View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16454_high_3 (Length: 347)

Name: NF16454_high_3
Description: NF16454
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16454_high_3
NF16454_high_3
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (2-327)||(20394604-20394929)
chr8 (2-335)||(22375924-22376257)
chr8 (2-335)||(23887001-23887338)
chr8 (2-327)||(22246904-22247229)
chr8 (103-327)||(22988715-22988939)
chr8 (2-326)||(22422363-22422687)
chr8 (2-326)||(18858563-18858887)
chr8 (2-327)||(23652026-23652351)
chr8 (2-335)||(21920219-21920552)
chr8 (2-326)||(22118646-22118970)
chr8 (2-326)||(22127430-22127754)
chr8 (12-326)||(20016744-20017058)
chr8 (2-326)||(30311615-30311939)
chr8 (2-335)||(23656904-23657237)
chr8 (2-322)||(17672494-17672814)
chr8 (2-326)||(22131512-22131836)
chr8 (10-335)||(22052840-22053165)
chr8 (75-335)||(21252921-21253181)
chr8 (10-335)||(21927404-21927730)
chr8 (89-335)||(29301984-29302230)
chr8 (75-328)||(21392405-21392658)
chr8 (75-328)||(21782964-21783217)
chr8 (75-328)||(21786899-21787152)
chr8 (75-335)||(19864637-19864898)
chr8 (10-335)||(20008400-20008725)
chr8 (93-327)||(32602129-32602364)
chr8 (108-326)||(19979953-19980171)
chr8 (93-326)||(15535369-15535602)
chr8 (10-335)||(21323758-21324082)
chr8 (171-326)||(19114676-19114831)
chr8 (10-327)||(19861420-19861737)
chr8 (2-322)||(19482535-19482855)
chr8 (119-335)||(20390076-20390292)
chr8 (2-326)||(21165009-21165333)
chr8 (10-310)||(31414948-31415248)
chr8 (93-323)||(16875657-16875887)
chr8 (93-323)||(21848899-21849129)
chr8 (108-326)||(22041813-22042031)
chr8 (10-335)||(16269703-16270028)
chr8 (10-335)||(6605635-6605960)
chr8 (10-326)||(31569321-31569637)
chr8 (10-335)||(27356513-27356838)
chr8 (10-141)||(28983082-28983213)
chr8 (10-141)||(28988301-28988432)
chr8 (93-335)||(22372908-22373150)
chr8 (5-139)||(22522719-22522853)
chr8 (10-335)||(4984019-4984344)
chr8 (10-335)||(14567119-14567444)
chr8 (10-68)||(19984424-19984482)
chr8 (2-67)||(20390331-20390396)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (2-335)||(22217-22549)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (2-327)||(15626433-15626758)
chr7 (3-335)||(48813290-48813621)
chr7 (2-335)||(14041595-14041928)
chr7 (2-335)||(14351625-14351958)
chr7 (2-327)||(15146921-15147247)
chr7 (2-326)||(11235250-11235574)
chr7 (154-335)||(11770430-11770611)
chr7 (2-326)||(15159094-15159418)
chr7 (12-326)||(8709514-8709828)
chr7 (10-335)||(11386452-11386777)
chr7 (93-326)||(14334305-14334538)
chr7 (93-326)||(14956463-14956696)
chr7 (2-326)||(11551139-11551463)
chr7 (10-335)||(13675353-13675678)
chr7 (18-322)||(44789404-44789708)
chr7 (10-335)||(12204823-12205148)
chr7 (10-335)||(15342332-15342657)
chr7 (10-335)||(19149112-19149436)
chr7 (108-326)||(12689411-12689629)
chr7 (10-335)||(15100626-15100951)
chr7 (10-335)||(20748511-20748835)
chr7 (10-335)||(14262268-14262592)
chr7 (10-335)||(16948495-16948820)
chr7 (2-326)||(10872599-10872923)
chr7 (10-326)||(14139589-14139905)
chr7 (108-326)||(15493-15711)
chr7 (93-323)||(7825812-7826042)
chr7 (10-335)||(16070320-16070643)
chr7 (93-323)||(27105902-27106132)
chr7 (93-323)||(27172193-27172423)
chr7 (10-335)||(26092821-26093146)
chr7 (10-335)||(13023258-13023583)
chr7 (10-335)||(19614576-19614901)
chr7 (10-335)||(49154202-49154527)
chr7 (2-325)||(18179655-18179978)
chr7 (10-335)||(11301236-11301561)
chr7 (2-255)||(13688021-13688274)
chr7 (10-335)||(13966691-13967016)
chr7 (10-335)||(14284399-14284724)
chr7 (10-335)||(26116613-26116938)
chr7 (10-326)||(18051976-18052292)
chr7 (10-326)||(23503893-23504209)
chr7 (231-326)||(14213583-14213678)
chr7 (93-231)||(18588299-18588437)
chr7 (10-335)||(12458541-12458866)
chr7 (245-326)||(8200537-8200618)
chr7 (277-326)||(13687973-13688022)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (2-327)||(2849-3174)
scaffold0647 (2-335)||(7690-8023)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (21-335)||(9084-9398)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (2-335)||(20466309-20466642)
chr5 (3-335)||(23473070-23473402)
chr5 (2-327)||(26736937-26737262)
chr5 (10-335)||(21408980-21409302)
chr5 (2-330)||(21337504-21337832)
chr5 (2-326)||(37289706-37290030)
chr5 (2-326)||(14997949-14998273)
chr5 (2-326)||(19771812-19772136)
chr5 (2-326)||(22331097-22331421)
chr5 (2-326)||(22136520-22136844)
chr5 (75-335)||(25428276-25428536)
chr5 (2-326)||(27612206-27612530)
chr5 (18-322)||(40710636-40710940)
chr5 (2-326)||(41772694-41773018)
chr5 (2-326)||(27520258-27520582)
chr5 (93-326)||(16358354-16358587)
chr5 (93-322)||(27666791-27667020)
chr5 (93-326)||(34568346-34568579)
chr5 (2-326)||(29474283-29474607)
chr5 (2-326)||(22349771-22350095)
chr5 (2-326)||(27683610-27683934)
chr5 (2-326)||(18780966-18781290)
chr5 (2-327)||(28893152-28893477)
chr5 (2-327)||(28921978-28922303)
chr5 (93-323)||(21935489-21935719)
chr5 (93-323)||(23507521-23507751)
chr5 (14-335)||(22234142-22234463)
chr5 (10-335)||(25849900-25850225)
chr5 (3-327)||(20777746-20778070)
chr5 (93-326)||(20801249-20801482)
chr5 (10-335)||(22504504-22504829)
chr5 (19-327)||(28914640-28914948)
chr5 (19-327)||(28929908-28930216)
chr5 (3-326)||(22463785-22464108)
chr5 (2-268)||(21562234-21562500)
chr5 (10-327)||(20344115-20344432)
chr5 (226-335)||(21679212-21679321)
chr5 (10-335)||(24796615-24796940)
chr5 (10-335)||(37541599-37541924)
chr5 (3-327)||(20823286-20823610)
chr5 (93-323)||(24583047-24583277)
chr5 (10-326)||(17267552-17267868)
chr5 (12-335)||(14885211-14885534)
chr5 (197-335)||(24618700-24618838)
chr5 (197-335)||(24714931-24715069)
chr5 (197-335)||(24747959-24748097)
chr5 (282-326)||(23442060-23442104)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (22-335)||(1900-2213)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-335)||(494959-495294)
scaffold0001 (10-335)||(453252-453577)
scaffold0001 (10-335)||(515392-515717)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (2-335)||(5054-5386)
scaffold0074 (1-202)||(11196-11397)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (2-330)||(10772-11100)
scaffold0018 (2-330)||(16964-17292)
scaffold0018 (21-327)||(24348-24654)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (2-330)||(24818798-24819126)
chr2 (2-335)||(30010752-30011085)
chr2 (10-335)||(30209493-30209819)
chr2 (10-335)||(23098594-23098919)
chr2 (2-326)||(27372820-27373144)
chr2 (2-335)||(23073405-23073738)
chr2 (10-335)||(23112278-23112603)
chr2 (2-326)||(24711585-24711909)
chr2 (2-335)||(23106296-23106629)
chr2 (2-323)||(41606953-41607274)
chr2 (15-335)||(22734355-22734675)
chr2 (2-322)||(10870405-10870725)
chr2 (2-326)||(24263921-24264245)
chr2 (2-326)||(24875318-24875642)
chr2 (93-326)||(21143700-21143933)
chr2 (18-322)||(16926915-16927219)
chr2 (18-322)||(17000555-17000859)
chr2 (93-326)||(9485767-9486000)
chr2 (93-322)||(27219571-27219800)
chr2 (2-322)||(44384138-44384458)
chr2 (159-326)||(22323581-22323748)
chr2 (208-335)||(45534482-45534609)
chr2 (21-335)||(23278318-23278632)
chr2 (108-326)||(24706156-24706374)
chr2 (10-335)||(19650626-19650951)
chr2 (15-324)||(21323847-21324156)
chr2 (162-335)||(25264596-25264769)
chr2 (2-326)||(23189470-23189793)
chr2 (10-326)||(12575904-12576220)
chr2 (2-326)||(24677040-24677364)
chr2 (10-326)||(27789291-27789607)
chr2 (12-335)||(24950132-24950455)
chr2 (93-323)||(24829847-24830077)
chr2 (10-335)||(1065293-1065618)
chr2 (10-335)||(31832200-31832525)
chr2 (93-250)||(9337209-9337366)
chr2 (153-335)||(23295477-23295659)
chr2 (10-335)||(19717593-19717918)
chr2 (103-323)||(22279659-22279879)
chr2 (241-330)||(27208979-27209068)
chr2 (10-142)||(25255654-25255786)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (2-335)||(14510-14843)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (2-327)||(14418-14743)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (2-335)||(3856-4189)
scaffold0010 (10-335)||(40372-40697)
scaffold0010 (197-335)||(45626-45763)
scaffold0010 (10-172)||(45466-45628)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (2-327)||(5920-6245)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (2-335)||(22647-22980)
scaffold0042 (2-326)||(37851-38175)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (2-335)||(24564-24897)
scaffold0011 (10-335)||(150511-150836)
scaffold0011 (241-335)||(193974-194068)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (15-335)||(14849147-14849467)
chr4 (3-335)||(14696024-14696356)
chr4 (15-335)||(8707822-8708142)
chr4 (2-326)||(23957667-23957991)
chr4 (2-326)||(8051391-8051715)
chr4 (2-326)||(27713256-27713580)
chr4 (2-326)||(40474960-40475284)
chr4 (16-335)||(14161381-14161700)
chr4 (93-326)||(12478520-12478753)
chr4 (93-326)||(19776652-19776885)
chr4 (2-326)||(14301747-14302071)
chr4 (108-326)||(14682487-14682705)
chr4 (93-335)||(15323128-15323370)
chr4 (18-322)||(8388336-8388640)
chr4 (2-326)||(15145653-15145977)
chr4 (2-335)||(18225214-18225547)
chr4 (10-335)||(15072270-15072595)
chr4 (10-335)||(16149622-16149947)
chr4 (10-335)||(16153768-16154093)
chr4 (10-335)||(3262830-3263155)
chr4 (10-335)||(15001401-15001725)
chr4 (10-335)||(44659902-44660227)
chr4 (3-335)||(27902297-27902629)
chr4 (10-326)||(51604828-51605144)
chr4 (159-326)||(18613749-18613916)
chr4 (108-250)||(16234866-16235008)
chr4 (3-335)||(1647306-1647638)
chr4 (216-335)||(1640322-1640441)
chr4 (10-335)||(15357156-15357481)
chr4 (10-335)||(29451573-29451898)
chr4 (18-250)||(17092933-17093165)
chr4 (93-323)||(15291277-15291507)
chr4 (2-153)||(16218323-16218474)
chr4 (2-153)||(16221643-16221794)
chr4 (10-178)||(11205268-11205436)
chr4 (258-326)||(29037428-29037496)
chr4 (10-184)||(15257990-15258164)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (2-335)||(16819-17151)
scaffold0040 (258-335)||(111775-111852)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (2-335)||(15252-15585)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (6-335)||(27283-27611)
scaffold0058 (3-335)||(21062-21394)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (2-327)||(15261168-15261493)
chr3 (10-323)||(15014031-15014344)
chr3 (2-335)||(17491380-17491713)
chr3 (2-326)||(15723201-15723525)
chr3 (93-266)||(11889638-11889811)
chr3 (2-326)||(10007139-10007463)
chr3 (18-326)||(48426986-48427294)
chr3 (12-322)||(15346522-15346832)
chr3 (93-326)||(13254229-13254462)
chr3 (2-326)||(10907749-10908073)
chr3 (10-330)||(11950172-11950492)
chr3 (2-326)||(20060321-20060645)
chr3 (10-335)||(17187914-17188239)
chr3 (2-322)||(5108878-5109198)
chr3 (2-322)||(5423197-5423517)
chr3 (3-326)||(15400785-15401108)
chr3 (18-335)||(15229143-15229460)
chr3 (18-335)||(15235011-15235328)
chr3 (93-326)||(15340808-15341041)
chr3 (93-326)||(16637312-16637545)
chr3 (2-323)||(16805214-16805535)
chr3 (10-335)||(12358791-12359116)
chr3 (93-322)||(16755059-16755288)
chr3 (2-322)||(3687486-3687806)
chr3 (93-325)||(6602276-6602508)
chr3 (2-322)||(12888252-12888572)
chr3 (2-326)||(15587659-15587983)
chr3 (93-326)||(12499787-12500020)
chr3 (93-322)||(53383376-53383605)
chr3 (75-326)||(14874839-14875090)
chr3 (93-326)||(16693703-16693936)
chr3 (10-335)||(28755858-28756183)
chr3 (93-323)||(30139358-30139588)
chr3 (93-323)||(30148909-30149139)
chr3 (10-335)||(31693449-31693774)
chr3 (12-335)||(11959435-11959758)
chr3 (10-335)||(13970384-13970709)
chr3 (10-335)||(14088213-14088538)
chr3 (93-323)||(8272757-8272987)
chr3 (10-335)||(18132610-18132935)
chr3 (10-335)||(47125484-47125809)
chr3 (93-323)||(13965710-13965941)
chr3 (10-335)||(31940443-31940768)
chr3 (3-327)||(10418302-10418626)
chr3 (191-335)||(12179878-12180022)
chr3 (10-326)||(41179071-41179387)
chr3 (93-323)||(15611655-15611885)
chr3 (10-326)||(16379192-16379508)
chr3 (10-326)||(16834774-16835090)
chr3 (10-330)||(16327924-16328244)
chr3 (10-141)||(13943758-13943889)
chr3 (10-141)||(44778981-44779112)
chr3 (93-301)||(15948828-15949036)
chr3 (10-335)||(13318766-13319091)
chr3 (117-335)||(10385211-10385429)
chr3 (10-123)||(10407720-10407833)
chr3 (10-64)||(12510747-12510801)
chr3 (10-67)||(8745654-8745711)
chr3 (10-67)||(24189112-24189169)
chr3 (2-82)||(11888621-11888701)
chr3 (10-205)||(12269880-12270075)
chr3 (10-52)||(12180167-12180209)
chr3 (10-51)||(14291796-14291837)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (2-335)||(217451-217784)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (10-335)||(84558-84883)
scaffold0007 (3-327)||(268558-268882)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (133-327)||(18965599-18965793)
chr6 (2-268)||(23085944-23086210)
chr6 (19-335)||(23080244-23080560)
chr6 (120-327)||(18196024-18196231)
chr6 (89-335)||(25608121-25608367)
chr6 (15-335)||(20634126-20634446)
chr6 (28-327)||(18450286-18450585)
chr6 (89-335)||(18406204-18406450)
chr6 (2-335)||(22760628-22760961)
chr6 (2-323)||(24293955-24294276)
chr6 (33-329)||(19487486-19487772)
chr6 (93-326)||(22828619-22828852)
chr6 (2-322)||(2872976-2873296)
chr6 (108-327)||(16961761-16961980)
chr6 (10-329)||(14378097-14378416)
chr6 (10-329)||(14379647-14379966)
chr6 (2-327)||(5837392-5837717)
chr6 (93-322)||(28261461-28261690)
chr6 (93-322)||(28284226-28284455)
chr6 (93-322)||(28340210-28340439)
chr6 (10-330)||(19454804-19455124)
chr6 (93-327)||(16925902-16926136)
chr6 (108-322)||(25114340-25114554)
chr6 (108-326)||(27564112-27564330)
chr6 (10-335)||(18796465-18796790)
chr6 (2-137)||(18963261-18963396)
chr6 (15-322)||(27189224-27189531)
chr6 (15-322)||(27259709-27260016)
chr6 (93-323)||(16380637-16380867)
chr6 (10-335)||(19881073-19881398)
chr6 (10-335)||(25769619-25769944)
chr6 (10-335)||(19436777-19437102)
chr6 (93-326)||(19866471-19866704)
chr6 (105-326)||(22435653-22435874)
chr6 (105-326)||(22444051-22444272)
chr6 (93-323)||(16648233-16648463)
chr6 (2-335)||(21473376-21473708)
chr6 (10-335)||(24366187-24366512)
chr6 (75-326)||(25763474-25763725)
chr6 (3-327)||(15461119-15461443)
chr6 (93-323)||(23998035-23998265)
chr6 (10-335)||(10467030-10467355)
chr6 (226-335)||(34643983-34644092)
chr6 (10-141)||(28280994-28281125)
chr6 (93-323)||(1647078-1647308)
chr6 (10-335)||(21568172-21568497)
chr6 (2-125)||(18183540-18183663)
chr6 (10-67)||(24516589-24516646)
chr6 (196-327)||(5295573-5295704)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (2-335)||(98-431)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (30-335)||(939-1244)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (2-335)||(201499-201832)
scaffold0004 (10-335)||(324646-324971)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (3-325)||(3533-3855)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (21-327)||(16028-16333)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (2-335)||(7962-8295)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (2-335)||(103175-103508)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (28-335)||(42164-42471)
scaffold0035 (10-335)||(4691-5016)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (161-330)||(115171-115340)
scaffold0037 (2-96)||(115069-115163)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (10-335)||(86711-87035)
scaffold0023 (3-335)||(2537-2869)
scaffold0023 (105-335)||(151052-151282)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (2-330)||(7118-7446)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (2-323)||(5825-6146)
scaffold0270 (2-323)||(12955-13276)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (2-325)||(840-1163)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (2-335)||(3374-3707)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (2-335)||(55697-56030)
scaffold0022 (2-335)||(40574-40907)
scaffold0022 (2-335)||(74294-74627)
scaffold0022 (93-323)||(8948-9178)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (2-335)||(50618498-50618831)
chr1 (2-325)||(21750876-21751199)
chr1 (90-335)||(20140009-20140254)
chr1 (18-323)||(51331609-51331914)
chr1 (75-335)||(430289-430549)
chr1 (2-322)||(33389129-33389449)
chr1 (2-335)||(22360344-22360677)
chr1 (2-326)||(21832237-21832561)
chr1 (2-326)||(21838885-21839209)
chr1 (2-321)||(21862473-21862792)
chr1 (2-326)||(17043115-17043439)
chr1 (10-335)||(20834008-20834333)
chr1 (93-322)||(16348787-16349016)
chr1 (93-326)||(19108303-19108536)
chr1 (10-335)||(21743660-21743985)
chr1 (108-326)||(21233937-21234155)
chr1 (2-206)||(16378150-16378354)
chr1 (2-326)||(20854860-20855184)
chr1 (2-322)||(41351762-41352082)
chr1 (93-323)||(20829583-20829813)
chr1 (10-335)||(19661244-19661569)
chr1 (10-335)||(31538105-31538430)
chr1 (10-335)||(48424830-48425155)
chr1 (10-335)||(52987698-52988023)
chr1 (2-326)||(24792716-24793040)
chr1 (159-335)||(41308599-41308775)
chr1 (10-335)||(20938171-20938496)
chr1 (10-335)||(38910934-38911259)
chr1 (10-335)||(24097711-24098036)
chr1 (159-326)||(21026108-21026275)
chr1 (10-335)||(19856231-19856556)
chr1 (10-335)||(20296338-20296663)
chr1 (93-314)||(22503480-22503701)
chr1 (10-335)||(37679006-37679331)
chr1 (247-327)||(16378076-16378156)
chr1 (10-326)||(21952844-21953160)
chr1 (93-310)||(20927005-20927222)
chr1 (226-335)||(23196573-23196682)
chr1 (294-335)||(22116839-22116880)
chr1 (10-52)||(41310766-41310808)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (93-335)||(38070-38312)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (2-335)||(176375-176708)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (2-335)||(10770-11103)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (2-335)||(810-1140)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (2-335)||(85261-85594)
scaffold0008 (2-319)||(85827-86144)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (75-335)||(1-261)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (89-335)||(7163-7409)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (2-335)||(17596-17924)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (10-335)||(11735-12060)
scaffold0309 (2-335)||(16583-16916)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (2-335)||(20180-20513)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (2-335)||(30887-31220)
scaffold0026 (10-328)||(50759-51077)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (75-335)||(1486-1746)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (2-326)||(8889-9213)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (89-335)||(708-954)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (12-322)||(45106-45416)
scaffold0028 (93-323)||(10428-10658)
scaffold0028 (2-323)||(16890-17211)
scaffold0028 (10-335)||(48553-48878)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (2-335)||(24976-25309)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (10-327)||(50219-50536)
scaffold0067 (10-327)||(59253-59570)
scaffold0067 (10-327)||(65641-65958)
scaffold0067 (10-335)||(28564-28889)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (10-335)||(55886-56211)
scaffold0053 (10-335)||(47073-47398)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (10-335)||(99601-99926)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (11-335)||(2658-2982)
scaffold0079 (2-326)||(35446-35771)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (76-335)||(6436-6695)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (2-335)||(4118-4454)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (10-335)||(1811-2136)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (2-335)||(6692-7025)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (10-335)||(33276-33601)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-335)||(49914-50239)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (10-335)||(2992-3317)
scaffold0034 (3-335)||(69312-69644)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (10-335)||(262166-262491)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (2-326)||(11270-11594)
scaffold0080 (108-335)||(50032-50259)
scaffold0080 (75-277)||(53635-53837)
scaffold0080 (75-326)||(30833-31084)
scaffold0080 (75-326)||(36298-36550)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (10-335)||(10096-10421)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (10-335)||(52987-53312)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (93-322)||(16113-16342)
scaffold0044 (93-322)||(2375-2605)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (10-329)||(5128-5447)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (75-335)||(7991-8251)
scaffold0358 (75-335)||(17187-17447)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (75-335)||(393-652)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (2-326)||(40104-40428)
scaffold0109 (108-326)||(14261-14480)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (93-325)||(107933-108165)
scaffold0029 (10-335)||(114501-114826)
scaffold0029 (2-67)||(94925-94990)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (93-324)||(9319-9550)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (75-326)||(20553-20804)
scaffold0081 (75-326)||(35977-36228)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (15-326)||(195531-195842)
scaffold0017 (2-326)||(57966-58290)
scaffold0017 (226-326)||(18321-18422)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (10-335)||(2311-2636)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (10-335)||(16054-16379)
scaffold0266 (93-323)||(7983-8213)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (10-335)||(21554-21879)
scaffold0261 (10-335)||(13375-13700)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (10-327)||(19302-19619)
scaffold0244 (226-323)||(25032-25129)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (10-335)||(29324-29649)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (10-335)||(49046-49371)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (10-335)||(24156-24481)
scaffold0104 (10-335)||(44456-44781)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (10-335)||(109572-109897)
scaffold0031 (2-326)||(55022-55346)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (75-335)||(8314-8574)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (174-326)||(44846-44998)
scaffold0130 (39-335)||(8876-9172)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (105-327)||(13345-13567)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (75-325)||(23178-23428)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (10-335)||(169-493)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (10-335)||(1524-1849)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (10-327)||(31358-31675)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (10-330)||(893-1213)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (10-335)||(9500-9821)
scaffold0235 (10-335)||(19714-20035)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (108-335)||(5487-5714)
scaffold0149 (108-335)||(9918-10145)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (93-323)||(25348-25578)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (93-323)||(14862-15092)
scaffold0162 (93-310)||(11296-11513)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (10-335)||(873-1198)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (102-323)||(64639-64860)
scaffold0054 (10-67)||(64558-64615)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (75-335)||(18445-18705)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (75-326)||(444-695)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (102-335)||(936-1169)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (2-239)||(2637-2874)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (10-335)||(28467-28792)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (10-335)||(31716-32041)
scaffold0076 (102-323)||(42212-42433)
scaffold0076 (10-67)||(54450-54507)
scaffold0076 (220-335)||(55149-55264)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (10-335)||(250562-250887)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (226-335)||(195182-195291)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (108-326)||(4145-4363)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (93-323)||(7107-7337)
scaffold0302 (93-323)||(165-395)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (129-335)||(33911-34117)
scaffold0180 (241-335)||(510-604)
scaffold0180 (241-335)||(4830-4924)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (117-326)||(7839-8048)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (10-335)||(41639-41963)
scaffold0102 (15-250)||(51389-51624)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (3-335)||(619-951)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (174-326)||(3556-3708)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (220-335)||(1794-1909)
scaffold0476 (2-136)||(10307-10441)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (10-335)||(40-365)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (10-335)||(588-912)
scaffold0420 (10-67)||(7824-7881)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (10-327)||(10825-11142)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (170-326)||(28770-28926)
scaffold0215 (94-250)||(28586-28742)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (226-335)||(36055-36164)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (10-335)||(37590-37915)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (10-327)||(79870-80187)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (191-335)||(14142-14286)
scaffold0124 (132-323)||(5969-6160)
scaffold0124 (10-52)||(14431-14473)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (3-330)||(25060-25387)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (168-326)||(1003-1161)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (245-335)||(20791-20881)
scaffold0090 (245-335)||(24953-25043)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (241-335)||(546-640)
scaffold0089 (44-335)||(14786-15077)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (10-335)||(9003-9328)
scaffold0222 (12-67)||(1530-1585)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (10-335)||(42859-43183)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (2-154)||(3-155)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (231-335)||(23339-23443)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (241-335)||(1825-1919)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (21-327)||(12349-12655)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (93-323)||(34039-34269)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (252-330)||(5974-6052)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-271)||(19673-19934)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (3-326)||(7965-8288)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (10-141)||(9913-10044)
scaffold0348 (241-327)||(10159-10245)
scaffold0348 (10-67)||(18522-18579)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (241-327)||(243-329)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (93-310)||(2074-2291)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (252-335)||(16430-16513)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (93-224)||(21298-21429)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (214-335)||(3868-3989)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (10-335)||(28875-29199)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (111-310)||(943-1141)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (93-238)||(1743-1888)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (10-205)||(572-767)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (253-323)||(2218-2288)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (241-327)||(4606-4692)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (231-327)||(44733-44829)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (241-327)||(1274-1360)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (214-287)||(9215-9288)
[»] scaffold0708 (2 HSPs)
scaffold0708 (11-67)||(6185-6241)
scaffold0708 (241-329)||(6415-6503)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 20394604 - 20394929
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20394604 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttagtgctacaaatgcaccg 20394703  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20394704 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 20394803  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20394804 aagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaataaggtgag 20394903  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20394904 ttttcttggccatattatttctggta 20394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 22375924 - 22376257
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||   || |||||||||||    ||||||||||||     
T  22375924 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttcagcattacaaatgcacca 22376023  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  22376024 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatatttttatatactccaagactgaag 22376123  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||||  || ||||    
T  22376124 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaattctggttgaaatagatgag 22376223  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22376224 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 22376257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23887338 - 23887001
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  23887338 gattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcca 23887239  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23887238 gatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctaaag 23887139  T
Q  202 aagaa----aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgagg 297  Q
    |||||     |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23887138 aagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctagttgaatgagg 23887039  T
Q  298 tgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  23887038 tgagttttcttggccatgttatttttcgtagtggtatt 23887001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 22246904 - 22247229
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  22246904 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 22247003  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22247004 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagattgaag 22247103  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
     |||| |||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22247104 gagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggcgag 22247203  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22247204 ttttcatggccatgttatttctggta 22247229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 103 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22988939 - 22988715
Alignment:
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22988939 gtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatattccaagactgaaga 22988840  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22988839 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagt 22988740  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggta 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22988739 tttcttggccatgttatttctggta 22988715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 22422363 - 22422687
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||  || || || || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  22422363 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 22422462  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22422463 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaagtccgaag 22422562  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22422563 aagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattatggttgaaagaggtgag 22422662  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  22422663 tttccttggccatgttatttctggt 22422687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18858887 - 18858563
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  18858887 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 18858788  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18858787 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 18858688  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  18858687 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 18858588  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  18858587 ttttcttggccatgttatttctggt 18858563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23652351 - 23652026
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||||||||||||     
T  23652351 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaatgcacct 23652252  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||    
T  23652251 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaagactgaag 23652152  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23652151 aggaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaggtaag 23652052  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||    
T  23652051 ttttcttggccatgtcatttctggta 23652026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 21920219 - 21920552
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||    | |||| | |||  || |||||||||||      
T  21920219 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacat 21920318  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  21920319 ggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttacttcaagactgaag 21920418  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21920419 aagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgag 21920518  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21920519 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 21920552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 22118646 - 22118970
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22118646 gattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22118745  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22118746 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 22118845  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    |||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22118846 aagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaagaggtgag 22118945  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  22118946 ttttctaggccatgttatttctggt 22118970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 22127430 - 22127754
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |  |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22127430 gattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22127529  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22127530 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 22127629  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    |||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22127630 aagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtcgaaagaggtgag 22127729  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  22127730 ttttctaggccatgttatttctggt 22127754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Original strand, 20016744 - 20017058
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 111  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || ||||    
T  20016744 aaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 20016843  T
Q  112 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 211  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20016844 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 20016943  T
Q  212 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 311  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  20016944 tgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggc 20017043  T
Q  312 catattatttctggt 326  Q
    ||| |||||||||||    
T  20017044 catgttatttctggt 20017058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 30311615 - 30311939
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  30311615 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 30311714  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  30311715 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatattttaatttactccaagactgaag 30311814  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  30311815 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 30311914  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  30311915 ttttcttggccatgttatttctggt 30311939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23657237 - 23656904
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  23657237 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct 23657138  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||| | ||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  23657137 ggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaatatattctaagactgaag 23657038  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  23657037 aagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttatggttaagtgaagtaag 23656938  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23656937 ttttcttggccatattatttatggtagtggtatt 23656904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 17672494 - 17672814
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  17672494 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 17672593  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  17672594 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 17672693  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17672694 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 17672793  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  17672794 ttttctaggccatgttatttc 17672814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 22131512 - 22131836
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || | |||||| || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  22131512 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 22131611  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22131612 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatattttgatctactccaagactgaag 22131711  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  22131712 aagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaag 22131811  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  22131812 ttttcttggccatgttatttctggt 22131836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22053165 - 22052840
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  22053165 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 22053066  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| | ||| |||||||| |||||  | || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  22053065 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcctaatttattctaagactgaagaggagcat 22052966  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  22052965 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttg 22052866  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  22052865 gccacattatttctggtagtggtatt 22052840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21253181 - 21252921
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |  ||||| || || || |    
T  21253181 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatg 21253082  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21253081 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 21252982  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21252981 gtgagaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 21252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21927730 - 21927404
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||| || ||| ||||| || ||||| ||    
T  21927730 tgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggtgtgtt 21927631  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  21927630 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 21927531  T
Q  210 gcca-agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctt 308  Q
      || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||    
T  21927530 tgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagatttctt 21927431  T
Q  309 ggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21927430 ggccatattatttctggtagtggtatt 21927404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 29301984 - 29302230
Alignment:
Q  89 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 188  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |  |||||||  |||||||| || || ||||| || ||| |||| |||    
T  29301984 tacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattctgatttac 29302083  T
Q  189 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 288  Q
    |||||| | |||||| || ||||  | || |||||| |||| || |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29302084 tctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggt 29302183  T
Q  289 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  29302184 tgagtgaagtaagttttcttggccacgttatttctggtagtggtatt 29302230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 328
Target Start/End: Original strand, 21392405 - 21392658
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21392405 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21392504  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21392505 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21392604  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 328  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21392605 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21392658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 328
Target Start/End: Original strand, 21782964 - 21783217
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21782964 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21783063  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21783064 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaa 21783163  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 328  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21783164 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21783217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 328
Target Start/End: Original strand, 21786899 - 21787152
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||| | || || ||||| || || || |    
T  21786899 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatg 21786998  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  21786999 atatattgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaa 21787098  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 328  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21787099 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtag 21787152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Original strand, 19864637 - 19864898
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  19864637 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 19864736  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttg-caagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||  | |||||  |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |    
T  19864737 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtcta 19864836  T
Q  274 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  19864837 agtgcgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 19864898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 20008400 - 20008725
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  20008400 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 20008499  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  20008500 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagagcat 20008599  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  20008600 gcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 20008699  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20008700 gccatattatttctggtagtggtatt 20008725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32602364 - 32602129
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  32602364 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactcca 32602265  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattc-tggttga 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  32602264 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattcttggttga 32602165  T
Q  292 atgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    | || || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32602164 aagaagtaagtttttttggccatgttatttctggta 32602129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19980171 - 19979953
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  19980171 tttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 19980072  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  || || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || || || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19980071 atgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgatttctggttgaaagaggtaagttttct 19979972  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19979971 tggccatgttatttctggt 19979953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15535602 - 15535369
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  15535602 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactcca 15535503  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15535502 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 15535403  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15535402 agaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 15535369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 21323758 - 21324082
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  21323758 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 21323857  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| || || || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  21323858 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattctgatctattcaaagactgaagaagagcat 21323957  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  21323958 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaa-gttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 21324056  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21324057 gccacattatttctggtagtggtatt 21324082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19114831 - 19114676
Alignment:
Q  171 gacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgt 270  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||    
T  19114831 gacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgt 19114732  T
Q  271 caaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19114731 ctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 19114676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19861737 - 19861420
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    |  ||||| |||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19861737 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19861638  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||| | || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||||||||| ||    
T  19861637 tatgaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagaacat 19861538  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  19861537 gcagagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 19861438  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19861437 gccatattatttctggta 19861420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 19482535 - 19482855
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  19482535 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 19482634  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19482635 ggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 19482734  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  19482735 aagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 19482834  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  19482835 ttttcttggtcatgttatttc 19482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20390292 - 20390076
Alignment:
Q  119 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 218  Q
    ||||||| | ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  |||||    
T  20390292 catgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcat 20390193  T
Q  219 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 318  Q
    || ||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||    
T  20390192 ttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtccaaatttgaattctagttaagtgaagcaagttttcttggccatatta 20390093  T
Q  319 tttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  20390092 tttatggtagtggtatt 20390076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 21165009 - 21165333
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  21165009 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 21165108  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || ||||| || || ||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  21165109 ggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatattttaatttactccaagactgaag 21165208  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  21165209 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatccaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 21165308  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  21165309 ttttcttggccatgttatttctggt 21165333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 310
Target Start/End: Original strand, 31414948 - 31415248
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  31414948 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgtt 31415047  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| | ||||| ||  ||    
T  31415048 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagaccgaagaggagcat 31415147  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  31415148 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggttaagtgaagtgaattttcttg 31415247  T
Q  310 g 310  Q
    |    
T  31415248 g 31415248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 16875657 - 16875887
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16875657 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16875756  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16875757 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16875856  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16875857 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 21848899 - 21849129
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21848899 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21848998  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21848999 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagttttggttgaa 21849098  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21849099 ggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 21849129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22042031 - 22041813
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  22042031 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatgtactccaagactgaagaagaac 22041932  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||  | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||    
T  22041931 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgagaattctggttgaaagaaataagttttct 22041832  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22041831 tggccatgttatttctggt 22041813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 16269703 - 16270028
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |  || ||||| ||    
T  16269703 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgggcctggtgtgtt 16269802  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||  |||||| ||  ||    
T  16269803 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaatgaagaggagcat 16269902  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||  |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  16269903 gcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 16270002  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  16270003 gtcacattatttctggtagtggtatt 16270028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6605960 - 6605635
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  6605960 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 6605861  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  6605860 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 6605761  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||| ||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  6605760 gcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 6605661  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  6605660 gtcacattatttctggtagtggtatt 6605635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 31569321 - 31569637
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  31569321 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 31569420  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  31569421 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 31569520  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  31569521 gcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 31569620  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  31569621 gtcatattatttctggt 31569637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27356838 - 27356513
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  27356838 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 27356739  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  27356738 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 27356639  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  27356638 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 27356539  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||    
T  27356538 gtcatattatttttggtagtggtatt 27356513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28983213 - 28983082
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  28983213 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 28983114  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 141  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28983113 tatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28983082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28988432 - 28988301
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  28988432 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 28988333  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 141  Q
    |||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  28988332 tatggagtacatgaaccgaattttccatgctt 28988301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22373150 - 22372908
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| | ||| |||||  | || || ||||    
T  22373150 aatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttactgatgatatcctaatttattcta 22373051  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||       
T  22373050 agaatgaagaagaccatgcagagcatcttaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagtggtccaaatgtgaattatggttacg 22372951  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  22372950 tgaagtaagttttcttggtcacattatttttggtagtggtatt 22372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22522853 - 22522719
Alignment:
Q  5 taaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggt 104  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||| || ||     
T  22522853 taaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccagga 22522754  T
Q  105 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc 139  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22522753 gtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgc 22522719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4984344 - 4984019
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  ||  || || || || ||||| ||    
T  4984344 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgtaactaaagcgcctggtgtttt 4984245  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | |||||   |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| || || |||   || |||||  ||    
T  4984244 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaatgataccttgatttattccaagaacgaggaagagcat 4984145  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| | || |||||    || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  4984144 gcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttaaaggagaagcgattgtatgttaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 4984045  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  4984044 gtcacattatttctggtagtggtatt 4984019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14567444 - 14567119
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  14567444 tgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgtttt 14567345  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  14567344 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 14567245  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    || |||||  | ||  | || ||||||||| |||| || || |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  14567244 gcaaagcacctaaaaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 14567145  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  14567144 gtcacattatttctggtagtggtatt 14567119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19984482 - 19984424
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataa 68  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  19984482 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataa 19984424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20390396 - 20390331
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20390396 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaata 20390331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 22217 - 22549
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  22217 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcg-tgttactaatgcaccg 22315  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22316 ggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctgaag 22415  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22416 aagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 22515  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22516 tttttttggccatattatttctggtagtggtatt 22549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15626758 - 15626433
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||||||||     
T  15626758 gattaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcacca 15626659  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15626658 ggtgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataagtctgaag 15626559  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15626558 aagaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 15626459  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15626458 tttccttggccatattatttctggta 15626433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Original strand, 48813290 - 48813621
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| || || |||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||      
T  48813290 attaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaa 48813389  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813390 gtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctgaaga 48813489  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48813490 agaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaa-ttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 48813588  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  48813589 tttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 48813621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14041928 - 14041595
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  14041928 gattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 14041829  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  14041828 gatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaagactgagg 14041729  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14041728 aagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 14041629  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||    
T  14041628 ttttcttggacatgttactactggtagtggtatt 14041595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14351958 - 14351625
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  14351958 gattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 14351859  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  14351858 gatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatttactccaagactgagg 14351759  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14351758 aagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 14351659  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||    
T  14351658 ttttcttggacatgttactactggtagtggtatt 14351625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 15146921 - 15147247
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||   ||  ||||||||   || ||||||||||||     
T  15146921 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgccttttggtgttacaaatgcacct 15147020  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgc-ttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 200  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||    
T  15147021 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatatttttatctactccaagactgaa 15147120  T
Q  201 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 300  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15147121 gaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaa 15147220  T
Q  301 gttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15147221 gttttcttggccatgttatttctggta 15147247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 11235250 - 11235574
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  11235250 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 11235349  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  11235350 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 11235449  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  11235450 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 11235549  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  11235550 ttttctaggccatgttatttctggt 11235574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 335
Target Start/End: Original strand, 11770430 - 11770611
Alignment:
Q  154 ttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaa 253  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  11770430 ttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 11770529  T
Q  254 gttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11770530 gttatatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 11770611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 15159094 - 15159418
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  15159094 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 15159193  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  15159194 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgacg 15159293  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15159294 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 15159393  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  15159394 ttttctaggccatgttatttctggt 15159418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8709828 - 8709514
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||| || || ||||    
T  8709828 aaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgttta 8709729  T
Q  112 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 211  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8709728 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 8709629  T
Q  212 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 311  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  8709628 tgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggc 8709529  T
Q  312 catattatttctggt 326  Q
    ||| |||||||||||    
T  8709528 catgttatttctggt 8709514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 11386452 - 11386777
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  11386452 tgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtatt 11386551  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || | |||  | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||  ||    
T  11386552 tatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagactgaagaagagcat 11386651  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  11386652 gccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctcg 11386751  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  11386752 gccacattatttctggtagtggtatt 11386777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14334538 - 14334305
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  14334538 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 14334439  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14334438 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14334339  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14334338 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 14334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14956696 - 14956463
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  14956696 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 14956597  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14956596 agactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 14956497  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14956496 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 14956463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 11551139 - 11551463
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  11551139 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 11551238  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||    
T  11551239 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttattccaagactgaag 11551338  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  11551339 aagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 11551438  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  11551439 ttttcttggccatgttatttctggt 11551463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13675678 - 13675353
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13675678 tgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 13675579  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  13675578 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 13675479  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  13675478 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttatcttg 13675379  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13675378 gccacattatttctggtagtggtatt 13675353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Original strand, 44789404 - 44789708
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  44789404 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 44789503  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  44789504 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 44789603  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  44789604 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 44789703  T
Q  318 atttc 322  Q
    |||||    
T  44789704 atttc 44789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 12204823 - 12205148
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  12204823 tgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 12204922  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   | ||| || ||||| ||||| ||||| || || || | |||| ||||||||||  ||    
T  12204923 tatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagactgaagaagagcat 12205022  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  12205023 gcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 12205122  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  12205123 gccacattatttctggtagtggtatt 12205148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15342657 - 15342332
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15342657 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15342558  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| || |||| ||  ||    
T  15342557 catggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagactaaagaggagcat 15342458  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15342457 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttg 15342358  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15342357 gccacattatttctggtagtggtatt 15342332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19149436 - 19149112
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19149436 tgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19149338  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |||| |||||  ||    
T  19149337 tatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaagagcat 19149238  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  19149237 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 19149138  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19149137 gccatattatttctggtagtggtatt 19149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12689629 - 12689411
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  12689629 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 12689530  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12689529 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttct 12689430  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12689429 tggccatgttatttctggt 12689411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 15100626 - 15100951
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15100626 tgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15100725  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  15100726 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 15100825  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| | || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  15100826 gcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 15100925  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15100926 gccacattatttctggtagtggtatt 15100951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20748835 - 20748511
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  20748835 tgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 20748737  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| |||| |||||  ||    
T  20748736 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaagagcat 20748637  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  20748636 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 20748537  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20748536 gccatattatttctggtagtggtatt 20748511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 14262268 - 14262592
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||  || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14262268 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14262367  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | ||||||||||  ||    
T  14262368 tatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcta-gactgaagaagagcat 14262466  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  14262467 gcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 14262566  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14262567 gccatattatttctagtagtggtatt 14262592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 16948495 - 16948820
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  16948495 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtt 16948594  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||    ||||| ||  |     
T  16948595 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaatcgaagaggagcac 16948694  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  16948695 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggttaagtgaagtgagttttctgg 16948794  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16948795 gccacattatttctggtagtggtatt 16948820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10872923 - 10872599
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  10872923 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 10872824  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10872823 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 10872724  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10872723 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10872624  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  10872623 ttttctaggccatgttatttctggt 10872599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14139905 - 14139589
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  14139905 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 14139806  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  14139805 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagactgaagaagagcat 14139706  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| || ||||| ||||    
T  14139705 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttg 14139606  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  14139605 gtcatattatttctggt 14139589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Original strand, 15493 - 15711
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  15493 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 15592  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  15593 atgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 15692  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  15693 tggccatgttatttttggt 15711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7826042 - 7825812
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  7826042 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 7825943  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7825942 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7825843  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7825842 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 7825812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 16070320 - 16070643
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||  ||||  |    
T  16070320 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgt--t 16070417  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||  ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| ||||||||||  ||    
T  16070418 tatggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagactgaagaagagcat 16070517  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16070518 gcagagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctgg 16070617  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  16070618 gtcatattatttctggtagtggtatt 16070643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 27105902 - 27106132
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27105902 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27106001  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27106002 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27106101  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27106102 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27106132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27172423 - 27172193
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  27172423 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 27172324  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27172323 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 27172224  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  27172223 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 27172193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 26092821 - 26093146
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  26092821 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 26092920  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  26092921 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 26093020  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  26093021 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 26093120  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  26093121 gtcacattatttctggtagtggtatt 26093146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13023583 - 13023258
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13023583 tgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 13023484  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  13023483 tatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataatttgatttattctaagactgaagaggagcat 13023384  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  13023383 gcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttgtggttaagtgaagtgagttttctgg 13023284  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  13023283 gtcacattatttctggtagtggtatt 13023258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19614901 - 19614576
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19614901 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19614802  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  19614801 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 19614702  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  19614701 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 19614602  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19614601 gccatattatttctggtagtggtatt 19614576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49154527 - 49154202
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  49154527 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 49154428  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||  |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  49154427 tatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 49154328  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  49154327 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 49154228  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  49154227 gtcacattatttctggtagtggtatt 49154202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18179978 - 18179655
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  18179978 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 18179879  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || ||  ||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18179878 agagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttgatttactccaagactgaag 18179779  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa--aaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtg 299  Q
    ||||| ||||| ||||| | ||| |||| || |||||| |||| |||||  | | || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18179778 aagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgttgaa-gagaangacactt-tatgccaaattgtctaagtatgaattctggttgaaagaggtg 18179681  T
Q  300 agttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18179680 agttttcttggccatgttatttctgg 18179655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 11301236 - 11301561
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  11301236 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 11301335  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  11301336 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 11301435  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||| |    
T  11301436 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagatctggttaaatgaagtaagttttctgg 11301535  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  11301536 gtcacattatttctggtagtggtatt 11301561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13688274 - 13688021
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || |  || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  13688274 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 13688175  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  13688174 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgacg 13688075  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagt 255  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13688074 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagt 13688021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 13966691 - 13967016
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  13966691 tgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 13966790  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  13966791 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 13966890  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  13966891 gcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 13966990  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  13966991 gtcacattatttctggtagtggtatt 13967016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 14284399 - 14284724
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  14284399 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtt 14284498  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || || ||  | |||||||||||||   | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  14284499 catggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgatgacattttgatttattctaagactgaagaggagcat 14284598  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
     |  | ||| ||| | || | ||||||||  |||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  14284599 acagaacatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaagaagctgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaagtgagttttcttg 14284698  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  14284699 gccacattatttctggtagtggtatt 14284724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 26116613 - 26116938
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  26116613 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttt 26116712  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   ||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  26116713 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 26116812  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  26116813 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 26116912  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || ||||||| |||||||||||||    
T  26116913 gtcacattatttttggtagtgatatt 26116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 18051976 - 18052292
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  18051976 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 18052075  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  18052076 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 18052175  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  18052176 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 18052275  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  18052276 gtcatattatttctggt 18052292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 23503893 - 23504209
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  23503893 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 23503992  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  23503993 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 23504092  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  23504093 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 23504192  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  23504193 gtcatattatttctggt 23504209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14213678 - 14213583
Alignment:
Q  231 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14213678 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 14213583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Original strand, 18588299 - 18588437
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  18588299 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 18588398  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 231  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  18588399 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttt 18588437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12458866 - 12458541
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  12458866 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 12458767  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| ||  ||||    || || ||||||| | | |||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||  |||||| ||  ||    
T  12458766 catggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcat 12458667  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  12458666 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagatttctgg 12458567  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  12458566 gacacattatttctggtagtggtatt 12458541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8200618 - 8200537
Alignment:
Q  245 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8200618 agagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 8200537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13688022 - 13687973
Alignment:
Q  277 gtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13688022 gtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 13687973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3174 - 2849
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  3174 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcaccg 3075  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3074 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatataatctaagtctgaag 2975  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2974 aagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctcaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 2875  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  2874 tttccgtggccatattatttctggta 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 7690 - 8023
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  7690 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 7789  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7790 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 7889  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  7890 aagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtatgaattctggttgaaaggagtgag 7989  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7990 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 8023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 335
Target Start/End: Original strand, 9084 - 9398
Alignment:
Q  21 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  9084 gatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtaca 9183  T
Q  121 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||    
T  9184 tgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcattt 9283  T
Q  221 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 320  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9284 gaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatgaggtgagttttcttggccatgttatt 9383  T
Q  321 tctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||| ||||    
T  9384 tctggtagtggtatt 9398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 20466309 - 20466642
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| || || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||   || ||| |||||||||    
T  20466309 gattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttttggtgttactaatgcaccg 20466408  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466409 ggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaag 20466508  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20466509 aagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgag 20466608  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20466609 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 20466642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23473402 - 23473070
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| || |    
T  23473402 attaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccag 23473303  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23473302 gtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatgtactcaaagtctgaaga 23473203  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||| ||||  ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23473202 agaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatgaggtgagt 23473103  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23473102 tttcttggccatgttatttctggtggtggtatt 23473070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 26736937 - 26737262
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  26736937 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 26737036  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26737037 ggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtccgaag 26737136  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26737137 aagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 26737236  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26737237 ttttcttggccatgttatttctggta 26737262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21409302 - 21408980
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||||  || ||  ||||| || || |||||    
T  21409302 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacataacgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccaggagtatt 21409203  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||    
T  21409202 tatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgaaatactctaagtctgaggaggaacat 21409103  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21409102 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctga---agaagaatttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 21409006  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21409005 gtcatattatttctggtagtggtatt 21408980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 21337504 - 21337832
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||| |||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  21337504 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgcca 21337603  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  21337604 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttgatttactccaagtttgaag 21337703  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21337704 aagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 21337803  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  21337804 ttttctcggccacgttatttctggtagtg 21337832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 37289706 - 37290030
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  37289706 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 37289805  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  37289806 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 37289905  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  37289906 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 37290005  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  37290006 ttttctaggccatgttatttctggt 37290030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 14997949 - 14998273
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  14997949 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 14998048  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  14998049 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 14998148  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14998149 aggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 14998248  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  14998249 ttttctaggccatgttatttctggt 14998273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19772136 - 19771812
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  19772136 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 19772037  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  19772036 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaag 19771937  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  19771936 aagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 19771837  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||    
T  19771836 ttttctaggccatgttatttttggt 19771812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 22331097 - 22331421
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22331097 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22331196  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22331197 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 22331296  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22331297 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 22331396  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| ||| || |||||||||||    
T  22331397 ttttctaggctatgttatttctggt 22331421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22136844 - 22136520
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22136844 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttactaatgcacct 22136745  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22136744 ggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 22136645  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22136644 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 22136545  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  22136544 ttttctaggccatgttatttctggt 22136520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25428536 - 25428276
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| || || || || ||||| || ||||| |    
T  25428536 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatg 25428437  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  25428436 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 25428337  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25428336 gtgtgaattctagttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 25428276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27612530 - 27612206
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  27612530 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 27612431  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  27612430 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 27612331  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27612330 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 27612231  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27612230 ttttctaggccatgttatttctggt 27612206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40710940 - 40710636
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  40710940 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 40710841  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  40710840 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 40710741  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  40710740 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 40710641  T
Q  318 atttc 322  Q
    |||||    
T  40710640 atttc 40710636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41773018 - 41772694
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  41773018 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 41772919  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  41772918 agagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaag 41772819  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  41772818 aagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaatttttatgctaaattgtctaaatgtgaattctggttgaaagaagtgag 41772719  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  41772718 ttttctaggccatgttatttctggt 41772694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27520582 - 27520258
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  27520582 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 27520483  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  27520482 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaagactgaag 27520383  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27520382 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 27520283  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27520282 ttttctaggccatgttatttctggt 27520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16358587 - 16358354
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16358587 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 16358488  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16358487 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 16358388  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16358387 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 16358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Original strand, 27666791 - 27667020
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  27666791 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttgatttactcca 27666890  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27666891 agactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 27666990  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  27666991 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 27667020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34568579 - 34568346
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  34568579 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 34568480  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34568479 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 34568380  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34568379 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 34568346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 29474283 - 29474607
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  29474283 gattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 29474382  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  29474383 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 29474482  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  29474483 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgataaattatcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 29474582  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  29474583 ttttctaggccatgttatttctggt 29474607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22350095 - 22349771
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  22350095 gattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 22349996  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  22349995 ggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 22349896  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  22349895 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgag 22349796  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22349795 ttttcttggccatgttatttatggt 22349771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 27683610 - 27683934
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  27683610 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 27683709  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || | |||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  27683710 ggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttgatttactccaagactgacg 27683809  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||    
T  27683810 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttcaaagaagtgag 27683909  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||    
T  27683910 ttttctaggccatgttatctctggt 27683934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18781290 - 18780966
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || || |||||     
T  18781290 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaacgcacct 18781191  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18781190 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 18781091  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | | ||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  18781090 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaattctgattgaaggaagtaag 18780991  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  18780990 ttttcttggccatgttatttctggt 18780966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 28893152 - 28893477
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||    
T  28893152 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccg 28893251  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  28893252 ggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaag 28893351  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| |||||    
T  28893352 aggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgag 28893451  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||    
T  28893452 ttttctaggccatgtcatttctggta 28893477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 28921978 - 28922303
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||    
T  28921978 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccg 28922077  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  28922078 ggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaag 28922177  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| |||||    
T  28922178 aggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgag 28922277  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||    
T  28922278 ttttctaggccatgtcatttctggta 28922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 21935489 - 21935719
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  21935489 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 21935588  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21935589 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 21935688  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  21935689 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 21935719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23507751 - 23507521
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  23507751 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 23507652  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  ||| || ||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  23507651 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 23507552  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  23507551 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23507521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 335
Target Start/End: Original strand, 22234142 - 22234463
Alignment:
Q  14 ggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatg 113  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||| ||    
T  22234142 ggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttgtg 22234241  T
Q  114 gaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgcca 213  Q
    || || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||||      
T  22234242 gagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcag 22234341  T
Q  214 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggcca 313  Q
    | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  22234342 atcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggcca 22234441  T
Q  314 tattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  22234442 tattatttctagtagtggtatt 22234463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25850225 - 25849900
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  25850225 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatt 25850126  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| |  || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||  |||||| ||  ||    
T  25850125 tatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatcttgatttattcgaagaatgaagaggagcat 25850026  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  25850025 gcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 25849926  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  25849925 gtcacattatttctggtagtggtatt 25849900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20778070 - 20777746
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  20778070 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 20777971  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||   ||||||    
T  20777970 gtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatattttgatctattctaaaattgaaga 20777871  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||| | ||||| ||  | ||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  20777870 ggaacacgccaaacacctaaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 20777771  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggta 327  Q
    || || |||||| ||| ||||||||    
T  20777770 ttcctaggccatgttacttctggta 20777746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20801482 - 20801249
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | || || || |||||||| || ||||| |    
T  20801482 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactcca 20801383  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  20801382 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaa 20801283  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  20801282 agaggtaagtttccttggccatgtcatttctggt 20801249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22504829 - 22504504
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |  || ||||| ||    
T  22504829 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgagcctggtgtgtt 22504730  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||   ||||| ||  ||    
T  22504729 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaagaacgaagaggagcat 22504630  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  22504629 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 22504530  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  22504529 gtcacattatttctggtagtggtatt 22504504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914948
Alignment:
Q  19 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  119 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 218  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  219 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 318  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  28914840 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28914939  T
Q  319 tttctggta 327  Q
    |||||||||    
T  28914940 tttctggta 28914948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 327
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930216
Alignment:
Q  19 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| || ||||| ||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  119 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 218  Q
     ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||| | ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  219 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 318  Q
     ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |    
T  28930108 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtca 28930207  T
Q  319 tttctggta 327  Q
    |||||||||    
T  28930208 tttctggta 28930216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22464108 - 22463785
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  22464108 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 22464009  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  22464008 gtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaactgaaga 22463909  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| | ||| ||||||    
T  22463908 ggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtacgagttctggttaagtgaagtgagt 22463809  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||| |||||| |||||||||||    
T  22463808 tttctaggccatgttatttctggt 22463785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 21562234 - 21562500
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| |||||  |     
T  21562234 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgtct 21562333  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||  |||| || |||||| ||||||    
T  21562334 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcctgatttattctaagactgaag 21562433  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt 268  Q
    ||||  ||||  ||||||| ||  |||| || |||||| |||| || |||||| | |||||||||||    
T  21562434 aagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgttgaaggaaaaaaagctgtatgccaagtt 21562500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20344432 - 20344115
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || |  || ||||| ||    
T  20344432 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgtgcctggtgtgtt 20344333  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||  ||    
T  20344332 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggagcat 20344233  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  20344232 gcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 20344133  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    | || |||||||||||||    
T  20344132 gtcacattatttctggta 20344115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Original strand, 21679212 - 21679321
Alignment:
Q  226 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679212 ttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctgg 21679311  T
Q  326 tagtgatatt 335  Q
    ||||| ||||    
T  21679312 tagtggtatt 21679321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 24796615 - 24796940
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  24796615 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 24796714  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||  ||| || ||  ||    
T  24796715 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatttattccaagaatgaggaggagcat 24796814  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| |    
T  24796815 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttacatgaagtaagttttctgg 24796914  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  24796915 gtcacattatttctggtagtggtatt 24796940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 37541599 - 37541924
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  37541599 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 37541698  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | | | |||   |||||||| || || ||||| |||||| | || || || |||  ||| || ||| |     
T  37541699 tatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattctaatctattccaagaatgaggaggaacac 37541798  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  37541799 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 37541898  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || ||||||| |||||||| ||||    
T  37541899 gtcacattatttatggtagtggtatt 37541924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20823610 - 20823286
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  20823610 attaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 20823511  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || || ||  |||||||    
T  20823510 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatattgatctattcaaaaactgaaga 20823411  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  20823410 ggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 20823311  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggta 327  Q
    || || |||||  ||||||||||||    
T  20823310 ttcctcggccacgttatttctggta 20823286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24583277 - 24583047
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24583277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24583178  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||| ||| |||||  ||||  |||||||||   |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24583177 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 24583078  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  24583077 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24583047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 17267552 - 17267868
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  17267552 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 17267651  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| | | | |||   ||||| || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  17267652 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 17267751  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||  |||   |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||| | || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  17267752 gcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtaagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 17267851  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  17267852 gtcatattatttctggt 17267868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Original strand, 14885211 - 14885534
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 111  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||||    
T  14885211 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgttttta 14885310  T
Q  112 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 211  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||| | ||    
T  14885311 tggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggaacacgc 14885410  T
Q  212 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 311  Q
      ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||     
T  14885411 agagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagtttcctgggt 14885510  T
Q  312 catattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  14885511 cacattatttctggtagtggtatt 14885534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 24618700 - 24618838
Alignment:
Q  197 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 296  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24618700 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24618799  T
Q  297 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24618800 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24618838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 24714931 - 24715069
Alignment:
Q  197 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 296  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24714931 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24715030  T
Q  297 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24715031 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24715069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 24747959 - 24748097
Alignment:
Q  197 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 296  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | |||     
T  24747959 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24748058  T
Q  297 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24748059 gtaagttttctgggccatattattcctggtagtggtatt 24748097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23442104 - 23442060
Alignment:
Q  282 ttctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23442104 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgtcatttctggt 23442060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 335
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2213
Alignment:
Q  22 atatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacat 121  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||  || ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  122 gaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttg 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  222 aagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattattt 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggtcatgttattt 2199  T
Q  322 ctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||| ||||    
T  2200 ctggtagtggtatt 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 495294 - 494959
Alignment:
Q  1 tgattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||    
T  495294 tgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcc 495195  T
Q  101 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 200  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  495194 aggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtctgaa 495095  T
Q  201 gaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga 300  Q
    |||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  495094 gaagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagttctggttgaatgaggtga 494995  T
Q  301 gttttcttggccat-attatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  494994 gttttcttggccatgtttatttctggtagtggtatt 494959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 453252 - 453577
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  453252 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 453351  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |  ||| ||||||||||  ||    
T  453352 tatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagactgaagaagagcat 453451  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  453452 gcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaagaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagatttcttg 453551  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  453552 gccacattatttctggtagtggtatt 453577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 515392 - 515717
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  515392 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatt 515491  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || |||  |||||| ||| |     
T  515492 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaagaggaacac 515591  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  515592 gcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 515691  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  515692 gtcacattatttctggtagtggtatt 515717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5386 - 5054
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | ||| ||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  5386 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacgaatgcgcca 5287  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5286 ggtgtgttcatg-agtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttgatatactccaagactgaag 5188  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5187 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgcaaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgag 5088  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5087 ttttcttggccatgttatttctgctagtggtatt 5054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11397 - 11196
Alignment:
Q  1 tgattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcacc 100  Q
    |||||||  |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11397 tgattaaggtgaaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacc 11298  T
Q  101 gggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaa 200  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |||||    
T  11297 tggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaa 11198  T
Q  201 ga 202  Q
    ||    
T  11197 ga 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 10772 - 11100
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  10772 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 10871  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10872 ggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaag 10971  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  10972 aagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaag 11071  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11072 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 16964 - 17292
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  16964 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 17063  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17064 ggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaag 17163  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  17164 aagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaag 17263  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17264 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 17292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Original strand, 24348 - 24654
Alignment:
Q  21 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 120  Q
    |||||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||  |||| |||| ||||||||||  || |||||| || ||  |||| |||||||| ||||    
T  24348 gatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtaca 24447  T
Q  121 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||    ||||||    
T  24448 tgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttgatatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcattt 24547  T
Q  221 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24548 gaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaaatgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctaggccatgttatt 24647  T
Q  321 tctggta 327  Q
    |||||||    
T  24648 tctggta 24654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 24818798 - 24819126
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  24818798 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 24818897  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24818898 ggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaag 24818997  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  24818998 aagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatgaagtaag 24819097  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24819098 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 24819126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 30010752 - 30011085
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||| ||||| ||     
T  30010752 gattaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaatgcgcca 30010851  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  30010852 ggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgagg 30010951  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||| ||| | |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||    
T  30010952 aggaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaagttatcgatgtgcgaattctggttgaacgaagtgag 30011051  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30011052 ttttctcggtcatattatttctggtagtgatatt 30011085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 30209493 - 30209819
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | ||| || ||    
T  30209493 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtgtt 30209592  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||    
T  30209593 tatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggaggaacat 30209692  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    | | | |||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  30209693 gtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttctcg 30209792  T
Q  310 gccatatta-tttctggtagtgatatt 335  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||    
T  30209793 atcatattattttctggtagtgttatt 30209819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 23098594 - 23098919
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  23098594 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 23098693  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||||| | | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||  ||    
T  23098694 tatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattctaagactgaagaagagcat 23098793  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||| ||||| ||| | |||| || || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  23098794 gccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctcg 23098893  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  23098894 gccacattatttctggtagtggtatt 23098919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27373144 - 27372820
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  27373144 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 27373045  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  27373044 ggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 27372945  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27372944 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 27372845  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27372844 ttttctaggccatgttatttctggt 27372820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23073738 - 23073405
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  23073738 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 23073639  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23073638 ggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 23073539  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| || | |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23073538 aagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 23073439  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23073438 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 23073405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23112603 - 23112278
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  23112603 tgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 23112504  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  23112503 tatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 23112404  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  23112403 gcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 23112304  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23112303 gccatattatttctagtagtggtatt 23112278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24711909 - 24711585
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  24711909 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 24711810  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24711809 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 24711710  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24711709 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 24711610  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  24711609 ttttctaggccatgttatttctggt 24711585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 23106296 - 23106629
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  23106296 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 23106395  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23106396 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 23106495  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  23106496 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattatggttaaaagaagtgag 23106595  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23106596 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 23106629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Original strand, 41606953 - 41607274
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  41606953 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 41607052  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41607053 ggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 41607152  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  41607153 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 41607252  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  41607253 ttttctaggccatgttatttct 41607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 22734355 - 22734675
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || || ||||||||| || |||||||||     
T  22734355 gatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttataaatgcacctggagtatttatgt 22734454  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | ||||||||||| || |||||||  | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  22734455 agtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 22734554  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  22734555 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtaaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 22734654  T
Q  315 attatttctggtagtgatatt 335  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  22734655 gttatttctggtagtggtatt 22734675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10870725 - 10870405
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  10870725 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 10870626  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10870625 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 10870526  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10870525 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10870426  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  10870425 ttttctaggccatgttatttc 10870405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24264245 - 24263921
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  24264245 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 24264146  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24264145 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 24264046  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||| |||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24264045 aggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 24263946  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  24263945 ttttctaggccatgttatttctggt 24263921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 24875318 - 24875642
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  24875318 gattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 24875417  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24875418 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttgatttactccaagactgaag 24875517  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  24875518 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgag 24875617  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24875618 ttttcttggccatgttatttctggt 24875642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Original strand, 21143700 - 21143933
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  21143700 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 21143799  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21143800 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 21143899  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21143900 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 21143933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16927219 - 16926915
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  16927219 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 16927120  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  16927119 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 16927020  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  16927019 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 16926920  T
Q  318 atttc 322  Q
    |||||    
T  16926919 atttc 16926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17000859 - 17000555
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  17000859 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 17000760  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  17000759 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 17000660  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  17000659 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtt 17000560  T
Q  318 atttc 322  Q
    |||||    
T  17000559 atttc 17000555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9486000 - 9485767
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  9486000 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 9485901  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9485900 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 9485801  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9485800 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 9485767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27219800 - 27219571
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  27219800 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 27219701  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27219700 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 27219601  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  27219600 agaagtgagttttctaggccatgttatttc 27219571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 44384138 - 44384458
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  44384138 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 44384237  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  44384238 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 44384337  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  44384338 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 44384437  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  44384438 ttttctaggccatgttatttc 44384458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Original strand, 22323581 - 22323748
Alignment:
Q  159 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 258  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  22323581 gttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagcttt 22323680  T
Q  259 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  22323681 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttgtttctggt 22323748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45534609 - 45534482
Alignment:
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  45534609 atgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttct 45534510  T
Q  308 tggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||    
T  45534509 cggtcatattatttctggtagtggtatt 45534482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23278632 - 23278318
Alignment:
Q  21 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 120  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  23278632 gatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 23278533  T
Q  121 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 220  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  23278532 tgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatct 23278433  T
Q  221 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 320  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23278432 gaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatt 23278333  T
Q  321 tctggtagtgatatt 335  Q
    | |||||||| ||||    
T  23278332 tttggtagtggtatt 23278318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Original strand, 24706156 - 24706374
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| || | ||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  24706156 tttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 24706255  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24706256 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 24706355  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  24706356 tggccatgttatttctggt 24706374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 19650626 - 19650951
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  ||  || || || || ||||| ||    
T  19650626 tgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgtcactaacgcgcctggtgtgtt 19650725  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| ||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| | ||||| ||  ||    
T  19650726 catggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaccgaagaggagcat 19650825  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  19650826 gcagagcatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctagttaagtgaagtaagttttcttg 19650925  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19650926 gccacattatttctggtagtggtatt 19650951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Original strand, 21323847 - 21324156
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||| |||| || ||||||||||    
T  21323847 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttttggtgttaccaatacacctggagtatttatgg 21323946  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  21323947 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctga 21324046  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21324047 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 21324146  T
Q  315 attatttctg 324  Q
     | |||||||    
T  21324147 gtcatttctg 21324156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264596
Alignment:
Q  162 gtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatg 261  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 25264670  T
Q  262 ccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25264669 ccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 25264596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23189793 - 23189470
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  23189793 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 23189694  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  23189693 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgagg 23189594  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||  | || ||    
T  23189593 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg-attctggttgaagaaagtaag 23189495  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  23189494 ttttctgggccatgttatttctggt 23189470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12576220 - 12575904
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  12576220 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 12576121  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  12576120 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 12576021  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||  |||| || |||||||| ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  12576020 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgaattttggctaagtgaagtgagtttccttg 12575921  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  12575920 gtcatattatttctggt 12575904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24677364 - 24677040
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  24677364 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 24677265  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    |  || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  24677264 gtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaag 24677165  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24677164 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 24677065  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  24677064 ttttctgggccatgttatttctggt 24677040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27789607 - 27789291
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  27789607 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 27789508  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  27789507 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 27789408  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  27789407 gcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 27789308  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  27789307 gtcatattatttctggt 27789291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24950455 - 24950132
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| || |    
T  24950455 aaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttca 24950356  T
Q  112 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 211  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||  ||||| ||  |||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||||    
T  24950355 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgtatttgttgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcatgc 24950256  T
Q  212 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 311  Q
      | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  24950255 agaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttatggttaagtgaagtgagtcttcttggc 24950156  T
Q  312 catattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||  ||| |||| |||||| ||||    
T  24950155 caccttacttctcgtagtggtatt 24950132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 24829847 - 24830077
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  24829847 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 24829946  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||| |  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  24829947 agtctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttcaa 24830046  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  24830047 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 24830077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1065618 - 1065293
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  1065618 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 1065519  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  1065518 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 1065419  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |    
T  1065418 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctgattaaatgaagtaagttttctgg 1065319  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  1065318 gtcacattatttctggtagtggtatt 1065293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31832525 - 31832200
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31832525 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 31832426  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  31832425 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 31832326  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| || |||||||| |    
T  31832325 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctgg 31832226  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  31832225 gtcacattatttctggtagtggtatt 31832200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9337366 - 9337209
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  9337366 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 9337267  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 250  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  9337266 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 9337209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23295659 - 23295477
Alignment:
Q  153 tttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaa 252  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||||||||    
T  23295659 tttgtggttgtgtttattgatgacatcctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaa 23295560  T
Q  253 agttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  23295559 agttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtgagttttctgggccacattattttgggtagtggtatt 23295477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 19717593 - 19717918
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  19717593 tgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgtt 19717692  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||   |||||||| ||||| |||||| | || || |||||| |||||||  |  ||    
T  19717693 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaagatcagcat 19717792  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || ||||| |    
T  19717793 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagatttctag 19717892  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19717893 gccacattatttctggtagtggtatt 19717918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22279879 - 22279659
Alignment:
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||| || ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || || ||  | ||    
T  22279879 gtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaatcgaagga 22279780  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22279779 ggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagt 22279680  T
Q  303 tttcttggccatattatttct 323  Q
    || ||||| ||| | ||||||    
T  22279679 ttccttggtcatgtgatttct 22279659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 330
Target Start/End: Original strand, 27208979 - 27209068
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27208979 tgaaagagagaaagttgtatgccaacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttctggtagtg 27209068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25255786 - 25255654
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| |  ||||| ||    
T  25255786 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgtt 25255687  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctta 142  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  25255686 tatggagtatatgaaccgaattttccatgctta 25255654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 14510 - 14843
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  14510 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 14609  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  14610 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagattgaag 14709  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14710 aagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 14809  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14810 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14743 - 14418
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||||||| ||| |||||| |||||     
T  14743 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacct 14644  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14643 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaag 14544  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14543 aagagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttag 14444  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14443 ttttcttggccatgttatttcgggta 14418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3856
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||| | ||     
T  4189 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatacgcca 4090  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4089 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagactgaag 3990  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3989 aagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 3890  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  3889 ttttcttggcaatgttatttctggtagtggtatt 3856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 40372 - 40697
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  40372 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 40471  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  40472 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 40571  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  40572 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 40671  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  40672 gtcacattatttctggtagtggtatt 40697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45763
Alignment:
Q  197 tgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgag 296  Q
    |||||||||  |||| || ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||     
T  45626 tgaagaagagcatgcaaaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaagaagttgtatgctaa-ttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 45724  T
Q  297 gtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  45725 gtaagttttcttggccacattatttctggttgtggtatt 45763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 45466 - 45628
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||   | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  45466 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 45565  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattga 172  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||    
T  45566 catggagtatatgaaccaaattttccatgcttacttggataaatttgtggttgtgtttattga 45628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 5920 - 6245
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || | ||||||||||  || |||||| || ||     
T  5920 gattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcggtgttacaaacgcgcca 6019  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6020 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactctaaggctgaag 6119  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6120 aagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtcat 6219  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6220 ttttcttggtcatgttatttctggta 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22980 - 22647
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||||| ||| ||     
T  22980 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcgttgttacaactgcgcca 22881  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttgatatactctaagtctgaag 22781  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22780 aagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtaag 22681  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  22680 ttttcttggccatgttatttttggtagtggtatt 22647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 37851 - 38175
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  37851 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 37950  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || || ||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  37951 ggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 38050  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  38051 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 38150  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  38151 ttttcttggccatgttatttctggt 38175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 24564 - 24897
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  24564 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcca 24663  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24664 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagactgaag 24763  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24764 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 24863  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  24864 ttttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 24897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 150836 - 150511
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  150836 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 150737  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||  | ||||  || ||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  150736 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacattttgatttattctaagactgaagaagagcat 150637  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  150636 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttaagtgaggtaagttttcttg 150537  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  150536 gccacattatttctggaagtggtatt 150511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Original strand, 193974 - 194068
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  193974 tgaaagaaaagaagtcgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 194068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 14849147 - 14849467
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||||    
T  14849147 gatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgcctttcggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatgg 14849246  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   |    
T  14849247 agtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagtccgaagaagaacatgttga 14849346  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  14849347 gcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccaa 14849446  T
Q  315 attatttctggtagtgatatt 335  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  14849447 gttatttctggtagtggtatt 14849467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14696356 - 14696024
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| ||| | |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||   || ||||||||| || |    
T  14696356 attaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttttggtgttacaaatgcgccag 14696257  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14696256 gtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcgaagtccgaaga 14696157  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14696156 agaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggtgagt 14696057  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14696056 tttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 14696024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8708142 - 8707822
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| || || | |||||| |||||||    
T  8708142 gatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatgg 8708043  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||  |    
T  8708042 agtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcaga 8707943  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || |||||| ||||||||    
T  8707942 gcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttattggccat 8707843  T
Q  315 attatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  8707842 attatttctggtagtggtatt 8707822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23957991 - 23957667
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  23957991 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 23957892  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  23957891 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 23957792  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23957791 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 23957692  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  23957691 ttttctaggccatgttatttctggt 23957667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 8051391 - 8051715
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  8051391 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 8051490  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  8051491 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 8051590  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  8051591 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 8051690  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  8051691 ttttctaggccatgttatttctggt 8051715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27713580 - 27713256
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  27713580 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 27713481  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  27713480 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 27713381  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  27713380 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctagttgaaagaagtgag 27713281  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  27713280 ttttctaggccatgttatttctggt 27713256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40475284 - 40474960
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  40475284 gattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 40475185  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  40475184 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 40475085  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  40475084 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 40474985  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  40474984 ttttctaggccatgttatttctggt 40474960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14161700 - 14161381
Alignment:
Q  16 atgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgga 115  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||  || | | |||||||| || |||||||||||    
T  14161700 atgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgcctttcggtgtttctaatgcacctggagtatttatgga 14161601  T
Q  116 atacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaag 215  Q
     || |||||  | ||||||||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| |||||  | || || ||| || | ||||||||| ||||  ||    
T  14161600 gtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatcctaatttattctgagacagaagaagaacatgctgag 14161501  T
Q  216 catttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccata 315  Q
    ||||||||| ||||| | || ||| |||| || |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14161500 catttgaagattgttctacaggtgttgaaggaaagtaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccaca 14161401  T
Q  316 ttatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  14161400 ttatctctggtagtggtatt 14161381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12478753 - 12478520
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  12478753 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 12478654  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12478653 agaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 12478554  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12478553 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 12478520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Original strand, 19776652 - 19776885
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  19776652 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 19776751  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19776752 agaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 19776851  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19776852 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 19776885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 14301747 - 14302071
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  14301747 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 14301846  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  14301847 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 14301946  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14301947 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 14302046  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  14302047 ttttctaggccatgttatttctggt 14302071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14682705 - 14682487
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||     
T  14682705 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaaaagaac 14682606  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14682605 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttct 14682506  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14682505 tggccatgttatttctggt 14682487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15323370 - 15323128
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||    
T  15323370 aatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattgtaatttattcta 15323271  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||  |||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  15323270 agagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaag 15323171  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15323170 tgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 15323128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8388640 - 8388336
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  8388640 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 8388541  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  8388540 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagca 8388441  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8388440 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatgtt 8388341  T
Q  318 atttc 322  Q
    |||||    
T  8388340 atttc 8388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 15145653 - 15145977
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  15145653 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgttaccaatgcacct 15145752  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15145753 ggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 15145852  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||  ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15145853 aagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 15145952  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  15145953 ttttcttggccatgttatttctggt 15145977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 18225214 - 18225547
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  18225214 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 18225313  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||  | |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18225314 ggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaag 18225413  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||       
T  18225414 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtacc 18225513  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18225514 ttttcttggccatgttatttctggtgatgatatt 18225547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15072595 - 15072270
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15072595 tgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15072496  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||| ||||  ||    
T  15072495 tatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaataagagcat 15072396  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  15072395 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 15072296  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || ||||||||| |||||| ||||    
T  15072295 gtcacattatttcttgtagtggtatt 15072270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16149947 - 16149622
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||    
T  16149947 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgtt 16149848  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||||||||  ||    
T  16149847 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactgaagaagagcat 16149748  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||     
T  16149747 gcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttt 16149648  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16149647 gccacattatttctggtagtggtatt 16149622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16154093 - 16153768
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| ||||| ||    
T  16154093 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgtt 16153994  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || || | | ||||||||||  ||    
T  16153993 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattctgatttattcaatgactgaagaagagcat 16153894  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||     
T  16153893 gcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctta 16153794  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16153793 gccacattatttctggtagtggtatt 16153768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 3262830 - 3263155
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  3262830 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 3262929  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  3262930 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 3263029  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  3263030 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 3263129  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  3263130 gtcacattatttctggtagtggtatt 3263155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 15001401 - 15001725
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || | ||| ||    
T  15001401 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgatactaatgcgcctgttgtgtt 15001500  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||  |||||||||  ||    
T  15001501 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagattgaagaagagcat 15001600  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||  || ||||| | |||||| | ||| || ||||||||||    
T  15001601 gcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtgagt-ctggttaagtgaagtaagttttcttg 15001699  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15001700 gccacattatttctggtagtggtatt 15001725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 44659902 - 44660227
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  44659902 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtatt 44660001  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  44660002 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 44660101  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||| | | ||| ||||| ||||| |    
T  44660102 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggctaagtgaagtgagctttctgg 44660201  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
      || |||||||||||||||| ||||    
T  44660202 atcacattatttctggtagtggtatt 44660227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27902629 - 27902297
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  27902629 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctg 27902530  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    | || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||   | |||   || || || || || |||||  |||||||||| || |||||| |||||||    
T  27902529 gagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatattttgatttattctaagactgaaga 27902430  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||  ||||  | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||||    
T  27902429 ggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctagttaaatgaagtgagt 27902330  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27902329 tttctaggccacattatttctggtagtggtatt 27902297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 51604828 - 51605144
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  51604828 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 51604927  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  51604928 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 51605027  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  51605028 gcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 51605127  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  51605128 gtcatattatttctggt 51605144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Original strand, 18613749 - 18613916
Alignment:
Q  159 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 258  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  18613749 gttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 18613848  T
Q  259 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| |||| ||||||    
T  18613849 atgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtaagttttctaggccatgttatatctggt 18613916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 250
Target Start/End: Original strand, 16234866 - 16235008
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  16234866 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 16234965  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 250  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16234966 atgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaa 16235008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Original strand, 1647306 - 1647638
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || |    
T  1647306 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctg 1647405  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| |||||||| || |||||| | ||||| ||||||| | | |||   || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  1647406 gtgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagactgaaga 1647505  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||  ||||  | ||  ||||| |||| ||||   | |||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  1647506 ggagcatgcagaacacctgaagattgtgttgcggattctgaaagaaagaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 1647605  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  1647606 tttgttggccacgtgatttctggtagtggtatt 1647638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 335
Target Start/End: Original strand, 1640322 - 1640441
Alignment:
Q  216 catttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccata 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  1640322 catttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttagccatg 1640421  T
Q  316 ttatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  1640422 ttatttctggtgatgatatt 1640441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 15357156 - 15357481
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15357156 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15357255  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || |  ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  15357256 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcat 15357355  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||  | ||||||||||    
T  15357356 gcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaattaagttttcttg 15357455  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15357456 gccacattatttctggtagtggtatt 15357481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 29451573 - 29451898
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  29451573 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 29451672  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  29451673 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 29451772  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||| |||| || || |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  29451773 gcagatcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 29451872  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  29451873 gtcatattatttctggtagtggtatt 29451898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 17092933 - 17093165
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  17092933 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 17093032  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  17093033 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagca 17093132  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 250  Q
    | ||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  17093133 tctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaa 17093165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 15291277 - 15291507
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | || | |||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15291277 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 15291376  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15291377 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 15291476  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  15291477 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15291507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16218474 - 16218323
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||||   |     
T  16218474 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtca 16218375  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 153  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16218374 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16218323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16221794 - 16221643
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||   || |||||| |||  || ||||||||   |     
T  16221794 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttcggtgttacaaatgtgtca 16221695  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgtt 153  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  16221694 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtt 16221643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 11205268 - 11205436
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  11205268 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 11205367  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatat 178  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11205368 tatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatat 11205436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 326
Target Start/End: Original strand, 29037428 - 29037496
Alignment:
Q  258 tatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29037428 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 29037496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15258164 - 15257990
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  15258164 tgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 15258065  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgat 184  Q
     |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |  ||   ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15258064 catggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttgat 15257990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17151 - 16819
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||  || ||| ||||| ||     
T  17151 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-cctttcggtgttaccaatgcgcca 17053  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17052 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagactgaag 16953  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  16952 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgtcaattctgattgaaagaggtgag 16853  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16852 tgtttttggcaatgttatttctggtagtgatatt 16819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Original strand, 111775 - 111852
Alignment:
Q  258 tatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  111775 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttctggtggtggtatt 111852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 15252 - 15585
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||   || ||| ||||||  || ||||||||| ||     
T  15252 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcggtgttacaaatgcgcca 15351  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15352 ggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagactgaag 15451  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15452 aagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctagttgaaagaggtgag 15551  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15552 ttttcttggccatgtaatttctggtagtggtatt 15585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 335
Target Start/End: Original strand, 27283 - 27611
Alignment:
Q  6 aaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtg 105  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||| ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||| || | ||||||||||  || ||| ||||| ||||| |    
T  27283 aaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggag 27382  T
Q  106 tatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 205  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  27383 tatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctgatatactctaagtctgaggagga 27482  T
Q  206 aaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttt 305  Q
    | ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  27483 acatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgagaattctggttgaacga-gtgagtttt 27581  T
Q  306 cttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27582 cttggtcatattatttctggtagtggtatt 27611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21394 - 21062
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||    | ||| ||||||  || ||| ||||| || |    
T  21394 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctttcggtgttactaatgcgcctg 21295  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||||| ||||| ||  |||| |||||| | || || |||||| |||||||    
T  21294 gtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattctaatttattctaagactgaaga 21195  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||  || ||| | || ||||| | | | || |||    
T  21194 ggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaataagttgtatgctaaattgttgaaatgttagttttggttaagtaaagtaagt 21095  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21094 tttcttggtcacattatttctggtagtggtatt 21062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15261493 - 15261168
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || || |||||| ||     
T  15261493 gattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttagaaatgcgcca 15261394  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||    
T  15261393 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttgatatattccaagactgaag 15261294  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15261293 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 15261194  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15261193 ttttcttggccatgttatttctggta 15261168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 323
Target Start/End: Original strand, 15014031 - 15014344
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||||  || ||| || || || || || ||    
T  15014031 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggagtgtt 15014130  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||| | || || ||| ||    
T  15014131 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattctaatatactctaagaccgaggaggaacat 15014230  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||| ||||||  |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15014231 gccgagcattgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttg 15014330  T
Q  310 gccatattatttct 323  Q
    ||||||||||||||    
T  15014331 gccatattatttct 15014344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17491713 - 17491380
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||| || ||||||||||||     
T  17491713 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcagtgttacaaatgcacct 17491614  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| || |||||| | | ||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17491613 ggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttactccaagtctgaag 17491514  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17491513 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 17491414  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17491413 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 17491380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 15723201 - 15723525
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  15723201 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 15723300  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15723301 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 15723400  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15723401 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 15723500  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  15723501 ttttctaggccatgttatttctggt 15723525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 266
Target Start/End: Original strand, 11889638 - 11889811
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11889638 aatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttgatatactcta 11889737  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaag 266  Q
    ||| | | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11889738 agtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaag 11889811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10007463 - 10007139
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  10007463 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 10007364  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10007363 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 10007264  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10007263 aagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10007164  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  10007163 ttttctaggccatgttatttctggt 10007139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 48427294 - 48426986
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  48427294 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 48427195  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  48427194 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgccgagca 48427095  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  48427094 tctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgtt 48426995  T
Q  318 atttctggt 326  Q
    |||||||||    
T  48426994 atttctggt 48426986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 322
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346832
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || ||||    
T  15346522 aaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 15346621  T
Q  112 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 211  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  15346622 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 15346721  T
Q  212 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 311  Q
      ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  15346722 tgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggc 15346821  T
Q  312 catattatttc 322  Q
    ||| |||||||    
T  15346822 catgttatttc 15346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13254462 - 13254229
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  13254462 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 13254363  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13254362 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 13254263  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13254262 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 13254229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10908073 - 10907749
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  10908073 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 10907974  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10907973 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 10907874  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  10907873 aagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 10907774  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  10907773 ttttctaggccatgttatttctggt 10907749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 11950172 - 11950492
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  11950172 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 11950271  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  11950272 catggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaagagcat 11950371  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  11950372 gcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 11950471  T
Q  310 gccatattatttctggtagtg 330  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  11950472 gccacattatttctggtagtg 11950492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 20060321 - 20060645
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  20060321 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 20060420  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20060421 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 20060520  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20060521 aagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaagtgag 20060620  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  20060621 ttttctaggccatgttatttctggt 20060645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17188239 - 17187914
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  17188239 tgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 17188140  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| || || | | |||| |||||  ||    
T  17188139 catggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggactgaggaagagcat 17188040  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  17188039 gcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 17187940  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  17187939 gccacattatttctggtagtggtatt 17187914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 5108878 - 5109198
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  5108878 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 5108977  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  5108978 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaag 5109077  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  5109078 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 5109177  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  5109178 ttttctaggccatgttatttc 5109198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 5423197 - 5423517
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  5423197 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 5423296  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  5423297 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttgatttactctaagactgaag 5423396  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5423397 aagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattcttgttgaatgaagtgag 5423496  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  5423497 tttccttggccatgttatttc 5423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 326
Target Start/End: Original strand, 15400785 - 15401108
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||  |    
T  15400785 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacttg 15400884  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    | || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15400885 gagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaaga 15400984  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15400985 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagt 15401084  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  15401085 tttcttggccatgttatttctggt 15401108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15229460 - 15229143
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  15229460 gaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaat 15229361  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||    
T  15229360 acatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagca 15229261  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  15229260 tctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagttttcttggccacatt 15229161  T
Q  318 atttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15229160 atttctggtagtggtatt 15229143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15235328 - 15235011
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| ||  |||| ||||||||||    
T  15235328 gaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctagtgtgtttatggaat 15235229  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||    
T  15235228 acatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagca 15235129  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||  || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||| |||    
T  15235128 tctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagttttcttggccacatt 15235029  T
Q  318 atttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15235028 atttctggtagtggtatt 15235011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15341041 - 15340808
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  15341041 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactcca 15340942  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15340941 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 15340842  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15340841 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 15340808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16637545 - 16637312
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16637545 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttgatctactcca 16637446  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16637445 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 16637346  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16637345 agaagtgagttttctaggccatgttatttctggt 16637312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Original strand, 16805214 - 16805535
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  16805214 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 16805313  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  16805314 ggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaag 16805413  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
     |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  16805414 gagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 16805513  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  16805514 ttttcttggccatgttatttct 16805535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 12358791 - 12359116
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  12358791 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaaagcgcctggtgtgtt 12358890  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  12358891 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 12358990  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  12358991 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 12359090  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  12359091 gccacattatttctggtagtggtatt 12359116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Original strand, 16755059 - 16755288
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  16755059 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttgatttactcca 16755158  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||    ||||||||||||||||||    
T  16755159 agactgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtttgtgtgtgaattctggttgaa 16755258  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16755259 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 16755288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3687806 - 3687486
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||    | ||| ||||||||     
T  3687806 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggagttaccaatgcacct 3687707  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  3687706 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 3687607  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  3687606 aagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 3687507  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    |||||| || ||| |||||||    
T  3687506 ttttctaggtcatgttatttc 3687486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6602508 - 6602276
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  6602508 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 6602409  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || | ||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6602408 agaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 6602309  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6602308 tgaagtgagtttccttggccatgttatttctgg 6602276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12888572 - 12888252
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  12888572 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 12888473  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  12888472 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 12888373  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  12888372 aagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 12888273  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  12888272 tttacttggccatgttatttc 12888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 15587659 - 15587983
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  15587659 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 15587758  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15587759 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatctactccaagactgaag 15587858  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15587859 aagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 15587958  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  15587959 ttttctaggccatgttatttctggt 15587983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12500020 - 12499787
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  12500020 aatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactcca 12499921  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  12499920 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaa 12499821  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12499820 agaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 12499787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Original strand, 53383376 - 53383605
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  53383376 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 53383475  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||| || || ||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53383476 agactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 53383575  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  53383576 tgaagtgagtttccttggccatgttatttc 53383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Original strand, 14874839 - 14875090
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |    
T  14874839 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattcatggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatg 14874938  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  14874939 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaa 14875038  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||    
T  14875039 gtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggccttgttatttctggt 14875090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16693936 - 16693703
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  16693936 aatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaattttgatatactcca 16693837  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16693836 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 16693737  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16693736 agaagtaagttttcttggtcatgttatttctggt 16693703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28756183 - 28755858
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| |||||||| ||    
T  28756183 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtttt 28756084  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||  ||| || ||  ||    
T  28756083 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagcat 28755984  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  28755983 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 28755884  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  28755883 gtcacattatttctggtagtggtatt 28755858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30139588 - 30139358
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30139588 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30139489  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30139488 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30139389  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30139388 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30139358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30149139 - 30148909
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  30149139 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 30149040  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30149039 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 30148940  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  30148939 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 30148909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 31693449 - 31693774
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31693449 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31693548  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || |  ||| ||||||||||  ||    
T  31693549 tatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttatttaaagactgaagaagagcat 31693648  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  31693649 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31693748  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31693749 gccacattatttatggtagtggtatt 31693774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Original strand, 11959435 - 11959758
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 111  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||||    
T  11959435 aaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttta 11959534  T
Q  112 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 211  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||||| | | |||   ||| | |||||||| ||||| |||||||| || || || |||  |||||| ||  ||||    
T  11959535 tggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcatgc 11959634  T
Q  212 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 311  Q
      ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||     
T  11959635 agagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctgggt 11959734  T
Q  312 catattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || ||||||| |||||||| ||||    
T  11959735 cacattatttgtggtagtggtatt 11959758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 13970384 - 13970709
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13970384 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 13970483  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  13970484 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 13970583  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  13970584 gcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 13970683  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13970684 gccatattatttctggtagtggtatt 13970709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14088538 - 14088213
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14088538 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14088439  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  14088438 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 14088339  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  14088338 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 14088239  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14088238 gccatattatttctggtagtggtatt 14088213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 8272757 - 8272987
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8272757 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 8272856  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  8272857 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 8272956  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  8272957 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8272987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 18132610 - 18132935
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  18132610 tgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 18132709  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||| |||||||||||  | || || || ||| ||||||| ||   |    
T  18132710 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatatcctaatttattcaaagactgaagaggagctt 18132809  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
     |  | ||| ||| | || | ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  18132810 acggaacatctgaggattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctgattaagtgaagtgacttttcttg 18132909  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18132910 gccacattatttctggtagtggtatt 18132935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47125809 - 47125484
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  47125809 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 47125710  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||  ||| || ||  ||    
T  47125709 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaagaatgaggaggagcat 47125610  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   | || ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||| |    
T  47125609 gcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttacatgaagtaagttttctgg 47125510  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  47125509 gtcacattatttctggtagtggtatt 47125484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 13965710 - 13965941
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  13965710 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 13965809  T
Q  193 agtctgaagaagaa-aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttga 291  Q
    ||||||| ||||||  ||||  ||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||  |||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  13965810 agtctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgagttttggttga 13965909  T
Q  292 atgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
    | || |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  13965910 aggaagtgagttttcttggtcatgtgatttct 13965941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31940768 - 31940443
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || | |||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31940768 tgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31940669  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||  |||| || || ||| |||||||| |  ||    
T  31940668 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatactgatttattcaaagactgaagaatagcat 31940569  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  31940568 gcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 31940469  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  31940468 gccacattatttatggtagtggtatt 31940443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 10418302 - 10418626
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  10418302 attaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 10418401  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||| ||||| || || ||  |||||||    
T  10418402 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatcttgatctattcaaaaactgaaga 10418501  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||| |  |||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  10418502 ggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaggaagttgtatgccaagctgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaagtgagt 10418601  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||    
T  10418602 tttctaggccacgttatttctggta 10418626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12180022 - 12179878
Alignment:
Q  191 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 290  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||     
T  12180022 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 12179923  T
Q  291 aatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12179922 attgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 12179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41179387 - 41179071
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || ||||| ||||| ||    
T  41179387 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcacccggtgtgtt 41179288  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||| | | |||   || || || || || ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  41179287 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaagactgaagaagagcat 41179188  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
     |  | ||| |||   ||||  |||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  41179187 tcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 41179088  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  41179087 gtcatattatttctggt 41179071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15611885 - 15611655
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15611885 aatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 15611786  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | |||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  15611785 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagttttggttgaa 15611686  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  15611685 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 15611655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 16379192 - 16379508
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  16379192 tgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 16379291  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||| | | | |||   ||  | || || || ||||| |||||| |||| || |||||| || |||||||  ||    
T  16379292 catggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatttattctaagacttaagaagagcat 16379391  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| || ||||| ||||    
T  16379392 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttg 16379491  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | |||||||||||||||    
T  16379492 gtcatattatttctggt 16379508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 16834774 - 16835090
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  16834774 tgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 16834873  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||| | | | |||   ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || |||||| |||| || ||  ||    
T  16834874 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcctaatttattctaagactgacgaggagcat 16834973  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| |||||||| ||||    
T  16834974 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtgagtttccttg 16835073  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  16835074 gccatattatttctggt 16835090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 16327924 - 16328244
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||    | ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  16327924 tgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctttcggtgttactaacacgcctggtgtgtt 16328023  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||| | |   |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||  |||||| ||  ||    
T  16328024 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattctaagaatgaagaggagcat 16328123  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| |||||||   |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  16328124 gcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttatggttaagtgaagtgagttttctgg 16328223  T
Q  310 gccatattatttctggtagtg 330  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  16328224 gtcatattatttctggtagtg 16328244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13943889 - 13943758
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  13943889 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtgtt 13943790  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 141  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  13943789 catggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 13943758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 44779112 - 44778981
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||||||    
T  44779112 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcccggtgtatt 44779013  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 141  Q
     ||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  44779012 catggagtttatgaatcgaatttttcatgctt 44778981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 301
Target Start/End: Original strand, 15948828 - 15949036
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || || ||||| || || ||||| || ||||||||| | || || |    
T  15948828 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttggtgtattcga 15948927  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15948928 agtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaattttggttgaa 15949027  T
Q  293 tgaggtgag 301  Q
     || |||||    
T  15949028 ggaagtgag 15949036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 13318766 - 13319091
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | |||||| |||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  13318766 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 13318865  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||| || |||| ||  ||    
T  13318866 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattttaatttattccaagactaaagaggagcat 13318965  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| || | |||||| |  ||||||||| ||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  13318966 gcagaacatctgaagattatgttgcaaattttgaaagagagaaatttgtatgctaaattgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctag 13319065  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || |  ||||||||||||||| ||||    
T  13319066 gctacgttatttctggtagtggtatt 13319091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10385429 - 10385211
Alignment:
Q  117 tacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagc 216  Q
    ||||||||||| || || ||||||| | |||||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||   || |||||  ||||   ||    
T  10385429 tacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagggc 10385330  T
Q  217 atttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatat 316  Q
    || |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||    
T  10385329 atctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgggtcacat 10385230  T
Q  317 tatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  10385229 tatttctggtagtggtatt 10385211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10407833 - 10407720
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   ||  |||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  10407833 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctttctgtgttactaatgcgcctggtgtttt 10407734  T
Q  110 tatggaatacatga 123  Q
    |||||| |||||||    
T  10407733 tatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Original strand, 12510747 - 12510801
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacga 64  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12510747 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacga 12510801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 8745654 - 8745711
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8745654 tgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaata 8745711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24189169 - 24189112
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24189169 tgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaata 24189112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Original strand, 11888621 - 11888701
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgccttt 82  Q
    ||||||| |||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  11888621 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatattcggtgatgccttt 11888701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12270075 - 12269880
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||  || | ||| ||    
T  12270075 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtt 12269976  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 205  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||  |||||||||    
T  12269975 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagattgaagaaga 12269880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 12180209 - 12180167
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 52  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12180209 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 12180167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 14291796 - 14291837
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtt 51  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14291796 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtt 14291837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 217451 - 217784
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  217451 gattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccca 217550  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  217551 ggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgatatactcgaagttcgaag 217650  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  217651 aagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttctagttgaatgaggtgag 217750  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  217751 ttttcttggccacgttatttctggtagtggtatt 217784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 84558 - 84883
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | | | |||||    
T  84558 tgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgagagtatt 84657  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| |  | || ||  ||    
T  84658 tatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccaaggaggagcat 84757  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  84758 gccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaattctggttgaacaaagtgagtttccttg 84857  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||    
T  84858 gtcatattatttcagttagtggtatt 84883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 268882 - 268558
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  268882 attaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 268783  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   || || || ||||| || || ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  268782 gtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatattttgatttattctaaaactgaaga 268683  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||| | ||| | ||  ||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  268682 ggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagt 268583  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggta 327  Q
    || || |||||| ||||||||||||    
T  268582 ttcctaggccatgttatttctggta 268558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 133 - 327
Target Start/End: Original strand, 18965599 - 18965793
Alignment:
Q  133 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  18965599 ttcatgcttatttagatcgctttgttgttttgttcattgatgatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttt 18965698  T
Q  233 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18965699 tcaagtgatgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttctggta 18965793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 268
Target Start/End: Original strand, 23085944 - 23086210
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||| |||    
T  23085944 gattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgccg 23086043  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23086044 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtatgaag 23086143  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt 268  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||| |||||    
T  23086144 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctggaggagaagaagctttatgctaagtt 23086210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080244
Alignment:
Q  19 aagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaata 118  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || |||||||||||| || || |||||||| ||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  119 catgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcat 218  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||  |||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  219 ttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatta 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtta 23080261  T
Q  319 tttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  23080260 tttttggtagtggtatt 23080244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 327
Target Start/End: Original strand, 18196024 - 18196231
Alignment:
Q  120 atgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatt 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  18196024 atgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatt 18196123  T
Q  220 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||    
T  18196124 tgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttat 18196223  T
Q  320 ttctggta 327  Q
    ||||||||    
T  18196224 ttctggta 18196231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 25608121 - 25608367
Alignment:
Q  89 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 188  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  25608121 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatttac 25608220  T
Q  189 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 288  Q
    || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25608221 tccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggt 25608320  T
Q  289 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25608321 tgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 25608367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 20634126 - 20634446
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||    
T  20634126 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatgg 20634225  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||  |    
T  20634226 agtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctaaagaagaacatgctga 20634325  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  20634326 gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacat 20634425  T
Q  315 attatttctggtagtgatatt 335  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  20634426 gttatttctggtagtggtatt 20634446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18450585 - 18450286
Alignment:
Q  28 agaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcg 127  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| |  | ||||||||||  || ||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || ||    
T  18450585 agaagacgacctttaggacacgttacagaaattacgaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctgggagtatttatggaatatattaaccg 18450486  T
Q  128 tatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagttt 227  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |   | || ||| ||| | |||||||||   ||    
T  18450485 tatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgatatactctaaattcaaggaggaacatgtcgagcatttgagaatt 18450386  T
Q  228 gttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18450385 gttttgcaagtgctgaaggggaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagggagttttcttggtcatattatttctggta 18450286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 18406204 - 18406450
Alignment:
Q  89 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 188  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  18406204 tacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttac 18406303  T
Q  189 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 288  Q
    || ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  18406304 tccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaattctggt 18406403  T
Q  289 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18406404 tgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 18406450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 22760628 - 22760961
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  22760628 gattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 22760727  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22760728 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgatattttgatttactccaagtctgaag 22760827  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22760828 aagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 22760927  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  22760928 ctttcttggacatgttatttgtggtagtggtatt 22760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Original strand, 24293955 - 24294276
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||  |||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  24293955 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 24294054  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24294055 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 24294154  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24294155 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 24294254  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  24294255 ttttctaggccatgttatttct 24294276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 19487486 - 19487772
Alignment:
Q  33 acggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtattt 132  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           
T  19487486 acggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat------- 19487578  T
Q  133 ttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgtttt 232  Q
       |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||    
T  19487579 ---atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgtt 19487675  T
Q  233 gcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 329  Q
    ||||||| |||| |  || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19487676 gcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagt 19487772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Original strand, 22828619 - 22828852
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||| |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  22828619 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttgatttactcca 22828718  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22828719 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 22828818  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828819 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 22828852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 2872976 - 2873296
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  2872976 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 2873075  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  2873076 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 2873175  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  2873176 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaagtgag 2873275  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  2873276 tttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 327
Target Start/End: Original strand, 16961761 - 16961980
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  16961761 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 16961860  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16961861 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagtcatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttct 16961960  T
Q  308 tggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  16961961 tggccatgtcatttctggta 16961980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Original strand, 14378097 - 14378416
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14378097 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14378196  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  14378197 catggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagaggagcat 14378296  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | ||| || ||||||||||    
T  14378297 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagttttcttg 14378396  T
Q  310 gccatattatttctggtagt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14378397 gccacattatttctggtagt 14378416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Original strand, 14379647 - 14379966
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  14379647 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 14379746  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  14379747 catggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagaggagcat 14379846  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | ||| || ||||||||||    
T  14379847 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagttttcttg 14379946  T
Q  310 gccatattatttctggtagt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14379947 gccacattatttctggtagt 14379966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 5837392 - 5837717
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  5837392 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 5837491  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||| |||| |    
T  5837492 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattctgatttattccaagactgagg 5837591  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5837592 aagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgccaagttgtctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 5837691  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5837692 ttttcttggccacgttatttctggta 5837717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Original strand, 28261461 - 28261690
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28261461 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28261560  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28261561 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28261660  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28261661 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28284455 - 28284226
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28284455 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28284356  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28284355 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28284256  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28284255 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Original strand, 28340210 - 28340439
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28340210 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 28340309  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28340310 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 28340409  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
     || |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28340410 agaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19455124 - 19454804
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19455124 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19455025  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || || ||| || |||||||  ||    
T  19455024 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttgatttattcaaagactaaagaagagcat 19454925  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| | || ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  19454924 gcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 19454825  T
Q  310 gccatattatttctggtagtg 330  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  19454824 gccacattatttttggtagtg 19454804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 327
Target Start/End: Original strand, 16925902 - 16926136
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || ||| |||| || ||||| || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16925902 aatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatattttgatttactcca 16926001  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16926002 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagttatctaagtgtgaattctggttgaa 16926101  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16926102 agaggtaagttttcttggccatgtcatttctggta 16926136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25114554 - 25114340
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  25114554 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttgatctactccaagactgaagaagaac 25114455  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25114454 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgtcaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttct 25114355  T
Q  308 tggccatattatttc 322  Q
    ||||||| |||||||    
T  25114354 tggccatgttatttc 25114340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Original strand, 27564112 - 27564330
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  27564112 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaattttgatttactccaagactgaagaagaac 27564211  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27564212 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttct 27564311  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  27564312 tggccatgttatttctggt 27564330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18796790 - 18796465
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||| || ||| ||||  || ||||| ||    
T  18796790 tgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctggtgtgtt 18796691  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| ||||||||  | |||||||| || ||||   ||||||||||  ||    
T  18796690 catggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattctagaactgaagaagagcat 18796591  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  18796590 gcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaaatgaagtgagttttcatg 18796491  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18796490 gccacattatttctggtagtggtatt 18796465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Original strand, 18963261 - 18963396
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||||||||     
T  18963261 gattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaatgcacca 18963360  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18963361 ggtgtatttatggagtacatgaatcatatttttcat 18963396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27189531 - 27189224
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27189531 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27189432  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27189431 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27189332  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27189331 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27189232  T
Q  315 attatttc 322  Q
     |||||||    
T  27189231 gttatttc 27189224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 322
Target Start/End: Original strand, 27259709 - 27260016
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||    
T  27259709 gatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgg 27259808  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | || |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  27259809 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgcgga 27259908  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27259909 acatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagtttccttggccat 27260008  T
Q  315 attatttc 322  Q
     |||||||    
T  27260009 gttatttc 27260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 16380637 - 16380867
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16380637 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16380736  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16380737 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16380836  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16380837 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16380867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19881398 - 19881073
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||| ||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19881398 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19881299  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  19881298 catggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 19881199  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  19881198 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttcttg 19881099  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19881098 gccatattatttctggtagtggtatt 19881073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25769944 - 25769619
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| |||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  25769944 tgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 25769845  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| |||||||||   |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||  ||    
T  25769844 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagtatgaagaagagcat 25769745  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  25769744 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 25769645  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25769644 gccacattatttctggtagtggtatt 25769619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19437102 - 19436777
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  19437102 tgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 19437003  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   ||||||||||  ||    
T  19437002 catggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaactgaagaagagcat 19436903  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |    
T  19436902 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaagagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctgcttaagtgaagtgagttttctgg 19436803  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19436802 gccacattatttctggtagtggtatt 19436777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19866704 - 19866471
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |    
T  19866704 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactcca 19866605  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || ||| |||| |||||||||||    
T  19866604 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagcgtgagttctggttgaa 19866505  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19866504 agaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 19866471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22435874 - 22435653
Alignment:
Q  105 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22435874 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22435775  T
Q  205 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 304  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22435774 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22435675  T
Q  305 tcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  22435674 tcttggccatgttatttctggt 22435653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22444272 - 22444051
Alignment:
Q  105 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  22444272 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaag 22444173  T
Q  205 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 304  Q
    || |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||| | || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22444172 aacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttt 22444073  T
Q  305 tcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  22444072 tcttggccatgttatttctggt 22444051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 16648233 - 16648463
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  16648233 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 16648332  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16648333 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 16648432  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16648433 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 16648463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21473708 - 21473376
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||    | |||| ||||| ||| ||| ||||| | |    
T  21473708 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctttcgatgttactaatgcgctg 21473609  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    | ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||| | |||||  | || || ||||||  |||||    
T  21473608 g-tgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcctaatttattctaagaatgaag 21473510  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||    
T  21473509 aggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaggaagttgtatgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 21473410  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  21473409 ttttcttggccacaatatttttggtagtggtatt 21473376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24366512 - 24366187
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||  || ||||||||    
T  24366512 tgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgtgccaggtgtatt 24366413  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  24366412 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 24366313  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||  |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  24366312 gcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 24366213  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  24366212 gtcacattatttctggtagtggtatt 24366187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Original strand, 25763474 - 25763725
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || |||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||| || || | ||| | ||| ||||| ||| | ||||| || ||||| |    
T  25763474 atgcctttcggtgttacaaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatg 25763573  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    | ||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||  | ||||| || || || ||    
T  25763574 acattttaatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagataaaaatgtatgctaaattatctaa 25763673  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  25763674 ttgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttctggt 25763725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15461443 - 15461119
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| || ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || |    
T  15461443 attaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 15461344  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | |||||   ||||| || ||||| || || |||||| |||| || |||||  |||||||    
T  15461343 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctgatttattctaaaactgaaga 15461244  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||| | ||| | || |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  15461243 ggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgatttctggttaagtgaagtgagt 15461144  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||    
T  15461143 tttctaggccacgttatttctggta 15461119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23998265 - 23998035
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || |  |    
T  23998265 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattgaa 23998166  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    |||| || |||||  ||||  | ||||||| | |||| ||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| |    
T  23998165 agtccgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaagagaaccagttatgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 23998066  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  23998065 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 23998035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 10467030 - 10467355
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  10467030 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 10467129  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||| | || || || |||  |||||| ||  ||    
T  10467130 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattctaatctattccaagaatgaagaggagcat 10467229  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |    
T  10467230 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaagtgagttttctgg 10467329  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||    
T  10467330 gtcacattatttctgatagtggtatt 10467355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Original strand, 34643983 - 34644092
Alignment:
Q  226 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34643983 ttgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctgg 34644082  T
Q  326 tagtgatatt 335  Q
     |||| ||||    
T  34644083 aagtggtatt 34644092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 28280994 - 28281125
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || |||||||| ||    
T  28280994 tgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgtt 28281093  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 141  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28281094 catggagtatatgaatcgaatttttcatgctt 28281125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 1647078 - 1647308
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||| | || || |    
T  1647078 aatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttggtgtattcga 1647177  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||| ||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||| ||   ||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  1647178 agtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 1647277  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  1647278 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 1647308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 21568172 - 21568497
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||   || |||| |||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  21568172 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 21568271  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| | | |||   ||| | ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||| | ||||| ||  ||    
T  21568272 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagaccgaagaggagcat 21568371  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    |   | ||| ||| | |||  ||  | ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| | | ||| || |||||||| |    
T  21568372 gtagaacatctgaggattgaattataggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggctaattgaagtaagttttctcg 21568471  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21568472 gccacattatttctggtagtggtatt 21568497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Original strand, 18183540 - 18183663
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  18183540 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcct 18183639  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaat 125  Q
    ||||| |||||||  |||||||||    
T  18183640 ggtgtgtttatggtgtacatgaat 18183663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 24516589 - 24516646
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24516589 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaata 24516646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 327
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295704
Alignment:
Q  196 ctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatga 295  Q
    ||||||||||  ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || |  |||||||| | |||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgtgttctggttaagtga 5295672  T
Q  296 ggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5295673 agtaagttttcttggccacattatttctggta 5295704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 98 - 431
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  98 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 197  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |    
T  198 ggtgtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagg 297  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298 aagaacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 397  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  398 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1244 - 939
Alignment:
Q  30 aagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgta 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||  || ||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1244 aagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtttatggaatatatgaatcgta 1145  T
Q  130 tttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||  |||||||||   ||||    
T  1144 tttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccgaagaggaacatgcggagcatttgagaattgt 1045  T
Q  230 tttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 329  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1044 tttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaaattatcgaagtgtgaattctggttgaacgaagtgacttttcttggccatatcatttctggtagt 945  T
Q  330 gatatt 335  Q
    | ||||    
T  944 ggtatt 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 201499 - 201832
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||| ||  | |||    
T  201499 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttactaacacgccg 201598  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  201599 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatattttgatatactctaagactgaag 201698  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  | ||||||||| |||| ||||||||| |||| || || ||| | |||||||| | ||| || |||||||||||||| | ||| || |     
T  201699 aagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagctgtatgccaaatggtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaa 201798  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  201799 ttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 201832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 324971 - 324646
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  324971 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 324872  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || ||||| || ||||| || ||| |||| || || | | ||||||||||  ||    
T  324871 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaagagcat 324772  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    |   | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  324771 gtagaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 324672  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  324671 gccacattatttctggtagtggtatt 324646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3855 - 3533
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || |||||||||||| |    
T  3855 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctg 3756  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  3755 ctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagga 3656  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||| ||||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3655 agaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaaaaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaattatggttgaaagaggtgagt 3556  T
Q  303 tttcttggccatattatttctgg 325  Q
    |||||| | ||| ||||||||||    
T  3555 tttcttagacatgttatttctgg 3533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Original strand, 16028 - 16333
Alignment:
Q  21 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 120  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || |||| |||||||||   || |||||| || || ||||| |||||| | ||||    
T  16028 gatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgcctttgggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatgtagtaca 16127  T
Q  121 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||    
T  16128 tgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttgatatactctaagactgaagaggaatatgctgagcattt 16227  T
Q  221 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 320  Q
    |||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  16228 gaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtaagttttcttgaccgtgttatt 16326  T
Q  321 tctggta 327  Q
    |||||||    
T  16327 tctggta 16333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8295 - 7962
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| ||| |||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  8295 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 8196  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  8195 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccatgtctgaag 8096  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  8095 aagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 7996  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7995 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 7962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 103508 - 103175
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||| ||||| || || ||   || ||||||||||  || | ||||||| ||     
T  103508 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaatgcgcca 103409  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  103408 ggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttgatttactccaagtctgagg 103309  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  103308 aagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaattctgattgaaagaggtgag 103209  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  103208 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 103175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 42164 - 42471
Alignment:
Q  28 agaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcg 127  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||  || ||| || || |  || || ||||||||||| |||||||     
T  42164 agaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatca 42263  T
Q  128 tatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagttt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||| |||||||||| ||| | || || ||| ||||| |||||||||  |||    
T  42264 tatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctgatatactccaagaccgaggaggaacatgccgagcatttgagattt 42363  T
Q  228 gttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42364 gttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccagtttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagttttcttggtcatattatttccggta 42463  T
Q  328 gtgatatt 335  Q
    ||| ||||    
T  42464 gtggtatt 42471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5016 - 4691
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||| ||  | || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  5016 tgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 4917  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||||||| ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  4916 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctgatttattctaagactgaagaagagcat 4817  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  4816 gcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagttctggttaagtgaagtcagttttcttg 4717  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  4716 gccacattatttctggtagtggtatt 4691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 161 - 330
Target Start/End: Original strand, 115171 - 115340
Alignment:
Q  161 tgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatat 260  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  115171 tgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatat 115270  T
Q  261 gccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  115271 gccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtg 115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Original strand, 115069 - 115163
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatg 96  Q
    ||||||| |||| || || |||||  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||  || ||||||||    
T  115069 gattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgcctttcggtgttacaaatg 115163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 87035 - 86711
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||  || ||| || || || || || ||    
T  87035 tgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtt 86936  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || || || ||| | |||||||||||| | || || ||| ||    
T  86935 tatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttatgtttatagatgagattctaatatactctaagaccgaggaggaacat 86836  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||    
T  86835 gccgagcattt-aagaatgttttgcaagtgctgaaggagaataagttatatgcctagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtaagttttcttg 86737  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  86736 gccatattatttctggtagtggtatt 86711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Original strand, 2537 - 2869
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||   || ||||||||    || |||||| || |  |    
T  2537 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttctggtgttacaaacgcgcttg 2636  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  2637 gtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttgatttactccaagtctgagga 2736  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||| ||||  |||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2737 agaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagagatgagt 2836  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  2837 tttcttggccatgttatttctagtagtggtatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 151282 - 151052
Alignment:
Q  105 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  151282 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatattttaatttactccaagtctgaagaag 151183  T
Q  205 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 304  Q
    || ||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  151182 aacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgagctt 151083  T
Q  305 tcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| || ||| | ||||||||||||| ||||    
T  151082 tctaggacatgtaatttctggtagtggtatt 151052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 7118 - 7446
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||   || |||| | |||  || ||||||||||||     
T  7118 gattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacct 7217  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||  | ||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||| ||||||    
T  7218 ggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttggtttactccaagactgaag 7317  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7318 aagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 7417  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7418 ttttcttggccatgttatttctggtagtg 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6146 - 5825
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||||| ||     
T  6146 gattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcgcca 6047  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6046 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagtccgaag 5947  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  5946 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaagaggtaag 5847  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  5846 ttttcttggccacgttatttct 5825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13276 - 12955
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||| |||||   || |||| |||||  || ||||||||| ||     
T  13276 gattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcgcca 13177  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13176 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagtccgaag 13077  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  13076 aagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaattctggttgaaagaggtaag 12977  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  12976 ttttcttggccacgttatttct 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Original strand, 840 - 1163
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || || || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  840 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 939  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  940 ggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttgatttactccaagtctgaag 1039  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1040 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 1139  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  1140 ttttcttggacatgttatttctgg 1163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3707 - 3374
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || |  || |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||| ||| ||||     
T  3707 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttactaattcacct 3608  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  3607 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaactctgaag 3508  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  3507 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 3408  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3407 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 3374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 56030 - 55697
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  56030 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccct 55931  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |    
T  55930 ggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagg 55831  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55830 aagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 55731  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  55730 ttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 55697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40907 - 40574
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  40907 gattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 40808  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| ||| | || |    
T  40807 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaagaccgagg 40708  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40707 aagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 40608  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  40607 ttttcttggccatgttatttatggtagtggtatt 40574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 74627 - 74294
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |  || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  74627 gattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 74528  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || ||| | |||||||| || ||||| || ||||| ||| | || |    
T  74527 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacattttaatttactccaagaccgagg 74428  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  74427 aagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 74328  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  74327 ttttcttggccatgttatttatggtagtggtatt 74294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 8948 - 9178
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||  | |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  8948 aatgcaccaggtgtctttatgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 9047  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  9048 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 9147  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  9148 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 9178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 50618498 - 50618831
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  50618498 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccct 50618597  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| |    
T  50618598 ggagtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgagg 50618697  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50618698 aagaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 50618797  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  50618798 ttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 50618831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21751199 - 21750876
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||   ||  ||||||||   || ||| ||||| |      
T  21751199 gattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttttggtgttactaatgctctt 21751100  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21751099 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttaatttactccaagtctgaag 21751000  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || || |     
T  21750999 aagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaagaagtaat 21750900  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  21750899 ttttcttggacatgttatttctgg 21750876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20140254 - 20140009
Alignment:
Q  90 acaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatact 189  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20140254 acaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatattttgatttact 20140155  T
Q  190 ctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggtt 289  Q
    | ||| ||||||||||| ||||  | || |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20140154 ccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 20140055  T
Q  290 gaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||  | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20140054 gaaaaaagtgagctttcttggccatgttatttctcgtagtggtatt 20140009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 323
Target Start/End: Original strand, 51331609 - 51331914
Alignment:
Q  18 gaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaat 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| || || |||||||| |    
T  51331609 gaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagt 51331708  T
Q  118 acatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagca 217  Q
    | |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  51331709 atatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgcggagca 51331808  T
Q  218 tttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatatt 317  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||    
T  51331809 tctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgtt 51331908  T
Q  318 atttct 323  Q
    ||||||    
T  51331909 atttct 51331914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Original strand, 430289 - 430549
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  430289 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 430388  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || ||    
T  430389 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 430488  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  430489 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctggtagtggtatt 430549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 33389129 - 33389449
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  33389129 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 33389228  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  33389229 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 33389328  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  33389329 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 33389428  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  33389429 ttttctaggccatgttatttc 33389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 22360344 - 22360677
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  22360344 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 22360443  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||  ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22360444 tgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 22360543  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    |||||  |||  ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| | | | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22360544 aagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtgag 22360643  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22360644 ctatcttggacatgttatttctggtagtggtatt 22360677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21832561 - 21832237
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||      
T  21832561 gattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacat 21832462  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  21832461 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 21832362  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  21832361 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 21832262  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  21832261 ttttctaggccatgttatttctggt 21832237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21839209 - 21838885
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  21839209 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 21839110  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  21839109 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 21839010  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  21839009 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 21838910  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  21838909 ttttctaggccatgttatttctggt 21838885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 321
Target Start/End: Original strand, 21862473 - 21862792
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || | |||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  21862473 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 21862572  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||| |||| |    
T  21862573 agtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacattttaatttactccaagactgagg 21862672  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21862673 aagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgag 21862772  T
Q  302 ttttcttggccatattattt 321  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  21862773 ttttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 17043115 - 17043439
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  17043115 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 17043214  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  17043215 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactaaag 17043314  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  17043315 aagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 17043414  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  17043415 ttttcttggccatgttatttctggt 17043439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 20834008 - 20834333
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||||||||   || ||| ||||| |  ||||| ||    
T  20834008 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtggtgtgtt 20834107  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||    
T  20834108 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagaacat 20834207  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| | |||||||||||    
T  20834208 gcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttatgtgaagcgagttttcttg 20834307  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20834308 gccacattatttctggtagtggtatt 20834333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Original strand, 16348787 - 16349016
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16348787 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttgatttactcca 16348886  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16348887 agactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 16348986  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
     || ||||||||||| || ||| |||||||    
T  16348987 agaagtgagttttctaggtcatgttatttc 16349016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19108536 - 19108303
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || || || | ||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  19108536 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttgatttactcta 19108437  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19108436 agactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 19108337  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19108336 agaagtgagttttcttggccatgttatttctggt 19108303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 21743660 - 21743985
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  21743660 tgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 21743759  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  21743760 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 21743859  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || ||| ||||||    
T  21743860 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagtcttcttg 21743959  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21743960 gccacattatttctggtagtggtatt 21743985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Original strand, 21233937 - 21234155
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  21233937 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaac 21234036  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21234037 atgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttct 21234136  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21234137 tggccatgttatttctggt 21234155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16378354 - 16378150
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||||||||| ||     
T  16378354 gattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcgcct 16378255  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||    
T  16378254 ggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttgatatacttcaagtccgaag 16378155  T
Q  202 aagaa 206  Q
    |||||    
T  16378154 aagaa 16378150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 20854860 - 20855184
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || ||     
T  20854860 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcct 20854959  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || || || || || ||||||||||| || |||||  ||||||    
T  20854960 ggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaaaactgaag 20855059  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    | ||  ||||  | || |||||| |||| |||||  |  |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| |||||    
T  20855060 aggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgag 20855159  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  20855160 ttttctaggccatgttatttctggt 20855184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 322
Target Start/End: Original strand, 41351762 - 41352082
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  41351762 gattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 41351861  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||  || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41351862 ggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatttactccaagactgaag 41351961  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  41351962 aagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 41352061  T
Q  302 ttttcttggccatattatttc 322  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  41352062 ttttcttggtcatgttatttc 41352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 20829583 - 20829813
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20829583 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 20829682  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20829683 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 20829782  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  20829783 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 20829813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 19661244 - 19661569
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19661244 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19661343  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || | | ||||||||||  ||    
T  19661344 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaggactgaagaagagcat 19661443  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||| ||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||    
T  19661444 gcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcctg 19661543  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19661544 gccacattatttctggtagtggtatt 19661569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 31538105 - 31538430
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31538105 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 31538204  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  31538205 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 31538304  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  31538305 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 31538404  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  31538405 gtcacattatttctggtagtggtatt 31538430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48425155 - 48424830
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  48425155 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 48425056  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  48425055 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 48424956  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  48424955 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 48424856  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  48424855 gtcacattatttctggtagtggtatt 48424830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52988023 - 52987698
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  52988023 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 52987924  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  52987923 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 52987824  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  52987823 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttctgg 52987724  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  52987723 gtcacattatttctggtagtggtatt 52987698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 24792716 - 24793040
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   ||  || ||||||||     
T  24792716 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaatgcacct 24792815  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24792816 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagactgaag 24792915  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || || ||    
T  24792916 aagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaag 24793015  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24793016 ttttcttggccatgttatttctggt 24793040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41308775 - 41308599
Alignment:
Q  159 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 258  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  41308775 gttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgt 41308676  T
Q  259 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41308675 atgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 41308599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 20938171 - 20938496
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  20938171 tgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 20938270  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || | | |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  20938271 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtctgatttattcgaagactgaagaagagcat 20938370  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    |   ||||| |||   | || || |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  20938371 gtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtaagttttcttg 20938470  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20938471 gccacattatttctggtagtggtatt 20938496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 38910934 - 38911259
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  38910934 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 38911033  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| |||||||   | |||   |||||||| || || ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||    
T  38911034 tatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcat 38911133  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  38911134 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 38911233  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38911234 gtcatattatttctggtagtggtatt 38911259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 24097711 - 24098036
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  24097711 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 24097810  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   || || || || || ||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  24097811 catggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatctattctaagactgaagaggagcat 24097910  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  |  || ||||| |||| ||| ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  24097911 gcagaaaatctgaagattgtattgtaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 24098010  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  24098011 gtcacattatttctggtagtggtatt 24098036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21026275 - 21026108
Alignment:
Q  159 gttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttat 258  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |    
T  21026275 gttgttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 21026176  T
Q  259 atgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21026175 atgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttctggt 21026108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19856556 - 19856231
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  | || |||||    | ||||||||||  || |||  |||| || ||||| ||    
T  19856556 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatgcctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtt 19856457  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||||||| ||||  || |||||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  19856456 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgtgtttattggtgacattttgatttattctaagactgaagaagagcat 19856357  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    |   | ||| ||||| | || |||||| |  | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||| ||||    
T  19856356 gaagaacatctgaagatagtattgcaaatattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttctagttaagtgaagtgagtttccttg 19856257  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19856256 gccacattatttctggtagtggtatt 19856231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20296663 - 20296338
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  20296663 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 20296564  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| |||||||| || || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||  |||||| ||  ||    
T  20296563 catggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattctaagaatgaagaggagcat 20296464  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| | |   |||| ||||||||| |||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  20296463 gcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 20296364  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  20296363 gtcacattatttctggtagtggtatt 20296338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 314
Target Start/End: Original strand, 22503480 - 22503701
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  22503480 aatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactcca 22503579  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| |||   ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| |||||||||||    
T  22503580 agactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaa 22503679  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccat 314  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  22503680 agaggtaagttttcttggccat 22503701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37679331 - 37679006
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  37679331 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttt 37679232  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| ||  |  ||    
T  37679231 tatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggagaagcat 37679132  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   ||| || |||||| | |    
T  37679131 gcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaattctggttaggtgaagtaagttttttgg 37679032  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  37679031 gtcacattatttctggtagtggtatt 37679006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16378076
Alignment:
Q  247 agaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16378156 agaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggttagttttcttggccatgttatttctggta 16378076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21953160 - 21952844
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  21953160 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 21953061  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |||||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||   ||||| ||  ||    
T  21953060 tatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaacgaagaggagcat 21952961  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| ||||| |    
T  21952960 gcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagcgaagtgagctttctgg 21952861  T
Q  310 gccatattatttctggt 326  Q
    | || ||||||| ||||    
T  21952860 gtcacattatttatggt 21952844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20927222 - 20927005
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | ||  ||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  20927222 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 20927123  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  |||   ||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  20927122 agtctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaa 20927023  T
Q  293 tgaggtgagttttcttgg 310  Q
     || |||| ||| |||||    
T  20927022 ggaagtgattttccttgg 20927005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Original strand, 23196573 - 23196682
Alignment:
Q  226 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| || || || |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
T  23196573 ttgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttatgg 23196672  T
Q  326 tagtgatatt 335  Q
    ||||| ||||    
T  23196673 tagtggtatt 23196682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22116880 - 22116839
Alignment:
Q  294 gaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22116880 gaggtgagttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 22116839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 41310808 - 41310766
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 52  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41310808 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 41310766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 335
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38312
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 38269  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  38270 agaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 38312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 176375 - 176708
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| | || ||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||  || ||| ||||| ||     
T  176375 gattaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcct 176474  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  176475 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaag 176574  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  ||||||| ||| |||| ||| ||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |     
T  176575 aagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaa 176674  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  176675 ttttcttggccatattatttatggtagtggtatt 176708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11103 - 10770
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  11103 gattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctttcggtgttaccaatgcgcct 11004  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||    
T  11003 ggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaag 10904  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  || |  ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||    
T  10903 aagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 10804  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10803 ttttcttggccatatcatttctggtagtggtatt 10770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 810 - 1140
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  810 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 909  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  910 agagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactccaagtctgaag 1009  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    || |   |||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || |||||    
T  1010 aaca---tgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggttgagagaagtgag 1106  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  1107 ctttcttggacatgttatttttggtagtggtatt 1140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 85261 - 85594
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||   ||  |||||||||  || ||| ||||||||     
T  85261 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacct 85360  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||||||||    
T  85361 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatttcctccaagtctgaag 85460  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  85461 aagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaagaagtgag 85560  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  85561 ctttcttggacatgttatttcaggtagtggtatt 85594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Original strand, 85827 - 86144
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  85827 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 85926  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || ||||| || || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  85927 ggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaagactgaag 86026  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  86027 aagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 86126  T
Q  302 ttttcttggccatattat 319  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  86127 ttttcttggccatgttat 86144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 261 - 1
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  261 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatg 162  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || || || ||    
T  161 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaa 62  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  61 gtgtgaattctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttctggtagtggtatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7409 - 7163
Alignment:
Q  89 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 188  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  7409 tacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttac 7310  T
Q  189 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 288  Q
    || ||| | || |||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  7309 tccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaattctggt 7210  T
Q  289 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7209 taaaagaagtgagttttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 7163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17924 - 17596
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||| || || || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||||||||     
T  17924 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 17825  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||| ||| |||     ||| ||||  ||  ||||||    
T  17824 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatgat-----gatttacttcaatactgaag 17730  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17729 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 17630  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17629 ttttcttggccatgttatttctggtagtggtatt 17596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12060 - 11735
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  12060 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 11961  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||||||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  11960 tatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagagcat 11861  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  11860 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttgagtgaattaagttttcttg 11761  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11760 gccatattatttctggtagtggtatt 11735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16916 - 16583
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  16916 gattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacca 16817  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||   ||| ||||| || || || || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16816 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaag 16717  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||||    
T  16716 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaattctggttgaaagaagtgag 16617  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16616 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 16583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20180
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || || || |||||||| || ||    | |||||| |||  || ||||||||||||     
T  20513 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgttcggtgttacaaatgcacct 20414  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     | || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20413 agagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagactgaag 20314  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  20313 aagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaattgag 20214  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  20213 ctttcttggacatgctatttctggtagtggtatt 20180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31220 - 30887
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  || ||||||||||||     
T  31220 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacct 31121  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     | ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | ||| ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||     
T  31120 agagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtcttaat 31021  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  31020 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 30921  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  30920 ctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 30887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51077 - 50759
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  51077 tgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 50978  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||| ||| | |||   ||| | |||||||| ||||| || || || || || |||| | ||||||||||  ||    
T  50977 tatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgactgaagaagagcat 50878  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  50877 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagttttcttg 50778  T
Q  310 gccatattatttctggtag 328  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50777 gccatattatttctggtag 50759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Original strand, 1486 - 1746
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||| | ||  | ||||| |||||||| |    
T  1486 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatg 1585  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  1586 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 1685  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1686 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttgtacatgttatttctggtagtggtatt 1746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9213 - 8889
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  9213 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 9114  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  9113 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 9014  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9013 aagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgag 8914  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  8913 ttttctaggccatgttatttctggt 8889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 954 - 708
Alignment:
Q  89 tacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatac 188  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| |||    
T  954 tacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttac 855  T
Q  189 tctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggt 288  Q
    |  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  854 ttcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaattctggt 755  T
Q  289 tgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  754 tgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctggtagtggtatt 708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45416 - 45106
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattta 111  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||  | |||||||    
T  45416 aaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtattta 45317  T
Q  112 tggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgc 211  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  45316 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 45217  T
Q  212 caagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggc 311  Q
      | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45216 tgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggc 45117  T
Q  312 catattatttc 322  Q
    ||| |||||||    
T  45116 catgttatttc 45106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10658 - 10428
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  10658 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactcca 10559  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||| ||||| ||||  ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||     
T  10558 agactgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgag 10459  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10458 agaagtgagtttccttggccatgttatttct 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17211 - 16890
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  17211 gattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 17112  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||| | || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||     
T  17111 ggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaa 17012  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||    
T  17011 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgagagaagtgag 16912  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  16911 tttccttggccatgttatttct 16890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 48553 - 48878
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  48553 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 48652  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  48653 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 48752  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  48753 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 48852  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48853 gccatattatttctggtagtggtatt 48878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Original strand, 24976 - 25309
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||   || ||||||||||  || ||||||||||||     
T  24976 gattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 25075  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |    
T  25076 gaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttgatttactccaagattgagg 25175  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||  | ||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  25176 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagataagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaattctggttgaaagaattgag 25275  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||  || ||||||||| ||||| ||||    
T  25276 ttttcttggatatgttatttctgttagtggtatt 25309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 50219 - 50536
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  50219 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgtt 50318  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||  ||    
T  50319 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcat 50418  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | ||| || || |||||||    
T  50419 gcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaagttagctttcttg 50518  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    |||||||||||| |||||    
T  50519 gccatattatttttggta 50536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 59253 - 59570
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  59253 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgtt 59352  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||  ||    
T  59353 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcat 59452  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | ||| || || |||||||    
T  59453 gcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaagttagctttcttg 59552  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    |||||||||||| |||||    
T  59553 gccatattatttttggta 59570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 65641 - 65958
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||  | || ||||| ||    
T  65641 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccggtgtgtt 65740  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||  ||    
T  65741 catggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaagagcat 65840  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | ||| || || |||||||    
T  65841 gcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctagttaagtgaagttagctttcttg 65940  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    |||||||||||| |||||    
T  65941 gccatattatttttggta 65958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28889 - 28564
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || |||||  |    
T  28889 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgct 28790  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  28789 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 28690  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| | || ||| ||||| ||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| || |||||| |||    
T  28689 gcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttagatgaagtaagttttgttg 28590  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28589 gccacattatttatggtagtggtatt 28564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 55886 - 56211
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  55886 tgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 55985  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||| | | |||   ||| | ||||| |||||||| || ||  | || || || ||| ||||||| ||  ||    
T  55986 catggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagaggagcat 56085  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||     
T  56086 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttctta 56185  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  56186 gccacattatttctggtagtggtatt 56211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 47073 - 47398
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  47073 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 47172  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||| | || ||||| |  ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || | ||||  |||||| ||  ||    
T  47173 tatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattttaagaatgaagatgagcat 47272  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| || || |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||  |||||||||    
T  47273 gcagagcatctgcagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaaaagttgtatgcgacgttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaggttttcttg 47372  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47373 gccatattatttctggtagtggtatt 47398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 99601 - 99926
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  99601 tgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 99700  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || ||||   ||||||||||  ||    
T  99701 catggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattctagaactgaagaagagcat 99800  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  99801 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 99900  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  99901 gccacattatttctggtagtggtatt 99926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2982 - 2658
Alignment:
Q  11 gaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtattt 110  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||    
T  2982 gaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttt 2883  T
Q  111 atggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatg 210  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||  |||    
T  2882 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagcatg 2783  T
Q  211 ccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttgg 310  Q
    |  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||| || |||||||||||    
T  2782 cagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttgg 2683  T
Q  311 ccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  2682 ccacattatttctggtagtggtatt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35771 - 35446
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  35771 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 35672  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||||| ||| | ||||    
T  35671 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatattttaatttactccaagaccgaag 35572  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga- 300  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  35571 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaag 35472  T
Q  301 gttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35471 gttttgttggccatgttatttctggt 35446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 335
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6695
Alignment:
Q  76 tgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacga 175  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| || || || ||    
T  6436 tgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatga 6535  T
Q  176 tattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaag 275  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||    
T  6536 tattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaag 6635  T
Q  276 tgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    || |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| ||||| || |||||| ||||    
T  6636 tgcgaattctggttgaaagaagtgtgctttcttggacatgttattgctagtagtggtatt 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4454 - 4118
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata--atcagc-gatgcctttcaatgctacaaatgca 98  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  || ||  ||||||||||  || ||| |||||     
T  4454 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcg 4355  T
Q  99 ccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctg 198  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || | |||| |||    
T  4354 cctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataagactg 4255  T
Q  199 aagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggt 298  Q
    |||||||  ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||    
T  4254 aagaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagt 4155  T
Q  299 gagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  4154 aagttttctgggccatatcatttatggtagtggtatt 4118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2136 - 1811
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  |||||| ||||| ||  |||| ||    
T  2136 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgctactaatgcgcctagtgtgtt 2037  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||    |||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  2036 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 1937  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  1936 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 1837  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||||||||||||||| ||||    
T  1836 accatattatttctggtagtggtatt 1811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7025 - 6692
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||     
T  7025 gattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct 6926  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    | ||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||| | |   |   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |    
T  6925 gatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgagg 6826  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  |||   | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||    
T  6825 aagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgag 6726  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6725 ttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 6692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33601 - 33276
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  33601 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 33502  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||| |||   || || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  33501 tatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 33402  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| | ||| |||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  33401 gcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgttaaaatgtgagttctagttaagtgaagtaagttttcttg 33302  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  33301 gccacattatttctggtagtggtatt 33276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 49914 - 50239
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||    
T  49914 tgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctggtgtgtt 50013  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||  ||    
T  50014 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcat 50113  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| || ||||||||||    
T  50114 gcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagttttcttg 50213  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50214 gccatattatttctggtagtggtatt 50239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 2992 - 3317
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  2992 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 3091  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   || || |||||||| ||||| || ||  | || || || ||| ||||||||||  ||    
T  3092 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagactgaagaagagcat 3191  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||  |||||||||    
T  3192 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtttagtgaagtttgttttcttg 3291  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  3292 gccacattatttctggtagtggtatt 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 69644 - 69312
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || |    
T  69644 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctg 69545  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   || || || || || ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  69544 gtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaagactgaaga 69445  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||  ||||  | |  |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| | ||| ||||||    
T  69444 ggagcatgcagaacgcttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttcttgttaagtgaagtgagt 69345  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  69344 tttctaggccacgttatttctggtagtggtatt 69312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 262491 - 262166
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  262491 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 262392  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||| ||||  | | | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || |||||| || |||| ||  ||    
T  262391 catggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcctaatttattctaagactaaagaggagcat 262292  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  262291 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttg 262192  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  262191 gccacattatttctggtagtggtatt 262166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 11270 - 11594
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| || || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  11270 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 11369  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  11370 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaag 11469  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  11470 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaag 11569  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  11570 ttttcttggccatgttatttctggt 11594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50032
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattttggttgaaagaagtgggctttct 50060  T
Q  308 tggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  50059 tggacatgttatttctcgtagtggtatt 50032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53837 - 53635
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| |||| ||| |    
T  53837 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatg 53738  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  53737 atattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 53638  T
Q  275 gtg 277  Q
    |||    
T  53637 gtg 53635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31084 - 30833
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || ||||| ||||| || |    
T  31084 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaag 30985  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || || ||    
T  30984 atattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 30885  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30884 gtgtgagttctggttgaaagaggtcagttttcttggccatgttatttctggt 30833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36550 - 36298
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  36550 atgcctttcgatgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatg 36451  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| || ||  | ||||| || || || ||    
T  36450 atatttttatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaa 36351  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtga-gttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  36350 gtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctggt 36298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 10096 - 10421
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| ||  |||| ||    
T  10096 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtt 10195  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||  |||||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  10196 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagcat 10295  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  10296 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 10395  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10396 gccatattatttctggtagtggtatt 10421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53312 - 52987
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    | ||| |||||| ||| ||| ||||  || ||| | ||    
T  53312 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctttcgatgttactaatgtgcctggtttgtt 53213  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  53212 catggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaagagcat 53113  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  53112 gcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgttaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 53013  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  53012 gccacattatttctggtagtggtatt 52987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16113
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  16342 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatattttgatttactcca 16243  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16242 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtctaagtgtgaattctggttgaa 16143  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
     ||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  16142 agaattaagttttcttggccatgttatttc 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2605 - 2375
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  2605 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 2506  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagtt-gtcaaagtgtgaattctggttga 291  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  2505 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacctttatgctaacttggtctaagtgtgaattctggttga 2406  T
Q  292 atgaggtgagttttcttggccatattatttc 322  Q
    | ||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  2405 aagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 329
Target Start/End: Original strand, 5128 - 5447
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagc-gatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || | ||  |||| |||||  || ||| ||||| || ||||| |    
T  5128 tgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagta-taagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgt 5226  T
Q  109 ttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaa 208  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || ||||||  |||||||||  |    
T  5227 ttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagagca 5326  T
Q  209 tgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttctt 308  Q
    |||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||  || |||||||||    
T  5327 tgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtggagtaagttttctt 5426  T
Q  309 ggccatattatttctggtagt 329  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  5427 ggccatattatttatggtagt 5447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8251 - 7991
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| || ||  |||| |||||||| |    
T  8251 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatg 8152  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  8151 atattttgatttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 8052  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  8051 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtatt 7991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17447 - 17187
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||  |  |||| |||||||| |    
T  17447 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatg 17348  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||    
T  17347 atattttgatttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaa 17248  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  17247 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttctggtagtggtatt 17187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 393
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || ||| | |    
T  652 atgcctttcagttttactaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatg 553  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||    
T  552 atattttgatttactctaagtctgaagaagaacatatga-gcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatctaa 454  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
     |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  453 ctgtgaattttggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttcttgtagtggtatt 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40428 - 40104
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |  || ||||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  40428 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 40329  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  40328 ggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaag 40229  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||    
T  40228 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtaag 40129  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  40128 ttttcttggccatgttatttctggt 40104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Original strand, 14261 - 14480
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttg-atatactctaagtctgaagaagaa 206  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||  || ||||| | | |||||||||||    
T  14261 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttttatttactccatgactgaagaagaa 14360  T
Q  207 aatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttc 306  Q
     ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  14361 tatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttctaagtgtgaattctgtttgaaggaagtaagttttc 14460  T
Q  307 ttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14461 ttggccatgttatttctggt 14480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 325
Target Start/End: Original strand, 107933 - 108165
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||| ||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  107933 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 108032  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||  |||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  108033 agattgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 108132  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  108133 agaggtaagttttcttggccatgttatttctgg 108165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 114826 - 114501
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  114826 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 114727  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     |||||||| |||||| | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  114726 catggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcaagaactgaggaagagcat 114627  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  114626 gcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcgagttctggttaaatgaagtgagttttcttg 114527  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  114526 gccatattatttctggtagtggtatt 114501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 94925 - 94990
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  94925 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaata 94990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9550 - 9319
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |    
T  9550 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatatttttatttactcca 9451  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9450 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaa 9351  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttctg 324  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9350 agaagtgagttttcttggccatgttatttctg 9319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20804 - 20553
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  20804 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 20705  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  20704 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaa 20605  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20604 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 20553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36228 - 35977
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  36228 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatg 36129  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | | |||||| ||  | ||||| || || || ||    
T  36128 atattttaatttactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaatagagaagaaactttatgctaaattatctaa 36029  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36028 gtgtgagttctggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 35977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 326
Target Start/End: Original strand, 195531 - 195842
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  195531 gatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatgg 195630  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | || |||||||| || || ||||| | | | ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |    
T  195631 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctga 195730  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccat 314  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  195731 gcatctgaaggttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccat 195830  T
Q  315 attatttctggt 326  Q
     | |||||||||    
T  195831 gtcatttctggt 195842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 58290 - 57966
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || ||||||||     
T  58290 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacct 58191  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||  || || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  58190 ggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacattttgatttactccaagactgaag 58091  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||   |||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  58090 aagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaag 57991  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  57990 ttttcttggccatgttatttctggt 57966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 326
Target Start/End: Original strand, 18321 - 18422
Alignment:
Q  226 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtga-gttttcttggccatattatttctg 324  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  18321 ttgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttctg 18420  T
Q  325 gt 326  Q
    ||    
T  18421 gt 18422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 2311 - 2636
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  2311 tgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 2410  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  2411 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaatgaagaagagcat 2510  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  2511 gcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 2610  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  2611 gccacattatttatggtagtggtatt 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16379 - 16054
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  16379 tgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 16280  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||| | ||||||||||  ||    
T  16279 tatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgactgaagaagagcat 16180  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  16179 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 16080  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  16079 gccatattatttatggtagtggtatt 16054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8213
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||| | || ||||| || || ||||||||  | || || |    
T  7983 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgatattttagtgtattcga 8082  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    |||| || |||||  |||   ||||| ||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||  || ||||||||    
T  8083 agtcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgtgttttggttgaa 8182  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  8183 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 8213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 21554 - 21879
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||| || ||||| ||    
T  21554 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtt 21653  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| | ||||||||  ||    
T  21654 tatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagacagaagaagagcat 21753  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  21754 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 21853  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21854 gccacattatttctggtagtggtatt 21879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 13375 - 13700
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    | ||||||||||  |  ||| ||||| || ||||| ||    
T  13375 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtcttactaatgcgcctggtgtgtt 13474  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || || ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| | ||||||||  ||    
T  13475 tatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcgaagacagaagaagagcat 13574  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  13575 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 13674  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13675 gccacattatttctggtagtggtatt 13700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19619 - 19302
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  19619 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 19520  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || || ||    ||||| ||||||||| |||||   ||||| ||| |||| ||||| || || || || || |||||| | ||||| ||  ||    
T  19519 tatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggttatgtttattgatgacatcttaatttattctaagaccgaagaggagcat 19420  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  19419 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 19320  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19319 gccacattatttctggta 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 323
Target Start/End: Original strand, 25032 - 25129
Alignment:
Q  226 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  25032 ttgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgcaaagttatctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 29324 - 29649
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||||   ||  |||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  29324 tgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 29423  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| | || || ||||||  |||||||||  ||    
T  29424 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagaatgaagaagagcat 29523  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  29524 gcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 29623  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  29624 gccacattatttatggtagtggtatt 29649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49371 - 49046
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||    
T  49371 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctggtgtgtt 49272  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||    ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  49271 tatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 49172  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | | || ||||||||||    
T  49171 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtcaagtaagttttcttg 49072  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49071 gccatatcatttatggtagtggtatt 49046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24481 - 24156
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  24481 tgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggggtgtt 24382  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  24381 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaggagcat 24282  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  24281 gcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 24182  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24181 gccacattatttctggttgtggtatt 24156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 44456 - 44781
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  44456 tgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 44555  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||    ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| || |||||||  ||    
T  44556 tatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactaaagaagagcat 44655  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
     | || ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  44656 acaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttg 44755  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||    
T  44756 gccccattatttctggtagtggtatt 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 109897 - 109572
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||  ||  |||| ||    
T  109897 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgtgcctagtgtgtt 109798  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || ||  |||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  109797 tatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtgatttattctaagactgaagaagagcat 109698  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  109697 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagttctggttaagtgaagtaagttttcttg 109598  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  109597 gccatattatttcttgtagtggtatt 109572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 326
Target Start/End: Original strand, 55022 - 55346
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||     
T  55022 gattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacct 55121  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||  ||||| ||||| ||  | || |||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  55122 ggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttttatttactccaatactgaag 55221  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||  |||| ||    
T  55222 aagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtttaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaaaaggtaag 55321  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  55322 ttttcttggccatgttatttctggt 55346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8574 - 8314
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||| || || || |    
T  8574 atgcctttcggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatg 8475  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | |||||| || |  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||   ||||| || ||||| ||    
T  8474 atattttgatttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaa 8375  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  8374 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttctagtagtggtatt 8314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 326
Target Start/End: Original strand, 44846 - 44998
Alignment:
Q  174 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 273  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||| ||  | |||||||| ||||| |    
T  44846 gatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtcta 44945  T
Q  274 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44946 agtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttctggt 44998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 8876 - 9172
Alignment:
Q  39 tttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatg 138  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||||    ||||| ||||    
T  8876 tttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatg 8975  T
Q  139 cttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 238  Q
    ||||| | |||   ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||  || | ||||||||    
T  8976 cttatctggataaatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagt 9075  T
Q  239 gctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9076 gttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttatgtgaagtgtgttttcttcgccatattatttctggtagtggtatt 9172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 13345 - 13567
Alignment:
Q  105 gtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaag 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||  || |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13345 gtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttgatttactccaagtctgaagaag 13444  T
Q  205 aaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 304  Q
    || |||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  13445 aacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttaaaagaagtgagctt 13544  T
Q  305 tcttggccatattatttctggta 327  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  13545 tcttggacatgttatttctggta 13567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 325
Target Start/End: Original strand, 23178 - 23428
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  23178 atgcctttcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacg 23277  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    | |||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||||||  |||| ||    
T  23278 acattttgatttactccaaaactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaa 23377  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23378 gtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttctgg 23428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 493 - 169
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  493 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 394  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||| | || ||||| || ||||| ||||| ||| | |||   ||  | ||||| || ||||| || |||||||| || | || | ||||||||||  ||    
T  393 tatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacattttgat-tattttaggactgaagaagagcat 295  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  294 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgatttctggttaagtgatgttagttttcttg 195  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||    
T  194 gccacattatttcttgtagtggtatt 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 1524 - 1849
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| || | ||| || |||||    | |||  |||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  1524 tgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 1623  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || || || || ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||  ||    
T  1624 tatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcat 1723  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  |  || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  1724 gcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaagttagttttcttg 1823  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  1824 gccacattatttatggtagtggtatt 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 31358 - 31675
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||      ||||||||||| || ||| ||||| || || |||||    
T  31358 tgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctggggtatt 31457  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| | | | |   ||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  31458 tatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaggagcat 31557  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| || | ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  31558 gcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 31657  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    | || |||||||||||||    
T  31658 gtcacattatttctggta 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Original strand, 893 - 1213
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  893 tgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggcgtgtt 992  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||   || || |||| ||| ||||| || || ||||| || ||||||  ||||||||| |||    
T  993 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatcttgatttattctaagaatgaagaagagaat 1092  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  1093 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaattttggttaagtgaagtgagttttcttg 1192  T
Q  310 gccatattatttctggtagtg 330  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  1193 gccacattatttctggaagtg 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 9500 - 9821
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  9500 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 9599  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || ||    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | ||||||| ||  ||    
T  9600 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaat----ttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggactgaagaggagcat 9695  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
     |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  9696 acagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagatttcttg 9795  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9796 gccacattatttctggtagtggtatt 9821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 19714 - 20035
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  19714 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 19813  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  || ||    |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||| | ||||||| ||  ||    
T  19814 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctaaat----ttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttaagctaggactgaagaggagcat 19909  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
     |  | ||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  19910 acagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagctttcttg 20009  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20010 gccacattatttctggtagtggtatt 20035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Original strand, 5487 - 5714
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||      
T  5487 tttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagc 5586  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||    
T  5587 atgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 5686  T
Q  308 tggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  5687 tggccacattagttctggtagtggtatt 5714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 335
Target Start/End: Original strand, 9918 - 10145
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||      
T  9918 tttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaagaagagc 10017  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||    
T  10018 atgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 10117  T
Q  308 tggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  10118 tggccacattagttctggtagtggtatt 10145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25578 - 25348
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  25578 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 25479  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25478 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 25379  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  25378 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 25348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15092 - 14862
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  15092 aatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaa 14993  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14992 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 14893  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  14892 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 14862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Original strand, 11296 - 11513
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  11296 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 11395  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||    ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  11396 agtctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttatataagtgtgagttttggttgaa 11495  T
Q  293 tgaggtgagttttcttgg 310  Q
     || |||||||| |||||    
T  11496 ggaagtgagtttccttgg 11513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 873 - 1198
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  873 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 972  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| |  ||||| |||| || | | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||  |||||| ||  ||    
T  973 tatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaatctattccaagaatgaagaggagcat 1072  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  1073 gcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 1172  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  1173 gtcatattatttctggtagtggtatt 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 323
Target Start/End: Original strand, 64639 - 64860
Alignment:
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||| ||||||    
T  64639 ggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaag 64738  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||    
T  64739 aagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaag 64838  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  64839 ttttcttggccacattatttct 64860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 64558 - 64615
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||    
T  64558 tgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaata 64615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 335
Target Start/End: Original strand, 18445 - 18705
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||  || || ||||| || || || |    
T  18445 atgcctttcggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatg 18544  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  ||| | ||||| || ||||| ||    
T  18545 atattttgatttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaagagatgaagctttatgcgaaattgtctaa 18644  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18645 gtgcgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttatggtagtggtatt 18705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 326
Target Start/End: Original strand, 444 - 695
Alignment:
Q  75 atgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacg 174  Q
    |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||  | ||||||||||| || |    
T  444 atgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatg 543  T
Q  175 atattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaa 274  Q
    ||| ||||||  |||| ||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||| ||  | ||||| || || |||||    
T  544 ataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaa 643  T
Q  275 gtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    |||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  644 gtgtgagttctggctgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttctggt 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 936
Alignment:
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||| ||||||    
T  1169 ggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactgaag 1070  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  | ||| ||||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||    
T  1069 aagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaaatgaagtaag 970  T
Q  302 ttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  969 ttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2874 - 2637
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||  |||||||  ||||||| || || || ||||| || ||||||  || |||||| |||| || ||||||||||||     
T  2874 gattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgttcagtgttacaaatgcacct 2775  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
     | || |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||  ||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2774 cgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactgcaagtctgaag 2675  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtg 239  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2674 aagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtg 2637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28792 - 28467
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||||||| || ||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||||||    
T  28792 tgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtatt 28693  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||| ||| | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||  | || || |||| |  ||||||| |  ||    
T  28692 tatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaatgaagaaaagcat 28593  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  28592 gcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttg 28493  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||    
T  28492 gccatattatttatggtagtggtatt 28467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 31716 - 32041
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  31716 tgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 31815  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | ||||||||||||||  | |||   ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || |   |||| |||||  ||    
T  31816 catggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcat 31915  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||    
T  31916 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttg 32015  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32016 gccatattatttctggtagtggtatt 32041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 42433 - 42212
Alignment:
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaag 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |    
T  42433 ggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgagg 42334  T
Q  202 aagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgag 301  Q
    ||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  42333 aagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgag 42234  T
Q  302 ttttcttggccatattatttct 323  Q
    ||| ||||| ||| | ||||||    
T  42233 tttccttggtcatgtgatttct 42212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 54450 - 54507
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54450 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaata 54507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 335
Target Start/End: Original strand, 55149 - 55264
Alignment:
Q  220 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 319  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  || || ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  55149 tgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaataagagttttggttaagtgaagtaagttttcttggccacattat 55248  T
Q  320 ttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||| ||||    
T  55249 ttctggtagtggtatt 55264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 250887 - 250562
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || || || ||    
T  250887 tgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgtt 250788  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||  ||    
T  250787 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaggagcat 250688  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  250687 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctgg 250588  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||    
T  250587 gtcacattatttctggcagtggtatt 250562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 195291 - 195182
Alignment:
Q  226 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  195291 ttgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttctgg 195192  T
Q  326 tagtgatatt 335  Q
    ||||| ||||    
T  195191 tagtggtatt 195182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4363 - 4145
Alignment:
Q  108 tttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaa 207  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||  |||  ||||||||||     
T  4363 tttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaatgaagaagaac 4264  T
Q  208 atgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttct 307  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4263 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttct 4164  T
Q  308 tggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  4163 tggccatgttatttttggt 4145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7337 - 7107
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  7337 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 7238  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7237 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 7138  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7137 ggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 165
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  395 aatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 296  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  295 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgagttttggttgaa 196  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  195 ggaagtgagtttccttggtcatttgatttct 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 335
Target Start/End: Original strand, 33911 - 34117
Alignment:
Q  129 atttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttg 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||  ||||  ||||||| ||| ||     
T  33911 attttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagatta 34010  T
Q  229 ttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtag 328  Q
    | ||||||||| | || || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34011 tgttgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctgatag 34110  T
Q  329 tgatatt 335  Q
    || ||||    
T  34111 tggtatt 34117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Original strand, 510 - 604
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  510 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Original strand, 4830 - 4924
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4830 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 4924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 326
Target Start/End: Original strand, 7839 - 8048
Alignment:
Q  117 tacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagc 216  Q
    |||| |||||| || |||||||| | ||| ||||| || || ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||    
T  7839 tacacgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagc 7938  T
Q  217 atttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatat 316  Q
    || ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  7939 atctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgt 8038  T
Q  317 tatttctggt 326  Q
    ||||||||||    
T  8039 tatttctggt 8048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41963 - 41639
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    | ||||||||||   | ||| ||||| || ||||| ||    
T  41963 tgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggagttactaatgcgcctggtgtgtt 41864  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| | |||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||  |||||||||  ||    
T  41863 tatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagaatgaagaagagcat 41764  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || || ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||    || || ||||||||||    
T  41763 gcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaa-gaaaagaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaattctggttacgcgaagtaagttttcttg 41665  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  41664 gccatattatatctggtagtggtatt 41639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 51389 - 51624
Alignment:
Q  15 gatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatgg 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   ||  ||||||||   || ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  51389 gatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgccttttggtgttaccaatgcacctcgagtatttatgg 51488  T
Q  115 aatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaa 214  Q
    | || |||||||| || ||||||||   ||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |    
T  51489 agtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttgatttactccaagactgaagaagaagatgctga 51588  T
Q  215 gcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 250  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  51589 gcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 51624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 335
Target Start/End: Original strand, 619 - 951
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| |||||||| |    
T  619 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctg 718  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    |||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||  |||||   ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || |   | || ||    
T  719 gtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttacctagataaatttgtggttgtattcattgatgacatttttatctattcaagaaccgagga 818  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
    |||  | ||  | ||   |||| |||| |||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||| |  || |||| |    
T  819 agagcacgcagaacaccagaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttttcgaagtgcgggttctggttaagggaagtgaat 918  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  919 tttcttggccatattatttctggtagtggtatt 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 326
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3708
Alignment:
Q  174 gatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaa 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || |    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  274 agtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 335
Target Start/End: Original strand, 1794 - 1909
Alignment:
Q  220 tgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattat 319  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1794 tgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattat 1893  T
Q  320 ttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||||| ||||    
T  1894 ttctggtagtggtatt 1909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10441 - 10307
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||  | || ||||| || ||    | ||||||||||  || ||||||||||||     
T  10441 gattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacct 10342  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttca 136  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  10341 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttca 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Original strand, 40 - 365
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  40 tgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 139  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||   ||||| || |||| |||||| || |||||||| || || |   | || |||||  ||    
T  140 catggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatgacattttgatctattcgacaacggaggaagagcat 239  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| |||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||    
T  240 gcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttccttg 339  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  340 gccatattatttctggaagtggtatt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 912 - 588
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| |||||||| ||    
T  912 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtt 813  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||| | || ||||| || ||||| ||||||| | | |||   ||||| || ||||| ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  812 catgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattctaatttattctaagactgaagaggagcat 713  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||| | | ||| || |||||||| |    
T  712 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcgaaatgtgagttttgg-taagtgaagtaagttttctgg 614  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  613 gccacattatttctggtagtggtatt 588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7881 - 7824
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  7881 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 10825 - 11142
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  10825 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 10924  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||   | |||   || || || || || ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  10925 catggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatattttaatttattctaagactgaagaggagcat 11024  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||| | |||| ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| | | ||| || ||||| ||||    
T  11025 gcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggctaagtgaagtaagtttccttg 11124  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    | ||||||||||||||||    
T  11125 gtcatattatttctggta 11142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 326
Target Start/End: Original strand, 28770 - 28926
Alignment:
Q  170 tgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttg 269  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||     
T  28770 tgangatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaatta 28869  T
Q  270 tcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    || |||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28870 tctaagtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 28926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 250
Target Start/End: Original strand, 28586 - 28742
Alignment:
Q  94 atgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaa 193  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||    
T  28586 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaa 28685  T
Q  194 gtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaa 250  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28686 gactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaa 28742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36164 - 36055
Alignment:
Q  226 ttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctgg 325  Q
    |||| ||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  36164 ttgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttatgg 36065  T
Q  326 tagtgatatt 335  Q
    ||||| ||||    
T  36064 tagtggtatt 36055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37915 - 37590
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    | |||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  37915 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgccttacggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 37816  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||  | |||   ||||| ||||  || ||||| || ||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  37815 catggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattctgatttattcaaagactgaagaagagcat 37716  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||  ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | | | |||||||||||||    
T  37715 gcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttttggttaagtaaagtgagttttcttg 37616  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  37615 gccacattatttatggtagtggtatt 37590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 327
Target Start/End: Original strand, 79870 - 80187
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| |  ||||| ||    
T  79870 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcttggtgtgtt 79969  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || |||||  | |||||||||||||   | |||   ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||  ||    
T  79970 catggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatattttaatttattctaagactgaagaggagcat 80069  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    || |||||| ||| | |||| || || ||  ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| | ||| || ||||| ||||    
T  80070 gcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaagtaagtttccttg 80169  T
Q  310 gccatattatttctggta 327  Q
    |||||||||||| |||||    
T  80170 gccatattatttttggta 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14286 - 14142
Alignment:
Q  191 taagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttg 290  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||     
T  14286 taagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtta 14187  T
Q  291 aatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14186 attgaagtgagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 14142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 323
Target Start/End: Original strand, 5969 - 6160
Alignment:
Q  132 tttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttt 231  Q
    |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| |    
T  5969 tttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgt 6068  T
Q  232 tgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
    |||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  6069 tgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttct 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 14473 - 14431
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgtta 52  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14473 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgtta 14431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25387 - 25060
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||  || || || |    
T  25387 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttattaacgcgcctg 25288  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||| | | | |||   || || || || || || || ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  25287 gcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatattttgatttattctaagactgaaga 25188  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||  ||||  |||| |||||| |||| |||||  |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  25187 ggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgggagttctggttaactgaagtgagt 25088  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  25087 tttctaggccacgttatttctggtagtg 25060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1003
Alignment:
Q  168 attgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagt 267  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||  | ||||| ||      
T  1161 attgatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaac 1062  T
Q  268 tgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggt 326  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1061 tatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttctggt 1003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20881 - 20791
Alignment:
Q  245 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20881 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 20791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25043 - 24953
Alignment:
Q  245 agagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25043 agagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtggtatt 24953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Original strand, 546 - 640
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  546 tgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccacattatttatggtagtggtatt 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 335
Target Start/End: Original strand, 14786 - 15077
Alignment:
Q  44 gacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttat 143  Q
    ||||||||| || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||  || || ||||||| |    
T  14786 gacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgctttt 14885  T
Q  144 ttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctga 243  Q
     | |||   |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||  ||| || ||  ||||  ||||| |||   |||| ||||||||| |||    
T  14886 ctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttga 14985  T
Q  244 aagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  14986 aggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctagttaagtgaagtgagctttctgggtcacattatttctggtagtggtatt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9328 - 9003
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    | |||| |||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  9328 tgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 9229  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||| | |||   ||||| ||||| || ||||| || || || || || || ||| ||||||||||  ||    
T  9228 catggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaagaagagcat 9129  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||| |||| || |||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| |    
T  9128 gcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgagttctagttaagtgaagtgagttttctgg 9029  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9028 gccacattatttctggtagtggtatt 9003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 1530 - 1585
Alignment:
Q  12 aaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  1530 aaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaata 1585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43183 - 42859
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  43183 tgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 43084  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
     || || || ||||| || |||| | |||||||  | |||   ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||    
T  43083 catcgagtatatgaaccgaatttct-atgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatctattcaaagactgaagaagagcat 42985  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  | ||| ||||  |||| |||||| |  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||    
T  42984 gcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagctttcttg 42885  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||    
T  42884 gccacatcatttctggtagtggtatt 42859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 3
Alignment:
Q  2 gattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||| || ||   ||   ||||| ||| || ||||||||||||     
T  155 gattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctctcagtgttacaaatgcacct 56  T
Q  102 ggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttt 154  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  55 ggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 335
Target Start/End: Original strand, 23339 - 23443
Alignment:
Q  231 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||||||| |||| || || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339 ttgcaagtgttgaaggaaaagaaggtgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggtagtg 23438  T
Q  331 atatt 335  Q
     ||||    
T  23439 gtatt 23443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1919 - 1825
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1919 tgaaagagagaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacattatttctggtagtggtatt 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12655
Alignment:
Q  21 gatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaataca 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||    | ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  121 tgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatgccaagcattt 220  Q
     ||| || ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||| || |||||  ||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||||  | ||| |    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatct 12548  T
Q  221 gaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatt 320  Q
    |||| |||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  12549 gaagattgtgttgcaattattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggtaaagtgaagtgagttttctgggccacatcatt 12648  T
Q  321 tctggta 327  Q
    | |||||    
T  12649 tttggta 12655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34269 - 34039
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || |||||||| || ||||||||| | || || |    
T  34269 aatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 34170  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  34169 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgga 34070  T
Q  293 tgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
     || || ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  34069 ggaagtaagtttccttggtcatgtgatttct 34039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 5974 - 6052
Alignment:
Q  252 aagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 330  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5974 aagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttctggtagtg 6052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 271
Target Start/End: Original strand, 19673 - 19934
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    | ||||||||||| || ||| |||||  | |  || ||    
T  19673 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgtctgacgtgtt 19772  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||   || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||  |||||||||  ||    
T  19773 tatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagaatgaagaagagcat 19872  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtc 271  Q
    ||  | ||| ||||| |||| ||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19873 gcagaacatctgaagattgtattgcaagtattcaaagagaataagttgtatgccaagttgtc 19934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 7965
Alignment:
Q  3 attaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgg 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |  | ||| || || || |||||   ||  |||||||||  ||  || |||||||| |    
T  8288 attaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctg 8189  T
Q  103 gtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaaga 202  Q
    | || |||||||| || |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||  |||| ||    
T  8188 gagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattgttgtgtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgagga 8089  T
Q  203 agaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagt 302  Q
     ||| ||||  | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8088 ggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagt 7989  T
Q  303 tttcttggccatattatttctggt 326  Q
    ||| | |||||| |||||||||||    
T  7988 tttatgggccatgttatttctggt 7965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 9913 - 10044
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||   || ||||||||||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  9913 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgtt 10012  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgctt 141  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  10013 catggagtatatgaaccgaatttttcatgctt 10044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Original strand, 10159 - 10245
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10159 tgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctggta 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 18522 - 18579
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  18522 tgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaata 18579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Original strand, 243 - 329
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  243 tgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttctggta 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Original strand, 2074 - 2291
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| | || | |||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  2074 aatgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttggtgtattcaa 2173  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaa 292  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | || | ||||| ||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||| |    
T  2174 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgga 2273  T
Q  293 tgaggtgagttttcttgg 310  Q
     || |||||||| |||||    
T  2274 ggaagtgagtttccttgg 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 335
Target Start/End: Original strand, 16430 - 16513
Alignment:
Q  252 aagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16430 aagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccacattatttctggtagtggtatt 16513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21429 - 21298
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  21429 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatttactcca 21330  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaag 224  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  21329 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaag 21298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3989 - 3868
Alignment:
Q  214 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggcca 313  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||| | ||||||||||||||| || || || ||||||||| | ||    
T  3989 agcatttgaaggtgattttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctatgtgtgaattctggttaaaagaagtaagttttcttagaca 3890  T
Q  314 tattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | |||||| |||||||| ||||    
T  3889 tgttatttttggtagtggtatt 3868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29199 - 28875
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||| ||   || ||||||||||  || ||| || || || ||||| ||    
T  29199 tgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgtt 29100  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaat 209  Q
    |||| | || ||||| |  ||||| ||||||| | | |||   |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||  |||||| ||  ||    
T  29099 tatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatctattctaagaatgaaga-gagcat 29001  T
Q  210 gccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttg 309  Q
    ||  ||||  |||   |||| ||||||||  ||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  29000 gcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctgg 28901  T
Q  310 gccatattatttctggtagtgatatt 335  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  28900 gtcacattatttctggtagtggtatt 28875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 310
Target Start/End: Original strand, 943 - 1141
Alignment:
Q  111 atggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaagaaaatg 210  Q
    |||||||| |||||| | || |||||| ||||||| || | |||||| || ||||| || || ||||||| | | || || |||||||| || ||  |||    
T  943 atggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccattttgtggtggtgtttatagatgatatttgg-tgtattcgaagtctgaggaggagcatg 1041  T
Q  211 ccaagcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttgg 310  Q
    |  ||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||    
T  1042 ctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgaattttggttgcaggaagtgagtttccttgg 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 238
Target Start/End: Original strand, 1743 - 1888
Alignment:
Q  93 aatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactcta 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | || |||||||| || ||||| || || ||||||||| | || || |    
T  1743 aatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcga 1842  T
Q  193 agtctgaagaagaaaatgccaagcatttgaagtttgttttgcaagt 238  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||| | |||| ||||||||    
T  1843 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 572
Alignment:
Q  10 tgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcagcgatgcctttcaatgctacaaatgcaccgggtgtatt 109  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||    | |||||| |||  || ||| ||||| || ||||| ||    
T  767 tgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 668  T
Q  110 tatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgttttgttgttgtgttcattgacgatattttgatatactctaagtctgaagaaga 205  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||| |||||   ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||| ||||||||||    
T  667 tatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaaga 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2288 - 2218
Alignment:
Q  253 agttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttct 323  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2288 agttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgttatttct 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Original strand, 4606 - 4692
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4606 tgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggtcatattatttctggta 4692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44829 - 44733
Alignment:
Q  231 ttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||||| |||| || || | ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  44829 ttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggtcacattatttctggta 44733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1274
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggta 327  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1360 tgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttctggta 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9288 - 9215
Alignment:
Q  214 agcatttgaagtttgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctgg 287  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  9288 agcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 6185 - 6241
Alignment:
Q  11 gaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaata 67  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  6185 gaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaata 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 329
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6503
Alignment:
Q  241 tgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggccatattatttctggtagt 329  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  6415 tgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgttaaaatgtgagttatggttaagtgaagtgagttttctgggttacattatttctggtagt 6503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University