View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1638-INSERTION-15 (Length: 597)

Name: NF1638-INSERTION-15
Description: NF1638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1638-INSERTION-15
NF1638-INSERTION-15
[»] scaffold0477 (2 HSPs)
scaffold0477 (7-544)||(4342-4879)
scaffold0477 (536-592)||(5125-5180)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (6-481)||(4622144-4622619)
chr6 (6-495)||(4259809-4260298)
chr6 (6-481)||(4625953-4626428)
chr6 (14-480)||(4613381-4613847)
chr6 (6-555)||(4256279-4256816)
chr6 (14-480)||(4563714-4564180)
chr6 (16-480)||(4601792-4602256)
chr6 (16-477)||(4592237-4592698)
chr6 (14-467)||(4579448-4579901)
chr6 (6-480)||(4617025-4617499)
chr6 (6-499)||(4516305-4516798)
chr6 (16-477)||(4585642-4586103)
chr6 (14-480)||(4557128-4557594)
chr6 (14-480)||(4574311-4574777)
chr6 (6-480)||(4461126-4461600)
chr6 (6-480)||(4560509-4560982)
chr6 (6-467)||(4598187-4598648)
chr6 (6-481)||(3171743-3172218)
chr6 (16-555)||(4266831-4267370)
chr6 (15-477)||(4570978-4571440)
chr6 (15-480)||(4480696-4481161)
chr6 (6-477)||(4490010-4490481)
chr6 (6-480)||(4505860-4506334)
chr6 (6-480)||(4514776-4515250)
chr6 (14-477)||(4469809-4470272)
chr6 (16-203)||(4299486-4299673)
chr6 (6-464)||(4568072-4568533)
chr6 (6-477)||(4504052-4504523)
chr6 (92-480)||(4492958-4493346)
chr6 (16-233)||(4457844-4458061)
chr6 (274-510)||(4299669-4299899)
chr6 (22-200)||(4391794-4391976)
chr6 (377-479)||(4392052-4392154)
chr6 (430-474)||(4457644-4457688)
chr6 (432-480)||(4606972-4607020)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (6-477)||(3086426-3086897)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (6-482)||(3374-3850)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (6-464)||(1281133-1281591)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (6-480)||(1674229-1674703)
chr8 (6-480)||(20863498-20863972)
chr8 (22-480)||(16685938-16686396)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (16-505)||(24102977-24103466)
chr5 (6-464)||(27999754-28000212)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (94-258)||(3428-3591)
scaffold0475 (6-103)||(3164-3261)


Alignment Details
Target: scaffold0477 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 544
Target Start/End: Original strand, 4342 - 4879
Alignment:
Q  7 aagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4342 aagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcagatagaggcctaa 4441  T
Q  107 ttgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4442 ttgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgt 4541  T
Q  207 aggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaat 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542 aggagtgccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactatcggtatatctcccatatatgggagactggtatggaaattgatactaat 4641  T
Q  307 gtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcag 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4642 gtgaagagagagaaggtaacgaatatgatcaatgaattgatgtcgggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcag 4741  T
Q  407 aggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatgctagactaaagtgatttattctat 506  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  4742 aggagaacaccagttctggtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatgctagattaaagttatatattctat 4841  T
Q  507 gaaacgtggttctgtgatttcctcttgaatttatttta 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4842 gaaacgtggttgtgtgatttcctcttgaatttatttta 4879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 536 - 592
Target Start/End: Original strand, 5125 - 5180
Alignment:
Q  536 tttattttatggttaaaaaacgaagcattttagtgtgaggtgctaaacatatataaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tttattttatggttaaaaaacgatgcattt-agtgtgaggtgctaaacatatataaa 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4622619 - 4622144
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4622619 caagaaaccctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcatgggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaggtagaggccta 4622520  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || ||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  4622519 atcgcaggttggtgtccacaagaggaagtacttaaccaccctgcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccaccgaaagcatatgtg 4622420  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||  |||||||| ||| || |||||  |||||||    
T  4622419 ctggagtttcaatgctgtgttggccatttttcgctgatcagccaacaaactgtagatatatctgcaattcatgggagattggaatcgaaatcaatactaa 4622320  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    |||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4622319 tgtgaaaagagaggaggtgtcgaatctgatcaatgaattgatgtcgggagataaaggaaagaagatgagacaaaaggccatggagttgaaggagaaggca 4622220  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaat 481  Q
    || ||||  ||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4622219 gatgagacgaccagccctggtggttgttcatacaacaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaat 4622144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 495
Target Start/End: Original strand, 4259809 - 4260298
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  4259809 caagaaaccctttttgtggatcattaggcctgacctcattattggtggctcctttattttgtcatctgagtttgagagtgaaatttcggatagaggccta 4259908  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4259909 atcgcgagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccactcttcagttggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccattgaaagcatttgtg 4260008  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   | ||| |   |   |||||||| ||| || |||||| |||||||    
T  4260009 ccgaagttccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagccaacaaactgtagatttatttgtaacgaatgggagattggaattgaaattaatactaa 4260108  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    |||||  |||||  ||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4260109 tgtgaaaagagatgaggtggcgaagctgatcaatgaaattatgtcaggagaagaaggaaagaagatgaggcaaaaggtcatggagttgaagaggaaggca 4260208  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatgctagactaaagtg 495  Q
    |||||||||||||||||   ||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  4260209 gaggagaacaccagtccatctggttattcattgatgaacttggacaaagttattaagcaggtcatgctcaaacaatactagattaaagtg 4260298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 4626428 - 4625953
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4626428 caagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtgattggtggctcatttatttcgtcatccgagtttgagaatgaaatttcagatagaggccta 4626329  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4626328 atcgcaagctggtgtccgcaagagaaagtactgaaccatccttcaattggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattgaaagcatatgcg 4626229  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||   ||||| | | ||  |||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  4626228 ctggagttccaatgctgtgttggccaaattttgctgatcagccaacaaattgtagatatatttgcaatgaatgggagattggaatggaaatcgatgctaa 4626129  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| ||| |||  ||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626128 tgtgaagagggagggggtagagaaactgatcaatgcattgatggcaggagataacggaaagaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 4626029  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaat 481  Q
    ||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  4626028 gaggagaacattagtcccggtggttgttcatacatgaatatggataaactgattaatgatgtcttgcttaaacaat 4625953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 480
Target Start/End: Original strand, 4613381 - 4613847
Alignment:
Q  14 cctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4613381 cctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcagttgttttgtcatcagagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgag 4613480  T
Q  114 ctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagta 213  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  4613481 ctggtgtcctcaagagcaagtattaaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtg 4613580  T
Q  214 ccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| | | ||  |||||| | ||| ||||||||||| || ||||||| |    
T  4613581 ccaatgttgtgttggccatttttcgcggatcagccagcaaactg-cagatatatatgcaatgaatgggaaattgggatggaaattgacaccaatgtgaag 4613679  T
Q  313 agagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggaga 412  Q
    |||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  4613680 agagatgaggtagagaagctggtcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaagaaaatgaggcaaaaggcaattgagttgaagaagaaggcagaggagg 4613779  T
Q  413 acaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    |||| || ||  | || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||    
T  4613780 acacgagaccaggaggttgttcatatatgaacttggacaaagtgatcaatgaggtgctgctgaaacaa 4613847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 555
Target Start/End: Original strand, 4256279 - 4256816
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||             | |||||||| |||    
T  4256279 caagaaaccatttttgtgtatcattaggcctgacctcgtcattggtggctcctttattttgtcatctgagttt-------------cggatagaggacta 4256365  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4256366 atcgagagttggtgtccgcaagagcaagtactgaaccactcttcagttggtggattcttgactcattgaggatggaactcaaccattgaaagcatttgtg 4256465  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcag-ccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatacta 304  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||   | ||| |       |||||||| ||| || |||||  ||||||    
T  4256466 ccggagttccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagaccaacaaactgtagatttatttgtagcgaatgggagattggaattgaaatcaatacta 4256565  T
Q  305 atgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggc 404  Q
    |||||| ||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4256566 atgtgaagagagatgaggtggagaatctgatcaatgaattgatgtcgggagaaaaaggaaagaagatgaggcaaaaggtcatggaattgaagaagaagac 4256665  T
Q  405 agaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatgctagactaaagtgatttattct 504  Q
    |||| |||||||||| ||   |||   |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  4256666 agagaagaacaccagcccagctggtcattcattgatgaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaatactagattatagtaatttattct 4256765  T
Q  505 atgaaacgtggttctgtgatttcctcttgaatttattttatggttaaaaaa 555  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  4256766 atgaaatgtggttgtgtaatctcctcttgaatttgttttattgtcaaaaaa 4256816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4564180 - 4563714
Alignment:
Q  14 cctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  4564180 cctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggtggctcagtcgttttgtcatctgagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcttaattgcaag 4564081  T
Q  114 ctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagta 213  Q
     ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  4564080 ttggtgtccacaggagaaagtattgaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtt 4563981  T
Q  214 ccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacga 313  Q
    |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||     ||| | | ||  |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| | ||    
T  4563980 ccaatgttgtgttggccattctttggtgatcagccaacaaactgtagacttatttacaatgaatgggagattgggatggaaatcgatacgaatgtaaaga 4563881  T
Q  314 gagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaa 413  Q
    ||||  ||||   ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||    
T  4563880 gagaagaggtggagaaacttgtcaatgaattgatgtcaggagagaaaggaaagaagatgcggcaaaaggcaattgagttgaagaagaaagtggaggaaaa 4563781  T
Q  414 caccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    ||| ||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4563780 cacgagagctggaggttgttcatacatgaacttggacaaagtgatcaaggaggttttgcttaaacaa 4563714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4602256 - 4601792
Alignment:
Q  16 tttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| || || |    
T  4602256 tttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttgtcatctgagtttacaaatgaaatttcagatagaggcctaatagcaagtt 4602157  T
Q  116 ggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtacc 215  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  4602156 ggtgtccacaagagaaagtgttgaaccacccttcgatcggcggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgcc 4602057  T
Q  216 aatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgaga 315  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   | ||| |   ||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  4602056 gatgttgtgttggcctttttttgccgatcagccaacaaactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacaaatgtgaagaga 4601957  T
Q  316 gagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaaca 415  Q
    ||| || |  |||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  4601956 gaggagttggcgaagctgatcaatgaagtgatagccggagataaaggcaagaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagatggcaaaggagagca 4601857  T
Q  416 ccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    | || |   |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  4601856 ctagactaggtggttgttcatacaagaacctggacaaagttattaaggaggtgttgcttaaacaa 4601792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 4592698 - 4592237
Alignment:
Q  16 tttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  4592698 tttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggcacaattgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcgtaatcgcgagct 4592599  T
Q  116 ggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtacc 215  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||    
T  4592598 ggtgtcctcaagagcaagtattaaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagtatatgtgctggaattcc 4592499  T
Q  216 aatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgaga 315  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||     ||| | | ||  |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  4592498 aatgttgtgttggccattctttagtgatcagccaacaaactgtagacttatttacaatgaatgggagattgggatggaaattgatacgaatgtaaagaga 4592399  T
Q  316 gagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaaca 415  Q
    ||| ||||   ||| || |||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4592398 gaggaggtggagaaacttatcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaagaagatgaggaaaaaggcaatcgagttgaagaagaaggcagaggagaaca 4592299  T
Q  416 ccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaa 477  Q
    | || ||| | || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  4592298 cgagacctggaggttgttcatatatgaacttggacaaattgatcaaggaggtgttgcttaaa 4592237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4579901 - 4579448
Alignment:
Q  14 cctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgag 113  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||   | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  4579901 cctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggcggctcagctgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaataacgag 4579802  T
Q  114 ctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagta 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||     
T  4579801 ctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaatcactgaaagcatatctgctggagtt 4579702  T
Q  214 ccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||| ||| ||| | | | ||| |||| | | ||| || ||||| || |||||||||| |    
T  4579701 ccaatgttgtgttggccatttttcgctgatcacccagtaagctg-cagatatttatgcaatacatggaaaattggaattgaaatcgacactaatgtgaag 4579603  T
Q  313 agagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggaga 412  Q
    |||||| ||||   ||| ||| | ||||||||||||   ||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||     
T  4579602 agagaggaggtggagaagctggttaatgaattgatggtgggagagaaagcaaagaagatgaggcaaaaggcaattgagttgaagaagaaggtggaggagg 4579503  T
Q  413 acaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggt 467  Q
    |||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4579502 acacgagacctggaggctgttcatacatgaacttggagaaagtgattaaggaggt 4579448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4617499 - 4617025
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||    
T  4617499 caagaaatcatttttgtggatcataaggcctgatcttgtcattggtggctcagtgattttctcatctgagtttacaaatgaaattgcagatagaggccta 4617400  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || || ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  4617399 atagcaagttggtgtccacaagacaaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagtatatgcg 4617300  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||   | ||| |   ||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  4617299 ctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgccgaccagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatgggagattggtatggaaatcgatacgaa 4617200  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| ||||||| || |  | || |||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4617199 tgtgaagagagaggagttggcaaagctgatcaatgaagtgatagccggagataaaggaaagaaaatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 4617100  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    ||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  4617099 gaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttgaacaaagttattaaggatgtgttgcttaaacaa 4617025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 4516798 - 4516305
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||||||||| ||    
T  4516798 caagaaaccttttttgtggattattaggcctgaccttgtcattggtggctcggttattttgtcatccgattttgtgaatgaaacttcggatagaggcgta 4516699  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || ||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4516698 atagcaagctggtgtccgcaagagaaagtgttgaaccatccttcagttggaggattcttgactcattgtggatggaactccacaatggaaagcatctgtg 4516599  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatacta 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||| ||||| | | ||  |||||||| |||    ||||||||||| |    
T  4516598 ccggagtaccaatgttgtgttggcctttttttgctgagcagccaacaaattg-cagatatatttgcaatgaatgggagattggagcagaaattgatacca 4516500  T
Q  305 atgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggc 404  Q
    |||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4516499 atgtgaagagagaggaggtggagaagctgatcaatgaattaatggtgggagataaaggaaagaagatgaggcaaaaggccatggaattgaagaagaaggc 4516400  T
Q  405 agaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatgctagactaaagtgattt 499  Q
    ||||||| |||| || ||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||   |||| |||||||||||    
T  4516399 agaggaggacacaagaccaggtggttgttcatatgtgaacttggaaaaagtgattaaggaggtgctgctcaaacaaaattagattaaagtgattt 4516305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 4586103 - 4585642
Alignment:
Q  16 tttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagct 115  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |    
T  4586103 tttttatggatcattagacctgatcttgtcattggtggttccttggttttgtcatctgagtttaagaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcgggtt 4586004  T
Q  116 ggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtacc 215  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  4586003 ggtgcccgcaagagcaagtattgaaccacccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgcc 4585904  T
Q  216 aatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagta-tatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgag 314  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| || | ||| | | ||  |||||||| ||| |||||| |||| || ||||||| |||    
T  4585903 aatgttgtgttggccattcattgctgatcagccaacaaactgt-agaattatttgcaatgaatgggagattgggatggaagttgacaccaatgtgaagag 4585805  T
Q  315 agagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaac 414  Q
    |||| ||||   |||  || ||||||||||||||   ||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4585804 agaggaggtggagaagttggtcaatgaattgatggtgggagagaatggaaagaagatgaggcaaaaggcaatcgagttgaagaagaaggcggaggaggac 4585705  T
Q  415 accagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaa 477  Q
    || || ||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  4585704 acgagacctggaggttgttcatacataaacttggaaaaagtgattaaggaggttttgcttaaa 4585642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4557594 - 4557128
Alignment:
Q  14 cctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgag 113  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||  || |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  4557594 cctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcatcggtggctcagttgttttgtcatcggagtttgtcaatgaaatttcagatagaggcctaatcgcggg 4557495  T
Q  114 ctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagta 213  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||     
T  4557494 ctggtgcccgcaagagcaagtattaaaccatccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagcatatctgctggagtt 4557395  T
Q  214 ccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||| | | ||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |    
T  4557394 ccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagccagcaaactg-cagatatatttgcaatacatgggagattggcatggaaattgacaccaatgtgaag 4557296  T
Q  313 agagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggaga 412  Q
    |||||  |||||  |||| || ||||||||||||||   || || ||||||| ||||||| || |||||   || ||| |||||| |||||| ||||||     
T  4557295 agagatgaggtagagaatttggtcaatgaattgatggagggggagaaaggaaagaagatgtggaaaaagataattgagatgaagacgaaggcggaggagg 4557196  T
Q  413 acaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4557195 acacgagacctggtggttgttcatacatgaatttggaaaaagtgattaaggaggttttgcttaaacaa 4557128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4574777 - 4574311
Alignment:
Q  14 cctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  4574777 cctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggactaatagcaag 4574678  T
Q  114 ctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagta 213  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  4574677 ttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacctttcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtt 4574578  T
Q  214 ccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacg 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||| | | ||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||| | |    
T  4574577 ccaatgttatgttggccatttttttcggatcagccagcaaactg-cagatatatttgcaatgaatgggagattggaaaggaaatcgatactaatgtaaag 4574479  T
Q  313 agagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggaga 412  Q
    || ||| ||||   ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |     
T  4574478 agggaggaggtggagaaactggtcaatgaattgatgtccggagataaaggaaagaagatgaggcaaaaagccattgagctgaagaagaaggtggaggtgg 4574379  T
Q  413 acaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    |||| || ||| | || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4574378 acacgagacctggaggttgttcatacacaaacttggagaaagtgattaaggaggtgttgcttaaacaa 4574311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4461600 - 4461126
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4461600 caagaaaccctttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgtgaatgaaatttcagatagaggccta 4461501  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4461500 atagcaagctggtgtccgcaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccactgaaagcatatgtg 4461401  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||   | ||| | | | | |||||||| |||  | ||||| ||||   |    
T  4461400 ctggagtgccgatgttgtgttggccattctttggtgatcagccagcaaactgtagatttatttgcaacaaatgggagattggacttgaaatcgataaaga 4461301  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| ||| ||  ||||   |||  || |||| |||||||||   ||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||      
T  4461300 tgtgaagagggatgaggtggagaagttggtcaacgaattgatggttggagagattggaaagaagatgaggcaaaaggtcatggaattcaagaagaaggtg 4461201  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    |||||| | ||||| ||| | ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  4461200 gaggaggataccagacctggaggtgtttcatacaagaacttggacaaagtcattaaggatgtcttgcttaaacaa 4461126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4560982 - 4560509
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  4560982 caagaaaccatttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtggttttctcatctgattttt-gaaagaaatttcagatagaggacta 4560884  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4560883 atagcaagttggtgtccacaagagaaagtattgaaccacccatcagtcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtg 4560784  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    ||||| | | ||  |||| ||| ||| |  ||||||||||| ||    
T  4560783 ctggagttccaatgttgtgttggccattttttgcagatcagccagcaaactgaagatatatttgcaatgaatggaagattggaaacgaaattgatacaaa 4560684  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||| | ||| ||| | ||   ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  4560683 tgtaaagagggaggacgtggagaaactggtcaatgaattgatgtcctgagataaaggaaagaagatgaggcaaaaggccatggagctgaagaaaaaggcg 4560584  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    |||| | |||| || ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4560583 gaggtgtacacgagacctggaggttgttcatacatgaacttggagaaagtgattaaggaggtgttgcttaaacaa 4560509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4598648 - 4598187
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  4598648 caagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggctta 4598549  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
     |||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4598548 gttgcaagctggtgtctgcaagagcaagtattaaaccatccttcaattggtggattcttaactcattgcggatggaactcaaccactgaaagtatatgtg 4598449  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatacta 304  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| | | ||||| ||| ||||| | | ||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  4598448 ccggagtgccaatgttgtgttgtccctttttcgcggatcagcaagccaactg-cagatatatttgcaatgaatgggagattggaatcaaaattgaaacta 4598350  T
Q  305 atgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggc 404  Q
    |||||| ||||||| ||||   ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || || ||||||| ||||||    
T  4598349 atgtgaagagagaggaggtggagaagctggtcaacgaattgatgtcgggagataaaggaaagaaaatgaggcaaaagacaattgatttgaagatgaaggc 4598250  T
Q  405 agaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggt 467  Q
     |||||| | || || | | | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4598249 ggaggaggaaacgagacttggaggttgttcatacatgaacttagagaaagtgattaaggaggt 4598187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 3172218 - 3171743
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3172218 caagaaaccctttttgtggattattaggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggccta 3172119  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || || |||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  ||||||    
T  3172118 atagcaagttggtgtccgcaagagaaagtgttgaaccatccttcaattggcggattcttgactcactgcggatggaactcaaccacggaaagtgtatgtg 3172019  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagta-tatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatacta 304  Q
    | ||| | |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| | ||| || || | ||| | | |   |||| ||| ||| |||||||||||||| |    
T  3172018 ctggaatgccaatgttgtgtaggccattttttgctgatcaaccacctaacagt-agaattatttgccaagaatggaagattgggatggaaattgatacca 3171920  T
Q  305 atgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggc 404  Q
    |||| | ||||| | |||||  ||| |||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3171919 atgtaaagagaggggaggtagagaaactgatcaacgaattgatggtgggagagaaaggaaagaagatgaggcaaagggccatggagttgaagaagaaggc 3171820  T
Q  405 agaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaat 481  Q
    ||||||| | || ||   | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3171819 agaggaggatacaagatttggtggttgttcatacatgaacttggataaagtgattaaggaggtcttgcttaaacaat 3171743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 555
Target Start/End: Original strand, 4266831 - 4267370
Alignment:
Q  16 tttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||   || ||| ||||||||||||| ||||| || || |    
T  4266831 tttttgtggataattaggcctgatcttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaaatttcagatagaggactaatagcaagtt 4266930  T
Q  116 ggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtacc 215  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  4266931 ggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaattcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgcc 4267030  T
Q  216 aatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgaga 315  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||   | ||| | ||||  |||||||| |||  | |||||  |||| ||||||| ||||    
T  4267031 aatgttgtgttggccattctttggtgatcagccaacaaactgtagatttatttgctatgaatgggagattggactcgaaatcaatacaaatgtgaagaga 4267130  T
Q  316 gagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaaca 415  Q
    ||  | ||   |||  |  ||||||||||||||   ||||| |||||||  | ||||| |||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4267131 gatgacgtcgagaagttagtcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaatatgatgaagcaaaatgtcttggagttgaagaggaaggcagaagagaaca 4267230  T
Q  416 ccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatgctagactaaagtgatttattctatgaaacgtgg 515  Q
    | || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||  || |    
T  4267231 caagacctggtggtttttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaatactagattgaagtcatttattctaggaattgtag 4267330  T
Q  516 ttctgtgatttcctcttgaatttattttatggttaaaaaa 555  Q
    || ||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  4267331 ttgtgtaatctcctcttgaatttgttttattgtcaaaaaa 4267370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 4571440 - 4570978
Alignment:
Q  15 ctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |     
T  4571440 ctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggtggctcagttgttttgtcatcggagtttgtgaatgaaatttcagatagaggcctaattgctggt 4571341  T
Q  115 tggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtac 214  Q
    |||||  | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| |  |||||||||| | | ||||| |    
T  4571340 tggtgctcgcaagagaaagtattgaaccatccttcaattggtggtttcttgactcactgtggatggaactcaacgaccgaaagcatatctactggagttc 4571241  T
Q  215 caatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgag 314  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||   ||||||| | ||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||    
T  4571240 caatgttgtgttagccattttttgctgatcagccagcaaactgtagatatatctgcaatacatgggagattggaatcgaaatcgatactaatgtgaagag 4571141  T
Q  315 agagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaac 414  Q
    | |  ||||   |||| || ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  4571140 aaatgaggtggagaatttggtcaatgaattgatggtgggagataaaggaaagaagatgaggaaaaatataatggagatgaagaagaaggcggaggaggac 4571041  T
Q  415 accagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaa 477  Q
    || || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  4571040 acgagacctggtggttgttcatacatgaacttggaaaaagtgattaaggaggttttgcttaaa 4570978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4481161 - 4480696
Alignment:
Q  15 ctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagc 114  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||  |  | ||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||     
T  4481161 ctttttgtggattattaggtctaatcttgtcattggtggctcagtggtgttgtcatctgagtatttgaaagaaatttcaaatagaggcctaatagcaagt 4481062  T
Q  115 tggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtac 214  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| |    
T  4481061 tggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaatcggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagtgtatgtgctggagtgc 4480962  T
Q  215 caatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagta-tatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacga 313  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| || || | ||| | | ||  |||||||| |||  | ||||| ||||| ||||||| ||    
T  4480961 caatgttgtgttggccattctttgccgatcagccacctaaccgt-agaattatttgcaatgaatgggagattggactcgaaatcgataccaatgtgaaga 4480863  T
Q  314 gagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaa 413  Q
    ||||  | ||   ||   | |||||||||||| ||   ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4480862 gagaagatgtggagaggttaatcaatgaattgttggtgggagagaaaggaaagaagatgaagcaaaaggccatggagttgaagaagatggcagaggagga 4480763  T
Q  414 caccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4480762 cacaagacctggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcttgcttaaacaa 4480696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 477
Target Start/End: Original strand, 4490010 - 4490481
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||     | ||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  4490010 caagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgttattggtggctcacaggtgttgtcatctgattttttgaaagaaatttcagatagaggacta 4490109  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || || ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  4490110 atagcaagttggtgtccacaagagaaggtattgaatcacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaatcatggagagtatatgtg 4490209  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagta-tatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatacta 304  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||   | | || || | ||| | | |   |||||||| ||| ||| |||||||||| |    
T  4490210 ctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgctgatcaaccacttagcagt-agaattatttgcgaagaatgggagattgggatgaaaattgatacca 4490308  T
Q  305 atgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggc 404  Q
    |||| | ||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4490309 atgtaaagagagaagaggtagagaaactgatcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaagaagatgaggcaaaaggcgacggagttgaagaagaaggc 4490408  T
Q  405 agaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaa 477  Q
    || |||| |||| || |   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4490409 agcggaggacacgagactcggtggtagttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggatgtcatgcttaaa 4490481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4506334 - 4505860
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |  ||||||| || |||||||  |||||| ||||||||||| ||||     
T  4506334 caagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtaattggtggctcagtggttttgtcttcagagtttgcaaatgaaatttcagatagaagcctt 4506235  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || ||||||||| |||||||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4506234 atagcaagctggtgttcacaagagaaagtgttaaatcacccttcaattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcg 4506135  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||   | ||| | | ||  || ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  4506134 ctggagtgccaatgctgtgttggccgttctttggtgatcaaccaacaaactgtagatttatttgcaatgaattggagattggaatcgaaattgatactaa 4506035  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    |||||  ||||| || |||  ||| ||| || ||||| | |||   ||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  4506034 tgtgaatagagaaaatgtagagaagctggtcgatgaaattatggttggagagaaaggaaacaagatgaggaaaaaggtcatggagttgaaaaagagggca 4505935  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
     ||||| | || || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  4505934 aaggaggatacaagacctggtggttgttcattcatgaacttggacaaagttattaaggaggtgttgcttaaacaa 4505860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 4514776 - 4515250
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4514776 caagaaaacctttttatggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcgtctgagtttgtgaatgaaattgcagatagaggccta 4514875  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  4514876 atagcaagttggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaattggcggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgagagcatatgcg 4514975  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| |||||| | ||||||| ||| || |  ||||| ||||||||||||   | ||| | | ||  |||||||| ||| || ||||| ||||  ||    
T  4514976 ctggagtgccaatgctttgttggcaattctttggtgatcaaccaacaaactgtagatttatttgcaatgaatgggagattgggatcgaaatcgatatgaa 4515075  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| ||||||| ||||    || ||  ||||||||||||||   ||||| |||||||  || |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  4515076 tgtgaagagagaggaggttgaaaagcttgtcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaataaaatgaggaaaaaggttatggagttgaaaaagaaggca 4515175  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    || ||| |||| || | | | || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4515176 gacgaggacactagacttggcgggtcttcatacttgaacttggacaaagtgatcaaggaggtgttgcttaaacaa 4515250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 4470272 - 4469809
Alignment:
Q  14 cctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgag 113  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||  |||| | ||||||||||||||||||| | ||     
T  4470272 cctttttgtggatcattaggcccgatcttgtcattggcggctcggtagttttctcatcagagattgtaaatggaatttcagatagaggcctaatcgtgaa 4470173  T
Q  114 ctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagta 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||     
T  4470172 ctggtgtcctcaagagcaagtactgaaccacccttcaatcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtg 4470073  T
Q  214 ccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacga 313  Q
    |||||||||||||||||||| || |  ||||||| | |||| |||   | ||| | | ||  |||||||| |||  | ||||| ||||   |||||| ||    
T  4470072 ccaatgttgtgttggccattctttggtgatcagctagcaaattgtagatttatttgcaatgaatgggagattggacttgaaatcgataaagatgtgaaga 4469973  T
Q  314 gagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaa 413  Q
    ||||  ||||   ||| ||  ||||||||||||||   ||||| || |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||  |||||| |    
T  4469972 gagatgaggtggagaagctagtcaatgaattgatggttggagagaatggaaagaagatgagggaaaagatcatggagttcaagaagaaggtggaggagga 4469873  T
Q  414 caccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaa 477  Q
     ||||| ||| | ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  4469872 taccagacctggaggtgtttcatacaagaacttggacaaagtcattaaggatgtcttgcttaaa 4469809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 4299486 - 4299673
Alignment:
Q  16 tttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagct 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||    
T  4299486 tttttgtggatcattaggccagaccttgtcattggcggcttgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaaatttcaaatagaggcctaaccgcaagct 4299585  T
Q  116 ggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatg 203  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4299586 agtgtccacaagaacaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcactgtggatggaactcaaccattgaaagcatatg 4299673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 4568533 - 4568072
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||| |||||||||| |    
T  4568533 caagaaaccttttttgtggatcattaggccttagcttgtcattggtggctcagttattttgtcatccgagtttgtgaatggaacttcggatagaggccaa 4568434  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||    
T  4568433 atagcaagctggtgtccgcaagagcaagtgttgaaccacccttcagttggacgattcttgactcattgtggatggaactccacattggaaagcatttgtg 4568334  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatacta 304  Q
    |  ||||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||||||| |||| ||| ||||| |   |||  | |||||  || || ||||||||||| |    
T  4568333 ccagagtaccaatgttatgttggccttttttttctgagcagccaacatactg-cagatatatttgtaataagttggagatcggaatcgaaattgatacaa 4568235  T
Q  305 atgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagtt---gaagaagaa 401  Q
    |||||| ||||||| ||||   ||| ||||| |||||||| |||   ||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  4568234 atgtgaagagagaggaggtggagaagctgatgaatgaattaatggtgggacagaaaggaaaaaagatgaggcaaaaggccgtggagttgaagaagaagaa 4568135  T
Q  402 ggcagaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaagga 464  Q
    ||||||| || |||| || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4568134 ggcagagaaggacacaagacctggtgattcttcatacatgaacttggacaaagtgattaagga 4568072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 477
Target Start/End: Original strand, 4504052 - 4504523
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||     | ||||||||||| |||| |||||||  |||  ||||||| ||     
T  4504052 caagaaaccttttttgtggattattaggcctgatcttgttattggtggctcagaggtgttgtcatctgattttgtgaatgaaacttctaatagaggactt 4504151  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
     | || || ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||    
T  4504152 gtagcaagttggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgtggatggaactcaaccactgaaagtgtttgtg 4504251  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||   ||  |  |   ||| | | |   |||||||| ||| ||| | |||||| | ||    
T  4504252 ctggagtgccaatgttgtgttggccatttttttctgatcagccacttaatagcaacattatttgcgaagaatgggagattgggatgaagattgatgccaa 4504351  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    |||   ||||||  |||||  ||| || || ||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4504352 tgtacagagagaagaggtagagaaacttattaatgaattgatggtgggagagaaaggaaagaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 4504451  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaa 477  Q
    |||||| |||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4504452 gaggaggacacaagacttggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggacgtcttgcttaaa 4504523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4493346 - 4492958
Alignment:
Q  92 cagatagaggcctaattgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccat 191  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |     
T  4493346 cagatagaggcctaattgctagttggtgtccacaagagaaactgctgaaccaccattcgattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaactac 4493247  T
Q  192 tgaaagcatatgtgcaggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatg 291  Q
      ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||||   |  || | | ||  || ||||| |||  |     
T  4493246 caaaaacatatgtgccggagtgccaatgttgtgttggcctttctttagtgatcagccaacaaactgtagattgatttgcaatgaattggagattggagta 4493147  T
Q  292 gaaattgatactaatgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagt 391  Q
    ||||| ||||  ||||| |  ||||| || ||   ||||||| |||||||  | |||   ||||| |||||||  |||||||||  ||| |||| |||||    
T  4493146 gaaatcgataggaatgttaatagagaaaatgtggagaatctggtcaatgagattatggttggagagaaaggaaacaagatgaggagaaaagccacggagt 4493047  T
Q  392 tgaagaagaaggcagaggagaacaccagt-cctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  4493046 tgaaaaagaaggcagaggaggaca-cagtacctggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgatcaaggatgtcttgcttaaacaa 4492958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4458061 - 4457844
Alignment:
Q  16 tttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagct 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| || |||| |||||||  ||| ||||||||| |||| || || |    
T  4458061 tttttgtggataactaggcctgatcttgtcattggtggctcggttgttttgtcatcggattttgtgaatgaaacttctgatagaggcttaatagcaagtt 4457962  T
Q  116 ggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtacc 215  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  4457961 ggtgtccacaagataaagtgttgaaccacccttcaatcggaggattcttgactcattgtggatgaaactcaaccactgaaagcatatgcgctggagtgcc 4457862  T
Q  216 aatgttgtgttggccatt 233  Q
    |||| || ||||||||||    
T  4457861 aatgctgcgttggccatt 4457844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 510
Target Start/End: Original strand, 4299669 - 4299899
Alignment:
Q  274 atatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatga 373  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    || ||||||||||||||||||   ||||| ||||||   |||||||    
T  4299669 atatgggagattggaatcgaaatcgatacaaatgtgaggagagaggaggtggaaaagctgatcaatgaattgatggtgggagagaaaggagataagatga 4299768  T
Q  374 ggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgct 473  Q
    | |||||||| | ||||||||||      |||||||||||||| | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  4299769 gacaaaaggcaagggagttgaag------gcagaggagaacactaatccaggtggttgttcgtacatgaacttggacaaagttattaaggaggttctgct 4299862  T
Q  474 taaacaatgctagactaaagtgatttattctatgaaa 510  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4299863 taaacaatattagaataaagtgatttattctaggaaa 4299899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 4391794 - 4391976
Alignment:
Q  22 tggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaatt----gcgagctgg 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | || | | |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |    || || |||    
T  4391794 tggatcattaggcttgaccttgtcattggcaggtcatgtgttttgttatatgagtatgagaatgaaatttcagatagaggtctatctagtcgcaagatgg 4391893  T
Q  118 tgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcat 200  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || | ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  4391894 tgtccgaaagagcaagtattgaaccacccttgaatttgtggattcttaacgcattgtggatgaaactcacccattgaaagcat 4391976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 479
Target Start/End: Original strand, 4392052 - 4392154
Alignment:
Q  377 aaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaa 476  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||| |||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4392052 aaaaggcgatcgagttgaagaagaaggcaaaggaggacacatgacctggtggttcttcattcatgaacttggacaaactgattaaggaggtcttgcttaa 4392151  T
Q  477 aca 479  Q
    |||    
T  4392152 aca 4392154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4457688 - 4457644
Alignment:
Q  430 tgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgctt 474  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4457688 tgttcatacttgaacttggacaaagtgactaaggaagtcatgctt 4457644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 480
Target Start/End: Original strand, 4606972 - 4607020
Alignment:
Q  432 ttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4606972 ttcatacatgaacttggaaaaagtgattaagaaggttttgcttaaacaa 4607020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 3086897 - 3086426
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  3086897 caagaaaccatttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcctttattatgtcatctgagtttgagaaagaaatttcagatagaggtcta 3086798  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||  ||    
T  3086797 atcgcaagctggtgtccgcaagagcaagtattgaatcacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaactcaacggttgaaagcgtacttg 3086698  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||||||   ||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  3086697 ctggagtgccaatgttgtgttggccattttatggagatcaaccaataaactgtagatatatctgcaatatatgggagattggaattgaaatcgatactaa 3086598  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| ||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||| |||||||| |||    
T  3086597 tgtgaagagagaggaggtcgagaagctgatcaatgaattgatggtgggagataaaggaaagaagatgaggcaaaatgtcgcagagttaaagaagaaagca 3086498  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaa 477  Q
    || ||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3086497 gaagagaacaccagtatcggtggttgttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaggtcttgcttaaa 3086426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 482
Target Start/End: Original strand, 3374 - 3850
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3374 caagaaaccgtttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggcggctcgtttattttgtcatcagaatttgagaatgaaatttcagatagaggccta 3473  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  3474 atcacaagctggtgtccacaagagcaagtactgatccacccttcaattggtggattcttgactcattgtggatggaattcaaccactgaaagcatatgcg 3573  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||   | ||| | | |   |||||||| |||  | ||||| ||||   |    
T  3574 ctggagtaccaatgctttgttggccattctttggtgatcagccaacaaactgtagatttatttgcaacgaatgggagattggacttgaaatcgatatgga 3673  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| ||||||  ||||   ||| ||  |||||||||||| |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3674 tgtgaagagagatgaggtggagaagctagtcaatgaattgacggtgggagagaaaggaaagaagatgaggcaaaaggccgtggagttaaagaagaaggca 3773  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatg 482  Q
    ||||||||||| || ||  ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  3774 gaggagaacactagaccaggtggtcgttcatacatgaacctggacaaagttattaaggaggttttgcttaaacaatg 3850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 1281591 - 1281133
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1281591 caagaaaccatttttgtggatcactaggcctgatcttgtcattggcggctcagtgattttgtcatctgactttgcgaatgaaatttcagatagaggccta 1281492  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || || || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1281491 atagcaagttggtgtccacaagagaaagtgttgaaccacccttcaatcggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtg 1281392  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||   | ||| |   ||  |||| ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  1281391 ctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagccaacagactgtagatttatttgtaatgaatggaagattggtatggaaatcgatacaaa 1281292  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| ||||||| ||||  | ||  ||||||||||||||||  | || ||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||  |||     
T  1281291 tgtgaagagagaggaggtggctaagttgatcaatgaattgatagccggggatgaaggaaagaatatgagagaaaaggccatggaattgaagaaggcggcg 1281192  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaagga 464  Q
    ||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1281191 gaggagaacactagaccgggtggttgttcatacatgaacttcgacaaagtgattaagga 1281133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1674703 - 1674229
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  1674703 caagaaaccttttttgtggatcactaggcctgatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcatctgagtttatgaaagaaatttcagatagaggccta 1674604  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    ||  | |  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1674603 atatcaaattggtgtccacaagagaaagtgttgaaccacccttcaatcggcggattcttgacacactgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgcg 1674504  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   | ||| |   ||  |||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  1674503 ctggagtgccaatgttgtgttggccattttttgctgatcagccaacaaactgtagatttatttgtaatgaatggaagattggtatggaaattgatacgaa 1674404  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| |||||||    |   ||| || |||||||||||||||   ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1674403 tgtgaagagagagggtttggagaagcttatcaatgaattgatggtgggagagaatggaaaaaagatgaggcaaaaggccatggaattgaagaagaaggca 1674304  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    ||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  1674303 gaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaagtgttgcttaaacaa 1674229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 20863498 - 20863972
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20863498 caagaaaccctttttgtggatcattaggcctgatcttgtcattggtggctcggtgattttttcatctgcgtttgtgaatgaaatttcagatagaggccta 20863597  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20863598 atcgcgagttggtgtccacaagagaaggtgttgaaccatccttcaattggtggatttctaactcattgtggatggaactcaaccattgagagcatatgtg 20863697  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatacta 304  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| || || | | | | |||||||| ||| || |||||||| || |    
T  20863698 ctggagtgccaatgttgtgctggccattttttgctgatcagccgacaaactg-cagatacatttgcaacaaatgggagattgggatcgaaattgacacca 20863796  T
Q  305 atgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggc 404  Q
    |||| | ||||||| ||||   ||  ||| | ||||||||||||   ||||| ||||||| || ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  20863797 atgtcaagagagaggaggtggagatgctggtaaatgaattgatggtgggagagaaaggaaggaggatgaggcaaaagacaaatgagttgaagaagaaggc 20863896  T
Q  405 agaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    ||||||| |||| || ||    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20863897 agaggaggacacaagaccggaaggtggttcatatatgaacttggacaaagtgattaaggaggtgttgcttaaacaa 20863972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 480
Target Start/End: Original strand, 16685938 - 16686396
Alignment:
Q  22 tggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagctggtgtc 121  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  16685938 tggatcattaggtctgatcttgtcatttgcggttccgtggttttgtcatctgagtttaagaatgaaatctcagatagaagcctaatcgcgagctggtgcc 16686037  T
Q  122 cacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtaccaatgtt 221  Q
    | |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  16686038 cgcaagagcaagtattaaaccatccttcaatcggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccactgaaagtatatatgctggagttccaatgtt 16686137  T
Q  222 gtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcag-tatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgagagagaa 320  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||| ||||| | | ||  |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||  |    
T  16686138 gtgttggccattttttgctgatcagccagcaaaatg-cagatatatttgcaatgaatgggagattggcatggaaattgacaccaatgtgaagagagatga 16686236  T
Q  321 ggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaacaccagt 420  Q
    |||   |||  || ||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| |||||   || ||  || | | |||||  || ||  || | ||     
T  16686237 ggtggagaaattggtcaatgaattgatggtgggagagaaaggaaagaagatgaggaaaaagataattgaactgcaaatgaaggtggacgaagacccgaga 16686336  T
Q  421 cctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaa 480  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  16686337 cctggtggttgttcatacatgaacttggaaaaagtgattatggaggttttgcttaaacaa 16686396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24103466 - 24102977
Alignment:
Q  16 tttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcctaattgcgagct 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  24103466 tttttgtggataattaggcctgatcttgtcattgggggctcagttgttttgtcatctgatttttttaaagaagtttcagatagaggactaatagcaagtt 24103367  T
Q  116 ggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtgcaggagtacc 215  Q
    |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  24103366 ggtgtccacaagataaagtgttaaaccacccttcgattggtggattcttgactcattgcggatggaactcaaccactgaaagcatatgtgctggagtgcc 24103267  T
Q  216 aatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaatgtgacgaga 315  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||   | ||| | ||||  |||||||| |||  | ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24103266 aatgttgtgttggccattctttggtgatcaaccaacaaactgtagatttatttgctatgaatgggagattggactcgaaatcgatacaaatgtgaagaga 24103167  T
Q  316 gagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggcagaggagaaca 415  Q
    ||  | ||   |||  |  ||||||||||||||   ||||| || |||| || ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24103166 gatgacgtcgagaagttagtcaatgaattgatggtgggagagaacggaaagacgatgaagcaaaaggtcttggagttcaagaagaaggcagaagagaaca 24103067  T
Q  416 ccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaaggaggtcatgcttaaacaatgctagactaaagtgatttattcta 505  Q
    | ||  || |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  24103066 caagatctggtggtttttcatacatgaacttggacaaagttattaaggaggtcatgcttaaacaattctagattaaagtcatttattcta 24102977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 464
Target Start/End: Original strand, 27999754 - 28000212
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggccta 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  27999754 caagaaaccttttttgtggatcactaggcctaatcttgtcattggtggctcagtggttttgtcatctgagtttaggaaagaaatttcagatagaggccta 27999853  T
Q  106 attgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattgaaagcatatgtg 205  Q
    ||  | |  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  | || ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  27999854 atatcaaattggtgtccacaagagaaagttttgaaccacccttcaatcagcgggttcttgactcactgcggatggaactcaaccaccgaaagcatatgcg 27999953  T
Q  206 caggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgtcagtatatctcctatatatgggagactggtatggaaattgatactaa 305  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||   | ||| |   ||  |||| ||| |||||||||||||||||  ||    
T  27999954 ctggagtgccaatgttgtgttggtcattttttgctgatcagccaacaaactgtagatttatttgtaatgaatggaagattggtatggaaattgatatgaa 28000053  T
Q  306 tgtgacgagagagaaggtaacgaatctgatcaatgaattgatgtcaggagataaaggaatgaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaagaaggca 405  Q
    ||||| || |||| |  |   ||| || |||||||||||||||   ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28000054 tgtgaagatagaggatttggagaagcttatcaatgaattgatggtgggagagaatggaaaaaagatgaggcaaaaggccatggagttgaagaaaaaggca 28000153  T
Q  406 gaggagaacaccagtcctcgtggctgttcatacatgaacttggacaaagtgattaagga 464  Q
    ||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28000154 gaggagaacactagaccaggtggttgttcatacatgaacttggacaaagtgattaagga 28000212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 3428 - 3591
Alignment:
Q  94 gatagaggcctaattgcgagctggtgtccacaagagcaagtactgaaccacccttcaattggtggattcttgactcgttgcggatggaactcaaccattg 193  Q
    |||| ||||||| | || || ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3428 gatataggcctagtcgcaagatggtgtccgtaagagcaagtgttgaaccaccctt-agttggtggattcttaactcattgtggatggaactcaaccattg 3526  T
Q  194 aaagcatatgtgcaggagtaccaatgttgtgttggccatttttcgccgatcagccaacaaactgt 258  Q
    ||||||| ||| | ||||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  3527 aaagcatttgttctggagttccaatgctgcgttggccatttttccccgaacactcaacaaactgt 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 103
Target Start/End: Original strand, 3164 - 3261
Alignment:
Q  6 caagaaatcctttttgtggatcattaggcctgaccttgtcattggcggctcgtttattttgtcatctgagtttgagaatgaagtttcagatagaggcc 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |  ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3164 caagaaaccctttgtgtggatcattaggtctgaccttgtcattggcggatcatgtgctttgttatatgagtttgagaatgaaacttcagatagaggcc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University