View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1643_high_59 (Length: 342)

Name: NF1643_high_59
Description: NF1643
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1643_high_59
NF1643_high_59
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (7-325)||(33907888-33908206)
chr2 (7-294)||(11707271-11707558)
chr2 (10-294)||(26828159-26828443)
chr2 (19-291)||(5253003-5253275)
chr2 (19-294)||(19167206-19167481)
chr2 (19-290)||(30569902-30570171)
chr2 (19-291)||(36632396-36632673)
chr2 (27-294)||(45399464-45399736)
chr2 (19-291)||(42886043-42886321)
chr2 (19-294)||(1514329-1514608)
chr2 (33-294)||(11448414-11448679)
chr2 (95-291)||(26822342-26822538)
chr2 (77-293)||(33663115-33663330)
chr2 (21-294)||(4812185-4812475)
chr2 (95-291)||(19126060-19126254)
chr2 (19-294)||(35285641-35285914)
chr2 (19-291)||(45204355-45204642)
chr2 (19-294)||(18092078-18092343)
chr2 (95-291)||(21098411-21098607)
chr2 (95-291)||(16723723-16723919)
chr2 (27-291)||(27364202-27364451)
chr2 (161-294)||(9543997-9544130)
chr2 (157-294)||(10048374-10048511)
chr2 (165-294)||(4291031-4291160)
chr2 (19-86)||(33663352-33663419)
chr2 (238-291)||(18137829-18137882)
chr2 (238-294)||(28608458-28608514)
chr2 (238-293)||(14323269-14323324)
chr2 (238-291)||(6342787-6342840)
chr2 (238-293)||(1993010-1993065)
chr2 (238-293)||(28502446-28502501)
chr2 (19-70)||(16723921-16723972)
chr2 (19-70)||(21098358-21098409)
chr2 (19-70)||(19126256-19126307)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (7-291)||(35539271-35539555)
chr5 (7-294)||(34373727-34374015)
chr5 (19-295)||(3149947-3150223)
chr5 (19-291)||(20350535-20350807)
chr5 (19-294)||(3029355-3029629)
chr5 (19-325)||(17997168-17997474)
chr5 (19-291)||(21030709-21030981)
chr5 (19-294)||(27066472-27066747)
chr5 (19-324)||(19448595-19448900)
chr5 (19-291)||(20995239-20995516)
chr5 (19-291)||(20758545-20758817)
chr5 (25-297)||(287068-287343)
chr5 (19-252)||(1851346-1851579)
chr5 (27-294)||(33706114-33706385)
chr5 (7-293)||(38935050-38935324)
chr5 (95-291)||(7286330-7286526)
chr5 (19-294)||(10511722-10511984)
chr5 (95-325)||(33610476-33610706)
chr5 (97-290)||(26320448-26320641)
chr5 (106-291)||(2195825-2196010)
chr5 (107-291)||(30689995-30690179)
chr5 (19-294)||(12419922-12420216)
chr5 (133-294)||(41781631-41781792)
chr5 (27-292)||(3396495-3396747)
chr5 (117-294)||(34726738-34726919)
chr5 (157-296)||(30142270-30142409)
chr5 (19-148)||(41781442-41781576)
chr5 (161-294)||(25696898-25697031)
chr5 (165-294)||(41691051-41691180)
chr5 (165-290)||(34717365-34717490)
chr5 (19-160)||(33930414-33930561)
chr5 (19-107)||(4882872-4882960)
chr5 (155-294)||(33930966-33931098)
chr5 (202-291)||(4882963-4883052)
chr5 (238-290)||(19395582-19395634)
chr5 (238-293)||(31295612-31295667)
chr5 (19-70)||(7286277-7286328)
chr5 (19-70)||(26320645-26320696)
chr5 (19-70)||(30689913-30689964)
chr5 (7-70)||(33610708-33610771)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (7-294)||(2766-3053)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (7-325)||(44600067-44600385)
chr8 (7-325)||(38994050-38994369)
chr8 (21-291)||(22332064-22332334)
chr8 (19-291)||(36597372-36597644)
chr8 (26-290)||(19394900-19395164)
chr8 (33-297)||(23521991-23522255)
chr8 (33-294)||(7015544-7015803)
chr8 (8-294)||(44382130-44382420)
chr8 (19-293)||(41629267-41629529)
chr8 (19-278)||(3751492-3751745)
chr8 (19-291)||(38962547-38962831)
chr8 (19-231)||(6476890-6477102)
chr8 (19-294)||(41977877-41978158)
chr8 (95-291)||(14078190-14078386)
chr8 (95-291)||(33423619-33423815)
chr8 (95-297)||(42785600-42785802)
chr8 (95-291)||(9761699-9761895)
chr8 (95-291)||(27273663-27273859)
chr8 (19-294)||(19248493-19248781)
chr8 (19-294)||(19321677-19321965)
chr8 (19-290)||(22946140-22946409)
chr8 (19-221)||(41156973-41157183)
chr8 (19-294)||(41533189-41533468)
chr8 (95-291)||(5836027-5836221)
chr8 (7-209)||(42810359-42810554)
chr8 (110-291)||(30826837-30827018)
chr8 (86-294)||(45291820-45292032)
chr8 (117-294)||(4465826-4466007)
chr8 (19-147)||(38992891-38993020)
chr8 (117-294)||(7389704-7389884)
chr8 (117-294)||(25620136-25620317)
chr8 (165-294)||(12760752-12760881)
chr8 (117-297)||(25345015-25345199)
chr8 (158-294)||(25615862-25615998)
chr8 (238-295)||(44940446-44940503)
chr8 (238-293)||(6300545-6300600)
chr8 (238-293)||(42060723-42060778)
chr8 (19-89)||(45293110-45293180)
chr8 (242-293)||(37029846-37029897)
chr8 (248-294)||(41157180-41157226)
chr8 (19-70)||(9761646-9761697)
chr8 (238-293)||(23966448-23966503)
chr8 (19-70)||(27273610-27273661)
chr8 (19-70)||(33423817-33423868)
chr8 (19-70)||(42785547-42785598)
chr8 (19-70)||(5835974-5836025)
chr8 (19-66)||(30826772-30826819)
chr8 (19-65)||(14078393-14078439)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (10-294)||(28973707-28973992)
chr4 (19-291)||(53343064-53343335)
chr4 (19-293)||(33502363-33502637)
chr4 (19-291)||(55998076-55998348)
chr4 (19-325)||(19830727-19831033)
chr4 (19-325)||(36514670-36514976)
chr4 (19-291)||(22115415-22115687)
chr4 (19-291)||(2776931-2777203)
chr4 (19-291)||(39742359-39742630)
chr4 (19-294)||(17699830-17700105)
chr4 (25-291)||(19109121-19109387)
chr4 (19-325)||(37700928-37701233)
chr4 (19-294)||(38008915-38009192)
chr4 (19-295)||(35494964-35495237)
chr4 (36-291)||(21353690-21353945)
chr4 (19-291)||(41983592-41983869)
chr4 (19-294)||(17740695-17740974)
chr4 (21-294)||(47556783-47557060)
chr4 (19-297)||(7643163-7643428)
chr4 (19-291)||(13628709-13628978)
chr4 (95-291)||(34055950-34056146)
chr4 (6-294)||(36857709-36857986)
chr4 (95-291)||(23479607-23479804)
chr4 (19-294)||(40622805-40623079)
chr4 (95-288)||(14828901-14829094)
chr4 (95-291)||(5271662-5271858)
chr4 (157-291)||(54331130-54331264)
chr4 (117-294)||(2116579-2116761)
chr4 (165-291)||(15642423-15642549)
chr4 (165-294)||(39714902-39715031)
chr4 (117-294)||(12682160-12682340)
chr4 (117-294)||(46104653-46104834)
chr4 (165-294)||(52800800-52800929)
chr4 (19-129)||(7847678-7847789)
chr4 (19-111)||(8531472-8531564)
chr4 (238-293)||(28134764-28134819)
chr4 (238-293)||(740365-740420)
chr4 (242-293)||(15520999-15521050)
chr4 (19-70)||(23479554-23479605)
chr4 (201-231)||(14828874-14828904)
chr4 (33-70)||(14829096-14829133)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (19-294)||(17940138-17940413)
chr6 (34-291)||(18312423-18312680)
chr6 (19-286)||(15276254-15276521)
chr6 (33-291)||(35041720-35041977)
chr6 (19-291)||(22373200-22373472)
chr6 (23-294)||(4425107-4425370)
chr6 (19-290)||(33320807-33321082)
chr6 (19-291)||(7222929-7223189)
chr6 (95-297)||(18598359-18598561)
chr6 (95-291)||(21800212-21800408)
chr6 (19-294)||(34321713-34321981)
chr6 (19-294)||(14832101-14832380)
chr6 (95-291)||(1072643-1072839)
chr6 (95-291)||(33814662-33814858)
chr6 (95-291)||(34856623-34856819)
chr6 (95-278)||(11932875-11933058)
chr6 (103-291)||(14887318-14887506)
chr6 (19-293)||(25540550-25540835)
chr6 (7-154)||(30044814-30044960)
chr6 (117-294)||(4108441-4108622)
chr6 (140-294)||(35158714-35158867)
chr6 (165-294)||(1220293-1220422)
chr6 (165-294)||(24445702-24445831)
chr6 (165-294)||(9979444-9979573)
chr6 (107-189)||(2521850-2521932)
chr6 (214-291)||(2521928-2522005)
chr6 (117-191)||(28573340-28573418)
chr6 (19-70)||(34856570-34856621)
chr6 (19-70)||(2521783-2521834)
chr6 (19-70)||(11933060-11933111)
chr6 (238-293)||(13456793-13456848)
chr6 (19-70)||(14887516-14887567)
chr6 (19-70)||(18598563-18598614)
chr6 (19-70)||(33814609-33814660)
chr6 (19-70)||(1072841-1072892)
chr6 (19-70)||(21800159-21800210)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (7-297)||(48580-48869)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (7-291)||(16342277-16342558)
chr3 (19-291)||(18741577-18741849)
chr3 (21-291)||(54648240-54648510)
chr3 (19-291)||(21698936-21699208)
chr3 (19-294)||(51248937-51249212)
chr3 (19-290)||(50742006-50742277)
chr3 (19-294)||(52852801-52853076)
chr3 (19-294)||(54513418-54513699)
chr3 (19-291)||(52462275-52462552)
chr3 (21-293)||(49113700-49113960)
chr3 (19-294)||(52842213-52842495)
chr3 (19-294)||(55294123-55294402)
chr3 (19-294)||(23194822-23195106)
chr3 (19-294)||(48520382-48520661)
chr3 (19-294)||(8243124-8243416)
chr3 (67-286)||(19406691-19406910)
chr3 (19-290)||(32756147-32756416)
chr3 (95-291)||(50770619-50770815)
chr3 (19-290)||(54934439-54934715)
chr3 (33-294)||(39092974-39093238)
chr3 (19-294)||(40824012-40824291)
chr3 (95-291)||(31368388-31368584)
chr3 (107-291)||(6103493-6103677)
chr3 (95-290)||(35087225-35087408)
chr3 (117-294)||(4138129-4138310)
chr3 (95-288)||(2839578-2839777)
chr3 (117-294)||(26777275-26777456)
chr3 (19-133)||(11597467-11597581)
chr3 (77-228)||(48977608-48977749)
chr3 (19-102)||(2843461-2843544)
chr3 (207-291)||(11597368-11597452)
chr3 (238-294)||(48988911-48988967)
chr3 (212-291)||(19353697-19353776)
chr3 (238-293)||(5252314-5252369)
chr3 (238-293)||(39796413-39796468)
chr3 (117-183)||(53800998-53801068)
chr3 (19-88)||(48977312-48977381)
chr3 (55-133)||(6093396-6093474)
chr3 (19-65)||(6103701-6103747)
chr3 (19-60)||(31368595-31368636)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (19-294)||(379-654)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (19-294)||(42688192-42688467)
chr7 (19-325)||(17470369-17470675)
chr7 (19-325)||(17582539-17582845)
chr7 (19-294)||(11500497-11500765)
chr7 (19-291)||(33031496-33031767)
chr7 (19-294)||(47175100-47175378)
chr7 (19-297)||(23299066-23299348)
chr7 (19-294)||(42918501-42918781)
chr7 (19-294)||(27734397-27734674)
chr7 (61-277)||(5963364-5963581)
chr7 (19-294)||(9149962-9150242)
chr7 (19-294)||(33638020-33638299)
chr7 (19-297)||(19521787-19522052)
chr7 (19-293)||(42826704-42826982)
chr7 (19-221)||(17478551-17478753)
chr7 (19-221)||(17482986-17483188)
chr7 (19-221)||(17570026-17570228)
chr7 (19-221)||(17574461-17574663)
chr7 (95-291)||(8925286-8925482)
chr7 (103-296)||(14309553-14309760)
chr7 (95-259)||(23765847-23766011)
chr7 (117-294)||(4848834-4849015)
chr7 (117-294)||(49145638-49145819)
chr7 (157-294)||(39649330-39649467)
chr7 (161-294)||(48528140-48528273)
chr7 (165-294)||(17170801-17170930)
chr7 (161-294)||(31898171-31898304)
chr7 (238-293)||(6911419-6911474)
chr7 (238-293)||(47573397-47573452)
chr7 (19-70)||(8925484-8925535)
chr7 (19-70)||(23766013-23766064)
chr7 (27-70)||(14309500-14309543)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (33-288)||(25712-25967)
scaffold0047 (201-231)||(25685-25715)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (19-294)||(44407002-44407277)
chr1 (19-294)||(52310476-52310755)
chr1 (19-291)||(45005412-45005688)
chr1 (21-294)||(38844531-38844814)
chr1 (95-325)||(34692810-34693040)
chr1 (6-293)||(17672079-17672372)
chr1 (20-291)||(36682681-36682957)
chr1 (19-294)||(50561691-50561968)
chr1 (19-294)||(12245229-12245503)
chr1 (95-325)||(34688282-34688512)
chr1 (19-291)||(48340957-48341234)
chr1 (95-291)||(52520977-52521173)
chr1 (80-297)||(47135977-47136198)
chr1 (95-291)||(31620384-31620580)
chr1 (103-291)||(41829410-41829598)
chr1 (21-297)||(10694132-10694430)
chr1 (95-291)||(18814914-18815110)
chr1 (19-293)||(16030944-16031239)
chr1 (95-291)||(41962296-41962483)
chr1 (28-283)||(51965201-51965451)
chr1 (117-297)||(5426715-5426899)
chr1 (117-294)||(16300781-16300963)
chr1 (165-294)||(4891875-4892004)
chr1 (165-294)||(29186483-29186612)
chr1 (165-294)||(33361478-33361607)
chr1 (72-297)||(17707238-17707455)
chr1 (238-294)||(24294797-24294853)
chr1 (238-295)||(50395024-50395081)
chr1 (238-294)||(39760076-39760132)
chr1 (7-70)||(34692745-34692808)
chr1 (238-293)||(43254612-43254667)
chr1 (19-70)||(18814861-18814912)
chr1 (19-70)||(34688229-34688280)
chr1 (26-70)||(31620338-31620382)
chr1 (19-70)||(41829608-41829659)
chr1 (19-70)||(52521175-52521226)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (33-290)||(14680-14945)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (19-294)||(101344-101624)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (19-294)||(12271-12550)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (19-290)||(120539-120814)
scaffold0010 (10-163)||(177084-177237)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (19-297)||(10075-10356)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (19-294)||(4310-4586)
scaffold0032 (19-294)||(10759-11035)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (55-294)||(29696-29931)
[»] scaffold1891 (1 HSPs)
scaffold1891 (95-291)||(115-311)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (95-291)||(5185-5381)
scaffold0122 (19-70)||(5132-5183)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (95-288)||(10615-10808)
scaffold0005 (201-231)||(10805-10835)
scaffold0005 (33-70)||(10576-10613)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (94-294)||(3123-3326)
scaffold0115 (19-92)||(581-656)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (165-294)||(18763-18892)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (165-294)||(13508-13637)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (210-291)||(16979-17060)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (233-294)||(231816-231877)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Original strand, 33907888 - 33908206
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33907888 tagattatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 33907987  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33907988 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 33908087  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnna 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |    
T  33908088 taaactgattatatactctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaagaatttttttta 33908187  T
Q  307 tcgaatacgttattgaacc 325  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33908188 tcgaatacgttattgaacc 33908206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Original strand, 11707271 - 11707558
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11707271 tagattatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttaatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 11707370  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11707371 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggtttcaattgttttcatcctaaatattatgccaatttgtattctca 11707470  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11707471 taaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 11707558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Original strand, 26828159 - 26828443
Alignment:
Q  10 attatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttt 109  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26828159 attatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttt 26828258  T
Q  110 tttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26828259 tttataattttggataatatgtaaattcacacatcattagtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataa 26828358  T
Q  210 actgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26828359 actaattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 26828443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 5253003 - 5253275
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5253003 actcaccaatgttacttctttgtttgatttcattttatgtgaatatgtgtatcaatcattttttattaactctataacaacaactctcttttttataatt 5253102  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5253103 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 5253202  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5253203 atgctctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 5253275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19167481 - 19167206
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19167481 actcatcgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttgataattctataacaacaacattcttttttataatt 19167382  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  19167381 ttggataatatgtaaattcacacatcaatggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 19167282  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19167281 atgttctcttaatcagcccatacatattttataatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 19167206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30570171 - 30569902
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30570171 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtaacaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 30570072  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  30570071 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatcttataaactgattat 30569972  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    ||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  30569971 atgctctcttaatcagc--ctacattttttatgatgaatcacaatgttccttcattttaacagctcttcttt 30569902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36632673 - 36632396
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36632673 actcaccgatgctacttctttgctttatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaataacactctattttataatt 36632574  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    | |||||||||||||     ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  36632573 tgggataatatgtaatcataattcaaacatcattggttcatttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcataatctcataaactg 36632474  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36632473 attatatgctctcttaatcagtccatatatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 36632396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 45399464 - 45399736
Alignment:
Q  27 atgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataa 126  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45399464 atgctacttctttgcttcatttcatctgttttaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaattctcttttttataattttggataa 45399563  T
Q  127 tatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatg 221  Q
    |||||||     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  45399564 tatgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactaattatatg 45399663  T
Q  222 ctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45399664 ctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 45399736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 42886043 - 42886321
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt------ 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||          
T  42886043 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcacttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacattttttttttttttt 42886142  T
Q  113 -ataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
     |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  42886143 tataattctggataatatttaaattcatacatcattggtca-tttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaac 42886241  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42886242 tgattatatgcgctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 42886321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1514608 - 1514329
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1514608 actcaccgatgctatttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatcggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 1514509  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||| ||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1514508 ttggataacatgtaatcgtaattcacacatcattggtt-cttttttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcttaatctcataaactg 1514410  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1514409 attatatgatctctaaatcaacccatacatatttcatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 1514329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 294
Target Start/End: Original strand, 11448414 - 11448679
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448414 cttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaattcttttttggtaactccataacaa-aacactcttttttataattttggataatatgta 11448512  T
Q  133 a-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctct 227  Q
    |     |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  11448513 atcataattcacacatcattggttcctttattggtttcaattgttttcatcttaaatattatgtcaattcctaatcttataaactgattatttgctttct 11448612  T
Q  228 taattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11448613 taatcaacccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttttttcgaa 11448679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 26822342 - 26822538
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822342 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 26822441  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26822442 ttcctaatatcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 26822538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33663330 - 33663115
Alignment:
Q  77 ttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttca 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  33663330 ttttttggcaactctataacaacaacactcttttttacaattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcatttattggtttcaattgttttca 33663231  T
Q  177 tcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgtttt 276  Q
    | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33663230 t-ctaaatattatgtcaattactaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcatttt 33663132  T
Q  277 aatatctcttctttcga 293  Q
    || || |||||||||||    
T  33663131 aacatatcttctttcga 33663115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Original strand, 4812185 - 4812475
Alignment:
Q  21 tcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttt--------- 111  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||             
T  4812185 tcactgatgctagttctttgcctgatttcatctgttttaaatatgggtatcaatcctttttttgtcactctataacaacaacactctttttattttattt 4812284  T
Q  112 tataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4812285 tataattttcgataatatgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctca 4812384  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatac---atattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812385 taaactgattatatgctctcttaatcatcccatacatgatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 4812475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19126254 - 19126060
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19126254 acaacaacactctttt--ataattttggataatatgtaaattcacatatcattggttcctttattggttccaattattttcatcctaaatattatgtcaa 19126157  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19126156 ttcctaatatcataaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcattttaacatctcttctttc 19126060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35285914 - 35285641
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35285914 actcactgatgctacttatttgcttgatttcatctgttttaaatatgggtatcaatcattttttggtaactttataacaacaacactcttttttataatt 35285815  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||| ||||||||||     ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | || ||||||||     
T  35285814 ttgaataatatgtaatcataattcccacatcattgtttcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaaattccaatcacataaacta 35285715  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35285714 a-------ctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 35285641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45204642 - 45204355
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactct----------t 108  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |          |    
T  45204642 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaattctatgacaaaaacactttattttttattt 45204543  T
Q  109 ttttataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattc 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||    
T  45204542 ttttgtaattttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttcctttattagttccaattgttttcattttaaatattatgtcaattcgtaatc 45204443  T
Q  204 tcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45204442 tcagaaactgattagatgctttcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatctcttctttc 45204355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18092343 - 18092078
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  18092343 actcaccgatgctacttatttatttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggcaactcta---caacaacactcttttttataatt 18092247  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  18092246 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggtt------------ccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatttcataaactg 18092159  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18092158 attatatgatctctaaattagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 18092078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 21098411 - 21098607
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  21098411 acaacaaaactcttttttataattttgggtaatatgtaaatccacacatcattgattcctttattggttccaataattttcatcataaatattatgtcaa 21098510  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21098511 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttctttc 21098607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16723919 - 16723723
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16723919 acaacaaaactcttttttataattttcgataatatgtaaattcacacatcattgattcttttattggttcaaatagttttcattctaaatattatgtcaa 16723820  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16723819 ttcctaatctcataaactgattatatgctctctaaatcaggccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 16723723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27364451 - 27364202
Alignment:
Q  27 atgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatcctttttt-ggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggata 125  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27364451 atgctacttttttgcttcatttcatctgttttaaatatgggtatcaatcctttttttggtaactctataacaacaacgctcttttttataattttggata 27364352  T
Q  126 atatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatat 220  Q
    ||||||||     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        || |||               
T  27364351 atatgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatatgatgtcaat--------tcctaa----------- 27364271  T
Q  221 gctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
      ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27364270 --tctcttaatcatctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 27364202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9544130 - 9543997
Alignment:
Q  161 gttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9544130 gttccaattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcac 9544031  T
Q  261 aatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  9544030 aatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 9543997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10048511 - 10048374
Alignment:
Q  157 attggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaa 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10048511 attggttccaattattttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaa 10048412  T
Q  257 tcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  10048411 tcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 10048374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4291160 - 4291031
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4291160 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 4291061  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  4291060 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 4291031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33663419 - 33663352
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggta 86  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33663419 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggta 33663352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 291
Target Start/End: Original strand, 18137829 - 18137882
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18137829 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 18137882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 28608458 - 28608514
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  28608458 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 28608514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14323324 - 14323269
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14323324 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 14323269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6342840 - 6342787
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6342840 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttc 6342787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1993065 - 1993010
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1993065 atacatattttatgatgaattataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 1993010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 28502446 - 28502501
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  28502446 atacatattttatgatgaatcataatattccgtcgttttaacatatcttctttcga 28502501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 16723972 - 16723921
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16723972 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 16723921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 21098358 - 21098409
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21098358 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 21098409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19126307 - 19126256
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19126307 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 19126256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35539555 - 35539271
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35539555 tagattatattaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactt 35539456  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35539455 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 35539356  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35539355 taaattgattatatgctctcttaattagctcatacatattttatgatgagtcacaatgttccgtcgttttaatatcttttctttc 35539271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34374015 - 34373727
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34374015 tagattatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccctttttggtaactctataacaaggacactc 34373916  T
Q  107 tttttt-ataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctc 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34373915 tttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctc 34373816  T
Q  206 ataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34373815 ataaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatattccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 34373727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3150223 - 3149947
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3150223 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 3150124  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  3150123 ttggataatatataaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcattctaaatattatgtcaattccttatctcataaactgattat 3150024  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaat 295  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3150023 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttaattcgttttaacatctcttctttcgaat 3149947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 20350535 - 20350807
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20350535 actcatcgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttacaatt 20350634  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  20350635 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgcttat 20350734  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  20350735 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttagcatcacttctttc 20350807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 3029355 - 3029629
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3029355 actcaccgatgttacttctttgcttgatttcattt-atgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacattcttttttataatt 3029453  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  3029454 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatttcataaactaattat 3029553  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  3029554 atgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatattccttcgttttaacatttcttctttcgaa 3029629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Original strand, 17997168 - 17997474
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17997168 actcaccaatgatacttctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 17997267  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  17997268 ttgggtaatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttcgaatctcataaactaattat 17997367  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnnatcgaatacgtta 318  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||        |||||||||||||    
T  17997368 atgctctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcaaagaattttttttatcgaatacgtta 17997467  T
Q  319 ttgaacc 325  Q
    |||||||    
T  17997468 ttgaacc 17997474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 21030709 - 21030981
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21030709 actcaccgatgctaattctttacttgatttcatctgatgtaaatatggctatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 21030808  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21030809 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattagttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 21030908  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  21030909 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgttgttttaacatctcttctttc 21030981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 27066472 - 27066747
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066472 actcaccgatgctatttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatggctatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 27066571  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||    
T  27066572 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatattaattcctaatctcataaactgattat 27066671  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  27066672 atgctctcttaatcagtctatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaccatctcttctttcgaa 27066747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 324
Target Start/End: Original strand, 19448595 - 19448900
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19448595 actcaccgatgctacttctttacttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 19448694  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  19448695 ttggataatatgtaaattcacatatcattagttcatttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcataatcttataaactgattat 19448794  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnnatcgaatacgtta 318  Q
    ||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||        |||||||||||||    
T  19448795 atgctctcttaatcaatccatacatattttatgatgaatcacaatattccgtcgttttaacatctcttcttttgaagaattttttttatcgaatacgtta 19448894  T
Q  319 ttgaac 324  Q
    ||||||    
T  19448895 ttgaac 19448900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20995516 - 20995239
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20995516 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactctattttataatt 20995417  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  20995416 ttggataatatgtaatcataattcaaacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 20995317  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20995316 attatatgctcttttaatcagtccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 20995239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 20758545 - 20758817
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20758545 actcaccgatgttacttctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgggtatcaatcattttttagtaactctataacaacaacactcttttttataatt 20758644  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  20758645 ttggattatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaactgttttcatcataaatattatgttaatttctaatctcataaactaattat 20758744  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20758745 atgctctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 20758817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 287343 - 287068
Alignment:
Q  25 cgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggat 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  287343 cgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataattttggat 287244  T
Q  125 aatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattata 219  Q
    |||||||||     |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  287243 aatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt--tggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattata 287146  T
Q  220 tgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  287145 tgatctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatattttctttcgaataa 287068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1851579 - 1851346
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851579 actcaccgatgctacttgtttgtttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 1851480  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  1851479 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 1851380  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatga 252  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  1851379 atgctctcttaatcagcctatacatattttatga 1851346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33706385 - 33706114
Alignment:
Q  27 atgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataa 126  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33706385 atgctacttctttgtttgatttcatctaatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctgcaacaacaacactcttttttataattttggataa 33706286  T
Q  127 tatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatg 221  Q
    |||||||     |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  33706285 tatgtaatcataattcacacatcattggttccttttttg-ttccaattgttttcatcctaaatattatctcaattcctaatctcataaactgattatatg 33706187  T
Q  222 ctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
     ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33706186 atctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 33706114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 293
Target Start/End: Original strand, 38935050 - 38935324
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||  ||| | |||||||| || | ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38935050 tagattatattcactcacatatgttacttctttgttttacttcatttgatgtgaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactc 38935149  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  38935150 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattg------------gttccaatcgttttcatcctaaatattatgtcaattcataatctca 38935237  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38935238 taaactgattatatgctctcttaatcaactcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcccttctttcga 38935324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 7286330 - 7286526
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7286330 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaatttacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 7286429  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7286430 ttcctaatctcacaaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatattccgtcgttttaacatctcttctttc 7286526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10511984 - 10511722
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  10511984 actcaccgaagttacttctttgcttgatttcatttgaagtaattatgagtatcaatccttttttggtaaccctacaacaacatcactcttttt-ataatt 10511886  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  10511885 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtt------------ccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattactaatctcataaactgattat 10511798  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10511797 atgttctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttctttcgaa 10511722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33610706 - 33610476
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33610706 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcttaaatattatgtcaa 33610607  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  33610606 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagctcatacgtattttatgacgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctattctttcaaa 33610507  T
Q  295 taannnnnnnnatcgaatacgttattgaacc 325  Q
     ||        ||||||||||||||||||||    
T  33610506 gaattttttttatcgaatacgttattgaacc 33610476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26320641 - 26320448
Alignment:
Q  97 aacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatt 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26320641 aacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgatttctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaatt 26320542  T
Q  197 tgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26320541 cctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcaggccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatatcttcttt 26320448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 291
Target Start/End: Original strand, 2195825 - 2196010
Alignment:
Q  106 cttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  2195825 cttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctc 2195924  T
Q  206 ataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2195925 ataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatctcttctttc 2196010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Original strand, 30689995 - 30690179
Alignment:
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  30689995 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctca 30690094  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30690095 taaactgattatatgctctcttaatcagtccatacatattttatgatgaatcacgatgttccttcgttttaacatctcttctttc 30690179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12420216 - 12419922
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt------ 112  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||          
T  12420216 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatcctttttcggtaactctacaaaaacaacactttttttttttttt 12420117  T
Q  113 ---------ataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttg 198  Q
             |||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  12420116 ttttttttaataattttggataatatgtaatcataattcacatatcattggttccttt-ttggttccaattattttcatcctaaatattatgtcaattcc 12420018  T
Q  199 tattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12420017 taatctcataaactgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcaaaatgttccgtcgttttaacatattttctttcgaa 12419922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Original strand, 41781631 - 41781792
Alignment:
Q  133 aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaatt 232  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41781631 aattcacacatcattgtttcctttattggttccaattattttcttcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatc 41781730  T
Q  233 agctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41781731 agtccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcattttaacatctcttctttcgaa 41781792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3396747 - 3396495
Alignment:
Q  27 atgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattt----tgg 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    |||    
T  3396747 atgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatggatatcaatcattttttggtaactctattacaacaacactcttttttattagtttggatgg 3396648  T
Q  123 ataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgc 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||                  |||||||||||||||||    
T  3396647 ataatatggaaattcacacatcattggtttctatattggttccatttgttttcatcct-aatatt------------------ataaactgattatatgc 3396567  T
Q  223 tctcttaattagctaatacatattttatgatg--aatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcg 292  Q
    ||||||||| | |  || ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  3396566 tctcttaataaacccatccatattttatgatgaaaatcacaatgttctgtagttttaacatctcttctttcg 3396495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34726919 - 34726738
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  34726919 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttttttg-ttccaattgttttcatcctaaacattatgtcaatttctaatctcataaac 34726821  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  34726820 tgtttatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 34726738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 296
Target Start/End: Original strand, 30142270 - 30142409
Alignment:
Q  157 attggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaa 256  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30142270 attggtttcaattattttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaa 30142369  T
Q  257 tcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaata 296  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  30142370 tcacaatgttctgttgttttaacatcttttctttcgaata 30142409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 41781442 - 41781576
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781442 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgttttaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 41781541  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattg 148  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  41781542 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattg 41781576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25697031 - 25696898
Alignment:
Q  161 gttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25697031 gttccaattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttaggatgaatcac 25696932  T
Q  261 aatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25696931 aatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 25696898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 41691051 - 41691180
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41691051 caattgttttcattctaaaaattatgtcaatttctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 41691150  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  41691151 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 41691180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 290
Target Start/End: Original strand, 34717365 - 34717490
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34717365 caattgttttcattctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 34717464  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  34717465 ttccgttgttttaacatcttttcttt 34717490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 33930414 - 33930561
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc-ttttttataat 117  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33930414 actcactgattctacttatttgcttgatttcatctgttttaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttttataat 33930513  T
Q  118 tttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattg 160  Q
    |||| ||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33930514 tttgaataatatgtaatcataattcacacatcattgttttctttattg 33930561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 4882872 - 4882960
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactct 107  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4882872 actcaccaatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactct 4882960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 294
Target Start/End: Original strand, 33930966 - 33931098
Alignment:
Q  155 ttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatg 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |       |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  33930966 ttattggtttcaattgttttcatcataaatattatgtcaaattataatctcataaactaa-------ctctcttaatcagcccatacatattttatgatg 33931058  T
Q  255 aatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33931059 aatcagaatgttccgtcattttaacatctcttctttcgaa 33931098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 291
Target Start/End: Original strand, 4882963 - 4883052
Alignment:
Q  202 tctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4882963 tctcataaactgattatatgctctcttaaccagcctttacatattttacgatgaagcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 4883052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 290
Target Start/End: Original strand, 19395582 - 19395634
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19395582 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttcttt 19395634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31295667 - 31295612
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31295667 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 31295612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 7286277 - 7286328
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7286277 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 7286328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26320696 - 26320645
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26320696 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 26320645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 30689913 - 30689964
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30689913 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 30689964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 33610771 - 33610708
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    ||||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33610771 tagattatattcactcattgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 33610708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3053 - 2766
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3053 tagattatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 2954  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2953 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgcattctca 2854  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2853 taaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttttgatgaatcacaatgttccgtcattttaatatctcttctttcgaa 2766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Original strand, 44600067 - 44600385
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600067 tagattatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactc 44600166  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44600167 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctacatattatgtcaatttgtattctca 44600266  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnna 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |    
T  44600267 taaactgattatatgctctcttaatcaactcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaagaatttttttta 44600366  T
Q  307 tcgaatacgttattgaacc 325  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44600367 tcgaatacgttattgaacc 44600385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Original strand, 38994050 - 38994369
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38994050 tagattatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactc 38994149  T
Q  107 ttttttat-aattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctc 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38994150 ttttttattaattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctacatattatgtcaatttgtattctc 38994249  T
Q  206 ataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnn 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||            
T  38994250 ataaactgattatatgctctcttaatcaactcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaagaatttttttt 38994349  T
Q  306 atcgaatacgttattgaacc 325  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38994350 atcgaatacgttattgaacc 38994369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22332334 - 22332064
Alignment:
Q  21 tcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332334 tcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatttt 22332235  T
Q  121 ggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  22332234 ggataatatgtaaattcatacatcattggttcctttattggttcaaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatat 22332135  T
Q  221 gctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22332134 gctctcttaatcagcccgtacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 22332064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36597644 - 36597372
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36597644 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctattacaacaacactcttttttataatt 36597545  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  36597544 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattagttccaattgttttcatcttaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 36597445  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36597444 atgctctcttaatcaacccatacatattttatgatgcatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 36597372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19395164 - 19394900
Alignment:
Q  26 gatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggata 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19395164 gatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggcatcaatcattttttggtaactctataacaataacactcttttttataattttggata 19395065  T
Q  126 atatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctct 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  19395064 aaatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatatcaattcctaatctcataaactgattatatgctct 19394965  T
Q  226 cttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19394964 cttaatctgcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttcttt 19394900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23522255 - 23521991
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 132  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522255 cttctttgtttgatttcatttgatgtgaatataggtatcaatcattttttagtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 23522156  T
Q  133 aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaatt 232  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23522155 aattcaaacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattatatgctctcttaatc 23522056  T
Q  233 agctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  23522055 agcacatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcattttaacatctcttctttcaaataa 23521991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 294
Target Start/End: Original strand, 7015544 - 7015803
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7015544 cttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttgataactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 7015643  T
Q  133 aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||   ||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  7015644 aattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcttaaatattatgtcaattccta--atcatagactgattatatgctcacttaatc 7015741  T
Q  233 agctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7015742 agctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 7015803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44382420 - 44382130
Alignment:
Q  8 agattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactct 107  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44382420 agattatattcactcaccgatgctacttctttacttgatttcatcttatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctacaacaacaacactct 44382321  T
Q  108 tttttataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  44382320 tttttataattttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaat 44382222  T
Q  203 ctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44382221 ctcataaactgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatcttttctttcgaa 44382130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 41629267 - 41629529
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41629267 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgattatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 41629366  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  41629367 ttggataatatgtaaattcacacatc------------attggttccaattgttttcatcctaaatattttgtcaattcctagtctcataaactgattat 41629454  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41629455 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcga 41629529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Original strand, 3751492 - 3751745
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3751492 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaaaactcttttttataatt 3751591  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3751592 ttggataat-----aattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 3751685  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaa 278  Q
    ||  ||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3751686 ataatctctaaatcagcctatacatattttttgatgaatcacaatgttccgttgttttaa 3751745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 38962547 - 38962831
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962547 actcactgatgctacttctttgcttgattttatttgatgtaaatatggatatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 38962646  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttc------------tttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||    
T  38962647 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttcatttattggttccaattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctca 38962746  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38962747 taaactgattatatgctctcttaatcagcccatgtatattttatgatgaatcacaatattccgtcgttttaacatcacttctttc 38962831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6477102 - 6476890
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6477102 actcaccgatgctacttctttttttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 6477003  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  6477002 ttggataatatgtatattcacacattattggttcctttattggttccaattgtttttatcctatatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 6476903  T
Q  219 atgctctcttaat 231  Q
    ||||||| |||||    
T  6476902 atgctctattaat 6476890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 41977877 - 41978158
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaaca---ctcttttttata 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||||    
T  41977877 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcaccttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacaacactattttttata 41977976  T
Q  116 attttggataatatgtaaa-----ttcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaa 210  Q
    |||| | |||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||||||    
T  41977977 attt-gaataatatgtaatcatacttcacacatcattggtttcttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtccattcctaatttcataaa 41978074  T
Q  211 ctgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41978075 ctgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaacgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 41978158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14078386 - 14078190
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14078386 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 14078287  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14078286 ttcctaatctcataaactggttatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 14078190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33423815 - 33423619
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423815 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 33423716  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33423715 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagtccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 33423619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 95 - 297
Target Start/End: Original strand, 42785600 - 42785802
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42785600 acaacaacactattttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggtttcaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 42785699  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  42785700 ttcttaatttcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatatcttctttcaaa 42785799  T
Q  295 taa 297  Q
    |||    
T  42785800 taa 42785802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 9761699 - 9761895
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9761699 acaacaacactattttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaa 9761798  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  9761799 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgtttcgtcgttctaacatctcttctttc 9761895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 27273663 - 27273859
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27273663 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcatttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaa 27273762  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27273763 ttcataatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatatatattttttgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 27273859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 19248493 - 19248781
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaa-tccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataat 117  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19248493 actcactgacgctacttcttttcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataat 19248592  T
Q  118 ttt--------ggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattct 204  Q
    |||        ||||||| |||||     |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  19248593 tttataattttggataatgtgtaattataattctcacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatct 19248691  T
Q  205 cataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19248692 cataaactgattatatgctctcttcatcagctcgtacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttccttcgaa 19248781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 19321677 - 19321965
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaa-tccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataat 117  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19321677 actcactgacgctacttcttttcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataat 19321776  T
Q  118 ttt--------ggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattct 204  Q
    |||        ||||||| |||||     |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  19321777 tttataattttggataatgtgtaattataattctcacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatct 19321875  T
Q  205 cataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19321876 cataaactgattatatgctctcttcatcagctcgtacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttccttcgaa 19321965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22946409 - 22946140
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22946409 actcactgatgctacttatttgcttgatttcatttgttttaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacgttcttttttataatt 22946310  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||| ||||||||||     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  22946309 ttgaataatatgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaaattctaatctcataaacta 22946210  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    |       |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22946209 a-------ctctcttaatcagctcatatatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctctacttt 22946140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 41156973 - 41157183
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaaca---ctcttttttata 115  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  41156973 actcaccgatgctacttctttgtttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacaacactcttttttata 41157072  T
Q  116 attttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaa 210  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  41157073 attttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttttttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaa 41157172  T
Q  211 ctgattatatg 221  Q
    |||||||||||    
T  41157173 ctgattatatg 41157183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41533468 - 41533189
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||| | ||||| || | |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41533468 actcaccgatgttacttctatgttagatttcatctgatgtaaatatggatatcaatcgttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 41533369  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||| ||     |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  41533368 ttggataatatgcaatcataattcacacattattggttccttt-ttcgttccaattgctttcttcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaattg 41533270  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  41533269 attatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgtcctgtcgttttaacatcttttctttcgaa 41533189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 5836027 - 5836221
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5836027 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattagttcttttattggttccaattgtttttttcataaatattatgtcaa 5836126  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5836127 ttcctaatctcattaactgattatatg--ctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttctttc 5836221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42810554 - 42810359
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42810554 tagattatcctcactcaccgatgctacttctttgcttgatt-catttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactc 42810456  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||    
T  42810455 ttttttataattttgga------gtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctca 42810362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 291
Target Start/End: Original strand, 30826837 - 30827018
Alignment:
Q  110 tttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||    
T  30826837 tttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttgttggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatcgtataa 30826936  T
Q  210 actgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30826937 attgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgtttcgtcgttttaacatctcttctttc 30827018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45292032 - 45291820
Alignment:
Q  86 aactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcct 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||     |||| ||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||    
T  45292032 aactctataacaacaacaatctttttaataattttggataatgtgtaatcataattctcacatcattggttccttt-ttggtgataattgttttcatcct 45291934  T
Q  181 aaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaata 280  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45291933 aaatattatgtcaattcctaatctcataaacttattatatgctctcttaatcagcccgtacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacg 45291834  T
Q  281 tctcttctttcgaa 294  Q
    | ||||||||||||    
T  45291833 tatcttctttcgaa 45291820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4466007 - 4465826
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||     
T  4466007 ttttggataatatgtaatcataattcacacattattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaacattatgtcaattcataatctcataaat 4465909  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  4465908 tgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 4465826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 38992891 - 38993020
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttta-taat 117  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38992891 actcactgatgctacttctttgcttgattttatttgatgtaaatatggatatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttattaat 38992990  T
Q  118 tttggataatatgtaaattcacacatcatt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38992991 tttggataatatgtaaattcacacatcatt 38993020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Original strand, 7389704 - 7389884
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     ||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  7389704 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattgat--cctttttggttccaattgttttcctcctaaacattatgtcaattcctaatctcataaac 7389801  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  7389802 tgattaaatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 7389884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25620317 - 25620136
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||||   | ||||||||||    
T  25620317 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttcctttttta-ttccaattgttttcatcctaaacattattccaattcccaatctcataaac 25620219  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25620218 tgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttaagatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 25620136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 12760752 - 12760881
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12760752 caattgttttcatcctatatattatgtcaattcctaatctcataaacagattatatgatctctaaatcagcctatacatattttatgatgaatcacaatg 12760851  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12760852 ttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 12760881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 297
Target Start/End: Original strand, 25345015 - 25345199
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||    
T  25345015 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaacattatgttaattcctaatctcataaac 25345113  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
     ||||||||| ||| | ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||    
T  25345114 agattatatgatctttcaatcagcccatacatattttatgatgaaccacaatgttccgtttttttaacatcttttctttcgtataa 25345199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25615998 - 25615862
Alignment:
Q  158 ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaat 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25615998 ttggttccaattgttatcatcctaaacattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaat 25615899  T
Q  258 cacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||    
T  25615898 cacaatgtttcattgttttaacatcttttctttcgaa 25615862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 44940446 - 44940503
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaat 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44940446 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcgaat 44940503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6300600 - 6300545
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6300600 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 6300545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42060778 - 42060723
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42060778 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 42060723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 45293180 - 45293110
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaact 89  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  45293180 actcaccgatgctacttcttttcttgatttcatatgatgtaaatatggatatcaatcattttttggtaact 45293110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 293
Target Start/End: Original strand, 37029846 - 37029897
Alignment:
Q  242 atattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37029846 atattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 37029897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Original strand, 41157180 - 41157226
Alignment:
Q  248 tatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41157180 tatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 41157226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 9761646 - 9761697
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9761646 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 9761697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23966503 - 23966448
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23966503 atacatattttatgaagaattataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 23966448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 27273610 - 27273661
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27273610 actcactgatgctacttctttccttgatttcatttgatgtaaatatgagtat 27273661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 33423868 - 33423817
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33423868 actcaccgatgctatttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 33423817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 42785547 - 42785598
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42785547 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 42785598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 5835974 - 5836025
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5835974 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 5836025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Original strand, 30826772 - 30826819
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatga 66  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30826772 actcactgatgctacttctttgcttgatttcattagatgtaaatatga 30826819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14078439 - 14078393
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatg 65  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14078439 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatg 14078393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Original strand, 28973707 - 28973992
Alignment:
Q  10 attatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttt 109  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28973707 attatattcactcaccgatgctacttctttacttgatttcttttgatgtaaatatgggtatcaatcctttttcggtaactctataacaacaacactcttt 28973806  T
Q  110 t-ttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcata 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28973807 ttttataattttggataatatgtaaactcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattatcata 28973906  T
Q  209 aactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28973907 aactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcattttaatatctcttctttcgaa 28973992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 53343064 - 53343335
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53343064 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgtgtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactctttt-tataatt 53343162  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  53343163 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 53343262  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53343263 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 53343335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33502637 - 33502363
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33502637 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatggatatcaatcattttttgataactctataacaacaacactcttttttataatt 33502538  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  33502537 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttttttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 33502438  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33502437 atgctctcttaattagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcattttaacatctcttctttcga 33502363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55998348 - 55998076
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55998348 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaaacattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 55998249  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  55998248 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggtttcaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatatcataaactgattat 55998149  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55998148 atgctctcttaaacagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccttcgttttaatatctcttctttc 55998076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19831033 - 19830727
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19831033 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacattcttttttataatt 19830934  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||   || |||||||||||||||||    
T  19830933 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctatacattatgttaatacctaatctcataaactgattat 19830834  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnnatcgaatacgtta 318  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||        |||||||||||||    
T  19830833 atgctctattaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcatctttcgaagaattttttttatcgaatacgtta 19830734  T
Q  319 ttgaacc 325  Q
    |||||||    
T  19830733 ttgaacc 19830727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36514976 - 36514670
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36514976 actcaccgatgttacttctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgagtatcaatcattttttagtaactctataacaacaacactcttttttataatt 36514877  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36514876 ttggattatatgtaaattcagacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 36514777  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnnatcgaatacgtta 318  Q
    ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||        |||||||||||||    
T  36514776 atgttctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatattccgtcgttttaacatctcttctttcaaagaattttttttatcgaatacgtta 36514677  T
Q  319 ttgaacc 325  Q
    |||||||    
T  36514676 ttgaacc 36514670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22115687 - 22115415
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22115687 actctccgatgttacttctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgggtatcaatcattttttagtaactctataacaccaacactcttttttataatt 22115588  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22115587 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 22115488  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22115487 atgctctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatctcttctttc 22115415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 2776931 - 2777203
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776931 actcaccgatgttatttctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgggtatcaatcattttttagtaactctataacaacaacactcttttttataatt 2777030  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  2777031 ttggataatatgtaaattcacatatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgttaatttctaatctcataaactaattat 2777130  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2777131 atgctctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 2777203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39742630 - 39742359
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39742630 actcactgatgctacttctttgcttgatttcattt-atgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 39742532  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  39742531 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcatttattgattccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 39742432  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  39742431 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatcttttctttc 39742359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 17699830 - 17700105
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17699830 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggcatcaatcattttttggtaactctataacaacgtcactcttttttataatt 17699929  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  17699930 ttggataatatgtaaattcacacattattggttcctttactggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaacttattat 17700029  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17700030 atgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatctattctttcgaa 17700105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19109387 - 19109121
Alignment:
Q  25 cgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggat 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19109387 cgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttgttaactctataacaacaacactcttttttacaattttggat 19109288  T
Q  125 aatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||||||||||    
T  19109287 aatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatttcataaattgtttatatgctc 19109188  T
Q  225 tcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  19109187 tcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttagcatcacttctttc 19109121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37701233 - 37700928
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37701233 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactattttctataatt 37701134  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   || | |||||||||||||||    
T  37701133 ttggataatatataaattcacacatcattgg-ttctttattggtttcaattgttttcatcctatatattatgtcaatacctaatttcataaactgattat 37701035  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnnatcgaatacgtta 318  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  37701034 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaattacaatgttccatcgttttaacatctcttctttcgaataattttttttatcgaatacgtta 37700935  T
Q  319 ttgaacc 325  Q
    |||||||    
T  37700934 ttgaacc 37700928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 38008915 - 38009192
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttata--a 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  38008915 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgtgtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacacttttttttttatta 38009014  T
Q  117 ttttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgatt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||    
T  38009015 ttttgcataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatatcataaattgatt 38009114  T
Q  217 atatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38009115 atatgctcccttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 38009192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35495237 - 35494964
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35495237 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 35495138  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  35495137 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcct-aatattatgtcaattcctaatctcataaactaattat 35495039  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaat 295  Q
    ||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  35495038 atgctctcttaatcagcccat--atattttctgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatatttactttcgaat 35494964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 291
Target Start/End: Original strand, 21353690 - 21353945
Alignment:
Q  36 ctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaat 135  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21353690 ctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgggtatcaatcattttttagtaactctataacaacaacacttttttttataattttggataatatgtaaat 21353789  T
Q  136 tcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagc 235  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21353790 taacacatcattggttcttttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagc 21353889  T
Q  236 taatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21353890 acatacatattttatgatgaatcacaatgtttcgtcgttttaacatctcttctttc 21353945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41983869 - 41983592
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41983869 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatggatatcaattcttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 41983770  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  41983769 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttcctttattggttccaattgtttccatcctaaatattatttcaattcataatctcataaactg 41983670  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41983669 attatattctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaagcacaatgtttcgtcgttttaacatctcttctttc 41983592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 17740695 - 17740974
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17740695 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaattcttttttggcaactctacaacaacaacactcttttttataatt 17740794  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17740795 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactg 17740893  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17740894 attatatgatctctaaatcaacccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 17740974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47557060 - 47556783
Alignment:
Q  21 tcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatttt 120  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  47557060 tcaccgatgctacttctttgtttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctgcaacaacaacactcttttttataatttt 47556961  T
Q  121 ggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgat 215  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  47556960 ggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttttttg-ttccaattgttttcatcctaaatattatctcaattcctaatctcataaactgat 47556862  T
Q  216 tatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47556861 tatatgatctctaaatcagttcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 47556783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7643428 - 7643163
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7643428 actcaccgatgctacttttttgcttgatttcattttatgtaaatatgtgtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttacaatt 7643329  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||            |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7643328 ttggttaatatgtaaatttacacatcatt------------ggttccgattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 7643241  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7643240 atgctctc-taataagctcatacatattttatgatgaattacaatgttccgtcgttttaacatatcttctttcgaataa 7643163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 13628709 - 13628978
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13628709 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgacgtaaatatgggtagcaatcattttttggtaactctatatcaacaacaatcttttttataatt 13628808  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  13628809 ttggataatatgtaaattcaaacatcattggttcctttattggttctaattgtttt-atcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaattgattat 13628907  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  13628908 atgctatcttaatcagc--ctacattttttatgatgaatcacaatgatccgtcgttttaacagctcttctttc 13628978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34056146 - 34055950
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34056146 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatatcaa 34056047  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34056046 ttcctaatctcataaactgattatatgttctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 34055950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Original strand, 36857709 - 36857986
Alignment:
Q  6 gtagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacact 105  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  36857709 gtagattatcctcactcactaatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcatttttcggcaactcaattacaacaacact 36857808  T
Q  106 cttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  36857809 cttttttataattttggataatatgtaaattcacacatc------------attggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctc 36857896  T
Q  206 ataaactgattatat-gctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  36857897 ataaattgattatatggctctcttaatcagcctatacatattttatgataaatcacaatgttccgttgttttaacgtttcttctttcgaa 36857986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 23479607 - 23479804
Alignment:
Q  95 acaacaacactctttt-ttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtca 193  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23479607 acaacaaaactctttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgatttctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtca 23479706  T
Q  194 atttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23479707 attcctaatcttataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 23479804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 40622805 - 40623079
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||    
T  40622805 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctaatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactctttttt---ttt 40622901  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  40622902 ttggataatatgtaatcataattcacacattattagttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcttaatctcataaactg 40623000  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||| |||  | |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  40623001 attgtat--tatctagattagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatcttttctttcgaa 40623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14829094 - 14828901
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14829094 acaacaaaactcttttttagaattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 14828995  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttct 288  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14828994 ttcataatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttct 14828901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5271858 - 5271662
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5271858 acaacaaaactctttaatataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcatttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 5271759  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5271758 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagtccatacatattttatgatgaatttcaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 5271662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 157 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54331264 - 54331130
Alignment:
Q  157 attggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  54331264 attggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaa 54331165  T
Q  257 tcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54331164 tcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 54331130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Original strand, 2116579 - 2116761
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatatt-atgtcaatttgtattctcataaa 210  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||    
T  2116579 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaacatttatgtcaattcataatctcataaa 2116677  T
Q  211 ctgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2116678 ctgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 2116761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15642549 - 15642423
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15642549 caattgttttcatcttaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcataatg 15642450  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15642449 ttccgtcgttttaacatctcttctttc 15642423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39715031 - 39714902
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39715031 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 39714932  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  39714931 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 39714902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12682340 - 12682160
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     ||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  12682340 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattgat--cctttttggttccaattgttttcatcctaaacattatgtcaattcctaatctcataaac 12682243  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  12682242 tgattaaatgatctctaaatcaactcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgtttaaacatcttttctttcgaa 12682160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Original strand, 46104653 - 46104834
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  46104653 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttttttgtttc-aattattttcatcctaaacattatgtcaattcctaatctcataaac 46104751  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  46104752 tgattatattatctctaaatcagcccatacatattttataatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 46104834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 52800800 - 52800929
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52800800 caattgttttcattctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 52800899  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  52800900 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 52800929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 7847678 - 7847789
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc-ttttttataat 117  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7847678 actcactgatgctacttctttacttgatttcaattgttttaaatatgggtatcaatcctttcttggtaactctataacaacaacactctttttttataat 7847777  T
Q  118 tttggataatat 129  Q
    ||||||||||||    
T  7847778 tttggataatat 7847789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Original strand, 8531472 - 8531564
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  8531472 actcaccgatgctacttttttgcttgatttcatctgatgtaaatatgtgtatcaatccttttttgataactctacaacaacaaaactcttttt 8531564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28134819 - 28134764
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28134819 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcga 28134764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 740420 - 740365
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  740420 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 740365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 293
Target Start/End: Original strand, 15520999 - 15521050
Alignment:
Q  242 atattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15520999 atattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 15521050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 23479554 - 23479605
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23479554 actcactgatgctacgtctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtat 23479605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14828904 - 14828874
Alignment:
Q  201 ttctcataaactgattatatgctctcttaat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14828904 ttctcataaactgattatatgctctcttaat 14828874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14829133 - 14829096
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14829133 cttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 14829096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 17940138 - 17940413
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17940138 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttacaatt 17940237  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  17940238 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 17940337  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  17940338 atgttctcttaatcaacccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttagcatctcttctttcgaa 17940413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 291
Target Start/End: Original strand, 18312423 - 18312680
Alignment:
Q  34 ttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaa 133  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18312423 ttctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaa 18312522  T
Q  134 attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaatta 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18312523 attcacacatcattggttcctttattggttccaattattttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattatatgctctcttaatca 18312622  T
Q  234 gctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  18312623 gcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgtttcaacatctcttctttc 18312680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Original strand, 15276254 - 15276521
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15276254 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccctttttggtaactctataacaacatcactcttttttataatt 15276353  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||    
T  15276354 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgtttttatcataaatattatgttaattcccaatctcataaactgattat 15276453  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctctt 286  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  15276454 atgatctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatattccgtcattttaacatctctt 15276521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 291
Target Start/End: Original strand, 35041720 - 35041977
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 132  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35041720 cttctttgtttgatttcatttgatgtgaatatgggtatcaattattttttagtaactctataataacaacactcttttttataattttggataatatgta 35041819  T
Q  133 aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaatt 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35041820 aattcacacatcattggttcctttattggttccaattg-tttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattatatgctctcttaatc 35041918  T
Q  233 agctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35041919 agcacatacatattttatgatgaatcacaatcttccgtcgttttaacatctcttctttc 35041977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22373472 - 22373200
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22373472 actcactgatgctacttttttgcttgatttcatttgatgtcaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaagaacactcttttttataatt 22373373  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  22373372 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattgggtctaattgttttcatcttaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 22373273  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  22373272 gtgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatattccgtagttttaacatatcttctttc 22373200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 4425107 - 4425370
Alignment:
Q  23 accgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatcctttt-ttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttg 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425107 accgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgcaaatctgggtatcaatcatttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttg 4425206  T
Q  122 gataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |         |||||||||||||    
T  4425207 gataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcct---------aactgattatatg 4425297  T
Q  222 ctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4425298 ctctcttaatcaacccatacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 4425370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33321082 - 33320807
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33321082 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatataaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 33320983  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||| |||||     |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  33320982 ttggataacatgtaatcataattaacacatcattggttccttt-ttggttctaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 33320884  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  33320883 attatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatcttttcttt 33320807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 7222929 - 7223189
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7222929 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctattacaacaacactcttttttataatt 7223028  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||            ||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  7223029 ttggataatatgtaaattcatacatcattggttt------------caaatgttttcatcttaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 7223116  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  7223117 atgctctcttaatcagcagatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcattttaacatctcttctttc 7223189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 95 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18598561 - 18598359
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18598561 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 18598462  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18598461 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaagcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcaaa 18598362  T
Q  295 taa 297  Q
    |||    
T  18598361 taa 18598359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 21800212 - 21800408
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21800212 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgatttctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 21800311  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21800312 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcaggtcatacatattttatgatgcatcacaatgttccgtcgtttttacatctcttctttc 21800408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 34321713 - 34321981
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321713 actcaccgatgctacttcttttcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 34321812  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||| |||||       ||| |||  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  34321813 ttggataatgtgtaat------cataattc-tcacatcattggttccaattgttttcatcctaaatattatgccaatttctaatctcataaactgattat 34321905  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||  ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34321906 atgctctcttaatctgcccgtacatatttcatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatctcttctttcgaa 34321981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 14832101 - 14832380
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc-ttttttataat 117  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14832101 actcaccgattatacttctttgtttgatttcatctgatgtatatatg-gtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcgttttttataat 14832199  T
Q  118 tttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaact 212  Q
    ||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  14832200 tttggataatatgtaatcataattcaaacatcattggttcgttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaactcctaatctcataaact 14832298  T
Q  213 gattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14832299 gattatatgatctctaaatcagcccatatatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 14832380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1072839 - 1072643
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1072839 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 1072740  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1072739 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatttcaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 1072643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 33814662 - 33814858
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33814662 acaacaacactattttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 33814761  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  33814762 ttcctaatctcataaattgattatatgctctcttaatcatcccatacatattttatgatgaatcacaatgtttcgtcgttttatcatctcttctttc 33814858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 34856623 - 34856819
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34856623 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 34856722  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34856723 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagtccatacatattttatgatgaatcataatgttccgtagttttaacatctcttctttc 34856819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 95 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11933058 - 11932875
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11933058 acaacaacacttttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggtttcaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 11932959  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaa 278  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11932958 ttcctaatctcttaaactgattatatactctcttaatcaggtcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaa 11932875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 103 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14887506 - 14887318
Alignment:
Q  103 actcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtatt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  14887506 actcttttttataatttttgataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggtttcaatagttttcatcctaaatattatgtcaattcttaat 14887407  T
Q  203 ctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14887406 ctcataaactgattatatgctctcttaatcagcctatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatctcttctttc 14887318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 25540550 - 25540835
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt------ 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    | ||||||          
T  25540550 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgatttaaatatgggtatcaatcattttttggtaattctacaacaacacttttttttttttttttt 25540649  T
Q  113 -ataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
     |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||    
T  25540650 tataattttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttttttg-ttccaattgttttcatcctaaacattatgtcaattcctaatctca 25540748  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  25540749 taaactgattatatgatctctaaatcaggccatacatattttatgatgaatcataattttttgtcgttttaatatcttttctttcga 25540835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 30044814 - 30044960
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30044814 tagattatattcactcactgatgctacttctttgcttgatttcttttgatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaa-aacactc 30044912  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttct 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  30044913 ttttttataattttggataatatgtaaactcacatatcgttggtttct 30044960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Original strand, 4108441 - 4108622
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  4108441 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttcctattgttttcatcctaaatattatgtcaattcttaatctcataaac 4108539  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  4108540 tgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttataatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 4108622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Original strand, 35158714 - 35158867
Alignment:
Q  140 acatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaat 239  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||   ||    
T  35158714 acatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagtccat 35158812  T
Q  240 acatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  35158813 acagattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatattttctttcgaa 35158867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 1220293 - 1220422
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1220293 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 1220392  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  1220393 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 1220422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 24445702 - 24445831
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24445702 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 24445801  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24445802 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 24445831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9979573 - 9979444
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9979573 caattgttttcattctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 9979474  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  9979473 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 9979444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 189
Target Start/End: Original strand, 2521850 - 2521932
Alignment:
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2521850 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattat 2521932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 291
Target Start/End: Original strand, 2521928 - 2522005
Alignment:
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2521928 attatatgctctcttaatcaactcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcattttaacatctcttctttc 2522005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28573418 - 28573340
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgt 191  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28573418 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaatcgttttcatcctaaacattatgt 28573340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 34856570 - 34856621
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34856570 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtat 34856621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 2521783 - 2521834
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2521783 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 2521834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11933111 - 11933060
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11933111 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 11933060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13456848 - 13456793
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  13456848 atacatattttatgatgaattataatgttccatcgttttaacatatcttctttcga 13456793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 14887567 - 14887516
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14887567 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 14887516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18598614 - 18598563
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18598614 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 18598563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 33814609 - 33814660
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33814609 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 33814660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 1072892 - 1072841
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1072892 actcactgatgctacttctttgtttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 1072841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 21800159 - 21800210
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21800159 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 21800210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48869 - 48580
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48869 tagattatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcttttgatgtaaatatgagtataaatctttttttggtaactctataacaa-aacactc 48771  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48770 ttttttataattttggataatatgtaaactcacatatcattggtttctttattggttccaattgttttaatcctaaatattatgttagtttgtattctca 48671  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48670 taaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttatgtcattttaatatctcttctttcgaataa 48580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Original strand, 16342277 - 16342558
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 106  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16342277 tagattatattcactcaccgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatggctatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactc 16342376  T
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16342377 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttc---ttgttttcatcctaaatattatgtcaatttttattctca 16342473  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16342474 taaactgattatatgatctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaattactcttctttc 16342558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18741849 - 18741577
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18741849 actcaccgatgctacttctttgcttgattgcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 18741750  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  18741749 ttggataatatttaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcattctaaatattatgtcaattcctaatcttataaactgattat 18741650  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18741649 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 18741577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54648510 - 54648240
Alignment:
Q  21 tcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54648510 tcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataataacaacactcttttttataatttt 54648411  T
Q  121 ggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||    
T  54648410 ggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggtttcaattgttttcatcctaaatattatgtcaattactaatctcataaactgattacat 54648311  T
Q  221 gctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54648310 gctctcttaatcaacctatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttctttc 54648240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21699208 - 21698936
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21699208 actcaccgatgctacttctttgctcgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttcgtaactttataacaacaacattcttttttataatt 21699109  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21699108 ttggataatatgtaaattcacacatcattagttcctttattggttcaaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 21699009  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21699008 atgctctcttaatcagtccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 21698936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 51248937 - 51249212
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248937 actcaccgatgctagttctttgcttgatttcatttgaggtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 51249036  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  51249037 ttggataatatataaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcataatctcataaattgattat 51249136  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  51249137 gtgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttagcatctcttctttcgaa 51249212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 50742006 - 50742277
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50742006 actcatcgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttacaatt 50742105  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  50742106 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttatttgttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgtttat 50742205  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  50742206 atgctctcttaattatcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcattttagcatcacttcttt 50742277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 52853076 - 52852801
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52853076 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttagtaactttataacaacaacactcttttttataatt 52852977  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||    
T  52852976 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttctaattgttttcatcctaaatattatgttaattcctaatttcataaactgattat 52852877  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  52852876 atgctctcttaatcagctcatacatattttataatgaatcataatattccattgttttaacatatcttctttcgaa 52852801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 54513418 - 54513699
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54513418 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 54513517  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  54513518 ttggataatatgtaatcataattcacgcatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaattg 54513617  T
Q  214 attatatg--ctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||  |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54513618 attatatgctctctcttaatcagcccata-atattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 54513699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 52462552 - 52462275
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52462552 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacagcaacactcttttttataatt 52462453  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  52462452 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttcctttattggttccaattgtttccatcctaaatattatttcaattcttaatctcataaactg 52462353  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  52462352 attatattctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcataatgtttcgtcgttttaacatctcttctttc 52462275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 49113700 - 49113960
Alignment:
Q  21 tcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113700 tcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatttt 49113799  T
Q  121 ggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||            |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  49113800 ggataatatgtaaattcacacatc------------attgattccaattgtttttatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaattgattatat 49113887  T
Q  221 gctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49113888 gctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgtttcgtcgttttaacatctcttctttcga 49113960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 52842213 - 52842495
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaaca---ctcttttttata 115  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  52842213 actcactgatgctacttctttgtttgatttcatcttatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacaacgctcttttttata 52842312  T
Q  116 attttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaa 210  Q
    ||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  52842313 attttggataatatgtaatcataattcacacgtcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaa 52842411  T
Q  211 ctgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52842412 ctgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 52842495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55294402 - 55294123
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55294402 actcaccaatgttacttctttgtttgatttcatcttatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 55294303  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  55294302 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 55294204  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  55294203 attatatgatctctaaatcagcccatgcatattttatgatgaatcacaatattccgtcgttttaaaatcttttctttcgaa 55294123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 23194822 - 23195106
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttat---- 114  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||        
T  23194822 actcatcgatgttacttctttgcttaatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaaaaacacttttttttatttgt 23194921  T
Q  115 aattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataa 209  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23194922 aattttggataatatgtaatcataattcacacatcattgatttctttattagctccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataa 23195021  T
Q  210 actgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23195022 actgattatatgctctcttaatcagtccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaaaatctcttctttcgaa 23195106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48520661 - 48520382
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48520661 actcaccaatgctacttctttgtttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 48520562  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  48520561 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttacttt-ttggttccaattgttttcattctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 48520463  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  48520462 attatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatcaatcacaatgttctgtcgttttaacatcttttctttcgaa 48520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 8243124 - 8243416
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt------ 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          
T  8243124 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactttttttttttttt 8243223  T
Q  113 ------ataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtat 201  Q
          |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  8243224 ttttttataattttggataatatgtaatcataattcacacatcattgattcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaa 8243323  T
Q  202 tctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8243324 tctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatctattctttcgaa 8243416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 67 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19406910 - 19406691
Alignment:
Q  67 gtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttcca 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19406910 gtatcaatcattttttggtaactctattacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttcca 19406811  T
Q  167 attgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgtt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19406810 attgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatatatattttatgatgaatcacaatgtt 19406711  T
Q  267 ccgtcgttttaatatctctt 286  Q
     | ||||||||| |||||||    
T  19406710 tcatcgttttaacatctctt 19406691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 32756147 - 32756416
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756147 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgttttaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 32756246  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  32756247 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaacta 32756346  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    |       |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32756347 a-------ctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaccatctcttcttt 32756416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50770815 - 50770619
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50770815 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 50770716  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50770715 ttcctaatatcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 50770619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 54934439 - 54934715
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54934439 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgttttaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactattttttataatt 54934538  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||| |||     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  54934539 ttggataatatataatcatgattcacacatcattgtttcctttattggttccaattattttcatcctaaatattatgtcaattcttaatctcataaacta 54934638  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    || ||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54934639 atgatatgctttcttaatcagtccatacatattttatgatgaatcacaatgttccttcgttttaacatctcttcttt 54934715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 294
Target Start/End: Original strand, 39092974 - 39093238
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 132  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39092974 cttctttgtttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatc-ttttttcgtaactctacaacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 39093072  T
Q  133 a-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctct 227  Q
    |     |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||    
T  39093073 atcataattcacacatcattggttccttttttg-ttccaattgtttgcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctct 39093171  T
Q  228 taattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39093172 aaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 39093238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40824291 - 40824012
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatcctttttt-ggtaactctataacaacaacactcttttttataat 117  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40824291 actcatcgatgctacttctttacttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatcatttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataat 40824192  T
Q  118 tttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaact 212  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  40824191 tttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttcaaattgttttcatcc-aaatattatgtcaattcctaatctcataaact 40824094  T
Q  213 gattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    | ||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40824093 gtttatattttctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 40824012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31368584 - 31368388
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31368584 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcattctaaatattatgtcaa 31368485  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31368484 ttcctaatttcataaactgattatatgctctcttaatcagtccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 31368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 107 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6103677 - 6103493
Alignment:
Q  107 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  6103677 ttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctca 6103578  T
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  6103577 taaactgattatatgctatcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcataatgttctgtcgttttaacatcttttctttc 6103493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35087408 - 35087225
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087408 acaacaacattcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtt------------ccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 35087321  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35087320 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttacgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttcttt 35087225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4138310 - 4138129
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  4138310 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggtttcttt-ttggttccaattgttttcatcctaaacattatgtcaatttctaatctcataaac 4138212  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||    
T  4138211 tgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttttttcgaa 4138129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2839777 - 2839578
Alignment:
Q  95 acaacaacactctttttt-ataattttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatatta 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||     |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2839777 acaacaacactctttttttataattttgaataatatataatcataattaacacatcattgattcctttattggtttcaattgttttcatcctaaatatta 2839678  T
Q  189 tgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttct 288  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2839677 tgtcaattcttaatctcataaactgattatatgttctcttaatcaactcatatatattttataatgaattacaatgttccgtcgttttaacatctcttct 2839578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26777456 - 26777275
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||    
T  26777456 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattagttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaacattatgccaattcctaatctcataaac 26777358  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  26777357 tgattatatgatctcgaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 26777275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11597581 - 11597467
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11597581 actcaccaatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatctttttttggtaactctataagaacaacactcttttttataact 11597482  T
Q  119 ttggataatatgtaa 133  Q
    |||||||||||||||    
T  11597481 ttggataatatgtaa 11597467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 48977608 - 48977749
Alignment:
Q  77 ttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||            ||||||||||||||||||||    
T  48977608 ttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacaaatc------------attggttccaattgttttca 48977695  T
Q  177 tcctaaatattatgtcaatttgtattctcat--aaactgattatatgctctctt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||   | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48977696 tcctaaaaattatgtcaattcaaaatctcataaaaactgattatatgctctctt 48977749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 2843544 - 2843461
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaac 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2843544 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgaggtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctctaacaacaac 2843461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11597452 - 11597368
Alignment:
Q  207 taaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11597452 taaactgattatatgatctctaaatcagcctatacatattttatgatgaatcacaatgtttcgtcgttttaatatcttttctttc 11597368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 48988911 - 48988967
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  48988911 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcacttctttcgaa 48988967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 19353697 - 19353776
Alignment:
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19353697 tgattatatgctctcttaatcaatccatacatattttatgatgaatcacaatgtttcatcgttttaacatctcttctttc 19353776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5252369 - 5252314
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5252369 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttccttcga 5252314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39796468 - 39796413
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  39796468 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatattttctttcga 39796413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 183
Target Start/End: Original strand, 53800998 - 53801068
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaa 183  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53800998 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaa 53801068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 48977312 - 48977381
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaac 88  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  48977312 actcactgattctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcgattattttttggtaac 48977381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6093474 - 6093396
Alignment:
Q  55 atgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaa 133  Q
    ||||||||||  || | ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  6093474 atgtaaatattggtgttaatccctttttggtaactctatgacaataacgctcacttttataatttcggctaatatgtaa 6093396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6103747 - 6103701
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatg 65  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6103747 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatg 6103701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31368636 - 31368595
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaa 60  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31368636 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaa 31368595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 654 - 379
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  654 actcacagatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 555  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  554 ttacataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 455  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  454 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatattccatcgtgttaacatctcttctttcgaa 379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 42688192 - 42688467
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42688192 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgtgtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacacccttttttataatt 42688291  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  42688292 ttgaataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttcaaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 42688391  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||| ||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42688392 atgttctcttaaacagcccatacatattttacgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 42688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Original strand, 17470369 - 17470675
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17470369 actcaccaatgttacttctttgtttgatttcattttatgtgaatatgggtatcaatcattttttaataactcaataacaacaacactcttttttataatt 17470468  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17470469 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 17470568  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnnatcgaatacgtta 318  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||         |||||||||||||    
T  17470569 atgctctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatgtttcatcgttttaacatctcttctttcaaatatttttttttatcgaatacgtta 17470668  T
Q  319 ttgaacc 325  Q
    |||||||    
T  17470669 ttgaacc 17470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17582845 - 17582539
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17582845 actcaccaatgttacttctttgtttgatttcattttatgtgaatatgggtatcaatcattttttaataactcaataacaacaacactcttttttataatt 17582746  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17582745 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaactgattat 17582646  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataannnnnnnnatcgaatacgtta 318  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||         |||||||||||||    
T  17582645 atgctctcttaatcagcacatacatattttatgatgaatcacaatgtttcatcgttttaacatctcttctttcaaatatttttttttatcgaatacgtta 17582546  T
Q  319 ttgaacc 325  Q
    |||||||    
T  17582545 ttgaacc 17582539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 11500497 - 11500765
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500497 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 11500596  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  11500597 ttggataatatgtaaattcacacatcattagttcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattat 11500696  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||| ||||| |  |||     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11500697 atgctctgttaatca--taa-----atattatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 11500765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 33031496 - 33031767
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33031496 actcaccgatgctacttatttgcttgatttcatttgatgtcaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaataacact-ttttttataatt 33031594  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  33031595 ttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggtttcaattgttttcatcctaaatattatgtcaattctgaatctcataaactgattat 33031694  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33031695 atgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttc 33031767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 47175100 - 47175378
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  47175100 actcatcgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatacgagtatctatccttttttggtaactcca--acaacaaaactcttttttataatt 47175197  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  47175198 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcataatctcataaactg 47175297  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  47175298 attatatgctctcttaatcaacccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcattttaacatctcttctttcgaa 47175378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23299348 - 23299066
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23299348 actcaccgatgctacttctttacttgatttcatgtgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaagaacactcttttttataatt 23299249  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  23299248 ttggataatatgtaatcataattcacatatcattgattccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 23299150  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  23299149 attatatgatctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcattttaacatcttttctttcgaataa 23299066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 42918501 - 42918781
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt-ataat 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42918501 actcaccgatgctactttttttcttgatttcatctgatgtaaatatgagtatcaatctttttttggtaactctataacaacaacactctttttttataat 42918600  T
Q  118 tttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaact 212  Q
    |||||||||| |||||     |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  42918601 tttggataatgtgtaatcataattctcacatcattggttccttt-ttggtttcaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaact 42918699  T
Q  213 gattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42918700 gattatatgctctcttaatcagccggtacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 42918781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27734674 - 27734397
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27734674 actcaccgatgctacttctttgtttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 27734575  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  27734574 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaattattatgtcaattcctaatctcataaactg 27734476  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27734475 attatatgatctctaaatcagcccatacatattttataatgaat--caatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 27734397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 61 - 277
Target Start/End: Original strand, 5963364 - 5963581
Alignment:
Q  61 atatgagtatcaatcctttt-ttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttatt 159  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5963364 atatgggtatcaatcatttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacttcattggttcctttatt 5963463  T
Q  160 ggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatca 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  5963464 ggttctaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaattgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatca 5963563  T
Q  260 caatgttccgtcgtttta 277  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5963564 caatgttccgtcgtttta 5963581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 9149962 - 9150242
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9149962 actcaccgatgctacttctttgtttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 9150061  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttcc-aattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaact 212  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  9150062 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttcctttttgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaact 9150160  T
Q  213 gattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||    
T  9150161 gattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccttcgtttatacatcttttctttcgaa 9150242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33638299 - 33638020
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33638299 actcaccgatgttacttctttgcttaatttcatctgatgtaaatacggatatcaatccttttttgctaactctacaacaacgacactcttttttataatt 33638200  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  33638199 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctaataaactg 33638101  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| | ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33638100 attataagatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 33638020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Original strand, 19521787 - 19522052
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatcctttttt-ggtaactctataacaacaacactcttttttataat 117  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19521787 actcacagatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatgtg--tttcaatcatttttttggtaactctataacaataacactcttttttataat 19521884  T
Q  118 tttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgatta 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||    
T  19521885 tttggataatatgtaaattcacacatcattg------------gttccaattgttttcaacctaaatattatgtcaattcataatctcataaactggtta 19521972  T
Q  218 tatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19521973 tatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaataa 19522052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42826982 - 42826704
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctt-ttttataat 117  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42826982 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctattttaaatatgggtatcaatctttttttggtaactctataacaacaacactctttttttataat 42826883  T
Q  118 tttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaact 212  Q
    |||| ||||| ||||     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  42826882 tttgaataatgtgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaattatttttatcctaaatattatgtcaatttctaatctcataaatt 42826783  T
Q  213 gattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
      ||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42826782 --ttacacgctctcttaatcagcctatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcga 42826704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 17478551 - 17478753
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17478551 actcatcgatgctacttatttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacattcttttttacaatt 17478650  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  17478651 ttggataatatgtaaattcacacatcattatttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctaataaactgattat 17478750  T
Q  219 atg 221  Q
    |||    
T  17478751 atg 17478753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 17482986 - 17483188
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17482986 actcatcgatgctacttatttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacattcttttttataatt 17483085  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  17483086 ttggataatatgtaaattcacacatcattatttcctttattggttccaattgtttttatcctaaatattatgtcaattcctaatctaataaactgattat 17483185  T
Q  219 atg 221  Q
    |||    
T  17483186 atg 17483188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17570228 - 17570026
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17570228 actcatcgatgctacttatttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacattcttttttataatt 17570129  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  17570128 ttggataatatgtaaattcacacatcattatttcctttattggttccaattgtttttatcctaaatattatgtcaattcctaatctaataaactgattat 17570029  T
Q  219 atg 221  Q
    |||    
T  17570028 atg 17570026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17574663 - 17574461
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17574663 actcatcgatgctacttatttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacattcttttttacaatt 17574564  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  17574563 ttggataatatgtaaattcacacatcattatttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctaataaactgattat 17574464  T
Q  219 atg 221  Q
    |||    
T  17574463 atg 17574461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8925482 - 8925286
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8925482 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcatacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 8925383  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || | ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8925382 ttcctaatatcataaactgattatatgctctcttgatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 8925286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 296
Target Start/End: Original strand, 14309553 - 14309760
Alignment:
Q  103 actcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttcttta--------------ttggttccaattgttttcatcctaaatatta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||              ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14309553 actcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatttattggttccaatagttttcatcctaaatatta 14309652  T
Q  189 tgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttct 288  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14309653 tgtcaattcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattctatgatgaatcacgatgttccgtcgttttaacatctcttct 14309752  T
Q  289 ttcgaata 296  Q
    ||| ||||    
T  14309753 ttcaaata 14309760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23766011 - 23765847
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23766011 acaacaaaactcttttttataattttcgataatatgtaaattcacacatcattgattcatttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 23765912  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatca 259  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  23765911 ttcctaatctcataaactgattatatgctttctaaatcaggtcatacatattttatgatgaatca 23765847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Original strand, 4848834 - 4849015
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  4848834 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggtt-cttttttggttccaattgttttcaacttaaacattatgtcaattcctaatctcataaac 4848932  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  4848933 tgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaagatcttttctttcgaa 4849015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 49145819 - 49145638
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||    
T  49145819 ttttggataatatgtaatcataattcacatatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatcaaataaac 49145721  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  49145720 tgattatatgatctctaaatcagtccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 49145638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 157 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39649467 - 39649330
Alignment:
Q  157 attggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaa 256  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39649467 attggtttcaattattttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaa 39649368  T
Q  257 tcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  39649367 tcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 39649330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48528273 - 48528140
Alignment:
Q  161 gttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48528273 gttccaattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcac 48528174  T
Q  261 aatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  48528173 aatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 48528140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 17170801 - 17170930
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17170801 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 17170900  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17170901 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 17170930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31898304 - 31898171
Alignment:
Q  161 gttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31898304 gttccaattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcac 31898205  T
Q  261 aatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||    
T  31898204 aatgttccgttgttttaacatcctttctttcgaa 31898171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6911474 - 6911419
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6911474 atacatattttatgatgaattataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 6911419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47573452 - 47573397
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  47573452 atacatattttatgatgaattataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 47573397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8925535 - 8925484
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8925535 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 8925484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23766064 - 23766013
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23766064 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 23766013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 70
Target Start/End: Original strand, 14309500 - 14309543
Alignment:
Q  27 atgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14309500 atgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 14309543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25967 - 25712
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgta 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25967 cttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctattacaacaaaactcttttttagaattttggataatatgta 25868  T
Q  133 aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaatt 232  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25867 aattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaattcataatctcataaactgattatatgctctcttaatc 25768  T
Q  233 agctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttct 288  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  25767 agcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttct 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25715 - 25685
Alignment:
Q  201 ttctcataaactgattatatgctctcttaat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25715 ttctcataaactgattatatgctctcttaat 25685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 44407002 - 44407277
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||||| | || | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44407002 actcaccaatgttacttctttgtttgatttcatctgatctgaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 44407101  T
Q  119 ttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  44407102 ttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattagttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttctaatcttataaactgattat 44407201  T
Q  219 atgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44407202 atgctcttttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 44407277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 52310476 - 52310755
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52310476 actcaccgatgctacttctttgtttgatttcatatgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 52310575  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    || ||||||||||||     ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  52310576 ttagataatatgtaatcataattcatacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 52310674  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52310675 attatatgatctctaaatcatctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 52310755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 45005412 - 45005688
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45005412 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgttttaaatatgagtatcaattcttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 45005511  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  45005512 ttggataatatgtaatcataattcacacatcatta-tttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaacta 45005610  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45005611 attatatgctttcttaatcagcctatacatattttatgatgaatcacaatgctccatcgttttaacatctcttctttc 45005688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38844814 - 38844531
Alignment:
Q  21 tcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatcctttttt-ggtaactctataacaacaacactctttttt------- 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||           
T  38844814 tcaccgattctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcatttttttggtaactctataacaacaacacttttttttttttttt 38844715  T
Q  113 --ataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaa 210  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  38844714 ttataattttggataatacgtaaattcacagatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaa 38844615  T
Q  211 ctgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  38844614 ctgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcattttaacatctcttctttcgaa 38844531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 95 - 325
Target Start/End: Original strand, 34692810 - 34693040
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34692810 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 34692909  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34692910 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctattctttcaaa 34693009  T
Q  295 taannnnnnnnatcgaatacgttattgaacc 325  Q
     ||        ||||||||||||||||||||    
T  34693010 gaattttttttatcgaatacgttattgaacc 34693040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 293
Target Start/End: Original strand, 17672079 - 17672372
Alignment:
Q  6 gtagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatcctttttt-ggtaactctataacaacaacac 104  Q
    |||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17672079 gtagattatcttcactcactgatgctacttctttgcttgatttcatctattttaaatatgggtatcaatcttttttttggtaactctataacaacaacgc 17672178  T
Q  105 tcttttttataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  17672179 tcttttttataattttggataatatgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaatggttttcgtcctaaatattatgtcaattcct 17672278  T
Q  200 attctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17672279 aatctcataaattaattttatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcga 17672372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 291
Target Start/End: Original strand, 36682681 - 36682957
Alignment:
Q  20 ctcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt-ataatt 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36682681 ctcactgatgctacttctttgcttgatttcatctgttttaaatatgagtatcaattcttttttggtaactctataacaacaacactctttttttataatt 36682780  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  36682781 ttggataatatgtaatcataattcacacatcctta-tttctttattggatccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaacta 36682879  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36682880 attatatgttttcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgctccgtcgttttaacatctcttctttc 36682957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 50561691 - 50561968
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50561691 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgagtatcaatccttttttgataactctaaaacaacaacactcttttttataatt 50561790  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||    
T  50561791 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggtttcaattgttttcattctaaatattatgtcaattccta--atcataaactg 50561887  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  50561888 attatatgatctctaaatcagcccatatatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatcttttatttcgaa 50561968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12245503 - 12245229
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatcctttttt-ggtaactctataacaacaacactcttttttataat 117  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245503 actcactgatgctacttatttgcttgatttcatctgttttaaatatgggtatcaatcctttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataat 12245404  T
Q  118 tttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaact 212  Q
    |||| |||||||||||     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  12245403 tttgaataatatgtaatcataattcacacatcattgtttcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaaattataatctcataaact 12245304  T
Q  213 gattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
     |       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245303 aa-------ctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 12245229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 325
Target Start/End: Original strand, 34688282 - 34688512
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34688282 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 34688381  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34688382 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctattctttcaaa 34688481  T
Q  295 taannnnnnnnatcgaatacgttattgaacc 325  Q
     ||        ||||||||||||||||||||    
T  34688482 gaattttttttatcgaatacgttattgaacc 34688512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Original strand, 48340957 - 48341234
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||    
T  48340957 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaaaaacatttttttttgtaatt 48341056  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  48341057 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttcctttattagttccaattgttttcattctaaatattatgtcaattcctaatctcaaaaactg 48341156  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||    
T  48341157 attagatgctttcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatattttatcgttttaacatctcttctttc 48341234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 52521173 - 52520977
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52521173 acaacaacactcttttttataattttgaataatatgtaaattcacatatcattggttcctttattggttccaattattttcatcctaaatattatgtcaa 52521074  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  52521073 ttcataatctcataaactgattatatgctctcttaatcagctcatacgtattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctattctttc 52520977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 297
Target Start/End: Original strand, 47135977 - 47136198
Alignment:
Q  80 tttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgtttt 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  47135977 tttggtaactctacaacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgtttt 47136075  T
Q  175 catcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47136076 catcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgtt 47136175  T
Q  275 ttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  47136176 ttaacatcttttctttcgaataa 47136198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 31620384 - 31620580
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31620384 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaaaattatgtcaa 31620483  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31620484 ttcataatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatctcttctttc 31620580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 103 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41829598 - 41829410
Alignment:
Q  103 actcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  41829598 actcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaattcctaat 41829499  T
Q  203 ctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||    
T  41829498 ctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacaactattctttc 41829410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10694430 - 10694132
Alignment:
Q  21 tcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt-------- 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            
T  10694430 tcaccggtgctacttctttgcttgatttcatctcatgtaaatatgggtatcaattcttttttggtaactctacaacaacaacactctttttttatttttt 10694331  T
Q  113 ----------ataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattt 197  Q
              |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10694330 ttttatttttataattttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttgtttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattc 10694232  T
Q  198 gtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10694231 ttaatctcataaactgattatatgatctcttaatcagcccatacgtattttatgatgaatcacaatgtttcgtcgttttaacatcttttctttcgaataa 10694132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 18814914 - 18815110
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18814914 acaacaaaactcttttctataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 18815013  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18815014 ttcctaatctcataaactgattatatgatctctaaaacagaccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttc 18815110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16031239 - 16030944
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt------ 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||          
T  16031239 actcactgatgctgcttctttgcttgatttcatctgttttaaatatgggtatcaatctttttttggtaactctataacaacaacgttttttttttttttt 16031140  T
Q  113 -----------ataattttggataatatgtaa----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattt 197  Q
               |||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16031139 tttttttttttataattttggataatatgtaatcataatcacacatcattgtttcctttattagttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattc 16031040  T
Q  198 gtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
     || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16031039 ctaatctcataaactaattatattctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttatttcga 16030944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41962483 - 41962296
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41962483 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 41962384  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || ||||||||||||||         ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41962383 ttcctaatctcataaactgat---------tcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttagcatctcttctttc 41962296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51965451 - 51965201
Alignment:
Q  28 tgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt-ataattttggataa 126  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51965451 tgctacttctttgtttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactctttttttatacttttggataa 51965352  T
Q  127 tatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatg 221  Q
    |||||||     ||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  51965351 tatgtaatcataattcacacatcattggtt------------ccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatg 51965264  T
Q  222 ctctcttaattagctaatacata-ttttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatct 283  Q
     ||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  51965263 atctctaaatcagcacatacatatttttatgatgaatcacaatgttctctcgttttaacatct 51965201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 297
Target Start/End: Original strand, 5426715 - 5426899
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaac 211  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  5426715 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaacattatgtcaattcataatctcataaac 5426813  T
Q  212 tgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  5426814 tgattatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaataa 5426899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 117 - 294
Target Start/End: Original strand, 16300781 - 16300963
Alignment:
Q  117 ttttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaat-attatgtcaatttgtattctcataaa 210  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||    
T  16300781 ttttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaaacattatgtcaattcctaatctcataaa 16300879  T
Q  211 ctgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  16300880 ctgattatatgatctctaaatcaacccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 16300963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 4891875 - 4892004
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4891875 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 4891974  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  4891975 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 4892004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29186612 - 29186483
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29186612 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 29186513  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  29186512 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 29186483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 33361478 - 33361607
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33361478 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcataaatattttatgatgaatcacaatg 33361577  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33361578 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 33361607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17707455 - 17707238
Alignment:
Q  72 aatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttcca 166  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||| ||||||||||            | |    
T  17707455 aatcattttttggtaactctataataacaacactcttttttataattttggataatatataataataattcacatatcattggtt------------caa 17707368  T
Q  167 attgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgtt 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  17707367 attattttcatcctaaatattatgtcaattcataatctcataaattgattatgtgcactcttaatcagcccatatatattttataatgaatcacgatgtt 17707268  T
Q  267 ccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    ||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  17707267 ccgt-attttaacatctattctttcgaataa 17707238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 24294797 - 24294853
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24294797 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatatcttctttcgaa 24294853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50395081 - 50395024
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaat 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50395081 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcgaat 50395024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39760132 - 39760076
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39760132 atacatattttatgatgaatcacaatattccgtcgttttaacatatcttctttcgaa 39760076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 34692745 - 34692808
Alignment:
Q  7 tagattatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34692745 tagattatattcactcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgagtat 34692808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43254667 - 43254612
Alignment:
Q  238 atacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43254667 atacatattttatgatgaatcataatgttccgtcgttttaacatatcttctttcga 43254612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 18814861 - 18814912
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18814861 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 18814912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 34688229 - 34688280
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34688229 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 34688280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 31620338 - 31620382
Alignment:
Q  26 gatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31620338 gatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 31620382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 41829659 - 41829608
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41829659 actcactggtgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 41829608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 52521226 - 52521175
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52521226 actcactgatgttacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 52521175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14945 - 14680
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactctttttt--------ataattttggat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  14945 cttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtatcaatcattttttggtaactctataacaacaacactcttttttttttttttataattttggat 14846  T
Q  125 aatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctc 224  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  14845 aatacgtaaattcacagatcattggttcctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgctc 14746  T
Q  225 tcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  14745 tcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcattttaacatctcttcttt 14680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 101344 - 101624
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  101344 actcactggtgctacttctttgcttgatttcatctgttttaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaaaaacgctcttttttataatt 101443  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  101444 ttggataatatgtaatcataattcacacattattgtttcctttattggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaacta 101543  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  101544 attatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttctgtcgttttaacatctcttctttcgaa 101624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12550 - 12271
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12550 actcaccgatgctacttctttgcttggtttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttgctaactctacaacaacaacactcttttttataatt 12451  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  12450 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccctt-ttggttctaattgtttttatcctaaatattatgtcaattcataatctcataaactg 12352  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12351 attatatgatctctaaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcttttctttcgaa 12271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 290
Target Start/End: Original strand, 120539 - 120814
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  120539 actcatcgatgctactcctttgcttgatttcatctgatgtaaatataagtatcaatccttttttggtaactctctaacaacaaaactcttttttataatt 120638  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  120639 ttggataatatgtaatcataattctcacatcattggttcctttattggttccaattg-tttcatcttaaatattatatcaattcataatctcataaactg 120737  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttcttt 290  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  120738 attatatgctctcttaattaacccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttcttt 120814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 177084 - 177237
Alignment:
Q  10 attatactaactcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttt 109  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177084 attatattcactcaccgatgctacttctttgcttgatttcatttaatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttt 177183  T
Q  110 tttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggtt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177184 tttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggtt 177237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10075
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10356 actcactgatgatacttctttgtttgatttcatcttatgtaaatatg-gtatcaatccttttttggtaactctacaacaacaacactcttttttataatt 10258  T
Q  119 ttggataatatgta-----aattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    ||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  10257 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaaatg 10159  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaataa 297  Q
    ||||||||  ||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  10158 attatatgacctctagatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcctttctttcgaataa 10075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4586 - 4310
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  4586 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactcta---caacaacactcttttttataatt 4490  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  4489 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 4391  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  4390 attatatgatctctaaatcagcccatacaaatgttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcggttctttcgaa 4310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11035 - 10759
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataatt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  11035 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactcta---caacaacactcttttttataatt 10939  T
Q  119 ttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactg 213  Q
    |||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  10938 ttggataatatgtaatcataattcacacatcattggttccttt-ttggttccaattgttttcatcataaatattatgtcaattcctaatctcataaactg 10840  T
Q  214 attatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  10839 attatatgatctctaaatcagcccatacaaatgttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcggttctttcgaa 10759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29931 - 29696
Alignment:
Q  55 atgtaaatatgagtatcaatccttttttggtaactctataacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttct 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  29931 atgtaaatatgggtatcaatccttttttggtaactctataacaaca---ctttcttttataattttggataatgtgtaaattcatacatcattgtttcct 29835  T
Q  155 ttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatg 254  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| |    
T  29834 tt-ttggttccaattattttcatcctaaatattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccgtacatattttatgagg 29736  T
Q  255 aatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29735 aatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttcgaa 29696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1891 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1891
Description:

Target: scaffold1891; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 115 - 311
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  115 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 214  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  215 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagctcatatatattttatgatgaatcacaaagttccgtcattttaacatctcttctttc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 5185 - 5381
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5185 acaacaaaactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 5284  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5285 ttcctaatctcataaactgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttataatgaattacaatgttccgttgttttaacatctcttctttc 5381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5183
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5132 actcactgatgctacttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 288
Target Start/End: Original strand, 10615 - 10808
Alignment:
Q  95 acaacaacactcttttttataattttggataatatgtaaattcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatattatgtcaa 194  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10615 acaacaaaactcttttttagaattttggataatatgtaaattcacacatcattgattcctttattggttccaatagttttcatcctaaatattatgtcaa 10714  T
Q  195 tttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttct 288  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10715 ttcataatctcataaactgattatatgctctcttaatcagcccatacatattttatgatgaatcacaatgttccatcgttttaacatctcttct 10808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 231
Target Start/End: Original strand, 10805 - 10835
Alignment:
Q  201 ttctcataaactgattatatgctctcttaat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10805 ttctcataaactgattatatgctctcttaat 10835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Original strand, 10576 - 10613
Alignment:
Q  33 cttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgagtat 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10576 cttctttgcttgatttcatttgatgtaaatatgggtat 10613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 294
Target Start/End: Original strand, 3123 - 3326
Alignment:
Q  94 aacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaa-----attcacacatcattggtttctttattggttccaattgttttcatcctaaatatta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3123 aacaacaacactcttttttataattttggataatatgtaatcataattcacacaacattcgttccttt-ttggttccaattgttttcatcctaaatatta 3221  T
Q  189 tgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttct 288  Q
    ||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  3222 tgtcaattcctaat-tcataaactgattatatgatctctaaattaccccatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatcctttct 3320  T
Q  289 ttcgaa 294  Q
    ||||||    
T  3321 ttcgaa 3326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Original strand, 581 - 656
Alignment:
Q  19 actcaccgatgctccttctttgcttgatttcattttatgtaaatatgag--tatcaatccttttttggtaactcta 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  581 actcaccgatgctacttctttgcttgatttcatctgatgtaaatatgggtatatcaatccttttttcgtaactcta 656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18892 - 18763
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18892 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 18793  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  18792 ttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 18763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 13508 - 13637
Alignment:
Q  165 caattgttttcatcctaaatattatgtcaatttgtattctcataaactgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatg 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13508 caattgttttcatcctaaaaattatgtcaattcctaatctcataaactgattatatgatctctaaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatg 13607  T
Q  265 ttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  13608 ttccgttgttttaacatcttttccttcgaa 13637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 291
Target Start/End: Original strand, 16979 - 17060
Alignment:
Q  210 actgattatatgctctcttaattagctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttc 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16979 actgattatatgctctcttaatcagctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaacatctcttctttc 17060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Original strand, 231816 - 231877
Alignment:
Q  233 agctaatacatattttatgatgaatcacaatgttccgtcgttttaatatctcttctttcgaa 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  231816 agctcatacatattttatgatgaatcacaatgttccgttgttttaacatcttttctttcgaa 231877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University