View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16356_high_1 (Length: 374)

Name: NF16356_high_1
Description: NF16356
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16356_high_1
NF16356_high_1
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (30-351)||(2041-2362)
scaffold0234 (30-351)||(10932-11253)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (30-351)||(17684189-17684510)
chr6 (30-351)||(27380972-27381293)
chr6 (30-351)||(27471355-27471676)
chr6 (30-351)||(11651889-11652210)
chr6 (30-351)||(17691160-17691481)
chr6 (30-351)||(29309056-29309377)
chr6 (30-351)||(29316016-29316336)
chr6 (30-351)||(188697-189018)
chr6 (30-269)||(27296877-27297116)
chr6 (30-303)||(16394165-16394438)
chr6 (34-271)||(25536915-25537152)
chr6 (31-252)||(16559193-16559414)
chr6 (47-355)||(13359010-13359314)
chr6 (247-351)||(16566257-16566361)
chr6 (40-334)||(2669476-2669768)
chr6 (30-337)||(16789071-16789373)
chr6 (30-337)||(22859888-22860190)
chr6 (30-337)||(27508347-27508649)
chr6 (30-337)||(1586108-1586410)
chr6 (44-337)||(27527947-27528235)
chr6 (30-337)||(14074480-14074782)
chr6 (74-337)||(18019885-18020143)
chr6 (52-345)||(10359073-10359359)
chr6 (30-337)||(8612915-8613221)
chr6 (208-336)||(27925935-27926062)
chr6 (133-336)||(17850321-17850521)
chr6 (115-267)||(20736413-20736562)
chr6 (214-319)||(28172754-28172859)
chr6 (213-345)||(20553492-20553622)
chr6 (99-284)||(8510155-8510338)
chr6 (30-143)||(33317055-33317167)
chr6 (30-269)||(17120505-17120740)
chr6 (299-351)||(25537148-25537200)
chr6 (242-337)||(13995151-13995245)
chr6 (127-269)||(21994655-21994794)
chr6 (127-339)||(19218427-19218630)
chr6 (202-323)||(19347092-19347212)
chr6 (158-338)||(22560311-22560487)
chr6 (108-171)||(28172899-28172963)
chr6 (47-186)||(28756145-28756283)
chr6 (115-262)||(5758565-5758709)
chr6 (127-339)||(4073574-4073781)
chr6 (301-337)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (30-351)||(18262378-18262699)
chr4 (30-351)||(18269239-18269560)
chr4 (30-351)||(55612849-55613170)
chr4 (30-351)||(26963806-26964127)
chr4 (30-351)||(26970629-26970950)
chr4 (30-351)||(868763-869084)
chr4 (30-351)||(19926480-19926801)
chr4 (30-351)||(5707486-5707807)
chr4 (30-351)||(5714114-5714435)
chr4 (30-351)||(8858333-8858654)
chr4 (30-351)||(10621053-10621374)
chr4 (30-345)||(10628132-10628447)
chr4 (30-351)||(28392854-28393175)
chr4 (30-351)||(8845369-8845690)
chr4 (30-351)||(4426336-4426645)
chr4 (30-345)||(35223732-35224047)
chr4 (30-341)||(5667849-5668156)
chr4 (26-351)||(20311458-20311781)
chr4 (30-262)||(10677303-10677534)
chr4 (30-262)||(10890943-10891174)
chr4 (30-337)||(15461497-15461799)
chr4 (30-337)||(34975551-34975853)
chr4 (30-337)||(2677013-2677315)
chr4 (30-337)||(15815021-15815323)
chr4 (30-337)||(18111043-18111345)
chr4 (30-337)||(3369023-3369325)
chr4 (30-337)||(17299959-17300261)
chr4 (30-337)||(18163162-18163464)
chr4 (30-337)||(20243937-20244239)
chr4 (30-337)||(26531613-26531915)
chr4 (30-337)||(4675983-4676285)
chr4 (205-341)||(56516232-56516368)
chr4 (30-336)||(5870419-5870720)
chr4 (131-281)||(21453961-21454110)
chr4 (46-337)||(19365519-19365806)
chr4 (30-337)||(1941724-1942026)
chr4 (30-316)||(32646523-32646807)
chr4 (47-269)||(19362477-19362695)
chr4 (30-262)||(9487625-9487853)
chr4 (132-337)||(32636484-32636685)
chr4 (46-269)||(5528495-5528714)
chr4 (46-345)||(5616387-5616681)
chr4 (255-333)||(24700213-24700291)
chr4 (30-250)||(30040489-30040705)
chr4 (46-262)||(9538033-9538244)
chr4 (115-337)||(4546080-4546298)
chr4 (30-247)||(11421096-11421309)
chr4 (108-158)||(24701361-24701411)
chr4 (127-281)||(33888594-33888743)
chr4 (293-345)||(10677538-10677590)
chr4 (293-345)||(10891178-10891230)
chr4 (163-290)||(34777850-34777975)
chr4 (279-349)||(9937933-9938003)
chr4 (58-139)||(9937745-9937826)
chr4 (169-260)||(9937830-9937923)
chr4 (301-337)||(11421016-11421052)
chr4 (301-345)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (30-351)||(6110230-6110551)
chr3 (30-351)||(16482203-16482524)
chr3 (30-351)||(10579075-10579396)
chr3 (30-351)||(15600604-15600925)
chr3 (30-351)||(15607149-15607470)
chr3 (30-351)||(10572312-10572633)
chr3 (30-351)||(15341939-15342260)
chr3 (30-351)||(18520141-18520462)
chr3 (30-336)||(8490676-8490982)
chr3 (34-344)||(18522836-18523146)
chr3 (30-351)||(15357306-15357627)
chr3 (30-351)||(17780838-17781159)
chr3 (30-351)||(13211468-13211789)
chr3 (30-345)||(13248779-13249094)
chr3 (30-351)||(32056619-32056941)
chr3 (26-351)||(17199900-17200225)
chr3 (30-351)||(13516977-13517294)
chr3 (30-345)||(1647241-1647556)
chr3 (30-351)||(17136525-17136840)
chr3 (30-351)||(29925137-29925458)
chr3 (30-351)||(29974290-29974611)
chr3 (30-320)||(16200627-16200917)
chr3 (30-337)||(21034238-21034540)
chr3 (30-337)||(15846536-15846838)
chr3 (30-337)||(20147554-20147856)
chr3 (30-337)||(21398792-21399094)
chr3 (48-345)||(24253130-24253423)
chr3 (30-337)||(14890391-14890693)
chr3 (30-337)||(55427021-55427323)
chr3 (30-337)||(12299911-12300212)
chr3 (30-269)||(25978728-25978963)
chr3 (128-345)||(14147013-14147226)
chr3 (64-262)||(15526827-15527021)
chr3 (30-188)||(28088251-28088408)
chr3 (30-269)||(11787654-11787889)
chr3 (30-334)||(15317176-15317472)
chr3 (169-298)||(28953965-28954093)
chr3 (299-351)||(19089734-19089786)
chr3 (104-296)||(32280313-32280507)
chr3 (252-345)||(9504455-9504548)
chr3 (226-341)||(8251933-8252048)
chr3 (68-183)||(30464147-30464261)
chr3 (278-351)||(16200291-16200363)
chr3 (127-191)||(36138033-36138097)
chr3 (206-258)||(4189223-4189275)
chr3 (127-191)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (30-351)||(18252196-18252517)
chr1 (30-351)||(18532234-18532555)
chr1 (30-351)||(27131130-27131450)
chr1 (30-351)||(27310297-27310618)
chr1 (30-351)||(16358755-16359076)
chr1 (30-345)||(3855639-3855954)
chr1 (30-345)||(36816354-36816668)
chr1 (30-311)||(22641594-22641871)
chr1 (30-345)||(27277278-27277592)
chr1 (158-351)||(21171081-21171274)
chr1 (30-337)||(19706439-19706741)
chr1 (30-337)||(43802365-43802667)
chr1 (30-337)||(28134723-28135025)
chr1 (197-351)||(22657108-22657262)
chr1 (30-321)||(23507096-23507385)
chr1 (30-337)||(9456116-9456418)
chr1 (30-223)||(9916497-9916689)
chr1 (108-345)||(12014084-12014319)
chr1 (30-337)||(20391239-20391541)
chr1 (30-337)||(20779645-20779947)
chr1 (30-337)||(22670257-22670559)
chr1 (30-337)||(42816989-42817291)
chr1 (30-337)||(22612492-22612794)
chr1 (50-346)||(633925-634216)
chr1 (228-344)||(9917837-9917952)
chr1 (30-337)||(8727667-8727969)
chr1 (30-337)||(47667485-47667776)
chr1 (46-269)||(29096789-29097008)
chr1 (205-337)||(35930582-35930713)
chr1 (232-321)||(12006461-12006550)
chr1 (30-143)||(28145723-28145835)
chr1 (130-262)||(21881475-21881604)
chr1 (117-282)||(24301691-24301855)
chr1 (203-329)||(26923553-26923678)
chr1 (209-262)||(51997353-51997406)
chr1 (97-177)||(12006332-12006413)
chr1 (132-191)||(10852402-10852461)
chr1 (169-248)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (31-351)||(21940831-21941151)
chr8 (30-351)||(22171653-22171974)
chr8 (30-351)||(6094289-6094610)
chr8 (30-351)||(24642815-24643135)
chr8 (30-293)||(15326422-15326685)
chr8 (30-293)||(15506791-15507054)
chr8 (30-171)||(28548393-28548534)
chr8 (97-340)||(14983710-14983950)
chr8 (30-345)||(8371253-8371563)
chr8 (30-337)||(21969333-21969635)
chr8 (145-342)||(24797224-24797419)
chr8 (30-337)||(12562123-12562425)
chr8 (30-337)||(27007517-27007819)
chr8 (30-337)||(27014660-27014962)
chr8 (30-337)||(27880487-27880789)
chr8 (30-337)||(28020668-28020970)
chr8 (46-345)||(38232115-38232412)
chr8 (30-337)||(22130609-22130911)
chr8 (30-337)||(25611195-25611497)
chr8 (30-336)||(22659494-22659795)
chr8 (30-337)||(21916676-21916978)
chr8 (30-337)||(45534273-45534575)
chr8 (30-337)||(26240484-26240786)
chr8 (127-345)||(18835342-18835556)
chr8 (210-349)||(32872741-32872880)
chr8 (30-269)||(6430953-6431188)
chr8 (115-261)||(8781959-8782102)
chr8 (228-314)||(2375214-2375300)
chr8 (40-137)||(24796731-24796826)
chr8 (46-192)||(20535226-20535371)
chr8 (30-269)||(2962932-2963171)
chr8 (240-334)||(29645537-29645631)
chr8 (25-143)||(36970439-36970556)
chr8 (26-143)||(2375411-2375528)
chr8 (230-337)||(36970265-36970371)
chr8 (57-179)||(29645675-29645797)
chr8 (238-290)||(10920427-10920479)
chr8 (263-318)||(24535514-24535569)
chr8 (316-351)||(28555049-28555084)
chr8 (30-91)||(8968015-8968076)
chr8 (42-90)||(41368106-41368154)
chr8 (42-90)||(41375077-41375125)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (30-345)||(24695186-24695501)
chr5 (30-351)||(19714218-19714539)
chr5 (30-351)||(19706939-19707259)
chr5 (30-351)||(18569581-18569904)
chr5 (152-351)||(39538754-39538953)
chr5 (30-321)||(17298621-17298912)
chr5 (30-321)||(17285470-17285759)
chr5 (117-345)||(18806843-18807069)
chr5 (26-192)||(27347252-27347417)
chr5 (30-137)||(24701950-24702057)
chr5 (30-337)||(20941027-20941329)
chr5 (30-337)||(25805385-25805687)
chr5 (30-337)||(31899-32201)
chr5 (30-337)||(12789663-12789965)
chr5 (30-337)||(22941250-22941552)
chr5 (30-337)||(23545922-23546224)
chr5 (206-340)||(22546912-22547046)
chr5 (30-337)||(24933306-24933608)
chr5 (42-335)||(20100255-20100543)
chr5 (30-337)||(31096816-31097118)
chr5 (30-337)||(12764990-12765296)
chr5 (30-337)||(5097651-5097953)
chr5 (30-337)||(7865430-7865736)
chr5 (30-337)||(9811733-9812039)
chr5 (30-337)||(12703874-12704180)
chr5 (117-255)||(18806483-18806619)
chr5 (117-255)||(18806663-18806799)
chr5 (257-345)||(27347425-27347513)
chr5 (26-115)||(28719471-28719558)
chr5 (30-279)||(18829281-18829530)
chr5 (30-337)||(26245102-26245404)
chr5 (26-269)||(26129689-26129928)
chr5 (30-111)||(39538954-39539035)
chr5 (205-334)||(33477193-33477321)
chr5 (292-336)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (30-351)||(7273-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (30-351)||(6654-6975)
scaffold0390 (30-351)||(13670-13991)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (34-351)||(15152609-15152926)
chr7 (30-351)||(29327950-29328271)
chr7 (30-351)||(11535782-11536103)
chr7 (30-351)||(11542700-11543021)
chr7 (30-356)||(12750987-12751313)
chr7 (30-351)||(12738702-12739023)
chr7 (30-351)||(18561173-18561485)
chr7 (30-341)||(13392326-13392637)
chr7 (24-342)||(18257559-18257874)
chr7 (30-337)||(2204552-2204854)
chr7 (30-337)||(8464999-8465301)
chr7 (30-337)||(18400104-18400406)
chr7 (30-337)||(18407088-18407390)
chr7 (30-337)||(48808496-48808798)
chr7 (30-337)||(15729751-15730053)
chr7 (30-337)||(18139338-18139640)
chr7 (30-337)||(19230888-19231190)
chr7 (42-337)||(30254138-30254428)
chr7 (30-270)||(2365169-2365407)
chr7 (30-269)||(41680968-41681203)
chr7 (30-337)||(10668901-10669204)
chr7 (42-337)||(47166871-47167161)
chr7 (52-336)||(24443349-24443628)
chr7 (30-262)||(34128647-34128875)
chr7 (115-345)||(19388544-19388774)
chr7 (30-337)||(28130561-28130863)
chr7 (228-318)||(10235361-10235451)
chr7 (52-339)||(25845498-25845780)
chr7 (52-339)||(25845917-25846199)
chr7 (68-337)||(19393462-19393726)
chr7 (30-269)||(18259124-18259359)
chr7 (228-336)||(47833875-47833983)
chr7 (296-351)||(15148308-15148363)
chr7 (237-346)||(19859113-19859221)
chr7 (41-178)||(39112138-39112275)
chr7 (204-342)||(3132849-3132986)
chr7 (214-332)||(7662569-7662686)
chr7 (30-262)||(14591924-14592153)
chr7 (30-262)||(16011515-16011744)
chr7 (116-255)||(31190524-31190660)
chr7 (259-345)||(7396361-7396450)
chr7 (130-262)||(22969024-22969153)
chr7 (104-179)||(22948499-22948574)
chr7 (30-218)||(15169290-15169474)
chr7 (214-272)||(7396469-7396527)
chr7 (248-303)||(29983179-29983234)
chr7 (237-340)||(39111989-39112092)
chr7 (299-341)||(2365070-2365112)
chr7 (120-184)||(29984308-29984372)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (30-351)||(18454-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (26-351)||(25706-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (30-351)||(21329968-21330289)
chr2 (30-351)||(18796672-18796993)
chr2 (24-345)||(18619976-18620296)
chr2 (30-345)||(36270338-36270650)
chr2 (30-345)||(22183206-22183518)
chr2 (30-301)||(20978091-20978360)
chr2 (44-342)||(6991847-6992146)
chr2 (42-351)||(18822249-18822556)
chr2 (30-337)||(30174377-30174679)
chr2 (30-337)||(24250032-24250334)
chr2 (30-337)||(24229215-24229517)
chr2 (205-345)||(19279460-19279600)
chr2 (228-336)||(18851977-18852085)
chr2 (42-269)||(15342014-15342237)
chr2 (28-336)||(29800468-29800775)
chr2 (30-193)||(17241034-17241196)
chr2 (228-331)||(36801899-36802003)
chr2 (115-337)||(19616435-19616653)
chr2 (97-177)||(36799745-36799826)
chr2 (128-262)||(40301034-40301164)
chr2 (228-335)||(28741220-28741326)
chr2 (30-97)||(41661694-41661761)
chr2 (55-260)||(41316305-41316506)
chr2 (127-262)||(21626824-21626955)
chr2 (115-191)||(28740910-28740986)
chr2 (203-266)||(28718943-28719006)
chr2 (228-345)||(24763751-24763867)
chr2 (301-341)||(12098609-12098649)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (49-351)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (26-351)||(5695-6013)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (30-286)||(230111-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (30-337)||(183-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (30-337)||(3675-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (30-337)||(119730-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (42-337)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (68-337)||(130262-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (30-337)||(67374-67676)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (30-337)||(39988-40290)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (127-337)||(8305-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (30-269)||(26609-26844)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (228-345)||(90033-90151)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (58-345)||(8723-9005)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (30-220)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (30-262)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (127-262)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (30-336)||(53766-54066)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (207-298)||(45956-46051)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (301-345)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2362
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 2340  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  2341 atagtctctatgctttaatgat 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11253
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11231  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11232 atagtctctatgctttaatgat 11253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684510
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17684488  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17684489 atagtctctatgctttaatgat 17684510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381293
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27381271  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27381272 atagtctctatgctttaatgat 27381293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471676
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27471654  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27471655 atagtctctatgctttaatgat 27471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651889
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 11651911  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11651910 atagtctctatgctttaatgat 11651889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691481
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17691459  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  17691460 atagtctttatgctttaatgat 17691481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309056
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29309078  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29309077 atagtctctatgctttaatgat 29309056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316016
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29316038  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29316037 atagtctctatgctttaatgat 29316016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 188697 - 189018
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 188996  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  188997 atagtctctatgctttaatgat 189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296877
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 303
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394438
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 271
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  34 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  134 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  234 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 271  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 252
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  31 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  131 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 230  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  231 atccaatataaatattactcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 355
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359314
Alignment:
Q  47 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  147 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||  ||| | |||||||||  |||||  |   |||| |||||||||||     
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  246 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgcttt 13359304  T
Q  346 gatgatgtcc 355  Q
     ||| |||||    
T  13359305 aatgttgtcc 13359314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566361
Alignment:
Q  247 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  347 atgat 351  Q
    |||||    
T  16566357 atgat 16566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669476
Alignment:
Q  40 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 139  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  140 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaata 238  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  239 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789071
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16789177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 16789079  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  16789078 atagtctc 16789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860190
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22860084 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22860182  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  22860183 atagtctc 22860190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508649
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27508641  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    | ||||||    
T  27508642 acagtctc 27508649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586410
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 1586402  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  1586403 atagtctc 1586410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 337
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528235
Alignment:
Q  44 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 143  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  144 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 243  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  244 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctc 27528235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074480
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14074488  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  14074487 atagtctc 14074480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 337
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020143
Alignment:
Q  74 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 173  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  174 gaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag 273  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18019984 gaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatag 18020080  T
Q  274 acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18020081 acttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 18020143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 345
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359359
Alignment:
Q  52 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 151  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  152 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 251  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||| |  || || ||||| ||||||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  252 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||   || ||||| |  ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  10359268 taatatttatatctatgtatagacttaatatctc-acattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgcttt 10359359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612915
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8612926  T
Q  327 ataatagtctc 337  Q
    |||||||||||    
T  8612925 ataatagtctc 8612915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925935
Alignment:
Q  208 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 307  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  308 tgatcatcagtctacctacataatagtct 336  Q
     |||||||||| || | ||||||||||||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatagtct 27925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 336
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850521
Alignment:
Q  133 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 231  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | |||||||||||| | |  || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  232 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 331  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataat 17850516  T
Q  332 agtct 336  Q
    |||||    
T  17850517 agtct 17850521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736562
Alignment:
Q  115 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 214  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  215 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 267  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  214 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 313  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  314 tcagtc 319  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 345
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553622
Alignment:
Q  213 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 312  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  313 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgcttt 20553622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510155
Alignment:
Q  99 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataa 198  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| ||  ||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  199 cttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 284  Q
    | ||  |||||||||||| ||||    | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  130 agtggtttcaggtc 143  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120740
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcat 17120603  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||| ||| |||||||    || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120701 aatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 351
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537200
Alignment:
Q  299 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 25537200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 337
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995245
Alignment:
Q  242 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 13995245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||  ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218427
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatatcttatgaaa-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgg 19218534  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     |||||     |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||| | || ||||| |  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  19218533 gtcaat-----ataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctcat-attcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatac 19218440  T
Q  327 ataatagtctcta 339  Q
    |||||||||||||    
T  19218439 ataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 323
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  202 ttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  302 gagatgtgatcatcagtctacc 323  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  158 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 257  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||    | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  258 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 338  Q
    ||| | ||||||  | |||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  108 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 171  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  47 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 146  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  147 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 186  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 262
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  115 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | |  ||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatctc-ataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  215 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    ||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073574
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| | |  ||||||||||||||| |   |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatgaa--ttttcataacatat--tatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||  |||||| ||| |||  ||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||  ||    
T  4073685 gtcaatcaaatataaatattacctctaatatttacacttatgtatagacttaatatctc-atattcatgacctatgggatgtgatcctcaatctacaaac 4073587  T
Q  327 ataatagtctcta 339  Q
    |||||||||||||    
T  4073586 ataatagtctcta 4073574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 337
Target Start/End: Original strand, 20736594 - 20736630
Alignment:
Q  301 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20736594 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 20736630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262378
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18262400  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18262399 atagtctctatgctttaatgat 18262378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269239
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18269261  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18269260 atagtctctatgctttaatgat 18269239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612849
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 55612871  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  55612870 atagtctctatgctttaatgat 55612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963806
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26963828  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26963827 atagtctctatgctttaatgat 26963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970629
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26970651  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  26970650 atagtctctatgctttaatgat 26970629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868763
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 868785  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  868784 atagtctctatgctttaatgat 868763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926801
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 19926779  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19926780 atagtctctatgctttaatgat 19926801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707486
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5707508  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5707507 atagtctctatgctttaatgat 5707486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714114
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5714136  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5714135 atagtctctatgctttaatgat 5714114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858333
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8858355  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8858354 atagtctctatgctttaatgat 8858333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621374
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10621352  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10621353 atagtctctatgctttaatgat 10621374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628447
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10628431  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  10628432 atagtctctatgcttt 10628447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393175
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 28393153  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  28393154 atagtctctatgctttaatgat 28393175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845369
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8845391  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  8845390 atagtctctatgctttaatgat 8845369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426645
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 4426623  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4426624 atagtctctatgctttaatgat 4426645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223732
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacata 35223748  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35223747 atagtctatatgcttt 35223732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 341
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668156
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacata 5668144  T
Q  330 atagtctctatg 341  Q
    ||||||||||||    
T  5668145 atagtctctatg 5668156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311458
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 125  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  126 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgac 224  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||   |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagttac-ataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  225 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 324  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||     
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctaccc 20311485  T
Q  325 acataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20311484 acaaaatagtctctatgctttaatgat 20311458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461497
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15461505  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  15461504 atagtctc 15461497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975551
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 34975755  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 34975559  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  34975558 atagtctc 34975551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677013
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2677119 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2677021  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  2677020 atagtctc 2677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815021
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15815127 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15815029  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  15815028 atagtctc 15815021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111345
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18111239 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18111337  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  18111338 atagtctc 18111345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369325
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3369317  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  3369318 atagtctc 3369325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300261
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  17300155 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 17300253  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  17300254 atagtctc 17300261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163162
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18163366  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacata 18163170  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  18163169 atagtctc 18163162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20243937
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20243945  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  20243944 atagtctc 20243937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531613
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 26531817  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26531719 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 26531621  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  26531620 atagtctc 26531613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676285
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 4676277  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  4676278 atagtctc 4676285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 205 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516232
Alignment:
Q  205 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 304  Q
    ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  305 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 341  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatg 56516232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870419
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 5870426  T
Q  330 atagtct 336  Q
    |||||||    
T  5870425 atagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 281
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  131 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 230  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || |||||||||||||||||  || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  231 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 281  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365519
Alignment:
Q  46 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 145  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  146 agggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 244  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  245 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  ||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttatacctatgtatagatttaatatctc-atactcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacgtatataatagtctc 19365519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941724
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 1941928  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 1941732  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  1941731 atagtctc 1941724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 316
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646807
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | |  ||||| |||  ||||||| ||||| |||   | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 316  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32646720 caatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  47 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 146  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  147 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 246  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  247 actcctaatatttatatctatgt 269  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  19362499 actcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487625
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636484
Alignment:
Q  132 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 231  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  232 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 32636490  T
Q  332 agtctc 337  Q
    ||||||    
T  32636489 agtctc 32636484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 269
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528714
Alignment:
Q  46 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 145  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  146 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 245  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| ||||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  246 tactcctaatatttatatctatgt 269  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  5528691 cactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616387
Alignment:
Q  46 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 145  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  146 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 245  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||||| |   | |||||||| |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  246 tactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||  | |||| | | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5616485 tacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgcttt 5616387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 255 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  255 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| |||||||  || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  230 aatccaatataaatattactc 250  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  46 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 145  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  146 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 245  Q
    ||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacactttc-ataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  246 tactcctaatatttata 262  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9538049 tactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546080
Alignment:
Q  115 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  215 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 314  Q
    |||||| |  || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| ||| ||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcgattat 4546103  T
Q  315 cagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  4546102 cagtcaacatacataatagtctc 4546080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421096
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| | |  || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  230 aatccaatataaatatta 247  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  108 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 158  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||  |||| |  |  ||||| ||||| |||||  ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 281  Q
     ||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888645 gtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 345
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677590
Alignment:
Q  293 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10677590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 345
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891230
Alignment:
Q  293 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10891230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  163 tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |   | | |||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  263 tctatgtgaagacttgataactctttat 290  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 349
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9938003
Alignment:
Q  279 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 349  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgcttcgatg 9938003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 139
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  58 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 260
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  169 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta---tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 260  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  |||||    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421016
Alignment:
Q  301 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 11421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 345
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040784
Alignment:
Q  301 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttt 30040784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110230
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6110252  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6110251 atagtctctatgctttaatgat 6110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482524
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 16482502  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16482503 atagtctctatgctttaatgat 16482524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579396
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10579374  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10579375 atagtctctatgctttaatgat 10579396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600925
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15600903  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15600904 atagtctctatgctttaatgat 15600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607470
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15607448  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15607449 atagtctctatgctttaatgat 15607470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572633
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10572611  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  10572612 atagtctctatgctttaatgat 10572633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342260
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15342238  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  15342239 atagtctctatgttttaatgat 15342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520141
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18520163  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18520162 atagtctctatgctttaatgat 18520141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490676
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 8490683  T
Q  330 atagtct 336  Q
    || ||||    
T  8490682 atcgtct 8490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 34 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522836
Alignment:
Q  34 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  134 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  234 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 18522847  T
Q  334 tctctatgctt 344  Q
    |||||||||||    
T  18522846 tctctatgctt 18522836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357627
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15357605  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  15357606 atagtctctatgttttaatgat 15357627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781159
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17781137  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17781138 atagtctctatgctttaatgat 17781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211468
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13211490  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13211489 atagtctctatgctttaatgat 13211468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248779
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13248795  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  13248794 atagtctctatgcttt 13248779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056941
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacat 32056918  T
Q  329 aatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  32056919 aatagtctctatgctttaatgat 32056941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200225
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  126 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  226 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 325  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 17200199  T
Q  326 cataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  17200200 cataatagtctctatgctttaatgat 17200225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13516977
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 13516999  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  13516998 atagtctctgtgctttaatgat 13516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647556
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 1647540  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  1647541 atagtctctatgcttt 1647556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136525
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacata 17136547  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  17136546 atagtctctatgttttaatgat 17136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925137
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29925159  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    
T  29925158 atagcctccatgctttaatgat 29925137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974290
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29974312  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||| ||| ||||||| |||||    
T  29974311 atagcctccatgctttaatgat 29974290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200627
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtct 320  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtct 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034238
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21034246  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  21034245 atagtctc 21034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846838
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15846830  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  15846831 atagtctc 15846838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147856
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20147750 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20147848  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  20147849 atagtctc 20147856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398792
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacata 21398800  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  21398799 atagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 345
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253423
Alignment:
Q  48 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 147  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaat 24253229  T
Q  148 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 247  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |    
T  24253230 g-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataa 24253325  T
Q  248 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253326 ctcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctctatgcttt 24253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890391
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||| ||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14890399  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  14890398 atagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427021
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 55427029  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  55427028 atagtctc 55427021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299911
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12299919  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  12299918 atagtctc 12299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978963
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 25978826  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147013
Alignment:
Q  128 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 227  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||| | | |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 327  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  328 taatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttt 14147013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  64 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 163  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  164 atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||| ||| |   |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088251
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| |||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcat 28088310  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 188  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787654
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||| | | |  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatgaaaatatc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 334
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317472
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  ||||| |  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatacata 15317467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  169 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctat 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  268 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 351
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089786
Alignment:
Q  299 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgat 19089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  104 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  200 ttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 296  Q
      | |||||||| |||||||||   || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504455
Alignment:
Q  252 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatccttt 9504455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 341
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  226 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 325  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | | |    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  326 cataatagtctctatg 341  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  68 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 167  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  168 ctatgagaatatctta 183  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16200363 - 16200291
Alignment:
Q  278 gataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16200363 gataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgat 16200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 191
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 191  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4189275 - 4189223
Alignment:
Q  206 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 258  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  4189275 tatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaatattactcataatatt 4189223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252196
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18252218  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18252217 atagtctctatgctttaatgat 18252196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532555
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacata 18532533  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18532534 atagtctctatgctttaatgat 18532555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131450
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27131428  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  27131429 atagtctttatgctttaatgat 27131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310618
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 27310596  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27310597 atagtctctatgctttaatgat 27310618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359076
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 16359054  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16359055 atagtctctatgctttaatgat 16359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855954
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgta 3855938  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||| |||||||    
T  3855939 atagtctccatgcttt 3855954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816668
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 36816652  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  36816653 atagtctctatgcttt 36816668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 311
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641871
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 311  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277592
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||||| |||  || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacata 27277576  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  27277577 atagtctctatgcttt 27277592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 158 - 351
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171274
Alignment:
Q  158 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  258 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 21171274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706741
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19706733  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  19706734 atagtctc 19706741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802667
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 43802659  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  43802660 atagtctc 43802667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28135025
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28135017  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    || |||||    
T  28135018 attgtctc 28135025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 197 - 351
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657262
Alignment:
Q  197 aacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  297 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgat 22657262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507096
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | || ||||| ||||| |||  || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtcta 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456116
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  9456222 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 9456124  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  9456123 atagtctc 9456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916689
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  130 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatga 9916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 345
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014319
Alignment:
Q  108 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 206  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  207 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagat 306  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagat 12014280  T
Q  307 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  12014281 gtgatcatcattctacccacataatggtctttacgcttt 12014319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391541
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20391337  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20391533  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  20391534 atagtctc 20391541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779947
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20779841 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20779939  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  20779940 atagtctc 20779947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670559
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22670453 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22670551  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  22670552 atagtctc 22670559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817291
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  42817185 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 42817283  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  42817284 atagtctc 42817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612492
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22612500  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  22612499 atagtctc 22612492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 633925
Alignment:
Q  50 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 149  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  150 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattact 249  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || | |||||| |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  250 cctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 346  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  || | |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttg 633925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 344
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917952
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  328 taatagtctctatgctt 344  Q
    || || |||||||||||    
T  9917936 tagtattctctatgctt 9917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727667
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||  |||||||||||| || |||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatagata 8727675  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  8727674 atagtctc 8727667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667776
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 47667583  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||           ||| |  || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--act-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  47667670 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 47667768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096789
Alignment:
Q  46 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 145  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  146 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 245  Q
    || |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T
Q  246 tactcctaatatttatatctatgt 269  Q
    || ||||||||| |||| ||||||    
T  29096812 tattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930582
Alignment:
Q  205 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 304  Q
    |||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  305 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctc 35930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 321
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  232 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 321  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  130 agtggtttcaggtc 143  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 262
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 282
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301855
Alignment:
Q  117 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtatt 216  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||  | ||||||| |||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtatt 24301788  T
Q  217 ctcatgacggatcaatccaata-taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 282  Q
    ||| ||| || |   || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24301789 ctcgtgatgggtatttctaatagcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaaatcttgataa 24301855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 329
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  203 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 302  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  303 agatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  209 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 177
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  97 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 177  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  132 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 191  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  169 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacactttc-ataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 31 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940831
Alignment:
Q  31 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  131 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  231 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 21940852  T
Q  331 tagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21940851 tagtctctatgctttaatgat 21940831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171653
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacata 22171675  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22171674 atagtctctatgctttaatgat 22171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094289
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatata 6094311  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6094310 atagtctctatgctttaatgat 6094289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642815
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 24642837  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  24642836 atagtctctatactttaatgat 24642815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 340
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983950
Alignment:
Q  97 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttta 195  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  196 taacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 295  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatg 14983905  T
Q  296 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 340  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14983906 atccgtgagatatgatcattagtctacccacataatagtccctat 14983950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371563
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 8371351  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8371547  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||| |||||||    
T  8371548 atagtctcgatgcttt 8371563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969333
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21969341  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  21969340 atagtctc 21969333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  145 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  245 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 342  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562123
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12562131  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  12562130 atagtctc 12562123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007819
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27007713 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27007811  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  27007812 atagtctc 27007819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014962
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27014856 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27014954  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  27014955 atagtctc 27014962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880789
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  27880683 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27880781  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  27880782 atagtctc 27880789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020970
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28020864 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28020962  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  28020963 atagtctc 28020970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 345
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232412
Alignment:
Q  46 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 145  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  146 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 244  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  245 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 344  Q
    |||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctt 38232411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130911
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  22130805 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22130903  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  22130904 atagtctc 22130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611195
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  25611301 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 25611203  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  25611202 atagtctc 25611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659795
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22659592  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| ||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 22659788  T
Q  330 atagtct 336  Q
    |||||||    
T  22659789 atagtct 22659795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916676
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||    || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  21916782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21916684  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  21916683 atagtctc 21916676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534575
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 45534567  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  45534568 atagtctc 45534575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240484
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||| | ||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatatacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacata 26240492  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  26240491 atagtctc 26240484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 127 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835342
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  327 ataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttt 18835342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 349
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872880
Alignment:
Q  210 tagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  310 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 349  Q
    ||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatg 32872880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430953
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 6431090  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 261
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  115 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  215 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttat 261  Q
    |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2375300 - 2375214
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375300 tcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 137
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  40 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535371
Alignment:
Q  46 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 145  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  146 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 192  Q
    || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963171
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| || |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acgtctagggatcat 2963030  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | ||||  | |||||||||||||||||  |   |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963129 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  240 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 334  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  25 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggg 124  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  125 tacatagtggtttcaggtc 143  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 125  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  126 acatagtggtttcaggtc 143  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970265
Alignment:
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| |||||     
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacatg 36970273  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  36970272 atagtctc 36970265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  57 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 156  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  157 caccactatcactatgagaatat 179  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  238 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 263 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535514
Alignment:
Q  263 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 318  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||    
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagt 24535514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555049
Alignment:
Q  316 agtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 28555049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 91
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 90  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 90  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695501
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 24695485  T
Q  330 atagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||||||||||    
T  24695486 atagtctctatgcttt 24695501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714539
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19714517  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19714518 atagtctctatgctttaatgat 19714539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707259
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19707237  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19707238 atagtctctatgctttaatgat 19707259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569904
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaaca 18569880  T
Q  328 taatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  18569881 taatagtctttatgctttaatgat 18569904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538754
Alignment:
Q  152 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  252 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgat 39538754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 321
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298912
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||  || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 321  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 321
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285759
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||||||   || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 345
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807069
Alignment:
Q  117 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagttacaa-aacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  216 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatc 315  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatc 18807039  T
Q  316 agtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18807040 agtctacccgcataatagtctctatgcttt 18807069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347417
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  126 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 192  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  130 agtggttt 137  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941027
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20941035  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  20941034 atagtctc 20941027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805687
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 25805679  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  25805680 atagtctc 25805687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31899
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  32005 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31907  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  31906 atagtctc 31899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789965
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 12789761  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12789957  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  12789958 atagtctc 12789965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941250
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||  |||| |||| |  ||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacata 22941258  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  22941257 atagtctc 22941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545922
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  23546028 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 23545930  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  23545929 atagtctc 23545922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 340
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22547046
Alignment:
Q  206 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaga 305  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgaga 22547011  T
Q  306 tgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 340  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22547012 tgtgatcatcggtctatccacataatagtctctat 22547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933608
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24933600  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  24933601 atagtctc 24933608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 335
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100543
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  142 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 241  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  242 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtc 335  Q
     |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20100451 gtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096816
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcat 31097020  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31096824  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  31096823 atagtctc 31096816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765296
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12765088  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |   |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12765285  T
Q  327 ataatagtctc 337  Q
    |||||||||||    
T  12765286 ataatagtctc 12765296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097651
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||||||||||||||| |  || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaatttc-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5097757 aatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacata 5097659  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  5097658 atagtctc 5097651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865736
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 7865725  T
Q  327 ataatagtctc 337  Q
    |||||||||||    
T  7865726 ataatagtctc 7865736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9812039
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 9811831  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 9812028  T
Q  327 ataatagtctc 337  Q
    ||| |||||||    
T  9812029 atagtagtctc 9812039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704180
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12703972  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12704169  T
Q  327 ataatagtctc 337  Q
    ||| |||||||    
T  12704170 atagtagtctc 12704180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 255
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  117 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  216 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 255  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 255
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  117 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  216 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 255  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 345
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347513
Alignment:
Q  257 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgcttt 27347513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 115
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 279
Target Start/End: Original strand, 18829281 - 18829530
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaa---ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggta 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||  ||  || |||| | |   |||||| || ||||||  ||||| || |||    
T  18829281 catgatccatggagtacccatcaataaccaactttatagtcatcattttatagatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcacatc-agtgta 18829379  T
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 225  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||   ||||||||  |||||||  |||||||||  |    
T  18829380 catagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaacttac-ataacttt--ctatgtatcattctcatggtg 18829476  T
Q  226 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 279  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829477 ggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245102
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||||  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||| | || || | |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||| |||||||| |    |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26245208 aatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacata 26245110  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  26245109 atagtctc 26245102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 269
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129928
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 125  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  126 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 225  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| ||||| ||| |  |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  226 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 111  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477321
Alignment:
Q  205 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 304  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  305 atgtgatcatcagtctacctacataatagt 334  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataatagt 33477321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  292 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 336  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7273
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 7295  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  7294 atagtctctatgctttaatgat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6975
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6953  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6954 atagtctctatgctttaatgat 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13991
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 13969  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  13970 atagtctttatgctttaatgat 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 34 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152609
Alignment:
Q  34 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  134 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  234 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 15152627  T
Q  334 tctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15152626 tctctatgctttaatgat 15152609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327950
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29327972  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  29327971 atagtctctatgctttaatgat 29327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536103
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11536081  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11536082 atagtctctatgctttaatgat 11536103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11543021
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11542999  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11543000 atagtctctatgctttaatgat 11543021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12750987
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 12751014  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgatgtcca 356  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12751013 atagtctctatgctttaatgatatcca 12750987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738702
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacata 12738724  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  12738723 atagtctctatgctttaatgat 12738702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561173
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18561195  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18561194 atagtctctatgctttaatgat 18561173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392326
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | |    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaataca 13392338  T
Q  330 atagtctctatg 341  Q
    ||||||||||||    
T  13392337 atagtctctatg 13392326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 342
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257874
Alignment:
Q  24 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 123  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  124 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 223  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||| |||||| | |     
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  224 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 323  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatc 18257855  T
Q  324 tacataatagtctctatgc 342  Q
     |||||||||||| |||||    
T  18257856 cacataatagtctttatgc 18257874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204552
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  2204658 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2204560  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  2204559 atagtctc 2204552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8464999
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8465007  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  8465006 atagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400104
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18400210 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18400112  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  18400111 atagtctc 18400104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407088
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18407194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18407096  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  18407095 atagtctc 18407088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808798
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  48808692 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 48808790  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  48808791 atagtctc 48808798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729751
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15729759  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  15729758 atagtctc 15729751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139640
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18139632  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  18139633 atagtctc 18139640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230888
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19230896  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  19230895 atagtctc 19230888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254138
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  142 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 241  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  242 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 30254138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
    ||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||||| ||| |||||  || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 270  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681203
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669204
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacat 10669195  T
Q  329 aatagtctc 337  Q
    |||||||||    
T  10669196 aatagtctc 10669204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 337
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167161
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  142 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 241  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  242 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47167067 atattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 47167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443628
Alignment:
Q  52 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 151  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  152 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 251  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||   |||||||||||| ||||| |  || | |||| | |||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  252 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 336  Q
    ||||||| ||| ||||||  | |||| ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||||||||||||||||  | |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388544
Alignment:
Q  115 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtag 212  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacactttc-ataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  213 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 312  Q
    |||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || ||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtc 19388577  T
Q  313 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388576 atcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130561
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||| ||||||||    || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||| | |||||||||||| | ||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatgcata 28130569  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  28130568 atagtctc 28130561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10235451 - 10235361
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 318  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10235451 tcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgagatgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845780
Alignment:
Q  52 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 151  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  152 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 251  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  252 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 339  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25845694 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846199
Alignment:
Q  52 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 151  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  152 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 251  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  252 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 339  Q
    ||||||| | |  || ||  |||||| ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25846113 taatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 337
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393726
Alignment:
Q  68 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 167  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  168 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 267  Q
     | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| |   | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctat 19393657  T
Q  268 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19393658 gtatagacttaatatctc-atatttatgacccatgaaatgtggtcattagtctacatacataatagtctc 19393726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259359
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||||| |||||||||| |  || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
     ||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259320 tatccagtataaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 327  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  328 taatagtct 336  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148308
Alignment:
Q  296 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15148308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859113
Alignment:
Q  237 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T
Q  337 ctatgctttg 346  Q
    | | ||||||    
T  19859122 cgacgctttg 19859113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  41 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  141 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 178  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  204 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 303  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  304 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 342  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  214 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 313  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  314 tcagtctacctacataata 332  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14592153 - 14591924
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  14592153 catgattcatcaagtacccattagccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 14592054  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| ||||||||||||| |  || ||    
T  14592053 agtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgggtc 14591957  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591956 aatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16011744 - 16011515
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  16011744 catgattcatcaagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 16011645  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | |||||||||||||  || ||    
T  16011644 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgggtc 16011548  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011547 aatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  116 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 215  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  216 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 255  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396361
Alignment:
Q  259 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgcttt 7396361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  104 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 179  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 15169290 - 15169474
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |||||| |  | |||| ||||| |||  |||    
T  15169290 catgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcat 15169388  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattct 218  Q
    |||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||    
T  15169389 agtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7396527 - 7396469
Alignment:
Q  214 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 272  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396527 attcttatgacgggttaatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983179
Alignment:
Q  248 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 303  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga 29983179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111989
Alignment:
Q  237 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||  |  ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| ||||||||   ||||||||||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  337 ctat 340  Q
    ||||    
T  39111992 ctat 39111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365070
Alignment:
Q  299 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatg 2365070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  120 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 184  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18454
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18476  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18475 atagtctctatgctttaatgat 18454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 25706 - 26031
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  126 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  226 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 26005  T
Q  326 cataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||    
T  26006 cataatagtcgctatgctttaatgat 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330289
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacata 21330267  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  21330268 atagtctctatgctttaatgat 21330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 30 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796672
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18796694  T
Q  330 atagtctctatgctttgatgat 351  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  18796693 atagtctcaatgctttaatgat 18796672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 24 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18619976
Alignment:
Q  24 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 123  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  124 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacactttc-ataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  224 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 323  Q
     || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacc 18619998  T
Q  324 tacataatagtctctatgcttt 345  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  18619997 cacataatagtctatatgcttt 18619976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270338
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||| |||  |||||||  ||||||||| ||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||| |||     
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacac 36270355  T
Q  329 aatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  36270354 aatagtctttatacttt 36270338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 345
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183518
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||   ||||||  ||| ||||| ||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacat 328  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| || |    
T  22183403 caatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgt 22183501  T
Q  329 aatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||||||| ||||    
T  22183502 aatagtctctatacttt 22183518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 228  Q
    ||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||  | || ||  ||||||||| ||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  229 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 342
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992146
Alignment:
Q  44 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  143 cgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   |||| |||  ||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcacttac-ataatttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  242 atattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctcta 339  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatcttta 6992143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822249
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  142 tcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatata 240  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  ||||||  | ||||||| | |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  241 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 340  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | |    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatct 18822260  T
Q  341 gctttgatgat 351  Q
    ||||| |||||    
T  18822259 gctttaatgat 18822249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174377
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30174483 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 30174385  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  30174384 atagtctc 30174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250334
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24250228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24250326  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  24250327 atagtctc 24250334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229517
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24229509  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  24229510 atagtctc 24229517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279460
Alignment:
Q  205 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 304  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  305 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgcttt 19279460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Original strand, 18851977 - 18852085
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18851977 tcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagatgggatcattagtctaccgaca 18852076  T
Q  328 taatagtct 336  Q
    |||||||||    
T  18852077 taatagtct 18852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 269
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 141  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  142 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 241  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||| |  || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  242 atattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800468
Alignment:
Q  28 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtac 127  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  128 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 227  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt---atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| || | | | |   |||||||| |  || ||||||||||||||||||| |    
T  29800579 tcaatccagtataaatattactcctaatatttatacccatgtatatacttaattaatatctcacatccatgacccatgggatgtgatcatcagtctacat 29800480  T
Q  325 acataatagtct 336  Q
    ||||||||||||    
T  29800479 acataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 193  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaa-ggtgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 331
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  327 ataat 331  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616435
Alignment:
Q  115 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  215 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 314  Q
    |||||| |  || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| ||   |||  ||||    ||||||||| ||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct-aatatttatgactcatgagatgtggtcat 19616458  T
Q  315 cagtctacctacataatagtctc 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19616457 cagtctacatacataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 177
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  97 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 177  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 262
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  128 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 227  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||||||  ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacac--ttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 335
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 327  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  328 taatagtc 335  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 260
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316506
Alignment:
Q  55 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  155 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaa 254  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||| || ||||||||||  || || ||  | |||||||||||||| |||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  255 tattta 260  Q
    ||||||    
T  41316501 tattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||   |||||||||||||||  ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  115 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 191  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 266
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  203 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 266  Q
    |||| ||||||||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763867
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||| |||  | || |||| |  ||||| ||| |||||||||||| || |    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacgtaatatctc-atgtctatgacccatgagacgtggtcatcagtctacataaa 24763849  T
Q  328 taatagtctctatgcttt 345  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24763850 taatagtctcgatgcttt 24763867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 341
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098649
Alignment:
Q  301 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 341  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatg 12098649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 49 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1159
Alignment:
Q  49 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 148  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  149 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  249 tcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgat 348  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 1162  T
Q  349 gat 351  Q
    |||    
T  1161 gat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5695
Alignment:
Q  26 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  126 acatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttactatgtagtattctcatga 223  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  224 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacc 5723  T
Q  324 tacataatagtctctatgctttgatgat 351  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5722 cacataatagtctttatgctttaatgat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 183
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacata 191  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  190 atagtctc 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3977
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3871 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3969  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  3970 atagtctc 3977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119730
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  119836 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacata 119738  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  119737 atagtctc 119730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 337
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13251
Alignment:
Q  42 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  142 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 241  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  242 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13157 atattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctc 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 337
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130526
Alignment:
Q  68 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 167  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  168 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 267  Q
     | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  268 gtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 337  Q
    ||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  130458 gtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 130526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67676
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 67472  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||  ||||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 67668  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  67669 atagtctc 67676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40290
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||    || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40184 aatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacata 40282  T
Q  330 atagtctc 337  Q
    ||||||||    
T  40283 atagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8305
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  327 ataatagtctc 337  Q
    |||||||||||    
T  8315 ataatagtctc 8305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26609
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |  || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Original strand, 90033 - 90151
Alignment:
Q  228 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactc-tttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 326  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  90033 tcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgattatcagtctatctac 90132  T
Q  327 ataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  90133 atagtagtctttatgcttt 90151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8723
Alignment:
Q  58 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 157  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  158 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| |||||||||||||   || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T
Q  258 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||| |  ||||   |  ||| ||| |||  |||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8809 ttacacatatgcatatccttaatatctc-atatctatgacatgtgagacgtgatcatcaatctacatacatattagtctctacgcttt 8723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcag 190  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctca 220  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11758
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |   |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   |||||   ||||||||||||||||||    ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 262
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  127 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 226  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||||||||   ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacac-cttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  227 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 262  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53766
Alignment:
Q  30 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||| ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcat 53969  T
Q  130 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 229  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||| || | || ||   ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  53968 agtggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 53872  T
Q  230 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 329  Q
    || ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  53871 aacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgtatagaattaatacctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcaatctacatacata 53773  T
Q  330 atagtct 336  Q
    |||||||    
T  53772 atagtct 53766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  207 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat----ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 298  Q
    |||||| ||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 345
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15133
Alignment:
Q  301 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 345  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttt 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University