View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16480_high_13 (Length: 336)

Name: NF16480_high_13
Description: NF16480
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16480_high_13
NF16480_high_13
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (14-155)||(38427563-38427704)
chr7 (14-155)||(1469493-1469634)
chr7 (14-155)||(8162712-8162853)
chr7 (14-155)||(47281124-47281265)
chr7 (14-154)||(44544409-44544549)
chr7 (14-155)||(23842305-23842446)
chr7 (14-155)||(42979338-42979479)
chr7 (14-154)||(47219145-47219285)
chr7 (14-155)||(31684134-31684275)
chr7 (14-155)||(35600122-35600263)
chr7 (14-155)||(43968259-43968400)
chr7 (14-155)||(47271981-47272122)
chr7 (14-155)||(47294291-47294432)
chr7 (14-155)||(11476556-11476697)
chr7 (14-155)||(30798368-30798509)
chr7 (14-155)||(40851274-40851415)
chr7 (35-155)||(2960640-2960760)
chr7 (18-154)||(33884323-33884459)
chr7 (14-155)||(30876259-30876400)
chr7 (18-155)||(37393998-37394135)
chr7 (37-155)||(221298-221416)
chr7 (18-155)||(11050261-11050398)
chr7 (14-155)||(27364339-27364480)
chr7 (14-155)||(41113377-41113518)
chr7 (14-155)||(43752776-43752917)
chr7 (14-155)||(48628805-48628946)
chr7 (18-150)||(4923220-4923352)
chr7 (19-155)||(7336065-7336200)
chr7 (14-154)||(29248342-29248482)
chr7 (14-155)||(30971941-30972082)
chr7 (14-155)||(45723491-45723632)
chr7 (14-130)||(3797548-3797664)
chr7 (14-155)||(41139408-41139553)
chr7 (14-155)||(47579086-47579228)
chr7 (18-155)||(18353148-18353285)
chr7 (18-130)||(37354288-37354400)
chr7 (14-155)||(47119991-47120134)
chr7 (18-155)||(44800410-44800547)
chr7 (14-130)||(27774108-27774224)
chr7 (14-107)||(40520918-40521011)
chr7 (102-155)||(42888937-42888990)
chr7 (14-74)||(39034062-39034122)
chr7 (99-135)||(5106127-5106163)
chr7 (29-65)||(12583316-12583352)
chr7 (14-63)||(29739781-29739829)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (16-155)||(26017425-26017564)
chr4 (14-154)||(40988633-40988773)
chr4 (14-155)||(4544985-4545126)
chr4 (14-155)||(42273802-42273943)
chr4 (14-155)||(55517185-55517326)
chr4 (16-155)||(8882013-8882152)
chr4 (14-155)||(28264643-28264784)
chr4 (14-155)||(33807780-33807921)
chr4 (14-155)||(11795154-11795295)
chr4 (14-155)||(12196469-12196610)
chr4 (14-155)||(17847096-17847236)
chr4 (14-155)||(17993017-17993158)
chr4 (14-155)||(28159953-28160094)
chr4 (14-155)||(31591076-31591216)
chr4 (14-155)||(31973591-31973732)
chr4 (14-155)||(48707733-48707874)
chr4 (19-155)||(49118616-49118752)
chr4 (14-155)||(5227390-5227531)
chr4 (14-155)||(28812287-28812427)
chr4 (14-155)||(19496102-19496243)
chr4 (18-155)||(23135006-23135143)
chr4 (14-155)||(30141108-30141249)
chr4 (18-155)||(32317957-32318094)
chr4 (14-155)||(35930040-35930180)
chr4 (14-154)||(32118714-32118854)
chr4 (19-155)||(44490324-44490460)
chr4 (16-155)||(24458631-24458770)
chr4 (15-154)||(33174021-33174160)
chr4 (14-155)||(22298517-22298659)
chr4 (17-155)||(48149502-48149640)
chr4 (14-155)||(15985010-15985151)
chr4 (18-155)||(23553069-23553205)
chr4 (18-155)||(30467003-30467140)
chr4 (46-155)||(31208776-31208885)
chr4 (14-155)||(39700045-39700186)
chr4 (16-155)||(2055280-2055419)
chr4 (14-153)||(10588580-10588719)
chr4 (14-155)||(14564796-14564937)
chr4 (14-155)||(39995167-39995308)
chr4 (18-155)||(48551764-48551901)
chr4 (14-155)||(50542354-50542495)
chr4 (14-130)||(19168820-19168936)
chr4 (14-130)||(24623148-24623264)
chr4 (14-155)||(9339123-9339267)
chr4 (16-154)||(37381848-37381986)
chr4 (18-155)||(25734223-25734360)
chr4 (14-155)||(33693333-33693474)
chr4 (16-155)||(50276138-50276274)
chr4 (14-155)||(51371047-51371188)
chr4 (18-155)||(25730244-25730381)
chr4 (14-95)||(56555200-56555281)
chr4 (34-130)||(42549647-42549743)
chr4 (74-155)||(20534225-20534306)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (14-155)||(20086314-20086455)
chr3 (14-155)||(55164115-55164256)
chr3 (14-155)||(21564496-21564637)
chr3 (14-155)||(38446476-38446617)
chr3 (14-155)||(1017044-1017185)
chr3 (18-155)||(1687655-1687792)
chr3 (14-155)||(21656518-21656659)
chr3 (14-155)||(33151696-33151837)
chr3 (14-155)||(36314972-36315113)
chr3 (14-155)||(20813441-20813582)
chr3 (18-155)||(35346471-35346608)
chr3 (14-155)||(42107099-42107240)
chr3 (14-150)||(19664541-19664677)
chr3 (19-155)||(21890175-21890311)
chr3 (14-149)||(22851996-22852131)
chr3 (14-155)||(20760071-20760212)
chr3 (14-155)||(31122662-31122803)
chr3 (18-155)||(32650820-32650957)
chr3 (18-155)||(10618480-10618617)
chr3 (14-155)||(26455582-26455723)
chr3 (14-155)||(27070739-27070880)
chr3 (14-155)||(35608131-35608272)
chr3 (14-155)||(41250886-41251027)
chr3 (14-155)||(47329175-47329316)
chr3 (14-155)||(48651248-48651389)
chr3 (18-155)||(50287570-50287707)
chr3 (14-155)||(51562162-51562303)
chr3 (19-155)||(42016878-42017014)
chr3 (14-155)||(1448735-1448873)
chr3 (14-147)||(12748391-12748524)
chr3 (18-155)||(40922165-40922302)
chr3 (14-155)||(44798268-44798408)
chr3 (14-155)||(53925979-53926120)
chr3 (14-154)||(29677476-29677616)
chr3 (16-155)||(3697148-3697287)
chr3 (14-123)||(19268521-19268630)
chr3 (14-155)||(37247956-37248097)
chr3 (14-155)||(53196014-53196155)
chr3 (18-130)||(51475271-51475383)
chr3 (14-155)||(52821049-52821190)
chr3 (35-155)||(20913754-20913874)
chr3 (35-155)||(20921872-20921992)
chr3 (16-130)||(50977866-50977980)
chr3 (16-130)||(51080998-51081112)
chr3 (221-320)||(44152880-44152979)
chr3 (14-155)||(45380260-45380401)
chr3 (14-155)||(33473239-33473380)
chr3 (14-155)||(39069726-39069867)
chr3 (14-130)||(50364912-50365028)
chr3 (14-127)||(28699685-28699798)
chr3 (16-130)||(34019462-34019576)
chr3 (14-155)||(38923998-38924139)
chr3 (14-84)||(44152700-44152770)
chr3 (45-120)||(42641213-42641288)
chr3 (14-78)||(47473230-47473294)
chr3 (113-155)||(44152772-44152814)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (18-155)||(37838301-37838438)
chr2 (14-155)||(40854609-40854750)
chr2 (14-155)||(16246193-16246334)
chr2 (14-155)||(27328584-27328725)
chr2 (14-155)||(34253142-34253283)
chr2 (14-155)||(921022-921163)
chr2 (14-155)||(28650426-28650567)
chr2 (14-149)||(771981-772116)
chr2 (14-155)||(1106559-1106700)
chr2 (14-155)||(11949426-11949567)
chr2 (14-155)||(41500502-41500643)
chr2 (14-148)||(3430631-3430765)
chr2 (14-155)||(7378963-7379104)
chr2 (14-155)||(9276574-9276715)
chr2 (14-155)||(33106969-33107110)
chr2 (14-155)||(33865267-33865408)
chr2 (14-154)||(17134229-17134369)
chr2 (14-154)||(38751048-38751188)
chr2 (14-155)||(2094410-2094551)
chr2 (14-155)||(2456010-2456151)
chr2 (14-155)||(42629962-42630103)
chr2 (14-154)||(36444229-36444369)
chr2 (16-155)||(2314975-2315114)
chr2 (16-155)||(7297234-7297373)
chr2 (17-155)||(2056929-2057067)
chr2 (14-155)||(8899682-8899822)
chr2 (18-155)||(17484550-17484687)
chr2 (14-155)||(19180422-19180562)
chr2 (14-155)||(43249412-43249553)
chr2 (14-150)||(36211046-36211182)
chr2 (14-155)||(12759750-12759890)
chr2 (14-155)||(29737748-29737889)
chr2 (14-155)||(37732193-37732334)
chr2 (15-155)||(45124120-45124260)
chr2 (18-155)||(25087796-25087933)
chr2 (14-130)||(8396576-8396692)
chr2 (29-134)||(37654123-37654228)
chr2 (14-115)||(41178059-41178160)
chr2 (14-130)||(19916012-19916128)
chr2 (63-155)||(14630663-14630755)
chr2 (65-155)||(23671811-23671901)
chr2 (15-155)||(9331757-9331897)
chr2 (14-70)||(23672958-23673014)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (16-155)||(49814302-49814441)
chr1 (14-155)||(12143072-12143213)
chr1 (14-155)||(23767414-23767555)
chr1 (14-155)||(26549388-26549529)
chr1 (14-155)||(41106016-41106157)
chr1 (14-155)||(46825531-46825672)
chr1 (14-155)||(19315640-19315781)
chr1 (14-155)||(28425363-28425504)
chr1 (14-155)||(38473626-38473767)
chr1 (18-155)||(49094711-49094848)
chr1 (14-154)||(19274559-19274699)
chr1 (16-155)||(25988271-25988410)
chr1 (14-155)||(7553016-7553157)
chr1 (14-155)||(7651662-7651803)
chr1 (14-155)||(33325727-33325868)
chr1 (14-155)||(36157678-36157818)
chr1 (14-155)||(46095075-46095216)
chr1 (14-155)||(52349924-52350065)
chr1 (14-155)||(7608766-7608907)
chr1 (14-155)||(16705870-16706011)
chr1 (14-155)||(18892329-18892470)
chr1 (14-155)||(33674017-33674158)
chr1 (14-155)||(46051450-46051591)
chr1 (18-155)||(48669396-48669533)
chr1 (14-155)||(48802331-48802472)
chr1 (14-154)||(50533383-50533523)
chr1 (18-155)||(9962755-9962892)
chr1 (14-155)||(23228194-23228335)
chr1 (18-155)||(26069896-26070033)
chr1 (14-152)||(24204474-24204612)
chr1 (18-155)||(45350717-45350852)
chr1 (14-155)||(52146993-52147134)
chr1 (16-155)||(36781172-36781311)
chr1 (18-155)||(37216900-37217037)
chr1 (14-155)||(50689943-50690084)
chr1 (35-155)||(5400891-5401011)
chr1 (14-155)||(40721342-40721484)
chr1 (18-155)||(45670486-45670623)
chr1 (18-155)||(8141486-8141623)
chr1 (18-155)||(9878784-9878921)
chr1 (18-155)||(34971084-34971221)
chr1 (14-155)||(43396675-43396816)
chr1 (14-155)||(6711440-6711581)
chr1 (18-127)||(48319074-48319183)
chr1 (14-155)||(52067651-52067792)
chr1 (14-118)||(12964646-12964750)
chr1 (14-130)||(30281631-30281747)
chr1 (14-130)||(33194676-33194792)
chr1 (18-153)||(41982237-41982372)
chr1 (18-135)||(9974846-9974963)
chr1 (14-155)||(17983898-17984039)
chr1 (18-155)||(21965069-21965206)
chr1 (19-155)||(33714361-33714495)
chr1 (18-155)||(18782089-18782226)
chr1 (18-130)||(16506813-16506925)
chr1 (14-154)||(18917524-18917664)
chr1 (40-155)||(21929545-21929667)
chr1 (18-155)||(25800648-25800782)
chr1 (54-155)||(44978768-44978868)
chr1 (14-71)||(50099220-50099277)
chr1 (14-62)||(44979281-44979329)
chr1 (14-58)||(32373650-32373694)
chr1 (16-58)||(17989864-17989906)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-155)||(218885-219027)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (14-155)||(1915343-1915484)
chr6 (14-154)||(6503718-6503858)
chr6 (14-155)||(3408189-3408330)
chr6 (14-155)||(10256237-10256378)
chr6 (18-155)||(17943040-17943177)
chr6 (18-155)||(30379021-30379158)
chr6 (18-155)||(1077241-1077378)
chr6 (14-155)||(2707459-2707600)
chr6 (14-155)||(8178249-8178390)
chr6 (14-155)||(12626636-12626777)
chr6 (18-155)||(26393009-26393146)
chr6 (14-155)||(29050272-29050413)
chr6 (16-155)||(2390267-2390406)
chr6 (14-155)||(9382519-9382660)
chr6 (34-155)||(17428272-17428393)
chr6 (14-155)||(26230932-26231073)
chr6 (14-155)||(11133873-11134015)
chr6 (18-155)||(16193314-16193451)
chr6 (35-135)||(35223919-35224019)
chr6 (14-155)||(3258807-3258948)
chr6 (35-155)||(2598099-2598219)
chr6 (14-130)||(26936607-26936723)
chr6 (14-155)||(6785101-6785239)
chr6 (18-155)||(26196321-26196458)
chr6 (35-155)||(10931148-10931267)
chr6 (68-155)||(31375971-31376058)
chr6 (18-154)||(25820550-25820686)
chr6 (97-155)||(12612971-12613029)
chr6 (76-155)||(12612848-12612927)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (18-155)||(14717609-14717746)
chr5 (14-155)||(6739955-6740096)
chr5 (14-155)||(8215900-8216041)
chr5 (14-155)||(19659501-19659642)
chr5 (14-155)||(30297749-30297890)
chr5 (14-155)||(35342180-35342321)
chr5 (14-154)||(41282342-41282482)
chr5 (16-155)||(39002025-39002164)
chr5 (18-155)||(6600136-6600273)
chr5 (14-155)||(11000728-11000869)
chr5 (14-155)||(11692147-11692288)
chr5 (14-155)||(16095960-16096100)
chr5 (14-155)||(33760470-33760611)
chr5 (14-155)||(38964114-38964254)
chr5 (14-154)||(30863253-30863393)
chr5 (9-155)||(23128913-23129059)
chr5 (14-155)||(3352002-3352143)
chr5 (14-155)||(4015874-4016015)
chr5 (14-155)||(6251972-6252113)
chr5 (14-155)||(8689572-8689713)
chr5 (18-155)||(14952328-14952465)
chr5 (14-155)||(20079258-20079399)
chr5 (14-155)||(26593280-26593421)
chr5 (14-155)||(27457197-27457338)
chr5 (14-155)||(31710282-31710423)
chr5 (14-155)||(39824556-39824697)
chr5 (14-155)||(40074950-40075091)
chr5 (14-155)||(42993518-42993659)
chr5 (14-155)||(28078405-28078546)
chr5 (14-155)||(30208402-30208543)
chr5 (14-155)||(43166269-43166410)
chr5 (18-155)||(20408537-20408674)
chr5 (22-155)||(1052541-1052674)
chr5 (18-155)||(27116099-27116236)
chr5 (18-155)||(11935450-11935586)
chr5 (18-155)||(19398193-19398330)
chr5 (14-130)||(16752116-16752232)
chr5 (14-116)||(6331377-6331479)
chr5 (14-130)||(26035371-26035487)
chr5 (14-155)||(8694866-8695007)
chr5 (38-130)||(444978-445070)
chr5 (14-155)||(27509978-27510112)
chr5 (221-250)||(11935652-11935681)
chr5 (111-155)||(6332873-6332917)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (14-155)||(114-255)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (14-155)||(35443311-35443452)
chr8 (19-155)||(15847117-15847253)
chr8 (14-155)||(513308-513448)
chr8 (14-155)||(2533272-2533413)
chr8 (18-155)||(37933646-37933783)
chr8 (18-155)||(38107103-38107240)
chr8 (14-155)||(1293486-1293627)
chr8 (14-155)||(3875908-3876049)
chr8 (14-155)||(9056338-9056479)
chr8 (14-155)||(28707446-28707587)
chr8 (14-155)||(36400070-36400211)
chr8 (25-155)||(41536527-41536657)
chr8 (18-155)||(259982-260118)
chr8 (18-155)||(655803-655939)
chr8 (18-155)||(841538-841674)
chr8 (14-155)||(43806533-43806674)
chr8 (16-155)||(35884430-35884569)
chr8 (14-155)||(22683988-22684129)
chr8 (14-155)||(33651841-33651982)
chr8 (14-155)||(38633710-38633851)
chr8 (18-155)||(440844-440981)
chr8 (14-155)||(28496355-28496495)
chr8 (18-155)||(40301893-40302030)
chr8 (14-130)||(7434886-7435002)
chr8 (14-130)||(23935233-23935349)
chr8 (14-150)||(39513344-39513480)
chr8 (14-155)||(12010549-12010693)
chr8 (14-155)||(23972295-23972437)
chr8 (18-155)||(38208756-38208894)
chr8 (14-155)||(13797089-13797229)
chr8 (14-155)||(24430571-24430712)
chr8 (16-130)||(6016207-6016321)
chr8 (18-155)||(4649154-4649291)
chr8 (14-155)||(42988227-42988367)
chr8 (14-130)||(29485287-29485402)
chr8 (18-155)||(36218781-36218917)
chr8 (90-154)||(24193131-24193195)
chr8 (14-84)||(24193364-24193433)
chr8 (36-79)||(8137196-8137239)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (18-155)||(5190-5326)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (18-155)||(5027-5164)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-155)||(252438-252579)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (18-154)||(11362-11498)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (14-130)||(1998-2114)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (19-155)||(47967-48103)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (18-155)||(13099-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (18-155)||(59608-59745)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (74-155)||(3371-3452)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (74-155)||(599-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (74-155)||(1913-1994)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (74-155)||(1877-1958)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (14-64)||(19781-19831)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (14-67)||(289-342)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38427704 - 38427563
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38427704 agagcattatccgccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38427605  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38427604 accaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 38427563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1469634 - 1469493
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1469634 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaacaaagatgagttcaaggaagcaatt 1469535  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1469534 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1469493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8162853 - 8162712
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8162853 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataacaaagatgagttcaaggaagcaatt 8162754  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8162753 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 8162712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47281265 - 47281124
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47281265 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47281166  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47281165 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47281124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 44544409 - 44544549
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  44544409 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 44544508  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44544509 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 44544549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 23842305 - 23842446
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23842305 agagcattatccaccatctgccatgcctaaaaagatgactaatttgaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 23842404  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23842405 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 23842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42979479 - 42979338
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42979479 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttgatatcaaagatgagttcaacgaagcaatt 42979380  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  42979379 accaactatgttatctacagtaggacttgtttgaaacgattc 42979338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 47219145 - 47219285
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  47219145 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47219244  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47219245 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 47219285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31684275 - 31684134
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31684275 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31684176  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31684175 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31684134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35600263 - 35600122
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35600263 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35600164  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  35600163 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 35600122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43968400 - 43968259
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43968400 agagcattatccaccatttgtcatgcctataaagatgactaattttaagtgggtattatgagccaaatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 43968301  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43968300 accaactacgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 43968259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 47271981 - 47272122
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  47271981 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47272080  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47272081 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47294432 - 47294291
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  47294432 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47294333  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47294332 accaacgatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 47294291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11476697 - 11476556
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11476697 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11476598  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11476597 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11476556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30798509 - 30798368
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30798509 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30798410  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  30798409 accaactatgctatctacaataggatttgtttgaaacgattc 30798368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40851274 - 40851415
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  40851274 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 40851373  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40851374 accaactattctacctacaataggacttgtttgaaacgattc 40851415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2960760 - 2960640
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  2960760 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaat 2960661  T
Q  135 aggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  2960660 aggacttgtttgaaacgattc 2960640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Original strand, 33884323 - 33884459
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884323 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 33884422  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  33884423 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgatt 33884459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 30876259 - 30876400
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||| |||||||||    
T  30876259 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcccaatttggtaccaaaaatgagttcaatgaagcaatt 30876358  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  30876359 accaactatgctatctacaatagcacttgtttgaaacgattc 30876400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37394135 - 37393998
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37394135 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactacca 37394036  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37394035 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37393998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 155
Target Start/End: Original strand, 221298 - 221416
Alignment:
Q  37 tgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataatag 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  221298 tgcctaaaaagaagactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattaccaactatgctatctacaatag 221397  T
Q  137 gacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  221398 gacttgtttgaaacgattc 221416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11050398 - 11050261
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11050398 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggaggcagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaattacca 11050299  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11050298 aatatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11050261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27364480 - 27364339
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27364480 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaatt 27364381  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  27364380 accaactatgttatctacaataggatctgtttgaaacgattc 27364339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 41113377 - 41113518
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  41113377 agagcattattcatcatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 41113476  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  41113477 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 41113518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43752917 - 43752776
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  43752917 agagcattatccaccatttgtcctgcctcaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43752818  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43752817 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 43752776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 48628805 - 48628946
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  48628805 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtgcaaaaaatgagttcaaggaagcaatt 48628904  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  48628905 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 48628946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Original strand, 4923220 - 4923352
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4923220 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 4923319  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaac 150  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  4923320 actatgctatccacaataggacttgtttgaaac 4923352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 7336065 - 7336200
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7336065 attattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaatgatgagttcaaggaagcaattatcaa 7336164  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||    
T  7336165 ctatgctatctacaatagaac-tgtttgaaacgattc 7336200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 29248342 - 29248482
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29248342 agagaattatccacaatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttgatgccaaagatgagttcaaggaatcaatt 29248441  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  29248442 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaatgatt 29248482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30972082 - 30971941
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  30972082 agagcattatccacaatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgggtttaaggaagtaatt 30971983  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  30971982 accaactatgccatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 30971941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45723632 - 45723491
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  45723632 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatt 45723533  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || || ||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  45723532 actaattatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgattc 45723491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3797664 - 3797548
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3797664 agagcattatccaccatttaacatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3797565  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  3797564 atcaactatgctatcta 3797548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41139553 - 41139408
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  41139553 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41139454  T
Q  114 accaac----tatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  41139453 accaactatatatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 41139408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47579228 - 47579086
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagc-aat 112  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  47579228 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatggttaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaaat 47579129  T
Q  113 taccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  47579128 taccaattatgctatctataataggacttgtctgaaacaattc 47579086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 18353148 - 18353285
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18353148 cattatccaccatttatcatgtctaaaaagatgactaattttaattaggtgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaagaaaacaattacca 18353247  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  18353248 actatgctatctaccttaggacttgtttgaaacgattc 18353285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37354400 - 37354288
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37354400 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccaaatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 37354301  T
Q  118 actatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||    
T  37354300 actatgctatcta 37354288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 47119991 - 47120134
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  47119991 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaatatgagttcaagaaagcaatt 47120090  T
Q  114 accaac--tatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47120091 accaactatatgctctctacaataggacttgtttgaaacgattc 47120134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44800547 - 44800410
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44800547 cattatccaccatatatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccatatttggtaccaaagatgagttcaatgaaacaattacca 44800448  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  44800447 actatgttatctacaacaggacttgtttgaaacaattc 44800410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 27774108 - 27774224
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  27774108 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctgattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaatt 27774207  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  27774208 accaactatgctatcta 27774224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Original strand, 40520918 - 40521011
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaa 107  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  40520918 agagcattatccaccatttgccatggctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaa 40521011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 42888937 - 42888990
Alignment:
Q  102 aaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42888937 aaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Original strand, 39034062 - 39034122
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagga 74  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39034062 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggcgttagga 39034122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 135
Target Start/End: Original strand, 5106127 - 5106163
Alignment:
Q  99 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataata 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5106127 ttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaata 5106163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 65
Target Start/End: Original strand, 12583316 - 12583352
Alignment:
Q  29 atttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg 65  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12583316 atttttcatgcgtaaaaagatgactaattttaagtgg 12583352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Original strand, 29739781 - 29739829
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagt 63  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29739781 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaa-gatgactaattttaagt 29739829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 26017425 - 26017564
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26017425 agcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 26017524  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26017525 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 26017564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 40988633 - 40988773
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40988633 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40988732  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40988733 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 40988773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4545126 - 4544985
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4545126 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 4545027  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4545026 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 4544985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 42273802 - 42273943
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42273802 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42273901  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42273902 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42273943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 55517326 - 55517185
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  55517326 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 55517227  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  55517226 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 55517185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8882152 - 8882013
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  8882152 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaagaagcaattat 8882053  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8882052 caactatgctatctagaataggacttgtttgaaacgattc 8882013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 28264643 - 28264784
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28264643 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28264742  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28264743 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28264784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33807921 - 33807780
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  33807921 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 33807822  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33807821 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33807780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11795295 - 11795154
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  11795295 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11795196  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  11795195 accaactatgctatctagaatatgacttgtttgaaacgattc 11795154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12196469 - 12196610
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  12196469 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12196568  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  12196569 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 12196610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17847236 - 17847096
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847236 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaa-gatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 17847138  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17847137 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17993158 - 17993017
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  17993158 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 17993059  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  17993058 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 17993017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28160094 - 28159953
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28160094 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 28159995  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  28159994 accaactatggtatctacaataagacttgtttgaaatgattc 28159953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31591076 - 31591216
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31591076 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31591174  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31591175 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31591216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31973591 - 31973732
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31973591 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31973690  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  31973691 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 31973732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48707874 - 48707733
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  48707874 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 48707775  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  48707774 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaaagattc 48707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 49118616 - 49118752
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49118616 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 49118715  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49118716 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 49118752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 5227390 - 5227531
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  5227390 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatactaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 5227489  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5227490 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 5227531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28812427 - 28812287
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  28812427 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgacttcaaggaagcaatt 28812329  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28812328 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28812287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19496243 - 19496102
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19496243 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggcgccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19496144  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19496143 accaactatggtatctacaataggacttgtttgaaacaattc 19496102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23135143 - 23135006
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135143 cattagccaccatttggcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 23135044  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23135043 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 23135006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30141249 - 30141108
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  30141249 agagcattatccatcatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 30141150  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  30141149 accaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattc 30141108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 32317957 - 32318094
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32317957 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagacagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 32318056  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  32318057 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattc 32318094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 35930040 - 35930180
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  35930040 agagcattatccacc-tttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcatggaagcaatt 35930138  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  35930139 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 35930180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 32118714 - 32118854
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  32118714 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagggggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 32118813  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  32118814 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgatt 32118854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 44490324 - 44490460
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44490324 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaactttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 44490423  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44490424 ctatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 44490460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24458770 - 24458631
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24458770 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 24458671  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  24458670 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 24458631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33174160 - 33174021
Alignment:
Q  15 gagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33174160 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatta 33174061  T
Q  115 ccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  33174060 ccaactatgaaatctacaataagacttgtttgaaacgatt 33174021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 22298517 - 22298659
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaa-agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22298517 agagcattatccaccatttgctatgcctaaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagtttaaggaaacaat 22298616  T
Q  113 taccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  22298617 taccaattatgctatctacaatagggcttgtttgaaacgattc 22298659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 48149502 - 48149640
Alignment:
Q  17 gcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacc 116  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48149502 gcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgtcaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 48149601  T
Q  117 aactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  48149602 aactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 48149640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 15985010 - 15985151
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15985010 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagattactgattttaagtaggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 15985109  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  15985110 accaactatgttatctagaatatgacttgtttgaaacgattc 15985151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 23553069 - 23553205
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23553069 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 23553167  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  23553168 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 23553205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30467140 - 30467003
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30467140 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaaatgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaattacca 30467041  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  30467040 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 30467003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 31208776 - 31208885
Alignment:
Q  46 agatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31208776 agatgactaattttaagtgggtgttgggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgttt 31208875  T
Q  146 gaaacgattc 155  Q
    ||||||||||    
T  31208876 gaaacgattc 31208885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 39700045 - 39700186
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  39700045 agagcattattcacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaagagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 39700144  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39700145 accaattatgttatctataataagacttgtttgaaacgattc 39700186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 2055280 - 2055419
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||     
T  2055280 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaactttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattat 2055379  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  2055380 caactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2055419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 10588580 - 10588719
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  10588580 agagcattatctgccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 10588679  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgat 153  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  10588680 accaactatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgat 10588719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 14564796 - 14564937
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  14564796 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 14564895  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  14564896 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 14564937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39995308 - 39995167
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  39995308 agaggattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 39995209  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  39995208 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 39995167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48551901 - 48551764
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48551901 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagattttgtaccaaagatgagttcaagaaagcaattacca 48551802  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  48551801 accatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 48551764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50542495 - 50542354
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  50542495 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50542396  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||||    
T  50542395 accaactatgctatctacaataagatttgtttaaaacgattc 50542354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19168936 - 19168820
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19168936 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgagtcaaatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19168837  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  19168836 accaactatgctatcta 19168820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 24623148 - 24623264
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24623148 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaataactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 24623247  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  24623248 accaactatgctatcta 24623264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9339267 - 9339123
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaa---gatgagttcaaggaagca 110  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||    
T  9339267 agagcattattcaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgatgagttcaaggaagca 9339168  T
Q  111 attaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  9339167 attaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaatgattc 9339123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 154
Target Start/End: Original strand, 37381848 - 37381986
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37381848 agcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatggtaccaaaaatgagtttaaggaagcaattac 37381947  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  37381948 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaatgatt 37381986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25734360 - 25734223
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25734360 cattatccaccgtttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacgaaagatgagttcaattaagcaattacca 25734261  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  25734260 actatgttatctacaataggacttgtttgaaatgattc 25734223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33693474 - 33693333
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| |  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33693474 agagcattatctatcatttgccatgtctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33693375  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  33693374 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattc 33693333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50276274 - 50276138
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  50276274 agcattatccaccgtttgccatgcctaaaaaga---ctaattttaagtgggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 50276178  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  50276177 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 50276138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 51371188 - 51371047
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  51371188 agagcattattcaccatttgccatgtctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgaattcaaggaagcaatt 51371089  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  51371088 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 51371047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 25730244 - 25730381
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25730244 cattatccactatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcggatttagtgccaaagatgagttcaaggaatcaattacca 25730343  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  25730344 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 25730381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 56555281 - 56555200
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagat 95  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  56555281 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtcaggagccagatttggtaccaaagat 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42549743 - 42549647
Alignment:
Q  34 tcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42549743 tcatgcctaaaaagatgattgattttaagtgggtgttaggagccaaatttagtaccaaagataagttcaatgaagcaattaccaactatgttatcta 42549647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Original strand, 20534225 - 20534306
Alignment:
Q  74 agccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  20534225 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattaccaactatgctatcaacaataggacttgtttgaaacgattc 20534306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20086455 - 20086314
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20086455 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20086356  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20086355 accaagtatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 20086314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 55164256 - 55164115
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55164256 agagcattatccactatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 55164157  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  55164156 agcaactatgctatctacaatatgacttatttgaaacaattc 55164115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 21564496 - 21564637
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21564496 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21564595  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21564596 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 21564637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 38446476 - 38446617
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38446476 agagcattatctactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38446575  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  38446576 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38446617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 1017044 - 1017185
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1017044 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1017143  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1017144 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1017185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 1687655 - 1687792
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687655 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1687754  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1687755 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 1687792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 21656518 - 21656659
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21656518 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaaggtgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 21656617  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  21656618 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 21656659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33151696 - 33151837
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  33151696 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagattagttcaaggaagcaatt 33151795  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33151796 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33151837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36315113 - 36314972
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36315113 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 36315014  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  36315013 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 36314972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20813582 - 20813441
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20813582 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20813483  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||    
T  20813482 accaattatgctatctacattatgacttgtttgaaacgattc 20813441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35346608 - 35346471
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346608 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattttgtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 35346509  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  35346508 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 35346471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42107240 - 42107099
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42107240 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtgtcaaagatgagttcaaggaagtaatt 42107141  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42107140 accaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 42107099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 19664541 - 19664677
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19664541 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttatgagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 19664640  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaac 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19664641 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaac 19664677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 21890175 - 21890311
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890175 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 21890274  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21890275 atatgttatctataataggacttgtttgaaacgattc 21890311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 22851996 - 22852131
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  22851996 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaacagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 22852095  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaa 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22852096 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaa 22852131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20760212 - 20760071
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20760212 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 20760113  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  20760112 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 20760071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31122662 - 31122803
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31122662 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtcttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31122761  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  31122762 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 31122803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32650957 - 32650820
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650957 cattatccaccatttgccatgcctagaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 32650858  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  32650857 actatgctatctataatagaacttgtttgaaatgattc 32650820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10618617 - 10618480
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10618617 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaattacca 10618518  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10618517 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 10618480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 26455582 - 26455723
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26455582 agagcgttatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 26455681  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  26455682 accaactatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 26455723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27070880 - 27070739
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27070880 agagcattatccaccatttataatgtctgaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 27070781  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  27070780 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 27070739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35608272 - 35608131
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  35608272 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttaggagtccgatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 35608173  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35608172 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaacgattc 35608131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 41250886 - 41251027
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  41250886 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 41250985  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  41250986 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattc 41251027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47329316 - 47329175
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47329316 agagcattatccaccatttgccatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 47329217  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||    
T  47329216 accaactatgctatctacgatatgacttgttggaaacgattc 47329175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 48651248 - 48651389
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48651248 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagacgattaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagtttaaggaagcaatt 48651347  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  48651348 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 48651389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 50287570 - 50287707
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  50287570 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagtttaatgaagcaattacca 50287669  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  50287670 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 50287707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 51562162 - 51562303
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  51562162 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 51562261  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  51562262 accaactatgttatctacattagaacttgtttgaaacgattc 51562303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 42016878 - 42017014
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42016878 attatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaattaccaa 42016977  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  42016978 ctatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 42017014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1448873 - 1448735
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1448873 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatactaaagatgagttcaaggaagcaatt 1448774  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||   | |||||||||| |||||||||||||    
T  1448773 accaactatggta---acaataggacttctttgaaacgattc 1448735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 12748391 - 12748524
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12748391 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaacagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12748490  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttga 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12748491 accaactatgctatctacaataggacttgtttga 12748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40922302 - 40922165
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40922302 cattatccaccattttccatgcctaaaaaaattactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagtaattacca 40922203  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  40922202 actatgctatctacaatacgacttgtttgaaacgattc 40922165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 44798268 - 44798408
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  44798268 agagcattatccaccatttgacatgcctaaaaa-atgagtaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 44798366  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44798367 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 44798408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 53926120 - 53925979
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  53926120 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 53926021  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  53926020 accaactatactatctacaatatgacttatttgaaatgattc 53925979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 29677476 - 29677616
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29677476 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaaatgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29677575  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  29677576 acaaactatgatatctacgataggacctgtttgaaacgatt 29677616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 3697148 - 3697287
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3697148 agcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgaattcaatgaagcaattac 3697247  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  3697248 caactatactatctacaataggacttgtttgaaaggattc 3697287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 19268521 - 19268630
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  19268521 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 19268620  T
Q  114 accaactatg 123  Q
    ||||||||||    
T  19268621 accaactatg 19268630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 37247956 - 37248097
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  37247956 agagcattattcatcatttgtcatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 37248055  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37248056 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37248097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 53196014 - 53196155
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||    
T  53196014 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagcgagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaataatt 53196113  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  53196114 accaactatgttatctacaataagacttctttgaaacgattc 53196155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 51475383 - 51475271
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51475383 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttatgaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 51475284  T
Q  118 actatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||    
T  51475283 actatgctatcta 51475271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52821190 - 52821049
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  52821190 agagcattatccatcatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagttttactaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 52821091  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| ||| |||||||||    
T  52821090 accaactatgttatctacaacaggacttgtttaaaacgattc 52821049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20913874 - 20913754
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20913874 catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaat 20913775  T
Q  135 aggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  20913774 agaacttgtttgaaacgattc 20913754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20921992 - 20921872
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20921992 catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattatcaactatgctatctacaat 20921893  T
Q  135 aggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  20921892 agaacttgtttgaaacgattc 20921872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Original strand, 50977866 - 50977980
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50977866 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 50977965  T
Q  116 caactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||    
T  50977966 caactatgctatcta 50977980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Original strand, 51080998 - 51081112
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51080998 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactgattttaagtgggcgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaactac 51081097  T
Q  116 caactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||    
T  51081098 caactatgctatcta 51081112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 221 - 320
Target Start/End: Original strand, 44152880 - 44152979
Alignment:
Q  221 cttaaaggacctttagatacatttgatctagttttaaagacaaacgatattcttgtaataggttttgtttgagaaacaccatgtttggttcagaaacatt 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44152880 cttaaaggacctttagatgcatttgaccttgttttaaagacaaacgatatttctgtaataggttttgtttgagaaacaccatgtttggttcagaaacatt 44152979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45380401 - 45380260
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||    
T  45380401 agagcattatccaccatttaccatgcataaaaagatgactaattttaagt-ggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagtttaaagaagcaatt 45380303  T
Q  114 a-ccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  45380302 atcaaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 45380260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33473380 - 33473239
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||| |  |||||||| |||||    
T  33473380 agagcattatccaccatttatcatgactaaaaagatgactaattttaagtgcgtgttagaaaccagatttggtaccaaagataaaatcaaggaaacaatt 33473281  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  33473280 accaactatgttatctacaataaaacttgtttgaaacgattc 33473239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 39069726 - 39069867
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||    
T  39069726 agagcattatccaccatttgccatgcatgaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccagatttggtaccaaagataagttaaaggaaacaatt 39069825  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||    
T  39069826 atcaactatgctattaacaatatgacttgtttgaaacgattc 39069867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 50365028 - 50364912
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  50365028 agagcattacccaccatttgccatgcctaaaaagattactgattttaagtgagtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 50364929  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  50364928 accaactatgttatcta 50364912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 28699685 - 28699798
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  28699685 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtgccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28699784  T
Q  114 accaactatgctat 127  Q
    | | |||| |||||    
T  28699785 atctactaagctat 28699798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Original strand, 34019462 - 34019576
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||||| |||||||||     
T  34019462 agcattatccaccatttgacatgcctaaaaatatggctgattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacagtgagttcaagtaagcaattat 34019561  T
Q  116 caactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||    
T  34019562 caactatgctatcta 34019576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38924139 - 38923998
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38924139 agagcgttattcattatttgtcatgcttaaagagatgattaattttaagtggatgttaggagtccaatttggtaccaaagataagttcaacgaagcaatt 38924040  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  38924039 accaactattttatctacgataggacttgtttgaaacaattc 38923998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 44152700 - 44152770
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 84  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44152700 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagtcagatttg 44152770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 42641288 - 42641213
Alignment:
Q  45 aagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42641288 aagatgattgattttaagtgggtgttaggaggcagacttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaact 42641213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 47473230 - 47473294
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagcca 78  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47473230 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatggctaattttaagtggatgttaggagcca 47473294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Original strand, 44152772 - 44152814
Alignment:
Q  113 taccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44152772 taccaactatgttatctataatatgacttgtttgaaacgattc 44152814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 37838301 - 37838438
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37838301 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaattacca 37838400  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37838401 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37838438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40854609 - 40854750
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40854609 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 40854708  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40854709 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 40854750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16246334 - 16246193
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16246334 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16246235  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16246234 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 16246193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 27328584 - 27328725
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27328584 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27328683  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27328684 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 27328725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 34253142 - 34253283
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34253142 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaatt 34253241  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34253242 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 34253283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 921022 - 921163
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  921022 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 921121  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  921122 atcaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 921163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28650567 - 28650426
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28650567 agagcattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaatt 28650468  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28650467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28650426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 772116 - 771981
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  772116 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 772017  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaa 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  772016 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaa 771981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1106700 - 1106559
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1106700 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1106601  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1106600 accaattatgctatctacaataggacttatttgaaatgattc 1106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11949567 - 11949426
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  11949567 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 11949468  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11949467 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11949426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41500643 - 41500502
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41500643 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41500544  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  41500543 accaactatgctatgtacaataggacttgtttgaaacgattc 41500502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3430765 - 3430631
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430765 agagcattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 3430666  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3430665 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaa 3430631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 7378963 - 7379104
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7378963 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagaggactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7379062  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||    
T  7379063 accaactattctatctacattatgacttgtttgaaacgattc 7379104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 9276574 - 9276715
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9276574 agagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9276673  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9276674 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 9276715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33107110 - 33106969
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33107110 agagcattatttaccatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33107011  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  33107010 accaactatgatatctacaataggactcgtttgaaacgattc 33106969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33865408 - 33865267
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33865408 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 33865309  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  33865308 accaactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 33865267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 17134229 - 17134369
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17134229 agagcattatccatcatttgccattcctaaaaagatgactacttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 17134328  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17134329 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgatt 17134369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 38751048 - 38751188
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38751048 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtggatgttaggagccacatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38751147  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  38751148 accaactatactatctacattaggacttgtttgaaacgatt 38751188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2094551 - 2094410
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2094551 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccaaatttagtatcaaagattagttcaaggaagcaatt 2094452  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2094451 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2094410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 2456010 - 2456151
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2456010 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2456109  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  2456110 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 2456151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 42629962 - 42630103
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  42629962 agagcatcatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 42630061  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42630062 atcaattatgctatctatgataggacttgtttgaaacgattc 42630103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36444369 - 36444229
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36444369 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtaggtgttatgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36444270  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  36444269 accaactatgctatctactataggacttgtttgaaacgatt 36444229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2315114 - 2314975
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2315114 agcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattac 2315015  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  2315014 caactatgctatctacaataagacttgtttgaaacaattc 2314975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7297373 - 7297234
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |  |||||||    
T  7297373 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaagaagacaattac 7297274  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  7297273 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7297234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 2056929 - 2057067
Alignment:
Q  17 gcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacc 116  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056929 gcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctggatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacc 2057028  T
Q  117 aactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  2057029 aactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 2057067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8899682 - 8899822
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  8899682 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcatggaagcaatt 8899781  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  8899782 accaactatgctatctacaatatgactt-gttgaaacgattc 8899822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17484687 - 17484550
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17484687 cattatccaccattttccatgcttaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagtcaaatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaattacca 17484588  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17484587 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 17484550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 19180422 - 19180562
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19180422 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttag-agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19180520  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  19180521 actaactatactatctacaataagacttgtttgaaacgattc 19180562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43249553 - 43249412
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||    
T  43249553 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgtattcaaggaaacaatt 43249454  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||    
T  43249453 accaactatgctatcatcaataggacttgttcgaaacgattc 43249412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 36211046 - 36211182
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  36211046 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 36211145  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaac 150  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  36211146 acaaactatgttatctagaataggacttgtttgaaac 36211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12759890 - 12759750
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12759890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta-gaggcaaatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaatt 12759792  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12759791 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12759750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 29737748 - 29737889
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29737748 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatcttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29737847  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  29737848 atcaactatgctatcgacaataggacttgtttgaaacaattc 29737889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37732334 - 37732193
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37732334 agagcattatccaccatttgtcatacataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttgataccaaaaatgagttcaagaaagcaatt 37732235  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||||    
T  37732234 accaactatgttatttacaataagacttgtttgaaacgattc 37732193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 45124120 - 45124260
Alignment:
Q  15 gagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  45124120 gagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaagagtctgatttgataccaaagatgagtttaaggaaacaatta 45124219  T
Q  115 ccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  45124220 ccaactatgctatctacaataagatttgtttgaaacgattc 45124260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25087933 - 25087796
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25087933 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccagagatgagttcaaggaagcaattatca 25087834  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| ||| || |||| ||||| |||||||| ||||    
T  25087833 actatgttatatacaataagacttgtttgaaacaattc 25087796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8396692 - 8396576
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8396692 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggttttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 8396593  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  8396592 atcaactatgctatcta 8396576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Original strand, 37654123 - 37654228
Alignment:
Q  29 atttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatc 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37654123 atttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatc 37654222  T
Q  129 tataat 134  Q
    ||||||    
T  37654223 tataat 37654228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 41178160 - 41178059
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41178160 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41178061  T
Q  114 ac 115  Q
    ||    
T  41178060 ac 41178059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19916128 - 19916012
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  19916128 agagcattatccacaatttgtcaagcctaaaaagatgattgatattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaatt 19916029  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  19916028 accaactatgctatcta 19916012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Original strand, 14630663 - 14630755
Alignment:
Q  63 tgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  14630663 tgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 14630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23671901 - 23671811
Alignment:
Q  65 ggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23671901 ggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaaccatgttatctataataagacttgtttgaaacgattc 23671811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 155
Target Start/End: Original strand, 9331757 - 9331897
Alignment:
Q  15 gagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatta 114  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||| |  ||  |||||||||||    
T  9331757 gagcattatccaccatttgtcatgcataaaaagatagctaatcttaggtgggtgttaggagccaaatttggtacctaagataatatctgggaagcaatta 9331856  T
Q  115 ccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9331857 ccaacaatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 9331897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23673014 - 23672958
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 70  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673014 agagcattttccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtt 23672958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 49814302 - 49814441
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  49814302 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 49814401  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49814402 caactatgctatctagaatatgacttatttgaaacgattc 49814441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12143072 - 12143213
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12143072 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12143171  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12143172 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12143213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23767555 - 23767414
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23767555 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23767456  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  23767455 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 23767414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 26549388 - 26549529
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26549388 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 26549487  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26549488 accaactatgctatctacaataggacttgtttaaaacgattc 26549529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 41106016 - 41106157
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41106016 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41106115  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41106116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 41106157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 46825531 - 46825672
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46825531 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46825630  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46825631 accaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 46825672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 19315640 - 19315781
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19315640 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 19315739  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  19315740 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 19315781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28425504 - 28425363
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28425504 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28425405  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  28425404 accaactatgctatctgcaataggacttgtttgaaacgattc 28425363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38473767 - 38473626
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38473767 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38473668  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38473667 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 38473626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49094848 - 49094711
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094848 cattatccaccatttgttatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 49094749  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49094748 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 49094711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 19274559 - 19274699
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  19274559 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 19274658  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19274659 accagctatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 19274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25988410 - 25988271
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25988410 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaccaattac 25988311  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25988310 caactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 25988271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7553157 - 7553016
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7553157 agagcattatccaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7553058  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  7553057 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7553016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 7651662 - 7651803
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  7651662 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 7651761  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  7651762 atcaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 7651803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33325727 - 33325868
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33325727 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtcttagaagccagatttgataccaaagatgagtttaaggaagcaatt 33325826  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33325827 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33325868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36157818 - 36157678
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36157818 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36157719  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36157718 -ccaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 36157678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 46095216 - 46095075
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46095216 agagcattatccaccatttgtcatgtttaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagacagatttgatatcaaagatgagttcaaggaaacaatt 46095117  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46095116 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 46095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52350065 - 52349924
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52350065 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaagagccaaatttgatagaaaagatgagtttaaggaagcaatt 52349966  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  52349965 accaactatgctatttacaataggacttgtttgaaacgattc 52349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7608907 - 7608766
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7608907 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaacatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtacaaaagatgagttcaaagaagcaatt 7608808  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7608807 atcaactatgctatctataataggacttgtttgaaacgattc 7608766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 16705870 - 16706011
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16705870 agagcattatccaccattttccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggcgccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16705969  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  16705970 accaactatgttatctaaaataagacttgtttgaaacgattc 16706011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 18892329 - 18892470
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18892329 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaggatgactaattttcagtgggtgttagaagccagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 18892428  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18892429 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 18892470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33674017 - 33674158
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33674017 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaagatgagttcaaggaagcaatt 33674116  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  33674117 accagctatgctatctacaataggacttgtttgacacgattc 33674158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 46051450 - 46051591
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46051450 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactagttttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 46051549  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  46051550 accaactatgctatctacaacaggacttgtttgaaacgattc 46051591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48669533 - 48669396
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48669533 cattatccattatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatcacca 48669434  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  48669433 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 48669396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48802472 - 48802331
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48802472 agagcattatccaccatttatcatgcctacaaagatgactaattttaagtaggtgttaggagccatatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 48802373  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  48802372 accaactatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 48802331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 50533383 - 50533523
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  50533383 agagcattatccaaaatttgacatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50533482  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50533483 accaactatgttatctataataggacttgtttgaaacgatt 50533523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 9962755 - 9962892
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9962755 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaactagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9962854  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||    
T  9962855 actatgctatctacaacagaacttgtttgaaacgattc 9962892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23228335 - 23228194
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23228335 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaaatggatgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 23228236  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  23228235 accaactatgctatctacaatagtacttgtttgaaacgattc 23228194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 26069896 - 26070033
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26069896 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccggatttgataccaaaaatgagttcaaggaaacaattacca 26069995  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  26069996 actatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 26070033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24204612 - 24204474
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24204612 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactcattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 24204513  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacga 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24204512 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacga 24204474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45350852 - 45350717
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45350852 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagatcaaggaagcaattacca 45350753  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||    
T  45350752 actatgttatctacaatagg--ttgtttgaaacgattc 45350717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 52146993 - 52147134
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  52146993 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaatgaagcaatt 52147092  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || ||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||    
T  52147093 acaaactatgctatatacaacatgacttgtttgaaacgattc 52147134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36781311 - 36781172
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36781311 agcattatccaccatttgccatgcccaaaaagacgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 36781212  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  36781211 caactatgatatctacaataagacttgtttgaaacgattc 36781172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 37216900 - 37217037
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37216900 cattatccaccatttgccatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagctagagttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaattacca 37216999  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37217000 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 37217037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 50689943 - 50690084
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  50689943 agagcattatccatcatttgctatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 50690042  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  50690043 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 50690084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Original strand, 5400891 - 5401011
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5400891 catgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttagaaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 5400990  T
Q  135 aggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  5400991 aggacttgtttgaaaagattc 5401011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40721342 - 40721484
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-gggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40721342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagataattaattttaggttgggtattaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaagaaagcaat 40721441  T
Q  113 taccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  40721442 tatcaactatgctatctacaataggacttgttggaaacgattc 40721484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45670623 - 45670486
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacc- 116  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  45670623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 45670525  T
Q  117 aactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45670524 aactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 45670486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8141623 - 8141486
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8141623 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacaagtcagatttggtactaaagatgagttcaaagaagcaattacaa 8141524  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8141523 attatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 8141486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9878921 - 9878784
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878921 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaacccgatatggtactaaagatgagttcaaggaagcaattacca 9878822  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  9878821 actattttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 9878784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 34971084 - 34971221
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  34971084 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagtcagatttgataccaaatatgagttcaaagaaacaattacca 34971183  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  34971184 actatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 34971221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 43396675 - 43396816
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43396675 agagcattatccatcatttgctatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43396774  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  43396775 atcaactctgctatctacagtaggatttgtttgaaacgattc 43396816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 6711440 - 6711581
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6711440 agagcattatccaccatttaccatgtgtaaaaagatggctaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6711539  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||  | |||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  6711540 accaactataatgtctacaatatgacttgtttgaaacgattc 6711581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 48319183 - 48319074
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48319183 cattatccaccatttgtaatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 48319084  T
Q  118 actatgctat 127  Q
    ||||||||||    
T  48319083 actatgctat 48319074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52067792 - 52067651
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  52067792 agagcattatccaccatttgtcatccctaaaaagatgaataattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaacgatgagttcaaggaagcaatt 52067693  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || || ||||| ||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  52067692 acaaattatgccatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 52067651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 12964646 - 12964750
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12964646 agagcattatacaacatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 12964745  T
Q  114 accaa 118  Q
    |||||    
T  12964746 accaa 12964750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 30281631 - 30281747
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30281631 agagcattatccaccattttacatgcctaaaaagataactggtattaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 30281730  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  30281731 accaactatgctatcta 30281747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33194792 - 33194676
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  33194792 agagcattaaccaccattcgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaact 33194693  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  33194692 accaactatgctatcta 33194676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41982372 - 41982237
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  41982372 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaatatgactaattttaaatgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaattatca 41982273  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgat 153  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  41982272 actatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgat 41982237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 9974846 - 9974963
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9974846 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccatatttagtaccaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 9974945  T
Q  118 actatgctatctataata 135  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  9974946 actatgctatctacaata 9974963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17984039 - 17983898
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  17984039 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 17983940  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || ||||||| ||| || | ||||||||  ||||||||||||    
T  17983939 acaaactatgttatttacattaggacttggttgaaacgattc 17983898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 21965069 - 21965206
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  21965069 cattatacaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtaaggagtcagatttggtaccaaagatgagtttaatgaagcaattacca 21965168  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21965169 attatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 21965206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33714495 - 33714361
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33714495 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaatgt-aagtgg-tgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaaacaattatcaa 33714398  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  33714397 ctatgttatctacaataggatttgtttgaaacgattc 33714361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18782226 - 18782089
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18782226 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctatgaaccagattttgtaccaaagatgagttcaaataagcaattatca 18782127  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  18782126 actatgctatctagaatatgacttgtttgaaatgattc 18782089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16506925 - 16506813
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16506925 cattatccaccatttgccatgcttaaaaagatggctgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggttgagttcaaggaagcaattacca 16506826  T
Q  118 actatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||    
T  16506825 actatgctatcta 16506813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 18917524 - 18917664
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| | |||||||||||||||    
T  18917524 agagaattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcatatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaatt 18917623  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |  || ||||||||||| |||| || || ||||||||||||    
T  18917624 attaaatatgctatctacaatatgatttgtttgaaacgatt 18917664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 155
Target Start/End: Original strand, 21929545 - 21929667
Alignment:
Q  40 ctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaag-------atgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctata 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21929545 ctaaaaagatgactaattttaagtgggttttaggagccagatttggtaccaaagatgaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctaca 21929644  T
Q  133 ataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  21929645 atagaacttgtttgaaacgattc 21929667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 25800648 - 25800782
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatca----aagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| || ||    |||||||||||||||||||||||    
T  25800648 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta------agatttggtaccaaattaagatgagttcaaggaagcaatt 25800741  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  25800742 accaac-atgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 25800782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44978868 - 44978768
Alignment:
Q  54 aattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgat 153  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |  ||||| |||||||||||    
T  44978868 aattttaagtgg-tattaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattatcaattatgctatctacattctgacttgtttgaaacgat 44978770  T
Q  154 tc 155  Q
    ||    
T  44978769 tc 44978768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 50099220 - 50099277
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtta 71  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50099220 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgtta 50099277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 44979329 - 44979281
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaag 62  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44979329 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaag 44979281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 32373694 - 32373650
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattt 58  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32373694 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 32373650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 17989906 - 17989864
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattt 58  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17989906 agcattattcactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattt 17989864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 218885 - 219027
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggg-tgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  218885 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaat 218984  T
Q  113 taccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  218985 taccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 219027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1915484 - 1915343
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915484 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 1915385  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1915384 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaactattc 1915343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 6503718 - 6503858
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  6503718 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgggttcaaggaagcaatt 6503817  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6503818 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgatt 6503858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 3408189 - 3408330
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  3408189 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 3408288  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  3408289 accaactatactatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 3408330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 10256237 - 10256378
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10256237 agagcattatccaccatttgcaatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 10256336  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10256337 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 10256378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 17943040 - 17943177
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17943040 cattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagtttaaggaagcaattacca 17943139  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  17943140 attatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 17943177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 30379021 - 30379158
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30379021 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 30379120  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30379121 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 30379158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 1077241 - 1077378
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077241 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 1077340  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  1077341 actatgctatctacaacatgacttatttgaaacgattc 1077378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 2707459 - 2707600
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  2707459 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagacgagttcaaggaagcaatt 2707558  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2707559 accaactatgatatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2707600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8178390 - 8178249
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  8178390 agagcattatccaccatttgccatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8178291  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  8178290 accaactatgctatctacaataggacatgtttgaaacgattc 8178249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12626636 - 12626777
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  12626636 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 12626735  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12626736 accaactattctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12626777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26393146 - 26393009
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393146 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 26393047  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  26393046 actatgctatctacaatagaagttttttgaaacgattc 26393009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 29050272 - 29050413
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29050272 agagcattacccaccattcgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29050371  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29050372 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 29050413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 2390267 - 2390406
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2390267 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattataagtgggtgttaggagctatatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 2390366  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2390367 caactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 2390406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 9382519 - 9382660
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9382519 agagcattatccaccatttgtcatgcttaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 9382618  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  9382619 accaactatgttatctacatcaggacttgtttgaaacgattc 9382660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17428393 - 17428272
Alignment:
Q  34 tcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17428393 tcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaa 17428294  T
Q  134 taggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  17428293 taggacttgtttgaaacgattc 17428272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26231073 - 26230932
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  26231073 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagaaact 26230974  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||    
T  26230973 accaactatgttatttacattaggacttgtttgaaacgattc 26230932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 11133873 - 11134015
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttc-aaggaagcaat 112  Q
    |||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  11133873 agagcattatccatcatttgttatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaggaagcaat 11133972  T
Q  113 taccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  11133973 taccatctatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattc 11134015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 16193314 - 16193451
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193314 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 16193413  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||  |||||  | ||| |||| |||||||||||||    
T  16193414 actattttatctgcattagaacttgtttgaaacgattc 16193451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35224019 - 35223919
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35224019 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagctagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaat 35223920  T
Q  135 a 135  Q
    |    
T  35223919 a 35223919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3258948 - 3258807
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3258948 agagcgttatccaccatttgtcatgcataaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3258850  T
Q  114 acc-aactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  3258849 accaaactatggtatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 3258807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2598219 - 2598099
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2598219 catgcctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaataaagcaattaccaactatgatatctacaat 2598120  T
Q  135 aggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  2598119 atgacttgtttgaaacgattc 2598099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 26936607 - 26936723
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26936607 agagtattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccggatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 26936706  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  26936707 atcaactatgctatcta 26936723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6785239 - 6785101
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||       
T  6785239 agagcattatacaaaatttgacatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagca--- 6785143  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  6785142 accaattatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 6785101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26196458 - 26196321
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacc- 116  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||     
T  26196458 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgt-tgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcacggaagcaattacca 26196360  T
Q  117 aactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  26196359 aactatgttatctacaataggacttggttgaaccgattc 26196321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10931267 - 10931148
Alignment:
Q  35 catgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | | |    
T  10931267 catgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaatta-caactatgctatccacatt 10931169  T
Q  135 aggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  10931168 aggacttgtttgatacgattc 10931148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Original strand, 31375971 - 31376058
Alignment:
Q  68 gttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31375971 gttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaattaacaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 31376058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25820686 - 25820550
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||  ||||  |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25820686 cattatccataatttgacatgactaaaattatgactaattttaaatgggtgttatgagttagatttggtaccaaacatgagttcaatgaagcaattacca 25820587  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  25820586 actatgctatctacgataggaattgtttgaaacgatt 25820550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12613029 - 12612971
Alignment:
Q  97 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12613029 agttcaaggaagcaattaccaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 12612971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12612927 - 12612848
Alignment:
Q  76 ccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  12612927 ccagatttggtagcaaagatgagttcaatgaagcaagtactaactttgctatctacaataggacttgtttgaaatgattc 12612848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 14717609 - 14717746
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717609 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14717708  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14717709 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 14717746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6740096 - 6739955
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6740096 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6739997  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6739996 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6739955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8215900 - 8216041
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  8215900 agagcattatccaccatttgtcattcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 8215999  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8216000 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 8216041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19659642 - 19659501
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  19659642 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaaaaagcaatt 19659543  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19659542 accaactatgctatctacaataggacttatttgaaacgattc 19659501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30297890 - 30297749
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  30297890 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgctaggagccagatttggtaccaaagatgagttgaaggaagcaatt 30297791  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30297790 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 30297749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 35342180 - 35342321
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35342180 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35342279  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  35342280 atcaactatgctatctacaatgagacttgtttgaaacgattc 35342321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 41282342 - 41282482
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41282342 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 41282441  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  41282442 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaatgatt 41282482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39002164 - 39002025
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39002164 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 39002065  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  39002064 caactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacaattc 39002025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6600273 - 6600136
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600273 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 6600174  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6600173 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6600136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11000869 - 11000728
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11000869 agagcattatccaccacttgccaggcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 11000770  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11000769 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11000728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11692288 - 11692147
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692288 agagcattatccaccatttgtgatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 11692189  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  11692188 accaactatgctatctgcaatatgacttgtttgaaacgattc 11692147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16096100 - 16095960
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  16096100 agagcattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggta-ccaagatgagttcaaggaagcaatt 16096002  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16096001 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 16095960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33760611 - 33760470
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  33760611 agagcattatccaccatttgtcatgactaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagtaatt 33760512  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33760511 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 33760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38964254 - 38964114
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38964254 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38964156  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  38964155 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38964114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 30863253 - 30863393
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  30863253 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 30863352  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  30863353 accaactatgctatctacattatgacttgtttgaaacgatt 30863393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23129059 - 23128913
Alignment:
Q  9 agcagagagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaag 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23129059 agcaaagagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggttgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaag 23128960  T
Q  109 caattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  23128959 caattaccaattatgctatctacgatatgacttgtttgaaacgattc 23128913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3352143 - 3352002
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  3352143 agagcattatccaccctttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaatt 3352044  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3352043 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 3352002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4016015 - 4015874
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4016015 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaatatgactaattttaagtaggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 4015916  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  4015915 accaactatgttatctacaataggacttgcttgaaacgattc 4015874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 6251972 - 6252113
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  6251972 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaatt 6252071  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6252072 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 6252113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8689572 - 8689713
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  8689572 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaatcaatt 8689671  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||    
T  8689672 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattc 8689713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 14952328 - 14952465
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952328 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 14952427  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  14952428 actatgttatctacaacaagacttgtttgaaacgattc 14952465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20079399 - 20079258
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20079399 agagcattatccacaatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 20079300  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  20079299 accaactatgttatctacattaggacttgtttgaaacgattc 20079258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26593421 - 26593280
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26593421 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagataagttcaaagaagcaatt 26593322  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  26593321 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 26593280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27457338 - 27457197
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27457338 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaatttaaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 27457239  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  27457238 accaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 27457197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 31710282 - 31710423
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31710282 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 31710381  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||    
T  31710382 accaactatgttatctacattatgacttgtttgaaacgattc 31710423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 39824556 - 39824697
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  39824556 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtaccaaagataagttcaaggaagcaatt 39824655  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39824656 accaactatgtcatctacaataggacttgtttgaaacgattc 39824697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 40074950 - 40075091
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  40074950 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaatgaagcaatt 40075049  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40075050 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattc 40075091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 42993518 - 42993659
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42993518 agagcattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 42993617  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  42993618 accaactatgctatctacaataggaattgtttgaaacaattc 42993659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28078546 - 28078405
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078546 agagcattatctaccatttgtcatgcctaattagtttactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28078447  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  28078446 accaactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 28078405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30208543 - 30208402
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30208543 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtaggtgttaggagccaaatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 30208444  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  30208443 accaactatgttatctacaatagaacttgtttgaaatgattc 30208402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43166410 - 43166269
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  43166410 agagcattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagtcagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 43166311  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43166310 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 43166269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 20408537 - 20408674
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20408537 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagcgggtgttaggagctagatttggtaccaaatatgagttcaatgaagcaattacca 20408636  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20408637 actatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 20408674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Original strand, 1052541 - 1052674
Alignment:
Q  22 atccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaacta 121  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052541 atccaccatttgccatgcttaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaggatgagttcaaggaagcaattaccaacta 1052640  T
Q  122 tgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1052641 tgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 1052674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27116236 - 27116099
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27116236 cattatccacgatttgtaatgcctaaaaagatgactaatttgaagtggatgttaggagccagatttggtaccaaatatgagttcaaggaagcaattacca 27116137  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||    
T  27116136 actatgctatctacaataggacttgtttaaaatgattc 27116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 11935450 - 11935586
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11935450 cattatccactatttgttatgcctaaaaagatggctaattttaagtgagtgttaggagccacatttggt-tcaaagatgagatcaaggaaacaattacca 11935548  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11935549 actatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 11935586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19398330 - 19398193
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19398330 cattatccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaggctagatttggtaccaaagatgagttcaaagaaacaattacca 19398231  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||    
T  19398230 actatgctatctacaatagaacttgtttgaaatgattc 19398193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 16752116 - 16752232
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16752116 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggatccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 16752215  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16752216 accaactatgttatcta 16752232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Original strand, 6331377 - 6331479
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6331377 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 6331476  T
Q  114 acc 116  Q
    |||    
T  6331477 acc 6331479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26035487 - 26035371
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  26035487 agagcattatccaccatttgtcgtgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtattaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 26035388  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26035387 accaactatggtatcta 26035371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 8694866 - 8695007
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||  ||||    
T  8694866 agagcattatccaccatttatcatgcctaagaacatgactaattttaagtgagtattatgagccagatttggtactaaagatgagttcaatgaaataatt 8694965  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8694966 atcaattatgctatctacaataggacttgtttgaaacaattc 8695007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 130
Target Start/End: Original strand, 444978 - 445070
Alignment:
Q  38 gcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcta 130  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  444978 gcctaaaaagacgactgattttaagtgggttttaggagtcatatttgataccaaagatgagttcaagaaagcaattaccaactatgctatcta 445070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 27509978 - 27510112
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||        |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  27509978 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtcctt-ttagtt------tttggtaccaaagatgagttcaaagaagcaatt 27510070  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||    
T  27510071 accaactatgcttattacaataggacttgtttgaaacgattc 27510112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 250
Target Start/End: Original strand, 11935652 - 11935681
Alignment:
Q  221 cttaaaggacctttagatacatttgatcta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11935652 cttaaaggacctttagatacatttgatcta 11935681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Original strand, 6332873 - 6332917
Alignment:
Q  111 attaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  6332873 attaccaactattctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 6332917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 114 - 255
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 213  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  214 accgactatgctatctacattaggacttgtttgaaacgattc 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 35443311 - 35443452
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35443311 agagcattatccactatttgccatgcctaaaaagataactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 35443410  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  35443411 accaactatgctatctacaatagaacttgtttgaaacgattc 35443452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 15847117 - 15847253
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15847117 attatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 15847216  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15847217 ctatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 15847253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 513308 - 513448
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  513308 agagcattatccaccatttgtcacgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 513406  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  513407 accaactatgctatctacaataggacttgtttgaaacgattc 513448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 2533272 - 2533413
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2533272 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgtttggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2533371  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  2533372 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 2533413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 37933646 - 37933783
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933646 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 37933745  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  37933746 actatgctatctacgataagacttgtttgaaacgattc 37933783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 38107103 - 38107240
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38107103 cattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 38107202  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  38107203 actatgctatctacaataagacttgtttgaaacgattc 38107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 1293486 - 1293627
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1293486 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaaccagatttgataccaaagatgagttcaaggaagcaatt 1293585  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  1293586 accaactatgttatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 1293627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 3875908 - 3876049
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  3875908 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatatagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 3876007  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3876008 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 3876049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9056479 - 9056338
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9056479 agagcattatccaccatttatcatgcctaaaaagatgactaattttaagtggatgttaggagtcagatttggtatcaaagatgagttcaaagaagcaatt 9056380  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9056379 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacaattc 9056338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28707587 - 28707446
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28707587 agagcattatccaccatttgtcatgccttaaaagatgactaattttaagtgggtgttatgagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 28707488  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  28707487 accaattatgatatctacaataggatttgtttgaaacgattc 28707446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36400211 - 36400070
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36400211 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaagtttaagtgggtgttagaaggcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 36400112  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  36400111 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 36400070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41536657 - 41536527
Alignment:
Q  25 cactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgc 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41536657 cactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagataaattcaaggaagcaattaccaactatgc 41536558  T
Q  125 tatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41536557 tatctacaataggacttgtttgaaacgattc 41536527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 259982 - 260118
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  259982 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 260080  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  260081 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 260118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 655939 - 655803
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  655939 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 655841  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  655840 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 655803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 841674 - 841538
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  841674 cattatccacaatctgtcatgcctaaaaa-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattacca 841576  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  841575 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 841538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43806674 - 43806533
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  43806674 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgagtgttaggagccagatttagtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 43806575  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  43806574 accaactatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 43806533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35884569 - 35884430
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  35884569 agcattatcctccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttacgagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattac 35884470  T
Q  116 caactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  35884469 caactatgttatctacaataagacttgtttgaaacgattc 35884430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22684129 - 22683988
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22684129 agagcattattcaccatttgtcatggctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaacaatt 22684030  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  22684029 accaactatgatatctacaatatgacttgtttgaaatgattc 22683988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 33651841 - 33651982
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33651841 agagcattatccaccgtttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaggcagatttggtatgaaagatgagttcaaggaaacaatt 33651940  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  33651941 acaaactatgctatctacgataggacttgtttgaaacgattc 33651982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38633851 - 38633710
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38633851 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagaaatcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 38633752  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  38633751 accaactatgctatctacattagaacttgtttgaaacgattc 38633710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 440844 - 440981
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    ||||||||||  |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  440844 cattatccaccgtttgccatgtctaaaaagatgagtaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaaggaagcaattacca 440943  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  440944 actatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 440981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28496495 - 28496355
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28496495 agagtattatccatcatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtattagaa-ctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 28496397  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28496396 accaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgattc 28496355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40302030 - 40301893
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  40302030 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgattaattttaagtgagtgttaggagctagatttggtaccaaagataaattcaatgaagcaattacca 40301931  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  40301930 actatgctatctacaatatgacttttttgaaacgattc 40301893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 7434886 - 7435002
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7434886 agagcattatccaccatttgtcaagcctataaagatgactaattttaagtgggtgttaggagtcagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 7434985  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  7434986 accaactatgttatcta 7435002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 23935233 - 23935349
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23935233 agagcattatccaccatttgccatgcctaaaaagatgactgattttaagtgggtgttaggagccagatttggtactaaagatgagttcaaggaagcaatt 23935332  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  23935333 atcaactatgctatcta 23935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39513480 - 39513344
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  39513480 agagtattatccaccatatgccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaagaaagcaatt 39513381  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaac 150  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  39513380 accaactatgttatctacattaggacttatttgaaac 39513344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 12010549 - 12010693
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  12010549 agagcattatccaccatttgccatgcataaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccaaatttggtaccaaagatgagttcaaggcaacaatt 12010648  T
Q  114 accaactatgctat---ctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12010649 accaactatgctatctactacaataggacttgtttgaaacaattc 12010693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23972437 - 23972295
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttt-tcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaat 112  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  23972437 agagtattatccaacattttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagtgggtgataggagtcagatttggtaccaaaaatgagttcaaggaagcaat 23972338  T
Q  113 taccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  23972337 taccaactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 23972295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 38208756 - 38208894
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaag-atgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacc 116  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38208756 cattatccaccatttgccatgtctaaaatggatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtagcaaagatgagttcaaagaagcaattacc 38208855  T
Q  117 aactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  38208856 aactatgttatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 38208894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 13797089 - 13797229
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  13797089 agagcatcgtccaccatttgtcatacctaaaaagatgactaattttatgtggatgttaggagccagatttgataccaaa-atgagttcaaagaagcaatt 13797187  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  13797188 accaactatgctatatacaataggatttgtttgaaacgattc 13797229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24430712 - 24430571
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||  || |||||    
T  24430712 agagcattatccaccttttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttagtagtgagatttggtaccaaagatgagttcaataaaacaatt 24430613  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24430612 atcaactatactatctacaataggacttgtttgaaacgattc 24430571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Original strand, 6016207 - 6016321
Alignment:
Q  16 agcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattac 115  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6016207 agcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactgattttaagtggatgttaggagccaaattgagtatcaaagatgagtttaaagaagcaattac 6016306  T
Q  116 caactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||    
T  6016307 caactatgctatcta 6016321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 4649154 - 4649291
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4649154 cattatccaccatttgccatgcctaaaaaaatgactaattttaagtggatgttggaagtcagatttggtaccaaagacgagttcaaggaaacaattacca 4649253  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  4649254 attatgctatctacaattggacttgtttgaaacgattc 4649291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42988367 - 42988227
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||| || |||| || |||||||||    
T  42988367 agagcattatctaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaatataagttaaatgaagcaatt 42988268  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42988267 atcaactatattatctacaataggactt-tttgaaacgattc 42988227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 29485287 - 29485402
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29485287 agagcattatccatcatttgccatgcctaaaaa-atgactgattttaagtgggtgttaggagttagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 29485385  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||| ||||||    
T  29485386 accaactatgttatcta 29485402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36218917 - 36218781
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36218917 cattatccaccatttgccatgcctaaaaagatggctaattttaagtgggtgctagaagtcagatttggtaccaaagatgagttcaa-gaagcaattatca 36218819  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||  |||||| |  | ||||| |||||||||||||    
T  36218818 actatattatctacatcatgacttgtttgaaacgattc 36218781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24193195 - 24193131
Alignment:
Q  90 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24193195 aaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgttatctacaataggacttgtttgaaacgatt 24193131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24193433 - 24193364
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttg 84  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24193433 agagcattattcaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagt-ggtgttaggagccagatttg 24193364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 79
Target Start/End: Original strand, 8137196 - 8137239
Alignment:
Q  36 atgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccag 79  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8137196 atgcctaaaaaaatgactaattttaagtaggtgttaggagccag 8137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 5190 - 5326
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5190 cattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgg-tgttaggagccagatttggtatcaaagatgagttcaaggaagcaattaaca 5288  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  5289 attatgctatctacaacatgacttgtttgaaacgattc 5326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5164 - 5027
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||    
T  5164 cattatccaccatttgtcatgtctaaaaagatgactaattttaagagggtgttaggagccatatttggtaccaaagatgagttcaagaaaacaattacca 5065  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  5064 actatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 5027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 252579 - 252438
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  252579 agagcattatccaccgtttgccatgcctaaaaagatgactaattttaactgggtgttaggagccagatttggtacgaaaaatgagttcaatgaagcaatt 252480  T
Q  114 accaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  252479 accaactatgctatatacaataggacttgtttgaaacgattc 252438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Original strand, 11362 - 11498
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  11362 cattatccaccatttaccatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttggtaccatagataagtttaaggaagcaattacca 11461  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgatt 154  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  11462 actatgctacctacaataggtcttatttaaaacgatt 11498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2114 - 1998
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2114 agagcattatccaccatttgtcatgcctaataagatgactgattttaagtaggtgttaggagccagattcggtaccaaagatgagttcaaggaagcaatt 2015  T
Q  114 accaactatgctatcta 130  Q
    |||||||||||||||||    
T  2014 accaactatgctatcta 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 47967 - 48103
Alignment:
Q  19 attatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaa 118  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47967 attatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggaaccagatttggtaccaaaggtgagttcaaggaagcaattaccaa 48066  T
Q  119 ctatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    |||||  || || ||| |||||| ||| |||||||||    
T  48067 ctatgtgatatacaatcggacttgtttaaaacgattc 48103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 13099 - 13236
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13099 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 13198  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  13199 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 13236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 59745 - 59608
Alignment:
Q  18 cattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggtgttaggagccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattacca 117  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  59745 cattatccatcatttgccatgcctaaaaagatgaataattttaagtggatattaggagctagatttggtaccaaagatgagttcaaggaaggaattatca 59646  T
Q  118 actatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  59645 attatgctatctacaatatgacttgtttgaaacgattc 59608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3452 - 3371
Alignment:
Q  74 agccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  3452 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatcaacattaggacttatttgaaacgattc 3371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Original strand, 599 - 680
Alignment:
Q  74 agccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||    
T  599 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattc 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1994 - 1913
Alignment:
Q  74 agccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||    
T  1994 agccagatttggtaccaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctattaacattaggacttgtttgaaacgattc 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 155
Target Start/End: Original strand, 1877 - 1958
Alignment:
Q  74 agccagatttgatatcaaagatgagttcaaggaagcaattaccaactatgctatctataataggacttatttgaaacgattc 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||    
T  1877 agccagatttggtaccaaagatgaggtcaaggaagcaattatcaactatgctatcaacattaggacttgtttgaaacgattc 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 19781 - 19831
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781 agagcattatccactatttgtcatgcctaaaaagatgactaattttaagtg 19831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 342 - 289
Alignment:
Q  14 agagcattatccactatttttcatgcctaaaaagatgactaattttaagtgggt 67  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  342 agagcattatccaccatttgtcatgcctaaaaagatgaataattttaagtgggt 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University