View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16404_low_2 (Length: 418)

Name: NF16404_low_2
Description: NF16404
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16404_low_2
NF16404_low_2
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (191-404)||(54534314-54534525)
chr3 (191-404)||(37698129-37698342)
chr3 (190-404)||(15520128-15520342)
chr3 (198-404)||(38856089-38856295)
chr3 (195-404)||(8042600-8042809)
chr3 (196-404)||(25999382-25999590)
chr3 (195-403)||(42307892-42308100)
chr3 (195-404)||(22174976-22175185)
chr3 (191-404)||(50528918-50529131)
chr3 (196-404)||(25494271-25494479)
chr3 (195-403)||(46452149-46452357)
chr3 (202-404)||(21581042-21581244)
chr3 (199-399)||(32244117-32244317)
chr3 (195-404)||(20842334-20842543)
chr3 (193-403)||(15520627-15520837)
chr3 (193-403)||(24835686-24835896)
chr3 (194-404)||(29445480-29445690)
chr3 (194-404)||(54870160-54870370)
chr3 (195-404)||(12117644-12117853)
chr3 (199-404)||(32359256-32359461)
chr3 (193-404)||(35226438-35226649)
chr3 (193-404)||(38933937-38934147)
chr3 (193-404)||(42104957-42105168)
chr3 (197-403)||(20699144-20699350)
chr3 (192-404)||(44609319-44609531)
chr3 (196-404)||(2895179-2895391)
chr3 (196-403)||(26122808-26123015)
chr3 (192-404)||(53028215-53028419)
chr3 (192-404)||(34700331-34700543)
chr3 (202-404)||(48924989-48925189)
chr3 (223-403)||(44688782-44688961)
chr3 (197-354)||(35643212-35643369)
chr3 (235-404)||(16354379-16354548)
chr3 (202-336)||(50529827-50529961)
chr3 (225-401)||(12915930-12916105)
chr3 (195-330)||(49128042-49128177)
chr3 (316-403)||(24366143-24366230)
chr3 (326-404)||(13696917-13696995)
chr3 (195-252)||(24366085-24366142)
chr3 (356-404)||(50528868-50528916)
chr3 (199-229)||(40240485-40240515)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (195-404)||(6394748-6394957)
chr7 (200-404)||(4477311-4477515)
chr7 (195-404)||(43067963-43068172)
chr7 (190-404)||(7164176-7164390)
chr7 (194-404)||(24792322-24792532)
chr7 (199-404)||(5280861-5281066)
chr7 (195-404)||(30181014-30181223)
chr7 (195-403)||(36890821-36891028)
chr7 (197-404)||(20346487-20346694)
chr7 (195-404)||(42204151-42204361)
chr7 (189-402)||(3511314-3511527)
chr7 (195-404)||(12101168-12101377)
chr7 (195-404)||(42964986-42965195)
chr7 (196-404)||(22649684-22649892)
chr7 (196-404)||(33359080-33359288)
chr7 (201-404)||(1803029-1803232)
chr7 (195-404)||(933282-933491)
chr7 (201-404)||(38866547-38866750)
chr7 (195-404)||(4347270-4347478)
chr7 (199-404)||(9452591-9452796)
chr7 (195-404)||(15655909-15656118)
chr7 (203-402)||(43156718-43156917)
chr7 (190-404)||(25748479-25748693)
chr7 (194-404)||(33846519-33846724)
chr7 (190-404)||(42673457-42673667)
chr7 (196-404)||(12097580-12097788)
chr7 (197-404)||(8630665-8630872)
chr7 (194-404)||(32041538-32041748)
chr7 (198-404)||(46134294-46134500)
chr7 (199-404)||(46891329-46891535)
chr7 (233-402)||(48865665-48865837)
chr7 (190-404)||(16894497-16894701)
chr7 (198-404)||(17753600-17753806)
chr7 (195-404)||(43021570-43021775)
chr7 (195-343)||(19828267-19828415)
chr7 (195-293)||(37704977-37705075)
chr7 (195-400)||(37005805-37006010)
chr7 (195-400)||(43405017-43405223)
chr7 (196-341)||(36849590-36849735)
chr7 (214-292)||(27691428-27691506)
chr7 (196-348)||(30075277-30075426)
chr7 (193-324)||(20163814-20163945)
chr7 (195-348)||(15655458-15655611)
chr7 (190-229)||(22032910-22032950)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (193-401)||(1579033-1579241)
chr5 (193-401)||(1605574-1605782)
chr5 (190-404)||(9008057-9008271)
chr5 (199-404)||(16069356-16069561)
chr5 (196-403)||(5202972-5203179)
chr5 (194-404)||(27679169-27679379)
chr5 (195-400)||(27420857-27421062)
chr5 (194-404)||(8374339-8374548)
chr5 (195-404)||(24105671-24105880)
chr5 (195-404)||(31883143-31883352)
chr5 (195-404)||(33491196-33491405)
chr5 (201-404)||(16737447-16737650)
chr5 (195-404)||(4120936-4121145)
chr5 (193-404)||(33991137-33991348)
chr5 (202-404)||(3386486-3386688)
chr5 (203-401)||(1165604-1165802)
chr5 (190-404)||(3921575-3921789)
chr5 (195-404)||(19358525-19358734)
chr5 (195-404)||(35782644-35782853)
chr5 (195-404)||(20992146-20992355)
chr5 (193-404)||(38598450-38598661)
chr5 (196-401)||(31410476-31410681)
chr5 (233-404)||(26602942-26603113)
chr5 (241-404)||(27025001-27025164)
chr5 (204-337)||(33284642-33284775)
chr5 (186-331)||(20992354-20992503)
chr5 (346-404)||(35420424-35420482)
chr5 (191-348)||(25634577-25634732)
chr5 (208-332)||(31638157-31638281)
chr5 (262-315)||(41818552-41818605)
chr5 (196-228)||(26603108-26603140)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (189-404)||(24113166-24113381)
chr8 (192-403)||(39218772-39218983)
chr8 (196-404)||(14422702-14422910)
chr8 (197-404)||(34842365-34842572)
chr8 (193-404)||(39206582-39206793)
chr8 (195-404)||(18594535-18594744)
chr8 (200-404)||(144397-144601)
chr8 (196-404)||(29938060-29938268)
chr8 (193-404)||(10836755-10836966)
chr8 (199-404)||(13110406-13110611)
chr8 (194-404)||(22260630-22260840)
chr8 (201-402)||(2042526-2042727)
chr8 (195-404)||(6144273-6144482)
chr8 (196-404)||(35118031-35118239)
chr8 (195-403)||(4035845-4036053)
chr8 (192-404)||(7791406-7791618)
chr8 (196-404)||(33278399-33278607)
chr8 (202-404)||(34679457-34679659)
chr8 (192-404)||(7774759-7774971)
chr8 (200-403)||(41575516-41575719)
chr8 (196-404)||(5320563-5320771)
chr8 (196-400)||(38167159-38167363)
chr8 (192-404)||(7811990-7812202)
chr8 (190-404)||(34998896-34999110)
chr8 (203-403)||(44804945-44805145)
chr8 (193-353)||(33287076-33287236)
chr8 (191-401)||(28639272-28639484)
chr8 (199-404)||(8021721-8021918)
chr8 (195-404)||(36491155-36491364)
chr8 (201-404)||(42571598-42571798)
chr8 (200-403)||(66180-66384)
chr8 (195-353)||(40117903-40118061)
chr8 (195-336)||(26783801-26783942)
chr8 (276-401)||(9807339-9807464)
chr8 (195-348)||(2322068-2322221)
chr8 (191-324)||(5005160-5005293)
chr8 (199-284)||(9806875-9806960)
chr8 (199-348)||(39220258-39220407)
chr8 (191-293)||(18683704-18683805)
chr8 (191-293)||(18729266-18729367)
chr8 (367-401)||(33287040-33287074)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (193-404)||(25897368-25897579)
chr1 (193-404)||(29288143-29288352)
chr1 (193-404)||(39260346-39260557)
chr1 (191-404)||(33510476-33510689)
chr1 (195-403)||(16052092-16052300)
chr1 (192-404)||(52753147-52753359)
chr1 (189-404)||(20089461-20089676)
chr1 (193-404)||(1168497-1168708)
chr1 (198-404)||(26663257-26663463)
chr1 (202-403)||(29078519-29078720)
chr1 (191-404)||(42370795-42371008)
chr1 (196-404)||(970524-970734)
chr1 (193-404)||(26580270-26580481)
chr1 (193-404)||(41928495-41928706)
chr1 (195-404)||(46409431-46409642)
chr1 (194-404)||(1940747-1940957)
chr1 (202-404)||(38829072-38829274)
chr1 (193-404)||(2347650-2347862)
chr1 (196-404)||(12682817-12683025)
chr1 (191-403)||(46760958-46761170)
chr1 (196-404)||(52696788-52696996)
chr1 (190-401)||(1170447-1170658)
chr1 (199-404)||(19715161-19715366)
chr1 (195-404)||(32671575-32671784)
chr1 (193-401)||(2473716-2473924)
chr1 (200-404)||(8120870-8121074)
chr1 (196-404)||(15203109-15203317)
chr1 (190-404)||(17591682-17591893)
chr1 (194-403)||(8079710-8079919)
chr1 (195-404)||(43905650-43905859)
chr1 (198-404)||(5215384-5215590)
chr1 (199-404)||(7145207-7145412)
chr1 (195-404)||(13996723-13996932)
chr1 (195-404)||(49146168-49146377)
chr1 (196-404)||(40092488-40092696)
chr1 (196-404)||(51359217-51359424)
chr1 (196-404)||(23498457-23498665)
chr1 (233-404)||(40149497-40149668)
chr1 (194-404)||(15554152-15554354)
chr1 (215-404)||(17587505-17587694)
chr1 (201-401)||(15717787-15717986)
chr1 (198-399)||(6765458-6765659)
chr1 (197-365)||(29695673-29695842)
chr1 (17-144)||(12489653-12489781)
chr1 (195-403)||(38171828-38172023)
chr1 (193-321)||(52086261-52086389)
chr1 (213-347)||(23322897-23323031)
chr1 (190-270)||(5675096-5675176)
chr1 (193-348)||(5217840-5217994)
chr1 (143-192)||(12489420-12489469)
chr1 (90-150)||(12487770-12487830)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (196-404)||(38055154-38055362)
chr4 (193-404)||(1756752-1756963)
chr4 (197-403)||(37968746-37968952)
chr4 (193-395)||(50055098-50055300)
chr4 (191-404)||(28032700-28032913)
chr4 (195-404)||(45424522-45424731)
chr4 (191-404)||(53717452-53717665)
chr4 (195-404)||(54189541-54189750)
chr4 (196-404)||(19913618-19913826)
chr4 (196-402)||(23776449-23776655)
chr4 (190-404)||(27488636-27488850)
chr4 (195-404)||(15241016-15241225)
chr4 (199-403)||(20877047-20877251)
chr4 (199-404)||(31969681-31969886)
chr4 (193-404)||(2481396-2481607)
chr4 (193-404)||(6611348-6611559)
chr4 (193-404)||(35490761-35490972)
chr4 (190-404)||(54412619-54412833)
chr4 (196-404)||(6688615-6688817)
chr4 (200-404)||(19164961-19165164)
chr4 (195-404)||(37464717-37464926)
chr4 (195-404)||(44784905-44785114)
chr4 (195-404)||(50353797-50354006)
chr4 (197-404)||(40428708-40428915)
chr4 (199-401)||(30423556-30423757)
chr4 (195-404)||(14987788-14987997)
chr4 (193-402)||(48909840-48910049)
chr4 (200-404)||(16700782-16700986)
chr4 (200-404)||(53875658-53875862)
chr4 (197-404)||(11639566-11639773)
chr4 (195-401)||(23704200-23704406)
chr4 (193-404)||(27536092-27536299)
chr4 (194-404)||(44379175-44379385)
chr4 (199-404)||(1617084-1617289)
chr4 (194-401)||(43289951-43290158)
chr4 (195-405)||(8932165-8932375)
chr4 (200-404)||(30171581-30171785)
chr4 (197-404)||(47632032-47632240)
chr4 (193-404)||(15669177-15669388)
chr4 (199-401)||(52139203-52139405)
chr4 (199-404)||(8591080-8591285)
chr4 (203-404)||(27583620-27583821)
chr4 (208-404)||(33703850-33704046)
chr4 (195-403)||(53353051-53353267)
chr4 (202-370)||(28360433-28360602)
chr4 (194-404)||(40680026-40680236)
chr4 (194-404)||(55344813-55345023)
chr4 (198-395)||(44375844-44376041)
chr4 (192-401)||(16703818-16704023)
chr4 (208-404)||(38071314-38071504)
chr4 (193-348)||(50053437-50053592)
chr4 (276-404)||(23269034-23269162)
chr4 (199-284)||(23265865-23265950)
chr4 (317-404)||(53408137-53408225)
chr4 (341-404)||(23261874-23261937)
chr4 (195-348)||(44548185-44548339)
chr4 (265-347)||(51780763-51780845)
chr4 (301-404)||(9595890-9595982)
chr4 (355-404)||(50055301-50055350)
chr4 (206-348)||(17493340-17493482)
chr4 (338-404)||(48748197-48748263)
chr4 (194-253)||(9595974-9596032)
chr4 (370-404)||(55344681-55344715)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (193-404)||(36699-36910)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (194-404)||(6086599-6086809)
chr6 (192-404)||(2837540-2837752)
chr6 (196-404)||(26946876-26947084)
chr6 (200-404)||(34887292-34887496)
chr6 (194-404)||(21893452-21893662)
chr6 (195-404)||(3347523-3347732)
chr6 (196-404)||(26704339-26704547)
chr6 (196-404)||(30691850-30692058)
chr6 (195-404)||(18613536-18613745)
chr6 (193-404)||(17261073-17261284)
chr6 (196-404)||(9459562-9459770)
chr6 (192-404)||(11167235-11167447)
chr6 (193-403)||(35198280-35198489)
chr6 (192-397)||(16307015-16307220)
chr6 (196-404)||(20726790-20726994)
chr6 (194-404)||(28199508-28199719)
chr6 (198-404)||(3955769-3955972)
chr6 (207-404)||(1153603-1153800)
chr6 (193-360)||(52832-52999)
chr6 (201-399)||(30698934-30699132)
chr6 (267-404)||(33464399-33464536)
chr6 (290-404)||(53001-53115)
chr6 (199-275)||(33463703-33463779)
chr6 (193-228)||(34800920-34800956)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (192-404)||(6174828-6175040)
chr2 (195-404)||(33906047-33906256)
chr2 (196-404)||(31517215-31517423)
chr2 (194-404)||(18806884-18807094)
chr2 (196-404)||(3873244-3873452)
chr2 (195-404)||(26323186-26323395)
chr2 (194-404)||(42937714-42937925)
chr2 (193-403)||(39635446-39635656)
chr2 (195-383)||(1108276-1108463)
chr2 (190-404)||(2178769-2178983)
chr2 (199-404)||(28329839-28330042)
chr2 (199-404)||(4016039-4016244)
chr2 (195-404)||(4232142-4232351)
chr2 (195-404)||(5733395-5733604)
chr2 (200-404)||(1482903-1483106)
chr2 (195-399)||(19901143-19901346)
chr2 (212-401)||(19383938-19384127)
chr2 (195-404)||(30270679-30270888)
chr2 (199-404)||(850997-851202)
chr2 (193-402)||(30420181-30420378)
chr2 (194-404)||(16588776-16588986)
chr2 (203-396)||(16066302-16066495)
chr2 (191-404)||(44947549-44947755)
chr2 (200-400)||(429817-430017)
chr2 (194-348)||(42446625-42446779)
chr2 (200-348)||(3585291-3585439)
chr2 (235-341)||(22101210-22101316)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (190-399)||(22956-23165)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (195-404)||(10234-10443)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (199-403)||(145246-145450)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (192-404)||(295-507)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (193-404)||(6-217)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (197-404)||(3708-3915)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (194-404)||(6-217)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 54534525 - 54534314
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54534525 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 54534426  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534425 tatcatggttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 54534328  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  54534327 ttcgattctctctg 54534314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 37698342 - 37698129
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37698342 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 37698243  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37698242 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 37698143  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  37698142 ttcgattctctctg 37698129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15520342 - 15520128
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15520342 gattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataac 15520243  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15520242 ttatcatcgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 15520143  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
     ||||||||||||||    
T  15520142 attcgattctctctg 15520128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 198 - 404
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856295
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 38856188  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38856189 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgatt 38856288  T
Q  398 ctctctg 404  Q
     ||||||    
T  38856289 atctctg 38856295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 8042600 - 8042809
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8042600 aggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatc 8042699  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8042700 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 8042799  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  8042800 attctctctg 8042809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 25999382 - 25999590
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25999382 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25999481  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25999482 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 25999581  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  25999582 ttctctctg 25999590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42308100 - 42307892
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42308100 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 42308001  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42308000 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcg 42307901  T
Q  395 attctctct 403  Q
    |||||||||    
T  42307900 attctctct 42307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22175185 - 22174976
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22175185 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 22175086  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22175085 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 22174986  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  22174985 attctctctg 22174976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Original strand, 50528918 - 50529131
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  50528918 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagct 50529017  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50529018 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcc 50529117  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  50529118 ttcgattctctctg 50529131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25494479 - 25494271
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25494479 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25494380  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25494379 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcga 25494280  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  25494279 ttctctctg 25494271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 46452357 - 46452149
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452357 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 46452258  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46452257 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 46452158  T
Q  395 attctctct 403  Q
    |||||||||    
T  46452157 attctctct 46452149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 202 - 404
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581244
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctct 21581241  T
Q  402 ctg 404  Q
    |||    
T  21581242 ctg 21581244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 199 - 399
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244317
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 32244216  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32244217 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 32244316  T
Q  399 t 399  Q
    |    
T  32244317 t 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20842543 - 20842334
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  20842543 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatc 20842444  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20842443 atagtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 20842344  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  20842343 attctctctg 20842334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 403
Target Start/End: Original strand, 15520627 - 15520837
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  15520627 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 15520726  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15520727 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctcctt 15520826  T
Q  393 cgattctctct 403  Q
    |||||||||||    
T  15520827 cgattctctct 15520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24835896 - 24835686
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24835896 ttaggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 24835797  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24835796 ttatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactcctt 24835697  T
Q  393 cgattctctct 403  Q
    ||||| |||||    
T  24835696 cgattatctct 24835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Original strand, 29445480 - 29445690
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29445480 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 29445579  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29445580 catagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 29445679  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
     ||||| ||||    
T  29445680 cattctatctg 29445690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 54870370 - 54870160
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54870370 taggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 54870271  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54870270 catcgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 54870171  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||| ||||    
T  54870170 gattctttctg 54870160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12117853 - 12117644
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12117853 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 12117754  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12117753 atagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 12117654  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  12117653 attctctctg 12117644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359461
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatag 32359355  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32359356 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 32359455  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  32359456 tctctg 32359461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 35226438 - 35226649
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  35226438 ttaggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagctta 35226537  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35226538 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 35226637  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  35226638 cgattctctctg 35226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 38933937 - 38934147
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  38933937 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 38934035  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38934036 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 38934135  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  38934136 cgattctctctg 38934147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 42105168 - 42104957
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42105168 ttagaccccattaggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagttta 42105069  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42105068 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42104969  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    |||||| |||||    
T  42104968 cgattccctctg 42104957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 197 - 403
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699350
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  20699244 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgat 20699343  T
Q  397 tctctct 403  Q
    |||||||    
T  20699344 tctctct 20699350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44609531 - 44609319
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  44609531 tttagaccctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctt 44609432  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  44609431 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctt 44609332  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  44609331 tcgattctctctg 44609319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 2895179 - 2895391
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  2895179 ggccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatca 2895278  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||    
T  2895279 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctcct 2895378  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  2895379 tcgattctctctg 2895391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 403
Target Start/End: Original strand, 26122808 - 26123015
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26122808 ggcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26122907  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||    
T  26122908 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcga 26123007  T
Q  396 ttctctct 403  Q
    ||||||||    
T  26123008 ttctctct 26123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 53028215 - 53028419
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||        |||||||||||||||| ||    
T  53028215 tttaggccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagctt 53028306  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    |||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53028307 atcatattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 53028406  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  53028407 tcgattctctctg 53028419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 34700331 - 34700543
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34700331 tttaggccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt 34700430  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  34700431 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcct 34700530  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    | |||| ||||||    
T  34700531 ttgattatctctg 34700543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48924989
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 48924992  T
Q  402 ctg 404  Q
    |||    
T  48924991 ctg 48924989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 223 - 403
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688961
Alignment:
Q  223 gcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatat 322  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catat 44688880  T
Q  323 ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 403  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 44688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 197 - 354
Target Start/End: Original strand, 35643212 - 35643369
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35643212 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35643311  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcc 354  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35643312 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctcc 35643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 404
Target Start/End: Original strand, 16354379 - 16354548
Alignment:
Q  235 ttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcct 334  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16354379 ttatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcct 16354478  T
Q  335 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  16354479 aaattttcagcttatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctctg 16354548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 401
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916105
Alignment:
Q  225 ttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatattt 324  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattt 12916028  T
Q  325 caataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12916029 aaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 330
Target Start/End: Original strand, 49128042 - 49128177
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  49128042 aggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatc 49128141  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataa 330  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49128142 gtaatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366230
Alignment:
Q  316 gccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 403  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctct 24366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 326 - 404
Target Start/End: Original strand, 13696917 - 13696995
Alignment:
Q  326 aataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  13696917 aataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctctg 13696995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 252
Target Start/End: Original strand, 24366085 - 24366142
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24366085 aggccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528868
Alignment:
Q  356 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctatctg 50528868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 229
Target Start/End: Original strand, 40240485 - 40240515
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240485 cccgtttggattgacttattttgagcttatg 40240515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 6394748 - 6394957
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6394748 aggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 6394847  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394848 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 6394947  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  6394948 attctctctg 6394957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477311
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 4477316  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  4477315 ctctg 4477311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 43068172 - 43067963
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43068172 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 43068073  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43068072 atagtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 43067973  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  43067972 attctctctg 43067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Original strand, 7164176 - 7164390
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7164176 gatttagaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 7164275  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7164276 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7164375  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
     ||||||||| ||||    
T  7164376 tttcgattctatctg 7164390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24792532 - 24792322
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24792532 taggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 24792433  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24792432 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 24792333  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  24792332 gattctctctg 24792322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 5280861 - 5281066
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5280861 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 5280960  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5280961 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 5281060  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  5281061 tctctg 5281066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30181223 - 30181014
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30181223 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 30181124  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30181123 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcg 30181024  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  30181023 attctctctg 30181014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36891028 - 36890821
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36891028 aggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 36890930  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36890929 atagtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 36890830  T
Q  395 attctctct 403  Q
    |||||||||    
T  36890829 attctctct 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 197 - 404
Target Start/End: Original strand, 20346487 - 20346694
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20346487 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 20346586  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20346587 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgat 20346686  T
Q  397 tctctctg 404  Q
    ||||||||    
T  20346687 tctctctg 20346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 42204151 - 42204361
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42204151 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttat 42204250  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42204251 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttc 42204350  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  42204351 gattctctctg 42204361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 402
Target Start/End: Original strand, 3511314 - 3511527
Alignment:
Q  189 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 288  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3511314 agattaaggtcccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatag 3511413  T
Q  289 tttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacct 388  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3511414 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 3511513  T
Q  389 ccttcgattctctc 402  Q
    ||||||||||||||    
T  3511514 ccttcgattctctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12101377 - 12101168
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12101377 aggccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 12101278  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12101277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 12101178  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  12101177 attctctctg 12101168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 42965195 - 42964986
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42965195 aggccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 42965096  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42965095 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 42964996  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  42964995 attctctctg 42964986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22649892 - 22649684
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649892 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 22649793  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22649792 taatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcga 22649693  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    || ||||||    
T  22649692 ttttctctg 22649684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33359288 - 33359080
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33359288 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33359189  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33359188 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33359089  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  33359088 ttctctctg 33359080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 201 - 404
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803232
Alignment:
Q  201 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 400  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 1803228  T
Q  401 tctg 404  Q
    ||||    
T  1803229 tctg 1803232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 933282 - 933491
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933282 aggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 933381  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  933382 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 933481  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    | ||||||||    
T  933482 aatctctctg 933491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 201 - 404
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866750
Alignment:
Q  201 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatc 38866746  T
Q  401 tctg 404  Q
    ||||    
T  38866747 tctg 38866750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 4347270 - 4347478
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4347270 aggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttacc 4347369  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  4347370 atagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc-ccttct 4347468  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  4347469 attctctctg 4347478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452796
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 9452790  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  9452791 tctctg 9452796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 15655909 - 15656118
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15655909 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatc 15656008  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15656009 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcg 15656108  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  15656109 attctctctg 15656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 203 - 402
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156917
Alignment:
Q  203 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  303 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 402  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43156917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Original strand, 25748479 - 25748693
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25748479 gattttggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 25748578  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25748579 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 25748678  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||| ||||||    
T  25748679 cttcgattatctctg 25748693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33846724 - 33846519
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33846724 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 33846625  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33846624 catagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 33846530  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  33846529 gattctctctg 33846519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Original strand, 42673457 - 42673667
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||     
T  42673457 gatttatgctccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagc 42673552  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42673553 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 42673652  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  42673653 cttcgattctctctg 42673667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12097788 - 12097580
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12097788 ggccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 12097689  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12097688 tagtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12097589  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  12097588 ttctctctg 12097580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 197 - 404
Target Start/End: Original strand, 8630665 - 8630872
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630665 gccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8630764  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  8630765 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgat 8630864  T
Q  397 tctctctg 404  Q
    ||||||||    
T  8630865 tctctctg 8630872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Original strand, 32041538 - 32041748
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32041538 taggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 32041637  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||    
T  32041638 catagtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattc 32041737  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  32041738 gattctctctg 32041748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 198 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134294
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  46134400 gtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgatt 46134301  T
Q  398 ctctctg 404  Q
    |||||||    
T  46134300 ctctctg 46134294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891329
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc-ttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgatt 46891336  T
Q  398 ctctctg 404  Q
     ||||||    
T  46891335 gtctctg 46891329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 402
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865837
Alignment:
Q  233 gcttatctactcccataagc---ttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaata 329  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  330 agcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 402  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 48865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16894701 - 16894497
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16894701 gattaaggccccgtttggattggcttattttgagc----------ttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagt 16894612  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  16894611 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatc 16894512  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||| ||||    
T  16894511 cttcgattctttctg 16894497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 198 - 404
Target Start/End: Original strand, 17753600 - 17753806
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17753600 ccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacata 17753699  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17753700 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgatt 17753799  T
Q  398 ctctctg 404  Q
    |||||||    
T  17753800 ctctctg 17753806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 43021775 - 43021570
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  43021775 aggccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttatt 43021676  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||     | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43021675 atagtttcataagctgcttatggcatatttc----ggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 43021580  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  43021579 attctctctg 43021570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 195 - 343
Target Start/End: Original strand, 19828267 - 19828415
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19828267 aggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatc 19828366  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttca 343  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19828367 atagtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 293
Target Start/End: Original strand, 37704977 - 37705075
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37704977 aggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37006010 - 37005805
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  37006010 aggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatc 37005911  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttat-gaatttatgtgacctccttc 393  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| |||||| |    |||||| || ||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  37005910 gtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagcttaacacaaggcttatcacggagcttatggaattcaag-gacctccttc 37005812  T
Q  394 gattctc 400  Q
    |||||||    
T  37005811 gattctc 37005805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 400
Target Start/End: Original strand, 43405017 - 43405223
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43405017 aggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatc 43405116  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttat-gaatttatgtgacctccttc 393  Q
     |  ||||||||| || || | | |||||| |||||||| || |||| |||||| |    |||||| || ||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  43405117 gtaatttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagcttaacacaaggcttatcacggagcttatggaattcaagggacctccttc 43405216  T
Q  394 gattctc 400  Q
    |||||||    
T  43405217 gattctc 43405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36849735 - 36849590
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||    
T  36849735 ggccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatca 36849636  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttt 341  Q
       |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  36849635 caatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27691506 - 27691428
Alignment:
Q  214 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27691506 ttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatatttta 27691428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30075426 - 30075277
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||  ||| | |   |||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  30075426 ggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagcttat-a 30075329  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    |  |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  30075328 t-atttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 20163814 - 20163945
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||   ||||| | ||| | || | |||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  20163814 ttaggccctttttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagctta 20163913  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatattt 324  Q
    |||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  20163914 tcacagtttcataagctgcttatagcatattt 20163945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15655611 - 15655458
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  15655611 aggccgcgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttacc 15655512  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    |   ||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  15655511 acaattttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22032950 - 22032910
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattga-cttattttgagcttatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22032950 gatttaggccccgtttggattgagcttattttgagcttatg 22032910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 193 - 401
Target Start/End: Original strand, 1579033 - 1579241
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579033 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 1579132  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1579133 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1579232  T
Q  393 cgattctct 401  Q
    |||||||||    
T  1579233 cgattctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 193 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1605782 - 1605574
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605782 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 1605683  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1605682 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1605583  T
Q  393 cgattctct 401  Q
    |||||||||    
T  1605582 cgattctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9008271 - 9008057
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9008271 gattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 9008172  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9008171 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctt 9008072  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  9008071 cttcgattctctctg 9008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069561
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 16069555  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  16069556 tctctg 16069561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 196 - 403
Target Start/End: Original strand, 5202972 - 5203179
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5202972 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 5203071  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5203072 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttcttcga 5203171  T
Q  396 ttctctct 403  Q
    ||||||||    
T  5203172 ttctctct 5203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27679379 - 27679169
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27679379 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 27679280  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27679279 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 27679180  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  27679179 gattctctctg 27679169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 400
Target Start/End: Original strand, 27420857 - 27421062
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27420857 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatc 27420956  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27420957 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 27421056  T
Q  395 attctc 400  Q
    ||||||    
T  27421057 attctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8374548 - 8374339
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374548 taggccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 8374449  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8374448 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttc 8374350  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  8374349 gattctctctg 8374339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24105880 - 24105671
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24105880 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 24105781  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24105780 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 24105681  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  24105680 attctctctg 24105671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 31883143 - 31883352
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883143 aggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 31883242  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31883243 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 31883342  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  31883343 attctctctg 31883352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33491405 - 33491196
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33491405 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33491306  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33491305 atagtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33491206  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  33491205 attctctctg 33491196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 201 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737447
Alignment:
Q  201 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 16737451  T
Q  401 tctg 404  Q
    ||||    
T  16737450 tctg 16737447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 4120936 - 4121145
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4120936 aggccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatc 4121035  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4121036 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttg 4121135  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  4121136 attctctctg 4121145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 33991137 - 33991348
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33991137 ttaggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 33991236  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33991237 tcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatt 33991336  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  33991337 cgattctctctg 33991348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 202 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386486
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3386588 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttcgattatct 3386489  T
Q  402 ctg 404  Q
    |||    
T  3386488 ctg 3386486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 203 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165604
Alignment:
Q  203 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  303 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Original strand, 3921575 - 3921789
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  3921575 gattaaggtcccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 3921674  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3921675 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctc 3921774  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  3921775 cttcgattctctctg 3921789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 19358525 - 19358734
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19358525 aggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 19358624  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19358625 atagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcg 19358724  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  19358725 attctctctg 19358734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35782853 - 35782644
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35782853 aggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35782754  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35782753 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctta-caaggagcttatgaatttatgtaacctcattc 35782655  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  35782654 gattctctctg 35782644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20992355 - 20992146
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20992355 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatc 20992256  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20992255 atagtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcg 20992156  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  20992155 attctctctg 20992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 38598661 - 38598450
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38598661 ttaggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagctta 38598562  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38598561 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 38598462  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  38598461 cgattctctctg 38598450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 196 - 401
Target Start/End: Original strand, 31410476 - 31410681
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  31410476 ggccgcgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatca 31410575  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31410576 tagttttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcga 31410675  T
Q  396 ttctct 401  Q
    ||||||    
T  31410676 ttctct 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26603113 - 26602942
Alignment:
Q  233 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagc 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26603113 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagc 26603014  T
Q  333 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
     ||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26603013 ataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctctg 26602942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 404
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025164
Alignment:
Q  241 actcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattt 340  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  341 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27025101 tcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctctctg 27025164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 204 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  204 ttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  304 taagctgcttatgccatatttcaataagcctaaa 337  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20992503 - 20992354
Alignment:
Q  186 acaagatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgt----gggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaata 281  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992503 acaacattaaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaata 20992404  T
Q  282 aaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataag 331  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20992403 aaaatagcatatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420424
Alignment:
Q  346 ttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 35420424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 348
Target Start/End: Original strand, 25634577 - 25634732
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||  |||||||| ||| |||   ||||||||||||||   ||||||| |    
T  25634577 atttaggccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataa--taaaatagct 25634674  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    ||| |   |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634675 tataacaatttcataagccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 332
Target Start/End: Original strand, 31638157 - 31638281
Alignment:
Q  208 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataag 307  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  ||||||   ||| |||||    
T  31638157 attgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataag 31638256  T
Q  308 ctgcttatgccatatttcaataagc 332  Q
    || |||||| ||||||| |||||||    
T  31638257 cttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  262 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttat 315  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26603140 - 26603108
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttat 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26603140 ggccccgtttggattggcttattttgagcttat 26603108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24113381 - 24113166
Alignment:
Q  189 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24113381 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacag 24113282  T
Q  289 tttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacct 388  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24113281 attatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 24113182  T
Q  389 ccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||||    
T  24113181 ccttcgattctctctg 24113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 192 - 403
Target Start/End: Original strand, 39218772 - 39218983
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39218772 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggttt 39218871  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39218872 atcatagcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctcct 39218971  T
Q  392 tcgattctctct 403  Q
    ||||||||||||    
T  39218972 tcgattctctct 39218983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 14422702 - 14422910
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14422702 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 14422801  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14422802 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 14422901  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  14422902 ttctctctg 14422910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 197 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34842572 - 34842365
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842572 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 34842473  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34842472 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgat 34842373  T
Q  397 tctctctg 404  Q
    ||||||||    
T  34842372 tctctctg 34842365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 39206582 - 39206793
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39206582 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 39206681  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39206682 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39206781  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  39206782 cgattctctctg 39206793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 18594535 - 18594744
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18594535 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 18594634  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18594635 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 18594734  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  18594735 attctctctg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144601
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 144596  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  144597 ctctg 144601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 29938060 - 29938268
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29938060 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 29938159  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29938160 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 29938259  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  29938260 ttctctctg 29938268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10836966 - 10836755
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836966 ttaggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 10836867  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10836866 tcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttt 10836767  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||| ||||||    
T  10836766 cgattatctctg 10836755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110611
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattc 13110605  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  13110606 tctctg 13110611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22260840 - 22260630
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22260840 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttat 22260741  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22260740 cctagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 22260641  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  22260640 gattctctctg 22260630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 201 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042526
Alignment:
Q  201 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 2042528  T
Q  401 tc 402  Q
    ||    
T  2042527 tc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6144482 - 6144273
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6144482 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6144383  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6144382 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 6144283  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  6144282 attctctctg 6144273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35118239 - 35118031
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35118239 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35118140  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35118139 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcga 35118040  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  35118039 ttctctctg 35118031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Original strand, 4035845 - 4036053
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4035845 aggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatc 4035944  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4035945 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 4036044  T
Q  395 attctctct 403  Q
    |||||||||    
T  4036045 attctctct 4036053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 7791406 - 7791618
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7791406 tttagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 7791505  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7791506 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 7791605  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  7791606 tcgattctctctg 7791618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 33278399 - 33278607
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33278399 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 33278598  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  33278599 ttctctctg 33278607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 202 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679457
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattcttt 34679460  T
Q  402 ctg 404  Q
    |||    
T  34679459 ctg 34679457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 7774759 - 7774971
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7774759 tttaggcctcgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 7774858  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7774859 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 7774958  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  7774959 tcgattctctctg 7774971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 200 - 403
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575719
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 41575715  T
Q  400 ctct 403  Q
    ||||    
T  41575716 ctct 41575719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 5320563 - 5320771
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5320563 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatca 5320662  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5320663 tagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 5320762  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  5320763 ttctctctg 5320771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 196 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38167363 - 38167159
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38167363 ggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatca 38167264  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38167263 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 38167164  T
Q  396 ttctc 400  Q
    |||||    
T  38167163 ttctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 7811990 - 7812202
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7811990 tttaggccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 7812089  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7812090 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcat 7812189  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  7812190 tcgattctctctg 7812202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34999110 - 34998896
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34999110 gattaaggtcccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 34999011  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  34999010 ttatcttagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctc 34998911  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  34998910 cttcgattctctctg 34998896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 203 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804945
Alignment:
Q  203 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  303 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 402  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 44804946  T
Q  403 t 403  Q
    |    
T  44804945 t 44804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 193 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33287236 - 33287076
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33287236 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagttta 33287137  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctc 353  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287136 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 33287076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 191 - 401
Target Start/End: Original strand, 28639272 - 28639484
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccata----agcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 286  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28639272 atttaggtcccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaat 28639371  T
Q  287 agtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgac 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||    
T  28639372 agtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaac 28639469  T
Q  387 ctccttcgattctct 401  Q
    |||||||||||||||    
T  28639470 ctccttcgattctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021918
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  8021821 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattc 8021912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 36491155 - 36491364
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36491155 aggccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 36491254  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36491255 atagtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctctttcg 36491354  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  36491355 attctctctg 36491364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 201 - 404
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571798
Alignment:
Q  201 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctc 42571794  T
Q  401 tctg 404  Q
    ||||    
T  42571795 tctg 42571798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66180
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccc-tccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  66284 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattc 66185  T
Q  399 tctct 403  Q
    |||||    
T  66184 tctct 66180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 195 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 40118061 - 40117903
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40118061 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 40117962  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctc 353  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40117961 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26783942 - 26783801
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26783942 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatc 26783843  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaa 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26783842 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 276 - 401
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  276 taaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 375  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  376 atttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2322221 - 2322068
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  2322221 aggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatc 2322122  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    |   |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  2322121 acaatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 5005160 - 5005293
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  5005160 atttaggtcctgtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagct 5005259  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatattt 324  Q
    |||  |  | |||||| |||||||||| ||||||    
T  5005260 tatgctactctcataaactgcttatgctatattt 5005293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 348
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220407
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||         
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  39220358 tttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 293
Target Start/End: Original strand, 18683704 - 18683805
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| ||| |||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  18683704 atttaagcctcgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtt 18683802  T
Q  291 tat 293  Q
    |||    
T  18683803 tat 18683805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 293
Target Start/End: Original strand, 18729266 - 18729367
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||  |||||||| ||| |||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  18729266 atttaagcctcgtttggactgacttattttaagcttattggagcttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaat-aataaaaatagtt 18729364  T
Q  291 tat 293  Q
    |||    
T  18729365 tat 18729367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33287074 - 33287040
Alignment:
Q  367 agcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287074 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33287040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 25897368 - 25897579
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25897368 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25897467  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25897468 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 25897567  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  25897568 cgattctctctg 25897579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 29288143 - 29288352
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288143 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 29288242  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  29288243 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctcctt 29288340  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  29288341 cgattctctctg 29288352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 39260557 - 39260346
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39260557 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 39260458  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39260457 tcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39260358  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  39260357 cgattctctctg 39260346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Original strand, 33510476 - 33510689
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33510476 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtt 33510575  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33510576 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 33510675  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  33510676 ttcgattctctctg 33510689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Original strand, 16052092 - 16052300
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16052092 aggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 16052191  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16052192 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 16052291  T
Q  395 attctctct 403  Q
    |||||||||    
T  16052292 attctctct 16052300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 52753359 - 52753147
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52753359 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 52753260  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52753259 atcatagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 52753160  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  52753159 tcgattctctctg 52753147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 404
Target Start/End: Original strand, 20089461 - 20089676
Alignment:
Q  189 agatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20089461 agattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatag 20089560  T
Q  289 tttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacct 388  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20089561 cttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 20089660  T
Q  389 ccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||||    
T  20089661 ccttcgattctctctg 20089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 1168497 - 1168708
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1168497 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 1168596  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1168597 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctt 1168696  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
     |||||||||||    
T  1168697 tgattctctctg 1168708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 198 - 404
Target Start/End: Original strand, 26663257 - 26663463
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  26663257 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 26663356  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26663357 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 26663456  T
Q  398 ctctctg 404  Q
    |||||||    
T  26663457 ctctctg 26663463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 202 - 403
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078720
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 29078718  T
Q  402 ct 403  Q
    ||    
T  29078719 ct 29078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 42371008 - 42370795
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  42371008 attttggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaact 42370909  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42370908 tatcatagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 42370809  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  42370808 ttcgattctctctg 42370795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 970734 - 970524
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc- 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  970734 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 970635  T
Q  295 -atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  970634 tatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 970535  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  970534 gattctctctg 970524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26580481 - 26580270
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26580481 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagctta 26580382  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26580381 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26580282  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||| ||||||    
T  26580281 cgattatctctg 26580270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41928706 - 41928495
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928706 ttaggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 41928607  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  41928606 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 41928507  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  41928506 cgattctctctg 41928495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 46409431 - 46409642
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46409431 aggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 46409530  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409531 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 46409630  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  46409631 cgattctctctg 46409642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1940957 - 1940747
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1940957 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 1940858  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1940857 catagtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 1940758  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
     ||||||||||    
T  1940757 aattctctctg 1940747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 202 - 404
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829274
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctct 38829271  T
Q  402 ctg 404  Q
    |||    
T  38829272 ctg 38829274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 2347650 - 2347862
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2347650 ttaggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 2347749  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccata-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2347750 tcatagtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcct 2347849  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  2347850 tcgattctctctg 2347862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 12682817 - 12683025
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12682817 ggccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 12682916  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12682917 tagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcga 12683016  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  12683017 ttctctctg 12683025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 191 - 403
Target Start/End: Original strand, 46760958 - 46761170
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46760958 atttaggtcccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 46761057  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  46761058 tatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttcc 46761157  T
Q  391 ttcgattctctct 403  Q
    |||||||||||||    
T  46761158 ttcgattctctct 46761170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 52696788 - 52696996
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  52696788 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 52696987  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    || ||||||    
T  52696988 ttatctctg 52696996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 190 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1170658 - 1170447
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1170658 gattcaggccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagc 1170559  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1170558 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 1170459  T
Q  390 cttcgattctct 401  Q
    ||||||||||||    
T  1170458 cttcgattctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715161
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 19715167  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  19715166 tctctg 19715161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 32671575 - 32671784
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32671575 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 32671674  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32671675 atagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcg 32671774  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  32671775 attctctctg 32671784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 193 - 401
Target Start/End: Original strand, 2473716 - 2473924
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2473716 ttaggtcccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 2473815  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2473816 ttatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctcctt 2473915  T
Q  393 cgattctct 401  Q
    ||| |||||    
T  2473916 cgagtctct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121074
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 8121069  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  8121070 ctctg 8121074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203317
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15203109 ggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatca 15203208  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15203209 tagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 15203308  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  15203309 ttctctctg 15203317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Original strand, 17591682 - 17591893
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17591682 gatttaggccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagc 17591778  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17591779 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 17591878  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  17591879 cttcgattctctctg 17591893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 194 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8079919 - 8079710
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8079919 taggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 8079820  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  8079819 catagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttt 8079720  T
Q  394 gattctctct 403  Q
    ||||||||||    
T  8079719 gattctctct 8079710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 43905650 - 43905859
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43905650 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 43905749  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43905750 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcg 43905849  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||| ||||||    
T  43905850 attgtctctg 43905859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 198 - 404
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215590
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5215484 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 5215583  T
Q  398 ctctctg 404  Q
     ||||||    
T  5215584 atctctg 5215590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 7145207 - 7145412
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttatttt-gagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7145207 cccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcata 7145305  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7145306 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgatt 7145405  T
Q  398 ctctctg 404  Q
    |||||||    
T  7145406 ctctctg 7145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13996932 - 13996723
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  13996932 aggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttata 13996833  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13996832 atggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcg 13996733  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  13996732 attctctctg 13996723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 49146168 - 49146377
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49146168 aggctccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 49146267  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||    
T  49146268 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattcg 49146367  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  49146368 attctctctg 49146377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 40092488 - 40092696
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  40092488 ggccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatca 40092587  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  40092588 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcga 40092687  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    || ||||||    
T  40092688 ttttctctg 40092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 51359424 - 51359217
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51359424 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatca 51359326  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51359325 tagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcga 51359226  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  51359225 ttctctctg 51359217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 23498457 - 23498665
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23498457 ggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatca 23498556  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23498557 tagtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 23498656  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  23498657 ttctctctg 23498665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149668
Alignment:
Q  233 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  333 ctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 40149668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15554354 - 15554152
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  15554354 taggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag----- 15554260  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    |||   ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15554259 cat---ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 15554163  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  15554162 gattctctctg 15554152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 215 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587505
Alignment:
Q  215 tattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgctta 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  315 tgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctttctg 17587505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 201 - 401
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717986
Alignment:
Q  201 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 400  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctc 15717985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 198 - 399
Target Start/End: Original strand, 6765458 - 6765659
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6765458 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 6765557  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  6765558 ttttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgatt 6765657  T
Q  398 ct 399  Q
    ||    
T  6765658 ct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 197 - 365
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695842
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagctttt-ttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaag 365  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12489781 - 12489653
Alignment:
Q  17 aaaaaatgggaagaacgtgattgtaattgtatataatcgagagggaatt-ggtcctttccttcatgtaatgtgttgtgtgtattcattgcaatttgcaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12489781 aaaaaatgggaagaacgtgattgtaattgtatataatcgagagggaatttggtcctttccttcatgtaatgtgttgtgtgtattcattgcaatttgcaag 12489682  T
Q  116 gtggggaaaatttgttaatttgtataatt 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12489681 gtgtggaaaatttgttaatttgtataatt 12489653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Original strand, 38171828 - 38172023
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38171828 aggctccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatc 38171927  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38171928 atagtttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 38172014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 52086261 - 52086389
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  52086261 ttaggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataactta 52086360  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccata 321  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52086361 tcataatttcataagctgcttatgccata 52086389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23323031 - 23322897
Alignment:
Q  213 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgct 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23323031 cttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgct 23322932  T
Q  313 tatgccatatttcaataagcctaaattttcagctt 347  Q
    |||| |||| || |||||||  ||||||| |||||    
T  23322931 tatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 270
Target Start/End: Original strand, 5675096 - 5675176
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgg 270  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  5675096 gattaaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5217994 - 5217840
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||    ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5217994 ttaggcctcgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagctta 5217896  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    |     |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||  |||||| ||||||    
T  5217895 taccaatttcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12489469 - 12489420
Alignment:
Q  143 ttgtggaaaatgatatcgcatgtgttgtgtcatgatgtggggtacaagat 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12489469 ttgtcgaaaatgatatcgcatgtgttgtgtcatgatgtggggtagaagat 12489420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12487830 - 12487770
Alignment:
Q  90 tgtgtgtattcattgcaatttgcaaggtggggaaaatttgttaatttgtataattgtggaa 150  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  12487830 tgtgtgaattcagtacagtttgcaaggtggggaaaatttgttacttactataattgtggaa 12487770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 38055154 - 38055362
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38055154 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 38055253  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38055254 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcga 38055353  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  38055354 ttctctctg 38055362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1756963 - 1756752
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1756963 ttagaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatta 1756864  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1756863 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttt 1756764  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  1756763 cgattctctctg 1756752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 197 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37968952 - 37968746
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37968952 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 37968853  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968852 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 37968753  T
Q  397 tctctct 403  Q
    |||||||    
T  37968752 tctctct 37968746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 193 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 50055300 - 50055098
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  50055300 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagctta 50055201  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50055200 tcatggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50055101  T
Q  393 cga 395  Q
    |||    
T  50055100 cga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28032913 - 28032700
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032913 atttaggccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 28032814  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28032813 tatcatagtatcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 28032714  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||| ||||||    
T  28032713 ttcgattatctctg 28032700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 45424731 - 45424522
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424731 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 45424632  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45424631 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 45424532  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||| ||||    
T  45424531 attctttctg 45424522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 53717665 - 53717452
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  53717665 atttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagct 53717566  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53717565 tatcatagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 53717466  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  53717465 ttcgattctctctg 53717452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 54189541 - 54189750
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54189541 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54189640  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54189641 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 54189740  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  54189741 attctctctg 54189750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19913826 - 19913618
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  19913826 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatca 19913727  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19913726 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 19913627  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  19913626 ttctctctg 19913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 196 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23776655 - 23776449
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23776655 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23776556  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23776555 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcga 23776456  T
Q  396 ttctctc 402  Q
    |||||||    
T  23776455 ttctctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27488850 - 27488636
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27488850 gatttaggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 27488751  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27488750 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctc 27488651  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  27488650 cttcgattctctctg 27488636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15241225 - 15241016
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15241225 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 15241126  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15241125 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 15241026  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  15241025 attctctctg 15241016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 199 - 403
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877251
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 20877146  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  20877147 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagattc 20877246  T
Q  399 tctct 403  Q
    |||||    
T  20877247 tctct 20877251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969886
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 31969880  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  31969881 tctctg 31969886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2481607 - 2481396
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  2481607 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 2481508  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2481507 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2481408  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  2481407 cgattctctctg 2481396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6611559 - 6611348
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6611559 ttaggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 6611460  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6611459 tcatagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 6611360  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  6611359 cgattctctctg 6611348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35490972 - 35490761
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35490972 ttaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 35490873  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35490872 tcatagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccacctt 35490773  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  35490772 cgattctctctg 35490761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Original strand, 54412619 - 54412833
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  54412619 gatttagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 54412718  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54412719 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctc 54412818  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  54412819 cttcgattctctctg 54412833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6688817 - 6688615
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6688817 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6688717 tagttt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 6688624  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  6688623 ttctctctg 6688615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19164961
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  19165064 tttcataagctgcttatgccatattt-aataagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgtttt 19164967  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  19164966 tctctg 19164961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 37464717 - 37464926
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37464717 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 37464816  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37464817 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcg 37464916  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  37464917 attctctctg 37464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44785114 - 44784905
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44785114 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatc 44785015  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44785014 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 44784915  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  44784914 attctctctg 44784905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 50353797 - 50354006
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50353797 aggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatg 50353896  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50353897 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 50353996  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||| ||||||    
T  50353997 attatctctg 50354006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 197 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40428915 - 40428708
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40428915 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40428816  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40428815 agtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 40428716  T
Q  397 tctctctg 404  Q
    ||||||||    
T  40428715 tctctctg 40428708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30423757 - 30423556
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  30423757 cccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 30423658  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30423657 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgattc 30423559  T
Q  399 tct 401  Q
    |||    
T  30423558 tct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 14987788 - 14987997
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14987788 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 14987887  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14987888 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 14987987  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||| ||||    
T  14987988 attctttctg 14987997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 402
Target Start/End: Original strand, 48909840 - 48910049
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  48909840 ttaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 48909939  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48909940 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 48910039  T
Q  393 cgattctctc 402  Q
    ||||||||||    
T  48910040 cgattctctc 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700986
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattct 16700981  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  16700982 ctctg 16700986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875862
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattct 53875857  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  53875858 ctctg 53875862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 197 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11639773 - 11639566
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11639773 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11639674  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  11639673 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 11639574  T
Q  397 tctctctg 404  Q
    ||||||||    
T  11639573 tctctctg 11639566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23704406 - 23704200
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704406 aggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 23704307  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23704306 atagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttg 23704207  T
Q  395 attctct 401  Q
    |||||||    
T  23704206 attctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27536299 - 27536092
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536299 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 27536204  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27536203 tcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 27536104  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  27536103 cgattctctctg 27536092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44379385 - 44379175
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44379385 taggccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 44379286  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  44379285 catagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttc 44379186  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  44379185 gattctctctg 44379175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617289
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 1617283  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  1617284 tctctg 1617289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 194 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43290158 - 43289951
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43290158 taggctccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttat 43290059  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43290058 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 43289959  T
Q  394 gattctct 401  Q
    ||||||||    
T  43289958 gattctct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 195 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 8932375 - 8932165
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  8932375 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaac 8932276  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8932275 gtagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcg 8932176  T
Q  395 attctctctgc 405  Q
    |||||||||||    
T  8932175 attctctctgc 8932165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171785
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattct 30171780  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  30171781 ctctg 30171785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 197 - 404
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632240
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  47632132 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaa 47632231  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  47632232 ttctctctg 47632240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 15669177 - 15669388
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15669177 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 15669276  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15669277 tcatagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 15669376  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    | ||||||||||    
T  15669377 ccattctctctg 15669388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 199 - 401
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139405
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 52139402  T
Q  399 tct 401  Q
    |||    
T  52139403 tct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591080
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8591185 tttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttc 8591086  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  8591085 tctctg 8591080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 203 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583620
Alignment:
Q  203 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  303 ataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctc 27583622  T
Q  403 tg 404  Q
    ||    
T  27583621 tg 27583620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 208 - 404
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33704046
Alignment:
Q  208 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  308 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33703950 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33704046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Original strand, 53353051 - 53353267
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagctta----tgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53353051 aggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 53353150  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttca----ataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgac 386  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  53353151 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaac 53353250  T
Q  387 ctccttcgattctctct 403  Q
    |||||||||||||||||    
T  53353251 ctccttcgattctctct 53353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  202 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  302 cataagctgcttatgcca-tatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 370  Q
     ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40680236 - 40680026
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40680236 taggcccgctttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttat 40680137  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  40680136 catagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattc 40680037  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  40680036 gattctctctg 40680026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55345023 - 55344813
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55345023 taggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 55344924  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    |||  || ||| || || |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  55344923 catatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttt 55344824  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  55344823 gattctctctg 55344813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 198 - 395
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44376041
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44375944 gtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 401
Target Start/End: Original strand, 16703818 - 16704023
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16703818 tttaggcctcgtttggattgactta----gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagttt 16703913  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  16703914 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaaccccct 16704013  T
Q  392 tcgattctct 401  Q
    ||||||||||    
T  16704014 tcgattctct 16704023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 208 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071314
Alignment:
Q  208 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataag 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  308 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgattctctctg 38071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 348
Target Start/End: Original strand, 50053437 - 50053592
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  50053437 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagctta 50053536  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  50053537 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 276 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269034
Alignment:
Q  276 taaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 375  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  376 atttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctctg 23269034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 317 - 404
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408225
Alignment:
Q  317 ccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccct-ccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 53408225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261874
Alignment:
Q  341 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 23261874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44548339 - 44548185
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgac-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||    
T  44548339 aggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttat 44548240  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    ||   ||| ||||| || ||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  44548239 cacaattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  265 gtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctt 347  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595890
Alignment:
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctc 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||           || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaa-----------actctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 9595894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 355 - 404
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055350
Alignment:
Q  355 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 50055350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 348
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493482
Alignment:
Q  206 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcata 305  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||  | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||  |  ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  306 agctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  17493440 agctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 404
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748263
Alignment:
Q  338 ttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctctg 48748263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9596032 - 9595974
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagct 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9596032 taggccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactctcataagct 9595974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55344715 - 55344681
Alignment:
Q  370 ttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55344715 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 55344681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Original strand, 36699 - 36910
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36699 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 36798  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36799 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 36898  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  36899 cgattctctctg 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6086809 - 6086599
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6086809 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 6086710  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6086709 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 6086610  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  6086609 gattctctctg 6086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 2837540 - 2837752
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2837540 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 2837639  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2837640 atcatagtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 2837739  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  2837740 tcgattctctctg 2837752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26947084 - 26946876
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26947084 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26946985  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26946984 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26946885  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  26946884 ttctctctg 26946876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887292
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattct 34887297  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  34887296 ctctg 34887292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Original strand, 21893452 - 21893662
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21893452 taggccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttat 21893551  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21893552 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 21893651  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  21893652 gattctctctg 21893662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3347732 - 3347523
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  3347732 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatc 3347633  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3347632 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 3347533  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  3347532 attctctctg 3347523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26704547 - 26704339
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26704547 ggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26704448  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26704447 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 26704348  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  26704347 ttctctctg 26704339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 30691850 - 30692058
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30691850 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 30691949  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30691950 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 30692049  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  30692050 ttctctctg 30692058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 18613536 - 18613745
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18613536 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 18613635  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18613636 atagttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 18613735  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  18613736 attctctctg 18613745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17261284 - 17261073
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17261284 ttaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 17261185  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17261184 taatattttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcctt 17261085  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  17261084 cgattctctctg 17261073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 9459562 - 9459770
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9459562 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 9459661  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459662 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcga 9459761  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  9459762 ttctctctg 9459770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 11167235 - 11167447
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11167235 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 11167334  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11167335 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 11167434  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  11167435 tcgattctctctg 11167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 403
Target Start/End: Original strand, 35198280 - 35198489
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35198280 ttaggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 35198378  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  35198379 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcatt 35198478  T
Q  393 cgattctctct 403  Q
    |||||||||||    
T  35198479 cgattctctct 35198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 192 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16307220 - 16307015
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16307220 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagctt 16307121  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16307120 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcat 16307021  T
Q  392 tcgatt 397  Q
    ||||||    
T  16307020 tcgatt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Original strand, 20726790 - 20726994
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  ||||||    
T  20726790 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataacttatca 20726885  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20726886 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 20726985  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  20726986 ttctctctg 20726994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28199719 - 28199508
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28199719 taggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 28199621  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28199620 tatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 28199522  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  28199521 ttcgattctctctg 28199508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 198 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955769
Alignment:
Q  198 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatg 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3955873  T
Q  298 gtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgatt 397  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  3955872 gtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa---ccttcgatt 3955776  T
Q  398 ctctctg 404  Q
    |||||||    
T  3955775 ctctctg 3955769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 207 - 404
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153800
Alignment:
Q  207 gattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataa 306  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  307 gctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctctctg 1153800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 360
Target Start/End: Original strand, 52832 - 52999
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52832 ttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 52931  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggctta 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52932 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 201 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698934
Alignment:
Q  201 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtt 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  301 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 267 - 404
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464536
Alignment:
Q  267 ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  367 agcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctctg 33464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 290 - 404
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53115
Alignment:
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  53101 cttcgattctctctg 53115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 275
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463779
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaa 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Original strand, 34800920 - 34800956
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattga-cttattttgagcttat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34800920 ttaggccccgtttggattgagcttattttgagcttat 34800956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6175040 - 6174828
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6175040 tttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttt 6174941  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6174940 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcct 6174841  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  6174840 tcgattctctctg 6174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33906256 - 33906047
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33906256 aggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33906157  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33906156 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33906057  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||| ||||||    
T  33906056 attatctctg 33906047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31517423 - 31517215
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31517423 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 31517324  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31517323 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 31517224  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  31517223 ttctctctg 31517215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18807094 - 18806884
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807094 taggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 18806995  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18806994 catagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 18806895  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||||||||||    
T  18806894 gattctctctg 18806884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 196 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3873452 - 3873244
Alignment:
Q  196 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 295  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3873452 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 3873353  T
Q  296 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  3873352 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcga 3873253  T
Q  396 ttctctctg 404  Q
    |||||||||    
T  3873252 ttctctctg 3873244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26323395 - 26323186
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26323395 aggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatc 26323296  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26323295 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcg 26323196  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  26323195 attctctctg 26323186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Original strand, 42937714 - 42937925
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937714 taggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 42937813  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaat-aagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42937814 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42937913  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  42937914 cgattctctctg 42937925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 193 - 403
Target Start/End: Original strand, 39635446 - 39635656
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  39635446 ttaggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagctta 39635545  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39635546 tcatagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctcctt 39635645  T
Q  393 cgattctctct 403  Q
    |||||||||||    
T  39635646 cgattctctct 39635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 195 - 383
Target Start/End: Original strand, 1108276 - 1108463
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108276 aggccccgtttggatgg-cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1108374  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 383  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1108375 atagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgt 1108463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2178983 - 2178769
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2178983 gatttaggccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagc 2178884  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2178883 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 2178784  T
Q  390 cttcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||||    
T  2178783 cttcgattctctctg 2178769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329839
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattc 28329845  T
Q  399 tctctg 404  Q
    | ||||    
T  28329844 tttctg 28329839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016244
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 4016238  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  4016239 tctctg 4016244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4232351 - 4232142
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4232351 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 4232252  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4232251 atagtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcg 4232152  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||| ||||||    
T  4232151 attatctctg 4232142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 5733395 - 5733604
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  5733395 aggccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatc 5733494  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5733495 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcg 5733594  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  5733595 attctctctg 5733604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 200 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482903
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1483007 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattct 1482908  T
Q  400 ctctg 404  Q
    |||||    
T  1482907 ctctg 1482903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19901346 - 19901143
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19901346 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatc 19901248  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19901247 atagtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcg 19901148  T
Q  395 attct 399  Q
    |||||    
T  19901147 attct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19384127 - 19383938
Alignment:
Q  212 acttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgc 311  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  19384127 acttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgt 19384028  T
Q  312 ttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19384027 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30270888 - 30270679
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  30270888 aggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatc 30270789  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30270788 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcg 30270689  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||| ||||||    
T  30270688 attatctctg 30270679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851202
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||      
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattc 851196  T
Q  399 tctctg 404  Q
    ||||||    
T  851197 tctctg 851202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 193 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30420378 - 30420181
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30420378 ttagtccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 30420279  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30420278 tcataggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag------------cttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccccctt 30420191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16588986 - 16588776
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16588986 taggctccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttat 16588887  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttc 393  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  16588886 tatagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctccgtc 16588787  T
Q  394 gattctctctg 404  Q
    |||| ||||||    
T  16588786 gattatctctg 16588776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 203 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066302
Alignment:
Q  203 tttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggttt 301  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaag-tgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 16066397  T
Q  302 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16066396 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44947755 - 44947549
Alignment:
Q  191 atttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    ||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44947755 atttaagccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtt 44947656  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  44947655 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctcc 44947563  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  44947562 ttcgattctctctg 44947549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 400
Target Start/End: Original strand, 429817 - 430017
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataat 429916  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattct 399  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  429917 ttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 430016  T
Q  400 c 400  Q
    |    
T  430017 c 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42446779 - 42446625
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||    
T  42446779 taggccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttat 42446680  T
Q  294 catggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||    
T  42446679 cacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585439
Alignment:
Q  200 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggt 299  Q
    |||||||||| | ||||||   |||||||||||  ||||| |||  ||||| | || ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||   |    
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaat 3585390  T
Q  300 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagctta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  3585391 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22101316 - 22101210
Alignment:
Q  235 ttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcct 334  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |  ||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22101316 ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagccc 22101217  T
Q  335 aaatttt 341  Q
    |||||||    
T  22101216 aaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 190 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23165 - 22956
Alignment:
Q  190 gatttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 289  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23165 gatttgggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 23066  T
Q  290 ttatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctc 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23065 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 22966  T
Q  390 cttcgattct 399  Q
    ||||||||||    
T  22965 cttcgattct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 195 - 404
Target Start/End: Original strand, 10234 - 10443
Alignment:
Q  195 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10234 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 10333  T
Q  295 atggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcg 394  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10334 atagtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 10433  T
Q  395 attctctctg 404  Q
    ||||||||||    
T  10434 attctctctg 10443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 199 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145246
Alignment:
Q  199 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatgg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  299 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattc 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattc 145251  T
Q  399 tctct 403  Q
    |||||    
T  145250 tctct 145246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 507 - 295
Alignment:
Q  192 tttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttt 291  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  507 tttagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagatt 408  T
Q  292 atcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcct 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  407 atcatagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 308  T
Q  392 tcgattctctctg 404  Q
    |||||||||||||    
T  307 tcgattctctctg 295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 193 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 6
Alignment:
Q  193 ttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 292  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  217 ttaggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 118  T
Q  293 tcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  117 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18  T
Q  393 cgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||    
T  17 cgattctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 197 - 404
Target Start/End: Original strand, 3708 - 3915
Alignment:
Q  197 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 296  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3708 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3807  T
Q  297 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgat 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  3808 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgat 3907  T
Q  397 tctctctg 404  Q
    ||||||||    
T  3908 tctctctg 3915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 194 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 6
Alignment:
Q  194 taggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  217 taggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 119  T
Q  291 tatcatggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcc 390  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  118 tatcatagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 20  T
Q  391 ttcgattctctctg 404  Q
    ||||||||||||||    
T  19 ttcgattctctctg 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University