View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16515_low_77 (Length: 256)

Name: NF16515_low_77
Description: NF16515
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16515_low_77
NF16515_low_77
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (21-256)||(22321397-22321632)
chr7 (21-256)||(2797159-2797394)
chr7 (17-256)||(8107484-8107723)
chr7 (21-256)||(10345901-10346136)
chr7 (21-256)||(31157872-31158107)
chr7 (17-256)||(45500307-45500546)
chr7 (21-256)||(2631727-2631962)
chr7 (21-256)||(22820435-22820670)
chr7 (21-256)||(23795425-23795660)
chr7 (21-253)||(22909448-22909680)
chr7 (21-256)||(31878930-31879164)
chr7 (21-237)||(1274918-1275134)
chr7 (21-256)||(6172846-6173081)
chr7 (21-256)||(12090055-12090291)
chr7 (21-256)||(12184195-12184425)
chr7 (21-256)||(31882441-31882676)
chr7 (48-256)||(1954285-1954492)
chr7 (21-256)||(3544474-3544709)
chr7 (21-256)||(24483078-24483311)
chr7 (20-253)||(2477990-2478223)
chr7 (21-256)||(12191172-12191407)
chr7 (21-178)||(19471864-19472021)
chr7 (118-256)||(22825036-22825174)
chr7 (24-240)||(29032406-29032622)
chr7 (21-256)||(31664108-31664326)
chr7 (115-256)||(4704974-4705115)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (21-256)||(27257715-27257950)
chr2 (21-256)||(13229938-13230173)
chr2 (21-256)||(32523259-32523494)
chr2 (23-256)||(42700569-42700802)
chr2 (21-256)||(21160296-21160531)
chr2 (21-256)||(29224045-29224280)
chr2 (21-256)||(29337344-29337579)
chr2 (21-256)||(23924628-23924863)
chr2 (21-256)||(41977925-41978160)
chr2 (21-256)||(36039858-36040093)
chr2 (21-256)||(9786700-9786935)
chr2 (21-256)||(14700974-14701209)
chr2 (21-256)||(28457473-28457708)
chr2 (20-216)||(31758607-31758803)
chr2 (21-256)||(36557158-36557393)
chr2 (21-256)||(43991856-43992080)
chr2 (21-256)||(36667484-36667700)
chr2 (120-256)||(8679391-8679527)
chr2 (24-256)||(24662724-24662958)
chr2 (21-110)||(40200270-40200359)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (21-253)||(40999703-40999935)
chr1 (17-256)||(16832379-16832618)
chr1 (21-256)||(11738394-11738629)
chr1 (21-256)||(12167812-12168047)
chr1 (21-256)||(33491794-33492029)
chr1 (21-256)||(38121528-38121763)
chr1 (21-256)||(44504864-44505099)
chr1 (21-256)||(49249395-49249630)
chr1 (21-256)||(431937-432172)
chr1 (21-256)||(39000777-39001012)
chr1 (21-237)||(16130836-16131052)
chr1 (21-256)||(36084089-36084324)
chr1 (21-256)||(9667292-9667527)
chr1 (17-256)||(13217644-13217884)
chr1 (25-256)||(8995858-8996089)
chr1 (21-252)||(15161758-15161988)
chr1 (154-256)||(20225958-20226060)
chr1 (24-256)||(9268969-9269201)
chr1 (178-242)||(13830756-13830820)
chr1 (30-105)||(39456627-39456703)
chr1 (51-113)||(7063546-7063608)
chr1 (189-254)||(3365824-3365889)
chr1 (30-114)||(6244534-6244619)
chr1 (170-202)||(27048318-27048350)
chr1 (178-242)||(39456759-39456823)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (21-256)||(28925739-28925974)
chr8 (21-256)||(8742879-8743114)
chr8 (21-256)||(9067763-9067998)
chr8 (24-256)||(41576927-41577159)
chr8 (21-256)||(3299132-3299367)
chr8 (21-256)||(28370424-28370659)
chr8 (21-256)||(11308583-11308818)
chr8 (21-256)||(13510294-13510529)
chr8 (21-256)||(13599824-13600059)
chr8 (21-256)||(27348357-27348592)
chr8 (21-242)||(22222285-22222506)
chr8 (21-256)||(34006369-34006604)
chr8 (21-242)||(22228627-22228848)
chr8 (21-256)||(22242839-22243074)
chr8 (21-242)||(22233460-22233681)
chr8 (21-237)||(12538494-12538710)
chr8 (24-237)||(36736821-36737034)
chr8 (21-216)||(21692777-21692972)
chr8 (24-256)||(16958886-16959116)
chr8 (21-256)||(4861547-4861782)
chr8 (63-242)||(22227118-22227297)
chr8 (21-256)||(17993197-17993432)
chr8 (21-254)||(13848926-13849160)
chr8 (21-170)||(22180932-22181081)
chr8 (195-256)||(22181081-22181142)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (21-256)||(3539378-3539613)
chr6 (21-256)||(14271003-14271238)
chr6 (21-256)||(24160852-24161087)
chr6 (21-256)||(26515024-26515259)
chr6 (21-256)||(34914019-34914254)
chr6 (21-256)||(1455122-1455357)
chr6 (21-256)||(1466814-1467049)
chr6 (21-256)||(9932401-9932636)
chr6 (21-256)||(24879196-24879431)
chr6 (21-256)||(25977280-25977515)
chr6 (17-256)||(13173420-13173659)
chr6 (17-256)||(13181953-13182192)
chr6 (21-256)||(21596124-21596359)
chr6 (21-256)||(16698240-16698475)
chr6 (21-256)||(32806359-32806594)
chr6 (21-256)||(5988598-5988833)
chr6 (21-218)||(34006833-34007030)
chr6 (21-254)||(21631514-21631747)
chr6 (24-242)||(9518056-9518275)
chr6 (24-256)||(15642751-15642982)
chr6 (30-113)||(26604679-26604763)
chr6 (220-256)||(8667461-8667497)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (21-256)||(4838732-4838967)
chr4 (21-256)||(22048012-22048247)
chr4 (21-256)||(46691633-46691868)
chr4 (21-256)||(40995143-40995378)
chr4 (21-256)||(5273158-5273393)
chr4 (21-256)||(19247424-19247659)
chr4 (21-256)||(21677264-21677498)
chr4 (21-256)||(323769-324004)
chr4 (21-256)||(1188295-1188530)
chr4 (21-256)||(26070058-26070293)
chr4 (21-256)||(42532482-42532717)
chr4 (17-256)||(26373227-26373466)
chr4 (21-256)||(35416292-35416527)
chr4 (21-256)||(52618833-52619068)
chr4 (21-256)||(55327107-55327337)
chr4 (54-256)||(21668500-21668703)
chr4 (21-256)||(30217983-30218217)
chr4 (21-256)||(53895709-53895944)
chr4 (21-242)||(20949076-20949298)
chr4 (21-226)||(9417059-9417264)
chr4 (21-237)||(33110317-33110533)
chr4 (95-254)||(42271781-42271941)
chr4 (148-256)||(33239375-33239483)
chr4 (192-256)||(19731001-19731065)
chr4 (204-256)||(44428987-44429039)
chr4 (30-99)||(8895205-8895275)
chr4 (193-242)||(6640465-6640514)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (21-256)||(11767085-11767320)
chr5 (21-256)||(24836053-24836288)
chr5 (21-256)||(33434933-33435168)
chr5 (21-256)||(34456626-34456861)
chr5 (21-256)||(9404755-9404990)
chr5 (21-256)||(11722872-11723107)
chr5 (21-256)||(16904205-16904440)
chr5 (21-256)||(27166694-27166929)
chr5 (17-256)||(37251501-37251740)
chr5 (21-256)||(7315535-7315770)
chr5 (21-256)||(14344792-14345027)
chr5 (21-256)||(30606672-30606907)
chr5 (17-256)||(32226985-32227224)
chr5 (21-256)||(6270220-6270456)
chr5 (21-254)||(34869342-34869577)
chr5 (21-191)||(519360-519530)
chr5 (21-135)||(31846310-31846424)
chr5 (24-236)||(39655652-39655865)
chr5 (164-256)||(31846426-31846518)
chr5 (21-67)||(7315296-7315342)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (21-256)||(7652818-7653053)
chr3 (21-256)||(9989726-9989961)
chr3 (21-256)||(10385666-10385901)
chr3 (21-256)||(1232087-1232322)
chr3 (21-256)||(8625954-8626189)
chr3 (21-256)||(20962852-20963087)
chr3 (21-256)||(22097997-22098232)
chr3 (17-256)||(37471283-37471522)
chr3 (21-256)||(48167790-48168025)
chr3 (21-256)||(52307681-52307916)
chr3 (21-256)||(3588731-3588966)
chr3 (21-256)||(36469032-36469267)
chr3 (21-256)||(4742598-4742834)
chr3 (21-256)||(27850147-27850382)
chr3 (21-256)||(45527978-45528213)
chr3 (24-256)||(20837427-20837659)
chr3 (21-235)||(49434428-49434642)
chr3 (21-256)||(37023019-37023256)
chr3 (30-217)||(23411817-23412004)
chr3 (21-256)||(33248320-33248555)
chr3 (85-256)||(22098375-22098546)
chr3 (21-256)||(23194250-23194485)
chr3 (21-256)||(2357491-2357726)
chr3 (30-236)||(27104326-27104537)
chr3 (21-144)||(26335439-26335562)
chr3 (220-256)||(23394099-23394135)
chr3 (178-242)||(17404747-17404811)
chr3 (188-228)||(24899554-24899594)
chr3 (188-228)||(24906020-24906060)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (21-256)||(12084-12319)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (21-256)||(15570-15805)
scaffold0298 (21-256)||(11800-12035)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (21-256)||(28495-28730)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (21-256)||(9073-9308)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (21-256)||(12525-12760)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (21-256)||(25246-25481)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (21-256)||(116164-116399)
scaffold0019 (34-256)||(169004-169226)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (21-256)||(76048-76283)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (21-237)||(599-815)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (21-256)||(7062-7297)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (21-256)||(16069-16304)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (21-256)||(34919-35155)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (21-256)||(14516-14750)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (92-256)||(4942-5107)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (189-256)||(7255-7322)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (189-256)||(7265-7332)
[»] scaffold0152 (1 HSPs)
scaffold0152 (189-256)||(24876-24943)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (21-67)||(7363-7409)
scaffold0447 (21-67)||(11977-12023)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (21-67)||(9972-10018)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (30-105)||(7014-7090)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22321632 - 22321397
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||    
T  22321632 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattagactacccaattgactttttg 22321533  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  22321532 atcgtttaaaagtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 22321433  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321432 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 22321397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2797394 - 2797159
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  2797394 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 2797295  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2797294 gtcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 2797195  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2797194 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 2797159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8107723 - 8107484
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||    
T  8107723 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactt 8107624  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8107623 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 8107524  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8107523 atagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 8107484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10346136 - 10345901
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  10346136 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 10346037  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  10346036 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 10345937  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10345936 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 10345901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31158107 - 31157872
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  31158107 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 31158008  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  31158007 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 31157908  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31157907 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 31157872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45500546 - 45500307
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  45500546 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactt 45500447  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45500446 tgtggtcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttagacatgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 45500347  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45500346 atcgtttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagat 45500307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 2631727 - 2631962
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  2631727 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 2631826  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  2631827 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatattatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 2631926  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2631927 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 2631962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 22820435 - 22820670
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  22820435 atgttaatatttgataatcaattttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 22820534  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  22820535 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 22820634  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22820635 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 22820670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 23795425 - 23795660
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  23795425 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttagtcgattgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 23795524  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  23795525 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 23795624  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23795625 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 23795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 22909448 - 22909680
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||    
T  22909448 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtg 22909547  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22909548 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22909647  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgaga 253  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22909648 tttaaaaagctagaatctgttatttgatcgaga 22909680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 31878930 - 31879164
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  31878930 atgttagtatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaatctatccaatcgattttgtg 31879029  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  31879030 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggaaacaaatgatattgtcg--tgattgtgataatatcg 31879127  T
Q  221 ttt-aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31879128 tttaaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 31879164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 1274918 - 1275134
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  1274918 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 1275017  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1275018 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1275117  T
Q  221 tttaaaaagctagaatc 237  Q
    ||||||| |||||||||    
T  1275118 tttaaaatgctagaatc 1275134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 6172846 - 6173081
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  6172846 atgttaatatttgataatcagttttaatctaggacttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 6172945  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| | |    
T  6172946 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgttgagtgattatgataatatag 6173045  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6173046 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 6173081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12090291 - 12090055
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  12090291 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 12090192  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgata-ttgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  12090191 atcctttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaacctcttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatatttgtcgagtgattgtgataatatc 12090092  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  12090091 gtttaaaaagctagaatacgataatcgatcgagagat 12090055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 12184195 - 12184425
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  12184195 atgttaaaatttgataatcacttttaatctacgacttaatgcttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 12184294  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12184295 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacg-----atttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 12184389  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12184390 tttaaaaagctagaatttgttaatcgatcgagagat 12184425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 31882441 - 31882676
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| || ||||||    
T  31882441 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatacttttgggtgatttaatcggttgggaaatcattgattaaactatccaatcgaatttgtg 31882540  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31882541 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttggaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 31882640  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  31882641 tttaaaaagttagaattcgttaatcgatcgagagat 31882676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Original strand, 1954285 - 1954492
Alignment:
Q  48 tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1954285 tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtataaatgtttagaaaatcgatg 1954384  T
Q  148 tttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcga 247  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1954385 tttaaatgatcccatagaaataacgatatcatttggacactaatgat-ttgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcga 1954483  T
Q  248 tcgagagat 256  Q
    |||||||||    
T  1954484 tcgagagat 1954492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3544709 - 3544474
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3544709 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 3544610  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || ||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3544609 attgtttaaatgtttgagaaatcgacatttaaacaatctcttagaaataacaatatcatttggacaaaaatgctattgtcgagtgattgtgataatatcg 3544510  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||    
T  3544509 tttaaaaagctataattcgttatttgatcgagagat 3544474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 24483078 - 24483311
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  24483078 atgttaatatttgataatcatttttaatctaga-cttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaa-tcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 24483175  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24483176 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatccattagaaataacgatatcatttggacccgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 24483275  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24483276 ttaaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 24483311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 2477990 - 2478223
Alignment:
Q  20 aatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  2477990 aatgttaatatttgataatcacttttcatctagaacttaatgcttttgggtcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgt 2478089  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  2478090 gattgtttaaatgtttggaaaatcaacatttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacatgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatc 2478189  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgaga 253  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  2478190 gtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgaga 2478223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 12191172 - 12191407
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | || || || |||  || ||||||| || ||||||    
T  12191172 atgttaaaatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgttttgtaattcttctatttaactatccaatcgactttgtg 12191271  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  12191272 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgattgatattgtcgagtgattgtgataatatca 12191371  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12191372 tttaaaaatctagaattcgttaatcgatcgagagat 12191407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19472021 - 19471864
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  19472021 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 19471922  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatca 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471921 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatca 19471864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 118 - 256
Target Start/End: Original strand, 22825036 - 22825174
Alignment:
Q  118 gtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  22825036 gtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataata 22825135  T
Q  218 tcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22825136 tagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 22825174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29032622 - 29032406
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||| ||||||| | ||||| || || ||||||||     
T  29032622 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcaattaattgattgagaaatcatcgattaaatgatccgatcgactttgtgatt 29032523  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgttt 223  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  29032522 gtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacggatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgttt 29032423  T
Q  224 aaaaagctagaatctgt 240  Q
    |||||||||||||||||    
T  29032422 aaaaagctagaatctgt 29032406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31664326 - 31664108
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| || || |||| || ||| |     
T  31664326 atgttagtatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggg-----------------aaatcgtcgattaaactattcaatcgactttttt 31664244  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  31664243 attgtttaaatgtttggagaatcgatgtttaaacgacctcttaaaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcaaatgattgtgttaatatcg 31664144  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31664143 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 31664108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4705115 - 4704974
Alignment:
Q  115 tttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgata 214  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||    
T  4705115 tttgtgatcgtttaaatgttttgaaaatcgatatttaaacgatcccttagaactaacgatatcatttggacacatatggtattgttgagtgattgtgata 4705016  T
Q  215 atttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  4705015 atatcgtttaaaaagttagaatccgttatttgatcgagagat 4704974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 27257715 - 27257950
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  27257715 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 27257814  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27257815 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 27257914  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27257915 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 27257950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13230173 - 13229938
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  13230173 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttagttcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 13230074  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  13230073 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatcg 13229974  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13229973 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 13229938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 32523259 - 32523494
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  32523259 atgttaatatttgataatcacttttaatctaaaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 32523358  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32523359 atcgtttaaatatttgggaaatcgatgtttcaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 32523458  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32523459 tttaaaaagctagaatatgttaatcgatcgagagat 32523494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42700802 - 42700569
Alignment:
Q  23 gttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  42700802 gttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgctttttggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgat 42700703  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtt 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  42700702 cgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcatt 42700603  T
Q  223 taaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42700602 taaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 42700569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 21160296 - 21160531
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  21160296 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtg 21160395  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  21160396 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcg 21160495  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21160496 tttaaaaagttagaatctgttaattgatcgagagat 21160531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 29224045 - 29224280
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  29224045 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 29224144  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  29224145 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 29224244  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29224245 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagat 29224280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 29337344 - 29337579
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  29337344 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 29337443  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  29337444 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 29337543  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29337544 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagat 29337579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23924863 - 23924628
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| || ||||||    
T  23924863 atgttaatttttgataatcacttttaatctaggttttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcaattaaattatccaatcgactttgtg 23924764  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  23924763 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 23924664  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23924663 tttaaaaagcaagaatccgttaatcgatcgagagat 23924628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 41977925 - 41978160
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| || ||||||    
T  41977925 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaagctatccaatcgactttgtg 41978024  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  41978025 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatag 41978124  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||    
T  41978125 tttaaaaagttagaatccgttatttgatcgtgagat 41978160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36040093 - 36039858
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||| ||    
T  36040093 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatcctatcgactttttg 36039994  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  36039993 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttataaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 36039894  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36039893 tttaaaaagctagaatcctttaatcgatcgagagat 36039858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9786935 - 9786700
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||    
T  9786935 atgtcaatatttgataatcacttttaatccaagacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgattcaatcgactttgtg 9786836  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  9786835 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaattccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcg 9786736  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  9786735 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgatagat 9786700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 14700974 - 14701209
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  14700974 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatatttttaggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 14701073  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14701074 attgtttaaatgtttggaaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcttttagacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 14701173  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    | ||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  14701174 tctaaaaagctagaatccgtttattgatcgagagat 14701209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28457708 - 28457473
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||    
T  28457708 atgttaatatttgataattacatttaatctagaatttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcaactttgtg 28457609  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28457608 attgtttaaatgtttgggaaatagacatttaaacaatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 28457509  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  28457508 ttttaaaagctagaatccgttatttgatcgagagat 28457473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 31758607 - 31758803
Alignment:
Q  20 aatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||    
T  31758607 aatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgttgattaaacgatccaatcgactttgt 31758706  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31758707 gattgtttaaatgtttggtaaatcgacatttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 31758803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36557393 - 36557158
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  36557393 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcattcaaacggctgggaaatcgtcgattatacaatgcaatcgactttgtg 36557294  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || || ||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||    
T  36557293 attgtgtaaatgtttggaaaattgacatttaaacgatcccttataaataacgatatcatttggacacgaatgatattatcaagtgattgtgataatatcg 36557194  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  36557193 tttaaaaggctagaatccgttatttgatcgagagat 36557158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 43991856 - 43992080
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| || ||||||    
T  43991856 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacgtaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaactatctaatcgactttgtg 43991955  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43991956 atcgtttaaatgtttgggaaat-----------cgatcccttagaaataacgatatcatttggacactaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 43992044  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43992045 tttaaaaagctagaatatgttaattgatcgagagat 43992080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36667700 - 36667484
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  36667700 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatccgttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 36667601  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||             ||| ||||||||||||| |||    
T  36667600 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgttt------tcccttagaaataacgatatcatttggaca-------------cgagtgattgtgataatatcg 36667520  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36667519 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 36667484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8679527 - 8679391
Alignment:
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  8679527 gatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatc 8679428  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8679427 gtttaaaaagatagaatctattaatcgatcgagagat 8679391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24662958 - 24662724
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |  |||||||    
T  24662958 ttaatctttgataatcactttgtaatcaagaacttaatgctttttggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcaacattgtgat 24662859  T
Q  123 cgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgt 221  Q
      ||||||| |||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  24662858 tatttaaatagtttgggaaatcgacttttaaataatccattagaaatcacgacattatttggacacgaatgatgttattgaatgattgtgataatatcgt 24662759  T
Q  222 ttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||| || ||||||| |||| | | |||||||||    
T  24662758 ttaaagagttagaatccgttatttggtcgagagat 24662724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 40200270 - 40200359
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40200270 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 40200359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40999935 - 40999703
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||    
T  40999935 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaaaaggctttgtg 40999836  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  40999835 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 40999736  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgaga 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40999735 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgaga 40999703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16832618 - 16832379
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  16832618 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactt 16832519  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16832518 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 16832419  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16832418 atcgcttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 16832379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11738629 - 11738394
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||    
T  11738629 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgactaaactatccaatcgactttgtg 11738530  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11738529 atcgtttaaatttttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 11738430  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11738429 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 11738394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12168047 - 12167812
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  12168047 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 12167948  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  12167947 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 12167848  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12167847 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 12167812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33492029 - 33491794
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  33492029 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 33491930  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  33491929 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 33491830  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33491829 tttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagat 33491794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38121763 - 38121528
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  38121763 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 38121664  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  38121663 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataatgatatcatttgtacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 38121564  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38121563 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 38121528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44505099 - 44504864
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  44505099 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 44505000  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  44504999 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgacctcttagaaataacgacatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 44504900  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44504899 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 44504864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 49249395 - 49249630
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  49249395 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgagtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 49249494  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  49249495 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 49249594  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49249595 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 49249630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 432172 - 431937
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  432172 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtgaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 432073  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  432072 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 431973  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  431972 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 431937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39001012 - 39000777
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  39001012 atgtcaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 39000913  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  39000912 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcgcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 39000813  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  39000812 tttaaaaagctagaatccgtaaatcgatcgaaagat 39000777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 16130836 - 16131052
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  16130836 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatcggttagggaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 16130935  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16130936 atcgtttaaatatttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 16131035  T
Q  221 tttaaaaagctagaatc 237  Q
    |||||||||||| ||||    
T  16131036 tttaaaaagctataatc 16131052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 36084089 - 36084324
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  36084089 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcatttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 36084188  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  36084189 attatataaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcaagtgattgtgataatatcg 36084288  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  36084289 tttaaaaagctagaatatgttaattgatcgtgagat 36084324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9667527 - 9667292
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  9667527 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttggtaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 9667428  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  9667427 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaggatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatag 9667328  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9667327 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagat 9667292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13217884 - 13217644
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattga-tt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||| || ||    
T  13217884 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatacttttggataatttaattagctgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactt 13217785  T
Q  116 ttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataa 215  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13217784 ttgggatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgattgatattgtcgagtgattgtgataa 13217685  T
Q  216 tttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13217684 tatcatttaaaaagctaaaatccgttaatcgatcgagagat 13217644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8996089 - 8995858
Alignment:
Q  25 taatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||    
T  8996089 taatatttgataatcacttttaatctaaaaattaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaagctatccaatcgactttgtgatcg 8995990  T
Q  125 tttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgttta 224  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| | |||||    
T  8995989 tttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcattttgacacgaatgatattattgagtgattgtgataatgtagttta 8995890  T
Q  225 aaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  8995889 aaaagctagaatccgttatttgatcgtgagat 8995858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 15161758 - 15161988
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| || ||||||    
T  15161758 atgttaatatttgataatcacttttaatatagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatagtcgattaaacggttcaatcgactttgtg 15161857  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  15161858 attgtttaaatgtttgggaaattgacatttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcgagt-attgtgataatatcg 15161956  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgag 252  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  15161957 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgag 15161988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20226060 - 20225958
Alignment:
Q  154 cgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgaga 253  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20226060 cgatcgcttataaataacgatatcatttggacacggatgagattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgaga 20225961  T
Q  254 gat 256  Q
    |||    
T  20225960 gat 20225958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 9268969 - 9269201
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| |||||||||||| || || || ||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||    
T  9268969 ttaatctttgataatcaccttgaaatcaagagcttaatgcttttaggtcgtttaattgattgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcggcttt-tgat 9269067  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtt 222  Q
     ||||||  |||| | |||| ||  ||||||   ||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  9269068 tgtttaatagtttggaaaattgacttttaaatagtccattagaaatcacgacatcatttagacacgaatgatgttgtcgagtgattttgataatatcgtt 9269167  T
Q  223 taaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||    
T  9269168 taaaaagttagaatccgttatttgatcgtgagat 9269201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 242
Target Start/End: Original strand, 13830756 - 13830820
Alignment:
Q  178 atttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    |||| |||| |||| || |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13830756 atttagacatgaataatgttgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgtta 13830820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Original strand, 39456627 - 39456703
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgat 105  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||| |||||||||||||||    
T  39456627 tttggtaatcactttgtaatcaagaacttaatgctattggatcgtttaatagattgagaaaacgtcgattagacgat 39456703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 113
Target Start/End: Original strand, 7063546 - 7063608
Alignment:
Q  51 agaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattga 113  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7063546 agaacttaatgctattggatcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatacaattga 7063608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3365889 - 3365824
Alignment:
Q  189 aatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagag 254  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  3365889 aatgatgttgtcgagaaattgtgataatatcgttttaaaagctagaatccgttatttgatcgagag 3365824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 6244534 - 6244619
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgat 114  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | ||| ||||||||    
T  6244534 tttggtaatcactttaaaatcaagaacttaatgttattgggtcatttaatagattgagaaatcatcgattaaaagatacaattgat 6244619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27048350 - 27048318
Alignment:
Q  170 acgatatcatttggacacgaatgatattgtcga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27048350 acgatatcatttggacacgaatgatgttgtcga 27048318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 242
Target Start/End: Original strand, 39456759 - 39456823
Alignment:
Q  178 atttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    |||| |||| |||| || |||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  39456759 atttagacatgaataatgttgttgagtgattgtgataatatcgtttgaaaatctagaatctgtta 39456823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28925974 - 28925739
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  28925974 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 28925875  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  28925874 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 28925775  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28925774 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 28925739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8743114 - 8742879
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  8743114 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 8743015  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  8743014 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 8742915  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8742914 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 8742879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9067998 - 9067763
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  9067998 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 9067899  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  9067898 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9067799  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9067798 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 9067763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41577159 - 41576927
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || |||||||||    
T  41577159 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatc 41577060  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgttt 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  41577059 gtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttt 41576960  T
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41576959 aaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 41576927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 3299132 - 3299367
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  3299132 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 3299231  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  3299232 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 3299331  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3299332 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 3299367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 28370424 - 28370659
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  28370424 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 28370523  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  28370524 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 28370623  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28370624 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 28370659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11308818 - 11308583
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||  || ||||||    
T  11308818 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactgcccaaacgactttgtg 11308719  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  11308718 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 11308619  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11308618 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgaaagat 11308583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 13510294 - 13510529
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  13510294 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 13510393  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13510394 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaattaccgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 13510493  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  13510494 tttaaaaaggtagaatccgttaattgatcgagagat 13510529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 13599824 - 13600059
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  13599824 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 13599923  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13599924 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaattaccgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 13600023  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  13600024 tttaaaaaggtagaatccgttaattgatcgagagat 13600059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 27348357 - 27348592
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  | ||||||    
T  27348357 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcaactttgtg 27348456  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  27348457 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatgg 27348556  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  27348557 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcaagagat 27348592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22222506 - 22222285
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||    
T  22222506 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtg 22222407  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22222406 attgttttaatgttcgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22222307  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22222306 tttaaaaagctagaatctgtta 22222285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34006604 - 34006369
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||  ||  | ||||||    
T  34006604 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgtttaaattatcttatctactttgtg 34006505  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  34006504 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaagatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 34006405  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34006404 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 34006369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22228848 - 22228627
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||    
T  22228848 atgttaatatttgataatcatttttaaactagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtg 22228749  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22228748 attgttttaatgttcgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22228649  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22228648 tttaaaaagctagaatctgtta 22228627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22243074 - 22242839
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||     
T  22243074 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattgaactatccaatcgactttgta 22242975  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22242974 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaagatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22242875  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||    
T  22242874 tttaaaaagccagaatccgttatttgatcgcgagat 22242839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22233681 - 22233460
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||    
T  22233681 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtg 22233582  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  22233581 attgttttaatgtttggaaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtggagtgattgtgataatatcg 22233482  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22233481 tttaaaaagctagaatctgtta 22233460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 12538494 - 12538710
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  12538494 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtcatttaatcgattagaaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 12538593  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12538594 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaattccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 12538693  T
Q  221 tttaaaaagctagaatc 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  12538694 tttaaaaagctagaatc 12538710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36737034 - 36736821
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||| |||| || |||||||||    
T  36737034 ttaatctttgataatcactattaatctagaacttgaagcttttgagtcatttaatagattgggaaatcatcgattaaatgatgcaatcgactttgtgatc 36736935  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgttt 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36736934 gtttaaatgtttgtgaaatcgatatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgttt 36736835  T
Q  224 aaaaagctagaatc 237  Q
    |||| |||||||||    
T  36736834 aaaatgctagaatc 36736821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Original strand, 21692777 - 21692972
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||| || ||||||    
T  21692777 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatttttgattaaacgatccaatcgactttgtg 21692876  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21692877 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataatgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattatgataat 21692972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 16958886 - 16959116
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||     
T  16958886 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactctgtgatt 16958985  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgttt 223  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||    
T  16958986 gtttaaatgtttgagaaattgacatttaaacgat-ccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcattt 16959084  T
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    | ||||| |||||| |||| |  ||||||||||    
T  16959085 ataaagc-agaatccgttatttaatcgagagat 16959116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4861782 - 4861547
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||| |    
T  4861782 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgatccgatcgactttgcg 4861683  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  4861682 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcg 4861583  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  4861582 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagagat 4861547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22227297 - 22227118
Alignment:
Q  63 ttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatccctt 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22227297 ttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtgattgttttaatgtttggaaaatcgacatttaaacgatccctt 22227198  T
Q  163 agaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22227197 agaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtggagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgtta 22227118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 17993197 - 17993432
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || || |||| |    
T  17993197 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgcttggaaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgcg 17993296  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||    
T  17993297 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcaagtgattgtgataatatcg 17993396  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  17993397 tttaaaaagctagaattcgttatttgatcgagagat 17993432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13849160 - 13848926
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  13849160 atgttaatctttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttagatcaattaatagattgggaaatcatcgattaaatgatccaatcgattttgtg 13849061  T
Q  121 atcgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    ||| ||||||| |||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  13849060 atcatttaaatagtttggaaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgctatcatttgaacatgaatggtattgttgagtgattgtgataatatc 13848961  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagag 254  Q
      |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  13848960 acttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagag 13848926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 22180932 - 22181081
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  22180932 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 22181031  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 170  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22181032 atcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 22181081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Original strand, 22181081 - 22181142
Alignment:
Q  195 attgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22181081 attgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 22181142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 3539378 - 3539613
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  3539378 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 3539477  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  3539478 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 3539577  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3539578 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 3539613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 14271003 - 14271238
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  14271003 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 14271102  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14271103 atcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 14271202  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14271203 tttaaaaagctagaatctgttaattgatagagagat 14271238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24161087 - 24160852
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  24161087 atgttaatatttgataatcacttttaatcaaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 24160988  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24160987 atcgtttaaatgtttggggaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatatcg 24160888  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24160887 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagat 24160852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26515259 - 26515024
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  26515259 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 26515160  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  26515159 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 26515060  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26515059 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 26515024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 34914019 - 34914254
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  34914019 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 34914118  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  34914119 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 34914218  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34914219 tttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagat 34914254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 1455122 - 1455357
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||    
T  1455122 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactatccaatcgactttgtg 1455221  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1455222 atcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1455321  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1455322 ttgaaaaagctagaatctattaattgatcgagagat 1455357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 1466814 - 1467049
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||    
T  1466814 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactatccaatcgactttgtg 1466913  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1466914 atcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1467013  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1467014 ttgaaaaagctagaatctattaattgatcgagagat 1467049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9932636 - 9932401
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  9932636 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 9932537  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  9932536 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9932437  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9932436 tttaataagctagaatccattaatcgatcgagagat 9932401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 24879196 - 24879431
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||    
T  24879196 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtg 24879295  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  24879296 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacaagaatgatattgtcgagcgattgtgataatatcg 24879395  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24879396 tttaaaaagctagaatccgttaatcgattgagagat 24879431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 25977280 - 25977515
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  25977280 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactaaccaatcgactttgtg 25977379  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |    
T  25977380 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggaaacgaatgatattgtcgagagattgtgataatatag 25977479  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25977480 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 25977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13173659 - 13173420
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||    
T  13173659 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcttcgattgaactatccaatcgactt 13173560  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13173559 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 13173460  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  13173459 atcgtttaaaaagctagaatccgttattggatcgtgagat 13173420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13182192 - 13181953
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| || ||    
T  13182192 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagtacttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgattgaactatccaatcgactt 13182093  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13182092 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcctttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 13181993  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     | |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  13181992 attgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagat 13181953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21596359 - 21596124
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| ||    
T  21596359 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaccttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaaatatccaatcgactttttg 21596260  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21596259 atcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacgacctcttagcaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 21596160  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21596159 tttaaaaagctagaatccgttaatcgattgagagat 21596124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 16698240 - 16698475
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  16698240 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggtttggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 16698339  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  16698340 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatttttaagcgatcccttagaaataacgttatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 16698439  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  16698440 tttaaaaaggtagaatccattaatcgatcgagagat 16698475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32806594 - 32806359
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||    
T  32806594 atgttaatatttaataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgacgttgtg 32806495  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |    
T  32806494 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgacctcttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagcgattgtgataatattg 32806395  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32806394 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 32806359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5988833 - 5988598
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||    
T  5988833 atgttaatatttgataatcacttttaatttagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggtagggaaatcgtcaattaaacgatccaatcgacgttgtg 5988734  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    |   ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5988733 aatatttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtaataatatcg 5988634  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  5988633 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagagat 5988598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 34006833 - 34007030
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  34006833 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 34006932  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataattt 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34006933 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtggtaattt 34007030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 21631514 - 21631747
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||    
T  21631514 atgttaatctttgataatcacttataatctagaacttaatgtttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatctaatcgactttgtg 21631613  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || || |||  |||| ||| |||||  ||||||   |||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||    
T  21631614 attgtgtaatagtttgggatatcgaattttaaatagtcccttggaaatcacgacacaatttggacacgaatgatgatgttgagtgattgtgataatatcg 21631713  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagag 254  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  21631714 tttaaaaagttagaatccgttatttgatcgagag 21631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9518275 - 9518056
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  9518275 ttaatctttgataatcactttgtaattaagaacttaatacttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgtgat 9518176  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtt 222  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||| |    ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || |||| |||||    
T  9518175 tgtttaatagtttgggaaatcgacttttgagtagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtttagtgattatgctaatatcgtt 9518076  T
Q  223 taaaaagctagaatctgtta 242  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9518075 taaaaagctagaatctgtta 9518056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 15642751 - 15642982
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  15642751 ttaatctttcataatcactttgtaatcaagaacttaatgcttttggatcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgat 15642850  T
Q  123 cgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgt 221  Q
      ||||||| |||| | |||||||  ||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||   ||| || ||||||| ||||| ||||    
T  15642851 tatttaaatagtttggaaaatcgacttttaaataatccattagaaatcacgacatcatttggacaagaatga---tgttgagtgattgtaataatatcgt 15642947  T
Q  222 ttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||| || || |||| |||| | |||||| ||||    
T  15642948 ttaaagaggtaaaatccgttatttgatcgaaagat 15642982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 26604679 - 26604763
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattga 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26604679 tttgataatcactttgtaatcaagaacttaatgctatttgatcgtttaatagattgggaaatcgtcgattaaacgatccgattga 26604763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 256
Target Start/End: Original strand, 8667461 - 8667497
Alignment:
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8667461 gtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 8667497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4838967 - 4838732
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  4838967 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 4838868  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  4838867 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 4838768  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4838767 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 4838732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 22048012 - 22048247
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  22048012 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 22048111  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  22048112 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 22048211  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22048212 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 22048247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46691868 - 46691633
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  46691868 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttaggtcaattaatcggttgggaaatcatcgattaaacgatccaatcaactttgtg 46691769  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  46691768 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 46691669  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46691668 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 46691633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40995378 - 40995143
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||    
T  40995378 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgagtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgaaccaatcgactttgtg 40995279  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |      
T  40995278 atcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattt 40995179  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40995178 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 40995143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5273393 - 5273158
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  5273393 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 5273294  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  5273293 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 5273194  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5273193 tttaaaaagctagaatccgttaatcggtcgagagat 5273158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19247659 - 19247424
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  19247659 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 19247560  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19247559 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggatacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 19247460  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19247459 tttaaaaagttagaatctgttaatctatcgagagat 19247424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21677498 - 21677264
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  21677498 atgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 21677399  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  21677398 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcgagt-attgtgataatatcg 21677300  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21677299 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 21677264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 323769 - 324004
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |  |||||    
T  323769 atgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcaacgttgtg 323868  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  323869 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 323968  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  323969 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 324004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 1188295 - 1188530
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||    
T  1188295 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttgatgcttttgggtgatttaatcggttgggaaatcgtcgaataaactatccaatcgactttgtg 1188394  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1188395 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgtatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1188494  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1188495 tttaaaaagctagaatctgctaatcgatcgagagat 1188530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 26070058 - 26070293
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| || ||||||    
T  26070058 atgttaatatttgataatcacttttagtctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactatctaatcgactttgtg 26070157  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26070158 gtcgtttaaatgtttgagaaatcgatgttttaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 26070257  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26070258 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 26070293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42532717 - 42532482
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  42532717 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 42532618  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  42532617 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 42532518  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  42532517 tttaaaatgcttgaatcctttaatcgatcgagagat 42532482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26373466 - 26373227
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  26373466 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactt 26373367  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26373366 tgtgatcgtttaaacgtttgggaaatcaatgtttaaacaatcccttagaaataacaatataatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgatagt 26373267  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  26373266 atcgtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcaagagat 26373227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35416527 - 35416292
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||    
T  35416527 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcaattaaactatccaatcgactttatg 35416428  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35416427 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgacctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 35416328  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35416327 tttaacaagctagaatttgttaatcgatcaagagat 35416292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 52618833 - 52619068
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||    
T  52618833 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgatcgggaaatcgtcaattaaactatccaatcgactttgtg 52618932  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  52618933 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 52619032  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52619033 attaaaaagatagaatccgttaatcgatcgagagat 52619068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 55327107 - 55327337
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    |||||||||| ||| || ||||||| || ||||||    
T  55327107 atgttaatatttgataatcacttttaatctagagcttaatgtttttgggtaatttaatcgg----gaaatcgtcggttaaactatccaatcgactttgtg 55327202  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  55327203 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatat-g 55327301  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  55327302 tctaaaaagctggaatccgttaatcgatcgagagat 55327337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21668703 - 21668500
Alignment:
Q  54 acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaa 153  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21668703 acttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 21668604  T
Q  154 cgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg-tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21668603 cgatcccttagaaataacgatatcatttggtcacgaatgatattttcgagtgattgtgataatatcgttttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgag 21668504  T
Q  253 agat 256  Q
    ||||    
T  21668503 agat 21668500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30218217 - 30217983
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||    
T  30218217 atgttaatatttgataatcacttttaatctaaaacttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcatcgattaaa-gatccaatcgactttgtg 30218119  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30218118 atagtttaaatgtttgggaaatcgacatttagacgatccattagaaataacgatatcatttggacaggaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 30218019  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||    
T  30218018 tttaaaaagttagaattcgttatttgatcgagagat 30217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 53895709 - 53895944
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  53895709 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaccttaatgtttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtctattaaacgatccaatcgactttgtg 53895808  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||||||   ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  53895809 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttaaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 53895908  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  53895909 tttaaaaatctagaatctgttatttgatcgtgagat 53895944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 20949076 - 20949298
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||| || ||||||    
T  20949076 atgttaatctttgataatcacttttaatctagaatttaatgtttttggatcaattaatagattggaaaatcatcgattaaatgatccaatcgactttgtg 20949175  T
Q  121 atcgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
     |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  20949176 gtcgtttaaatagtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatgtc 20949275  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  20949276 gtttaaaaagctagaatccgtta 20949298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9417264 - 9417059
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  9417264 atgttaatattttacaatcacttttaatctagaatttaatgcttttggtttgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcgactttgtg 9417165  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  9417164 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccctagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatgtcg 9417065  T
Q  221 tttaaa 226  Q
     |||||    
T  9417064 attaaa 9417059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33110533 - 33110317
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  33110533 atgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgttcaggggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 33110434  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |    
T  33110433 attgtttaaatgtttgggagatcgacatttgaacaatcccttagaaatcacgacaacatttggacacgaatgatgttgttgagtgattgtgataatattg 33110334  T
Q  221 tttaaaaagctagaatc 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  33110333 tttaaaaagctagaatc 33110317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 254
Target Start/End: Original strand, 42271781 - 42271941
Alignment:
Q  95 gattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgat 194  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42271781 gattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacggccttttagaaataatgatatcatttggacacgaatgat 42271880  T
Q  195 attgtcgaatgattgtgataatttcgttt-aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagag 254  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  42271881 attgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaagttagaatccgttaattgatcgagag 42271941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 256
Target Start/End: Original strand, 33239375 - 33239483
Alignment:
Q  148 tttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcga 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33239375 tttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcga 33239474  T
Q  248 tcgagagat 256  Q
    |||||||||    
T  33239475 tcgagagat 33239483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19731065 - 19731001
Alignment:
Q  192 gatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19731065 gatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 19731001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44429039 - 44428987
Alignment:
Q  204 tgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44429039 tgattgtgataatatagtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 44428987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Original strand, 8895205 - 8895275
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgatta 99  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8895205 tttgataatcactttgaaatcaagaacttaatgcttttggatcgtttaataggttgagaaatcatcgatta 8895275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 242
Target Start/End: Original strand, 6640465 - 6640514
Alignment:
Q  193 atattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6640465 atattgttgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgtta 6640514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 11767085 - 11767320
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||    
T  11767085 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgattttgtg 11767184  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  11767185 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgaccccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 11767284  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11767285 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 11767320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 24836053 - 24836288
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  24836053 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 24836152  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  24836153 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 24836252  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24836253 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 24836288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 33434933 - 33435168
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| || ||||||    
T  33434933 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgacgattaaactacccaatcgactttgtg 33435032  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  33435033 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 33435132  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33435133 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 33435168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 34456626 - 34456861
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  34456626 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 34456725  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  34456726 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 34456825  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34456826 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 34456861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 9404755 - 9404990
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  9404755 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 9404854  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  9404855 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatag 9404954  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9404955 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 9404990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11723107 - 11722872
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  11723107 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 11723008  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  11723007 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 11722908  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11722907 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 11722872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16904440 - 16904205
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  16904440 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 16904341  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  16904340 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 16904241  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16904240 ttttaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 16904205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27166929 - 27166694
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  27166929 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 27166830  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27166829 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 27166730  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  27166729 tttaaaaagctacaattcgttaatcgatcgagagat 27166694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37251740 - 37251501
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| || ||    
T  37251740 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcgtttgggaaatcgtcgattaagctatccaatcgactt 37251641  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37251640 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataat 37251541  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  37251540 atagtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgagat 37251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 7315535 - 7315770
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  7315535 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 7315634  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  7315635 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 7315734  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7315735 tttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagat 7315770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 14344792 - 14345027
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  14344792 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 14344891  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  14344892 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataaagatatcatttgaacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 14344991  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14344992 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagat 14345027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30606907 - 30606672
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  30606907 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 30606808  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  30606807 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatatttaaacgatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 30606708  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30606707 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 30606672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 32226985 - 32227224
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||    
T  32226985 atgaatgtcaatatttgataatcacttttaatctaggacttagtgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactt 32227084  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32227085 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 32227184  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     || |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  32227185 atcatttaaaaagcaagaatccgttaattgatcaagagat 32227224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 6270220 - 6270456
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttggg-aaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  6270220 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgctttttggtaatttaatcggttggggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgt 6270319  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6270320 gatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatc 6270419  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  6270420 gtttaaaaagctagaatccgttaatcaatcaagagat 6270456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34869577 - 34869342
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| || ||||||    
T  34869577 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcctcgattaaattatccaatcgactttgtg 34869478  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatccc-ttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34869477 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatccctttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatc 34869378  T
Q  220 gttt-aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagag 254  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  34869377 gtttaaaaaagctagaatccgttaattaatcgagag 34869342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 519360 - 519530
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||  | ||||||    
T  519360 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaattgtcgattaaacgatcaaatcaactttgtg 519459  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaat 191  Q
    || |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  519460 attgtttaaatgtttgggaaatcgacaattaaacgatcccttagagataacgatatcatttggacacgaat 519530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 31846310 - 31846424
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  31846310 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 31846409  T
Q  121 atcgtttaaatgttt 135  Q
    |||||||||||||||    
T  31846410 atcgtttaaatgttt 31846424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39655865 - 39655652
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||    
T  39655865 ttaatctttgataatcactttgtaatcaagaacttaatggttttgggtcgtttaatagattgggaaatcgtcgattgaacgatccgattgactttctgat 39655766  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtt 222  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||  ||||    
T  39655765 tgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacaaatgatgttgttgagtgattgtgataataccgtt 39655666  T
Q  223 taaaaagctagaat 236  Q
    ||||||| ||||||    
T  39655665 taaaaagttagaat 39655652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 256
Target Start/End: Original strand, 31846426 - 31846518
Alignment:
Q  164 gaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31846426 gaaataacgatattatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 31846518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 7315296 - 7315342
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7315296 atgttaatatttgataatcatttttaatctagaacttaatgcttttg 7315342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7653053 - 7652818
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  7653053 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 7652954  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  7652953 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 7652854  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7652853 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 7652818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 9989726 - 9989961
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  9989726 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 9989825  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  9989826 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9989925  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9989926 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 9989961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10385901 - 10385666
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  10385901 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 10385802  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  10385801 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 10385702  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10385701 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 10385666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1232322 - 1232087
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  1232322 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtg 1232223  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  1232222 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcctttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcg 1232123  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1232122 tttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagat 1232087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 8625954 - 8626189
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  8625954 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 8626053  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  8626054 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 8626153  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8626154 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 8626189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20963087 - 20962852
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||    
T  20963087 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggactcaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcatcgattaaactatccaatcgactttgtg 20962988  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20962987 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgttgaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 20962888  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20962887 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 20962852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 22097997 - 22098232
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  22097997 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggttaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 22098096  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  22098097 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatataa 22098196  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22098197 tttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagat 22098232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37471522 - 37471283
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  37471522 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaattcttttggataatttaatcagttgagaaatcgtcgattaaattatccaatcgactt 37471423  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37471422 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 37471323  T
Q  217 ttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37471322 atcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 37471283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48168025 - 48167790
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  48168025 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgaatttgtg 48167926  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  48167925 agcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttgaacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 48167826  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  48167825 tttaaaaaactagaattcgttaatcgatcgagagat 48167790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52307916 - 52307681
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||  || ||||||    
T  52307916 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactacccaaacgactttgtg 52307817  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  52307816 atcgtttaaatgtttgtgaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 52307717  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52307716 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 52307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 3588731 - 3588966
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3588731 atgttaatatttgataatcacttataatctaggacttaatgcttttgggtcatttagtcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 3588830  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3588831 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 3588930  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3588931 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagat 3588966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36469267 - 36469032
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||  || ||||||    
T  36469267 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcggttaaaatatctaaacgactttgtg 36469168  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  36469167 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 36469068  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36469067 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 36469032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4742834 - 4742598
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| || ||||||    
T  4742834 atgttaatatttaataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggtttggaaattgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 4742735  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  4742734 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggtcacgaatgatattttcgagtgattgtgataatatcg 4742635  T
Q  221 -tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4742634 ttttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 4742598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27850382 - 27850147
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  27850382 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggctaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 27850283  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  27850282 atcgtttaaatgtttgggaaaccgatgtttaaacgatcccttagaaataatgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 27850183  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27850182 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 27850147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 45527978 - 45528213
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  45527978 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 45528077  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  45528078 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtgtaaacgatcccttagaaataacgacaacatttggacacgaatgacattgtcgagtgattgtgataatatcg 45528177  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45528178 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 45528213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 20837427 - 20837659
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| || || ||||||    
T  20837427 ttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcatcgattaaattatccaatcgacttcgtgatc 20837526  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgttt 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  20837527 gtttgaatgtttgggaaatcgacgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttt 20837626  T
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20837627 aaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 20837659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 49434428 - 49434642
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  49434428 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 49434527  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  49434528 attatttaaatgtttgagaaatcgacatttaaacaatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 49434627  T
Q  221 tttaaaaagctagaa 235  Q
    |||||||||||||||    
T  49434628 tttaaaaagctagaa 49434642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 37023019 - 37023256
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctaga--acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||    
T  37023019 atgttgatatttgataatcacttttaatctatatgatttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaactatccaatcgactttg 37023118  T
Q  119 tgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataattt 218  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37023119 tgatcgtttaaatgtttggaaaaacgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacggatgatattgtcgagtgattgtgataatat 37023218  T
Q  219 cgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37023219 cgtttaaaaagttaggatccgttaatcgatcgagagat 37023256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 23411817 - 23412004
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||    
T  23411817 tttgataatcacttttaatctagaacttaattcttttgggtaatttattcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaa 23411916  T
Q  130 atgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23411917 atgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatt 23412004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 33248320 - 33248555
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  33248320 atgttaatatttgataatcactttttatctcgaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcaactttgtg 33248419  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33248420 attgtttaaatgtatgagaaatcgacatttaaacaatctcttagaaataacgatatcatttggacgcgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 33248519  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  33248520 tttaaaaagctagaattcgttatttgatcgagagat 33248555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Original strand, 22098375 - 22098546
Alignment:
Q  85 ggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttgga 184  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22098375 ggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttgga 22098474  T
Q  185 cacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22098475 cacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatataatttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagat 22098546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 23194250 - 23194485
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||      
T  23194250 atgttaatatttgataaacacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgca 23194349  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || ||||||  |||| ||||||| |  ||| ||   ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  23194350 attgtttaatagtttgggaaatcaacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcg 23194449  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  23194450 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagagat 23194485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 2357491 - 2357726
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | || ||||| || ||||||    
T  2357491 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcaattaattgattgggaaatcatcgattaaatgaaccaatcgactttgtg 2357590  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   | | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| |||    
T  2357591 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagttcattagaaatcacgacatcatttggacacaaatgatgttgttgagtgattgtgataatatcg 2357690  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||    
T  2357691 tttaaaaagttagaatccgttatttgatcgtgagat 2357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 236
Target Start/End: Original strand, 27104326 - 27104537
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaa----tcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    | | ||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  27104326 tttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttggatcaattaacatatagattgagaaatcgtcgattaaatgatccaatcgactttgtgatcgt 27104425  T
Q  126 ttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgttta 224  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||    
T  27104426 ttaaatagtttgggaaatcgacatttaaatgatcccttcgaaataacgatatgatttggacatgaatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgttta 27104525  T
Q  225 aaaagctagaat 236  Q
    || |||||||||    
T  27104526 aatagctagaat 27104537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 26335439 - 26335562
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||| || ||||||    
T  26335439 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttatgggtcgtttaataggtttggaaatcgtcaattaaatgatccaatcgactttgtg 26335538  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcg 144  Q
    || |||||||||||| || |||||    
T  26335539 atagtttaaatgtttggggaatcg 26335562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 256
Target Start/End: Original strand, 23394099 - 23394135
Alignment:
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23394099 gtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 23394135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17404811 - 17404747
Alignment:
Q  178 atttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgtta 242  Q
    |||| |||| |||| || |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17404811 atttagacatgaataatgttgttgagtgattgtgataatatcgattaaaaagctagaatccgtta 17404747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24899594 - 24899554
Alignment:
Q  188 gaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaa 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  24899594 gaatgatattgtcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaa 24899554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24906060 - 24906020
Alignment:
Q  188 gaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaa 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  24906060 gaatgatattgtcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaa 24906020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12319 - 12084
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  12319 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 12220  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |    
T  12219 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcaagtgattgtgataatatag 12120  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12119 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 12084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15805 - 15570
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  15805 atgttaatatttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 15706  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  15705 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 15606  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15605 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 15570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12035 - 11800
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  12035 atgttaatatttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatctactttgtg 11936  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |    
T  11935 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgacgagtgattgtgataatatag 11836  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11835 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 11800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28730 - 28495
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  28730 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 28631  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  28630 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 28531  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28530 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 28495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 9073 - 9308
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  9073 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 9172  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  9173 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtctaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9272  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9273 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagat 9308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 12525 - 12760
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  12525 atgttaatatttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 12624  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |    
T  12625 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgacgagtgattgtgataatatag 12724  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12725 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 12760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25481 - 25246
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  25481 atgttaatatttgataatcacttttaatctagtacttaatgcttttgggtaaattaatcggtttggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 25382  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  25381 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 25282  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25281 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 25246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 116399 - 116164
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  116399 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 116300  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  116299 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattg 116200  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  116199 tttaaaaagttagaatccgttaattgatcgagagat 116164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 169226 - 169004
Alignment:
Q  34 ataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgt 133  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  169226 ataatcactttaaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttttgatcgtttaaatgt 169127  T
Q  134 ttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctag 233  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  169126 ttggaaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaacgatattatcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctag 169027  T
Q  234 aatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  169026 aatccgttaatcgatcgagagat 169004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 76283 - 76048
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  76283 atgttaatatttgataatcacttttaatctacgacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtg 76184  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  76183 atcgtttaaatcattgggaaatcgttgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtctagtgattgtgataatatcg 76084  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  76083 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagat 76048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 815 - 599
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  815 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgattttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 716  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |      
T  715 attgttttaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattt 616  T
Q  221 tttaaaaagctagaatc 237  Q
    |||||||||||||||||    
T  615 tttaaaaagctagaatc 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 7062 - 7297
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||    ||||||| || ||||||    
T  7062 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaattggttggaaaatcgtcgattaagttatccaatcgactttgtg 7161  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  7162 atcttttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatag 7261  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7262 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagat 7297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16304 - 16069
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  16304 atgttaatctttgataatcatttttaatctagaacttaatgcttttggatcgattaatagattgggaaatcatcgattaaacgatccaatcgactttgtg 16205  T
Q  121 atcgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  16204 atcgtttaaatagtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgttgagtgattgtgataa-ttc 16106  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  16105 gtttaaaaaggtagaatccgttatttgatcgagagat 16069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35155 - 34919
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||    
T  35155 atgttaatatttgataatcacttttaaatctagaacttaatgctttttggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgt 35056  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttc 219  Q
    |||  |||||  |||| |||||||||  ||||||   ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |     
T  35055 gattatttaatagtttgggaaatcgacttttaaatagtccattagaaatcacaacatcatttggacacgaatgatgttgtttagtgattgtgataatatt 34956  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  34955 gtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagat 34919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 14516 - 14750
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  14516 atgttaatatttgataatcactttaaatcaagagcttaatgcttttggatcgtttaatagattggaaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 14615  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatttcg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  |||||| | ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||    
T  14616 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttaaatggtccattataaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcg-agaattgtgataatatcg 14714  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14715 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagat 14750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5107 - 4942
Alignment:
Q  92 gtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaat 191  Q
    |||||||| || |||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107 gtcgattaaactatccaatcaactttgtgaacgtttaaatgttaaggaaatcgatgtttaaatgacctcttagaaataacgatatcatttggacacgaat 5008  T
Q  192 gatattgtcgaatgattgtgataatttcgttta-aaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  5007 gatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagat 4942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 256
Target Start/End: Original strand, 7255 - 7322
Alignment:
Q  189 aatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7255 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagat 7322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 256
Target Start/End: Original strand, 7265 - 7332
Alignment:
Q  189 aatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7265 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagat 7332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0152 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0152
Description:

Target: scaffold0152; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 256
Target Start/End: Original strand, 24876 - 24943
Alignment:
Q  189 aatgatattgtcgaatgattgtgataatttcgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagat 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24876 aatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaaactgttaattgatcgagagat 24943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 7363 - 7409
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7363 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 11977 - 12023
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11977 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 12023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 9972 - 10018
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9972 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 10018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7090 - 7014
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgat 105  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||| |||| ||||||||||    
T  7090 tttggtaatcactttgtaatcaagaacttaatgctattggatcgtttaatagattgagaaaacgtcaattagacgat 7014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University