View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16489_low_1 (Length: 732)

Name: NF16489_low_1
Description: NF16489
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16489_low_1
NF16489_low_1
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-468)||(387203-387680)
chr2 (72-468)||(39338510-39338916)
chr2 (72-468)||(10524127-10524529)
chr2 (72-468)||(7874321-7874709)
chr2 (72-468)||(5254286-5254684)
chr2 (72-430)||(14106172-14106536)
chr2 (72-468)||(14405228-14405630)
chr2 (88-452)||(17116553-17116914)
chr2 (72-333)||(7460839-7461107)
chr2 (72-166)||(14436916-14437010)
chr2 (78-193)||(41877207-41877322)
chr2 (72-167)||(43816096-43816191)
chr2 (72-169)||(3745676-3745773)
chr2 (79-168)||(13512495-13512584)
chr2 (78-167)||(43248882-43248971)
chr2 (73-149)||(15457817-15457893)
chr2 (72-169)||(45311453-45311550)
chr2 (82-193)||(22888552-22888662)
chr2 (72-138)||(9823695-9823761)
chr2 (194-469)||(16952162-16952435)
chr2 (194-469)||(17022827-17023100)
chr2 (194-469)||(17060133-17060406)
chr2 (79-155)||(7455601-7455676)
chr2 (72-140)||(25280964-25281032)
chr2 (383-467)||(4471954-4472035)
chr2 (414-470)||(34230229-34230285)
chr2 (414-468)||(2062919-2062973)
chr2 (384-469)||(17079198-17079281)
chr2 (376-468)||(10173539-10173629)
chr2 (414-470)||(15126407-15126463)
chr2 (416-468)||(16960012-16960064)
chr2 (412-467)||(18681096-18681151)
chr2 (414-468)||(1269513-1269567)
chr2 (414-468)||(7695993-7696047)
chr2 (414-468)||(13337304-13337358)
chr2 (392-468)||(22885111-22885184)
chr2 (140-169)||(15457278-15457307)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (73-468)||(3867146-3867545)
chr7 (72-468)||(5859932-5860339)
chr7 (72-468)||(47325534-47325936)
chr7 (111-468)||(38306291-38306653)
chr7 (72-468)||(44353213-44353615)
chr7 (74-468)||(37795019-37795426)
chr7 (72-371)||(31971784-31972089)
chr7 (72-468)||(10244212-10244612)
chr7 (73-468)||(41089396-41089799)
chr7 (86-468)||(3419321-3419707)
chr7 (72-468)||(35745481-35745878)
chr7 (72-474)||(25160839-25161240)
chr7 (269-468)||(33435139-33435337)
chr7 (72-333)||(3419048-3419313)
chr7 (267-468)||(34389992-34390192)
chr7 (72-470)||(48161690-48162079)
chr7 (72-333)||(6585045-6585318)
chr7 (72-193)||(33434480-33434601)
chr7 (72-304)||(40726140-40726392)
chr7 (74-193)||(37795635-37795754)
chr7 (72-193)||(34391493-34391614)
chr7 (72-193)||(42454383-42454504)
chr7 (360-468)||(6584939-6585046)
chr7 (77-177)||(43482232-43482331)
chr7 (74-169)||(11378772-11378866)
chr7 (267-468)||(8745183-8745384)
chr7 (429-468)||(6716748-6716787)
chr7 (414-468)||(12480916-12480970)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (84-468)||(43012405-43012796)
chr3 (72-468)||(19176532-19176938)
chr3 (72-467)||(47235729-47236130)
chr3 (72-468)||(2392152-2392557)
chr3 (72-468)||(45163885-45164285)
chr3 (80-468)||(9583710-9584104)
chr3 (78-468)||(40023224-40023623)
chr3 (72-397)||(2393915-2394252)
chr3 (72-468)||(34475407-34475805)
chr3 (72-468)||(23327997-23328401)
chr3 (72-451)||(53247947-53248332)
chr3 (225-470)||(20611811-20612054)
chr3 (79-468)||(17550987-17551382)
chr3 (72-468)||(45398826-45399217)
chr3 (72-468)||(31482914-31483312)
chr3 (94-333)||(30352110-30352356)
chr3 (72-173)||(21343678-21343779)
chr3 (72-193)||(50305223-50305344)
chr3 (74-190)||(37158618-37158735)
chr3 (72-169)||(4463734-4463831)
chr3 (72-167)||(25506719-25506814)
chr3 (78-170)||(50559978-50560070)
chr3 (72-135)||(47439284-47439347)
chr3 (296-430)||(21342603-21342735)
chr3 (72-165)||(5556918-5557011)
chr3 (197-306)||(7105031-7105140)
chr3 (414-468)||(1652883-1652937)
chr3 (365-468)||(33143899-33144000)
chr3 (414-468)||(47945736-47945790)
chr3 (419-468)||(2394255-2394304)
chr3 (392-464)||(27398992-27399062)
chr3 (194-227)||(32010030-32010063)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (72-468)||(8255057-8255459)
chr4 (72-468)||(8268475-8268877)
chr4 (72-468)||(30964471-30964869)
chr4 (72-333)||(8705789-8706061)
chr4 (77-468)||(31050315-31050713)
chr4 (72-468)||(30167212-30167615)
chr4 (72-470)||(2825811-2826213)
chr4 (78-468)||(35341006-35341389)
chr4 (72-193)||(35329318-35329439)
chr4 (88-301)||(20464786-20465005)
chr4 (72-193)||(27555579-27555701)
chr4 (72-173)||(7703018-7703118)
chr4 (566-691)||(7521449-7521574)
chr4 (566-691)||(7529514-7529639)
chr4 (566-691)||(7127618-7127743)
chr4 (566-691)||(7720893-7721018)
chr4 (72-176)||(4306033-4306136)
chr4 (597-691)||(7483423-7483517)
chr4 (574-688)||(7717066-7717180)
chr4 (566-691)||(7495791-7495916)
chr4 (72-169)||(46698428-46698525)
chr4 (76-169)||(49528421-49528514)
chr4 (270-468)||(4305755-4305951)
chr4 (73-191)||(11281375-11281493)
chr4 (72-193)||(36689454-36689575)
chr4 (72-155)||(9750116-9750198)
chr4 (78-170)||(52868766-52868859)
chr4 (508-563)||(7521359-7521414)
chr4 (511-563)||(7127778-7127830)
chr4 (511-563)||(7495704-7495756)
chr4 (511-563)||(7529427-7529479)
chr4 (511-563)||(7721053-7721105)
chr4 (382-468)||(25753202-25753285)
chr4 (414-468)||(38929857-38929911)
chr4 (414-469)||(28966896-28966951)
chr4 (427-474)||(36962626-36962672)
chr4 (414-468)||(53823418-53823472)
chr4 (429-474)||(19815236-19815281)
chr4 (507-563)||(7717223-7717278)
chr4 (414-470)||(22811157-22811213)
chr4 (414-468)||(12296205-12296259)
chr4 (429-463)||(19673135-19673169)
chr4 (414-468)||(35800519-35800573)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (72-468)||(31207011-31207413)
chr8 (72-468)||(24995044-24995446)
chr8 (72-468)||(20138456-20138858)
chr8 (76-470)||(37986508-37986911)
chr8 (72-468)||(12897925-12898325)
chr8 (72-468)||(9519529-9519938)
chr8 (72-468)||(15821026-15821430)
chr8 (72-468)||(36630867-36631254)
chr8 (72-468)||(32065934-32066346)
chr8 (127-468)||(34388711-34389056)
chr8 (72-468)||(41893052-41893451)
chr8 (76-468)||(16457128-16457512)
chr8 (75-411)||(35815896-35816238)
chr8 (72-193)||(22773932-22774053)
chr8 (78-467)||(38577441-38577840)
chr8 (73-176)||(35821583-35821685)
chr8 (72-193)||(3584048-3584170)
chr8 (111-193)||(27889157-27889239)
chr8 (111-193)||(27947815-27947897)
chr8 (72-165)||(13538324-13538417)
chr8 (72-165)||(13686057-13686150)
chr8 (72-132)||(9659474-9659534)
chr8 (223-305)||(35821432-35821514)
chr8 (297-397)||(22773598-22773699)
chr8 (72-108)||(34866309-34866345)
chr8 (127-170)||(10837941-10837984)
chr8 (414-468)||(17656999-17657053)
chr8 (414-468)||(30236125-30236179)
chr8 (414-468)||(32945700-32945754)
chr8 (417-467)||(15906717-15906767)
chr8 (251-297)||(22773815-22773861)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (72-468)||(18593273-18593674)
chr5 (72-468)||(29087511-29087903)
chr5 (72-468)||(34378128-34378531)
chr5 (72-373)||(7161663-7161973)
chr5 (72-468)||(698391-698799)
chr5 (72-177)||(7452915-7453020)
chr5 (79-192)||(5656749-5656862)
chr5 (72-409)||(18313303-18313636)
chr5 (366-452)||(7162267-7162352)
chr5 (72-165)||(18255099-18255192)
chr5 (123-174)||(41250893-41250944)
chr5 (415-468)||(22675322-22675375)
chr5 (414-470)||(8297496-8297552)
chr5 (414-469)||(27713098-27713153)
chr5 (414-468)||(7195236-7195290)
chr5 (192-227)||(7195078-7195113)
chr5 (414-468)||(13954231-13954285)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (76-468)||(24449584-24449981)
chr1 (72-468)||(41920482-41920889)
chr1 (72-468)||(5389077-5389472)
chr1 (72-468)||(5459191-5459587)
chr1 (123-468)||(46692519-46692870)
chr1 (79-468)||(46814121-46814518)
chr1 (72-468)||(30685573-30685955)
chr1 (72-468)||(24684142-24684529)
chr1 (78-468)||(27031496-27031891)
chr1 (72-468)||(24658959-24659351)
chr1 (267-468)||(31585610-31585811)
chr1 (259-468)||(7857683-7857891)
chr1 (72-193)||(31584689-31584809)
chr1 (72-176)||(6804866-6804969)
chr1 (72-176)||(7002515-7002619)
chr1 (72-177)||(40216155-40216260)
chr1 (72-169)||(14320658-14320755)
chr1 (267-369)||(6764232-6764334)
chr1 (223-298)||(6804739-6804814)
chr1 (414-468)||(19598666-19598720)
chr1 (414-468)||(27102221-27102275)
chr1 (194-280)||(32882583-32882668)
chr1 (419-470)||(20113523-20113574)
chr1 (414-468)||(10785456-10785510)
chr1 (414-468)||(32864558-32864612)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (78-452)||(5751-6131)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (76-468)||(3117523-3117922)
chr6 (72-349)||(10541980-10542262)
chr6 (72-244)||(3254211-3254389)
chr6 (190-343)||(14663231-14663384)
chr6 (72-219)||(15944274-15944431)
chr6 (115-169)||(33697789-33697843)
chr6 (72-156)||(15132489-15132573)
chr6 (77-145)||(14663414-14663480)
chr6 (414-468)||(32935336-32935390)
chr6 (365-468)||(20701754-20701854)
chr6 (192-228)||(15120380-15120416)
chr6 (420-468)||(16510304-16510352)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (190-468)||(35554-35822)
scaffold0068 (72-125)||(35473-35526)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (72-191)||(48648-48767)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (73-176)||(19245-19349)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (95-193)||(2345-2443)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (414-468)||(19413-19467)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (414-468)||(42135-42189)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 387680 - 387203
Alignment:
Q  1 atttacatcaacctaataatttgtaccaaactttcttgattttggctattgcatgactgannnnnnnnnnn-aatcggcaaatattattaaacgtcatcc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              ||||| || ||||||||||||||||||     
T  387680 atttacatgaacctaataatttgtaccaaactttcttgattttggctattgcataactttttttttttttttaatcgacagatattattaaacgtcatca 387581  T
Q  100 ccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaagataaac------ 193  Q
    ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||          
T  387580 ccgcaagtcgcagggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacttaaaaacacccatgaagataaacccacca 387481  T
Q  194 ----acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacac 289  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  387480 aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaa-caagcattgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcgtcactattcacccccaaagaacac 387382  T
Q  290 cctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttccaaaacctcgcgacctcc 389  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  387381 cctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttccaaaacctcgtgacctcc 387282  T
Q  390 gatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  387281 gatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagctcaaaaaccaacttgagtcaaagaattgactcccgatctcaaatcaaaa 387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 39338510 - 39338916
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39338510 aatcggcaaatattattaaacgccatcatcgtaagacgcaatgtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 39338609  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcacc-acctaaaacagactccttcacaaaaaa-caagcactgtaaacacaaaattcaccaccgc 259  Q
     ||||| |||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||    | |||||| ||||||||||||||| |  || ||||| |||    
T  39338610 gaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcacccacctaaaacagactcaaaaaaaaaaaaacaagcactgtaaaca-agtatccaccatcgc 39338708  T
Q  260 ccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatga 359  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||   ||||||||||||| || ||| ||    
T  39338709 ccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagacctcaacacccaagctgagtcacaattcgaagagcacctaaccgaagga 39338808  T
Q  360 acatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatct 458  Q
     ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39338809 tcattcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatct 39338906  T
Q  459 cgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||    
T  39338907 cgaatcaaaa 39338916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10524529 - 10524127
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10524529 aatcggcaaatattattaaacgcca-ccctgcaagacgcaaggtatggacgaaacaatatacaaatggtgcagcatatagatggtacaccataaccacct 10524431  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaacaca----------tcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||          |||||  |||||||| |||||     ||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||    
T  10524430 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacgtcaccgtctaaaacaaactcc-----aaaaaacaagcaccgtaaacacggtatccaccaccgccc 10524336  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || |    
T  10524335 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactcccaaaccccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacctaaccgaaggatc 10524236  T
Q  362 atgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaac----tgactcctgat 456  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||    
T  10524235 atgcagctatcacaaacctcgcgacctccgaac-accgaaagagcacaacac--aaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaatatattgactcccgat 10524139  T
Q  457 ctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||||    
T  10524138 ctcgaatcaaaa 10524127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7874709 - 7874321
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaa-cgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 170  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7874709 aatcagcaaatattattaaaacgccatcctcgcaagacacaaggtatagacaaaacaagatacaaatggcgccgcatatagacggtacaccataaccacc 7874610  T
Q  171 taaaaactcccctgaagataaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccact 270  Q
     || ||  |||||||| |||||| ||      ||||| || ||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||  || ||| ||| ||||||  ||||    
T  7874609 aaacaaagcccctgaatataaactca------cctaagacggacaccttgacagaaa-caaacactgtaaacacagtatccacaaccacccatcgtcact 7874517  T
Q  271 actcacccccaaagaaca-ccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct 369  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||  |||||||| | || |    
T  7874516 actcacccc-aaagaacatccctcaaaataaaactccaagacttcaacacccaagctgagccacat-tcgaaaagctcctaaccaaatgaacaagtagtt 7874419  T
Q  370 tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7874418 tccacaacctctcgacctccgatccaccgaatgagcacaaaa-caaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagagctgactcccgatctcgaatcaaaa 7874321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5254684 - 5254286
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  5254684 aatcagcaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgtaaggtatggacgaaata-gatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacctcca 5254586  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    || ||  | | |||||||||||          |||||||||||||| || ||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||  || ||| ||| |||    
T  5254585 aacaaagctcatgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaagacggacaccttaacagaaa-caaacactgtaaacacagtatccacaaccaccc 5254487  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||  ||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||  || |||||||    
T  5254486 atcgtcactactcaccc--aaagaacacccctcaaaa---aactctcagacttcaacacccaaactgagccacat-tcgaaaagctccaaaccgaatgaa 5254393  T
Q  361 catgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||     
T  5254392 catgcagcttccacaacctctcgacctccgatccaccgaaaaagcac-aaaacaaaagcccgaaaaccaacttgaaccaaagagcagactcccgatctca 5254294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 430
Target Start/End: Original strand, 14106172 - 14106536
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14106172 aatcagcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcagggtatg-acgaaacaagatagaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc- 14106269  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat---------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccca 262  Q
    ||| |  |||||||||||         ||||||| |||||||||| || ||| |||| || | |||||| || ||||||||||  || ||| ||| | ||    
T  14106270 aaacaagcccctgaagataacccaccaaaacacaacaccacctaagacggacaccttaac-agaaacaaacattgtaaacacagtatccacaaccactca 14106368  T
Q  263 tcaccactactcacccccaaagaaca-ccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| | ||| | ||| | | || |||||| |    
T  14106369 tcgtcactactcacccccaaagaacacccctcaaaataaaactctcagacttcaacacccaagctgagccacat-tcgtaaagctcttaaccgaatgatc 14106467  T
Q  362 atgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaa 430  Q
    || || |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14106468 atacaacttccacaacctctcgacctctgatccaccgaaagagcacaaaaacaaaaacccaaaaaccaa 14106536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14405630 - 14405228
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14405630 aatcagcaaatattattaaacgttattcctgcaagacgtaaggtatgaacgaa-caagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 14405532  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat---------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccca 262  Q
    || ||  ||||| |||||         |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| || |||| |||| ||| | | ||| | | ||||    
T  14405531 aacaaagcccctaaagataacctaccaaaacacatcaccacctaagacggacaccttaac-aaaaataaacactataaa-acacagtccacaatcaccca 14405434  T
Q  263 tcaccactactcaccccc-aaagaaca-ccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||| |  |||  ||| ||| ||  ||||||    
T  14405433 ttgtcactactcacccccaaaagaacatccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaagtcgagccacat-gcgacaagctcctaaccaaatgaa 14405335  T
Q  361 catgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    | ||||| ||||| |||| | |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  14405334 cgtgcagtttccacaaccactcgacttctgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagccaaagagctgactcccgatctcg 14405236  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  14405235 aatcaaaa 14405228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 452
Target Start/End: Original strand, 17116553 - 17116914
Alignment:
Q  88 taaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaag 187  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    ||      |  |     
T  17116553 taaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgagacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacactataaccacccctgaagataaatccac 17116652  T
Q  188 ataaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaac 287  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||     | |||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  17116653 agaaacacatcaccgcctaaaacagactaaa--aaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgcccatcgtcattactcacccacaaagaac 17116750  T
Q  288 accctcaaaat-aaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgac 385  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||  || || | || | ||  ||||||||||||    
T  17116751 accctcaaaataaaaactctcagaccccaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaaccgatggatcaagtagatatcacaaacctcgcgac 17116850  T
Q  386 ctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcc 452  Q
    |||| ||| | | ||| |||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17116851 ctccaatctatcgaaaaagcacaaaa--caaagcctaaaaaccaacatgagtcaaa-aactgactcc 17116914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7461107 - 7460839
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||     
T  7461107 aatcagcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcagagtatg-acgaaacaaaatacaaatggtgttgcatatagacagtacaccataaccacc- 7461010  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat---------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccca 262  Q
    ||| |  |||||||||||         || |||| |||| ||||| || ||| |||| || | |||||| |||||||||||||| || ||| ||| | ||    
T  7461009 aaacaagcccctgaagataacccaccaaatcacaacaccgcctaagacggacaccttaac-agaaacaaacactgtaaacacaatatccacaaccacaca 7460911  T
Q  263 tcaccactactcacccccaaagaaca-ccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccac 333  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7460910 tcgtcactactcaaccccaaagaacacccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaagctgagccac 7460839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 166
Target Start/End: Original strand, 14436916 - 14437010
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataac 166  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14436916 aatcagcaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataac 14437010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 41877207 - 41877322
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 177  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41877207 caaatattattaaactccatccccgcaagacgcaagatatggacgaaacaatatacaaatggtaccgtatatagacggtacaccataaccacctgaaaac 41877306  T
Q  178 tcccctgaagataaac 193  Q
     |||||||||||||||    
T  41877307 acccctgaagataaac 41877322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Original strand, 43816096 - 43816191
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43816096 aatcggcaaatattattaaacgtcattcccgcaaaacgcaaggtatggacgaaacaaagtacaaatgatgccgcatatagacggtacaccataacc 43816191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3745773 - 3745676
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  3745773 aatcggcaaatattattaaatgtcatccccataagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagatggtacatcataaccac 3745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Original strand, 13512495 - 13512584
Alignment:
Q  79 aaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacca 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13512495 aaatattattaaacgtcattcccgcaagacgcaatgtatggacgaaacaaaatacaaatgatgccgcatatagacggtacaacataacca 13512584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 167
Target Start/End: Original strand, 43248882 - 43248971
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 167  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  43248882 caaatattattaaacgtcatcctcacaagacacaaggtatggacgaaacaagatataaatggcgccgcatatagacggtatatcataacc 43248971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15457893 - 15457817
Alignment:
Q  73 atcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatat 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15457893 atcggcaaataatattaaacgtcatccccgcaagacgcatgatatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatat 15457817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 45311453 - 45311550
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  45311453 aatcggccaatattattaaacgccaaccccgcaagatgcaaggaaaggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatatacggaacaccataaccac 45311550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Original strand, 22888552 - 22888662
Alignment:
Q  82 tattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactccc 181  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  || ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||    
T  22888552 tattattaaatgtcatccc-gcaagacgcaatgtatggatgaaacaaggtagaaatggtgccacatatagacggtatatcataaccaactaagaacaccc 22888650  T
Q  182 ctgaagataaac 193  Q
    ||||||||||||    
T  22888651 ctgaagataaac 22888662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9823761 - 9823695
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9823761 aatcggcaaatattattaaacgccatctccgcaagacacaaggtatgaatgaaacaagatacaaatg 9823695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 469
Target Start/End: Original strand, 16952162 - 16952435
Alignment:
Q  194 acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccc-t 292  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||  |||| ||| |  | ||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16952162 acatcaccacttaaaacagacgccttcacgaaaacaaactactgcaaaaaagatattcatcaccactcatcgtcactactcacccccaaagaacacccct 16952261  T
Q  293 caaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgat 392  Q
    | |||| ||||||| || || ||||||| ||| ||| |||| |  |||| ||| |||  | ||| || | |  ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  16952262 ctaaatgaaactcccagtcctcaacaccaaagttgatccacatc-cgaaaagctcctatccgaaagatcgtttagcttccaccacctctcaacctccgat 16952360  T
Q  393 ccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaa 469  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  || | |||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16952361 ccaccgaaagaacaccaaaa--aatgtccaaaaccaaacttgagccaaagaactggctcccgatctcgaatcaaaaa 16952435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 469
Target Start/End: Original strand, 17022827 - 17023100
Alignment:
Q  194 acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccc-t 292  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||  |||| ||| |  | ||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17022827 acatcaccacttaaaacagacgccttcacgaaaacaaactactgcaaaaaagatattcatcaccactcatcgtcactactcacccccaaagaacacccct 17022926  T
Q  293 caaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgat 392  Q
    | |||| ||||||| || || ||||||| ||| ||| |||| |  |||| ||| |||  | ||| || | |  ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  17022927 ctaaatgaaactcccagtcctcaacaccaaagttgatccacatc-cgaaaagctcctatccgaaagatcgtttagcttccaccacctctcaacctccgat 17023025  T
Q  393 ccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaa 469  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  || | |||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17023026 ccaccgaaagaacaccaaaa--aatgtccaaaaccaaacttgagccaaagaactggctcccgatctcgaatcaaaaa 17023100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 469
Target Start/End: Original strand, 17060133 - 17060406
Alignment:
Q  194 acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccc-t 292  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||  |||| ||| |  | ||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17060133 acatcaccacttaaaacagacgccttcacgaaaacaaactactgcaaaaaagatattcatcaccactcatcgtcactactcacccccaaagaacacccct 17060232  T
Q  293 caaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgat 392  Q
    | |||| ||||||| || || ||||||| ||| ||| |||| |  |||| ||| |||  | ||| || | |  ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  17060233 ctaaatgaaactcccagtcctcaacaccaaagttgatccacatc-cgaaaagctcctatccgaaagatcgtttagcttccaccacctctcaacctccgat 17060331  T
Q  393 ccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaa 469  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  || | |||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17060332 ccaccgaaagaacaccaaaa--aatgtccaaaaccaaacttgagccaaagaactggctcccgatctcgaatcaaaaa 17060406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7455676 - 7455601
Alignment:
Q  79 aaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgg 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7455676 aaataatattaaacgtcatccccgcaagacgca-ggtatgaacgaaataagatacaaatggtgccgcaaatagacgg 7455601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 140
Target Start/End: Original strand, 25280964 - 25281032
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggt 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25280964 aatcggaaaatattattaaacgtcatccccacaagacgcagggtatggacgaaacaagatataaatggt 25281032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4472035 - 4471954
Alignment:
Q  383 gacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaa 467  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || |   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4472035 gacctccggtccaccaaaagaacaccaata---aagcccaaaaacaaacttgaatcaaagaactgactcccgatctcgaatcaaa 4471954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34230285 - 34230229
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaat 470  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34230285 aaaagcccaaaatcaaacttgatccaaagaactgactcctgatctcgaataaaaaat 34230229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2062973 - 2062919
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2062973 aaaagcccaaaaccaaacttgagccaaagagctgactcccgatctcgaatcaaaa 2062919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17079281 - 17079198
Alignment:
Q  384 acctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaa 469  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||  || | |||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17079281 acctccgatccaccgaaagaacaccaaaa--aatgtccaaaaccaaacttgagccaaagaactggctcccgatctcgaatcaaaaa 17079198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 468
Target Start/End: Original strand, 10173539 - 10173629
Alignment:
Q  376 acctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  10173539 acctctcgacctccgattcaccgaaagaacaccaa--caaaagcccaaaaccaaacttgagccaaataacttacttccgatctcgaatcaaaa 10173629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 470
Target Start/End: Original strand, 15126407 - 15126463
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaat 470  Q
    |||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15126407 aaaagcccaaaaccaaacatgagccaaagaaccgactcccgatctcgaatcaaaaat 15126463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 416 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16960064 - 16960012
Alignment:
Q  416 aagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16960064 aagcccaaaaccaaacttgagccaaagaactgactctcgatctcgaatcaaaa 16960012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 18681151 - 18681096
Alignment:
Q  412 acaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaa 467  Q
    |||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18681151 acaaaagcccaaaaccaaacttgaaccagagaactgactcccgatctcgaatcaaa 18681096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1269567 - 1269513
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1269567 aaaatcccaaaaccaaacttgagccaaagaactgacttccgatctcgaatcaaaa 1269513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7696047 - 7695993
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  7696047 aaaagcccaaaacctaacttgagccaaagaactgactcccggtatcgaatcaaaa 7695993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 13337358 - 13337304
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  13337358 aaaagtccaaaacctaacttgagtcaaagaactgacttccgatttcgaatcaaaa 13337304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 468
Target Start/End: Original strand, 22885111 - 22885184
Alignment:
Q  392 tccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||   ||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22885111 tccaccgaaagaacaccaaaacaa---cccaaaaccaaacttgaaccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 22885184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15457307 - 15457278
Alignment:
Q  140 tgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15457307 tgccgcatatagacggtacaccataaccac 15457278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 73 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3867545 - 3867146
Alignment:
Q  73 atcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  3867545 atcggcaaatattattaaacttcatccc-gcaagacgtaaggtattgacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataacaacata 3867447  T
Q  173 aaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccca 262  Q
    ||||| |||||||||||||||          ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||| | || |||||||| |||    
T  3867446 aaaacacccctgaagataaactcaccaaaacacatcaccacccaaaacaaactccttcacaaaaa-caa---ctgtaaacacgatatccaccaccgtcca 3867351  T
Q  263 tcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaaca 362  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || || ||    
T  3867350 tcgtcactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaacttccatactccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacctgaccaaaggatca 3867251  T
Q  363 tgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaa 462  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3867250 tgcagtttccataacctcgcgacctctgatccaccgcaagagcac-aaagcaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccggtctcgaa 3867152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 5859932 - 5860339
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5859932 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcatgatatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 5860031  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataa----------acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaa--aacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgc 259  Q
    |||||| ||||| |||||||          ||||||||||||||||||||||||     | ||||  |||||||||| | |||||   ||||||||  ||    
T  5860032 aaaaacacccctaaagataatcccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactaaaaaaaaaaaaaaacaagcactattaacacggtattcaccattgc 5860131  T
Q  260 ccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatga 359  Q
    |||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  5860132 ccatcgtcactactcatccacaaagaacaccctgaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaactgaagga 5860231  T
Q  360 acatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatct 458  Q
     ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  5860232 tcatgcagctatcacaaacctcgcgacctccgaaccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgcgtcaaagaattgactcccgatct 5860329  T
Q  459 cgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||    
T  5860330 cgaatcaaaa 5860339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 47325534 - 47325936
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47325534 aatcggcaaatattattaaacgtcatcctcgtaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 47325633  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| | | |||||||||||          |||||||||||||||||| |||  |  | |||||||||||||||||||||||  || || || |||||    
T  47325634 aaaaacactc-tgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaact--tcaaaaaaaaacaagcactgtaaacacagtatccatcatcgccc 47325730  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| || |    
T  47325731 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 47325830  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  47325831 attcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccatcgaaagagcacagca--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagagctgactcccgatctca 47325928  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  47325929 aatcaaaa 47325936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38306653 - 38306291
Alignment:
Q  111 aaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaagataaac----------acatcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||          |||||||    
T  38306653 aaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctaaagataaaccaaccaaaacacatcac 38306554  T
Q  201 cacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataa 300  Q
    ||||||||||| |||||    ||||||||||| |||| | |||| | || ||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38306553 cacctaaaacaaactcc----caaaaaacaagaactgcagacacgatatccaccaccacccatcgtcactactcacctacaaagaacaccctcaaaataa 38306458  T
Q  301 aactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaa 399  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| || ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| | |    
T  38306457 aactcacagaccccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacttaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacctcgcgacctccgaaccatcga 38306358  T
Q  400 aagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38306357 aagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccaatctcgaatcaaaa 38306291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 44353213 - 44353615
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44353213 aatcggtaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaagtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagatggtacaccataaccacct 44353312  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| ||| || ||||||||          ||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||   || |||||||| ||    
T  44353313 aaaaacacccatggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactcca----aaaaatcaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtcc 44353408  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaa-taaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||| || ||| ||     
T  44353409 atcgtcactactcacctacaaagaacaccctcaaaaataaaactcccagaccccaacacccaagccgggtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggat 44353508  T
Q  361 catgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctc 459  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  44353509 catgcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcacaacac--aaagcccaaaaaccaacataagtcaaagaactgactcccgatctc 44353606  T
Q  460 gaatcaaaa 468  Q
     ||||||||    
T  44353607 aaatcaaaa 44353615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 74 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 37795426 - 37795019
Alignment:
Q  74 tcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||    
T  37795426 tcggcaaatattattaaacgtcgtccccacaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgtcgcgattaaacggtacaccataaccacctaa 37795327  T
Q  174 aaactcccctgaagataaacaca----------tcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaa----gcactgtaaacacaaaattcaccaccgc 259  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||   | |||||| ||    |||||||||||||   || |||||||||    
T  37795326 aaacacccatgaagataaacccacaaaaacatatcaccacctaaaacagactccaaaaaaaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgc 37795227  T
Q  260 ccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatga 359  Q
    ||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||| ||    
T  37795226 ccatcattactacttaaccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcaaaccccaacacccaagctgagccacagttcgaagagcacctaaccgaagga 37795127  T
Q  360 acatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatct 458  Q
     ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37795126 tcatgcagctatcacaaacctcgcgacctccgaaccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgactcaaagaactgactcccgatct 37795029  T
Q  459 cgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||    
T  37795028 cgaatcaaaa 37795019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 371
Target Start/End: Original strand, 31971784 - 31972089
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971784 aatcggcaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 31971883  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||          |||||||| ||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||    
T  31971884 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacataaccacctaaaacaaactcc----aaaaaaacaagcactgtaaacacggtatcaaccaccgccc 31971979  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| || |    
T  31971980 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 31972079  T
Q  362 atgcagcttc 371  Q
    ||||| ||||    
T  31972080 atgcaccttc 31972089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10244612 - 10244212
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10244612 aatcggcaaatattattaaactccatctccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacagtacaccataaccacct 10244513  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataa----------acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||     |||||| |||||| |||||||    || ||||| |||||    
T  10244512 aaaaacacccctgaagataagtccacgaaaacacatcaccacctaaaacaaactcc-----aaaaaataagcaccgtaaacatggtatccaccatcgccc 10244418  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||| || ||| || |    
T  10244417 atcgtcactactcacccacaaagaccaccctccaactaaaaatcccagacccaaacacccaagctgagccacaattcaaagagcacctaaccgaaggatc 10244318  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10244317 atgcaactatcacaaacctcgcgacctccgaaccactgaaagagcacaaca--caaaggccaaaaactaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcg 10244220  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  10244219 aatcaaaa 10244212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 73 - 468
Target Start/End: Original strand, 41089396 - 41089799
Alignment:
Q  73 atcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 172  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41089396 atcggcaaatattattaaatgccatctctgcaagaca--aggtatggacgaaacaagatacaa-tggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 41089492  T
Q  173 aaaactcccctgaagataaa----------cacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaa---caagcactgtaaacacaaaattcaccaccgc 259  Q
    ||||| ||| ||||||||||          ||||||| |||||||||||||||||   | ||||||   ||||   ||||||||||  ||  ||||||||    
T  41089493 aaaacacccatgaagataaatccaccaaaacacatcatcacctaaaacagactccaaaaaaaaaaaaaacaagtcatgtaaacacagtatctaccaccgc 41089592  T
Q  260 ccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatga 359  Q
    ||||   ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||| ||   ||||||||||||| |  |||  |    
T  41089593 ccattgtcactatt-acccgcaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccctaacacccatcttgagctacacttcgaagagcacctcaacgaagaa 41089691  T
Q  360 acatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctc 459  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  41089692 tcatgcagcttccacaacctcgcgacctccgatccaccgaaagatcacaaaa-caaaagctcaaaaaccaacttgagtcaaagagctgactcccaatctc 41089790  T
Q  460 gaatcaaaa 468  Q
    |||||||||    
T  41089791 gaatcaaaa 41089799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 468
Target Start/End: Original strand, 3419321 - 3419707
Alignment:
Q  86 attaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctga 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3419321 attaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaacgttgccgcata--gacggtacaccataaccacctaaaaacactcctga 3419418  T
Q  186 agataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactca 275  Q
    ||||||||          ||| |||||||||||||||| |||     ||||||||| || ||||||||  | || ||||||||  ||||  |||||||||    
T  3419419 agataaactcaccaaaacacaacaccacctaaaacagaatcca----aaaaaacaancattgtaaacatgatatccaccaccgttcatcgtcactactca 3419514  T
Q  276 cccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttcca-a 374  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||   |||||| |||||| || ||| || || ||||||  || |    
T  3419515 ctcacaaagaacacccttaaaataaaactcccaaaccccaacacccaagttaagccacaattcgaagcgcacctaaccgaaggatcaagcagctatcaca 3419614  T
Q  375 aacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3419615 aaccttgtgacctctgatccaccgaaagagcacagaaacaaa-gcccaaaaaccaacttgagtcaaagagctgactcccgatctcgaatcaaaa 3419707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 35745481 - 35745878
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||     
T  35745481 aatcagcaaatattattaaacgtcatctccgtaaaacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgtcgca----------acaccataaccacca 35745570  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataa---------acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccca 262  Q
     | ||  |||||||||||||         |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||| |||  ||||||||| || |||| || ||||    
T  35745571 tacaag-cccctgaagataacccaccaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaa-caaacacactaaacacaacatccacccccaccca 35745668  T
Q  263 tcaccactactcacccccaaagaacacc-ctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacc---tatcgaagagcacctgactgaatg 358  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||| || |||||    
T  35745669 tcgtcactactcacccccaaagaacacctctcaaaataaaacagtcagacttcaacacccaagctgagccactatatatcgaaaagctcctaaccgaatg 35745768  T
Q  359 aacatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatct 458  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||    
T  35745769 aacatgcagcttccacaacctctccacctccaatccaccgaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagccaaagagatgacttccgatct 35745868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 25161240 - 25160839
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25161240 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgtaagatttaaggtatgaacgaaacaagatgcaaatggtgccgtatatagacggtacaccataaccacct 25161141  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    ||||||  ||||| ||||          ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||    
T  25161140 aaaaac-accctggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagact-----tcaaaaaacaagcaatgtaaacatagtatccaccaacgccc 25161047  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| | || |||||||||| |||||| || |    
T  25161046 atcgtcactactcacccacaaagaacacctttaaa--aaaactctcagaccccaacatctaagttgagccacatttccaagagcacctaactgaaggatc 25160949  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |  ||||| ||  |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||     | ||||||||||||||||| | |  ||||  ||||| | |||||||    
T  25160948 acacagctatcacaaaccttgagacctccaatccaccgaaagagcacaa----cacagcccaaaaaccaacttaatttcaagatttgacttccgatctcg 25160853  T
Q  461 aatcaaaaataatc 474  Q
    |||||||| |||||    
T  25160852 aatcaaaagtaatc 25160839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 269 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 33435337 - 33435139
Alignment:
Q  269 ctactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| || |||| |||    
T  33435337 ctactcacccccaaagaacaccctcaaaagaaaactctcagacctcaacaaccaagctgagccacaattcgaagagcacctgaccgaaggatcatgtagc 33435238  T
Q  369 ttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33435237 tttcacaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcac-aaaacaaatgcccacaaacgaacttgagacaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 33435139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 333
Target Start/End: Original strand, 3419048 - 3419313
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3419048 aatcgacaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaacgttgccgc--atagacggtacaccataaccacct 3419145  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| | |||||||||          ||||||| |||||||||||||||| |||     |||||||||||| ||||||||  | || ||||||||  |    
T  3419146 aaaaacactcctgaagataaactcaccaaaacacaacaccacctaaaacagaatcc----aaaaaaacaagcattgtaaacatgatatccaccaccgttc 3419241  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccac 333  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||    
T  3419242 atcatcactactcactcacaaaaaacacccttaaaataaaactcccaaaccccaacacccaagttaagccac 3419313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 267 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34390192 - 34389992
Alignment:
Q  267 cactactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgc 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | ||| ||| ||| |  ||||||||||||    
T  34390192 cactactcatccccaaagaacacccctcaaaataaaactcccagactacaacacccaagttgagccacattt-gaaaagctcctaatcgaatgaacatgc 34390094  T
Q  366 agcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatca 465  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34390093 agcttccacaacctctcgacctccgatccaccgaaagagcac-aaaataaaagcccaaaaaccaacttaagccaaagagctgactcccgatctcgaatca 34389995  T
Q  466 aaa 468  Q
    |||    
T  34389994 aaa 34389992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 470
Target Start/End: Original strand, 48161690 - 48162079
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48161690 aatcagcaaatattattaaacgtcatccctgcaagacacaagatatggacgaa-caaaatacaaatagtgccgcatatagacggcacaccataaccacct 48161788  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccacta 271  Q
    || ||  |||||||||||||     |||||| |||| |||||| |||| |  | |||||| ||||  ||| ||  | | ||| ||| || |||  ||| |    
T  48161789 aacaaagcccctgaagataa----ctcaccatctaagacagacacctt-aatagaaacaaacactagaaatac--agtccacaaccacctatcgtcacaa 48161881  T
Q  272 ctcacccccaaa-gaacacc-ctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct 369  Q
     ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||  ||||  |||||  ||||||| | ||||| |||  || ||  |||||||| ||| ||    
T  48161882 ttcacccccaaacgaacacctctcagaataaaactctcagacttcaac-gccaagtcgagccacat-tcgaaaagc-tctaacccaatgaacaagcaact 48161978  T
Q  370 tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaa 469  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  48161979 tccacaacctctcgacctctgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagtccaaaaatcaatttgagccaaagaactgatttccgatctcgaatcaaaaa 48162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6585318 - 6585045
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  6585318 aatcagcaaatattattaaacgccatccccgcaagatgcaaggaatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataaccacca 6585219  T
Q  172 aaaaactcccctgaaga----------taaacacatca-ccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcc 260  Q
    || ||  ||||||||||          ||||||||||| || ||||| || ||| |||| ||| |||  || ||||| |||||||  || ||| ||| |     
T  6585218 aacaaaacccctgaagataaagccacctaaacacatcacccccctaagacggacaccttaacagaaacaaaacactgaaaacacagtatccacaaccact 6585119  T
Q  261 catcaccactactcacccccaaagaaca-ccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccac 333  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6585118 catcgtcactactcacctccaaatagcacccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaagctgagccac 6585045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 33434480 - 33434601
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33434480 aatcggcaaatattattaaacgccatccccgcaatacgcaaggtatggacgaagcaagatacaaatggttctgtatatagacggtacaccataaccacct 33434579  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  33434580 aaaaacacccctggaaataaac 33434601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 304
Target Start/End: Original strand, 40726140 - 40726392
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaag--------------atacaaatggtgccgcatatagacggta 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||              ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  40726140 aatcggcaaatattattaaatgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacacgaaacaaaatacaaatgatgctacatatagacggta 40726239  T
Q  158 caccataaccacctaaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaa 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||          |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||       
T  40726240 caccataaccacctaaaaacacccctggagataaacccaccaaaacacattaccacctaaaacagactc---caaaaaaatcaagcacggtaaacacggt 40726336  T
Q  248 attcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaact 304  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40726337 atccaccaccgcctatcatcactactca-ccacaaagaacaccctcaaaataaaact 40726392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37795754 - 37795635
Alignment:
Q  74 tcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||    
T  37795754 tcggcaaatattattaaacgtcgtccccacaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgtcgcgattaaacggtacaccataaccacctaa 37795655  T
Q  174 aaactcccctgaagataaac 193  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  37795654 aaacacccatgaagataaac 37795635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34391614 - 34391493
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  34391614 aatcagcaaatattattaaacgtcatccccgcaggacgcagggtatggacgaaacaagatacaaataatgccgcatatagacgatacaccataaccacca 34391515  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    || ||  |||||||||||||||    
T  34391514 aacaaagcccctgaagataaac 34391493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 42454383 - 42454504
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42454383 aatcagcaaatattattaaacatcatccccgcaagacgcaagatatagacgaaacaaggtacaaatggtgccgcatatagacagtacaccataaccacct 42454482  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    |||||   || |||||||||||    
T  42454483 aaaaaaatccttgaagataaac 42454504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 360 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6585046 - 6584939
Alignment:
Q  360 acatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctc 459  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  6585046 acatgcaggttccacaacctctcaacctccgatccaccgaaagagcacaaaa-caaaagcccaaaaaccaacttaagccaaagagctgactcccgatctc 6584948  T
Q  460 gaatcaaaa 468  Q
    |||||||||    
T  6584947 gaatcaaaa 6584939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43482331 - 43482232
Alignment:
Q  77 gcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43482331 gcaaatattattaaacgtcatccccgta-gacgcaaggtatggacgaaataagatacaaatagtgctgcatacagacggtacaccacaaccacctaaaaa 43482233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 169
Target Start/End: Original strand, 11378772 - 11378866
Alignment:
Q  74 tcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11378772 tcggcaaatattattaaacgccaaccccgcaagacgcaaggtatggacg-aataagatacagatgatgccgcatataaacggtacaccataaccac 11378866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8745384 - 8745183
Alignment:
Q  267 cactactcacccccaaagaaca----ccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaaca 362  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||||||| ||||||| || |   |||||| |||||||||||| |  |||| ||| |||  ||||| || ||    
T  8745384 cactactcacccccaaagaaaaacacccctcaaaattaaactcccagtcttgaacaccaaagctgagccacatc-cgaaaagctcctatctgaaagatca 8745286  T
Q  363 tgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaa 462  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||   || |   |||||||||||| | |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  8745285 tgcagcttccacaacctctcgacctccgatccaccgaaagaaaccata---aaaagcccaaaaccaaacttgatccaacgaactgaatcccgatctcgaa 8745189  T
Q  463 tcaaaa 468  Q
    ||||||    
T  8745188 tcaaaa 8745183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 468
Target Start/End: Original strand, 6716748 - 6716787
Alignment:
Q  429 aacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6716748 aacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 6716787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12480970 - 12480916
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12480970 aaaagccaaaaaccaaacttgaaccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 12480916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 84 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43012796 - 43012405
Alignment:
Q  84 ttattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccct 183  Q
    |||||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  43012796 ttattaaatgtcatcct-gcaagacgcaaggtatgaacgaaacaatatacaaatggtgccgcatatagacgatacaccataaccacctaaaaacactcct 43012698  T
Q  184 gaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactact 273  Q
    ||||| ||||          ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  43012697 gaagaaaaacccaccaaaagacatcaccatctaaaacagactccttcacaaaaa-caagcattgtaaacacggtatccacccccgtccatcgccactact 43012599  T
Q  274 cacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttcca 373  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  43012598 cacctccaaagaacaccctcaaattaaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctgaccgaacgatcatgcaacttcca 43012499  T
Q  374 aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
     |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43012498 caacctcgcgacctctgattcaccgaaagagcac-aaaacaaaagctcaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 43012405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19176938 - 19176532
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19176938 aatcggcaaatattattaaacgtcattcctgcaagacgcaaagtatggacgaaacatgatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacgacct 19176839  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||  |||||||||| ||||          |||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||  || |||||||  ||    
T  19176838 aaaaatacccctgaagacaaacccaccaaaacacataaccacctaaaacagactccaaaa-aaaaaacaagcacagtaaacacagtatccaccaccatcc 19176740  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactg--aatga 359  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||    
T  19176739 atcgtcactactcacccctaaagaacaccctcaaaataaaacacccagaccccgacacccaagctgagccacattacgaagagcacctgaccgaaaagga 19176640  T
Q  360 acatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctc 459  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19176639 tcatgcagcttccacaaccttgcgacctccgatccaccaaaagagcac-aaatcaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctc 19176541  T
Q  460 gaatcaaaa 468  Q
    |||||||||    
T  19176540 gaatcaaaa 19176532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 72 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 47236130 - 47235729
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47236130 aatcagcaaatattattaaacgccatccctgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtataccataaccatct 47236031  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||    
T  47236030 aaaaacacccctggagataaacccaccaaaatacatcaccacctaaaacagact---taaaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtcc 47235934  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||| || |    
T  47235933 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcgcagaccccaacacccaagctgaaccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 47235834  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  47235833 atgcagctatcacaaacctcgcgacctctgatccaccgaaagagca-aaacac-aaagcccaaaaaccaacttaagtcaaagaaccgactctcgatctcg 47235736  T
Q  461 aatcaaa 467  Q
    |||||||    
T  47235735 aatcaaa 47235729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 2392152 - 2392557
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2392152 aatcggaaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 2392251  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||| ||||||          |||||||| ||||||| |||||     | |||||| |||||||||||||||   || |||||||||||    
T  2392252 aaaaacacccctgaaaataaacccaccaaaacacatcaccgcctaaaatagactaaaaaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgccc 2392351  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| || ||| || |    
T  2392352 atcgtcactactcacccacaaataacacctacaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacattttgaagagatcctaaccgaaggatc 2392451  T
Q  362 atgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||    
T  2392452 atgcagctagcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttaagacaaagaactgacttccaatctcg 2392549  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  2392550 aatcaaaa 2392557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 45164285 - 45163885
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45164285 aatcggcaaatattattaaacattatccccgcaagatgcaaggtatggactaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 45164186  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| ||| || ||||||||          |||||||||||||||| |||||||     || ||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||    
T  45164185 aaaaacaccc-tggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaatagactcca----aagaaacaagcattgtaaacacggtattcatcaccgccc 45164091  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||| || |    
T  45164090 atcgtcactaatcacctacaaataacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 45163991  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  45163990 atgcagctatcacaaacttcgtgacctccgatccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttaagacaaaaaactgacttctgatctcg 45163893  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  45163892 aatcaaaa 45163885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 468
Target Start/End: Original strand, 9583710 - 9584104
Alignment:
Q  80 aatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactc 179  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  9583710 aatattattaaacgccatctccgtaagacacaaggtatagacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgatacaccataaccacctaaaaatac 9583809  T
Q  180 ccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccac 269  Q
    || |||| ||||||          ||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||  |||    
T  9583810 ccttgaaaataaacccaccaaaacacatcaccacaaaaattagactccttca-aaaaaacaagcaccgtaaacacgatatccaccaccgcctatcgtcac 9583908  T
Q  270 tactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct 369  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||||| ||| || | |||  ||    
T  9583909 tactcaccgc-aaagaacatcctcaaaataaaactcccagaccccaaaacccaagcagagccacaattcgaagagcgcctgaccgaaggatcgtgcgact 9584007  T
Q  370 tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    || | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9584008 tc-acaacctcgcaacctccgatccaccgaaagatcacaaaa-caaaagcccaaaaaccatcttgagacaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 9584104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 40023224 - 40023623
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  40023224 caaatattattaaacatcatccccgcaagacgcattgtatggacgaaacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacaccataaccaccaaacaaa 40023323  T
Q  178 tcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcacc 267  Q
     |||||||||||||||          |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  || ||||||||||||   || ||| |||  |||||  |    
T  40023324 gcccctgaagataaacccatcaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaacaaaacactgtaaacacggtatccacaaccatccatcgtc 40023423  T
Q  268 actactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgca 366  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  40023424 actactcatcccaaaagaacgcccctcaaaataaaactcccagactacaacaccctagctgagccacat-tcgaaaagctcctaaccgaatgaacatgca 40023522  T
Q  367 gcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaa 466  Q
    ||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  40023523 gcttccacaacctcccgtcctctgatccaccgaaagagcacaaaa-caaaagcccaaaaaccaacttaagccaaagaatcgactcccgatctcgaatcaa 40023621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 397
Target Start/End: Original strand, 2393915 - 2394252
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2393915 aatcggaaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 2394014  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagact-ccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcc 260  Q
    |||||| |||||||| ||          |||||||||||| ||||||| |||||      | |||||| |||||||||||||||   || ||||||||||    
T  2394015 aaaaacacccctgaaaataaacccaccaaaacacatcaccgcctaaaatagactaaaaaaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgcc 2394114  T
Q  261 catcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| || ||| ||     
T  2394115 catcgtcactactcacccacaaataacacctacaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacattttgaagagatcctaaccgaaggat 2394214  T
Q  361 catgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccacc 397  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  2394215 catgcagctagcacaaacctcgcgacctccgatccacc 2394252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 34475407 - 34475805
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34475407 aatcggcacatattattaaacgtcatccccgcaagacgcagggtatgaacgaaacaagatacaaatggtgccccatatagacggtataccataaccacct 34475506  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    || ||| |||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||   || |||||||||||    
T  34475507 aagaacacccctggagataaactcaccaaaacacatcaccacctaaaacagactcc-----aaaaaacaagcaatgtaaacacggtatccaccaccgccc 34475601  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| || ||| || |    
T  34475602 atcgtcactactcacccacaaagaacacccttaaa--aaaactctcataccccaacacctaagctgagtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 34475699  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| |||||| | || ||||  ||||||| |||||||    
T  34475700 atacagctatcacaaacctcgcgacctccaatccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaatcaacttaattccaagatttgactcccgatctcg 34475797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 23327997 - 23328401
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23327997 aatcagcaaatattattaaacgctatccctgcaatacgcaaggtatggacgaaacaagatataaatggtgccgcatatatacggtacaccataaccacca 23328096  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaacaca----------tcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    || ||  ||| ||| ||||||| ||          ||||||||||| || |||  ||| ||| ||| ||| |||||||| ||||| || ||| ||| |||    
T  23328097 aacaaagcccttgaggataaacccacgaaaatatatcaccacctaagacggacctcttaacagaaa-caaacactgtaagcacaatatccacaaccaccc 23328195  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacacc-ctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| || |||||||    
T  23328196 atcgtcactactcacccccaaagaacaccactcaaaataaaactcccagacttcaacacccaagctgagccacat-tcgaaaagctcctaaccgaatgaa 23328294  T
Q  361 catgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    || | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||    
T  23328295 caaggagcttccacaacctctcgacctccgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaagctcaaaaaccaacttgagccaaaaagctaactcccgatctcg 23328393  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  23328394 aatcaaaa 23328401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 53248332 - 53247947
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    
T  53248332 aatcgacaaatattattaaacgtcatccccgcaaggcgtaaggtatggacaaaacaagatacaaatggtgtcgcatataggttgtacaccataaccatct 53248233  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    ||||||  ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||    
T  53248232 aaaaacaaccctgaagataaccccacaaaaacacatcaccacctaaaacagactcc----aaaaaaacaagcactgtaaacacggtaaccaccaccgccc 53248137  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaat-aaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||| ||     
T  53248136 atcgtcactactcacccacaaagaacactctcaaaataaaaactctcagaccccaacacccaaactgagccacatttcgaagagcacataaccgaaggat 53248037  T
Q  361 catgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactc 451  Q
    ||| || || ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53248036 catacaactatcacaaacctcgcgacctccaatccaccgaaagagcac-aacacaaaa-tctaaaaaccaacttgaatcaaagaattgactc 53247947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 225 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20612054 - 20611811
Alignment:
Q  225 aaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaag 324  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20612054 aaaacaagcactgtaaacacagtatccaccatcgcccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcagaataaaactcctaga-cccaacacccaag 20611956  T
Q  325 ctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaa 423  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||| || ||| || ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||   |||||||||    
T  20611955 ctgagtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcattcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcac--aacgcaaagcccaa 20611858  T
Q  424 aaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaat 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20611857 aaaccaacttaagtcaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaaat 20611811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17551382 - 17550987
Alignment:
Q  79 aaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaact 178  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||   | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17551382 aaatattattaaacgttatccctgcaagatgcagggtatgaacgaaacaaaatacaaatggtgccgcatatagactgtacaccataaccacctaaaaaca 17551283  T
Q  179 cccctgaaga----------taaacacatcaccacctaaaacagact--ccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcac 266  Q
    || ||||| |           |||||||||||||||||||| |||||       | |||||||||||| |  |||||    |  ||||||||||||||      
T  17551282 cctctgaaaaaaaacccaccaaaacacatcaccacctaaaagagactaaaaaaaaaaaaaaacaagcattacaaacaaggtaaccaccaccgcccatcgt 17551183  T
Q  267 cactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgca 366  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||     ||  | ||||||    
T  17551182 cactactcaccgacaaagaacaccctcaaaataaaactctcagaccccaacacccaaactgagccacatttcgaagagcacct-----aaccatcatgca 17551088  T
Q  367 gct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatca 465  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17551087 gctatcacaaacctcgcgacctccgatgcatcgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcgaatca 17550990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 45399217 - 45398826
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45399217 aatcagcaaatattattaaacgacatctccgaaagacgcgaggtatgaacgaaacaagatacaaacggtgccgcatatagacggtacaccataaccacca 45399118  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccacta 271  Q
    | | |  |||   ||    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||  || |||||||||||||| || ||| | |  |||||  |||||    
T  45399117 agataaacccaccaa----aacacatcaccacctaagacggacaccttaacagaaacaaaacactgtaaacacaatatccacaatcatccatcgtcacta 45399022  T
Q  272 ctcacccccaaagaacaccct-caaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagctt 370  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||  ||||||| ||| || ||||| | ||||| ||| | | || |||||||||||||||||    
T  45399021 ctcacccccaacgaacaccccacaaaatagaactcccaaacttcaacacctaagttgcgccacat-tcgaaaagctcataaccgaatgaacatgcagctt 45398923  T
Q  371 ccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  45398922 ccacaacctctcgacctccgatccatcgaaagagcataaaa-caaaagcccaaaaaccaacttaaatcaaagagctgactctcgatctcgaatcaaaa 45398826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 31483312 - 31482914
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483312 aatcggcaaatattattaaacaccatccccacaagacgcaaggtatgaacaaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 31483213  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||| ||||          |||||||||||| ||||||||| |||||      ||||| ||||| ||||||||    || |||||| |  |    
T  31483212 aaaaacacccctggagataaactcaccaaaacacatcaccgcctaaaacaaactcc------aaaaaaaagcaatgtaaacatggtatccaccactgttc 31483119  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||| || |    
T  31483118 atcgtcactactaacccacaaagaacacccttaaaa-aaaactctcaaaccccaacacctaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 31483020  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| |||||| | |  ||||  ||| ||| |||||||    
T  31483019 atgcagctatcacaaacctcgcgacctccaatccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaatcaacttaattttaagatttgattcccgatctcg 31482922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 333
Target Start/End: Original strand, 30352110 - 30352356
Alignment:
Q  94 tcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaagat---- 189  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||        
T  30352110 tcattcccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagaaggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataagc 30352209  T
Q  190 ------aaacacatcaccac--ctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcaccccca 281  Q
          ||||||||||||||  |  ||| |||   ||  | |||||||||| |||||||||||   || ||||||| ||||||  ||||||||| || ||    
T  30352210 ccaccaaaacacatcaccaccacctaaagaga---ctaaaaaaaaaacaagtactgtaaacacggtatccaccaccacccatcgtcactactcatccaca 30352306  T
Q  282 aagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccac 333  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30352307 aagaacaccct--aaaaaaaactccgagaccccaacacccaagctgagccac 30352356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21343779 - 21343678
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21343779 aatcgacaaatattattaaacgtcatcccggcaagacacaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacatcataaccacct 21343680  T
Q  172 aa 173  Q
    ||    
T  21343679 aa 21343678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 50305223 - 50305344
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  50305223 aatcagcaaatattattaaacgccattcccgcaagacgcaaggtatggacggaacaagatacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataaccatca 50305322  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    || ||  |||||||||||||||    
T  50305323 aataaagcccctgaagataaac 50305344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37158735 - 37158618
Alignment:
Q  74 tcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatat-agacggt-acaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  37158735 tcggcaaatattat-aaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaggatacaaatggtgccgcatataatatggtaacactataaccacct 37158637  T
Q  172 aaaaactcccctgaagata 190  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  37158636 aaaaacacccctgaagata 37158618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 4463734 - 4463831
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4463734 aatcggcaaatattattaaacgtcaaccccacaagacgcaagacatggacgaaacaacacacaaatggtgccgcatatagacggtgcaccataaccac 4463831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Original strand, 25506719 - 25506814
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25506719 aatcgacaaatattattaaacatcatccccgcaagacccaagatataaacaaaacaatatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 25506814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50560070 - 50559978
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50560070 caaatattattaaacgtcatcctcgcaatacgcaagatatggacgaaacaagatacaaaagatgccgcacatagacggtgcaccataaccacc 50559978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 47439347 - 47439284
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaa 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47439347 aatcggcaaatattactaaacgtcatccctacaagacataaggtatggacgaaacaagatacaa 47439284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21342735 - 21342603
Alignment:
Q  296 aataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatcca 395  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||  ||||||| | ||||| |||  || || ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  21342735 aataaaactctcagacttcaacacccaagtcgagccacat-tcgaaaagcttctaaccgaatgaacaagcagcttccacaacctctcgacctctgatcca 21342637  T
Q  396 ccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaa 430  Q
     | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21342636 tcgaaagagcac-aaaacaaaagcctaaaaaccaa 21342603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5557011 - 5556918
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||  |||||| || |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||    
T  5557011 aatcggcaaatattattaaacgtcatttccgtaggatgtaaggtttgaacgaaacaagatacaaatagttatgcatatagatggtacaccataa 5556918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7105140 - 7105031
Alignment:
Q  197 tcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaaca-ccctcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||  || ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||  |||| |||| ||    
T  7105140 tcaccacctaaaacagacttcttca-agaaaacaagcactataaaaacagtatccaccaccacccatcgtcactactcaccccaaagaaacaccccttaa 7105042  T
Q  296 aataaaactcc 306  Q
    |||||||||||    
T  7105041 aataaaactcc 7105031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 1652883 - 1652937
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1652883 aaaagcccaaaaccaaacttgaaccaaagaactaactcctgatctcgaatcaaaa 1652937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 468
Target Start/End: Original strand, 33143899 - 33144000
Alignment:
Q  365 cagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaa-cttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaat 463  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||   || |||   |||||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33143899 cagcttccaccacctcgcgacctctgatccaccgaaagaaaccataaa---aagcccaaaaactaatcttgatccaaagaactgactcccgatctcgaat 33143995  T
Q  464 caaaa 468  Q
    |||||    
T  33143996 caaaa 33144000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 47945790 - 47945736
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  47945790 aaaagcccaaaatcaaacttgagccaaataactgactcccgatctcgaatcaaaa 47945736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 468
Target Start/End: Original strand, 2394255 - 2394304
Alignment:
Q  419 cccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2394255 cccaaaaaccaacttaagacaaagaactgacttccaatctcgaatcaaaa 2394304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27399062 - 27398992
Alignment:
Q  392 tccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatc 464  Q
    |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27399062 tccaccaaaagaacaccaaaa--aaagcccaaaaccaaacttgaaccaaataactgactcctgacctcgaatc 27398992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32010063 - 32010030
Alignment:
Q  194 acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32010063 acatcaccacctaaaacagactccttcacgaaaa 32010030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8255459 - 8255057
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8255459 aatcggcaaatattattaaacgctatctccgcaagatataaggtgtggacgagacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacatcataaccacct 8255360  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| | |||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||  || ||||||  |||    
T  8255359 aaaaacactcctgaagataaactcacaaaaacacatcaccacctaaaacagactcc---aaataaaacaagcactgtaaacacagtatccaccacatccc 8255263  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||  || |    
T  8255262 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcacagaccctaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaactgatggatc 8255163  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8255162 aagcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcacaaaa--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgacttctgatctcg 8255065  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
     |||||||    
T  8255064 gatcaaaa 8255057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8268877 - 8268475
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8268877 aatcggcaaatattattaaacgctatctccgcaagatataaggtgtggacgagacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacatcataaccacct 8268778  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| | |||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||  || ||||||  |||    
T  8268777 aaaaacactcctgaagataaactcacaaaaacacatcaccacctaaaacagactcc---aaataaaacaagcactgtaaacacagtatccaccacatccc 8268681  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||  || |    
T  8268680 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcacagaccctaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaactgatggatc 8268581  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8268580 aagcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcacaaaa--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgacttctgatctcg 8268483  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
     |||||||    
T  8268482 gatcaaaa 8268475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30964869 - 30964471
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30964869 aatcgacaaatattattaaacaccatccctgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatgatgttgcatatagacggtacaccataaccacct 30964770  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| | |||| ||||          |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| || |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  30964769 aaaaacactcctggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactc---caaaaaaatcacgcactgtaaatacgatattcaccaccgccc 30964673  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| || |||||| |    
T  30964672 atcatcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccag----taccacccaagcagggccacatttcgaagagcacctaaccgaatgatc 30964577  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  30964576 atgcagctatcacaaacctcgcgacctccgaaccaccaaaagagcac-aacacaaaa-cccaaaaaccaacttgagtcaaagaacggactcccgatcacg 30964479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 333
Target Start/End: Original strand, 8705789 - 8706061
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8705789 aatcggcaaatattattaaacgtcatcccttcaagacgcgaggtatggacgaggcaggatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 8705888  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaa-----aacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcc 260  Q
    |||||| ||| |||||||      |||||||||||||||||||| ||||||    | ||||     |||||||||||||||||||  || |||||| |||    
T  8705889 aaaaacacccttgaagatccacaaaaacacatcaccacctaaaatagactcaaaaaaaaaaaaaaaaacaagcactgtaaacacagtatccaccactgcc 8705988  T
Q  261 catcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccac 333  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8705989 catcgtcactacccacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcttagaccccaacacccaagctgagccac 8706061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 468
Target Start/End: Original strand, 31050315 - 31050713
Alignment:
Q  77 gcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaa 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  31050315 gcaaatattattaaacgtcgtccccgcaagatgcgatgtatggacgaaacaagatacaaatgatgtcgcatatagacggtacaccataaccaccatacaa 31050414  T
Q  177 ctcccctgaagataa---------acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcacc 267  Q
      | |||||||||||         |||||||||||||||| ||  || |||  ||| ||  ||| |||||||||||||| || ||||| |  |||||  |    
T  31050415 g-cacctgaagataactcatcaaaacacatcaccacctaagacgaacacctcaacagaag-caaacactgtaaacacaacatccaccatcatccatcgtc 31050512  T
Q  268 actactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgca 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  31050513 actactcacccccaaggaacacccctcaaaataaaacagccagacttcaacacccaagcttagccaca-atcgaaaagctcctaaccgaatgaacatgca 31050611  T
Q  367 gcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaa 466  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| || ||| | |||||||||||||    
T  31050612 gcttccacaacctctcgacctccgatccactgaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaactcaaaccaaagacctaacttccgatctcgaatcaa 31050711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 30167212 - 30167615
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgca--tatagacggtacaccataaccac 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||||||||||| |||||||     
T  30167212 aatcgacaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatgatgcaaaaaatatagacggtacactataaccat 30167311  T
Q  170 ctaaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgc 259  Q
    |||||||  || ||||||||||||          |||||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||    
T  30167312 ctaaaaataccactgaagataaacccaccaaaacacatcacatcctaaaacagactcc---aaaaaaatcaagcactgtaaacacggtatccaccaccgc 30167408  T
Q  260 ccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatga 359  Q
    | | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| | | || ||| |     
T  30167409 caa-cgtcaccactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccataccccaacacccaagttgggccacatttcgaagagcgcttaaccgaaggg 30167507  T
Q  360 acatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatct 458  Q
     ||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |   ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30167508 tcatgcagctatcataaacctcgcgacctccggaccaccgaaagagcacaaca--caaaccccaaaaatcaacttgagtcaaagaaccgactcccgatct 30167605  T
Q  459 cgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||    
T  30167606 cgaatcaaaa 30167615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2826213 - 2825811
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  2826213 aatcagcaaatattattaaacgtcatctctgcaagacgcaaggtatggacggaacaagatacaaatggtgccgcatatatacggtacaccataaccccca 2826114  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataa--------acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccat 263  Q
    || ||  ||| |||||||||        |||||||| ||||||| ||| || |||| ||| ||| ||| | |||||||| ||  || ||| ||  |||||    
T  2826113 aacaaaaccc-tgaagataacctccaaaacacatcatcacctaagacaaacaccttaacagaaa-caaaccctgtaaacgcagtatccacaacgtcccat 2826016  T
Q  264 caccactactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaaca 362  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||    
T  2826015 cgtcactactcacccc-agagaacacccctcaaaataaaactcccaaacttcaacacccaaactgaaccacct-tcgaaaagctcctaaccgaatgaaca 2825918  T
Q  363 tgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaa 462  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||    
T  2825917 tgcagcttccacaacctctagacctccgatccaccgaaagagtac-aaaataaaagcccaaaaaccacattgagccaaagaggtgattcccgatctcgaa 2825819  T
Q  463 tcaaaaat 470  Q
    ||||||||    
T  2825818 tcaaaaat 2825811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 35341006 - 35341389
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatcccc--gcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  35341006 caaatattattaaacgtcatccccccgcaagacgcaatgtatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataacccccggaca 35341105  T
Q  176 actcccctgaagataaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactca 275  Q
    |  ||||||||||||| | |   | ||| | |      | |||| ||||||| ||| |||||||||||||  || | | ||| ||||||  |||||||||    
T  35341106 aagcccctgaagataacccccataacacatcac-----caccttaacaaaaa-caaacactgtaaacacagtatccgcaaccacccatcgtcactactca 35341199  T
Q  276 cccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttccaa 374  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  35341200 cccc-agagaacacccctcaaaataaaactcccaaacttcaacaccaaa-ctgagccacat-tcgaaaagctcataactgaatgaacatgcagcttccac 35341296  T
Q  375 aacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  35341297 aacctctcgaactccgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaaggccaaaaaccaacttgagccaaagagctgacttccgatctcggatcaaaa 35341389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35329439 - 35329318
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35329439 aatcggcaaatattagtaaacgccatccccgcaagacgtaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 35329340  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    |||||  ||| |||||||||||    
T  35329339 aaaaatacccatgaagataaac 35329318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20465005 - 20464786
Alignment:
Q  88 taaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaag 187  Q
    |||||||||||| | |||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20465005 taaacgtcatcctcacaagatgcaaggtatgaaagaaacaagatacaaatggtgccgtatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaag 20464906  T
Q  188 ataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacc 277  Q
    ||||||          |||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20464905 ataaacccaccaacatacatcaccacctaaaacaaa---cttca-aaaaaacaaaccctgtaaacacggtatccaccaccgcccatcgtcactactcacc 20464810  T
Q  278 cccaaagaacaccctcaaaataaa 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  20464809 cccaaataacaccctcaaaataaa 20464786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 27555579 - 27555701
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatcccc-gcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27555579 aatcggcaaatattattaaacgccatcccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaattgtgccgcatatagatggtacaccataaccacc 27555678  T
Q  171 taaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  27555679 taaaaacacccctgaagataaac 27555701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7703118 - 7703018
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703118 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacacaaggtatggatgaaa-aagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 7703020  T
Q  172 aa 173  Q
    ||    
T  7703019 aa 7703018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 566 - 691
Target Start/End: Original strand, 7521449 - 7521574
Alignment:
Q  566 caaacatctttggaagttggcaagtcttcaacatcttgagctggattattgtgataacttaacttctatgccacatggaataggaaagatgactaatctt 665  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7521449 caaagatctttggaagttggtaattcttagacatcttgagttggatgattgtgataacttaacttctatgccacttggaataggaaagatgactaatctt 7521548  T
Q  666 caaacaccgacaaaatttgtgttaga 691  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||    
T  7521549 caaacactgacacactttgtgttaga 7521574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 566 - 691
Target Start/End: Original strand, 7529514 - 7529639
Alignment:
Q  566 caaacatctttggaagttggcaagtcttcaacatcttgagctggattattgtgataacttaacttctatgccacatggaataggaaagatgactaatctt 665  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7529514 caaagatctttggaagttagtaagtcttagacatcttgagttggattattgtcataacttaacttctatgccacgtggaataggaaagatgactaatctt 7529613  T
Q  666 caaacaccgacaaaatttgtgttaga 691  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||    
T  7529614 caaacactgacacagtttgtgttaga 7529639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 566 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7127743 - 7127618
Alignment:
Q  566 caaacatctttggaagttggcaagtcttcaacatcttgagctggattattgtgataacttaacttctatgccacatggaataggaaagatgactaatctt 665  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7127743 caaagatctttggaagttggtaagccttagacatcttgagttggatgattgtgataacttaacttctatgccacgtggaataggaaagatgactaatctt 7127644  T
Q  666 caaacaccgacaaaatttgtgttaga 691  Q
    ||||||  |||| | |||||||||||    
T  7127643 caaacattgacacactttgtgttaga 7127618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 566 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 7721018 - 7720893
Alignment:
Q  566 caaacatctttggaagttggcaagtcttcaacatcttgagctggattattgtgataacttaacttctatgccacatggaataggaaagatgactaatctt 665  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7721018 caaagatctttagaagttggtaagtcttcgacatcttgagttggattattgccatgacttaacttctatgccaattggaataggaaagatgactaatctt 7720919  T
Q  666 caaacaccgacaaaatttgtgttaga 691  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||    
T  7720918 caaacactgacacagtttgtgttaga 7720893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4306136 - 4306033
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4306136 aatcggcaaatattattaaatgtcatccccggaagacgcaaggtatgaacgaaa-aagatataaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 4306038  T
Q  172 aaaaa 176  Q
    |||||    
T  4306037 aaaaa 4306033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 597 - 691
Target Start/End: Original strand, 7483423 - 7483517
Alignment:
Q  597 catcttgagctggattattgtgataacttaacttctatgccacatggaataggaaagatgactaatcttcaaacaccgacaaaatttgtgttaga 691  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7483423 catcttgagttggattattgtgatgacttaacttctatgccacgtggaataggaaagatgactaatcttcaaacacttacacaatttgtgttaga 7483517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 574 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 7717180 - 7717066
Alignment:
Q  574 tttggaagttggcaagtcttcaacatcttgagctggattattgtgataacttaacttctatgccacatggaataggaaagatgactaatcttcaaacacc 673  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7717180 tttggaagttggtaagtcttagacatcttgagttggatgattgtaataacttaacttctatgccacttggaataggaaagatgactaagcttcaaacact 7717081  T
Q  674 gacaaaatttgtgtt 688  Q
    |||| | ||||||||    
T  7717080 gacacagtttgtgtt 7717066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 566 - 691
Target Start/End: Original strand, 7495791 - 7495916
Alignment:
Q  566 caaacatctttggaagttggcaagtcttcaacatcttgagctggattattgtgataacttaacttctatgccacatggaataggaaagatgactaatctt 665  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7495791 caaagatctttggaagttggtaagtcttagacatcttgagttggatctttgtcataacttaacttctatgccacgtggaataggaaagatgactaatctt 7495890  T
Q  666 caaacaccgacaaaatttgtgttaga 691  Q
    |||| |  |||| | |||||||||||    
T  7495891 caaagattgacacactttgtgttaga 7495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 46698428 - 46698525
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698428 aatcagcaaatattattaaacgtcatccatgaaagacgcaaggtatggtcgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 46698525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49528514 - 49528421
Alignment:
Q  76 ggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49528514 ggcaaatatcattaaacaccaaccccgcaaaacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccaaaaccac 49528421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 4305951 - 4305755
Alignment:
Q  270 tactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct 369  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||| | ||||||||||||| || ||| || ||||||| |    
T  4305951 tactcacccacaaagatcaccctgaaaataaaactcccaaacccaaatacccaagttgagccacat-tcgaagagcacctcaccgaaggatcatgcagtt 4305853  T
Q  370 tcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
      || |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4305852 atcacaaaccttgcgacctctggaccaccaaaagagcacaacac--aaagcctaaaaaccaacttgagacaaagaactaactcccgatctcgaatcaaaa 4305755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 191
Target Start/End: Original strand, 11281375 - 11281493
Alignment:
Q  73 atcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11281375 atcggcaaatattattgaacgtcatctccacaagacgcaagatatggacgaaacatgatataaatggtgctgtatatagacggtataccataaccaccta 11281474  T
Q  173 aaaactcccctgaagataa 191  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  11281475 aaaacacctctgaagataa 11281493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 36689454 - 36689575
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  36689454 aatcgacaaatattattaaataccatctccgcaagacgcgaggtatggacgaaataagatacaaatggtatcgcatatagacggtacactataaccactt 36689553  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  36689554 aaaaacacccctgaagataaac 36689575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9750198 - 9750116
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgg 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9750198 aatcgacaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgca-ggtttggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgg 9750116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Original strand, 52868766 - 52868859
Alignment:
Q  78 caaatattattaaa-cgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 170  Q
    |||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52868766 caaatattattaaaacgtcatcttcacaagacgtaaggtatgaacgaattaagatacaaatggtgtcgcgtatagacggtacaccataaccacc 52868859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 508 - 563
Target Start/End: Original strand, 7521359 - 7521414
Alignment:
Q  508 taaggttgaagagctcccaaggtctataactgaattaatcaacttggcgactcttt 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7521359 taaggttgaagagctcccaaggtctataactgaattagttaacttggagactcttt 7521414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 511 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 7127830 - 7127778
Alignment:
Q  511 ggttgaagagctcccaaggtctataactgaattaatcaacttggcgactcttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7127830 ggttgaagagctcccaaggtctataactgaattagttaacttggagactcttt 7127778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 511 - 563
Target Start/End: Original strand, 7495704 - 7495756
Alignment:
Q  511 ggttgaagagctcccaaggtctataactgaattaatcaacttggcgactcttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7495704 ggttgaagagctcccaaggtctataactgaattagttaacttggagactcttt 7495756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 511 - 563
Target Start/End: Original strand, 7529427 - 7529479
Alignment:
Q  511 ggttgaagagctcccaaggtctataactgaattaatcaacttggcgactcttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7529427 ggttgaagagctcccaaggtctataactgaattagttaacttggagactcttt 7529479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 511 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 7721105 - 7721053
Alignment:
Q  511 ggttgaagagctcccaaggtctataactgaattaatcaacttggcgactcttt 563  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7721105 ggttgaggagctcccaaggtctataactgaattaattaacttggagactcttt 7721053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 25753285 - 25753202
Alignment:
Q  382 cgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25753285 cgacctccgatccaccgaaagaa-acaataa--aaagcccaaaatcaaacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 25753202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 38929911 - 38929857
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38929911 aaaagcccaaaatcaaacttgagccaaagaactgactcttgatctcgaatcaaaa 38929857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28966951 - 28966896
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaa 469  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28966951 aaaagcccaaaaccaaacttgagccaaagaactgactcccaatctcgaatcaaaaa 28966896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 474
Target Start/End: Original strand, 36962626 - 36962672
Alignment:
Q  427 ccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaataatc 474  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36962626 ccaacttgagtcaaaga-ctgactcctgatctcgaatcaaaagtaatc 36962672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 53823418 - 53823472
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53823418 aaaaacccaaaaccaaacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 53823472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 474
Target Start/End: Original strand, 19815236 - 19815281
Alignment:
Q  429 aacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaataatc 474  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19815236 aacttgagccaaagaactgactcctgatctcgaataaaaagtaatc 19815281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 507 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 7717278 - 7717223
Alignment:
Q  507 ataaggttgaagagctcccaaggtctataactgaattaatcaacttggcgactcttt 563  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  7717278 ataaggttgaagagctcc-aaggtctataactcaattatttaacttggagactcttt 7717223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 470
Target Start/End: Original strand, 22811157 - 22811213
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaat 470  Q
    ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22811157 aaaagcctaaaaccaaacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaataaaaaat 22811213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12296259 - 12296205
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12296259 aaaagcccaaaatcaaacttgaaccaaagaactgacttttgatctcgaatcaaaa 12296205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19673169 - 19673135
Alignment:
Q  429 aacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaat 463  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19673169 aacttgagccaaagaactgactcctgatctcgaat 19673135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 35800573 - 35800519
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35800573 aaaagcccaaaaccaaactggaatcaaagaactgacttccgatctcgaatcaaaa 35800519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 31207011 - 31207413
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31207011 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgtatataaacggtacaccataaccacct 31207110  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| | |||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||    
T  31207111 aaaaacactcctgaagataaactcaccaaaacacatcaccacctaaaacagactca---aaaaaaaaaaagcactgtaaacacagtatccaccatcgccc 31207207  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| |  |    
T  31207208 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccatactccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaagggtc 31207307  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31207308 attcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaaaagcacaaca--caaatcccaaaatccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcg 31207405  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  31207406 aatcaaaa 31207413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 24995044 - 24995446
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24995044 aatcagcaaatattattgaacgccatccccgtaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcttatagacagtacaccataaccacct 24995143  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaacaca----------tcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||          |||||||||||||||  ||||     |||||||||||| |||||||||   || |||||||||||    
T  24995144 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacatgtcaccacctaaaacaatctcca----aaaaaacaagcattgtaaacacggtatccaccaccgccc 24995239  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctaga-ccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||| ||     
T  24995240 atcgtcactactcacgcacaaagaacaccctcaaaataaaactcctagacccccaacacccaagctgagccatatttcgaagagcacctaaccgaaggat 24995339  T
Q  361 catgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctc 459  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24995340 catgcagctatcacaaacctcgcgacctctgacccactgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctc 24995437  T
Q  460 gaatcaaaa 468  Q
    |||||||||    
T  24995438 gaatcaaaa 24995446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20138858 - 20138456
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20138858 aatcggtaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaagtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagatggtacaccataaccacct 20138759  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| ||| || ||||||||          ||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||   || |||||||| ||    
T  20138758 aaaaacacccatggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactcca----aaaaatcaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtcc 20138663  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaa-taaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||| || ||| ||     
T  20138662 atcgtcactactcacctacaaagaacaccctcaaaaataaaactcccagaccccaacacccaagccgggtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggat 20138563  T
Q  361 catgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctc 459  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  20138562 catgcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcacaacac--aaagcccaaaaaccaacataagtcaaagaactgactcccgatctc 20138465  T
Q  460 gaatcaaaa 468  Q
     ||||||||    
T  20138464 aaatcaaaa 20138456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 76 - 470
Target Start/End: Original strand, 37986508 - 37986911
Alignment:
Q  76 ggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37986508 ggcaaatattattaaatgtcatccccgcaagacgcaaggcacggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 37986607  T
Q  176 actcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatca 265  Q
    || ||||| |||||||||          |||||||||||||||||| |||     | |||||||||||| |||||||||   ||  |||||| ||||||     
T  37986608 acacccctaaagataaacccattaaaacacatcaccacctaaaacaaactaaaaaaaaaaaaacaagcattgtaaacacggtatctaccaccacccatcg 37986707  T
Q  266 ccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgc 365  Q
     || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| || || ||    
T  37986708 tcattactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactcccagaccgaaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcaggc 37986807  T
Q  366 agct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatc 464  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37986808 agctatcacaaacctcgcgacctccgaaccaccgaaagagcacaaca--caaagcacaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcgaatc 37986905  T
Q  465 aaaaat 470  Q
    ||||||    
T  37986906 aaaaat 37986911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 12897925 - 12898325
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12897925 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagatgcaagatatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccattaccacct 12898024  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||| |  || |||||   ||| ||| ||||  |    
T  12898025 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactcc----aaaaaaacaatccatgcaaacatggaatccacaaccgttc 12898120  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||| || |    
T  12898121 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctaagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 12898220  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  12898221 a-gcagctatcacaaacctcgcgacctccgaaccatcgaaagagcacaaca--caaagccccaaaaccaacttgagttagataactgactccggatctcg 12898317  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  12898318 aatcaaaa 12898325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 9519938 - 9519529
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9519938 aatcgacaaatattattaaacaccatccctacaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacagtacatcataaccacct 9519839  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaacaca----------tcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaag---cactgtaaacacaaaattcaccaccg 258  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||          |||||||||||||||  |||    | |||||| ||    ||||||||||||   || ||||||||    
T  9519838 aaaaacacccctgatgataaacccaccaaaacacgtcaccacctaaaacaacctcaaaaaaaaaaaaaaaaaatcactgtaaacacggtatccaccaccg 9519739  T
Q  259 cccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagacccc-aacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaat 357  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||    
T  9519738 cccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcagacccccaacacccaagctgagccatatttcgaagagcacctaaccgaat 9519639  T
Q  358 gaacatgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgat 456  Q
    || |||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9519638 gatcatgcagctatcacaaacttcgcaacctccgacccaccgaaagagcacaacac--aaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgat 9519541  T
Q  457 ctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||||    
T  9519540 ctcgaatcaaaa 9519529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 15821026 - 15821430
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  15821026 aatcagcaaatattattaaacgtcatcct-gcaagacgcaaggtatggacggaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtataccataaccacca 15821124  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaa----------cacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    || ||  ||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  || ||  ||||||||||||| ||| ||| | |    
T  15821125 aataaaacccctgaagataaaaccaccaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaacaaaacaaggtaaacacaaaatccacaaccactc 15821224  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacac-cctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||| | ||||| ||| ||| ||  ||||||    
T  15821225 atcgccactactcactccaaaagaacactcctcaaaataaaactcccagacttcaacatccgagctgagccacat-tcgaaaagctcctaaccaaatgaa 15821323  T
Q  361 catgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    || |  | ||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  15821324 caagttgtttccacaacctctcgacctctgatccactgaaagagcacaaaa-caaaagcccaaaaaccaacataagtcaaagagctgactcccgatctcg 15821422  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  15821423 aatcaaaa 15821430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36631254 - 36630867
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36631254 aatcggaaaatattattatacgccatccctgcaagacgcaaggtatgaa-gaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataatcacct 36631156  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||    
T  36631155 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactcca----aaaaaacaaacactgtaaacacggtatccaccaccgccc 36631060  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||   ||||||||||||||||              |||||| |  ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||| || |    
T  36631059 atcgtaactactcacccccaaac-------------taaaacacgcagacccccacatccaagttgagccacatttcgaagagcacctgaccgaaggatc 36630973  T
Q  362 atgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcga 461  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  36630972 atgcagctcccacaacctcgcgacctccgatccatcgaaagagcac-aaaacaaaagcccaaaaacaaactagagtcaaagaactgacacccgatctcga 36630874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 32065934 - 32066346
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32065934 aatcggcaaatattattaaacgccatcaccgcaagatgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacac-ataaccacct 32066032  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgta------------aacacaaaat 249  Q
    |||||| |||||||||||||||          |||||||||||||||||| |||||     ||||||| | |||||||            |||||   ||    
T  32066033 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactcca----aaaaaaccaacactgtatccaccacaaccaacactgtat 32066128  T
Q  250 tcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacct 349  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||    
T  32066129 ccaccaccgcccatcgtcactactcactcacaaagaacaccctccaaataaaactctcagaccccaacacccaagctgaaccacatttcaaagagcatct 32066228  T
Q  350 gactgaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactga 448  Q
     || |||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32066229 aaccgaatgatcatgcagctatcacaaacctcgcaacctctgaaccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaactggagtcaaagagctga 32066326  T
Q  449 ctcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  32066327 ctcccgatttcgaatcaaaa 32066346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 468
Target Start/End: Original strand, 34388711 - 34389056
Alignment:
Q  127 aagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactc 216  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||          |||||||||||||||||| ||||    
T  34388711 aagatacaaatagtgctgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccgtgaagataaacccagcaaaacacatcaccacctaaaacaaactc 34388810  T
Q  217 cttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaa 316  Q
    |   | |||||  ||||| |||||||||  | | |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  34388811 c---aaaaaaagaaagcaatgtaaacacgta-tccaccaccgcctatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcataccccaa 34388906  T
Q  317 cacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaa 415  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||| ||||| |||||| || ||   ||||  || ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |   |    
T  34388907 cacccaagctgagccacatgatgaagaacacctaactgaaggatcact-agctatcacaaacctcacgacctacgatccaccgaaatagcacaacac--a 34389003  T
Q  416 aagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34389004 aagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcttgatctcgaatcaaaa 34389056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 41893052 - 41893451
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaaga---cataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacca 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||   || |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41893052 aatcgacaaatattattaaacgtcgtccccataagatgtcacaaggtatgaacgaaaaaa-atacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataacca 41893150  T
Q  169 cctaaaaactcccctgaagataaa----------cacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccg 258  Q
    ||||||||   ||| || ||||||          |||||||| ||||||||||||||     | |||||||||| |||||||||||   || ||||||||    
T  41893151 cctaaaaaaaaccc-gaggataaatccaccaaaacacatcactacctaaaacagact-----aaaaaaaacaagaactgtaaacacggtatccaccaccg 41893244  T
Q  259 cccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatg 358  Q
     |||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |  ||| |    
T  41893245 accatcgtcactactcacccacaaagaacaccctgaaaatagaactcccagacctcaacacccaagctgagccacatttcgaagagtacct-atagaagg 41893343  T
Q  359 aacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatc 457  Q
    | ||||||||| ||  |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41893344 atcatgcagctatcacaaaccttgcgacctcttaaccaccaaaagagcacaaca--caaagcccaaaaa-caacttgagacaaagaactgactcccgatc 41893440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 468
Target Start/End: Original strand, 16457128 - 16457512
Alignment:
Q  76 ggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16457128 ggcaaatattattaaacgtcatccctgcaagacgtaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataaccacctaaaa 16457227  T
Q  176 actcccctgaagat----------aaacacatcaccacct-aaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatc 264  Q
    | | || ||| |||          |||||||||||||||| |||| |||   ||  | ||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||    
T  16457228 aat-ccttgaggataatcgcaccaaaacacatcaccacctaaaaaaaga---ctaaaaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtccatc 16457323  T
Q  265 accactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatg 364  Q
      ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||              ||||||||||||||| | || |||||||||| ||   | || ||||    
T  16457324 gtcactactcacccataaagaccaccctgaaaataaaact--------------cccaagctgagccacatttcaaagagcacctaaccacaagatcatg 16457409  T
Q  365 cagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaat 463  Q
    ||||| ||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16457410 cagctatcacaaacctcacgacatccgaaccaccgaaagagcacaaca--caaagcctaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcgaat 16457507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 411
Target Start/End: Original strand, 35815896 - 35816238
Alignment:
Q  75 cggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaa 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  35815896 cggcaaatattattaaacgccatcctcgcaaaacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataacccccaaac 35815995  T
Q  175 aactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatc 264  Q
    ||  ||| |||||||          |||| ||||||||| ||| |||||| |||| || | |||||| || ||||||||||  || ||| ||| ||||||    
T  35815996 aaagcccatgaagataaacccaccaaaacccatcaccacttaagacagacaccttaac-agaaacaaacattgtaaacacagtatccacaaccacccatc 35816094  T
Q  265 accactactcacccccaaagaaca-ccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacat 363  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||   |||  ||||| |||| ||||||||| | ||||| | | | | || ||||||||||    
T  35816095 atcactactcacccccaaagaacacccctcaa---aaaactctctgacttcaacatccaaactgagccacat-tcgaaaaactcttaaccgaatgaacat 35816190  T
Q  364 gcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaa 411  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35816191 gcagcttccacaatctctcaacctccgatccaccaaaagagcacaaaa 35816238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22774053 - 22773932
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22774053 aatcggcaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaactagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccatct 22773954  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    |||||| ||  |||||||||||    
T  22773953 aaaaacaccagtgaagataaac 22773932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 467
Target Start/End: Original strand, 38577441 - 38577840
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 177  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||     
T  38577441 caaatattattaaacgtcatttccgcaagatgtaatgtatgaacgaaacaatatacaaatgatgccgcatatagacggtacaaaataactaccaaacaaa 38577540  T
Q  178 tcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcacc 267  Q
       | |||||||||||          |||||||||||||| || ||| |||  | | |||  || |||||||||||||  || ||| | |  |||||  |    
T  38577541 atacatgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaagacggacacctaaatataaacaaaacactgtaaacacagtatccacaatcatccatcgtc 38577640  T
Q  268 actactcacccccaaagaacac-cctcaaaataaaactcct-agaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgc 365  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| || ||||  | ||||| ||| ||  || ||||||||||||    
T  38577641 actactcatccccaaagaacactccacaaaataaaactccccagacttcaacacccaagttgcgccatat-tcgaaaagctccaaaccgaatgaacatgc 38577739  T
Q  366 agcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatca 465  Q
    |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38577740 agcttccacaaactctcgacctctgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaagtccaaaaaccaacttaaaccaaagaactaactcccgatctcgaatca 38577838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35821685 - 35821583
Alignment:
Q  73 atcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35821685 atcggcaaatattattaaacgccatctccgcaagacgcaagg-atggacgaaacatgatacaaatgatgccgcatatagacggtacaccataaccactta 35821587  T
Q  173 aaaa 176  Q
    ||||    
T  35821586 aaaa 35821583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3584170 - 3584048
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaa-gatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3584170 aatcagcaaatattattaaacgccatccccacaagacgcgaggtatgaacgaaacaaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 3584071  T
Q  171 taaaaactcccctgaagataaac 193  Q
     || ||  ||||| |||||||||    
T  3584070 aaacaaagccccttaagataaac 3584048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27889239 - 27889157
Alignment:
Q  111 aaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27889239 aaggtattgacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagactgtacaccataaccacctaaaaacacccctggagataaac 27889157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27947897 - 27947815
Alignment:
Q  111 aaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27947897 aaggtattgacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagactgtacaccataaccacctaaaaacacccctggagataaac 27947815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13538417 - 13538324
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 165  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13538417 aatcagcaaatattattaaacgccatctccacaagacgcaaggtatggacgaaagaatatacaaatggtaccgcatatagacggtacatcataa 13538324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 165
Target Start/End: Original strand, 13686057 - 13686150
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 165  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13686057 aatcagcaaatattattaaacgccatctccacaagacgcaaggtatggacgaaagaatatacaaatggtaccgcatatagacggtacatcataa 13686150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9659534 - 9659474
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagata 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9659534 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagata 9659474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35821514 - 35821432
Alignment:
Q  223 aaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35821514 aaaaaacaagcactgtaaacacagtatctagcaccgcccatcatcactactcatcctcaaagaacacccttaaaataaaactc 35821432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22773699 - 22773598
Alignment:
Q  297 ataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatcca 395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||| || |||| || | ||  |||||||| ||||||| |||||    
T  22773699 ataaaactcccagaccccaacacccaaactgagccacatttcgaagagcacctaacagaaggatcatgtagatatcacaaacctcgtgacctccaatcca 22773600  T
Q  396 cc 397  Q
    ||    
T  22773599 cc 22773598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 108
Target Start/End: Original strand, 34866309 - 34866345
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34866309 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagac 34866345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 170
Target Start/End: Original strand, 10837941 - 10837984
Alignment:
Q  127 aagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 170  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10837941 aagatgcaaatcgtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 10837984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 17656999 - 17657053
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17656999 aaaagtccaaaaccaaacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 17657053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 30236125 - 30236179
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30236125 aaaagcccaaaaccaaacttgaaccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 30236179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 32945700 - 32945754
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32945700 aaaagcccaaaaccaaacttgaatcaaagaattgactcccgatctcgaatcaaaa 32945754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15906767 - 15906717
Alignment:
Q  417 agcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaa 467  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15906767 agcccaaaaccaaacttgaaccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaa 15906717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22773861 - 22773815
Alignment:
Q  251 caccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaa 297  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22773861 caccactgcccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaa 22773815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18593674 - 18593273
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593674 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagatgcaaggtatggacgaaacaagataaatatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 18593575  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||          |||||||||||||| ||| |||||     ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  18593574 aaaaacacccctgaagataaacccgccaaaacacatcaccacctaacacaaactcca----aaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgccc 18593479  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||| || |    
T  18593478 atcgtcactactcacccacaaagaacatcctccaaataaaactcccagaccccaacacccaagttgagccacatttcgaagaacacctaaccgaaggatc 18593379  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    ||||| || ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18593378 atgcacctatcacaaatctcgcgacctccgaaccaccgaaagagcacaaca--ctaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactaactcccgatctcg 18593281  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  18593280 aatcaaaa 18593273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 29087903 - 29087511
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29087903 aatcggaaaatattattaaacgtcatccctgcaag-------gtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacatcataaccacct 29087811  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    ||||||  ||||||||||||||          |||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  29087810 aaaaacaaccctgaagataaacccaccaaaacacatcagcacctaaaacagactcc----aaaaaaacaagcactgtaaacacggtattcaccaccgccc 29087715  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||  || || |    
T  29087714 atcgtcactactcacccctaaagaa-accctcaaaataaagctcccagaccccaacatctaagttgagccacata-cgaagagcacctgaccaaaggatc 29087617  T
Q  362 atgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcga 461  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29087616 atggagctaccataacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaagcccagaaaccaatttgattcaaagaactgactcctgatctcga 29087518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 34378531 - 34378128
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34378531 aatcgacaaatattattaaacgccatctccgcaagacgcaaggcatggacgagacgagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccatct 34378432  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||| |||     | |||||||||||| |||||||||   || |||||||| ||    
T  34378431 aaaaacacccctgaagataaacccacaaaaacacatcaccacctaaaacaaact-aaaaaaaaaaaacaagca-tgtaaacacggtatccaccaccgtcc 34378334  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || || ||| || |    
T  34378333 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcaaaccccaacacccaagctgagccacattacgaagagcatctaaccgaaggatc 34378234  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |  || || ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34378233 aaacaactatcacaaacctcgcgacctccggtccaccgaaagagcacaaaa--caaagcccaaaaaccaacttgtgtcaaagaactgactcccgatctcg 34378136  T
Q  461 aatcaaaa 468  Q
    ||||||||    
T  34378135 aatcaaaa 34378128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 373
Target Start/End: Original strand, 7161663 - 7161973
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7161663 aatcggcaaatattattaaacgtcttccccacaagacgcaagatatggacgaaataagatacaaatagtgtagcatatagacggtacaccataatcacct 7161762  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||| ||||||          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||    
T  7161763 aaaaacacccctgaatataaacccaccaaaacacatcactacctaaaacagactccttcacaaaa-acaagcactgtaaacacgatttccaccaccaccc 7161861  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || || |    
T  7161862 aacgtcactactcacccccaaagaacaccatcaaaataaaactcccagaccccaacacacaagctgagccacatatcgaagaacacctgaccaaaggatc 7161961  T
Q  362 atgcagcttcca 373  Q
    ||||||||||||    
T  7161962 atgcagcttcca 7161973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 698799 - 698391
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  698799 aatcagcaaatattattaaacgacatctctgcaagacgtaaggtatggatgaaatatgatacaaatggtgccgcatatagacggtacactataaccacct 698700  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac------------------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcac 253  Q
    |||||| ||| |||||||||||                  |||||||||| ||||||| |||||     ||||||| | |||||||||  |   || |||    
T  698699 aaaaacacccttgaagataaacctaccaaaccacatcaccacatcaccacttaaaacaaactcca----aaaaaaccaacactgtaaat-cggtatccac 698605  T
Q  254 caccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgact 353  Q
    || |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||     
T  698604 catcgccgatcgtcactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactctcagaccccaacacccaagctgagccacatttcaaagagcacctaacc 698505  T
Q  354 gaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcc 452  Q
    ||| ||  |||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||  |||||| |||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  698504 gaaggattatgcagctatcacaaacctcgcaacctctgaaccacagaaagagtacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagagttgactcc 698407  T
Q  453 tgatctcgaatcaaaa 468  Q
     |||||||||||||||    
T  698406 cgatctcgaatcaaaa 698391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7453020 - 7452915
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7453020 aatcggcaaatattattaaacatcatccatgcaagacgcaaggtatggacaaatcaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 7452921  T
Q  172 aaaaac 177  Q
    ||||||    
T  7452920 aaaaac 7452915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 192
Target Start/End: Original strand, 5656749 - 5656862
Alignment:
Q  79 aaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaact 178  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  5656749 aaatattattaaacgccatcaccgcaagacgcaaggtatgaacgaaataagatacaaatgatgccgcatatagacggtacatgataaccacctaaaaaca 5656848  T
Q  179 cccctgaagataaa 192  Q
    | ||| ||||||||    
T  5656849 caccttaagataaa 5656862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 409
Target Start/End: Original strand, 18313303 - 18313636
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc- 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  18313303 aatcggtaaatattattaaacgtcattcctgtaagacgcaaggtatggatgaaacaagatgcaaatggtgccgcatatagacggtacaccaaaaacaccc 18313402  T
Q  171 -----taaaaactcccctgaagataaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatca 265  Q
          | |||| | ||       ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||| |||||||| | || || |||| | ||||     
T  18313403 tcggagataaacccacc------aaaacacatcaccacctaaaacagactcc----aaaaaaacaaacaccgtaaacacgatatccatcaccactcatcg 18313492  T
Q  266 ccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgc 365  Q
     ||||||||||||   ||||||||||| |||  |||||||| | | || || |||||| || |||||| | ||||||||||||| |  |||||| |||||    
T  18313493 tcactactcacccatgaagaacaccct-aaagaaaaactccaaaatcctaaaacccaaactaagccacatttcgaagagcacctaaacgaatgatcatgc 18313591  T
Q  366 agct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaa 409  Q
    |||| ||  |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  18313592 agctatcacaaacctcgcgaccttcaatccaccgaaagagtacaa 18313636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 366 - 452
Target Start/End: Original strand, 7162267 - 7162352
Alignment:
Q  366 agcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcc 452  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7162267 agcttccataacctcgcgacctccgatccatcgaaagagcacaaaa-caaaaacccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcc 7162352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 165
Target Start/End: Original strand, 18255099 - 18255192
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 165  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18255099 aatcggcaaatattgttaaacgttatccccgtaagatgcagggtatagacgaaacaagatacaaatagtgccgcatatagacggtacatcataa 18255192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 174
Target Start/End: Original strand, 41250893 - 41250944
Alignment:
Q  123 aaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41250893 aaacaagatataaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacgtaaa 41250944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 468
Target Start/End: Original strand, 22675322 - 22675375
Alignment:
Q  415 aaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22675322 aaagcccaaaaccaaacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 22675375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8297552 - 8297496
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaat 470  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8297552 aaaagtccaaaaccaaacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaaat 8297496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27713153 - 27713098
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaa 469  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27713153 aaaagcccaaaaccaaacttgagccaaagaactgattcccgatctcgaatcaaaaa 27713098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 7195236 - 7195290
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7195236 aaaagcccaaactctaacttgagccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 7195290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Original strand, 7195078 - 7195113
Alignment:
Q  192 acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaa 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7195078 acacgtcaccacctaaaacagactccttcacaaaaa 7195113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 13954231 - 13954285
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  13954231 aaaagcccaaaaccaaacttgagccaaagtaatgactcccgatctcgaatcaaaa 13954285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 468
Target Start/End: Original strand, 24449584 - 24449981
Alignment:
Q  76 ggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24449584 ggcaaatattattaaacgccatccc-gcaagatgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacataaaa 24449682  T
Q  176 actcccctgaagataaacaca----------tcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatca 265  Q
    || |||||  |||||||||||          ||||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||     
T  24449683 acacccctagagataaacacaccaaaacacatcaccacctaaagtagactcc---aaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgcccatcg 24449779  T
Q  266 ccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgc 365  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||| || |||||    
T  24449780 tcactactcacccacaaataacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccgcatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 24449879  T
Q  366 agct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatc 464  Q
    | || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  24449880 aactatcacaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaca--caaatcccaaaaaccaacttaagacaaagaactgacttccgatctcaaatc 24449977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41920889 - 41920482
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41920889 aatcgacaaatattattaaacgtcatctccgcaagacgtaaggtatggacgaaataaaatacaaattgtgctgcatatagacggtacaccgtaaccacct 41920790  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| ||| |||||||||||          ||| |||||||||||||| ||||    | |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||     
T  41920789 aaaaacacccgtgaagataaaccaaccaaaatacaccaccacctaaaacaaactc---aaaaaaaaacaagcaatgtaaacacggtattcaccaccgcct 41920693  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactga-----a 356  Q
    |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||     |    
T  41920692 atcgtcactactcacccacaaaaaacaccctcaaaataaaactccaagaccccaacacccaagctgagccacatgatgaagagcacctaactgaaggtta 41920593  T
Q  357 tgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctga 455  Q
     || ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41920592 ggatcatgcagctatcacaaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaatccaacttgagtcaaagaactgactcccga 41920495  T
Q  456 tctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||||    
T  41920494 tctcgaatcaaaa 41920482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 5389077 - 5389472
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||     ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5389077 aatcggaaaatattattaaacgccatcccc-----acgcaaggtatggacgaaataagatacaaatggtgccgcatatagacggcacactataaccacct 5389171  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||  ||||||||          |||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||| ||||||||   || |||||||||||    
T  5389172 aaaaacacccctagagataaaccaaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactcc----caaaaaacaagcaccgtaaacacggtatccaccaccgccc 5389267  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| || |    
T  5389268 atcgtcactactcacttacaa-gaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacttaaccgaaggacc 5389366  T
Q  362 atgcagcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    ||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5389367 atgtagctaacacaaacctcgcgacctccgaaccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaacaaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcg 5389464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5459587 - 5459191
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||||||||     ||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5459587 aatcagcaaatattattaaacg-----cccgcaatacgcaaggtatggacgaagcaacatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 5459493  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||  |||||||||||||||          ||||||| || ||||||| |||||     ||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||    
T  5459492 aaaaatacccctgaagataaactcaccaaaacacatcactacttaaaacaaactcca----aaaaaacaatcactgtaaacacggtatccaccaccgccc 5459397  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| || |    
T  5459396 atcgtcactactcacccacaaagaacaccatcaaaataaaacttccagaccccaacacccaagctgagccacatttcaaagagcacctaactgaaggatc 5459297  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  5459296 atgcagctatcacaaacctcgcaacctccgaaccactgaaagagcacaaca--caaagcccaaaaatcaacttgaatcaaataattgactcccgatctcg 5459199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 123 - 468
Target Start/End: Original strand, 46692519 - 46692870
Alignment:
Q  123 aaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaa-ctcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaaca 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  46692519 aaacaagataaaaatggtgccgcataaagacggtacaccataaccacctaaaaaacacccctgaagataaaccctccaaaacacatcaccacctaaaaca 46692618  T
Q  212 gactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagac 311  Q
     |||||     |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  46692619 aactcc----aaaaaaacaagcactgtaaacacgatatcaaccaccgcccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaacttccagac 46692714  T
Q  312 cccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | | ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  46692715 cccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacttaaccggaggataatgcagctatcacaaacctcgcgacctccgaaccaccgaaagagcacaac 46692814  T
Q  411 aacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46692815 a--caaagcccaaaaaccaacttgagccaaagaactaactcccgatctcgaatcaaaa 46692870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 79 - 468
Target Start/End: Original strand, 46814121 - 46814518
Alignment:
Q  79 aaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaact 178  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  46814121 aaatattattaaacgccatcctcgcaagacgtaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccaaacaaag 46814220  T
Q  179 cccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcacca 268  Q
    |||||||||||||||          |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||| | |||||||||||  || ||| |||| |||||  ||    
T  46814221 cccctgaagataaacctaccaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaa-caaaccctgtaaacacagtatccacaaccgtccatcgtca 46814319  T
Q  269 ctactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcag 367  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| | ||  ||||||||| || ||||||| | ||||| ||| ||| |  |||||||| |||||    
T  46814320 ctactcacctccaaataacacccctcgaaataaaactcccatacttcaacacccacgccgagccacat-tcgaaaagctcctaatcgaatgaacttgcag 46814418  T
Q  368 cttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaa 467  Q
    ||||   |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  46814419 cttctgcaacctctcgacatccgatccaccgaaagagcacaaaa-caaaagccaaaaaaccaacttgagccaaaaagctgactcccgatctcgaatcaaa 46814517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 30685573 - 30685955
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30685573 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagatggtacaccataaccacct 30685672  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||   || |||||||||||    
T  30685673 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactc---caacaaaaacaagcaatgtaaacacggtatccaccaccgccc 30685769  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  |||||| ||||| ||||||||||                    | |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||  || || |    
T  30685770 atcttcactacacacccacaaagaacac--------------------atcccaacacccaagctgagccacatatcaaggagcacctaaccaaaggatc 30685849  T
Q  362 atgcagct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30685850 atgcagctatcacaaacctcgcgacctccgaaccaccgaaagagcacaaca--caaagcccaaaagccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctca 30685947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Original strand, 24684142 - 24684529
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24684142 aatcggcaaatattattatatgtcatccctgcaagatgcaaggtatgaac-aaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataatcacct 24684240  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||          |||||||||||||||||| |||||     ||||||||| | |||||||||| | || |||||||||||    
T  24684241 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactcca----aaaaaacaaactctgtaaacacgatatccaccaccgccc 24684336  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaac 361  Q
    |||  ||||||||| |||||||              |||||| |  ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||| || |    
T  24684337 atcgtcactactcaaccccaaac-------------taaaacacgcagaccccgacatccaagttgagccacatttcgaagagcacctgaccgaaggatc 24684423  T
Q  362 atgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcga 461  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  24684424 atgcatcttccacaacctcgcgacctccgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaagcccaaaaaccaactagagtcaaagaactgacatccgatctcga 24684522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 468
Target Start/End: Original strand, 27031496 - 27031891
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||     
T  27031496 caaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgcaagatatggacggaacaatatataaatggtgccgcatatatacggtacaccataacccccatacaaa 27031595  T
Q  178 tcccctgaagataa--------acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccac 269  Q
     ||| |||||||||        |||||||||||||||| || ||| |||| ||| ||| ||| | |||||||||||  || ||  || ||| |||  |||    
T  27031596 gcccttgaagataacccccaaaacacatcaccacctaagacggacaccttaacagaaa-caaaccctgtaaacacagtatccataacggcctatcgtcac 27031694  T
Q  270 tactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagc 368  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| | | || |||||||||||||||    
T  27031695 tactcacccc-agagaacacccctcaaaataaaactcccagacttcaacatccaaactgagccacat-tcgaaaagctcttaaccgaatgaacatgcagc 27031792  T
Q  369 ttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  27031793 ttccacaacctctcaacctccgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaatccctaaaaccaacttgagccaaagagctgactctcgatctcgaatcaaaa 27031891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24659351 - 24658959
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24659351 aatcagcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacg-----------cgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacca 24659263  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    || ||  |||||||||||||||          |||| ||||||||| |  ||| |||| | || |||||| || ||||||||||  |  ||  ||| |||    
T  24659262 aacaaagcccctgaagataaacccaccaaaacacataaccacctaagatggacaccttaa-aagaaacaaacattgtaaacacagtaaccataaccaccc 24659164  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaa 360  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||   ||| |||| |||||||||| | ||||| |||  || || |||||||    
T  24659163 atcgtcactactcacccccaaataacacccctcaaaataaaactcccagactt-aactcccaggctgagccacat-tcgaaaagcttctaaccgaatgaa 24659066  T
Q  361 catgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcg 460  Q
    ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||    
T  24659065 catgatgcttccacaacctctcgacctccgatccaccgaaagagcacaaaaccaaa-gcccaaaaaccaacttcagccaaagagctgactcccgatctcg 24658967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 267 - 468
Target Start/End: Original strand, 31585610 - 31585811
Alignment:
Q  267 cactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagacccc-aacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgc 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||  || || ||| |    
T  31585610 cactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcagacccccaacacccaagcttagccacatttcgaagagcacctaaccaaaggatcatac 31585709  T
Q  366 agcttcca-aaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatc 464  Q
    ||||  || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31585710 agctatcacaaacctcgcgacctccgacccaccgaaatagcacaacac--aaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatctcgaatc 31585807  T
Q  465 aaaa 468  Q
    ||||    
T  31585808 aaaa 31585811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 259 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 7857891 - 7857683
Alignment:
Q  259 cccatcaccactactcacccccaaagaacaccc-tcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaat 357  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| | || || ||| ||| || ||||    
T  7857891 cccatcgccactactcacccccatagaacacccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaaactgagccacatttcaaa-agctcctaaccgaat 7857793  T
Q  358 gaacatgcagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatc 457  Q
    | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||    
T  7857792 ggacaagcagcttccacaacctctcgaccaccgatccaccgaaagagcac-aaaacaaaaggccaaaaaccaacttcagcaaaagagttgactcccgatc 7857694  T
Q  458 tcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||    
T  7857693 tcgaatcaaaa 7857683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 193
Target Start/End: Original strand, 31584689 - 31584809
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31584689 aatcggcaaatattattaaacaccatcctcgcaagacgcaaggtatg-acgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgatacaccataaccacct 31584787  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  31584788 aaaaacacccctgaagataaac 31584809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6804969 - 6804866
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6804969 aatcggtaaatattattaaacgctatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaa-aagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 6804871  T
Q  172 aaaaa 176  Q
    |||||    
T  6804870 aaaaa 6804866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7002619 - 7002515
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7002619 aatcggcaaatattattaaacgtcatcctcgcaaaatgtaaggtatggacgaaacaagatacaaaaggtgccgcatataaacggtacaccataaccactt 7002520  T
Q  172 aaaaa 176  Q
    |||||    
T  7002519 aaaaa 7002515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 177
Target Start/End: Original strand, 40216155 - 40216260
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40216155 aatcagcaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgccagatatggacgaatcaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacatcataaccacct 40216254  T
Q  172 aaaaac 177  Q
    ||||||    
T  40216255 aaaaac 40216260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14320755 - 14320658
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14320755 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccacaagatgcaaggtatggacaaaaccaaatacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataaccac 14320658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 369
Target Start/End: Original strand, 6764232 - 6764334
Alignment:
Q  267 cactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgca 366  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| | ||||||||||||| || ||| || ||||||    
T  6764232 cactactcacccacaaagaacatcctgaaaataaaactcccagaccccagtatccaagttgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggaccatgca 6764331  T
Q  367 gct 369  Q
    |||    
T  6764332 gct 6764334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6804814 - 6804739
Alignment:
Q  223 aaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaat 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6804814 aaaaaacaagcactgtaaatacagtatccaccaccgcccatcgtcactcctcacccacaaagaacaccctgaaaat 6804739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19598720 - 19598666
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19598720 aaaaacccaaaatcaaacttgagtcaaagaactgactctcgatctcgaatcaaaa 19598666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27102275 - 27102221
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27102275 aaaagcccaaaaccaaacttgatccaaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 27102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32882668 - 32882583
Alignment:
Q  194 acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcaccccc 280  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| | || || |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  32882668 acatcaccgcctaaaactgactccttcacgaaaa-cgagcactgtaaacacgatatccaacaccacccatcgtcactactcaccccc 32882583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 470
Target Start/End: Original strand, 20113523 - 20113574
Alignment:
Q  419 cccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaaat 470  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  20113523 cccaaaaaccaacttaagttaaagaactgattcccgatcttgaatcaaaaat 20113574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 10785456 - 10785510
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  10785456 aaaagcccaaaaccaaacttgagccaaacaactgactcccgatctcgaagcaaaa 10785510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 32864558 - 32864612
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  32864558 aaaagcccaaaaccaaacttgagtcaaagaaccgacttccgatctcgaattaaaa 32864612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 6131 - 5751
Alignment:
Q  78 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6131 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaagatatgaacgagacaagatacaaatggtgccgtatatagacgttacatcataaccacctaaaaac 6032  T
Q  178 tcccctgaagataaac-----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcac 266  Q
     || ||||||||||||           |||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||| |||||||    || ||||||| |||||||     
T  6031 acctctgaagataaaccccacaaaaacacatcaccacctaaaa-agact---tca-aaaaaacaagcaccgtaaacatggtatccaccacctcccatcat 5937  T
Q  267 cactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgca 366  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||| || || | |    
T  5936 cactactcacccacaaaaaacaccctcaaaataaaactcccagatcccaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaaccgaaggatcaagta 5837  T
Q  367 gct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcc 452  Q
    ||| ||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5836 gctatcacaaaccttgcgacctccgatctaccgaaagagcacaaaaac-aaagcccaaaaaccaacctgagtcaaagaactgactcc 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 76 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3117922 - 3117523
Alignment:
Q  76 ggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3117922 ggcaaatattattaaacgtcattcctgcaagacgtaaggtatggacgaaataagatacaaatggtgcagcatatagacgctacaccataaccacctaaaa 3117823  T
Q  176 actcccctgaagataaa----------cacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatca 265  Q
    || || |  ||||||||          ||||||||||||||||||| |||     | ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||| ||||     
T  3117822 acacctccaaagataaacctaccaaaccacatcaccacctaaaacaaact--aaaaaaaaaaacaagcactgtaaacacggtaaccaccaccgctcatcg 3117725  T
Q  266 ccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgc 365  Q
     | ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |  ||| || |||||    
T  3117724 tctctacttacccacaaagaacaccctataaataaaactcccagaccccaacacccaagttgagccacatttcgaagagcacataatcgaaggatcatgc 3117625  T
Q  366 agct-tccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatc 464  Q
    | || ||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3117624 aactatcacaaacctcgcgacctccgaaccacataaagagcacaaca--caaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcccgatcttgaatc 3117527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10542262 - 10541980
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||   ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10542262 aatcggaaaatattattaagcgccatccc-gcaagatgcaagatatgaacgaaacaagatacaaaaggtgccgcatatagacgatacaccataaccacct 10542164  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgccc 261  Q
    |||||| |||||||||||||||          ||| |||||||||||||| |||||     |||||||||||||| |||| ||   || |||||||||||    
T  10542163 aaaaacacccctgaagataaacccatcaaattacaccaccacctaaaacaaactcc----aaaaaaacaagcactttaaatacggtatccaccaccgccc 10542068  T
Q  262 atcaccactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacct 349  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10542067 atcgtcactactcacccacaaagaataccctccaaataaaacttccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacct 10541980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3254389 - 3254211
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  3254389 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgtatatagatagtacaccatagccacct 3254290  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataaac----------acatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacac 244  Q
    |||||| |||||||| ||||||          ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||    
T  3254289 aaaaacacccctgaaaataaacccaccaaaatacatcaccacctaaaacagactcc----aaaaaaacaagcaccgtaaacac 3254211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14663384 - 14663231
Alignment:
Q  190 aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacac 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||     
T  14663384 aaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaaaacaaaaagcactgtaaacacaatatccaccaccgcccatcgtcactactcacccgcaaagaacat 14663285  T
Q  290 cctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaaga 343  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||    
T  14663284 cctcaaaataaaactcccaaaccccaacatccaagccgagccacatttcgaaga 14663231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15944431 - 15944274
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15944431 aatcggcaaatattattaaacgccatccctgtaagacgcaaggtatggacagaagaagatacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataaacacct 15944332  T
Q  172 aaaaactcccctgaagat----------aaacacatcaccacctaaaacagactcctt 219  Q
    |||||  |||||||| ||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15944331 aaaaatacccctgaatataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactcctt 15944274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 33697789 - 33697843
Alignment:
Q  115 tatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33697789 tatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 33697843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Original strand, 15132489 - 15132573
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggt 156  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15132489 aatcagcaaatattattaaacgccatcatcgcaagacgtaaggtatggacaaaacaagatacaaatgatgccgtatatagacggt 15132573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14663480 - 14663414
Alignment:
Q  77 gcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgc 145  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14663480 gcaaatattattaaacgtcat-cctgcaagacgaaaggtatggacg-aacaagatacaaatgctgccgc 14663414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 32935336 - 32935390
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32935336 aaaagtccaaaatcaaacttgagtccaagaactgactcccgatctcgaatcaaaa 32935390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 468
Target Start/End: Original strand, 20701754 - 20701854
Alignment:
Q  365 cagcttccaaaacctcgcgacctccgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatc 464  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||   || |||   |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20701754 cagcttccactacctctcgacctccgatccaccgaaagaaaccataaa---aagcccaaaaccaaacttaagccaaagaactaactcccgatctcgaatc 20701850  T
Q  465 aaaa 468  Q
    ||||    
T  20701851 aaaa 20701854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 15120380 - 15120416
Alignment:
Q  192 acacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15120380 acacatcaccacctaaaacagactcattcacaaaaaa 15120416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 420 - 468
Target Start/End: Original strand, 16510304 - 16510352
Alignment:
Q  420 ccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16510304 ccaaaaaccaacttgagtaaaagaactgactctcaatctcgaatcaaaa 16510352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 468
Target Start/End: Original strand, 35554 - 35822
Alignment:
Q  190 aaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaaacaagcactgtaaacacaaaattcaccaccgcccatcaccactactcacccccaaagaacac 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||  ||| |||||||  | ||||||||    
T  35554 aaacacatcatcacctaaaacagactcc-----aaaaaacaagcactgtaaacacagtatccaccactgcccatcgtcac-actcacctgctaagaacac 35647  T
Q  290 cctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaacatgcagct-tccaaaacctcgcgacctc 388  Q
     || ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||  || ||||||||| ||  ||| |||| ||||||    
T  35648 tctaaaaa--aaactcccacaccccaacacccaagctgagcctcatttcgaagagcacctaaccgatggatcatgcagctatcacaaatctcgtgacctc 35745  T
Q  389 cgatccaccaaaagagcacaaaaacaaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    ||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35746 cgatccaccgaaagagcacaaca--taaagcccaaaaaccaacttaagtcaaagaa-tgactcccgatctcgaatcaaaa 35822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Original strand, 35473 - 35526
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35473 aatcggcaaatattattgaacgtcatccccgtaagacgtaaggtatggacgaaa 35526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 48767 - 48648
Alignment:
Q  72 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 171  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48767 aatccgcaaatattattcaacgtcctccccgcaagacacaagatatggactaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 48668  T
Q  172 aaaaactcccctgaagataa 191  Q
    |||||| ||| | |||||||    
T  48667 aaaaacacccttaaagataa 48648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19349 - 19245
Alignment:
Q  73 atcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa-ccacct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19349 atcggcaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgcatggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacccacct 19250  T
Q  172 aaaaa 176  Q
    |||||    
T  19249 aaaaa 19245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Original strand, 2345 - 2443
Alignment:
Q  95 catccccgcaagacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaactcccctgaagataaac 193  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2345 catccccacaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacagatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccttgaagataaac 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19467 - 19413
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19467 aaaagcccaaaaccaaacttgagccaaagaactgacttccgatctcgaatcaaaa 19413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 468
Target Start/End: Original strand, 42135 - 42189
Alignment:
Q  414 aaaagcccaaaaaccaacttgagtcaaagaactgactcctgatctcgaatcaaaa 468  Q
    |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42135 aaaatcccaaaaccaaacttgagccaaagaactgacttccgatctcgaatcaaaa 42189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University