View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16438_low_44 (Length: 234)

Name: NF16438_low_44
Description: NF16438
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16438_low_44
NF16438_low_44
[»] scaffold0400 (2 HSPs)
scaffold0400 (16-220)||(12793-12997)
scaffold0400 (17-212)||(6506-6701)
[»] scaffold0365 (2 HSPs)
scaffold0365 (16-220)||(13436-13640)
scaffold0365 (17-212)||(7150-7345)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (16-220)||(14532639-14532843)
chr1 (16-219)||(14481999-14482202)
chr1 (18-214)||(14503998-14504194)
chr1 (16-220)||(15037034-15037238)
chr1 (16-214)||(14467817-14468015)
chr1 (16-220)||(15002121-15002325)
chr1 (16-220)||(15011014-15011218)
chr1 (16-220)||(15032472-15032676)
chr1 (16-220)||(15017129-15017333)
chr1 (67-220)||(15040809-15040962)
chr1 (16-220)||(14522518-14522722)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (32-220)||(14605928-14606116)
chr7 (91-220)||(16102969-16103098)
chr7 (32-220)||(16025105-16025293)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (95-157)||(37026857-37026919)


Alignment Details
Target: scaffold0400 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 12793 - 12997
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12793 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacataataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 12892  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12893 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaattgaagcactgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 12992  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  12993 ctctg 12997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 6506 - 6701
Alignment:
Q  17 agttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatat 116  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||| |||| | |||||||    
T  6506 agttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataataatttttctggtaccattcccttgacctatggtgagatgtcaagcttaacaactattgatat 6605  T
Q  117 atcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6606 atcatacaaccaatttgaaggtccaattccaaacattccagccttcaaaaatgctccaattgaagcattaagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 6701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 13436 - 13640
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacataataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 13535  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13536 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaattgaagcactgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 13635  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  13636 ctctg 13640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 7150 - 7345
Alignment:
Q  17 agttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatat 116  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||| |||| | |||||||    
T  7150 agttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataataatttttctggtaccattcccttgacctatggtgagatgtcaagcttaacaactattgatat 7249  T
Q  117 atcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7250 atcatacaaccaatttgaaggtccaattccaaacattccagccttcaaaaatgctccaattgaagcattaagaaataacaaaggcttgtgtggtaa 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14532843 - 14532639
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14532843 cagttaaatcacttacaaacattgaatctttcacataataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 14532744  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14532743 tatcatacaaccaattggagggtccaattccaagcattacagccttccaaaaagctccaattgaagcacttagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 14532644  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  14532643 ctctg 14532639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Original strand, 14481999 - 14482202
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||| ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  14481999 cagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtaccattcccttcagatatggttagatgttaagcttgataactgtagata 14482098  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  14482099 tatcgtacaaccagttggagggtccgattccaagcattccagccttccagaaaactccaattgaagcactgagaaacaacaaagacttgtgtggtaatgc 14482198  T
Q  216 ctct 219  Q
    ||||    
T  14482199 ctct 14482202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 14503998 - 14504194
Alignment:
Q  18 gttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatata 117  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14503998 gttaaatcatttagaaacattgaatctctcacataataatctgtctggtacgatcccctttagctctggtgatatgttaagcttgacaattattgatata 14504097  T
Q  118 tcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14504098 tcatacaaccaattggagggtccgattccaagcattccagccttccaacaagctccaattgaagcactgagaaacaacaaagacttgtgtggtaatg 14504194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 15037034 - 15037238
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  | | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15037034 cagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattcccttaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgata 15037133  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||  || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15037134 tatcttacaaccagttggagggtccgattccaaacattacagctttcaaaagagctccaattgaagcattgacaaataacaaaggcttatgtggtaatgt 15037233  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  15037234 ctctg 15037238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 14467817 - 14468015
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||  | | | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  14467817 cagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataataatctttctggtaccattctcttcagctcagttgatatgttaagcttgacaactgtagata 14467916  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatg 214  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14467917 tatcgtacaaccagttggagggtccgattccaagcattccagccttccaacaggctccaattgaagcactgagaaacaacaaagacttgtgtggtaatg 14468015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 15002121 - 15002325
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15002121 cagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctaaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgata 15002220  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15002221 tatcttacaaccagttggagggtccgactccaaacattacagctttcgaaagagctccaattgaagcactgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 15002320  T
Q  216 ctctg 220  Q
     ||||    
T  15002321 ttctg 15002325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 15011014 - 15011218
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15011014 cagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctcaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgata 15011113  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| |||  || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15011114 tatcttacaaccaattggagggtccgattccaaatgttacagctttcaaaagagctccaattgaagcattgacaaataacaaaggcttatgtggtaatgt 15011213  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  15011214 ctctg 15011218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 15032472 - 15032676
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15032472 cagttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctcaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgata 15032571  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15032572 tatcttacaaccagttggagggtccaattccaaacattacagctttcaaaaaagctccaattgaagcattgacaaataacaaaggcttatgtggtaatgt 15032671  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  15032672 ctctg 15032676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 15017129 - 15017333
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  ||||  | | | |||||||||||||||| |||||||     
T  15017129 cagttaaatcacttagaaacattgaatctctcacataacaatctctctggtaccattccctcaagctttgttgatatgttaagcttgacaactgttgatg 15017228  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||  || |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15017229 tatcttacaaccagttggagggtccgactccaaacattacagctttcggaagagctccaattgaagcattgacaaataacaagggcttgtgtggtaatat 15017328  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  15017329 ctctg 15017333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 220
Target Start/End: Original strand, 15040809 - 15040962
Alignment:
Q  67 accattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaa 166  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||| || ||||||||     
T  15040809 accattcccttgacctatggtgagatgtcaggcttgacaactgttgatatatcatgcaaccaattgaagggtccaattccaaaaatttcatccttcctac 15040908  T
Q  167 aagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 220  Q
    |||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15040909 aagccccatttgaagcattaagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 15040962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14522722 - 14522518
Alignment:
Q  16 cagttaaatcacatacaaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgata 115  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| | |||||| || ||||    | | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  14522722 cagttaaatcgcttagaaacattgaatctctcacataataatctctatggtaacattcccttaagcttttttgatatgttaagtttgacaactgttgata 14522623  T
Q  116 tatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgt 215  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| || |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14522622 tatcttacaaccggttggagggtccaattccaaacattacagcattccaaagagctccagttgaagcatttagaaataacaaaggcttgtgcggtaatgt 14522523  T
Q  216 ctctg 220  Q
    |||||    
T  14522522 ctctg 14522518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 220
Target Start/End: Original strand, 14605928 - 14606116
Alignment:
Q  32 aaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaatt 131  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    ||||| |  |||| || | ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  14605928 aaacattgaatatctcacataataatctttctggttttattccctctagcttcgatcagatgttcagcttaacatctgttgatatatcatataaccaatt 14606027  T
Q  132 ggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 220  Q
    |||||||||  | || || |||| ||| |||   || ||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14606028 ggagggtccactccccaatattcgagctttcagcaacgctacaattgaagtggtgagaaataataaaggcttgtgtggtaatgtctctg 14606116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 220
Target Start/End: Original strand, 16102969 - 16103098
Alignment:
Q  91 atgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaa 190  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||| ||| |||  ||| ||| |||  ||||   ||||||    
T  16102969 atgttaagcttgacatctgttgatatatcatataaccaattggagggtccactccccaacattcgagctttcagaaacgctacaatcgaagtgttgagaa 16103068  T
Q  191 ataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 220  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16103069 ataataaagacttgtgtggtaatgtctctg 16103098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 220
Target Start/End: Original strand, 16025105 - 16025293
Alignment:
Q  32 aaacattgaatctttcacacaataatctttctggaaccattcctttgagctacggtaagatgttaagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaatt 131  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    ||||| |  |||| || | ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  16025105 aaacattgaatatctcacataataatctttctggttttattccctctagcttcgatcagatgttcagcttaacgtctgttgatatatcatataaccaatt 16025204  T
Q  132 ggagggtccgattcctaacattccagccttcctaaaagctccaactgaagcagtgagaaataacaaaggcttgtgtggtaatgtctctg 220  Q
    |||||||||  | || || |||| ||| |||   || ||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16025205 ggagggtccactccccaatattcgagctttcagcaacgctacaattgaagtggtgagaaataataaaggcttgtgtggtaatgtctctg 16025293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Original strand, 37026857 - 37026919
Alignment:
Q  95 taagcttgacaattgttgatatatcatacaaccaattggagggtccgattcctaacattccag 157  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  37026857 taagcttgacaatggttgacatatcttataaccaattagagggttcaattcctaacaatccag 37026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University