View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16360_high_2 (Length: 448)

Name: NF16360_high_2
Description: NF16360
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16360_high_2
NF16360_high_2
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (19-440)||(39472996-39473417)
chr5 (19-436)||(39476482-39476899)
chr5 (19-434)||(39487437-39487852)
chr5 (19-436)||(39484233-39484652)
chr5 (30-437)||(39463354-39463761)
chr5 (19-437)||(39451969-39452387)
chr5 (19-440)||(39457081-39457502)
chr5 (19-439)||(39455595-39456015)
chr5 (24-440)||(39461219-39461635)
chr5 (19-431)||(43311316-43311728)
chr5 (86-261)||(39452831-39453006)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39473417 - 39472996
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39473417 atacctgattcataatataatcaaccaatcgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 39473318  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39473317 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggcgcaccattaaactccgcc 39473218  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39473217 ctataatccaacgaaatttcaactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 39473118  T
Q  319 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39473117 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 39473018  T
Q  419 aacgacccttccaatctctgct 440  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  39473017 aacaacccttccaatctctgct 39472996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 39476899 - 39476482
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39476899 atacctcatacataatataatcaatcaaacgacctaaataattgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttactcttttcactcatctctttcac 39476800  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||| ||    
T  39476799 tttcttccttacatctgcatccttatccaacacactccttattcctcgctcaattttatcggcagttacaagatagttaggcctaccacttaactccacc 39476700  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 318  Q
    ||||||||||| |  || || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |    
T  39476699 ctataatccaatgcgatatccacacctatcttcagctcacacaccaattcaaaagcattagcctgttgttcagcaaagagtggccatgcggcaattggta 39476600  T
Q  319 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  39476599 caccaaaatatatgctctcgagtgttgaattccaaccacaatgtgaaacaaatcctcctatggctgggtgggctagtatttgggcctgttgggcccatcc 39476500  T
Q  419 aacgacccttccaatctc 436  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  39476499 aactatccttccaatctc 39476482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 19 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39487852 - 39487437
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39487852 atacctgattcataatataatcaatcaaatgacctaaataagtgtaggaagatccaccctctaacaaagtcttcttactcttttcactcatctctatcac 39487753  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||| || ||    
T  39487752 ttttttcctgaattctccatccttatccaacaaattccttattcctctctcaatcttatccgcagttacaagatagttaggcccttcattaaaccccacc 39487653  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 318  Q
     |||||||||| | |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  39487652 ttataatccaaagcaatttccacacctattttcagttcacacaccaattcaaaagcattagcctgttgctcagcatagagtggccacgcggcaataggca 39487553  T
Q  319 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  39487552 caccaaaatatatgctctcgagtgttgaattccaaccacaatgcgaaacaaatcctccagtggctggatgagctagtatttgggcctgttgggcccatcc 39487453  T
Q  419 aacgacccttccaatc 434  Q
    ||  ||||||||||||    
T  39487452 aattacccttccaatc 39487437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 39484652 - 39484233
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||||    
T  39484652 atacctgattcataatataatcaatcagatgacctaaataagtgtaggaagatccaccctctaacaaagtcttcctactcttctcactcatttttttcac 39484553  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||  |    
T  39484552 tttcttcttaacctctccatccttatacaacacactccttattactctctcaatcttgtcggcacttacaagatagttagactcaccactaaactccatc 39484453  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttc--gactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctatagg 316  Q
    ||||||||||| | ||| ||   || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||| |||||    
T  39484452 ctataatccaatgcaatctccacacacctatctgcagctcacacaccaattcaaaagcattagcctgttgttcaacaaagagtggccatgcggcaatagg 39484353  T
Q  317 cacaccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccat 416  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39484352 cacaccaaaatatatgctctcgagtgttgaattccaaccataatgtgaaacaaatcctcctatggctgggtgggctagtatttgggcttgttgggcccat 39484253  T
Q  417 ccaacgacccttccaatctc 436  Q
    | ||  | ||||||||||||    
T  39484252 ctaattatccttccaatctc 39484233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 437
Target Start/End: Original strand, 39463354 - 39463761
Alignment:
Q  30 ataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcactttcttcctta 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39463354 ataatataatcaatcaaacgacctaaataagtgtaggaagatcctccctctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcactttcttcctta 39463453  T
Q  130 catctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgccctataatccaa 229  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||| | || ||||||||    
T  39463454 cttctccatccttatctaacacactccttattcctctctcaatcttatcagcagttacaagatagttaggctcgccaagaaactccactctgtaatccaa 39463553  T
Q  230 cgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggcacaccaaaataa 329  Q
     ||||| || ||  | || || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |  ||||| | ||| |  || |||||||||||     
T  39463554 tgaaatctccaccgccatctttaactcacacaccagttcaaaagcatttgtctgttgttcagcaaagatcggccaagtggcaagtggaacaccaaaatat 39463653  T
Q  330 atgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatccaacgacccttc 429  Q
    |||||||| |||   |||||||| |||||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||  |||||||    
T  39463654 atgctctccagtgtcgaattccagccacaatgtgagacaaatcctcccgtggccgggtgggctagtatttgggcctgtggagcccaaccaatcacccttc 39463753  T
Q  430 caatctct 437  Q
    ||||||||    
T  39463754 caatctct 39463761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 39452387 - 39451969
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||   | | |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39452387 atacctggttcataatataatcaattaaacgacttaaataaatggaggaagatcctccttctaacagagtcttcttactcttttcactcatctctttcat 39452288  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||  |||  ||||||||| ||    
T  39452287 ttttttcctgaactctccatccttatccaacacactccttattcctttctcaatcttgtcagcagtcaaaagatagttaggaccactgttaaactccacc 39452188  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 318  Q
    |||||||| |||| ||| || ||    || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| | || |||||||  || || ||||    
T  39452187 ctataatctaacgcaatctccacggaaatcttcaactcacacaccaattcaaaagcattaacctgttgctcagcaaagagcggccatgttgcaatgggca 39452088  T
Q  319 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  39452087 caccaaaatatatgctctcgagtgtggaattccagccacaatgtgaaacaaatcctcctatggctggatgtgctagtatttgggcttgtggggcccaacc 39451988  T
Q  419 aacgacccttccaatctct 437  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  39451987 aatcacccttccaatctct 39451969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 440
Target Start/End: Original strand, 39457081 - 39457502
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39457081 atacctgatacctaatataatcgatcaaacgacctaaataagtgtaggaagatcctccatctaacagagtcttcttacttgctgcactcatctctttcac 39457180  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||   |    
T  39457181 tttcttccttacctctccatccttatccaacacactctttattcctctctcaatcttgtcggcagttaaaagatagttagactcgccattaaactctaac 39457280  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 318  Q
    |||||||| || | ||| || ||  | || |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| || || ||| | || ||||| | ||| | |||||    
T  39457281 ctataatctaatgcaatctccacagccatcttcagctcacataccaattgaaatgcatttgtctgctgatcagcaaagagcggccacgtggcaacaggca 39457380  T
Q  319 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 418  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   |||||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  39457381 caccaaaatatatgttctcgagtgtggaattccagccacaatgagaaacaaatcctcccgtggctgggtgggctagtatgtgcgtctgtggggcccatcc 39457480  T
Q  419 aacgacccttccaatctctgct 440  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  39457481 aataacccttccaatctctgct 39457502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 39456015 - 39455595
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39456015 atacctggttcataatataatcaattaaacgacctaaataagtggaagaagatcctccctctaacaaagtcttcttgctcttttcactcatctctttcac 39455916  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    | | ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||  ||| | || ||||| ||    
T  39455915 tgttttcctaaactctccatccttatccaatacactccttattcctctctcaatcttgtccgaagttaaaagatagttaggcccactactatactccacc 39455816  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 318  Q
    |||||||| | || ||| || ||  | || |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | || |||||||  || || ||||    
T  39455815 ctataatctagcgcaatctccacagcaatcttcagctcacacaccaattcaaaagcagtaacctgttgttcagcaaagagcggccatgttgcaatgggca 39455716  T
Q  319 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 418  Q
    ||||||| || |||| |||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||    
T  39455715 caccaaagtatatgccctcgagtgtggaattccaaccacaatgtgaaacaaatcctcctgtggctggatgggctagtatttgggtttgtggagcccaacc 39455616  T
Q  419 aacgacccttccaatctctgc 439  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  39455615 aatcacccttccaatctctgc 39455595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39461635 - 39461219
Alignment:
Q  24 tgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcactttct 123  Q
    ||||||| |||| |||| |  |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39461635 tgattcacaataaaatctattaaacgacctaaatgactgtaagaagatccaccctctaacaaagttttcctactcttttcactcatctctttcactttct 39461536  T
Q  124 tccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgccctata 223  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||    
T  39461535 ttctgacctctccatccttttccaacacattccttattcctctctcaatcttgtcagcagttacaagatagttaggctcaccattgaactccactctata 39461436  T
Q  224 atccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggcacacca 323  Q
    ||| |||  ||| || ||  | || |||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| | ||| || |||||||||    
T  39461435 atctaacacaatctccacagccatcttcagctcatgcaccaactgaaaagcattagtctgttgttcagcaaagagcggccacgtggcaatgggcacacca 39461336  T
Q  324 aaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatccaacga 423  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||| | ||||||    || || |||||||||| ||    
T  39461335 aaatacatgctctcgagtattgaattccagccacaatgggaaacgaatcctcccgtggctgggtgggccaatatttgagtctgcggagcccatccaatga 39461236  T
Q  424 cccttccaatctctgct 440  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39461235 cccttccaatccctgct 39461219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 431
Target Start/End: Original strand, 43311316 - 43311728
Alignment:
Q  19 atacctgattcataatataatcaaccaaacgacctaaatatgcgtaagaagatccaccttctaacaaagtcttcttacttttttcactcatctctttcac 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  43311316 atacatgattcataatataatcaatcaaactacctaagcaagtgtaggaagatccaccctctaacaatgtcttcctacaatgttcactcatctctttcac 43311415  T
Q  119 tttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagttacaagatagttaggttcaccattaaactccgcc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | || || |||||| | | |  || |||   |||||  |    
T  43311416 tttcttccttacctctccatctgtttccaacacactccttattcctttctcgatcttgtctgaagctaaaagataatcacgcccaacatcgtactccatc 43311515  T
Q  219 ctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacacaccaattcaaaagcattagtctgttgttctgcataaagtggccatgcggctataggca 318  Q
    ||||||||||  | ||| || || || || |||| |||| |||| | || ||||||||| || ||||| || ||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  43311516 ctataatccactgcaatctccacacccatcttcagctcagacacaagttgaaaagcattggtttgttgatcagcaaagagtggccatgtggcaataggca 43311615  T
Q  319 caccaaaataaatgctctcgagtactgaattccaaccacaatgcgaagcaaatcctccaatggctgggtgggctagtatttggacttgtggggcccatcc 418  Q
    ||||| |||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||  | ||||| || || |||| |||||| || || ||||||||    
T  43311616 caccataatatatgctctcgagagtcgaattccaaccacaatgtgaaacaaagcctcctgttgctggatgagcgagtacttggacctgaggagcccatcc 43311715  T
Q  419 aacgacccttcca 431  Q
    || ||||||||||    
T  43311716 aatgacccttcca 43311728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 261
Target Start/End: Original strand, 39452831 - 39453006
Alignment:
Q  86 agtcttcttacttttttcactcatctctttcactttcttccttacatctccatccttatccaacacactccttattcctctctcaatcttatcggcagtt 185  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||    
T  39452831 agtcttcttacatgtttcacttatctcttgcactttctttcttacctctccatccttatacaacacactctttattcctctctcaattttgtccgcagtt 39452930  T
Q  186 acaagatagttaggttcaccattaaactccgccctataatccaacgaaatttcgactcctattttcaactcacaca 261  Q
    | |||| ||||||  |||||| ||||||||  ||| ||||| |||| ||| || ||  | || |||||||||||||    
T  39452931 aaaagagagttagactcaccaataaactccaacctctaatctaacgtaatctccacgaccatcttcaactcacaca 39453006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University