccaatca 43644722  T
Q  193 catatatca 201  Q
    ||| |||||    
T  43644721 catttatca 43644713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Original strand, 25211108 - 25211180
Alignment:
Q  129 tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  25211108 tcaccaattacttgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 25211180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3800889 - 3800822
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3800889 aatcaccattcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 3800822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9654792 - 9654615
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||      |||| | |||||||||||||||   | ||||   |||||||||||| |     
T  9654792 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatat------catgcatttgatcaataataat---cacatattaatacttacatcacat 9654702  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  9654701 cccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaattaccaatcacatttatca 9654615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 22654339 - 22654412
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  22654339 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaataataata 22654412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 461139 - 461180
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  461139 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 461180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3801043 - 3800969
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  3801043 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 3800969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 22273164 - 22273233
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 78  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22273164 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaat-taatcatcatgtatttgatcaataata 22273233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24089120 - 24089028
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  24089120 aatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcgtgtcatgat 24089028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24089146 - 24089074
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  24089146 aatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacattta-tcatgaacaatcatcaatcacatttatca 24089074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Original strand, 461007 - 461060
Alignment:
Q  147 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  461007 atgaacaattatcaagtcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatc 461060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9654579 - 9654546
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9654579 caatcacatatatcaataagactcatggcatgat 9654546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20629114 - 20629073
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20629114 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcttgccatgat 20629073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23806404 - 23806359
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  23806404 atacttacatcacaccccaatatcccacatcaataatcatcaatca 23806359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 25120745 - 25120957
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120745 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 25120844  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25120845 cccaatatctcacataaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaattatcaaacacatatatcaataaga 25120944  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  25120945 ctcatgtcatgat 25120957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Original strand, 37605283 - 37605467
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37605283 acatcatcataatctaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaac 37605382  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37605383 cccaatatttcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatca 37605467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 41243948 - 41244109
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41243948 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 41244047  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaat 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41244048 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaat 41244109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 18610428 - 18610620
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18610428 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18610527  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18610528 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 18610620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41509122 - 41508927
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41509122 acatcatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaattcaaacatcaggcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 41509023  T
Q  107 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41509022 accccaatatctcacatcaataatcaccactcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 41508927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24719513 - 24719328
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||| ||||||||    
T  24719513 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttgcatcaaac 24719417  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 196  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24719416 cccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacaattattcatacacaatcaccaatcacata 24719328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13664743 - 13664550
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  13664743 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 13664644  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13664643 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 13664550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13724018 - 13723825
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  13724018 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 13723919  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13723918 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 13723825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22008548 - 22008366
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  22008548 acattatcataatccaaataacagttaacataaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 22008449  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||    
T  22008448 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcatttcatagttattcatacacaatcatcaat 22008366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22909535 - 22909342
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  22909535 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 22909436  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  22909435 cccaatatctcaaattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 22909342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19995078 - 19994857
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatactta-------- 99  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||            
T  19995078 acatcatcataatcaaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 19994979  T
Q  100 catcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 198  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  19994978 catcaaaaccccaataactcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaaacacatata 19994879  T
Q  199 tcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19994878 tcaataagactcatgtcatgat 19994857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24108657 - 24108465
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24108657 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 24108560  T
Q  108 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  24108559 ctccaatatgtcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 24108465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20655943 - 20655756
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||  |    
T  20655943 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatatccacatatgtatacttatatcatga 20655844  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20655843 tcccaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 20655756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 20479893 - 20480111
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 101  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||      ||||||||    
T  20479893 acatcatcataatcaaaataacacttaacatggatagttcaatataaacatcatgcatttgatcaa-aatgatattctcatatatacatatatacttaca 20479991  T
Q  102 tcaaaccccaa-tatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||    
T  20479992 tcaaaacccaaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacataatcaccgagcacatatatc 20480091  T
Q  201 aataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20480092 aataagactcatgtcatgat 20480111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 23509068 - 23509261
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||| |  |   |||||||||||||||    
T  23509068 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcctacatttggtcaataataatattcccgcatcaatacttacatcaaac 23509167  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23509168 cccaatatcgcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 23509261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22323398 - 22323225
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 123  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22323398 aataacagttaacatgaa-aattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatgcttacatcacaccccaatatctcacatc 22323303  T
Q  124 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22323302 aatattcatcaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 269950 - 270138
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| || |   |||||||||||||||    
T  269950 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 270045  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  270046 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 270138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 645970 - 645782
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| || |   |||||||||||||||    
T  645970 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 645875  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  645874 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 831705 - 831517
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| || |   |||||||||||||||    
T  831705 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 831610  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  831609 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 831517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16043245 - 16043054
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||     
T  16043245 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16043148  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16043147 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatc 16043054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 16416537 - 16416755
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 101  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||  ||| |||      |||| |||    
T  16416537 acatcatcataatcaaaataataattaacatggatagttcaatataaacatcataca-ttgatcaataatgatattcaaatatatacatatatactcaca 16416635  T
Q  102 tcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
T  16416636 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaataatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccgaacacatatatg 16416735  T
Q  201 aataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16416736 aataagactcatgtcatgat 16416755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 17343480 - 17343632
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||  ||||||||    
T  17343480 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatact--catcaaac 17343577  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaat 162  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17343578 cccaatatcccacatcaataatcgccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaat 17343632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16041569 - 16041378
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||     
T  16041569 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16041472  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16041471 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatc 16041378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6776422 - 6776303
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  6776422 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 6776323  T
Q  108 cccaatatcttacatcaata 127  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6776322 cccaatatctcacatcaata 6776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43375493 - 43375310
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  43375493 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 43375399  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  43375398 accccaatatcccacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 43375310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17731286 - 17731174
Alignment:
Q  110 caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataaga 207  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  17731286 caatatctcacatcaattaatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatacacaatcatcaatcacatttcaccaataaga 17731187  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  17731186 ctcatgtcatgat 17731174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 38531882 - 38532093
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca- 104  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| |  ||| ||||||| | | ||     
T  38531882 acatcatcataattcatataacagttaaacatgaataattcaattcaaatatcatgcacttaatcaaataagaatatcc--atatatatactcataccat 38531979  T
Q  105 aaccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaa 202  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | | | |    
T  38531980 aatcccaatatcttacattaagtaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacaattatt-atgcacaatcatcaatcacatttcaccca 38532077  T
Q  203 taagactcatgtcatg 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  38532078 taagactcatgtcatg 38532093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16204098 - 16203978
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  16204098 atacttgcatcacactccaatatctcacatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatca 16204006  T
Q  193 catatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16204005 catatatcaataagactcatgccatgat 16203978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3433718 - 3433535
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  3433718 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 3433622  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  3433621 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 3433535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18768691 - 18768481
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||  |||||| | | || |    
T  18768691 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataaatcaattcaaatatcatgtacttactcaataataatatccaaata--tatactcataccata 18768594  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    |  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || ||||||||||||||| | | ||||    
T  18768593 attccaatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-catattta-tcatgcataatcatcaatcacatttcaccaat 18768496  T
Q  204 aagactcatgtcatg 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18768495 aagactcatgtcatg 18768481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 28543151 - 28543213
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc 71  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28543151 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattcaat-taaacatcatgtacttgatc 28543213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 213
Target Start/End: Original strand, 28543270 - 28543377
Alignment:
Q  108 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 205  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | | ||||||    
T  28543270 cccaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaaatttcaccaataa 28543369  T
Q  206 gactcatg 213  Q
    ||||||||    
T  28543370 gactcatg 28543377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13664496 - 13664424
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13664496 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 13664424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13723771 - 13723699
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13723771 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 13723699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 190
Target Start/End: Original strand, 23509315 - 23509378
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 190  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23509315 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaat 23509378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23631173 - 23631046
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  23631173 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 23631077  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatca 138  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  23631076 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca 23631046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 28835980 - 28836155
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  28835980 acattatcataatccaaataacagttaacctgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 28836076  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28836077 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 28836155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3433352 - 3433285
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3433352 aatcaccattcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 3433285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 39448646 - 39448573
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  39448646 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 39448573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17731387 - 17731331
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgta 64  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  17731387 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatgattcaatttaaatatcatgta 17731331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Original strand, 29758643 - 29758740
Alignment:
Q  97 ttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 196  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||       ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||     
T  29758643 ttacatcacaccccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------cattaacaattatcaattcacaactattcattcacaatcaccaattacatt 29758735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 21695899 - 21695941
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaat 50  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21695899 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaat 21695941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22008236 - 22008194
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22008236 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgat 22008194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 29758768 - 29758810
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatc-aataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29758768 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgat 29758810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 220
Target Start/End: Original strand, 41244112 - 41244146
Alignment:
Q  186 tcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41244112 tcaatcacatatatcaataagattcatgtcatgat 41244146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3433455 - 3433390
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3433455 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 3433390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24719165 - 24719132
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24719165 caatcatatatatcaataagactcatgtcatgat 24719132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43375274 - 43375241
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43375274 caatcacatatatcaataagactcatgccatgat 43375241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 270226 - 270258
Alignment:
Q  188 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  270226 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgat 270258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 645694 - 645662
Alignment:
Q  188 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  645694 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgat 645662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 831429 - 831397
Alignment:
Q  188 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  831429 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgat 831397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24108368 - 24108300
Alignment:
Q  152 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  24108368 caaacatcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgat 24108300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 31626739 - 31626952
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31626739 acatcatcttaatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 31626838  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31626839 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatattaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 31626938  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  31626939 actcatgtcatgat 31626952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25646786 - 25646573
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  25646786 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatacatatacttacatcaaaa 25646687  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25646686 ccccaatatttcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaactattcacacacaatcaccaatcaaatatatcaataag 25646587  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  25646586 actcatgtcatgat 25646573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35017645 - 35017451
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  35017645 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatatcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatagatatacttacatcaaaa 35017546  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35017545 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 35017451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35011316 - 35011124
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  35011316 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 35011217  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35011216 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 35011124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 18128340 - 18128532
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18128340 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttca-tctaaacatcatgcacttgatcaataattacattcccatacatatacttacatcaaac 18128438  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18128439 cccaatatctcacatcaataatctccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcacatatatca 18128532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 18578834 - 18579027
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18578834 acatgatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatatgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18578933  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18578934 cccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18579027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13623121 - 13622937
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  13623121 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 13623025  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13623024 cccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacat 13622937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 18775506 - 18775691
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | | | |||||||||||||||    
T  18775506 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataaaattcaaaaaaaaatacttacatcaaac 18775605  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18775606 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcataaacaaaaatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcac 18775691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 19627498 - 19627690
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19627498 acatcaacataatccaaataacagttaacattattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19627597  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19627598 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcatatatatc 19627690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14628545 - 14628368
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 123  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14628545 aataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcattaataatattcccacatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatc 14628446  T
Q  124 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14628445 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatgtatca 14628368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18005050 - 18004857
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  18005050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaacatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 18004951  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18004950 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18004857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 23975708 - 23975902
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||||||    
T  23975708 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatt-tcccacatcaatacttacatcaa 23975806  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23975807 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 23975902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18843900 - 18843708
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18843900 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatattttaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 18843803  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18843802 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18843708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13016702 - 13016528
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaacc 108  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||    
T  13016702 acatcatcataatccaaatacagttaacatgaatatttcaatttaa-catcaagcatttgatcaataataatattctaaaaaatatacttacatcaa-cc 13016605  T
Q  109 ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 185  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13016604 ccaatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatca 13016528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33316582 - 33316422
Alignment:
Q  32 ttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatca 131  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33316582 ttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatcaataatca 33316483  T
Q  132 ccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33316482 ccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 33316422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 16104850 - 16105037
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |     
T  16104850 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcgttataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacataacaatacttacatcatac 16104949  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||    
T  16104950 ccccaatatctcacatcaattaatcacctatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 16105037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Original strand, 23151706 - 23151839
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23151706 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 23151805  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacat 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23151806 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacat 23151839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18825774 - 18825647
Alignment:
Q  75 aataatattctcatacatatacttacatcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattatt 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18825774 aataatattctcatatatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatt 18825675  T
Q  174 catacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||  ||||||| |||||| ||| ||||    
T  18825674 catgaacaatcaccaatcatatacatca 18825647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 22428473 - 22428689
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||     
T  22428473 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaacaataatactcaaatatatcaatacttacatcat 22428572  T
Q  105 aaccccaatatcttacatc-aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat 203  Q
    | |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||     
T  22428573 atccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaac 22428672  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  22428673 aagactcatgtcatgat 22428689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 32896282 - 32896486
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| |||  |||||          |||||||||||| ||    
T  32896282 acatcatcataatccaaataacagttaccatgaataatttaattcaaacattatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 32896371  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    
T  32896372 ccccaataactcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttctaaataa 32896471  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  32896472 gactcatgtcatgat 32896486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 1553946 - 1554113
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacat 122  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  1553946 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaatatctcacat 1554045  T
Q  123 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
    ||||||||| | ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1554046 caataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 1554113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 18397163 - 18397371
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||  |    
T  18397163 acatcatcataatccacataacgtttaacatgaatatttcaatttaaacttcgtgtacttggtcaataataatattcacatatatatacatatatcacga 18397262  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 204  Q
     | ||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||| || |||||||||||||| || | |||||    
T  18397263 tctcaacaactcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaagtatccaatcacatttattcatgcaaaatcatcaatcacaaatcaccaata 18397362  T
Q  205 agactcatg 213  Q
    |||||||||    
T  18397363 agactcatg 18397371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25746160 - 25745987
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||           ||  ||||    
T  25746160 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcat-----------ca--aaac 25746074  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    |||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25746073 cccaatatctcacattaataaatccccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcac 25745987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16828003 - 16827873
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||    
T  16828003 acattatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacgtcaatacttacatcaaac 16827904  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatca 138  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16827903 cccattatctcacatcaataatcatcaatca 16827873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25369184 - 25369071
Alignment:
Q  108 cccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||    
T  25369184 cccaatatcttacattaagtaatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataa 25369086  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  25369085 gactcatgtcatgat 25369071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Original strand, 18422182 - 18422248
Alignment:
Q  154 aatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18422182 aatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataagactcatgtcatgat 18422248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 17787746 - 17787827
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata 89  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  17787746 acatcatcataatcaaaataataattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattatcata 17787827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Original strand, 23975956 - 23976023
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23975956 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 23976023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14628388 - 14628316
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14628388 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 14628316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 25173518 - 25173590
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25173518 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25173590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 4989004 - 4989171
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaaccccaatatcttaca 121  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||     | ||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  4989004 aataacaaataacataaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataata-----acacattaatacttacatcacaccccgatatctcaca 4989098  T
Q  122 tcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  4989099 tcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 4989171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 195
Target Start/End: Original strand, 16238711 - 16238765
Alignment:
Q  141 tgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16238711 tgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 16238765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 18740645 - 18740828
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  18740645 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttgaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 18740739  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | ||  |||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| || || ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  18740740 atccagatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcaaaaatattcattcacaattaccaatcacatttatca 18740828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 4989201 - 4989275
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4989201 aatcaccaattacatgtatcatgaataaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 4989275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 18422115 - 18422185
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 78  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18422115 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataata 18422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33316353 - 33316292
Alignment:
Q  131 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33316353 accaatcacatgtatcagaaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatca 33316292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Original strand, 16238848 - 16238887
Alignment:
Q  181 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16238848 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 16238887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16827733 - 16827663
Alignment:
Q  131 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  16827733 accaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacataatcaccaatcatataaatca 16827663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 18740863 - 18740896
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18740863 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 18740896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13622878 - 13622839
Alignment:
Q  181 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13622878 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 13622839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18004827 - 18004770
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  18004827 aatcaccaatcacatgtatcaggaac-aatatcaattcacaactattcattcacaatca 18004770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19984887 - 19984845
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19984887 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgat 19984845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19985096 - 19984915
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||| ||||     
T  19985096 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttatatcac 19985004  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||     ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19985003 acctcaatatctcacatcaatcgtcatcaat--catg-----tgaacaattatcgattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 19984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 25173731 - 25173805
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  25173731 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 25173805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18835544 - 18835474
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18835544 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 18835474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 17098913 - 17099126
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17098913 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 17099012  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17099013 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatcaataag 17099112  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  17099113 actcatgtcatgat 17099126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 30204696 - 30204908
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30204696 acatcatcataatccaaataaaagttaatatggatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatgttctcatacatatacttacatcaaac 30204795  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  30204796 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataaga 30204895  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  30204896 ctcatgtcatgat 30204908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 11812801 - 11812994
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11812801 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatttatacttacatcaaac 11812900  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11812901 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 11812994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6148723 - 6148512
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6148723 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacacatacttacatcaaaa 6148624  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  6148623 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaagtattcacacacaatcaccaatcac--atatcaataag 6148526  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  6148525 actcatgtcatgat 6148512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51160335 - 51160123
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  51160335 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatctcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 51160236  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51160235 ctcaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaatgaga 51160136  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||| ||||||    
T  51160135 ctcatgccatgat 51160123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 38166213 - 38166407
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38166213 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 38166312  T
Q  108 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  38166313 ctccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 38166407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 18737974 - 18738167
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18737974 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatattccaatataaacatcatgcacttgatcaatagtactattctcatacatatacttacatcaaac 18738073  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  18738074 cccaatatctcacatcaataatcttcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaattacatatatca 18738167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 19944805 - 19944998
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19944805 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19944904  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  19944905 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 19944998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 7851683 - 7851877
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||    
T  7851683 acatcatcataatccaaataacagttagtatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttatatgacaa 7851782  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7851783 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatca 7851877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 30140984 - 30141177
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  30140984 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 30141083  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  30141084 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 30141177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 319486 - 319297
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctc--atacatatacttacatc-a 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  319486 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 319387  T
Q  105 aaccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  319386 aaccccaatatctcatattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcac 319297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50113991 - 50113780
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||    
T  50113991 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacattca-atacttacattagaa 50113893  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc-aata 204  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50113892 ccccaatatctcacatcaattaatcatcaatcacatatatcatgaataatcatcaatccacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaaata 50113793  T
Q  205 agactcatgtcat 217  Q
    |||||||||||||    
T  50113792 agactcatgtcat 50113780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22146145 - 22145940
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||| |||||| | |    
T  22146145 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacatacatcca-c 22146050  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22146049 cccaatatctaacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatatgcaatcaccaatcacatatatcaataaga 22145950  T
Q  208 ctcatgtcat 217  Q
    ||| ||||||    
T  22145949 ctcgtgtcat 22145940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 12796728 - 12796908
Alignment:
Q  14 atcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaacccc 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  12796728 atcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatt-tcccacatcaatacttacatcaaacccc 12796826  T
Q  111 aatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12796827 aatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 12796908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19572693 - 19572485
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  19572693 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgtgtttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 19572600  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  19572599 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaaatattcattcacaatcaccactcacatatatcaataa 19572500  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  19572499 gactcatgtcatgat 19572485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 17936455 - 17936649
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaat-ataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17936455 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacattttcatcataaacatcatgcacttgatcaattataatattcccatacatatacttatatcaaa 17936554  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17936555 ccccaatatctcacatcaataatctcaaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcatatatatca 17936649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16183945 - 16183720
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc---- 103  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||         
T  16183945 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 16183846  T
Q  104 ---------aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| | ||||||| ||| ||||    
T  16183845 tatatatcaaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaatcattcacagacaatcaccaaacaca 16183746  T
Q  195 tatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16183745 tatatcaataagactcatgtcatgat 16183720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 16819043 - 16819234
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  16819043 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 16819140  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16819141 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 16819234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 14287323 - 14287539
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctc--atacatatacttacatca- 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||| ||||||||| | ||     
T  14287323 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataacgttcacatatatatatacttataccat 14287422  T
Q  105 aaccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat 203  Q
     |  |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |   |||    
T  14287423 gattccaatacctcacatcaattaatcaacaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacaaaatcaccaatcacatttcaaaat 14287522  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  14287523 aagactcatgtcatgat 14287539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11199415 - 11199207
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||  |    
T  11199415 acatcatcataatccacataacaattaacatgaacaattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatatatacatataccatca 11199316  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 204  Q
      ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||  |||| | |||||| |||||||| ||||||||| | | |||||    
T  11199315 ttccaatatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacagtcatcaaatcacattcattcatgcacaatcaccaatcacatttcaccaata 11199216  T
Q  205 agactcatg 213  Q
    |||||||||    
T  11199215 agactcatg 11199207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47786735 - 47786522
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  47786735 acatcatcataatccaaataactgttatcatgaatatatcaatt--aacatcatgtacttgatcaataatagttttcacatatatatacttatatcacaa 47786638  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 204  Q
     |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    
T  47786637 tcccaatatctcacatcaattaatcactaatctcatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaccaata 47786538  T
Q  205 agactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  47786537 agactcatgtcatgat 47786522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 8630101 - 8630232
Alignment:
Q  66 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaataca 165  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8630101 ttgatcaataacaatatccacatacatatacttacatcaaaccccaatatctcacattcataatctccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattta 8630200  T
Q  166 caattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
    || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  8630201 cagttattcatgcacaattaccaatcacatat 8630232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 35121921 - 35122105
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  |||| | ||||||| ||||||     
T  35121921 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcgtgtacttgatcaataata---tttacatataaatacttatatcaaaa 35122017  T
Q  108 -cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
     |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35122018 tcccaaattctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcac 35122105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 54045703 - 54045594
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  54045703 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 54045604  T
Q  108 cccaatatct 117  Q
    ||||||||||    
T  54045603 cccaatatct 54045594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12351709 - 12351495
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||   |||||||  ||| |     
T  12351709 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcagttgatcaacaataatactcacatatcaatacttatgtcatat 12351610  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| |   || ||    
T  12351609 ccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcataattattcatacacaatcaccagtcacatttcaaaacaa 12351510  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||| ||||||||    
T  12351509 gactcacgtcatgat 12351495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 201
Target Start/End: Original strand, 13815973 - 13816070
Alignment:
Q  104 aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  13815973 aaactccaatatctcacgtcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 13816070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 14296730 - 14296917
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |    
T  14296730 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14296828  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
     ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||| || |||||||| ||||||||    
T  14296829 tcccaaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcaca 14296917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 14302357 - 14302544
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |    
T  14302357 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14302455  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
     ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||| || |||||||| ||||||||    
T  14302456 tcccaaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcaca 14302544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17958303 - 17958169
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa-- 106  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||| |      
T  17958303 acatcaacataatc-aataacagttaacatggatatttcaaagtaaacatcatgtacttgatcaataataatactcccatattaatacttacatcatatc 17958205  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17958204 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatg 17958169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 54686551 - 54686707
Alignment:
Q  36 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaaccccaatatcttacatcaataatcacc 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  54686551 catgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatc 54686650  T
Q  134 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
     ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  54686651 gatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 54686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11062861 - 11062748
Alignment:
Q  108 cccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||    
T  11062861 cccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataag 11062762  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||| ||||    
T  11062761 actcatgtcctgat 11062748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11063020 - 11062944
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 84  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11063020 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattc 11062944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9304819 - 9304664
Alignment:
Q  36 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcacca 134  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |     
T  9304819 catggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaatatctcacatcaataatcatcg 9304720  T
Q  135 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
    ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9304719 atca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 9304664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 25057035 - 25057166
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  25057035 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 25057129  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25057130 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 25057166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14523278 - 14523202
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 84  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523278 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatattccaatttaaccatcatgtacttgatcaataataatattc 14523202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 13815856 - 13815943
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13815856 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatata 13815943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 19230318 - 19230499
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||      || ||||  ||||||||||||     
T  19230318 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac-----cacacattaatacttacatcac 19230410  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||       ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19230411 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcatatg-------aacaattatcaattcacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatca 19230499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 11813179 - 11813253
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11813179 aatcaccaatcacatgggtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 11813253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17536923 - 17536847
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 84  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17536923 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttcatgcacttgatcaataataatattc 17536847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 18908679 - 18908854
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  18908679 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 18908775  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18908776 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 18908854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 22273034 - 22273209
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  22273034 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 22273130  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22273131 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 22273209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Original strand, 7851968 - 7852035
Alignment:
Q  134 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7851968 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7852035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 18908892 - 18908966
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18908892 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 49230262 - 49230429
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata-tacttacatcaaaccccaatatcttacat 122  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | | |||   || ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  49230262 aataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatggacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcacaccccaatatctcacat 49230357  T
Q  123 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||  ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  49230358 caatcttcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 49230429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 11813048 - 11813120
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11813048 aatcaccaattacatgtttcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 11813120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Original strand, 23490768 - 23490898
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| |||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  23490768 acattatcataatccaaataacagataacatgagtatttcaatataaacatcatgcatttgatcaatagtaa-----tcacacattaatacttacatcac 23490862  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacat 141  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23490863 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacat 23490898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 16819292 - 16819355
Alignment:
Q  131 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16819292 accaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 16819355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 53900463 - 53900388
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 84  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  53900463 acatcatcataatccaaacaacagtta-cataaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattc 53900388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 220
Target Start/End: Original strand, 15516035 - 15516144
Alignment:
Q  111 aatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagac 208  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  15516035 aatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaat-cacattta-tcatgaacaatcatcaatcacatttcaccaataagac 15516132  T
Q  209 tcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||    
T  15516133 tcatgtcatgat 15516144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 7851857 - 7851931
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  7851857 aatcatcaaccacatatatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaccatcaaccacatatatca 7851931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 33340038 - 33340155
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaa 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |||||||     || ||||  |||||||||||| |    
T  33340038 acattatcataatccaataacagttatcatgaataattcaatt--aacaacatgcatttgatcactaataat-----cacacattaatacttacatcaca 33340130  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatca 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  33340131 ccccaatatctaacatcaataatca 33340155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14060980 - 14060894
Alignment:
Q  133 caatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  14060980 caatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacattta-tcatgcacaatcatcaattacattttaccaataagactcatgtcatgat 14060894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 220
Target Start/End: Original strand, 17137827 - 17137913
Alignment:
Q  133 caatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  17137827 caatcacatgtgtcatgaacaaacatcaat-cacatttatt-atgcacaatcatcaaccacattacaccaataacactcatgtcatgat 17137913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19262907 - 19262733
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaataa-caattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||      || ||||  ||||||||||||     
T  19262907 acattatcataatccaattagcagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac-----cacacattaatacttacatcac 19262815  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  19262814 acccccatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcgccaatcaca 19262733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12563397 - 12563338
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtactt 67  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12563397 acatcatcataattcacataacacttaacatgaataattcaatttaaatatcatgtactt 12563338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 49230655 - 49230730
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  49230655 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgat 49230730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14523154 - 14523088
Alignment:
Q  129 tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  14523154 tcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacacttatgcatgcacaatcatcaattacat 14523088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 39654163 - 39654237
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  39654163 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 39654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 45581310 - 45581348
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcat 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581310 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcat 45581348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 11813307 - 11813348
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11813307 acaatcagcaatcacatttatcaataagactcatgtcatgat 11813348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17958093 - 17958052
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17958093 acaatcatcaatcacatatatcatataagactcatgtcatga 17958052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 195
Target Start/End: Original strand, 7852223 - 7852291
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7852223 aatcaccaatcacatttatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacat 7852291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12563281 - 12563193
Alignment:
Q  133 caatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  12563281 caatcacatgtgtcatgagaaatcatcaaatcacatttaatcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgccatgat 12563193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14061110 - 14061039
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataa 79  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14061110 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaat-tcaacatcatgtacttaatcaatgataa 14061039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15860902 - 15860863
Alignment:
Q  181 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15860902 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 15860863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2451229 - 2451155
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  2451229 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 2451155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17913933 - 17913891
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17913933 acaatcatcaatcacatacatcatataagactcatgtcatgat 17913891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 22273247 - 22273321
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  22273247 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 22273321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 49230509 - 49230583
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  49230509 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 49230583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2451084 - 2451035
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  2451084 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaaacatcaatcaca 2451035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 142
Target Start/End: Original strand, 10736904 - 10736953
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10736904 atacttacgtcacactccaatatctcacattaataatcaccaatcacatg 10736953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 142
Target Start/End: Original strand, 45581181 - 45581230
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  45581181 atacttacatcacacccccatatctcacatcaataatcatcaatctcatg 45581230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22408162 - 22407949
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22408162 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 22408063  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22408062 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgagcaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatcaataag 22407963  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||| ||||||||||    
T  22407962 acttatgtcatgat 22407949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2422997 - 2422788
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  2422997 acatcaacataatccaaataacaattaacatggatatttcaatataaacatcatacacttgatcaataata---ttctcatacatatacttacatcaaac 2422901  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
T  2422900 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataaga 2422801  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  2422800 ctcatgtcatgat 2422788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 41217544 - 41217739
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41217544 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 41217643  T
Q  107 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41217644 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 41217739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5676535 - 5676350
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5676535 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcattataaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatgcatatacttacatcaaac 5676436  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5676435 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatcac 5676350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 20252342 - 20252534
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  20252342 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattatcatatcaatacttacatcaaac 20252441  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20252442 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtatcatgaacgaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 20252534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9786315 - 9786123
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  9786315 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacatttcatcataaacatcatacacttgatcaataataatatcctcatacatgtacttacatcaa-c 9786217  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  9786216 cccaatgtctcacatcaataatctccaatcacatttgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattacccatcacatatatca 9786123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Original strand, 35053141 - 35053308
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||||||    
T  35053141 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacaccatgtacttgatcaataataacattctcataca----------tcaaac 35053230  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 185  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35053231 cacaatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatca 35053308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35524350 - 35524165
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  35524350 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttacatcataa 35524254  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
     |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35524253 tcccaatttctcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 35524165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22250905 - 22250776
Alignment:
Q  72 aataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaatta 171  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22250905 aataataatattctcatatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtta 22250806  T
Q  172 ttcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  22250805 ttcatacacaaccaccaatcatatacatca 22250776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 220
Target Start/End: Original strand, 49966013 - 49966096
Alignment:
Q  137 cacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966013 cacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 49966096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Original strand, 18505646 - 18505817
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||   | ||||   |||||||||||| ||    
T  18505646 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgcatttgatcaataataatca-cacatattaatacttacatcacac 18505743  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacaca 181  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  18505744 ccaaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacaaatattcattcaca 18505817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 21716430 - 21716624
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttaca-tca-- 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||  ||      
T  21716430 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcattataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatatatacacacacacata 21716529  T
Q  105 ----aaccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
        || | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  21716530 ccataatctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaattaccaatcaca 21716624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 51658255 - 51658043
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacat--ca- 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||  ||||||||     ||||||||| | |||  ||     
T  51658255 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatatacttaatcac-aataatatc----tacatatacattcataccat 51658161  T
Q  105 aaccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaa 202  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  | |||    
T  51658160 aattccaatatcttacatcaattaatcaccaatcgcatgtggcatgaacaattatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacattccaccaa 51658061  T
Q  203 taagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  51658060 taagactcatgtcatgat 51658043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20895660 - 20895514
Alignment:
Q  35 acatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcacca 134  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||                    |||||||||||||    
T  20895660 acatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttaca--------------------tcaataatcacca 20895581  T
Q  135 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  20895580 atcacatgtgtcataaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 20895514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 41217793 - 41217867
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  41217793 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 41217867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22837078 - 22836968
Alignment:
Q  109 ccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22837078 ccaatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaat-cacatttat-catgaacaatcatcaatcacatttatcaataaga 22836981  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  22836980 ctcatgtcatgat 22836968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15863508 - 15863325
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  15863508 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaccatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 15863414  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15863413 accccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 15863325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 21857753 - 21857934
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  21857753 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgtatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 21857845  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  21857846 accccaatatctcacatcaataatcatcaat--catg-----tgaacaattatcaatgcacaaatattcattcataatcaccaatcacatttatca 21857934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 17146820 - 17147003
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  17146820 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 17146916  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  17146917 cccgatatttcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtatatca 17147003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5676355 - 5676293
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5676355 aatcaccaatcacatgtgtcatga-caaatatcaatacataattattcatacacaatcaccaat 5676293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 22352498 - 22352570
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22352498 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 22352570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15863295 - 15863221
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  15863295 aatcaccaattacatgtatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 15863221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 22352285 - 22352468
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     |||  |||  ||||||||||||     
T  22352285 acattatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacgcattaatacttacatcac 22352379  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||        |||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  22352380 accccaatatctcatatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattttcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 22352468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20956776 - 20956684
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  20956776 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaat-cacaa-taatcatgaacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgat 20956684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20895486 - 20895445
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20895486 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 20895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 22364943 - 22365074
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  22364943 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 22365037  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    | |||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  22365038 atcccaatatctcacgtcaataatcatccatcacatg 22365074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15863149 - 15863074
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  15863149 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgat 15863074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20590078 - 20589963
Alignment:
Q  41 ataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatca 138  Q
    |||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||| |||||||||     
T  20590078 ataattcaatttaaatctcatatatttaatcaataataatatccacatgtatatacttatatcataatcacaatatctcacatcaataaatcaccaatcg 20589979  T
Q  139 catgtgtcatgaacaa 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  20589978 catgtatcatgaacaa 20589963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 58
Target Start/End: Original strand, 22080190 - 22080240
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacat 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22080190 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacat 22080240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 20444214 - 20444255
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20444214 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 20444255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 20529978 - 20530019
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20529978 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 20530019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 20929955 - 20929988
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20929955 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 20929988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37846162 - 37846121
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37846162 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 37846121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 131
Target Start/End: Original strand, 20444085 - 20444123
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatca 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20444085 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatca 20444123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 131
Target Start/End: Original strand, 20529825 - 20529863
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatca 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20529825 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatca 20529863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 22352601 - 22352643
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatc-aataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22352601 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgat 22352643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9785995 - 9785954
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9785995 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcatgtcatgat 9785954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 27673257 - 27673298
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  27673257 acaatcatcaatcacatttatcaaatagactcatgtcatgat 27673298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37846286 - 37846241
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  37846286 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaatgatcatcaatca 37846241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 154
Target Start/End: Original strand, 27673216 - 27673260
Alignment:
Q  111 aatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 154  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27673216 aatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 27673260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 31038 - 31249
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  31038 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaaaatacttacatcaa-c 31136  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31137 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 31236  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  31237 ctcatgtcatgat 31249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 138673 - 138461
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  138673 acatcatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattttcatacttatacttacatcaaac 138574  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  138573 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtttcatgaacaaatatcaattcaaaattatttatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 138474  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  138473 ctcatgtcatgat 138461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 76589 - 76798
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||  |||   |||||||||||||||    
T  76589 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgat---taataatattcatatatcaatacttacatcaaac 76685  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  76686 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatgcacaatcaccaatcacatatatcaataaga 76785  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  76786 ctcatgtcatgat 76798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Original strand, 10003 - 10105
Alignment:
Q  113 tatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactc 210  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  10003 tatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgccatgaacaatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacatttcagcaataagactc 10102  T
Q  211 atg 213  Q
    |||    
T  10103 atg 10105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12838192 - 12837979
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12838192 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttatatcaaaa 12838093  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  12838092 ccccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaaaaag 12837993  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  12837992 actcatgtcatgat 12837979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 18166874 - 18167067
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18166874 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18166973  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  18166974 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18167067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 34393385 - 34393580
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34393385 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 34393484  T
Q  107 -ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34393485 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatctgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcgccaatcacatatatca 34393580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53909750 - 53909555
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909750 acatcatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 53909651  T
Q  108 --cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53909650 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttatca 53909555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19699606 - 19699414
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19699606 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19699507  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19699506 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 19699414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19710191 - 19709999
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19710191 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19710092  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19710091 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 19709999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7134503 - 7134310
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   ||| |||||||||||    
T  7134503 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaataattacatcaaac 7134404  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7134403 cccaatatcccacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7134310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 8372607 - 8372800
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  8372607 acattatcataatccaaataacagttaacaagaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 8372706  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  8372707 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 8372800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 44345057 - 44345278
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatac--------tta 99  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||        |||    
T  44345057 acatcatcataatcaaaacaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatacatatatactta 44345156  T
Q  100 catcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| || ||| |    
T  44345157 catcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaaacatataca 44345256  T
Q  199 tcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44345257 tcaataagactcatgtcatgat 44345278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15274663 - 15274470
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |   |||||||||||||||    
T  15274663 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataaaattcccacatcaatacttacatcaaac 15274564  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  15274563 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatca 15274470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 33738477 - 33738676
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||     
T  33738477 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaata--------------catatacttacatcaaaa 33738562  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33738563 ccccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgccatgagcaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataag 33738662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 26678179 - 26678370
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  26678179 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccatatcaatacttacatcaaac 26678276  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  26678277 cccaatatgtcacatcaatattcacctatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 26678370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45460894 - 45460713
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata--catatacttacatca- 104  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||     
T  45460894 acatcataataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatgataatattcacatatgtatatacttatatcat 45460795  T
Q  105 aaccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 185  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45460794 aaccccaatatttcacatcaataattcatcaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatca 45460713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16366624 - 16366416
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||||   |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  16366624 acatcatcataatccaaataatagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgcgtttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 16366531  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16366530 accctaatatctcacatcaataatcatcaatcaaatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcactaatcacatatatcaataa 16366431  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  16366430 gactcatgtcatgat 16366416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21961440 - 21961253
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| |||| ||    
T  21961440 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatcaatacttaaatcatac 21961341  T
Q  108 -cccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
     ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||    
T  21961340 tcccaatagctcacatcaattaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 21961253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 53706828 - 53706635
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata--tacttacatcaa 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||      |||| ||   |||||||||||     
T  53706828 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcagtataaacatcatgcatttgatcaatagtaaa-----cataaattagtacttacatcac 53706734  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatc-aatcacatatatcaat 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  53706733 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaaatcacatatatcaat 53706635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22356616 - 22356424
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||   |||||| |||||| |    
T  22356616 acattatcataatccaaataacagttaacaataatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacataacaatacttgcatcaaga 22356519  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  22356518 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 22356424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 44054168 - 44054372
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||  |||||          |||||||||||| ||    
T  44054168 acatcatcataatccaaataacagttaacataattaatttaattcaaacatcatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 44054257  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
     |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||    
T  44054258 tcccaatatctcatatcaataaatcaccagtcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataa 44054357  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  44054358 gactcatgtcatgat 44054372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12901631 - 12901455
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||          |||||||||||| ||    
T  12901631 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatt-aattcaaacatcatgtacttgatcaatataaatat----------atacttacatcataa 12901543  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  12901542 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaataatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcac 12901455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20813890 - 20813715
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||   | |||  ||||||||| |||| ||    
T  20813890 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataat-attcacacatgtatatacttatatcataa 20813792  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaa 182  Q
     |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  20813791 tcccaatatttcacatcaataattcattaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaa 20813715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Original strand, 47355509 - 47355688
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aac 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||    |||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| |||    
T  47355509 acattatcataatccaataacagttatcacgaacatttcaatt---acatgatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaac 47355605  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 190  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47355606 cccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcatcaat 47355688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 13244606 - 13244806
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  13244606 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 13244698  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13244699 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaataa 13244791  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||| ||||||    
T  13244792 gactcatgccatgat 13244806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18294746 - 18294600
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||     
T  18294746 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaatatcatctacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacattaaat 18294647  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  18294646 cccaatatctcacatcaataatcaccgatcacataaatcatgaacaa 18294600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13811558 - 13811344
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc-aataataatattctcatacatatactta-catcaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||| | || | || |||  |    
T  13811558 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccaaatataaattcataccat--a 13811461  T
Q  106 accccaatatcttacat-caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||| || || ||| | | ||||    
T  13811460 atcccaatatcttacatccattaatcaccaatcacacgtgtaatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcaacattcgcatttcaccaat 13811361  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  13811360 aagactcatgtcatgat 13811344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30236411 - 30236204
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||         || ||||||||| |||| ||    
T  30236411 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacctgatcaataata---------tatatatacttatatcataa 30236321  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca--at 203  Q
    |  |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||  ||    
T  30236320 ctgcaatatctcacatcaataaatcaccaattacatgtgtcatgaacaatcaataattcacagttattcatacacagtcaccaatcacaattctcaacat 30236221  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  30236220 aagactcatgtcatgat 30236204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 15211515 - 15211698
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||  ||||||||||||     
T  15211515 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcatacattcatacttacatcac 15211609  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| ||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  15211610 acctcaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcgcaaatattcattaacaatcaccaatcacatttatca 15211698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 8874346 - 8874265
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  8874346 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcata 8874265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 183
Target Start/End: Original strand, 34393610 - 34393666
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34393610 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaat 34393666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 55378646 - 55378542
Alignment:
Q  91 atatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatca 188  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  55378646 atatacttacatcataattccaatatctcacatcaattaatcaccaatcttatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaaatattcatacacaatcatca 55378547  T
Q  189 atcac 193  Q
    |||||    
T  55378546 atcac 55378542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Original strand, 8372854 - 8372921
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8372854 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 8372921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Original strand, 18167097 - 18167164
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  18167097 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 18167164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Original strand, 15211762 - 15211856
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc-aataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || || |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15211762 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcaaaaatactcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgttatgat 15211856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 9293712 - 9293843
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  9293712 acattatcataatccaaataacagataacatggatatttcaacataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 9293806  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9293807 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 9293843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 10642374 - 10642505
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  10642374 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 10642468  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10642469 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 10642505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 19998517 - 19998700
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||| |||||| ||    
T  19998517 acattatcataatccaaataacagtcaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatactcacatcacac 19998613  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19998614 cccaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 19998700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 26678428 - 26678491
Alignment:
Q  131 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26678428 accaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 26678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Original strand, 19998907 - 19998973
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  19998907 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcac 19998973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 192
Target Start/End: Original strand, 19998780 - 19998845
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19998780 aatcaccaattacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcatacacaatcaccaatca 19998845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13751978 - 13751910
Alignment:
Q  126 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  13751978 taatcaccaatcacatatgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 13751910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 18246178 - 18246250
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18246178 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 18246250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 191
Target Start/End: Original strand, 47355705 - 47355769
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 191  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47355705 aatcaccaatcatatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatc 47355769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 16520801 - 16520985
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaa-catcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca 104  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||    
T  16520801 acatcatcataatctaaataatagttaacatggatatttcaatttaaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatca 16520895  T
Q  105 aaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
     ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16520896 caccccgatatcttacatctatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 16520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 54120195 - 54120066
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| | | |||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  54120195 acatcaacataatccaattaacaattaacatggatatttcaatt--aacatcatgcattcgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 54120103  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54120102 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 54120066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 55378757 - 55378691
Alignment:
Q  16 cataatccaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatat 82  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55378757 cataatccaataactgttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttaatcaataataatat 55378691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Original strand, 109828 - 109922
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||       ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||    
T  109828 atacttacatcacacccccatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcgccaatca 109920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 53706591 - 53706540
Alignment:
Q  169 ttattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53706591 ttattcacacacaatcaccaaacacaaatatcaataagactcatgtcatgat 53706540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7134208 - 7134116
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  7134208 aatcaccaatcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcgcaa-caccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgat 7134116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 192
Target Start/End: Original strand, 16521015 - 16521080
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16521015 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcatcaattaacaattattcatacacaatcaccaatca 16521080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 53909519 - 53909486
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909519 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 53909486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 18246391 - 18246465
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  18246391 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaatccacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 18246465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18496334 - 18496280
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatg 62  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  18496334 acatcatcataatccatataacaaataacatgaatagttcaatttaaatatcatg 18496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43283185 - 43283140
Alignment:
Q  109 ccaatatcttacat-caataatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 153  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43283185 ccaatatcttacattcaacaatcaccaatcacatatgtcatgaaca 43283140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 5684802 - 5684742
Alignment:
Q  14 atcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa 73  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5684802 atcataatccaaataacagttaacatgaatattacaaattaaacatcatgcacttgatcaa 5684742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18496233 - 18496121
Alignment:
Q  110 caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataaga 207  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||  |||| ||||| || |||| |||||| ||| || | | || ||| |    
T  18496233 caatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtttcatgaataatcatcaaatcacatttatttatgcacagtcatcactcatatttcaccattaaaa 18496134  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  18496133 ctcatgtcatgat 18496121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 37760 - 37973
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37760 acatcatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 37859  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  37860 ccccaatatctcacatcaataatcaccaataacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcactaag 37959  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  37960 actcatgtcatgat 37973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 236412 - 236597
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  236412 acatcatcataattcaaataacaattaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcgaac 236511  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  236512 cccaatatctgacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacaccattattcatacacaatcaccaatcac 236597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 270329 - 270515
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  270329 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 270428  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  270429 cccaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaataaccaatcacatttatca 270515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Original strand, 270545 - 270638
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  270545 aatcaccaattacatgtatcatgaataa-tatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgat 270638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 27950 - 28145
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27950 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 28049  T
Q  108 --cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28050 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 28145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Original strand, 28179 - 28272
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28179 aatcatcaaccacatatatcattaacaaatatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaacacaaatatcaataagactcatgtcatgat 28272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 28125 - 28199
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28125 aatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatca 28199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 21392432 - 21392643
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392432 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataaaaatattctcatacatatacttacatcaa-c 21392530  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21392531 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcagtttccaattattcatacacaatcaccaaacacatatatcaataaga 21392630  T
Q  208 ctcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||    
T  21392631 ctcatgtcatgat 21392643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 34937571 - 34937764
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  34937571 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 34937670  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34937671 cccaatatctaacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 34937764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21661593 - 21661407
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  21661593 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcatacatatgcttacatcaaga 21661494  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21661493 ccccaatatctcacaacaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcac 21661407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 10307 - 10500
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  10307 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 10406  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10407 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10780305 - 10780112
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  10780305 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcacatcaatacttacatcaaac 10780206  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10780205 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10780112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43445901 - 43445708
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  43445901 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 43445802  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  43445801 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 43445708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 28257781 - 28257970
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||| ||    
T  28257781 acatcatcataatcaaaataacagttaaaatgaa-aattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcacac 28257876  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28257877 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 28257970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22885234 - 22885041
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22885234 acattatcataatccaaataacagtcatcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 22885135  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  22885134 cccaatatctcacatcaatgatcgccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcatatacatca 22885041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25211982 - 25211796
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25211982 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25211885  T
Q  108 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25211884 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacat 25211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25276134 - 25275948
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25276134 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25276037  T
Q  108 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25276036 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacat 25275948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17473892 - 17473704
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||    
T  17473892 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacat-ca-atacttacatcaaac 17473795  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 198  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17473794 cccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatatgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatata 17473704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 19497952 - 19498120
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 123  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19497952 aataacagataacatgaatatttcaatttaaacattacgtacatgatcattaataatattcacacatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatc 19498051  T
Q  124 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19498052 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 19498120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 4863551 - 4863778
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttac 100  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||      |||||||    
T  4863551 acatcatcataatcaaaacaacagttaatcatgaataatttaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttac 4863650  T
Q  101 atcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcataca-------caatcatcaatca 192  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||       |||||| ||||||    
T  4863651 atcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaaagcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatca 4863750  T
Q  193 catatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4863751 catttatcaataagactcatgtcatgat 4863778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 11579922 - 11580113
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  11579922 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattctcata--tatacttacatcaaaa 11580018  T
Q  108 c-ccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||    
T  11580019 ctccaatatctcacatcagtaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacgcagtcaccaatcatatacatca 11580113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27185699 - 27185517
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  27185699 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatataaacattatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 27185603  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27185602 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgtacaaacaacaattcacatttattcagacacaattatcaatcac 27185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23986359 - 23986165
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  23986359 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttctatataaacatcatgcacttgataaataataatactctcatatcaatacttacatcatac 23986260  T
Q  108 ccc-aatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||| ||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23986259 ccccaatgtttcacatcaagtaatcaccaatcatatgtgtcaggaacaaatattaattcacagttattcatacacaatcatcattcacatatatc 23986165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1171464 - 1171320
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1171464 acatcatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaag 1171365  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaa 151  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| | |||||||    
T  1171364 ccccaatatctcacattaataaacatcaatcacatttatcatgaa 1171320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9732782 - 9732592
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  9732782 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcaagataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 9732688  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  9732687 atcccaatatctcgcatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaagatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 9732592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1221826 - 1221638
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||    
T  1221826 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaac 1221732  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  1221731 cccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 1221638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 23453184 - 23453397
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
T  23453184 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23453280  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  23453281 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23453380  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  23453381 aagactcatgtcatgat 23453397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 23460428 - 23460641
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
T  23460428 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23460524  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  23460525 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23460624  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  23460625 aagactcatgtcatgat 23460641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 23464689 - 23464902
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
T  23464689 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23464785  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
T  23464786 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23464885  T
Q  204 aagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  23464886 aagactcatgtcatgat 23464902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1170467 - 1170376
Alignment:
Q  129 tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170467 tcacaaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 1170376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Original strand, 11582266 - 11582359
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11582266 aatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatctccaatcacatacatcaataagactcatgccatgat 11582359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24185137 - 24184926
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| | ||||  | |||| ||    
T  24185137 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtaattgatcaataata---ttcacatataaatacaaatatcataa 24185041  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
     | |||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||    
T  24185040 tctcaatttctcacatcaattaatcaccaattccatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacacttcaaaacaa 24184941  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  24184940 gactcatgtcatgat 24184926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29192857 - 29192671
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  29192857 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 29192758  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  29192757 cccgatatctcgcatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcaatcacaatcaccaatcacatttatca 29192671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17907853 - 17908030
Alignment:
Q  16 cataatccaa-taacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaa 112  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  17907853 cataatccaaataacagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaa 17907952  T
Q  113 tatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17907953 tatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 17908030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35793345 - 35793162
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  35793345 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 35793249  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | | |||||| ||||||||  ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  35793248 ctcgatatctcacatcaatcttcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 35793162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 10554 - 10628
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10554 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1221584 - 1221491
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  1221584 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgat 1221491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9732562 - 9732495
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9732562 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 9732495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11338802 - 11338584
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-- 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||  || ||  |      
T  11338802 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatatttcaattaaaagatcatgtacttgatcaataacaacattcatatatatatatatatatatata 11338703  T
Q  106 -----------accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
               | ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  11338702 tatatatcatgatcccaataactcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaat-cacatttattcatgcacaatcaccaatcac 11338604  T
Q  194 atatatcaataagactcatg 213  Q
    || |   |||||||||||||    
T  11338603 atttcaaaataagactcatg 11338584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 24470555 - 24470712
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||   | || |   ||| |||||||| ||    
T  24470555 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatagttcaatttaa-catcatgcatttgatcaataataat---cacacaataatatttacatcacac 24470650  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaat 169  Q
    |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24470651 cccaatatctcacaacaataataatcaatcacatatgtcacgaacaattatcaattcacaat 24470712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25944750 - 25944566
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  25944750 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 25944656  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatc-accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||        |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  25944655 accctaatatctcacattaataatcaatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatca 25944566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 11340599 - 11340782
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  11340599 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 11340695  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||| |||| |||| ||| ||||||        |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  11340696 cccgatatctcacataaatattcatcaatca-------tatgaacgattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 11340782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18780235 - 18780052
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  18780235 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgattaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 18780139  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | | |||||| ||||||||  ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  18780138 ctcgatatctcacatcaatcttcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 18780052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Original strand, 11341018 - 11341085
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11341018 aatcaccattcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 11341085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 111157 - 110990
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaaaccccaatatcttaca 121  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  111157 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcacaccccgatatctcaca 111063  T
Q  122 tcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  111062 tcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 110990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Original strand, 19498182 - 19498248
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  19498182 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcac 19498248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 16534391 - 16534574
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  16534391 acattatcataatccagataataattaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaacaataat-tacacat--taatacttacatcacac 16534487  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |  ||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16534488 cccgaagtctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 16534574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 80
Target Start/End: Original strand, 25424680 - 25424736
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25424680 aataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25424736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25944536 - 25944472
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 191  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  25944536 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatc 25944472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43445654 - 43445582
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43445654 aatcgccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 43445582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22368411 - 22368337
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  22368411 aatcaccaattacatgtatcctgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 22368337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10780082 - 10780011
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10780082 aatcaccaatcacatgtatcaggaac-aatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 10780011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22368674 - 22368602
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22368674 acattatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat 22368602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22885017 - 22884942
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  22885017 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgat 22884942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17473648 - 17473607
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17473648 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 17473607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 196
Target Start/End: Original strand, 16534750 - 16534801
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 196  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  16534750 tcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatctccaatcacata 16534801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 110957 - 110888
Alignment:
Q  131 accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  110957 accaattacatgtatcatgaacaa-tatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 110888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 7726919 - 7726993
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7726919 acatcatcataatccagataacagctaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 7726993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29192641 - 29192583
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 185  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29192641 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatca 29192583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21653148 - 21653107
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21653148 acaatcaccaatcacatttatcaataagactcgtgtcatgat 21653107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21653265 - 21653228
Alignment:
Q  104 aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacat 141  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21653265 aaacctcaatatctcacatcaataatcaccaatcacat 21653228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 24470716 - 24470749
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24470716 caatcacatatatcagtaagactcatgtcatgat 24470749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25211719 - 25211651
Alignment:
Q  152 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  25211719 caaacatcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgat 25211651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25275871 - 25275803
Alignment:
Q  152 caaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  25275871 caaacatcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgat 25275803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 3055 - 3248
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3055 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaaaatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 3154  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3155 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 3248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 281 - 477
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata--cttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  281 acattatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 380  T
Q  106 a-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  381 aaccccaatatcttacctcaacaatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 3430 - 3463
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 3463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 30650 - 30843
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30650 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 30749  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30750 ccccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 31002 - 31035
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 31035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13740 - 13548
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13740 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 13641  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13640 cccaatatctcacatcaatattcactaatcacatgtgtcatgaac-aatatcaattcacaattatttatacacaatcaccaatcacaaatatca 13548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13557 - 13489
Alignment:
Q  151 acaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13557 acaaatatcatttaacaattactcatacacaatcactaaacacatatatcaa-aagactcatgtcatgat 13489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 20860 - 21073
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20860 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaagcatcatgcatttgattaacaataatattctcatacatatacttacatcataa 20959  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  20960 tcccaatatctcacatcaataatcaccaatcataagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaacaccaatcacatacatcaataag 21059  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  21060 actcatgtcatgat 21073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 28450 - 28663
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  28450 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattgaaacatcatgcatttgatcaacaataatattctcatacatagacttacatcatga 28549  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 206  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||    
T  28550 tctgaatatctcacatcaataatcaccaatcacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaacaccaatcacatacatcaataag 28649  T
Q  207 actcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||    
T  28650 actcatgtcatgat 28663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 535 - 745
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  535 acatcatcataatacaaataacagttagcatgaatatttcaatttaagcatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 634  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  635 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacgtaattaccaatcacatatatcaataaga 734  T
Q  208 ctcatgtcatg 218  Q
    |||||||||||    
T  735 ctcatgtcatg 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4831 - 4638
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 4732  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4731 cccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 4638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 49671 - 49478
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  49671 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 49572  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  49571 cccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 49478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 26451 - 26642
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
T  26451 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaa-c 26549  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26550 cccaatatctcacattcataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 26642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15271 - 15061
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     |||||||  ||||||||||||     
T  15271 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataat-----catacattaatacttacatcac 15177  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacac-aatcatcaatcacatatatcaata 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  15176 accccaatatctcacatcaataataatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcactaatattcattcacaaatcaccagtcacatgtatcaata 15077  T
Q  205 agactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  15076 agactcatgtcatgat 15061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21827 - 21633
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21827 acatcatcataatccaaataacagttagcataaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 21728  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  21727 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaaatgtcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 21633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 156376 - 156183
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  156376 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 156277  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  156276 tccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 156183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 86149 - 85966
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  86149 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcactataaacatcatgcatttgatcaataacaa-----tcacacattaatacttacatcac 86055  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  86054 accccaatatcccacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaacaatcacatttatca 85966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 156129 - 156062
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  156129 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 156062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7068
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 101  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||      ||||||||    
T  7287 acatcatcataatcaaaataaaagttaacatgaataattcaatataaacatcatacatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttaca 7188  T
Q  102 tcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7187 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattttcaattattcacacacaatcaccaaacacatatatc 7088  T
Q  201 aataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7087 aataagactcatgtcatgat 7068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 7453 - 7631
Alignment:
Q  25 ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa--ccccaatatcttacat 122  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  7453 ataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaagaataatattctcatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctcccat 7552  T
Q  123 caataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7553 caataatcaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 7631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Original strand, 7682 - 7759
Alignment:
Q  124 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  7682 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 7759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Original strand, 7842 - 7908
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||    
T  7842 aatcaccaatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 7908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2658 - 2474
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  2658 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 2559  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  2558 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattaccaatca 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 4078 - 4289
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| | ||||||| |||| ||    
T  4078 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtgcttgatc---aatagtattcacatatacatacttatatcataa 4174  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
     |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||    
T  4175 tcccaatttctcacatcaattaataaccaatcacatgtgtcatgaacactcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacaattcaaaacaa 4274  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  4275 gactcatgtcatgat 4289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 1104
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||| | ||   |||||||||||| ||    
T  1307 acatcatcataatcaaaataatagttatcatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaata------ttcacgtatcaatacttacatcacac 1214  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 207  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1213 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacccaatcaccaatcacatatatcaataaga 1114  T
Q  208 ctcatgtcat 217  Q
    ||||||||||    
T  1113 ctcatgtcat 1104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Original strand, 77600 - 77793
Alignment:
Q  11 atcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa--c 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  77600 atcatcataatccaaataacatttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaac 77699  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    || ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  77700 cctaatatctcacatccataaccaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatgcacaatcaccaatcacatatatca 77793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 154
Target Start/End: Original strand, 35999 - 36047
Alignment:
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaa 154  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35999 ccccaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtatcatgaacaa 36047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Original strand, 14849 - 15032
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaa- 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14849 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 14946  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  14947 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatca 15032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 17735 - 17928
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-a 106  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  17735 acatcatcaaaatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacaccatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcatta 17834  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
     ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17835 tcccaatacctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattaacagttattaatacacaatcaccaatcacatatatc 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Original strand, 18055 - 18096
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18055 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcatgtcatgat 18096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 683 - 499
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  683 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 587  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 195  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  586 cccaatatctcatattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacaccatcaccaatcacat 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Original strand, 29653 - 29830
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatc 123  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29653 aataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacaaatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatc 29752  T
Q  124 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29753 aataatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcaccgttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 29830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 33395 - 33580
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||     
T  33395 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatcaaat 33486  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  33487 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 33580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39449 - 39264
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||     
T  39449 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatcaaat 39358  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  39357 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 39264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7175
Alignment:
Q  12 tcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccc 109  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||  ||| || ||    
T  6984 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcatacatgtatacttatctcataatcc 7083  T
Q  110 caatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7084 cgatatctcacatcaataatcaccaatcacacgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 23040 - 23190
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23040 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 23139  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatat 158  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  23140 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgttctgaacaaatat 23190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Original strand, 16376 - 16445
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataat 77  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16376 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataat 16445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Original strand, 94335 - 94495
Alignment:
Q  40 aataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaataatcaccaatca 138  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  94335 aataattcaattcaaacatcatgtactggatcaataataatattctcatatatataattatatcataatcccaatatctcatattaataatcaccaatca 94434  T
Q  139 catgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  94435 catgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcacatatat 94495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 17526 - 17716
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  17526 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 17622  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  17623 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 17716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 19556 - 19746
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
T  19556 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 19652  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  19653 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 19746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Original strand, 19799 - 19866
Alignment:
Q  126 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  19799 taatcagcaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcac 19866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 8539 - 8466
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  8539 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13855
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  13928 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 12488 - 12709
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctc------atacatatacttaca 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||      ||| |||||||||||    
T  12488 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatatagacatcatgcacttgatgaataataatattctcatatatatatatatacttaca 12587  T
Q  102 tcaaa---ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
    |||||   ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12588 tcaaaaccccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaac-aacattaattcaaaattattcatacacaatcaccaatcacattt 12686  T
Q  198 atcaataagactcatgtcatgat 220  Q
       |||| |||||||||||||||    
T  12687 ccaaataggactcatgtcatgat 12709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 185
Target Start/End: Original strand, 68597 - 68773
Alignment:
Q  12 tcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccc 109  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| || ||    
T  68597 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcgcatataaatacttatatcataatcc 68696  T
Q  110 caatatcttacatca-ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 185  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||  |||| |||||||||||||||||    
T  68697 caatttctcacatcagttaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatca 68773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 30314 - 30519
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatcaaa 106  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | || |||  |||||||||| | |||| |||| | |||   ||     
T  30314 acatcatcataatctatataataattaacatgaataattcaattcaaatatcatgcatttaatccgataataatat-cacatatatattcatactataat 30412  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 204  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| || | | |||||    
T  30413 cccca-tatctcacatcaatcaatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaat-cacatttattcacacacaattatcaatcatatttcaccaata 30510  T
Q  205 agactcatg 213  Q
    |||||||||    
T  30511 agactcatg 30519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 201
Target Start/End: Original strand, 16826 - 16961
Alignment:
Q  66 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaataca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826 ttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattca 16925  T
Q  166 caattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  16926 cagttattcacacacaatcaccaatcatatacatca 16961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 59865 - 60051
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || | | ||||||| |||| |     
T  59865 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatccacaaata-atacttatatcatat 59963  T
Q  108 -cccaatatcttacatcaata-atcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  59964 tcccaatatctcacatcaatacatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 60051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26575 - 26475
Alignment:
Q  116 cttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtc 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26575 cttacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtc 26476  T
Q  216 a 216  Q
    |    
T  26475 a 26475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 66592 - 66415
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||    
T  66592 acatcatcataatccaaatgacatttaacatgaataattcaatataatcatcatgtacttgctcaataataatattcacatatcaatacttacatcataa 66493  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaat 183  Q
     | |||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || | ||| |||||||||||    
T  66492 tctcaatatctcatatcaattaatcaccaatcacatgaatcatgaacaatcatcaatccatagttactcatacacaat 66415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26660 - 26590
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 78  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26660 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata 26590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3893 - 3762
Alignment:
Q  91 atatacttacatcaaa-ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaa-tatcaatacacaattattcatacacaatcatca 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  3893 atatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaaatatcaattcacaattattcacacaccatcatca 3794  T
Q  189 atcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3793 atcacatatatcaacaaaactcatgtcatgat 3762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4014 - 3927
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4014 acatcattataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatata 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 2907 - 3101
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||  ||    
T  2907 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgaacaataatagtattcacataaatatacctatatcccaa 3006  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
      ||||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3007 ttccaatatctcacagcaatagtcactaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaattaccaatcacatatatca 3101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 9930
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |   | |||||||||||||    
T  10122 acattatcataatccaaatgacagttaacatgtatttttcaatttaa-catcatgcactttatcgataatattattctcaaatcaacacttacatcaaac 10024  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  10023 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaataaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 9930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4561
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||    
T  4425 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataagtcaatataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacatatcaatacttacatcatac 4524  T
Q  108 -cccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatg 142  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4525 tcccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatg 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 114150 - 113965
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| | ||||||| |||| ||    
T  114150 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttatatcataa 114054  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaa-taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
     |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  114053 tcccaatttctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcaccaaatcatagttatttatacacaatcaccaatcaca 113965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19489 - 19287
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
T  19489 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 19395  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 205  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||       ||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19394 atcccaatatctcacatcaataatcatcaatcatatg-------aacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaaaaa 19302  T
Q  206 gactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||    
T  19301 gactcatgtcatgat 19287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 220
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1865
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgat-caataataatattctcatacatatacttacatcaaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || | |||||||||| | |||| |||| | ||| |  ||    
T  1652 acatcatcataatccacataacaattaacatgagtaatttaatttaaacatcatgtacttaattcgataataatat-cacatatatattcatac-tataa 1749  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 204  Q
     |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  1750 tcccaatatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaata 1849  T
Q  205 agactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  1850 agactcatgtcatgat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 91018 - 90802
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata------------ 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||                
T  91018 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattcatatatatatatatatatatata 90919  T
Q  96 ----------cttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatc 184  Q
              |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  90918 tatgtatatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatc 90819  T
Q  185 atcaatcacatatatca 201  Q
    | |||||| ||| ||||    
T  90818 accaatcatatacatca 90802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 90748 - 90655
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  90748 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcttacacaatctccaatcacatacatcaataagactcatgccatgat 90655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 128730 - 128804
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  128730 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 128804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21288 - 21158
Alignment:
Q  66 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaata 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||        |||||||| |||||||     
T  21288 ttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaatt 21196  T
Q  164 cacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21195 cacaattattcattcacaatcaccaatcacatatatca 21158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21104 - 21030
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21104 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21002 - 20961
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21002 acaatcaccaatcacatatatcattaagactcatgccatgat 20961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 13964 - 14153
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata--catatacttacatca- 104  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||     
T  13964 acatcaacataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatatacttatatcat 14063  T
Q  105 aaccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||  |||||  ||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  14064 aaccccaatatctcacattaataagtcatcaatcgtatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacagacattcatacacaatcgtcaatcac 14153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14007 - 13914
Alignment:
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14007 cccaacatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatgtcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 13914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14154 - 14078
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 84  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14154 acatcatcataatccacataatagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattc 14078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6583 - 6410
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           
T  6583 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttac------- 6491  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  6490 -------------atcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaaccacatttatca 6410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 22
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaat-aacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa 105  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  119 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaa 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6406 - 6365
Alignment:
Q  179 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6406 acaatcattaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 6365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Original strand, 56206 - 56370
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||          |||||||||||| ||    
T  56206 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatataaatat----------atacttacatcataa 56295  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacaca 181  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  56296 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatg-gtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacaca 56370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 75727 - 75550
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  | ||||         | |||||||||||||| ||    
T  75727 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataatttaattcaaacatcatgtacttgatcg-tcataa---------atatatacttacatcataa 75638  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataa-tcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  75637 ccccaatatctcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 75550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Original strand, 25594 - 25718
Alignment:
Q  67 tgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaataca 165  Q
    |||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25594 tgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaaccccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattca 25693  T
Q  166 caattattcatacacaatcatcaat 190  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  25694 cagttattcatacataatcatcaat 25718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 191
Target Start/End: Original strand, 25735 - 25799
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 191  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25735 aatcaccaatcatatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatc 25799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3395 - 3188
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatca-a 105  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||| | |||  || |    
T  3395 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatatattcatac--cata 3298  T
Q  106 accccaatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 203  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| | ||||||| | |||||| | | ||||    
T  3297 atctcaatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcgcaatcataattcacatttcaccaat 3198  T
Q  204 aagactcatg 213  Q
    ||||||||||    
T  3197 aagactcatg 3188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 6123 - 6329
Alignment:
Q  16 cataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatcaaaccccaat 113  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||| | || | |||| | ||| |  || | ||||    
T  6123 cataatccacataaaaattaacatgagtaattcaatttaaatatcatgtacttaatccgataataatat-cacacatatattcatac-tataatctcaat 6220  T
Q  114 atcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactca 211  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  6221 atctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgttatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactca 6320  T
Q  212 tgtcatgat 220  Q
    |||||||||    
T  6321 tgtcatgat 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 44288 - 44443
Alignment:
Q  36 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcacca 134  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| || |     
T  44288 catgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaatatctcacatcaataaacatcg 44387  T
Q  135 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 197  Q
    ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44388 atca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 44443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 182
Target Start/End: Original strand, 52457 - 52597
Alignment:
Q  36 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatcacca 134  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||    
T  52457 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttaaatcaaaaccccaatatctcagatcaatagtcatca 52556  T
Q  135 atcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaa 182  Q
    ||||        |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  52557 atca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaa 52597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 2737 - 2811
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2737 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 2865 - 2939
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2865 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 2939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Original strand, 2616 - 2683
Alignment:
Q  134 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2616 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatca 2683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 2993 - 3067
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  2993 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 3067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 2475 - 2561
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2475 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 6)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Original strand, 5480 - 5547
Alignment:
Q  134 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5480 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatca 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5675
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  5601 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 5675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 328 - 511
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  328 acattatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 424  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  425 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5425
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  5339 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 5425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Original strand, 641 - 715
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  641 aatcaccaattacatgtatcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Original strand, 813 - 888
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  813 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcttcaatcacatttccaaataagactcatgtcatgat 888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 109971 - 109897
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  109971 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 109897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 54011 - 54112
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  54011 atacttacgtcacactccaatatctcacatcaataatcaccaatca-------catgaacaattatcaattcacaattattaattcactatcaccaatca 54103  T
Q  193 catatatca 201  Q
    ||| |||||    
T  54104 catttatca 54112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 110055 - 110002
Alignment:
Q  147 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 200  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  110055 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcactaatcacatatatc 110002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 109799 - 109724
Alignment:
Q  145 tcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  109799 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctcaaatcacatttccaaataagactcatgtcatgat 109724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Original strand, 54118 - 54158
Alignment:
Q  181 aatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54118 aatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgat 54158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15935
Alignment:
Q  125 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16011 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttgttcatacacaatcaccaatcacatatatca 15935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13085 - 12989
Alignment:
Q  36 catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaccccaatatcttacatcaataatca 131  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13085 catggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatca 12989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 31120 - 31192
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31120 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 31192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 185
Target Start/End: Original strand, 31333 - 31391
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatca 185  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31333 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatca 31391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 31925 - 32010
Alignment:
Q  110 caatatcttacatcaat-aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31925 caataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatacacaattatcaatcaca 32010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 31776 - 31850
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattc 84  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31776 acatcatcataacccacataacattta-catgaatatttcaatttaa-cttcatgcacttgatcaataataatattc 31850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 144987 - 145060
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144987 acattatcataatccacataacaattaacatgattaattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 145060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Original strand, 145283 - 145376
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  145283 aatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaattcacagttattcatacacaatcactactcacatttcaaaataagactcatgtcatgat 145376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 249313 - 249193
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  249313 atacttacatcacaccccaatatctcacatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatca 249221  T
Q  193 catatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||||    
T  249220 catttccaaataagactcatgtcatgat 249193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 804 - 987
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  804 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 900  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  901 cccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2899
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcc-aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  3083 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacataatgcacttgatcattaataa-----tcacacattaatacttacatcac 2989  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatc-accaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||        |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  2988 accccgatatctcacatcaataatcaatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatca 2899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2776
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgat 220  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||  || ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2869 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcattaat-cacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgat 2776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 27169 - 27352
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
T  27169 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 27263  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||        |||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  27264 accccgatatctcacatcaatattcatcgatca-------tatgagcaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 27352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15239 - 15167
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15239 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 15167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4639
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatata 95  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4725 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaatttaa-cttcatgcacttgatcaataataatattcacatatatata 4639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4596 - 4528
Alignment:
Q  126 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 194  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4596 taatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4044 - 3952
Alignment:
Q  127 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  4044 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacattta-tcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataatactcatgtcatgat 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Original strand, 26889 - 26954
Alignment:
Q  24 aataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcata 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26889 aataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaaaaataatattcacata 26954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Original strand, 8387 - 8443
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgta 64  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8387 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattcactataaacgtcatgta 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 5221 - 5396
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| ||    
T  5221 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 5317  T
Q  108 cccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 193  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||  ||||||        |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5318 cccgatatctcacatcaatattcgtcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1427
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||   ||||||||| | |||||||||||||||     || ||||  |||||||||| |     
T  1298 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacattac 1390  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1391 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1548
Alignment:
Q  181 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1509 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgat 1548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 264
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||| |     
T  448 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 352  T
Q  107 ccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||        |||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  351 ccccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaccaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 7489 - 7416
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  7489 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7115 - 6934
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 105  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||     || ||||  |||||||| |||     
T  7115 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaatagtaat-----cacacattaatacttacttcac 7023  T
Q  106 accccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||       | ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7022 atcccaatatctcacatcaatagtcatcaatcatatg-------accaattatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcacatttatca 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 144926 - 144980
Alignment:
Q  147 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  144926 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 144980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 147185 - 147239
Alignment:
Q  147 atgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 201  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  147185 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 147239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2511 - 2438
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  2511 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatccaaatttcatatacttaatcaatgataata 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12876 - 12843
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12876 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 12843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5274 - 5241
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5274 caatcacatatatcaataaaactcatgtcatgat 5241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 37627 - 37697
Alignment:
Q  9 acatcatcataatccaa-taacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataat 80  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  37627 acattatcataatccaaataacagttaacatgaataattca--attaacatcatgcatttgatcaataataat 37697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Original strand, 40010 - 40043
Alignment:
Q  187 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40010 caatcacatatatcaataagactcatgccatgat 40043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 7299 - 7341
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaat 50  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7299 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaat 7341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11845 - 11796
Alignment:
Q  93 atacttacatcaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatg 142  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  11845 atacttacatcacaccccaatatttctcatcaataatcatcaatcacatg 11796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 72166 - 72093
Alignment:
Q  9 acatcatcataatcca-ataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataata 81  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  72166 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcatttcaaatatcatatacttaatcaatgataata 72093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 220
Target Start/End: Original strand, 163817 - 163846
Alignment:
Q  191 cacatatatcaataagactcatgtcatgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163817 cacatatatcaataagactcatgtcatgat 163846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2989 - 2901
Alignment:
Q  126 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatg 213  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  2989 taatcgccagtcacgtgtatcatgaataatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacatttcaccaataagactcatg 2901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26692 - 26604
Alignment:
Q  126 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatg 213  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  26692 taatcgccagtcacgtgtatcatgaataatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacatttcaccaataagactcatg 26604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University