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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1643_low_1 (Length: 4083)
Name: NF1643_low_1
Description: NF1643
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1643_low_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 2089; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 2089; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1726 - 4063
Target Start/End: Original strand, 37426446 - 37428797
Alignment:
| Q |
1726 |
ttactttagatgaactataaaactgcaaattggtatatttagaagacaaaaaattagtagattgattataataaaactgaatggtgcctgtttaattatt |
1825 |
Q |
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| T |
37426446 |
ttactttagatgaactataaaactgcaaattggtatatttagaagacaaaaaattagtagattgattataataaaactgaatggtgcctgtttaattatt |
37426545 |
T |
|
| Q |
1826 |
gacaatatttcaagatataatatgaacacattcactaatccattt--cttagtttgattattatgtagaattcaaaataatttatgatatatttgggaga |
1923 |
Q |
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| T |
37426546 |
gacaatatttcaagatataatatgaacacattcactaatccatttttcttagtttgattattatgtagaattcaaaataatttatgatatatttgggaga |
37426645 |
T |
|
| Q |
1924 |
ttggaggggaagaaatgaaaggactttgggcgtaaaggagattagatggaaagagatagattttaagagagagaatcttacataattttttacgtacttc |
2023 |
Q |
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| T |
37426646 |
ttagaggggaagaaatgaaaggactttgggcgtaaaggggattagatggaaagagagagattttaagagagcgaatcttacataattttttacgtacttc |
37426745 |
T |
|
| Q |
2024 |
atggtcgaacttcaaattactaggacccaattttcctaggaatcaaggggataacacaacaacaaaaatagcttaattgcattttcggactccaaatatc |
2123 |
Q |
| |
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|
| T |
37426746 |
atggtcgaacttcaaattactatgacccaattttcctaggaatcaaggggataacacaacaataaaaatagcttaattgcattttcggactccaaatatc |
37426845 |
T |
|
| Q |
2124 |
gtaattgtgttaatttgacctccaacttttttgagcaattttagctcctaaagatttccccccttataatttagttcaatgactctactacaacttcttt |
2223 |
Q |
| |
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| T |
37426846 |
gtaattgtgttaatttgaccttcaacttttttgagcaattttagcccctaaagatttccccccttataatttagttcaatgactctactacaacttcttt |
37426945 |
T |
|
| Q |
2224 |
agattaaaatctacaaagtaattcaagcttttgaggacaacacataatcatactgaaatttaatatgcaataataatactaataatcatgttttgaaata |
2323 |
Q |
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|
| T |
37426946 |
agattaaaatctacaaagtaattcaagcttttgaggacaacacataatcatactgaaatttaatatgcaataataatattaataatcatgttttgaaata |
37427045 |
T |
|
| Q |
2324 |
cattcatccaagaacaatgttcaattataaatatgaaaagtgtattgctcacactattaaatatcttcaggaaccagattacgtgaaaattctatattaa |
2423 |
Q |
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|
|
| T |
37427046 |
cattcatccaagaacaatgttcaattataaatatgaaaagtgtattcctcacactattaaatatcttcaggaaccagattacgtgaaaattctatattaa |
37427145 |
T |
|
| Q |
2424 |
aacttctcttaaataaaaacatctctttttaaatttttcgaattccgccccgcgcagcccatgataacatgagaaactaatactctccagaacctgaccc |
2523 |
Q |
| |
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|
| T |
37427146 |
aacttctcttaaataaaaacatctctttttaagtttttcgaattccgccccgcgcagcccatgatagcatgagaaactaatactctccagaacctgaccc |
37427245 |
T |
|
| Q |
2524 |
ttttccataacaaatttagcaaaacttaactcatgcctaccacctgcaaaatcttcaaattttacctctttaagggtagataaaaaacagtcaggcacac |
2623 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37427246 |
ttttccataacaaatttagcaaaacttaactcatgcctaccacctgcgaaatcttcaaattttacctctttgagggtagataaaaaacagtcaggcacac |
37427345 |
T |
|
| Q |
2624 |
ttgcaaagttcaccggttcttcatcagagtctataacctgataatcagaagaagaag--nnnnnnnnngaacttgttaatattacacgacttggttcaat |
2721 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37427346 |
ttgcaaagttcaccggttcttcatcagaatctataacctgataatcagaagaagaagaaaaaaaaaaagaacttgttaatattacacgacttggttcaat |
37427445 |
T |
|
| Q |
2722 |
aagataatggaatggaaaagcttacacaaatattatgaattaaattacaaaatcagatagatatgttgttttcacttatatttttactattaaaccacaa |
2821 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37427446 |
aagataatggaatggaaaagcttacacaaatattatgaattaaattacaaaatcagatagatatgttgttttcacttatatttttactattaaaccacaa |
37427545 |
T |
|
| Q |
2822 |
gaccttatcttaaatgcatatcttgtcttcaatcatatttttactattaaaccaaaagaccttatcttaaatgcattttgtaaaatttaaagagcatcaa |
2921 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37427546 |
gaccttatcttaaatgcatatcttgtcttcaatcatatttttactattaaaccaaaagaccttatcttaaatgcattttgtgaaatttaaagagcatcaa |
37427645 |
T |
|
| Q |
2922 |
taacgaacctttaaatcctttaaaaccaaagtctccagccacggtgattttaaaagtaaacctaacaaaatttcacagttaacaaagagtagctgcaaat |
3021 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37427646 |
taacgaacctttaaatcctttaaaaccagagtctccagacacggtgattttaaaagtaaacctaacaaaatttcacagttaacaaagagtagatgcaaat |
37427745 |
T |
|
| Q |
3022 |
gacgcaacattcccaatgccggaatatcagctaaacaatgtttcatttgtgcaagatccaggaaggcatatggaatctgttcatgttagaacaacatatt |
3121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37427746 |
gacgcaacattcccaatgccggaatatcagctaaacaatgtttcatttgtgcaagatccaggaaggcatatggaatctgttcatgttagaacaacatatt |
37427845 |
T |
|
| Q |
3122 |
aagaaattatccaagagattgagtaaatgaaatgaacaattagacaatttttcactatggaaagtgttttaaccaccagagaacaattattaaaaagttt |
3221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37427846 |
aagaaattatccaagagattgagtaaatgaaatgaacaattagacaatttttcactatggaaagtgttttaaccaccagagaacaattattaaaaagttt |
37427945 |
T |
|
| Q |
3222 |
ccctagccttgtattttacttactaattacaaatttagttatttactttaatatgacaatgtaaatttcttcttatcaacatt----------ttgaagc |
3311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37427946 |
ccctagccttgtattttacttactaattacaaatttagttatttactttgatacaacaatgtaaatttcttcttatcaacattaacttaaaggttgaagc |
37428045 |
T |
|
| Q |
3312 |
aagaaaacataccggattaagatgcagataaagccgtaatcgtaaacattccacatcgatactgaaaagcttagtctctacgtaaaataatagaactggt |
3411 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37428046 |
aagaaaacataccggattaagatgcagataaagccgtaatcgtaaacattccacatcgatactgaaaagcttagtctctacgtaa---aatagaactggt |
37428142 |
T |
|
| Q |
3412 |
ggtatgaaattttaccatagcaaacatttttctctacaccccatcctattggatagttgccctgattccacccacagtggtggatgtaggaactttgggc |
3511 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37428143 |
ggtatgaaattttaccatagcaaacatttttctctacaccccatcctattggatagttgccctgattccacccacagtggtggatgtaggaactttgggc |
37428242 |
T |
|
| Q |
3512 |
caggtggtgcaannnnnnnncatcatcaagattgttaatttattatattgctaaatttgttat--tcaaatactcatttgattcattgatattaaaaact |
3609 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37428243 |
caggtggtgcaattttttttcatcatcaagattgttaatttattatattgctaaatttgttattctcaaatactcatttgattcattgatattaaaaact |
37428342 |
T |
|
| Q |
3610 |
gaattatttagccacaaatttatcaaatgtaaatcctcaatctaatctttaagcttacacctcatcacctatttatgaacataataagtagnnnnnnnag |
3709 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37428343 |
gaattatttagccacaaatttatcaaatgtaaatcctcaatctaatctttaagcttacacctcatcacctatttatgaacataataagtagtttttttag |
37428442 |
T |
|
| Q |
3710 |
tttgtgaaatccgcccaactagtcacggaag-tttttataaacagacccttatagagattaatgacaagtttcttagaattttagaaactagtttaacag |
3808 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
37428443 |
tttgtgaaatccgcccaactagtcacggaagttttttataaacagacccttatagagattaatgacaagtttcttagaattttagaaactaatttgacag |
37428542 |
T |
|
| Q |
3809 |
attttaccatctttagggaattaataatttgctttttgaggggtgtaagttcctaccctcaagtatggttgggtccgcccctgtccaaccgttgcactct |
3908 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37428543 |
attttaccatctttagggaattaataatttgctttttgaggggtgtaagttcctaccctcaagtatggttgggtccgcccctgtccaaccgttgcactct |
37428642 |
T |
|
| Q |
3909 |
ctttccataacccttattatatttatttctgtgatttgtaaatgatgcaggaagtgtatgagcagcagaaagaattaattttacttggagagagggtgtt |
4008 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37428643 |
ctttccataacccttattatatttatttctgtgatttgtaaatgatgcaggaagtgtatgagcagcagaaagaattaattttacttggagagagggtgtt |
37428742 |
T |
|
| Q |
4009 |
acttgccactttagattttgacctgaatgttcaacttccatatgagccccttgct |
4063 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37428743 |
acttgccactttagatttttacctgaatgttcaacttccgtatgagccccttgct |
37428797 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 983; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 1183
Target Start/End: Original strand, 37424676 - 37425840
Alignment:
| Q |
1 |
tatttcaaagtacaacaccctgatcaaattgtagaactcaaagcgattaaaagtacaatacccttcaaattgtagaactgatcaatgatcatttaacaga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37424676 |
tatttcaaagtacaacaccctgatcaaattgtagaactcaaagcgattaaaagtacaatacccttcaaattgtagaactgatcaatgattatttaacaga |
37424775 |
T |
|
| Q |
101 |
aaaatgaatgacaaagtgatatcttcataggcttttgacccatcctcaattgttatagcaacatccattggtttcggtggcactatggtatggtatccaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
37424776 |
aaaatgaatgacaaagtgatatcttcataggcttttgacccatcctcaattgttatagcaacatccattggtttcggtggcactatggtat-----ccta |
37424870 |
T |
|
| Q |
201 |
tgaaatttgcacgatcttgtaacatgaggaacgaactgcatctaactcaagaccatagaaggagtccaagttcaattgacggggtggagtatgagaaaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37424871 |
tgaaatttgcacgatcttgtaacatgaggaacgaactgcatctaactcaagaccatagaaggagtccaagttcaattgactgggtggagtttgagaaaac |
37424970 |
T |
|
| Q |
301 |
attctaaaactgtgaagaggaaacccttaattagatttctctcctattctcttttgtctgttcgcaatctttcaataaaattgtttattcttttccattc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37424971 |
attctaaaactgtgaagaggaaacccttt----gatttctctcctattctcttttgtccgttctcaatctttcaataaaattgtttattcttttccattc |
37425066 |
T |
|
| Q |
401 |
aattctttggttcctaacaaacacttaagactaatctgtggacataatatagaaaactatgtgaagcttaaaatcaaatgcacttacatctccattcatt |
500 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37425067 |
aattctttggttcctaacaaacacttaagactaatatgtggacataatatagaaaactatgtgaagcttaaaatcaaatgcacttacatctccattcatt |
37425166 |
T |
|
| Q |
501 |
tcataagcaagtagaaatctgcttcaggatttgcggcctgactgagtggtattgaagccttatatggcctccacaaggtttcnnnnnnngaaggaaaact |
600 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37425167 |
tcataagcaagtagaaatctgcttgaggatttgcggcctgactgagtggtattgaagccttatatagcctccacaaggtttcaaaaaaagaaggaaaact |
37425266 |
T |
|
| Q |
601 |
gatttcagtcataacaaacacaaggtttcaaaaacttcaaaaacaattttaacacgctggaaaaacaagaatgtcatcaagcttgttataaaggagcaac |
700 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37425267 |
gatttcagtcataacaaacacaaggt---------ttcaaaaataattttaacactctggaaaaacaagaatgccatcaagcttgttataaaggcgcaac |
37425357 |
T |
|
| Q |
701 |
ataattaatcacaaactcactatctagaatccggcttgaatatgcatatttgaatnnnnnnncctgaattgaatccaaaacaaccaagaaagagaacaca |
800 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37425358 |
ataattaatcacaaactcactatctagaatccggcttgaatatgcatatttgaataaaaaaacctgaattgaatccaaaacaaccaagaaagagaacaca |
37425457 |
T |
|
| Q |
801 |
tgttcattaatatgattacaagagctgccgaacattaaattttgccgccaaagccttcaactttgttgtcatgaattatgaatagaaaaccaagctctaa |
900 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37425458 |
tgttcattaatatgattacaagagctgccaaacattaaattttgccgccaaagccttcaactttgttgtcatgaattatgaatagaaaaccaagctctaa |
37425557 |
T |
|
| Q |
901 |
acttggaaataagatccctcaacttattgcatactatttgtagcgcaatttttcaagtaaaataaatggatacaaatttgnnnnnnngaagatgattctg |
1000 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37425558 |
acttggaaataagatccctcaacttattgcatactatttgtagcgcaatttttcaagtaaaataaatggatacaaatttgaaaaaaagaagatgattctg |
37425657 |
T |
|
| Q |
1001 |
gtttttcttttctcgtctatagatctttgttaaaataaatcagccaaagtttattggtatgtatctcttggtcatttaattattcattccctactttcac |
1100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37425658 |
gtttttcttttctcgtctatagatctttgttacaataaatcagccaaagtttattggtatgtatcacttggtcatttaattattcattccctactttcac |
37425757 |
T |
|
| Q |
1101 |
ctttcatcttattttttaagtgaagtttccttgcatttcaaatttaaataaatgtattatgctctcatgttgaggactacatc |
1183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37425758 |
ctttcatcttattttttaagtgaagtttccttgcatttcaaatttaaataaatgtattatgctctcatgttgaggactacatc |
37425840 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 565
Target Start/End: Original strand, 37417144 - 37417699
Alignment:
| Q |
1 |
tatttcaaagtacaacaccctgatcaaattgtagaactcaaagcgattaaaagtacaatacccttcaaattgtagaactgatcaatgatcatttaacaga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37417144 |
tatttcaaagtacaacaccctgatcaaattgtagaactcaaagcgattaaaagtacaatacccttcaaattgtagaactgatcaatgattatttaacaga |
37417243 |
T |
|
| Q |
101 |
aaaatgaatgacaaagtgatatcttcataggcttttgacccatcctcaattgttatagcaacatccattggtttcggtggcactatggtatggtatccaa |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
37417244 |
aaaatgaatgacaaagtgatatcttcataggcttttgacccatcctcaattgttatagcaacatccattggtttcggtggcactatggtat-----ccga |
37417338 |
T |
|
| Q |
201 |
tgaaatttgcacgatcttgtaacatgaggaacgaactgcatctaactcaagaccatagaaggagtccaagttcaattgacggggtggagtatgagaaaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37417339 |
tgaaatttgcacgatcttgtaacatgaggaacgaactgcatctaactcaagaccatagaaggagtccaagttcaattgacggggtggagtatgagaaaac |
37417438 |
T |
|
| Q |
301 |
attctaaaactgtgaagaggaaacccttaattagatttctctcctattctcttttgtctgttcgcaatctttcaataaaattgtttattcttttccattc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37417439 |
attctaaaactgtgaagaggaaacccttt----gatttctctcctattctcttttgtccgttcgcaatctttcaataaaattgtttattcttttccattc |
37417534 |
T |
|
| Q |
401 |
aattctttggttcctaacaaacacttaagactaatctgtggacataatatagaaaactatgtgaagcttaaaatcaaatgcacttacatctccattcatt |
500 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37417535 |
aattctttggttcctaacaaacacttaagactaatatgtggacataatatagaaaactatgtgaagcttaaaatcaaatgcacttacatctccattcatt |
37417634 |
T |
|
| Q |
501 |
tcataagcaagtagaaatctgcttcaggatttgcggcctgactgagtggtattgaagccttatat |
565 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37417635 |
tcataagcaagtagaaatctgcttcaggatttgcagcctgactgagtggtattgaagccttatat |
37417699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2240 - 2897
Target Start/End: Original strand, 37418387 - 37419061
Alignment:
| Q |
2240 |
agtaattcaagcttttgaggacaacacataatcatactgaaatttaatatgcaataataatactaataatcatgttttgaaatacattcatccaagaaca |
2339 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37418387 |
agtaattcaagcttttgagaacaacacaaaatcatactgaaatctaatatgcaataataatattaataatcatgttttgaaataaattcatccaagaaca |
37418486 |
T |
|
| Q |
2340 |
atgttcaatt-ataaatatgaaaagtgtattgctcacactattaaatatcttcaggaaccagattacgtgaaaattctatattaaaacttctcttaaata |
2438 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37418487 |
atgttgaatttataaatatgaaaagagtattcctcacactattaaacatcttcaggaaccagattacgtgaaaattctatagtaaaacttctcttaacta |
37418586 |
T |
|
| Q |
2439 |
aaaacatctctt-tttaaatttttcgaattccgccccgcgcagcccatgataacatgagaaactaatactctccagaacctgacccttttccataacaaa |
2537 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37418587 |
aaaatatctcttctttaagtttttcaaattccgccccgcgcagcccatgataacatgagaaactaatactctccagaacctgacccttttccataacaaa |
37418686 |
T |
|
| Q |
2538 |
tttagcaaaacttaactcatgcctaccacctgcaaaatcttcaaattttacctctttaagggtagataaaaaacagtcaggcacacttgcaaagttcacc |
2637 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37418687 |
tttagcaaaacttaactcatgcctaccacctgcaaaatcttcaaattttacctctttaagggtagataaaaaacagtcaggcacacttgcaaaattcacc |
37418786 |
T |
|
| Q |
2638 |
ggttcttcatcagagtctataacctgataatcagaagaagaagnnnnnnnnngaacttgttaatattacacgacttggttcaataagataatggaatgga |
2737 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37418787 |
ggttcttcatcagaatctataacctgataattagaagaagaagaaaaaaaaa-aacttgttaatattacacgacttggttcaataagacaatggaatgga |
37418885 |
T |
|
| Q |
2738 |
aaagcttacacaaatatta-----------tgaattaaattacaaaatcagatagatatgttgttttcacttatatttttactattaaaccacaagacct |
2826 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37418886 |
aaagcttacacaaatatcatgtttgtatcttgaattaaattacaaaaacagatagatatcttgttttcacttatatttttactattaaaccacaagacct |
37418985 |
T |
|
| Q |
2827 |
tatctta-----aatgcatatcttgtcttcaatc-atatttttactattaaaccaaaagaccttatcttaaatgcat |
2897 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37418986 |
tatcttaaatgcaatgcatatcttgttttcaatcaatatttttactatt-aaccacaagatcttatcttaaatgcat |
37419061 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1189 - 1665
Target Start/End: Original strand, 37425908 - 37426383
Alignment:
| Q |
1189 |
atttccttttgggagaattatatgaagaaaaatcatcctctaacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagattcaatagattcaaacattgtcaaat |
1288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37425908 |
atttccttttgggagaattatatgaagaaaaatcatcctctaacttttaataataaaaataaaagcaaaacagattcaatagattcaaacattgtcaaat |
37426007 |
T |
|
| Q |
1289 |
attcaacaatagtcaatgcataatcattcagcaatacaatcaaatgagaaaatgatcatacaagtaaatcgttgcaaaggaacttactttcaataatgcg |
1388 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37426008 |
attcaacaatagtcaacgcataatcattcagcaatacaatcaaatgagaaaatgatcatacaagtaaatcgttgcaaaggaacttactttcaataatacg |
37426107 |
T |
|
| Q |
1389 |
taaccaaggttttaacataccgttggccatgaaaccaccttttctgttatcaatttttgtctccatttatgttgcatgttctaagtgactttttatgata |
1488 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37426108 |
taaccaaggttctaacataccgttggccatgaaaccaccttttctgttatcaatttttgtctccatttatgttgcatgttctaagtgactttttatgata |
37426207 |
T |
|
| Q |
1489 |
acatgtcattgtcaagaccttattatatcattaacttggctatttaatccattattttaagcaatagataaataaataaagattaaacagttcaacaatt |
1588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37426208 |
acatgtcattgtcaagacctta-aatatcattaacttggctatttaatccattattttaagcaatagataaataaataaagattaaacagttcaacaatt |
37426306 |
T |
|
| Q |
1589 |
aaactaatatttcaaggttttatcaatgataagtcataaaataatcatttggaacctgtaacctgaacttttatata |
1665 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37426307 |
aaactaatatttcaaggttttatcaatgataagtcataaaataatcatttggaacctgtaacctgaacttttatata |
37426383 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1868 - 2267
Target Start/End: Original strand, 37417978 - 37418385
Alignment:
| Q |
1868 |
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1967 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37417978 |
tttcttagtttgattattatgtagaactcaaaacaatttatgatatatttgggagattggagag-aagaaatgaaaggactttgggggtaaaggagatta |
37418076 |
T |
|
| Q |
1968 |
gatggaaagagatagat-----------tttaagagagagaatcttacataattttttacgtacttcatggtcgaacttcaaattactaggacccaattt |
2056 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
37418077 |
gatggaaagagataaatcttatatattttttaagagagtgaatcttacagaattttttgcttacctcatggccgaacttaagattactaagacctaattt |
37418176 |
T |
|
| Q |
2057 |
tcctaggaatcaaggggataacacaacaacaaaaatagcttaattgcattttcggactccaaatatcgtaattgtgttaatttgacctccaacttttttg |
2156 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37418177 |
tcctagaaatcaaggggataataccaaaataaaaatagcttaattgcatttccggacaccaaatatcttaattgtgttaatttgacctccaacttttttg |
37418276 |
T |
|
| Q |
2157 |
agcaattttagctcctaaagatttccccccttataatttagttcaatgactctactacaacttctttagattaaaatctacaaagtaattcaagcttttg |
2256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37418277 |
agcaattttagcccctaaagattt-gccccataaaatttagttcaatgattctatta-agcttttttagattaaaatctacaaagtaaatcaagcttttg |
37418374 |
T |
|
| Q |
2257 |
aggacaacaca |
2267 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |
|
|
| T |
37418375 |
aagacaacaca |
37418385 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2892 - 3178
Target Start/End: Original strand, 37419131 - 37419415
Alignment:
| Q |
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atgcattttgtaaaatttaaagagcatcaataacgaacctttaaatcctttaaaaccaaagtctccagccacggtgattttaaaagtaaacctaacaaaa |
2991 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37419131 |
atgcattttgtaaaatttaaagagcatcaatcacgaacctttaaatcctttaaaaccagagtctccagacatggtgattttaaaagtaaacctaacaaaa |
37419230 |
T |
|
| Q |
2992 |
tttcacagttaacaaagagtagctgcaaatgacgcaacattcccaatgccggaatatcagctaaacaatgtttcatttgtgcaagatccaggaaggcata |
3091 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
37419231 |
cttcacagttaacaaagagtagctgcaaatgacgcaacattccaaatgccggaatatcagctaaacaatatttcatttgtgcaggatctaggaaagcata |
37419330 |
T |
|
| Q |
3092 |
tggaatctgttcatgttagaacaacatattaagaaattatccaagagattgagtaaatgaaatgaacaattagacaatttttcacta |
3178 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37419331 |
gggagcctg-tcatgttagaacaac-gattatgaaattatccaagagatagagtaaatgaaatgaaccattagacaatttatcacta |
37419415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3182 - 3350
Target Start/End: Original strand, 37419452 - 37419630
Alignment:
| Q |
3182 |
aaagtgttttaaccaccagagaacaattattaaaaagtttccctagccttgtattttacttactaattacaaatttagttatttactttaatatgacaat |
3281 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
37419452 |
aaagtattttaatcaccagagaacaattattaaaaagtctcccgagccttgtatattacttactaattacaaatttagttatttactttgatacaacaat |
37419551 |
T |
|
| Q |
3282 |
gtaaatttcttcttatcaacatt----------ttgaagcaagaaaacataccggattaagatgcagataaagccgtaa |
3350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37419552 |
gtaaatttcttcttatcaacattaacttaaaggttgaagcaagaaaacataccggattaagatacagataaagccgtaa |
37419630 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3943 - 4060
Target Start/End: Complemental strand, 37436478 - 37436361
Alignment:
| Q |
3943 |
tttgtaaatgatgcaggaagtgtatgagcagcagaaagaattaattttacttggagagagggtgttacttgccactttagattttgacctgaatgttcaa |
4042 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
37436478 |
tttgtaaatgatgcaggaagtgtatgagcagcagaaagaattaattttacttggagaaagggttgtacttgccactttaggttttgacttcgatgttcaa |
37436379 |
T |
|
| Q |
4043 |
cttccatatgagcccctt |
4060 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37436378 |
gaaccatatgggcccctt |
37436361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 420
Target Start/End: Original strand, 34317819 - 34317906
Alignment:
| Q |
333 |
agatttctctcctattctcttttgtctgttcgcaatctttcaataaaattgtttattcttttccattcaattctttggttcctaacaa |
420 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34317819 |
agatttctctcctattctcctttatcctttctcaatctttcaataaaatagttcattattttcaattcaattcttaggttcctaacaa |
34317906 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2491 - 2594
Target Start/End: Complemental strand, 37474448 - 37474345
Alignment:
| Q |
2491 |
catgagaaactaatactctccagaacctgacccttttc-cataacaaatttagcaaaacttaactcatgcctaccacctgcaaaatcttcaaattttacc |
2589 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37474448 |
catgagaaactaatactcgccaaaacccgacatttttttcataacaaatatagcaaaacttaactcatgctcaccacctgc-aaattttcaaattttacc |
37474350 |
T |
|
| Q |
2590 |
tcttt |
2594 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
37474349 |
acttt |
37474345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 2799 - 2904
Target Start/End: Original strand, 37419021 - 37419111
Alignment:
| Q |
2799 |
atatttttactattaaaccacaagaccttatcttaaatgcatatcttgtcttcaatcatatttttactattaaaccaaaagaccttatcttaaatgcatt |
2898 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37419021 |
atatttttactattaa-ccacaagatcttatcttaaatgcatatctt--------------ttttactattaaatcaaaagaccttatcttaaatgcatt |
37419105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1781 - 1835
Target Start/End: Original strand, 37417925 - 37417979
Alignment:
| Q |
1781 |
agtagattgattataataaaactgaatggtgcctgtttaattattgacaatattt |
1835 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
37417925 |
agtagattgatcataataaaactgaatggtgcatgcttaattatcgactatattt |
37417979 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 633 - 679
Target Start/End: Original strand, 660003 - 660049
Alignment:
| Q |
633 |
aacttcaaaaacaattttaacacgctggaaaaacaagaatgtcatca |
679 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
660003 |
aacttcaaaaacaattttaacaccatggaataacaacaatgtcatca |
660049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 76; Significance: 5e-34; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3946 - 4061
Target Start/End: Original strand, 32505244 - 32505359
Alignment:
| Q |
3946 |
gtaaatgatgcaggaagtgtatgagcagcagaaagaattaattttacttggagagagggtgttacttgccactttagattttgacctgaatgttcaactt |
4045 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| | |
|
|
| T |
32505244 |
gtaaatgatgtaggaagtgtatgagcagcagaaagagttaattttacttggagagagggttgtacttgccactttggcttttgacttgaatgtccaacat |
32505343 |
T |
|
| Q |
4046 |
ccatatgagccccttg |
4061 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32505344 |
ccatataagccccttg |
32505359 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 52127714 - 52127667
Alignment:
| Q |
370 |
tttcaataaaattgtttattcttttccattcaattctttggttcctaa |
417 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
52127714 |
tttcaataaaattgttgattcttttcaattcaattattgggttcctaa |
52127667 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1552 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 55926649 - 55926569
Alignment:
| Q |
1552 |
atagataaataaataaagattaaacagttcaacaattaaacta---atatttcaaggttttatcaatgataagtcataaaa |
1629 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
55926649 |
atagacaaattaataaagattaaacggttaaactattaaactaatgatattttaaggtcttatcaatgaaatgtcataaaa |
55926569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 70; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 471 - 567
Target Start/End: Original strand, 8471625 - 8471722
Alignment:
| Q |
471 |
aaatcaaatgcacttacatctccattcatttcataagcaagtagaa-atctgcttcaggatttgcggcctgactgagtggtattgaagccttatatgg |
567 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8471625 |
aaatcaaattaacttacttctccattcatttcataagcaagtagaacatctgcttcaggatttgcagcctgactgagtggtattgaggccttatatgg |
8471722 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 420
Target Start/End: Original strand, 10057358 - 10057440
Alignment:
| Q |
338 |
tctctcctattctcttttgtctgttcgcaatctttcaataaaattgtttattcttttccattcaattctttggttcctaacaa |
420 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10057358 |
tctctcctattctcgtttgtcctttctcaatctttcaataaaattgttcgttcctttcatatcaattttttggttcctaacaa |
10057440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 40; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 419
Target Start/End: Original strand, 43672413 - 43672464
Alignment:
| Q |
368 |
tctttcaataaaattgtttattcttttccattcaattctttggttcctaaca |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43672413 |
tctttcaataaaattgtccattcttttccattcaattcttgggttcctaaca |
43672464 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 38; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3956 - 4005
Target Start/End: Original strand, 28518007 - 28518056
Alignment:
| Q |
3956 |
caggaagtgtatgagcagcagaaagaattaattttacttggagagagggt |
4005 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28518007 |
caggaagtgtatgagcagcagaaggaattaattctacttgcagagagggt |
28518056 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 37; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 417
Target Start/End: Original strand, 7872062 - 7872146
Alignment:
| Q |
333 |
agatttctctcctattctcttttgtctgttcgcaatctttcaataaaattgtttattcttttccattcaattctttggttcctaa |
417 |
Q |
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| T |
7872062 |
agatttctctcatattctcatttatcctttatcaatatttcaataaaattgttcattcttttcaattcaatacttgggttcctaa |
7872146 |
T |
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Target: chr1 (Bit Score: 37; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2943 - 3063
Target Start/End: Original strand, 51943471 - 51943591
Alignment:
| Q |
2943 |
aaaaccaaagtctccagccacggtgattttaaaagtaaacctaacaaaatttcacagttaacaaagagtagctgcaaatgacgcaacattcccaatgccg |
3042 |
Q |
| |
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| T |
51943471 |
aaaactaaagtcaccagacttggtgattttaaaagtaagcccaacaaaatttcacgagtaacagagtttagctccagatcactcaacattccaaatgcag |
51943570 |
T |
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| Q |
3043 |
gaatatcagctaaacaatgtt |
3063 |
Q |
| |
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| T |
51943571 |
gaatatccgctaaataatgtt |
51943591 |
T |
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