View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16447_high_2 (Length: 421)

Name: NF16447_high_2
Description: NF16447
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16447_high_2
NF16447_high_2
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (44-390)||(844674-845021)
chr1 (46-382)||(35387269-35387606)
chr1 (44-382)||(42510402-42510741)
chr1 (49-382)||(45490833-45491167)
chr1 (47-382)||(1351393-1351728)
chr1 (46-382)||(6711004-6711342)
chr1 (37-379)||(41972782-41973124)
chr1 (47-382)||(16386734-16387069)
chr1 (47-382)||(28340262-28340597)
chr1 (49-382)||(16451009-16451343)
chr1 (49-379)||(32270240-32270566)
chr1 (49-382)||(51264377-51264711)
chr1 (48-378)||(17887828-17888160)
chr1 (46-384)||(7183797-7184136)
chr1 (49-351)||(12890120-12890423)
chr1 (42-390)||(44737992-44738340)
chr1 (98-382)||(26118173-26118458)
chr1 (49-382)||(24339596-24339929)
chr1 (49-382)||(50540226-50540560)
chr1 (55-387)||(50304540-50304872)
chr1 (55-382)||(31004021-31004348)
chr1 (42-388)||(16476107-16476453)
chr1 (50-382)||(17327607-17327940)
chr1 (98-378)||(30105641-30105923)
chr1 (48-382)||(41967806-41968142)
chr1 (44-382)||(39281772-39282110)
chr1 (48-378)||(16437259-16437574)
chr1 (55-382)||(42512728-42513052)
chr1 (47-379)||(46154780-46155120)
chr1 (85-382)||(32289302-32289600)
chr1 (55-389)||(11772583-11772917)
chr1 (48-382)||(51703121-51703455)
chr1 (48-382)||(1601049-1601386)
chr1 (46-382)||(6029254-6029595)
chr1 (48-382)||(26764753-26765082)
chr1 (65-388)||(15539842-15540165)
chr1 (106-382)||(45658761-45659037)
chr1 (111-382)||(49303312-49303583)
chr1 (49-379)||(3414814-3415146)
chr1 (50-382)||(5109614-5109944)
chr1 (136-382)||(42705195-42705442)
chr1 (55-363)||(38086973-38087281)
chr1 (55-382)||(10384256-10384578)
chr1 (50-379)||(6143947-6144276)
chr1 (46-365)||(16704605-16704925)
chr1 (46-286)||(25539735-25539975)
chr1 (49-351)||(13994064-13994366)
chr1 (55-261)||(38663021-38663227)
chr1 (95-321)||(20494927-20495137)
chr1 (135-377)||(50382363-50382608)
chr1 (182-382)||(7837149-7837350)
chr1 (46-251)||(34663821-34664012)
chr1 (255-382)||(8838986-8839113)
chr1 (61-326)||(570281-570549)
chr1 (118-335)||(25343213-25343431)
chr1 (279-382)||(21071727-21071830)
chr1 (287-382)||(38663228-38663323)
chr1 (106-337)||(504394-504625)
chr1 (137-384)||(6771338-6771586)
chr1 (55-210)||(8838827-8838987)
chr1 (306-389)||(40811322-40811405)
chr1 (266-367)||(7837474-7837575)
chr1 (190-387)||(26733579-26733776)
chr1 (167-289)||(46447665-46447787)
chr1 (185-382)||(39792826-39793022)
chr1 (58-169)||(21071621-21071727)
chr1 (136-251)||(32467910-32468025)
chr1 (266-388)||(33316499-33316621)
chr1 (118-244)||(34283912-34284040)
chr1 (163-388)||(46815682-46815906)
chr1 (125-345)||(2761551-2761770)
chr1 (199-379)||(17291612-17291791)
chr1 (207-274)||(23799603-23799670)
chr1 (118-210)||(15324109-15324201)
chr1 (111-379)||(47242477-47242743)
chr1 (133-379)||(31574320-31574566)
chr1 (183-388)||(40610739-40610944)
chr1 (329-382)||(25539981-25540034)
chr1 (46-91)||(30105915-30105960)
chr1 (307-379)||(23799531-23799603)
chr1 (47-91)||(26118450-26118494)
chr1 (55-134)||(23799670-23799749)
chr1 (340-382)||(16643190-16643232)
chr1 (111-213)||(49799322-49799424)
chr1 (108-196)||(7836542-7836630)
chr1 (159-250)||(16643272-16643361)
chr1 (111-215)||(52030330-52030434)
chr1 (265-392)||(7146859-7146986)
chr1 (255-345)||(8780601-8780690)
chr1 (226-379)||(30798557-30798705)
chr1 (118-176)||(47093006-47093064)
chr1 (131-207)||(30798824-30798900)
chr1 (265-329)||(35335799-35335863)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (43-389)||(36769446-36769793)
chr7 (48-382)||(47953066-47953401)
chr7 (44-389)||(10932434-10932780)
chr7 (47-382)||(3922587-3922923)
chr7 (47-382)||(11321769-11322105)
chr7 (48-382)||(26994109-26994444)
chr7 (50-387)||(43158565-43158903)
chr7 (46-382)||(46633571-46633903)
chr7 (50-382)||(21784749-21785082)
chr7 (44-382)||(43189126-43189466)
chr7 (43-388)||(18386396-18386741)
chr7 (55-377)||(18470567-18470888)
chr7 (59-382)||(26371693-26372017)
chr7 (55-380)||(41211086-41211413)
chr7 (49-379)||(32873659-32873987)
chr7 (46-390)||(43368076-43368420)
chr7 (49-378)||(1870011-1870342)
chr7 (46-382)||(40753044-40753366)
chr7 (49-382)||(30849130-30849464)
chr7 (49-382)||(47316582-47316901)
chr7 (104-382)||(29661255-29661533)
chr7 (55-378)||(3891930-3892238)
chr7 (46-392)||(9913400-9913745)
chr7 (46-392)||(9927088-9927433)
chr7 (108-388)||(11250558-11250834)
chr7 (45-382)||(48894591-48894928)
chr7 (55-382)||(34295295-34295615)
chr7 (55-382)||(329354-329687)
chr7 (136-382)||(44748660-44748906)
chr7 (46-382)||(38301223-38301554)
chr7 (46-335)||(30598939-30599229)
chr7 (72-378)||(1363538-1363843)
chr7 (56-388)||(11822116-11822440)
chr7 (47-348)||(23349209-23349510)
chr7 (55-383)||(20127171-20127501)
chr7 (106-380)||(43213811-43214085)
chr7 (55-379)||(37966858-37967182)
chr7 (54-390)||(48445404-48445740)
chr7 (130-387)||(17237035-17237292)
chr7 (55-382)||(22723916-22724243)
chr7 (58-368)||(22724429-22724739)
chr7 (49-382)||(26910295-26910624)
chr7 (48-237)||(47947636-47947826)
chr7 (47-300)||(46408771-46409021)
chr7 (49-366)||(21133248-21133567)
chr7 (55-270)||(26652750-26652965)
chr7 (207-389)||(16963174-16963356)
chr7 (130-382)||(46448528-46448780)
chr7 (118-382)||(15035135-15035401)
chr7 (118-301)||(34117399-34117581)
chr7 (190-388)||(34519527-34519725)
chr7 (47-169)||(12982178-12982301)
chr7 (55-273)||(41665568-41665786)
chr7 (46-212)||(16962986-16963149)
chr7 (266-382)||(26700572-26700688)
chr7 (48-286)||(22631609-22631853)
chr7 (136-260)||(46627135-46627259)
chr7 (146-367)||(21408526-21408745)
chr7 (107-273)||(48699334-48699500)
chr7 (106-337)||(29455778-29456006)
chr7 (130-281)||(29372764-29372915)
chr7 (291-379)||(41665485-41665573)
chr7 (127-253)||(35645403-35645529)
chr7 (304-382)||(41223320-41223398)
chr7 (106-327)||(2048887-2049107)
chr7 (266-330)||(3359773-3359837)
chr7 (48-96)||(34117349-34117397)
chr7 (104-174)||(47442769-47442840)
chr7 (171-249)||(42332059-42332137)
chr7 (130-235)||(30259938-30260043)
chr7 (275-370)||(16027823-16027918)
chr7 (181-218)||(8453285-8453322)
chr7 (50-83)||(17237005-17237038)
chr7 (147-220)||(29992741-29992813)
chr7 (133-189)||(8453204-8453260)
chr7 (153-217)||(41903603-41903667)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (46-382)||(51259657-51259994)
chr3 (46-382)||(28675661-28675998)
chr3 (44-379)||(1344587-1344923)
chr3 (55-382)||(12349048-12349376)
chr3 (49-382)||(2134944-2135278)
chr3 (49-382)||(29584749-29585083)
chr3 (47-387)||(31882894-31883234)
chr3 (50-382)||(21221238-21221570)
chr3 (46-379)||(24571153-24571486)
chr3 (46-378)||(53557676-53558009)
chr3 (49-382)||(47958309-47958643)
chr3 (41-382)||(39052715-39053058)
chr3 (83-382)||(40094411-40094711)
chr3 (49-368)||(25860312-25860632)
chr3 (95-382)||(44116859-44117147)
chr3 (55-382)||(25927204-25927533)
chr3 (42-382)||(4851340-4851674)
chr3 (47-374)||(34026554-34026867)
chr3 (55-388)||(3864548-3864879)
chr3 (55-382)||(50386333-50386660)
chr3 (104-389)||(42636273-42636559)
chr3 (45-382)||(51925085-51925422)
chr3 (44-389)||(5442160-5442494)
chr3 (47-363)||(20609544-20609846)
chr3 (136-382)||(20255007-20255252)
chr3 (44-382)||(33364655-33364993)
chr3 (48-382)||(38213227-38213562)
chr3 (48-388)||(22484614-22484954)
chr3 (55-382)||(3867526-3867848)
chr3 (47-379)||(21373812-21374135)
chr3 (48-328)||(26282315-26282599)
chr3 (55-378)||(29645946-29646270)
chr3 (130-378)||(54622678-54622925)
chr3 (59-383)||(3964173-3964497)
chr3 (145-382)||(49748788-49749025)
chr3 (137-382)||(51296544-51296787)
chr3 (47-387)||(45690778-45691112)
chr3 (55-382)||(50678677-50679006)
chr3 (98-382)||(3695184-3695449)
chr3 (45-380)||(10747088-10747406)
chr3 (179-383)||(19906767-19906971)
chr3 (153-382)||(24721463-24721693)
chr3 (237-382)||(41682930-41683075)
chr3 (55-238)||(53046667-53046846)
chr3 (42-190)||(43175436-43175585)
chr3 (118-387)||(6179376-6179639)
chr3 (130-376)||(44000217-44000462)
chr3 (123-379)||(44267691-44267941)
chr3 (288-387)||(43175589-43175688)
chr3 (176-368)||(52300439-52300633)
chr3 (113-324)||(34351303-34351514)
chr3 (118-235)||(41694925-41695042)
chr3 (181-324)||(39215404-39215547)
chr3 (130-278)||(25954407-25954554)
chr3 (140-382)||(8253640-8253881)
chr3 (262-325)||(53046605-53046668)
chr3 (106-378)||(8066939-8067210)
chr3 (130-378)||(25395570-25395818)
chr3 (199-379)||(26847351-26847532)
chr3 (113-285)||(42035652-42035824)
chr3 (191-282)||(14155438-14155528)
chr3 (133-223)||(32621828-32621918)
chr3 (170-335)||(32768588-32768755)
chr3 (108-325)||(17264606-17264822)
chr3 (264-367)||(30258962-30259065)
chr3 (45-91)||(20254945-20254991)
chr3 (191-249)||(23322158-23322216)
chr3 (123-216)||(41538131-41538225)
chr3 (46-156)||(54963985-54964095)
chr3 (47-91)||(3695441-3695485)
chr3 (118-177)||(28625001-28625060)
chr3 (262-305)||(53046517-53046560)
chr3 (155-205)||(8165833-8165883)
chr3 (306-378)||(8025895-8025967)
chr3 (111-159)||(42547463-42547511)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (47-387)||(34338681-34339022)
chr2 (58-382)||(9732813-9733138)
chr2 (45-382)||(18685705-18686043)
chr2 (46-382)||(32497785-32498122)
chr2 (47-378)||(35114656-35114988)
chr2 (50-382)||(17540588-17540922)
chr2 (44-382)||(2644970-2645308)
chr2 (44-380)||(5278720-5279056)
chr2 (47-379)||(33366481-33366814)
chr2 (47-382)||(30326215-30326550)
chr2 (47-382)||(44284508-44284836)
chr2 (47-382)||(37308527-37308863)
chr2 (72-389)||(7258792-7259111)
chr2 (50-382)||(30798372-30798703)
chr2 (49-382)||(19513571-19513906)
chr2 (49-365)||(42706231-42706549)
chr2 (44-360)||(16104142-16104459)
chr2 (46-382)||(33889128-33889450)
chr2 (49-379)||(39461187-39461518)
chr2 (136-387)||(7761451-7761702)
chr2 (47-382)||(40692176-40692504)
chr2 (55-388)||(42365456-42365790)
chr2 (50-382)||(2085946-2086269)
chr2 (46-382)||(3913343-3913679)
chr2 (60-382)||(28824440-28824762)
chr2 (46-379)||(16177769-16178100)
chr2 (47-367)||(4641387-4641706)
chr2 (46-382)||(6896040-6896375)
chr2 (112-382)||(32766387-32766658)
chr2 (47-374)||(40832360-40832692)
chr2 (49-382)||(38992954-38993284)
chr2 (46-379)||(10399756-10400084)
chr2 (145-370)||(12672373-12672594)
chr2 (46-277)||(37003856-37004089)
chr2 (50-383)||(30712732-30713068)
chr2 (55-379)||(11114752-11115074)
chr2 (46-289)||(26418793-26419037)
chr2 (55-382)||(13829318-13829633)
chr2 (55-383)||(27462684-27463010)
chr2 (59-379)||(8112189-8112505)
chr2 (43-368)||(26981606-26981912)
chr2 (48-273)||(9717113-9717322)
chr2 (93-381)||(12939202-12939474)
chr2 (49-220)||(18793306-18793478)
chr2 (204-379)||(38623190-38623365)
chr2 (256-378)||(18793180-18793300)
chr2 (282-389)||(37863242-37863349)
chr2 (186-382)||(41365993-41366189)
chr2 (118-382)||(45463005-45463256)
chr2 (69-278)||(1247049-1247250)
chr2 (291-382)||(9717317-9717408)
chr2 (59-378)||(41934465-41934785)
chr2 (49-250)||(20907468-20907664)
chr2 (298-382)||(37003774-37003858)
chr2 (105-298)||(35472967-35473160)
chr2 (120-278)||(37088218-37088376)
chr2 (191-335)||(40876554-40876697)
chr2 (44-123)||(12672596-12672674)
chr2 (199-325)||(15303180-15303306)
chr2 (119-329)||(26796173-26796382)
chr2 (279-379)||(83374-83474)
chr2 (120-244)||(13249421-13249545)
chr2 (199-379)||(18278926-18279104)
chr2 (264-330)||(6453249-6453315)
chr2 (180-379)||(16061980-16062178)
chr2 (339-382)||(26419045-26419089)
chr2 (146-293)||(38786503-38786647)
chr2 (347-382)||(1247257-1247292)
chr2 (152-210)||(31148786-31148844)
chr2 (310-379)||(31193954-31194023)
chr2 (264-319)||(12217650-12217706)
[»] chr4 (116 HSPs)
chr4 (44-382)||(23521751-23522090)
chr4 (44-388)||(24002209-24002555)
chr4 (46-388)||(56154494-56154837)
chr4 (46-382)||(29785412-29785750)
chr4 (46-382)||(38486133-38486465)
chr4 (47-382)||(20802407-20802743)
chr4 (47-382)||(49151976-49152311)
chr4 (55-382)||(55065209-55065536)
chr4 (48-382)||(12600761-12601096)
chr4 (47-382)||(21579900-21580235)
chr4 (46-380)||(33176910-33177245)
chr4 (47-382)||(52319200-52319538)
chr4 (46-382)||(9512216-9512553)
chr4 (47-366)||(37865627-37865947)
chr4 (50-382)||(55593759-55594096)
chr4 (47-359)||(21202614-21202926)
chr4 (46-382)||(36743565-36743901)
chr4 (55-382)||(50178368-50178696)
chr4 (49-382)||(6776460-6776788)
chr4 (98-392)||(33552708-33553003)
chr4 (55-382)||(52949604-52949930)
chr4 (63-382)||(54542881-54543198)
chr4 (98-382)||(1231236-1231521)
chr4 (44-379)||(20694247-20694578)
chr4 (110-380)||(2725011-2725281)
chr4 (44-382)||(36885817-36886142)
chr4 (85-389)||(20517890-20518196)
chr4 (98-378)||(24210243-24210525)
chr4 (59-382)||(44649040-44649361)
chr4 (118-382)||(50727789-50728054)
chr4 (118-382)||(50735803-50736068)
chr4 (46-382)||(9807030-9807365)
chr4 (50-382)||(42869859-42870181)
chr4 (106-382)||(44324218-44324494)
chr4 (111-382)||(46680386-46680658)
chr4 (98-382)||(29616095-29616376)
chr4 (46-382)||(29592774-29593105)
chr4 (55-382)||(3649519-3649846)
chr4 (104-382)||(36497148-36497427)
chr4 (136-382)||(38812484-38812730)
chr4 (55-367)||(34929797-34930110)
chr4 (44-382)||(2786836-2787174)
chr4 (46-361)||(47642388-47642703)
chr4 (106-382)||(32181197-32181473)
chr4 (43-278)||(43640969-43641205)
chr4 (55-382)||(50186411-50186738)
chr4 (98-382)||(47361289-47361570)
chr4 (113-382)||(4325731-4326001)
chr4 (107-388)||(11055977-11056258)
chr4 (131-382)||(41711806-41712057)
chr4 (55-392)||(22318250-22318587)
chr4 (43-382)||(7554833-7555172)
chr4 (58-329)||(37695470-37695741)
chr4 (107-379)||(39078596-39078868)
chr4 (49-382)||(53200519-53200858)
chr4 (191-382)||(2629827-2630018)
chr4 (59-388)||(16320408-16320734)
chr4 (179-382)||(50729418-50729621)
chr4 (69-382)||(26083235-26083547)
chr4 (162-378)||(28115243-28115457)
chr4 (50-272)||(37931798-37932020)
chr4 (47-223)||(14296471-14296648)
chr4 (55-379)||(30942671-30942995)
chr4 (47-223)||(14314719-14314896)
chr4 (226-382)||(6973789-6973945)
chr4 (250-382)||(14296645-14296777)
chr4 (250-382)||(14314893-14315025)
chr4 (216-382)||(42772832-42772998)
chr4 (106-273)||(23327850-23328020)
chr4 (205-382)||(25978488-25978664)
chr4 (55-293)||(13110211-13110448)
chr4 (255-382)||(56487163-56487285)
chr4 (291-382)||(23328015-23328106)
chr4 (66-296)||(7001748-7001976)
chr4 (106-281)||(43739395-43739570)
chr4 (190-327)||(9947947-9948084)
chr4 (106-327)||(45577619-45577842)
chr4 (118-379)||(44355734-44355995)
chr4 (138-232)||(42772724-42772818)
chr4 (120-392)||(20644107-20644379)
chr4 (266-382)||(44640417-44640532)
chr4 (106-384)||(43189636-43189914)
chr4 (309-379)||(13110443-13110513)
chr4 (98-175)||(53343560-53343638)
chr4 (327-379)||(2114191-2114243)
chr4 (136-218)||(56487292-56487374)
chr4 (190-326)||(3579142-3579279)
chr4 (105-217)||(985216-985327)
chr4 (199-382)||(52673838-52674024)
chr4 (69-253)||(52755417-52755601)
chr4 (106-366)||(31445768-31446027)
chr4 (291-378)||(43739557-43739644)
chr4 (385-421)||(23570780-23570816)
chr4 (50-102)||(32181161-32181213)
chr4 (47-107)||(38520438-38520498)
chr4 (55-143)||(50729641-50729729)
chr4 (47-93)||(2725283-2725329)
chr4 (106-168)||(10184879-10184941)
chr4 (191-253)||(38520518-38520580)
chr4 (49-91)||(46680658-46680700)
chr4 (50-91)||(33552995-33553036)
chr4 (164-217)||(40792409-40792462)
chr4 (106-159)||(52673762-52673815)
chr4 (95-139)||(32081080-32081124)
chr4 (343-382)||(38520597-38520637)
chr4 (108-232)||(41720779-41720903)
chr4 (316-368)||(44365940-44365992)
chr4 (49-89)||(50728048-50728088)
chr4 (49-89)||(50736062-50736102)
chr4 (44-83)||(23327803-23327842)
chr4 (125-176)||(32858276-32858327)
chr4 (63-110)||(39433510-39433557)
chr4 (130-249)||(43893535-43893654)
chr4 (65-143)||(47669219-47669297)
chr4 (281-327)||(51518482-51518528)
chr4 (105-189)||(36679926-36680009)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (43-388)||(27103826-27104172)
chr8 (46-382)||(45446325-45446662)
chr8 (46-382)||(34062998-34063335)
chr8 (46-382)||(41709647-41709984)
chr8 (49-382)||(32019899-32020233)
chr8 (47-382)||(34101379-34101715)
chr8 (46-387)||(31513476-31513818)
chr8 (46-382)||(8672953-8673290)
chr8 (47-387)||(3251549-3251890)
chr8 (44-390)||(6386444-6386791)
chr8 (47-382)||(29672220-29672557)
chr8 (46-348)||(29563158-29563461)
chr8 (50-388)||(7394706-7395045)
chr8 (46-382)||(25478118-25478450)
chr8 (98-382)||(4052404-4052687)
chr8 (72-382)||(5968762-5969073)
chr8 (49-381)||(13406834-13407167)
chr8 (47-382)||(31731935-31732257)
chr8 (98-387)||(30542915-30543205)
chr8 (46-382)||(37618290-37618626)
chr8 (98-382)||(37664180-37664466)
chr8 (55-379)||(12753226-12753550)
chr8 (106-382)||(10466995-10467271)
chr8 (46-380)||(22999128-22999463)
chr8 (46-379)||(40388911-40389244)
chr8 (86-382)||(7591345-7591641)
chr8 (55-380)||(15001346-15001671)
chr8 (55-387)||(39642763-39643095)
chr8 (49-382)||(17805563-17805898)
chr8 (106-387)||(41548549-41548830)
chr8 (42-381)||(14004943-14005268)
chr8 (44-389)||(35225531-35225876)
chr8 (49-382)||(45113929-45114262)
chr8 (46-382)||(30501016-30501352)
chr8 (47-273)||(32303592-32303819)
chr8 (106-382)||(29610953-29611229)
chr8 (55-387)||(37474599-37474912)
chr8 (182-382)||(37861866-37862065)
chr8 (47-379)||(17520468-17520798)
chr8 (113-382)||(16485707-16485976)
chr8 (128-379)||(10656587-10656838)
chr8 (60-367)||(16595063-16595369)
chr8 (167-382)||(21272676-21272874)
chr8 (133-379)||(10320180-10320424)
chr8 (64-382)||(6460152-6460465)
chr8 (291-387)||(32303501-32303597)
chr8 (310-388)||(38047481-38047559)
chr8 (88-289)||(27109532-27109735)
chr8 (190-389)||(22756307-22756501)
chr8 (130-379)||(10932691-10932940)
chr8 (121-327)||(54117-54322)
chr8 (55-139)||(21272592-21272676)
chr8 (98-159)||(37861803-37861865)
chr8 (46-159)||(37861766-37861865)
chr8 (44-115)||(955102-955173)
chr8 (141-367)||(10531244-10531472)
chr8 (180-328)||(36426201-36426347)
chr8 (132-215)||(32918842-32918925)
chr8 (154-335)||(11944854-11945035)
chr8 (106-219)||(28746254-28746367)
chr8 (47-91)||(4052368-4052412)
chr8 (164-244)||(14958948-14959027)
chr8 (302-382)||(15351820-15351900)
chr8 (120-219)||(5859533-5859632)
chr8 (118-176)||(9624180-9624239)
chr8 (154-217)||(11926893-11926956)
chr8 (125-216)||(15351686-15351776)
chr8 (49-91)||(30543197-30543239)
chr8 (50-91)||(37664458-37664499)
chr8 (268-356)||(9624310-9624397)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (55-387)||(11963220-11963553)
chr5 (46-382)||(32528585-32528922)
chr5 (44-379)||(7523039-7523376)
chr5 (46-382)||(35701147-35701484)
chr5 (48-388)||(2351552-2351893)
chr5 (81-383)||(31770479-31770782)
chr5 (55-393)||(34794766-34795105)
chr5 (42-382)||(39918374-39918714)
chr5 (46-382)||(24181513-24181835)
chr5 (46-392)||(41790342-41790688)
chr5 (98-388)||(41459511-41459801)
chr5 (98-382)||(29241300-29241585)
chr5 (47-339)||(21739093-21739381)
chr5 (47-382)||(6284189-6284524)
chr5 (47-387)||(8136710-8137049)
chr5 (55-382)||(3735237-3735564)
chr5 (48-326)||(4818085-4818364)
chr5 (55-382)||(7770168-7770495)
chr5 (46-380)||(4689589-4689923)
chr5 (47-368)||(22493322-22493643)
chr5 (46-388)||(31644318-31644659)
chr5 (48-382)||(24036105-24036436)
chr5 (98-387)||(31879960-31880250)
chr5 (98-389)||(7208112-7208404)
chr5 (71-382)||(40489232-40489543)
chr5 (98-382)||(39788114-39788400)
chr5 (98-382)||(23091193-23091478)
chr5 (55-378)||(18470321-18470644)
chr5 (44-378)||(7725702-7726036)
chr5 (64-330)||(28090461-28090726)
chr5 (137-379)||(553358-553601)
chr5 (108-382)||(5571546-5571806)
chr5 (126-382)||(8560871-8561126)
chr5 (69-379)||(32092874-32093183)
chr5 (75-359)||(700513-700798)
chr5 (50-374)||(5673018-5673329)
chr5 (55-382)||(37148478-37148790)
chr5 (47-267)||(40182335-40182556)
chr5 (164-394)||(27838951-27839180)
chr5 (106-337)||(22432243-22432471)
chr5 (179-382)||(5598484-5598687)
chr5 (267-382)||(4664923-4665038)
chr5 (152-368)||(17031134-17031350)
chr5 (47-179)||(20119642-20119777)
chr5 (46-123)||(548218-548295)
chr5 (50-187)||(32313713-32313850)
chr5 (340-382)||(40182553-40182595)
chr5 (156-216)||(1338601-1338661)
chr5 (47-91)||(29241264-29241308)
chr5 (47-91)||(31880242-31880286)
chr5 (109-222)||(29788507-29788618)
chr5 (46-91)||(7208396-7208441)
chr5 (348-382)||(21739019-21739053)
chr5 (264-326)||(35955088-35955150)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (46-379)||(2614766-2615100)
chr6 (43-388)||(15276853-15277199)
chr6 (46-387)||(3259548-3259895)
chr6 (55-389)||(17867714-17868049)
chr6 (55-389)||(17877497-17877832)
chr6 (59-382)||(32409774-32410098)
chr6 (49-382)||(24203236-24203569)
chr6 (55-354)||(24242543-24242843)
chr6 (63-389)||(15277195-15277522)
chr6 (47-380)||(10959872-10960205)
chr6 (50-382)||(11212131-11212464)
chr6 (48-382)||(3932729-3933064)
chr6 (58-380)||(10324035-10324358)
chr6 (98-383)||(166844-167130)
chr6 (46-387)||(11613708-11614035)
chr6 (55-382)||(10485038-10485364)
chr6 (98-382)||(34176752-34177037)
chr6 (48-382)||(17443135-17443464)
chr6 (88-342)||(32132342-32132597)
chr6 (152-382)||(11382041-11382269)
chr6 (47-382)||(14925378-14925713)
chr6 (55-382)||(18057399-18057726)
chr6 (137-380)||(11279090-11279333)
chr6 (55-382)||(31870019-31870349)
chr6 (60-382)||(11675296-11675619)
chr6 (55-380)||(3379591-3379915)
chr6 (55-382)||(18597080-18597407)
chr6 (46-387)||(32859922-32860263)
chr6 (138-382)||(3290635-3290866)
chr6 (46-382)||(8177804-8178141)
chr6 (56-382)||(29054239-29054563)
chr6 (49-380)||(23636097-23636428)
chr6 (106-383)||(9902579-9902857)
chr6 (55-339)||(4494079-4494348)
chr6 (43-368)||(34683929-34684247)
chr6 (50-382)||(14807940-14808254)
chr6 (47-197)||(29814736-29814887)
chr6 (47-197)||(28502330-28502482)
chr6 (125-382)||(7396048-7396302)
chr6 (199-378)||(9613998-9614177)
chr6 (46-140)||(32805348-32805442)
chr6 (106-345)||(35004087-35004326)
chr6 (106-337)||(27824620-27824849)
chr6 (47-123)||(11381964-11382040)
chr6 (306-382)||(14925139-14925215)
chr6 (201-375)||(9200316-9200491)
chr6 (312-381)||(33041403-33041472)
chr6 (49-112)||(11279012-11279075)
chr6 (312-379)||(13415861-13415928)
chr6 (184-378)||(28967221-28967414)
chr6 (229-379)||(34402850-34402992)
chr6 (106-212)||(32614030-32614136)
chr6 (46-91)||(34176715-34176760)
chr6 (43-91)||(167122-167170)
chr6 (184-240)||(27756314-27756370)
chr6 (306-378)||(29424498-29424570)
chr6 (126-241)||(29202990-29203104)
chr6 (139-217)||(16542362-16542440)
chr6 (226-288)||(24785106-24785168)
chr6 (137-219)||(29424652-29424734)
chr6 (126-217)||(15400672-15400760)
chr6 (126-217)||(15412459-15412547)
chr6 (126-217)||(15428053-15428141)
chr6 (106-210)||(7365318-7365422)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (46-382)||(101819-102156)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (47-387)||(23448-23787)
scaffold0054 (125-330)||(19857-20062)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (44-388)||(2222-2566)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (48-382)||(51311-51645)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (42-387)||(15038-15384)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (48-343)||(17982-18278)
scaffold0169 (48-280)||(12527-12760)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (49-382)||(4468-4796)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (72-382)||(2385-2695)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (55-378)||(5332-5656)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (104-374)||(18989-19258)
[»] scaffold0360 (3 HSPs)
scaffold0360 (98-382)||(15262-15551)
scaffold0360 (146-296)||(13554-13704)
scaffold0360 (47-91)||(15543-15587)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (136-379)||(372856-373099)
scaffold0004 (45-91)||(373130-373176)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (45-382)||(13576-13913)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (44-383)||(1531-1870)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (44-379)||(42843-43176)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (226-382)||(19044-19201)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (137-286)||(33530-33678)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (108-216)||(3683-3791)
[»] scaffold1112 (1 HSPs)
scaffold1112 (153-202)||(1078-1127)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (46-91)||(338757-338802)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 44 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 845021 - 844674
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  845021 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 844922  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  844921 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 844822  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844821 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 844722  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  844721 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaaga 844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 35387606 - 35387269
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387606 agggtctgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataataatacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttttatgg 35387507  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  35387506 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggttt 35387407  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387406 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35387307  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387306 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 35387269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Original strand, 42510402 - 42510741
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 142  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  42510402 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 42510501  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42510502 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 42510601  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42510602 ttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagt 42510701  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42510702 tgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 42510741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 45491167 - 45490833
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45491167 gtgtgtttggtatgcaaaacagcaattactggacagaacaatataagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttgtatggcat 45491068  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  45491067 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 45490968  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45490967 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttc 45490868  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45490867 tgtcctgtctttcattttttagcaaatcaaacgca 45490833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1351728 - 1351393
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1351728 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 1351629  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1351628 attgagta-ttttttgttttatatgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 1351530  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351529 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 1351430  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351429 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 1351393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6711342 - 6711004
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggttt-gcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atg 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6711342 agggtgtgtttggttttgcaaaacatcaagtactggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaattttttatg 6711243  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  6711242 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtt 6711143  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711142 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 6711043  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711042 gttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6711004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 37 - 379
Target Start/End: Original strand, 41972782 - 41973124
Alignment:
Q  37 ttaagtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat 136  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41972782 ttaagtttatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaat 41972881  T
Q  137 tttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||     
T  41972882 tttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgta 41972980  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972981 gtgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 41973080  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41973081 ctagagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 41973124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 16386734 - 16387069
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16386734 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaatacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 16386833  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16386834 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 16386933  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16386934 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaactgt 16387033  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16387034 tctgtcatgtccttcattttttag-aaatcaaacgca 16387069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28340597 - 28340262
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28340597 gggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaatttttttatggc 28340498  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28340497 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 28340398  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340397 atgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 28340298  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28340297 tctatcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgca 28340262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 16451009 - 16451343
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  16451009 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacatggcagaatagcacaggacaaattttttatggcat 16451108  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16451109 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16451208  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16451209 gagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgtta 16451308  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16451309 tgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 16451343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 49 - 379
Target Start/End: Original strand, 32270240 - 32270566
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| || |||    || |||||||||||||    
T  32270240 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaataggaca----aattttttatggcatt 32270335  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32270336 gagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtg 32270435  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270436 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctctacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 32270535  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32270536 gtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32270566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 51264377 - 51264711
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  51264377 gtgtgtttggtttgcaaatcagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacaggacaaattttttatggcat 51264476  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  51264477 tgagtaattttttgttttatacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 51264576  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51264577 gagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattc 51264676  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51264677 tgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 51264711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Original strand, 17887828 - 17888160
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17887828 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacagaatagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggca 17887927  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  17887928 ttgagtaatttgttgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 17888027  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17888028 gcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgt 17888127  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17888128 tttgtcatgtcattcattttttagcaaatcaaa 17888160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 46 - 384
Target Start/End: Original strand, 7183797 - 7184136
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  7183797 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaatacaggacaaattttttatgg 7183896  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  7183897 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatactatattggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggttt 7183996  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7183997 ggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacatatcaaacactggacaactaaagtta 7184096  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaac 384  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  7184097 ttctgtcctgtctttcaaattttagcaaatcaaacgcaac 7184136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 49 - 351
Target Start/End: Original strand, 12890120 - 12890423
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12890120 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatggcat 12890219  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  12890220 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatcttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgat 12890319  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890320 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 12890419  T
Q  348 tgtc 351  Q
    ||||    
T  12890420 tgtc 12890423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 42 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44738340 - 44737992
Alignment:
Q  42 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 140  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44738340 tctaaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtagaagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttt 44738241  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44738240 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaataaaaa-ctattttgctattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtg 44738142  T
Q  241 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44738141 gtttggtgagggacaaaaatatgagttttggtcctgtcccttgcctccaagttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaattaga 44738042  T
Q  341 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 390  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44738041 gttgttctgtcttgtctttcattttttagcaaaacaaacgcaccctaaga 44737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26118458 - 26118173
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118458 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 26118359  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26118358 ggtattttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtc 26118259  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26118258 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcatacgca 26118173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24339929 - 24339596
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24339929 gtgtgtttggtctgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 24339830  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt-gg 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  24339829 tgaataattttttgttttatacgatgtttgggggacaa--tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgttgtggttttgg 24339732  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24339731 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 24339632  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24339631 ctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 24339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 50540226 - 50540560
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50540226 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacacgtcagaacagcacagggcaaattttttatggcat 50540325  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  50540326 tgagtaatttgttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgat 50540425  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50540426 gaaggacaaaaatatgagtttatgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagctgttt 50540525  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50540526 tgttctgtcctttcttttttagcaaatcaaacgca 50540560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 55 - 387
Target Start/End: Original strand, 50304540 - 50304872
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50304540 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50304639  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50304640 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttaaacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgcagagggac 50304739  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50304740 aaaaatatcagtttttgtcttgtttcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctg 50304839  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50304840 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 50304872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 31004021 - 31004348
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31004021 ttggtttgcaaaacagcaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacagcgcaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatggcattgaataa 31004120  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31004121 ttttttgttttataggatttttgggggacgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31004220  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  31004221 aaaaacatcagtttttgtcctgtcccgtgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 31004320  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004321 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 31004348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 42 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16476453 - 16476107
Alignment:
Q  42 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   || ||| |||| | |||| |||||||||||||| ||    
T  16476453 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataagatagaacaacacgacataaggcataacaccacatgacaaatttgta 16476354  T
Q  142 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16476353 tggcattgaataattttatgttttatacaatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtgg 16476254  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16476253 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaa 16476154  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16476153 ttgtcctctcctctccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 16476107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17327940 - 17327607
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 148  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || | ||||||||||| ||||| ||    
T  17327940 tgtgtttgatttgcaaaaaagtaagtattggacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcgtt 17327841  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17327840 gagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatattattttggtattttagataatttgtacatgagacaaaaagttgtgctgtgatttggtg 17327741  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17327740 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgactccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgtttt 17327641  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17327640 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 17327607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 98 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30105923 - 30105641
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30105923 agaacagtacaacacaaggcagaacaacactggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 30105824  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30105823 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 30105724  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaa 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30105723 ctttacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcatttttttagcaaatcaaa 30105641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41968142 - 41967806
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  41968142 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtgctggacagaacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcggaacaatacatgacaaattttttatgaca 41968043  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  41968042 atgagtaattttttgttttatacaatttttgggagacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgg 41967943  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41967942 taagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgtt 41967843  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttag-caaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41967842 ctgtcctgtccttcattttttagtcaaatcaaacgca 41967806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Original strand, 39281772 - 39282110
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | | |||| |||||||||| ||| ||||    
T  39281772 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtataagatagaacagcacaacacaatgcataacaacacatgacaactttgtatg 39281871  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  39281872 acattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtt 39281971  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  39281972 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagtt 39282071  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
     |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39282072 atcttgtcatgtccttcatgttttagcaaatcaaacgca 39282110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Original strand, 16437259 - 16437574
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 147  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||               | ||| ||||||||||||||||||    
T  16437259 ggtgtgtttggtttgtaaaacagcaaatactggacagaacagtataagatagaacagtaca---------------gtacaggacaaatttttatggcat 16437343  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16437344 tgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16437443  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16437444 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctctagtttgtcctgtagctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttc 16437543  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16437544 tattctgtccttcattttttagcaaatcaaa 16437574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42513052 - 42512728
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  42513052 ttggtttgcaaaaca---agtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 42512956  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| |     
T  42512955 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaattctattttgatattttagacaatttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcac 42512856  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  42512855 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 42512756  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42512755 tcctttattttttagcaaatcaaacgca 42512728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 379
Target Start/End: Original strand, 46154780 - 46155120
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  46154780 gggtgtgtttagtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtataacacaagacataacggcacatgacaaattttttatgac 46154879  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc-------tg 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||       ||    
T  46154880 attgaataattttttgttttataagatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtgctgtagtttg 46154979  T
Q  239 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 338  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46154980 tagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcacctccagtttgtccagtacctgaaataattttacaaatcaaacactgaacaatta 46155079  T
Q  339 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46155080 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 46155120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 85 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32289600 - 32289302
Alignment:
Q  85 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 183  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||| |||  |||||| || | || |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  32289600 aacagtacaagatagaagagtataacataagccagaacaacataggataaatattttatgacattgaataattttatgttttatataatttttgagggac 32289501  T
Q  184 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32289500 aaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 32289401  T
Q  284 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289400 cctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 32289302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 55 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11772917 - 11772583
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||   ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||| | |    
T  11772917 ttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaacacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggttttgaatta 11772818  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11772817 ttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtatttaaaacaatttgtaggtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 11772718  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  11772717 aaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcctccagattgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcctg 11772618  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11772617 tccttcattttctagcaaatcaaacgcaccctaag 11772583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 51703455 - 51703121
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  51703455 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatataacagaacaacacaaggcaaaacaatacatgacaaattttttatggca 51703356  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  51703355 ttgagtaattttttgttttataccatttt-gagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacatgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtt-gg 51703258  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51703257 tgaggaacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgccttcagtttatcctgtacttgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgtt 51703158  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttag-caaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51703157 ctgtcttgtccttcattttttagtcaaatcaaacgca 51703121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Original strand, 1601049 - 1601386
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 141  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   |||||||||     || |||||| |||| |||||||||| ||    
T  1601049 ggtgtgtttggtctgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagaaagaacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacaagacaaatttttta 1601148  T
Q  142 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  1601149 tggcaatgagtaattttttgttttgtacgatttttggtggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 1601248  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1601249 tttggtgagggacaaaa--atgagtttttgttctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaccgttttacaaatcaaacactgaacaactaaag 1601346  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1601347 ttgttctgtcatgttcttca-tttttagcaaatcaaacgca 1601386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6029595 - 6029254
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||     
T  6029595 agggtgcgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttttatggt 6029496  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  6029495 attgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 6029396  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6029395 gtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 6029296  T
Q  346 tc-----tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6029295 tctgtcctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 6029254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26765082 - 26764753
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 147  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||| ||||    
T  26765082 ggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcagaacaatataggacaaatttttatagcat 26764983  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||   |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  26764982 tga---atttttt--tatatacgatttttgagggacgaaatattattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttcggt 26764888  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26764887 gagggacaaaaatataagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttatcttgtacctaaaacaattgtacaaatcaaacactggacaactggagttgttc 26764788  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26764787 tgtcatgtcttttattttttagcaaatcaaacgca 26764753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 65 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15540165 - 15539842
Alignment:
Q  65 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15540165 aaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataattttttgttt 15540066  T
Q  165 tatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatga 264  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||| | | |    
T  15540065 tatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtatgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaagacaaaagtttca 15539966  T
Q  265 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt 364  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15539965 ggttttgtcctgtctcttgcctccagtttgttctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattt 15539866  T
Q  365 tttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  15539865 tttaacaaatcaaacgcaccctaa 15539842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Original strand, 45658761 - 45659037
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  45658761 acaacacaagacagaatagcacatgacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 45658860  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
     |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  45658861 aacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgtctccagtttgtcctgtacttg 45658960  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45658961 aaacagttttacaaatcagacactagacaactggagttgttttgtcctgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 45659037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 111 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49303583 - 49303312
Alignment:
Q  111 acaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 209  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  49303583 acaaggcagaacatcacatgacaactattttacgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgttattttagtattttagaca 49303485  T
Q  210 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 309  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  49303484 acttgtacgtaggataaaaaattgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttctcttgtcccttgtctccagtttgtcttatacctgaaac 49303385  T
Q  310 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49303384 agttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgca 49303312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 49 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3415146 - 3414814
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaatttttatggcat 147  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||  | |||| |||||| |    ||||||||||||    
T  3415146 gtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatataacacaagacaaaacaacacatgtaattttttttatggcat 3415047  T
Q  148 tgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| || || ||| ||||||    
T  3415046 tgagtaatttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaactagtacgtgggataaaaaattatgatgtagtttgg 3414947  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3414946 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcgtctccagattgtccagtacctaaaatagttttacaaatcaaacactggataattagagttgtt 3414847  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3414846 ttgtcatatccttcatattttaacaaatcaaac 3414814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 5109614 - 5109944
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 149  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||  |  |||||||| | | |||| || |||||||||||||| | |||||    
T  5109614 tgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggactgaagagtacaagacaaaatagcgcaacacaaagcataacaccatatgacaaatttttacgacattg 5109713  T
Q  150 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 249  Q
    | |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5109714 atttttttttt-ttttatacaatttttgggggacaaaatgttattttgc-attttagacaacttgtactttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 5109811  T
Q  250 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 349  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5109812 gggacaaaaacatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctg 5109911  T
Q  350 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5109912 tcctgcacttcattttttagcaaatcaaacgca 5109944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 136 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42705442 - 42705195
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42705442 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgacatttcagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtg 42705343  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 334  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42705342 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttttcccgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaaca 42705243  T
Q  335 actagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |  ||||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42705242 atcagagttgttatgacatattctttattttttcgcaaatcaaacgca 42705195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38087281 - 38086973
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38087281 ttggtttgcaaaacattaagtactggacataacagtacaagacagaacagtacaacataaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgaataa 38087182  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    | ||||| ||||| | ||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||     
T  38087181 tattttgctttatgcaatttttggggaacgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacttgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaaggac 38087082  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |     
T  38087081 aaaaatatgagtttttgtcatgtccattgcatccattttatcctgtacttgaaactgttttataaatcaaacacaggacaactgaagttgttttgtccta 38086982  T
Q  355 tccttcatt 363  Q
    |||||||||    
T  38086981 tccttcatt 38086973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 10384256 - 10384578
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||| | |||||||| || | |||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  10384256 ttggtttgcaaaacagtaagtactgggcataacagtacaagaccgaacagcacaacacagggcaaaacaacactggacaattttttattgcattgaataa 10384355  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10384356 ttttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttgaatttttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaaggac 10384455  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |    
T  10384456 aaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcatccaatttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttc-----ag 10384550  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10384551 ttcttcattttttagcaaatcaaacgca 10384578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6144276 - 6143947
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 149  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  |   |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6144276 tgtgtttggtttgcaaaacagtaatcactgaacagaacagtacaagatagggcaacacaacataaggcagaacatcacaagacaaatttttatggtattg 6144177  T
Q  150 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 249  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||  ||    
T  6144176 aataattttctgttttatatgatttttgggtgacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttctacgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttgccga 6144077  T
Q  250 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 349  Q
    |||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6144076 gggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtctctgaaactgttttacaaatcaaacattggacaactgcagttgttctg 6143977  T
Q  350 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  6143976 tcctgtccttcattttgtatcaaatcaaac 6143947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 365
Target Start/End: Original strand, 16704605 - 16704925
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||||   | |||| || | |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  16704605 agggtgagtttggttttcaaaacagaaagtactggacataacaacacaagacagaacaacaaaacataaagcagaatagtacaagacaaatttttatggc 16704704  T
Q  146 attgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  16704705 attaaataaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaaagctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaagagttgtgatgtggttt 16704804  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||    
T  16704805 ggtaagggacaaaaatatatgtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttg 16704904  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcatttt 365  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  16704905 ttctgtcctgtcctttatttt 16704925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 286
Target Start/End: Original strand, 25539735 - 25539975
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25539735 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaatacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggc 25539834  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  25539835 tttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 25539934  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 286  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  25539935 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcct 25539975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13994366 - 13994064
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||  |||||| |  ||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||    
T  13994366 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtacagaacaaaacaacataagacaacacaacacaatacaaggcagaacaacacaagacaaattttgtatgatat 13994267  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13994266 tgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 13994168  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13994167 gagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttc 13994068  T
Q  348 tgtc 351  Q
    ||||    
T  13994067 tgtc 13994064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Original strand, 38663021 - 38663227
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  38663021 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataa 38663120  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  38663121 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 38663220  T
Q  255 aaaaata 261  Q
    |||||||    
T  38663221 aaaaata 38663227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20495137 - 20494927
Alignment:
Q  95 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 193  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20495137 gatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctat 20495038  T
Q  194 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20495037 tttggtattttagacaacttgtacgtggga-----------------cattggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 20494955  T
Q  294 gtcctgtacctgaaacagttttacaaat 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20494954 gtcctgtacctgaaacaattttacaaat 20494927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50382608 - 50382363
Alignment:
Q  135 atttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgt 234  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50382608 atttttatggtattgaataatattttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 50382509  T
Q  235 gctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg---cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 331  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  50382508 gttgtggtttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctccagtttgttatgtccctgaaacagttttaaaaatcaaacactaa 50382409  T
Q  332 acaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaa 377  Q
    |||  |||||||||| |||  | ||||||||||| || ||||||||    
T  50382408 acatgtagagttgttttgtattctccttcattttataacaaatcaa 50382363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 382
Target Start/End: Original strand, 7837149 - 7837350
Alignment:
Q  182 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| |||| |||||| | ||| |||||  | | ||||||||||||||||    
T  7837149 acaaaatactattttgatattttagacaacttgtctgtgagacaaaaagttgtgatgtgatttggtaatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtccct 7837248  T
Q  282 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacg 380  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7837249 tgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttctatcatatccttcatttttttagcaaatcaagcg 7837348  T
Q  381 ca 382  Q
    ||    
T  7837349 ca 7837350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 251
Target Start/End: Original strand, 34663821 - 34664012
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34663821 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacataaggtagaagagcacatgacaaattttttatgg 34663905  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||   |||||||||| ||||||||    
T  34663906 cattaagtaattttttgttttatatgatttttgagtgacaaaatgttattttgatattttagacaatttataagtgggtcaaaaagttgtgttgtggttt 34664005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 382
Target Start/End: Original strand, 8838986 - 8839113
Alignment:
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  8838986 aaaaatatcagtttttgtcatgtccatttcctccagtttgtcttgtaccagaaacagttttacaaatcaaacattggacaattggagttgttctgtcttg 8839085  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8839086 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 8839113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 326
Target Start/End: Original strand, 570281 - 570549
Alignment:
Q  61 tgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt 160  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||   |||||| || | |||||| |||| || |||||||||||| | ||| || ||||||    
T  570281 tgcaaaacagtaagtattagacaaaatagtacaagatagaacaacacaacataaagcagaacaacacaagataaatttttatggtactgaatactttttt 570380  T
Q  161 gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc--tgtggtttggtgagggataaaa 258  Q
     | |||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  570381 atcttatacaatttttggtggaaaaaatgttattttgatattttagacaacttatacgcgagacaaaaagttgtgcattgtggtttggtgagggacaaaa 570480  T
Q  259 atatgagtttttgtcatgtccc-ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 326  Q
    || |  |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  570481 atttctgtttttatcatgtccctttgcctccagtttatcttgtcgctgaaacaattttataaatcaaac 570549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25343431 - 25343213
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  25343431 agaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgctttatgcgatttttgagggacgaaatactattttggatttttggacaacttgtac 25343332  T
Q  218 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc-cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 316  Q
    ||| ||  ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || | |||  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  25343331 gtgcgacaaaaagttgtactatggtttagtgaaggacaaaaatatgtgtttttatcctatccatttgcatccagtttgtcctgtatatgaaactgtttta 25343232  T
Q  317 caaatcaaacactggacaa 335  Q
     ||||||||| | ||||||    
T  25343231 taaatcaaacgcaggacaa 25343213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 279 - 382
Target Start/End: Original strand, 21071727 - 21071830
Alignment:
Q  279 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21071727 ccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattgaagttgttctgtcatgtacttcattctttagcaaatcaaa 21071826  T
Q  379 cgca 382  Q
    ||||    
T  21071827 cgca 21071830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 382
Target Start/End: Original strand, 38663228 - 38663323
Alignment:
Q  287 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38663228 ccagtttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 38663323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 504625 - 504394
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||| ||  | |||||||||||  | |||||| |||| |||| |||||||    
T  504625 acaacacaaagtagaataacacatgtcaaatttttatggtattggacaatttttagtcctctacgatttttggtgaacaaaaagctactttggtatttta 504526  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    |||||||| || ||||||  |||| ||||| | |||||| ||||| || |||| | | |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||     
T  504525 gacaacttctatgtgggacaaaaaattgtgttatggtttagtgagagacaaaattttcagtttttgtgttgtcccttgcctcaagtttgtcttgtcccta 504426  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 337  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  504425 aaacaattttgcaaatcaaacgctgtacaact 504394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 384
Target Start/End: Original strand, 6771338 - 6771586
Alignment:
Q  137 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    |||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6771338 ttttatggtattgaataatacttagtcttatacgatttttttatggacaaaatattattttgatattttagtcaacttgtatgtgggagaaaaagttgtg 6771437  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
     |||| ||| ||||| || || ||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  6771438 ttgtgatttagtgagtgacaagaattttagtttttgtcttgtcccttgtctctaatttatcatgtccctaaaacagttttataaatcaaacaccgcacaa 6771537  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaac 384  Q
     || | ||||  |||| ||||||||  ||||||||| || ||| |||||    
T  6771538 ataaaattgtcatgtcttgtccttctatttttagcagattaaatgcaac 6771586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Original strand, 8838827 - 8838987
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  8838827 ttggtttgcaaaacagtaaatactagacataactgtataagacagaacaacacaacacaagatagaaaaacacataacaaatttttatagcattgaataa 8838926  T
Q  155 -ttttttgtt----ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 210  Q
     |||||||||    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8838927 tttttttgttttaattatatgatttttgggggacgaaatgccattttgatattttagacaa 8838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 306 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 40811405 - 40811322
Alignment:
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40811405 aaacagttttataaatcaaacgctggacaactaaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 40811322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 367
Target Start/End: Original strand, 7837474 - 7837575
Alignment:
Q  266 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 365  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||||||    
T  7837474 tttttgtcatgtcccctgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttataaatcaaacactgaacaactgaagttattctatcatatccttcatttt 7837573  T
Q  366 tt 367  Q
    ||    
T  7837574 tt 7837575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 387
Target Start/End: Original strand, 26733579 - 26733776
Alignment:
Q  190 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||| | |||||| ||| |||| || ||| | |||||||||||||||| | | ||| |    
T  26733579 ctattttggtattttagacaacttgtacatgaggcaaaaagttgtgttatggtttagtgggggacaagaatttcagtttttgtcatgtccatcgtctcta 26733678  T
Q  290 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  26733679 gtttgtccggtcctaaaaacagttttacaaatcaaacatcgtacaactgaagttgtcatgtcttgttcttcattttttagcaagtcaaatgcacccta 26733776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 289
Target Start/End: Original strand, 46447665 - 46447787
Alignment:
Q  167 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 266  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||   |||| |||||||| | |||    
T  46447665 tacgatttttgatggacaaaagactattttgatattttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtaatttaaggaggaataaaaattttagt 46447764  T
Q  267 ttttgtcatgtcccttgcctcca 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  46447765 ttttgtcaggtcccttgcctcca 46447787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 382
Target Start/End: Original strand, 39792826 - 39793022
Alignment:
Q  185 aaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgc 284  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  |  | |||||||| ||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||| ||  |||     
T  39792826 aaatgttattttattattttagacaatttgtacgtgaaacaacaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaagaatttcaatttttgtcatatcttttgt 39792925  T
Q  285 ctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39792926 ctccaatttatcttgtccctaaaacagttttgcaaatcaaacactgtacaacctaagttgtcatttcatgtcctcca-tttttagcaaatcaaacgca 39793022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 169
Target Start/End: Original strand, 21071621 - 21071727
Alignment:
Q  58 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||     ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21071621 gtttgtaaaacagtaagtactggactaaacagtacaagatagcac-----aacacaaggcagaacaatacatgacaaatttttattacattgaataattt 21071715  T
Q  158 tttgttttatac 169  Q
    ||||||||||||    
T  21071716 tttgttttatac 21071727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32468025 - 32467910
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||   | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32468025 tttttatggtattgactaattttttgtcttatatgattttttgtgaacaaaaaactattttgatattgtagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtg 32467926  T
Q  236 ctgtggtttggtgagg 251  Q
    |  |||||| ||||||    
T  32467925 cgttggtttagtgagg 32467910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 388
Target Start/End: Original strand, 33316499 - 33316621
Alignment:
Q  266 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 365  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||| | |||   ||||||||||||    
T  33316499 tttttgttttgtctcttgcgtccagtttgttttgtccctgaaacagatttacagatcaaatactgtagaactagagttgctatgtatcgtccttcatttt 33316598  T
Q  366 ttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  33316599 ttagcagatcaaacgcatcctaa 33316621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34284040 - 34283912
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattt--tagacaacttgt 215  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  || |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||  || | |||||||    
T  34284040 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataagtttttgccttgtacgattttttatggacaaaagactattttgatattttatatataacttgt 34283941  T
Q  216 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  34283940 acgtgagataaaaagttgtgttgtggttt 34283912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 46815906 - 46815682
Alignment:
Q  163 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 262  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| | |||||| |||||||| ||   | |    
T  46815906 tttagacggtttttggcggacaaaatgttattttggtattttagacaactagtacgtgggaaaaaaggttgtgatatggtttagtgaggga-aatttttt 46815808  T
Q  263 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 362  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||   |||||| | |   ||||||| ||||||||| ||||| | | |  | ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  46815807 tagtttgtgttatgtcccttgcgtctgatttgtcttatctttgaaacaattttacaaaccaaactccgtattattagagttatcatgtcttgtccttcat 46815708  T
Q  363 tttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  46815707 tttttagcagatcaaacgcaccctaa 46815682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2761770 - 2761551
Alignment:
Q  125 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 224  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||  |||||||  ||||||||| || |||||| || ||     
T  2761770 cacatgacagacttttatagtattgaataatttttggttttatatgatttttgttg-acaaaaatctatttttgtattttagataatttgtacttgagac 2761672  T
Q  225 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 324  Q
     |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  |  ||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||  |  ||||| |||||||||| ||    
T  2761671 aaaaaattgtgttgtggtttagtgagggatataaaattttgtttttgttttgtcccttgcctctagtttatcatgtcgcataaacaattttacaaattaa 2761572  T
Q  325 acactggacaactagagttgt 345  Q
    ||||   |||||| |||||||    
T  2761571 acaccatacaacttgagttgt 2761551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Original strand, 17291612 - 17291791
Alignment:
Q  199 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 298  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||| ||| |||| |||||| |  ||||||||| |||| |||| || ||  || ||||    
T  17291612 tattttatataacttgtacgagggacaaaaagttttgttgtggtttagtg-gggacaaaaatttatgtttttgtcctgtctcttgacttcaacttatcct 17291710  T
Q  299 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    || |   |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  17291711 gtcctaaaaacagttttacaaatcaaataccgtacaactggagttgtcctgtcatgttctcaattttttagcagatcaaac 17291791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799603
Alignment:
Q  207 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca 274  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23799670 acaacttaaacgtgcgataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtca 23799603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Original strand, 15324109 - 15324201
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 210  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15324109 agaacaacacatgaaaagcttttatggtaataaataattttttgtcttatacgatgtttgatggacaaattactattttgatattttagacaa 15324201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47242743 - 47242477
Alignment:
Q  111 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 210  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||| |  ||||| ||||||||  | |||||| |||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  47242743 acaaggcagaacgacacatgacaaacatttacgatattgaataatttttgatcttatacaattttt-atgtacaaaagactattttggtattttagacaa 47242645  T
Q  211 cttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 310  Q
    ||   ||||| ||  ||||||||| ||  | |||  |||| || |||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  47242644 ctaacacgtgagacaaaaagttgtactaggttttaatgagagaaaaaaattt-agtttttgtcttgtcacctacctccagtttgtcatgtcccataaaca 47242546  T
Q  311 gttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
     |||||||||| ||||||   ||||||  ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  47242545 attttacaaattaaacaccatacaactgaagttgtcatgtcatgtcatttattttttagcaaatgaaac 47242477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 379
Target Start/End: Original strand, 31574320 - 31574566
Alignment:
Q  133 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac-aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagt 231  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||  | |||  | ||||    
T  31574320 aaatttttgtgatattgaataattttttgttttatgcgattttttgtagactaaaaaactatttttgtattttaaacaacttgtatataggacaataagt 31574419  T
Q  232 tgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 331  Q
    || | ||||  || ||||| |||| |||| | ||||||||||||||  |||  |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||| | ||     
T  31574420 tgcgttgtgaattagtgagagatacaaattttagtttttgtcatgtttcttatctccagtttgttttgtttttgaaatagttttacaaatcaaa-attgt 31574518  T
Q  332 acaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31574519 acaactgaagttgtcatgtcatgtgcttcatttcttagcagatcaaac 31574566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 388
Target Start/End: Original strand, 40610739 - 40610944
Alignment:
Q  183 caaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc-cct 281  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||   |    
T  40610739 caaaatgttattttggtattttagacaacttatatatgtgataaaaagttgtgttgtggtttgatgagggagaagaat-tttgtttttgtcatatctttt 40610837  T
Q  282 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
    ||||| || |||||||||   | | ||||||||||||||||||||| || | || | || ||||  | |||| | ||||||||||||  ||||||||| |    
T  40610838 tgccttcaatttgtcctgccgccggaacagttttacaaatcaaacattgtaaaatttgaattgtcatatcatatacttcattttttaataaatcaaacac 40610937  T
Q  382 aacctaa 388  Q
    | |||||    
T  40610938 accctaa 40610944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 382
Target Start/End: Original strand, 25539981 - 25540034
Alignment:
Q  329 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25539981 tggacaactggagttgttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 25540034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30105960 - 30105915
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30105960 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 30105915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23799603 - 23799531
Alignment:
Q  307 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23799603 aacagttttataaatcaaacactaaacaactgaaattgttgtgtcatgtcattcaatttttagcaaatcaaac 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26118494 - 26118450
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26118494 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 26118450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23799749 - 23799670
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  23799749 ttggtttacaaaacagtaagtactgtatagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacatgacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16643232 - 16643190
Alignment:
Q  340 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643232 agttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 16643190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 213
Target Start/End: Original strand, 49799322 - 49799424
Alignment:
Q  111 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 210  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||| | |||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  49799322 acaagctagaacaccacaagacaaacttttatgatattgaataatatttggtcttattcaattttttatggacaaaagtctattttggtattttagacaa 49799421  T
Q  211 ctt 213  Q
    |||    
T  49799422 ctt 49799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Original strand, 7836542 - 7836630
Alignment:
Q  108 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    |||| ||||||||| | ||||  |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  7836542 aacataaggtagaataacacagaacaagttattatgatattgaataattttttgttttatacgagttttggggcacaaaatgctttttt 7836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16643361 - 16643272
Alignment:
Q  159 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 250  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  16643361 ttgttttatacgattttgg--ggacgaaatggtatttttgtattttagacaacctgtatgtgggacaaaaagttgtgtcgtgatttggtgag 16643272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52030434 - 52030330
Alignment:
Q  111 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 210  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| | |||||||||| |||| |||||||   ||||||||  |||||||  ||||||||| ||    
T  52030434 acaaggcataacagcacatggcaaacttttacggtattgaatcattttttgttatatatgattttttgtggacaaaaaactatttttgtattttagataa 52030335  T
Q  211 cttgt 215  Q
    |||||    
T  52030334 cttgt 52030330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 392
Target Start/End: Original strand, 7146859 - 7146986
Alignment:
Q  265 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt 364  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||| ||||| | |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||| | ||||| | ||    
T  7146859 gtttttgttttgtcctttgtctctagtttattctgtcccaaaaacaattttacaaatcaaacactatacaactgaagttgttatgtcttatcctttaatt 7146958  T
Q  365 tttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 392  Q
    ||||||  ||||||| || |||||||||    
T  7146959 tttagctgatcaaacacaccctaagaat 7146986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8780690 - 8780601
Alignment:
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  8780690 aaaaatttcagtttttggcatgtctcttgtccccagtttgttatgtccatgaaacagttttac-aatcaaacacagtacaactacagttgt 8780601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30798705 - 30798557
Alignment:
Q  226 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 325  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || | | | |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  30798705 aaaagttgtgatgtgggttagtgagggacaagactttcagtttt-gtcatgtcccctgcctccaatttgttatgtccctaaaacagtctttcaaatcaaa 30798607  T
Q  326 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 379  Q
    || || | || | ||||     |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30798606 cagtgtaaaattcgagt-----tgtcatgtccttcatttttttagcagatcaaac 30798557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47093064 - 47093006
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  47093064 agaacaacacatgacaaatttttataatattgaataattttttgccttatacgattttt 47093006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30798900 - 30798824
Alignment:
Q  131 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 207  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  30798900 acaaaattttatgatattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaacaaactattttggtattttaga 30798824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 35335799 - 35335863
Alignment:
Q  265 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 329  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  35335799 gtttttgtcatgtctcttgtctccattttgttatgtctctacaacagttttacaaatcaaacact 35335863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 43 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 36769793 - 36769446
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36769793 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 36769694  T
Q  142 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36769693 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 36769594  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769593 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 36769494  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36769493 ttgttctattctgtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaag 36769446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Original strand, 47953066 - 47953401
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 146  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47953066 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47953165  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47953166 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 47953265  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47953266 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 47953365  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47953366 ctgtcctgtcgttcattttttagcaaatcaaacgca 47953401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10932780 - 10932434
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||    
T  10932780 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacacggcagaacagcataggacaaattttttat 10932681  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  10932680 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagt 10932581  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10932580 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagt 10932481  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10932480 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 10932434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3922923 - 3922587
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3922923 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaccagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 3922824  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3922823 attgagtatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 3922724  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3922723 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactagagttgt 3922624  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922623 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3922587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11322105 - 11321769
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11322105 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggc 11322006  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11322005 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11321906  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11321905 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccgttgcctccagtttgtcctgtacctgaatcagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 11321806  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11321805 tctgtcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgca 11321769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26994444 - 26994109
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26994444 ggtgtgtttggtttgcaaaacagaaagtactggacagaacaggacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggca 26994345  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26994344 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 26994245  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994244 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 26994145  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994144 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 26994109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 50 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 43158903 - 43158565
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  43158903 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagatagagcagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttttatggcatt 43158804  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  43158803 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggta 43158704  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158703 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 43158604  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43158603 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 43158565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 46633571 - 46633903
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  46633571 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacataatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatgg 46633670  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46633671 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 46633770  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633771 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcttg-----ttcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 46633865  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633866 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 46633903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 21784749 - 21785082
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  21784749 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaatcttttatggcatt 21784848  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21784849 gagtaattttatgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21784948  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21784949 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttct 21785048  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21785049 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 21785082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43189466 - 43189126
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  43189466 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtgcatgacaaattttttat 43189367  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43189366 ggcattgagtaatttgttgtttcatacgatttttggggggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtgg 43189267  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43189266 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacatttttataaatcaaacactggacaactagag 43189167  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43189166 ttgttttgtcatgtcctccattttttagcaaatcaaacgca 43189126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 43 - 388
Target Start/End: Original strand, 18386396 - 18386741
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 141  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  18386396 ctaagggtgagtttggtttgcaaaacagcaagtattggacaaaacggtacaaaatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatttttta 18386495  T
Q  142 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18386496 tgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 18386595  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18386596 tttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 18386694  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18386695 ttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 18386741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 55 - 377
Target Start/End: Original strand, 18470567 - 18470888
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18470567 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 18470666  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18470667 attttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagaga 18470766  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  18470767 caaaaatatgagtttttgtcctgt--cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactcgacaactagagttgttctatcct 18470864  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaa 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  18470865 gtccttcattttgtagcaaatcaa 18470888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 59 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26372017 - 26371693
Alignment:
Q  59 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 157  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26372017 tttgaaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacataaaacagaacatcacatgacaaattttttatggcattgaataattt 26371918  T
Q  158 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26371917 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaa 26371818  T
Q  258 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26371817 aatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttgcaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatcc 26371718  T
Q  358 ttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26371717 ttcattttttagcaaatcaaacgca 26371693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 55 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 41211413 - 41211086
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  41211413 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagta 41211314  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41211313 attttttgttttatacgattttttagggataaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 41211214  T
Q  253 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 352  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  41211213 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaacttgagttgttctgtcc 41211114  T
Q  353 tgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41211113 tgtccttcattttttagcaaatcaaacg 41211086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 49 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32873987 - 32873659
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32873987 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcat 32873888  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  32873887 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 32873788  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||     
T  32873787 gaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatccggtacctgaaacaattttacaaatcaaacaatggacaactaga---gttt 32873691  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32873690 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32873659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 46 - 390
Target Start/End: Original strand, 43368076 - 43368420
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  43368076 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacatgacaaatttttatcac 43368175  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  43368176 attgaataattttttgttttatacgattttggagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttg 43368275  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
     ||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43368276 ctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcccgtctcttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 43368375  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43368376 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacggaccctaaga 43368420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 49 - 378
Target Start/End: Original strand, 1870011 - 1870342
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  1870011 gtgtgtttggtttgcaaaacagcatgtactgtacataacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgataaattttttatgacat 1870110  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1870111 tgagtaattttttgttttatacgatttttttagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 1870210  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1870211 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 1870310  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1870311 ctgcactgtccttcattttttagcaaatcaaa 1870342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 40753044 - 40753366
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  40753044 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaagcagaacaacacaggacaaattttttatgg 40753128  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  40753129 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgattt 40753228  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40753229 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacgagagttg 40753328  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40753329 ttctgtcatgtcccttattttttagcaaatcaaacgca 40753366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30849464 - 30849130
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  30849464 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaacacaggacaatttttttatggcat 30849365  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30849364 tgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 30849265  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30849264 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaatcattggacaactagaattgttc 30849165  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30849164 tgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 30849130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47316901 - 47316582
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||          |||    || |||||||||||||    
T  47316901 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacggtacaagatagaacagtacaacacaag----------aca----aattttttatggcatt 47316816  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  47316815 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtaatttagacaacttgcatgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 47316716  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47316715 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttattct 47316616  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47316615 gtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgca 47316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 104 - 382
Target Start/End: Original strand, 29661255 - 29661533
Alignment:
Q  104 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 202  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29661255 gtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgtgggacaaaatgctattttggtatt 29661354  T
Q  203 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 302  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29661355 ttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtac 29661454  T
Q  303 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661455 ctgaatcagttctacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatc-tatccttcattttttagcaaatcaaacgca 29661533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3892238 - 3891930
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3892238 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcatatgacaaattttttatggcattgagta 3892139  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3892138 attttttgttttacacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattctagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagaga 3892039  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3892038 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcc----------------ttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcct 3891955  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3891954 gtccttcattttttagcaaatcaaa 3891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 9913400 - 9913745
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9913400 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9913499  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9913500 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9913599  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9913600 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9913698  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  9913699 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcacccttagaat 9913745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 9927088 - 9927433
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9927088 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9927187  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9927188 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9927287  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9927288 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9927386  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  9927387 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcacccttagaat 9927433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 108 - 388
Target Start/End: Original strand, 11250558 - 11250834
Alignment:
Q  108 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11250558 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctagtttggtattttag 11250657  T
Q  207 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 306  Q
    ||||||      |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250658 acaacta-----tgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11250752  T
Q  307 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11250753 aacaattttacaaatgaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 11250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 382
Target Start/End: Original strand, 48894591 - 48894928
Alignment:
Q  45 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |    
T  48894591 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatatttgacataacagtacaagaccgaacagtacaacacaaggtaaaacagcactggacaattttttattg 48894690  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||  | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  48894691 cattgaataattttttgttttataagatttttgggggacaaaatgttattttggatttttagatgatttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 48894790  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
     ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48894791 agtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 48894890  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48894891 ttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 48894928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34295615 - 34295295
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  34295615 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataa 34295516  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  34295515 ttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 34295416  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  34295415 aaaaatatcagtttttgt-------cttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtccta 34295323  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || || |||||||||| |||||||||||    
T  34295322 tcttttattttttagctaatcaaacgca 34295295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 329354 - 329687
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  329354 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacagtacatgacaaatttttatggtattgaataa 329453  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  329454 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 329553  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac------tagagttgttct 348  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||      | |||||||| |    
T  329554 aaaaatttcagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactggagttggagttgtttt 329653  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  329654 gtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 329687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 136 - 382
Target Start/End: Original strand, 44748660 - 44748906
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  44748660 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgta 44748759  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748760 ttgtggtttggtgagggacaaaaatttgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 44748859  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44748860 ctagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 44748906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 38301223 - 38301554
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||      ||||||||| |    
T  38301223 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacag-----atttttatgac 38301317  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  38301318 attgaataattttttgtttaatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgt-cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 38301416  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38301417 ctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 38301516  T
Q  346 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38301517 tctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 38301554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30599229 - 30598939
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||     
T  30599229 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatga 30599130  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  30599129 aattgagtaatttgttgttttatacgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagataatttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggttt 30599030  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30599029 gatgagggacaaaaatatgagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacagtggacaa 30598939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 378
Target Start/End: Original strand, 1363538 - 1363843
Alignment:
Q  72 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacga 171  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1363538 aagtactggacataacaatataagatagaacaacacatcagaaggtagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacaa 1363637  T
Q  172 tttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttg 271  Q
    |||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  1363638 tttttg-ggtacgaaatgctatttttgtatttttgacaacctgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgatgagggacaaaaatatcagcttttg 1363736  T
Q  272 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagca 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  1363737 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacatgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttgtcctatcctttattttttagca 1363836  T
Q  372 aatcaaa 378  Q
    |||||||    
T  1363837 aatcaaa 1363843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 388
Target Start/End: Original strand, 11822116 - 11822440
Alignment:
Q  56 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |  |    
T  11822116 tggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtataaaatagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggacaaatttttatggcattgaat--t 11822213  T
Q  156 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 255  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||      ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  11822214 ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttgaatttttaaacaac------gtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggaca 11822307  T
Q  256 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  11822308 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacgaatcaaacactggacaagtgaagttgttctgtcctgt 11822407  T
Q  356 ccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11822408 cctttattttttagtaaatcaaacgcaccctaa 11822440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23349510 - 23349209
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23349510 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtaatggacataacagtacaagatagaacaaaacaacataaggtagaacagcacatgacaaatttttataaca 23349411  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23349410 ttgaataattttttgttttctacgattgttgggggacgaaatgtcattttagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 23349311  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  23349310 tgagggacaaaaatatcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacttgaaatagttttacaattcaaacactggacaactggagtagtt 23349211  T
Q  347 ct 348  Q
    ||    
T  23349210 ct 23349209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 55 - 383
Target Start/End: Original strand, 20127171 - 20127501
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg----a 150  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| | |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    |    
T  20127171 ttggtttgcaaaacagtaagtac--gatagaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagatagaacagcacatgacaaatttttgtagcattgaatta 20127268  T
Q  151 gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 250  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20127269 ttatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgtcattttggtattttacacaaattgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgctgag 20127368  T
Q  251 ggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgt 350  Q
    | | |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20127369 gaacaaaaatatcagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttaaaaatcaaacactggacaactggagttgttctgt 20127468  T
Q  351 catgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 383  Q
    | | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20127469 cctatctttcatttattagcaaatcaaacgcaa 20127501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 106 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43214085 - 43213811
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  43214085 acaacacaaggtagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaatcattttttgttttataggatttttgaggcacgaaatgctattttggtattttt 43213986  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||       
T  43213985 gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagcttttatcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtactga 43213886  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43213885 aaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgttctgtcctgttcttcattttttagcaaatcaaacg 43213811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 55 - 379
Target Start/End: Original strand, 37966858 - 37967182
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| | ||| | ||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  37966858 ttggtttgcaaaatagtaagtactagacataataatataagacataacagcacaacacaaagcagaatagtacataacaaatttttatggtattaaataa 37966957  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | ||||  ||     
T  37966958 ttttttgttttatacgatttttttgggacgaaatgctattttggatttttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtggtctagtgaaagac 37967057  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  37967058 aaaaatatgggtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggagaactaaagttgttttgtcatg 37967157  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37967158 tccttcattttttagcaaatcaaac 37967182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 48445404 - 48445740
Alignment:
Q  54 attggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||   | |||   ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48445404 attggtttgcaagacagtaagtactggacaaaacagtacaatgcataacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaata 48445503  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| | | ||  ||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  48445504 atttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattttcgtgttttagacaacttgtatgcgagacaaaaagttgtcctgtgatttggtgaagga 48445603  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  48445604 caaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctcaaacagttttacaaattaaacattggataactggagttgttctgtctt 48445703  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 390  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  48445704 ttccttcattttttaacaaattaaacgcaccctaaga 48445740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 387
Target Start/End: Original strand, 17237035 - 17237292
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||| ||  ||||    
T  17237035 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgagacaaaaa 17237134  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 329  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17237135 gttgtgttgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcatgttccttgcatccagtttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacact 17237234  T
Q  330 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17237235 ggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 17237292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22724243 - 22723916
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||   |||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||    
T  22724243 ttggtttgcaaaatagtaaataccggacaaaatagtataagataggacaacacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttatggtattgaataa 22724144  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||     
T  22724143 ttttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttatacaacttgtacgtgggataaaaagttgcgttgtggtttggcgatggac 22724044  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    ||| ||   |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  22724043 aaacattgcagtttttgtcctgtcccttacctcgagtttgtccggtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcaca 22723944  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22723943 tccttcattttttatcaaatcaaacgca 22723916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22724739 - 22724429
Alignment:
Q  58 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||| |||||| |||| || |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  22724739 gtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatatcacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttctggtattgaataattt 22724640  T
Q  158 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 257  Q
    | ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22724639 tctgtattatatgatttttgggcgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgcgctgtggtttggtgagggacaaa 22724540  T
Q  258 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 357  Q
    |||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||    
T  22724539 aattgcagcttttgtcatatcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacgctgaacaactggaattgttctgtcctatcc 22724440  T
Q  358 ttcatttttta 368  Q
    || | ||||||    
T  22724439 tttacttttta 22724429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26910624 - 26910295
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||   | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||    
T  26910624 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataggataggacatcataacacaaggtagaacagcgcaagacaaatttt-atggtatt 26910526  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    || ||||||| || |||||  |||||||| | ||| || | |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |    
T  26910525 gaataattttctgatttat--gatttttgggtgacgaattactatttttgtatttttgacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttggcg 26910428  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26910427 agggacaaaaattgcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgccctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactgtagttgttct 26910328  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  26910327 gtcatgtccttca-tttatatcaaatcaaacgca 26910295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 47947636 - 47947826
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 146  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47947636 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47947735  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47947736 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 47947826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Original strand, 46408771 - 46409021
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||      |||||||||||    
T  46408771 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacat------tttttatggca 46408864  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  46408865 ttgagtaattttttattttatacgatttttgagagacaatatgctattttgatattttagacaacttgtatgtcggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 46408964  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc----cttgcctccagtttgtcctgt 300  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||    
T  46408965 tgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtccctttcttgtctccagtttgtcctgt 46409021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 366
Target Start/End: Original strand, 21133248 - 21133567
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||| |||| || |||| |||||   ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| |||    
T  21133248 gtgtgtttggttggcaaaatagtaagtactatacataacaatacaagaaagaacatcacaacacaaggcagaacaacacagtacaaattttttatgacat 21133347  T
Q  148 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||      
T  21133348 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgggagacgaaatgctattttggtattttagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttat 21133447  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  21133448 tgagggaaaataatatcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaattaaacattaaataactagagttgtt 21133547  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttt 366  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  21133548 ctatcatttccttcattttt 21133567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 270
Target Start/End: Original strand, 26652750 - 26652965
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||| ||||||  |||||| | ||| |||||||||||| | ||| | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  26652750 ttggtttgtaaaacatcaagtacagtacataacagtataagaaaaaacagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 26652849  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  26652850 ttttttgttttatacgatttttggcggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 26652949  T
Q  255 aaaaatatgagttttt 270  Q
    |||||||| |||||||    
T  26652950 aaaaatatcagttttt 26652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 389
Target Start/End: Original strand, 16963174 - 16963356
Alignment:
Q  207 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 306  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16963174 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttgataagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctctagtttgtcatgtacctga 16963273  T
Q  307 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16963274 aacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaag 16963356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 130 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 46448780 - 46448528
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||   ||||||| || || ||| |||||  ||||    
T  46448780 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttaggggacgaaatgttattttggatttttagataatttatacatgggacaaaaa 46448681  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 329  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46448680 gttgtgctgtggtttagtgacggacaaaaatatgagtttttatcatgtcccttgcatccagtttgtaccgtacctgaaacaattttacaaatcaaacact 46448581  T
Q  330 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
     |||||||  ||||||||| || |||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  46448580 agacaactgaagttgttctatcttgtcttctattttttaacaaatcaaacgca 46448528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15035401 - 15035135
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  15035401 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtacgatttttggtgggcaaaatgttattttgatattttagacaatttgtat 15035302  T
Q  218 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag--tttt 315  Q
    |||| |  |||||||||| |||||| |||||||| | || ||| | | |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | || | |||  ||||    
T  15035301 gtggtacaaaaagttgtgttgtggtctggtgaggaacaagaatttcaattttcgtcctgtcctttgcttccagtttgtcctgtccttggagcagtttttt 15035202  T
Q  316 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||| || | || |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15035201 acaaattaaacattgtataattagagttgtcatgtcatgtatttcattttttagcaaatcaaacgca 15035135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 301
Target Start/End: Original strand, 34117399 - 34117581
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34117399 agaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcattttagacaacttgtac 34117498  T
Q  218 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgta 301  Q
     ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34117499 atggaacaaaaaattgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcatat-ccttgccttaagtttgtcctgta 34117581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 388
Target Start/End: Original strand, 34519527 - 34519725
Alignment:
Q  190 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 289  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  34519527 ctatttttgtattttagacaacttgtacctgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctcca 34519626  T
Q  290 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  34519627 gcttgtcatgtccctgaaactgttttacaattcgaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtcctttattttttattaaatcaaacgcaccctaa 34519725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 169
Target Start/End: Original strand, 12982178 - 12982301
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac-aaatttttatggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12982178 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggagagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggc 12982277  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12982278 attgagtaattttttgttttatac 12982301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41665786 - 41665568
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||| || | |||||| || | | || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  41665786 ttggtttacaaaacagtaagtacggaacataacaatacaagataggacagcacaacataacgcataatagcacaagacaaatttttatggtattgaataa 41665687  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  41665686 ttttctgttttatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggac 41665587  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtc 273  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  41665586 aaaaattgcagtttttgtc 41665568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 16962986 - 16963149
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   | | ||| | ||      ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16962986 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaacacaaggcagaacagcgcat-----aacagcacatgacaaattttttatgg 16963080  T
Q  145 cattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16963081 cattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaact 16963149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 382
Target Start/End: Original strand, 26700572 - 26700688
Alignment:
Q  266 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 365  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26700572 tttttgtcctttctcttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactggacaactggaattgttatgtcatgtccttcatttt 26700671  T
Q  366 ttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26700672 ttaccaaatcaaacgca 26700688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 286
Target Start/End: Original strand, 22631609 - 22631853
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttttat 142  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||   |||||||||     || |||||| ||||||||||||| |||     
T  22631609 ggtgtgtttcgtttgcaaaacaataagtattggacagaacagtacaagacataacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattattag 22631708  T
Q  143 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
     ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||||| || |||||    
T  22631709 agcattaaataatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatatcattttggtattttagacaacttgtacgtataacaaaaagttatgttgtgg 22631808  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 286  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  22631809 tttggtgaaggacaaaaatatcagttattgtcgcgtcccttgcct 22631853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 46627135 - 46627259
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||  ||||||||||||   ||||||| ||  |||| |||||    
T  46627135 tttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttgggagacgaaatactatttttgtattttagacaatccgtacgtgagacaaaaaattgtg 46627234  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaat 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  46627235 ctgtggtttgatgagggataaaaat 46627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21408745 - 21408526
Alignment:
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||   |||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||| || ||||||||     
T  21408745 attgaataattttttatcttatacgatttttagtggacgaaaa-ctatttttgtattttagataacttgtacatgaaataaaaagttatgttgtggttta 21408647  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
     ||||||| |||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||    
T  21408646 atgagggacaaatgtttt-gtctttgtcatgtcccttgcctccagtttgtgttgtcccaaaaacagctttacaaatcaaatattgtacaactagagatgt 21408548  T
Q  346 tctgtcatgtccttcatttttt 367  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  21408547 catgtcatgtccttcatttttt 21408526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 273
Target Start/End: Original strand, 48699334 - 48699500
Alignment:
Q  107 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | | |||| || || ||||||||||   ||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  48699334 caacataaggcagaacagcacaagacaagcttttatggtattgaatgacttttggtcttgtacgattttttgtggacataagtctattttggtattttag 48699433  T
Q  207 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 273  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||    
T  48699434 acaacttgtacgtggaacaaatagttgtgttgtggtttagtgagggacaagaatttcagtttttgtc 48699500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29456006 - 29455778
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||| | || |||||| ||||||||| |||||||    
T  29456006 acaacataaggcaaaacaacacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggtcttatatgattttggtgg-acaaaacgctattttggtatttta 29455908  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
     |  ||| ||| ||||||  |||||||||| ||| |||  | || ||| || ||| | | ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||  |||    
T  29455907 ta--actagtatgtgggacaaaaagttgtgttgttgttaagcgaaggacaagaatttcactttttgttatgtcccttgcctccaatttctactgtctctg 29455810  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 337  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  29455809 aaatagtgttacaaatcaaacattgcacaact 29455778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29372915 - 29372764
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||| |   |||    
T  29372915 gacaaacttttatggtattaaataatttttggtcttatatgatttttggtggataaaaggttaatttgaaattttagacaacttgtacatggaacagaaa 29372816  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 281  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  29372815 gttgtgttgtggtttagtgacggacaaaaattttagtttttgtcgtgtccct 29372764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41665573 - 41665485
Alignment:
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  41665573 tttgtcctgttcttgaaacagttttataattgaaacactggacaactggagttgttctgtcctatcctttattatttatcaaatcaaac 41665485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 253
Target Start/End: Original strand, 35645403 - 35645529
Alignment:
Q  127 catgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg-ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 225  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| || ||||||| | |||||||||||| || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||     
T  35645403 catgataaacttttatggtgttgggtcattttttatcttatacgattttggatgaa-aaaatgactattttattattttagacaacttgtacgtacgata 35645501  T
Q  226 aaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35645502 aaaagttgtgttgtggtttagtgaggga 35645529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 382
Target Start/End: Original strand, 41223320 - 41223398
Alignment:
Q  304 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41223320 tgaaacagttttacaaatcaaacacggaacaatcggaattgttttatcatatccttcattttttagcatatcaaacgca 41223398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Original strand, 2048887 - 2049107
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||| |||   ||| |||| || |||||| |||||| | ||||||||  |||||||  ||||||     
T  2048887 acaacacaaggcagaacaacacatgataaactcgtatggtattacataagttttggtcttatacaattttttatggacaaaaa-ctatttttgtattttt 2048985  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
     | ||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||| |||| ||| |||||| |   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||      
T  2048986 tataacttctacgtgggacaaaatgttttgttgtggtttagtgatggacaaaaatttatatttttgttatgttccttgcctctagtttgtcccgtcccaa 2049085  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaaca 327  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  2049086 aaacaatttttcaaatcaaaca 2049107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3359837 - 3359773
Alignment:
Q  266 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 330  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3359837 tttttgtcatgtcccttacctctagtttatcttgtgccagaaacagttttacaaatcaaagactg 3359773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 96
Target Start/End: Original strand, 34117349 - 34117397
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataaga 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34117349 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaaga 34117397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 174
Target Start/End: Original strand, 47442769 - 47442840
Alignment:
Q  104 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgattt 174  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47442769 gtacaacataaggcagaacactacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattt 47442840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 249
Target Start/End: Original strand, 42332059 - 42332137
Alignment:
Q  171 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 249  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  42332059 atttttggtggataaaatgttattttgatatttaagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 42332137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30260043 - 30259938
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | | ||||   || ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  30260043 gacaaatttttatgatattgaataatttttgatcttatacgagttttgatgaataaaaaattaatttgatattttagacaacttgtaagtaagataaaaa 30259944  T
Q  230 gttgtg 235  Q
    ||||||    
T  30259943 gttgtg 30259938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16027918 - 16027823
Alignment:
Q  275 tgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 370  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||| || ||||||    
T  16027918 tgtccattgtctccaatttgtcttgtctttgaaacaattttacaaatcaaacactatacaactagagttatcttgtcatatccttcgttctttagc 16027823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 218
Target Start/End: Original strand, 8453285 - 8453322
Alignment:
Q  181 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8453285 gacaaaatgttattttgatattttagacaatttgtacg 8453322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 83
Target Start/End: Original strand, 17237005 - 17237038
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17237005 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggaca 17237038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29992813 - 29992741
Alignment:
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 220  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29992813 ttgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaattattttg-tattttagataacttgtacgtg 29992741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Original strand, 8453204 - 8453260
Alignment:
Q  133 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 189  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  8453204 aaatttttatggtattgaatatttgtttgtcttatacgatttttaagagacaaaatg 8453260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41903667 - 41903603
Alignment:
Q  153 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  41903667 aattttttgttttatatgatgtttggtggacaaaagactattttagtattttagacaatttgtac 41903603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 51259994 - 51259657
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51259994 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaaatttttatgg 51259895  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  51259894 cattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggttt 51259795  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259794 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 51259695  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259694 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 51259657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 28675661 - 28675998
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  28675661 agggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatgg 28675760  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  28675761 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 28675860  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28675861 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattg 28675960  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28675961 ttctgtcctgttcttcattttttaacaaatcaaacgca 28675998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 44 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1344923 - 1344587
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  1344923 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacatcacatgacaatttttttat 1344824  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1344823 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 1344724  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344723 ttggtgagggacaaaaatatgagtttctgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 1344624  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1344623 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 1344587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12349376 - 12349048
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12349376 ttggtttgcaaaagagcaagtattggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 12349277  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12349276 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgtgctgtggtttggtgagaga 12349177  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  12349176 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcct 12349077  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349076 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 12349048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 2134944 - 2135278
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  2134944 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacgttacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcat 2135043  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2135044 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaagtgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 2135143  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135144 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 2135243  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135244 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2135278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 29584749 - 29585083
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||    
T  29584749 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagtacagaacaaattttttattgcat 29584848  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29584849 tgagtaattttttattttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 29584948  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584949 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 29585048  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29585049 tgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 29585083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31883234 - 31882894
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  31883234 gggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacaacacaggacaaatttttatgaca 31883135  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  31883134 ttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgc 31883035  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31883034 tgaggcacaaaaatatcagtttttgtcgtgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 31882935  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31882934 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31882894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21221570 - 21221238
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 148  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21221570 tgtgtttggtttgcaatacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcatt 21221471  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21221470 gagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21221371  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21221370 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccag-ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttct 21221272  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21221271 gtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 21221238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 24571153 - 24571486
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24571153 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaga-cactataagatagaacaatacaacataaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 24571251  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24571252 cattgagtaatttgttgttttattcgatttttgggggacaaaatcctatttttgtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggttt 24571351  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24571352 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24571451  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24571452 ttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 24571486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53558009 - 53557676
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53558009 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacaatacaaggtataacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 53557910  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  53557909 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgcagtggttt 53557810  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53557809 ggtgagggacaaaactatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagttg 53557710  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53557709 ctctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaa 53557676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47958643 - 47958309
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| ||| |||    
T  47958643 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacactacaatacaaggcagaacagcatagaacaaattttttatgtcat 47958544  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  47958543 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggt 47958444  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47958443 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 47958344  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    | |  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47958343 tatactgtccatcgttttttagcaaatcaaacgca 47958309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 41 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 39053058 - 39052715
Alignment:
Q  41 gtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 140  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39053058 gtcttagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaaatgctgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagatagaacaacacatgacaaattttt 39052959  T
Q  141 --atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 238  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  39052958 ttatagcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 39052859  T
Q  239 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 338  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39052858 tggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaacta 39052759  T
Q  339 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39052758 gagttgttttgtcttgtctttcattttttagcaaatcaaacgca 39052715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 83 - 382
Target Start/End: Original strand, 40094411 - 40094711
Alignment:
Q  83 agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg 181  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40094411 agaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatgcgatttttgaggg 40094510  T
Q  182 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40094511 acaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccct 40094610  T
Q  282 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094611 tgcctccagtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 40094710  T
Q  382 a 382  Q
    |    
T  40094711 a 40094711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 49 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25860632 - 25860312
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  25860632 gtgtgtttggtttgcaaaacggtaagcactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacaaaaggcataacaacacaggacaaattttttatggcaa 25860533  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  25860532 tgagtaattttttgttttatacgatttttggagaacaaaatgctatttcggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggt 25860433  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25860432 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 25860333  T
Q  348 tgtcatgtccttcatttttta 368  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  25860332 tgtcaagtccttcatttttta 25860312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 95 - 382
Target Start/End: Original strand, 44116859 - 44117147
Alignment:
Q  95 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 193  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116859 gatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 44116958  T
Q  194 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 293  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44116959 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 44117058  T
Q  294 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44117059 gtcctgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtccagtccttcattttttagcaaatcaaacgca 44117147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25927533 - 25927204
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaa-cagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagt 152  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25927533 ttggtttgcaaaaacaacaagtaccggacaaaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagt 25927434  T
Q  153 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 252  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25927433 gattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgttttggtaaggg 25927334  T
Q  253 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 352  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  25927333 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatttgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagttgttctgtcc 25927234  T
Q  353 tgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25927233 tgtccatcattttttagcaaatcaaacgca 25927204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 42 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4851674 - 4851340
Alignment:
Q  42 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||     
T  4851674 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaagacaggacaaatttttt 4851575  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4851574 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 4851475  T
Q  241 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 340  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4851474 ggttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcctgtcccttgcctccaaattgtcttgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 4851377  T
Q  341 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4851376 gttgttc-----tgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 4851340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 374
Target Start/End: Original strand, 34026554 - 34026867
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  34026554 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggt 34026638  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  34026639 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 34026738  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34026739 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaaatagagttgt 34026838  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaat 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34026839 tctgtcctgtccttcattttttagcaaat 34026867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 55 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3864879 - 3864548
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3864879 ttggtttgcaaaacagtaagtactgcacagaacagtacaagatagaacattacaacataacgcataacagcacaggacaaattttttatggcattgagta 3864780  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3864779 attttttgttttatatgatttttg-gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgaggga 3864681  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  3864680 caaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactaaagttgttctgtcct 3864581  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3864580 gtc--tcattttttagcaaatgaaacgcaccctaa 3864548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50386660 - 50386333
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || | ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  50386660 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaaaaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 50386561  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  50386560 ttttttgttttatacaatttttggggaacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgttgaggcac 50386461  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  50386460 aaaaatatcaatttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcctg 50386361  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50386360 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 50386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 42636559 - 42636273
Alignment:
Q  104 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42636559 gtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttaaacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatt 42636460  T
Q  203 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 302  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42636459 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcctatac 42636360  T
Q  303 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42636359 ctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaag 42636273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 45 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 51925422 - 51925085
Alignment:
Q  45 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 144  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51925422 aagggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggatataacagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttatgg 51925323  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  51925322 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattaaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 51925223  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51925222 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactggagttg 51925123  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51925122 ttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 51925085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Original strand, 5442160 - 5442494
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  5442160 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacagaacagtacaatttagaacagtacaatacaaggtataacaacacatgacaaattttttat 5442259  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  5442260 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttgatattttagacagcttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgat 5442359  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| |||||            || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442360 ttggtgagggacaaaaa-----------ctc-tgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactggacaactagagt 5442447  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5442448 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 5442494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20609846 - 20609544
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  20609846 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgac 20609762  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20609761 attgagtaattttttgttatatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 20609662  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20609661 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 20609562  T
Q  346 tctgtcatgtccttcatt 363  Q
    |||||| |||||||||||    
T  20609561 tctgtcctgtccttcatt 20609544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 136 - 382
Target Start/End: Original strand, 20255007 - 20255252
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  20255007 tttttatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta-gtgggacaagaagttgtg 20255105  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255106 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 20255205  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255206 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 20255252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33364993 - 33364655
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||  | |||| |||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  33364993 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagagagaacaacccaggacaaatttttatg 33364894  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  33364893 acattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtt 33364794  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    || ||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  33364793 tgctgaggggcaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactgaagtt 33364694  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33364693 gttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 33364655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Original strand, 38213227 - 38213562
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||   | ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38213227 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattgtacagaacagtacaagacaaaacaacataacattaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 38213326  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |    
T  38213327 atgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatggtattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttcg 38213426  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38213427 tgagtgacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagattgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 38213526  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38213527 ctatcctgtctttcattttttagcaaataaaacgca 38213562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 48 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22484954 - 22484614
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22484954 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagataggacaacacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttttatggtat 22484855  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||| ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||     
T  22484854 tgaataattttctgtattatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggc 22484755  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
     ||| | ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22484754 aaggaacaaaaattgtagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaatcactggacaattggagttgttc 22484655  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22484654 tgtcctgtccttcattttttatcaaatcaaacgcaccctaa 22484614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3867848 - 3867526
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||||     ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  3867848 ttggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtacaatgcagaacgg-----cacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataa 3867754  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3867753 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttagaaaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3867654  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  3867653 aaaaatttcaggttttgtcatgtctcttgtctccagtatgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcttg 3867554  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3867553 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 3867526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 379
Target Start/End: Original strand, 21373812 - 21374135
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||         |||| |||||||||||||||||    
T  21373812 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacaatacaagacagaacagcacaacacaaga--------cacaggacaaatttttatggca 21373903  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  21373904 ttgaataattttta-ttttatacgatttttggccgaagaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 21374002  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  21374003 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgtt 21374102  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  21374103 atgtcattttcttcattttttagcaaaccaaac 21374135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 48 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26282599 - 26282315
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26282599 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacatgacaaattttttatggca 26282500  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26282499 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttga 26282400  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga---aacagttttacaaatcaaacac 328  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |   || |||||||||||||||||||    
T  26282399 tgagagacaaaaatataagtttttgtcccgtctcttacctccagtttgtcttgtaccttaaataatagttttacaaatcaaacac 26282315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Original strand, 29645946 - 29646270
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || |||| | |||   |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  29645946 ttggtttgcaaaataacaagtattggacagaacaatacaagacaaaacaacacaacataaggtataacatcacaagacaaatttttatggcattaaataa 29646045  T
Q  155 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29646046 tttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 29646145  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |    
T  29646146 caaaaatatatgtttttgtcctatcccttgcctccagtttatcgtgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtctt 29646245  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  29646246 gtccttcattttttagaaaatcaaa 29646270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 130 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 54622925 - 54622678
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54622925 gacaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaa 54622826  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 329  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  54622825 gttgtgttgtggtttcgtgagcgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatttagtttgt-cagtacctgaaacagttttacaaatcaaatacc 54622727  T
Q  330 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54622726 ggacaactgaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 54622678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 59 - 383
Target Start/End: Original strand, 3964173 - 3964497
Alignment:
Q  59 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |  ||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  3964173 tttgcaaaacagtaagtacttgatagaacagcacaagacaacacaacacaatacaaggcagaacagcacaagacaaattttgtatgatattgaataattt 3964272  T
Q  158 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 257  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3964273 tatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaa 3964371  T
Q  258 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 357  Q
    ||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||    
T  3964372 aatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctatcc 3964471  T
Q  358 ttcattttttagcaaatcaaacgcaa 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3964472 ttcattttttatcaaatcaaacgcaa 3964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 145 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49749025 - 49748788
Alignment:
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  49749025 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 49748926  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  49748925 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactaaacaacttgagttg 49748826  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49748825 ttctatcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 49748788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 137 - 382
Target Start/End: Original strand, 51296544 - 51296787
Alignment:
Q  137 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  |||| |||||     
T  51296544 ttttatggtattgagtaattttttgttttatacgattttttggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttaggacaaaaaattgtgt 51296643  T
Q  237 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  51296644 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaat 51296743  T
Q  337 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  51296744 tagagttgttctgttctgtcttt--atttttagcaaatcaaacgca 51296787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 45691112 - 45690778
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||   |||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  45691112 gggtgtgtttgatttacaaaacactaagtactggatagaacagtacaagacagaacaacacaatataagatagaataacacatgacaaatttttatagca 45691013  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||        
T  45691012 ttgaataattttt-gttttatacgatttttggaggacgaaatgcgattttggtattttagacaacttatgcgtgagacaaaaagttgtgctgtggt---- 45690918  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45690917 -gagggagaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttatcctgtacctgaaacagttttgcaaatcaaacactggacaactgaagttgtt 45690819  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    || || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45690818 ctatcctgtccttcactttatagcaaatcaaacgcacccta 45690778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 50678677 - 50679006
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||  | |||||| |||||| || | | || |||||||||||||   ||||| | |    
T  50678677 ttggtttacgaaaccgtaagtactagacataacaatataagatagaatagcacaacataaggtataatatcgcaagacaaatttttatattattgaatta 50678776  T
Q  155 --ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 252  Q
      |||||||||||||| ||||| || || |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  50678777 ttttttttgttttataggatttatgtggaatgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagag 50678876  T
Q  253 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 352  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  50678877 acaaaaatatcagtttttgtcctgttctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttttcaaatcaaacactggacaacttgaattgttatgtct 50678976  T
Q  353 tgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50678977 tgtacttcattttttagcaaatcaaacgca 50679006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3695449 - 3695184
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  3695449 agaacagtacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgggggataaaatactattttg 3695354  T
Q  198 atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||               |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3695353 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaggttgtgatgtggtttggtgag---------------tttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtca 3695269  T
Q  298 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3695268 tgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3695184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 380
Target Start/End: Original strand, 10747088 - 10747406
Alignment:
Q  45 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 144  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | | ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  10747088 aagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtataaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatga 10747187  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||    
T  10747188 cattgaataattttttgttttatacgatttttggggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg------------------tgtggtt 10747269  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    || ||| | | |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  10747270 tgctgacgaacaaaaatatcagtttttgtcctatctcttgtctccagtttgtcctgtacctaaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaatt 10747369  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10747370 gttttgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacg 10747406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 179 - 383
Target Start/End: Original strand, 19906767 - 19906971
Alignment:
Q  179 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 278  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  19906767 gggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtc 19906866  T
Q  279 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||     
T  19906867 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgtccttcattttttaacaaatcaat 19906966  T
Q  379 cgcaa 383  Q
    |||||    
T  19906967 cgcaa 19906971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 382
Target Start/End: Original strand, 24721463 - 24721693
Alignment:
Q  153 aattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 251  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  24721463 aatttcttgttttatatgctttttggggggatgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttgttgagg 24721562  T
Q  252 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 351  Q
     |  ||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24721563 taccaaaattttagtttttgtcctgtcctttacctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtc 24721662  T
Q  352 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24721663 atgtccttcattttttaacaaattaaacgca 24721693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41683075 - 41682930
Alignment:
Q  237 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 336  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683075 tgtggtttgctgagggacaaaagtatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 41682976  T
Q  337 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41682975 tgaagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 41682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 53046846 - 53046667
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  53046846 ttggtttgcaaaacaacaagtactgaacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaattttttatggcattgagta 53046747  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||  |||||||||||||    
T  53046746 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgctg 53046667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 190
Target Start/End: Original strand, 43175436 - 43175585
Alignment:
Q  42 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttt 140  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||  ||||||||||| || ||| |||||    
T  43175436 tctatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtataatacaagacagaacagcacacgataaatttttt 43175535  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43175536 atggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 43175585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 387
Target Start/End: Original strand, 6179376 - 6179639
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||  |||||||||||       |    
T  6179376 agaacaacacaagacgaatttttatggtattgaataattttctttattatatgattttttggtgacgaaatgttatttttgtattttagaca-------c 6179468  T
Q  218 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg-ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 316  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  6179469 gtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggcgaggggacaaaaattacagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgacctgtttctgaaactgtttta 6179568  T
Q  317 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6179569 caaatcaaacactggacaactggagttgttttatcctgtccttcattttttataaaatcaaacgcacccta 6179639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 376
Target Start/End: Original strand, 44000217 - 44000462
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  44000217 gacaaacttttatggtattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaactatttttgtatttcagataacttgtacgtgggacaaaaa 44000316  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 329  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||||||||| ||||||  ||||| || | | ||  |||||||||||||||| ||||||     
T  44000317 attgtgatgtggtttagtgagggaaaaaaaattctgtttttgtcatgtcctttgccttgagtttatcatttcccaaaaacagttttacaaatgaaacacg 44000416  T
Q  330 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatca 376  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44000417 gtacaactagagttgtcatgtcatgtcattca-tttttagcaaatca 44000462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 379
Target Start/End: Original strand, 44267691 - 44267941
Alignment:
Q  123 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggg 222  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  44267691 agcacaagacaaatttttatcgtattcaataattttttgttttatatgatttttggatgacgaaatgctatttttgtattttagacaatttgtatgtggg 44267790  T
Q  223 atgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatc 322  Q
    || ||||||| || |||||||||| |||||| |     || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||    
T  44267791 ataaaaagttatgttgtggtttggcgagggaca-----attattttttgtcatgtcccttacctacagtttgtcatat-cctaaaactgttttacaaatc 44267884  T
Q  323 aaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||  | ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44267885 aaacatcgaacaactgaagttgttcgatcatgtccttcattttttatcaaataaaac 44267941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 288 - 387
Target Start/End: Original strand, 43175589 - 43175688
Alignment:
Q  288 cagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43175589 cagtttgtcctatacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 43175688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 368
Target Start/End: Original strand, 52300439 - 52300633
Alignment:
Q  176 tgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcat 275  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |    
T  52300439 tgagggacgaaatgatattttggtgttttagacaacttgtac-tgggacaaaaaattgcgttgtggtttggtgatggacaaaaatttcagtttttgtcct 52300537  T
Q  276 gtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag---agttgttctgtcatgtccttcatttttta 368  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52300538 gtcccttacctgcagtttgtcccgtctctgaaacagttttatgaatcaaacattggacaacaaccgaagttgttctgtcatgtccttcatttttta 52300633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34351514 - 34351303
Alignment:
Q  113 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 212  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | || || ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34351514 aaggcagaacaacatatgacgaatttttatagtattgaataatttatggtcttgtacgattttttgtggataaaatgttattttgatattttagacaact 34351415  T
Q  213 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 312  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||| ||||  || |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34351414 tgtatgtgcgacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaataatttttgtttttgtcgtgtctatttcctctagtttgtcatgtccctgaaacagt 34351315  T
Q  313 tttacaaatcaa 324  Q
    ||||||||||||    
T  34351314 tttacaaatcaa 34351303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41695042 - 41694925
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  41695042 agaacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttcagtattttagacaacttgtat 41694943  T
Q  218 gtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  41694942 gtgggacaaaaagttgtg 41694925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39215547 - 39215404
Alignment:
Q  181 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 280  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || || | ||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  39215547 gacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattatgatttggttcggtaaggggtaaaaatttcagtttttgtcttgtccc 39215448  T
Q  281 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 324  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39215447 ttacctccggtttgtcctgttcttgaaacagttttacaaatcaa 39215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 278
Target Start/End: Original strand, 25954407 - 25954554
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||| || ||| ||  ||||    
T  25954407 gacaaatttttatgatattgaataattttttattttatacgctttttg-gggacgaaatgttatattagtattttaaacaacttatatgtgagacaaaaa 25954505  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 278  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  25954506 gttgtgctgtaatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcgtgtc 25954554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 382
Target Start/End: Original strand, 8253640 - 8253881
Alignment:
Q  140 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||   || |||||||  ||    
T  8253640 tatggtattgattaatttttaatcttatacaatttttgatgaataaaatgttattttggtattttagacaacttttaattggggcaaagagttgtgtcgt 8253739  T
Q  240 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 339  Q
    ||||| || || || || ||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||| |||| |  ||||||||    
T  8253740 ggtttagt-agagacaagaacttcagtttttatcatgttccttgactccagtttgtcttgtccttgaaacaactttacaaatcgaacattatacaactag 8253838  T
Q  340 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8253839 agttgtcttgtcttatccttcattttttagtagatcaaacgca 8253881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 53046668 - 53046605
Alignment:
Q  262 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 325  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53046668 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaa 53046605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8067210 - 8066939
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||    
T  8067210 acaacacaagacagaccaacacatgacatacttttatggtattgaatgatttttgatcttatatgatttctagtggacaaaaagctattttgatatttta 8067111  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
     | |||||||||||| ||  ||||||||| || || ||| |||| ||| | |||| | |  ||||||| |||| | |||||| |  ||||  ||| ||||    
T  8067110 tataacttgtacgtgtgacaaaaagttgtactatgattttgtgaaggacacaaatttta-attttgtcttgtcacctgcctcaatcttgttttgtccctg 8067012  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  8067011 aaacaattttacaaatcaaatgcggtataactagtgttgttatgtcttgtccctcattttttaacagatcaaa 8066939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 378
Target Start/End: Original strand, 25395570 - 25395818
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||| ||||    
T  25395570 gacaaacttttatgacattgcattattttttgttttatacgatttttagtgaacaaaatgttattttggtattttagacaacttatatttaggataaaaa 25395669  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 328  Q
    ||||   | ||||||  ||||||| || ||| | |||||||||| | |  |||| || |||  ||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||      
T  25395670 gttgcattttggtttaatgagggacaagaatttcagtttttgtcttatgtcttgccccccaacttgtcatgtccctaaaacagttttac-aataaaacga 25395768  T
Q  329 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||||    
T  25395769 tgtacaactggagttgttatatcatgtgatttatttcttagcaaatcaaa 25395818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Original strand, 26847351 - 26847532
Alignment:
Q  199 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||| |||  | ||||| |  ||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||      
T  26847351 tattttagacaacttgtatgtgggacaaaaaagttttgttgtgattttataagggacatgaatttcagtttttgtcctgtctcttgcctccaatttgtta 26847450  T
Q  298 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    | |  || |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26847451 tatcacttaaacagttttacaaattaaacactatacaagtggagttgtcatgtcatatgcttcattttttagcaaatcaaac 26847532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42035824 - 42035652
Alignment:
Q  113 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 212  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||||| || |||   |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42035824 aaggtagaacaacacttgacaaacttttatggtattgaacaattttttctcttatactatgttttgtggacaaaatgctgttttgctattttacacaact 42035725  T
Q  213 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 285  Q
    ||||| |||| ||  ||||||   |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||  |||||||||||    
T  42035724 tgtacttgggttgccaagttgcattgtggtttagtgaaagacaagaatttcagtttttgttgtgtcccttgcc 42035652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14155528 - 14155438
Alignment:
Q  191 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| | || ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14155528 tattttgatattttagacaacttgtacttgagacaaaaagttgtgttatgatttagtgagggat-aaaatttcagtttttgtcatgtccctt 14155438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 32621828 - 32621918
Alignment:
Q  133 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 223  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32621828 aaattgttatgctattgaataattttttgttgtatacaatttttgatggacaacatattattttggtattttagacaacttgtacatggga 32621918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 32768588 - 32768755
Alignment:
Q  170 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 269  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||  |||||||||||| | |||  ||| | | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | | ||||    
T  32768588 gatttttgggtgacaaaaggttattttagtattttagacaaatagtaattggaacggaaagttgtgatgtggtttagtgagggacaataatttcaatttt 32768687  T
Q  270 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctg--tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
    ||||||||| ||||| |   ||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32768688 tgtcatgtctcttgctttttgtttgtcatgtctccctgaaacaattttacaaatcaaacactgtacaa 32768755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17264822 - 17264606
Alignment:
Q  108 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg--gacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| ||  || |||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||  |||||||    
T  17264822 aacataaggtagatcagcacaagacaaaattttatggtactgaataatgtt--gtcttatacaatttttgtggtcgacaaaaa-ctatttttgtatttta 17264726  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
     |||||||||||||||||  |||  || |  |||||||| |||| |||||| ||| | || |||||||||||  ||||| ||| ||||||  |||   ||    
T  17264725 cacaacttgtacgtgggacaaaatttttttatgtggtttagtgaaggataataatttcagcttttgtcatgtatcttgcttcctgtttgttatgtttttg 17264626  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaa 325  Q
     |||||||||||||||||||    
T  17264625 taacagttttacaaatcaaa 17264606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 367
Target Start/End: Original strand, 30258962 - 30259065
Alignment:
Q  264 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 363  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||   ||| |||||||||||    
T  30258962 agtttttgtcttgcccattgcctcgagtttatcctgtctttgaaacaattttacaaatcaaacattgtataactagggttgtcgcgtcttgtccttcatt 30259061  T
Q  364 tttt 367  Q
    ||||    
T  30259062 tttt 30259065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 91
Target Start/End: Original strand, 20254945 - 20254991
Alignment:
Q  45 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20254945 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 20254991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 249
Target Start/End: Original strand, 23322158 - 23322216
Alignment:
Q  191 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23322158 tattttgatatattagacaacttgtacgagagataaaaagttgtgttgtggtttagtga 23322216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41538225 - 41538131
Alignment:
Q  123 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta-ttttgatattttagacaacttgta 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  41538225 agcacatgataaacttttatgatattgaatgatttttgattttatacgattttttatggacaaaatactatttttgacattttaaacaacttgta 41538131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 54964095 - 54963985
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| || | ||| || ||||  ||||||||||||||     
T  54964095 agggtatgtttggtttgcaaaatagtacgtactggacataacagtataagataggacaccataacataaagcagagcaacacaaaacaaatttttatggt 54963996  T
Q  146 attgagtaatt 156  Q
    ||||| |||||    
T  54963995 attgaataatt 54963985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3695485 - 3695441
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3695485 gggtgtgtttggtttgcaaaaatgtaagtactggacagaacagta 3695441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28625060 - 28625001
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg 177  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28625060 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataattttttgtcttataagatttttg 28625001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 53046560 - 53046517
Alignment:
Q  262 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53046560 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctg 53046517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8165883 - 8165833
Alignment:
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  8165883 ttttttgttttatactatgtttgatggacaaaatgttagtttgatatttta 8165833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8025967 - 8025895
Alignment:
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  8025967 aaacagttttacatatcaaccgctgtacaacttgaattgttcgatcatatcctttattttttagcagatcaaa 8025895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42547511 - 42547463
Alignment:
Q  111 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  42547511 acaaggtagaacaacacatgacaaacttttatgatattgaataattttt 42547463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Original strand, 34338681 - 34339022
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34338681 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggc 34338780  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34338781 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 34338880  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338881 gtgagggtcaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34338980  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34338981 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 34339022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 58 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9733138 - 9732813
Alignment:
Q  58 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 156  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9733138 gtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcattgaataatt 9733039  T
Q  157 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9733038 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 9732939  T
Q  257 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9732938 aaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 9732839  T
Q  357 cttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  9732838 cttcattttttaacaaatcaaacgca 9732813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 45 - 382
Target Start/End: Original strand, 18685705 - 18686043
Alignment:
Q  45 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatg 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18685705 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatg 18685804  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18685805 gcattgagtaattttttgttttataggatttttgagggacaaaatgttattttaatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtt 18685904  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685905 tggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 18686004  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18686005 attctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 18686043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 32497785 - 32498122
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32497785 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 32497884  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32497885 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 32497984  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32497985 ggtgaggtacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 32498084  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32498085 ttctgccatgcccttcattttttagcaaatcaaacgca 32498122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 378
Target Start/End: Original strand, 35114656 - 35114988
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35114656 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggc 35114755  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  35114756 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 35114855  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35114856 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagttgt 35114955  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35114956 cctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaa 35114988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 17540588 - 17540922
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17540588 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacatattttttatggcatt 17540687  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17540688 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactatttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 17540787  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17540788 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttc 17540887  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  17540888 tgtcatatctttcattttttaacaaatcaaacgca 17540922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2645308 - 2644970
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  2645308 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacttgatagaacagtataagatagaacagtacaacataaggcagaacagcactggacaaattttttat 2645209  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  2645208 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2645109  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645108 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctct-ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 2645010  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645009 tgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2644970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 44 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5279056 - 5278720
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5279056 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 5278957  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  5278956 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgctgtggt 5278857  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  5278856 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacctaacaattagagt 5278757  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5278756 tgttctgtcatatcctt-attttttagcaaatcaaacg 5278720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 47 - 379
Target Start/End: Original strand, 33366481 - 33366814
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33366481 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggc 33366580  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  33366581 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttg 33366680  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33366681 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagaattgt 33366780  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33366781 tctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 33366814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30326550 - 30326215
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||     
T  30326550 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaccgtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatgga 30326451  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30326450 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 30326351  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    | ||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30326350 gcgagagacaaaa-tatgagtttttgtcctgtcccctgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgc 30326252  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326251 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 30326215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 44284508 - 44284836
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44284508 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaac--------acaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggc 44284599  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  44284600 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgttattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggttta 44284699  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  44284700 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactctagttgt 44284799  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44284800 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 44284836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 37308527 - 37308863
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37308527 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 37308626  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  37308627 attgagtaatttttttgttt-tacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 37308725  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37308726 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37308825  T
Q  346 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37308826 tctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 37308863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 72 - 389
Target Start/End: Original strand, 7258792 - 7259111
Alignment:
Q  72 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7258792 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttataca 7258891  T
Q  171 atttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 269  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7258892 atttttgagggacaaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 7258991  T
Q  270 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttag 369  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7258992 tgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacagctagagttgttctgtcatgtccttcattttttaa 7259091  T
Q  370 caaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  7259092 caaatcaaacgcagcctaag 7259111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30798703 - 30798372
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30798703 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagta--acataagacagaacagcacatgacaaattttgtatggtatt 30798606  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30798605 tagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtg 30798506  T
Q  249 agggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798505 agggacaaaaatatgagttttttttcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 30798406  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30798405 tgtc-tgcccttcattttttagcaaatcaaacgca 30798372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19513906 - 19513571
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| | |||  ||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  19513906 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggataaaacagtacaagatagaacagtacaatagaagacagaacagcacgggacaaattttttatggtat 19513807  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19513806 tgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 19513707  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19513706 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctcccgtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggaaaactagagttgttc 19513607  T
Q  348 tgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19513606 tgtcctgtccttcatttttttagcaaatgaaacgca 19513571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 365
Target Start/End: Original strand, 42706231 - 42706549
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42706231 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagcacttgacataacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcat 42706330  T
Q  148 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  42706331 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 42706430  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42706431 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgtt 42706530  T
Q  347 ctgtcatgtccttcatttt 365  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  42706531 ctgtcctgtcctttatttt 42706549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 44 - 360
Target Start/End: Original strand, 16104142 - 16104459
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 142  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||    
T  16104142 taagggtgtatttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagggcaaattttttat 16104241  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16104242 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 16104341  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16104342 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcgtgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagt 16104441  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttc 360  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  16104442 tgttctgtcctatccttc 16104459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 33889128 - 33889450
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33889128 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacataacaaattttttatgg 33889212  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33889213 tattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 33889312  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33889313 ggtgagggaaaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagttg 33889412  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33889413 ttctgtcctgtccttcattttttagtaaatcaaacgca 33889450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 49 - 379
Target Start/End: Original strand, 39461187 - 39461518
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39461187 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 39461286  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttg---tgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||   || |||| |||    
T  39461287 tgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacagcttgtacgtgagataaaaagttgtgttgttgtgattt 39461386  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| |||||    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39461387 ggtgagggacaaaaa---caatttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 39461483  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39461484 ttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 39461518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 136 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 7761702 - 7761451
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7761702 tttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtg 7761603  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761602 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 7761503  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7761502 ctagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 7761451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 40692176 - 40692504
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40692176 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatactagacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggc 40692275  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40692276 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgttctgtggtttg 40692367  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40692368 gtgagggacaaaaatacgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcttgtacctaaaacagtttcacaaattaaacactggacaactagagttgt 40692467  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40692468 tctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 40692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 55 - 388
Target Start/End: Original strand, 42365456 - 42365790
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  42365456 ttggtttgcaaaacagtaagtattggaaaaaacaacataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggcattgagta 42365555  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  42365556 attttttgttttatatgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtccgtgatataaaaagttgtgttgtggtttgatgaagga 42365655  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42365656 caaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactagacaactagagttgttatgtcat 42365755  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42365756 gtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 42365790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 2085946 - 2086269
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2085946 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgccatt 2086045  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||      
T  2086046 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatttcagacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtactgtggtttgggt 2086145  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2086146 agggacaaaaatatgagtttttg---------ttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg-tct 2086235  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086236 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2086269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3913679 - 3913343
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||    
T  3913679 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatacttgatagaacagtataagacagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggataaatttttatggc 3913580  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  3913579 attgaataatattttgttttatacgatttttggggagcaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttg 3913480  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3913479 gtgagggacaaacatgtgagtttttgtcctgtttcttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgt 3913380  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3913379 tttgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 3913343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28824762 - 28824440
Alignment:
Q  60 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  28824762 ttgcaaaacagtaagtactggactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaatacatgacaaatttttatgacatggaataaatttt 28824663  T
Q  160 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28824662 tgttttatacaatttttggggtgcgaaatgctattttagtattttagacaacttgcacgtgagataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaa 28824563  T
Q  260 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 359  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28824562 tatgagtttttgtcctgacccttgactccagtatgtgctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatgtcctt 28824463  T
Q  360 cattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28824462 cattttttagcaaatcaaacgca 28824440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16178100 - 16177769
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  16178100 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtgcaagacatatcaacacaacacaagatagaacaacacacgacaaatttttatagc 16178001  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  16178000 attgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacgaaattccattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 16177903  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    || || || |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16177902 gtaagcgacaaaaatatcagtttatgtcctgtccattgcctccagtttatcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 16177803  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16177802 tatgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 16177769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 367
Target Start/End: Original strand, 4641387 - 4641706
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||  |    
T  4641387 gggtgtgtttgctttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtaaaatatagaacagtacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatacc 4641486  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  4641487 attgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 4641586  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||   |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4641587 gtgagagacaaaaatatgaatttttgttccgtccc--acctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgt 4641684  T
Q  346 tctgtcatgtccttcatttttt 367  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  4641685 tctgtcttttccttcatttttt 4641706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 6896040 - 6896375
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||   ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  6896040 agggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtacta-acagaacagtataatgcagaacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggt 6896138  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  6896139 attgaataatttcttgttttatatgccttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgttgtttg 6896238  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6896239 gtgagggacaaaaatttcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 6896338  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6896339 tctgtcctgtctttcattttttaacaaatcaaacgca 6896375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 112 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32766658 - 32766387
Alignment:
Q  112 caaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 211  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32766658 caagggagaacaacacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaac 32766559  T
Q  212 ttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 310  Q
     ||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32766558 ctgtacgtaggacaaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaaca 32766459  T
Q  311 gttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32766458 gttttacaaatcaaacactggacaattatagttgttctgttctgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 32766387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40832692 - 40832360
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagta---agtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40832692 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtagtaagtattagacagaatagtacaagatagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttata 40832593  T
Q  144 gcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
      ||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  40832592 ttattgaattattatttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtattttagactacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtgg 40832493  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40832492 tttggtgagggacaaaaatatccgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaatagctttacaaatcaaacactggacaacttaag 40832393  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaat 374  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  40832392 ttgttatgtcatgtgcttccttttttagcaaat 40832360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38993284 - 38992954
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||   |||| |||    
T  38993284 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacaatataagataggacagcacaacataaggcagaacaacacaagacaaatt---atggtatt 38993188  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    || ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |    
T  38993187 gaataattttctgtattatattatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgacg 38993088  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||| | ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38993087 aggaacaaaaattgtagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctcttcctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttattct 38992988  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38992987 gtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgca 38992954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10400084 - 10399756
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||| | |||   |||||| ||||     |||||||||| |||||||||||||    
T  10400084 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtgagtactgaacacaatagtacaagacaaaacatcacaacataagg-----cagcacatgataaatttttatggc 10399990  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||     
T  10399989 attgaataattttttgttttatacgacttttgggggacaaaatgctattttggatttttagacaacttatacatgagacaaaaagttgtgttgtggttta 10399890  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  10399889 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtatcttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgt 10399790  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399789 tctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10399756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 145 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12672594 - 12672373
Alignment:
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  12672594 cattgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgggataaaaacttgtgttgtggttt 12672495  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12672494 ggtgagggacaaaaatatgagattttgtcccgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacacaggacaactagagttg 12672395  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagc 370  Q
     |||    ||||||||||||||||||    
T  12672394 ctct----tgtccttcattttttagc 12672373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37004089 - 37003856
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaattttt-atg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||    
T  37004089 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtaaaacagcacaaggacaaattttttatg 37003990  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  37003989 gcattgaataattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 37003890  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgt 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37003889 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgt 37003856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 383
Target Start/End: Original strand, 30712732 - 30713068
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 149  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||   ||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  30712732 tgtgtttggtttgtaaaaaagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacaacacaacacagcgcataacagcaaaggacaaatttttatggtattg 30712831  T
Q  150 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt----tg 245  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    ||    
T  30712832 aataattttttgttttatatgatttttg-gggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttctacgtgggataaaaagttgtgttgtggttaatttg 30712930  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30712931 gtgagggacaaaaatttcagtttgtgtcctgtcccttgcctccaggttgttctgtccctgaaacagtattacaaatcaaacactggataactggagttgt 30713030  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 383  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30713031 tttgtcatgtctttcattttttaacaaatcaaacgcaa 30713068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 379
Target Start/End: Original strand, 11114752 - 11115074
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  | | || |||||||||||||||||| |||    
T  11114752 ttggtttgcaaaacagtaagtactaaacataattgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaacaatataagaaaaatttttatggcattgaataa 11114851  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  11114852 tttttcgttttatacgattgttagcggacgaaatactattttggaattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggaac 11114951  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||    
T  11114952 aaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaactg-aacag-tttacaaatcaaacattggacaattggagttgttttgtcctg 11115049  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11115050 tccttcattttttagcaaatcaaac 11115074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 289
Target Start/End: Original strand, 26418793 - 26419037
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26418793 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatttgacagaacagtgcaagacagaacagcacaacgcaaggcagaacaacacatgacaaaaattttatgg 26418892  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26418893 caatgagtaattttttgttttatacaatttttgggggataaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 26418992  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 289  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26418993 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcatgtccctcgcctcca 26419037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 13829318 - 13829633
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||   ||||| | ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||    
T  13829318 ttggtttgcaaaacagtaattattggacaaaacagtacaaagcagaacagcacaacacaaggcagaacatcacagaacaaatttttatgatattgaataa 13829417  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||| | |||| |||     
T  13829418 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaaatgatattttggtgttttagataacttgtacctgggacaaaaagttgtgatgtggtctagtgatggac 13829517  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||            |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13829518 aaaaatttcagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcct------------gtttcacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 13829605  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13829606 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 13829633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 55 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27463010 - 27462684
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||  || | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27463010 ttggtttgcaaaacagcaagtattggataaaacagtgcaaaacagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttatatgacattgaataa 27462911  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||||  |||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  27462910 ttttttgtttt-tacgatttttagggcacgaaatgctattttggtatttttgacaatatgtatg-gtgataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 27462813  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||  || ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | || ||    
T  27462812 aaaaataacagcttttgtcttgtcccttgtctacagtttgtcatgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttatatcctg 27462713  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 383  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  27462712 tctttcatcttttaaaaaatcaaacgcaa 27462684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 379
Target Start/End: Original strand, 8112189 - 8112505
Alignment:
Q  59 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||        | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8112189 tttgcaaaacagtaagtactcgacggaacaatataagatagaacaatacaacacaa--------atcacatgacaaattttgtatgacattgagtaattt 8112280  T
Q  158 tttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatatttt-agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||| |||| | |||||  ||| |  |||||||||| |||||||||||||| || |    
T  8112281 tttgttttatacgatttttaagggaaaaaaatgttattttggtatttttagactatttgtatctggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagaca 8112380  T
Q  256 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca-ctggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||    
T  8112381 aaaatatgagtttttgtattgtctcttgcctccagtttgttctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacaccttgacaactagagtagtattgtcatg 8112480  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    | ||| || |||||| |||||||||    
T  8112481 ttctttatcttttagtaaatcaaac 8112505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26981912 - 26981606
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-- 140  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  26981912 ctaagggggtgtttggtttgcaag-caataagtactggacagaacagtacaagacaaaacagcacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttt 26981814  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||| || ||||    
T  26981813 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgg--------------------tattttagacaacttgtacgtagaacaaaaagttttgttgtg 26981734  T
Q  241 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26981733 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcatttgcctcccgtttgtcttgtatctggaacagttttacaaatcaaacactggacaactgga 26981634  T
Q  341 gttgttctgtcatgtccttcatttttta 368  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26981633 gttgttctgttctgtccttcatttttta 26981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 273
Target Start/End: Original strand, 9717113 - 9717322
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||              |||||||||||||||    
T  9717113 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacga--ta--------------aaatttttatggcat 9717196  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9717197 tgggtaattttttgtttgatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 9717296  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtc 273  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9717297 gagggacaaaaacatgagtttttgtc 9717322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12939474 - 12939202
Alignment:
Q  93 aagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 190  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||  |||||| || |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  12939474 aagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttaataacattgaatattgttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgt 12939375  T
Q  191 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 290  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12939374 tattttggtatcttagacaacttgtacgtgagataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcccttgcctccag 12939275  T
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
                      |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12939274 ------------------cagttttataaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttatccttcattttttagtaaatcaaacgc 12939202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18793478 - 18793306
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  18793478 gtgtgtttggtttgcaaaataataagtactggacaaaacagtataaaatagaacagtacaacataaggtagaacatcacaagacaaattttttatgggat 18793379  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18793378 tgagtaattttttgttttatacaatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtg 18793306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38623365 - 38623190
Alignment:
Q  204 tagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  38623365 tagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttttccattgcctcaagtttgtcctgtccc 38623266  T
Q  304 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38623265 tgaaacagttttacaaatcaaacattggataactgaagttgttatgtcatgtccttcaatttttaacaaatcaaac 38623190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 256 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18793300 - 18793180
Alignment:
Q  256 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18793300 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc--tttgtactgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgagcaactagagttgttctgtcatgt 18793203  T
Q  356 ccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18793202 ccttcattttttagcaaatcaaa 18793180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 282 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 37863349 - 37863242
Alignment:
Q  282 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37863349 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaagcgc 37863250  T
Q  382 aacctaag 389  Q
    | ||||||    
T  37863249 accctaag 37863242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 41366189 - 41365993
Alignment:
Q  186 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 285  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | || ||||||    
T  41366189 aatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatctcttgcc 41366090  T
Q  286 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  41366089 tccagtttgtcatgtccctgaaactgtttcacaaatcaaacattgcacaattggagttgttctatcttgtttttcagtttttagcaaatcaaacgca 41365993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 45463256 - 45463005
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  45463256 agaacaacacatgacaaatttttattgcattaaataattttttgttttatacgatttctg-gggacgaaatgttattttgatattttagacaatctgtac 45463158  T
Q  218 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttac 317  Q
    ||  ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||             |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  45463157 gtatgacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagtgacaaaaat-------------atgtctattgcctcctgtttgtcttgtacctgaagcagttttac 45463071  T
Q  318 aaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt-tttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||   || |||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  45463070 aaatcaaatgttgaacaactggagttgttatgtcatctctttcatttgtttaacaaatcaaacgca 45463005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 278
Target Start/End: Original strand, 1247049 - 1247250
Alignment:
Q  69 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 168  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||| |||||   ||||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1247049 agtaagtagttgacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaagcagtacagtacaagacaaatttttatggcattgaataattttttattttata 1247148  T
Q  169 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 268  Q
    ||||||||| || || ||||||        |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1247149 cgatttttggggaacgaaatgc--------tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagatt 1247240  T
Q  269 ttgtcatgtc 278  Q
    ||||| ||||    
T  1247241 ttgtcctgtc 1247250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 291 - 382
Target Start/End: Original strand, 9717317 - 9717408
Alignment:
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717317 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 9717408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 378
Target Start/End: Original strand, 41934465 - 41934785
Alignment:
Q  59 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 158  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||   |||||||||| || || | | ||| ||||||||||| || ||||| | |||||    
T  41934465 tttgcaaaacagtaagtaccgtataacacagtacaagatagaacaacacaacacaagataaaataacgcataacaaatttttacggtattgaatgatttt 41934564  T
Q  159 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 258  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||| |||| | | || |    
T  41934565 atgtcttatatgatttttggtggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaagtacaaga 41934664  T
Q  259 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag-ttgttctgtcatgtcc 357  Q
    || | |||||||||| ||||  |||| |||||||| ||   | ||| || ||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||  | |||||| |    
T  41934665 atttcagtttttgtcttgtcttttgcatccagtttatctcatcccttaatcagttttacaaatcacacactatacaacttgagtttgtcatatcatgttc 41934764  T
Q  358 ttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  41934765 ttcattttttaacaaatcaaa 41934785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 250
Target Start/End: Original strand, 20907468 - 20907664
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||| | | ||||||||| |||| |||||     ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20907468 gtgtgtttggtttgcaaaatagcaggtaccgtatagaacagtacaagaaagaac-----aacacaagggagaacaacatatgacaaatttttatgtcatt 20907562  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| |||| |||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  20907563 gaataattttttgttttgtacgatttttgggggataaaatgttattttagtattttatacaatttgtacataggacaaaaaattgttctgtggtttggtg 20907662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 298 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37003858 - 37003774
Alignment:
Q  298 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37003858 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaacttgagttgttatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 37003774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35473160 - 35472967
Alignment:
Q  105 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 204  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||| | |||||||| || |||||| | |||| | |||||||| | |||| || ||||||    
T  35473160 tacaatacaagttagaacaacatatgacaaattttgatggtattaaataatttttggtcttatacaaatttttatggacaaaaggatattatggtatttt 35473061  T
Q  205 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 298  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  35473060 agacaacttgtacgtgggacaaaaaattgcagagtggtttagtgaggaataagaatttcagtttttgacttgtcccttgcctccaatttgtcct 35472967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 278
Target Start/End: Original strand, 37088218 - 37088376
Alignment:
Q  120 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 219  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  |    
T  37088218 aacagcacaagacaaatttgtatggtattgaacaattttgtgtcttatccgatgtttgatggacaaaatgctattttggtattttaaacatcatgtattt 37088317  T
Q  220 gggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 278  Q
     |||||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  37088318 aggatgaaaagatgtgttgtggcttagtgagggacaagaatttcagtttttgtcttgtc 37088376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40876697 - 40876554
Alignment:
Q  191 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 290  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  40876697 tattttggtatattaaacaatttgtacttgg-atgaaaagttgtgttgtggtttaatgaaagataaaaatttgagcttttgtcatgtcccttacctccgg 40876599  T
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
    | |||| ||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40876598 tgtgtcatgtccttaaaatagttttacaaatcaaacattggacaa 40876554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12672674 - 12672596
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12672674 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactagacataa-aatataagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 12672596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15303306 - 15303180
Alignment:
Q  199 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 298  Q
    |||||||||||||||  | |||| |  |||||||||| ||| ||||| | | ||| |||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15303306 tattttagacaacttacatgtggaacaaaaagttgtgatgtagtttgataaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtgtcttgcctctagtttgtcct 15303207  T
Q  299 gtacctgaaacagttttacaaatcaaa 325  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15303206 gtctctgaagcagttttacaaatcaaa 15303180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 329
Target Start/End: Original strand, 26796173 - 26796382
Alignment:
Q  119 gaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 218  Q
    ||||| |||| |||||| | || ||| |||||||| ||||   | ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26796173 gaacaacacaagacaaactattctggtattgagtatttttggctcttatatgatttttggtggacaaaagactatttgg-tattttagacaacttgtacg 26796271  T
Q  219 tgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaca 318  Q
    || ||  |||||||| | |||| ||| |||||||| | |||| | | ||||| || | ||| ||||||  |||||||  ||| | || ||||||||||||    
T  26796272 tgtgacaaaaagttgcgttgtgctttagtgagggacacaaattttaatttttatcctatccattgcctgaagtttgttttgtccttgtaacagttttaca 26796371  T
Q  319 aatcaaacact 329  Q
    |||||||||||    
T  26796372 aatcaaacact 26796382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 379
Target Start/End: Original strand, 83374 - 83474
Alignment:
Q  279 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  83374 ccttacctctagtttgtcatgtcccacaaacagttttacaaatcaaacactgtgcaactgaagttgtcttgtcatgtccttcgttttttaacagatcaaa 83473  T
Q  379 c 379  Q
    |    
T  83474 c 83474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13249545 - 13249421
Alignment:
Q  120 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 219  Q
    |||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13249545 aacaacacaagacacatttttaagacattgaataattttttattatattctatatttgatggacaaaagtctattttgatattttaaacaacttgtactt 13249446  T
Q  220 gggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
     |||  |||| ||||| ||||||||    
T  13249445 tggacaaaaaattgtgttgtggttt 13249421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 379
Target Start/End: Original strand, 18278926 - 18279104
Alignment:
Q  199 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 298  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||||||  ||| ||| |||||| | |||||| | |||||||||   |||| ||| |||||||||||| |    
T  18278926 tattttatacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgacgtgatttagtgaggaacaaaaattttagtttttgtgccgtcctttgtctccagtttgtctt 18279025  T
Q  299 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | ||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18279026 gtccctaaaaca-ttttataaatcaaacattgcacaacta-aattgtcatgtcctgtccttaattttttagcagatcaaac 18279104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6453315 - 6453249
Alignment:
Q  264 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 330  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6453315 agtttttgtcttgtcccttacctccggtttatcctgtccctgaaacaattttaaaaatcaaacactg 6453249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16062178 - 16061980
Alignment:
Q  180 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 278  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||   || ||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||    
T  16062178 ggacaaaatgttattttgtcattttagacaa-ttgtatgtgggacaaaaaagttgtatcgtagtttgatgagggacaagaatttatgtttttgtcatatc 16062080  T
Q  279 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||| || ||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  || | | || || |||||| |||||||||||    
T  16062079 ccttaccaccaatttattttgtgtctg-aacagttttacaaatcaaaaactgtacaacttgagttgtcttgacctatcttttatttttgagcaaatcaaa 16061981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 382
Target Start/End: Original strand, 26419045 - 26419089
Alignment:
Q  339 gagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26419045 gagttgttatgtcatgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 26419089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38786647 - 38786503
Alignment:
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||  | ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||||| | ||||||     
T  38786647 attgaataatttttggtgttctacgattttgtacggacaaaagtctattttcatattt-agacaacttatacgtgagacaaaatgttgtgttttggttta 38786549  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 293  Q
    ||||| ||  ||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  38786548 gtgagaga--aaaatttcagtttttatcttgtccattgcctccagttt 38786503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 347 - 382
Target Start/End: Original strand, 1247257 - 1247292
Alignment:
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1247257 ctgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 1247292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 210
Target Start/End: Original strand, 31148786 - 31148844
Alignment:
Q  152 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  31148786 taattttttgttttatacaatttgtgttggataaaaaactattttgatattttagacaa 31148844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31194023 - 31193954
Alignment:
Q  310 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  31194023 agttttacaaatcaaacattatacaactgaagttgttatgttttatccttcattttttagcatatcaaac 31193954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12217706 - 12217650
Alignment:
Q  264 agtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 319  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  12217706 agtttttgtcatgtctcttgtcccccagtttgccctgtccctgtaacagttttacaa 12217650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 116)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Original strand, 23521751 - 23522090
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  23521751 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 23521850  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23521851 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 23521950  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521951 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 23522050  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522051 tgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 23522090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 44 - 388
Target Start/End: Original strand, 24002209 - 24002555
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat- 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  24002209 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttttt 24002308  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24002309 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 24002408  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002409 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagag 24002508  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24002509 ttgttctgtactgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 24002555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Original strand, 56154494 - 56154837
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  56154494 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 56154593  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56154594 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 56154693  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56154694 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttg 56154793  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56154794 ttctgtcctaaccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 56154837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29785750 - 29785412
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29785750 agggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactgaacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 29785651  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  29785650 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagctgtgttgtggttt 29785551  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29785550 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 29785451  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29785450 ttctgtcatgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 29785412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38486465 - 38486133
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |     ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38486465 agggtgtgtttcgtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtgcaagatagaacag-----cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 38486371  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  38486370 cgttgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgttagacaaaaagttgtgctgtggttt 38486271  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486270 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 38486171  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486170 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 38486133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20802743 - 20802407
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20802743 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 20802644  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  20802643 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 20802544  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20802543 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactaaagttgt 20802444  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20802443 tctgtcctatccttcattttttaacaaatcaaacgca 20802407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49152311 - 49151976
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49152311 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 49152212  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49152211 attgagtaattttttgttttatacgatttttgatggacaaaatgttattttggt-ttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttg 49152113  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  49152112 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcgtgtcccttgcatccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggataactaaagttgt 49152013  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152012 tctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 49151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 55065536 - 55065209
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55065536 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtataagataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgagtaa 55065437  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  55065436 ttttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 55065337  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  55065336 aaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaataactagagttgttctgtcat 55065237  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55065236 gtcctt-attttttagcaaattaaacgca 55065209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Original strand, 12600761 - 12601096
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12600761 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacttgacaaattttttatggca 12600860  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||     
T  12600861 ttgagtagttttttgttttaaacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttga 12600960  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12600961 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 12601060  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12601061 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 12601096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 21579900 - 21580235
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||     
T  21579900 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggt 21579999  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  21580000 attgagtaatttttagttttatacgatttttgagggacaacatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttg 21580099  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21580100 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaattagaattgt 21580199  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21580200 tctgtcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgca 21580235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 46 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 33177245 - 33176910
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||    
T  33177245 agggtgtgcttggtttgcaaaacggtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacaagacagaacaacaaaggacaaatattttatgg 33177146  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33177145 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 33177046  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33177045 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 33176946  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33176945 ttctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaacg 33176910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 52319200 - 52319538
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  52319200 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 52319299  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52319300 attgagtaattt---gttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgacattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 52319396  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt--- 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  52319397 gtgagggacaaaaatatgagttttcgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 52319496  T
Q  343 --tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52319497 tctgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 52319538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9512553 - 9512216
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  || ||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9512553 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtacgtgacagaacagtacaagatagaatagtgcaacaaaagacagaatagcacatgacaaattttttatgg 9512454  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9512453 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 9512354  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9512353 ggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgttacttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 9512254  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9512253 ttctatcatgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 9512216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 366
Target Start/End: Original strand, 37865627 - 37865947
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  37865627 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaatttttttatggc 37865726  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  37865727 attgaataattttttgttttatacgatttctgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtgatttg 37865826  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865827 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtctcttgcctccagattgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37865926  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttt 366  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  37865927 tatgtcgtgtccttcattttt 37865947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 55593759 - 55594096
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggac---agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||  ||||||||| ||||||    
T  55593759 tgtgtttggtttgtaaatcagtaagtactggacgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaatgcaaaacaaattttttatggc 55593858  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55593859 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttg 55593958  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55593959 gtgagggactaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgt 55594058  T
Q  346 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  55594059 tctgtcctgttcttcatttttttagcaaatcaaacgca 55594096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 359
Target Start/End: Original strand, 21202614 - 21202926
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21202614 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacaaaacagtacaagacagaacagcacaacacaaaacagaacagcacatgacaaattttttatggc 21202713  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21202714 aatgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 21202812  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202813 gtgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 21202912  T
Q  346 tctgtcatgtcctt 359  Q
    |||||| |||||||    
T  21202913 tctgtcctgtcctt 21202926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 36743901 - 36743565
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36743901 agggtgtgtttggtttgaaaaatagtaagtactagatagaacggtacaagatagaataatacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatgg 36743802  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  36743801 cattgagtaatttgttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagttt 36743702  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36743701 ggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaattcaaacactgaacaactagagttg 36743602  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36743601 ttttgttatatccttcat-ttttagcaaatcaaacgca 36743565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50178696 - 50178368
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50178696 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacatcacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50178597  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  50178596 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggca 50178497  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  50178496 caaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 50178397  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50178396 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50178368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 6776460 - 6776788
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6776460 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 6776553  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  6776554 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 6776653  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776654 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 6776753  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776754 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6776788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33553003 - 33552708
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33553003 agaacagtacaacacaaggcaaaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 33552904  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  33552903 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtc 33552804  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33552803 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcacccttagaat 33552708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 52949604 - 52949930
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  52949604 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 52949703  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||     
T  52949704 tttt-tgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggac 52949802  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  52949803 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacactggacaactagagttgttttgtcgtg 52949902  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  52949903 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 52949930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 63 - 382
Target Start/End: Original strand, 54542881 - 54543198
Alignment:
Q  63 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  54542881 caaaacagtaagtacta-acagaatagtacaggatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaagacaaattttttatgtcattgagtaattttttg 54542979  T
Q  162 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54542980 ttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaagttgtgctatggtttggtgagggacaaaaata 54543078  T
Q  262 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54543079 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacttgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgt-cttca 54543177  T
Q  362 ttttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54543178 ttttttagcaaatcaaacgca 54543198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 1231236 - 1231521
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1231236 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaagataaattttttatggcattatgtaatattttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 1231335  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  1231336 gatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttttgtgagggacaaaaatatgagtttttgtccagtctcttgcctccagtttatc 1231435  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1231436 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 1231521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 44 - 379
Target Start/End: Original strand, 20694247 - 20694578
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20694247 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaatggatagaacagtacaagatagaac-----aacacaaggcagaatagcacatgacaaattttgtat 20694341  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  20694342 ggcaatgagtaattttttgttttatataatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgttggacaaaaagttgcgttgtggt 20694441  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20694442 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgccttcagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagt 20694541  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20694542 tgttctgtgttgtccttcagtttttagcaaatcaaac 20694578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 110 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2725281 - 2725011
Alignment:
Q  110 cacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 208  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2725281 cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac 2725182  T
Q  209 aacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaa 308  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2725181 aacttgtacgtgg-acaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaa 2725083  T
Q  309 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725082 gagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 2725011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Original strand, 36885817 - 36886142
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||    
T  36885817 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcgagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatg 36885902  T
Q  144 gcattgagt-aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36885903 gcattgagttaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttaggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggt 36886002  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36886003 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 36886102  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36886103 tgttttgtcttgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 36886142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 85 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 20518196 - 20517890
Alignment:
Q  85 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 183  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20518196 aacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatagaatttttgagggac 20518097  T
Q  184 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20518096 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaagaagttatgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgactttttgtcctgtctcttg 20517997  T
Q  284 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20517996 cctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 20517897  T
Q  383 acctaag 389  Q
     ||||||    
T  20517896 ccctaag 20517890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 98 - 378
Target Start/End: Original strand, 24210243 - 24210525
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 195  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24210243 agaacgatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattt 24210342  T
Q  196 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 295  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24210343 tggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaataatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgt 24210442  T
Q  296 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  24210443 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaattagagttgttccgtcctatctttcattttttagcaaatcaaa 24210525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 59 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44649361 - 44649040
Alignment:
Q  59 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 158  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  44649361 tttgcaaaacggcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacaacacatgacaaattttgatgacattgaataatttt 44649262  T
Q  159 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 258  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  44649261 --gttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaa 44649164  T
Q  259 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 358  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  44649163 atatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaaactggataactggagttgttctgtcctgtcct 44649064  T
Q  359 tcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44649063 tcattttttagcaaatcaaacgca 44649040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 118 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50728054 - 50727789
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 216  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50728054 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50727955  T
Q  217 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 316  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50727954 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50727855  T
Q  317 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50727854 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50727789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 118 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50736068 - 50735803
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 216  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50736068 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50735969  T
Q  217 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 316  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50735968 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50735869  T
Q  317 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50735868 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50735803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 9807030 - 9807365
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9807030 agggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggc 9807129  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  9807130 attgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttg 9807229  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9807230 gtga-ggacaaaaagttgagtttttgtcctgtccattgcatctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 9807328  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
     ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9807329 cctgtcctatccttcatgttttagcaaatcaaacgca 9807365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 42869859 - 42870181
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaagg-tagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||         || |||||||||||||    
T  42869859 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactcgacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggatagaaca---------aattttttatggcatt 42869949  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  42869950 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggac---aagttgtgctgtggtttggt 42870046  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  42870047 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcccccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgtta 42870146  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42870147 tgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgca 42870181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44324494 - 44324218
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  44324494 acaacataaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 44324395  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44324394 aacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcccgtcttttgcctctagtttgtcctgtacctg 44324295  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44324294 aaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 44324218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 111 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 46680658 - 46680386
Alignment:
Q  111 acaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 209  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46680658 acaagatagaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttttagggacaaaatgctattatggtattttagaca 46680559  T
Q  210 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 309  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680558 atttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 46680459  T
Q  310 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680458 agttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 46680386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 29616095 - 29616376
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29616095 agaacagtacaacacaagacagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggacaaaatgttatttt 29616194  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29616195 ggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtc-----agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 29616289  T
Q  297 ctgtacct-gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29616290 ctgtaccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 29616376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 29592774 - 29593105
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||     ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29592774 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggacatatcagtacaagacagaac-----aacacaaggcagaacagaacaagacaaatttttttggc 29592868  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||     
T  29592869 attgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgccattttggatttttagacaacttttatgtgggacaaaaagttgtgctgtggttta 29592968  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  29592969 gtgaagtacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaggtgt 29593068  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29593069 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 29593105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 3649519 - 3649846
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  3649519 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacaacacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacatcacaaatttttatggtattgaataa 3649618  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3649619 tttcttgttttatatgttttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3649718  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  3649719 aaaaattttagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcttg 3649818  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3649819 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 3649846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 104 - 382
Target Start/End: Original strand, 36497148 - 36497427
Alignment:
Q  104 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 202  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36497148 gtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaaaaatttatagcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacagaatgctattttgatatt 36497247  T
Q  203 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 302  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36497248 ttagacaacttgtatgttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgtctccagtttgtcctgtac 36497347  T
Q  303 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36497348 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 36497427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 382
Target Start/End: Original strand, 38812484 - 38812730
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38812484 tttttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgcggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 38812583  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812584 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 38812683  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38812684 ctagagttgttatgtcctgtcctttattttttagcaaatgaaacgca 38812730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 55 - 367
Target Start/End: Original strand, 34929797 - 34930110
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34929797 ttggtttgcaaaacagtaaaaactagacaaaacagtacaaaataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattcagta 34929896  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34929897 aatttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtatatggggcaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaa 34929996  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34929997 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttattctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttattctgtcat 34930096  T
Q  354 gtccttcatttttt 367  Q
    |  ||| |||||||    
T  34930097 gatctttatttttt 34930110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 44 - 382
Target Start/End: Original strand, 2786836 - 2787174
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||   |||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||     
T  2786836 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagaccgaacaacacaacataaggcaaaacagcactagacaattttttatt 2786935  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  2786936 gcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgggacaaaaatttgtgatgtggtt 2787035  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2787036 tagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagtt 2787135  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2787136 gttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2787174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47642703 - 47642388
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  47642703 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaagtatagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaggataaatttttatgac 47642604  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  47642603 attgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 47642504  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47642503 ctgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtctcttacctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgt 47642404  T
Q  346 tctgtcatgtccttca 361  Q
    |||||| |||||||||    
T  47642403 tctgtcctgtccttca 47642388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Original strand, 32181197 - 32181473
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32181197 acaatacaagatagaacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatactatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 32181296  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  32181297 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacttg 32181396  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32181397 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgtcatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 32181473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Original strand, 43640969 - 43641205
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttta 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  43640969 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaattttta 43641068  T
Q  142 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43641069 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 43641168  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 278  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43641169 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 43641205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 50186411 - 50186738
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||  | |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  50186411 ttggtttgcaaaacagtaagtacttgactgaacagtataagacaaaatagcacaacataagacataacaacataggacaaatttttatgacattgaataa 50186510  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  50186511 ttttttattttatacgatttttggggtgcgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 50186610  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  50186611 aaaaatatgagtttttatcccgtcccttgcctctagtttgtcctgcacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctttcttg 50186710  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50186711 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 50186738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47361570 - 47361289
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47361570 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgatattgagtaattttttgttttatacgaatttttagggacaaaatgctatttt 47361471  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||||||||     |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  47361470 ggtattttagacaacttgtt----ggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttt-gtcttgtcccttgcctccggtttgtc 47361376  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47361375 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 47361289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 382
Target Start/End: Original strand, 4325731 - 4326001
Alignment:
Q  113 aaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 211  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4325731 aaggcagaacaacacacgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatgcgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 4325830  T
Q  212 ttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag 311  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4325831 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgcggttttgtgagagacaaaaatatgagtttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacag 4325930  T
Q  312 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4325931 ttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgca 4326001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 107 - 388
Target Start/End: Original strand, 11055977 - 11056258
Alignment:
Q  107 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |    
T  11055977 caacacaaggtagaacagtacgggacaaatctttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggcacgaaatgttattttggtatttttg 11056076  T
Q  207 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 306  Q
    ||||  ||||| |||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11056077 acaatctgtacatgggacataaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11056176  T
Q  307 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11056177 aacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgaccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 11056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 131 - 382
Target Start/End: Original strand, 41711806 - 41712057
Alignment:
Q  131 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaag 230  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  41711806 acaaatttttatgctattgaataattttttgttttatacgatatttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgagacaaaaag 41711905  T
Q  231 ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 330  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41711906 ttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtctttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactg 41712005  T
Q  331 gacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  41712006 gacaactagagttgttctgttctatcattcattttttagtaaatcaaacgca 41712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22318587 - 22318250
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||| | ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  22318587 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaagagtacaatgcagaacagcacaacacaagacataacaacacatgacaaatttttatgatattgaataa 22318488  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  22318487 tttcttgttttatatgatttttggatgacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtaagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 22318388  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||| | |  ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  22318387 aaaaatttcaaattttgtcctgtctcttgccttcagtttgttctgtccctaaaacagttttacaaatcaaacactagacagctggggttgttctgtcatg 22318288  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22318287 tccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaagaat 22318250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7555172 - 7554833
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| | |||   ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  7555172 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacttaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagacagaacatcacacgacaaatttttat 7555073  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||    
T  7555072 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggccgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggt 7554973  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  7554972 ttagtgaaggacaaaaatacgagtttttatcatgtctcttgcattcagtttgttttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctgaaat 7554873  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  7554872 tgttctgtcatatctttcactttttagcaaatcaaacgca 7554833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37695741 - 37695470
Alignment:
Q  58 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 157  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37695741 gtttgcaaaacaacaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatggcattgaataattt 37695642  T
Q  158 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  37695641 tttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttgatattttagacaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaa 37695542  T
Q  258 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 329  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37695541 aatatcagtttttgtcttgtctcttacctccaatttatcatgtacctgaaacagttttccaaataaaacact 37695470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 379
Target Start/End: Original strand, 39078596 - 39078868
Alignment:
Q  107 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 206  Q
    |||||||||| | |||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  39078596 caacacaaggcataacaacacaggataaatttttatggtattgaataatttcttattttatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttag 39078695  T
Q  207 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 306  Q
    |||||| |||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  39078696 acaactcgtacgtaggacaaaaatttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcctatctcttgcctccagtttgttctgtccctga 39078795  T
Q  307 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39078796 aacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaac 39078868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53200858 - 53200519
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaca-----gtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     ||| || | |||||   |||||| |||| | |||| ||||  |||||||||||||    
T  53200858 gtgtgtttggtttgcaaaagagtaagtactggatagaacatatcagtacaaaacagaacatcacaacataaggcataacaacacagaacaaatttttatg 53200759  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggt 242  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  53200758 gtattgaataattttttgttttgtatgatttttgagggacgaaatactattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggt 53200659  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||  |||    
T  53200658 ttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgttccttgcctccagtttatcctgtctctgaaacagttttgcaaatcaaacactaaacagctgaagt 53200559  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53200558 tattatgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 53200519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 191 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2630018 - 2629827
Alignment:
Q  191 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2630018 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatttggtctggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcctttgcctctag 2629919  T
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629918 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2629827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 388
Target Start/End: Original strand, 16320408 - 16320734
Alignment:
Q  59 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 158  Q
    |||||||||||| |||||||| | | | || || |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16320408 tttgcaaaacagcaagtactgtataaagcaatacaagaaagaacaacacaatagaagggagaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttt 16320507  T
Q  159 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 258  Q
      ||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16320508 --gttttatacgagttttgggggatgaaattctatttttgtattttaggcaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa 16320605  T
Q  259 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 358  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16320606 atatcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttttcctatacctgagacagttttacaaatcaaatactggacaactggagttgttctgtccagtcct 16320705  T
Q  359 tcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16320706 t-attttttagcatatcaaacgcaccctaa 16320734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50729621 - 50729418
Alignment:
Q  179 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 278  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||    
T  50729621 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatagacaaaaatttcagtttttgtcatgtc 50729522  T
Q  279 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50729521 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaa 50729422  T
Q  379 cgca 382  Q
    ||||    
T  50729421 cgca 50729418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 382
Target Start/End: Original strand, 26083235 - 26083547
Alignment:
Q  69 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 168  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||   |||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  26083235 agtaagtattggactgaacaatataatgcagaacaacacaacacaaggcataacagtacacgacaaatttttatggtattgaataatttcatgttttata 26083334  T
Q  169 cgatttttgagggacaaaatgctattttga-tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtt 267  Q
     | |||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  26083335 tgctttttgggggacgaaatgttattttgggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtt 26083434  T
Q  268 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  26083435 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactaaacaactgaagttgttctgt--tgtccttcattttct 26083532  T
Q  368 agcaaatcaaacgca 382  Q
    | ||||| |||||||    
T  26083533 aacaaattaaacgca 26083547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 378
Target Start/End: Original strand, 28115243 - 28115457
Alignment:
Q  162 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 261  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28115243 ttttataagattcttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 28115341  T
Q  262 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 361  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | | |||||    
T  28115342 tcaatttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacc-aaaacagttttacaaatcaaacactagacaacttgagttgttctgccctttgcttca 28115440  T
Q  362 ttttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||||||||||||||    
T  28115441 ttttttagcaaatcaaa 28115457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 272
Target Start/End: Original strand, 37931798 - 37932020
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37931798 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagacataataacataatacaaggcagaacagcacaagacaactttttatggcattg 37931897  T
Q  150 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 249  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  37931898 aataatttttcgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttgacattttaaacaacttgtatgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 37931997  T
Q  250 gggataaaaatatgagtttttgt 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  37931998 gggacaaaaatatgagtttttgt 37932020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 14296471 - 14296648
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14296471 gggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14296570  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14296571 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14296648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 379
Target Start/End: Original strand, 30942671 - 30942995
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||  ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30942671 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaattaagaacattacaatacaaggtataatagcatatgacaaatttttatagcattgaataa 30942770  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||| |   ||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  30942771 tttcttgttttatatgatttttgggggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttatatgtgaggcaaaatgttgtgttgtggtttggtgagagac 30942870  T
Q  255 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
    | |||| | || ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |    
T  30942871 agaaatttcagttttttgtcccgtctcttgcctccaatttgttctgtccctgaaacagttttataaatcaaacactgaataactggagttgttctgtctt 30942970  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||    
T  30942971 atcctt-attttttaacaaatcaaac 30942995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 14314719 - 14314896
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14314719 gggtgtgtttgatttgctaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14314818  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14314819 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14314896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 226 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6973945 - 6973789
Alignment:
Q  226 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 325  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6973945 aaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtcaattgcctcccgtttgtccagtacctgaaacagttttacaaatcaaa 6973846  T
Q  326 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6973845 cactggacaacaaaagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6973789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 382
Target Start/End: Original strand, 14296645 - 14296777
Alignment:
Q  250 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14296645 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14296744  T
Q  350 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14296745 tcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14296777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 382
Target Start/End: Original strand, 14314893 - 14315025
Alignment:
Q  250 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14314893 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14314992  T
Q  350 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14314993 tcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14315025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 216 - 382
Target Start/End: Original strand, 42772832 - 42772998
Alignment:
Q  216 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 315  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42772832 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctcaagtttgtcatgtacctgaaacaatttt 42772931  T
Q  316 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  42772932 acaaatcaaacacttgaaaactaaagttgttatgtcatgtcattcattttttaatgaatcaaacgca 42772998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Original strand, 23327850 - 23328020
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattt 203  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||    
T  23327850 acaacacaaagtagaacattacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggggggataaaatgttattttggtattt 23327949  T
Q  204 tagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 273  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23327950 tagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatgagtttttgtc 23328020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25978664 - 25978488
Alignment:
Q  205 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 304  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| |||    
T  25978664 agacaacttgtaagtgagacaaaaagttgtgatatggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgttcattgcctccaatttgtcatgt-cct 25978566  T
Q  305 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25978565 gaaacagttttacaaatcaaacactggataattgaagttgttttgtcatgtcctttattttttaacaaatcaaacgca 25978488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 293
Target Start/End: Original strand, 13110211 - 13110448
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||   | | |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  |||    
T  13110211 ttggtttgcaaaacagtaagtagtggataaaacaatacaagatagaacaacatagcacaaggtagaacaacgcagaacaaatttttatggcattgcataa 13110310  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg-tttggtgaggga 253  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||| || |||||||||  || ||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  13110311 ttttt-gttttgtatgatttttgggggacgaaatgctattttggatttttagacaaattttacgtgggacaaacagttgtgttgtggttttagtgaagga 13110409  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 293  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13110410 caaaaatatgag-ttttgtcatgtcctttgcatccagttt 13110448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 255 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 56487285 - 56487163
Alignment:
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  56487285 aaaaatataaatttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatatctgaaacagttttacaaatcaaac-----acaactagagttgttctgtcatg 56487191  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  56487190 tctttcattttttagcaaatcaaacgca 56487163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 382
Target Start/End: Original strand, 23328015 - 23328106
Alignment:
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328015 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaagtcaaacacatgacaactagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgca 23328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 296
Target Start/End: Original strand, 7001748 - 7001976
Alignment:
Q  66 aacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtttt 165  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7001748 aacagtaaatactggacaaaatagtacaagacagaacatcacaacacaagacagaacaatacaggacaaatttttatggcattgaataatttttggtctt 7001847  T
Q  166 atacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgag 265  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | | |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  7001848 atacgatttttggtggac-aaatgttattttggta-tttagacaacttatacatagaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttttg 7001945  T
Q  266 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  7001946 tttttgttctgtctcttgcctcgagtttgtc 7001976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 281
Target Start/End: Original strand, 43739395 - 43739570
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  43739395 acaacataaggcagaacaacacatgataaatttttttggtattaaataatttttggtcttatacaattttttgtggataaaatgttattttaatatttta 43739494  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 281  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  43739495 gacaacttgtatgtgggacaaaatgttgtgttgtggtttggtgagggacaataatttcagtttttgtcatgtccct 43739570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 327
Target Start/End: Original strand, 9947947 - 9948084
Alignment:
Q  190 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 289  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |    
T  9947947 ctattttggtattttgaataacttgtacgtgagacaaaaagttgtaatgtggtttagtgagggataagaattttagtttttgtcatgtctcttgcctcaa 9948046  T
Q  290 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 327  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9948047 gtttgtcatgttccttaaacagttttacaaatcaaaca 9948084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 45577842 - 45577619
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||  | ||||||   ||||||||||  |||||| |||||||    
T  45577842 acaacataaggttgaacaacacatgacaaagttttatggtattgaataatttt--gtcttaatcaattttttgtggacaaaatgtcattttggtatttta 45577745  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaat---atgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 302  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | |||| | || |||   ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  45577744 gacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagcgaggaacaagaatttcatttttttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcatgtcc 45577645  T
Q  303 ctgaaacag-ttttacaaatcaaaca 327  Q
     | |||||| ||||||||||||||||    
T  45577644 ataaaacagcttttacaaatcaaaca 45577619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44355995 - 44355734
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||  ||||| ||| |||| || || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  44355995 agaacaacacaggccaaacttttatgctattgaataacttttggtcttgtacgatttttgatggacaaaagactattttggtatatcatacaacttgtac 44355896  T
Q  218 gtgggatgaaaag-ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 316  Q
    ||  ||  ||||  ||||| ||||||||  ||||||| |||||| | | |||||||| | || ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  44355895 gtaagacaaaaaaattgtgttgtggtttaatgagggacaaaaatttcaatttttgtcctctctcttacctccagtttgtcctatccctaaaacag-ttta 44355797  T
Q  317 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||    
T  44355796 caaatcaaacaccacacaactagatttgtcatatcatatccttcattttttaacatatcaaac 44355734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 232
Target Start/End: Original strand, 42772724 - 42772818
Alignment:
Q  138 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  42772724 tttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttggaggaaaaaatgttattttggtattttagataacttatacgtgggacaaaaagtt 42772818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20644379 - 20644107
Alignment:
Q  120 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 219  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||      
T  20644379 aacaacacatgacacacttttatcgcattgaataatttttgattttatacgatttttggtgtacaaaaatctatttttgtatcttagataacttgtacac 20644280  T
Q  220 gggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 319  Q
    | ||  | ||| || | |||||||| ||||| || |||||| |   |||||| ||||| | ||||||| |||||    ||| || |||| |||||| |||    
T  20644279 gagacaagaagctgggatgtggtttagtgagagacaaaaatttatatttttgacatgttcattgcctctagtttagattgtcccagaaatagttttgcaa 20644180  T
Q  320 atcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 392  Q
    ||||||||| | | ||||  | || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  20644179 atcaaacaccgtataactgaaattatcctgtcatgtccttcattttttaacagatcaaacgcaccctaagaat 20644107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 382
Target Start/End: Original strand, 44640417 - 44640532
Alignment:
Q  266 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 365  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  44640417 tttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcattttccataaacagttttacaaatcaaacactgtacaactgaagttgttctgtc-tgtcattcatttt 44640515  T
Q  366 ttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| | ||||||||||    
T  44640516 ttagtagatcaaacgca 44640532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43189914 - 43189636
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||||| | | ||||||  ||||| |    
T  43189914 acaatacaaggaagagcaacacatgataaacttttatggtattgaataattttttgtcttatacgatatttagtggacaataagttatttttgtattt-a 43189816  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    || |||||| |  |||||  |||| |||||  ||||||| |||||  | |||||  |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |  |      
T  43189815 gataacttgcatttgggacaaaaacttgtgtcgtggtttagtgagacacaaaaaattatgtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcatatttcaa 43189716  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgcaac 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  43189715 aaacaattttacaaatcaaacactgtacaactaaaattgttatgtcttatctttcatttttttagcagatcaaatgcaac 43189636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 379
Target Start/End: Original strand, 13110443 - 13110513
Alignment:
Q  309 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13110443 cagttttacaaatcaaacactggacaactgaaatttttctgtcatgtctttcattttttagcaaatcaaac 13110513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 53343638 - 53343560
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttt 175  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53343638 agaacagtacaacacaatgcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttt 53343560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Original strand, 2114191 - 2114243
Alignment:
Q  327 actggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114191 actggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 2114243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 56487374 - 56487292
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 218  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  56487374 tttttatgtcattgattgattttttgttttatatgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttaaacaacttgtacg 56487292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 326
Target Start/End: Original strand, 3579142 - 3579279
Alignment:
Q  190 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa-aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 288  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||  |||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| |   ||||||||||||||||||||||     
T  3579142 ctattttggtattttagacaacttgaatgttggacaaaaagttgtgatatggtttagtgatggaaaataaatttacttttttgtcatgtcccttgcctca 3579241  T
Q  289 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 326  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  3579242 agtttgtcctgcccctaaaacagatttacgaatcaaac 3579279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 217
Target Start/End: Original strand, 985216 - 985327
Alignment:
Q  105 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 204  Q
    |||||||||||  | |||| || | |||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  985216 tacaacacaagacaaaacatcataagacaaatttttatggt-ttgaataatttttggtcttatatgatttttgctggacaaaagactattttgatatttt 985314  T
Q  205 agacaacttgtac 217  Q
    | |||||||||||    
T  985315 aaacaacttgtac 985327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 382
Target Start/End: Original strand, 52673838 - 52674024
Alignment:
Q  199 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttg---t 295  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  52673838 tattttagataactcatacgtgagacaaaaaattgtgttgaggtttagtgagggacaaaaatttctgtttttgtcatgtcccttgactccagtttgtgat 52673937  T
Q  296 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||  | ||  ||||||||||| ||| || | |||  |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  52673938 cccttcccaaaaacagttttataaaccagatactatacaactggagttatcttatcatgtccttcgttttttagcagatcaaacgca 52674024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 253
Target Start/End: Original strand, 52755417 - 52755601
Alignment:
Q  69 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 168  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||||||| |  || ||| ||||||| ||||| | |  |||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  52755417 agtaagtacttgatagaaccgtaaaagataggatagtgcaaaacaaggttgaacaacgctggacaaattgttatggtgttgaacaattttttgttttata 52755516  T
Q  169 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    | || ||||| ||| |||||| ||||||| || |||| ||| ||||| | ||| |  |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  52755517 caatgtttgatggaaaaaatgttattttgctaatttacacagcttgtgcttggaacaaaaagttgttttgtgctttggtgaggga 52755601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31446027 - 31445768
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  | || ||||||||||   | |||||| | ||||||  |||||||    
T  31446027 acaacacaaagtagaaaaacacatgacaaacttttatggtattggataattttta-tcttgtacgattttttgtgaacaaaaagttatttttgtatttta 31445929  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    || || ||||||||| |   |||||||||| ||| |||| ||| |||| |||  | |  ||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| | |  |      
T  31445928 gataatttgtacgtgtggcaaaaagttgtgatgttgtttagtg-gggacaaaggtttatgtttt-gtgttgtcctttgcctcccgtttgtcatatctcaa 31445831  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacac--tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 366  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31445830 aaacagttttacaaatcaaagacattgtacaactagagttgtcatgtcatgtccttcattttt 31445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 378
Target Start/End: Original strand, 43739557 - 43739644
Alignment:
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43739557 tttgtcatgtccctcaaacagttttacaaatcaaacattttacaactgaagttgtcttatcacgtccttcattttttagcaaatcaaa 43739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 421
Target Start/End: Original strand, 23570780 - 23570816
Alignment:
Q  385 ctaagaatgagatgataatacttcttcaaaattgtct 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570780 ctaagaatgagatgataatacttcttcaaaattgtct 23570816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Original strand, 32181161 - 32181213
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaac 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  32181161 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacaatacaagatagaac 32181213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Original strand, 38520438 - 38520498
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtac 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38520438 gggtgtgtttggtttgcaaaacaactagtattggacagaacagtataagatagaacagtac 38520498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50729729 - 50729641
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  50729729 ttggtttgcaaaatagtaaatactggacggcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacagaacaaatttttatg 50729641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2725329 - 2725283
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2725329 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatata 2725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10184941 - 10184879
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 168  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  10184941 acaatacaaggtggaacagcacatgacaaacttttatggtattgaacaattttttgtcttata 10184879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Original strand, 38520518 - 38520580
Alignment:
Q  191 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  38520518 tattttggtattttatacaacttgtgcgtgggacaaaaaattatgctgtggtttggtgaggga 38520580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 46680700 - 46680658
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46680700 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagta 46680658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33553036 - 33552995
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33553036 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 33552995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Original strand, 40792409 - 40792462
Alignment:
Q  164 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  40792409 ttatacgatttttgatggacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtac 40792462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Original strand, 52673762 - 52673815
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 159  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  52673762 acaacacaaggcagaactgcacatgacaaacttttatggtattgaataattttt 52673815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 139
Target Start/End: Original strand, 32081080 - 32081124
Alignment:
Q  95 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 139  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32081080 gatagaacagtacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttt 32081124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 382
Target Start/End: Original strand, 38520597 - 38520637
Alignment:
Q  343 tgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38520597 tgttctgtcatgtccttcattcttttagcaaatcaaacgca 38520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 232
Target Start/End: Original strand, 41720779 - 41720903
Alignment:
Q  108 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |||||| ||||||   ||||||||   ||||||  |||||||||    
T  41720779 aacacaaagtagaacaacacatgacaaactttaatgatattgtataatttttagtcttatactattttttgtggacaaaaaattatttttgtattttaga 41720878  T
Q  208 caacttgtacgtgggatgaaaagtt 232  Q
     || ||||||||||||  |||||||    
T  41720879 taatttgtacgtgggacaaaaagtt 41720903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44365992 - 44365940
Alignment:
Q  316 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttta 368  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44365992 acaaatcagacattgtacaacttgagttgttctgtcatgtacttcatttttta 44365940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 50728088 - 50728048
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 89  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50728088 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50728048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 50736102 - 50736062
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 89  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50736102 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50736062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 83
Target Start/End: Original strand, 23327803 - 23327842
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 83  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23327803 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggaca 23327842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 32858276 - 32858327
Alignment:
Q  125 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 176  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32858276 cacatgccaaatttttatagtattgaataattttttgttttatacaattttt 32858327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39433557 - 39433510
Alignment:
Q  63 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaac 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  39433557 caaaatagtaagtactggacagaacagtgtaagataggacagtacaac 39433510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Original strand, 43893535 - 43893654
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| ||| || ||||| ||  ||||    
T  43893535 gacaactttttatggtattgattttttttttgttttatataatttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacctgcacgtgagacaaaaa 43893634  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtga 249  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  43893635 attgtgttgtggtttagtga 43893654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47669297 - 47669219
Alignment:
Q  65 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||| | |||||| || |||||| |||||||    
T  47669297 aaacagtaagtattggacagaacaatacaagatggaacaatacaacataaggcaaaacagcgcacgacaaacttttatg 47669219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 327
Target Start/End: Original strand, 51518482 - 51518528
Alignment:
Q  281 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 327  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51518482 ttgcttccagcttgtcctgtatcagaaacagttttacaaatcaaaca 51518528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Original strand, 36679926 - 36680009
Alignment:
Q  105 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 189  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  36679926 tacaacataaggtagaacaatacatga-atttttttatggtattgatcaatgttttgttttataagatgtttgatggacaaaatg 36680009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 43 - 388
Target Start/End: Original strand, 27103826 - 27104172
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 141  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27103826 ctaagggtgtgtttgatttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 27103925  T
Q  142 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27103926 tggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtgg 27104025  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27104026 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagag 27104125  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27104126 ttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 27104172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 45446325 - 45446662
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45446325 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 45446424  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45446425 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 45446524  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45446525 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgtcgtgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtta 45446624  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45446625 ttttgtcttatccttcattttttagcaaatcaaacgca 45446662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 34062998 - 34063335
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  34062998 agggtgtgtttggtttgcaaaaccgcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagcacaacacatgacaaattttttatgg 34063097  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34063098 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 34063197  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063198 ggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 34063297  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063298 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34063335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 41709647 - 41709984
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  41709647 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaatttttttatgg 41709746  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  41709747 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgttggacaaaaagttgtgctgtggttt 41709846  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709847 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcatttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 41709946  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709947 ttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 41709984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32020233 - 32019899
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32020233 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 32020134  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32020133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggt 32020034  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32020033 gagggataaaaatatgagtttttgtcctaccccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttc 32019934  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32019933 tgtcctgtccttcaatttttagcaaatcaaacgca 32019899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 34101379 - 34101715
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  34101379 gggtgtgtttggtttgcaaaaaagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacaggacaaattttttatggc 34101478  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||    
T  34101479 gttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaaaaaaaagttatgttgtggtttg 34101578  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101579 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtgttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34101678  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101679 tctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34101715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31513818 - 31513476
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31513818 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 31513719  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  31513718 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctaggacaaaaagttgtgctgtggttt 31513619  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31513618 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatctacctgaaacaattttacaaatcaaacactggataactagagttg 31513519  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31513518 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31513476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8673290 - 8672953
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  8673290 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaaatttttatgg 8673191  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8673190 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 8673091  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8673090 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttg 8672991  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8672990 ttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 8672953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3251890 - 3251549
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  3251890 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattttttatggc 3251791  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3251790 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggataaaaagttgtgatgtggtttg 3251691  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3251690 gtgagggacaaaaatataagtttttgttctgtcgcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactagagttgt 3251591  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3251590 tctgtcttatcctttattttttagcaaatcaaacgcacccta 3251549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 44 - 390
Target Start/End: Original strand, 6386444 - 6386791
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||    
T  6386444 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaaaacaaattttttat 6386543  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  6386544 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggt 6386643  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6386644 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcttttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactacagt 6386743  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 390  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6386744 tgttatgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaaga 6386791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29672557 - 29672220
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  29672557 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagaactggacagaacaatacaagatagaacagtgcaacacaagacagaacaacacaggacaaatttttcatggc 29672458  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  29672457 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 29672358  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29672357 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagttgt 29672258  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttt-tagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29672257 tctgtcttgtccttcatttttaaagcaaatcaaacgca 29672220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 46 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29563461 - 29563158
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29563461 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgg 29563362  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29563361 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 29563262  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29563261 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcgagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 29563162  T
Q  345 ttct 348  Q
    ||||    
T  29563161 ttct 29563158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 50 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7395045 - 7394706
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |    
T  7395045 tgtgtttggtttgcaaaacagtaggtacttgacagaacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacagcataggacaagttttttatggcact 7394946  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||    
T  7394945 gagtaattttttgttttatgcgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttggtg 7394846  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394845 agggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttgtaaatcaaacactggacaactagagttgttct 7394746  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7394745 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 7394706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 25478118 - 25478450
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||    || ||||||||||    
T  25478118 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtacttgacaaaacagtataagatagaacaatacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggc 25478213  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25478214 attgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttg 25478313  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25478314 atgagggacaaaaatatgagtttttttcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 25478413  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25478414 tatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 25478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 4052404 - 4052687
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4052404 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 4052501  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4052502 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtc 4052601  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4052602 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 4052687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5969073 - 5968762
Alignment:
Q  72 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 170  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5969073 aagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacg 5968974  T
Q  171 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5968973 atttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagttttt 5968874  T
Q  271 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 370  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5968873 gtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagc 5968774  T
Q  371 aaatcaaacgca 382  Q
    |||| |||||||    
T  5968773 aaattaaacgca 5968762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 49 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13407167 - 13406834
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  13407167 gtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatagcat 13407068  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  13407067 tgagtaattttttgttttatacgatttttggggcacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaaattatgctgtggtttggt 13406968  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13406967 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgttccttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaattaaacactagacaactagagttgttc 13406868  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13406867 tgccctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 13406834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Original strand, 31731935 - 31732257
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31731935 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaaagtataagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacatgacaaaatttttatggc 31732034  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  31732035 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtactgtggtttg 31732134  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732135 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtc--------------gttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 31732220  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732221 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 31732257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 98 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30543205 - 30542915
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30543205 agaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttatttt 30543106  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30543105 ggtattttagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtc 30543006  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30543005 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 30542915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37618626 - 37618290
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37618626 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaaaacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatgtttatggc 37618527  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  37618526 attgaataattttttgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 37618427  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37618426 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 37618327  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37618326 tctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 37618290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37664466 - 37664180
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37664466 agaacagtacaacacaatgcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagcgacaaaatgctatttt 37664367  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37664366 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtc 37664267  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37664266 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 37664180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 55 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12753550 - 12753226
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12753550 ttggtttgcaaaacag-aagtattggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagta 12753452  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12753451 atttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaa 12753352  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12753351 caaaaatatgagtttttgtcttgtcatttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagtcttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcct 12753252  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12753251 gtccttcattttttagcaaatcaaac 12753226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Original strand, 10466995 - 10467271
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10466995 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacatagaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatatttta 10467094  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10467095 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccta 10467194  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10467195 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 10467271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 380
Target Start/End: Original strand, 22999128 - 22999463
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22999128 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacaatacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacagaacaaatttttatgac 22999227  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||    
T  22999228 attgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaagttgtacgtgggacaaaaaagttttgctatggttt 22999327  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22999328 gctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaaccggagttg 22999427  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999428 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 22999463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 40388911 - 40389244
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||    
T  40388911 agggtgcgtttggtttgcaaaatggtaagtactggacataagagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacaacacaggaaaaaattttatggc 40389010  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40389011 attgaataattttttattttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcatttaaaacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 40389110  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40389111 gtgagagataaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 40389210  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40389211 tctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaac 40389244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 86 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7591641 - 7591345
Alignment:
Q  86 acagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa 185  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7591641 acagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaa 7591542  T
Q  186 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7591541 aatgctattttgatattttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcc 7591442  T
Q  286 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7591441 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaaacaaacgca 7591345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 55 - 380
Target Start/End: Original strand, 15001346 - 15001671
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| ||||| ||    
T  15001346 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggtattgaata 15001445  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15001446 attttctgttttatatgatttttgggggacaaa-tgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 15001544  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     |||||| | |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  15001545 caaaaatttcagtttttgttctgtctattgcctccagtttgtcctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 15001644  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15001645 gtccttcattttttatcaaatcaaacg 15001671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 55 - 387
Target Start/End: Original strand, 39642763 - 39643095
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||| |||||   ||||   |||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  39642763 ttggtttgcaaaatagtaagtattgtacagaatagtacaagaaagaacaacacaatgtaagagagaacatcacaagacaaatttttatgacattgaataa 39642862  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||     
T  39642863 ttttttgttttatacaatttttgggggatgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgggacagaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 39642962  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39642963 aaaaatatcagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaaaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatg 39643062  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39643063 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 39643095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 17805563 - 17805898
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||     
T  17805563 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaagacagaataacacaacacaaggtagaacaacacaggacaaattttttagggcaa 17805662  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgag-ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||    
T  17805663 cgagtaattttttgttttatacgatttttgggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaagagttgtgctttggtttgg 17805762  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  17805763 tgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctctagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttggt 17805862  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  17805863 ctgttatgtccttcatttttaaacaaattaaacgca 17805898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 106 - 387
Target Start/End: Original strand, 41548549 - 41548830
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41548549 acaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatatttta 41548648  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  41548649 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtctgctgaggtacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtatctg 41548748  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41548749 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaattaaacgcacccta 41548830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14005268 - 14004943
Alignment:
Q  42 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||               |||||||||  |||||| || | |||||||||||     
T  14005268 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta---------------caacacaagacagaacaacataggacaaatttttt 14005184  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  14005183 atgacattgagtaattttttgttttatacaattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 14005084  T
Q  241 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 340  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14005083 gtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacaaatcaaatactggacaactaaa 14004984  T
Q  341 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
     ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14004983 attgttatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 14004943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 389
Target Start/End: Original strand, 35225531 - 35225876
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||   ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  35225531 taaggatgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagacaggacaacacaacacaagacagaacaacacaagacaaatttttatg 35225630  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    | ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  35225631 gtattgaataatttcctgttttatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtggtt 35225730  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    ||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35225731 tggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaaccaaacactggacaactggagtt 35225830  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35225831 gttctgtcctatccttcattttttatcaaatcaaacgcaccctaag 35225876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 45113929 - 45114262
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  45113929 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagagcagcacaacacaaggcataacaacacatgataaatttgtatgacatt 45114028  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  45114029 gaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctatgacaaaaagttgtactgtggtttggtg 45114128  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||  |    
T  45114129 agggacaaaaatatgagtttttgtcctctcccttgcatctcgtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattgaagttgtcat 45114228  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45114229 gtcctgtccttcatgttttagcaaatcaaacgca 45114262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 30501016 - 30501352
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||  || |||| |||| || |||| |||| |||||   |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |    
T  30501016 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaaatacttgacataatagtacaagacagaacaacacaacataagacaaaacaccataggacaaatttttatgac 30501115  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30501116 attgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 30501215  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  30501216 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaactgaagttgt 30501315  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30501316 tctgccatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 30501352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32303819 - 32303592
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32303819 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 32303720  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  32303719 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 32303620  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtc 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32303619 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 32303592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29611229 - 29610953
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29611229 acaacacaaggcataacaacacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgctattttggtgtttta 29611130  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29611129 gacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctg 29611030  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29611029 aaacagttttacaaatcaaacattggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 29610953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 55 - 387
Target Start/End: Original strand, 37474599 - 37474912
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | | | ||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37474599 ttggtttgcaaaacagcaagtacagcatatagcagtacaagaaagaacagcacaatacaagggataacagcacatgacaaatttttatgacattgaataa 37474698  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||                   ||||||||| |||||||     
T  37474699 ttttttattttatacgatttttggggaaaaaaacgctagtttggtattttagacaacttgtac-------------------tgtggtttgctgagggac 37474779  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37474780 aaaaatataagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcata 37474879  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37474880 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 37474912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 182 - 382
Target Start/End: Original strand, 37861866 - 37862065
Alignment:
Q  182 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37861866 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttatgatgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcact 37861965  T
Q  282 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37861966 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttactaatcaaacattgaacaactagagttg-tatgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 37862064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 379
Target Start/End: Original strand, 17520468 - 17520798
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata-----agatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     ||| ||||    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  17520468 gggtgtggttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagaacagaagaagacagaataacacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttta 17520567  T
Q  142 tggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 239  Q
    | || |||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  17520568 tagcgttggattattttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg--------gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgt 17520659  T
Q  240 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 339  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17520660 ggtttggtgagggacaaaa-tataagtttttgccctgtcccttgcctccattttatcatgcacctaaaacacttttacaaatcaaacaccggacaactgg 17520758  T
Q  340 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17520759 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaattaaac 17520798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16485976 - 16485707
Alignment:
Q  113 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 212  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16485976 aaggcagaacagcacaaaacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagaaaact 16485877  T
Q  213 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 312  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||  |    
T  16485876 tatacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgttctgtcctttgccttcaatttgtcatgtccctgaaactat 16485777  T
Q  313 tttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16485776 tttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttctatcatgtccttcattctttatcaaatcaaacgca 16485707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10656838 - 10656587
Alignment:
Q  128 atgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaa 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  10656838 atgacaaatttttatgttattgaataattttttcttttatacgattttttgtggacaaattgttattttgatattttagacaatttgtacgtgagacaaa 10656739  T
Q  228 aagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 327  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| |||||  | |||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||  || ||| || ||||||||||||| |    
T  10656738 aagttgtgttgtggttttgtgaaggacaaaaaattcagtttttgtcctgtcttttgcctctagtttgtcatgtctctaaaaaagatttacaaatcaaata 10656639  T
Q  328 ctggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656638 ctggacaattgaggttgttctgacatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10656587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16595369 - 16595063
Alignment:
Q  60 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 159  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||| || | ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  16595369 ttgctaaacagtatgtactggacagaacagtataagacagaacaacaaaacacaaggcagaaaagtaaatggcaaacttttttggtattgaataattttt 16595270  T
Q  160 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 259  Q
     || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| ||||     
T  16595269 ggtcttatacgatttttggtgaacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattagcgagggacaaaac 16595170  T
Q  260 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 359  Q
    |    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16595169 ttcatgtttttgtcctgtcccttgcctacagtttgttctgtcccagaaaca-atttacaaatcaaacaatatacaactggtgttgtcctgtcatgtcctt 16595071  T
Q  360 catttttt 367  Q
    ||||||||    
T  16595070 catttttt 16595063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 167 - 382
Target Start/End: Original strand, 21272676 - 21272874
Alignment:
Q  167 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 266  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21272676 tacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 21272775  T
Q  267 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 366  Q
    ||||||| ||||                  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||    
T  21272776 ttttgtcctgtc-----------------gctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctctcgtgtcattcattctt 21272858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10320424 - 10320180
Alignment:
Q  133 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 232  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10320424 aaatttttatggtattgaataatttttggttttatacgattgttgttagacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgtggtaaaaagtt 10320325  T
Q  233 gtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 332  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |   |||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |  |    
T  10320324 gtgttgtggtttggtgagggataagaatttctgttttt-tttcgtcccttg-ctcaagtttgtcatgtccctaaaacggttttacaaatcaaacattata 10320227  T
Q  333 caactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||| || ||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  10320226 caacttgaattgttttg-cacggtcttcatttttttagcaaatcaaac 10320180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 382
Target Start/End: Original strand, 6460152 - 6460465
Alignment:
Q  64 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtt 163  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| | || | ||| | ||| |||| || |||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||     
T  6460152 aaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaggacaaaacagcacagcacagggcagagtagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttt--gtc 6460249  T
Q  164 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 262  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||| || |||         
T  6460250 ttatacgattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaa----- 6460344  T
Q  263 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttac-aaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 361  Q
       |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||| || |||||| | ||| |  |||| | |||||||    
T  6460345 ---tttttgtcttgtcccttgcctccagattgtcatgtctctaaaacagctttacaaaatcaaacaatgtacaacttgggttatcatgtcttatccttca 6460441  T
Q  362 ---ttttttagcaaatcaaacgca 382  Q
       |||||||||||||||||||||    
T  6460442 tttttttttagcaaatcaaacgca 6460465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32303597 - 32303501
Alignment:
Q  291 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32303597 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttctatcatttccttcgttttttagcaaatcaaacgcacccta 32303501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 310 - 388
Target Start/End: Original strand, 38047481 - 38047559
Alignment:
Q  310 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38047481 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 38047559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27109735 - 27109532
Alignment:
Q  88 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaa 185  Q
    |||| ||||||||||   |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |    
T  27109735 agtacaagatagaacaacacaatacaatgcagaacggtacaggacaaattttaatagcattgaataattttttttgttttatatgatttttgggggacga 27109636  T
Q  186 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 285  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  27109635 aatgttattttggtattttaaacaatttgtacgcgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaaggaacaaaaatatctgattttatcatgtcccttgcc 27109536  T
Q  286 tcca 289  Q
    ||||    
T  27109535 tcca 27109532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22756501 - 22756307
Alignment:
Q  190 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 289  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  22756501 ctatttttgtattttagataacttgtacgtgatacaaaaagttgtgttgtggtataatgagggataaaaatttatgtttttgtcttgtctcttgcctcaa 22756402  T
Q  290 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22756401 atttgtcctatcccagaaacagttttacaaatcaaacattgtataactggagttgtt-----ttgtccttcattttttagcagatcaaacacaccctaag 22756307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 379
Target Start/End: Original strand, 10932691 - 10932940
Alignment:
Q  130 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 229  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||  |  ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  10932691 gacaaatttgtatggtattgaataatttttggtcttataaaaaattttatggacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacgtggaactaaaa 10932790  T
Q  230 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 329  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||     
T  10932791 gttgtgatgtggtttagtgaggga-caaaattttagtttttatcatgtctcttgcctctactttgtcttgtcccataaacaattttataaatcaaacacc 10932889  T
Q  330 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 379  Q
      ||||||  |||||||  ||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10932890 atacaactgaagttgtttggtcttgtcctttatttttttagtaaatcaaac 10932940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Original strand, 54117 - 54322
Alignment:
Q  121 acagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 220  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||| |||||  ||||||| |||||| || |||||||| |||    
T  54117 acagcacaagataaacttttatggtattgaataattttttgtcttaaacgattttttgtggataaaatattattttg-tattttcgataacttgtatgtg 54215  T
Q  221 ggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaa 320  Q
    |||  |||||||||| |||||||| |  | ||| |||||| |  |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  54216 ggacaaaaagttgtgatgtggtttagcaaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtcccttgtgtccggattgtcatgtctcagaaacagttttacaaa 54315  T
Q  321 tcaaaca 327  Q
    |||||||    
T  54316 tcaaaca 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 21272592 - 21272676
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 139  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21272592 ttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacaatacaagatagatcagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaatttt 21272676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Original strand, 37861803 - 37861865
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttt 159  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37861803 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttt 37861865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Original strand, 37861766 - 37861865
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 144  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37861766 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaaca---------------gtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 37861850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 955173 - 955102
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaag 115  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  955173 taagagtgtgtttggtttacaaaacagcaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaag 955102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 367
Target Start/End: Original strand, 10531244 - 10531472
Alignment:
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||   ||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||| |||||||||  | ||    
T  10531244 atggtattgaataattttttatcttataagattttttatggacaaaagattattttggtattctaaacaatttgtatgtgagataaaaagttgtattttg 10531343  T
Q  241 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga--aacagttttacaaatcaaacactggacaacta 338  Q
    |||| |||||| | || ||| | ||||||| |||||||  |||| ||| ||||||| | | ||  |  || |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  10531344 gtttagtgaggaacaagaatttcagtttttatcatgtcttttgcatccggtttgtcatatgcccaataaatagttctacaaatcaaacattgtacaacta 10531443  T
Q  339 gagttgttctgtcatgtccttcatttttt 367  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  10531444 gagttgttttgtcttgtacttaatttttt 10531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36426347 - 36426201
Alignment:
Q  180 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 279  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||| || |  || |||| | | |||||||||| | |||    
T  36426347 ggacaaaagactattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagatgtgttgtggtttagtaaatgacaaaatttttagtttttgtcttatcc 36426248  T
Q  280 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 328  Q
    |||||||| || ||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  36426247 cttgcctcaagattgtcgtgt--ctgaaccaattttacaaatcaaacac 36426201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 32918842 - 32918925
Alignment:
Q  132 caaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgt 215  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32918842 caaatttttatgacattaaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggtattaaaaacaacttgt 32918925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 335
Target Start/End: Original strand, 11944854 - 11945035
Alignment:
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||||| || ||  |||||||||  |||||||| ||| || |    
T  11944854 atttttagtcttatacaatttttgaggcaaaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagttgtagtgtggtttagtggggaa 11944953  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
      | | | |||||||||   ||||| |||||||| |||||||| | | | | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11944954 ctagagtttgagtttttactatgtctcttgcctctagtttgtcatctccataaaacaattttacatatcaaacactgtacaa 11945035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 219
Target Start/End: Original strand, 28746254 - 28746367
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | || |||||||||||  | |||||||  ||||||| |||||||    
T  28746254 acaacataagataaaacagcacatgataaatttttatgacattgaataatttttgatcttgtacgatttttggtgaacaaaattttattttggtatttta 28746353  T
Q  206 gacaacttgtacgt 219  Q
     | | |||||||||    
T  28746354 aatagcttgtacgt 28746367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Original strand, 4052368 - 4052412
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4052368 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 4052412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 14958948 - 14959027
Alignment:
Q  164 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14958948 ttatacgattttttgtgggcaaaaagttattttgatattttagaca-cttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 14959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 382
Target Start/End: Original strand, 15351820 - 15351900
Alignment:
Q  302 cctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  15351820 cctgaaacaattttacaaatcaaacacggcataactgtagttgttctgttacatcattcattttttagcaaatgaaacgca 15351900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5859632 - 5859533
Alignment:
Q  120 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 219  Q
    |||| ||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5859632 aacatcacataagaaacttttattgtattgattaattattggtcttataagattttttatggacaaaatactattttagtattttagataacttgtacgt 5859533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 9624180 - 9624239
Alignment:
Q  118 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa-ttttttgttttatacgattttt 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9624180 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttttttgtcttatacaattttt 9624239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11926956 - 11926893
Alignment:
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11926956 atttttagtcttatacaatttttgaggcacaaaagactattttggtattttagacaaattgtac 11926893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 216
Target Start/End: Original strand, 15351686 - 15351776
Alignment:
Q  125 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 216  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15351686 cacatgataaatttttatgatattgaataattttga-ttttatacgatttttggttgataaaatgttattttggtattttagacaatttgta 15351776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30543239 - 30543197
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30543239 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacagaacagta 30543197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 37664499 - 37664458
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37664499 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagcactggacagaacagta 37664458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 356
Target Start/End: Original strand, 9624310 - 9624397
Alignment:
Q  268 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 356  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9624310 tttgtcatgtctcttgtctcccgtttgtcttgtcccagaaacaattttacaaat-aaacagtgtacaactgaagttgtcatgtcatgtc 9624397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 55 - 387
Target Start/End: Original strand, 11963220 - 11963553
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11963220 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaagcagaataacacatgacaaattttttatggcattgagta 11963319  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963320 attttgtattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 11963419  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11963420 caaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 11963519  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11963520 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 11963553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 32528585 - 32528922
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32528585 agggtgtgtttgatttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 32528684  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32528685 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 32528784  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32528785 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 32528884  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32528885 tcctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 32528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 44 - 379
Target Start/End: Original strand, 7523039 - 7523376
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7523039 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaggaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 7523138  T
Q  143 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7523139 gacattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtgg 7523238  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7523239 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 7523338  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7523339 ttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaac 7523376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 35701147 - 35701484
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||    
T  35701147 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaataacacaggacaaattttttatgg 35701246  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||    
T  35701247 caatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttatgttgtggttt 35701346  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701347 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35701446  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701447 ttctatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 35701484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 388
Target Start/End: Original strand, 2351552 - 2351893
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  2351552 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggataaattttttatggca 2351651  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2351652 ttgagtaattttttgttttgtacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 2351751  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2351752 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctataccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtc 2351851  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2351852 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 2351893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 81 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31770782 - 31770479
Alignment:
Q  81 acagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgag 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31770782 acagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgag 31770683  T
Q  180 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31770682 ggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcc 31770583  T
Q  280 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31770582 cttgcctccagtttgtcttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaac 31770483  T
Q  380 gcaa 383  Q
    ||||    
T  31770482 gcaa 31770479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 55 - 393
Target Start/End: Original strand, 34794766 - 34795105
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  34794766 ttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgataaattttttgtggcattgaata 34794865  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34794866 attttttgttttatacgaattttggggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 34794965  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34794966 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttctgtcat 34795065  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaatg 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  34795066 gtccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaataatg 34795105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 42 - 382
Target Start/End: Original strand, 39918374 - 39918714
Alignment:
Q  42 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttt 140  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  39918374 tctatgggtgtgtttggtttgcaat-cagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacaggacaaatatttt 39918472  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  39918473 atagtattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtg 39918572  T
Q  241 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918573 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 39918672  T
Q  341 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918673 gttgtcttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 39918714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24181835 - 24181513
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24181835 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 24181751  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24181750 cattgagtaatttgttgttttatacgatctttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttatgctgtggttt 24181651  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181650 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttggctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24181551  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181550 ttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 24181513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41790688 - 41790342
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 144  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41790688 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtataaaatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatgg 41790589  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  41790588 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttagtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttt 41790489  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41790488 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtttattgcctccagtttgtcctgta-ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 41790390  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 392  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  41790389 ttctgtcctgtctttcattttttagcgaatcaaatgcatcctaagaat 41790342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 98 - 388
Target Start/End: Original strand, 41459511 - 41459801
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41459511 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaggacaaaaatttaatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 41459610  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41459611 gatattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctctggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt-tcttgtcccttgcctccagtttgtc 41459709  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41459710 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactaaacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 41459801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 29241300 - 29241585
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29241300 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 29241399  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  29241400 gatattttagccaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagcttttggcctgtcccttgcctccaatttgtc 29241499  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29241500 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctggcctggccttcattttttagcaaatcaaacgca 29241585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21739381 - 21739093
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    || |||||||||||    
T  21739381 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacaggaca----aattttttatggca 21739286  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21739285 ttgtgtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 21739186  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739185 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 21739093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6284524 - 6284189
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6284524 gggtgtgtttgatttacaaaacagcaagtactggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagtacagcacaagacaaattttttatggc 6284425  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6284424 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttttggtattttggacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 6284325  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6284324 ggtgagggacaaaaaaataagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacctgaagcagttttacaaatcaaacactggacaactaaagtta 6284225  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6284224 ttc--tcccgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 6284189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Original strand, 8136710 - 8137049
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  8136710 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcataacaacacaggacaatttttttatggc 8136809  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  8136810 attgagtaatgttttgttttatactattttttggggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttg 8136907  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8136908 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaaacaaacactggacaactagagttgt 8137007  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8137008 tctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 8137049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 3735237 - 3735564
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||  | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  3735237 ttggtttgcaaaacagcaggtactgtacagaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 3735336  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  3735337 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatggac 3735436  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3735437 aaaaatatcagtttttgtcctgtccattgcctccattttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatg 3735536  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3735537 ttcttcattttttagcaaatcaaacgca 3735564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 48 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4818364 - 4818085
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4818364 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtgcaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggca 4818265  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4818264 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 4818165  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4818164 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgttccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 4818085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7770495 - 7770168
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  7770495 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataatcgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 7770396  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  7770395 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggac 7770296  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7770295 aaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatg 7770196  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7770195 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 7770168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4689923 - 4689589
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4689923 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtaatggacataacagtacaagacagaacaacacaacataaggcagaacaacacatgacaaatttttatgac 4689824  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  4689823 attgaataattttttgttttatacgacttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 4689724  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4689723 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 4689624  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689623 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 4689589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22493643 - 22493322
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22493643 gggtgtgtttggttcgcaaaacaacaagtattggacagaacagtgcaagacagaataacacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatggc 22493544  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22493543 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgcgg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttg 22493445  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22493444 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttggctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 22493345  T
Q  346 tctgtcatgtccttcatttttta 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  22493344 tctgtcctgtccttcatttttta 22493322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 46 - 388
Target Start/End: Original strand, 31644318 - 31644659
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||| |||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  31644318 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcatgtacagtgcagaacagtacaaga-agaatagcacaatacaaggtagaacaacacaagacaaatttttatgac 31644416  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31644417 attgaataattttatgttttatatgatttttaggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 31644516  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644517 gtgagggacaaaaatatgagtatttgtcttg-ctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 31644615  T
Q  346 tctgtcatgtccttcatttttt-agcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31644616 tctgtcccgtccttcattttttaagcaaatcaaacgcaccctaa 31644659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Original strand, 24036105 - 24036436
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  24036105 ggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactgtactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaacacatgacaaattttt--gacat 24036202  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24036203 tgaataattttttgttttatacgatttttggggtgcaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggt 24036302  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||     
T  24036303 gagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctgtacctgaaacagttttccaaatcaaacactggacaacttgaattgttt 24036402  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24036403 tgtcctgt-cttcattttttagcaaatcaaacgca 24036436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 98 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31880250 - 31879960
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31880250 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgtattatacgattgttgggggacaaaatgctatttt 31880151  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31880150 ggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtc 31880051  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31880050 ctgtacctgaaacagttttactaatcaaacactgaacaactagagttgttatatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31879960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7208404 - 7208112
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| |||||| |||||   |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7208404 agaacagtacaatacaagacggaacagcacgggacaaatattttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctatttt 7208305  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  7208304 ggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggttctgtctcttgcatccagtttgtc 7208205  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7208204 ccgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaag 7208112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 71 - 382
Target Start/End: Original strand, 40489232 - 40489543
Alignment:
Q  71 taagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatac 169  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| || | ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40489232 taagtattggacagaatagtacaagattgaacagtacaacataaagcagaacaatgcatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatac 40489331  T
Q  170 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 269  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40489332 aatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttt 40489431  T
Q  270 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttag 369  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  40489432 tgtcccgtcccttgcctccagtttgtcttctacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttattctgtcctgtcctt-attttttag 40489530  T
Q  370 caaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||    
T  40489531 caaatcaaacgca 40489543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 39788114 - 39788400
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 195  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39788114 agaacagtacaacataatgcagaacagcacatgacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaaatgttattt 39788213  T
Q  196 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 295  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  39788214 tagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctacagtttgt 39788313  T
Q  296 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39788314 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagaattgttctgtcctgtcctttattttttaacaaatcaaacgca 39788400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23091478 - 23091193
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattt-ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23091478 agaacagtacaacacaagatagaacaacacaagacaaatttcttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 23091379  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23091378 gatattttagacaatttatacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgacggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttatc 23091279  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23091278 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacttgagtagttatatcttgtcattcattttttagcaaatcaaacgca 23091193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18470644 - 18470321
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | |||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  18470644 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaatacaagacataacagcacagaacaaatttttatggtattgaataa 18470545  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  18470544 tttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtaagggac 18470445  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  18470444 aaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcttg 18470345  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  18470344 tccttcattttttaacaaatcaaa 18470321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 44 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7726036 - 7725702
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||   |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  7726036 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactagacataacagtacaagacagtacatcacaacacaaggtagaatagtataggacaaatttttatg 7725937  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg-atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7725936 gaattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggatattt-agacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 7725838  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  7725837 ttaatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacaattttactaatcaaacactggacaactgaagt 7725738  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7725737 tgttttgtcctgtccttaattttttagcaaatcaaa 7725702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28090726 - 28090461
Alignment:
Q  64 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgt 162  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  28090726 aaaacattaagtattggacagaaca--ataagatagaacagtacaactcacggcagaacagtacaggacaaattttttatattattgagtaattttttgt 28090629  T
Q  163 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28090628 tttatacgatttttgagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatat 28090529  T
Q  263 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28090528 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 28090461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 379
Target Start/End: Original strand, 553358 - 553601
Alignment:
Q  137 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  553358 ttttatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 553457  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  553458 ttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttataaatcaaacactagacaa 553557  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
     || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  553558 ttaaagttgttctgtcatattcttcattttttagcaaatcaaac 553601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571546
Alignment:
Q  108 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 206  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  5571806 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaa--tgctattttggtattttag 5571709  T
Q  207 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 306  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5571708 acaacttgtacgttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg- 5571610  T
Q  307 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
                |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5571609 ------------aatcaaacactggacaactagagttgttttgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 5571546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 126 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8561126 - 8560871
Alignment:
Q  126 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      
T  8561126 acatgacaaatttttatggcattgattaattttttgttttatacgatttttg-gggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacctggaaca 8561028  T
Q  226 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8561027 aaaagttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgctttcagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaa 8560928  T
Q  326 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| | ||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8560927 cactgaataactgaagttgttatgtcacgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 8560871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32093183 - 32092874
Alignment:
Q  69 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 168  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||   | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||    
T  32093183 agtaagtactggacagaacagtaagagacagaacaacataacacaaggcagaacagcacaacacaaatttttatggtattgaaaatttttatgttttata 32093084  T
Q  169 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 268  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  32093083 taatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-ggacaaaaatttcagttt 32092985  T
Q  269 ttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttta 368  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32092984 ttgtcctatcctttgcctccaatttgtcctgttcctgaaacaattttacaaatcaaacactgcacaactggagttgttctgtcttgtccttcatttttta 32092885  T
Q  369 gcaaatcaaac 379  Q
      |||||||||    
T  32092884 taaaatcaaac 32092874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 700798 - 700513
Alignment:
Q  75 tactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatt 173  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  700798 tactggacataacagtacaagacaaaataatacaacacaaggtagaacagcacatgacaaaatttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatt 700699  T
Q  174 tttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 273  Q
    || | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  700698 ttcgggggacaaaataatattttggtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgaatttttgtt 700599  T
Q  274 atgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 359  Q
     ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  700598 ttgtcccttgtctcttgtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaatcattgaacaactagagttgttttgtcatgtcctt 700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 374
Target Start/End: Original strand, 5673018 - 5673329
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||| |||||||||| |    
T  5673018 tgtgtttggtttacaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatataacagcacaacacaaggcataacatcaaaggacaaatattttatggcaat 5673117  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  5673118 gagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 5673212  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||         ||||||||||||    ||||||||||||||| |    
T  5673213 agggacaaaaatatgagtttttgacttgtcccttgcctccagtttatcgtgtacctga---------acaaatcaaacatcaaacaactagagttgttat 5673303  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaat 374  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5673304 gtcttgtccttcattttttagcaaat 5673329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37148790 - 37148478
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  37148790 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataatacagaacagcacaacacaaggtataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataa 37148691  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||| || |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||               |||||||| |||||||||||||| |     
T  37148690 tttcttattttatattctttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaactt---------------agttgtgccgtggtttggtgaggaac 37148606  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||     
T  37148605 aaaaatttcagtttttgtcccgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaattgacaactggagttgttctgtcata 37148506  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37148505 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 37148478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 267
Target Start/End: Original strand, 40182335 - 40182556
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 145  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40182335 gggtgtgtttggtttccaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagaaagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacatgacaaattttttatggc 40182434  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  40182435 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 40182534  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtt 267  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  40182535 gtgagggacaaaaatataagtt 40182556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27839180 - 27838951
Alignment:
Q  164 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatg 263  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |     
T  27839180 ttatacgatttttggaggacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgttttatggtttggtgagggacaaaaattta 27839081  T
Q  264 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 363  Q
     |||||  || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27839080 tgtttta-tcctgtccattgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 27838982  T
Q  364 ttttagcaaatcaaacgcaacctaagaatga 394  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  27838981 ttttaacaaatcaaacgcaccctaaggatga 27838951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22432471 - 22432243
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |   ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22432471 acaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatatgattgatt---ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 22432375  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    |||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22432374 gacaacttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttatcctgaacctg 22432275  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22432274 aaacagttttacaaatcaaacataggacaact 22432243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 5598484 - 5598687
Alignment:
Q  179 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 278  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||| | ||    
T  5598484 gggacgaaatgttattttgatattttagacaagttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgttgtttgatgaaggacaaaaatatctgtttttgtcctctc 5598583  T
Q  279 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5598584 ccttgcctccagtttgtctcgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacttgagttgttctgttctgtgcttcattttttagcaaatcaaa 5598683  T
Q  379 cgca 382  Q
    ||||    
T  5598684 cgca 5598687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 267 - 382
Target Start/End: Original strand, 4664923 - 4665038
Alignment:
Q  267 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 366  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4664923 ttttgtcatgtcccttgcctcctgtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcatgtccttcattttt 4665022  T
Q  367 tagcaaatcaaacgca 382  Q
     | |||||||||||||    
T  4665023 aatcaaatcaaacgca 4665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 368
Target Start/End: Original strand, 17031134 - 17031350
Alignment:
Q  152 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 251  Q
    |||||||| || ||||| |||||||   |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  17031134 taatttttggtcttatatgattttttgtggacaaaaagctatttttgtattttaaataacttgtacgtgggacgaaaagttgtgctgtgatttaatgagg 17031233  T
Q  252 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 351  Q
    |  |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||  ||||    
T  17031234 ggcaaaaatttatgtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtactgtccctgaaacagttttacaaatcaaacattatacaagtggagttgtgttgtc 17031333  T
Q  352 atgtccttcatttttta 368  Q
     ||||||||||||||||    
T  17031334 ttgtccttcatttttta 17031350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Original strand, 20119642 - 20119777
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20119642 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttaatagca 20119741  T
Q  147 ttgagtaa---ttttttgttttatacgatttttgag 179  Q
    |||| |||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  20119742 ttgaataatatttgtttgttttatatgatttttgag 20119777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 123
Target Start/End: Original strand, 548218 - 548295
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  548218 agggtgtgtttggtttgcaaaacattaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaaca 548295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 187
Target Start/End: Original strand, 32313713 - 32313850
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 149  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||   | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  32313713 tgtgtttgatttgctaaacaataagtacttgacataaaagtataagacagaacaacataacacaagacagaacaacacatgacaaatttgtatagtattg 32313812  T
Q  150 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa 187  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||    
T  32313813 attaatttttgatcttatacgatttttgctggacaaaa 32313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 382
Target Start/End: Original strand, 40182553 - 40182595
Alignment:
Q  340 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40182553 agttgttctgtcatttccttcattttttagcaaatcaaacgca 40182595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 216
Target Start/End: Original strand, 1338601 - 1338661
Alignment:
Q  156 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1338601 tttttgttatatacgatatttgatggacaaaaaattattttgatattttagacaacttgta 1338661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Original strand, 29241264 - 29241308
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29241264 gggtgtgcttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 29241308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 31880286 - 31880242
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880286 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 31880242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29788618 - 29788507
Alignment:
Q  109 acacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 208  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||  || |||||| |||||||   ||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  29788618 acacaagatagaacaacacatgataaacttttatggtattgaatagtttt--gtcttatacaatttttggttgatcaaatgttattttaatattttagac 29788521  T
Q  209 aacttgtacgtggg 222  Q
    |||||| |||||||    
T  29788520 aacttgaacgtggg 29788507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7208441 - 7208396
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7208441 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagta 7208396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21739053 - 21739019
Alignment:
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739053 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 21739019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Original strand, 35955088 - 35955150
Alignment:
Q  264 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 326  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||    
T  35955088 agtttttgtcttgtctcatgcctccagtttgtcatgtctttgaaacaattttacaaatcaaac 35955150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 46 - 379
Target Start/End: Original strand, 2614766 - 2615100
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2614766 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 2614865  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2614866 cattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 2614965  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2614966 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacagtggacaactagagttg 2615065  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2615066 ttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaac 2615100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 43 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15277199 - 15276853
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttta 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  15277199 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgacaaaaatttta 15277100  T
Q  142 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  15277099 tggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgctattttgttcttttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtgg 15277000  T
Q  242 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15276999 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagag 15276900  T
Q  342 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15276899 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaa 15276853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 3259548 - 3259895
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac------aaatttt 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||      || ||||    
T  3259548 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaggattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacatgacaaattttt 3259647  T
Q  140 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3259648 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgt 3259747  T
Q  240 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259748 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 3259847  T
Q  340 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3259848 agttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcatccta 3259895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 55 - 389
Target Start/End: Original strand, 17867714 - 17868049
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17867714 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17867813  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17867814 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17867913  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17867914 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17868013  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17868014 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 17868049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 55 - 389
Target Start/End: Original strand, 17877497 - 17877832
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17877497 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17877596  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17877597 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17877696  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17877697 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17877796  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17877797 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 17877832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 59 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32410098 - 32409774
Alignment:
Q  59 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 157  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  32410098 tttgcaaaacagtaaatactagacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgaataattt 32409999  T
Q  158 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32409998 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtgagtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaa 32409899  T
Q  258 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32409898 aatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttattctgtcatgtcc 32409799  T
Q  358 ttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32409798 ttcattttttagcaaatcaaacgca 32409774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 24203236 - 24203569
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24203236 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacatgatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcat 24203335  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24203336 tgagtaattttttgttttatacaatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 24203434  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203435 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttc 24203534  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24203535 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 24203569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 55 - 354
Target Start/End: Original strand, 24242543 - 24242843
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24242543 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaagagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagta 24242642  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24242643 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 24242742  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24242743 caaaaatatgagtttttgttgtgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 24242842  T
Q  354 g 354  Q
    |    
T  24242843 g 24242843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 63 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15277522 - 15277195
Alignment:
Q  63 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  15277522 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggtaaaacaacacagaacaaattttttatagcattgagtaatttgttg 15277423  T
Q  162 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 261  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15277422 ttttatacgatttttggaagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 15277323  T
Q  262 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  15277322 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacaattttacaaatcaaacactggacaaatagagttgttttgtcttgtctttca 15277223  T
Q  362 ttttttagcaaatcaaacgcaacctaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15277222 ttttttagcaaatcaaacgcaccctaag 15277195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 380
Target Start/End: Original strand, 10959872 - 10960205
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||   ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10959872 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagacagaacatcacagcacaaggcagaacaacacatgacaaatttttatggca 10959971  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  10959972 ttgaatgatattttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgt 10960071  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10960072 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 10960171  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10960172 ctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacg 10960205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 11212131 - 11212464
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  11212131 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatgttttatggcctt 11212230  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| || ||||||||||||    
T  11212231 gagtaattttttgttttattcgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgcacgtgagacaaaaggttatgttgtggtttggtg 11212330  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212331 agggacaaaagtatgagtttttgtcatgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 11212430  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212431 gtcccgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 11212464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3933064 - 3932729
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3933064 ggtgtgtttggtttgcaaaataacaagtattggataaaacagtataagatagaacagtacaacacaagacaaaacagcacaggacaaattttttatggca 3932965  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3932964 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgg 3932865  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3932864 tgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgccccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgtt 3932765  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3932764 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3932729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 58 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10324358 - 10324035
Alignment:
Q  58 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  10324358 gtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatgggattgagtaatt 10324259  T
Q  157 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 256  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10324258 ttttgttttatacgattttttggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 10324159  T
Q  257 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  10324158 aaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactgaacaactagagttgttctgttctgtc 10324059  T
Q  357 cttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10324058 cttcattttttagcaaatcaaacg 10324035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 98 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 167130 - 166844
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  167130 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacgaaatgctatttt 167031  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  167030 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgtcccttgcctctagtttgtc 166931  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  166930 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaagtagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 166844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11614035 - 11613708
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||||    
T  11614035 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacacgatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatggc 11613950  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11613949 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttatacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11613850  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11613849 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgtctccattttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 11613750  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11613749 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 11613708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 10485038 - 10485364
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  10485038 ttggtttgtaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaaggga-aacaacacaggacaaatatttatgacattgaataa 10485136  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  10485137 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 10485236  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  10485237 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaataattttacaaatcaaacactggacaactggagttgttttgtcttg 10485336  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10485337 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 10485364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Original strand, 34176752 - 34177037
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176752 agaacagtacaacataagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34176851  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34176852 ggtattttagactacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcatgtcacttgcctccagtttgtc 34176951  T
Q  297 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176952 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaagtgacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34177037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Original strand, 17443135 - 17443464
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  17443135 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatattggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacat 17443234  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  17443235 tgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggt 17443334  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||         
T  17443335 gagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatggttttacaaatcaaacactggacaactaaagt----- 17443429  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17443430 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 17443464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 88 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32132597 - 32132342
Alignment:
Q  88 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaa 186  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32132597 agtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaa 32132498  T
Q  187 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32132497 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcct 32132398  T
Q  287 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32132397 ccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 32132342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 152 - 382
Target Start/End: Original strand, 11382041 - 11382269
Alignment:
Q  152 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  11382041 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag- 11382139  T
Q  252 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 351  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382140 -acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtc 11382238  T
Q  352 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382239 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 11382269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14925713 - 14925378
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  14925713 gggtgtgtttggtttgcaaagaagtaagtacgggacataacagtaaaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgaca 14925614  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  14925613 ttgaataattttatgttttatacgatttttaggggacggaatgctattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttgg 14925514  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  14925513 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtc 14925414  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
     |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14925413 atgtcctgtccttcattttttaacgaatcaaacgca 14925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Original strand, 18057399 - 18057726
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  18057399 ttggtttgcaaaacagtaagtattggatagaacagtaaaagatagaacagcacaacacaaggcataatagcacaggacaaatttgtatgacattgaataa 18057498  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18057499 ttttatgttttatacgatttttagaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggac 18057598  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || || ||    
T  18057599 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacatctagtttgtcatgtatctcaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttgtcctatcctg 18057698  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18057699 tccttcattttttagcgaatcaaacgca 18057726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 137 - 380
Target Start/End: Original strand, 11279090 - 11279333
Alignment:
Q  137 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  11279090 ttttatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgt 11279189  T
Q  237 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 336  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279190 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 11279289  T
Q  337 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11279290 tggagttgttctgtcccgtctttcattttttagcaaatcaaacg 11279333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31870349 - 31870019
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31870349 ttggtttgcaaaacatcaagtattgtacataacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataa 31870250  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31870249 ttttttgttttatacgagttttgggggacgaaatgctatttttgtattttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31870150  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc---tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 351  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31870149 aaaaatatcagtttttgttttgtcccttgcctctagtttgttctgttgttcctgagacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtc 31870050  T
Q  352 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31870049 cagtccttcattttttagcaaatcaaacgca 31870019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 60 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11675619 - 11675296
Alignment:
Q  60 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| |||||   |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11675619 ttgcaaaacagtaagtattggacataacaatacaagacagaacaacacaacaaaaggtaaaatagcacatgacaaatttctatagcattgaataattttt 11675520  T
Q  160 t-gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 258  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  11675519 ttgttttatacgatttttgggggacgagatgccatttaggtattttacaaagcttgtacgtgggataaaaagttgtgttatggtttggtgagagacaaaa 11675420  T
Q  259 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 358  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |    
T  11675419 atatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtcttgtctt 11675320  T
Q  359 tcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  11675319 tatttttttagcaaatcaaacgca 11675296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 55 - 380
Target Start/End: Original strand, 3379591 - 3379915
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||||||||| || |||| ||||    ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  ||    
T  3379591 ttggtttgcaaaaccgcaagtatcggacagaacaatacaagacagaataacacaacacaatgcagaacagtacatgtcaaattttaa--gcattgaacaa 3379688  T
Q  155 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3379689 tttttttgttttatatgatttttggaggacgaaatgctattttggtatttaagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctatggtttggtgagcga 3379788  T
Q  254 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
     |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3379789 caaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactaaagttgttctatcat 3379888  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3379889 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 3379915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 55 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18597407 - 18597080
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||   ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  18597407 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacagaacagtacaaagcagaacaacacaacactaggtagaacaacacataataaatttttatggtattgaataa 18597308  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  18597307 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaagtactattttagcgttttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 18597208  T
Q  255 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 354  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||  |    
T  18597207 aaaaatttcagattttgtcatgtcccttgcctccggtttgtcatatccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaattgttcaatcccg 18597108  T
Q  355 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18597107 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 18597080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 387
Target Start/End: Original strand, 32859922 - 32860263
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||   |||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  32859922 agggtgtgtttgatttgtagaacagtaagtattggacataacagtacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaatacaaatttttatggt 32860021  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  32860022 attgaataattttctgtattatttgatttttgggtgacgaaatgttatttttgtattttagaaaacttgtacgtgagacaaaaggttgtgctgtggtttg 32860121  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    | || ||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32860122 gcgatggacaaaaattgcagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 32860221  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32860222 tttgtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgcacccta 32860263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 138 - 382
Target Start/End: Original strand, 3290635 - 3290866
Alignment:
Q  138 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 237  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  3290635 tttatgacattgaataattgtttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtggga--aaaagttgtgtt 3290732  T
Q  238 gtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 337  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3290733 gtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt-----------tgacacagttatacaaatcaaacactgaacaact 3290821  T
Q  338 agagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3290822 agagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3290866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8178141 - 8177804
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || |||||||||  | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||    
T  8178141 agggtgtgtttggtttgcaaaacatgaagcactggatagaacaatacaagatagaatagcacaacacaagacagaacagtacatgacaagttttaatagc 8178042  T
Q  146 attga--gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    |||||   |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  8178041 attgaacatttttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgaacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 8177942  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |  ||||    
T  8177941 tggtaagggacaaaaatatca-tttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtacctgaaacagttttataaatcaaacaccggataattgaagtt 8177843  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8177842 gttttttcatgtcctttattttttagcaaatcaatcgca 8177804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 382
Target Start/End: Original strand, 29054239 - 29054563
Alignment:
Q  56 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 155  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||    
T  29054239 tggtttgcaaaataataagtactggacataacagtacaagataggacaacacaacataagacagaacagcacaagataaatttt-atggtattgaataat 29054337  T
Q  156 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 255  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29054338 tttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgttattttg-tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggaca 29054436  T
Q  256 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 355  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  | || ||||||  |||    
T  29054437 aaaattgtagtttttgtcatgtcccttgcttccaatttgtcctgttcctgaaactgttttacaaatcaaacattggacagctttaattattctgttctgt 29054536  T
Q  356 ccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29054537 ccttcattttttatcaaatcaaacgca 29054563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 380
Target Start/End: Original strand, 23636097 - 23636428
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||   |||||| |||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  23636097 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggatataacagtacaagacagaacaacacaacagaaggcagaactgtacatgacagttttttatggcatt 23636196  T
Q  149 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 248  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||   ||||| | |||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||  ||    
T  23636197 gaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggatttttaaataacttgtacgtgagacaaaaatttgtgttgtggtttaatg 23636296  T
Q  249 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 348  Q
    |   | |||||||||||||||| || | | |||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23636297 aataacaaaaatatgagtttttatcctattccttgcatccagtttatcatgtacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttct 23636396  T
Q  349 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23636397 gtcatatccttcattttttagcaaatcaaacg 23636428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9902857 - 9902579
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat-tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 204  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||  |||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9902857 acaacacaaggcagatcagtacataacaattttttataacattgaataaaatttttggtttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttt 9902758  T
Q  205 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 304  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  9902757 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttaatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttacctctagtttgtcctatacct 9902658  T
Q  305 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 383  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9902657 gaaacagttcaacaaattaaacactgaacaactgaagttgttctatcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 9902579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4494348 - 4494079
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  4494348 ttggtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtacaggatagaacagcacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcaatgagta 4494249  T
Q  154 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 253  Q
    ||||||||                 ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4494248 attttttg-----------------gggacaaaatgttatttcggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgaggga 4494166  T
Q  254 taaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 339  Q
     |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4494165 caaaaatatgagttttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagtcttacaaatcaaacactggacaactag 4494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34684247 - 34683929
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt--ttt 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||   |||||| |||| | |||| |||| || |||    |||    
T  34684247 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagacaggacaacacaacataaggcataacaacacaggataaaaaagttt 34684148  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgata-ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 239  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  34684147 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtatttttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgt 34684048  T
Q  240 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 339  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34684047 ggtttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacc--------ttttacaaatcaaaaactggacaactag 34683958  T
Q  340 agttgttctgtcatgtccttcatttttta 368  Q
    ||||| |||| | | ||||| ||||||||    
T  34683957 agttggtctgacctatcctttatttttta 34683929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14808254 - 14807940
Alignment:
Q  50 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 149  Q
    |||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14808254 tgtgtttggtttgcaaaacaacaaatattgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatggaattg 14808155  T
Q  150 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 249  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  14808154 aataatttttagttttatacgatttttgggggatgaaatgttattttggta-cttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 14808056  T
Q  250 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 349  Q
    |||| |||||||| | ||||| || | ||||||||||| |||||                  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14808055 gggacaaaaatatcaatttttatcctatcccttgcctctagttt-----------------attttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctg 14807973  T
Q  350 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807972 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 14807940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Original strand, 29814736 - 29814887
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa-atttttatggc 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  29814736 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttatggc 29814835  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29814836 attgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 29814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Original strand, 28502330 - 28502482
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt--atgg 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||   |||    
T  28502330 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttattgg 28502429  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28502430 cattgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 28502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7396302 - 7396048
Alignment:
Q  125 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||     
T  7396302 cacatgacaaatttttatggtattgaataatttt--gtctcataccatttttgatggacaaaacactatttttgtattttagataacttgtacgtgagac 7396205  T
Q  225 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 324  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||| || | | |  ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7396204 aaaaagttgtgtagtggtttagtgagggacaagatt-tctgtttttgtcctgtccattgcttccagcttgtcatgtcccagaaacagctttacaaatcaa 7396106  T
Q  325 acactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||   ||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7396105 acaccatacaactgaaattgttttgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgca 7396048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 378
Target Start/End: Original strand, 9613998 - 9614177
Alignment:
Q  199 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9613998 tattttagacaacttatacgtggaacaaaaaattgtgttgcggtttagtgagtaacaaaaacttcaaattttgtcatgtcccttgcctccagtttatcct 9614097  T
Q  299 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9614098 gtccttgaaacagttttacaaatcaaacattgtacaactgaagttttcttgttatgtccttcattttttagcagatcaaa 9614177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 140
Target Start/End: Original strand, 32805348 - 32805442
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32805348 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttt 32805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 35004326 - 35004087
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||| || |||||| |||||| |  |||||||  ||||||||||||||||    
T  35004326 acaatacaaggcagaacaacacataacaaacttttatgatattgaatagtttttggtattatacaattttttattgacaaaaatctattttgatatttta 35004227  T
Q  206 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 305  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||| |||||||   |||| || |||||  | |||||||||| |||| |||| |||| |||| || ||| |       
T  35004226 gaaaacttgtacgtgggacaaagagttgtgttgtggttatatgagagacaaaaaatttagtttttgtcttgtctcttgtctccggtttatcttgtcctat 35004127  T
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  35004126 aaaccgttttacaaatcaaacaccgcacaactggagttgt 35004087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27824849 - 27824620
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtag-aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 204  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||    
T  27824849 acaacacaaggttggaacaatacatgacaaacttttatggtattgaataatttttgatcttatatgatttttgttggacaaaaagctatttttgtatttt 27824750  T
Q  205 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 304  Q
     || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||| ||   | |   || || || | ||||||||||| |||||||||| | ||     
T  27824749 ggataactcgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtataatgagggacaatttttt---ttcttctcttatcccttgcctctagtttgtcctttccca 27824653  T
Q  305 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27824652 aaaacagttttacaaatcaaacactgtacaact 27824620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 11381964 - 11382040
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 123  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11381964 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 11382040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14925215 - 14925139
Alignment:
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14925215 aaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 14925139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9200491 - 9200316
Alignment:
Q  201 ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt-gcctccagtttgtcctg 299  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  9200491 ttttaaacaatttgtatgtgggacaaaaagttgttatatggtttggtgagggagaagaatttttgtttttgtcttgtctcttagcctctagtttgtcatg 9200392  T
Q  300 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatc 375  Q
    |   | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9200391 tctttaaaacagttttacaaatcaaacattgtacaacttgagttgtcatgtcttgtccttaactttttagcaaatc 9200316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 381
Target Start/End: Original strand, 33041403 - 33041472
Alignment:
Q  312 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  33041403 ttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctattcttcattttttaacaaatcaaacgc 33041472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 112
Target Start/End: Original strand, 11279012 - 11279075
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacac 112  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11279012 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacac 11279075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 379
Target Start/End: Original strand, 13415861 - 13415928
Alignment:
Q  312 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13415861 ttttacaaatcaaacactgtacaactagagttgttatgttctgtctttcgttttttagcaaatcaaac 13415928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28967414 - 28967221
Alignment:
Q  184 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| | |||||||  ||||   | ||  |  |  |||||||||  ||| | ||    
T  28967414 aaaatgctattttgataatttagacaacttgtacttgaaataaaaagttgggttgtggttcagtgaaaaacaatcacttttgtttttgtcccgtctcgtg 28967315  T
Q  284 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||| |||  | || |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28967314 cctccagtttgtcatgttcttggaacagttttacaaattaaagactctataattgaagtt-ttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 28967221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 379
Target Start/End: Original strand, 34402850 - 34402992
Alignment:
Q  229 agttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 328  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| || ||| | |||||||||| | |||||   |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    |    
T  34402850 agttgtgctgtgatttgataagggacaataatttcagtttttgtcgtatccct---ctccagtttgttttgt-cctgaaacaattttacaaatca----c 34402941  T
Q  329 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34402942 tggacaattgaagttgttctgtcttgtcctccattttttaacaaatcaaac 34402992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32614136 - 32614030
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||    
T  32614136 acaacacaaggcataacaacatatgacaaacttttatggtattatataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaagttatttttatatttta 32614037  T
Q  206 gacaact 212  Q
    || ||||    
T  32614036 gataact 32614030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Original strand, 34176715 - 34176760
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34176715 agggtgggtttggtttgcaaaacggtaagtactggacagaacagta 34176760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 167170 - 167122
Alignment:
Q  43 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  167170 ctaagggtgtgtttgatgtgcaaaacagtaaatactggacagaacagta 167122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Original strand, 27756314 - 27756370
Alignment:
Q  184 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||    
T  27756314 aaaatgttattttgatattttagacaacttatacgggggacaaaaagttgtgttgtg 27756370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29424570 - 29424498
Alignment:
Q  306 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29424570 aaacaattttacaaataaaacactatagaattagagttgtcatgtcatgtcctttattttctagcaaatcaaa 29424498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29203104 - 29202990
Alignment:
Q  126 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 225  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| || ||||   ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||      
T  29203104 acatgacaaatttttatgatattgaacaattatttgtcttatatgaatttttgtggacaaaatgct-ctttggtattttaaacaacttgtacttgagaga 29203006  T
Q  226 aaaagttgtgctgtgg 241  Q
    |||||||||| |||||    
T  29203005 aaaagttgtgttgtgg 29202990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16542440 - 16542362
Alignment:
Q  139 ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||  | | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16542440 ttatggtattgaataattttttatcttatacaatttttgttgcataaaaggttattttggtattttagacaacttgtac 16542362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 24785106 - 24785168
Alignment:
Q  226 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 288  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24785106 aaaaattgtgttgtggtttagtgagcgacaagaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctcc 24785168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29424734 - 29424652
Alignment:
Q  137 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  29424734 ttttatggtattgaataatttttggtcttgtacgttttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacttgtacgt 29424652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15400760 - 15400672
Alignment:
Q  126 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15400760 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15400672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15412547 - 15412459
Alignment:
Q  126 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15412547 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15412459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15428141 - 15428053
Alignment:
Q  126 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 217  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15428141 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15428053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Original strand, 7365318 - 7365422
Alignment:
Q  106 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 205  Q
    |||||||||| || || | ||||| | | |||||||||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   |||||||   ||||||||||||||||    
T  7365318 acaacacaagttaaaataacacataatatatttttatggtattaaataatttttagtcttataccattttttgcggacaaatgactattttgatatttta 7365417  T
Q  206 gacaa 210  Q
    |||||    
T  7365418 gacaa 7365422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 46 - 382
Target Start/End: Original strand, 101819 - 102156
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  101819 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacagaacagtataagatagaacagtacaatataaggtagaacagcacaggacaaattttttatgg 101918  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  101919 cattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 102018  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  102019 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccgttgcctccaagttgtcctgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 102118  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102119 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 102156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 47 - 387
Target Start/End: Original strand, 23448 - 23787
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  23448 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcactggacaaattttttatggc 23547  T
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23548 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 23645  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 345  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23646 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 23745  T
Q  346 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23746 tctgtcctgcccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 23787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 330
Target Start/End: Original strand, 19857 - 20062
Alignment:
Q  125 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 224  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |  |||| |||||||||| | ||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||  |     
T  19857 cacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggcgttatgcgatttttgatgaacaaaagactattttggtatttcaaacaacttgtacgtgaaac 19956  T
Q  225 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 324  Q
     ||||||||| | ||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||| ||||||  || || |||||| | |  || ||||||||||||| |||||    
T  19957 aaaaagttgtacagtggtttagtgagtgacaagaatttcagtttttgtcatatcccttttctacaatttgtcttatctctaaaacagttttacatatcaa 20056  T
Q  325 acactg 330  Q
    ||||||    
T  20057 acactg 20062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 44 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2566 - 2222
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2566 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 2467  T
Q  143 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2466 gacattgagtaattttttgttttataggatttttatgggacaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2367  T
Q  243 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  2366 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact-gaaaactaaagt 2268  T
Q  343 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 388  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2267 tgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 2222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 48 - 382
Target Start/End: Original strand, 51311 - 51645
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  51311 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtataatacaagacagaacagcacaagacaaattttttatgaca 51410  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  51411 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt-g 51509  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51510 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaaagttgtt 51609  T
Q  347 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51610 ctgttttgtccttcattttttatcaaatcaaacgca 51645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 42 - 387
Target Start/End: Original strand, 15038 - 15384
Alignment:
Q  42 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-ttt 140  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||   |||    
T  15038 tctatgggggtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgaaaaaaaattt 15137  T
Q  141 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  15138 atggcattgagtaatttgttgttttataagatttttgggggacaaaatactattttagtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtg 15237  T
Q  241 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 340  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15238 gtttggtgggggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaga 15337  T
Q  341 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 387  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15338 gttgttttgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 15384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 48 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18278 - 17982
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  18278 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 18179  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18178 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 18079  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 17982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12760 - 12527
Alignment:
Q  48 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 146  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  12760 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 12661  T
Q  147 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12660 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 12561  T
Q  247 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12560 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccc 12527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4796 - 4468
Alignment:
Q  49 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4796 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 4703  T
Q  148 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  4702 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 4603  T
Q  248 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4602 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 4503  T
Q  348 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4502 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 4468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 72 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2695 - 2385
Alignment:
Q  72 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  2695 aagtactggacataacagtataagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgagattgggtaattttttgttttatacg 2596  T
Q  171 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  2595 atttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagac-aatagttgtgttgtggtttggttagggacaaagatatgagttttt 2497  T
Q  271 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 370  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  2496 gtcctgtccctttcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcttgtccttcaatttttagc 2397  T
Q  371 aaatcaaacgca 382  Q
    ||||||||||||    
T  2396 aaatcaaacgca 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 55 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5656 - 5332
Alignment:
Q  55 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  5656 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 5557  T
Q  155 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  5556 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 5457  T
Q  255 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 353  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  5456 aaaaatatgtgttttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgttct 5357  T
Q  354 gtccttcattttttagcaaatcaaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5356 gtccttcattttttagcaaatcaaa 5332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 104 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19258 - 18989
Alignment:
Q  104 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  19258 gtacaacacaaggtagaacagcacatggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtatt 19159  T
Q  203 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 302  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19158 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtac 19060  T
Q  303 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaat 374  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19059 ctg-aacagttttacaaatcaaacactggacaaatataattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaat 18989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 98 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15551 - 15262
Alignment:
Q  98 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  15551 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg----aaatgctatttt 15456  T
Q  197 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca--------tgtcccttgcctcc 288  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  15455 ggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtgatcttgtcccttgcctcc 15356  T
Q  289 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15355 agtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctatcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgca 15262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13554
Alignment:
Q  146 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 245  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||  ||  |||     
T  13704 attgattaattattggtcttatacgatttttgatggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacatgtgacaaaaagttgtgtcgtatttta 13605  T
Q  246 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 296  Q
    ||||| || | |||| | | |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13604 gtgagagacacaaatttcaatttttgtcatgtctattgcctccaatttgtc 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15587 - 15543
Alignment:
Q  47 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaacagta 15543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 136 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 373099 - 372856
Alignment:
Q  136 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  373099 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 373000  T
Q  236 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 335  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  372999 ttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatatcccttgtctccagttttttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacatttgacaa 372900  T
Q  336 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  372899 ctaaaattgttctgtcatatccttcattttttagcaaataaaac 372856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 373176 - 373130
Alignment:
Q  45 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  373176 aaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagta 373130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13913 - 13576
Alignment:
Q  45 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 144  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   | || |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||    
T  13913 aagggtgcgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataatgcagaacaacaaaatacaaggcataattgcacaggacaaatttttatgg 13814  T
Q  145 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 244  Q
     ||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  13813 tattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacggaatgctattttggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggttt 13714  T
Q  245 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 344  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13713 ggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 13614  T
Q  345 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13613 ttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 13576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1870 - 1531
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||   | ||| | ||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  1870 taagggtgcgtttgatttgcaaaacaataagtatttgacagaactgtacaaagcaaaacagcacaacacaagagagaacaacacagaacaaatttttatg 1771  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  1770 gtattgaataattttttgttttatatgacttttgagggacgaaatgctattttggttttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 1671  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  1670 tggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctatccttgaaacagttttacaaatcaaacactggagaactgaagtt 1571  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 383  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1570 gttctgttttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaa 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43176 - 42843
Alignment:
Q  44 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 143  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||| | |||| |||||| | || |  |||   ||||||||| ||    
T  43176 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtactagacagagcagtacaatgcagaacagcacaatacaaggcataataatacagatcaaatttttgtg 43077  T
Q  144 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 243  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  43076 gtattgaataatttcttgttttatatgattgtttggggacaacatgctattttggtgttttagacaa-ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 42978  T
Q  244 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 343  Q
    |||||||||| | |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  42977 tggtgagggacacaaatttcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacta-tggagtt 42879  T
Q  344 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 379  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  42878 gttctgtcttatccttcattttttaacaaatcaaac 42843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19201 - 19044
Alignment:
Q  226 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 325  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19201 aaaagttgtgttgagctttgatgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctgtttattctgtccctgaaacagttttacaaatcaaa 19102  T
Q  326 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 382  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19101 cactggataactggaattgttatgtcctatccttcatttttttaacaaatcaaacgca 19044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33678 - 33530
Alignment:
Q  137 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 236  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || |||||| | |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  33678 ttttatgatattgaataatttttggtcttatacaagttttgatggacaaaagcctattttggtattttatacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 33579  T
Q  237 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 286  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  33578 tgtggtttgatgagggacaagaatttca-tttttgtcatgtcccttgcct 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3791 - 3683
Alignment:
Q  108 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||||  |||||||  |||||||||    
T  3791 aacacaaggtagaatagtacatgacaaacttttatgatattgaataattttttatcttatatgatttttggtggataaaaaactatttttgtattttaga 3692  T
Q  208 caacttgta 216  Q
     ||||||||    
T  3691 taacttgta 3683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1112 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1112
Description:

Target: scaffold1112; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1127
Alignment:
Q  153 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1078 aatttttggttttatacgatttttgagggacaagatgatattttgatatt 1127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Original strand, 338757 - 338802
Alignment:
Q  46 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 91  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  338757 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University