View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16448_high_1 (Length: 730)

Name: NF16448_high_1
Description: NF16448
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16448_high_1
NF16448_high_1
[»] chr4 (191 HSPs)
chr4 (1-351)||(31959813-31960163)
chr4 (1-350)||(52569515-52569864)
chr4 (1-350)||(53707727-53708076)
chr4 (1-355)||(48174088-48174442)
chr4 (1-350)||(436162-436511)
chr4 (1-350)||(56375223-56375572)
chr4 (7-350)||(48622543-48622884)
chr4 (1-359)||(4440788-4441144)
chr4 (378-714)||(53710299-53710649)
chr4 (8-360)||(33190838-33191190)
chr4 (8-356)||(33227149-33227497)
chr4 (1-361)||(1777006-1777364)
chr4 (1-355)||(43433851-43434211)
chr4 (14-350)||(46582826-46583160)
chr4 (1-350)||(23906297-23906650)
chr4 (11-350)||(39100536-39100872)
chr4 (8-350)||(47265195-47265544)
chr4 (1-350)||(37797785-37798133)
chr4 (8-350)||(27450180-27450515)
chr4 (7-350)||(28236124-28236464)
chr4 (1-316)||(50286904-50287209)
chr4 (8-316)||(37773485-37773792)
chr4 (92-357)||(8286455-8286728)
chr4 (58-347)||(20192023-20192311)
chr4 (47-339)||(39708412-39708704)
chr4 (60-349)||(26037506-26037795)
chr4 (1-347)||(1793393-1793741)
chr4 (10-360)||(27983142-27983485)
chr4 (88-350)||(32479058-32479320)
chr4 (161-360)||(21236951-21237150)
chr4 (6-350)||(51421670-51422012)
chr4 (1-350)||(20591306-20591649)
chr4 (196-356)||(6957726-6957886)
chr4 (1-350)||(45204840-45205197)
chr4 (196-350)||(12494791-12494945)
chr4 (8-350)||(20601652-20601988)
chr4 (1-281)||(41009419-41009699)
chr4 (119-300)||(50679556-50679736)
chr4 (8-357)||(1211385-1211732)
chr4 (7-346)||(54470146-54470485)
chr4 (1-307)||(16002860-16003165)
chr4 (1-112)||(12494683-12494794)
chr4 (196-345)||(7947065-7947214)
chr4 (196-359)||(21528416-21528579)
chr4 (99-360)||(53518314-53518571)
chr4 (1-360)||(35690237-35690563)
chr4 (1-136)||(31458961-31459098)
chr4 (102-283)||(20821075-20821255)
chr4 (240-356)||(19154857-19154973)
chr4 (245-350)||(19969358-19969463)
chr4 (186-349)||(4548140-4548303)
chr4 (7-346)||(10208977-10209312)
chr4 (152-350)||(28351643-28351841)
chr4 (113-358)||(37488136-37488381)
chr4 (273-360)||(19061925-19062012)
chr4 (189-271)||(50862764-50862847)
chr4 (1-281)||(7092290-7092568)
chr4 (1-176)||(25257755-25257928)
chr4 (2-137)||(51252674-51252807)
chr4 (1-127)||(49987361-49987487)
chr4 (239-357)||(55007917-55008035)
chr4 (105-358)||(13805257-13805510)
chr4 (191-356)||(31961260-31961425)
chr4 (1-136)||(33709852-33709992)
chr4 (186-350)||(51811280-51811442)
chr4 (52-350)||(31897428-31897724)
chr4 (31-130)||(44047568-44047667)
chr4 (158-356)||(2589162-2589360)
chr4 (286-356)||(50238609-50238679)
chr4 (286-356)||(50238695-50238765)
chr4 (1-350)||(56224998-56225350)
chr4 (212-349)||(26024851-26024988)
chr4 (75-260)||(26356626-26356811)
chr4 (277-350)||(49939734-49939807)
chr4 (1-137)||(38570960-38571095)
chr4 (31-179)||(28497451-28497600)
chr4 (220-347)||(31459146-31459273)
chr4 (31-350)||(46371987-46372306)
chr4 (289-359)||(30634097-30634167)
chr4 (16-350)||(42639020-42639354)
chr4 (1-138)||(17900413-17900550)
chr4 (191-350)||(2557671-2557831)
chr4 (60-350)||(35555650-35555937)
chr4 (224-350)||(5306452-5306578)
chr4 (277-355)||(32633401-32633479)
chr4 (1-137)||(50662322-50662457)
chr4 (1-118)||(10775654-10775771)
chr4 (226-355)||(25574982-25575111)
chr4 (241-350)||(34208269-34208378)
chr4 (279-360)||(44719351-44719432)
chr4 (93-262)||(55579057-55579226)
chr4 (192-265)||(55809075-55809148)
chr4 (1-176)||(25755250-25755425)
chr4 (52-347)||(31339521-31339803)
chr4 (270-350)||(40932924-40933004)
chr4 (1-138)||(41192767-41192906)
chr4 (275-355)||(45209200-45209280)
chr4 (174-350)||(49987514-49987690)
chr4 (33-263)||(50680704-50680935)
chr4 (45-168)||(1427466-1427589)
chr4 (288-359)||(15661863-15661934)
chr4 (1-339)||(34233035-34233382)
chr4 (1-137)||(44360016-44360155)
chr4 (93-332)||(47372676-47372915)
chr4 (191-350)||(53540413-53540572)
chr4 (197-327)||(31043201-31043331)
chr4 (1-138)||(50471461-50471596)
chr4 (297-350)||(4879109-4879162)
chr4 (277-358)||(7066491-7066571)
chr4 (279-348)||(17900691-17900760)
chr4 (275-360)||(20105508-20105593)
chr4 (221-350)||(28550455-28550584)
chr4 (251-348)||(55388213-55388310)
chr4 (99-333)||(17666067-17666294)
chr4 (103-350)||(22420717-22420961)
chr4 (275-350)||(8284346-8284421)
chr4 (291-350)||(15665324-15665383)
chr4 (251-350)||(29209175-29209274)
chr4 (275-350)||(29399011-29399086)
chr4 (53-136)||(30621418-30621501)
chr4 (216-347)||(37042667-37042798)
chr4 (300-355)||(46153940-46153995)
chr4 (288-359)||(50967019-50967090)
chr4 (275-349)||(3979127-3979201)
chr4 (201-347)||(13296566-13296712)
chr4 (72-138)||(29398822-29398888)
chr4 (270-360)||(32339761-32339851)
chr4 (212-350)||(40018189-40018327)
chr4 (300-350)||(47372936-47372986)
chr4 (280-350)||(50869880-50869950)
chr4 (197-350)||(20999129-20999282)
chr4 (239-332)||(28486092-28486185)
chr4 (1-58)||(43070056-43070113)
chr4 (75-182)||(20131167-20131274)
chr4 (1-312)||(21106917-21107236)
chr4 (288-348)||(34585702-34585762)
chr4 (213-281)||(41009288-41009356)
chr4 (78-138)||(42285912-42285972)
chr4 (1-134)||(45423552-45423681)
chr4 (73-137)||(46715585-46715649)
chr4 (98-138)||(47611757-47611797)
chr4 (298-350)||(49738550-49738602)
chr4 (297-345)||(50862860-50862908)
chr4 (288-356)||(51438665-51438733)
chr4 (302-350)||(56130404-56130452)
chr4 (152-313)||(21945678-21945836)
chr4 (31-134)||(36557246-36557348)
chr4 (153-347)||(38841607-38841798)
chr4 (287-350)||(46236708-46236771)
chr4 (298-336)||(1380600-1380638)
chr4 (256-350)||(25427862-25427956)
chr4 (276-346)||(36255526-36255596)
chr4 (288-346)||(49686913-49686971)
chr4 (275-348)||(1095652-1095725)
chr4 (277-334)||(8598957-8599014)
chr4 (213-350)||(31403034-31403171)
chr4 (297-350)||(36799657-36799710)
chr4 (249-306)||(41729494-41729551)
chr4 (277-350)||(44360295-44360368)
chr4 (319-360)||(49454469-49454510)
chr4 (1-134)||(2588914-2589056)
chr4 (288-348)||(21359227-21359287)
chr4 (296-356)||(25959221-25959281)
chr4 (298-350)||(28348287-28348339)
chr4 (1-137)||(45175941-45176075)
chr4 (278-333)||(6958255-6958310)
chr4 (297-344)||(7544537-7544584)
chr4 (251-350)||(41192244-41192343)
chr4 (191-361)||(47147496-47147664)
chr4 (68-139)||(49738815-49738886)
chr4 (194-281)||(50288012-50288099)
chr4 (212-350)||(56439570-56439709)
chr4 (277-347)||(13262421-13262491)
chr4 (251-353)||(16875749-16875851)
chr4 (295-350)||(21879147-21879204)
chr4 (288-350)||(32613650-32613712)
chr4 (322-360)||(35585859-35585897)
chr4 (297-350)||(813147-813200)
chr4 (112-177)||(20605241-20605306)
chr4 (270-347)||(22241239-22241316)
chr4 (251-348)||(22873601-22873698)
chr4 (8-65)||(25967552-25967609)
chr4 (305-350)||(28764374-28764419)
chr4 (270-335)||(39761343-39761408)
chr4 (68-137)||(40018396-40018465)
chr4 (212-357)||(42293258-42293403)
chr4 (309-350)||(43774098-43774139)
chr4 (319-360)||(48451063-48451104)
chr4 (309-350)||(52357924-52357965)
chr4 (53-134)||(55768717-55768798)
chr4 (53-134)||(55832973-55833054)
[»] chr1 (174 HSPs)
chr1 (1-350)||(1210678-1211027)
chr1 (1-359)||(30202121-30202479)
chr1 (1-350)||(49347393-49347742)
chr1 (8-350)||(34792349-34792691)
chr1 (1-355)||(8671853-8672205)
chr1 (3-350)||(22090029-22090378)
chr1 (1-356)||(51601991-51602344)
chr1 (1-350)||(9592667-9593016)
chr1 (7-350)||(51440765-51441108)
chr1 (1-349)||(43240380-43240730)
chr1 (8-350)||(696209-696552)
chr1 (10-307)||(32230997-32231294)
chr1 (10-350)||(4001455-4001795)
chr1 (60-358)||(4029114-4029412)
chr1 (8-350)||(15085874-15086204)
chr1 (1-356)||(8391705-8392060)
chr1 (1-350)||(38807671-38808023)
chr1 (8-338)||(32082768-32083087)
chr1 (88-357)||(25979224-25979493)
chr1 (1-316)||(9509251-9509566)
chr1 (1-343)||(9599401-9599743)
chr1 (7-348)||(37462878-37463214)
chr1 (152-350)||(37311755-37311953)
chr1 (131-350)||(39318193-39318410)
chr1 (185-350)||(52921197-52921362)
chr1 (1-339)||(27847811-27848153)
chr1 (16-347)||(39140468-39140794)
chr1 (98-349)||(52561590-52561841)
chr1 (6-351)||(18469081-18469424)
chr1 (69-350)||(32404527-32404807)
chr1 (68-350)||(48431399-48431688)
chr1 (60-350)||(2544591-2544875)
chr1 (232-350)||(4707221-4707338)
chr1 (240-350)||(24020267-24020377)
chr1 (218-350)||(32079177-32079307)
chr1 (71-360)||(5338727-5339005)
chr1 (1-273)||(34827180-34827451)
chr1 (192-350)||(41560353-41560511)
chr1 (261-350)||(44751677-44751766)
chr1 (98-350)||(8796239-8796491)
chr1 (188-350)||(4415469-4415631)
chr1 (20-137)||(43423671-43423788)
chr1 (215-350)||(10200306-10200441)
chr1 (60-335)||(40416363-40416638)
chr1 (11-118)||(52561843-52561950)
chr1 (20-350)||(6025557-6025887)
chr1 (25-338)||(36623897-36624191)
chr1 (60-355)||(3818851-3819146)
chr1 (268-350)||(29577452-29577534)
chr1 (261-350)||(42337749-42337838)
chr1 (261-350)||(44941776-44941865)
chr1 (232-350)||(46423216-46423331)
chr1 (2-184)||(14225995-14226175)
chr1 (220-350)||(19936612-19936742)
chr1 (44-350)||(38868858-38869164)
chr1 (1-138)||(1661359-1661500)
chr1 (265-360)||(5113940-5114035)
chr1 (212-349)||(29128927-29129065)
chr1 (221-347)||(52532619-52532745)
chr1 (258-355)||(28090689-28090786)
chr1 (249-350)||(40568410-40568511)
chr1 (198-350)||(11941580-11941732)
chr1 (275-350)||(25715326-25715401)
chr1 (125-324)||(27520233-27520428)
chr1 (275-350)||(28533674-28533749)
chr1 (60-350)||(36339804-36340093)
chr1 (251-360)||(6084158-6084267)
chr1 (251-356)||(34444539-34444644)
chr1 (288-357)||(41165502-41165571)
chr1 (18-345)||(19908040-19908371)
chr1 (170-266)||(26299187-26299283)
chr1 (289-356)||(4318839-4318906)
chr1 (1-125)||(19936455-19936571)
chr1 (32-183)||(35828717-35828868)
chr1 (62-261)||(37263325-37263523)
chr1 (15-134)||(51812472-51812591)
chr1 (277-350)||(21769711-21769784)
chr1 (191-332)||(28511819-28511960)
chr1 (32-137)||(40419603-40419708)
chr1 (278-350)||(38877343-38877415)
chr1 (83-262)||(478695-478872)
chr1 (153-359)||(30833967-30834174)
chr1 (297-356)||(43481792-43481851)
chr1 (152-350)||(50806753-50806949)
chr1 (198-343)||(8676869-8677017)
chr1 (98-244)||(9002382-9002528)
chr1 (103-333)||(42501143-42501373)
chr1 (270-348)||(52073050-52073128)
chr1 (252-349)||(4590533-4590630)
chr1 (1-133)||(17815408-17815537)
chr1 (1-166)||(18793172-18793337)
chr1 (287-356)||(26299287-26299356)
chr1 (253-358)||(50636266-50636371)
chr1 (288-356)||(2914117-2914185)
chr1 (223-355)||(7133297-7133429)
chr1 (188-268)||(8628150-8628230)
chr1 (212-303)||(7762484-7762575)
chr1 (275-350)||(26113439-26113514)
chr1 (275-350)||(50846769-50846844)
chr1 (58-249)||(52832035-52832226)
chr1 (251-313)||(109030-109092)
chr1 (1-136)||(4379938-4380081)
chr1 (297-359)||(22175374-22175436)
chr1 (70-261)||(27637720-27637913)
chr1 (60-137)||(52073675-52073753)
chr1 (221-350)||(52739510-52739640)
chr1 (285-350)||(3777260-3777325)
chr1 (278-335)||(7124351-7124408)
chr1 (16-246)||(10272211-10272436)
chr1 (5-58)||(16142176-16142229)
chr1 (273-350)||(32111989-32112066)
chr1 (1-74)||(52442780-52442853)
chr1 (288-360)||(31274391-31274463)
chr1 (303-355)||(38758015-38758067)
chr1 (113-233)||(50771673-50771792)
chr1 (251-350)||(11584180-11584279)
chr1 (66-221)||(13827699-13827854)
chr1 (277-348)||(15437130-15437201)
chr1 (212-311)||(16142019-16142118)
chr1 (2-137)||(16943109-16943243)
chr1 (275-346)||(27072491-27072562)
chr1 (160-327)||(28528447-28528614)
chr1 (275-350)||(50257777-50257852)
chr1 (68-138)||(8343070-8343140)
chr1 (68-138)||(13827929-13827999)
chr1 (1-138)||(16822234-16822368)
chr1 (274-355)||(27704156-27704238)
chr1 (270-344)||(49377503-49377577)
chr1 (319-360)||(8809491-8809532)
chr1 (190-355)||(12930306-12930471)
chr1 (285-350)||(43028808-43028873)
chr1 (216-349)||(52292188-52292320)
chr1 (190-283)||(52878366-52878459)
chr1 (275-339)||(2429640-2429704)
chr1 (298-350)||(3863478-3863530)
chr1 (194-334)||(8203150-8203290)
chr1 (191-349)||(8342885-8343040)
chr1 (302-350)||(12231592-12231640)
chr1 (1-233)||(16272938-16273169)
chr1 (275-339)||(17269000-17269064)
chr1 (191-339)||(19908395-19908543)
chr1 (288-356)||(37430414-37430482)
chr1 (1-77)||(41611105-41611181)
chr1 (226-350)||(43375598-43375722)
chr1 (275-339)||(45510844-45510908)
chr1 (288-355)||(2001121-2001188)
chr1 (6-65)||(19908655-19908714)
chr1 (191-346)||(29577147-29577301)
chr1 (275-350)||(30396729-30396804)
chr1 (94-129)||(31274578-31274613)
chr1 (69-136)||(41611807-41611874)
chr1 (297-347)||(990469-990519)
chr1 (262-348)||(1290033-1290119)
chr1 (296-350)||(4380188-4380241)
chr1 (98-136)||(7762651-7762689)
chr1 (191-350)||(15577541-15577696)
chr1 (52-134)||(17275180-17275262)
chr1 (161-207)||(31979745-31979791)
chr1 (108-253)||(34074250-34074396)
chr1 (249-350)||(42539212-42539314)
chr1 (287-349)||(52815094-52815155)
chr1 (105-138)||(10569279-10569312)
chr1 (277-350)||(14224294-14224366)
chr1 (275-332)||(14225854-14225911)
chr1 (297-334)||(15784981-15785018)
chr1 (270-347)||(16943357-16943434)
chr1 (285-334)||(29808073-29808122)
chr1 (319-356)||(30985302-30985339)
chr1 (305-350)||(31434314-31434359)
chr1 (298-351)||(43898439-43898492)
chr1 (277-334)||(48861391-48861448)
chr1 (302-347)||(50830637-50830682)
chr1 (277-350)||(51584953-51585026)
chr1 (156-229)||(52739662-52739735)
[»] chr7 (166 HSPs)
chr7 (1-350)||(34869353-34869702)
chr7 (6-360)||(39906362-39906714)
chr7 (1-350)||(37617877-37618227)
chr7 (1-350)||(11593893-11594242)
chr7 (1-358)||(12841267-12841624)
chr7 (1-339)||(35906212-35906550)
chr7 (6-350)||(49029214-49029557)
chr7 (7-357)||(33349799-33350149)
chr7 (1-356)||(44855168-44855521)
chr7 (1-348)||(46355858-46356205)
chr7 (1-355)||(36651927-36652279)
chr7 (8-350)||(43281616-43281956)
chr7 (8-350)||(45836482-45836822)
chr7 (33-364)||(6374833-6375161)
chr7 (1-297)||(13859061-13859357)
chr7 (1-358)||(31005156-31005495)
chr7 (71-358)||(22349623-22349910)
chr7 (69-357)||(31682595-31682883)
chr7 (33-359)||(29650349-29650675)
chr7 (1-349)||(35558994-35559343)
chr7 (1-356)||(43491241-43491596)
chr7 (8-360)||(38606945-38607284)
chr7 (60-350)||(2885722-2886012)
chr7 (1-224)||(33072887-33073108)
chr7 (67-359)||(36869228-36869527)
chr7 (78-356)||(15682184-15682462)
chr7 (181-360)||(38900070-38900248)
chr7 (1-350)||(36136697-36137046)
chr7 (8-316)||(23404358-23404665)
chr7 (7-347)||(28627936-28628276)
chr7 (185-350)||(40979928-40980093)
chr7 (107-356)||(32631615-32631852)
chr7 (119-350)||(7273151-7273382)
chr7 (126-350)||(24598188-24598411)
chr7 (1-307)||(47848607-47848912)
chr7 (1-177)||(7272972-7273148)
chr7 (219-350)||(21078068-21078199)
chr7 (152-348)||(31681022-31681215)
chr7 (6-350)||(8492236-8492577)
chr7 (31-172)||(46014359-46014499)
chr7 (203-350)||(48919247-48919394)
chr7 (225-350)||(27648937-27649062)
chr7 (190-350)||(9210704-9210864)
chr7 (88-360)||(38135203-38135474)
chr7 (71-359)||(12966025-12966307)
chr7 (191-347)||(45601599-45601755)
chr7 (8-110)||(32630535-32630636)
chr7 (255-360)||(28208318-28208423)
chr7 (240-360)||(34035144-34035264)
chr7 (124-350)||(1011103-1011328)
chr7 (1-135)||(42187404-42187537)
chr7 (1-133)||(36514424-36514554)
chr7 (32-222)||(25579205-25579394)
chr7 (1-350)||(36101777-36102114)
chr7 (60-259)||(7189310-7189516)
chr7 (15-184)||(19262600-19262766)
chr7 (244-350)||(33073105-33073211)
chr7 (1-233)||(43282338-43282574)
chr7 (68-178)||(40169649-40169759)
chr7 (212-350)||(42187585-42187723)
chr7 (215-349)||(14057625-14057759)
chr7 (215-349)||(14367653-14367787)
chr7 (277-350)||(31869102-31869175)
chr7 (7-136)||(39811896-39812025)
chr7 (246-339)||(47852265-47852358)
chr7 (69-310)||(26741934-26742177)
chr7 (60-136)||(27021906-27021982)
chr7 (1-65)||(36869574-36869638)
chr7 (286-358)||(40630652-40630724)
chr7 (188-350)||(44951274-44951437)
chr7 (115-316)||(1569063-1569264)
chr7 (212-313)||(36239833-36239934)
chr7 (1-136)||(5335855-5335988)
chr7 (1-83)||(24598409-24598495)
chr7 (10-136)||(28020906-28021032)
chr7 (203-349)||(34745882-34746028)
chr7 (240-338)||(42969870-42969968)
chr7 (1-350)||(48735901-48736248)
chr7 (1-138)||(14593694-14593835)
chr7 (220-356)||(27893557-27893693)
chr7 (1-138)||(30200175-30200308)
chr7 (212-347)||(40149016-40149150)
chr7 (243-350)||(47652722-47652829)
chr7 (15-127)||(47796359-47796473)
chr7 (255-349)||(24177628-24177721)
chr7 (225-350)||(28355322-28355448)
chr7 (14-176)||(28546034-28546193)
chr7 (288-350)||(28708601-28708663)
chr7 (63-133)||(38920789-38920859)
chr7 (32-138)||(41948480-41948586)
chr7 (275-359)||(4604754-4604838)
chr7 (288-348)||(6263479-6263539)
chr7 (158-350)||(7220846-7221038)
chr7 (226-350)||(8519046-8519170)
chr7 (272-348)||(24777165-24777241)
chr7 (251-351)||(34341394-34341494)
chr7 (229-350)||(40415168-40415295)
chr7 (201-304)||(21517426-21517529)
chr7 (68-167)||(35713695-35713794)
chr7 (288-350)||(5418294-5418356)
chr7 (91-233)||(6420607-6420749)
chr7 (98-264)||(28562452-28562618)
chr7 (280-350)||(31840442-31840512)
chr7 (60-134)||(45558354-45558428)
chr7 (279-360)||(25891099-25891180)
chr7 (242-339)||(33103100-33103197)
chr7 (201-350)||(37976368-37976517)
chr7 (124-268)||(1531443-1531587)
chr7 (60-183)||(5418071-5418195)
chr7 (1-138)||(16013217-16013358)
chr7 (255-355)||(30814120-30814220)
chr7 (278-350)||(33281097-33281168)
chr7 (277-349)||(34029677-34029749)
chr7 (1-136)||(40139133-40139265)
chr7 (270-350)||(48515477-48515557)
chr7 (251-350)||(2882736-2882835)
chr7 (74-137)||(7220750-7220813)
chr7 (98-141)||(24549902-24549945)
chr7 (239-310)||(31859046-31859117)
chr7 (270-357)||(40008424-40008511)
chr7 (197-348)||(40830331-40830481)
chr7 (305-355)||(14593989-14594039)
chr7 (305-355)||(16013512-16013562)
chr7 (122-200)||(26925264-26925342)
chr7 (288-350)||(29312209-29312271)
chr7 (292-350)||(29318795-29318853)
chr7 (288-350)||(41483707-41483769)
chr7 (288-350)||(47700056-47700117)
chr7 (158-356)||(47796146-47796344)
chr7 (103-225)||(48202827-48202949)
chr7 (285-350)||(1523860-1523925)
chr7 (297-350)||(20158671-20158724)
chr7 (297-350)||(20525052-20525105)
chr7 (305-350)||(21244283-21244328)
chr7 (275-348)||(24376025-24376098)
chr7 (7-105)||(25731597-25731696)
chr7 (122-255)||(33139208-33139341)
chr7 (297-350)||(33732061-33732114)
chr7 (222-307)||(35922407-35922492)
chr7 (212-349)||(38103616-38103751)
chr7 (5-110)||(42177255-42177360)
chr7 (278-338)||(17759483-17759543)
chr7 (69-137)||(18605359-18605427)
chr7 (69-137)||(18637563-18637631)
chr7 (69-137)||(18650997-18651065)
chr7 (165-333)||(19119441-19119608)
chr7 (310-350)||(41157897-41157937)
chr7 (7-58)||(27021998-27022049)
chr7 (220-350)||(28541943-28542074)
chr7 (60-135)||(30632960-30633035)
chr7 (298-349)||(39738446-39738497)
chr7 (25-138)||(40830183-40830293)
chr7 (191-313)||(44401164-44401284)
chr7 (32-129)||(27893769-27893864)
chr7 (287-350)||(38921086-38921151)
chr7 (221-339)||(40138959-40139077)
chr7 (276-350)||(41461318-41461392)
chr7 (277-347)||(46990102-46990172)
chr7 (298-339)||(6682583-6682624)
chr7 (1-138)||(25826682-25826819)
chr7 (319-356)||(35725565-35725602)
chr7 (285-350)||(35865920-35865985)
chr7 (319-348)||(43653184-43653213)
chr7 (277-350)||(45558539-45558611)
chr7 (298-343)||(47155179-47155224)
chr7 (319-356)||(47413709-47413746)
[»] chr8 (142 HSPs)
chr8 (1-350)||(36545080-36545431)
chr8 (6-350)||(36565241-36565585)
chr8 (34-350)||(11523723-11524040)
chr8 (1-360)||(36394938-36395299)
chr8 (1-357)||(40813255-40813613)
chr8 (70-347)||(12491141-12491418)
chr8 (8-355)||(42853999-42854346)
chr8 (1-357)||(39946790-39947137)
chr8 (8-335)||(2796495-2796820)
chr8 (8-350)||(18125115-18125453)
chr8 (15-358)||(21121105-21121435)
chr8 (40-347)||(8932676-8932982)
chr8 (1-350)||(45419172-45419517)
chr8 (8-350)||(37077705-37078031)
chr8 (152-355)||(42469722-42469925)
chr8 (14-353)||(8879443-8879776)
chr8 (1-350)||(29520593-29520931)
chr8 (1-357)||(32043523-32043876)
chr8 (218-350)||(25473403-25473535)
chr8 (87-316)||(26904941-26905169)
chr8 (169-350)||(2027631-2027812)
chr8 (11-228)||(18751998-18752212)
chr8 (195-356)||(14742076-14742234)
chr8 (101-316)||(43904699-43904914)
chr8 (241-360)||(44047522-44047641)
chr8 (239-350)||(44529396-44529507)
chr8 (93-359)||(30559718-30559989)
chr8 (60-326)||(29700268-29700534)
chr8 (224-356)||(490491-490623)
chr8 (1-164)||(6510614-6510775)
chr8 (16-283)||(10079974-10080239)
chr8 (77-356)||(32930970-32931248)
chr8 (158-349)||(35362651-35362842)
chr8 (220-346)||(45041320-45041445)
chr8 (6-267)||(45512578-45512840)
chr8 (7-134)||(13171865-13171992)
chr8 (196-350)||(23492163-23492316)
chr8 (20-350)||(5908594-5908928)
chr8 (21-137)||(12796913-12797027)
chr8 (79-356)||(35643602-35643872)
chr8 (230-350)||(15215412-15215532)
chr8 (20-135)||(9695583-9695698)
chr8 (113-350)||(35914601-35914838)
chr8 (104-350)||(42584407-42584640)
chr8 (170-350)||(2216390-2216568)
chr8 (126-346)||(12025847-12026058)
chr8 (7-138)||(44681251-44681382)
chr8 (9-246)||(25985462-25985696)
chr8 (19-184)||(7046285-7046449)
chr8 (261-350)||(10668497-10668586)
chr8 (15-348)||(16917131-16917462)
chr8 (216-349)||(25288912-25289045)
chr8 (216-349)||(25300247-25300380)
chr8 (1-350)||(39953264-39953613)
chr8 (152-360)||(7531634-7531842)
chr8 (1-78)||(12492116-12492191)
chr8 (261-359)||(8255522-8255622)
chr8 (278-350)||(1928587-1928659)
chr8 (60-350)||(13589478-13589761)
chr8 (1-65)||(15215556-15215620)
chr8 (60-183)||(10824331-10824454)
chr8 (190-357)||(28169514-28169680)
chr8 (240-360)||(31715992-31716114)
chr8 (8-82)||(25288842-25288916)
chr8 (8-82)||(25300177-25300251)
chr8 (273-359)||(32569701-32569787)
chr8 (131-349)||(38178261-38178479)
chr8 (99-268)||(9904964-9905132)
chr8 (6-138)||(30748397-30748527)
chr8 (66-142)||(2776437-2776513)
chr8 (19-131)||(30113416-30113528)
chr8 (191-339)||(43733330-43733477)
chr8 (31-183)||(44373739-44373891)
chr8 (7-182)||(2518560-2518734)
chr8 (60-183)||(36143357-36143480)
chr8 (68-174)||(25985776-25985881)
chr8 (188-270)||(28269759-28269840)
chr8 (109-350)||(30198266-30198507)
chr8 (154-270)||(5266016-5266131)
chr8 (275-355)||(27556297-27556377)
chr8 (276-356)||(32276893-32276973)
chr8 (251-347)||(44699649-44699745)
chr8 (16-138)||(78988-79113)
chr8 (3-138)||(16705697-16705832)
chr8 (251-350)||(21425229-21425328)
chr8 (191-350)||(30812816-30812975)
chr8 (8-110)||(13986434-13986536)
chr8 (216-349)||(14459043-14459177)
chr8 (71-137)||(18474173-18474239)
chr8 (240-350)||(26363660-26363768)
chr8 (1-283)||(33827824-33828106)
chr8 (288-350)||(35323993-35324055)
chr8 (297-355)||(41031415-41031473)
chr8 (297-355)||(41031521-41031579)
chr8 (303-356)||(1064955-1065008)
chr8 (285-350)||(38901819-38901884)
chr8 (298-350)||(9695815-9695867)
chr8 (152-344)||(16351462-16351653)
chr8 (277-349)||(18473973-18474045)
chr8 (152-261)||(24558571-24558676)
chr8 (298-350)||(31309583-31309635)
chr8 (1-206)||(39760572-39760773)
chr8 (251-350)||(12611680-12611779)
chr8 (199-318)||(17491686-17491805)
chr8 (275-350)||(35646930-35647005)
chr8 (246-360)||(3464161-3464274)
chr8 (214-268)||(25439471-25439525)
chr8 (1-63)||(36069576-36069638)
chr8 (275-349)||(36143548-36143622)
chr8 (288-350)||(39651028-39651090)
chr8 (1-86)||(16351323-16351408)
chr8 (193-356)||(39388907-39389074)
chr8 (68-129)||(41444547-41444608)
chr8 (288-360)||(1070279-1070351)
chr8 (275-347)||(1313771-1313843)
chr8 (221-349)||(3802026-3802154)
chr8 (299-359)||(4558199-4558259)
chr8 (300-356)||(16921451-16921507)
chr8 (298-346)||(26055651-26055699)
chr8 (275-339)||(30689942-30690006)
chr8 (251-350)||(3473753-3473852)
chr8 (297-360)||(12985919-12985982)
chr8 (194-350)||(23023351-23023509)
chr8 (60-131)||(34196064-34196135)
chr8 (297-356)||(40982890-40982949)
chr8 (212-350)||(4955335-4955473)
chr8 (279-357)||(18741843-18741921)
chr8 (279-357)||(18746807-18746885)
chr8 (277-359)||(36042407-36042489)
chr8 (211-349)||(36069745-36069883)
chr8 (275-350)||(41212068-41212145)
chr8 (288-346)||(45512448-45512506)
chr8 (298-359)||(5266174-5266235)
chr8 (301-350)||(5810278-5810327)
chr8 (298-339)||(14742849-14742890)
chr8 (319-356)||(24837942-24837979)
chr8 (320-357)||(32978126-32978163)
chr8 (319-360)||(33076375-33076416)
chr8 (32-123)||(33666726-33666814)
chr8 (301-350)||(35085137-35085186)
chr8 (60-137)||(41971991-41972067)
chr8 (297-350)||(43350731-43350784)
[»] chr5 (134 HSPs)
chr5 (1-356)||(4496315-4496672)
chr5 (6-358)||(12492376-12492731)
chr5 (1-356)||(28976853-28977206)
chr5 (1-350)||(24178443-24178792)
chr5 (1-348)||(2075475-2075823)
chr5 (1-361)||(10639230-10639595)
chr5 (1-339)||(1287590-1287938)
chr5 (33-339)||(38684932-38685238)
chr5 (1-350)||(1275198-1275546)
chr5 (10-350)||(3301786-3302126)
chr5 (71-349)||(20456776-20457054)
chr5 (1-350)||(16347380-16347727)
chr5 (16-359)||(14665658-14666003)
chr5 (7-350)||(34272961-34273295)
chr5 (126-356)||(2915490-2915719)
chr5 (1-356)||(26884683-26885038)
chr5 (157-350)||(13561386-13561579)
chr5 (199-350)||(29816513-29816664)
chr5 (160-348)||(14911264-14911452)
chr5 (100-346)||(38501422-38501668)
chr5 (212-350)||(16913882-16914021)
chr5 (15-261)||(31636009-31636253)
chr5 (32-303)||(14749271-14749542)
chr5 (18-351)||(36215450-36215771)
chr5 (248-358)||(30213755-30213865)
chr5 (10-350)||(27836-28164)
chr5 (60-350)||(79505-79795)
chr5 (1-304)||(32516491-32516791)
chr5 (71-355)||(43475243-43475526)
chr5 (6-312)||(6888931-6889237)
chr5 (241-350)||(5558314-5558423)
chr5 (221-356)||(28276391-28276526)
chr5 (17-345)||(2712897-2713213)
chr5 (30-355)||(6859343-6859668)
chr5 (60-350)||(14667755-14668053)
chr5 (226-350)||(418034-418158)
chr5 (16-350)||(7359261-7359593)
chr5 (16-138)||(33667166-33667286)
chr5 (75-351)||(1525651-1525924)
chr5 (286-350)||(408494-408558)
chr5 (191-338)||(9235172-9235316)
chr5 (53-233)||(15489609-15489789)
chr5 (10-137)||(10082952-10083079)
chr5 (212-350)||(11675673-11675812)
chr5 (32-131)||(15168756-15168855)
chr5 (193-355)||(29922409-29922571)
chr5 (17-134)||(418201-418318)
chr5 (152-349)||(12576861-12577058)
chr5 (1-281)||(17340505-17340786)
chr5 (230-347)||(39040918-39041035)
chr5 (69-233)||(28676596-28676760)
chr5 (25-232)||(42199245-42199450)
chr5 (211-350)||(2090556-2090695)
chr5 (275-350)||(5860041-5860116)
chr5 (79-333)||(30588460-30588712)
chr5 (275-350)||(38132543-38132618)
chr5 (218-288)||(2552932-2553002)
chr5 (297-362)||(9234115-9234180)
chr5 (8-128)||(11002645-11002763)
chr5 (277-350)||(28411885-28411958)
chr5 (251-356)||(32442120-32442224)
chr5 (273-350)||(42576215-42576292)
chr5 (192-339)||(15588401-15588546)
chr5 (277-348)||(3442873-3442944)
chr5 (68-138)||(18351119-18351190)
chr5 (259-350)||(18855798-18855889)
chr5 (105-262)||(9917538-9917695)
chr5 (1-75)||(20318920-20318989)
chr5 (224-350)||(20367049-20367175)
chr5 (288-350)||(27386560-27386622)
chr5 (292-350)||(35118322-35118380)
chr5 (285-350)||(9121078-9121143)
chr5 (79-316)||(29938126-29938358)
chr5 (278-350)||(42272687-42272759)
chr5 (191-326)||(6788190-6788325)
chr5 (88-183)||(21093772-21093867)
chr5 (152-263)||(33157918-33158029)
chr5 (276-350)||(218052-218126)
chr5 (105-207)||(11675547-11675649)
chr5 (1-134)||(34194714-34194845)
chr5 (95-221)||(36200769-36200894)
chr5 (252-350)||(38830504-38830601)
chr5 (1-350)||(7678413-7678759)
chr5 (265-350)||(9400708-9400793)
chr5 (307-360)||(34119859-34119912)
chr5 (297-350)||(36551375-36551428)
chr5 (267-348)||(39128261-39128342)
chr5 (288-350)||(41108727-41108791)
chr5 (253-350)||(43557833-43557930)
chr5 (230-350)||(2393039-2393158)
chr5 (275-347)||(7640510-7640582)
chr5 (275-350)||(11069162-11069237)
chr5 (275-350)||(28186782-28186857)
chr5 (17-136)||(31906610-31906729)
chr5 (31-86)||(42504447-42504502)
chr5 (158-309)||(43035071-43035222)
chr5 (1-111)||(219692-219802)
chr5 (305-359)||(3775065-3775119)
chr5 (288-350)||(4026328-4026390)
chr5 (161-283)||(15168864-15168986)
chr5 (276-350)||(32366186-32366260)
chr5 (60-166)||(43558011-43558117)
chr5 (278-347)||(2049271-2049339)
chr5 (297-350)||(3000968-3001021)
chr5 (117-182)||(27799892-27799957)
chr5 (275-336)||(41200360-41200421)
chr5 (60-138)||(41833794-41833874)
chr5 (275-356)||(41894280-41894361)
chr5 (298-350)||(2645220-2645272)
chr5 (1-65)||(5305549-5305613)
chr5 (152-235)||(8082068-8082152)
chr5 (95-183)||(15986904-15986992)
chr5 (297-345)||(28985312-28985360)
chr5 (72-136)||(37065533-37065597)
chr5 (7-58)||(9235008-9235059)
chr5 (297-348)||(10668569-10668620)
chr5 (297-348)||(27800057-27800108)
chr5 (7-58)||(28186960-28187011)
chr5 (288-347)||(38105266-38105325)
chr5 (235-350)||(42504247-42504362)
chr5 (297-346)||(8081967-8082017)
chr5 (277-347)||(11002424-11002494)
chr5 (190-268)||(14725640-14725718)
chr5 (305-343)||(15252751-15252789)
chr5 (288-334)||(39322095-39322141)
chr5 (320-350)||(42408700-42408730)
chr5 (288-350)||(43423496-43423557)
chr5 (298-359)||(1101999-1102060)
chr5 (302-351)||(7367171-7367220)
chr5 (309-350)||(10989085-10989126)
chr5 (319-356)||(29929305-29929342)
chr5 (1-50)||(36200715-36200764)
chr5 (288-349)||(39766741-39766802)
chr5 (251-332)||(41808105-41808186)
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (1-356)||(28085309-28085664)
chr6 (1-350)||(32755852-32756203)
chr6 (1-347)||(30031189-30031535)
chr6 (1-356)||(5258142-5258499)
chr6 (6-349)||(608097-608442)
chr6 (8-356)||(20427630-20427978)
chr6 (8-350)||(9706716-9707052)
chr6 (40-350)||(12890556-12890857)
chr6 (8-350)||(35043441-35043783)
chr6 (1-310)||(5631751-5632064)
chr6 (14-334)||(21351853-21352171)
chr6 (1-350)||(9593710-9594061)
chr6 (8-350)||(14030746-14031077)
chr6 (1-222)||(10099987-10100206)
chr6 (79-350)||(30679417-30679678)
chr6 (191-356)||(34143759-34143924)
chr6 (191-356)||(34156375-34156540)
chr6 (70-307)||(33496963-33497198)
chr6 (117-245)||(7133795-7133923)
chr6 (117-245)||(7136718-7136846)
chr6 (238-350)||(34934830-34934942)
chr6 (5-350)||(28026829-28027170)
chr6 (133-311)||(5080905-5081083)
chr6 (236-350)||(31818999-31819113)
chr6 (1-315)||(6055806-6056119)
chr6 (231-355)||(3206454-3206578)
chr6 (190-350)||(5095956-5096116)
chr6 (219-356)||(10098890-10099025)
chr6 (6-138)||(33083996-33084128)
chr6 (74-268)||(2689646-2689834)
chr6 (76-316)||(24665818-24666059)
chr6 (191-350)||(34505-34664)
chr6 (62-350)||(31818526-31818813)
chr6 (273-350)||(1615223-1615300)
chr6 (15-350)||(8364523-8364838)
chr6 (16-101)||(5080803-5080888)
chr6 (226-350)||(5897615-5897739)
chr6 (1-206)||(26291711-26291917)
chr6 (1-350)||(12133902-12134250)
chr6 (277-348)||(30789076-30789147)
chr6 (275-350)||(32945455-32945530)
chr6 (11-108)||(5095816-5095913)
chr6 (288-359)||(579638-579709)
chr6 (275-350)||(586057-586132)
chr6 (8-84)||(2065018-2065098)
chr6 (1-137)||(9568593-9568731)
chr6 (253-360)||(9568884-9568990)
chr6 (191-349)||(33997545-33997703)
chr6 (76-356)||(6293386-6293660)
chr6 (18-131)||(6641628-6641741)
chr6 (297-350)||(33730194-33730247)
chr6 (277-357)||(38980-39060)
chr6 (279-350)||(12119642-12119714)
chr6 (60-124)||(21870299-21870363)
chr6 (69-136)||(2079341-2079408)
chr6 (277-356)||(4245866-4245945)
chr6 (68-231)||(25493969-25494131)
chr6 (230-348)||(7492551-7492669)
chr6 (252-345)||(2079465-2079558)
chr6 (1-54)||(2689589-2689642)
chr6 (279-360)||(18130804-18130885)
chr6 (298-347)||(21870069-21870118)
chr6 (278-347)||(21886314-21886383)
chr6 (115-199)||(5897524-5897608)
chr6 (275-347)||(21089604-21089676)
chr6 (60-183)||(14389335-14389457)
chr6 (279-350)||(30642980-30643051)
chr6 (7-78)||(33496123-33496194)
chr6 (221-339)||(43063-43181)
chr6 (275-349)||(5053733-5053807)
chr6 (277-339)||(10453272-10453334)
chr6 (212-261)||(38907-38956)
chr6 (305-350)||(507100-507145)
chr6 (277-350)||(1008052-1008124)
chr6 (279-360)||(23888468-23888549)
chr6 (297-350)||(29900275-29900328)
chr6 (1-66)||(33998288-33998353)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-350)||(31401-31750)
scaffold0018 (60-138)||(44080-44158)
[»] chr3 (132 HSPs)
chr3 (1-350)||(52138733-52139082)
chr3 (1-350)||(28245370-28245719)
chr3 (1-350)||(51447717-51448058)
chr3 (1-315)||(54278953-54279267)
chr3 (8-357)||(22013-22361)
chr3 (8-356)||(5168768-5169120)
chr3 (6-350)||(47233596-47233940)
chr3 (51-350)||(35033129-35033428)
chr3 (101-356)||(48508268-48508523)
chr3 (8-356)||(25191319-25191665)
chr3 (1-350)||(53519519-53519862)
chr3 (1-350)||(54128311-54128661)
chr3 (7-251)||(33272122-33272371)
chr3 (71-350)||(38850123-38850403)
chr3 (180-359)||(12096696-12096875)
chr3 (27-350)||(43694771-43695083)
chr3 (10-350)||(45289091-45289434)
chr3 (7-350)||(19676081-19676433)
chr3 (61-346)||(50960641-50960922)
chr3 (8-242)||(45728086-45728324)
chr3 (15-348)||(39600683-39601016)
chr3 (75-316)||(48953453-48953697)
chr3 (6-350)||(48734147-48734477)
chr3 (60-217)||(38060423-38060580)
chr3 (7-350)||(49503568-49503897)
chr3 (24-344)||(38430799-38431129)
chr3 (5-268)||(3186706-3186968)
chr3 (88-339)||(39235158-39235407)
chr3 (1-339)||(19736929-19737254)
chr3 (1-339)||(19757832-19758157)
chr3 (209-350)||(52156084-52156225)
chr3 (1-349)||(26490250-26490596)
chr3 (63-355)||(42510011-42510301)
chr3 (246-359)||(47555323-47555436)
chr3 (222-359)||(53262295-53262432)
chr3 (212-350)||(38060858-38060996)
chr3 (1-243)||(27917505-27917745)
chr3 (17-350)||(54424959-54425304)
chr3 (213-350)||(49042081-49042219)
chr3 (44-308)||(52678892-52679154)
chr3 (60-350)||(54364976-54365266)
chr3 (71-353)||(30294120-30294403)
chr3 (261-359)||(7895871-7895969)
chr3 (239-356)||(311303-311420)
chr3 (202-338)||(17022684-17022820)
chr3 (5-222)||(344839-345056)
chr3 (221-350)||(15296060-15296189)
chr3 (237-350)||(2133612-2133725)
chr3 (1-176)||(36820135-36820308)
chr3 (152-262)||(19162675-19162785)
chr3 (32-345)||(23534576-23534887)
chr3 (277-360)||(40273195-40273278)
chr3 (277-350)||(31566161-31566234)
chr3 (262-350)||(48532151-48532240)
chr3 (68-309)||(21200550-21200787)
chr3 (277-350)||(31454225-31454298)
chr3 (285-350)||(45834600-45834665)
chr3 (1-347)||(49841544-49841895)
chr3 (25-137)||(3987004-3987116)
chr3 (239-339)||(40116349-40116449)
chr3 (285-347)||(41529978-41530040)
chr3 (69-183)||(41842678-41842792)
chr3 (251-360)||(39208791-39208900)
chr3 (278-359)||(45374468-45374549)
chr3 (288-360)||(52927838-52927910)
chr3 (255-350)||(30797822-30797917)
chr3 (2-125)||(31337751-31337872)
chr3 (251-350)||(40106620-40106719)
chr3 (275-350)||(46148235-46148310)
chr3 (7-345)||(46431684-46432014)
chr3 (6-207)||(50249319-50249526)
chr3 (192-338)||(27893213-27893359)
chr3 (275-356)||(388256-388337)
chr3 (7-350)||(2340717-2341057)
chr3 (60-233)||(11581436-11581609)
chr3 (288-349)||(21862742-21862803)
chr3 (261-342)||(24541340-24541421)
chr3 (277-350)||(24778609-24778682)
chr3 (32-136)||(29600863-29600968)
chr3 (251-360)||(40991614-40991723)
chr3 (202-350)||(45486849-45487000)
chr3 (298-350)||(49933440-49933492)
chr3 (239-350)||(29601063-29601174)
chr3 (275-350)||(37083292-37083367)
chr3 (256-350)||(4472387-4472481)
chr3 (195-350)||(11284120-11284270)
chr3 (288-350)||(31146919-31146981)
chr3 (199-329)||(40116489-40116619)
chr3 (288-350)||(52882662-52882724)
chr3 (293-350)||(7278689-7278746)
chr3 (192-261)||(26990337-26990406)
chr3 (261-350)||(33271910-33271999)
chr3 (225-350)||(36304123-36304248)
chr3 (1-58)||(45236789-45236846)
chr3 (191-350)||(29475811-29475968)
chr3 (46-137)||(31453151-31453242)
chr3 (302-350)||(39512777-39512825)
chr3 (319-359)||(41230506-41230546)
chr3 (251-350)||(14415260-14415358)
chr3 (1-131)||(37227863-37227991)
chr3 (288-339)||(40672378-40672429)
chr3 (230-350)||(54422837-54422963)
chr3 (298-348)||(659755-659805)
chr3 (1-127)||(26388414-26388540)
chr3 (286-348)||(31452963-31453025)
chr3 (38-136)||(31454441-31454537)
chr3 (9-86)||(33307087-33307162)
chr3 (297-351)||(35465758-35465812)
chr3 (60-138)||(39535652-39535730)
chr3 (213-347)||(45493695-45493829)
chr3 (8-65)||(38850034-38850091)
chr3 (288-356)||(20208218-20208286)
chr3 (1-129)||(29817437-29817565)
chr3 (197-349)||(34719081-34719233)
chr3 (258-350)||(39781918-39782009)
chr3 (298-350)||(50249607-50249659)
chr3 (290-350)||(53214871-53214931)
chr3 (279-338)||(6988113-6988172)
chr3 (279-350)||(37102808-37102879)
chr3 (270-348)||(37598171-37598250)
chr3 (152-219)||(44571523-44571590)
chr3 (285-355)||(3987551-3987621)
chr3 (297-347)||(32170634-32170684)
chr3 (73-127)||(37534429-37534483)
chr3 (1-63)||(38054624-38054686)
chr3 (270-360)||(39535391-39535480)
chr3 (96-137)||(3870657-3870698)
chr3 (297-350)||(32052541-32052594)
chr3 (270-347)||(46367390-46367467)
chr3 (319-360)||(48259955-48259996)
chr3 (256-353)||(49045023-49045120)
chr3 (298-343)||(53951985-53952030)
[»] chr2 (141 HSPs)
chr2 (1-357)||(3866005-3866361)
chr2 (1-348)||(8180713-8181060)
chr2 (1-353)||(36183384-36183736)
chr2 (1-350)||(38452686-38453038)
chr2 (1-349)||(3243654-3244000)
chr2 (1-359)||(12734634-12734991)
chr2 (1-356)||(38429817-38430171)
chr2 (1-350)||(4807525-4807877)
chr2 (60-350)||(2610580-2610870)
chr2 (89-356)||(451642-451909)
chr2 (39-350)||(25834650-25834960)
chr2 (8-355)||(45367620-45367966)
chr2 (10-357)||(41197220-41197568)
chr2 (8-350)||(11992108-11992448)
chr2 (8-350)||(41763043-41763383)
chr2 (110-350)||(7326160-7326400)
chr2 (9-350)||(18424378-18424716)
chr2 (139-350)||(28508749-28508960)
chr2 (75-350)||(24583631-24583907)
chr2 (8-348)||(23997557-23997882)
chr2 (185-350)||(35643065-35643230)
chr2 (8-350)||(6237753-6238096)
chr2 (63-350)||(12141539-12141826)
chr2 (125-348)||(39029638-39029867)
chr2 (1-350)||(9556369-9556717)
chr2 (7-350)||(38434890-38435234)
chr2 (4-359)||(43751938-43752293)
chr2 (172-350)||(31959625-31959803)
chr2 (237-356)||(227358-227477)
chr2 (230-359)||(30306194-30306323)
chr2 (68-349)||(18958907-18959192)
chr2 (188-349)||(45543074-45543234)
chr2 (230-356)||(38328364-38328488)
chr2 (8-138)||(16097198-16097332)
chr2 (248-360)||(3635313-3635425)
chr2 (192-355)||(43573125-43573287)
chr2 (198-357)||(12882038-12882197)
chr2 (210-350)||(9996623-9996766)
chr2 (216-350)||(9496014-9496148)
chr2 (1-339)||(4598573-4598913)
chr2 (64-138)||(43238305-43238379)
chr2 (37-349)||(37481618-37481930)
chr2 (1-137)||(7825291-7825429)
chr2 (107-350)||(42543274-42543517)
chr2 (268-350)||(12474927-12475009)
chr2 (34-346)||(41545372-41545683)
chr2 (160-348)||(35755247-35755439)
chr2 (63-348)||(13149326-13149612)
chr2 (66-360)||(44437711-44438005)
chr2 (7-347)||(42092458-42092796)
chr2 (280-356)||(17670680-17670756)
chr2 (191-348)||(26670891-26671048)
chr2 (158-346)||(33504313-33504502)
chr2 (253-349)||(39709202-39709298)
chr2 (6-65)||(2610466-2610525)
chr2 (275-350)||(12520062-12520137)
chr2 (10-121)||(30743565-30743675)
chr2 (160-338)||(13443920-13444098)
chr2 (6-135)||(19337069-19337193)
chr2 (197-350)||(7431889-7432042)
chr2 (221-350)||(8197541-8197670)
chr2 (221-350)||(8202301-8202430)
chr2 (44-355)||(11412697-11412997)
chr2 (279-356)||(25384680-25384757)
chr2 (225-350)||(30743686-30743811)
chr2 (60-357)||(43832091-43832387)
chr2 (262-350)||(9531600-9531688)
chr2 (1-237)||(13592411-13592645)
chr2 (203-350)||(12489802-12489949)
chr2 (30-137)||(13240958-13241065)
chr2 (58-176)||(11017304-11017422)
chr2 (68-360)||(3481144-3481446)
chr2 (1-181)||(9578872-9579050)
chr2 (158-338)||(19234996-19235176)
chr2 (212-360)||(28960201-28960350)
chr2 (239-347)||(19336896-19337004)
chr2 (1-227)||(23714384-23714607)
chr2 (1-227)||(24102056-24102279)
chr2 (18-137)||(40759049-40759169)
chr2 (191-350)||(19855585-19855744)
chr2 (288-350)||(10516749-10516811)
chr2 (277-359)||(15025703-15025785)
chr2 (196-350)||(33287549-33287703)
chr2 (297-350)||(35704216-35704269)
chr2 (53-138)||(38860158-38860243)
chr2 (158-350)||(5758995-5759187)
chr2 (62-350)||(6218961-6219247)
chr2 (280-356)||(17626284-17626360)
chr2 (152-316)||(21834638-21834802)
chr2 (275-350)||(19863441-19863516)
chr2 (275-350)||(19867773-19867848)
chr2 (275-350)||(19872674-19872749)
chr2 (194-337)||(37470146-37470289)
chr2 (53-106)||(227307-227360)
chr2 (297-350)||(16521007-16521060)
chr2 (98-339)||(26784351-26784592)
chr2 (275-339)||(3720426-3720490)
chr2 (285-348)||(522446-522509)
chr2 (68-123)||(12882267-12882322)
chr2 (275-350)||(17429257-17429332)
chr2 (277-348)||(20900554-20900625)
chr2 (275-350)||(42549837-42549912)
chr2 (98-136)||(907710-907748)
chr2 (288-350)||(14444889-14444951)
chr2 (297-355)||(15775840-15775898)
chr2 (279-337)||(29968624-29968682)
chr2 (71-205)||(32443668-32443802)
chr2 (277-349)||(887065-887138)
chr2 (241-350)||(9394630-9394739)
chr2 (285-350)||(12470897-12470962)
chr2 (209-326)||(19224922-19225039)
chr2 (275-348)||(34931639-34931712)
chr2 (297-346)||(45482989-45483038)
chr2 (275-359)||(7615476-7615560)
chr2 (277-357)||(15015154-15015234)
chr2 (1-136)||(18188716-18188848)
chr2 (81-137)||(41858744-41858800)
chr2 (298-349)||(624687-624738)
chr2 (21-124)||(786783-786885)
chr2 (288-351)||(2515170-2515233)
chr2 (308-347)||(11414571-11414610)
chr2 (152-283)||(17581543-17581674)
chr2 (277-328)||(19334174-19334225)
chr2 (273-348)||(32364923-32364998)
chr2 (297-347)||(186135-186185)
chr2 (304-358)||(8560798-8560852)
chr2 (93-183)||(12026172-12026262)
chr2 (1-55)||(13149246-13149300)
chr2 (76-137)||(14197375-14197437)
chr2 (153-183)||(32365081-32365111)
chr2 (288-350)||(36993755-36993816)
chr2 (60-134)||(41330121-41330195)
chr2 (113-183)||(45077800-45077870)
chr2 (1-42)||(451930-451971)
chr2 (309-350)||(2073307-2073348)
chr2 (309-350)||(10403893-10403934)
chr2 (319-360)||(13188393-13188434)
chr2 (38-127)||(19024150-19024239)
chr2 (294-346)||(23354105-23354158)
chr2 (275-316)||(23915727-23915768)
chr2 (254-347)||(45077915-45078008)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (25-350)||(948-1271)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (8-350)||(82661-83000)
scaffold0024 (259-347)||(48119-48207)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-355)||(4275-4621)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (8-350)||(86609-86949)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (110-350)||(11549-11787)
scaffold0113 (8-136)||(11810-11940)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (196-350)||(25532-25686)
scaffold0157 (1-112)||(25683-25794)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (179-350)||(16689-16860)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (218-350)||(481-613)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (138-350)||(4706-4918)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (47-348)||(7422-7720)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (260-356)||(28883-28979)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (209-356)||(14724-14871)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (191-350)||(58226-58385)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (212-349)||(160325-160462)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (72-136)||(11802-11866)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (287-350)||(99286-99349)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (212-358)||(1514-1657)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (275-339)||(6783-6847)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (279-357)||(3648-3726)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (262-348)||(16438-16524)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (277-355)||(163189-163267)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (229-310)||(39480-39561)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 191)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31960163 - 31959813
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31960163 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31960064  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31960063 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 31959964  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31959963 gaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 31959864  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31959863 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtc 31959813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52569864 - 52569515
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52569864 gttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 52569765  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52569764 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 52569665  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52569664 gaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 52569565  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52569564 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52569515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 53707727 - 53708076
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53707727 gttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 53707826  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707827 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 53707926  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53707927 gaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 53708026  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53708027 gatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 53708076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48174442 - 48174088
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48174442 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaa 48174343  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48174342 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 48174243  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  48174242 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcattt 48174143  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48174142 gatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 48174088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 436162 - 436511
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  436162 gttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 436261  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  436262 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 436361  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  436362 gaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcattt 436461  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  436462 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 56375223 - 56375572
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  56375223 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaa 56375322  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56375323 aacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 56375422  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  56375423 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 56375522  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  56375523 gatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgt 56375572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48622884 - 48622543
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  48622884 ttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaatagg 48622787  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622786 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 48622687  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48622686 ctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatcca 48622587  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48622586 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 4440788 - 4441144
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4440788 gttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattaga--gagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaa 4440885  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4440886 aataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 4440985  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4440986 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 4441085  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||    
T  4441086 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttgttgttgt 4441144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 378 - 714
Target Start/End: Original strand, 53710299 - 53710649
Alignment:
Q  378 agttagctaacttattatgttcatttaggacggaaattttttagcctcgtannnnnnngtaggtatttatt-------------gtcgtaagctaaaaaa 464  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||             |||||||||||| |||    
T  53710299 agttagctaacttattctgttcatttaggacggaaattttttagcctcgtattttttagtaggtatttattattagtattttttgtcgtaagctaacaaa 53710398  T
Q  465 tacttttaaatatagtatttgtgtatcttttagagcttaatttgttataaagaaaacaaaatagacccacgtgtatgctatcatatcatattaaataaaa 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53710399 tacttttaaatatagtatttgtgtatcttttagagcttaatttgttataaagaaaacaaaatagacccacgtgtatgctatcatatcatattaaataaaa 53710498  T
Q  565 atagtgttttgtacat-aaagaatctcacattatctagaaacgaggttaatagcacttcataaataacaattaaactcttcaatttaatggaacaacttt 663  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  53710499 atagtgttttgtacataaaagaatctcacattatctagaaacgaggttaatagcacttcataaataacaattaaactcttcaatttaatggaacagtttt 53710598  T
Q  664 tataacagacaaaattgggaagactcataatatgtcgaaggtggacagtac 714  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53710599 tataacagacaaaattgagaagactcataatatgtctaaggtggacagtac 53710649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33191190 - 33190838
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33191190 tggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 33191091  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33191090 ttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 33190991  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  33190990 taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgacccat 33190891  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  33190890 gtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttgctgttgtt 33190838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 356
Target Start/End: Original strand, 33227149 - 33227497
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33227149 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 33227248  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33227249 ttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacc 33227348  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33227349 taggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccat 33227448  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||   ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||    
T  33227449 gtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttgttgt 33227497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1777364 - 1777006
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1777364 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtggaaatagcacctatagtaaaaaagttggtagaa 1777267  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1777266 aataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 1777167  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  1777166 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtatggcgtcattt 1777067  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtta 361  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  1777066 gatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttcttgttgtta 1777006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 43433851 - 43434211
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag------agtgggggtagcacctatagtagtaaagttg 94  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43433851 gttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 43433950  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43433951 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 43434050  T
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcg 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  43434051 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcg 43434150  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43434151 tcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 43434211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46583160 - 46582826
Alignment:
Q  14 agtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46583160 agtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 46583061  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagaccc-gtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgagga 212  Q
    || |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  46583060 gggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatga 46582963  T
Q  213 aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  46582962 aaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagc 46582863  T
Q  313 cgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46582862 ctac-ccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 46582826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23906650 - 23906297
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag------tgggggtagcacctatagtagtaaagttg 94  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  23906650 gttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttt 23906551  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  23906550 gtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaag 23906453  T
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcg 294  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23906452 gtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 23906353  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23906352 tcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39100872 - 39100536
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctta 110  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  39100872 atgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggctta 39100775  T
Q  111 gatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgag 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  39100774 gatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatg-cgttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctag 39100676  T
Q  211 gaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||| || |||||||| || | |||||||||    
T  39100675 gaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgta 39100576  T
Q  311 gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39100575 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39100536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47265544 - 47265195
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||     
T  47265544 tggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggt 47265445  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagac-------ccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  47265444 ttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagaggtagag 47265345  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||    
T  47265344 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagtgtaattt 47265245  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47265244 gatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgt 47265195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 37797785 - 37798133
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37797785 gttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 37797884  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||    
T  37797885 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagag 37797983  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||| ||||||||    
T  37797984 gaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcattt 37798083  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  37798084 gatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgt 37798133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27450515 - 27450180
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27450515 tggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 27450422  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27450421 ttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacc 27450322  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27450321 taagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat-tttgatagaacactatggcgtcatttgatccat 27450223  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27450222 gtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 28236124 - 28236464
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28236124 ttggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaatagg 28236221  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||    
T  28236222 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagac 28236320  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| || |||||||| |    
T  28236321 ctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatcta 28236420  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28236421 tgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28236464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 50286904 - 50287209
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  50286904 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag-----ggg----acctatagtagaaaagttggtagaa 50286994  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  50286995 aatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaa 50287094  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  50287095 gaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacactatgg-gccattt 50287193  T
Q  301 gatccatgtagccgac 316  Q
    ||||||||||| ||||    
T  50287194 gatccatgtagtcgac 50287209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37773792 - 37773485
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg-ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37773792 tggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattaga--gagagtaaggggtagcacctatagtagaaaagtcggtagaaaatagg 37773695  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  37773694 cttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagatgaatac 37773595  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||||| |    
T  37773594 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacactatgacataatttgatcta 37773495  T
Q  307 tgtagccgac 316  Q
    | ||||||||    
T  37773494 tatagccgac 37773485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 92 - 357
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286728
Alignment:
Q  92 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  192 ga--------ggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgataga 283  Q
    ||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  284 gcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 8286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 347
Target Start/End: Original strand, 20192023 - 20192311
Alignment:
Q  58 aaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaaga 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  20192023 aaagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaaga 20192122  T
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  20192123 agagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggt 20192222  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20192223 tggatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 339
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708704
Alignment:
Q  47 gacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatg 146  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  147 tcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttaga 246  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  247 ggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttg 39708704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26037795 - 26037506
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  26037795 agagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaagaag 26037696  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  26037695 agtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgagttg 26037596  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26037595 gatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 1793393 - 1793741
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1793393 gttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaa 1793492  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||   | |||||||||||||    
T  1793493 aataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggagg--agtcgtatcaaaagaggtagag 1793590  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaac----tattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
     ||||||  | |||||||| ||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  1793591 aaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgta 1793690  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  1793691 atttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 360
Target Start/End: Original strand, 27983142 - 27983485
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||       ||||    
T  27983142 gatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtag-------gctt 27983234  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  27983235 agatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacata 27983334  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
     |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||   | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27983335 agaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 27983434  T
Q  310 agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||   || ||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  27983435 agccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtttttgttgtt 27983485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 88 - 350
Target Start/End: Original strand, 32479058 - 32479320
Alignment:
Q  88 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagtt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  32479058 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggtt 32479157  T
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcac 287  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||| |||    
T  32479158 gaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaacac 32479257  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  32479258 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 32479320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 161 - 360
Target Start/End: Original strand, 21236951 - 21237150
Alignment:
Q  161 gtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21236951 gtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 21237050  T
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  21237051 atccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttgttgttgtt 21237150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 51421670 - 51422012
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||   || || ||||||||||    
T  51421670 gttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattaga--gagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaatag 51421767  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||    
T  51421768 gcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaaga 51421867  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
       || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  51421868 tttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatcc 51421967  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51421968 atgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 51422012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20591649 - 20591306
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||| | ||  ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20591649 gttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaa 20591550  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    ||||||||||    
T  20591549 aataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagag 20591455  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  20591454 gaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacacaatgacgtaattt 20591356  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||| ||  ||||     ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20591355 gattcatatattcgaccctttttagtgggataagacttgattgttgttgt 20591306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 196 - 356
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957886
Alignment:
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 6957886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45205197 - 45204840
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagt-gggggtagcacctatagtagtaaagttggtaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  45205197 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtaga 45205098  T
Q  100 aaataggctt--agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaa-------atgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaa 190  Q
    |||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||| |||        |||  || ||| ||||||||||||| |||||||| || ||  | |||    
T  45205097 aaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagag-cagatcaaa 45204999  T
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||| || | ||||||||| || ||     
T  45204998 agaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta- 45204900  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45204899 ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45204840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494945
Alignment:
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12494945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20601988 - 20601652
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||| | |||||| | ||| ||||| |||  ||||||||||| |||  ||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  20601988 tggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagttggtagaaaatagga 20601889  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || | |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||    
T  20601888 ttagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacc 20601789  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
       ||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||| |||    
T  20601788 -ttgaaaactataagagaaaccattagaaag-----tcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatgacgtaatttgattcat 20601695  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| | ||   ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  20601694 gtaactgaacccacttagtgggataagagttaattgttgttgt 20601652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41009699 - 41009419
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggt-aga 99  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  41009699 gttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaa 41009600  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||  |||  || ||||||| | ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  41009599 aaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtaga 41009500  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgata 281  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| || | |||||||    
T  41009499 ggaagacc-tggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgata 41009419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Original strand, 50679556 - 50679736
Alignment:
Q  119 gggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaacta 218  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50679556 gggcatgtagaaagaagatc-gtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 50679654  T
Q  219 ttagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| ||||||||    
T  50679655 ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1211732 - 1211385
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag--aaaatag 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||  || |||     
T  1211732 tggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcg--agagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatat 1211635  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || || | || ||||||||||||||||| |||||| | ||||   | ||||||| ||||||||||    
T  1211634 gcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaaga 1211535  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt-catttgatc 304  Q
    |  |||| |||||| ||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||| | | | ||||| ||||| |||||  |||||||     
T  1211534 cataggagaactataagataaattattagaaa-aaattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgatt 1211438  T
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  1211437 catgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttgttgtt 1211385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 346
Target Start/End: Original strand, 54470146 - 54470485
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||     
T  54470146 ttggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaga 54470245  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||   || ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||  ||||| | | ||||||    
T  54470246 cttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaattactagaggcaaaagaagac 54470345  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| || | |||||  ||||| ||| |||||||||||||||    
T  54470346 caagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagcattattgcgtcatttgatcca 54470445  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54470446 tgtagccaaccccacttagtgggattaggcttggttgttg 54470485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 16002860 - 16003165
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || | |||||||| |||  ||||||| |||||    
T  16002860 gttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgatagaa 16002959  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||| |||| ||||| || ||| | || ||||||  |||||    
T  16002960 aatagtcttagatggtt-gaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaatagag 16003058  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  16003059 gaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaattt 16003158  T
Q  301 gatccat 307  Q
     ||||||    
T  16003159 aatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 12494683 - 12494794
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12494683 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 12494782  T
Q  101 aataggcttaga 112  Q
    ||||||||||||    
T  12494783 aataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 196 - 345
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 196 - 359
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528579
Alignment:
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| |||||||| |     
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 21528579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518314
Alignment:
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||  || ||| ||||||||||||| ||||||   |||||| | | |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||||||||| | || | |||||||||  |||||||||    
T  53518374 ttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttgctgttgttgtt 53518314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 35690237 - 35690563
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||            ||||||    
T  35690237 gttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctata------------gtagaa 35690324  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||                     |||||||| ||| | |||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  35690325 aataggcttaggtggtttgggcatgtagataga---------------------agaagagtggattagatggaggaaagtcagatcaaaagaggtagag 35690403  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||||    | | ||||||||| || |||||||| ||||    
T  35690404 gaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacattatggcgtaattt 35690503  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  35690504 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttgttgttgtt 35690563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 31458961 - 31459098
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaaga--gagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31458961 gttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaaaagatggtag 31459060  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31459061 aaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821075
Alignment:
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagagg 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |  ||| || ||||||| | |||||| | | |||  | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  202 aagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgataga 283  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgataga 20821075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154857
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  340 attgttgttgtcgttgt 356  Q
     |||||||||| |||||    
T  19154873 gttgttgttgttgttgt 19154857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969463
Alignment:
Q  245 gaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  345 tgttgt 350  Q
    ||||||    
T  19969458 tgttgt 19969463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 349
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  186 ttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagc 285  Q
    |||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 346
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209312
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||      
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattaga----gagttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaa 10209072  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta--gaggaag 204  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | |  || ||||  | || ||    
T  10209073 cttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtagggggggag 10209172  T
Q  205 accgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatc 304  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||| |||  ||||||| ||||||     
T  10209173 acctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgatt 10209270  T
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  10209271 caagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttg 10209312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Original strand, 28351643 - 28351841
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| | |    
T  28351643 gtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaagatttagagatta 28351742  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     |||||||||||||||| |  | |||  |||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28351743 ttgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggctgttgttgt 28351841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 358
Target Start/End: Original strand, 37488136 - 37488381
Alignment:
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgagga 212  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||| | ||||||||||| ||| | ||| ||||  | |  | ||| ||||| ||||| || |    
T  37488136 tggttcgggcatgtagatagaagaccggtagatgttgtagtagggagagtagatcagatgcatgattgtcagatcaccataggcagaggtagacctagaa 37488235  T
Q  213 aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||| ||||  | ||| |||| |||| |||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37488236 aaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagc 37488335  T
Q  313 cgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37488336 cagccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttg 37488381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 273 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19062012 - 19061925
Alignment:
Q  273 tgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19062012 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 19061925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 271
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862847
Alignment:
Q  189 aaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattaga-gaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 50862847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7092568 - 7092290
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||| ||  ||||||||||||||| |||  || |||||    
T  7092568 gttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagtagaaaatatgatagaa 7092470  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||  | ||| ||||||||||||| ||||| || |||||    | ||||||| |||    
T  7092469 aataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcagaacataagaggtggag 7092370  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgata 281  Q
    ||||||| | || || ||| || |||| |||||  || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||| |||||||    
T  7092369 gaagaccta-gagaaatataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagatctaaatatgatttatgata 7092290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25257928 - 25257755
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||| | |||| |||||| | ||  |||| ||||||||    
T  25257928 gttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattaga--gagagttgaggtaacacctacaatataaaagatggtagaa 25257831  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg 176  Q
      ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  25257830 gctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggagg 25257755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 51252807 - 51252674
Alignment:
Q  2 ttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaa 101  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  51252807 ttgtgttagatgtgtcgtaagactagacgagataggattagaaatgactacattaga--gagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaa 51252710  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51252709 ctaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 49987361 - 49987487
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||||||||||| |||| |||| |||    
T  49987361 gttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagtagaaaagatggtggaa 49987460  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgta 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49987461 aataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 357
Target Start/End: Original strand, 55007917 - 55008035
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  55007917 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 55008016  T
Q  339 gattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  55008017 ggttgttgttgttgttgtt 55008035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13805510 - 13805257
Alignment:
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || || | || | ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  | |  ||||| |||||||     
T  13805510 ggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaa 13805411  T
Q  205 accgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatc 304  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||| |||   ||| |||||||   |||| || | ||||||||| || |||||  | ||||||||    
T  13805410 acctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatc 13805311  T
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13805310 catgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgttgttg 13805257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31961425 - 31961260
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||   | |  || |   ||||||| ||||||    
T  31961425 agaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactat 31961326  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    | |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31961325 gacgtcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 31961260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 33709852 - 33709992
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagaca-----ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttgg 95  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||    
T  33709852 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatgg 33709951  T
Q  96 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    | |||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  33709952 tggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  186 ttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagc 285  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||  ||||||  ||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||| || | | ||||||| |    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccgac-ccacttagtgggataaggcttg-ttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31897724 - 31897428
Alignment:
Q  52 cattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtg 151  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||   ||     
T  31897724 cattagagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgta 31897627  T
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    || || ||||| ||| | |||||||  |||||  | |  |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |    
T  31897626 gttaggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 31897527  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||   | |  || |   ||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31897526 atgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44047667 - 44047568
Alignment:
Q  31 ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44047667 ggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 2589162 - 2589360
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||  |||||||||| | |||| || ||||  || ||||||||||| |  | |||| ||||| | |||||||    
T  2589162 agagtagatcaaatggaggggagttaaattactagaggtagagcacgacctagaaaaagcataagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagt 2589261  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||  |||| || | | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2589262 tggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 2589360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238609
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 50238609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238695
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 50238695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 56224998 - 56225350
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagact---agacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggta 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||  || ||| ||| ||  ||||||||||  |||| |||||    
T  56224998 gttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataaga--gaaagttgggataatacctatagtataaaagatggta 56225095  T
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   | || |||| || ||| | |||||| |||| |||||||| |||| | | || | || ||    
T  56225096 gaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtctaatcaagaaagtta 56225195  T
Q  198 gaggaagaccgagga--aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    ||| |||| | |  |  ||||||| || | ||||||||  || | ||||||||| ||| | || ||||||||| || | | | ||||| |||||||  ||    
T  56225196 gagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgt 56225295  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  56225296 aatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataaggatcggttgttgttgt 56225350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024851
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||  ||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| | |  || | ||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttg 26024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356811
Alignment:
Q  75 cacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgga 174  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||   | | || ||||| ||||||||||  |||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  175 ggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 260  Q
    ||  |||||| | |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939734
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 49939734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38571095 - 38570960
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||||||||  |||| | || |||    
T  38571095 gttgtgttggatgtgtggtac-actagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagtggaa 38570997  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38570996 actaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 28497451 - 28497600
Alignment:
Q  31 ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg--ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtag 128  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |  |||||||||||| |||||| |||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28497451 ggataggattagaaatgacaacatcagagagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtag 28497549  T
Q  129 agagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggata 179  Q
    |||||||||  ||| ||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28497550 agagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggaggata 28497600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Original strand, 31459146 - 31459273
Alignment:
Q  220 tagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc 319  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||| || ||| |||| || || |||||||  | |||||||||||| |||||  |    
T  31459146 tagaaaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgacccc 31459245  T
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31459246 acttagtgggataaggcttggttgttgt 31459273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 46371987 - 46372306
Alignment:
Q  31 ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||  | ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  46371987 ggatagaattagaaatgatgacattagagatagagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagag 46372086  T
Q  131 agaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaacta 230  Q
    |||||||  ||  ||   ||  ||||||||| |||||| || ||||  || ||  | |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  46372087 agaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaacta 46372186  T
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggga 330  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||| |||  | ||||| |||||| |||||||| |||  |||||||| ||     
T  46372187 ttaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttggg 46372286  T
Q  331 taaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  46372287 taaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30634167 - 30634097
Alignment:
Q  289 atggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30634167 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 30634097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42639354 - 42639020
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatgg 115  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  |||  || | ||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||| |||    
T  42639354 tggtaacactagacgggataggattataaatagcaaccttagagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtgg 42639255  T
Q  116 tttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaa 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||   ||||||||  | ||| || | |||||||  |||||| | |  ||||||||||||| | | || ||||    
T  42639254 tttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatcactagaggtagaggaatatctagaaaaa 42639155  T
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    ||   |||||||||||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  |||| || | | ||||||| || ||||||||| | | || ||||||||| |    
T  42639154 ctgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatggcgtcgtgtaattcatgtagccaa 42639055  T
Q  316 catcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |  | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42639054 ccccgcttagtgggataaggcatgcttgttgttgt 42639020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 17900413 - 17900550
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||  ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  17900413 gttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagtagaaaagacggtagaa 17900512  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    | ||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17900513 actagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557671
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||  |||||| |  || | || |||||||||| |||| || | ||||||||| || |||    
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 2557732  T
Q  291 -ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     || || ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2557731 tggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2557671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35555937 - 35555650
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||   || || || ||    
T  35555937 agagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagttaggag 35555838  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||| | || ||||| |||   || |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||   |||  | ||||| | |||||||||    
T  35555837 agtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatt---aagagtctagagataaatgagttg 35555741  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||   | |  || | | ||||||  || ||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  35555740 gagaaagacatggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgt 35555650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 350
Target Start/End: Original strand, 5306452 - 5306578
Alignment:
Q  224 gaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactt 323  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || | ||||| | | || |||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||||    
T  5306452 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccactt 5306551  T
Q  324 agtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5306552 ggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32633479 - 32633401
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  32633479 tgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgttg 32633401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 50662322 - 50662457
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |   ||||||||| | ||||||| |||||||  ||||||  ||| | |||||||||||| |||| |||| |||    
T  50662322 gttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattaga--gagagtttgggcaacacctatagtagaaaagatggtggaa 50662419  T
Q  101 aataggcttagatgg-tttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  50662420 agtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagac 50662457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10775771 - 10775654
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10775771 gttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagtagaaaagatggtagaa 10775672  T
Q  101 aataggcttagatggttt 118  Q
    | ||| | ||| ||||||    
T  10775671 actagacataggtggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 355
Target Start/End: Original strand, 25574982 - 25575111
Alignment:
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    ||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||||| |||  || ||||    
T  25574982 aactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttag 25575081  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25575082 tgggataaggcttggttgttgttgttgttg 25575111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208269
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttga 340  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||||||     
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  341 ttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgt 34208269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44719432 - 44719351
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  44719432 atagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttgttgttgtt 44719351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 262
Target Start/End: Original strand, 55579057 - 55579226
Alignment:
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaag 192  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    ||||||| || ||| |||||||| ||   |||||||| |||||| | |||||    
T  55579057 tggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaaag 55579156  T
Q  193 aggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| | | ||||||||   || |||||| ||||  |||||||||||    
T  55579157 aggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggat 55579226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809075
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 265  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatcca 55809075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25755250 - 25755425
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaag-ttggtaga 99  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| | ||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||    
T  25755250 gttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaatagaaa-agagttggggtagcacctatcttagaaaagaaaggtgga 25755348  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg 176  Q
    |||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||  || ||   || ||||| |||||||||||||||||||    
T  25755349 aaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacctatagattatgttgtaagtagagtagatcaaatggagg 25755425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 347
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339803
Alignment:
Q  52 cattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtg 151  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||   ||     
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaat-ggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgta 31339619  T
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||  ||||||| | |  ||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||    |||       | ||||| | |    
T  31339620 gtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtcaa-tcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgagaa----tta-------tctagagatta 31339707  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||||| |||| || |  |||||||| || |||| |||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31339708 atgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataaggcttgcttgttgt 31339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40933004 - 40932924
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40933004 tgatatatgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgt 40932924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 41192767 - 41192906
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg--ggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||||||||||  ||||  ||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| |||| |||| |    
T  41192767 gttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatggtgg 41192866  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  41192867 aaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacc 41192906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45209280 - 45209200
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45209280 tatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 45209200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Original strand, 49987514 - 49987690
Alignment:
Q  174 aggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgat 273  Q
    ||||||||||| | |  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || || || ||| | |||||| ||||||||| | || |    
T  49987514 aggatagtcaattcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggt 49987613  T
Q  274 gtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
      ||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||  |||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  49987614 tcatgatagagcattatggcgtaattttatccttctagttgaccccacttagttggataaggtttggttgttgttgt 49987690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 263
Target Start/End: Original strand, 50680704 - 50680935
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gggcatgtagaga 131  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||  ||| | |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  50680704 ataggattggaaataacaacattagagagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagaga 50680803  T
Q  132 gaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaacta- 230  Q
    |||| |  ||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |  | |  | ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||     
T  50680804 gaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaaggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattat 50680903  T
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 263  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  50680904 ttagaaa-gatctagagattaatgagttggatc 50680935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427466
Alignment:
Q  45 atgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaa 144  Q
    |||||| ||||||| ||||||   |||||| || |||||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacctgtgga 1427490  T
Q  145 tgtcgtggtaagaagagtagatca 168  Q
    | | |||||||| |||||||||||    
T  1427489 ttttgtggtaaggagagtagatca 1427466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15661934 - 15661863
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  15661934 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttgttgttgt 15661863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34233382 - 34233035
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaa--gagagtgggggtagcacctatagtagtaaa-gttggta 97  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||      
T  34233382 gttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtagaaaaagttggg- 34233284  T
Q  98 gaaaataggcttaga-------tggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaa 190  Q
    |||||| |||||||        |||||||| ||||||||||||  ||  ||| ||   || ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  | |      
T  34233283 gaaaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatcgtcagatcact 34233184  T
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||   || ||  ||||| | |||||||| |||| ||||  | | ||||||||| || | |    
T  34233183 agaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgt 34233084  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
     |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||    
T  34233083 agcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttg 34233035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 44360016 - 44360155
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaa----agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| ||||| |||||||  ||||||     ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  44360016 gttgtgttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggt 44360115  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44360116 agaaacta-gattaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 332
Target Start/End: Original strand, 47372676 - 47372915
Alignment:
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaag 192  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  || | || | ||||||||||||| | | ||||| ||||||| | |  ||    
T  47372676 tggtggaaactagacttcgatggtttaggcatgtagagcgaagacccgtggattttgtaggaagaagagtagattagacggagggtagtcaaatcactag 47372775  T
Q  193 aggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatgg 292  Q
    ||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||| ||  || |||  |||| | ||||||||||||  |||| || | ||| ||||| || |||||    
T  47372776 aggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagttggatagaaatatggtatattatagaacattatgg 47372875  T
Q  293 cgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
     ||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  47372876 agtcgtttgatccatgtagcccatcccacttagtgggata 47372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540572
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| || || || ||| | |||||||||||   |||| || | ||||||||| || |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgt 53540572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 327
Target Start/End: Original strand, 31043201 - 31043331
Alignment:
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||| || |     
T  31043201 agaggaagacccagataaactaaaagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcata 31043300  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtg 327  Q
    ||||||||| || ||| |||  |||||||||    
T  31043301 atttgatccttgcagctgaccccacttagtg 31043331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 50471461 - 50471596
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||| |||   ||||||||||  |||||| |||||||  |||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||| |||    
T  50471461 gttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattaga--gagactcggggtagcactaatagtagaaaagatggtggaa 50471558  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    | |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50471559 actaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagacc 50471596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879109
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgt 4879109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7066571 - 7066491
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7066571 tgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttg 7066491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 348
Target Start/End: Original strand, 17900691 - 17900760
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17900691 atagagcactatggcgttgtttgattcatttagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 17900760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20105593 - 20105508
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  20105593 tatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgttgttgttgtt 20105508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550455
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | | |||||||   |||||   | |||||||| ||||||| |||  ||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacccca 28550485  T
Q  321 cttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  28550484 cttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 55388310 - 55388213
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||| |||| |||| |||| ||||||||| || | ||| || ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55388310 aatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666067
Alignment:
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||| ||   || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||| ||||| ||     
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcatattacaagagatat 17666195  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    | ||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| |||  |||       ||||||||| || |||| |||  |    
T  17666194 atgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagatttatagattaatgagttagatgaaaa-------tatgatagaacaatatgacgtatt 17666102  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataa 333  Q
    | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  17666101 tcgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataa 17666067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22420961 - 22420717
Alignment:
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | | | || | ||  |||||||||||||| | |||||| ||| |||| | |  ||||| |  |||    
T  22420961 taggcttaggtgatttggacatgtagagagaagatctgaagattttgtaataagaagagtagataagatggagaatattcaaatcactagaggcaaggga 22420862  T
Q  203 agaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttga 302  Q
    |||   || |||||||| |||  |||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||  | || || |  ||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22420861 agatttagaaaaactataaga--aactataagaaag-atctagagattaatgagttggatagagatatggtaaatgatagagcattatggcgttgtttga 22420765  T
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || ||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22420764 tctatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 22420717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 8284346 - 8284421
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8284346 tatgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Original strand, 15665324 - 15665383
Alignment:
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15665324 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15665383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209175
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgtttttgt 29209175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 29399011 - 29399086
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29399011 tatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 29399086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30621501 - 30621418
Alignment:
Q  53 attagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30621501 attagagagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37042798 - 37042667
Alignment:
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||| | | ||||||||||  ||||  | | | ||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37042798 ctataagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccga 37042699  T
Q  316 catcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37042698 cccgacttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 355
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153995
Alignment:
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 46153995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50967090 - 50967019
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  50967090 tatgtcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgttattgttgt 50967019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 3979127 - 3979201
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3979127 tatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Original strand, 13296566 - 13296712
Alignment:
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||| | ||||  | |||||| |  | || ||| |||| ||||    
T  13296566 gaagacctaggaaagctattagagatactattagacaagatttggaaattaatgagttggaccgaaatacggtgtatggttaaacattatagcgtaattt 13296665  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  13296666 gatgcatgcagccgacctcacttagtgggaaaatgcttggttgttgt 13296712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 29398822 - 29398888
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29398822 tagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacc 29398888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 360
Target Start/End: Original strand, 32339761 - 32339851
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| | |    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32339761 tgatatatgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 32339851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40018327 - 40018189
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| ||| ||||| |||  || ||| ||||| ||||||||||||||    || |||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  40018327 aaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagatcaatgagttggatagggatatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtag 40018228  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||  |||||||||| ||||  |||| ||| ||||||    
T  40018227 ccgaccccacttagtggaataaaacttgtttgctgttgt 40018189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 350
Target Start/End: Original strand, 47372936 - 47372986
Alignment:
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47372936 tgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50869950 - 50869880
Alignment:
Q  280 tagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50869950 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50869880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Original strand, 20999129 - 20999282
Alignment:
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||| || |||||||| | | |||||||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  | || ||   |||| ||||||| |||| ||||    
T  20999129 agaggaagacctagaaaaactataatataaactattaagaaagatctagagtttaatgagttgaataaatatatggcatatggtagagcattatgacgtc 20999228  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20999229 gtttgatccttgtagccgaccccactcagtgggataaagcttgattgttattgt 20999282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 332
Target Start/End: Original strand, 28486092 - 28486185
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||  || || || |||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  28486092 gatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagctgacctcggttagtgggata 28486185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 43070113 - 43070056
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga 58  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43070113 gttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattaga 43070056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20131274 - 20131167
Alignment:
Q  75 cacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg-gcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgg 173  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||   ||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  20131274 cacctatagtagaaaaat-ggtagaaaatagacttagatgtttttttgcatgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaatgg 20131176  T
Q  174 aggatagtc 182  Q
    |||| ||||    
T  20131175 aggagagtc 20131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 21106917 - 21107236
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaa----gagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||||| | |    |||||| | ||||| | ||||||||| || | | ||    
T  21106917 gttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtatctatagtagaaaggatagt 21107016  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagaccc---gtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaa-atggaggatagtcaagttaaaag 192  Q
     |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||     ||| ||   || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||  | |   |    
T  21107017 tgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggtagtcagatcactgg 21107116  T
Q  193 aggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatgg 292  Q
    | | || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || | ||||| | | ||| |||||||||||||| || | ||||||||| |  |||||    
T  21107117 atgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgatagaactttatgg 21107216  T
Q  293 cgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    | |  ||||||| |||||||    
T  21107217 cttagtttgatctatgtagc 21107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 34585702 - 34585762
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34585702 tatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41009356 - 41009288
Alignment:
Q  213 aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgata 281  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  41009356 aaactataagagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgata 41009288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285912
Alignment:
Q  78 ctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacc 42285912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 45423552 - 45423681
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |    |||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  45423552 gttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattata----gagttgaggtagcacctataatagaaaagatggtagaa 45423647  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    | | | ||||  |||||| | |||||||| ||||    
T  45423648 acttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 46715649 - 46715585
Alignment:
Q  73 agcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46715649 agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Original strand, 47611757 - 47611797
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47611757 gaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 47611797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738550
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 345
Target Start/End: Original strand, 50862860 - 50862908
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50862860 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 51438665 - 51438733
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51438665 tatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 51438733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130452
Alignment:
Q  302 atccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 56130452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21945836 - 21945678
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |  |||||  |||||||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||| ||  | |    
T  21945836 gtaaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagatttggaaatta 21945737  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||||||||||   |||| || | ||||||||| |   |||||||  ||||||||||||||||    
T  21945736 atgagttggactgaaatatggtttatgatagaac---atggcgtattttgatccatgtagcc 21945678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36557348 - 36557246
Alignment:
Q  31 ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    |||||| ||||| ||||||   ||| || ||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  36557348 ggatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtagag 36557250  T
Q  131 agaa 134  Q
    ||||    
T  36557249 agaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38841798 - 38841607
Alignment:
Q  153 taagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaa 252  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||  | || |||| ||||||||||||| | |  |||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||  | ||    
T  38841798 taagaatagtagatcaagtcgaggagagctaggtcaaaaaaggtagaggaagatctat-aaaattataagagaaattgttagaaaagatttagatttgaa 38841700  T
Q  253 tgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||  |||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  38841699 tg--ttggattcaaatatgttctataatagaacactatgatgtgatttgatctatgtaaccgacttcatttagtgggataaaacttgattgttgt 38841607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Original strand, 46236708 - 46236771
Alignment:
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  46236708 ctatggcgtactttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 336
Target Start/End: Original strand, 1380600 - 1380638
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggc 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1380600 tttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggc 1380638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25427956 - 25427862
Alignment:
Q  256 gttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||  |||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  25427956 gttggatctaaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgt 25427862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36255596 - 36255526
Alignment:
Q  276 atgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36255596 atgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttg 36255526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 346
Target Start/End: Original strand, 49686913 - 49686971
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49686913 tatggcgtcgtttgaaccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttg 49686971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Original strand, 1095652 - 1095725
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1095652 tatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8599014 - 8598957
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataag 334  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8599014 tgatagaacattatggcgtcgtttgattcatgtagccgacgccacttagtgggataag 8598957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31403171 - 31403034
Alignment:
Q  213 aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||| ||| |||||||||  || ||| ||||| | ||| ||||||||  |||| || | |||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||     
T  31403171 aaactataagaaaaactattatgaaagatctagagattaattagttggatagaaatgtggtatatgatagagcattatggtgttgcttgatccatgtaga 31403072  T
Q  313 cgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||  |||||||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  31403071 cgaccccacttagtaggataaaacttggttgttgttgt 31403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36799710 - 36799657
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36799710 atttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729494
Alignment:
Q  249 tcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 44360295 - 44360368
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  44360295 tgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgt 44360368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49454510 - 49454469
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49454510 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 49454469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 2588914 - 2589056
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg----------ggggtagcacctatagtagtaaa 90  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||  || ||| |          ||||||| ||||||||| | |||    
T  2588914 gttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattagggagggagggagggagggttggggtagtacctatagt-gaaaa 2589012  T
Q  91 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    | ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2589013 gatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaa 2589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21359287 - 21359227
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21359287 tatggcgtaatttgattcatgcagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgtt 21359227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25959281 - 25959221
Alignment:
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  25959281 catttgatccttgtagccaacctcacctagtgggataagacttggttgttgttgttgttgt 25959221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 45175941 - 45176075
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||| |||||||   ||| | ||||||| |||||||  ||||| |||| |||| |  || ||    
T  45175941 gttgtcttggatgtgtggtagtactagacaagataatattagaaatgacaatgtta-agagagagttggggtagtgcctattgtagaaaagattcta-aa 45176038  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45176039 aattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 45176075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6958310 - 6958255
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataa 333  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  6958310 gatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa 6958255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7544584 - 7544537
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgt 344  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  7544584 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgt 7544537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Original strand, 41192244 - 41192343
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||| |||| || |||||| || || ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41192244 aatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataaggcttggttgttgttgt 41192343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 361
Target Start/End: Original strand, 47147496 - 47147664
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||   |||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  | || |||| ||||||||| || |||    
T  47147496 agaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggat--agatatgatatatgatagaacattat 47147593  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtta 361  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||  |  || |||||||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||    
T  47147594 ggcattgtttgatccatgtaaccatccccaattagtgggataaggcccggttgttattgctgttgttgtta 47147664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738815
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagaccc 139  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||| || |||| || |||| |||||||||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagaccc 49738815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 50288099 - 50288012
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgata 281  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| || | |||||||    
T  50288099 ggtagaggaagacttagaaaaactataagataaattattaaaaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgata 50288012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 56439709 - 56439570
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||||||||  || ||||| ||  | ||| ||||||||| |||| || | ||||||||| || ||| |||| |||| |||||| |||    
T  56439709 aaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatccatatag 56439610  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggc-ttgattgttgttgt 350  Q
    || ||  ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  56439609 ccaaccccacttagtgcgaaaaggctttgcttgttgttgt 56439570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 13262421 - 13262491
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  13262421 tgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16875851 - 16875749
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||| |||||| |||| ||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  16875851 aatgtgttggacccaaatatgatttatgatagaacattattatgtaacttgatccatgtagcagaccccactttgtggaaaaaggtttgattgttgttgt 16875752  T
Q  351 cgt 353  Q
    |||    
T  16875751 cgt 16875749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21879204 - 21879147
Alignment:
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggc--ttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21879204 tcatttggtccatgtcgccgactccacttagtgggataaggcttttgattgttgttgt 21879147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 32613650 - 32613712
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |   |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32613650 tatgacgtcgtttgatccatgtagccaatcacacttaatgggatatggcttgattgttgttgt 32613712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 360
Target Start/End: Original strand, 35585859 - 35585897
Alignment:
Q  322 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35585859 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 35585897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 813147 - 813200
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  813147 atttgatccatgtagcagaccccgcttagtggaataaggcttggttgttgttgt 813200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 20605241 - 20605306
Alignment:
Q  112 atggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||   |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  20605241 atggtttgggcatgtagagagaagagctgtagattctgtggtaaggagagtatatcaagtggagga 20605306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22241316 - 22241239
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  22241316 tgatttatgatagagaattatggtgtcgtttgaaccatgtagccgactccacctagtgggacaaaacttgattgttgt 22241239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||  ||| |||| |||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 25967609 - 25967552
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag 65  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  25967609 tggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagagag 25967552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28764419 - 28764374
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28764419 catgtagccgacctcatttggtgggataaggcttggttgttgttgt 28764374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39761408 - 39761343
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataagg 335  Q
    |||||||| ||||| ||  |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39761408 tgatgtataatagaacatcatggtgtcctttgatctatgtagccgacttcacttagtcggataagg 39761343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40018465 - 40018396
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||||| |||  |||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  40018465 ggggtagcacctatcgtaaaaaagatggtagaaacttggcttatgtggtttgggcatgccgagagaagac 40018396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42293403 - 42293258
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||  | |||||||| |||  | || || | |||||||||||| || |   |||||| ||| ||||||    
T  42293403 aaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacgatatcatttaatctatgtag 42293304  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||| |  |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  42293303 ccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttgttgtt 42293258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Original strand, 43774098 - 43774139
Alignment:
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43774098 tagccgaccccatttagtgggataaggcttgattgttgttgt 43774139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 48451104 - 48451063
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48451104 cacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 48451063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Original strand, 52357924 - 52357965
Alignment:
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  52357924 tagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 52357965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 55768798 - 55768717
Alignment:
Q  53 attagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55768798 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 55833054 - 55832973
Alignment:
Q  53 attagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55833054 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 174)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1210678 - 1211027
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1210678 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 1210777  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1210778 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 1210877  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1210878 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 1210977  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1210978 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1211027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30202479 - 30202121
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30202479 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaa 30202380  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30202379 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagag 30202280  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30202279 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 30202180  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30202179 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 30202121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49347742 - 49347393
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49347742 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaa 49347643  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49347642 aataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 49347543  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49347542 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 49347443  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49347442 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34792691 - 34792349
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34792691 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggc 34792592  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792591 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 34792492  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34792491 taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 34792392  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34792391 gtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 34792349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 8671853 - 8672205
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8671853 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8671950  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8671951 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 8672050  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8672051 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcattt 8672150  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8672151 gatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgttg 8672205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 3 - 350
Target Start/End: Original strand, 22090029 - 22090378
Alignment:
Q  3 tgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag--agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22090029 tgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 22090128  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22090129 aataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagag 22090228  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22090229 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 22090328  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22090329 gatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgt 22090378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 51601991 - 51602344
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51601991 gttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattaga--gagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 51602088  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51602089 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 51602188  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  51602189 gaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcattt 51602288  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51602289 gatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 51602344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 9592667 - 9593016
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9592667 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaa 9592766  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9592767 aataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 9592866  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9592867 gaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcattt 9592966  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9592967 gatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 9593016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51441108 - 51440765
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51441108 ttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 51441009  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51441008 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagac 51440909  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  51440908 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattca 51440809  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51440808 tgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 51440765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43240730 - 43240380
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag--tgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  43240730 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatag 43240631  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  43240630 aaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtag 43240531  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43240530 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 43240431  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43240430 ttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 696209 - 696552
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  696209 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 696308  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  696309 ttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacc 696408  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcacta-tggcgtcatttgatcca 306  Q
     | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  696409 taagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaa 696508  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  696509 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 696552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32231294 - 32230997
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32231294 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggctt 32231195  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32231194 agatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 32231095  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  32231094 ggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4001795 - 4001455
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4001795 gatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 4001696  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4001695 agatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagaccta 4001596  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
     |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  4001595 agaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccatgt 4001496  T
Q  310 agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4001495 agccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 4001455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 60 - 358
Target Start/End: Original strand, 4029114 - 4029412
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4029114 agagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaag 4029213  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4029214 aatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttg 4029313  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  4029314 gatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgttgttg 4029412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 15085874 - 15086204
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15085874 tggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 15085973  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15085974 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagaggaagacc 15086073  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | ||            |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15086074 taaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 15086161  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15086162 gtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15086204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 8391705 - 8392060
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8391705 gttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8391804  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |     
T  8391805 aataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatat 8391904  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  8391905 gaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcattt 8392004  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||| |||  | |||||||| |||||    
T  8392005 gatccatgtagccaaccccacttagtaggaaaagacttagtcgttgttgttgttgt 8392060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38808023 - 38807671
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag----tgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38808023 gttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 38807925  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||| |    
T  38807924 agaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagct 38807825  T
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    || |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||     
T  38807824 aggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgta 38807725  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38807724 atttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38807671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32083087 - 32082768
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32083087 tggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 32082988  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32082987 ttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacc 32082888  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggc-gtcatttgatcca 306  Q
     | ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  32082887 taaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatcca 32082800  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  32082799 tgtagccgaccccacttagtgggaaaaggctt 32082768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 88 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25979493 - 25979224
Alignment:
Q  88 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagtt 187  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  25979493 aaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcaggtt 25979394  T
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcac 287  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  25979393 aaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacac 25979294  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25979293 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 25979224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 9509251 - 9509566
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  9509251 gttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaaaa 9509350  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||   | |||   ||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  9509351 aataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagag 9509450  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||   |||||||| || |||||| || | |||||| || || |||||||| |||     
T  9509451 gaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattc 9509550  T
Q  301 gatccatgtagccgac 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  9509551 gatccatgtagccgac 9509566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9599743 - 9599401
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  9599743 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaa 9599644  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||| | | ||||  | |||  |||||||||||| |||||||| |||||  | | |||||||||||    
T  9599643 aataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagag 9599544  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||| || || | ||||||||| |  |||||||| ||||    
T  9599543 gaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaattt 9599444  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg 343  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||||    
T  9599443 gatccatgtagctgaccttacttagtgggaaaaggattgattg 9599401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37463214 - 37462878
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  37463214 ttggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattag--agagagttggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaatagg 37463117  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtc-aagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||| ||||||||||   || |||| ||||  ||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |   |||||||||||||||  |    
T  37463116 cttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggatta 37463020  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || || |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  37463019 cctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatcc 37462921  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37462920 atgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311755
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 37311755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318410
Alignment:
Q  131 agaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaacta 230  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  39318193 agaagacccgtagatg-cgtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgac-ccgcttagtggga 39318390  T
Q  331 taaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgt 39318410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 185 - 350
Target Start/End: Original strand, 52921197 - 52921362
Alignment:
Q  185 gttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagag 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||     
T  52921197 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaa 52921296  T
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52921297 cactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27848153 - 27847811
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  27848153 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtagaa 27848055  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  || ||| |||||||| |||| |||||||| |||||  | | |||||||||||    
T  27848054 aataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtagag 27847955  T
Q  201 gaagacc-gaggaaaactattagagaaactatta-gaaag---gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    |||||||   | |||| ||| |||||||||| ||  ||||   ||||||||||| |||||||| | |  |||| || | |||||| || || |||| |||    
T  27847954 gaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgccgt 27847855  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
     |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27847854 aattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttg 27847811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 39140468 - 39140794
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatgg 115  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||| |||    
T  39140468 tggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtgg 39140567  T
Q  116 tttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||  ||| ||||||||||||||   | |  |||     
T  39140568 tttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaag 39140664  T
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
     |||  ||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||| || | |  |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39140665 ttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccga 39140762  T
Q  316 catcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |  ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39140763 ccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || |||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtca 297  Q
    |||||||||  || |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |  | |||| || |||||||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18469424 - 18469081
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  18469424 gttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattaga--gagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaatag 18469327  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    | |||| | |||||| ||| ||| ||||||||  ||| |||| || ||| |||||||| |||| |||||| | ||||   | |||||||||||| |||||    
T  18469326 gattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaaga 18469227  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    |  || |||| ||| ||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| || || ||||| || ||||| | |    
T  18469226 cttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttc 18469127  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  18469126 atgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgtc 18469081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404527
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatca 168  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||    | ||||| ||||||||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  169 aatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
     ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  269 ttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     || | ||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgt 32404527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431399
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || | || ||||  ||||| ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  168 aaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggt-------caatgagttgg 260  Q
    | |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |        ||||||||||    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| || | | ||||| | ||  ||||| | ||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 48431399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Original strand, 2544591 - 2544875
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||    | ||||| ||    
T  2544591 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaaggag 2544690  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||     | ||||| ||  |||||||||||    
T  2544691 agtagatcagatggaggatagtcaa-acactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagttg 2544784  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || | |||| || | ||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  2544785 gagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707221
Alignment:
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggat 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  332 aaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgt 4707221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 240 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020267
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  340 attgttgttgt 350  Q
     ||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgt 24020267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079177
Alignment:
Q  218 attagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgaca 317  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgacc 32079210  T
Q  318 tcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32079209 ccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 32079177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 360
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5339005
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 170  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||   | ||||| ||||||||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  171 tggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    ||||||||| |||  | |  ||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||           ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  5338827 tggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa-----------gatctagagattaatgagttggatcgaaatgt 5338915  T
Q  271 gatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  5338916 gatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggctcggttgttgttgttgttgttgtt 5339005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34827451 - 34827180
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||   ||||   ||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  34827451 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgact--attatgtagagagttggggtagcgcatatagaagtaaagatggtagaa 34827354  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||  || |||   | ||||||| ||||||| | |||||||| ||| | |||| || |  || ||    
T  34827353 aataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttagaaaaaataaag 34827254  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagagg-tcaatgagttggatccaaatttgat 273  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  34827253 gaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtttaatcagttgaatccaaatatgat 34827180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 192 - 350
Target Start/End: Original strand, 41560353 - 41560511
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatg 291  Q
    |||||||| ||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| || ||||    
T  41560353 gaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatg 41560452  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41560453 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751766
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44751766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 350
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796491
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||  | |||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||  | |  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtca 297  Q
    |||||||||| |  |||||| | |||||||||||||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| || | ||||||||| || |||||||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 8796438  T
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8796439 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 8796491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Original strand, 4415469 - 4415631
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcac 287  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| ||     
T  4415469 aaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacat 4415568  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| | ||| |||| ||||||||||    
T  4415569 tatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgt 4415631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 43423671 - 43423788
Alignment:
Q  20 aagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  43423671 aagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttg 43423770  T
Q  120 ggcatgtagagagaagac 137  Q
    | ||||||||||||||||    
T  43423771 gccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 215 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10200441 - 10200306
Alignment:
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  10200441 actatgagagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccg 10200342  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  10200341 acctcacttaatgggataatgcttggttgttgttgt 10200306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 335
Target Start/End: Original strand, 40416363 - 40416638
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| || | || ||||| ||    
T  40416363 agagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaaggag 40416462  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  | |  | ||  ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||  || ||| || || | |||||||||    
T  40416463 agtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatgagttg 40416562  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataagg 335  Q
    |||| |||| || | ||||||||| || ||||| || || |||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  40416563 gatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtgggttaagg 40416638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctta 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  111 gatggttt 118  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 350
Target Start/End: Original strand, 6025557 - 6025887
Alignment:
Q  20 aagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||  || | |||| |||| ||||||||||||  |||    
T  6025557 aagactagactggataagattagaaatgatagcattaaagagatagttgggttagcacctatagtaaaaacgatggttgaaactaggcttagatgacttg 6025656  T
Q  120 ggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactat 219  Q
    |||||||| |||||| |||  |  ||       |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| | |  ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  6025657 ggcatgtacagagaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactat 6025756  T
Q  220 tagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc 319  Q
     ||||| |||| || ||| ||| ||||| | ||||||||||||  |||| || | | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6025757 aagagatactagtaaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattcc 6025856  T
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  6025857 acttagtgggataatacttggttgtttttgt 6025887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36624191 - 36623897
Alignment:
Q  25 tagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |  ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36624191 tagacgggatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggttt-ggcat 36624093  T
Q  125 gtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagag 224  Q
    || ||||||||||  |||      || ||| ||||||||||||| |||||||| ||||   | | ||||||||||||||||||            |||||    
T  36624092 gtcgagagaagactggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacc------------tagag 36624010  T
Q  225 aaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggc-gtcatttgatccatgtagccgacatcactt 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || | || ||| || || |||||| || |  |||||||||||| ||||   ||||    
T  36624009 aaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggctgtaa--tgatccatgtagtcgaccctactt 36623912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3819146 - 3818851
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||| | || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||  ||    | ||||  ||    
T  3819146 agagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaaagag 3819047  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||   |  ||||  |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||    
T  3819046 agtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttg 3818947  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
     ||  |||| || | |||||| || || |||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  3818946 aatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgttg 3818851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Original strand, 29577452 - 29577534
Alignment:
Q  268 tttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29577452 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29577534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941776
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44941776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggat 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaaca---tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  332 aaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14226175 - 14225995
Alignment:
Q  2 ttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaa 101  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||  |||||| |  |||||||||||  ||| |||| |||| ||||    
T  14226175 ttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattgga--gagagttgcagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaa 14226078  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaa 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| || | || ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  14226077 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagaggattcctgtagattttgtagtaaggagagtagatcacatggagcgtagtcaa 14225995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 350
Target Start/End: Original strand, 19936612 - 19936742
Alignment:
Q  220 tagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc 319  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| || |  |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  19936612 tagaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactcc 19936711  T
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19936712 gcttagtgggataagacttgattgttgttgt 19936742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 350
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38869164
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaa 143  Q
    ||||||| ||||| | |||| || || |||||||||||  ||| |||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||     
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtag 38868957  T
Q  144 atgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggattt 243  Q
    ||    | |  || ||||||||| | ||||||| ||||||| | |  ||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||  || ||| |    
T  38868958 attctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatct 38869057  T
Q  244 agaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg 343  Q
    || | | |||| |||||||  | || || | ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||    
T  38869058 agcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttg 38869157  T
Q  344 ttgttgt 350  Q
     ||||||    
T  38869158 ctgttgt 38869164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 1661359 - 1661500
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattag----gaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||   |||||||||||    ||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1661359 gttgtgttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatgaatgacaatatttgagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggt 1661458  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1661459 ggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 360
Target Start/End: Original strand, 5113940 - 5114035
Alignment:
Q  265 aaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  5113940 aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttgttgttgtt 5114035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Original strand, 29128927 - 29129065
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgat-ccatgta 310  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| || | ||||||||| || ||||| || || |||| |||||||    
T  29128927 aaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgta 29129026  T
Q  311 gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  29129027 gccgaccccacttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52532745 - 52532619
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| | |||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||    
T  52532745 agagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacccca 52532646  T
Q  321 cttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||    
T  52532645 cttagtgggaaaaggcttggttgttgt 52532619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090689
Alignment:
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgttg 28090689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  249 tcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||||| | |||| || | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  349 gt 350  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941580
Alignment:
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtca 297  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||  | | || | ||||||| | || ||||||||      
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11941632 tttgatccatgtagtcggcctcacttagtgggatacggcttggttgttgttgt 11941580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25715401 - 25715326
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25715401 tatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27520428 - 27520233
Alignment:
Q  125 gtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaa--ctattag 222  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| |      | | |||||| |||||||||| ||||||||  |  ||||  |||| ||    
T  27520428 gtagagagaagacatgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaga------aaaatcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataag 27520335  T
Q  223 agaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcact 322  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  || ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27520334 agaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacctcact 27520235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 28533674 - 28533749
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28533674 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36340093 - 36339804
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||  || || | || |||||  |    
T  36340093 agagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaaggcg 36339994  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
     || ||||| ||||||||||   |  | |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||||    
T  36339993 ggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagttg 36339895  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||   |||  || |  |||||| | || ||||  || |||||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  36339894 gacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084267
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  351 cgttgttgtt 360  Q
     |||||||||    
T  6084258 tgttgttgtt 6084267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444644
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| ||| | || ||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  351 cgttgt 356  Q
     |||||    
T  34444639 tgttgt 34444644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Original strand, 41165502 - 41165571
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  41165502 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgttgtt 41165571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19908371 - 19908040
Alignment:
Q  18 gtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 117  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| |||||||  |||| | ||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||  ||||  | | |||| || ||    
T  19908371 gtaagactagacatgacagggttagaaatgacaaaattaaagagagagttgtggtagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatt 19908272  T
Q  118 tgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaa---- 213  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||   || ||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||  | |  | ||||||||| ||||  || ||        
T  19908271 tgggcatgtagagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagcaaatcagatgga-gatagccagatcagtaaaggtagaggtagacttagaaaatta 19908173  T
Q  214 -aactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
     |||||| ||||| || |||||||    ||||||| | |||||||||||| ||||| || | |||||| || || ||| |||| |||| |||||||||||    
T  19908172 taactataagagacacgattagaatttttttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagc 19908073  T
Q  313 cgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19908072 cgaccccacttagtgggataaggcttgattgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 266
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299283
Alignment:
Q  170 atggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 266  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgggtccaa 26299283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4318906 - 4318839
Alignment:
Q  289 atggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  4318906 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgttgt 4318839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 19936455 - 19936571
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  19936455 gttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgacacc--------gagagttagggtagcacctatagcaaaaaagatggtagaa 19936546  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
    |||||| |||  |||||||||||||    
T  19936547 aataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35828868 - 35828717
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||  | ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  35828868 gataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagaga 35828769  T
Q  132 gaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    |||||||  || ||   || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  35828768 gaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtca 35828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 261
Target Start/End: Original strand, 37263325 - 37263523
Alignment:
Q  62 agagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagag 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| ||  ||  |||| | |||||| ||||    
T  37263325 agagttggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagag 37263424  T
Q  162 tagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    || |||| |||||||   ||||| | |  |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | | | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37263425 taaatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaatactattagtgaaactatca-agaagatctagagatcaatgagttgga 37263523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 51812472 - 51812591
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||  | ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  51812472 gtggtaagattagacacgataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtg 51812571  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaa 134  Q
     |||||||||||||||||||    
T  51812572 atttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21769784 - 21769711
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21769784 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511819
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| || ||| || || || ||| | ||||||||||| | |||  || | ||||||||| || |||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattat 28511861  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28511860 ggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggata 28511819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 137
Target Start/End: Original strand, 40419603 - 40419708
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| | || |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40419603 gatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagtagaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaga 40419702  T
Q  132 gaagac 137  Q
    ||||||    
T  40419703 gaagac 40419708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478872
Alignment:
Q  83 gtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtc 182  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  ||| |||| ||  ||| |||  || ||||||||||||||||| ||| | || |||     
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  183 aagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    | || ||||||| |||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggat 478872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30834174 - 30833967
Alignment:
Q  153 taagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaa 252  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |  | ||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||    
T  30834174 taaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaaaagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaa 30834075  T
Q  253 tgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg-ttgttgtc 351  Q
    ||||||||||  |||| |  | | |||  || || | ||||||||||| | ||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||     
T  30834074 tgagttggatagaaatatagtatttgacggaacattgtggcgtcatttaaaccatgtagcggacctcattttgagggataaggcttgattgtttgttgtt 30833975  T
Q  352 gttgttgt 359  Q
    ||||||||    
T  30833974 gttgttgt 30833967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481792
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 43481792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Original strand, 50806753 - 50806949
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  |||||| | |  ||| ||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||  |||| | |    
T  50806753 gtaaggagggtagatcaaatggaggggagtcaaatcactagaagtagatgaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaaggat--agagatta 50806850  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| |||||||  |||| || | ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||| |||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  50806851 atgcgttggataaaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8677017 - 8676869
Alignment:
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatg---tatgatagagcactatggcg 294  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| || ||   |||||||||  | ||||||     
T  8677017 gaggaaaacctaggaaatctataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggca 8676918  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg 343  Q
    | ||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||    
T  8676917 taatttgatccatgtagccgactccggttagtgggttaaggattgattg 8676869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 244
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002528
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggataatcatattagaagaggta 9002481  T
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggattta 244  Q
     || |||||| ||  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||    
T  9002482 tagaaagacctagagaaactatcagaaaaactatttgaaaagattta 9002528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 333
Target Start/End: Original strand, 42501143 - 42501373
Alignment:
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||  ||   || | ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| | |  ||||||||||||    
T  42501143 taggcttgggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagagga 42501242  T
Q  203 agaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttga 302  Q
    | ||| || |||||||| ||||||| |||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| ||   ||||||||| || ||  ||||| ||| |    
T  42501243 aaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagcgtcgtttaa 42501342  T
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataa 333  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  42501343 tccatgtagccgaccctacttagtgggataa 42501373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52073128 - 52073050
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52073128 tgatatatgatagaacattatggcggcgattgatccatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgtt 52073050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4590630 - 4590533
Alignment:
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||||||||  | || |||| | ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4590630 atgagttggatagatatatgatatgtgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 17815408 - 17815537
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||   | ||||| || |||| | | |||| |||| |||    
T  17815408 gttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagagat--gaggtaggacttataatggaaaagatggtggaa 17815504  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 133  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17815505 actaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18793337 - 18793172
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| | |||| || ||||||| || ||| |||| |||| ||||||||    
T  18793337 gttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaagatggtagaa 18793238  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagat 166  Q
    | ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||  | || | | || |||||||||||||||    
T  18793237 actagacttagttgattttggcatgcagagagaagacatgcaattttggtagtaagaagagtagat 18793172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 26299287 - 26299356
Alignment:
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  26299287 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttgttgt 26299356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 358
Target Start/End: Original strand, 50636266 - 50636371
Alignment:
Q  253 tgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcg 352  Q
    ||||||||||  |||| || | |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||    |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  50636266 tgagttggataaaaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttg 50636365  T
Q  353 ttgttg 358  Q
    ||||||    
T  50636366 ttgttg 50636371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2914185 - 2914117
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2914185 tatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 2914117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7133429 - 7133297
Alignment:
Q  223 agaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcact 322  Q
    ||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||| | ||||  | || |||||||| || | |||| | |||||||||||||||| |||  ||||    
T  7133429 agaaactattagaaatgatttggtaattaatgagttggaccgaaatacggtgaatgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccact 7133330  T
Q  323 tagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  7133329 tagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgttg 7133297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 268
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628230
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaat 8628230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7762575 - 7762484
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgat 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  7762575 aaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgat 7762484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26113514 - 26113439
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26113514 tatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataagactacattgttgttgt 26113439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 50846769 - 50846844
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  50846769 tatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 50846844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 249
Target Start/End: Original strand, 52832035 - 52832226
Alignment:
Q  58 aaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaaga 157  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||| || || ||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||  || |||| || |||       
T  52832035 aaagagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacag 52832134  T
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggt 249  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||   ||| || ||||||||||| ||| || ||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  52832135 agagtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggt 52832226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 109092 - 109030
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  109092 aatgagttggataaatatatgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcc 109030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 4379938 - 4380081
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagaga--------gtgggggtagcacctatagtagtaaagt 92  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||| |||||        || ||||||||| ||||||||| ||||     
T  4379938 gttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactatagtagaaaaga 4380037  T
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||| |||| || | |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  4380038 tggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 359
Target Start/End: Original strand, 22175374 - 22175436
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  22175374 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttgatgttgttgt 22175436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637720
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc-- 167  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  ||  |||| || ||||| ||||||||||      
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatcat 27637814  T
Q  168 aaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    | ||||||   || ||| | |  |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||||| |  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27637813 atatggagtggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaacttttagagaaactatcaagaaggatctagtgatcaatgagttgga 27637720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52739640 - 52739510
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatg-atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc 319  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||| |||||||| | || |||| ||||| || |||| | | ||||||| ||||||||| || ||    
T  52739640 agagaaactattaggaaagatttttaggttaatgagttgaatccaaatataatttatggatagaacattatgacttaatttgattcatgtagccaacttc 52739541  T
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  52739540 acctagtagcataaggcttgattgttattgt 52739510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3777325 - 3777260
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  3777325 cactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgt 3777260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 335
Target Start/End: Original strand, 7124351 - 7124408
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataagg 335  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7124351 gatagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataagg 7124408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 10272211 - 10272436
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatgg 115  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||    || |  |||| |||||| |||||| |||| ||||||||| ||| || |  |||    
T  10272211 tggtaagactagacgggatagaattagagatgacaacattaga----gattttgggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtgg 10272306  T
Q  116 tttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||  || |||| | ||| |||| |||||| ||||| |  |||||| | |  |||||||| |||||||| || |||     
T  10272307 ttttggcatgtagagagaagacctgtggat-tcgtaggaaggagaggagatcagatggatgggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaac 10272405  T
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttaga 246  Q
     ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  10272406 ttataagagaaactattaagaaggatctaga 10272436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16142229 - 16142176
Alignment:
Q  5 tgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga 58  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16142229 tgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattaga 16142176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32112066 - 32111989
Alignment:
Q  273 tgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  32112066 tgtatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgt 32111989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 52442853 - 52442780
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtag 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||| || ||||||| |||||||    
T  52442853 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagagagttggggtag 52442780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31274463 - 31274391
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  31274463 tatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgttgttgtt 31274391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758015
Alignment:
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 38758015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50771792 - 50771673
Alignment:
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgagga 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  || | || ||||| ||||||||||| |||||||  |||||| | |  |||||||| |||||||| || |    
T  50771792 tggtttgggc-tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaa 50771694  T
Q  213 aaactattagagaaactatta 233  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  50771693 aaactataagcgaaactatta 50771673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Original strand, 11584180 - 11584279
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||| |||||| || | ||||||| | || |||||  | ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11584180 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 11584279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827699
Alignment:
Q  66 tgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtaga 165  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||   ||| ||   || ||||| ||||||||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtaga 13827755  T
Q  166 tcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactatta 221  Q
    ||| |||||  |||||||  | |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  13827754 tcatatggaacatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta 13827699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15437201 - 15437130
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15437201 tgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16142118 - 16142019
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||| | || | |||||| || || |||| ||| |||||||||||||||    
T  16142118 aaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Original strand, 16943109 - 16943243
Alignment:
Q  2 ttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaa 101  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  |||||  || |||  |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  16943109 ttgtgttggatgcgtgataagactagacgagataaaattagacattacaatattagggagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaa 16943208  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
     |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16943209 ctagatttag-tggtttgggcgtgtagggagaagac 16943243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27072562 - 27072491
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27072562 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 327
Target Start/End: Original strand, 28528447 - 28528614
Alignment:
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |    ||| |||| |||||||| |  |||||||| | |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||    
T  28528447 agtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagtaggggaagacctaaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttg 28528546  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtg 327  Q
    ||   | |  || | | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  28528547 gagaaagacatggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 50257777 - 50257852
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  50257777 tatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8343140 - 8343070
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  8343140 ggggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagacc 8343070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13827999 - 13827929
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  13827999 ggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16822368 - 16822234
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||  ||||| |  |||||  || ||| || ||  ||||  ||| ||||||||    
T  16822368 gttgtgttggatgtgtggtaatactagataagataggattagaaatgacagtattagta--agagttaggatagaactta-cgtagacaagatggtagaa 16822272  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16822271 actcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 16822234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 355
Target Start/End: Original strand, 27704156 - 27704238
Alignment:
Q  274 gtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg-ataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||    
T  27704156 gtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaagacttgtttgttgttgttgttg 27704238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Original strand, 49377503 - 49377577
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgt 344  Q
    |||| ||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  49377503 tgatatatgatagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgactccagttagtgggataaggcttggttgt 49377577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8809532 - 8809491
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8809532 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 8809491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12930471 - 12930306
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcacta 289  Q
    |||||||||||  || || ||||||| ||| ||||||| |||||  ||  ||||| || | | |||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||    
T  12930471 aagaggtagagagaggcctaggaaaattataagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagatta 12930372  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||    |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  12930371 tgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttgttg 12930306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43028873 - 43028808
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43028873 cactatggtgtcgtttgattcatgtaagcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43028808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Original strand, 52292188 - 52292320
Alignment:
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||| | ||||||||||| |||| | |  | |||||||||  | ||| | || |||||||||||||| || |    
T  52292188 ctataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttgga-ccaattattgtttatgatagaaaattattgagtaatttgatccatgtaaccaa 52292286  T
Q  316 catcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52292287 ccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52878459 - 52878366
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgataga 283  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||    
T  52878459 aagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaattattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaactacgatttatgataga 52878366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2429704 - 2429640
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  2429704 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggacaaagcttg 2429640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Original strand, 3863478 - 3863530
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  3863478 tttgatccgtgtagccgacaccacttagtgggattaggcgtgattgatgttgt 3863530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203150
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggc 293  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||   |  | ||||  | |||||| || ||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggacggaggtatgatagaagatagaacattatggc 8203191  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataag 334  Q
    ||   || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  8203190 gttgatttatccatgtagccgaccccacttagtgtgataag 8203150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8343040 - 8342885
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |  | | |||| || || |||    
T  8343040 agagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaacattat 8342941  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    | |||   |||||| ||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8342940 gacgt---ttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 8342885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  302 atccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16273169 - 16272938
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   |||  |||||| ||||||| ||||  || || ||| || ||| |||||||| || ||||  | || |||    
T  16273169 gttgcgttggatgtgtggtaagactagatgagatgagattagaaatgacaacattgtaaggatagttggtgtaacacctatatta-taaatattgtggaa 16273071  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||  ||| ||    | ||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||| |||||||| ||    
T  16273070 aataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggataatcatattacaagaggtatag 16272971  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactatta 233  Q
     | |||| || | |||||||||||||| |||||    
T  16272970 aacgacctagaagaactattagagaaattatta 16272938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17269064 - 17269000
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||    
T  17269064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggaaaagtcttg 17269000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19908543 - 19908395
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| | | ||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| || | ||| |||||    |||    
T  19908543 agaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaatcttat 19908444  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
     ||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  19908443 tgcgtagtttgatccatgtacctgaccccacttagtgggataaggcttg 19908395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37430482 - 37430414
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37430482 tatggcgtagtttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgttgt 37430414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 41611105 - 41611181
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcac 77  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  41611105 gttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattaggaatgacgctattagagagagtgttggggtagcac 41611181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43375722 - 43375598
Alignment:
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    ||||||||  || ||||||||| | ||||||||||| | |||| || |  |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |   |||||||    
T  43375722 aactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttag 43375623  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  43375622 tgggataaagattggttgttgttgt 43375598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 45510908 - 45510844
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  45510908 tatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttg 45510844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2001188 - 2001121
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||    
T  2001188 tatggcgttgtttgattcatgtagcagacctcacttagtggtataaggcttttttgttgttgttgttg 2001121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19908714 - 19908655
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag 65  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  19908714 gttggatgtgttgtaagactagacatgatatgatttgtaatgacaacattagaaagagag 19908655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29577301 - 29577147
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  | | |||||||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| || | ||||||||| || |||    
T  29577301 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggt-tatgatagaacattat 29577203  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  29577202 ggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtgcttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30396804 - 30396729
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || ||||| | | |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30396804 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccgtgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 30396729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  94 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 41611807 - 41611874
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  41611807 gggtagcacttatattagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaaga 41611874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 990519 - 990469
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  990519 atttgattcatgtagccgacaccacttaacgggataaggcttggttgttgt 990469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  262 tccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| || | ||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 350
Target Start/End: Original strand, 4380188 - 4380241
Alignment:
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4380188 cattttatccatgtagccgacc-cacttagtgggataagacttggttgttgttgt 4380241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7762689 - 7762651
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762689 gaaaatatgattagatggtttgggcatgtagagagaaga 7762651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Original strand, 15577541 - 15577696
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||  || |||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||  | || |||| | ||||||| || |||    
T  15577541 agaggtagaggaagatctaaaaaaataataagagaaactattaagaaggatatagagattaatgagttggatagagatatgatatttgatagaacattat 15577640  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     | ||  ||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15577641 tgtgttgtttgatccatgtacccaac----cttagtgggataaggcttggtggttgttgt 15577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 17275180 - 17275262
Alignment:
Q  52 cattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||| |||| | || |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17275180 cattagagagagatttggggtagcttctatagtagaaaagattgtggaaacttggcttaggtggtttgtgcatgtagagagaa 17275262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31979791 - 31979745
Alignment:
Q  161 gtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  31979791 gtagatcaaatagaggatagtcaggttacaagaggtagatgaagacc 31979745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34074396 - 34074250
Alignment:
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||  ||  |||| || || ||||| | || | |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  34074396 ttagatggtttggatatgtagagagaagacctctagatgtcgtcctagaaagaatatattaaatgaaagagaatcaagttaaaagagctagaaaaagacc 34074297  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattag-aaaggatttagaggtcaat 253  Q
        ||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34074296 tttaaaacctataagagaatctattagaaaaagatttagaggtcaat 34074250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42539314 - 42539212
Alignment:
Q  249 tcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat-ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||||||| | ||||||  | ||||||||| ||  || || || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| || ||||    
T  42539314 tcaatgagttggaccaaaatttagtttatgatagaacatcattggtgtaatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggttattgt 42539215  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  42539214 tgt 42539212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Original strand, 52815094 - 52815155
Alignment:
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  52815094 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttag-aggataaggcttggttgttgttg 52815155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569279
Alignment:
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 10569279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 14224294 - 14224366
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  14224294 tgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgt 14224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14225911 - 14225854
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  14225911 tatgatagaacagtatggtgtcgtttgatccatgtagccggccccacttagtgggata 14225854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15785018 - 15784981
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataag 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15785018 atttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataag 15784981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Original strand, 16943357 - 16943434
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16943357 tgatatatgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Original strand, 29808073 - 29808122
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataag 334  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  29808073 cactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataag 29808122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30985339 - 30985302
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30985339 cacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttgttgt 30985302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31434359 - 31434314
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  31434359 catgtagccgacttcacttagtgagataaagcttggttgttgttgt 31434314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 351
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898492
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtc 43898492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48861448 - 48861391
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataag 334  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  48861448 tgatagagcattatgacgtcgtttgattcatgtcgccgaccccacttagtgggataag 48861391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50830682 - 50830637
Alignment:
Q  302 atccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  50830682 atccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgt 50830637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 51584953 - 51585026
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||| | |  |||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51584953 tgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 51585026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52739735 - 52739662
Alignment:
Q  156 gaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaact 229  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |  | |||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  52739735 gaagagtagatcaaatggaagaaagttagatcaaaagaggtaggtgaagaccgagaaatactataagagaaact 52739662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 166)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 34869353 - 34869702
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34869353 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 34869452  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34869453 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagag 34869552  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34869553 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 34869652  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34869653 gatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39906714 - 39906362
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39906714 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 39906615  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39906614 gcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg--agtcaagttaaaagaggtagaggaaga 39906517  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39906516 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 39906417  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  39906416 atgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttattgtt 39906362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 37617877 - 37618227
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37617877 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 37617976  T
Q  101 aa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37617977 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 37618076  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37618077 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatt 37618176  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37618177 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37618227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 11593893 - 11594242
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11593893 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 11593992  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11593993 aatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 11594092  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11594093 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 11594192  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11594193 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 11594242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12841624 - 12841267
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12841624 gttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 12841525  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12841524 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 12841425  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12841424 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcattt 12841325  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12841324 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttg 12841267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35906550 - 35906212
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35906550 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 35906451  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35906450 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 35906351  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35906350 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 35906251  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35906250 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 35906212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Original strand, 49029214 - 49029557
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49029214 gttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 49029313  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49029314 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 49029413  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49029414 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 49029513  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  49029514 atgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgt 49029557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33350149 - 33349799
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33350149 ttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaatagg 33350050  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33350049 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 33349950  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  33349949 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatcca 33349850  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33349849 tgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 33349799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44855521 - 44855168
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44855521 gttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggtagaa 44855422  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44855421 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagag 44855322  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  44855321 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaattt 44855224  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44855223 ggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 44855168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 46356205 - 46355858
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46356205 gttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 46356106  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46356105 aataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 46356006  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  46356005 gaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcattt 46355906  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  46355905 gatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Original strand, 36651927 - 36652279
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  36651927 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga--gagggtaggggtggcatccatagtagaaaagttggtagaa 36652024  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36652025 aataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagag 36652124  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36652125 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 36652224  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  36652225 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttgttg 36652279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 43281616 - 43281956
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43281616 tggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 43281713  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43281714 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacc 43281813  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43281814 taagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccat 43281913  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43281914 gtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 43281956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45836822 - 45836482
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45836822 tggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 45836723  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  | |||||||||| |||||    
T  45836722 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggtt--atgaggtagagggagacc 45836625  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45836624 taggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 45836525  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45836524 gtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 45836482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 33 - 364
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375161
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  133 aagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt 232  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  333 aggcttgattgttgttgtcgttgttgttatag 364  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  6375133 aggcttg---gttgttgtcgttgttgttatag 6375161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13859357 - 13859061
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13859357 gttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 13859258  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13859257 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagag 13859158  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtca 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  13859157 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 31005156 - 31005495
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31005156 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31005255  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31005256 aataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 31005355  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||                  |||||||    
T  31005356 gaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggtgt------------------gtcattt 31005437  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31005438 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttg 31005495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 71 - 358
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349910
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  171 tggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  271 gatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgttgttg 22349910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682595
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatca 168  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  169 aatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  269 ttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 31682595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650675
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  133 aagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt 232  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||| ||||||| |||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  333 aggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgttgttgttgt 29650675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35559343 - 35558994
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacct-atagtagtaaagttggtaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35559343 gttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaaagttggtaga 35559244  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35559243 aaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 35559144  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| || ||| || |||||    
T  35559143 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacattatagcatcatt 35559044  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||  |||||||||    
T  35559043 tgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 43491241 - 43491596
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  43491241 gttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaaaattggtagaa 43491340  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  43491341 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 43491440  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  || ||||    
T  43491441 gaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaattt 43491540  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43491541 catccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 43491596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 38606945 - 38607284
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38606945 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggc 38607043  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  38607044 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagaggaagacc 38607143  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | ||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38607144 taaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccat 38607231  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38607232 gtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 38607284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2886012 - 2885722
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||    
T  2886012 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaag 2885913  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2885912 agtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagttg 2885813  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || |||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2885812 gacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2885722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33072887 - 33073108
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33072887 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 33072984  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33072985 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagag 33073084  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagag 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||    
T  33073085 gaagacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 67 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869228
Alignment:
Q  67 gggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagat 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||   |||||||||||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  167 caaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 266  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  267 atttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatc-------catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 36869228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 78 - 356
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682462
Alignment:
Q  78 ctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagga 177  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  178 tagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtat 277  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttgttgt 15682462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 181 - 360
Target Start/End: Original strand, 38900070 - 38900248
Alignment:
Q  181 tcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38900070 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 38900169  T
Q  281 agagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38900170 tgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgac-ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 38900248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 36136697 - 36137046
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36136697 gttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 36136796  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||  || |||| || ||| |||||| |||||| |||||||| |||||  | | |||| ||||||    
T  36136797 aatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagag 36136896  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||| || ||||| |||||||||||| || | ||||||||| || ||| | || ||||    
T  36136897 gaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattatagggtaattt 36136996  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||  || || ||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36136997 gatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 316
Target Start/End: Original strand, 23404358 - 23404665
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23404358 tggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaaataggc 23404457  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||  |||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||    
T  23404458 ttagacagtttgg-catgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacc 23404556  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     ||||||| ||| | |||||| |||| ||   ||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||| |||| |    
T  23404557 taggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatggtgtaattttatccgt 23404656  T
Q  308 gtagccgac 316  Q
     ||||||||    
T  23404657 atagccgac 23404665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28628276 - 28627936
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||  ||||||||| | || |||| ||||||| ||| ||| ||||||| || |||| || |||||||||| ||||| || | |||| |||||| ||    
T  28628276 ttggatgtatggtaagaccatacgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattgg 28628177  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||   || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28628176 cttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagac 28628077  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  28628076 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcca 28627977  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28627976 tgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 185 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  185 gttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagag 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||     
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 356
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631852
Alignment:
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | | |||||| |||||| ||            |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaaccattagaaaa------------gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 32631852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Original strand, 7273151 - 7273382
Alignment:
Q  119 gggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaacta 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || ||| ||| | |||||||||   |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7273151 gggcatgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaacta 7273250  T
Q  219 ttagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacat 318  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  7273251 taagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 7273350  T
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273351 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 7273382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 126 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598188
Alignment:
Q  126 tagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccgac-tcatttaa 24598213  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgt 24598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 47848607 - 47848912
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |||    
T  47848607 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaa 47848706  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||   | |  ||||| ||||    
T  47848707 aataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagag 47848806  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||| | || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||  | ||||    
T  47848807 gaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtttaattt 47848905  T
Q  301 gatccat 307  Q
    |||||||    
T  47848906 gatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 7272972 - 7273148
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7272972 gttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaa 7273071  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7273072 aataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggagga 7273148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078199
Alignment:
Q  219 ttagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacat 318  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgactt 21078167  T
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21078168 catttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21078199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31681215 - 31681022
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  31681215 gtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaaggatttaagggtca 31681119  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31681118 atgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8492577 - 8492236
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||  || | |||||||||||||    
T  8492577 gttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaatag 8492478  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||| || |||||||  | |||||||| |||||  ||| |||| || |||  |||||||||||| ||||||||  || |  ||| ||||||||||| ||||    
T  8492477 gctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaaaga 8492378  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || | |||||  |||| |  |||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||| || || | |||||||||  |||||||| | ||||||||     
T  8492377 cc-acgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatca 8492281  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |  ||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  8492280 atgtaactaaccccacttagtgagataaggctcgactgttgttgt 8492236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 46014499 - 46014359
Alignment:
Q  31 ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46014499 ggataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagag 46014401  T
Q  131 agaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatg 172  Q
    ||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  46014400 agaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 203 - 350
Target Start/End: Original strand, 48919247 - 48919394
Alignment:
Q  203 agaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttga 302  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48919247 agacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttga 48919346  T
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  48919347 tccatgtagtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649062
Alignment:
Q  225 aaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactta 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  325 gtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgt 27649062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210704
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcacta 289  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| | || ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgt 9210704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 38135474 - 38135203
Alignment:
Q  88 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagtt 187  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| || | || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |     
T  38135474 aaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcagatc 38135376  T
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcac 287  Q
    |  ||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||   |||||||||  |     
T  38135375 attagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatat 38135276  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  38135275 tatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtgggacaaggcttggttgttattgttgttgttgtt 38135203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 359
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966307
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 170  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  171 tggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    || ||  ||||||| | |       |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| | ||||| ||||||  |||| |    
T  12966125 tgaagactagtcaaatcac------tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  271 gatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    | | ||||||| | || |||| | |  |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 12966307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 347
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    || || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 32630535 - 32630636
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32630535 tggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 32630633  T
Q  108 tta 110  Q
    |||    
T  32630634 tta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208318
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgtt 354  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtt 28208324  T
Q  355 gttgtt 360  Q
    ||||||    
T  28208323 gttgtt 28208318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 240 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035144
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  340 attgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
     |||||||||  |||||||||    
T  34035164 gttgttgttgctgttgttgtt 34035144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 350
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011328
Alignment:
Q  124 tgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattaga 223  Q
    ||||||||||||||   || |||| || ||| ||||||||||||| ||  |||| |||||  | |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  224 gaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactt 323  Q
    |||| |||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||| || | || |||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  |||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatcc-aatatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 1011301  T
Q  324 agtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1011302 agtgggataaggcttggttgttgttgt 1011328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 42187404 - 42187537
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||    
T  42187404 gttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaaagatggtggaa 42187502  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42187503 aataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36514554 - 36514424
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| || |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36514554 gttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattaga--gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 36514457  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 133  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36514456 actagacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25579394 - 25579205
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggg-gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||| |||||||| |||| || |||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25579394 gataggattagaaatgaccacattaga--gagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagag 25579297  T
Q  131 agaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattag 222  Q
    |||||||  ||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | ||||| || | ||||||| || |||||||||||    
T  25579296 agaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcacaagagttaaatgaagacctagaaaaactattag 25579205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36102114 - 36101777
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||| ||   ||||||  ||||||||||||| ||| |||| || | |||    
T  36102114 gttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataatagaaaagatgttggaa 36102015  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || || | ||   | | ||||||||||| |||||| |||||||  | |  ||||| ||||    
T  36102014 aataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcagatcactagaggcagag 36101915  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||            |||| ||| |||||  || |||||| || | ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  36101914 gaagacc------------tagaaaaattattatgaaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaattt 36101827  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36101826 gatccatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36101777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7189516 - 7189310
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaat------gtcgtggt 153  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||      || || ||    
T  7189516 agagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgtagt 7189417  T
Q  154 aagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaact-attagaaaggatttagaggtcaa 252  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||| || |||||||| || ||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  7189416 atgaagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggttaa 7189317  T
Q  253 tgagttg 259  Q
     ||||||    
T  7189316 ggagttg 7189310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19262766 - 19262600
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  19262766 gtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattaga--gagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtg 19262669  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaa 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  19262668 gtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggagtgtagtcaa 19262600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 350
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073211
Alignment:
Q  244 agaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  344 ttgttgt 350  Q
    || ||||    
T  33073205 ttattgt 33073211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 43282338 - 43282574
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatt---agaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggta 97  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  43282338 gttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtg 43282437  T
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagag--g 195  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  | | ||   || | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  | | |||||  |    
T  43282438 gaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcacaagaggtg 43282536  T
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatta 233  Q
    ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43282537 tagaggatgacctagaaaaactataagagaaactatta 43282574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 178
Target Start/End: Original strand, 40169649 - 40169759
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||  ||| ||||||||||    
T  40169649 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatc 40169748  T
Q  168 aaatggaggat 178  Q
    |||||||||||    
T  40169749 aaatggaggat 40169759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 42187585 - 42187723
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcact-atggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| | | ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  42187585 aaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaattggtt-tatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgta 42187683  T
Q  311 gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42187684 gccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 42187723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 349
Target Start/End: Original strand, 14057625 - 14057759
Alignment:
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| || | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  14057625 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14057724  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||  |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  14057725 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 349
Target Start/End: Original strand, 14367653 - 14367787
Alignment:
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| || | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  14367653 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14367752  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||  |||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  14367753 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31869175 - 31869102
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31869175 tgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31869102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 136
Target Start/End: Original strand, 39811896 - 39812025
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||| |||  ||||  ||| | ||    
T  39811896 ttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaatggtgaaaactcgg 39811995  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39811996 cttaggtagtttgggcatgtagagagaaga 39812025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 339
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852358
Alignment:
Q  246 aggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttg 47852358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741934
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatca 168  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| | ||||  || || | |||||||| |||||||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  169 aatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactat--tagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 266  Q
     || ||| |||||||  | |  ||||| ||||||||||  || ||||||||   ||| |||||||||| ||  |||| ||  | ||||||||||| | ||    
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaa 26741978  T
Q  267 atttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    || || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  26741977 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgta 26741934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27021982 - 27021906
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27021982 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 36869638 - 36869574
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36869638 gttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 36869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 358
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630724
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgttgttg 40630724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Original strand, 44951274 - 44951437
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactatta-gagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagca 286  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||  | |||||||  |||||||  ||||| | |||||| | || ||| ||||| | || ||||||||| ||    
T  44951274 aaaagaggtagaggaagatctaggaaaattacaaagagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaaca 44951373  T
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  44951374 ctatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatacttagtggtataaggtttggttgttgttgt 44951437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 316
Target Start/End: Original strand, 1569063 - 1569264
Alignment:
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||   ||||| ||||| || || || |||    
T  1569063 gtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaa 1569162  T
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||| ||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||    
T  1569163 actataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcg 1569262  T
Q  315 ac 316  Q
    ||    
T  1569263 ac 1569264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36239934 - 36239833
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  36239934 aaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 36239835  T
Q  312 cc 313  Q
    ||    
T  36239834 cc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 5335855 - 5335988
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||   ||||| ||||| | |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  5335855 gttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattaga--gagagttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcgaa 5335952  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    | ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5335953 actagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24598495 - 24598409
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccat--tagaa--agagagtgggggtagcacctatag 83  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  24598495 gttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctatag 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 28020906 - 28021032
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||| ||| ||||||| |||| |||| |||| | ||||| | ||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||| |||| |||| |||| | |||||    
T  28020906 gatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtagaaaagatggtggaaacttggctt 28021005  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  28021006 aggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 349
Target Start/End: Original strand, 34745882 - 34746028
Alignment:
Q  203 agaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttga 302  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| || || | |||||||||||   |||  || | | ||||||| | |||||||||  |||||    
T  34745882 agacctagaaaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttga 34745981  T
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34745982 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 338
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969968
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| || || ||| |  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 42969968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48736248 - 48735901
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  48736248 gttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgggagaa 48736149  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||  ||   || || || |||||||||||||||||||  |||||  | |  |||||||| |    
T  48736148 actagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagg-gagtcagatcactagaggtaggg 48736050  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
      |||||  | |||||||| |||||  ||||||| | || | ||||| | |||||||| ||   | |  || | ||||| |||  ||||||||||| |||    
T  48736049 ctagaccttgaaaaactataagagaggctattagtagggttctagagataaatgagtttgagaaagacatggtttatga-agaatactatggcgtcgttt 48735951  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48735950 gattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 48735901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 14593694 - 14593835
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg----ggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | |  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    |||||  |||||||||||| |||  ||||    
T  14593694 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatagtagaaaaaatggt 14593793  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  14593794 agaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27893693 - 27893557
Alignment:
Q  220 tagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc 319  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||| | |||||| |||| | |||| || | ||||||||| || |||||| | ||||||| ||||||||||||       
T  27893693 tagaaaaactattaagaaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccct 27893594  T
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27893593 acttagtgcgataaggcttggttgttgttgttgttgt 27893557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30200308 - 30200175
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||    ||||  ||||| |||||||||||| |||| |||| |||    
T  30200308 gttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattaga----gagttagggtaacacctatagtagaaaagatggtggaa 30200213  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    | ||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||    
T  30200212 actaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40149150 - 40149016
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || || || |||  |||||||||||| | |||| || | ||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||    
T  40149150 aaaactataagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggt-tatgatagaacattatggcgcaatttgatctatgtag 40149052  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40149051 ccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652829
Alignment:
Q  243 tagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgatt 342  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| || | |  |||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  343 gttgttgt 350  Q
    ||||||||    
T  47652822 gttgttgt 47652829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 47796473 - 47796359
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg--ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttaga 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||||| |  || ||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| |||     
T  47796473 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtagg 47796374  T
Q  113 tggtttgggcatgta 127  Q
    |||||||||||||||    
T  47796373 tggtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177628
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355448
Alignment:
Q  225 aaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagcc-gacatcactt 323  Q
    |||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||| || | ||||||| | || |||||||  |||||||||| |||| | |||  |||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  324 agtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgt 28355448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28546193 - 28546034
Alignment:
Q  14 agtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagat 113  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| | | ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||| |    
T  28546193 agtggtaagactatacgggatatgattaggaatgataccatt-gaaa-agagttgcgatagcacctataataa-aaagatggtagaaaataagcttaggt 28546097  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg 176  Q
    | |||| ||||||| || || |||  ||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||    
T  28546096 gatttgagcatgtaaagtgatgacttgtaaatgtcctagtacgaagagtagatcgaagggagg 28546034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 28708601 - 28708663
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28708601 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgt 28708663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 133
Target Start/End: Original strand, 38920789 - 38920859
Alignment:
Q  63 gagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38920789 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 138
Target Start/End: Original strand, 41948480 - 41948586
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||  |||||| || ||||||| || | ||| |||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41948480 gatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagaga 41948579  T
Q  132 gaagacc 138  Q
    |||||||    
T  41948580 gaagacc 41948586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 359
Target Start/End: Original strand, 4604754 - 4604838
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||    
T  4604754 tatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttgttgttgt 4604838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 350
Target Start/End: Original strand, 7220846 - 7221038
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |  ||||| || || |||| |||||  || ||||||||| | |||| ||    
T  7220846 agagtagattagatggaggatagtcaaattactagaggcagagtaagacctataaaaaccataagtgaaattattaacaaagatttagagattaatgtgt 7220945  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||  | || | || | |||||||  | |||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  7220946 tggataaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgt 7221038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8519170 - 8519046
Alignment:
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    |||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||| || || | |||||||||  |||||||| | |||||||| ||||| |  ||  |||||||    
T  8519170 aactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttag 8519071  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || ||||||||| ||||||||||||    
T  8519070 tgagataaggctcgattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Original strand, 24777165 - 24777241
Alignment:
Q  272 atgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24777165 atgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341394
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||  |||| || | ||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T
Q  351 c 351  Q
    |    
T  34341394 c 34341394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Original strand, 40415168 - 40415295
Alignment:
Q  229 tattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc------act 322  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||| || | |||| || | ||||||||||||||||||||  |      |||    
T  40415168 tattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatact 40415267  T
Q  323 tagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40415268 tagtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517426
Alignment:
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||| | || |||| ||| ||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  301 gatc 304  Q
    ||||    
T  21517429 gatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 35713695 - 35713794
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    ||||||| || |||||| | |||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || | || ||||| ||||||||||    
T  35713695 ggggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatc 35713794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 5418294 - 5418356
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5418294 tatggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 5418356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420607
Alignment:
Q  91 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaa 190  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||   || ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  | |      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatta 233  Q
    ||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaactataagagatactatta 6420607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28562618 - 28562452
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||||||| ||||| |||| || ||||  |||||||||||  | | || | || ||||||||| ||||||| || ||| ||||| |  ||| ||||||||    
T  28562618 gaaaatagacttaggtggtatgcgcatacagagagaagacatgcagattttgtagtaagaagattagatcagatagagaatagttagattacaagaggta 28562519  T
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 264  Q
    ||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||| | || |||||||||||    
T  28562518 gaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcc 28562452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840512
Alignment:
Q  280 tagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31840512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 45558354 - 45558428
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45558354 agagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Original strand, 25891099 - 25891180
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  25891099 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttgatgttgtt 25891180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Original strand, 33103100 - 33103197
Alignment:
Q  242 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||| | ||||||||| |||  ||| || | ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  33103100 ttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttg 33103197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 350
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976517
Alignment:
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||| ||  || ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||   |||     
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaatta 37976467  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||   ||||||| ||| ||||||||||    
T  37976468 gatccatgtagccaaccccgcttagcaagataaggtttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531443
Alignment:
Q  124 tgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattaga 223  Q
    |||||||||||||||  || |||| || ||| ||| ||||||||| ||  |||| || ||  | |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  224 gaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
     ||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaat 1531443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Original strand, 5418071 - 5418195
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc-ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaa 158  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| |||  |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||  ||   || ||||| |    
T  5418071 agagagttggggtagcacctcttgtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagta 5418170  T
Q  159 gagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  5418171 gagtagatcaggtggaggatagtca 5418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 16013217 - 16013358
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg----ggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | |    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    |||||  |||||||||||  |||  ||||    
T  16013217 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatagtacaaaaaatggt 16013316  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  16013317 agaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 16013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814120
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgtt 354  Q
    ||||||||| |||| || | ||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgtggtt 30814121  T
Q  355 g 355  Q
    |    
T  30814120 g 30814120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 33281097 - 33281168
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33281097 gatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgg-accacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33281168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029677
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40139265 - 40139133
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||  |||||| ||| |  |||||||||||| |||  |||| |||    
T  40139265 gttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattaga--gagagtcgggttt-cacctatagtagaaaatatggtggaa 40139169  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    | | ||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  40139168 actgggcttaggtgatctgggcatgtagggagaaga 40139133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Original strand, 48515477 - 48515557
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  48515477 tgatttatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgt 48515557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882736
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| |||  || | ||||||||| || |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatttagctgacctcacttagtgagaaaaggcttggtggttgttgt 2882736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 137
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7220813
Alignment:
Q  74 gcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 7220813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24549945 - 24549902
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgt 141  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549945 gaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgt 24549902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| | | ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40008511 - 40008424
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||| ||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  40008511 tgatatatgatagaacattatgtcgttgtttgatccatgtagctgacctcacttaatgagataagacttggttgttgttgttgttgtt 40008424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Original strand, 40830331 - 40830481
Alignment:
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||  | ||||||||| ||   | | |||| ||||||||| || || || | |    
T  40830331 agaggaagacctagaaaatctataagagaaactattaagaaggatctagaaattaatgagttgtatatga-tatgatatatgatagaacattacggaggc 40830429  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
     |||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40830430 gtttgatccatgtagccaacccctcctagtgggataaggcttgattgttgtt 40830481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 355
Target Start/End: Original strand, 14593989 - 14594039
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14593989 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 14594039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 355
Target Start/End: Original strand, 16013512 - 16013562
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16013512 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 16013562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 200
Target Start/End: Original strand, 26925264 - 26925342
Alignment:
Q  122 catgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  26925264 catgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagag 26925342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 29312209 - 29312271
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29312209 tatggcgtaatttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29312271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29318853 - 29318795
Alignment:
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29318853 gcgtaatttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29318795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 41483707 - 41483769
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  41483707 tatggtgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgt 41483769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47700117 - 47700056
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  47700117 tatggcgtaatttgatccatgtagccgac-ccacttggtgggaaaaggcttggttgttgttgt 47700056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47796344 - 47796146
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  | |  || || ||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||  | ||| |||    
T  47796344 agagtagatcagatggaggattgtcagatcactaggggcagatgaagaccgagaaaaattataagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagt 47796245  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||   |||| || | |||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||   | |||||| ||| ||| |||  |||||||||| |||||    
T  47796244 tggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgcagccgatcccgcttagtcggaaaagccttctttgttgttgttgttgt 47796146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202827
Alignment:
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||   || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |  | ||| ||||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  203 agaccgaggaaaactattagaga 225  Q
    || || || |||||||| |||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagaga 48202827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Original strand, 1523860 - 1523925
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  1523860 cactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgt 1523925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20158724 - 20158671
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20158724 atttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525052
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgt 20525052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244283
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21244283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24376098 - 24376025
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  24376098 tatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcgcttagtgggacaaggttttgttgttgtt 24376025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25731696 - 25731597
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag--agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaata 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||    
T  25731696 ttggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagagagaaagttggggtagcacttacaatag-aaagatggtagaaaata 25731598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 255
Target Start/End: Original strand, 33139208 - 33139341
Alignment:
Q  122 catgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactatta 221  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||| | || |||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |  |    
T  33139208 catgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaagagttaagtcaaaagagatagagtaagacataggaaaaccacaa 33139307  T
Q  222 gagaaactattagaaaggatttagaggtcaatga 255  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  33139308 gagaaacacttaaaaatgatttcgaggttaatga 33139341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 33732061 - 33732114
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33732061 atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922492
Alignment:
Q  222 gagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| || |||| | | |||||||||||    
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38103751 - 38103616
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||| |  | ||||||| | || ||||| || ||||||||| |||||    
T  38103751 aaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgataaa-cattatggtgtaatttgatcc-tgtag 38103654  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38103653 ccgaccccagttagtgggataagacttggttgttgttg 38103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 42177360 - 42177255
Alignment:
Q  5 tgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||  |||||||||||| || ||||  |||||| |||||||  |||||| ||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||  ||| ||    
T  42177360 tgttggatatgtggtaagactatactggatttgattagaaatgacaatattagagagagagttgaggtatcacctatagtagaaaagatggtgaaaacta 42177261  T
Q  105 ggctta 110  Q
    ||||||    
T  42177260 ggctta 42177255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Original strand, 17759483 - 17759543
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17759483 gatagaacactatggtgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 17759543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 137
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19119608 - 19119441
Alignment:
Q  165 atcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 264  Q
    |||| |||||||| |||||| | |  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |  | |||| ||||| |||||||||| ||       
T  19119608 atcagatggaggagagtcaaatcactagaggtagtggaagacctag-aaaactattagagaaactatcaagatggatctagagatcaatgagtttgagaa 19119510  T
Q  265 aaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataa 333  Q
    | |  ||   | ||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19119509 agacatggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataa 19119441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 350
Target Start/End: Original strand, 41157897 - 41157937
Alignment:
Q  310 agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157897 agccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 41157937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27022049 - 27021998
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga 58  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  27022049 ttggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattaga 27021998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28542074 - 28541943
Alignment:
Q  220 tagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc 319  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||  || | || | ||||||||| ||  ||||| |  |||||||| ||||||||||  |    
T  28542074 tagaaaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccc 28541975  T
Q  320 -acttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28541974 cacttagttggataaggcttggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 135
Target Start/End: Original strand, 30632960 - 30633035
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||  |||  |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30632960 agagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39738497 - 39738446
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39738497 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 39738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 40830183 - 40830293
Alignment:
Q  25 tagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||     ||||||||||||| | || |||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||||    
T  40830183 tagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagtt---gggtagcacctattgaagaaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcat 40830279  T
Q  125 gtagagagaagacc 138  Q
    | ||||||||||||    
T  40830280 gaagagagaagacc 40830293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44401284 - 44401164
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    |||||| ||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||  || ||||||||| | || |||||  ||| |||| || | ||||||||| || |||    
T  44401284 agaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattat 44401187  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  44401186 gacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27893864 - 27893769
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||  |||||| | |||| |||||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27893864 gataggattagaaacgacaatattaga--gagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38921151 - 38921086
Alignment:
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtag--ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  38921151 ctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40139077 - 40138959
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||| | |||| ||| |||  |||| |||  |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  40139077 agagaaactattaagaaagatctagagattaatgcgtttgatagaaatatgacatatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagacccca 40138978  T
Q  321 cttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  40138977 cttagtgcgataagacttg 40138959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Original strand, 41461318 - 41461392
Alignment:
Q  276 atgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||| |||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41461318 atgatagaccattatggcgtcggttgatccatgcagccaaccccggttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41461392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 46990102 - 46990172
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||  |||||||    
T  46990102 tgatagagcattatgaagtcatttgatacatgtagccgacctcacccagtgggataagactttgttgttgt 46990172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 339
Target Start/End: Original strand, 6682583 - 6682624
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6682583 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 6682624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25826819 - 25826682
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| | ||||||| || |||| | ||| | | |||| |||| |||| ||||||||    
T  25826819 gttgtattggatatgtggtaagaccatacgagataggattagaaatgaaaacattagagagggagttgcggttgaaactattgtagaaaagatggtagaa 25826720  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    | | ||||| | ||||||| | |||| |||||||||||    
T  25826719 actcggcttgggtggtttgcgaatgtggagagaagacc 25826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35725602 - 35725565
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35725602 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 35725565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Original strand, 35865920 - 35865985
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| ||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  35865920 cactatggcgtcgtttggttcatgtagccaaccccacttagtgggacagggcttgcttgttgttgt 35865985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43653213 - 43653184
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43653213 cacttagtgggataaggcttgattgttgtt 43653184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 45558539 - 45558611
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||  | |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  45558539 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagt-ggataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47155224 - 47155179
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg 343  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  47155224 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttgattg 47155179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47413746 - 47413709
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47413746 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 47413709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 142)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 36545080 - 36545431
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag--agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36545080 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtag 36545179  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36545180 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtag 36545279  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36545280 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcat 36545379  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36545380 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36545431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36565585 - 36565241
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36565585 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 36565486  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36565485 gcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 36565386  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36565385 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatcc 36565286  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36565285 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 36565241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523723
Alignment:
Q  34 taggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  133 aagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt 232  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  333 aggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgt 11523723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36395299 - 36394938
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36395299 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 36395200  T
Q  101 aataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36395199 aataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtata 36395100  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtca-t 298  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| | | || |    
T  36395099 ggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcatt 36395000  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  36394999 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttggtgttgttgtt 36394938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 40813255 - 40813613
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag--agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40813255 gttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 40813354  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40813355 aaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 40813454  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  40813455 aggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcat 40813554  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||    
T  40813555 ttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttgttgtt 40813613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 70 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaa 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  170 atggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 269  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42854346 - 42853999
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42854346 tggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaaataggc 42854247  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42854246 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacc 42854147  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42854146 taagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatccat 42854047  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  42854046 gtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttgttg 42853999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 39946790 - 39947137
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39946790 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 39946889  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  39946890 aataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagag 39946989  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  39946990 gacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcattt 39947089  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |        |||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  39947090 g--------agccgac-ccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgttgtt 39947137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 335
Target Start/End: Original strand, 2796495 - 2796820
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagacta--gacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2796495 tggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaatag 2796594  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    | ||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2796595 gcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaaga 2796690  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| | | ||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  2796691 cctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattc 2796790  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataagg 335  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  2796791 atgtagacgaccccacttagtgggataagg 2796820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 18125115 - 18125453
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18125115 tggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 18125212  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  18125213 ttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagagggagacc 18125311  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| || |||||||| ||    
T  18125312 tagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatggtgt-atttgatcaat 18125410  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| | ||   ||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  18125411 gtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgt 18125453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 358
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121435
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             |||||||| |||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtac------------aaaataggtttagatg 21121192  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaa 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  21121193 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaa 21121292  T
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21121293 tctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccg 21121391  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  21121392 accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgttgttg 21121435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 347
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932982
Alignment:
Q  40 taggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagaccc 139  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8932676 taggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatcc 8932773  T
Q  140 gt-aaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaag 238  Q
    || ||||| | | |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  8932774 gttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaa 8932873  T
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||   | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||| ||||    
T  8932874 gatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagctt 8932973  T
Q  339 gattgttgt 347  Q
    | |||||||    
T  8932974 ggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 45419172 - 45419517
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  45419172 gttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattaga--gagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtataa 45419269  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |   | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |   |||||||||||    
T  45419270 aatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagagg--ctagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagag 45419367  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || | |||| |    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||| || ||||    
T  45419368 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaattt 45419467  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45419468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 37077705 - 37078031
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |            ||||||||||||||||| |    
T  37077705 tggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtagaa------------aagttggtagaaaatagac 37077792  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||    
T  37077793 ttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaaaataggtagatgaagacc 37077890  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | |||||| |||  || ||| |||||||||||    
T  37077891 taggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac--tgacgtaatttgatccat 37077988  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | |||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  37077989 gcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgt 37078031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42469925 - 42469722
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42469925 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 42469826  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  42469825 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgtt 42469726  T
Q  352 gttg 355  Q
    ||||    
T  42469725 gttg 42469722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 8879776 - 8879443
Alignment:
Q  14 agtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagat 113  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8879776 agtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagat 8879677  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaa 213  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||  |||||| | |||| ||||  |||||    
T  8879676 gatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaa 8879581  T
Q  214 aactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| || | ||||||| | |||  || ||| |||| ||||||||||||    
T  8879580 aactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagcc 8879483  T
Q  314 gacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgt 353  Q
    |||  |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  8879482 gactccacttattaggataaagcttggttgttgttgtcgt 8879443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 29520593 - 29520931
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaa-agttggtaga 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| || |  |||| ||    
T  29520593 gttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaataaatggtgga 29520692  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||||  ||| || | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  29520693 aa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcacaagaggtaga 29520781  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    ||||| || || |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||    
T  29520782 ggaag-cctagaaaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatt 29520880  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29520881 tgatccatgtagcccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 32043523 - 32043876
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||||    
T  32043523 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaa 32043622  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| ||| ||||||| |||||||   ||||| | |  |||||||| |    
T  32043623 actagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggg 32043722  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||| |  |||||| || || |||||||||||||   | |  || | | ||||||| |||||||||  | |||    
T  32043723 gaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgttt 32043820  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32043821 gattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgttgtt 32043876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 218 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473403
Alignment:
Q  218 attagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgaca 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacc 25473436  T
Q  318 tcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25473435 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25473403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26905169 - 26904941
Alignment:
Q  87 taaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  26905169 taaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagat 26905070  T
Q  187 taaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagca 286  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |  | ||| ||| | ||    
T  26905069 aaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaaca 26904971  T
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgac 316  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  26904970 ctatgtcgtaatttgatccatatagtcgac 26904941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 169 - 350
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027812
Alignment:
Q  169 aatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  269 ttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga-catcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     || | ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2027812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18752212 - 18751998
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18752212 atgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata-gctta 18752116  T
Q  111 gatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgag 210  Q
    |||||||||| |||||||||||| || || || ||| ||| || | |||||| |||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| ||| |     
T  18752115 gatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaagaggtagaggaatacctaa 18752016  T
Q  211 gaaaactattagagaaac 228  Q
     ||||| ||||| |||||    
T  18752015 aaaaaccattagcgaaac 18751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742076
Alignment:
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcg 294  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   || | ||||||| ||||||||||    
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaat---atttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 14742076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43904914 - 43904699
Alignment:
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  || |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  43904914 aataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacag 43904815  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||  |||  |  ||||||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||||| ||||    
T  43904814 gaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 43904715  T
Q  301 gatccatgtagccgac 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  43904714 gatccatgtagccgac 43904699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 241 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047522
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttga 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  341 ttgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttgttgttgtt 44047522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 239 - 350
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529507
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 44529495  T
Q  339 gattgttgttgt 350  Q
    | ||||||||||    
T  44529496 ggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 359
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559989
Alignment:
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaag 192  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| || | || ||||| | ||| ||||| |||||||||||||   | |  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  193 aggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatgg 292  Q
    || |||| ||||||  |  |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||     
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatga 30559917  T
Q  293 cgtcatttgatccatgt-----agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||| |||||||||||||     |||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  30559918 cgtaatttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtggttgt 30559989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 326
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700534
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |  ||   || ||||| ||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||| || || || ||| | ||||||| |    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcg 29700467  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagt 326  Q
    || | ||||||  | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29700468 gaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagt 29700534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 224 - 356
Target Start/End: Original strand, 490491 - 490623
Alignment:
Q  224 gaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactt 323  Q
    |||||||| || || ||||||||| |  ||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  490491 gaaactataaggaaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactt 490590  T
Q  324 agtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  490591 agtgggataaggcttgtttgttgttgttgttgt 490623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6510775 - 6510614
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||   ||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6510775 gttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattg--aagagagagagcgtagcacctataatagaaaagttggtagaa 6510678  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtag 164  Q
    || |   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  6510677 aacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagagtag 6510614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10080239 - 10079974
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatgg 115  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||| |||| |||| ||||| | |||||    
T  10080239 tggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaagatggtggaaactaggcct-gatgg 10080142  T
Q  116 tttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   || | || ||||| ||||||||||||||| |||  |||||| | |  ||||||||||||||||| ||  |||    
T  10080141 tttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacctagagaaa 10080042  T
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgataga 283  Q
    |||| ||| ||||| |||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||    
T  10080041 ctataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatgatatttgataga 10079974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 356
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931248
Alignment:
Q  77 cctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg 176  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||| | |  || ||   || ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  177 atagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgta 276  Q
    |||||||  | |  ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| || ||||    
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| ||| |||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttgttgt 32931248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35362842 - 35362651
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |    | ||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  35362842 agagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 35362743  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||   |||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35362742 tggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041320
Alignment:
Q  220 tagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatc 319  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccc 45041347  T
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45041346 acttagtgggataaggcttggttgttg 45041320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45512840 - 45512578
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag--agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaat 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| |  |||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||||||    
T  45512840 gttggatgtgtggtaagactagatagg-tagggttagaaatgaaaatattaaagagagggagttggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaat 45512742  T
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaa 203  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || ||   || ||||| ||||||||| | ||||  ||||||||| | |  ||||| |||||||    
T  45512741 aagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtcaaatcactagaggcagaggaa 45512642  T
Q  204 gaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 267  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||| | |||||||| ||||||||    
T  45512641 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaa 45512578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13171992 - 13171865
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |    
T  13171992 ttggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatatg 13171893  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13171892 cttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Original strand, 23492163 - 23492316
Alignment:
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcg 294  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| || ||| | | ||||||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  23492163 tagaggaagacctag-aaaactattagagaaactactcagaaag-atgtagcgattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtg 23492260  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23492261 tcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 350
Target Start/End: Original strand, 5908594 - 5908928
Alignment:
Q  20 aagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttgg------tagaaaataggcttagat 113  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||      | |||| ||| ||||| |    
T  5908594 aagactagacgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaaagatggttgaaatggaaactagacttagtt 5908693  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaa 213  Q
    |||||||  || ||||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||  |||||||| ||||  | |  ||||  | ||||||||| || ||    
T  5908694 ggtttgg--atatagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtcagatcactagagacataggaagacctagaaa 5908791  T
Q  214 aactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||  |  | | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |  ||| |||| ||| |||||||||||      
T  5908792 aactataagagaaactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaaccttattgcgtaattggatccatgtagtt 5908891  T
Q  314 gacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |    || ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5908892 ggacccaattagtggaataaggcttggttgttgttgt 5908928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12797027 - 12796913
Alignment:
Q  21 agactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg 120  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12797027 agactagacggaataagattaggaataacaccattagaaagag--tggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttag 12796930  T
Q  121 gcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12796929 gcatgcagagagaagac 12796913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643602
Alignment:
Q  79 tatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaa----atgga 174  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||         ||||| ||| ||||||||     ||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgta---------gtaaggagaatagatcaatcagctgga 35643782  T
Q  175 ggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatg 274  Q
    |||||||||  |||  ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |     
T  35643781 ggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtt 35643682  T
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||| |||  || | |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  35643681 tatgatagaacac--tgccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgttgt 35643602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215412
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || | | | ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtagg 15215433  T
Q  330 ataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  15215432 ataaggcttggttgttgttgt 15215412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695698
Alignment:
Q  20 aagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  120 ggcatgtagagagaag 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaag 9695698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35914838 - 35914601
Alignment:
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgagga 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || || |  | | ||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |    ||||  ||||||||||  || |    
T  35914838 tggtttgggcacgtagagagaagacctatagattttatagcaaggagagtaggtcagatggaggatagtcagatccctagagacagaggaagacatagaa 35914739  T
Q  213 aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||  || | ||||||||||| | |||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  35914738 aaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 35914639  T
Q  313 cgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     |||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  35914638 tgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 350
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584640
Alignment:
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaa 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||  | ||||||||||||  ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  204 gaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgat 303  Q
    ||||            |||| ||||||| || || ||| || |||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  42584507 gacc------------tagaaaaactataaggaaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42584594  T
Q  304 ccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42584595 ct-tgtagccgaccccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 42584640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 350
Target Start/End: Original strand, 2216390 - 2216568
Alignment:
Q  170 atggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 269  Q
    ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| |||     
T  2216390 atggaggatagtcagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaag-atttagagatcaatgagttggatcctaata 2216488  T
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || | ||||||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  2216489 tgtt-tatgatagaacattatagtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 346
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  126 tagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||| |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaaccattagaaa 12025946  T
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat---ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcact 322  Q
    |            ||||||||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||| |||||   |||    
T  12025947 a------------gatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  323 tagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44681382 - 44681251
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |    
T  44681382 ttggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataag 44681283  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  44681282 cttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 246
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985696
Alignment:
Q  9 ggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggct 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattaga--gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagact 25985559  T
Q  109 tagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccg 208  Q
    |   || ||| ||||||| ||||||||||  || ||| | |  ||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||| | |  |||||||||||||||||     
T  25985560 tgcgtgattttggcatgt-gagagaagacatgtgaattttgaagtaaggagactagatcagatgtaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacct 25985658  T
Q  209 aggaaaactattagagaaactattagaaaggatttaga 246  Q
    || |||||||   | ||||||||||  |||||||||||    
T  25985659 agaaaaactaaatgggaaactattaagaaggatttaga 25985696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046449
Alignment:
Q  19 taagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||   |||||||||| || |||| |||| |||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  119 gggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaa 184  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |   || ||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatc-agtggaggatagtcaa 7046449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10668586 - 10668497
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10668586 atccatatttggtgtacgatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10668497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Original strand, 16917131 - 16917462
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||  ||||||| ||||||  | | ||| ||||||| ||| | ||||| |||| ||||  ||| ||||||||| ||    
T  16917131 gtggtaagactcggctggataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagtaccgaaagtagaaaagatggtgcaaactaggcttaggtg 16917230  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaa 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||| || | || ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |  | ||||||| ||||||| || |||    
T  16917231 gtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaatcactacaggtagaagaagacctagaaaa 16917329  T
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
     ||||  | |||||||| |   | ||||||||| | ||||||||||||  |||| || | ||||||||| || | || |  | |||||||||||||||||    
T  16917330 gctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaaca-tttgactgcttttgatccatgtagccg 16917428  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
     |  |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  16917429 tccccacttagtgggataagacttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Original strand, 25288912 - 25289045
Alignment:
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | | ||||| | | |||||||| || |||| ||    
T  25288912 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctga 25289011  T
Q  316 catcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |  ||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  25289012 ccccacctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Original strand, 25300247 - 25300380
Alignment:
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | ||||||| | | |||||||| ||||||| ||    
T  25300247 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctga 25300346  T
Q  316 catcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |  ||| |||||| | |||||||| | |||||||    
T  25300347 ccccacctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39953613 - 39953264
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||  ||||| ||| |   ||||||| ||||||| ||| |||||||||||  || |||| ||||||||    
T  39953613 gttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatgagaaaagatggtagaa 39953514  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | |||  |||| |||||| |||||||||||||  ||||  |  ||   || ||||| ||||||||||| ||| |||  | |||  | |  |||||||| |    
T  39953513 actagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcagatcactagaggtaggg 39953414  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    | ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   |||  || | | |||| |  |||||||| ||  |||    
T  39953413 gtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgttt 39953314  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39953313 gattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 39953264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7531842 - 7531634
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||  | |  |||||||  || ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| | |    
T  7531842 gtaaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagagataa 7531743  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    ||||||||||   | |  || | | ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |     
T  7531742 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgttctt 7531643  T
Q  352 gttgttgtt 360  Q
    |||||||||    
T  7531642 gttgttgtt 7531634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12492191 - 12492116
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacc 78  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  12492191 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattag--agagaatgggggtagcacc 12492116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255522
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagcc--gacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgttgttg 8255523  T
Q  359 t 359  Q
    |    
T  8255522 t 8255522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928587
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1928587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Original strand, 13589478 - 13589761
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||| |||  |||||||||||| | |||| |||||||  ||||| |||||||||||  || |||| || ||| ||||    
T  13589478 agagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtacgaag 13589577  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||| | |||||||| | | |||       ||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  13589578 agtagattatatggaggacaatgaag-------aggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatgagttg 13589670  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     ||| |||| |||| |   ||||| || |||||||  |||||||| |||||||| ||   || |  || |||||| |||||||||||||||    
T  13589671 aatcaaaatatgattttaaatagaacaatatggcgcaatttgatctatgtagccaaccctacattatgagataagacttgattgttgttgt 13589761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15215620 - 15215556
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag 65  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15215620 gttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagagag 15215556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10824454 - 10824331
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | || || | || ||| | ||    
T  10824454 agagagttgaggcagcacctaaagtagaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggag 10824355  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10824354 agtagatcaaatggaggatagtca 10824331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 357
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169680
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcacta 289  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||| ||||| || | ||||||| |  | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||| || |||| |||||| || || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagt-ggataaggcttggttgatgttgttgttgtt 28169680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 360
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716114
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagc--cgacatcacttagtgggataaggct 337  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| || | || |||||| || |||||||| ||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  338 tgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    || |||||||||| ||| |||||    
T  31716092 tggttgttgttgttgttattgtt 31716114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 25288842 - 25288916
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctata 82  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25288842 tggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 25300177 - 25300251
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctata 82  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25300177 tggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32569787 - 32569701
Alignment:
Q  273 tgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  32569787 tgtatgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttgttgttgt 32569701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38178479 - 38178261
Alignment:
Q  131 agaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaacta 230  Q
    |||||||| ||| || | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  38178479 agaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaacta 38178380  T
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggga 330  Q
    |||  || ||  ||||  | ||||||||||||  | || |||| ||||| | | |  || ||| | || ||||||||||||| ||||  ||||||  |||    
T  38178379 ttaacaaagacctagacattaatgagttggatagagatatgatatatgacaaaaccttagggcattatctgatccatgtagctgacagtacttagcagga 38178280  T
Q  331 taaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  38178279 taaggcttggttgttgttg 38178261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904964
Alignment:
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| || |||| || | |||||||   | |||| |||||| | |||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaaaaaaa-tagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    | ||||||| || |||||||  |||||||||||||  || ||||||||  | ||||| ||||||| ||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaat 9904964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Original strand, 30748397 - 30748527
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||| | ||| |||||  |||||| |||| |||| |||   ||    
T  30748397 gttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattaca--gagagttgtggtcgcaccagtagtagaaaagatggtggaatcaag 30748494  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30748495 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 30748527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2776513 - 2776437
Alignment:
Q  66 tgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgta 142  Q
    |||||||||||||||| |||| || | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2776513 tgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgta 2776437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30113528 - 30113416
Alignment:
Q  19 taagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 118  Q
    ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||    
T  30113528 taagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggttt 30113429  T
Q  119 gggcatgtagaga 131  Q
    |||||| ||||||    
T  30113428 gggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 339
Target Start/End: Original strand, 43733330 - 43733477
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||    |||||| ||||| | ||||||||||||  |||| || | |  |||||| ||||||    
T  43733330 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttggataaaaatgtgttttg-gatagaacactat 43733428  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||| ||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  43733429 ggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 43733477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Original strand, 44373739 - 44373891
Alignment:
Q  31 ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 130  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||||||  |||||| || |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  44373739 ggataggattagaaatgaaaatattagagtgagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagag 44373838  T
Q  131 agaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
      ||||||  || || | || ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  44373839 taaagacctatagattttgtagtaaagagagtagatcaaatagaggatagtca 44373891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2518734 - 2518560
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||| ||| | | ||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||    
T  2518734 ttggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaagatggtggaaaatagg 2518636  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtc 182  Q
     |||| |||||||   |||||||||||||||  ||| || | || | ||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  2518635 tttaggtggtttgattatgtagagagaagacttgtagattttgtaggaaagagagtatatcaaattgaggatagtc 2518560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Original strand, 36143357 - 36143480
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || | || |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  || ||   || ||| | ||    
T  36143357 agagagtcgaggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggag 36143456  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36143457 agtagatcaaatggaggatagtca 36143480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985776
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagacctgtgaattttgtagtaaggagagtagatc 25985783  T
Q  168 aaatgga 174  Q
    | |||||    
T  25985782 agatgga 25985776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28269840 - 28269759
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28269840 aaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattagcaag-atttagaggttaatgagttggatccaaattt 28269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30198507 - 30198266
Alignment:
Q  109 tagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccg 208  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  || ||  || | || ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    |  ||||| ||||| ||||      
T  30198507 tagatggtttgggcatcttgagagaaagcctgttgattttgtagtaacgagagtagatcagatgaaggatagtcagtacactagaggcagaggtagactt 30198408  T
Q  209 aggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    || |||||||| ||||||| |||||  || ||| | ||| | |||||||||||||  ||| || | |||||||||  | ||||| ||  ||||||| |||    
T  30198407 agaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgagattaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatg 30198308  T
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30198307 ttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 270
Target Start/End: Original strand, 5266016 - 5266131
Alignment:
Q  154 aagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaat 253  Q
    |||||||| | |||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||  |||| || |||||| |||||||||    
T  5266016 aagaagagcaaatcaaacggaggagagt-aagtcagaagaggtagagaaagacctagaaaaactatcatagaaatcattataatggatttggaggtcaat 5266114  T
Q  254 gagttggatccaaattt 270  Q
    |||||| ||||||||||    
T  5266115 gagttgaatccaaattt 5266131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27556377 - 27556297
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  27556377 tatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttgttg 27556297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276973
Alignment:
Q  276 atgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgttgt 32276973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 347
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||| || | |||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79113
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaata---ggcttaga 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||  |  ||||| |||||| ||||| || | ||||||||| ||   |||||||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttagg 79087  T
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  79088 tggtttgggcatgtatagagaagacc 79113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 16705697 - 16705832
Alignment:
Q  3 tgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaa 102  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| || |     
T  16705697 tgtgttggttgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattag--agagagttggagtagcatctatagtaaaaaagatggtggagac 16705794  T
Q  103 taggcttagatggtttgggc--atgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16705795 taggcttaagtagtttgggcatatgtagagagaagacc 16705832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Original strand, 21425229 - 21425328
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |||   ||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  21425229 aatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatggcttggttattgttgt 21425328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30812975 - 30812816
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||| ||||||    
T  30812975 agaggtaggggtagacctagaaaaactatacaagaaactgttaggaaggatctagagataaatgagttggaaaaagacatggtttttgatagaacactat 30812876  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  30812875 ggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgt 30812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 13986434 - 13986536
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||| ||||| | || || | ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |    
T  13986434 tggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaatagac 13986533  T
Q  108 tta 110  Q
    |||    
T  13986534 tta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Original strand, 14459043 - 14459177
Alignment:
Q  216 ctattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || | |||| || | |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  14459043 ctataagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T
Q  316 -catcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
     |  ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  14459143 cccccactttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 350
Target Start/End: Original strand, 26363660 - 26363768
Alignment:
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||||| |||| | | || ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  26363660 atttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataagacttg 26363757  T
Q  340 attgttgttgt 350  Q
     ||||||||||    
T  26363758 gttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33828106 - 33827824
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| | |||| || ||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||||| || |||||||| ||||  | || |||    
T  33828106 gttgtgttggatgtctagtaaaactagataagataagactagaaatgacaacattatagagatagttggggtaacaactatagtattaaatattgtggaa 33828007  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    || | |||||| || |||| |||| |||||| |||||  ||| || || | |||||| ||||||||||||| || ||||   |  ||| ||||||||  |    
T  33828006 aacatgcttaggtgatttgagcatatagagataagacgtgtagatttcatagtaagatgagtagatcaaatagaagataaaaagattacaagaggtacgg 33827907  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgataga 283  Q
    ||||||  |  |||||||| ||||||||||||| |||  ||||| || | ||||| ||||||| |||| || | |||||||||    
T  33827906 gaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgataga 33827824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324055
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 35324055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41031473 - 41031415
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41031473 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 41031415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41031579 - 41031521
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41031579 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 41031521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 356
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065008
Alignment:
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 1065008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38901884 - 38901819
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38901884 cactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgt 38901819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Original strand, 9695815 - 9695867
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9695815 tttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9695867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 344
Target Start/End: Original strand, 16351462 - 16351653
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| |   ||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |    
T  16351462 gtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaagtcacttgagataggagaagacctagaaaaactattagagaaactattaagaaggatctagagatta 16351561  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgt 344  Q
    ||||||| ||   | |  || | | | ||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  16351562 atgagtt-gagaaagacatggtttttaatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18474045 - 18473973
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||| || |||| | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18474045 tgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 261
Target Start/End: Original strand, 24558571 - 24558676
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||    |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  || ||||||||| | |    
T  24558571 gtaagaatagtagatcagatggaggatagtcaaatcaaa----gtagaggaagaccgagaaaaacaataagagaaattattaagaaagatttagagatta 24558666  T
Q  252 atgagttgga 261  Q
    ||||| ||||    
T  24558667 atgagctgga 24558676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Original strand, 31309583 - 31309635
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31309583 tttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 31309635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39760773 - 39760572
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||| ||||   || |||    
T  39760773 gttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacctatcgtagaaaagaatgtggaa 39760674  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | |    |||| |||||||||||| |||||| ||||   ||| ||  |||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |    ||||||||||    
T  39760673 act----ttaggtggtttgggcatatagagaaaagagttgtagattccgtaataaggagagtagatcatatggagggtagtcaaatcgctagaggtagag 39760578  T
Q  201 gaagac 206  Q
    ||||||    
T  39760577 gaagac 39760572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Original strand, 12611680 - 12611779
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |  |||| |||| |||| |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611680 aatgagttgggtagaaatatgatatatgttagaactttatggtgtcgtttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491686
Alignment:
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||||  || || || ||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||||| || ||||||||       
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatg 17491706  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacat 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17491705 ttgatccatgtagccgacat 17491686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35647005 - 35646930
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  35647005 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3464274 - 3464161
Alignment:
Q  246 aggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| || |||||  |  |||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3464274 aggtcaatgagttgga-ccaaatataatttatgatagaacattatggtatagtttgatccatatagtcgattccacttaatgggataagacttgattgtt 3464176  T
Q  346 gttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||  |||||||||    
T  3464175 gttgatgttgttgtt 3464161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 268
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439525
Alignment:
Q  214 aactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaat 25439525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 36069576 - 36069638
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||| ||||    
T  36069576 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagagag 36069638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 36143548 - 36143622
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||    
T  36143548 tatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39651090 - 39651028
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39651090 tatggtgtaatttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39651028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 16351323 - 16351408
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtag 86  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  16351323 gttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtag 16351408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 356
Target Start/End: Original strand, 39388907 - 39389074
Alignment:
Q  193 aggtagaggaagaccgaggaaaactatta-gagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttga---tgtatgatagagcact 288  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||  ||||  ||   | | || ||||  | |    
T  39388907 aggtagaggaggacctagaaaaactataaagagaaactattaggaaagatctagagattaatgagttggatagaaataagaaactatttggtagaagatt 39389006  T
Q  289 atggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  39389007 atggcgtcgtttgatccatgtggccaaccccacttagtgggataaagcttggtttttgttgttgttgt 39389074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 360
Target Start/End: Original strand, 1070279 - 1070351
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |  |||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1070279 tatggcatcatttgatccatgtagctaatctcacctggtgggataagacttgattgttgttgttgtttttgtt 1070351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 1313771 - 1313843
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1313771 tatgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 349
Target Start/End: Original strand, 3802026 - 3802154
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    ||||| |||||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||  || | |||||| || |||||||| || |||||||  |||||| |||   ||    
T  3802026 agagagactattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacactatggagtaatttgattaatgtagtcgaaccca 3802125  T
Q  321 cttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||    
T  3802126 tttagtgggataaggctttgttgttgttg 3802154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558199
Alignment:
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttcttgttgt 4558199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 356
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921507
Alignment:
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgttgt 16921507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Original strand, 30689942 - 30690006
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  30689942 tatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttg 30690006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Original strand, 3473753 - 3473852
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| |  |||||| | |||||| ||  | |||||||  |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3473753 aatgagttggaccggaatttggtttatgattgaatattatggcgaaatttaatccatttagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 3473852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 360
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985982
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtt 12985982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 350
Target Start/End: Original strand, 23023351 - 23023509
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggc 293  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||  || ||| || || | ||||||||||||   ||  |||| |||||||||  | |||| |    
T  23023351 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttggataggaacatgatatatgatagaatattatgac 23023450  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgacatcact--tagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  23023451 gtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttatagtgggatatggtttggttgatgttgt 23023509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982890
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgttgt 40982890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 4955335 - 4955473
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  | |||||||| |||  |||| |||| ||| ||| | || || | ||| |||||||  ||||||    
T  4955335 aaaattattagagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtag 4955434  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  4955435 tcgatctcacttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741921
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgtcgttattgttgtt 18741921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746885
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgtcgttattgttgtt 18746885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 359
Target Start/End: Original strand, 36042407 - 36042489
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||| |||  ||| |||||||||| || |||||    
T  36042407 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttgtcgttgt 36042489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Original strand, 36069745 - 36069883
Alignment:
Q  211 gaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||| ||| || ||||||||||  ||  |||||||| | |||||||||| |  |||| || | ||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  36069745 gaaaattataagggaaactattaacaaatatttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatata 36069844  T
Q  311 gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||| |   |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36069845 gccaaacccacttactggaataatgcttgattgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 41212068 - 41212145
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta--gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  41212068 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 41212145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45512506 - 45512448
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45512506 tatggcataatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggatgaggcttggttgttg 45512448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 359
Target Start/End: Original strand, 5266174 - 5266235
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  5266174 tttgatctatgtagccgactgcatttagtgggataaactttgattgttgttgttgttgttgt 5266235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5810327 - 5810278
Alignment:
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  5810327 gatccatgtagccaacctcacttaatgggatgaggcttggttgttgttgt 5810278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14742890 - 14742849
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14742890 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttg 14742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Original strand, 24837942 - 24837979
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24837942 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 24837979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 357
Target Start/End: Original strand, 32978126 - 32978163
Alignment:
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32978126 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 32978163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Original strand, 33076375 - 33076416
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  33076375 cacttagtgggataagatttgattgttgttgttgttgttgtt 33076416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666726
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 123  Q
    |||||||||| ||||||||   | ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgaca---taagagagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaactctacttaaatggtttgggca 33666726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085137
Alignment:
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgt 35085137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41972067 - 41971991
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||||  ||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972067 agagagttagggtaacaccta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43350784 - 43350731
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43350784 atttgatccaagtagccgaccccgctaagtgggataaggcttggttgttgttgt 43350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 134)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 4496315 - 4496672
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagaca--ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4496315 gttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctggtag 4496414  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4496415 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 4496514  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4496515 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcat 4496614  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4496615 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 4496672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12492731 - 12492376
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcaccta---tagtagtaaagttggtagaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  12492731 gttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaa 12492632  T
Q  103 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagagga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12492631 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 12492532  T
Q  203 agaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttga 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12492531 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 12492432  T
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12492431 tgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttg 12492376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28977206 - 28976853
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28977206 gttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28977109  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28977108 aataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 28977009  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28977008 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 28976909  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28976908 gattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 28976853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 24178443 - 24178792
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24178443 gttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 24178542  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24178543 aataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 24178642  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24178643 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcattt 24178742  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  24178743 gatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgt 24178792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2075823 - 2075475
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  2075823 gttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagac 2075724  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2075723 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 2075624  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattag-aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  2075623 gaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatt 2075524  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075523 tgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 10639230 - 10639595
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatag-------tagtaaagtt 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||       ||| ||||||    
T  10639230 gttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagactatagtagaaaagtt 10639329  T
Q  94 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaaga 193  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  10639330 ggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggagga--gtcaagttaaaaga 10639427  T
Q  194 ggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggc 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10639428 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 10639527  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtta 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10639528 gtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgtta 10639595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1287938 - 1287590
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag----------tgggggtagcacctatagtagtaaa 90  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||| |||    
T  1287938 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 1287839  T
Q  91 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1287838 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaa 1287739  T
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  1287738 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagtacactat 1287639  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1287638 ggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 1287590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 339
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685238
Alignment:
Q  33 ataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  133 aagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt 232  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  333 aggcttg 339  Q
    |||||||    
T  38685232 aggcttg 38685238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1275198 - 1275546
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1275198 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaa 1275296  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  1275297 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaacaggggtagag 1275396  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  1275397 gaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacattatgacgtcattt 1275496  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1275497 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgt 1275546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Original strand, 3301786 - 3302126
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3301786 gatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 3301885  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3301886 agatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagaccta 3301985  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
     |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3301986 agaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgt 3302085  T
Q  310 agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3302086 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 71 - 349
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  171 tggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  271 gatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16347727 - 16347380
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16347727 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 16347628  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16347627 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 16347528  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||| |||  |||||||||||    
T  16347527 gaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcattt 16347430  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16347429 gatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 359
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14666003
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag----agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttag 111  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  112 atggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgagg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 14666003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 34272961 - 34273295
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag----------tgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34272961 ttggatgagtggtaagactagacaggat-----taggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggt 34273055  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||              |||||||||||||||||    
T  34273056 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagaggaga--------------gtcaagttaaaagaggt 34273141  T
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  34273142 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtc 34273241  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  34273242 attcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgt 34273295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 126 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915490
Alignment:
Q  126 tagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttgttgt 2915490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26885038 - 26884683
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagta-gtaaagttggtaga 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  26885038 gttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 26884939  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||   ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||    
T  26884938 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtaga 26884839  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||| || | ||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||| |||| || |||||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||  ||    
T  26884838 ggatgagctaggaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaat 26884741  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26884740 ttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttgttgt 26884683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 157 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561386
Alignment:
Q  157 aagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgag 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  257 ttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||| | || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgt 13561386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 350
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816664
Alignment:
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29816664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Original strand, 14911264 - 14911452
Alignment:
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14911264 agtagatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttg 14911363  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  14911364 gatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgtt 14911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501422
Alignment:
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
     ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| | || ||     
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaata 38501469  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38501468 tgatcgatgtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  312 ccga-catcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31636009
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattaga--gaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtg 31636156  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||| | |||| ||  |||||| | |  |||| ||| |||||| | || |||    
T  31636155 gtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaa 31636056  T
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  31636055 actattagagaaactatcaagaaggatatagagatcaatgagttgga 31636009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 303
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  132 gaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactat 231  Q
    ||||||| ||  ||   || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| | |  | ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgat 303  Q
     |  |||||| ||||| | || |||||||||  |||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14749471 caagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 351
Target Start/End: Original strand, 36215450 - 36215771
Alignment:
Q  18 gtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 117  Q
    |||| |||||| | |||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36215450 gtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtt 36215547  T
Q  118 tgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaact 217  Q
    | |||| ||||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||          ||||||||||    
T  36215548 tcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggta----------gaggaaaact 36215637  T
Q  218 attagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgaca 317  Q
    || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  |||  ||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||   |||     
T  36215638 ataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttgattcatgtaatggacc 36215737  T
Q  318 tcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    || |||| || |||||  |||| |||||||||||    
T  36215738 tcgcttaatgagataaaacttggttgttgttgtc 36215771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 248 - 358
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213865
Alignment:
Q  248 gtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  348 tgtcgttgttg 358  Q
    ||| |||||||    
T  30213855 tgttgttgttg 30213865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Original strand, 27836 - 28164
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||    
T  27836 gatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataggctt 27934  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    || ||||||| ||  ||||  || |||   |||         ||| ||||||||||||| |||   || |||||  | ||||||||| |||||||||| |    
T  27935 aggtggtttgagc--gtaggtaggagatttgta---------gtacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaaaagaggttgaggaagaccta 28023  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  28024 gaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacactatggcataatttgatacatgt 28123  T
Q  310 agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| |||  || |||||  |||||| |||| || |||||||    
T  28124 agctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgt 28164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Original strand, 79505 - 79795
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |   |||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||   || ||||| ||    
T  79505 agagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaaggag 79604  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||| ||||||||||||||| |||   | | ||||||  |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||  | |||||| ||    
T  79605 agtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatgagctg 79704  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || | |||| || || |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  79705 gaccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagctggccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgt 79795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 32516491 - 32516791
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||  ||||||| || ||| ||| |||||||| |||| |||| |||    
T  32516491 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattag--agagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaa 32516588  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||  ||| ||   || ||| | ||||||||||  ||| |||||| |||  ||| |||||||||||    
T  32516589 aataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagag 32516688  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||  |||||||| ||||| || | |||||||||  | |||| ||| ||||    
T  32516689 gaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaattt 32516787  T
Q  301 gatc 304  Q
    ||||    
T  32516788 gatc 32516791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 355
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475526
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 170  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  171 tggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 270  Q
    |||||||||||||  | |  | ||| | | | | ||  || |||||| | |||||||||||||  || |||  |||| | ||||||||||||| |||| |    
T  43475343 tggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaacatagaaaaact-taagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggatcgaaatat 43475441  T
Q  271 gatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||| |||| |||| |  ||||| || |||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43475442 gatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgttg 43475526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 312
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889237
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| |||||||  |||| | | ||||| |||||||||| |||||  | |||| |||| ||||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||  ||   |||||||| | | || || | |||||||||||||||   |   |||| ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||||||  | |||| || | ||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 6889230  T
Q  306 atgtagc 312  Q
    |||||||    
T  6889231 atgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 350
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558423
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttga 340  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  341 ttgttgttgt 350  Q
    |||| |||||    
T  5558414 ttgtcgttgt 5558423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 356
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276526
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  | |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactcca 28276490  T
Q  321 cttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28276491 cttagcgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 28276526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Original strand, 2712897 - 2713213
Alignment:
Q  17 ggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggt 116  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||     ||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| | ||| ||||| ||||    
T  2712897 ggtaagactagacggggtagaattagaaatgacaacat----cagagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggt 2712992  T
Q  117 ttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||   ||   ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |  ||||  || |||||||| || |||||    
T  2712993 ttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggagagtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaac 2713092  T
Q  217 tattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgac 316  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||   |||      |   |||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||     
T  2713093 tataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttgga--gaaa------gacagatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgag 2713184  T
Q  317 atcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2713185 cccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 355
Target Start/End: Original strand, 6859343 - 6859668
Alignment:
Q  30 aggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||    ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||    
T  6859343 aggatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtaga 6859442  T
Q  130 gagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaact 229  Q
    ||||||||  ||  ||   || |||||  || || || | |||||||||||||||   |  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6859443 gagaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaact 6859542  T
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    ||||| || |||||| || | | | | ||||  | |||| || | ||||||||| || |||||| | |||| |||||||| || |||  |||||||||||    
T  6859543 attaggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtggg 6859642  T
Q  330 ataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||    
T  6859643 ataaggcttggtagttgttgttgttg 6859668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Original strand, 14667755 - 14668053
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg--------catgtagagagaagacccgtaaatgtcgtg 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||        ||||||||||||||||  ||| ||   ||     
T  14667755 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacattatgta 14667854  T
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||| |  | |  ||||| || ||||  || || |||||||| |||||| ||| ||  || ||| ||||| | |    
T  14667855 gtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaagaaagatctagagatta 14667954  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  14667955 atgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgtagttgt 14668053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 418158 - 418034
Alignment:
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    |||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  418158 aacttttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttgg 418059  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||    
T  418058 tgggatatggcttgaatgttgttgt 418034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7359593 - 7359261
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatgg 115  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||   ||||| |||||||   |||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||| |||| |||    
T  7359593 tggtaagactggacgagatagaattagaaatgacaatgttagagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtgg 7359494  T
Q  116 tttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaa 215  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||| ||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |  ||||| |||||||  || || ||||    
T  7359493 tttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaa 7359395  T
Q  216 ctattagagaaactatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    | || |||||||||||| |||||  || ||||| | ||| ||||||||| |||| || | || |||| | || |||| ||| |||||||||||||||| |    
T  7359394 ccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgataaa-cattatgacgtaatttgatccatgtagctg 7359297  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  7359296 accccacttagtgggacaagacttggttgttgttgt 7359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 33667166 - 33667286
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatgg 115  Q
    |||||||| ||||||| | || ||||| ||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||    
T  33667166 tggtaagagtagacagtagagaattagaaatgacaacatta--acgagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtgg 33667263  T
Q  116 tttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33667264 tttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 351
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525924
Alignment:
Q  75 cacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgga 174  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||   |  || || ||||||||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  175 ggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatg 274  Q
    ||| |||||  | |  |||||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||   | |  || |     
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    | ||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccgac--ca-ttagtgagataaggcttggttgttgttgtc 1525924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 408558 - 408494
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  408558 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 408494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235316
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| || | ||||||||| || |||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaacta--agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 9235269  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9235270 ggcataatttgatccatgtagccgac-ccacttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489609
Alignment:
Q  53 attagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtgg 152  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || | ||      
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtat 15489690  T
Q  153 taagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatta 233  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||  | | |  ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  15489689 taaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactatta 15489609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10083079 - 10082952
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||  ||||  | |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||    
T  10083079 gatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 10082980  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||    
T  10082979 aagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 11675673 - 11675812
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||   |||| || | ||||||||| || ||||||||  ||| |||||||||    
T  11675673 aaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgta 11675772  T
Q  311 gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11675773 gccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 11675812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Original strand, 15168756 - 15168855
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15168756 gataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 355
Target Start/End: Original strand, 29922409 - 29922571
Alignment:
Q  193 aggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatgg 292  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| | ||  |||||||   |||  || | || |||||| || |||||    
T  29922409 aggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatgg 29922508  T
Q  293 cgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  29922509 cgtaatttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgttgttgttg 29922571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418201
Alignment:
Q  17 ggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttaga--tg 114  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| | ||||||||  ||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattaga--gagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctg 418221  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  418220 gtttgggcatgtagagagaa 418201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12577058 - 12576861
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||   | |  ||||| ||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||  || ||| ||||| | |    
T  12577058 gtaaggagagtagatcagatggagggtagtcctatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagatta 12576959  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||||| ||  |||| || | ||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12576958 atgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17340786 - 17340505
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacct-atagtagtaaagttggtaga 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    ||  |||||||||||||||||||||| |||| || | | || ||| | ||||||| ||  ||  ||||    
T  17340786 gttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtagaaacattattaga 17340687  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||  |||||| || || | |||  || ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||||    
T  17340686 aaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaaagggtaga 17340587  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgata 281  Q
     ||||||  || |||| ||| |  | ||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  17340586 tgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgata 17340505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 347
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041035
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| || | | ||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  330 ataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgt 39041035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676760
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatca 168  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||   || ||||| | | || || |    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatta 28676695  T
Q  169 aatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatta 233  Q
     ||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||| ||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaatta 28676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 42199245 - 42199450
Alignment:
Q  25 tagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||  | ||| | ||||| | |||||||||| ||  |||| |||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  42199245 tagacgggataggattagaaatgacgacgttacagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcat 42199342  T
Q  125 gtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagag 224  Q
    |||||||||||||  ||| ||   || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| | |  || || |||| |||||| || ||||||||||||     
T  42199343 gtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattagac 42199442  T
Q  225 aaactatt 232  Q
    ||||||||    
T  42199443 aaactatt 42199450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 350
Target Start/End: Original strand, 2090556 - 2090695
Alignment:
Q  211 gaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| |  | ||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  2090556 gaaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgta 2090655  T
Q  311 gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     |||||  || | |||||||||||||||  ||||||||||    
T  2090656 cccgaccccattgagtgggataaggctttgttgttgttgt 2090695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 5860041 - 5860116
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5860041 tatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 5860116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 30588460 - 30588712
Alignment:
Q  79 tatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggat 178  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||  ||| ||   || ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  30588460 tataatagaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagat--aatggaggat 30588557  T
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatg 278  Q
    ||||| || |  ||||  | ||||||||| || |||||||| ||||||| | |||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | |||     
T  30588558 agtcaggtcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttata 30588657  T
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataa 333  Q
    ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30588658 atagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 38132543 - 38132618
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38132543 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38132618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 288
Target Start/End: Original strand, 2552932 - 2553002
Alignment:
Q  218 attagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcact 288  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2552932 attagagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Original strand, 9234115 - 9234180
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgttat 362  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9234115 atttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgtatttgttgttat 9234180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11002763 - 11002645
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||| |    
T  11002763 tggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattaga--gagagttcgggtagcacctacagtagaaaacatggtagaaactagac 11002666  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtag 128  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  11002665 ttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411958
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28411958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442120
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || | |  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  351 cgttgt 356  Q
     |||||    
T  32442125 tgttgt 32442120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Original strand, 42576215 - 42576292
Alignment:
Q  273 tgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42576215 tgtatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42576292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15588546 - 15588401
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatg 291  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||   ||||||||||||  |||  || | ||||| ||| || ||||    
T  15588546 gaggcagaggacgacctagaaaaactataagagaaactattataa--gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatg 15588449  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15588448 gcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttg 15588401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3442944 - 3442873
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3442944 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351119
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca-tgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacc 18351119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855889
Alignment:
Q  259 ggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18855889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9917695 - 9917538
Alignment:
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  ||  || | || ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| | | |||||  |||||| |    
T  9917695 ggcttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatg 9917596  T
Q  205 accgaggaaaactattagagaaactatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9917595 acctagaaaaactattagagaaactatttagaaag-atatagagatcaatgagttggat 9917538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 20318920 - 20318989
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagc 75  Q
    |||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20318920 gttgcgttggatgagtggtaagact-----ggataggattaggaatgacaccattagagaaagagtgggggtagc 20318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 350
Target Start/End: Original strand, 20367049 - 20367175
Alignment:
Q  224 gaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactt 323  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || | ||||| | | || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||  |||||    
T  20367049 gaaactagtaggaaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccactt 20367148  T
Q  324 agtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     || |||||||||||| ||||||||||    
T  20367149 ggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 27386560 - 27386622
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27386560 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35118380 - 35118322
Alignment:
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118380 gcgtaatttgatccatgtacccgacctcatttagtgggataaggcttgattgttgttgt 35118322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9121143 - 9121078
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9121143 cactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 316
Target Start/End: Original strand, 29938126 - 29938358
Alignment:
Q  79 tatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggat 178  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||| ||| ||   |||||||| | |||||||   ||| |||||    
T  29938126 tataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggat 29938225  T
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatg 278  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||| || ||||||    ||||||||||||| || ||||||  | | ||||||||||||  |||| |||| ||||    
T  29938226 agtcagatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact----gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatgatttatg 29938321  T
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgac 316  Q
     |||| || | ||| || | ||| ||||||||||||||    
T  29938322 -tagaacattttggtgtaagttggtccatgtagccgac 29938358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272759
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgt 42272759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 326
Target Start/End: Original strand, 6788190 - 6788325
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| | || ||||||||| || || || ||  | |||||||||||   |||| |||| ||||||||| || |||    
T  6788190 agaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaattaatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattat 6788289  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagt 326  Q
     |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6788290 agcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagt 6788325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093867
Alignment:
Q  88 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  | | || | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtca 21093867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33158029 - 33157918
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||| | ||||||| || ||| |||| |||||||||| || |||  ||||| || | |    
T  33158029 gtaagaagagtagatcaaatataagatagtcatgttacaagaggtataagaagacctagaaaacctataagagaaactactaaaaaatatttatagatta 33157930  T
Q  252 atgagttggatc 263  Q
    ||||||||||||    
T  33157929 atgagttggatc 33157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 218126 - 218052
Alignment:
Q  276 atgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  218126 atgaaagagcattatggcgtcattagatccatgtagccgaccccacctagtgggataagacttggttgttattgt 218052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Original strand, 11675547 - 11675649
Alignment:
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||   || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  11675547 ggcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatcaaaagatgtagaggaag 11675646  T
Q  205 acc 207  Q
    |||    
T  11675647 acc 11675649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34194845 - 34194714
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||  ||||||| ||| || ||||||||  |  |||| |||| |||    
T  34194845 gttgtgttggatgtgtggtaaaactagacaggataggattagaaatgtaaacattag--agagagttgggataacacctataacataaaagatggtggaa 34194748  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    |  |||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  34194747 accaggcctaggtggtttgggcatctaaagagaa 34194714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Original strand, 36200769 - 36200894
Alignment:
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||  | ||||     
T  36200769 gtagaaaatatgattaggtggttttagcatgtagagagaaaaccagtaaatgatgtagtatgaagagtagatcagatagaggagagtaaag-aagaagat 36200867  T
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactatta 221  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  36200868 gtagaggaagacctagaaaaactatta 36200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 350
Target Start/End: Original strand, 38830504 - 38830601
Alignment:
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  38830504 atgagttggaccgaaatatgatgtatgatagaacattatagcgtaatt-gatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgt 38830601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 7678413 - 7678759
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaa-----agagagtgggggtagca-cctatagtagtaaagttg 94  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||      ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| | |    
T  7678413 gttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatagtagaaaaat-g 7678511  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagag 194  Q
    || ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| ||   || ||||| |||||||||     ||||||||||||  | |  ||||    
T  7678512 gtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagat-----ggaggatagtcagatcactagag 7678604  T
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggc 293  Q
    | ||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  | | ||| ||| | || ||||      
T  7678605 gcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaa-cattatgag 7678702  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  7678703 gtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgt 7678759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 350
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400793
Alignment:
Q  265 aaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||| || |||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgt 9400793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 360
Target Start/End: Original strand, 34119859 - 34119912
Alignment:
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34119859 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgatttttgttgttgttgttgtt 34119912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 36551375 - 36551428
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36551375 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 36551428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 348
Target Start/End: Original strand, 39128261 - 39128342
Alignment:
Q  267 atttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| ||||||| | || ||||||| | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39128261 atttgatatatgatacaacattatggcgccgtttgatacatgtagccgacctaacttagtgggatatggtttgattgttgtt 39128342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41108791 - 41108727
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtg--ggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41108791 tatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgtgggataaggcttgattgttgttgt 41108727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43557930 - 43557833
Alignment:
Q  253 tgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||| | | | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43557930 tgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttgttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Original strand, 2393039 - 2393158
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |  | | | |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  2393039 attagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 2393138  T
Q  330 ataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  2393139 ataaagcttg-ttgttgttgt 2393158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7640582 - 7640510
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  7640582 tatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11069237 - 11069162
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11069237 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatatagctgaccccacatagtgggatatggcttggttgttgttgt 11069162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28186857 - 28186782
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||   ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  28186857 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 136
Target Start/End: Original strand, 31906610 - 31906729
Alignment:
Q  17 ggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggt 116  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||  |||||| | ||| ||||||||| | |||||  ||||||| ||    
T  31906610 ggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcggaaatattcttagatagt 31906709  T
Q  117 ttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    || | |||||||| ||||||    
T  31906710 ttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42504502 - 42504447
Alignment:
Q  31 ggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtag 86  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42504502 ggatatgattaggaatgacatcatcagagagagagtgggggtagcacttatagtag 42504447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 309
Target Start/End: Original strand, 43035071 - 43035222
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||| ||  |||| ||  |  ||||||    
T  43035071 agagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaaatttatgagt 43035170  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    |||| | |||| || ||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||    
T  43035171 tggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgttttttaatccatgt 43035222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 219802 - 219692
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||  |||| ||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || | |||| |||| |||    
T  219802 gttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgttgaaaaggtggtggaa 219703  T
Q  101 aataggcttag 111  Q
    | | |||||||    
T  219702 acttggcttag 219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3775119 - 3775065
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  3775119 catgtagccgaccccacttagtgggataaagcctgattgttgttgttgttgttgt 3775065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4026390 - 4026328
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4026390 tatgacgtcgtttgatccatgtagccgagttcactttgtgggatcaggcttggttgttgttgt 4026328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 15168864 - 15168986
Alignment:
Q  161 gtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 260  Q
    |||||| | |||||||| ||| |  ||| |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| ||||||    
T  15168864 gtagattagatggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttgg 15168963  T
Q  261 atccaaatttgatgtatgataga 283  Q
    ||||| || || | |||||||||    
T  15168964 atccagatatggtttatgataga 15168986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Original strand, 32366186 - 32366260
Alignment:
Q  276 atgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32366186 atgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgt 32366260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43558117 - 43558011
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||| |||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||  |  ||||||||    
T  43558117 agagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaagaag 43558018  T
Q  160 agtagat 166  Q
    |||||||    
T  43558017 agtagat 43558011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 2049271 - 2049339
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2049271 gatagaccattatggcatgatttgatccatgtagccgactgcactta-tgggataaggcttggttgttgt 2049339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 182
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799957
Alignment:
Q  117 ttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtc 182  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtc 27799957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41200421 - 41200360
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggc 336  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  41200421 tatgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggc 41200360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833794
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagta--gtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  | |||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagacc 41833794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 356
Target Start/End: Original strand, 41894280 - 41894361
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  41894280 tatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagactttgttgttgttgttgttgt 41894361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Original strand, 2645220 - 2645272
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2645220 tttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2645272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 5305549 - 5305613
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag 65  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  5305549 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagagagag 5305613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8082152 - 8082068
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactat-tagagaaactattaga 235  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||    
T  8082152 gtaaggagagtagatcagatgaacgatagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataaagagaaactactaga 8082068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986904
Alignment:
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||   ||| ||    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtca 15986904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 345
Target Start/End: Original strand, 28985312 - 28985360
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  28985312 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Original strand, 9235008 - 9235059
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  9235008 ttggatgtgtggtaagactagacgggataggattataaatgacaacattaga 9235059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 348
Target Start/End: Original strand, 10668569 - 10668620
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10668569 atttgatcaatgtagccgaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 10668620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 348
Target Start/End: Original strand, 27800057 - 27800108
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27800057 atttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 27800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28187011 - 28186960
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga 58  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  28187011 ttggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattaga 28186960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38105325 - 38105266
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||   || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38105325 tatggcgtaatttgatccatgtagtgtacctcactaagtgggataaagcttgattgttgt 38105266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42504362 - 42504247
Alignment:
Q  235 aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataag 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||| || | ||||||||| || |||| ||| |||||||| | ||||  ||  |||| ||||||  || |    
T  42504362 aaaggatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatcaacgtagttgatttcacctagtggtctagg 42504263  T
Q  335 gcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||    
T  42504262 gcttggttgttgttgt 42504247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8082017 - 8081967
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatc-acttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8082017 atttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11002494 - 11002424
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11002494 tgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Original strand, 14725640 - 14725718
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    |||||||||||||| | | || |||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  14725640 aagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaat 14725718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15252789 - 15252751
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg 343  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15252789 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattg 15252751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39322141 - 39322095
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataag 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  39322141 tatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 39322095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42408730 - 42408700
Alignment:
Q  320 acttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42408730 acttagtgggataaggcttgattgttgttgt 42408700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43423557 - 43423496
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43423557 tatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccttttagtgggataaggcttg-ttgttgttgt 43423496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 359
Target Start/End: Original strand, 1101999 - 1102060
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || || ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  1101999 tttgatccatgtggccgacctcacttactgagacaagacttggttgttgttgttgttgttgt 1102060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367171
Alignment:
Q  302 atccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgtc 7367171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10989126 - 10989085
Alignment:
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10989126 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10989085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Original strand, 29929305 - 29929342
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29929305 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 29929342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 36200715 - 36200764
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgaca 50  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  36200715 gttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Original strand, 39766741 - 39766802
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||| ||| |||||||||    
T  39766741 tatggcgtaattttatccatgtagccgacctcacttactgagaaaagggttggttgttgttg 39766802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 332
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808186
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggata 332  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagtaggata 41808186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 28085309 - 28085664
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28085309 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28085408  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28085409 aataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagag 28085508  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28085509 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcattt 28085608  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28085609 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 28085664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 32755852 - 32756203
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag--agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32755852 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 32755951  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32755952 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 32756051  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32756052 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 32756151  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  32756152 ttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgt 32756203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 30031189 - 30031535
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30031189 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 30031288  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30031289 aataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 30031388  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30031389 ggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 30031488  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30031489 gatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5258499 - 5258142
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag--tgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258499 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 5258400  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5258399 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtag 5258300  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    || |||||| | |||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| || | | ||||  | ||||||||||||||    
T  5258299 agaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcat 5258200  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  5258199 ttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttgttgt 5258142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 349
Target Start/End: Original strand, 608097 - 608442
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  608097 gttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattaga--gagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaatag 608194  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||    
T  608195 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaaga 608294  T
Q  206 cc----gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttg 301  Q
    ||     | |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||  |||||| |||||||||    
T  608295 cctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttg 608394  T
Q  302 atccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  608395 atccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20427978 - 20427630
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20427978 tggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 20427879  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20427878 ttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacc 20427779  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || | | | |||||  ||||||||| ||||| ||| ||    
T  20427778 taagaaaactattagagaaaccattagaaa-aatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatactatggcgacatttaatcaat 20427680  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggat-aaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||    
T  20427679 gtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttgttgt 20427630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 9706716 - 9707052
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9706716 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggc 9706815  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||| || | | ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  |||||  |    
T  9706816 ttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggc 9706909  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | | |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9706910 taagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccat 9707009  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707010 gtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 40 - 350
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890857
Alignment:
Q  40 taggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagaccc 139  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||    
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------ccc 12890646  T
Q  140 gtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaagg 239  Q
     || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12890647 atagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  240 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 12890846  T
Q  340 attgttgttgt 350  Q
     ||||||||||    
T  12890847 gttgttgttgt 12890857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35043783 - 35043441
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35043783 tggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggc 35043684  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  35043683 ttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacc 35043584  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  35043583 taagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcaat 35043484  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||   ||||||  | ||||||||||| ||||||||||    
T  35043483 gtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 5631751 - 5632064
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag----agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5631751 gttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggt 5631850  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||      
T  5631851 agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagac 5631950  T
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    | ||||||||  | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| | ||||||| ||||    
T  5631951 aaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtc 5632050  T
Q  297 atttgatccatgta 310  Q
    ||||||||||||||    
T  5632051 atttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351853
Alignment:
Q  14 agtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagat 113  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttaga--gagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagat 21352074  T
Q  114 ggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaa 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| | | || |||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21352073 gatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaa 21351974  T
Q  214 aactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagcc 313  Q
    ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21351973 aaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagcc 21351874  T
Q  314 gacatcacttagtgggataag 334  Q
    ||| ||| |||||| ||||||    
T  21351873 gacctcagttagtgagataag 21351853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9594061 - 9593710
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtggg------ggtagcacctatagtagtaaagttg 94  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||      |||||||||  |||||| |||| ||    
T  9594061 gttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattagtagaaaagatg 9593962  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagag 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |   |||||    
T  9593961 gtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaaat--caagag 9593864  T
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcg 294  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||| || | ||||||||| || ||||  |    
T  9593863 gtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgatagaacattatg--g 9593766  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | ||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9593765 taatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 9593710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 14030746 - 14031077
Alignment:
Q  8 tggatgagtggt-aagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14030746 tggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataatagg 14030845  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  14030846 cttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagac 14030945  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |           | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  14030946 c-----------taagaaaaac-attagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaatactataacgtcatttgatcca 14031033  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | || |||||   | |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  14031034 tataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgt 14031077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10100206 - 10099987
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10100206 gttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattaga--gagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaa 10100109  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  10100108 aataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagag 10100009  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattag 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  10100008 gaagacctaggaaaactattag 10099987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 79 - 350
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679678
Alignment:
Q  79 tatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggat 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |     
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatg 278  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||          |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgt 30679678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143759
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 34143759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156375
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 34156375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 307
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  70 ggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatca 168  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||| ||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  169 aatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33497062 aatgaagga--gtcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  269 ttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     |||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  117 ttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  217 tattagagaaactattagaaaggatttag 245  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 117 - 245
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  117 ttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaac 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  217 tattagagaaactattagaaaggatttag 245  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34934942 - 34934830
Alignment:
Q  238 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34934942 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 34934843  T
Q  338 tgattgttgttgt 350  Q
    || ||||||||||    
T  34934842 tggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28027170 - 28026829
Alignment:
Q  5 tgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  28027170 tgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatgggg-tagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaata 28027072  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| || ||| ||| |||  || ||| |||||||| |||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  28027071 ggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaag 28026973  T
Q  205 accgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatc 304  Q
    ||| |  |||||||| ||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||| ||| || ||||| || | ||||||  | || || ||||| |||||| |    
T  28026972 acctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgat--aacattacggcgtaatttga-c 28026876  T
Q  305 catgtagccgacatcacttagt-gggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     |||||||||||  |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  28026875 aatgtagccgaccccacttattgggggtaaggcttgcttgttgttgt 28026829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 133 - 311
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  133 aagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt 232  Q
    |||||||||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  233 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
      |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 350
Target Start/End: Original strand, 31818999 - 31819113
Alignment:
Q  236 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataagg 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  31818999 aagggtttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatg 31819098  T
Q  336 cttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||| |||||    
T  31819099 cttggttgtggttgt 31819113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6056119 - 6055806
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagt-tggtaga 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| |||   |  |||     
T  6056119 gttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattaga--gagagttggggtaacacctatagtagaaaaaaattatagg 6056022  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| || ||   || ||||||||| ||||| || |||||| | |||| |||||||    
T  6056021 aaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaaggtaga 6055922  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    |||||||| |  |||||| | |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| || || | ||| |||    
T  6055921 ggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatt 6055822  T
Q  300 tgatccatgtagccga 315  Q
    |||| |||||||||||    
T  6055821 tgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206454
Alignment:
Q  231 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggga 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  331 taaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttgttg 3206454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 350
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  190 aagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcacta 289  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098890
Alignment:
Q  219 ttagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacat 318  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||  ||||      
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacactaa--cgtcatttgatccatgtaatcgaccc 10098928  T
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10098927 cacttagtgggataagacttgattgttgttgttgttgt 10098890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Original strand, 33083996 - 33084128
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  33083996 gttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactag 33084095  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33084096 acttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 268
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689834
Alignment:
Q  74 gcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgg 173  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  174 aggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    || | ||||| || |||||||||      ||||| || |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaat 2689834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 316
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666059
Alignment:
Q  76 acctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgta-aatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgga 174  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | | | || ||||| ||||||||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  175 ggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatg 274  Q
    | ||||||   | |  ||||| |||||||| |  || | |||||  |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |     
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgac 316  Q
    ||||||||| || |||| | | ||||||||  ||||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccgac 24666059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34505
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| || | ||||||||| || |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 34505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 350
Target Start/End: Original strand, 31818526 - 31818813
Alignment:
Q  62 agagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagag 161  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||| ||  ||   |  ||||| | ||    
T  31818526 agagtcggggtagcacctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaag 31818624  T
Q  162 tagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    ||||||| ||||||| |||| |  | |  | ||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || | ||| ||| | |||||||||||    
T  31818625 tagatcatatggagggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttgga 31818724  T
Q  262 tccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || || | || | ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  31818725 tcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1615300 - 1615223
Alignment:
Q  273 tgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1615300 tgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Original strand, 8364523 - 8364838
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||| ||    | || |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  8364523 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagacag----ttggagtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtg 8364618  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaa 214  Q
    |||||||||||||||||                 || |  || ||||||||||| ||||||||| ||||  | |  ||||| ||| ||||||| |  |||    
T  8364619 gtttgggcatgtagagat----------------gtagctaggagagtagatcagatggaggattgtcagatcactagaggaagatgaagacctaaaaaa 8364702  T
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||  | ||| |||||||   |||  || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8364703 actataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccg 8364802  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8364803 accccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgt 8364838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 5080803 - 5080888
Alignment:
Q  16 tggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaa 101  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5080803 tggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 5897615 - 5897739
Alignment:
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||| || | |||| ||||  | |||| ||| |||||||||||||||| ||   |||||||    
T  5897615 aactattagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttag 5897714  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5897715 tgggataaggcttgattgttgttgt 5897739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 26291711 - 26291917
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatt--agaaagagagtgggggtag-cacctatagtagtaaagttggta 97  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| || |||  ||| |||||||  |||||| |||||||| ||| |||  |||||    
T  26291711 gttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatagaaaatatggta 26291810  T
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||   || |||| |  |||||| |||||||||| |||||||| |||    | |||||| |||    
T  26291811 gaaaatagacttaggtggttt--gcatgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgatcaaaagacgta 26291908  T
Q  198 gaggaagac 206  Q
    |||||||||    
T  26291909 gaggaagac 26291917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12134250 - 12133902
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||    |||| ||||| |||||||  |||||| ||||| | | ||||  ||||||||||| |||| |||| |||    
T  12134250 gttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagagaattgaggtacgacctatagtagaaaagatggtggaa 12134151  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||   ||||| |||| ||||||| |||| |  |||||  |||  |||| |||| | ||||  |  ||||||||||  | |  ||||| | ||    
T  12134150 aataggcttacggggtttcggcacgtagagaaaagaactataaattccgtaataaggagagcaaatcaggtataggatagtcagatcactagaggcatag 12134051  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |  |||||||| | | ||| |||||| || | ||||||  | ||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || |||||| | || |    
T  12134050 gaagacctacaaaaactataatataaaatattaggaaag-tttagaaattaatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaacattatggcataatct 12133952  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  12133951 gatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgt 12133902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30789147 - 30789076
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30789147 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 30789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 32945455 - 32945530
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  32945455 tatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacatcacttagttgaataaggcttggttgtcgttgt 32945530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095913
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggct 108  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||  ||| || ||| || |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaataggct 5095913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Original strand, 579638 - 579709
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  579638 tatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgttgttgt 579709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 586057 - 586132
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  586057 tatgatagaacattatgacgtcatttgattcatggagccgacctcacttaatgggataaaccttgattgttgttgt 586132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2065098 - 2065018
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaa----agagagtgggggtagcacctatagt 84  Q
    |||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  2065098 tggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 9568593 - 9568731
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaag--agagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||  |  || || | |||||||| |||||||| |||| || | |    
T  9568593 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagatgatgg 9568692  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  9568693 aaaatggacttagatggtttgggcaactagagggaagac 9568731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 360
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568990
Alignment:
Q  253 tgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcg 352  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||  ||||| |||||||||| |    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagccaac-ccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T
Q  353 ttgttgtt 360  Q
    ||||||||    
T  9568983 ttgttgtt 9568990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33997703 - 33997545
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatta-gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcacta 289  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |  | |||| | ||||||||||||  |||| || |  ||||| || || ||    
T  33997703 agaggcagaggaagaccttggaaaactataagagaaactattaagaaaagcct-agagattaatgagttggatagaaatatggtacatgattgaacatta 33997605  T
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||||||||| |||   || ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33997604 tggcgtcatttgatctatgcgaccaaccacacttagtgggataatgcttgattgttgttg 33997545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6293660 - 6293386
Alignment:
Q  76 acctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggag 175  Q
    ||||||||||  |||  |||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||   ||  |||| |||||| |||| ||| ||    
T  6293660 acctatagtacaaaatatggtggaaactaggttcaggtggtttgggcatgtagagagaacacctgtagattatgtaataaggagagtaaatcagatgaag 6293561  T
Q  176 gatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgt 275  Q
    ||||||||| | |       |||||||||| | || |||||||  | |||||||||||| ||  || ||||  | |||||||| |||  |||| || | |    
T  6293560 gatagtcaaatcac------tagaggaagatctagaaaaactaaaatagaaactattaggaaatatctagatattaatgagttagatagaaatatggtat 6293467  T
Q  276 atgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  6293466 atgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgttgttgt 6293386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6641741 - 6641628
Alignment:
Q  18 gtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 117  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | | |||    
T  6641741 gtaagactagatgggataagattggaaatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggttgtt 6641642  T
Q  118 tgggcatgtagaga 131  Q
    ||||||| ||||||    
T  6641641 tgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 357
Target Start/End: Original strand, 38980 - 39060
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38980 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttgttgtt 39060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119642
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccga-catcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12119714 atagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21870363 - 21870299
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21870363 agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcat 21870299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4245945 - 4245866
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||| || |||| | || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  4245945 tgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttgttgt 4245866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25494131 - 25493969
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | || ||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||| ||    | |||| | |||||||||    
T  25494131 ggggtagcacctatagta-taaatattgtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatc 25494033  T
Q  168 aaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactat 231  Q
    |||| |||||||||||  ||| |||||||| | ||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  25494032 aaatagaggatagtcatattacaagaggtacaagaagacctagaagaactataagagaaactat 25493969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 348
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492669
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||| || | |  |||||| || ||| |||| |||||  ||| |||||||||  |||||||||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtggg 7492650  T
Q  330 ataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  7492651 ataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Original strand, 2079465 - 2079558
Alignment:
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
    ||||||| || | |||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  2079465 atgagtttgaccgaaatatgatttatgatagagcattatagcgtaatttaatccatgtagccgactcgacttagtggggtaaggtttggttgtt 2079558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 2689589 - 2689642
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccat 54  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2689589 gttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18130885 - 18130804
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  18130885 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgtagtttttgtt 18130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21870118 - 21870069
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21870118 tttgatccatgcagccgacctcacttagtgggataaggtttggttgttgt 21870069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 5897524 - 5897608
Alignment:
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| || | || ||| | ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5897524 gtttgggcatgtagagagaagatatgtatattttgtagtatggagagtagatcggatggaggatagtcaaattacaagaggtaga 5897608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 21089604 - 21089676
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||| || |||||| |  ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21089604 tatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14389457 - 14389335
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||| ||||  |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||  || |  | || ||||| ||    
T  14389457 agagagttgaggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaaa-cttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagactttgtagtaaggag 14389359  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  14389358 aatagatcagatggaggatagtca 14389335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Original strand, 30642980 - 30643051
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  30642980 atagaacattatggagtaatttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgt 30643051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 33496123 - 33496194
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacc 78  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  33496123 ttggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtaggggtagcacc 33496194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43181 - 43063
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||   ||||||||||||| |||| |  | |||||||||| | ||||| || |||| ||||||||| ||  | |||    
T  43181 agagaaactattaataaagatctagagagtaatgagttggatcaaaatatagtttatgatagagtattatggtgtaattttatccatgtatccagcctca 43082  T
Q  321 cttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  43081 cttagtgggataagacttg 43063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 5053733 - 5053807
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||| |||| | | ||||| ||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5053733 tatgataaagcattgttgcgtcgtttgatcaatgtagccgaccccatttagtaggataaggcttggttgttgttg 5053807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 339
Target Start/End: Original strand, 10453272 - 10453334
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||||    
T  10453272 tgatagaacactatggcgtcttttgattcatgtagccgaccatgcttactgggataaggcttg 10453334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 261
Target Start/End: Original strand, 38907 - 38956
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  38907 aaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 38956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 350
Target Start/End: Original strand, 507100 - 507145
Alignment:
Q  305 catgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  507100 catgtagccgactttacttagtgggatatggcttggttgttgttgt 507145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1008124 - 1008052
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||  ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1008124 tgatagaacattatggcgtaatttgatccaggtagca-accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 1008052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23888549 - 23888468
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  23888549 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgtagtttttgtt 23888468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 29900275 - 29900328
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  29900275 atttgatccatgtagccgacccctcttagtgggataaggattggttcttgttgt 29900328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 33998353 - 33998288
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagt 66  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  33998353 gttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagagagt 33998288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31750
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31401 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31500  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31501 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagag 31600  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||    
T  31601 gaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcattt 31700  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31701 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44080
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 132)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 52138733 - 52139082
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52138733 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 52138832  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52138833 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 52138932  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  52138933 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttattt 52139032  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52139033 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52139082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 28245370 - 28245719
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28245370 gttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28245469  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28245470 aatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagat 28245569  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28245570 gaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcattt 28245669  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28245670 gatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgt 28245719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51448058 - 51447717
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51448058 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtaggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaa 51447960  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  51447959 aataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga------- 51447867  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51447866 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 51447767  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51447766 gattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 51447717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 54278953 - 54279267
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54278953 gttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 54279052  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  54279053 aataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaa 54279152  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54279153 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 54279252  T
Q  301 gatccatgtagccga 315  Q
    |||| ||||||||||    
T  54279253 gatcaatgtagccga 54279267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 357
Target Start/End: Original strand, 22013 - 22361
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22013 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggc 22111  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||     
T  22112 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagact 22211  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22212 taagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctat 22311  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22312 gtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgttgtt 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 356
Target Start/End: Original strand, 5168768 - 5169120
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag----agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaat 103  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5168768 tggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaat 5168867  T
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaa 203  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5168868 acgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaa 5168967  T
Q  204 gaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgat 303  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5168968 gacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 5169067  T
Q  304 ccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5169068 ccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 5169120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47233940 - 47233596
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47233940 gttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 47233841  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||||    
T  47233840 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaagaaga 47233741  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  47233740 cctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattc 47233641  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47233640 atgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 51 - 350
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033428
Alignment:
Q  51 ccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgt 150  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccat 35033228  T
Q  151 ggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtc 250  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35033229 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 35033328  T
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35033329 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 356
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508523
Alignment:
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 48508523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 356
Target Start/End: Original strand, 25191319 - 25191665
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |    
T  25191319 tggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagac 25191416  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |    
T  25191417 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaagaac 25191516  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25191517 taagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccat 25191616  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25191617 gtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtcgttgt 25191665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 53519519 - 53519862
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctata------gtagtaaagttg 94  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||| |||||||    
T  53519519 gttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtagaaaagttg 53519618  T
Q  95 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagag 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  53519619 gtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagag 53519718  T
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcg 294  Q
    ||||||||||||| | ||            |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||| ||||||| ||    
T  53519719 gtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacg 53519806  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53519807 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 53519862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 54128311 - 54128661
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  54128311 gttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 54128410  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |  ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||||||    
T  54128411 aataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatcgaaagaggtagag 54128510  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactatt-agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || |||||| | |||    
T  54128511 gaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatt 54128610  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54128611 tgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 54128661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33272371 - 33272122
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag--tgggggtagcacctata----gtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||    
T  33272371 ttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaa 33272272  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33272271 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 33272173  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33272172 gaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 350
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850403
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 170  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||||| ||    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  171 tggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattag-aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 269  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||    
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattcaaatt 38850322  T
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||  ||||||||||    
T  38850323 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096696
Alignment:
Q  180 gtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  280 tagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 12096696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43695083 - 43694771
Alignment:
Q  27 gacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtggggg-tagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
    |||| |||||||||||||||||||      || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43695083 gacatgataggattaggaatgaca------gagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatg 43694990  T
Q  126 tagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagaga 225  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  43694989 tagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaagg------aagttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagaga 43694896  T
Q  226 aactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttag 325  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | | | ||||||||| || || | |||||||||||| |||||| ||||  || ||||    
T  43694895 aaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttag 43694796  T
Q  326 tgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||    
T  43694795 tgggataaagctgggttgttgttgt 43694771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45289434 - 45289091
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg--ggggtagcacctat--agtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||    
T  45289434 gatgtgtgataagactagacgggataagattagaaatgacac-attagagagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaatag 45289336  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||| || | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  45289335 gcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaaga 45289236  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
     | | ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| || | |||||||||    
T  45289235 tctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatcc 45289136  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45289135 atgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19676433 - 19676081
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg----------ggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |          ||||||||||||||||||  |||| || |    
T  19676433 ttggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctatagtacaaaagatgat 19676334  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||  || |||  ||||| |||||| || ||||| |||||  | |||||||||    
T  19676333 agaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtcagatcaaaagaggt 19676234  T
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||     
T  19676233 a-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatagagcattatggcgtg 19676135  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19676134 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 19676081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 50960922 - 50960641
Alignment:
Q  61 gagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaaga 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||| || | |||||||    
T  50960922 gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacct----atgttgtagaaagaaga 50960827  T
Q  161 gtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 260  Q
    |||||||| |||||||| ||||   |  ||||||| ||||||||||| || |||| | | |||||||||||||| || | ||||||| | ||||||||||    
T  50960826 gtagatcagatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttgg 50960727  T
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50960726 atccaaatatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 50960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 45728086 - 45728324
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatt-agaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45728086 tggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaagtagg 45728185  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaaga-cccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagat--caaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaa 203  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  45728186 atcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagatagaggaa 45728285  T
Q  204 gaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatt 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45728286 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600683
Alignment:
Q  15 gtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatg 114  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  115 gtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaa 214  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||| ||   || |  || ||||||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| || |||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  215 actattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||| || ||||| || ||||||||||| || ||     
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaacca 39600717  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||  ||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  39600716 accccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953453
Alignment:
Q  75 cacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa-gacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgg 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  174 aggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttaga--ggtcaatgagttggatccaaatttg 271  Q
    |||| ||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||| | ||| |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatatg 48953498  T
Q  272 atgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgac 316  Q
    || ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  48953497 atttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccgac 48953453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48734477 - 48734147
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| || |||||||| | |||||||| | || |||||||||||||    
T  48734477 gttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattaga--gagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaatag 48734380  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | |  || ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |  | |||||||||||||||||     
T  48734379 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaagg 48734280  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    ||  | |||||||||||||||            |||||| ||||||| ||||||| ||||||  || | ||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  48734279 ccttgaaaaactattagagaa------------gatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttgatcc 48734192  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48734191 atgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Original strand, 38060423 - 38060580
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  38060423 agagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaagaag 38060522  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaact 217  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38060523 agtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503568
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 49503798  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||  ||  || ||||||||| |||||||  ||||   ||| |||| ||||||||||||    
T  49503797 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagac 49503698  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    |               |||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| ||||||| || | |  |||| |  | |||||||| ||||||||||    
T  49503697 c--------------tagaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatcca 49503612  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49503611 tgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49503568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 344
Target Start/End: Original strand, 38430799 - 38431129
Alignment:
Q  24 ctagacaggataggattaggaatgacaccattagaa-----agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||| || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  38430799 ctagacgggataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgatt 38430898  T
Q  119 gggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaacta 218  Q
    ||||||||||||||| |||| | | |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  38430899 gggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaacta 38430998  T
Q  219 ttagagaaactatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagca-----ctatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
      ||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||      || ||||| |||||||||||||||     
T  38430999 caagagaaactattgtggaagg-tttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattacgttacggcgtaatttgatccatgtagt 38431097  T
Q  313 cgacatcacttagtgggataaggcttgattgt 344  Q
    ||||  |||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  38431098 cgaccccactaagtaggatgaggcttggttgt 38431129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 268
Target Start/End: Original strand, 3186706 - 3186968
Alignment:
Q  5 tgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3186706 tgttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaata 3186805  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||| | ||||||| | ||||||| || ||| | ||||| || ||||||||| ||| ||     
T  3186806 ggc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaat 3186904  T
Q  205 accgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 268  Q
    ||| | ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3186905 acctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaat 3186968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 339
Target Start/End: Original strand, 39235158 - 39235407
Alignment:
Q  88 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagtt 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |     
T  39235158 aaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtcagatc 39235257  T
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcac 287  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| || | || |||||| ||     
T  39235258 aaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgatagaacat 39235357  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  39235358 tatgtcgtga-ttgatccatgtagccgac-cctcttagtaggataaggcttg 39235407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 19736929 - 19737254
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagt-gggggtagcacctatagtagtaaagttggtaga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  19736929 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtaga 19737028  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| |  | |||| |||| ||    
T  19737029 aaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggttga 19737127  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||||            |||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  ||| || | ||||||| | || |||||  | |||    
T  19737128 ggaagacc------------tagaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatt 19737215  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  19737216 tgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttg 19737254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 19757832 - 19758157
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagt-gggggtagcacctatagtagtaaagttggtaga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  19757832 gttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtaga 19757931  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||  || | ||| |||||||    
T  19757932 aaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggtaga 19758030  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    ||||||||            |||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||||||||  ||| || | ||||||||| || |||||  | |||    
T  19758031 ggaagacc------------tagaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatt 19758118  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  19758119 tgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttg 19758157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52156225 - 52156084
Alignment:
Q  209 aggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  52156225 aggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatg 52156126  T
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52156125 tagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 52156084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 26490250 - 26490596
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||  | | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26490250 gttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagag--ttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaa 26490347  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||  |  |||| || ||| ||||||||||||| || ||||| | |||  ||| | |||| || |    
T  26490348 aataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattagatgaggcagtg 26490447  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    |||||   || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| |||| |   |||||  | |||||||| ||||    
T  26490448 gaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatattatggcgtaattt 26490547  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||| ||| |||   ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26490548 gatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42510301 - 42510011
Alignment:
Q  63 gagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagt 162  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  || || | |||||||| |||||    
T  42510301 gagttgggatagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagt 42510204  T
Q  163 agatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    |||||| ||||||||||||||  | |  ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||     
T  42510203 agatcagatggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggac 42510104  T
Q  263 ccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    | |||| || | |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||  ||||||||| ||||    
T  42510103 caaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttgttg 42510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555323
Alignment:
Q  246 aggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  346 gttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||| ||||||||    
T  47555336 gttgttgttgttgt 47555323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 222 - 359
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262432
Alignment:
Q  222 gagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcac 321  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  322 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 53262432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27917505 - 27917745
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  27917505 gttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattaga--gaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagga 27917602  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| ||  ||  |||| |||||||||||||||| | |||  | | || |||||||     
T  27917603 aataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcagatcataataggtagac 27917702  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggattt 243  Q
    ||||||| |  |||||||| ||||| || | |||||| |||||    
T  27917703 gaagacctataaaaactataagagagacaactagaaaagattt 27917745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 54425304 - 54424959
Alignment:
Q  17 ggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggt 116  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| | |    
T  54425304 ggtaagaatagtcgggataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagat 54425206  T
Q  117 ttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag-------agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    |||  ||||||| ||||||||| | | ||| ||| ||||| ||       ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |    
T  54425205 ttgaacatgtagggagaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagaccta 54425106  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt------catttgat 303  Q
     |||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||  |||||| | |       |||||||    
T  54425105 agaaagctataagagggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgat 54425006  T
Q  304 ccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||| |||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  54425005 ccatctagctgaccccacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042219
Alignment:
Q  213 aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgt-atgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  49042181 ccgaccccacttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52679154 - 52678892
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagaaagagagtggggg--tagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgt 141  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||   ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  52679154 aatgacaccattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgt 52679055  T
Q  142 aaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggat 241  Q
    | ||||  ||||||||| | ||||||  |||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  || |||    
T  52679054 agatgt--tggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaacta--agagaaactattatgaaagat 52678959  T
Q  242 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| ||||  |||||| |  | ||| |||| ||||||||||||    
T  52678958 ttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 54365266 - 54364976
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga--agacccgtaaatgtcgtggtaaga 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||| ||    |  ||||     
T  54365266 agagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataagg 54365168  T
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||| | |||| ||    
T  54365167 agagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgtgt 54365068  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | || | |||| || | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  54365067 tagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccacac-tagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294120
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat---gtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||  ||| ||| |   |||||||||||| ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  168 aaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 267  Q
    | ||  |||| ||||  || |||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||     
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaag 30294204  T
Q  268 tttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgt 353  Q
    | |||| ||||||| | |||||||||   ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  30294203 tatgatttatgataaaacactatggc--aatttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgttatcgt 30294120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895871
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 7895871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311303
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || | | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 311321  T
Q  339 gattgttgttgtcgttgt 356  Q
    | |||||||||| |||||    
T  311320 ggttgttgttgttgttgt 311303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17022820 - 17022684
Alignment:
Q  202 aagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttg 301  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||  | ||||| |||||||     
T  17022820 aagacctaggaaagctattagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcattta 17022721  T
Q  302 atccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17022720 attcatgtagccgacctcatttagtgggataaggctt 17022684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 345056 - 344839
Alignment:
Q  5 tgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaata 104  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  345056 tgttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaata 344957  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaag 204  Q
    ||||||  | |||||| |||||||||||| |||| |||||| |  | ||||  || |||||||  ||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||    
T  344956 ggcttaagtagtttggtcatgtagagagaggacctgtaaattttttagtaatgagcgtagatcggatggaggatagtcagattacaagaggcagagaaag 344857  T
Q  205 accgaggaaaactattag 222  Q
    |   || |||||||||||    
T  344856 atgtagaaaaactattag 344839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 350
Target Start/End: Original strand, 15296060 - 15296189
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |  |||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||  ||    
T  15296060 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccca 15296159  T
Q  321 cttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15296160 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2133725 - 2133612
Alignment:
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggc 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  2133725 aggatgtagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggc 2133626  T
Q  337 ttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||    
T  2133625 ttggttgttgttgt 2133612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36820308 - 36820135
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||    
T  36820308 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattaga--gagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaa 36820211  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg 176  Q
    | ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| || ||   || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  36820210 actaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagattatgtagtaaggagggtagatcaaatagagg 36820135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162675
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  252 atgagttggat 262  Q
    |||||||||||    
T  19162685 atgagttggat 19162675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23534887 - 23534576
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag--gcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| ||||  |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||    
T  23534887 gataagattagaaatgacaatattagagagagt-tgggggtagcatttatagtaaaaaagatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtaga 23534789  T
Q  130 gagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaact 229  Q
    ||  ||||||||   |   || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |  | |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||||||    
T  23534788 ga--agacccgtgggttatgtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatcactagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaact 23534691  T
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    ||||| || || |||||| | |||||||||||    ||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||    
T  23534690 attaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgacctcactttgt-gg 23534592  T
Q  330 ataaggcttgattgtt 345  Q
    |||||||||| |||||    
T  23534591 ataaggcttggttgtt 23534576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 40273278 - 40273195
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  40273278 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttgttgttgtt 40273195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31566234 - 31566161
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31566234 tgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532240
Alignment:
Q  262 tccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca-tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48532240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 309
Target Start/End: Original strand, 21200550 - 21200787
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    |||||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||   |  ||||| ||||||||||    
T  21200550 ggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatc 21200647  T
Q  168 aaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaacta-ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 266  Q
    | ||||||  ||||||| | |  || || ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||  ||    
T  21200648 acatggagagtagtcaaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaa-gatctagatattaatgagttggatagaa 21200746  T
Q  267 atttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    || ||  |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  21200747 atatg--gtattatagagcattatggcgtcgtttgatgcatgt 21200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31454298 - 31454225
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31454298 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31454225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834600
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45834600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 49841544 - 49841895
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag---tgggg-----gtagcacctatagtagtaaagt 92  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||||  ||||||   |||||     |||||||||||| ||| ||||     
T  49841544 gttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagccgtagcacctatattagaaaaga 49841643  T
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaag 192  Q
    |||| |||| ||| || || |||||||||| ||||||||||||||    |  | |  | ||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||| |||  ||    
T  49841644 tggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagacattgacttctt-tagtaaggagagtaaatcagatgaagggtagtcaaattactag 49841742  T
Q  193 aggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatgg 292  Q
    |||||||||||||||   |||||  || |||||||||||||  || ||| || || | ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||    
T  49841743 aggtagaggaagacca--gaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatgg 49841840  T
Q  293 cgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    | | |||||||||||||||| |||  ||| ||| | | ||||||||| |||||||    
T  49841841 cataatttgatccatgtagctgaccccacatagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Original strand, 3987004 - 3987116
Alignment:
Q  25 tagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||   ||| || ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||    
T  3987004 tagacgggatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaat 3987103  T
Q  125 gtagagagaagac 137  Q
    |||||||||||||    
T  3987104 gtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116349
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggctt 40116350  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  40116349 g 40116349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 347
Target Start/End: Original strand, 41529978 - 41530040
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41529978 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842678
Alignment:
Q  69 gggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatca 168  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||   || ||||  |||||||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatca 41842693  T
Q  169 aatggaggatagtca 183  Q
    |||||||||||||||    
T  41842692 aatggaggatagtca 41842678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208900
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||||| || | ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  351 cgttgttgtt 360  Q
     |||||||||    
T  39208891 tgttgttgtt 39208900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45374549 - 45374468
Alignment:
Q  278 gatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45374549 gatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 45374468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 52927910 - 52927838
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  52927910 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttgttgttgtt 52927838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  255 agttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31337872 - 31337751
Alignment:
Q  2 ttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaa 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  31337872 ttgtgttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagttggg-tagcacctatagtagaaaagatggttgaaa 31337775  T
Q  102 ataggcttagatggtttgggcatg 125  Q
     ||||||||  ||||||| |||||    
T  31337774 ctaggcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||| | | |||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 46148235 - 46148310
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  46148235 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgt 46148310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46432014 - 46431684
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||| |||   | |||||||| | | | |||| ||||    | |||| | ||    
T  46432014 ttggatgtgtggtaagactagacaggatagggttagaaatgactacatcagatagac--ttggggtagcgcttcttgtagaaaagacaatggaaactcgg 46431917  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  || | ||| ||   || ||||| ||||||||| | |||||||||| |||| | |  ||||| |||| |        
T  46431916 cttaggtggtttgggcatgtagagag--gatctgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaggatactcaaatcactagaggcagagaa---- 46431823  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | || |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||  | || | || |||||| || || |  |||||| |||||||||    
T  46431822 ctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggatagagatattatatatgatggaacattgaggcgtcgtttgatcca 46431723  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgtt 345  Q
    ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46431722 tgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 46431684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 50249319 - 50249526
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggat---taggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaa 102  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||   ||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||| ||||     
T  50249319 gttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcgcgtatagtagaaaagatggtggaaac 50249418  T
Q  103 taggcttagatggt---ttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    ||| ||||| ||||   |||||||||||||| ||||||  ||| ||    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | |  |||||||||    
T  50249419 tagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtcatatcaccagaggtaga 50249518  T
Q  200 ggaagacc 207  Q
    ||||||||    
T  50249519 ggaagacc 50249526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Original strand, 27893213 - 27893359
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatg 291  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||| ||| |||||||    
T  27893213 gaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaacactatg 27893312  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    || |  |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27893313 gcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 27893359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 388337 - 388256
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  388337 tatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtcgttgttgttgt 388256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2341057 - 2340717
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||| || | || |||||||||||  | |||| |||| |||| ||||||       
T  2341057 ttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaaagatggtggaaaatcat 2340958  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||| |||| |  || ||   || ||    |||||||| ||||| |||| ||||||| | |  | || ||||| |||||    
T  2340957 cttacgtggtttgagcatgtagagaaaagatctatagattatgtagt---gagagtagagcaaatagagggtagtcaaatcactaaagctagagaaagac 2340861  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||| |||        |||| ||||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  2340860 ctaggaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtcggagagggtaatgatatatgatagaacattatggcgttgtttgatcca 2340761  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || |||| ||  |||||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  2340760 tgaagccaaccccacttagttgtataaggattggttgttgttgt 2340717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 11581436 - 11581609
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    |||||||  |||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||   || ||||||||    
T  11581436 agagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaagaag 11581535  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatta 233  Q
    |||| |||| ||| |||  |||||| | |  |||||||   ||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  11581536 agtacatcagatgtaggtgagtcaaatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactatta 11581609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21862803 - 21862742
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21862803 tatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541340
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgatt 342  Q
    |||||||| || | || |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttgatt 24541340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778609
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 136
Target Start/End: Original strand, 29600863 - 29600968
Alignment:
Q  32 gataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagag 130  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |  ||| | | |||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29600863 gatatgattagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagag 29600962  T
Q  131 agaaga 136  Q
    ||||||    
T  29600963 agaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 360
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991723
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| | |||| || | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T
Q  351 cgttgttgtt 360  Q
    ||||| ||||    
T  40991714 cgttgatgtt 40991723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45487000 - 45486849
Alignment:
Q  202 aagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatg---tatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||  || || || ||| | ||||| ||||| ||||||   |||   ||||||||| || |||||| | ||    
T  45487000 aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataat 45486901  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45486900 ttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 45486849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49933492 - 49933440
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49933492 tttggtccatgtagccgacctcacttagtgggataaagcttgattgttgttgt 49933440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 350
Target Start/End: Original strand, 29601063 - 29601174
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| |  | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  29601063 gatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacggctt 29601162  T
Q  339 gattgttgttgt 350  Q
    | || |||||||    
T  29601163 ggttcttgttgt 29601174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37083367 - 37083292
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37083367 tatgatcgaacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37083292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4472481 - 4472387
Alignment:
Q  256 gttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  4472481 gttggattcaaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagttcgataaagcttggttgttgttgt 4472387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 350
Target Start/End: Original strand, 11284120 - 11284270
Alignment:
Q  195 gtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcg 294  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||     ||| ||||| | ||||||||||||  |||| || | |||||| || || ||| ||     
T  11284120 gtagaggaagacctag-aaaactataagagaaactattaa----gatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgca 11284214  T
Q  295 tcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || |||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11284215 tcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggcttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 31146919 - 31146981
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31146919 tatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31146981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40116619 - 40116489
Alignment:
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcat 298  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||||| || | |||||| ||    
T  40116619 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattgtggcgtaat 40116520  T
Q  299 ttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    | |||| | |||||| || || |||||||||    
T  40116519 tcgatctacgtagccaacctcgcttagtggg 40116489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52882724 - 52882662
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  52882724 tatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 293 - 350
Target Start/End: Original strand, 7278689 - 7278746
Alignment:
Q  293 cgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  7278689 cgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 26990337 - 26990406
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26990337 gaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctagagatcaatgagttgga 26990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271910
Alignment:
Q  261 atccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||| |  ||||| ||||  ||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgt 33271910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 36304123 - 36304248
Alignment:
Q  225 aaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactta 324  Q
    |||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  36304123 aaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactca 36304222  T
Q  325 gtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     || || |||||| | ||||||||||    
T  36304223 atgtgacaaggctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 45236789 - 45236846
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattaga 58  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45236789 gttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattaga 45236846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Original strand, 29475811 - 29475968
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |  | |||||||||  |||||    
T  29475811 agaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattgtttatgatagaaaactat 29475908  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29475909 ggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataaggtttggttgttgttgt 29475968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  46 tgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagta-gtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattagaa-gagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 350
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512825
Alignment:
Q  302 atccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39512825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41230546 - 41230506
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41230546 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgttgttgt 41230506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  251 aatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||| || || | ||||||| | || |||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37227863 - 37227991
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| || |||||| |||| |||| |||  |||  |||    
T  37227863 gttgtgttggttgtgtggtaagactagacaatataggattagaaatgaccacattag--agagagttggagtagcagctatcgtagaaaaaatggcggaa 37227960  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagaga 131  Q
    | | ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  37227961 actcggcttaggtggtttctgcatgtagaga 37227991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40672429 - 40672378
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40672429 tatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttg 40672378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422837
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt------catttgatccatgtagccgacatcactt 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||  |||||| | |       ||||||||||| |||| |||  |||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccccactt 54422864  T
Q  324 agtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||    
T  54422863 agtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 348
Target Start/End: Original strand, 659755 - 659805
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  659755 tttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 26388414 - 26388540
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||    ||| |||||| ||| | ||||||||| | ||||| | | | ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26388414 gttgcgttggatgtgtggttagactagattatatatgattagaaattaaaccattagacatagagttgagatggcacctataatagaaaagatggtagaa 26388513  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgta 127  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||    
T  26388514 aataggtttaggtgatttgggcatgta 26388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31453025 - 31452963
Alignment:
Q  286 actatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31453025 actatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtt 31452963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454441
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgttggt-tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt-ggtggtttgtgcatgtagagagaaga 31454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307162
Alignment:
Q  9 ggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtag 86  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| || |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattag--agagagttggggtagcacctatagtag 33307162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 351
Target Start/End: Original strand, 35465758 - 35465812
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  35465758 atttgatccatgtagctgacctcacttaatgggataaggattggttgttgttgtc 35465812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 39535730 - 39535652
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||   ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  39535730 agagagttggggcaacacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagacc 39535652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45493829 - 45493695
Alignment:
Q  213 aaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagc 312  Q
    ||||||| | |||||||||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  || | |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  45493829 aaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattatggcgccattcaatccatgtagc 45493730  T
Q  313 cgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||  |||||||| |||||| || || |||||||    
T  45493729 cgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgt 45493695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Original strand, 38850034 - 38850091
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag 65  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38850034 tggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagagag 38850091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 20208218 - 20208286
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||    
T  20208218 tatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttgttgt 20208286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 29817437 - 29817565
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||| ||||  || ||| |||| ||||  ||||||||||||||   |||||| ||| | || |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  29817437 gttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaattggtgtagcacctatagtagaaaagattgtagaa 29817536  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    | || | |||| |||||||| ||||||||    
T  29817537 agtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34719233 - 34719081
Alignment:
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |   || ||||  | ||||| ||||||  | ||  ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  34719233 agaggaagacctagaaaaactataaaagaaactattaggacaaatctagaaattaatgatttggattgagatacgatatatgatagagcattatggcttc 34719134  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
     |||||| | ||| || |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34719133 gtttgattcttgtggctgaccccacttagggggataaggcttggttgttgttg 34719081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39782009 - 39781918
Alignment:
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||  | | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  39782009 tggatccaaatacggtttatgataga-cattatggcgtaatttgatcaatgtggccgaccccactcagtgggataaggcttgggtgttgttgt 39781918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249659
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgt 50249659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53214931 - 53214871
Alignment:
Q  290 tggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53214931 tggcgtaatttgatccatgcagccgaccccatttagtcggataaggcttggttgttgttgt 53214871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Original strand, 6988113 - 6988172
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  6988113 atagatcattatggcgtcatttgatcaatgtagccgactccttttagtgggataaggctt 6988172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37102879 - 37102808
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  37102879 atagagcgttatggtgtaatttgatccatgtagcctaccccacttcgtgggataaggcatgtttgttgttgt 37102808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37598250 - 37598171
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgaca-tcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| | ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37598250 tgatatatgatagaacattatggcgtcatttgactcatgtagtcaaccctcatttagtgggataaagcttgattgttgtt 37598171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Original strand, 44571523 - 44571590
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  44571523 gtaaggagagtagatcaaatggatgatagtcagattacaagaggtagaagaagatctagaaaaactat 44571590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 355
Target Start/End: Original strand, 3987551 - 3987621
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  3987551 cactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgttg 3987621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 347
Target Start/End: Original strand, 32170634 - 32170684
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  32170634 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37534483 - 37534429
Alignment:
Q  73 agcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 127  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37534483 agcaccgatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacctggtttgggcatgta 37534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 38054686 - 38054624
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag 63  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  38054686 gttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagag 38054624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39535480 - 39535391
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    |||| ||||||||| || ||||| | | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  39535480 tgatatatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaaccggcc-cacttagtgggataaagcatggttgttgttgttgttgttgtt 39535391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3870698 - 3870657
Alignment:
Q  96 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3870698 tagaaacttggcttagatggttttggcatgtagagagaagac 3870657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32052594 - 32052541
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  32052594 atttgattcatgtagccgacgtgacttagtgtgataaggtttggttgttgttgt 32052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46367467 - 46367390
Alignment:
Q  270 tgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  46367467 tgatatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Original strand, 48259955 - 48259996
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  48259955 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgctgttgtt 48259996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 49045023 - 49045120
Alignment:
Q  256 gttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgt 353  Q
    ||||||||||||| |  | ||||| ||| || ||||||   |||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  49045023 gttggatccaaatatagtttatgacagaacattatggccgaatttaatccatgtagccgaccccactcagtgggacaaggcttggttgttgtcgtcgt 49045120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 343
Target Start/End: Original strand, 53951985 - 53952030
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattg 343  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  53951985 tttgatccatatagccgaccccacatagtgggataaggcttgattg 53952030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 141)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 3866005 - 3866361
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3866005 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaa 3866104  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  3866105 aataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagag 3866204  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3866205 gaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcattt 3866304  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3866305 gatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 3866361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 8180713 - 8181060
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8180713 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8180812  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8180813 aataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagag 8180912  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  8180913 gaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcattt 8181012  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8181013 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 36183384 - 36183736
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36183384 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 36183483  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36183484 aataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 36183583  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  36183584 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccattt 36183683  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgt 353  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36183684 gatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgtcgt 36183736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38453038 - 38452686
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag----tgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38453038 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagttggt 38452939  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38452938 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggt 38452840  T
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||    
T  38452839 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacactatggtgtc 38452740  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38452739 attcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3244000 - 3243654
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  3244000 gttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaa 3243903  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3243902 aataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 3243803  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3243802 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 3243703  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3243702 gatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 12734634 - 12734991
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12734634 gttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaa 12734731  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagagg-taga 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12734732 aataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtaga 12734831  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||    
T  12734832 gggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatt 12734931  T
Q  300 tgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12734932 tgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 12734991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 38429817 - 38430171
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38429817 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaa 38429916  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  38429917 aataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagag 38430016  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  38430017 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 38430116  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  38430117 gatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttg-gtgttgttgttgttgt 38430171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 4807525 - 4807877
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag----tgggggtagcacctatagtagtaaagttggt 96  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4807525 gttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 4807624  T
Q  97 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggt 196  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4807625 agaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggt 4807723  T
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  4807724 agatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtc 4807823  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4807824 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 4807877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 60 - 350
Target Start/End: Original strand, 2610580 - 2610870
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2610580 agagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaagaag 2610679  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610680 agtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 2610779  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2610780 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 2610870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 89 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451642
Alignment:
Q  89 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagtta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  189 aaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcact 288  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  289 atggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgttgt 451642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 350
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834960
Alignment:
Q  39 ttaggaatgacaccattagaaagagag--tgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  137 cccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaa 236  Q
    || ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagga--gttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 25834946  T
Q  337 ttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||    
T  25834947 ttggttgttgttgt 25834960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45367966 - 45367620
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  45367966 tggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataacc 45367868  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  45367867 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagact 45367768  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45367767 caagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 45367668  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    || ||||||  |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||    
T  45367667 gtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttgttg 45367620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41197568 - 41197220
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41197568 gatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggctt 41197469  T
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagtt-aaaagaggtagaggaagaccg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||     
T  41197468 agatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagacct 41197369  T
Q  209 aggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    | |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41197368 aagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatg 41197269  T
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||| ||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41197268 tagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 41197220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11992448 - 11992108
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11992448 tggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattaga--gagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagc 11992351  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  11992350 ttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacc 11992251  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11992250 taagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccat 11992151  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11992150 gtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41763383 - 41763043
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41763383 tggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggg-taacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 41763285  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41763284 ttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacc 41763185  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  41763184 taagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttgatccat 41763086  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41763085 gtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326160
Alignment:
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  310 agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7326200 agccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 7326160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18424716 - 18424378
Alignment:
Q  9 ggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggct 108  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18424716 ggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattaga--gagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 18424619  T
Q  109 tagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccg 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||      
T  18424618 tagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacat 18424519  T
Q  209 aggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18424518 aggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatg 18424419  T
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || ||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18424418 ta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 139 - 350
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508960
Alignment:
Q  139 cgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaag 238  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  339 gattgttgttgt 350  Q
    | ||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgt 28508960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583631
Alignment:
Q  75 cacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgga 174  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  175 ggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttga-- 272  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  273 tgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | | ||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||  |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgt 24583631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 348
Target Start/End: Original strand, 23997557 - 23997882
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |   || |||||||||||||| |    
T  23997557 tggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatagaa---aatttggtagaaaatagcc 23997653  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  23997654 ttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtggaagaagacc 23997753  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     | ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| | ||||||||||| ||||||| |||    
T  23997754 taaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttgattcat 23997841  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||| |||||  |||||| |  |||||| ||||||| |||||    
T  23997842 gtatccgaccccacttattcagataagacttgattattgtt 23997882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 185 - 350
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643230
Alignment:
Q  185 gttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagag 284  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 35643230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6238096 - 6237753
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagta--gtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | | ||||||||   ||||||||| |  |  |  |||||||||||||| |     
T  6238096 tggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatggga-gagagtggacatagcacctaaaaaaaagataagttggtagaaaacat 6237998  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||| ||||    
T  6237997 gcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaagaggtagagtaaga 6237898  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || || |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |  | ||||||||| ||||||||  | ||||||||     
T  6237897 cctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatgggatgatttgatct 6237798  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    || ||| ||||  |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  6237797 atatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgt 6237753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 350
Target Start/End: Original strand, 12141539 - 12141826
Alignment:
Q  63 gagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagt 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||    | ||||| |||||    
T  12141539 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagt 12141638  T
Q  163 agatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 262  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||||    
T  12141639 agatcagattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggat 12141738  T
Q  263 ccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| || | ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12141739 ccaaatatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgt 12141826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 125 - 348
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029867
Alignment:
Q  125 gtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagag 224  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  225 aaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca------tgtagccgacat 318  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||||      ||||||||||      
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 39029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9556717 - 9556369
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||| ||| | ||| |||    
T  9556717 gttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat-ggtggaa 9556619  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||   || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||  ||||| | ||    
T  9556618 aataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactagaggcaaag 9556519  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcattt 300  Q
    |||||||  | |||||||| ||| |||||||||  || ||| ||| | | ||||||||||||| | || || | ||||||||| || || || || ||||    
T  9556518 gaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggtgtaattt 9556419  T
Q  301 gatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9556418 gatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgt 9556369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 38434890 - 38435234
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  || | |||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||     
T  38434890 ttggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaga 38434989  T
Q  107 cttaga-tggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    ||| |  ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||   | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |  ||||| ||||| |||    
T  38434990 ctttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtaga 38435089  T
Q  206 ccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcc 305  Q
    || || |||||||  |||||||||||||  || ||| ||||| | |||| |||||||| ||||||| | |||||| || || |||||||| |||||||||    
T  38435090 cctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatcc 38435189  T
Q  306 atgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38435190 atgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43752293 - 43751938
Alignment:
Q  4 gtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaat 103  Q
    |||||||||| | ||||| || |||  ||||| |||||| | ||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43752293 gtgttggatgtgcggtaaaaccagatgggataagattagaactgaccatattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaat 43752194  T
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaa 203  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  || ||   || ||| | ||||||||||| |||||||||| |||  | |   |||| | |||||    
T  43752193 aggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaa 43752094  T
Q  204 gaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgat 303  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||  || ||||||||||| |||||||  || |||||||    
T  43752093 gacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgat 43751994  T
Q  304 ccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||   |||||||||| ||||||||    
T  43751993 ccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttgttgttgt 43751938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 350
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959803
Alignment:
Q  172 ggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 271  Q
    |||||| ||||| || ||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 31959724  T
Q  272 atgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31959725 gtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 237 - 356
Target Start/End: Original strand, 227358 - 227477
Alignment:
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  227358 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 227457  T
Q  337 ttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  227458 ttggttgttgttgttgttgt 227477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306323
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 30306293  T
Q  330 ataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30306294 ataaggcttggttgttgttgttgttattgt 30306323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 349
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959192
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg----gcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagta 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||| | |  | | || ||||| ||||||    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  164 gatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 263  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |  ||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||| || || || || ||| | |||||||||||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  264 caaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
     |||| || | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18959107 aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  188 aaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcac 287  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38328488 - 38328364
Alignment:
Q  230 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtggg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38328488 attagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 38328391  T
Q  330 ataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    
T  38328390 ataaggcttggttgttgttgttgttgt 38328364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16097332 - 16097198
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagag----agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16097332 tggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaat 16097233  T
Q  104 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16097232 aggcttagatgatttggacatgtagagagaagacc 16097198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 248 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635313
Alignment:
Q  248 gtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  348 tgtcgttgttgtt 360  Q
    ||| |||||||||    
T  3635325 tgttgttgttgtt 3635313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573125
Alignment:
Q  192 gaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatg 291  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  292 gcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttg 43573125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12882197 - 12882038
Alignment:
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtca 297  Q
    |||||||||| |  ||| |||| |||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||| || | |||||| |    
T  12882197 gaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaa 12882098  T
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12882097 tttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgtt 12882038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9996766 - 9996623
Alignment:
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  | ||||||||| | |||||||||||||    
T  9996766 ggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgt 9996667  T
Q  310 agccgacatcactt---agtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||  |||||   || ||||||||||||| ||||||||||    
T  9996666 agccgaccccacttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 350
Target Start/End: Original strand, 9496014 - 9496148
Alignment:
Q  216 ctattagagaaactatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccg 314  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  9496014 ctataagagaaactattcagaaa-gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcca 9496112  T
Q  315 acatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9496113 accccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 9496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4598913 - 4598573
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg--ggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||   ||||||  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4598913 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtag 4598814  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtag 198  Q
    ||| ||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||||  || ||| | || ||||| | |  |||| |||||||||  ||||| || |  ||||||||    
T  4598813 aaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgtgaattttgtagtaagtataacagataaaatggaggggagtcaggtcactagaggtag 4598714  T
Q  199 aggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca-aatttgatgtatgatagagcactatggcgtca 297  Q
     || | ||| || ||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  | ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  4598713 tggtaaacctagaaaaactatacgagaagctattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatagat-tttgatagaacactatggcgtca 4598615  T
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  4598614 tttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttg 4598573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238305
Alignment:
Q  64 agtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagacc 43238305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481618
Alignment:
Q  37 gattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||  |||| |||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 37481831  T
Q  137 cccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaa 236  Q
    |  || ||| | || || || ||||||||||| |||||||  ||| |  | |   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |    
T  37481830 cttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaaga 37481731  T
Q  237 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggc 336  Q
    | ||| ||| | | ||||||||||||  |||| || | | |||||||  | ||||| ||| |||||| ||| ||| ||||  ||| |||| |||||||||    
T  37481730 aagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccccacgtagtcggataaggc 37481631  T
Q  337 ttgattgttgttg 349  Q
     || |||||||||    
T  37481630 gtggttgttgttg 37481618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 7825291 - 7825429
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg--ggggtagcacctatagtagtaaagttggtag 98  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||  ||||      
T  7825291 gttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagtagcacctatagttgtaaatatggtga 7825390  T
Q  99 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7825391 aaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 7825429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 350
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543517
Alignment:
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||   || || || |||||||||||||||||||  |||||  | |  |||||||| || ||||    
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||| | |||||||||  |||||| ||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattca 42543473  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42543474 tgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42543517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12475009 - 12474927
Alignment:
Q  268 tttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12475009 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 346
Target Start/End: Original strand, 41545372 - 41545683
Alignment:
Q  34 taggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaa-gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 132  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||    
T  41545372 taggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaag 41545471  T
Q  133 aagac-ccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactat 231  Q
    ||| | | ||| ||||||| ||   ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||     |||||| | || |||||||| |||||||| ||    
T  41545472 aagtctctgtagatgtcgttgt---aagagtatatcagatggaggattgtcaagccaaaagagacgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccat 41545568  T
Q  232 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggat 331  Q
    || ||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| || | ||||||||| ||||||| | | |||||||  || |||||||  ||||||| || |||    
T  41545569 tataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcacttaatgagat 41545668  T
Q  332 aaggcttgattgttg 346  Q
    ||  | |||||||||    
T  41545669 aatacatgattgttg 41545683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35755439 - 35755247
Alignment:
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatga---- 255  Q
    |||| |||| |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| || || |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||| |        
T  35755439 agtacatcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgg 35755340  T
Q  256 gttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| || | || ||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35755339 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 35755247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 348
Target Start/End: Original strand, 13149326 - 13149612
Alignment:
Q  63 gagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagt 162  Q
    |||| |||||||||||||||   | |||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||  || |   |||||||    
T  13149326 gagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctcgaagagt 13149425  T
Q  163 agatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggt-agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
    |||| | |||||||| |||||  | | |||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |    
T  13149426 agataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaa 13149525  T
Q  262 tccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| |  |  |||||||| || |||| | | ||||||||||| |||||||  ||| ||| || |||||| |||| ||||||||    
T  13149526 tccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437711
Alignment:
Q  66 tgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtaga 165  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||  ||   ||  |||| ||  ||||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtataga 44437906  T
Q  166 tcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 265  Q
    | | |||||||  |||||  | |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||   |    
T  44437905 tgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaa 44437806  T
Q  266 aatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||  || | | ||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  44437805 aacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttcttgtt 44437711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 42092458 - 42092796
Alignment:
Q  7 ttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||||  |||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| || |    
T  42092458 ttggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttaga--gagagttggggtagcgcctatactagaaaagatggtagaaactaag 42092555  T
Q  107 cttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 206  Q
     |||| || | |||||||||||||||||| |  ||| || | || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| | |  | ||  | ||| ||||    
T  42092556 attaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagggtagtcaattcactatagagacaggtagac 42092655  T
Q  207 cgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatcca 306  Q
    | || ||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||| ||||||||    ||  ||| |||||||||| | | ||||||  |||||||||    
T  42092656 ctagaaaaactataggagaaactattaaaaaagatgtagagattaattagttggatagtgatacgatatatgatagaggattgtggcgttgtttgatcca 42092755  T
Q  307 tgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||| |||   ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  42092756 tgtagctgaccctacttagtaggattaggcttggttgttgt 42092796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670756
Alignment:
Q  280 tagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 17670756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 348
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671048
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||  || ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||  |  ||    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataat 26670990  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    || || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| || |||||    
T  26670991 ggtgtaatttgatccatgtagccgacactgcttagtgggataagacttggttattgtt 26671048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Original strand, 33504313 - 33504502
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtc-aatgag 256  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  | |  ||||| |||| || ||| || |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| |  ||| ||    
T  33504313 agagtagatcagatggagggtagtcagatcactagaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataag 33504412  T
Q  257 ttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||||  |||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33504413 ttggattgaaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  253 tgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 65
Target Start/End: Original strand, 2610466 - 2610525
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagag 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2610466 gttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12520137 - 12520062
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12520137 tatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12520062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 121
Target Start/End: Original strand, 30743565 - 30743675
Alignment:
Q  10 gatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||  ||    
T  30743565 gatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagt-ggggtagcacttatggtagaaaaattggtagaaattagaatt 30743663  T
Q  110 agatggtttggg 121  Q
    ||||||||||||    
T  30743664 agatggtttggg 30743675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13444098 - 13443920
Alignment:
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||  || ||| |||| ||||||| ||||  |||   ||||||  | |||||| ||    
T  13444098 agtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaattattgaaaaaattttagatattaatgagatg 13443999  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    |  |||||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  13443998 ggcccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggctt 13443920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19337193 - 19337069
Alignment:
Q  6 gttggatgagtggtaagact-agacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaata 104  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19337193 gttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattaga--gagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtggaaaata 19337096  T
Q  105 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 135  Q
     |||||    | |||||||||||||||||||    
T  19337095 agctta----ggttgggcatgtagagagaag 19337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7432042 - 7431889
Alignment:
Q  197 agaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtc 296  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| || | ||| ||||| ||  |||| |||    
T  7432042 agaggaaaacctagaaaaactattggagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgaataaaaatatggtatataatagatcataatggtgtc 7431943  T
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  7431942 atttgatccatgcaaccgacctcacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7431889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8197670 - 8197541
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||||||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  8197670 agagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgacccta 8197571  T
Q  321 cttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8197570 cttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8197541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8202430 - 8202301
Alignment:
Q  221 agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatca 320  Q
    |||||||||||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  8202430 agagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgacccta 8202331  T
Q  321 cttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8202330 cttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8202301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 355
Target Start/End: Original strand, 11412697 - 11412997
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaa 143  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| | |||     
T  11412697 aatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtag 11412796  T
Q  144 atgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgga-ggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatt 242  Q
    ||   || |||   ||||||||||| ||||| || ||||||  | |  ||||  ||||||| ||| || |||||||||||           |||||   |    
T  11412797 attctgtagta--gagagtagatcagatggaggggtagtcagatcactagagccagaggaaaacctagaaaaactattag-----------gaaag--at 11412881  T
Q  243 tagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatga---tagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||   |||| || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  11412882 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttg 11412981  T
Q  340 attgttgttgtcgttg 355  Q
     |||||||||| ||||    
T  11412982 gttgttgttgtggttg 11412997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 356
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384757
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttgttgt 25384757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 350
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743811
Alignment:
Q  225 aaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactta 324  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||||||||| || || |||  |||||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  325 gtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgt 30743811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 357
Target Start/End: Original strand, 43832091 - 43832387
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaag 159  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  |||  || | |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  ||  ||   || || || ||    
T  43832091 agagagttggggtatcacctatagtaaaaaatatg-tggaaactaggcttaggtgatttgggcatgtacagagaaaacatgtggattatgtagttaggag 43832189  T
Q  160 agtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 259  Q
    ||||||||| ||||||  || |||| | |  ||| | ||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||    
T  43832190 agtagatcagatggagagtaatcaaatcagtagacgcagaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttg 43832289  T
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    |||    || |||||||| ||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43832290 gataaggatatgatgtattatagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttgttgtt 43832387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531600
Alignment:
Q  262 tccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| || | |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9531600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13592645 - 13592411
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | | ||||  ||||| |||||| |||| || ||||  |  || ||| |||||||||||||||||| ||||  | || |||    
T  13592645 gttgtgttggatgtgtggtgatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagta-taaatattgtggaa 13592547  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    |||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||| || |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||| ||    
T  13592546 aatagt-ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttcaagaggtatag 13592448  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaa 237  Q
    ||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||    
T  13592447 gaagacctagaagaactataagagaaactatcagaaa 13592411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12489949 - 12489802
Alignment:
Q  203 agaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttga 302  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||| | |||| ||||||| |||||    
T  12489949 agacctagaaaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttga 12489850  T
Q  303 tccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12489849 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12489802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13241065 - 13240958
Alignment:
Q  30 aggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 129  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | || ||||||  |||  ||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13241065 aggataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaga 13240966  T
Q  130 gagaagac 137  Q
    ||||||||    
T  13240965 gagaagac 13240958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Original strand, 11017304 - 11017422
Alignment:
Q  58 aaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaaga 157  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | || |||| | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || | || || |||    
T  11017304 aaagagagttgaggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagagaagacccgtagattttgtagttaga 11017403  T
Q  158 agagtagatcaaatggagg 176  Q
    || ||||||||||||||||    
T  11017404 agggtagatcaaatggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 360
Target Start/End: Original strand, 3481144 - 3481446
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatc 167  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||   || | ||| ||||||||||    
T  3481144 ggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatc 3481240  T
Q  168 aaatggaggatagtca-------agttaaa-----agaggtagaggaagaccgaggaaaactatt-agagaaactattagaaaggatttagaggtcaatg 254  Q
    | ||||||||||||||       ||| | |     ||||| ||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||| || ||||| ||  | ||      
T  3481241 agatggaggatagtcagatggacagtcagatcactagaggaagaggaagacctagaaaaaaaaatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaaca 3481340  T
Q  255 agttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgtt 354  Q
    |||||||   |||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||    
T  3481341 agttggacagaaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgtt 3481440  T
Q  355 gttgtt 360  Q
    | ||||    
T  3481441 gctgtt 3481446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9579050 - 9578872
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||   |||||  |||||| |||||  ||| ||||||||||||| || |  ||    
T  9579050 gttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgacaatgttaga--gagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgtaa 9578953  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagt 181  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  9578952 aatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtaaattttgtattaagtagagtagattaaatgaatgatagt 9578872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19235176 - 19234996
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactatt-agaaaggatttagaggtcaatgag 256  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| | |  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||     
T  19235176 agagtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaa-gatctagagattaatgat 19235078  T
Q  257 ttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||  |||| || | | ||||||| || | || |||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  19235077 ttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataaggctt 19234996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28960350 - 28960201
Alignment:
Q  212 aaaactatta-gagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||| | |||||||||||   | || || | | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  28960350 aaaactattaagagaaactgttaagaaggatctagagataaatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgta 28960251  T
Q  311 gccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28960250 gtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtttttgttgtt 28960201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19337004 - 19336896
Alignment:
Q  239 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggctt 338  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||| ||||    
T  19337004 gatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaagctt 19336905  T
Q  339 gattgttgt 347  Q
    | |||||||    
T  19336904 ggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23714607 - 23714384
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||     ||||||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  23714607 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagag---ttgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaa 23714511  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||  ||  ||   || ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | |  ||| |||||     
T  23714510 actagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatcactagacgtagat 23714411  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaa 227  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||    
T  23714410 gaagacttagaaaaactataagagaaa 23714384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24102279 - 24102056
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||     ||||||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  24102279 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagag---ttgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaa 24102183  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 200  Q
    | ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||  ||  ||   || ||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | |  ||| |||||     
T  24102182 actagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaatcactagacgtagat 24102083  T
Q  201 gaagaccgaggaaaactattagagaaa 227  Q
    ||||||  || |||||||| |||||||    
T  24102082 gaagacttagaaaaactataagagaaa 24102056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 40759049 - 40759169
Alignment:
Q  18 gtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagaga-gtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggt 116  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| |||  |||| |||| |||  |||| ||||    
T  40759049 gtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggt 40759148  T
Q  117 ttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  40759149 ttgtgcatgtagagagaagac 40759169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Original strand, 19855585 - 19855744
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  || | |||||||||||| |||    
T  19855585 agaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 19855684  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  19855685 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgttgt 19855744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10516811 - 10516749
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10516811 tatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 359
Target Start/End: Original strand, 15025703 - 15025785
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15025703 tgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgttgt 15025785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287703
Alignment:
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||  | |||||||| |||| |||| || | ||||||||| || |||| | |    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
      |||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgt 33287703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35704269 - 35704216
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35704269 atttgattcatgtagccgacatcatttagtgggataagacttgattgttgttgt 35704216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Original strand, 38860158 - 38860243
Alignment:
Q  53 attagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacc 138  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  38860158 attagatagagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacc 38860243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5759187 - 5758995
Alignment:
Q  158 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 257  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||| | |  |||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||| |||||||||    
T  5759187 agagtagatcagatggaggggaatcaaatcactagaggtagggaaatacctagaaaaactattagagaaactaccaagaaggatctagagatcaatgagt 5759088  T
Q  258 tggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||   | |  || | | ||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5759087 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 350
Target Start/End: Original strand, 6218961 - 6219247
Alignment:
Q  62 agagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagag 161  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||| ||   || ||||| ||||    
T  6218961 agagttggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagag 6219060  T
Q  162 tagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 261  Q
      ||||||||||||||||||    | |   |||| |||| ||||||   |||| |||| | | |||| ||||| || ||||||||| | | |||||||||    
T  6219061 gtgatcaaatggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttagaaa-ctataatataaac-attaggaaagatttagagattagtgagttgga 6219158  T
Q  262 tccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     | |||| || | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  6219159 ccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttggataaggcttggttgttattgt 6219247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626360
Alignment:
Q  280 tagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 17626360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 316
Target Start/End: Original strand, 21834638 - 21834802
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||| ||  ||| |||||||| || |||| | || |||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| || | |    
T  21834638 gtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatagaaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttatagatta 21834737  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgac 316  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||| | |  |||| ||||||||| ||||    
T  21834738 atgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcgac 21834802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 19863441 - 19863516
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19863441 tatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19863516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 19867773 - 19867848
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19867773 tatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19867848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 19872674 - 19872749
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19872674 tatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470146
Alignment:
Q  194 ggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggc 293  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||   ||||||||| || |||||     
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  294 gtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggct 337  Q
    ||  |||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggct 37470146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Original strand, 227307 - 227360
Alignment:
Q  53 attagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatagg 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  227307 attagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatagg 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26784592 - 26784351
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggta 197  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||   ||  || | || ||||| || |||||| | ||||||| ||||||| | |  ||||| |    
T  26784592 gaaactaggcttaggttgtttgtgcatttagagagaagatatgtggattttgtagtaaggagggtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggca 26784493  T
Q  198 gaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtca 297  Q
    ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| || | ||||||| | || | |||  | |    
T  26784492 gagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgataaaacattttggtttaa 26784393  T
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||    
T  26784392 tttgatccatgtagccaatctcacttagtaggataagacttg 26784351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3720490 - 3720426
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  3720490 tatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggagaaggcttg 3720426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 348
Target Start/End: Original strand, 522446 - 522509
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  522446 cactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12882322 - 12882267
Alignment:
Q  68 ggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 123  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12882322 ggggcagcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggca 12882267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Original strand, 17429257 - 17429332
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||| | | ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17429257 tatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 348
Target Start/End: Original strand, 20900554 - 20900625
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    |||||||| | |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20900554 tgatagagtattatgacgtagtttgatccatgtagccgacctcacttaattagataaggcttgattgttgtt 20900625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42549912 - 42549837
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42549912 tatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 42549837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 136
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907748
Alignment:
Q  98 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaaga 907748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 14444889 - 14444951
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14444889 tatggcgtactttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14444951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775840
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttgttg 15775840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29968682 - 29968624
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggct 337  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29968682 atagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgactccacttagtgggataaggct 29968624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 205
Target Start/End: Original strand, 32443668 - 32443802
Alignment:
Q  71 gtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaa 170  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||| ||  ||| |||| || ||| ||||||| ||| | |    
T  32443668 gtagcacctataaaaggaaatatgatagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataaga 32443767  T
Q  171 tggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 205  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  32443768 tggaggatagtcagattaaaagaggtagtggaaga 32443802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 887138 - 887065
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataa-ggcttgattgttgttg 349  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  887138 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394630
Alignment:
Q  241 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttga 340  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||  ||||| || ||||||| |||      
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataagactttg 9394640  T
Q  341 ttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||    
T  9394639 ttgttgttgt 9394630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12470962 - 12470897
Alignment:
Q  285 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12470962 cactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgt 12470897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 326
Target Start/End: Original strand, 19224922 - 19225039
Alignment:
Q  209 aggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||  | | ||| |||||| || ||  ||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  19224922 aggaaaactatatgagaaactattacgaaagatttagatattattgaattggatacatatacgatatatgatagaacactatgatgtcgtttgatccatg 19225021  T
Q  309 tagccgacatcacttagt 326  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  19225022 tagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Original strand, 34931639 - 34931712
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34931639 tatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 359
Target Start/End: Original strand, 7615476 - 7615560
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgt 359  Q
    ||||||| | || |||| ||||||||||||| | || |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  7615476 tatgataaaacattatgtcgtcatttgatccgtctatccgataccaattagtgggataaggcctgattgttgttgatgttgttgt 7615560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 357
Target Start/End: Original strand, 15015154 - 15015234
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  15015154 tgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttgttgtt 15015234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 18188716 - 18188848
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||| || ||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||| |  ||| |||| |||| |||    
T  18188716 gttgtgttggatgtgtg-taaggctagacgggatatgatcagaaatgacaacattgga--gagagttggggtagcacctcttctagaaaagatggtggaa 18188812  T
Q  101 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
      | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18188813 gctcgacttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 18188848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 137
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  81 tagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    |||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 624738 - 624687
Alignment:
Q  298 tttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  624738 tttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 786783 - 786885
Alignment:
Q  21 agactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg 120  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||     
T  786783 agaccagacgggataggattagaaatggcaacattacaatgagagttgaagtagcacctatagtagaaaagatggcagaaactagacttag-tggtttga 786881  T
Q  121 gcat 124  Q
    ||||    
T  786882 gcat 786885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2515233 - 2515170
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtc 351  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2515233 tatggcgtactttgatctatctagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgtcgttgtc 2515170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 347
Target Start/End: Original strand, 11414571 - 11414610
Alignment:
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11414571 gtagccgacaccacttagtgggataaggcttggttgttgt 11414610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 283
Target Start/End: Original strand, 17581543 - 17581674
Alignment:
Q  152 gtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtca 251  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||  |||||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||||  || |||||| |  |      
T  17581543 gtaagaaaagtatatcaaatagaggatagtcatattttaagaggtatagaaagacctagaaaaactataagagagactattacgaaagatttacatattt 17581642  T
Q  252 atgagttggatccaaatttgatgtatgataga 283  Q
    |||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgataga 17581674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19334225 - 19334174
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgg 328  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19334225 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccacttagtgg 19334174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32364998 - 32364923
Alignment:
Q  273 tgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  32364998 tgtatgatagaacattatggtgtaatttgatcaatgtagctgacctcacttaataggaaaaggcttggttgttgtt 32364923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 186185 - 186135
Alignment:
Q  297 atttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  186185 atttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560798
Alignment:
Q  304 ccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttgttgttg 8560798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12026262 - 12026172
Alignment:
Q  93 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || | ||  |||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  12026262 tggtggaaactaggcttaggtggtttgaccatgtagagagaagacctgtagattttgtactaaggagagtagatcagatggtgggtagtca 12026172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 13149246 - 13149300
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatt 55  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13149246 gttgtgttggacaagtggtaagactaaaagggataagattaggaatgacaccatt 13149300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197375
Alignment:
Q  76 acctatagtagtaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagac 137  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagac 14197375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32365111 - 32365081
Alignment:
Q  153 taagaagagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32365111 taagaagagtagatcaaatggaggatagtca 32365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 36993755 - 36993816
Alignment:
Q  288 tatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36993755 tatgacgtaatttgatccatgtagcctacca-acttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 41330121 - 41330195
Alignment:
Q  60 agagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 134  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41330121 agagagttgaggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 183
Target Start/End: Original strand, 45077800 - 45077870
Alignment:
Q  113 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 183  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||| || | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45077800 tggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtca 45077870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 451971 - 451930
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattag 42  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  451971 gttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattag 451930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2073348 - 2073307
Alignment:
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2073348 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2073307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10403934 - 10403893
Alignment:
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10403934 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10403893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 360
Target Start/End: Original strand, 13188393 - 13188434
Alignment:
Q  319 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttgtt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  13188393 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgctgtt 13188434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 19024150 - 19024239
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 127  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||| | | |||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  19024150 attagaaatgacaacattagagagagggtttgggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 23354105 - 23354158
Alignment:
Q  294 gtcatttgatccatgtagccga-catcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23354105 gtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaagattgattgttg 23354158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23915768 - 23915727
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgac 316  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23915768 tatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccgac 23915727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 347
Target Start/End: Original strand, 45077915 - 45078008
Alignment:
Q  254 gagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||||||||| |||| |  | ||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45077915 gagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 948
Alignment:
Q  25 tagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattaga--gagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccat 1174  T
Q  125 gtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagag 224  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1173 gtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 1074  T
Q  225 aaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcactta 324  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||    
T  1073 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccattta 974  T
Q  325 gtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  973 gtgggataaggcttggttgttgttgt 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 82661 - 83000
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  82661 tggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggc 82760  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || || |||  || |||||||| ||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||    
T  82761 ttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagacc 82858  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  82859 taggaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccat 82957  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  82958 gtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48119
Alignment:
Q  259 ggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgt 347  Q
    |||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggattaggcttagttgttgt 48119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4621 - 4275
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtg-ggggtagcacctatagtagtaaagttggtaga 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  4621 gttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaa 4522  T
Q  100 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtaga 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||      
T  4521 aaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagttaaaagaggta-- 4424  T
Q  200 ggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatt 299  Q
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  4423 --------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacactatgacgttatt 4332  T
Q  300 tgatccatgtagccga-catcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    |||||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  4331 tgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttgttg 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 86949 - 86609
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | | | || |   | ||||| |||||||||||||||||| |    
T  86949 tggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagag-ag-agagagagtagaaaagttggtagaaaatagtc 86852  T
Q  108 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 207  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  86851 ttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagatggagacc 86752  T
Q  208 gaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccat 307  Q
     ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  86751 taggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacactatgacgtaatttgatccat 86652  T
Q  308 gtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||| || |  |||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  86651 gtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgt 86609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11549
Alignment:
Q  110 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| ||| |    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  210 ggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgt 309  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttg--gtttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  310 agccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgt 11549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11940 - 11810
Alignment:
Q  8 tggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagaga--gtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaatag 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11940 tggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 11841  T
Q  106 gcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11840 gcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25532
Alignment:
Q  196 tagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgt 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  296 catttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25794 - 25683
Alignment:
Q  1 gttgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25794 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 25695  T
Q  101 aataggcttaga 112  Q
    ||||||||||||    
T  25694 aataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Original strand, 16689 - 16860
Alignment:
Q  179 agtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatg 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||    
T  16689 agtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttg 16788  T
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16789 atagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 218 - 350
Target Start/End: Original strand, 481 - 613
Alignment:
Q  218 attagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgaca 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 580  T
Q  318 tcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  581 ccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 350
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4918
Alignment:
Q  138 ccgtaaatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaa 237  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  238 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggct 337  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgct 4905  T
Q  338 tgattgttgttgt 350  Q
    || ||||||||||    
T  4906 tggttgttgttgt 4918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7720
Alignment:
Q  47 gacaccattagaaagagagtgggggtagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatg 146  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||| || ||||  |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||    
T  7422 gacaccattaga--gagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatg 7519  T
Q  147 tcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttaga 246  Q
    || |  ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||| |  |  |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||    
T  7520 tcttcataagaagagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaagag-tgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcaga 7618  T
Q  247 ggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttg 346  Q
    ||||| | |||||||| ||||| || |  | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7619 ggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccatctccacttagtgggataaagcttggttgttg 7718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28883
Alignment:
Q  260 gatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgttgt 28883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 356
Target Start/End: Original strand, 14724 - 14871
Alignment:
Q  209 aggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatg 308  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  14724 aggaaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatg 14823  T
Q  309 tagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgt 356  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||    
T  14824 tagccaaccccacgtagtgggataaatcttggttgttgttgttgttgt 14871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58226
Alignment:
Q  191 agaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactat 290  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||  | || ||| ||||||||||||| | | || || | ||||||||| || |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  291 ggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgt 58226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 160462 - 160325
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||| |||  | |||||||| || | |||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  160462 aaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtag 160363  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttg 349  Q
    || ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  160362 ccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  72 tagcacctatagtagtaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 136  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 99349 - 99286
Alignment:
Q  287 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 350  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  99349 ctatggtgtcgtttgaatcatgtagccgacaccacatagtgggataaggcttggttgttgttgt 99286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1657 - 1514
Alignment:
Q  212 aaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtag 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  |   || | |  |||||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  1657 aaaactataagagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtag 1561  T
Q  312 ccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgttg 358  Q
    | |||  |||||| |  ||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  1560 ctgaccccacttattaagataaagcttggttgttgttgttgttgttg 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6847 - 6783
Alignment:
Q  275 tatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttg 339  Q
    ||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  6847 tatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttg 6783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3726
Alignment:
Q  279 atagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttgtt 357  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgtcgttattgttgtt 3726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  262 tccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgtt 348  Q
    ||||||| || | ||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 163267 - 163189
Alignment:
Q  277 tgatagagcactatggcgtcatttgatccatgtagccgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgtcgttg 355  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  163267 tgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccgactccatttagtggaataaaacttgattgttgttgttgttg 163189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 39480 - 39561
Alignment:
Q  229 tattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagagcactatggcgtcatttgatccatgta 310  Q
    |||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||    
T  39480 tattaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University