View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16343_low_4 (Length: 277)

Name: NF16343_low_4
Description: NF16343
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16343_low_4
NF16343_low_4
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (11-266)||(1494-1749)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-277)||(20274-20541)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (11-277)||(6287-6553)
scaffold0310 (19-277)||(1-259)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (11-277)||(7283939-7284205)
chr7 (28-277)||(3895127-3895376)
chr7 (28-277)||(35094918-35095166)
chr7 (28-277)||(44865332-44865582)
chr7 (28-277)||(11287519-11287768)
chr7 (28-277)||(143741-143991)
chr7 (28-260)||(45452063-45452296)
chr7 (28-277)||(39046523-39046768)
chr7 (28-277)||(15822327-15822576)
chr7 (28-277)||(12369735-12369985)
chr7 (24-277)||(47289883-47290138)
chr7 (28-277)||(13862828-13863075)
chr7 (28-277)||(12759089-12759340)
chr7 (28-266)||(26070161-26070398)
chr7 (28-266)||(26093948-26094185)
chr7 (28-277)||(12248015-12248266)
chr7 (29-277)||(16569902-16570151)
chr7 (29-277)||(16595511-16595760)
chr7 (17-242)||(17223819-17224048)
chr7 (17-242)||(13377666-13377894)
chr7 (28-266)||(49047569-49047808)
chr7 (28-237)||(13274919-13275129)
chr7 (17-242)||(14271782-14272009)
chr7 (69-242)||(16914866-16915038)
chr7 (1-59)||(126739-126797)
chr7 (24-242)||(48356781-48357001)
chr7 (7-59)||(111148-111200)
chr7 (24-242)||(9611445-9611665)
chr7 (24-242)||(9839016-9839236)
chr7 (5-59)||(32493923-32493977)
chr7 (5-59)||(1936894-1936948)
chr7 (5-59)||(3060272-3060326)
chr7 (28-163)||(31501389-31501526)
chr7 (28-101)||(25124407-25124482)
chr7 (28-242)||(34241101-34241317)
chr7 (245-277)||(111390-111422)
chr7 (245-277)||(126517-126549)
chr7 (245-277)||(2190307-2190339)
chr7 (245-277)||(32494167-32494199)
chr7 (245-277)||(42056410-42056442)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (11-219)||(19833-20041)
scaffold0122 (11-219)||(24137-24345)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (28-277)||(11603-11853)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-277)||(22793-23043)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (28-277)||(53704629-53704878)
chr4 (28-277)||(55376494-55376742)
chr4 (28-276)||(44346930-44347177)
chr4 (28-277)||(44056017-44056266)
chr4 (32-277)||(8872372-8872616)
chr4 (28-277)||(23269829-23270079)
chr4 (28-277)||(12837096-12837345)
chr4 (28-277)||(16732271-16732520)
chr4 (28-277)||(30458005-30458255)
chr4 (28-277)||(53907604-53907844)
chr4 (28-277)||(34395359-34395609)
chr4 (47-277)||(45458769-45459000)
chr4 (28-243)||(20813442-20813658)
chr4 (28-277)||(21959359-21959608)
chr4 (28-197)||(819826-819996)
chr4 (28-277)||(52265403-52265653)
chr4 (28-266)||(27961084-27961324)
chr4 (28-277)||(13809405-13809655)
chr4 (28-277)||(30232391-30232641)
chr4 (28-258)||(18494224-18494453)
chr4 (28-277)||(15044930-15045181)
chr4 (109-277)||(47535042-47535210)
chr4 (24-242)||(7185735-7185954)
chr4 (5-59)||(54118145-54118199)
chr4 (28-242)||(15109243-15109459)
chr4 (28-222)||(41256263-41256459)
chr4 (231-277)||(820015-820061)
chr4 (7-59)||(5682407-5682459)
chr4 (28-222)||(15013177-15013372)
chr4 (5-59)||(25119084-25119138)
chr4 (181-277)||(41165995-41166091)
chr4 (28-173)||(14901437-14901584)
chr4 (17-64)||(41165838-41165885)
chr4 (69-242)||(18276571-18276743)
chr4 (28-162)||(7964606-7964742)
chr4 (245-277)||(5682648-5682680)
chr4 (245-277)||(14951864-14951896)
chr4 (245-277)||(15272433-15272465)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (28-277)||(50111946-50112196)
chr3 (28-277)||(317405-317653)
chr3 (28-277)||(13817614-13817862)
chr3 (28-277)||(16995956-16996204)
chr3 (28-277)||(8631892-8632142)
chr3 (28-277)||(12349434-12349684)
chr3 (28-277)||(54424114-54424364)
chr3 (28-277)||(19570586-19570833)
chr3 (28-277)||(16181842-16182090)
chr3 (28-277)||(22144167-22144417)
chr3 (28-277)||(17100755-17101004)
chr3 (28-277)||(17101440-17101689)
chr3 (28-277)||(34439237-34439488)
chr3 (28-267)||(38527841-38528079)
chr3 (28-273)||(6154226-6154472)
chr3 (28-277)||(14298523-14298773)
chr3 (28-277)||(14304150-14304400)
chr3 (28-277)||(17938676-17938925)
chr3 (28-277)||(14295540-14295790)
chr3 (28-277)||(14301167-14301417)
chr3 (23-267)||(17522780-17523024)
chr3 (28-276)||(35123799-35124047)
chr3 (87-258)||(55440803-55440974)
chr3 (28-258)||(3578210-3578440)
chr3 (28-277)||(11060902-11061151)
chr3 (132-265)||(19260839-19260972)
chr3 (117-277)||(53898440-53898600)
chr3 (28-132)||(6146664-6146769)
chr3 (149-277)||(6146763-6146891)
chr3 (28-277)||(11328859-11329106)
chr3 (28-162)||(14527975-14528110)
chr3 (104-277)||(11196291-11196457)
chr3 (28-258)||(17139630-17139861)
chr3 (28-277)||(16880225-16880477)
chr3 (17-242)||(17204818-17205046)
chr3 (28-277)||(12560131-12560381)
chr3 (17-266)||(17191654-17191906)
chr3 (32-277)||(14059112-14059358)
chr3 (7-59)||(7854306-7854358)
chr3 (87-277)||(39656628-39656817)
chr3 (133-242)||(47784767-47784876)
chr3 (20-226)||(3576323-3576532)
chr3 (7-59)||(54038003-54038055)
chr3 (106-197)||(15876250-15876341)
chr3 (5-59)||(3992874-3992928)
chr3 (5-59)||(15857140-15857194)
chr3 (5-59)||(17955861-17955915)
chr3 (1-59)||(19232090-19232148)
chr3 (5-59)||(55513194-55513248)
chr3 (28-242)||(30207353-30207570)
chr3 (5-59)||(2844515-2844569)
chr3 (5-59)||(45581955-45582010)
chr3 (28-222)||(14080666-14080863)
chr3 (67-266)||(12488662-12488860)
chr3 (17-62)||(15550919-15550964)
chr3 (28-154)||(11882113-11882240)
chr3 (24-154)||(13301360-13301491)
chr3 (24-154)||(13312016-13312147)
chr3 (17-64)||(38810898-38810945)
chr3 (28-101)||(51961031-51961106)
chr3 (88-162)||(15517848-15517921)
chr3 (5-59)||(16744018-16744072)
chr3 (29-162)||(33368822-33368957)
chr3 (28-162)||(9590648-9590784)
chr3 (236-269)||(12349834-12349867)
chr3 (245-277)||(3992652-3992684)
chr3 (245-277)||(16261555-16261587)
chr3 (245-277)||(30153044-30153076)
chr3 (245-277)||(33341983-33342015)
chr3 (245-277)||(53771143-53771175)
chr3 (245-277)||(54685422-54685454)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (9-277)||(15348-15616)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (28-277)||(4665-4913)
scaffold0447 (28-277)||(9279-9527)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (28-277)||(7274-7522)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (28-273)||(717-963)
scaffold0673 (37-277)||(6749-6990)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (28-277)||(32898892-32899142)
chr6 (28-277)||(18570381-18570630)
chr6 (28-276)||(22441037-22441285)
chr6 (28-277)||(16086119-16086369)
chr6 (28-277)||(16106618-16106868)
chr6 (28-277)||(13014603-13014854)
chr6 (28-277)||(18432745-18432994)
chr6 (95-277)||(31628370-31628552)
chr6 (28-277)||(18777248-18777481)
chr6 (28-277)||(18399040-18399290)
chr6 (17-226)||(22361649-22361859)
chr6 (17-277)||(21623270-21623533)
chr6 (28-267)||(21410944-21411184)
chr6 (28-253)||(25367130-25367357)
chr6 (24-242)||(17556909-17557127)
chr6 (28-236)||(18629502-18629712)
chr6 (28-197)||(33324874-33325046)
chr6 (28-197)||(35135906-35136078)
chr6 (11-59)||(18583641-18583689)
chr6 (5-59)||(19983169-19983223)
chr6 (5-59)||(35015034-35015088)
chr6 (28-242)||(17083093-17083307)
chr6 (140-267)||(28195101-28195228)
chr6 (88-222)||(29605607-29605739)
chr6 (28-146)||(16887685-16887806)
chr6 (133-277)||(18381684-18381828)
chr6 (28-197)||(15079606-15079774)
chr6 (28-146)||(33538264-33538384)
chr6 (245-277)||(15742341-15742373)
chr6 (245-277)||(18583419-18583451)
chr6 (245-277)||(23995025-23995057)
chr6 (245-277)||(26089837-26089869)
chr6 (245-277)||(35015278-35015310)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (28-277)||(21397194-21397444)
chr5 (11-277)||(11584156-11584422)
chr5 (28-277)||(4865365-4865613)
chr5 (28-277)||(28261623-28261867)
chr5 (28-266)||(11337081-11337320)
chr5 (28-277)||(24183027-24183277)
chr5 (28-277)||(20712178-20712428)
chr5 (28-277)||(1168100-1168349)
chr5 (28-277)||(21646636-21646884)
chr5 (95-277)||(24475680-24475861)
chr5 (28-255)||(19405662-19405891)
chr5 (67-223)||(21906855-21907011)
chr5 (17-277)||(19862311-19862574)
chr5 (50-222)||(23981433-23981606)
chr5 (28-277)||(3673964-3674215)
chr5 (28-266)||(16595621-16595860)
chr5 (28-258)||(23466558-23466787)
chr5 (23-277)||(5450731-5450988)
chr5 (17-242)||(21222492-21222718)
chr5 (28-242)||(21310603-21310819)
chr5 (28-277)||(23494021-23494272)
chr5 (28-242)||(28902328-28902545)
chr5 (28-242)||(28938723-28938940)
chr5 (28-277)||(7728522-7728774)
chr5 (28-242)||(21297069-21297285)
chr5 (28-242)||(432600-432815)
chr5 (63-148)||(6456852-6456937)
chr5 (88-222)||(22885799-22885932)
chr5 (245-277)||(2031912-2031944)
chr5 (245-277)||(11342787-11342819)
chr5 (245-277)||(21205028-21205060)
chr5 (245-277)||(21650797-21650829)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (28-277)||(25875816-25876064)
chr2 (28-277)||(23836601-23836850)
chr2 (28-273)||(32465964-32466207)
chr2 (28-277)||(36890581-36890830)
chr2 (28-267)||(25602136-25602377)
chr2 (28-277)||(271272-271521)
chr2 (28-277)||(4448028-4448278)
chr2 (28-277)||(28974151-28974400)
chr2 (28-267)||(27261916-27262156)
chr2 (28-267)||(24571188-24571427)
chr2 (28-277)||(22579758-22580007)
chr2 (23-277)||(68094-68351)
chr2 (28-267)||(31146073-31146316)
chr2 (17-277)||(43645995-43646259)
chr2 (5-59)||(19794606-19794660)
chr2 (1-59)||(22284279-22284337)
chr2 (17-161)||(19660098-19660243)
chr2 (5-59)||(20627215-20627269)
chr2 (5-59)||(22275046-22275100)
chr2 (5-62)||(15633535-15633592)
chr2 (24-146)||(19666761-19666884)
chr2 (17-176)||(25305634-25305796)
chr2 (28-197)||(23821534-23821704)
chr2 (28-197)||(23830613-23830783)
chr2 (5-59)||(43642858-43642912)
chr2 (28-124)||(19669003-19669101)
chr2 (239-273)||(6879543-6879577)
chr2 (245-277)||(22274824-22274856)
chr2 (245-277)||(22284057-22284089)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (28-277)||(9783959-9784209)
chr1 (28-277)||(22403005-22403255)
chr1 (28-277)||(49967752-49968002)
chr1 (35-277)||(41212174-41212415)
chr1 (28-267)||(35054868-35055108)
chr1 (69-277)||(21718330-21718537)
chr1 (28-212)||(35522247-35522432)
chr1 (17-277)||(20177277-20177540)
chr1 (17-242)||(13376741-13376969)
chr1 (28-242)||(16646049-16646266)
chr1 (133-277)||(27329757-27329900)
chr1 (28-242)||(16656775-16656992)
chr1 (28-266)||(51627558-51627798)
chr1 (7-59)||(41218729-41218781)
chr1 (28-222)||(22143256-22143451)
chr1 (5-59)||(21860335-21860389)
chr1 (5-59)||(41394528-41394582)
chr1 (5-59)||(44034848-44034902)
chr1 (28-173)||(19603303-19603449)
chr1 (28-197)||(21195196-21195368)
chr1 (28-222)||(8537803-8538000)
chr1 (28-222)||(8603042-8603239)
chr1 (245-277)||(15861547-15861579)
chr1 (245-277)||(21860113-21860145)
chr1 (245-277)||(35522432-35522464)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (28-277)||(14976-15224)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (28-267)||(133-370)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (28-277)||(11548-11799)
scaffold0359 (28-277)||(1419-1667)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (28-277)||(48249-48496)
scaffold0068 (28-277)||(61697-61944)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (28-277)||(22234700-22234948)
chr8 (28-277)||(37611770-37612020)
chr8 (28-277)||(41246760-41247009)
chr8 (28-277)||(20561526-20561776)
chr8 (28-277)||(20573087-20573337)
chr8 (28-277)||(19992952-19993199)
chr8 (28-277)||(20481707-20481955)
chr8 (28-203)||(25122618-25122793)
chr8 (28-277)||(21681104-21681356)
chr8 (32-132)||(7000524-7000624)
chr8 (17-266)||(21198035-21198286)
chr8 (19-277)||(23837300-23837561)
chr8 (171-267)||(20653944-20654040)
chr8 (28-277)||(22981375-22981622)
chr8 (17-242)||(17285341-17285570)
chr8 (28-277)||(39446660-39446911)
chr8 (185-277)||(20647882-20647974)
chr8 (28-122)||(20529748-20529843)
chr8 (24-242)||(26011631-26011848)
chr8 (106-277)||(38533751-38533922)
chr8 (24-242)||(5854751-5854971)
chr8 (5-59)||(16404877-16404931)
chr8 (5-59)||(24716739-24716793)
chr8 (5-59)||(274767-274821)
chr8 (5-59)||(641028-641082)
chr8 (5-59)||(826834-826888)
chr8 (24-222)||(15933455-15933655)
chr8 (28-197)||(33528607-33528778)
chr8 (7-59)||(39115599-39115651)
chr8 (24-142)||(22743001-22743122)
chr8 (24-197)||(29306599-29306776)
chr8 (28-148)||(31194217-31194340)
chr8 (88-162)||(27233047-27233120)
chr8 (245-277)||(24385873-24385905)
chr8 (245-277)||(24716983-24717015)
chr8 (245-277)||(39115377-39115409)
chr8 (245-277)||(41506930-41506962)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (28-277)||(7671-7922)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (28-277)||(117857-118108)
scaffold0035 (28-267)||(109356-109597)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (28-277)||(254710-254959)
scaffold0011 (28-277)||(261316-261565)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (28-277)||(4387-4635)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (28-277)||(5143-5391)
scaffold0480 (28-277)||(8776-9027)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (28-277)||(9089-9339)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (28-277)||(164317-164565)
scaffold0016 (5-59)||(162055-162109)
scaffold0016 (5-59)||(166141-166195)
scaffold0016 (17-64)||(116440-116487)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (28-277)||(132144-132395)
scaffold0021 (24-277)||(88377-88631)
scaffold0021 (28-277)||(11789-12041)
scaffold0021 (28-256)||(16022-16253)
scaffold0021 (28-256)||(25553-25784)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (28-267)||(112441-112680)
scaffold0022 (28-277)||(102815-103067)
scaffold0022 (181-277)||(109692-109788)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (28-267)||(85444-85683)
scaffold0014 (28-267)||(159411-159651)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (28-277)||(38400-38650)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (28-277)||(60908-61159)
scaffold0001 (63-277)||(70552-70767)
scaffold0001 (28-167)||(79785-79925)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (28-277)||(25313-25563)
scaffold0158 (127-277)||(25060-25210)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (28-277)||(24623-24873)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (47-277)||(252903-253134)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (28-277)||(246-496)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (28-277)||(10039-10289)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (28-277)||(11464-11713)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (28-277)||(33764-34014)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (28-277)||(21614-21862)
scaffold0120 (28-265)||(31325-31561)
scaffold0120 (28-137)||(47445-47554)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (89-277)||(5043-5231)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (28-182)||(2961-3115)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (28-277)||(70715-70964)
scaffold0031 (69-255)||(31168-31352)
scaffold0031 (24-242)||(97088-97308)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (28-277)||(471-721)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (32-267)||(2027-2263)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (11-145)||(8-142)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (24-277)||(46267-46521)
scaffold0034 (28-267)||(40770-41010)
scaffold0034 (7-59)||(80188-80240)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (69-258)||(6062-6251)
scaffold0342 (7-59)||(331-383)
scaffold0342 (245-277)||(572-604)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (132-267)||(146713-146848)
scaffold0025 (24-242)||(53483-53703)
scaffold0025 (92-222)||(85690-85818)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (28-258)||(7927-8157)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (28-258)||(3441-3671)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (21-242)||(76733-76957)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (28-277)||(33622-33873)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (17-242)||(6907-7135)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (24-222)||(197143-197343)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (28-222)||(8167-8363)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (28-197)||(1440-1611)
scaffold0456 (28-197)||(8585-8756)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (17-242)||(35615-35843)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (28-162)||(1242-1378)
scaffold0409 (28-162)||(9497-9633)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (87-253)||(93728-93893)
scaffold0032 (245-277)||(55683-55715)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (5-59)||(5754-5808)
scaffold0686 (5-59)||(5960-6014)
scaffold0686 (245-277)||(6204-6236)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (28-277)||(2211-2461)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (28-162)||(89760-89894)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (24-242)||(69594-69814)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (109-242)||(2662-2795)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (133-242)||(6798-6907)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (28-124)||(70201-70298)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (28-162)||(10879-11014)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (5-59)||(31157-31211)
scaffold0184 (245-277)||(31401-31433)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (5-59)||(41633-41687)
scaffold0078 (245-277)||(41411-41443)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (24-242)||(31157-31377)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (134-266)||(28649-28781)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (28-146)||(22323-22443)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-59)||(30418-30466)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (238-277)||(32305-32344)
scaffold0091 (238-277)||(41959-41998)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (232-277)||(618-663)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (24-197)||(23562-23737)
scaffold0080 (24-242)||(43688-43908)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (28-162)||(855-992)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (28-162)||(79756-79891)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (17-59)||(1393-1435)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (245-277)||(6664-6696)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (245-277)||(1099-1131)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (245-277)||(13507-13539)
scaffold0251 (245-277)||(21481-21513)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (245-277)||(17525-17557)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (245-277)||(15051-15083)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (5-59)||(42678-42729)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (245-277)||(186647-186679)
scaffold0004 (245-277)||(193609-193641)


Alignment Details
Target: scaffold1164 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1749 - 1494
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1749 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttggatgataagtgcttaattgggtgaattg 1650  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  1649 attaattgttcctatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattatat 1550  T
Q  211 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1549 gttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattgttgaattatg 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20541 - 20274
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20541 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 20442  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  20441 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 20342  T
Q  211 gttcaaagt--atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||  |||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20341 gttcaaagtgtatgaaaa-tagatatatgttgaaaatatgctcaattggttaattatgctttgttgttg 20274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 6287 - 6553
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6287 taatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 6386  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  6387 attaactgttcataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacat 6486  T
Q  211 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  6487 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttg 6553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Original strand, 1 - 259
Alignment:
Q  19 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaaatg 100  T
Q  119 ttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaag 218  Q
    || |||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  101 ttaataaatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaag 200  T
Q  219 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  201 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttg 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 7283939 - 7284205
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7283939 taataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttatatgataagtgcttaattggatgaattg 7284038  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||   ||    
T  7284039 attaattgttcataagtggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatggatgattgaattgttattagttgaattgtat 7284138  T
Q  211 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  7284139 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatcctttgttgttg 7284205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3895376 - 3895127
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3895376 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataatt 3895277  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||     
T  3895276 gatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgaaaaa 3895177  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3895176 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 3895127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35095166 - 35094918
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35095166 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 35095067  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag-aa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  35095066 gatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtatatgaaa 35094968  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35094967 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcactgttgttg 35094918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44865582 - 44865332
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44865582 taaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 44865484  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||     
T  44865483 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 44865385  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44865384 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttg 44865332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11287768 - 11287519
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  11287768 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 11287670  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11287669 tgatgaaattagtgctctgattatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 11287570  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11287569 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 11287519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 143991 - 143741
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  143991 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtataaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 143892  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  143891 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 143794  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  143793 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 143741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 45452063 - 45452296
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45452063 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 45452162  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45452163 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 45452262  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtga 260  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45452263 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttgtga 45452296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 39046523 - 39046768
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046523 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 39046622  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||    ||| ||    
T  39046623 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa---ttgaaaa 39046719  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046720 atgagtatatg-tgaaaatat-ctcaattggtgaattatgcattgttgttg 39046768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 15822327 - 15822576
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  15822327 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcagttatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 15822426  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |  |||    
T  15822427 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatg-ttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgtatgaa 15822525  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15822526 aatggtatatgttgaaaatatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttg 15822576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 12369735 - 12369985
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  12369735 taaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 12369834  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12369835 tgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 12369934  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12369935 atgggtatctgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgccttgttgttg 12369985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47290138 - 47289883
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 121  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47290138 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaaatgcttaattggatgaattgattaattgttc 47290039  T
Q  122 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gt 219  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||    
T  47290038 ataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgt 47289940  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47289939 atga-aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 47289883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 13862828 - 13863075
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||      
T  13862828 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaa----gcttaattgggtgaatagattaattgtccataaa 13862923  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13862924 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 13863023  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  13863024 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 13863075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12759340 - 12759089
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12759340 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataa 12759241  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |    
T  12759240 atgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgtgaaa 12759141  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12759140 aaggggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 12759089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 26070161 - 26070398
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26070161 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26070257  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26070258 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26070357  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 266  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26070358 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatg 26070398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 26093948 - 26094185
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  26093948 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 26094044  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26094045 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 26094144  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 266  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26094145 aaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatg 26094185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 12248015 - 12248266
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12248015 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaattggat-aattgattacttgttcata 12248112  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  12248113 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgag 12248212  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  12248213 aaaatagtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 12248266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 16569902 - 16570151
Alignment:
Q  29 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16569902 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16569999  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16570000 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16570099  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16570100 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 16570151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16595760 - 16595511
Alignment:
Q  29 aaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||      
T  16595760 aaggtaagggggttaaaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgctcataaa 16595663  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16595662 tgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 16595563  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16595562 aatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 16595511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 17223819 - 17224048
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||      
T  17223819 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattt-tatgattaagtgcttaattgagtaaata- 17223916  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    |||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  |||    
T  17223917 attaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcat 17224016  T
Q  211 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17224017 gttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17224048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13377894 - 13377666
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| |||||| || ||||  | ||| ||    
T  13377894 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgattcattgagt-aatcga 13377797  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    |||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||||    
T  13377796 ttaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg 13377697  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13377696 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 13377666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 49047569 - 49047808
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  49047569 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtta-tatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcaga 49047666  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || |  |||| |||||| |||| | |||||||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||    
T  49047667 attgttagaatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 49047766  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 266  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49047767 agagtggtatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatg 49047808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13275129 - 13274919
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  13275129 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 13275032  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |   |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  13275031 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgag 13274932  T
Q  225 aagttggtatatg 237  Q
    ||  |||||||||    
T  13274931 aaagtggtatatg 13274919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 14271782 - 14272009
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||    
T  14271782 ttggtgataattaaggtaagggaattagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-ga 14271879  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||| |||||||||| ||  |||  ||||    
T  14271880 ttaattgttcatagttg-tcaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatg 14271978  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  14271979 ttcaaagtatgtgaaaatgatatatgttgaa 14272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Original strand, 16914866 - 16915038
Alignment:
Q  69 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 167  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||    
T  16914866 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatg 16914963  T
Q  168 tatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
     ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  16914964 catgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaa 16915038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 126797 - 126739
Alignment:
Q  1 aagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  126797 aagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 126739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48357001 - 48356781
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 120  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||||||    
T  48357001 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagt-aagtgattaattgtt 48356903  T
Q  121 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta 220  Q
    ||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||    
T  48356902 catagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 48356803  T
Q  221 tgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    || |||  || |||||||||||    
T  48356802 tgtgaaagtgttatatgttgaa 48356781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 111148 - 111200
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111148 gagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 111200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9611665 - 9611445
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9611665 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9611568  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  9611567 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9611468  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  9611467 atgtgaaagtgttatatgttgaa 9611445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9839236 - 9839016
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||  | |  |||||||||||    
T  9839236 taattaaggtaagagggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatcattaagtgcttaattgagt-acgtgattaattgt 9839139  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  9839138 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 9839039  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  9839038 atgtgaaagtgttatatgttgaa 9839016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 32493923 - 32493977
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32493923 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 32493977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 1936894 - 1936948
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1936894 tagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatca 1936948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 3060326 - 3060272
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  3060326 tagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatca 3060272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31501526 - 31501389
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  31501526 taaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttc-attaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcat 31501429  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttta 163  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||    
T  31501428 agttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgttta 31501389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124407
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 25124407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Original strand, 34241101 - 34241317
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||||||||    
T  34241101 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgattaattgagt-aagtgattaattgttcata 34241199  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||| ||||||||| | ||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |||||| |||||||| |    
T  34241200 gttgataaaattcgtgttataattatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtg 34241299  T
Q  225 aagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||  |  |||||||||||    
T  34241300 aaagtaatatatgttgaa 34241317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 111390 - 111422
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  111390 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 111422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 126549 - 126517
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  126549 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 126517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 2190307 - 2190339
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2190307 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 2190339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 32494167 - 32494199
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32494167 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 32494199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 42056410 - 42056442
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42056410 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 42056442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 19833 - 20041
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19833 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 19932  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  19933 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 20032  T
Q  211 gttcaaagt 219  Q
    |||||||||    
T  20033 gttcaaagt 20041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 24137 - 24345
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24137 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 24236  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  24237 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtat 24336  T
Q  211 gttcaaagt 219  Q
    |||||||||    
T  24337 gttcaaagt 24345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11853
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11603 taagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 11702  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11703 tgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11802  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11803 atgggtattagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 11853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23043 - 22793
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23043 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatcaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 22944  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22943 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 22844  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22843 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttg 22793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 53704629 - 53704878
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704629 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgttatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 53704728  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  53704729 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa 53704828  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53704829 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 53704878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 55376494 - 55376742
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55376494 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttttgaaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 55376593  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||     
T  55376594 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaagtatgaaaaa 55376693  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55376694 tgggtatgtg-tgaaaatatactcaattggtgaattatacattgttgttg 55376742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44347177 - 44346930
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44347177 taaggtaagggagttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 44347078  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag-aa 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||    
T  44347077 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtaagaaa 44346979  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 276  Q
     | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44346978 atgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgtt 44346930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44056266 - 44056017
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44056266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 44056167  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44056166 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat-tttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 44056068  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44056067 atgaatatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttg 44056017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 8872372 - 8872616
Alignment:
Q  32 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 131  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8872372 gtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtggtg 8872471  T
Q  132 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttgg 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| || | ||    
T  8872472 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatggg 8872571  T
Q  232 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8872572 tatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttg 8872616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 23269829 - 23270079
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23269829 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 23269928  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  23269929 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 23270026  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23270027 aaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttg 23270079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 12837096 - 12837345
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  12837096 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgaatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 12837194  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12837195 tgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 12837294  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12837295 attggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 12837345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16732520 - 16732271
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttc-aattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  16732520 taaggtaaagaggttagaattcatcataatcattattgcaattttttaattagt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 16732422  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16732421 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 16732322  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16732321 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 16732271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30458255 - 30458005
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  30458255 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 30458156  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  30458155 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaaa 30458056  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30458055 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattacgcattgttgttg 30458005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 53907604 - 53907844
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  53907604 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtagttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggat--------taattgttcatatgt 53907695  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||| ||     
T  53907696 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaagtatgaaaaa 53907795  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53907796 tgggtatgtg-tgaaaatatgcccaattggtgaattatgcattgttgttg 53907844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34395609 - 34395359
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  34395609 taaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaactgattaattgttcataaa 34395510  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  34395509 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 34395412  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34395411 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 34395359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 277
Target Start/End: Original strand, 45458769 - 45459000
Alignment:
Q  47 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 145  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45458769 ttcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataagtgatgaaatttgtgctcta 45458868  T
Q  146 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  45458869 attatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaatatgagaagtttgtatatgttaaagat 45458968  T
Q  246 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45458969 atgttcaattggtgaattatgctttgctgttg 45459000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 243
Target Start/End: Original strand, 20813442 - 20813658
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20813442 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20813541  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20813542 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20813641  T
Q  227 gttggtatatgttgaaa 243  Q
     | ||||| ||||||||    
T  20813642 atgggtatgtgttgaaa 20813658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 21959359 - 21959608
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||      
T  21959359 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaa 21959458  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  21959459 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacat-ctcaaagtatgaaaa 21959557  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21959558 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 21959608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 819826 - 819996
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  819826 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaaatgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 819925  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  819926 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 819996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 52265403 - 52265653
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52265403 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgtttaattgggt-aattgattaattgttcata 52265500  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||||    
T  52265501 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgag 52265600  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52265601 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttg 52265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27961324 - 27961084
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  27961324 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 27961227  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  || |  ||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  27961226 aattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaataattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatga 27961127  T
Q  224 -gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 266  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  27961126 agaagt-ggtatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatg 27961084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 13809405 - 13809655
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13809405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgccatttttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcata 13809502  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| ||   ||  |||||||||||||||||    
T  13809503 attgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgag 13809602  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  13809603 aaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattagttgaattatgctatgttgttg 13809655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 30232391 - 30232641
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30232391 taaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatg-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcat 30232488  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta--t 221  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||  |    
T  30232489 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgt 30232587  T
Q  222 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30232588 gaaaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 30232641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 258
Target Start/End: Original strand, 18494224 - 18494453
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||  | ||||||| |||||||||||     
T  18494224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatg-gtatgaataggtgcttaattgtgt-aattgatcaattgttcataa 18494321  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag- 224  Q
     || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||||     
T  18494322 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 18494420  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18494421 aaaatggtatatgttg-aaatgtgctcaattggt 18494453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15045181 - 15044930
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15045181 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 15045084  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||    
T  15045083 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15044984  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15044983 gaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttg 15044930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 277
Target Start/End: Original strand, 47535042 - 47535210
Alignment:
Q  109 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcac 208  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |    
T  47535042 tgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 47535141  T
Q  209 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  47535142 aagttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttg 47535210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 7185735 - 7185954
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 121  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  7185735 taattaaggtaaggaggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttc 7185833  T
Q  122 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 221  Q
    |||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  |||   ||||||| |||||    
T  7185834 atagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtat 7185933  T
Q  222 gagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    | |||  || |||||||||||    
T  7185934 gtgaaaatgatatatgttgaa 7185954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 54118145 - 54118199
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54118145 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 54118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Original strand, 15109243 - 15109459
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  15109243 taaggtaagggggttagatttcatcataatcattttagtttaaattctcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattcat 15109340  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |   | |  ||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||    
T  15109341 aatagttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 15109440  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||  || |||||||||||    
T  15109441 gaaagtgatatatgttgaa 15109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 41256263 - 41256459
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  41256263 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 41256361  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  41256362 agttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgttga-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 41256459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 277
Target Start/End: Original strand, 820015 - 820061
Alignment:
Q  231 gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  820015 gtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 820061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 5682407 - 5682459
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5682407 gagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatca 5682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 15013177 - 15013372
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  15013177 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcatttgtt-gtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 15013274  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  15013275 agttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgttga-atgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 15013372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 25119084 - 25119138
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  25119084 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatca 25119138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 277
Target Start/End: Original strand, 41165995 - 41166091
Alignment:
Q  181 ataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  41165995 ataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 41166091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14901584 - 14901437
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  || |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14901584 taaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 14901487  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaa 173  Q
    || || |  |||||||||||||||| |||  | ||||||  |||||||||    
T  14901486 atttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaa 14901437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Original strand, 41165838 - 41165885
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 64  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  41165838 ttggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcattttt 41165885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18276743 - 18276571
Alignment:
Q  69 ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 167  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||    
T  18276743 ttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-atgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatg 18276646  T
Q  168 tatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
     ||||| ||    |||||| |||||||||| ||  |||  ||||||||||| ||| |||  || |||||||||||    
T  18276645 catgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagtgttatatgttgaa 18276571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 7964606 - 7964742
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||||    
T  7964606 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgagtaattgttcata 7964704  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
      || | |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  7964705 gttgttaaaatccgtgctctaattatgatgatatgttt 7964742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 5682648 - 5682680
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5682648 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 5682680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14951896 - 14951864
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14951896 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 14951864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 15272433 - 15272465
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15272433 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 15272465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 50111946 - 50112196
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50111946 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 50112045  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  50112046 tgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 50112145  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50112146 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 50112196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 317405 - 317653
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  317405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 317504  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  317505 gatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 317604  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  317605 tgggtatgtg-tgaaaatatgctaaattggtgaattatgcattgttgttg 317653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13817862 - 13817614
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13817862 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgtacatatgt 13817763  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  13817762 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 13817665  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13817664 aatgggtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 13817614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 16995956 - 16996204
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16995956 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattattcataagt 16996055  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||     
T  16996056 ggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 16996155  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996156 tgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 16996204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8632142 - 8631892
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  8632142 taaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattaattaattgttcttaag 8632043  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8632042 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtttgagaa 8631943  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  8631942 gttggtatatgttgaaaatatgcttatttagtgaattatgctttgttgttg 8631892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 12349434 - 12349684
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||      
T  12349434 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgtccataaa 12349533  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12349534 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtgagaa 12349633  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12349634 gttgttatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 12349684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 54424364 - 54424114
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt-aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  54424364 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 54424265  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54424264 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 54424165  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54424164 attgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 54424114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 19570586 - 19570833
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19570586 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaatttttcatatgt 19570684  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||     
T  19570685 gatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaa 19570783  T
Q  228 ttg-gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570784 atgagtatatg-tggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 19570833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 16181842 - 16182090
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16181842 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 16181941  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||| |    
T  16181942 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatga-a 16182039  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16182040 aatgggtatgtg-tgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttg 16182090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 22144167 - 22144417
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  22144167 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaactgttcataac 22144266  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  22144267 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22144364  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22144365 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttg 22144417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17101004 - 17100755
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101004 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17100906  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  17100905 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17100806  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17100805 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 17100755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17101689 - 17101440
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||      
T  17101689 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaatt-tttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaa 17101591  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  17101590 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaac 17101491  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17101490 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 17101440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 34439237 - 34439488
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34439237 taaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataag 34439336  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttta-gatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |    
T  34439337 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgtaa 34439436  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34439437 aatgggtatgtgtttaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 34439488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38528079 - 38527841
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38528079 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaactatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 38527980  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  38527979 gatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 38527882  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38527881 aatgggtatgtg-ggaaaatatgctcaattggtgaattatgc 38527841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Original strand, 6154226 - 6154472
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6154226 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttctatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6154325  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaag--tatgag 224  Q
    | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||     
T  6154326 tcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtttatga- 6154423  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 273  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6154424 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 6154472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14298773 - 14298523
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14298773 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14298674  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||     
T  14298673 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14298574  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14298573 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 14298523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14304400 - 14304150
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  14304400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 14304301  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||     
T  14304300 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagtgtatgat 14304201  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14304200 atggttacgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 14304150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17938925 - 17938676
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |    
T  17938925 taagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgag 17938826  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||  |||  |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17938825 tgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaag-catggttaagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 17938727  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  17938726 gttgatatatgttgaaaatatgcttaattgatgaattatgctttgttgttg 17938676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14295790 - 14295540
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14295790 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14295692  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14295691 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14295592  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  14295591 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 14295540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14301417 - 14301167
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||      
T  14301417 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgctaaaatgggtgaattgattaattgttcataaa 14301319  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14301318 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaagtatgagaa 14301219  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  14301218 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 14301167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 17522780 - 17523024
Alignment:
Q  23 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 121  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17522780 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgagaagtgcttatttgggtgaattgattatttgttc 17522878  T
Q  122 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 221  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17522879 ataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtat 17522978  T
Q  222 gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
     | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17522979 aacaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 17523024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35124047 - 35123799
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35124047 taaggtaaaggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35123948  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa-agtatgaga 225  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||| |    
T  35123947 tgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttaaagtgtatgaaa 35123848  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 276  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35123847 ag--ggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgtt 35123799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 55440803 - 55440974
Alignment:
Q  87 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  55440803 ataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatt 55440902  T
Q  187 gaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55440903 gaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgatgaaaatatgctcaactggt 55440974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3578440 - 3578210
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  3578440 taaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtaggaataagtgcttaattgggtaaattgattaattgttcataa 3578342  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||| |||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3578341 atgatgatattcattctctaattatgatgacatgttga-atgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaatttcatgttcaaagtatgaga 3578243  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3578242 aaatagtatatgttgaaaatatgctcaactggt 3578210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 11060902 - 11061151
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  11060902 taaggtaagggggttggaattcatcataatcataattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggat-aattaattatttgttaatgg 11060999  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  11061000 atgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgaga 11061098  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11061099 aaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 11061151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 265
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19260972
Alignment:
Q  132 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttgg 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 19260938  T
Q  232 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 265  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19260939 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 19260972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 277
Target Start/End: Original strand, 53898440 - 53898600
Alignment:
Q  117 tgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa 216  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  53898440 tgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgcattaaatgttcaa 53898538  T
Q  217 a--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |  |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53898539 agtgtatga-aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 53898600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Original strand, 6146664 - 6146769
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6146664 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 6146763  T
Q  127 tgatga 132  Q
    ||||||    
T  6146764 tgatga 6146769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 277
Target Start/End: Original strand, 6146763 - 6146891
Alignment:
Q  149 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgagaagttggtatatgttgaaaata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| || | ||||| |||||||||||    
T  6146763 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tattagttgaattacatgttcaaagtgtatga-aaatgggtatgtgttgaaaata 6146860  T
Q  247 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6146861 tgctcaattggtgaatcatgcattgttgttg 6146891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 11328859 - 11329106
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  11328859 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 11328956  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||     | || ||||| | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  11328957 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtt-----gcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 11329051  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11329052 agaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 11329106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 14527975 - 14528110
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  14527975 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataa 14528073  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14528074 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 14528110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 277
Target Start/End: Original strand, 11196291 - 11196457
Alignment:
Q  104 tgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11196291 tgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttga 11196390  T
Q  204 atcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||   ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  11196391 attttatgt--------tgagaaaatggtatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgatttgttgttg 11196457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17139861 - 17139630
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  17139861 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattcttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaagtgttcat 17139764  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||| |   |||||||||||||||| ||  |||  |||||||||| |||||    
T  17139763 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatga 17139664  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17139663 gaaaatggtatatgttg-aaatatgctcaattggt 17139630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16880477 - 16880225
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  16880477 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaacaagtgtttaattgagt-aattgattaattgttca 16880380  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  16880379 taattgtttgaattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatg 16880280  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtg-aattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  16880279 agaaagtggtatatgtt-agaatatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttg 16880225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17205046 - 17204818
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||||||||  | ||| ||    
T  17205046 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtg-gtacgaacaagtgcttaattgagtaaat-ga 17204949  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| ||  |||  ||||    
T  17204948 ttaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatg 17204849  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17204848 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17204818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 12560131 - 12560381
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  12560131 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 12560228  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||| ||  |||  |||||||||  ||| ||||||| |||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  12560229 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttgaatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 12560328  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  12560329 aaagtggtatatg-tgaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgttg 12560381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17191906 - 17191654
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||  ||||||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||  | ||| ||    
T  17191906 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcacaatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgaacaattgcttaattgagtaaat-ga 17191809  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| ||  |||  ||||    
T  17191808 ttaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatg 17191709  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 266  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  17191708 ttcaaagtatgagaaagtgatttatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatg 17191654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 14059112 - 14059358
Alignment:
Q  32 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtg 128  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||   ||    
T  14059112 gtaagggggttataattcatcataatcattttagtgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgact-aattgactaattgttcatgattg 14059209  T
Q  129 atgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagt 228  Q
     |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||   |||  |||||||||||||||||||      
T  14059210 ttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaa 14059309  T
Q  229 tggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  14059310 tgacatatgttg-aaatatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttg 14059358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 7854358 - 7854306
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854358 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7854306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39656817 - 39656628
Alignment:
Q  87 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataatt 186  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||| |||||  ||||||  || |||||| ||    ||||||    
T  39656817 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgttatgtttgaatttatgaaattggtgataatt 39656719  T
Q  187 gaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  39656718 gaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 39656628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784876
Alignment:
Q  133 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 232  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 47784866  T
Q  233 atatgttgaa 242  Q
    ||||||||||    
T  47784867 atatgttgaa 47784876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 3576323 - 3576532
Alignment:
Q  20 gtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgatta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||  || ||||||    
T  3576323 gtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaatt-gttgtacgaataagtgcttaatt-gagtaaatgatta 3576420  T
Q  115 attgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttc 214  Q
    |||||||| |  || |  ||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||    
T  3576421 attgttcaaagttgttataattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttc 3576520  T
Q  215 aaagtatgagaa 226  Q
    || |||||||||    
T  3576521 aatgtatgagaa 3576532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 54038003 - 54038055
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54038003 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 54038055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15876341 - 15876250
Alignment:
Q  106 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||| ||| |  |||| ||||||||||||    
T  15876341 aattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgataatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgtt 15876250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 3992928 - 3992874
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3992928 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 3992874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 15857140 - 15857194
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15857140 tagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 15857194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955915
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 17955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 19232148 - 19232090
Alignment:
Q  1 aagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  19232148 aagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatca 19232090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 55513248 - 55513194
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55513248 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 55513194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30207570 - 30207353
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  30207570 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattattca 30207473  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||   | |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||    
T  30207472 tactggttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatg 30207373  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  30207372 agaaagtgatatatgttgaa 30207353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 2844569 - 2844515
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2844569 tagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 2844515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 45582010 - 45581955
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaag-ggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  45582010 tagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatca 45581955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14080863 - 14080666
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  14080863 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaactatg-gtatgaataagtgtttaattggataaat-gattaattgtgca 14080766  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtat 221  Q
    ||  || | |||||||||||| || | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  | |  ||||||||||||||    
T  14080765 tagatgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaagtat 14080667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 266
Target Start/End: Original strand, 12488662 - 12488860
Alignment:
Q  67 aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttaga 165  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | | || ||||||||||||||  || |  ||||| |||||||||| ||||    ||||| ||    
T  12488662 aattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtca-ttaattaattgttcataattgttagaattcatgctctaattatgatattgtgtttgga 12488759  T
Q  166 tgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaatta 264  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  12488760 tgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaatta 12488858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15550964 - 15550919
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15550964 ttggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatcactt 15550919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Original strand, 11882113 - 11882240
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||| ||     
T  11882113 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcttag 11882211  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 154  Q
     || |||| ||| |||||||||| |||||    
T  11882212 atgttgaatttcatgctctaattatgatg 11882240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Original strand, 13301360 - 13301491
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| | ||||    
T  13301360 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttc 13301458  T
Q  122 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 154  Q
     ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13301459 ttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13301491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Original strand, 13312016 - 13312147
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttc 121  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  |||||||| |||||||||||||| || || |||||| | ||||    
T  13312016 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattattggttc 13312114  T
Q  122 atatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatg 154  Q
     ||  || |||| |||||||||||||| |||||    
T  13312115 ttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatg 13312147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Original strand, 38810898 - 38810945
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 64  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  38810898 ttggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttt 38810945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961106
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattg 51961106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15517921 - 15517848
Alignment:
Q  88 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15517921 taagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 15517848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 16744018 - 16744072
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  16744018 tagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatca 16744072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 162
Target Start/End: Original strand, 33368822 - 33368957
Alignment:
Q  29 aaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33368822 aaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttca-ttaattgcatgattaagtgcttatttgaat-aattaattatttgttcata 33368919  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
      || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  33368920 gttgttgaaattcgtgctttaattgtggtgatatgttt 33368957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 9590648 - 9590784
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  9590648 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtggttaattgttcata 9590746  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
      || | |||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  9590747 gttgttaaaatccgtgctctaactatgatgatatgttt 9590784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 269
Target Start/End: Original strand, 12349834 - 12349867
Alignment:
Q  236 tgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcat 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12349834 tgttgataatatgctcaattggtgaattatgcat 12349867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3992684 - 3992652
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3992684 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 3992652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16261587 - 16261555
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16261587 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 16261555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30153076 - 30153044
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30153076 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 30153044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33342015 - 33341983
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33342015 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 33341983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53771175 - 53771143
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53771175 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 53771143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 54685422 - 54685454
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54685422 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 54685454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 15348 - 15616
Alignment:
Q  9 gctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaat 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348 gctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatcacttttgtaattttaaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaat 15447  T
Q  109 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcac 208  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       
T  15448 tgattaattgttcataagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggacaattgaattgttgttagttgaattgt 15547  T
Q  209 atgttcaaagtat-gagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||  | || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15548 atgttcaaagtataaaaaaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 15616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4913 - 4665
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4913 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 4816  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  4815 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 4716  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4715 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 4665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9527 - 9279
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9527 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 9430  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  9429 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 9330  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9329 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7274
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7522 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--gtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatat 7425  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  7424 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaaa 7325  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7324 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Original strand, 717 - 963
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  717 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattgattgttcatatg 816  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  817 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagtatgaaaa 916  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 273  Q
     | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  917 atgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Original strand, 6749 - 6990
Alignment:
Q  37 ggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 135  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgatcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaaat 6848  T
Q  136 tcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgagaagttggta 233  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||| || | ||||    
T  6849 tcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatga-aaatgggta 6947  T
Q  234 tatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6948 tgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 6990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32899142 - 32898892
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  32899142 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 32899043  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32899042 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 32898943  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32898942 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattattgttg 32898892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18570630 - 18570381
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18570630 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 18570531  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||     
T  18570530 gatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaagtatgaaaaa 18570431  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18570430 tgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 18570381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22441285 - 22441037
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  22441285 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcatatat 22441186  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  22441185 gatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaagtatgaaaaa 22441086  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 276  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22441085 tgggtatgagttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgtt 22441037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16086369 - 16086119
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  16086369 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 16086270  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16086269 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagtacgaaaa 16086170  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  16086169 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttg 16086119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16106868 - 16106618
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||      
T  16106868 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattaattgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattaattaattgttcgtaaa 16106769  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16106768 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 16106669  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  16106668 atgagtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattataccttgttgttg 16106618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 13014603 - 13014854
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattat--ttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13014603 taaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaattttcaattatgtttgtatgaaaagtgctaaattgggtgaattgattaattgttcata 13014702  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||     
T  13014703 agtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgtt-gaagtatgaa 13014801  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13014802 aaatgggtatgagttggaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 13014854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18432994 - 18432745
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  18432994 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaaattttcaattatt-gtatgaaaagagcttaattgggtgaattgattatttgttcataaa 18432896  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  18432895 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaagtatgaaaa 18432796  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18432795 atgggtgtatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttg 18432745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31628552 - 31628370
Alignment:
Q  95 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31628552 ttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgtt 31628453  T
Q  195 gttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31628452 gttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttg 31628370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18777481 - 18777248
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 ||||||      
T  18777481 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattg-----------------ttcataaa 18777399  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18777398 agatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 18777299  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18777298 atgggtatgtgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttg 18777248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18399290 - 18399040
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  18399290 taaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcata 18399193  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  18399192 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 18399093  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18399092 aaaatagtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 18399040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22361649 - 22361859
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  22361649 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattg-agcaaatgatt 22361746  T
Q  114 aattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgtt 213  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||  |  |||  ||||||    
T  22361747 aattgttcatagatgataaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgtt 22361846  T
Q  214 caaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||    
T  22361847 caaagtatgagaa 22361859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21623533 - 21623270
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaattt-tcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  21623533 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttctcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattga 21623436  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    |||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||  |  |||  ||||    
T  21623435 ttaattgttcataaatgttagaattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatg 21623336  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  21623335 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 21623270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 21410944 - 21411184
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  21410944 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gaggaattgactaattgttcat 21411041  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |   | |  |||| |||||| |||| |||||  |||| |  ||| |||||||| |  |||||||||| |||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  21411042 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatga 21411141  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  21411142 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatgc 21411184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Original strand, 25367130 - 25367357
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25367130 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgcttaatt-gagcaattgattaattgttcat 25367227  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaag-ttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||| || |  ||||| |||||||||||||   |||  |||||||||||||||    
T  25367228 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatg 25367327  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa 253  Q
    ||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  25367328 agaaagtggtttatgttg-aaatatgctcaa 25367357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 17556909 - 17557127
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatca-cttttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 120  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  17556909 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgcattattaagtgcttaattgaat-aattgattatttgtt 17557007  T
Q  121 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta 220  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||    
T  17557008 catagttgtt-aaattcgtgctctaattatgatgatatgttt-gatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagta 17557105  T
Q  221 tgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    || |||  || |||||||||||    
T  17557106 tgtgaaagtgttatatgttgaa 17557127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Original strand, 18629502 - 18629712
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  18629502 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaattttttatttgttgtatgattaagtgtttaattgaat-aagtgattaattgttcata 18629600  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||     
T  18629601 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgt 18629699  T
Q  224 gaagttggtatat 236  Q
    |||  ||||||||    
T  18629700 gaaagtggtatat 18629712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33325046 - 33324874
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatt--ttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||  |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33325046 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaat-gtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttca 33324949  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  33324948 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33324874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 35135906 - 35136078
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt--caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35135906 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattagat-aattgattaattgttca 35136003  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgtt 197  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  35136004 tagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgtt 35136078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 18583689 - 18583641
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18583689 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 18583641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 19983169 - 19983223
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19983169 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 35015034 - 35015088
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35015034 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 35015088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Original strand, 17083093 - 17083307
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||     
T  17083093 taaggtaagggggttagaattcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatag 17083191  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     || | | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||  |||   ||||||| |||||| ||    
T  17083192 ttgttaatattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtg-ataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 17083290  T
Q  226 agttggtatatgttgaa 242  Q
    |  || |||||||||||    
T  17083291 aaatgatatatgttgaa 17083307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Original strand, 28195101 - 28195228
Alignment:
Q  140 gctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgtt 239  Q
    |||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||  ||||||||| |    
T  28195101 gctccaattatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaatggtatatgat 28195200  T
Q  240 gaaaatatgctcaatt-ggtgaattatgc 267  Q
    | |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  28195201 g-aaatgtgctcaattagttgaattatgc 28195228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29605739 - 29605607
Alignment:
Q  88 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 187  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||    
T  29605739 taagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgataattg 29605642  T
Q  188 aattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||    
T  29605641 aattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatg 29605607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 16887685 - 16887806
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  16887685 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgaat-aaatgattaattgttca 16887782  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaa 146  Q
    ||  || | |||||||||||||||    
T  16887783 tagatgttaaaattcgtgctctaa 16887806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 277
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381828
Alignment:
Q  133 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 232  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||  ||  |||||||| |  |||||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 18381783  T
Q  233 atatgttgaaaatatgc-tcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||| || ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  18381784 atatgttg-aattatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttg 18381828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 15079606 - 15079774
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15079606 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt-tatgaataagggattaattggat-aattgattaattattcat 15079702  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    |  || | ||||||||||||||| |  ||||| |||||   ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  15079703 agatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatgttgt-atgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt 15079774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 33538264 - 33538384
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  33538264 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 33538362  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaa 146  Q
      || | |||||||||||||||    
T  33538363 gttgttaaaattcgtgctctaa 33538384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 15742341 - 15742373
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15742341 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 15742373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18583451 - 18583419
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18583451 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 18583419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23995057 - 23995025
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23995057 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 23995025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26089869 - 26089837
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26089869 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 26089837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 35015278 - 35015310
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35015278 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 35015310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21397444 - 21397194
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21397444 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataag 21397345  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  21397344 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 21397247  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21397246 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 21397194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11584422 - 11584156
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11584422 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaatta 11584323  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  11584322 attaattgttcatgagtggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcat 11584223  T
Q  211 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||  |||| |  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11584222 gtttcaagtgtatgaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 11584156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4865613 - 4865365
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4865613 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 4865514  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  4865513 ggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 4865414  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4865413 tgggtat-gggtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtggttg 4865365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28261867 - 28261623
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28261867 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 28261768  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  28261767 ggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaa- 28261669  T
Q  228 ttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261668 -----atatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 28261623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 11337081 - 11337320
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11337081 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataa 11337179  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11337180 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 11337279  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 266  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11337280 atatggtaaatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatg 11337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 24183027 - 24183277
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  24183027 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 24183126  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||    
T  24183127 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatggataattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaa 24183226  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24183227 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 24183277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20712428 - 20712178
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  20712428 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaattttcaattacttgtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataa 20712329  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  20712328 -tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaa 20712230  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20712229 aatgggtatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 20712178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 1168100 - 1168349
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||      
T  1168100 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaaatgcttattttggtgaattgattaattgttcataaa 1168198  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1168199 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 1168298  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1168299 aatgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttg 1168349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 21646636 - 21646884
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21646636 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttcatatg 21646734  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  |||    
T  21646735 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgtatgaa 21646833  T
Q  227 gttggtatatgt-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
      |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21646834 aatgg-gtatgtatgaaaatatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttg 21646884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24475861 - 24475680
Alignment:
Q  95 ttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24475861 ttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-t 24475763  T
Q  195 gttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| || | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24475762 gttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-aaatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 24475680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19405891 - 19405662
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19405891 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 19405793  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19405792 aatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 19405693  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt 255  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  19405692 aaaagggtatatgttgaaaatatgctcaatt 19405662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21907011 - 21906855
Alignment:
Q  67 aattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagat 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21907011 aattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagac 21906912  T
Q  167 gtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21906911 atatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagtatga 21906855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19862574 - 19862311
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | || ||||    
T  19862574 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aagtgat 19862476  T
Q  113 taattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgt 212  Q
    ||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||||    
T  19862475 taattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 19862376  T
Q  213 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19862375 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 19862311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981606
Alignment:
Q  50 atcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 148  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgataagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaatt 23981532  T
Q  149 gtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
     |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||    
T  23981533 atgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 23981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3674215 - 3673964
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt---tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3674215 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaattgattaattgttcat 3674118  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||  || ||||| |  |||||||||||||||||||   |||  |||| |||||||||||    
T  3674117 aattgttagaattcgtgctcaaattatgatgatatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatga 3674018  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  3674017 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 3673964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595621
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  16595860 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgactaattgttcat 16595763  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||   |||  ||||||||||||||||    
T  16595762 aattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatga 16595663  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatg 266  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16595662 gaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgtgaattatg 16595621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23466787 - 23466558
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||     
T  23466787 taaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattgtgt-aattgattaattgttcataa 23466690  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag- 224  Q
     |  |  ||||||||||| |||| ||   ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||||||     
T  23466689 ttattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgaga 23466591  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23466590 aaaatggtgtatgttg-aaatatgctcaattggt 23466558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Original strand, 5450731 - 5450988
Alignment:
Q  23 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || | || | ||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  5450731 ataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gcataaataaatgcttaattgagt-aattgattaatt 5450828  T
Q  118 gttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa 217  Q
    |||||||  || |  ||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  5450829 gttcataattgttagaattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T
Q  218 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  5450929 gtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttg 5450988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 21222492 - 21222718
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgat 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||    
T  21222492 ttggtgataattaaggtatgggggttagagttcaatcataattatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaattg--agtattgat 21222588  T
Q  113 taattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgt 212  Q
    ||||||||||||  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||| |||||||||| ||  |||  |||||    
T  21222589 taattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgt 21222688  T
Q  213 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||||||||  |||  || |||||||||||    
T  21222689 tcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaa 21222718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Original strand, 21310603 - 21310819
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  21310603 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 21310701  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||| || |    
T  21310702 aatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21310801  T
Q  225 aagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21310802 aaaatgatatatgttgaa 21310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23494272 - 23494021
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||||    
T  23494272 taaggtaagggggttagaaatcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aatcaattaattgttcat 23494175  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  || |  ||||||||||| || | ||||||||||||   ||| |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||    
T  23494174 aattgttagaattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaagtatga 23494075  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
      | | ||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  23494074 agaataggtatatgttg-agatatgcgaaattggttgaattatgctatgttgttg 23494021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28902545 - 28902328
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28902545 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28902448  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||   | |||||||||||||    
T  28902447 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28902348  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  28902347 agaaagtgatatatgttgaa 28902328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28938940 - 28938723
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28938940 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttgtagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 28938843  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||   | |||||||||||||    
T  28938842 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 28938743  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  28938742 agaaagtgatatatgttgaa 28938723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7728774 - 7728522
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||   ||| |||  |||  |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  7728774 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 7728676  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  || |  ||||||| ||| |||| ||| |  || |||  ||| ||||| ||    |||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||    
T  7728675 aattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 7728576  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  7728575 gaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 7728522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Original strand, 21297069 - 21297285
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  21297069 taaggtaagggggttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgttcata 21297167  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || | |||||||| |||||| | |||||| ||||||  | | ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||| || |    
T  21297168 aatgttaaaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtg 21297267  T
Q  225 aagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||  || |||||||||||    
T  21297268 aaaatgatatatgttgaa 21297285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 432815 - 432600
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||    
T  432815 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttactgcaatttttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgatcata 432718  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || | ||||||| |||| |||| |||||| ||||||  ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| ||  ||   |||||||||||||||||    
T  432717 attgttaaaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgag 432618  T
Q  225 aagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||  || |||||||||||    
T  432617 aaaatgatatatgttgaa 432600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6456937 - 6456852
Alignment:
Q  63 ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaatt 148  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  6456937 ttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaatt 6456852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885799
Alignment:
Q  88 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattg 187  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||   || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaat-aattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattg 22885834  T
Q  188 aattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  22885833 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 22885799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2031944 - 2031912
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2031944 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 2031912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11342819 - 11342787
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11342819 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 11342787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21205060 - 21205028
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21205060 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 21205028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21650829 - 21650797
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21650829 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 21650797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 25875816 - 25876064
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25875816 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataagt 25875915  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  25875916 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt-atgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 25876013  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25876014 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 25876064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 23836601 - 23836850
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23836601 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgaatgataagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataagt 23836700  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt--atgaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  |||| |    
T  23836701 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgt-gttagtggaattacatgttcaaagtgtatgaaa 23836799  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23836800 a-tgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 23836850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32466207 - 32465964
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32466207 taaggtaagggg-ttagtcttcatcataatcacttttgaaaattttaattatttgtacgataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgt 32466109  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  32466108 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaa 32466009  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 273  Q
    | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32466008 tggatatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 32465964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 36890581 - 36890830
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  36890581 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttattttcaattatg-gtatgaaaagtgcttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 36890679  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36890680 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 36890779  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
      ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  36890780 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctatgttgttg 36890830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25602377 - 25602136
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  25602377 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatg 25602279  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25602278 gatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgag 25602179  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25602178 aaattgatatatgttgaaaatatgctcaattggtgagttatgc 25602136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 271521 - 271272
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  271521 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattattcataaa 271423  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  271422 tgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 271323  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  271322 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttg 271272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 4448028 - 4448278
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  4448028 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttatatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaattgttcataaa 4448127  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  4448128 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 4448227  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4448228 atgggtttgtgttgaaaatatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttg 4448278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28974400 - 28974151
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  28974400 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattatttcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaa 28974302  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28974301 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaa 28974202  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  28974201 aatggtatatgttgaaaatatgctcatttggcgaattatgctatgttgttg 28974151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27262156 - 27261916
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27262156 taaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatg 27262058  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27262057 gatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggataattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaagtatgag 27261958  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27261957 aaattggtatatgttgaaaatatgctc-attggtgaattatgc 27261916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 24571188 - 24571427
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaat-tttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  24571188 taaggttagggggttagaattcatcataatcattattgcaatgtttcaattatt-gtatgaataaatgcttaattgggt-aattgattaattgttcatag 24571285  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||   |||  ||||||||| ||||||||    
T  24571286 atgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggatacttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgaga 24571385  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgc 267  Q
    |  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24571386 aaatgatatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgc 24571427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 22579758 - 22580007
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  22579758 taaggtaagggggttagaattcatcataatcactattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgtgt-aattgattaattgttcataa 22579855  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag- 224  Q
     || |  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||    ||| |||| |||||||     
T  22579856 ttgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgaga 22579954  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22579955 aaaatgttatatgttg-aaatatgctcaattggttgaattatgctttgttgttg 22580007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 68351 - 68094
Alignment:
Q  23 ataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaatt 117  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  68351 ataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtataaattttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaatagattaatt 68254  T
Q  118 gttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa 217  Q
    |||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||    
T  68253 gttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T
Q  218 gtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  68153 gtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 68094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146316
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatca-cttttgt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaact-gagtaattgattaattgtcca 31146171  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  |||||||| || |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||    
T  31146172 taattgttagaattcgtgttccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatg 31146271  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgc 267  Q
    ||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31146272 agaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgc 31146316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43646259 - 43645995
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| |||| | |  |||||||| |||||| |||||||  | ||| ||    
T  43646259 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttgtatgaataagtgtttaattgagtaaat-ga 43646161  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    ||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||| ||||||||| ||  |||  ||||    
T  43646160 ttaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatg 43646061  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  43646060 tttaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 43645995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 19794606 - 19794660
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19794606 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 19794660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22284337 - 22284279
Alignment:
Q  1 aagttagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22284337 aagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 22284279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19660243 - 19660098
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||  |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||    
T  19660243 ttggtgataattaaggtaa-ggggttagaattcatcataatcactttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgtttaa-tggaataagtgatt 19660146  T
Q  114 aattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtt 161  Q
    | |||||| ||  || |||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  19660145 atttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgatatgtt 19660098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 20627215 - 20627269
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20627215 tagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatca 20627269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22275100 - 22275046
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22275100 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatca 22275046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15633592 - 15633535
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt 62  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15633592 tagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcactt 15633535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19666884 - 19666761
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 120  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  19666884 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataaatgcttaattgaat-aagtgattaattgtt 19666787  T
Q  121 catatgtgatgaaattcgtgctctaa 146  Q
    ||||  || | |||||| ||||||||    
T  19666786 catagttgttaaaattcatgctctaa 19666761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25305796 - 25305634
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||  || |||    
T  25305796 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtataattttacaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatga 25305699  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt 176  Q
    ||||||||||| |  || |  |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  25305698 ttaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtt 25305634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 23821534 - 23821704
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23821534 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23821631  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  23821632 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgtt 23821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 23830613 - 23830783
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  23830613 taaggtaagggggttagatttcattataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gcatgcttaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgttcata 23830710  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
      || | ||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  23830711 gttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgtt 23830783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 43642858 - 43642912
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  43642858 tagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatca 43642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 19669003 - 19669101
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  19669003 taaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaatgattaattgttcat 19669100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6879577 - 6879543
Alignment:
Q  239 tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgtt 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6879577 tgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgtt 6879543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22274856 - 22274824
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22274856 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 22274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22284089 - 22284057
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22284089 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 22284057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 9783959 - 9784209
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9783959 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaattttcaattattggtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgataaattgttcataag 9784058  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9784059 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgagaa 9784158  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9784159 gttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttg 9784209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 22403005 - 22403255
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22403005 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataag 22403104  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  22403105 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 22403202  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22403203 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 22403255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49968002 - 49967752
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  49968002 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaattttcaattatttgcatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcaaaaa 49967903  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  49967902 tcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattataaaaa 49967803  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49967802 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatacattgttgttg 49967752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212174
Alignment:
Q  35 agggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaa 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaa 41212316  T
Q  135 ttcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtat 234  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || | |||||    
T  41212315 ttcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaagtatgaaaaatgggtat 41212216  T
Q  235 atgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41212215 gtg-taaaaatatgctcaattagtgaattatgcactgttgttg 41212174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35055108 - 35054868
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta-attttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||      
T  35055108 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattggttaattgttcataaa 35055009  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  35055008 tgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 35054909  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35054908 atgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 35054868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 69 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21718537 - 21718330
Alignment:
Q  69 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 168  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21718537 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgt 21718439  T
Q  169 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgca 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21718438 atgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaattggtgaattatgct 21718339  T
Q  269 ttgttgttg 277  Q
     ||||||||    
T  21718338 atgttgttg 21718330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 35522247 - 35522432
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  35522247 taaggtaagggagttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 35522346  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35522347 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgt 35522432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20177540 - 20177277
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||  | ||||||    
T  20177540 ttggtgataattaaggtaatggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgtttaagtgcttaattgagt-aattga 20177443  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    |||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||||    
T  20177442 ttaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg 20177343  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20177342 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 20177277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 13376741 - 13376969
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||||||    
T  13376741 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaatttagt-aattga 13376838  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaa-tcacat 210  Q
    |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  |||||| |||||||||  |||||| |  |||    
T  13376839 ttaattgttcatagatgatgagaatcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattaaattgttgtc-gttgaaatttcat 13376937  T
Q  211 gttcaaagtatg-agaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13376938 gttcaaagtatgaagaag-tggtatatgttgaa 13376969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16646266 - 16646049
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16646266 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16646169  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||| ||||| |||| ||  |||  |||||||||||||||    
T  16646168 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatg 16646069  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  16646068 agaaagtgatatatgttgaa 16646049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 277
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329900
Alignment:
Q  133 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta--tgagaagttg 230  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||   |||| ||||||||  ||| |||| |    
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatg-ataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgg 27329855  T
Q  231 gtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27329856 gt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 27329900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16656992 - 16656775
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg----taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||     |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16656992 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgttaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 16656895  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||   | |||||||||||||    
T  16656894 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatg 16656795  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||  || |||||||||||    
T  16656794 agaaagtgatatatgttgaa 16656775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 51627558 - 51627798
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  51627558 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gcatgaataagtgcttaattgagt-aattgattatttgttcat 51627655  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |   | |  |||| |||||| |||| |||||| ||| ||  ||| ||||| || |  || |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||    
T  51627656 aatcgttagaatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatga 51627755  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatg 266  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  51627756 gaaaatggtatatgttg-aaatatgttcaattggttgaattatg 51627798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 41218781 - 41218729
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41218781 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatca 41218729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 22143256 - 22143451
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22143256 taaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 22143352  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |  || | ||||||||||||||| | ||||||  |||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||    
T  22143353 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 22143451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 21860389 - 21860335
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21860389 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 21860335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 41394582 - 41394528
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41394582 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 41394528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 44034848 - 44034902
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44034848 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 44034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19603449 - 19603303
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19603449 taaggtaagggggctagaattcatcataatca-tttagtgcaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 19603353  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaa 173  Q
    |  || | |||||||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||    
T  19603352 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaa 19603303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21195368 - 21195196
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  21195368 taaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttcat 21195270  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    |  || | ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||| ||    |||||||||||||||||    
T  21195269 agttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgtt 21195196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 8537803 - 8538000
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8537803 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8537901  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  8537902 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8538000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 8603042 - 8603239
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||    
T  8603042 taaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattattcgttcat 8603140  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
       || ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  8603141 ggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 8603239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 15861547 - 15861579
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15861547 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 15861579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21860145 - 21860113
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21860145 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 21860113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522464
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 35522464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15224 - 14976
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15224 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatatgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 15125  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||  |||||| |    
T  15124 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgtatga-a 15027  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15026 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 14976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 133
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 271  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  270 tgatgaaattcgtgctctaat---gatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaagtatgagaa 174  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  173 attggtatatgttgaaaatatgctcaattcgtgaattatgc 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 11548 - 11799
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11548 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 11647  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||     
T  11648 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgtatga- 11746  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11747 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttg 11799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1667 - 1419
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||      
T  1667 taaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt--caattatttgtatgaaaagtggttaattgaatgaattgattaattgtgtataaa 1570  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1569 tgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 1470  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1469 atgggtatgtgatgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttg 1419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 48496 - 48249
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48496 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 48398  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  48397 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 48298  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  48297 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttg 48249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 61944 - 61697
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  61944 taaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 61846  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaag 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||     
T  61845 gatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatgaaaaa 61746  T
Q  228 ttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  61745 tgggtatgtgtt-aaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttg 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 22234700 - 22234948
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22234700 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattgaatgaattgattaattgttcataagt 22234799  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||| |    
T  22234800 gatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattg-tgttagttgaattacatgctcaaagtgtatga-a 22234897  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234898 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 22234948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37612020 - 37611770
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  37612020 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattagatgaattgattaattgttcataag 37611921  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  37611920 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 37611823  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37611822 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 37611770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41247009 - 41246760
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  41247009 taaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaattttcaattagttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataaa 41246910  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  41246909 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtaggaaaa 41246810  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41246809 atgggtatatgatg-aaatatgcttaattggtgaattatgcattgttgttg 41246760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 20561526 - 20561776
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20561526 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20561625  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20561626 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 20561725  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20561726 attggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttg 20561776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 20573087 - 20573337
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  20573087 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatttgtatgataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 20573186  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  20573187 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaa 20573286  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20573287 aagggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatcctttgttgttg 20573337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 19992952 - 19993199
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19992952 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttttgtaattt-caattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 19993050  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||| |    
T  19993051 gatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacttgttcaaagtgtatga-a 19993148  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993149 aatgggtatgtg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 19993199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20481955 - 20481707
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  20481955 taaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaat-gtatgaataagtgcttaattggat-aattgattatttgttcatgga 20481858  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20481857 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 20481758  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20481757 atggatatgtgttgataatatgctcaattggtgaattatactttgttgttg 20481707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25122793 - 25122618
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25122793 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattataattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaat 25122694  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttga 203  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25122693 gatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgctagttga 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21681356 - 21681104
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21681356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaatttgttgaattgattaattgttcata 21681258  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21681257 aatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaatttcatgtttaaagtatgag 21681158  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  21681157 agaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgttg 21681104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Original strand, 7000524 - 7000624
Alignment:
Q  32 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7000524 gtaagggggttagttttcatcataatcacttttttaattttcaattatttgtatgataagtgcttaataggatgaattgattaattgttcatatgtgatg 7000623  T
Q  132 a 132  Q
    |    
T  7000624 a 7000624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Original strand, 21198035 - 21198286
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21198035 ttggtgataattaagataagggggttagaattcattataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aattgat 21198132  T
Q  113 taattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgt 212  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||||    
T  21198133 taattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 21198232  T
Q  213 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 266  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  21198233 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatg 21198286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23837561 - 23837300
Alignment:
Q  19 ggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttttgta---attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||    
T  23837561 ggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttaatatagattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gatt 23837464  T
Q  114 aattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgtt 213  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |  |||  ||||||    
T  23837463 aattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgtt 23837364  T
Q  214 caaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  23837363 caaagtatgagaaagtgatatatgttg-aactatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 23837300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 267
Target Start/End: Original strand, 20653944 - 20654040
Alignment:
Q  171 gaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20653944 gaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgc 20654040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22981622 - 22981375
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22981622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt--ttgtatgaataagtgcttaattgggt-aattgattaattgttcaga 22981526  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  22981525 tg--atgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 22981428  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22981427 aaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 22981375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17285570 - 17285341
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  17285570 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt-gtatgattaagtgcttaattgaat-aattg 17285473  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacat 210  Q
    | ||||||||||||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||    
T  17285472 aataattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcat 17285373  T
Q  211 gttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17285372 gttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 17285341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 39446660 - 39446911
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39446660 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 39446757  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg- 222  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||     
T  39446758 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 39446857  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  39446858 agaag-tgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttg 39446911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 277
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20647974
Alignment:
Q  185 ttgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttg 20647974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 20529748 - 20529843
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20529748 taaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 20529843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26011848 - 26011631
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||  | || |||||||||||    
T  26011848 taattaaggtaagggggtta---ttcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgtttaattgagt-aagtgattaattgt 26011754  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  26011753 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagt 26011654  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  26011653 atgtgaaagtgttatatgttgaa 26011631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38533922 - 38533751
Alignment:
Q  106 aattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaat 205  Q
    |||||| ||||||||||||  || |  ||||||| ||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||   |||    
T  38533922 aattgactaattgttcataattgttagaattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaat 38533823  T
Q  206 cacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||    
T  38533822 ctcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttg-aaatatgctcaaattattgaattatgctatgttgttg 38533751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5854971 - 5854751
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||    
T  5854971 taattaaggtaaggaggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 5854874  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  5854873 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagt 5854774  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||  |||  || |||||||||||    
T  5854773 atatgaaagtgttatatgttgaa 5854751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 16404877 - 16404931
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16404877 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 16404931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 24716739 - 24716793
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24716739 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 24716793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 274821 - 274767
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  274821 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 274767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 641028 - 641082
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  641028 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 826834 - 826888
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  826834 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 826888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15933655 - 15933455
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgtt-catcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  15933655 taattaaggtaagggggttagaattaaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 15933558  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  15933557 tcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 15933458  T
Q  220 atg 222  Q
    |||    
T  15933457 atg 15933455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33528778 - 33528607
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  33528778 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattaattgttctta 33528680  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
      || |||| | |||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  33528679 gatgttgaattccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt 33528607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 39115651 - 39115599
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39115651 gagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatca 39115599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22743122 - 22743001
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatc-ataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  22743122 taattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgt 22743024  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgct 142  Q
    |||||  || |||||||||||||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgct 22743001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29306776 - 29306599
Alignment:
Q  24 taattaaggtaag-ggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattg 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||  |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  29306776 taattaaggtaagaggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaat-aagtgattgattg 29306678  T
Q  119 ttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    ||||||  || | | ||||||||||||| | |||||| |||||   ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  29306677 ttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgatgatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 29306599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194340
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt-gt---aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||   |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttttagtgcaaattttcaatt-gttgtatgaataattgcttaatt-gagtaattgattaattgttca 31194314  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaatt 148  Q
    |   || |  ||||||||||||||||    
T  31194315 tgattgttagaattcgtgctctaatt 31194340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 162
Target Start/End: Original strand, 27233047 - 27233120
Alignment:
Q  88 taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27233047 taagtgcttaattgaat-aagtgattattagttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttt 27233120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 24385873 - 24385905
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24385873 tatgctcaattggtgaattaagcattgttgttg 24385905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 24716983 - 24717015
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24716983 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 24717015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39115409 - 39115377
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39115409 tatgctcaattggtgaattatgcatagttgttg 39115377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 41506930 - 41506962
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41506930 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 41506962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7922 - 7671
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  7922 taaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 7823  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgac-atgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7822 tgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 7723  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7722 aatgggtatatgatgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 7671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 117857 - 118108
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  117857 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 117955  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  117956 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 118055  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  118056 aagttggtatatgttgaaaatatgttcaattggtgaattatgctatgttgttg 118108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 109356 - 109597
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt---caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109356 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattggctgaattgattaattgttcata 109454  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  109455 aatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgag 109554  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
    || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  109555 aaattggtatatattgaaaatatgataaattggtgaattatgc 109597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 254710 - 254959
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  254710 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 254808  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  254809 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 254906  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254907 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 254959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 261316 - 261565
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  261316 taaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaattt-caattatttgtatgataagtgtttaattggatgaattgattaattgttcatata 261414  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||     
T  261415 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtag-tagttgaattacatgttcaaagtgtatga- 261512  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  261513 aaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 261565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4635 - 4387
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4635 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 4536  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  4535 gatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 4438  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4437 aatgggtatgtg-tgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttg 4387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 5143 - 5391
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5143 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttctaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 5242  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  5243 gatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 5340  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5341 aataggtatgtg-cgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgttg 5391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 8776 - 9027
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  8776 taaggtaagggggttagagttcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcata 8874  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8875 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 8974  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  8975 aaaatgatatatgttg-atatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 9027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9089
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt--caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||     
T  9339 taaggtaagggggttagaatttatcataatcattattgcaattttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataa 9241  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9240 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 9141  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9140 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 9089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 164565 - 164317
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  164565 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattaattgtatggtaagtgcttaattggatgaattgattaatttttcataagt 164466  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaa--gtatgaga 225  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  164465 gatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatga-a 164368  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164367 aatgggtatgtg-tgaagatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 164317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 162055 - 162109
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  162055 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 162109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 166141 - 166195
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  166141 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Original strand, 116440 - 116487
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  116440 ttggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattttt 116487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 132144 - 132395
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  132144 taaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 132243  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  132244 atgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaagtatgaaa 132343  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  132344 aatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttg 132395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 88631 - 88377
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  88631 taataaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctattttcaattatttgtatgaaaagtgtttaattgggtgaattgattaattgtcca 88532  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  88531 taaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg 88432  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  88431 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgatcaattggtgaattatgctatgttgttg 88377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12041 - 11789
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12041 taaggtaaggtggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcata 11943  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11942 aatgatgaatttcgtgctctaattatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgag 11843  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||   | |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  11842 aaaaagatatgagttgaaaacatgctcaattggttgaattatgctatgttgttg 11789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16253 - 16022
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16253 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 16155  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16154 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 16055  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 256  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  16054 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25784 - 25553
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgta--attttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaatt-gttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25784 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaatttcaattatt-gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcat 25686  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatga 223  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25685 aaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatga 25586  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattg 256  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25585 gaaaatgatatgagttgaaaatatgctccattg 25553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 112441 - 112680
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||      
T  112441 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaa 112539  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  112540 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 112639  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  112640 attggtatatgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgc 112680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 102815 - 103067
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  102815 taaggtaaggggtttataattcatcataatcattttttgtgtaaattttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttca 102912  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    ||  || |  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  102913 taattgttagaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatg 103012  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||  ||||||||| ||  |||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||    
T  103013 agaaagtggtatatggtg-gaatatgctaaatttgttgaattatgctatgttgttg 103067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 109788 - 109692
Alignment:
Q  181 ataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||    
T  109788 ataattgaattgttgttaatgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtggtatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattttgctatgttgttg 109692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 85683 - 85444
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  85683 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaa 85585  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85584 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 85485  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  85484 attggtatatattgaaaatatgcttaattggtgaattatgc 85444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 159651 - 159411
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  159651 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtacgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 159553  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  159552 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaa 159453  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgc 267  Q
      || |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  159452 aatgatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgc 159411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38650 - 38400
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  38650 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaa 38551  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||    
T  38550 tgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaaggaagagaa 38451  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38450 atgggtatatgttgaaaatatgctcaattggcgaattatgcattgttgttg 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 61159 - 60908
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  61159 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataa 61060  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  61059 atgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgaaa 60960  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | | ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  60959 aatgggtatgtgttaaaaatatacttaattggtgaattatgctttgttgttg 60908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 70552 - 70767
Alignment:
Q  63 ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70552 ttgtaattttcaattatttgtaagaaaagtgcttatttggatgagttgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgttt 70651  T
Q  163 agatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaa 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70652 agatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaa 70751  T
Q  262 ttatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||| ||||||    
T  70752 ttatgcattattgttg 70767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 79785 - 79925
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  79785 taagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 79884  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatg 167  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  79885 tgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25563 - 25313
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25563 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaa 25464  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |  |||    
T  25463 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25364  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25363 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttg 25313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25210 - 25060
Alignment:
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |  |||    
T  25210 tgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaa 25111  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25110 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttg 25060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 24623 - 24873
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||      
T  24623 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattaggtgaattgattaattgtccataaa 24722  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24723 tgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaa 24822  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24823 atgggtatgtgttgaacatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 24873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 277
Target Start/End: Original strand, 252903 - 253134
Alignment:
Q  47 ttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 145  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |     
T  252903 ttcatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgctttg 253002  T
Q  146 attgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaat 245  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  253003 attatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaat 253102  T
Q  246 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  253103 atgctcaattggtgaatcatgctttgttgttg 253134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 246
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  496 taaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaattttcaattatttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 397  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||  |||| |  |||    
T  396 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgtatgaa 297  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  296 aagggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10039
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaa-ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  10289 taaggtaagggggttagaattcataataatcattattgcaaattttcaattctttgtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 10190  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaa--agtatgag 224  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  10189 tgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagagtatgaa 10090  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10089 aag--ggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttg 10039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11713
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||      
T  11464 taaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaaaagtgtttaattgt-tgaattgattaattgttcataaa 11562  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11563 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtatgaaaa 11662  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11663 atgggtatgtgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgctttgttgttg 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34014 - 33764
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatat 125  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34014 taaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaattttcaattact-gtatgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaa 33916  T
Q  126 gtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgaga 225  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33915 atgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaga 33816  T
Q  226 agttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  33815 aattggtatatgttgaaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttg 33764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21862 - 21614
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  21862 taaggtaagggggttataattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaaaggcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 21764  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21763 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatga-taattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaa 21665  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21664 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 21614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31561 - 31325
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  31561 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 31463  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31462 tgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatg-ataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagtatgagaa 31364  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattat 265  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31363 aatggtatatgttgaaaatatgctcaattggtaaattat 31325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 47445 - 47554
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  47445 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggcgaattgattaattgttcataaa 47543  T
Q  127 tgatgaaattc 137  Q
    |||||||||||    
T  47544 tgatgaaattc 47554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 5043
Alignment:
Q  89 aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattga 188  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  189 attgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcacagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaattggtgaattatgatttgttgttg 5043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Original strand, 2961 - 3115
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgt 127  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2961 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataaatgcttaattggatgaattgattaattgttcataagt 3060  T
Q  128 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3061 gatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaat 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 70964 - 70715
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||      
T  70964 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaattttcagttatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaa 70866  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  70865 tgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaat-tcatgttcaaagtatgagaa 70767  T
Q  227 gttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
      ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  70766 aatggaatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgttg 70715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31352 - 31168
Alignment:
Q  69 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 168  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31352 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgt 31254  T
Q  169 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaatt 255  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31253 atgaagttatggataattgaattgtggttagttgaat-tcatgttcaaagtataagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaatt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 97088 - 97308
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgata-agtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||  ||| | ||||||||||    
T  97088 taatgaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgatttagtgtttaattgagtgagt-gattaattgt 97185  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | | ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| || || ||    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  97186 tcatagttgttaagattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagt 97285  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  97286 atgtgaaagtgttatatgttgaa 97308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 471 - 721
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttg-taattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  471 taaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcata 568  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  569 aatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgag 668  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  669 aaaatggtatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttg 721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2263 - 2027
Alignment:
Q  32 gtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaatttt-caattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat 130  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  2263 gtaagggggttagaattcatcataatcattattgcaatttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgat 2165  T
Q  131 gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttg 230  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||    
T  2164 gaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaatg 2065  T
Q  231 gtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgc 267  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2064 gtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgc 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 142 - 8
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattg 43  T
Q  111 attaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctcta 145  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42 attaattgttcataaatgatgaaattcgtgctcta 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 46521 - 46267
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 122  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46521 taattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaaaagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 46423  T
Q  123 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatc-acatgttcaaagta- 220  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||     
T  46422 taaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtat 46323  T
Q  221 -tgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
     ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46322 gtgaaaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgctatgttgttg 46267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41010 - 40770
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatg 126  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  41010 taaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaatttttaattatt-gtatgaatagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaa 40912  T
Q  127 tgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatc-acatgttcaaagta--tga 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||    
T  40911 tgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagtatgtga 40812  T
Q  224 gaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40811 aaagtgggt-tatg-tgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 40770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 80240 - 80188
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80240 gagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 80188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6251 - 6062
Alignment:
Q  69 ttttcaattatttgtatgataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgt 168  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  6251 ttttcaattatt-gtatgaaaagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgtttgaatgt 6153  T
Q  169 atgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag-aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6152 atgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 6062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Original strand, 331 - 383
Alignment:
Q  7 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  331 gagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatca 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 572 - 604
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  572 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146713
Alignment:
Q  132 aaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttgg 231  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 146749  T
Q  232 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 267  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146748 tatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgc 146713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 53703 - 53483
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  53703 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 53606  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || |  ||||| |||||||||  |||||| ||||||  ||| ||||  ||    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||    
T  53605 tcatagttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagt 53506  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||| |||| || |||||||||||    
T  53505 atgtgaaggtgttatatgttgaa 53483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 85818 - 85690
Alignment:
Q  92 tgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaatt 191  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    |||||||||||    
T  85818 tgcttaattgaat-aagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaatt 85721  T
Q  192 gttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |||||| ||  |||  |||||||| ||||||    
T  85720 gttgttggtgaaattgcatgttcatagtatg 85690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8157 - 7927
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  8157 taaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 8060  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
    | || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||    
T  8059 tttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgag 7960  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7959 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3671 - 3441
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactt-ttgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3671 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaattttacaattatt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattgttcata 3574  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      || |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||   |||   ||||||||||||||||    
T  3573 attgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgag 3474  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctcaattggt 258  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3473 aaagtggtatatg-tgaaaatatgctcaattggt 3441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 76733 - 76957
Alignment:
Q  21 tgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||  | |||||| |||    
T  76733 tgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtacttaattgagt-aattgagtaa 76830  T
Q  116 ttgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttca 215  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||    
T  76831 ttgttcatagatgatgaaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 76930  T
Q  216 aagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||||||||||  || |||||||||||    
T  76931 aagtatgagaaagtgatatatgttgaa 76957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 33622 - 33873
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcactttt---gtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   |||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  33622 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaatttcaattgtt-gtatgaataaatgcttaattgagt-aattgattaattgttcat 33719  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg- 222  Q
    |  || |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||     
T  33720 aattgttagaattcatgctccaattatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatga 33819  T
Q  223 agaagttggtatatgttgaaaatatgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  33820 agaag-tgttatatgttg-aaatatgctaaattggttgaattatgctatgttgttg 33873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 6907 - 7135
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||| |||  |||||||||  | |  |||||||| ||||||||||||||  | ||| |||    
T  6907 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaattataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gat 7005  T
Q  113 taattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgt 212  Q
    |  |||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||   ||||    
T  7006 ttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgt 7105  T
Q  213 tcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7106 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 7135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 197143 - 197343
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 120  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  197143 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattggat-aagtgattaattgtt 197241  T
Q  121 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagta 220  Q
    | ||  || |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||  |||  || ||||||||||    
T  197242 cttagatgttgaatttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagta 197341  T
Q  221 tg 222  Q
    ||    
T  197342 tg 197343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8167
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8363 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 8266  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatg 222  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||    
T  8265 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatg-ataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatg 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 1440 - 1611
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1440 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1537  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1538 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 8585 - 8756
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt---aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8585 taaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 8682  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  8683 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgtt 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35843 - 35615
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||||  | ||  ||    
T  35843 ttggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcattttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgaataggtgcttaattgagtaaaa-ga 35746  T
Q  112 ttaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatg 211  Q
    ||||||||||| |  |  |  ||||||||||| |||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  ||||    
T  35745 ttaattgttcaaagttcttataattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatg 35646  T
Q  212 ttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  35645 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaa 35615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1378
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1242 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 1339  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  1340 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9633
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9497 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgcttaattggataaat-gattaattgttcat 9594  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
    |  || | ||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  9595 agatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgttt 9633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Original strand, 93728 - 93893
Alignment:
Q  87 ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatatgtgat-gaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataat 185  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||| |||||| |||| |  ||| |||||||| |  |||||    
T  93728 ataagtgcttaattgggtaaatt-attaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataat 93826  T
Q  186 tgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa 253  Q
    ||||| ||||||||   |||  |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  93827 tgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatttgttg-aaatatgctcaa 93893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 55715 - 55683
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55715 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 55683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 5754 - 5808
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5754 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 5808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 5960 - 6014
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5960 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6236
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6204 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2461
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  2211 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagt-aattgattaattaatcata 2308  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgag 224  Q
      |  |  ||||||||||| |||| |||||  ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||    
T  2309 attattagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 2408  T
Q  225 aagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||  ||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  2409 aaagtgacatatgttg-aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttg 2461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 89760 - 89894
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  89760 taaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aattgattaattgttcata 89857  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
      || | |||||||||||| || | |||||| ||||||    
T  89858 gatg-ttaaattcgtgctccaactatgatgatatgttt 89894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 69814 - 69594
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  69814 taattaagataagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattatt-gtatgattaagtgcttaattg-agaaagtgattaattgt 69717  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||    ||||||||||||||||  ||  |||  |||||| |||||    
T  69716 tcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagt 69617  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  69616 atgtgaaagtgttatatgttgaa 69594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2662
Alignment:
Q  109 tgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcac 208  Q
    ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |    
T  2795 tgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgc 2696  T
Q  209 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    |||||||||||||  |||  || |||||||||||    
T  2695 atgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaa 2662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6798
Alignment:
Q  133 aattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggt 232  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||  || |    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgat 6808  T
Q  233 atatgttgaa 242  Q
    ||||||||||    
T  6807 atatgttgaa 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 70201 - 70298
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttgt--aattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  70201 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtgaaattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaaatgtat-aattgattaattgttcata 70298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10879
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  11014 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataattttcaatta-ttgtatgaataagtgattaattggat-aaataattaattgttcata 10917  T
Q  125 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
      || |  |||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  10916 gatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgttt 10879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 31157 - 31211
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  31157 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 31211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31433
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31401 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 31433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 41687 - 41633
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  41687 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatca 41633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41443 - 41411
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41443 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 41411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31377 - 31157
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  31377 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaatta-ttgtatgattaagtgcttaatt-gagtaagtgattaattgt 31280  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || |  |||||||||||||||| |||||| || |||  ||| ||||| ||    ||||||| ||||||||| ||  |||  |||||||| |||    
T  31279 tcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 31180  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||| |||  || |||||||||||    
T  31179 atgtgaaagtgttatatgttgaa 31157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28649
Alignment:
Q  134 attcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagtatgagaagttggta 233  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||| || |  |||| |||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||  || ||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagtgata 28682  T
Q  234 tatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatg 266  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  28681 tatgttg-aattatgctcaaattgttgaattatg 28649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 22323 - 22443
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttttg---taattttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22323 taaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaatta-ttgtatgaataagtgattaattggatg-attgattgattgttcat 22420  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaa 146  Q
    |  || | |||||||||||||||    
T  22421 agatgttaaaattcgtgctctaa 22443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 30466 - 30418
Alignment:
Q  11 taatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30466 taataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatca 30418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32344 - 32305
Alignment:
Q  238 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32344 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttg 32305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 277
Target Start/End: Original strand, 41959 - 41998
Alignment:
Q  238 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41959 ttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttg 41998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 277
Target Start/End: Original strand, 618 - 663
Alignment:
Q  232 tatatgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  618 tatatgttgaaaatatgctcatttggtgaattatgctatgttgttg 663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23737
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcactt-ttgtaattttcaattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgtt 120  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  23562 taattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaat-aattgattatttgtt 23660  T
Q  121 catatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtt 197  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||  ||  ||||| || |  |||||||||||||||||    
T  23661 catagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgtt 23737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 43688 - 43908
Alignment:
Q  24 taattaaggtaagggggttagtgttca-tcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatgat-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||    
T  43688 taattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattgtt-gtatgattaagtgcttaattgagt-aagtgattaattgt 43785  T
Q  120 tcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaatcacatgttcaaagt 219  Q
    |||||  || | |||||  |||||||||| |||||  ||||||  ||| ||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||     
T  43786 tcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagg 43885  T
Q  220 atgagaagttggtatatgttgaa 242  Q
    ||  |||  || |||||||||||    
T  43886 atatgaaagtgatatatgttgaa 43908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 855 - 992
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttc-atcataatcactt--ttgtaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||  || || |||||| ||||||||    
T  855 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattaaat-aagtgattatttgttcat 953  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
    |  || | ||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  954 agttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgttt 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 79891 - 79756
Alignment:
Q  28 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt--tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 123  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  79891 taaggtaagggg-ttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcaattatt-gtatgaataagtgattaattggataaat-gattaattgttcat 79795  T
Q  124 atgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgttt 162  Q
    |  || | |||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  79794 agatgctaaaattcgtgcactaactatgatgatatgttt 79756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1435
Alignment:
Q  17 ttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1393 ttggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatca 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 6664 - 6696
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6664 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 6696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 1099 - 1131
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1099 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 13507 - 13539
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13507 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 13539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 21481 - 21513
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21481 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 21513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 17525 - 17557
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17525 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 17557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 15051
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15083 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 15051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 42729 - 42678
Alignment:
Q  5 tagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 59  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42729 tagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatca 42678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 186647 - 186679
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  186647 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 186679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 193609 - 193641
Alignment:
Q  245 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttg 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  193609 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttg 193641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University