View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16349_high_4 (Length: 270)

Name: NF16349_high_4
Description: NF16349
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16349_high_4
NF16349_high_4
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (9-250)||(29541764-29542005)
chr6 (7-258)||(18161374-18161625)
chr6 (7-258)||(16899255-16899506)
chr6 (7-258)||(31358870-31359121)
chr6 (7-256)||(34766667-34766916)
chr6 (7-256)||(18704824-18705073)
chr6 (7-256)||(18710759-18711008)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (7-258)||(53311-53562)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (7-258)||(9544021-9544272)
chr7 (7-258)||(16140965-16141216)
chr7 (7-258)||(5389952-5390203)
chr7 (7-258)||(26304865-26305116)
chr7 (7-258)||(26361702-26361953)
chr7 (7-258)||(32099689-32099940)
chr7 (7-258)||(46498423-46498674)
chr7 (7-258)||(8502358-8502609)
chr7 (7-258)||(44898608-44898859)
chr7 (7-258)||(6535793-6536044)
chr7 (6-212)||(13284209-13284416)
chr7 (96-256)||(42596698-42596858)
chr7 (51-165)||(7582477-7582591)
chr7 (95-165)||(15175386-15175456)
chr7 (7-60)||(42596865-42596918)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (7-258)||(18362586-18362837)
chr5 (7-258)||(26201106-26201357)
chr5 (7-258)||(33940629-33940880)
chr5 (9-258)||(27413457-27413706)
chr5 (7-256)||(20949166-20949415)
chr5 (7-249)||(23375678-23375920)
chr5 (12-165)||(24413672-24413825)
chr5 (12-165)||(30453382-30453535)
chr5 (12-165)||(30458460-30458613)
chr5 (12-166)||(5601579-5601733)
chr5 (51-166)||(24289908-24290023)
chr5 (51-166)||(24299415-24299530)
chr5 (183-256)||(19781874-19781947)
chr5 (33-166)||(21083100-21083233)
chr5 (94-166)||(22456711-22456783)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (9-256)||(17150684-17150931)
chr4 (7-258)||(6693527-6693778)
chr4 (7-257)||(16254548-16254793)
chr4 (7-256)||(520694-520943)
chr4 (7-256)||(7845239-7845488)
chr4 (12-165)||(54698557-54698710)
chr4 (48-165)||(26813334-26813451)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (7-258)||(8974155-8974406)
chr3 (7-258)||(6423616-6423867)
chr3 (7-258)||(9538444-9538695)
chr3 (7-258)||(12387297-12387547)
chr3 (12-166)||(48979673-48979827)
chr3 (48-165)||(28366893-28367010)
chr3 (107-165)||(28374773-28374831)
chr3 (107-165)||(28382595-28382653)
chr3 (95-166)||(4384458-4384529)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (7-258)||(16156192-16156443)
chr1 (7-256)||(1987970-1988219)
chr1 (7-198)||(22959697-22959888)
chr1 (51-166)||(14280877-14280992)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (7-259)||(14892533-14892785)
chr8 (7-258)||(21211751-21212002)
chr8 (7-185)||(22832121-22832299)
chr8 (12-166)||(25036134-25036288)
chr8 (12-166)||(25050171-25050325)
chr8 (51-166)||(18233759-18233874)
chr8 (51-166)||(18243210-18243325)
chr8 (51-166)||(12916388-12916503)
chr8 (51-166)||(33600725-33600840)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (7-258)||(18652527-18652778)
chr2 (7-258)||(9512545-9512796)
chr2 (7-250)||(45015670-45015913)
chr2 (7-256)||(27168767-27169016)
chr2 (9-212)||(22903494-22903697)
chr2 (12-166)||(1791955-1792109)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (7-258)||(148017-148268)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (7-256)||(7080-7329)
scaffold0313 (7-256)||(10862-11111)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (7-256)||(6349-6598)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (7-258)||(20084-20335)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (7-249)||(16545-16787)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (7-198)||(189307-189498)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (9-91)||(1-83)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (12-165)||(103071-103224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (51-166)||(257898-258013)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29542005 - 29541764
Alignment:
Q  9 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29542005 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagattgaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactc 29541906  T
Q  109 tttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactcttatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29541905 tttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactcttttc 29541806  T
Q  209 tttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatc 250  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29541805 tttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatc 29541764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18161625 - 18161374
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18161625 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 18161526  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  18161525 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 18161426  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18161425 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 18161374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16899506 - 16899255
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16899506 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatctcatacttctttagcatttgtacattcatcaac 16899407  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16899406 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 16899307  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  16899306 gctttgacagctccttctttggttgttggaacatagtctccatctgtgatga 16899255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31359121 - 31358870
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31359121 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 31359022  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  31359021 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 31358922  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||    
T  31358921 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtcttcatttgtgatga 31358870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34766916 - 34766667
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  34766916 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 34766817  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766816 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 34766717  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34766716 actttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 34766667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 18704824 - 18705073
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || || ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||    
T  18704824 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactctcagagtgtctcatacctctttggcatttttacactcatcaac 18704923  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18704924 tcttgcactttcttccatggtcagtgcacatgataaaaagagtctagctttagagtttagtaatacatgagctttttcatctgttgaccatgcactcttt 18705023  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
    || ||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  18705024 tcctttacagctccttatttggttgttgcaacaaagtctccatctgtgat 18705073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 18710759 - 18711008
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || || ||||| ||||| |||||  |||| ||||||||    
T  18710759 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactctcagagtgtctcatacctctttggcatttttacactcatcaac 18710858  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18710859 tcttgcactttcttccatggtcagtgcacatgataaaaagagtctagctttagagtttagtaatacatgagctttttcatctgttgaccatgcactcttt 18710958  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
    || ||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  18710959 tcctttacagctccttatttggttgttgcaacaaagtctccatctgtgat 18711008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 53311 - 53562
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  53311 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtatttttaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaac 53410  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  53411 tctttcactttcttccatggttaatgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatctattgaccatgcactcttt 53510  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  53511 tctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 53562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 9544021 - 9544272
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9544021 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagggtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 9544120  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  9544121 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 9544220  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9544221 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 9544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 16140965 - 16141216
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16140965 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 16141064  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16141065 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 16141164  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16141165 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 16141216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 5389952 - 5390203
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5389952 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 5390051  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  5390052 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 5390151  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  5390152 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 5390203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26305116 - 26304865
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26305116 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 26305017  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26305016 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 26304917  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  26304916 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 26304865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 26361702 - 26361953
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26361702 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 26361801  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26361802 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 26361901  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  26361902 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 26361953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32099940 - 32099689
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32099940 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 32099841  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  32099840 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaataatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 32099741  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  32099740 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaaatctccatttgtgatga 32099689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 46498674 - 46498423
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46498674 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgaaatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 46498575  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  46498574 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 46498475  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46498474 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 46498423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8502609 - 8502358
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8502609 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacattcatcaac 8502510  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  8502509 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 8502410  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  8502409 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 8502358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44898859 - 44898608
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44898859 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacattcatcaac 44898760  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  44898759 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 44898660  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  44898659 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 44898608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6536044 - 6535793
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6536044 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacattcatcaac 6535945  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  6535944 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgctgaccatgcacttttt 6535845  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  6535844 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 6535793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 13284209 - 13284416
Alignment:
Q  6 ttgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  13284209 ttgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaagtatcccatacctctttagcattcttgcattcatcaa 13284308  T
Q  106 ctctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgac-catgcactct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13284309 ctctttcactttcttccatggttagtgcacataatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacttgagatttttcatctgttgacacatgcactct 13284408  T
Q  205 tatctttg 212  Q
    | ||||||    
T  13284409 tttctttg 13284416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42596858 - 42596698
Alignment:
Q  96 cattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgacc 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42596858 cattcatcacctctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagctttttcatctgttgacc 42596759  T
Q  196 atgcactcttatctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
    |||||||||| ||||||   | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  42596758 atgcactcttttctttgatggttccttttttggtctttggaacaaagtctccatctgtgat 42596698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7582591 - 7582477
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7582591 tcatgatgaatttttagagtgtcccaaacttcttttgcagtcacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtc 7582492  T
Q  151 tagctttagagttta 165  Q
     ||||||||| ||||    
T  7582491 gagctttagaattta 7582477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15175456 - 15175386
Alignment:
Q  95 acattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15175456 acattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaaaagtcaagctttagagttta 15175386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42596918 - 42596865
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgta 60  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42596918 tgactctaatgtcaattatagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgta 42596865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18362837 - 18362586
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18362837 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 18362738  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  18362737 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 18362638  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18362637 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 18362586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 26201106 - 26201357
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26201106 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 26201205  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26201206 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 26201305  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  26201306 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 26201357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33940880 - 33940629
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33940880 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacattcatcaac 33940781  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  33940780 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 33940681  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  33940680 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 33940629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27413706 - 27413457
Alignment:
Q  9 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27413706 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaactc 27413607  T
Q  109 tttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactcttatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27413606 tttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttaaaatttagtaatacctgacctttttcatctgttgaccatgcactttttgc 27413507  T
Q  209 tttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27413506 tttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 27413457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20949415 - 20949166
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  20949415 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 20949316  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949315 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 20949216  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20949215 actttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 20949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 23375678 - 23375920
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| | | ||  | |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  23375678 tgactcctatgttaattctggtttccttgacatgagaggtaccttcatggcgtactcttaaaatttcccatacctctttagcattcttgcatttatcaac 23375777  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||     
T  23375778 tctttcattttcttccatggttagtgcacatgataaaaagagtctaggtttagagtttaacaatacatgagctttgtcatctattgaccatgcactcttt 23375877  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccat 249  Q
    | ||||   | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  23375878 tgtttgatggttccttctttagtctttggaacaaagtctccat 23375920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24413825 - 24413672
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  24413825 ccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaatttttagagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactcttt 24413726  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24413725 cactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 24413672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 30453382 - 30453535
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  30453382 ccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaatttttagagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactcttt 30453481  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30453482 cactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 30453535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 30458460 - 30458613
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  30458460 ccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaatttttagagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactcttt 30458559  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30458560 cactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 30458613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5601733 - 5601579
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||   ||| || |||||||| | ||| |  |||||||| || | ||| ||| |   |||||||||||||||||    
T  5601733 ccaatgtcaattcttgtttctttaacatggcttgttccttcatgatggactttgagagtatcccacaccttttttgcagtatcacattcatcaactcttt 5601634  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5601633 cactttcttccatgcttagtgcacatgatagaaagagtcgagctttagaatttaa 5601579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Original strand, 24289908 - 24290023
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||     
T  24289908 tcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtacattcataaattctttcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagtt 24290007  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
     |||||||||||||||    
T  24290008 gagctttagagtttaa 24290023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Original strand, 24299415 - 24299530
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||     
T  24299415 tcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtacattcataaattctttcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagtt 24299514  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
     |||||||||||||||    
T  24299515 gagctttagagtttaa 24299530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19781947 - 19781874
Alignment:
Q  183 tcatctgttgaccatgcactcttatctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19781947 tcatctgtggaccatgcactattttcctttacaactccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 19781874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 166
Target Start/End: Original strand, 21083100 - 21083233
Alignment:
Q  33 ttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtg 132  Q
    |||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||| | |||||||| || ||||| |||  ||||||| || |||  |    
T  21083100 ttgacatgacttgttccttcatgatgaatttttaaggcttcccatatctctttagcagttgtacattcttctactctatcatattcttccctgcttaaag 21083199  T
Q  133 cacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||||    
T  21083200 cacatgttagaaaaagttgagctttagagtttaa 21083233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Original strand, 22456711 - 22456783
Alignment:
Q  94 tacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||  |||||| || |||||    
T  22456711 tacattcataaattctttcactttcttccatggttaatgaacattgtaaaaagagttgagctttggaatttaa 22456783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17150931 - 17150684
Alignment:
Q  9 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17150931 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcattcttacattcatcaactc 17150832  T
Q  109 tttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactcttatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17150831 tttcactttcttccatggttagtgcaaatgatagaaagagtctagctttaaagtttaacaatacctgagcattttcatctgttgaccatgcactcttttc 17150732  T
Q  209 tttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
    |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17150731 tttgacagttccttcgttggttgttggaacaaagtctccatctgtgat 17150684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6693778 - 6693527
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6693778 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacattcatcaac 6693679  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  6693678 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 6693579  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  6693578 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 6693527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16254793 - 16254548
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||    
T  16254793 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatccc-----tctttagcattcttacattcatcaac 16254699  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  16254698 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacttgagctttttcatctgttgaccatgtactcttt 16254599  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatg 257  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16254598 tctgtgacaactccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatg 16254548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 520694 - 520943
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  520694 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 520793  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520794 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 520893  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  520894 actttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 520943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 7845239 - 7845488
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||    
T  7845239 tgactccaatatcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatatattttcagagtgtcccatacctctttggcatttttacactcatcaac 7845338  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  7845339 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaaaagtctagctttagagtttagtaatacatgagccttttcatctgttgaccatgccttcttt 7845438  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
    || ||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  7845439 tcctttatagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatctgtgat 7845488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 54698557 - 54698710
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  54698557 ccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaatttttagagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactcttt 54698656  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54698657 cactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 54698710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26813451 - 26813334
Alignment:
Q  48 ccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaaga 147  Q
    ||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26813451 ccctcatgatgaatttttagagtgtcccaaacttcttttgcagtaacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaaga 26813352  T
Q  148 gtctagctttagagttta 165  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  26813351 gtcgagctttggagttta 26813334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8974406 - 8974155
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8974406 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 8974307  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  8974306 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 8974207  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8974206 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 8974155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6423867 - 6423616
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6423867 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 6423768  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  6423767 tctttcactttcttccatggttagtgcacacgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcatttttt 6423668  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6423667 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 6423616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9538695 - 9538444
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9538695 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttgtttagcatttgtacattcatcaac 9538596  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  9538595 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 9538496  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  9538495 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 9538444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12387547 - 12387297
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||    
T  12387547 tgacttcaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaacttcatgatgtactatcaaggtatcccatacctcttt-gcattcttaaattcataaac 12387449  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  12387448 tctttcagtttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttattaatacttgagctttttcatttgttgaccatgcacttttt 12387349  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12387348 tctttgacagttccttctttggtttttggaacaaagtctccatctgtgatga 12387297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 48979827 - 48979673
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||   ||| || |||||||| | ||| |  |||||||| || | ||| ||| |   |||||||||||||||||    
T  48979827 ccaatgtcaattcttgtttctttaacatggcttgttccttcatgatggactttgagagtatcccacaccttttttgcagtatcacattcatcaactcttt 48979728  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48979727 cactttcttccatgcttagtgcacatgatagaaagagtcgagctttagaatttaa 48979673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 165
Target Start/End: Original strand, 28366893 - 28367010
Alignment:
Q  48 ccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaaga 147  Q
    ||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28366893 ccctcatgatgaatttttagagtgtcccaaacttcttttgcagtgacacattcatcaactctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaaga 28366992  T
Q  148 gtctagctttagagttta 165  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  28366993 gtcgagctttggagttta 28367010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 165
Target Start/End: Original strand, 28374773 - 28374831
Alignment:
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28374773 tctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttggagttta 28374831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 165
Target Start/End: Original strand, 28382595 - 28382653
Alignment:
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28382595 tctttcactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttggagttta 28382653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 166
Target Start/End: Original strand, 4384458 - 4384529
Alignment:
Q  95 acattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  4384458 acattcatcaactctttcactttcttccatgcttaatctgcatgatagatagactcgagctttagaatttaa 4384529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16156443 - 16156192
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16156443 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatacttctttagcatttgtacattcatcaac 16156344  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16156343 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 16156244  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16156243 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 16156192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 1987970 - 1988219
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  1987970 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 1988069  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988070 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 1988169  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1988170 actttgatgattccttctttggttaatggaacaaagtctccatctgtgat 1988219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22959888 - 22959697
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || || |||||||||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22959888 tgactccaatgtcaattcttgtttcttcgacatgagtggttccttcatgatgtacttttaaagtgtcccacacttctttggcatttgtacattcatcaac 22959789  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatg 198  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||    
T  22959788 cctttcactttcttccaaggttaatgcacatgataaaaataagctaactttagaatttaacaataccttatctttttcatcagttgtccatg 22959697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Original strand, 14280877 - 14280992
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | |||||| ||  | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||     
T  14280877 tcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtgcattcataaattctttcactttcttccatggttattgaacattgtaaaaagagtt 14280976  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
      ||||||||||||||    
T  14280977 gggctttagagtttaa 14280992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 14892533 - 14892785
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  14892533 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtatttttaaggtatcccatacctctttatcattcttacattcatcaac 14892632  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  14892633 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagaatttaacaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 14892732  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatgat 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14892733 tctttgacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatatgtgatgat 14892785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 21211751 - 21212002
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21211751 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagaagtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacattcatcaac 21211850  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21211851 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 21211950  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  21211951 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 21212002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22832299 - 22832121
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||    
T  22832299 tgactccattatcaattctagtttctttgatatgagatgtaccttcatgatgtactctcaaagtgtcccatacctctttggcatttttacactcatcaac 22832200  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttca 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22832199 tctttcactttctttcatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttca 22832121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 25036134 - 25036288
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    || || |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||  | || ||||||| || |||||    
T  25036134 ccaatgtctatccttgtttctttgacatggctagttccttcatgatgtatttttaatgtatcccaaatttcttttgccgtggtgcattcataaattcttt 25036233  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||||||||||    
T  25036234 cactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 25036288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 25050171 - 25050325
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    || || |||||||||||||| || |||||||| | |||||| ||  | || ||||||| || |||||    
T  25050171 ccaatgtctatccttgtttctttgacatggctagttccttcatgatgtatttttaatgtatcccaaatttcttttgccgtggtgcattcataaattcttt 25050270  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||||||||||    
T  25050271 cactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagttgagctttagagtttaa 25050325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18233874 - 18233759
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||     
T  18233874 tcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtacattcataaattctttcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagtt 18233775  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
     |||||||||||||||    
T  18233774 gagctttagagtttaa 18233759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18243325 - 18243210
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||     
T  18243325 tcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtacattcataaattctttcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagtt 18243226  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
     |||||||||||||||    
T  18243225 gagctttagagtttaa 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12916503 - 12916388
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| | |||||| ||  | || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||     
T  12916503 tcatgatgaatttttaacgtatcccaaatttcttttgccgtagtgcattcataaattctttcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagtt 12916404  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
     |||||||||||||||    
T  12916403 gagctttagagtttaa 12916388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Original strand, 33600725 - 33600840
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| | |||||| ||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||     
T  33600725 tcatgatgaatttttaatgtgtcccaaatttcttttgcagtactacattcataaatcctttcactttcttccatggttaatgaacattgtagaaagagtt 33600824  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
     |||||| || |||||    
T  33600825 gagctttggaatttaa 33600840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18652778 - 18652527
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18652778 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacattcatcaac 18652679  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  18652678 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 18652579  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  18652578 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 18652527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 9512545 - 9512796
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  9512545 tgactccaatgtcaattctagtttctctgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcagagtatcccatactcctttagcatttgtacactcatcaac 9512644  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  9512645 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 9512744  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  9512745 gctttgacagctccttctttgtttgttggaacaaagtctccatttgtgatga 9512796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45015913 - 45015670
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45015913 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacctctttagcatttgtacattcatcaac 45015814  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  45015813 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgataaaaagactctagctttagagtatagtaatacctgagctttttcatctgttgaccatgcacttttt 45015714  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatc 250  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  45015713 gctttgacagctccttctttggttgttggaacaaaatcttcatc 45015670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 27168767 - 27169016
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  27168767 tgactccaatgtcaattctggtctctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 27168866  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168867 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 27168966  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27168967 actttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 27169016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22903697 - 22903494
Alignment:
Q  9 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  22903697 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccatcatgatgtaatatcaaaatatcccatacatctttagcattaatacattcatcaactc 22903598  T
Q  109 tttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactcttatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22903597 tttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagttttttcatctgttgaccatgcactcttttc 22903498  T
Q  209 tttg 212  Q
    ||||    
T  22903497 tttg 22903494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1792109 - 1791955
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||   ||| || |||||||| | ||| |  |||||||| || | ||| ||| |   |||||||||||||||||    
T  1792109 ccaatgtcaattcttgtttctttaacatggcttgttccttcatgatggactttgagagtatcccacaccttttttgcagtatcacattcatcaactcttt 1792010  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaa 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1792009 cactttcttccatgcttagtgcacatgatagaaagagtcgagctttagaatttaa 1791955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 148268 - 148017
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  148268 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagaagtaccctcatgatgtatttttaaggtatcacatacctctttagcattcttacattcatcaac 148169  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  148168 tctttcactttcttccatggtaagtgcacatgatagaaagagtctagcttaagagtttagtaatacctgagctttttcatttgttgaccatgcactcttt 148069  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
    || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  148068 tcctttacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 148017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7329 - 7080
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  7329 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 7230  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7229 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 7130  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7129 actttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 7080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11111 - 10862
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  11111 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 11012  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11011 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 10912  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10911 actttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 10862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 6349 - 6598
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  6349 tgactccaatgtcaattctggtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaggtatcccatacctctttagcatttttgcattcatcaac 6448  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6449 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttagcaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 6548  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgat 256  Q
     |||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6549 actttgatgatcccttctttggttagtggaacaaagtctccatctgtgat 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20335 - 20084
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||  || |||||||| ||||| |||||  ||||  |||||||    
T  20335 tgactccaatgtcaattctagttcctttgacatgagatgtacctttatgatgtactctcagagtgtcccatacatctttggcatttttacacacatcaac 20236  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  20235 tctttcactttcttccctagtcagtgcacatgatagaaagagtctagctttggagtttagtaatacctgagatttttcatctgttgaccatgcacttttt 20136  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccatcagtgatga 258  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20135 tcttttacagctccttctttggttgttggaacaaagtctccatctgtgatga 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16787 - 16545
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| | | ||  | |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  16787 tgactcctatgttaattctggtttccttgacatgagaggtaccttcatggcgtactcttaaaatttcccatacctctttagcattcttgcatttatcaac 16688  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatgcactctta 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||     
T  16687 tctttcattttcttccatggttagtgcacatgataaaaagagtctaggtttagagtttaacaatacatgagctttgtcatctattgaccatgcactcttt 16588  T
Q  207 tctttggcagctccttctttggttattggaacaaagtctccat 249  Q
    | ||||   | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16587 tgtttgatggttccttctttagtctttggaacaaagtctccat 16545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Original strand, 189307 - 189498
Alignment:
Q  7 tgactccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaac 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  189307 tgactccaatgtcaattcttgtttcttcgacatgagaggttccttcatgatgtacttttaaagtgtcccacacttctttggcatttgtacattcatcaac 189406  T
Q  107 tctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagtttaacaatacctgagccttttcatctgttgaccatg 198  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||    
T  189407 cctttcaatttcttccaaggttagtgcacatgataaaaataagctaactttagaatttaacaataccttatctttttcatcagttgtccatg 189498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 83 - 1
Alignment:
Q  9 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcatt 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  83 actccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccttcatgatgtactttcaaagtatcccatacctctttagcatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 103071 - 103224
Alignment:
Q  12 ccaatgtcaattctagtttctttgacatgagatgtaccctcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactcttt 111  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||    || || |||||||| ||||| |  || ||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  103071 ccaatgtctattcttgtttcttttacatggctagttccttcatgatgaatttttagagtgtcccacacttcttttgcagtcacacattcatcaactcttt 103170  T
Q  112 cactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtctagctttagagttta 165  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  103171 cactttcttccatgcttagtgcgcatgatagaaagagtcgagctttagagttta 103224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 258013 - 257898
Alignment:
Q  51 tcatgatgtattttcaaggtatcccatacttctttagcattcgtacattcatcaactctttcactttcttccatggttagtgcacatgatagaaagagtc 150  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||     
T  258013 tcatgatgaatttttaacgtatcccatatttcttttgccgtagtacattcataaattctttcactttcttccatggttagtgaacattgtaaaaagagtt 257914  T
Q  151 tagctttagagtttaa 166  Q
     |||||||||||||||    
T  257913 gagctttagagtttaa 257898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University