View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1639_high_10 (Length: 375)

Name: NF1639_high_10
Description: NF1639
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1639_high_10
NF1639_high_10
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (16-359)||(49067134-49067476)
chr3 (16-358)||(40823303-40823643)
chr3 (16-359)||(48314269-48314612)
chr3 (16-335)||(55370243-55370560)
chr3 (13-328)||(53926376-53926690)
chr3 (210-357)||(5557779-5557926)
chr3 (210-353)||(8235080-8235224)
chr3 (210-325)||(47756940-47757055)
chr3 (255-359)||(13495880-13495984)
chr3 (210-356)||(8113211-8113358)
chr3 (259-351)||(51657186-51657278)
chr3 (210-290)||(13495738-13495819)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (16-359)||(17413556-17413897)
chr5 (16-359)||(32719735-32720074)
chr5 (16-359)||(17546642-17546987)
chr5 (16-359)||(41040999-41041339)
chr5 (83-359)||(43622468-43622732)
chr5 (16-359)||(35392178-35392509)
chr5 (210-360)||(41290588-41290738)
chr5 (210-350)||(42691692-42691832)
chr5 (213-359)||(19121337-19121483)
chr5 (210-359)||(25480272-25480419)
chr5 (230-359)||(18241413-18241541)
chr5 (210-359)||(3891203-3891359)
chr5 (231-340)||(22740865-22740975)
chr5 (301-359)||(26161553-26161611)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (16-359)||(41842874-41843216)
chr8 (16-349)||(16913213-16913545)
chr8 (210-359)||(34893078-34893227)
chr8 (210-360)||(27853816-27853966)
chr8 (213-359)||(24255186-24255332)
chr8 (213-297)||(8628141-8628226)
chr8 (218-302)||(37063822-37063906)
chr8 (301-359)||(15096751-15096810)
chr8 (218-302)||(45262046-45262131)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (16-359)||(26898889-26899230)
chr6 (296-359)||(14366000-14366063)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (16-358)||(1314-1656)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (16-359)||(12642-12984)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (16-359)||(11653628-11653969)
chr4 (16-357)||(54243403-54243739)
chr4 (16-359)||(22454837-22455179)
chr4 (210-357)||(4875486-4875633)
chr4 (210-359)||(42351011-42351160)
chr4 (210-359)||(24539155-24539305)
chr4 (210-359)||(9061412-9061560)
chr4 (210-355)||(23633196-23633342)
chr4 (210-335)||(48809222-48809347)
chr4 (210-356)||(40682183-40682330)
chr4 (210-322)||(49750382-49750494)
chr4 (210-325)||(49357791-49357906)
chr4 (259-359)||(46420683-46420785)
chr4 (259-359)||(2527644-2527744)
chr4 (213-359)||(12758514-12758657)
chr4 (296-359)||(23633403-23633466)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (16-359)||(36159132-36159472)
chr7 (16-359)||(15237145-15237490)
chr7 (27-359)||(34405108-34405437)
chr7 (16-359)||(2732840-2733171)
chr7 (18-359)||(16718573-16718923)
chr7 (18-359)||(17692783-17693133)
chr7 (210-359)||(24396495-24396644)
chr7 (210-359)||(38029528-38029678)
chr7 (226-344)||(40107886-40108004)
chr7 (225-359)||(26455147-26455282)
chr7 (210-359)||(20077961-20078101)
chr7 (223-357)||(40241616-40241750)
chr7 (259-359)||(29322575-29322675)
chr7 (210-359)||(728908-729049)
chr7 (210-359)||(39703937-39704075)
chr7 (276-359)||(40462369-40462452)
chr7 (257-303)||(32201661-32201707)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (16-359)||(52407929-52408268)
chr1 (210-356)||(28946657-28946803)
chr1 (225-359)||(50290242-50290376)
chr1 (208-359)||(21007792-21007944)
chr1 (210-359)||(45914065-45914214)
chr1 (213-357)||(39268301-39268446)
chr1 (259-357)||(43991652-43991749)
chr1 (244-302)||(49193219-49193278)
chr1 (218-302)||(8998722-8998807)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (16-359)||(8850-9195)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (16-325)||(38329146-38329453)
chr2 (210-359)||(37995261-37995410)
chr2 (210-359)||(25236528-25236676)
chr2 (210-345)||(44240556-44240692)
chr2 (210-359)||(10128611-10128760)
chr2 (231-335)||(6686871-6686975)
chr2 (158-208)||(14390427-14390477)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (210-359)||(87721-87870)
[»] scaffold1155 (1 HSPs)
scaffold1155 (210-359)||(122-272)
[»] scaffold0642 (1 HSPs)
scaffold0642 (210-359)||(34-184)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (210-359)||(9945-10095)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (210-359)||(28885-29035)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49067476 - 49067134
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49067476 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 49067378  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49067377 gcgaatggttaatatgcacatgagtcatataagggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 49067278  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49067277 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatattaaa 49067178  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49067177 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 49067134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Original strand, 40823303 - 40823643
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40823303 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 40823400  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40823401 gcgaacggtttatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccatgtactta 40823500  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  40823501 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaactatgttatggtacagtaccaacatttatgcttcttaatattatgtaatactata 40823600  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40823601 tgacaatcatgacattcatctaaactatttttttacctattac 40823643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 48314269 - 48314612
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48314269 atgagtggatagtaagaaaaaagagagcatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 48314366  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcgg--ctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtact 213  Q
     |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48314367 acgaacggttaatatgcacatgagtaatatatgggtcctatatatttcatgggtggcggggctgccccttttcattagtccctagctccgtccctgtact 48314466  T
Q  214 taacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatacta 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48314467 taacctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatacta 48314566  T
Q  314 aatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48314567 tatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 48314612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Original strand, 55370243 - 55370560
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  55370243 atgagtggatggtaaggaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaaa-tggatatgaaagcatgggca 55370340  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55370341 gcgaacggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 55370440  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  55370441 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatgctata 55370540  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatc 335  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  55370541 tgacaatcataacactcatc 55370560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 53926690 - 53926376
Alignment:
Q  13 aaaatgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgg 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53926690 aaaatgactggatggtaagaaaaaagagaacataagtggacctttaattaaaaaaaataaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgg 53926592  T
Q  113 gtggcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtac 212  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  53926591 gtggcgaacagttaatatgcacatgagtcttataggggtcctatatatttcatgggtggcagttgccccttttcattggtacctagctccatccctgtac 53926492  T
Q  213 ttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatact 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53926491 ttaacctataatgttacgttacggtatcaaagatgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattataaaatact 53926392  T
Q  313 aaatgacaatcatgac 328  Q
    | ||||||||||||||    
T  53926391 atatgacaatcatgac 53926376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 210 - 357
Target Start/End: Original strand, 5557779 - 5557926
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5557779 tacttaagctattatgttacgttacggtatgaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacaatatcaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 5557878  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatta 357  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5557879 actatatgaaaattatgacattcatctaaattattttgttacctatta 5557926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 353
Target Start/End: Original strand, 8235080 - 8235224
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8235080 tacttaacctattatgttatgttacggtaccaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttattgttatgaaa 8235179  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacct 353  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8235180 tactatatgacaatcgtgacattcatctaaactattttgttacct 8235224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47757055 - 47756940
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47757055 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacatctatgcttcttaatattatgaaat 47756956  T
Q  310 actaaatgacaatcat 325  Q
    | || |||||| ||||    
T  47756955 aatatatgacattcat 47756940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 359
Target Start/End: Original strand, 13495880 - 13495984
Alignment:
Q  255 gaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttaccta 354  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13495880 gaaatattatgttattgtacagtacaaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactatatgacaatcaagacattcatctaaactattttattaccta 13495979  T
Q  355 ttacc 359  Q
    |||||    
T  13495980 ttacc 13495984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 210 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8113358 - 8113211
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| || || |||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  8113358 tacttaacatattatgttacgttgctgtaccaaagacgatgtcatggaaatattatggtatgatacagcaccaatatctctgcttcttaatatcatgaaa 8113259  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatt 356  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8113258 tattatatgacaatcatgacattcatttaaactattttattacttatt 8113211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 351
Target Start/End: Original strand, 51657186 - 51657278
Alignment:
Q  259 aattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttac 351  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657186 aattatgttatggtacaagaccaacgtttatacttcttaatattacgaaatactatatgacaattatgacattcatctaaactattttgttac 51657278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Original strand, 13495738 - 13495819
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatg 290  Q
    |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13495738 tacttaatctattatgttacgctacggtatcaaggacgatgtcgtggaaatattatgttatggtacagtaccaacgtctatg 13495819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17413897 - 17413556
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17413897 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 17413800  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17413799 gcgaacggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccatgtactta 17413700  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17413699 acctataatgttaagttatggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactata 17413600  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17413599 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 17413556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 32719735 - 32720074
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32719735 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgaatggacgtttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaatcatgggtg 32719832  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32719833 gcgaacggttaatacgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 32719932  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32719933 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtc--ggaaaattatgttatggtacattaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactcta 32720030  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32720031 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 32720074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17546987 - 17546642
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17546987 atgagtggatggtcagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttaatataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 17546890  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17546889 gcgaacgtttaatatgcacatgagtcctacacgggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagatccgtctctgtactta 17546790  T
Q  216 a----catataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatac 311  Q
    |    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17546789 attaacctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatacttcttaatattatgaaatac 17546690  T
Q  312 taaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17546689 tatatgacaatcataacattcatctaaacaattttgttacctattacc 17546642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41041339 - 41040999
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41041339 atgagtggatgataagaaaaaa-agaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 41041243  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41041242 gtgaacggttaatatgcacatgagtcctataagggtcctatatatttcatgggtggcggctaccccttttcattagtacctagcttcgtccctgtactta 41041143  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41041142 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatagaaaattatgttatggtacaataccaatgtctatgcttcttaatattatgaaatactata 41041043  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
     |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41041042 cgacagttatgacattcatttaaactattttgttacctattacc 41040999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 83 - 359
Target Start/End: Original strand, 43622468 - 43622732
Alignment:
Q  83 aagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtggcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgcccct 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43622468 aagtgaaccaa-gtggatatgaaagtatgggtggcgaacgattaatatgcacatgagtcc-----------tatatatttcataggtggcagctgcccct 43622555  T
Q  183 tttcattagtacctagctccgtccctgtacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaa 282  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  43622556 ttccattagtacctagcttcgtccctgtacttaacctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatgggacagtaccaa 43622655  T
Q  283 cgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622656 cgtctatgcttcttaatattatgaaatactatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 43622732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35392509 - 35392178
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35392509 atgagtggatggtaagaaaaaagagaatatgagtgaacctttaattaaaaagaataaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 35392411  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctatagg----ggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgta 211  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||     
T  35392410 gtgaacggttaatatgcacatgagtcctataggggccggtcctatatatttcatgggcggcggctgcccctttttattagtacctaactccgtccttgtt 35392311  T
Q  212 cttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatac 311  Q
     | ||| |||||||||               ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35392310 atcaacctataatgtt---------------ggatgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattataaaatac 35392226  T
Q  312 taaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35392225 tatatgacaatcatgatattcatctaaactattttgttacctattacc 35392178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 210 - 360
Target Start/End: Original strand, 41290588 - 41290738
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41290588 tacttaacctattatgttacgttacgatatcaaggacgatgttatgaaaaattatgttgtgggacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 41290687  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacct 360  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41290688 actatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttatctattacct 41290738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42691832 - 42691692
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42691832 tacttaacctattatgttacattacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgtttcttaatattatgaaat 42691733  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgtta 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42691732 actatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgtta 42691692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 213 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19121483 - 19121337
Alignment:
Q  213 ttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatact 312  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19121483 ttaacctattatgttatgttacggtatcaaggatgatgtcatggaaaattattttatggtacagtaccaacgtttatgtttcttaatattatgaaatact 19121384  T
Q  313 aaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121383 atatgacaaacatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 19121337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25480419 - 25480272
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25480419 tacttaacctattatgttactttacagtatcaaggacgatgtcctggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcctcttaatactatgaaat 25480320  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25480319 actatatgacaatcatgacattcatctaaacta--ttgttacctattacc 25480272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18241541 - 18241413
Alignment:
Q  230 gttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgaca 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18241541 gttacggtatcaaggatgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgtttcttaatattatgaaatattatatcacaatcatgaca 18241442  T
Q  330 ttcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18241441 ttcatctaaa-tattttgttacctattacc 18241413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 3891203 - 3891359
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagta-------ccaacgtctatgcttcttaatatt 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  3891203 tacttaacctattatgttacgttacgatatccaggacgatgtcatggaaaattatactgtggtacagtaccaagtaccaacgtctatgcttcttaatatt 3891302  T
Q  303 atgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3891303 acgaaatactatatgacaattataacattcatctaaactattttattacttattacc 3891359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Original strand, 22740865 - 22740975
Alignment:
Q  231 ttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgaca 329  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  22740865 ttacgttatcaaggatgatgtcatggaaatattatgttatgatacagtaccaacatttatacttcttaatattataaaataatatatgacaatcatgaca 22740964  T
Q  330 ttcatctaaac 340  Q
    |||||||||||    
T  22740965 ttcatctaaac 22740975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 359
Target Start/End: Original strand, 26161553 - 26161611
Alignment:
Q  301 ttatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  26161553 ttatgaaatattatatgacaatcataacattcatctaaaatattttgttatttattacc 26161611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41843216 - 41842874
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41843216 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaaataaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcaagggtg 41843118  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41843117 gcgaacggttaatatgtacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctctgtccctgtactta 41843018  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41843017 acctataatgctacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtacaataccaacgtctatacttcttaatattatgaaatactata 41842918  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41842917 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 41842874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16913545 - 16913213
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16913545 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaaataaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 16913447  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16913446 acgaacggttaatatacacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagcttcgtccatgtactta 16913347  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16913346 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattataaaatattata 16913247  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgtt 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16913246 tgacaatcatgactttcatctaaactattttgtt 16913213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34893227 - 34893078
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34893227 tacttaacctattatgttacgttactgtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 34893128  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34893127 actatatgacaattatgacattcatttaaactgttttgttacctattacc 34893078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 210 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27853966 - 27853816
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27853966 tacttaacctattatgttacgttacagtgtcaaggatgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 27853867  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacct 360  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27853866 actatatgacaatcataacattcatctaaactattttgttacctattacct 27853816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 213 - 359
Target Start/End: Original strand, 24255186 - 24255332
Alignment:
Q  213 ttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatact 312  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24255186 ttaacctattatgttacgttacggtatgaaggacgatatcatataaaattatgttatggtacagtaccaatgtctatgcttcttaatattatgaaatact 24255285  T
Q  313 aaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24255286 atatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 24255332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8628226 - 8628141
Alignment:
Q  213 ttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcat-gaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttctta 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8628226 ttaacatattatgttacgttacggtaccaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacaataccaacgtctatgcttctta 8628141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 302
Target Start/End: Original strand, 37063822 - 37063906
Alignment:
Q  218 atataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatatt 302  Q
    |||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37063822 atattatgttatgttacagtgccaaggacgatgtcatggaaatatatgttatggtacagtaccaacgtatatgctttttaatatt 37063906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15096810 - 15096751
Alignment:
Q  301 ttatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgtt-acctattacc 359  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15096810 ttatgaaatactatgtgacaattatgacattcatctaaactatttttttaacctattacc 15096751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45262131 - 45262046
Alignment:
Q  218 atataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatatt 302  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | || ||||   ||||||||||||||||    
T  45262131 atattatgttatgttacagtaccaaggacgatgtcatgaaaatattatgttaaagtacaatatcaacaaatatgcttcttaatatt 45262046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26899230 - 26898889
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26899230 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaagaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 26899133  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26899132 gcgaatggttaatatgtacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctatgctta 26899033  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26899032 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaatgataatatggtacagtaccaacgactatgcttcttaatattatgaaatactata 26898933  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26898932 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 26898889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14366063 - 14366000
Alignment:
Q  296 taatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14366063 taatattataaaatactatatgaaaattatgacatttatctaaactattttgttttctattacc 14366000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1656 - 1314
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaat-ttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1656 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaaaaaaaaaattagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggt 1558  T
Q  115 ggcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1557 ggcgaacggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcgggtgccccttttcattagtacctaactccgtccctatactt 1458  T
Q  215 aacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaa 314  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1457 aatctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacatctatgcttcttaatattatgaaatactat 1358  T
Q  315 atgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1357 atgacaatcatgacattcatctaaactattttgttatctattac 1314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12984 - 12642
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12984 atgagtggaatgtaagaaaaaagagaaaatgagtggacctttaattaaaaaaaataaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatggatg 12886  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12885 gcgaacgattaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatggatggcggctgcccctattcattagtatctagctccgtccctgtactta 12786  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  12785 acctataatattacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatcctttttaatattatgaaatactata 12686  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12685 tgacaatcatgtcattcatttaaactattttgttacctattacc 12642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11653969 - 11653628
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11653969 atgagtggatggtaagaaaaaagataacatgagtggacctttaattaaaaaaaataaaatttagtataaatgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 11653871  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11653870 gcgaacgattaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatattttatgggtggcggctgcctcttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 11653771  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  11653770 acctataatgttacgttacagtatcaaggacaatgtcatg-gaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcatcttaatattatgaaatattata 11653672  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11653671 tgacaatcatgacattcatctaaactattttattacctattacc 11653628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 357
Target Start/End: Original strand, 54243403 - 54243739
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54243403 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaaaaaaaatt-agtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 54243500  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54243501 gcgaacggttaatatgcacatgagtcctatagggatcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctaactccgtccatgtactta 54243600  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54243601 acctataatgttacgttacggtatcaaagacgatgtcatggaaa---atgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactata 54243697  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatta 357  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  54243698 taacaatcatgacatttatttaaactattttgttacctatta 54243739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 22454837 - 22455179
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22454837 atgagtggatgataagaaaaaagagaatatgagtggacctttaattaaaaaaaaaaaaatttagtataaatgaaccaa-gtagatatgaaagcatgggtg 22454935  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22454936 gcgaacggttaatctgcacatgagtcatatagaggtcctatatattttatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 22455035  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22455036 acctataatgttatgttacgatatcaaggacgttgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatgttatgaaatactata 22455135  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22455136 tgacaattatgacattcatttaaactattttattacttattacc 22455179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4875633 - 4875486
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4875633 tacttaacatattatgttacgttacggtatcaatgacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 4875534  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatta 357  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4875533 attacatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatta 4875486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 42351011 - 42351160
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42351011 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattattttatagtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 42351110  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42351111 actatatgacagttatgacattcatctaaactattttgttatctattacc 42351160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 24539155 - 24539305
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24539155 tacttaacatattatgttacgttatggtatcaaggacaatgtcatggaaatattatgttatggtacagtaccaaagtctatgcttcttaatattatgaaa 24539254  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24539255 tactatatgacgatcatgacattcatgtaaactattttgttacctattacc 24539305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 9061412 - 9061560
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9061412 tacttaacctattatgttacgttacggtatcacggaatatgtcatggaaaattat-ttatggtatagtaacaacgtctatgcttcttagtattatgaaat 9061510  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9061511 actatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 9061560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 210 - 355
Target Start/End: Original strand, 23633196 - 23633342
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23633196 tacttaacctattatgttacgttacggtaccaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacagtaccaacgtctatggttcttaatattatgaaa 23633295  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctat 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23633296 tactatatgacaatcatgacatttatttaaactattttgttacctat 23633342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Original strand, 48809222 - 48809347
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48809222 tacttaacctattatgttacgttacgctatcaaggatgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 48809321  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatc 335  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  48809322 actatatgacaatcatgaaattcatc 48809347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40682330 - 40682183
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40682330 tacttaacctattatgttatgttacggtaccaaggacgatgtcatggaaatattatgttgtggtacagtaccaacatctatgcttcttaatattatgaaa 40682231  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatt 356  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40682230 tactatataacaatcatagcattcatctaaactattttgttacctatt 40682183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49750494 - 49750382
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49750494 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacaatatcaacgtctattcttcttaatattatgaaat 49750395  T
Q  310 actaaatgacaat 322  Q
    |||||||||||||    
T  49750394 actaaatgacaat 49750382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 49357791 - 49357906
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49357791 tacttaacatattatgttacgttatgatatcaaggacgatgtaatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 49357890  T
Q  310 actaaatgacaatcat 325  Q
    |||  |||||| ||||    
T  49357891 actgcatgacattcat 49357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 46420683 - 46420785
Alignment:
Q  259 aattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaat--catgacattcatctaaactattttgttacctatt 356  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46420683 aattatgttatggtacaataacaacgtttatgcttcttaatattatgaaatactatatgacaattatatgacattcatctaaactattttgttacctatt 46420782  T
Q  357 acc 359  Q
    |||    
T  46420783 acc 46420785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 2527644 - 2527744
Alignment:
Q  259 aattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattac 358  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2527644 aattatgttatgatacagtaccaacatctattcttcttaatattatgaaatattgtatgacaattatgacattcatctaaactattttgttatctattac 2527743  T
Q  359 c 359  Q
    |    
T  2527744 c 2527744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12758657 - 12758514
Alignment:
Q  213 ttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgtta-----tggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaa 307  Q
    ||||| ||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12758657 ttaacctattatattacattacagtatcaaggatgatgtcatggaaaattatgttatgttgtggtacagtaccaacgtctatg-ttcttaatattatgaa 12758559  T
Q  308 atactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||||| || ||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12758558 atactatattacaatc-------tcatctaaactattttgttacttattacc 12758514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23633466 - 23633403
Alignment:
Q  296 taatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23633466 taatattatgaaatactatatgaaaatcatgacattcatttaaactattttgttatctattacc 23633403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 36159132 - 36159472
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36159132 atgagtggatggtaagaaaaaagagaatatgagtggacctttaattaaaaaaaataaaatttattataagtgaatcaa-gtggatatgaaagcatgggtg 36159230  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36159231 gcgaacggttaatatgcacatgagtcatatagggg-cctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccttgtactta 36159329  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  36159330 cc-tataatgttacgttacagtatcaaggacgatgtcatagaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatattata 36159428  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36159429 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 36159472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 15237145 - 15237490
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15237145 atgagtggatggtcagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttaatataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 15237242  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15237243 gcgaacgtttaatatgcacatgagtcctacacgggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagatccgtctctgtactta 15237342  T
Q  216 a----catataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatac 311  Q
    |    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15237343 attaacctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatacttcttaatattatgaaatac 15237442  T
Q  312 taaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15237443 tatatgacaatcataacattcatctaaacaattttgttacctattacc 15237490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34405437 - 34405108
Alignment:
Q  27 gtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtggcgaatggtta 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  |||     
T  34405437 gtaagaaaaaagagaacatgagtggacgtttaattaaaaaaaaaaaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaatcatgggtggagaacagttt 34405339  T
Q  127 atatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtacttaacatataatgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  34405338 atatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagcttcgtccttgtacttaacctataatgt 34405239  T
Q  227 tacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34405238 tacgttacggtatcaaggacgatgtc--gaaaagttatgtaatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactatatgacaatcatg 34405141  T
Q  327 acattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34405140 acattcatttaaactattttgttacttattacc 34405108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2733171 - 2732840
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2733171 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagcggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 2733074  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2733073 gcgaacggttaatatgcacatgagtcctatcggggt----------tcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtaatta 2732984  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  2732983 acctataatgttacattacggtatcaaggacgatgtcatcgaaaattatgttatggtacaataccaacatctatgcttcttaatattatgaaatattata 2732884  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732883 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 2732840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 16718573 - 16718923
Alignment:
Q  18 gagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtggc 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16718573 gagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtggc 16718670  T
Q  118 gaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtacttaac 217  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16718671 aaacggttaatatgcacatgagtcatataggggtcctatatatttcacgcgtggcagctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtacttagc 16718770  T
Q  218 atataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatga----------- 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  16718771 ctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaat--tgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactacatg 16718868  T
Q  307 --aatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16718869 acaatactatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 16718923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 17692783 - 17693133
Alignment:
Q  18 gagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtggc 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17692783 gagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtggc 17692880  T
Q  118 gaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtacttaac 217  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17692881 aaacggttaatatgcacatgagtcatataggggtcctatatatttcacgcgtggcagctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtacttagc 17692980  T
Q  218 atataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatga----------- 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  17692981 ctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaat--tgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactacatg 17693078  T
Q  307 --aatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693079 acaatactatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 17693133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24396644 - 24396495
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24396644 tacttaacctattatgttacgttacagtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacaatatcaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 24396545  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24396544 actatatgacaatcatgacattcatctaaattattttgttacctattacc 24396495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 38029528 - 38029678
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38029528 tacttaacctattatgtt-cgttaccgtaccaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 38029626  T
Q  309 -tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38029627 ttactatatgacaatcataacattcatctaaactattttgttacctattacc 38029678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 226 - 344
Target Start/End: Original strand, 40107886 - 40108004
Alignment:
Q  226 ttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcat 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40107886 ttacgttacggtatcaaagacgaagtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactatatgacaatcat 40107985  T
Q  326 gacattcatctaaactatt 344  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  40107986 gacattcatctaaaatatt 40108004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 225 - 359
Target Start/End: Original strand, 26455147 - 26455282
Alignment:
Q  225 gttacgttacggtatcaaggacgatgtcat-gaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatc 323  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26455147 gttacggtacggtaccaaggacgatgtcatagaaatattatgttatggtccagtaccaacgtctatacttcttaatattatgaaatactatatgacaatc 26455246  T
Q  324 atgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26455247 atgacatttatctaaactattttgttatctattacc 26455282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 20077961 - 20078101
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20077961 tacttaacctattatgttacattacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggttcagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 20078060  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20078061 acta---------tatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 20078101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 223 - 357
Target Start/End: Original strand, 40241616 - 40241750
Alignment:
Q  223 atgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  | |||||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  40241616 atgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatagaaaattatattatggtactgaaccaacatttatgcttcttaatattataaaatacaatatgacaat 40241715  T
Q  323 catgacattcatctaaactattttgttacctatta 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40241716 catgacattcatctaaactattttgtaatctatta 40241750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 29322575 - 29322675
Alignment:
Q  259 aattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattac 358  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29322575 aattatgttatggtacagtatcaacgtctatgcttcttaatgttatgaaatactatatgacaattatgacattcatctaaactattttgttatctattac 29322674  T
Q  359 c 359  Q
    |    
T  29322675 c 29322675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 728908 - 729049
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  728908 tacttaacctattatgttacgttacagtaccaaggacgatgtcatgggaatattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 729007  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    || ||          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  729008 tatta---------tatgacattcatctaaactatttggttacctattacc 729049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39704075 - 39703937
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||             |||||||||||||||||    
T  39704075 tacttaacctattatgttacattacggtagcaaggacgatgtcatggaaatattatattatggtacagtag------------ttcttaatattatgaaa 39703988  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39703987 tactatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgctacctattacc 39703937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40462452 - 40462369
Alignment:
Q  276 gtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40462452 gtaccaacgtctatatttcttaatattatgaaatactatatgataatcatgacattcatctaaactattttattaccaattacc 40462369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 303
Target Start/End: Original strand, 32201661 - 32201707
Alignment:
Q  257 aaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatatta 303  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||    
T  32201661 aaaattatgttatggtacaatatcaacgtctatacttcttaatatta 32201707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 52408268 - 52407929
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  52408268 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgg-tg 52408172  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52408171 gcgaacggttaatatgcacatgggtcaaataggggtcctatatatttcatgggtggcgactgcctcttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 52408072  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52408071 acctataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacattaccaacgtttatgcttcttaatattatgaaatactata 52407972  T
Q  316 tgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52407971 tg-caatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 52407929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 210 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28946803 - 28946657
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28946803 tacttaacctattatgttatgttacgatatcaaggacaatgtcatgaaaaattatgttattgtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 28946704  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatt 356  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28946703 attatatgacaatcatgacattcatctaaattattttattacctatt 28946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 225 - 359
Target Start/End: Original strand, 50290242 - 50290376
Alignment:
Q  225 gttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatca 324  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50290242 gttacgttacgatatcaaggatgatgtcatggaaaatcatgttatggtacaataccaacgtctatgcttctgaatattatgaaatactaaatgacaatca 50290341  T
Q  325 tgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50290342 tgacattcatctaaactatttttctacctattacc 50290376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 208 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21007944 - 21007792
Alignment:
Q  208 tgtacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatga 306  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21007944 tgtacttcacctattatgttacgttacggtaccaaggacgatgtcatggaaatattattttgtggtacagtatcaacgtctatgcttcttaatattatga 21007845  T
Q  307 aatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21007844 aatactatatgacaatcatgacattgatctaaactattttattacctattacc 21007792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45914214 - 45914065
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45914214 tacttaacctattatgttatgttacggtatcaaggacgatgttaaggaaaattatgttatggtacaataccaacgtctatgattcttaatattatgaaat 45914115  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45914114 actatatgataatcataacatttatctaaaatattttgttacctattacc 45914065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39268446 - 39268301
Alignment:
Q  213 ttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatac 311  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39268446 ttaacctattatgttacgttgcggtaccaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtaccgtaccaacgtttatgtttcttaatattatgaaatac 39268347  T
Q  312 taaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatta 357  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39268346 tatatgacaattatgacattcatctaaagtactttgttacctatta 39268301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Original strand, 43991652 - 43991749
Alignment:
Q  259 aattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctatta 357  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  43991652 aattatgttatggtacggtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactatataacaattatgacattcatct-aactattctgttacttatta 43991749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49193278 - 49193219
Alignment:
Q  244 gacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatatt 302  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49193278 gacgatgtcatggaaatattatgttatggtacagtaccaacgtatatgcttcttaatatt 49193219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 302
Target Start/End: Original strand, 8998722 - 8998807
Alignment:
Q  218 atataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatatt 302  Q
    |||| |||||| |||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  8998722 atattatgttatgttacaataccaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtagagtaccaacatatatgcttcttagtatt 8998807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9195 - 8850
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnn-taaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9195 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaataaaataaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggt 9097  T
Q  115 ggcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactt 214  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9096 gacgaacggttaataggcacatgagtcctatagggatcctatatatttcatggatggcggctgccccttttcattagtacccagctccgtccctgtactt 8997  T
Q  215 aacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacg--tctatgcttcttaatattatgaaatact 312  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8996 aacctataatattatcttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgcctatatgcttcttaatattatgaaatact 8897  T
Q  313 aaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8896 atatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 8850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Original strand, 38329146 - 38329453
Alignment:
Q  16 atgagtggatagtaagaaaaaagagaacacgagtggacctttaattnnnnnnnntaaaatttagtataagtgaaccaaagtggatatgaaagcatgggtg 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38329146 atgagtggatggtaagaaaaaagagaacatgagtggacctttaattaaaaaaa-taaaatttagtataagtgaaccaa-gtggatatgaaagcatgggtg 38329243  T
Q  116 gcgaatggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccctgtactta 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  38329244 gcgaacggttaatatgcacatgagtcctataggggtcctatatatttcatgggtggcggttgccccttttcattagtatctagctttgtccctgcactta 38329343  T
Q  216 acatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaa 315  Q
    || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38329344 acctataatgttgtgttacgatatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatgctacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactata 38329443  T
Q  316 tgacaatcat 325  Q
    ||||| ||||    
T  38329444 tgacattcat 38329453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 37995261 - 37995410
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37995261 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacaataccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 37995360  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37995361 actatatgacaatcatgacatttatctaaactattttgttacctactacc 37995410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 25236528 - 25236676
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25236528 tacttaacctattatgttacgttacgatatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattataaaat 25236627  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25236628 attatatgacaatcatgacatttatctaaacta-tttgttacctattacc 25236676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 210 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44240692 - 44240556
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44240692 tacttaacctattatgttacgttacggtaccaaggacgatgtcatgaaaatattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 44240593  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44240592 tactatatgacaatcatgacattgatctaaactattt 44240556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10128760 - 10128611
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10128760 tacttaacctattatgttacgttacggtaccaaggacaatgtcatggaaatattatgttatggtacaatac-aacgtctatgcttcttaatattatgaaa 10128662  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10128661 tattgtatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 10128611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 335
Target Start/End: Original strand, 6686871 - 6686975
Alignment:
Q  231 ttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaatactaaatgacaatcatgacat 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  6686871 ttacgctatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgctttttaataatatgaaatattatatgacaatcatgaaat 6686970  T
Q  331 tcatc 335  Q
    |||||    
T  6686971 tcatc 6686975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Original strand, 14390427 - 14390477
Alignment:
Q  158 tatttcatgggtggcggctgccccttttcattagtacctagctccgtccct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14390427 tatttcatgggtggcggctgccccatttctttaatacgtagctccgtccct 14390477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 87721 - 87870
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaaattatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaat 309  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  87721 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaaattatgttatggtacagtaccaacgtctatgcttcttaatattttgaaat 87820  T
Q  310 actaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  87821 actatatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacatattacc 87870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1155 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1155
Description:

Target: scaffold1155; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 122
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  272 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacaataccaacgtttatgcttcttaatattatgaaa 173  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  172 tactatatgacaatcgtgacattcatctaaactatttagttacctattacc 122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0642
Description:

Target: scaffold0642; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 34 - 184
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacaataccaacgtttatgcttcttaatattatgaaa 133  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  134 tactatatgacaatcgtgacattcatctaaactatttagttacctattacc 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 9945 - 10095
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9945 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacaataccaacgtttatgcttcttaatattatgaaa 10044  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10045 tactatatgacaatcgtgacattcatctaaactatttagttacctattacc 10095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29035 - 28885
Alignment:
Q  210 tacttaacatataatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatgaaaa-attatgttatggtatagtaccaacgtctatgcttcttaatattatgaaa 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29035 tacttaacctattatgttacgttacggtatcaaggacgatgtcatggaaatattatgttatggtacaataccaacgtttatgcttcttaatattatgaaa 28936  T
Q  309 tactaaatgacaatcatgacattcatctaaactattttgttacctattacc 359  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28935 tactatatgacaatcgtgacattcatctaaactatttagttacctattacc 28885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University