View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF16514_low_2 (Length: 807)
Name: NF16514_low_2
Description: NF16514
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF16514_low_2 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 745; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 745; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15301909 - 15301133
Alignment:
| Q |
15 |
caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac |
114 |
Q |
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| T |
15301909 |
caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac |
15301810 |
T |
|
| Q |
115 |
tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac |
214 |
Q |
| |
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|
| T |
15301809 |
tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggaaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac |
15301710 |
T |
|
| Q |
215 |
aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag |
314 |
Q |
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| T |
15301709 |
aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag |
15301610 |
T |
|
| Q |
315 |
gaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg |
414 |
Q |
| |
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| T |
15301609 |
gaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg |
15301510 |
T |
|
| Q |
415 |
tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc |
514 |
Q |
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| T |
15301509 |
tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc |
15301410 |
T |
|
| Q |
515 |
cttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcact |
614 |
Q |
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| T |
15301409 |
cttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgatgtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagtgcactatttcact |
15301310 |
T |
|
| Q |
615 |
tgaaactttcaatgtggtaagcaaaagaagtttattagttttgatgtgttttagtaatactttcttttttgaatatgtgttttagtaatactcatcaaca |
714 |
Q |
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|
| T |
15301309 |
tgaaactttcaatgtggtaagcaaaagaagtttattagttttgatgtgttttagtaatactttcttttttgaatgtgtgttttagtaatacttatcaata |
15301210 |
T |
|
| Q |
715 |
taacagttttacgccactttctaatacatggttatgattaatctaagtaaataattatcttttattgaaagttattt |
791 |
Q |
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|
|
| T |
15301209 |
taacagttttacgccactttctaatacatggttatgattaatctaagtaaataattatcttttattgaaaattattt |
15301133 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 745; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15482278 - 15481502
Alignment:
| Q |
15 |
caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac |
114 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15482278 |
caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac |
15482179 |
T |
|
| Q |
115 |
tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac |
214 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15482178 |
tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggaaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac |
15482079 |
T |
|
| Q |
215 |
aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag |
314 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15482078 |
aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag |
15481979 |
T |
|
| Q |
315 |
gaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg |
414 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15481978 |
gaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg |
15481879 |
T |
|
| Q |
415 |
tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15481878 |
tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc |
15481779 |
T |
|
| Q |
515 |
cttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcact |
614 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15481778 |
cttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgatgtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagtgcactatttcact |
15481679 |
T |
|
| Q |
615 |
tgaaactttcaatgtggtaagcaaaagaagtttattagttttgatgtgttttagtaatactttcttttttgaatatgtgttttagtaatactcatcaaca |
714 |
Q |
| |
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|
| T |
15481678 |
tgaaactttcaatgtggtaagcaaaagaagtttattagttttgatgtgttttagtaatactttcttttttgaatgtgtgttttagtaatacttatcaata |
15481579 |
T |
|
| Q |
715 |
taacagttttacgccactttctaatacatggttatgattaatctaagtaaataattatcttttattgaaagttattt |
791 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15481578 |
taacagttttacgccactttctaatacatggttatgattaatctaagtaaataattatcttttattgaaaattattt |
15481502 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15445656 - 15445015
Alignment:
| Q |
15 |
caaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcac |
114 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||||| |||| | |||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15445656 |
caaaaggcaacgacttagactattataagtatatgcatgttattgacctttctaacaaccatttttcgggtagaataccttcagaagtatttagactcac |
15445557 |
T |
|
| Q |
115 |
tgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac |
214 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15445556 |
tgcattgaaatccttgaacttgt-acaaaatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaac |
15445458 |
T |
|
| Q |
215 |
aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15445457 |
aacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgttgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattag |
15445358 |
T |
|
| Q |
315 |
gaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttgg |
414 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15445357 |
gaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggtaatcctgaactttgtggaactccactcattgagaaatgcaaacacaatgaagcccttgg |
15445258 |
T |
|
| Q |
415 |
tgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacc |
514 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15445257 |
tgaggacacaaatgacgaggaaggatccgagttaatggaatgtttctatatgggcatgggagttggatttgcaacaggcttctggatagtttttggttct |
15445158 |
T |
|
| Q |
515 |
cttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcact |
614 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
15445157 |
cttttattcaagaggtcatggaggcatgcttacttcaattttctttatgatgtcaaagactggtttatatcaagatggacctgaagtacattgtttcact |
15445058 |
T |
|
| Q |
615 |
tgaaac-tttcaatgtggtaagcaaaagaagtttattagtttt |
656 |
Q |
| |
|
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|
| T |
15445057 |
tgaaacttttcaatatggtaagcaaaaccagtttattaatttt |
15445015 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15283402 - 15282734
Alignment:
| Q |
13 |
agcaaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactc |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
15283402 |
agcaaaaggaaacgacttaacctatgacaagtatatgcatgtcgttgacctttctaacaaccaattgtcaggtagaatacctatagaagtatttagactc |
15283303 |
T |
|
| Q |
113 |
actgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaa |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15283302 |
actgcattgaaatccttaaacttgtcacaaaatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacaattagagtcccttgatttgtcaa |
15283203 |
T |
|
| Q |
213 |
acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15283202 |
acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctataacttttcttgaggtattaaacctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt |
15283103 |
T |
|
| Q |
313 |
aggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagccctt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
15283102 |
aggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaactccactcattgagaaatgcaaaaagaatgaagcccct |
15283003 |
T |
|
| Q |
413 |
ggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctgga |
500 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15283002 |
ggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagaggaaggatctgagctaatggaatgtttctatatgggcatgggagttggatttacaacaggcttctgga |
15282903 |
T |
|
| Q |
501 |
tagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaag |
600 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15282902 |
tagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgatgtgaaagactggtttatgtcaagatggacttgaag |
15282803 |
T |
|
| Q |
601 |
ggcactatttcacttgaaactttcaatgtggtaagcaaaagaagtttattagttttgatgtgttttagt |
669 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15282802 |
tacactttgtcacttgaaatcttcaatgtggtaagcaatagaagtttattaactttgacgtgttttagt |
15282734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15463771 - 15463103
Alignment:
| Q |
13 |
agcaaagggcaaccacttatcctataaaaagtatatacatatcattggcctttccaataaccaattgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactc |
112 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
15463771 |
agcaaaaggaaacgacttaacctatgacaagtatatgcatgtcgttgacctttctaacaaccaattgtcaggtagaatacctatagaagtatttagactc |
15463672 |
T |
|
| Q |
113 |
actgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaa |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15463671 |
actgcattgaaatccttaaacttgtcacaaaatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacaattagagtcccttgatttgtcaa |
15463572 |
T |
|
| Q |
213 |
acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15463571 |
acaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctataacttttcttgaggtattaaacctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccatt |
15463472 |
T |
|
| Q |
313 |
aggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagccctt |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
15463471 |
aggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaactccactcattgagaaatgcaaaaagaatgaagcccct |
15463372 |
T |
|
| Q |
413 |
ggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctgga |
500 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15463371 |
ggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagaggaaggatctgagctaatggaatgtttctatatgggcatgggagttggatttacaacaggcttctgga |
15463272 |
T |
|
| Q |
501 |
tagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaag |
600 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15463271 |
tagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatgatgtgaaagactggtttatgtcaagatggacttgaag |
15463172 |
T |
|
| Q |
601 |
ggcactatttcacttgaaactttcaatgtggtaagcaaaagaagtttattagttttgatgtgttttagt |
669 |
Q |
| |
|
|||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15463171 |
tacactttgtcacttgaaatcttcaatgtggtaagcaatagaagtttattaactttgacgtgttttagt |
15463103 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 634
Target Start/End: Original strand, 15114025 - 15114506
Alignment:
| Q |
153 |
tgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtc |
252 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15114025 |
tgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatttctcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtc |
15114124 |
T |
|
| Q |
253 |
tctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatg |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15114125 |
tctttcttttcttgaggtattgaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagctttacaccacttagttgtatg |
15114224 |
T |
|
| Q |
353 |
ggaaatcctgaactttgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaatgatgaggaaggatccgagctaatgg |
452 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
15114225 |
ggtaatcctgaactttgtggaactccactcattgcgaaatgcaaacacaatgaagcccctggtgaggacacaaatgacgaggaatgatccgagttaatgg |
15114324 |
T |
|
| Q |
453 |
aatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaa |
552 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
15114325 |
aatgtttctatatgggcatgggagttggatttgcaatcagcttttggattgtttttggttctcttttactcaagaggacatggaggcatgcttacttcaa |
15114424 |
T |
|
| Q |
553 |
ttttctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcacttgaaactttcaatgtggtaa |
634 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15114425 |
ttttctttatgatgtcaaagattggcttatgtcaagatggaactgaagtgcattctttcacttgaaactttaaatgtggtaa |
15114506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 77 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 15312712 - 15312137
Alignment:
| Q |
77 |
ttgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcactgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattg |
176 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15312712 |
ttgtccggcagaattcctttagaaatattcagactcactgcattacaatccttgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgaaattg |
15312613 |
T |
|
| Q |
177 |
gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaa |
276 |
Q |
| |
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|
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| T |
15312612 |
gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaactcactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctctatcttttcttgaggtattgaa |
15312513 |
T |
|
| Q |
277 |
tctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaact |
376 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15312512 |
tctctcattcaacaatttaaaaggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaagt |
15312413 |
T |
|
| Q |
377 |
ccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata |
464 |
Q |
| |
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| T |
15312412 |
ccgctcattgagaaatgcaaccatgataaagtccctgatggtgacataaatgttatggcaaaagaagaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata |
15312313 |
T |
|
| Q |
465 |
tgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatga |
564 |
Q |
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| T |
15312312 |
tgggtatgggagttggatttgcaacaggcttctgggtagtttttggttctcttttattcaagaggtcatggagacatgcttacttcaatttcctttatga |
15312213 |
T |
|
| Q |
565 |
ggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcacttgaaac-tttcaatgtggtaagcaaa |
639 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15312212 |
tgtgaaagactggtttatgtcaaaatagtcataaagtgcactatttcacttgaatcttttcaatatggtaagcaaa |
15312137 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 77 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 15493081 - 15492506
Alignment:
| Q |
77 |
ttgtcgggtagaataccttcaggagtatttagactcactgcattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattg |
176 |
Q |
| |
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|
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| T |
15493081 |
ttgtccggcagaattcctttagaaatattcagactcactgcattacaatccttgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgaaattg |
15492982 |
T |
|
| Q |
177 |
gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaacacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaa |
276 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15492981 |
gcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaactcactttcaggagaaattcctcaaaccatgtctgctctatcttttcttgaggtattgaa |
15492882 |
T |
|
| Q |
277 |
tctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagcttcacaccacttagttatatgggaaatcctgaactttgtggaact |
376 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15492881 |
tctctcattcaacaatttaaaaggtcaaatcccattaggaacccaactccaaagctttacaccacttagttatatgggcaatcctgaactttgtggaagt |
15492782 |
T |
|
| Q |
377 |
ccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaat------------gatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata |
464 |
Q |
| |
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| T |
15492781 |
ccgctcattgagaaatgcaaccatgataaagtccctgatggtgacataaatgttatggcaaaagaagaggaaggatccgagctaatggaatgtttctata |
15492682 |
T |
|
| Q |
465 |
tgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatga |
564 |
Q |
| |
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| T |
15492681 |
tgggtatgggagttggatttgcaacaggcttctgggtagtttttggttctcttttattcaagaggtcatggagacatgcttacttcaatttcctttatga |
15492582 |
T |
|
| Q |
565 |
ggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcacttgaaac-tttcaatgtggtaagcaaa |
639 |
Q |
| |
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| T |
15492581 |
tgtgaaagactggtttatgtcaaaatagtcataaagtgcactatttcacttgaatcttttcaatatggtaagcaaa |
15492506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 368 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15280429 - 15280119
Alignment:
| Q |
368 |
tgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaatgat------------gaggaaggatccgagctaatggaat |
455 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15280429 |
tgtggaactccactcattgagaaatgcaaacacaatgaagcccctggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagagtaaggatctgagctaatggaat |
15280330 |
T |
|
| Q |
456 |
gtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattt |
555 |
Q |
| |
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|
| T |
15280329 |
gtttctatatgggcatgggagttggatttgcaacaggcttct----agtttttggttctcttttattcaacaggtcatggaagcatgcttacttcaattt |
15280234 |
T |
|
| Q |
556 |
tctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcacttgaaac-tttcaatgtggtaagcaaaagaagtttatt-agt |
653 |
Q |
| |
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| | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | | |
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| T |
15280233 |
tttatatgatgtgaaagactggtatatgtcaagatggaactgaagtgc-ctatttcagttgaaacttttcaatatggtaagcaaatacagtttattaatt |
15280135 |
T |
|
| Q |
654 |
tttgatgtgttttagt |
669 |
Q |
| |
|
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| T |
15280134 |
tttcatgtgttttagt |
15280119 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 368 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 15460798 - 15460488
Alignment:
| Q |
368 |
tgtggaactccactcattgaaaaatgcaaacagaatgaagcccttggtgaggacataaatgat------------gaggaaggatccgagctaatggaat |
455 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15460798 |
tgtggaactccactcattgagaaatgcaaacacaatgaagcccctggtgaggacacaaatgttatggcaaaagaagagtaaggatctgagctaatggaat |
15460699 |
T |
|
| Q |
456 |
gtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttatttaagaggacatggaggcatgcttacttcaattt |
555 |
Q |
| |
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|
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| T |
15460698 |
gtttctatatgggcatgggagttggatttgcaacaggcttct----agtttttggttctcttttattcaacaggtcatggaagcatgcttacttcaattt |
15460603 |
T |
|
| Q |
556 |
tctttatgaggtcaaagactggtttatgtcaagatggacctgaagggcactatttcacttgaaac-tttcaatgtggtaagcaaaagaagtttatt-agt |
653 |
Q |
| |
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| | ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | | |
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| T |
15460602 |
tttatatgatgtgaaagactggtatatgtcaagatggaactgaagtgc-ctatttcagttgaaacttttcaatatggtaagcaaatacagtttattaatt |
15460504 |
T |
|
| Q |
654 |
tttgatgtgttttagt |
669 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15460503 |
tttcatgtgttttagt |
15460488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18051302 - 18051086
Alignment:
| Q |
117 |
cattacaatccatgaacttgtcacaaaatcaattcatgggaaccataccaaatgatattggcaacatgaaacagttagagtcccttgatctgtcaaacaa |
216 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||| || | || || || |
|
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| T |
18051302 |
cattgcaatccttaaatttgtcgcataatcaattaatgggaaccataccaaaagaaattggcaacatgaaacaattggaatcccttaatttctcgaataa |
18051203 |
T |
|
| Q |
217 |
cacactttcaggagaaattcctcaaaccatgtcgtctctttcttttcttgaggtattaaatctctcgttcaacaatttgaagggtcaaatcccattagga |
316 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || | |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
18051202 |
cacactttctggagaaattcctaaaagcatgtctgctttaactttccttgaggcattgaatctctcattcaacaatttggagggtcaaatcccattagga |
18051103 |
T |
|
| Q |
317 |
acccaactccaaagctt |
333 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |
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| T |
18051102 |
acccaacttcaaagctt |
18051086 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 18050982 - 18050842
Alignment:
| Q |
424 |
aaatgatgaggaaggatccgagctaatggaatgtttctatatgggcatggcagttggattttcaacatgcttctggatagtttttggtacccttttattt |
523 |
Q |
| |
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|||||||||| | || || || ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||| || | |||||||| |
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| T |
18050982 |
aaatgatgagaatggttctgatctactggaatggttttatatgggcatgggagttggatttgcaatcagcttcttgattgttttttgttctcttttattc |
18050883 |
T |
|
| Q |
524 |
aagaggacatggaggcatgcttacttcaattttctttatga |
564 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
18050882 |
aatcgaacatggaggcacaattacttcaaatttcttgatga |
18050842 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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