View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16516_high_24 (Length: 219)

Name: NF16516_high_24
Description: NF16516
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16516_high_24
NF16516_high_24
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (18-202)||(37184734-37184918)
chr3 (18-204)||(35566411-35566597)
chr3 (20-204)||(14451681-14451865)
chr3 (18-204)||(1733093-1733279)
chr3 (18-204)||(16063562-16063748)
chr3 (18-204)||(16419403-16419589)
chr3 (18-204)||(26826114-26826300)
chr3 (29-204)||(8346449-8346624)
chr3 (29-204)||(9530389-9530564)
chr3 (27-204)||(19928311-19928488)
chr3 (29-182)||(11811932-11812085)
chr3 (30-187)||(4786473-4786628)
chr3 (30-204)||(4801294-4801466)
chr3 (20-204)||(34799628-34799800)
chr3 (29-138)||(10414060-10414169)
chr3 (107-204)||(15104270-15104367)
chr3 (20-114)||(4882854-4882948)
chr3 (20-114)||(8279153-8279247)
chr3 (20-114)||(8291314-8291408)
chr3 (20-114)||(8307963-8308057)
chr3 (20-114)||(11261164-11261258)
chr3 (20-114)||(18046613-18046707)
chr3 (20-114)||(18062676-18062770)
chr3 (20-114)||(22641610-22641704)
chr3 (27-102)||(4684356-4684431)
chr3 (27-114)||(18002968-18003055)
chr3 (20-102)||(5647158-5647240)
chr3 (27-102)||(4694440-4694515)
chr3 (27-114)||(10600616-10600703)
chr3 (20-102)||(5662581-5662662)
chr3 (20-114)||(8226839-8226933)
chr3 (20-114)||(15730790-15730884)
chr3 (20-114)||(15745875-15745969)
chr3 (30-114)||(1999619-1999703)
chr3 (133-204)||(10422983-10423054)
chr3 (29-114)||(3392300-3392383)
chr3 (34-114)||(9722119-9722197)
chr3 (34-114)||(4445422-4445500)
chr3 (34-114)||(4449585-4449663)
chr3 (34-114)||(4888835-4888913)
chr3 (34-114)||(28012991-28013069)
chr3 (34-114)||(28359789-28359867)
chr3 (34-114)||(35876128-35876206)
chr3 (61-114)||(19273859-19273912)
chr3 (34-114)||(35891198-35891276)
chr3 (140-181)||(11812070-11812111)
chr3 (30-114)||(18326261-18326342)
chr3 (30-114)||(18341360-18341441)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (21-204)||(30913056-30913239)
chr5 (18-204)||(25504160-25504346)
chr5 (19-204)||(570796-570981)
chr5 (18-204)||(18083807-18083993)
chr5 (18-204)||(34496980-34497166)
chr5 (19-204)||(15494638-15494823)
chr5 (18-204)||(35871408-35871595)
chr5 (29-204)||(35396495-35396670)
chr5 (30-204)||(23722597-23722771)
chr5 (19-169)||(16682591-16682741)
chr5 (29-204)||(29881919-29882082)
chr5 (20-114)||(20193725-20193819)
chr5 (27-114)||(3943848-3943935)
chr5 (27-114)||(24692834-24692921)
chr5 (20-114)||(32449540-32449634)
chr5 (27-102)||(30930036-30930111)
chr5 (27-102)||(30956919-30956994)
chr5 (29-114)||(18061655-18061740)
chr5 (30-114)||(22347536-22347620)
chr5 (30-114)||(22445611-22445695)
chr5 (34-124)||(11545786-11545874)
chr5 (34-124)||(11559845-11559933)
chr5 (34-114)||(33772951-33773029)
chr5 (34-114)||(33787903-33787981)
chr5 (34-114)||(41301536-41301614)
chr5 (34-114)||(23430740-23430817)
chr5 (34-114)||(37650954-37651033)
chr5 (30-114)||(22988489-22988570)
chr5 (30-114)||(23003556-23003637)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (18-204)||(166634-166820)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (18-204)||(16264315-16264501)
chr8 (18-204)||(16272901-16273087)
chr8 (18-204)||(19650436-19650622)
chr8 (18-204)||(19661481-19661667)
chr8 (18-204)||(30367198-30367384)
chr8 (19-204)||(29036783-29036968)
chr8 (18-204)||(24461348-24461534)
chr8 (20-204)||(14552984-14553168)
chr8 (20-204)||(14573808-14573992)
chr8 (29-204)||(14359474-14359649)
chr8 (20-204)||(19698497-19698682)
chr8 (39-204)||(15210369-15210534)
chr8 (27-204)||(555503-555680)
chr8 (19-169)||(12480033-12480183)
chr8 (27-204)||(19906523-19906700)
chr8 (18-168)||(22143310-22143461)
chr8 (30-204)||(18801010-18801182)
chr8 (19-135)||(23079208-23079324)
chr8 (27-114)||(5516484-5516571)
chr8 (20-114)||(16254418-16254512)
chr8 (27-114)||(2141999-2142086)
chr8 (29-114)||(28262901-28262986)
chr8 (30-114)||(21337322-21337406)
chr8 (30-114)||(21377283-21377367)
chr8 (27-114)||(18786539-18786626)
chr8 (27-103)||(2126841-2126917)
chr8 (29-114)||(27598574-27598657)
chr8 (29-114)||(27613626-27613709)
chr8 (34-114)||(31339637-31339715)
chr8 (61-114)||(33242278-33242331)
chr8 (61-114)||(33271622-33271675)
chr8 (61-114)||(14025297-14025350)
chr8 (61-102)||(15324416-15324457)
chr8 (61-102)||(15504785-15504826)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (18-204)||(40794873-40795059)
chr2 (24-204)||(27687791-27687971)
chr2 (19-204)||(37870322-37870507)
chr2 (18-205)||(32236635-32236822)
chr2 (19-203)||(13065007-13065191)
chr2 (20-204)||(17632435-17632619)
chr2 (19-204)||(27424092-27424277)
chr2 (19-204)||(27439136-27439321)
chr2 (29-204)||(39885511-39885686)
chr2 (29-204)||(39901087-39901262)
chr2 (18-169)||(26265700-26265851)
chr2 (18-169)||(26620370-26620521)
chr2 (27-114)||(12650934-12651021)
chr2 (27-114)||(12665855-12665942)
chr2 (19-104)||(24045211-24045296)
chr2 (30-114)||(39757378-39757462)
chr2 (27-114)||(34306406-34306493)
chr2 (20-114)||(28269507-28269601)
chr2 (27-114)||(34263607-34263694)
chr2 (30-114)||(28877595-28877679)
chr2 (30-114)||(28892805-28892889)
chr2 (19-114)||(20831483-20831575)
chr2 (34-114)||(23121413-23121491)
chr2 (30-114)||(4727324-4727405)
chr2 (30-114)||(15713535-15713616)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (29-204)||(16561942-16562117)
chr6 (19-204)||(31541468-31541653)
chr6 (18-204)||(7585078-7585264)
chr6 (18-204)||(20216941-20217127)
chr6 (18-204)||(22110963-22111149)
chr6 (20-204)||(24874107-24874292)
chr6 (29-204)||(27646487-27646662)
chr6 (30-204)||(27029740-27029914)
chr6 (20-204)||(24852081-24852266)
chr6 (30-204)||(26995418-26995593)
chr6 (61-204)||(16767606-16767749)
chr6 (27-114)||(18815035-18815122)
chr6 (27-114)||(19900609-19900696)
chr6 (20-114)||(3043473-3043567)
chr6 (27-114)||(15402080-15402167)
chr6 (27-114)||(15413867-15413954)
chr6 (27-114)||(15429460-15429547)
chr6 (19-114)||(22923858-22923953)
chr6 (19-114)||(22939570-22939665)
chr6 (19-114)||(23862015-23862110)
chr6 (20-102)||(34471403-34471485)
chr6 (107-204)||(29628221-29628318)
chr6 (30-113)||(26984518-26984601)
chr6 (30-113)||(27035581-27035664)
chr6 (29-114)||(12621360-12621445)
chr6 (30-123)||(18940370-18940463)
chr6 (30-114)||(13288704-13288788)
chr6 (30-114)||(13303671-13303755)
chr6 (30-114)||(24295325-24295409)
chr6 (30-114)||(24309343-24309427)
chr6 (107-204)||(30969279-30969376)
chr6 (34-114)||(32781123-32781201)
chr6 (159-204)||(27292874-27292919)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (18-204)||(39862221-39862407)
chr7 (18-204)||(4948274-4948460)
chr7 (18-204)||(39150804-39150990)
chr7 (19-204)||(14929886-14930071)
chr7 (19-204)||(35971883-35972068)
chr7 (19-204)||(35993295-35993480)
chr7 (21-204)||(15918740-15918923)
chr7 (22-204)||(18623078-18623260)
chr7 (18-204)||(6178798-6178984)
chr7 (18-204)||(18429871-18430057)
chr7 (29-204)||(30308328-30308503)
chr7 (30-204)||(5801962-5802136)
chr7 (18-204)||(18459600-18459786)
chr7 (18-204)||(14225551-14225725)
chr7 (30-204)||(18137682-18137854)
chr7 (20-114)||(15353421-15353515)
chr7 (27-102)||(5246190-5246265)
chr7 (27-114)||(11361210-11361297)
chr7 (20-114)||(2149963-2150057)
chr7 (20-114)||(2165174-2165268)
chr7 (20-114)||(4186253-4186347)
chr7 (20-114)||(20592646-20592740)
chr7 (27-114)||(13736218-13736305)
chr7 (27-114)||(2968845-2968932)
chr7 (27-114)||(10921521-10921608)
chr7 (29-114)||(11414454-11414539)
chr7 (29-102)||(11429450-11429523)
chr7 (34-114)||(18539097-18539175)
chr7 (34-114)||(18549606-18549684)
chr7 (61-114)||(36879208-36879261)
chr7 (19-114)||(18626931-18627023)
chr7 (29-114)||(5123657-5123739)
chr7 (29-114)||(5158610-5158692)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (18-204)||(4865500-4865686)
chr4 (18-204)||(34271724-34271910)
chr4 (18-204)||(40464110-40464296)
chr4 (19-204)||(18027686-18027871)
chr4 (18-190)||(6557337-6557509)
chr4 (18-204)||(15196199-15196385)
chr4 (19-204)||(40562930-40563115)
chr4 (30-204)||(20308793-20308967)
chr4 (20-114)||(9247838-9247932)
chr4 (27-114)||(13441035-13441122)
chr4 (27-114)||(14658802-14658889)
chr4 (20-102)||(19639632-19639714)
chr4 (27-114)||(14657048-14657135)
chr4 (27-114)||(14675482-14675569)
chr4 (30-114)||(17009408-17009492)
chr4 (30-102)||(17023373-17023445)
chr4 (34-114)||(22111626-22111704)
chr4 (71-114)||(30278295-30278338)
chr4 (158-204)||(22111551-22111597)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (29-204)||(20321367-20321542)
chr1 (18-204)||(18598023-18598209)
chr1 (19-204)||(24654767-24654952)
chr1 (18-204)||(21645335-21645521)
chr1 (20-114)||(21481477-21481571)
chr1 (27-114)||(18293509-18293596)
chr1 (27-114)||(18289106-18289193)
chr1 (61-111)||(21505743-21505793)
chr1 (30-114)||(47662898-47662979)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (18-204)||(31971-32157)
[»] scaffold1704 (1 HSPs)
scaffold1704 (19-204)||(570-755)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (19-187)||(18200-18368)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (20-114)||(20593-20687)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (27-114)||(11546-11633)
scaffold0089 (20-114)||(51766-51860)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (29-114)||(5266-5351)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (65-198)||(25250-25384)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (20-114)||(72864-72958)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (24-113)||(11780-11869)
[»] scaffold1665 (1 HSPs)
scaffold1665 (30-114)||(104-188)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (33-114)||(13496-13577)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (18-69)||(9968-10019)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (34-114)||(4908-4987)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37184918 - 37184734
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37184918 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 37184819  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaa 202  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37184818 cacacaccacacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaa 37184734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35566597 - 35566411
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35566597 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 35566498  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  35566497 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 35566411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14451865 - 14451681
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcg 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  14451865 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtagaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgca 14451766  T
Q  120 cacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14451765 cacaccccacatagatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 14451681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1733279 - 1733093
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1733279 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataaatgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 1733180  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  1733179 cacacaccccacatggatcttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 1733093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16063748 - 16063562
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16063748 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 16063649  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16063648 cacacaccccacatagatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 16063562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16419589 - 16419403
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16419589 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataatggatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 16419490  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16419489 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattaggggatgtatgcttagatgtatgcttaggttttataacacttagacaaaaa 16419403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26826300 - 26826114
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26826300 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 26826201  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  26826200 cacacatcccatatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacacttagacaaaaa 26826114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 8346449 - 8346624
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  8346449 cttgcaagaccatagaatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacacacccca 8346548  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8346549 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 8346624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 9530389 - 9530564
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9530389 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgaccaccgacacatgcacacacccca 9530488  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9530489 catggatattctagatgcatgattaggcaatgtatgtttagatgtatgcttaggttctataatgcttagacaaaaa 9530564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 19928311 - 19928488
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19928311 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccc 19928410  T
Q  127 cacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  19928411 cacacggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 19928488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 182
Target Start/End: Original strand, 11811932 - 11812085
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11811932 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacacccca 11812031  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttagg 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  11812032 catggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgcttagatgcatgattagg 11812085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4786628 - 4786473
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4786628 ttgcaagaccatagaatgtaactaggaca--atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccac 4786531  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggtttta 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4786530 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcctaggtttta 4786473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4801466 - 4801294
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4801466 ttgcaagaccatagaatgtaactaggaca--atgtaaatgactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccac 4801369  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||||    
T  4801368 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcctaggttttacaacgcttagaccaaaa 4801294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34799800 - 34799628
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcg 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            ||||     
T  34799800 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcactgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac------------atgca 34799713  T
Q  120 cacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  34799712 cacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatatatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 34799628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 10414060 - 10414169
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||    
T  10414060 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacaaaagcaccgacacatgcacacacccca 10414159  T
Q  129 catggatatt 138  Q
    ||||||||||    
T  10414160 catggatatt 10414169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 15104270 - 15104367
Alignment:
Q  107 accgacacatgcgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15104270 accgacacatgcacacaccccacatggatattctagatttatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 15104367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 4882854 - 4882948
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  4882854 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 4882948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8279247 - 8279153
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  8279247 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 8279153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 8291314 - 8291408
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8291314 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 8291408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8308057 - 8307963
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  8308057 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 8307963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11261258 - 11261164
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  11261258 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 11261164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 18046613 - 18046707
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18046613 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 18046707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 18062676 - 18062770
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18062676 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 18062770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22641704 - 22641610
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22641704 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 22641610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 4684356 - 4684431
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4684356 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 4684431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 18002968 - 18003055
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18002968 tccttgcaagaccatatcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 18003055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 5647158 - 5647240
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5647158 ttttaattccttgcaagaccatagcttgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 5647240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 4694440 - 4694515
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4694440 tcctttcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 4694515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 10600616 - 10600703
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10600616 tccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 10600703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 5662581 - 5662662
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5662581 ttttaattccttgcaa-accatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 5662662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8226933 - 8226839
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  8226933 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggattcaatgtaaaggactatggacactataaatgatgtacaccgacacaagcaccgacac 8226839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15730884 - 15730790
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15730884 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggattcaatgtaaaggactatggacgctataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 15730790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15745969 - 15745875
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15745969 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggattcaatgtaaaggactatggacgctataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 15745875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 1999619 - 1999703
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  1999619 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 1999703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Original strand, 10422983 - 10423054
Alignment:
Q  133 gatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  10422983 gatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggctttacaacgcttagacaaaaa 10423054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 3392300 - 3392383
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3392300 cttgcaagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 3392383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9722197 - 9722119
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9722197 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacgagcaccgacac 9722119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 4445422 - 4445500
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4445422 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 4445500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 4449585 - 4449663
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4449585 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 4449663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 4888835 - 4888913
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4888835 aagaccataacatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 4888913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 28012991 - 28013069
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28012991 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatgaacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 28013069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 28359789 - 28359867
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  28359789 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacatcgacacaagcaccgacac 28359867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 35876128 - 35876206
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  35876128 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacactgacacaagcaccgacac 35876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 114
Target Start/End: Original strand, 19273859 - 19273912
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  19273859 atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 19273912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 35891198 - 35891276
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  35891198 aagaccatatcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacactgacacaagcaccgacac 35891276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 11812070 - 11812111
Alignment:
Q  140 tagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11812070 tagatgcatgattagggaatgtatgcttagatgtatgcttag 11812111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 18326261 - 18326342
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  18326261 ttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 18326342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 18341360 - 18341441
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  18341360 ttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 18341441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30913239 - 30913056
Alignment:
Q  21 tttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  30913239 tttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcac 30913140  T
Q  121 acaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30913139 acaccccacgtggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgtttagacaaaaa 30913056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25504346 - 25504160
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25504346 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 25504247  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  25504246 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 25504160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 570981 - 570796
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  570981 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatac 570882  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  570881 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 570796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 18083807 - 18083993
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18083807 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 18083906  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  18083907 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgtttaggttttacaacgcttagacaaaaa 18083993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34497166 - 34496980
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34497166 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactacggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 34497067  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||    
T  34497066 cacacacctcacatggatattctagatgcataattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttaggcaaaaa 34496980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 15494638 - 15494823
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15494638 cttttaattctttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 15494737  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  15494738 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 15494823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35871595 - 35871408
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35871595 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 35871496  T
Q  118 cgcaca-ccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  35871495 cacacacccccacatggatattctagatgcatgattaggggatgtatgcttagatgtatgcttaggttttataacacttagacaaaaa 35871408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35396670 - 35396495
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35396670 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacacccca 35396571  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  35396570 catggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgcttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 35396495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23722771 - 23722597
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23722771 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccac 23722672  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  23722671 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtctgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 23722597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 16682591 - 16682741
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16682591 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 16682690  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttag 169  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16682691 acacaccccacatggatgttctagatgcatgactagggaatgtatgcttag 16682741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29882082 - 29881919
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||            |||| |||||||||    
T  29882082 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaatgactatggacactataagtgatgtacaccgacac------------atgcacacacccca 29881995  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29881994 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 29881919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20193819 - 20193725
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20193819 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 20193725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 3943848 - 3943935
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  3943848 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 3943935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24692921 - 24692834
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  24692921 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 24692834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 32449634 - 32449540
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  32449634 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 32449540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 30930036 - 30930111
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30930036 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 30930111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 30956919 - 30956994
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30956919 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 30956994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18061740 - 18061655
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18061740 cttgcaagaccatagcatgtatttaggattcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 18061655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 22347536 - 22347620
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22347536 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 22347620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 22445611 - 22445695
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22445611 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 22445695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 11545786 - 11545874
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacac 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  11545786 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacacac 11545874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 11559845 - 11559933
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacac 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  11559845 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacacac 11559933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 33772951 - 33773029
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33772951 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 33773029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 33787903 - 33787981
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33787903 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 33787981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 41301536 - 41301614
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41301536 aagaccatagaatgtaattaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 41301614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23430817 - 23430740
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23430817 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatg-acattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 23430740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 37650954 - 37651033
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaa-ggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||| |||||| ||||||   ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  37650954 aagaccatagaatgtatctaggaca--atgtaaaaggaccatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 37651033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22988570 - 22988489
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  22988570 ttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 22988489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23003637 - 23003556
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  23003637 ttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 23003556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 166634 - 166820
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  166634 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 166733  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  166734 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 166820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 16264315 - 16264501
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16264315 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 16264414  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16264415 cacacacctcacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 16264501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 16272901 - 16273087
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16272901 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 16273000  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16273001 cacacacctcacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 16273087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19650622 - 19650436
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19650622 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 19650523  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  19650522 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 19650436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19661667 - 19661481
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19661667 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 19661568  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  19661567 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 19661481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30367384 - 30367198
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30367384 tcttttaaatccttacaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 30367285  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  30367284 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 30367198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 29036783 - 29036968
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29036783 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataactgatgtacaccgacacgagcaccgacgcatgc 29036882  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  29036883 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 29036968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24461534 - 24461348
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24461534 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttgggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 24461435  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24461434 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttagattttataacgcttagacaaaaa 24461348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 14552984 - 14553168
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcg 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14552984 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgca 14553083  T
Q  120 cacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  14553084 cacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 14553168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 14573808 - 14573992
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcg 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14573808 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgca 14573907  T
Q  120 cacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  14573908 cacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 14573992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14359649 - 14359474
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  14359649 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacacacccca 14359550  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14359549 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgcatgcttaagttttataatgcttagacaaaaa 14359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 19698497 - 19698682
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaa-ggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19698497 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 19698596  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  19698597 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcctaggttttacaacgcttagacaaaaa 19698682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 204
Target Start/End: Original strand, 15210369 - 15210534
Alignment:
Q  39 catagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccacatggatatt 138  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15210369 catagcatgtatctaggagtcaatgtaaaggactatggacactataagcgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccacatggatgtt 15210468  T
Q  139 ctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15210469 ctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 15210534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 555503 - 555680
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccc 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  555503 tccttgcaagaccatagtatgtatttaggactcaatgtaaaggattatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccc 555602  T
Q  127 cacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||||    
T  555603 cacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggctttacaacgcttagaccaaaa 555680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12480183 - 12480033
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12480183 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 12480084  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttag 169  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480083 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttag 12480033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19906700 - 19906523
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccc 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  19906700 tccttgcaggaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacgtgcacacaccc 19906601  T
Q  127 cacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  19906600 cacacggatgttctaaatgcatgattagggaatgaatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 19906523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 22143310 - 22143461
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22143310 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 22143409  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattaggg-aatgtatgttta 168  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22143410 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggcaatgtctgttta 22143461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 18801010 - 18801182
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18801010 ttgcaagaccatagaatgtaactaggaca--atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccac 18801107  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  18801108 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcctaggttttacaacgcttagacaaaaa 18801182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 23079208 - 23079324
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23079208 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 23079307  T
Q  119 gcacaccccacatggat 135  Q
     ||||||||||||||||    
T  23079308 acacaccccacatggat 23079324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5516571 - 5516484
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5516571 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatataaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 5516484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16254512 - 16254418
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  16254512 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaagactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 16254418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2142086 - 2141999
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  2142086 tccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagcgatgtacaccgacacaagcaccgacac 2141999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 28262901 - 28262986
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  28262901 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 28262986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21337406 - 21337322
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21337406 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 21337322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21377367 - 21377283
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21377367 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 21377283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18786626 - 18786539
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18786626 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcagtgtaaaggactatggacgctataagagatgtacaccgacacaagcaccgacac 18786539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2126917 - 2126841
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2126917 tccttgcaagaccatagcatgtatctagaactcaatgtaaaggactatggacactataagcgatgtacaccgacacg 2126841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27598657 - 27598574
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27598657 cttgcaagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 27598574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27613709 - 27613626
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27613709 cttgcaagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 27613626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31339715 - 31339637
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  31339715 aagaccataacatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccaacacaagcaccgacac 31339637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 114
Target Start/End: Original strand, 33242278 - 33242331
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  33242278 atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 33242331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 114
Target Start/End: Original strand, 33271622 - 33271675
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  33271622 atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 33271675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14025350 - 14025297
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  14025350 atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacactgacacaagcaccgacac 14025297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 15324416 - 15324457
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15324416 atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 15324457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 102
Target Start/End: Original strand, 15504785 - 15504826
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15504785 atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 15504826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 40794873 - 40795059
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40794873 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 40794972  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  40794973 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 40795059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 27687791 - 27687971
Alignment:
Q  24 aaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcaca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27687791 aaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacaca 27687890  T
Q  124 ccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27687891 ccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaatgcttagacaaaaa 27687971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37870507 - 37870322
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37870507 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 37870408  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  37870407 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 37870322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32236822 - 32236635
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32236822 tcttttaaattcttgcaagactatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 32236723  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaac 205  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  32236722 cacataccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaac 32236635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 13065007 - 13065191
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13065007 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 13065106  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaa 203  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13065107 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttagaacgcttagacaaaa 13065191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 17632435 - 17632619
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcg 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  17632435 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgatacatgca 17632534  T
Q  120 cacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17632535 cacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 17632619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27424277 - 27424092
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27424277 cttttaattccttgcaagaacataccatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 27424178  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  27424177 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgtttaggttttacaacgcttagacaaaaa 27424092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27439321 - 27439136
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27439321 cttttaattccttgcaagaacataccatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 27439222  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  27439221 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgtttaggttttacaacgcttagacaaaaa 27439136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 39885511 - 39885686
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39885511 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacacccca 39885610  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||||    
T  39885611 catggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggctttacaacgcttagaccaaaa 39885686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 39901087 - 39901262
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39901087 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacacccca 39901186  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| ||||    
T  39901187 catggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggctttacaacgcttagaccaaaa 39901262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26265851 - 26265700
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26265851 tcttttaaattcttgcaagaccataacatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 26265752  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttag 169  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26265751 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttag 26265700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26620521 - 26620370
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26620521 tcttttaaattcttgcaagactatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 26620422  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttag 169  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26620421 cacacatcccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttag 26620370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 12650934 - 12651021
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12650934 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 12651021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 12665855 - 12665942
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12665855 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 12665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 104
Target Start/End: Original strand, 24045211 - 24045296
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacga 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24045211 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacga 24045296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 39757378 - 39757462
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39757378 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 39757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34306493 - 34306406
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  34306493 tccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcgatgtaaaggactatggacgctataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 34306406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28269601 - 28269507
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  28269601 ttttaattccttgcaagaccatagcatatatttaggattcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 28269507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34263694 - 34263607
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  34263694 tccttgaaagaccatagcatgtatctaggactcgatgtaaaggactatggacgctataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 34263607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 28877595 - 28877679
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28877595 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaagggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 28877679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 28892805 - 28892889
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28892805 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaagggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 28892889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 20831483 - 20831575
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||   |  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20831483 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggacaatggactct---aatgatgtacaccgacacaagcaccgacac 20831575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 23121413 - 23121491
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23121413 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 23121491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4727405 - 4727324
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  4727405 ttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 4727324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15713616 - 15713535
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  15713616 ttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 15713535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 16561942 - 16562117
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16561942 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacacccca 16562041  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16562042 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 16562117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 31541468 - 31541653
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31541468 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 31541567  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  31541568 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 31541653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 7585078 - 7585264
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7585078 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 7585177  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  7585178 cacacaccccacatggatgttctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 7585264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 20216941 - 20217127
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20216941 tcttttaaatttttgcaagaccatagaatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 20217040  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20217041 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaatgcttagacaaaaa 20217127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 22110963 - 22111149
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22110963 tcttttaaatttttgcaagaccatagaatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 22111062  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22111063 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaatgcttagacaaaaa 22111149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 24874107 - 24874292
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcga-tgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24874107 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccaacacgagcaccgacacatgc 24874206  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  24874207 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 24874292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 27646487 - 27646662
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27646487 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacacccca 27646586  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  27646587 catggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgcttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 27646662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 27029740 - 27029914
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27029740 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccac 27029839  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  27029840 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcctaggttttacaacgcttagacaaaaa 27029914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 24852081 - 24852266
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcga-tgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24852081 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccaacacgagcaccgacacatgc 24852180  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  24852181 acacaccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacgacgcttagacaaaaa 24852266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 26995418 - 26995593
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26995418 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccac 26995517  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatg-cttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||    
T  26995518 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgccttaggttttacaacgcttagacaaaaa 26995593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16767749 - 16767606
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16767749 atgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgatacatgcacacaccccacgtggatattctagatgcatgattagggaatg 16767650  T
Q  161 tatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16767649 tatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 16767606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18815122 - 18815035
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18815122 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 18815035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 19900696 - 19900609
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19900696 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 19900609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 3043473 - 3043567
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  3043473 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 3043567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15402167 - 15402080
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15402167 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 15402080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15413954 - 15413867
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15413954 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 15413867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15429547 - 15429460
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15429547 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 15429460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22923953 - 22923858
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  22923953 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtaatgtacaccgacacaagcaccgacac 22923858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22939665 - 22939570
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  22939665 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtaatgtacaccgacacaagcaccgacac 22939570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23862110 - 23862015
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  23862110 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtaatgtacaccgacacaagcaccgacac 23862015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34471485 - 34471403
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34471485 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 34471403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 29628221 - 29628318
Alignment:
Q  107 accgacacatgcgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29628221 accgacacatgcacacacctcacatgaatattctagatgcatgattagggaatgtatgcttagatgtatgcttaggtttaataatgcttagataaaaa 29628318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 26984518 - 26984601
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgaca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  26984518 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgaca 26984601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 27035581 - 27035664
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgaca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  27035581 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgaca 27035664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 12621360 - 12621445
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  12621360 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaagactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 12621445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 18940370 - 18940463
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcaca 123  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  18940370 ttgcaagaccatagaatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacaca 18940463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13288788 - 13288704
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13288788 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 13288704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13303755 - 13303671
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13303755 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 13303671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24295409 - 24295325
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24295409 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 24295325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24309427 - 24309343
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24309427 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 24309343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30969376 - 30969279
Alignment:
Q  107 accgacacatgcgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  30969376 accgacacatgcacacacctcacatggttattttagatgtatgattagggaatgtatgcttagatgtatgcttaggatttataatgcttagataaaaa 30969279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 32781201 - 32781123
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32781201 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacaccagcaccgacac 32781123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27292919 - 27292874
Alignment:
Q  159 tgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27292919 tgtatgcttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 27292874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39862407 - 39862221
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||    
T  39862407 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacatcgacacaagcaccgacacatg 39862308  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  39862307 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 39862221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 4948274 - 4948460
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4948274 tcttttaaattttcgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggactctataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 4948373  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4948374 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 4948460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 39150804 - 39150990
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39150804 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 39150903  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  39150904 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagagaatgtatgtttagatgtatgcctaggttttacaacgcttagacaaaaa 39150990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14930071 - 14929886
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14930071 cttttaattctttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 14929972  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  14929971 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 14929886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 35971883 - 35972068
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35971883 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacattataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 35971982  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  35971983 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgtttaggttttacaacgcttagacaaaaa 35972068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 35993295 - 35993480
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35993295 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacattataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 35993394  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  35993395 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgtttaggttttacaacgcttagacaaaaa 35993480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15918923 - 15918740
Alignment:
Q  21 tttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  15918923 tttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcac 15918824  T
Q  121 acaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  15918823 acaccccacatggatgttctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 15918740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 18623078 - 18623260
Alignment:
Q  22 ttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgca 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18623078 ttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcaca 18623177  T
Q  122 caccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18623178 caccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 18623260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 6178798 - 6178984
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6178798 tcttttaaatttttgcaagaccatagcatgtacctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 6178897  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6178898 cacacaccccacatggatatcctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 6178984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 18429871 - 18430057
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18429871 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacactgacacaagcaccgacacatg 18429970  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18429971 cacaccccccacatggatattctagatgcatgattagagaatgcatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 18430057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Original strand, 30308328 - 30308503
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  30308328 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacattataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacacacccca 30308427  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30308428 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttatatgcatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 30308503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5802136 - 5801962
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  5802136 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacacaccccac 5802037  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  5802036 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 5801962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18459786 - 18459600
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  18459786 tcttttaattactcgcaagaccatagcatgtatttaggactcgttgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcatcgacacatg 18459687  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18459686 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 18459600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14225725 - 14225551
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            |||||||    
T  14225725 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccg------------acacatg 14225638  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  14225637 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattaggggatgtatgcttagatgtatgcttaggttttataacacttagacaaaaa 14225551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 18137682 - 18137854
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacga-gtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||| ||    
T  18137682 ttgcaagaccatagaatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggactccctaatg-atgtacacagacacaaagcaccgacacatgcacacacctca 18137778  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18137779 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagataaaaa 18137854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15353515 - 15353421
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15353515 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 15353421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 5246190 - 5246265
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5246190 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 5246265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 11361210 - 11361297
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  11361210 tccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 11361297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 2149963 - 2150057
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  2149963 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 2150057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 2165174 - 2165268
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  2165174 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 2165268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 4186253 - 4186347
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  4186253 ttttaattccttgcaagaccataacatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 4186347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 20592646 - 20592740
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20592646 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggattcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 20592740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13736305 - 13736218
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13736305 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactattagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 13736218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 2968845 - 2968932
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  2968845 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatgaacattataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 2968932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10921608 - 10921521
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  10921608 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcagtgtaaaggactatggacgctataagcgatgtacaccgacacaagcaccgacac 10921521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11414539 - 11414454
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  11414539 cttgcaagcccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 11414454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11429523 - 11429450
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11429523 cttgcaagcccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 11429450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 18539097 - 18539175
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18539097 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacgagcaccgacac 18539175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Original strand, 18549606 - 18549684
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18549606 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacgagcaccgacac 18549684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36879261 - 36879208
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36879261 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 36879208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 18626931 - 18627023
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||   |  ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18626931 cttttaattccttgcaagaccgtagcatgtagttaggactcaatgtaaaggacaatggactct---aatgatgtacaccgacacaagcaccgacac 18627023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 5123657 - 5123739
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  5123657 cttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 5123739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 5158610 - 5158692
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  5158610 cttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 5158692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 4865500 - 4865686
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4865500 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 4865599  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  4865600 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataacacttagacaaaaa 4865686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 34271724 - 34271910
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34271724 tcttttaaatccttgcaagaccataacatgtatttaggactcgatgtgaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatg 34271823  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  34271824 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 34271910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40464296 - 40464110
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40464296 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 40464197  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  40464196 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 40464110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18027871 - 18027686
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18027871 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 18027772  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18027771 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 18027686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6557509 - 6557337
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6557509 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 6557410  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataa 190  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6557409 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattaggggatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataa 6557337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15196385 - 15196199
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  15196385 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggacttgatttaaaggactatggacactataagtgatgtacactgacacaagcaccgacgcatg 15196286  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15196285 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataacgcttagacaaaaa 15196199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 40562930 - 40563115
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40562930 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgaacaccgacacatgc 40563029  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  40563030 acacaccccacgtggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgtttaggttttacaacgcttagacaaaaa 40563115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Original strand, 20308793 - 20308967
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacaccccac 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20308793 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacgagcaccgacacatgcacacaccccac 20308892  T
Q  130 atggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  20308893 atggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgcttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 20308967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9247932 - 9247838
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  9247932 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 9247838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 13441035 - 13441122
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  13441035 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 13441122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14658889 - 14658802
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14658889 tccttgcatgaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 14658802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19639714 - 19639632
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19639714 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 19639632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 14657048 - 14657135
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  14657048 tcctcgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 14657135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 14675482 - 14675569
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  14675482 tcctcgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 14675569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 17009408 - 17009492
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  17009408 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 17009492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 102
Target Start/End: Original strand, 17023373 - 17023445
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacac 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17023373 ttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacac 17023445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22111704 - 22111626
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22111704 aagaccatagcatgtatctaggaca--atgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 22111626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 114
Target Start/End: Original strand, 30278295 - 30278338
Alignment:
Q  71 ctatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  30278295 ctatggacactataagggatgtccaccgacacaagcaccgacac 30278338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22111597 - 22111551
Alignment:
Q  158 atgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  22111597 atgtatgcttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 22111551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20321542 - 20321367
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgcgcacacccca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  20321542 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgcacacacccca 20321443  T
Q  129 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20321442 catggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgcttagacaaaaa 20321367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 18598023 - 18598209
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18598023 tcttttaaattcttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 18598122  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  18598123 cacacaccccacatggatattctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 18598209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 24654767 - 24654952
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24654767 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 24654866  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  24654867 acacatcccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 24654952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21645521 - 21645335
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  21645521 tcttttaaatactagcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacaag 21645422  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  21645421 cacacaccccacatggatattctagatgcatgattaggggatgtatgtttagatgtgtgcttaggttttataacacttagacaaaaa 21645335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 21481477 - 21481571
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21481477 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 21481571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 18293509 - 18293596
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  18293509 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 18293596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 18289106 - 18289193
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  18289106 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggtctcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacagaagcaccgacac 18289193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 111
Target Start/End: Original strand, 21505743 - 21505793
Alignment:
Q  61 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21505743 atgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacaagcaccga 21505793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 47662979 - 47662898
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || ||||||||    
T  47662979 ttgcaagaccatagaatgtatctagga--caatgtaaaggactatggactctctaa-taatgtacaccgacacaagcaccgacac 47662898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32157 - 31971
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32157 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatg 32058  T
Q  118 cgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  32057 cacacaccccacatggatatcctagatgtatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 31971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1704 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1704
Description:

Target: scaffold1704; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 570
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  755 cttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacattataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacacatgc 656  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttataatgtttagacaaaaa 204  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  655 acacgccccacatggatgttctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggttttacaacgcttagacaaaaa 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 18200 - 18368
Alignment:
Q  19 cttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacacatgc 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18200 cttttaatttcttgcaagaccatagcatgtatctaggactcgatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacacatgc 18299  T
Q  119 gcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggtttta 187  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18300 acacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtatgtttagatgtatgcttaggtttta 18368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20687 - 20593
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  20687 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 20593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11633 - 11546
Alignment:
Q  27 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  11633 tccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 51860 - 51766
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  51860 ttttaattccttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5351 - 5266
Alignment:
Q  29 cttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5351 cttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacac 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Original strand, 25250 - 25384
Alignment:
Q  65 aaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacga-gtaccgacacatgcgcacaccccacatggatattctagatgcatgattagggaatgtat 163  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||    
T  25250 aaaggactatggactctctaaataatgtacaccgacacgaagcaccgacacatgcacacacctcacatggttattttagatgtatgattagggggtgtat 25349  T
Q  164 gtttagatgtatgcttaggttttataatgtttaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25350 gtttagatgtatgcttaggtttcataatgcttaga 25384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 72958 - 72864
Alignment:
Q  20 ttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  72958 ttttaattccttgcaagaccatagcatatatttaggattcaatgtaaaggactatggacactataagtgatgtacaccgacacaagcaccgacac 72864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 11780 - 11869
Alignment:
Q  24 aaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgaca 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11780 aaatctttgcaagaccatagcatgtatctaggactcaatgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgaca 11869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1665 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1665
Description:

Target: scaffold1665; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 104
Alignment:
Q  30 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||    
T  188 ttgcaagaccatagcatgtatttaggactcaatgtaaaggactatggacactataagttttgtacaccgacacaagcaccgacac 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13577 - 13496
Alignment:
Q  33 caagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaaggactatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13577 caagaccatagcatgtatctagggctcaatgtaaaggactatggacattataagggatgtacaccgacacaagcaccgacac 13496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 9968 - 10019
Alignment:
Q  18 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaagg 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9968 tcttttaaatccttgcaagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaagg 10019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 4987 - 4908
Alignment:
Q  34 aagaccatagcatgtatttaggactcgatgtaaagg-actatggacactataagggatgtacaccgacacgagtaccgacac 114  Q
    |||||||||| |||||| ||||||   ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4987 aagaccatagaatgtatctaggaca--atgtaaagggaccatggacactataagtgatgtacaccgacacgagcaccgacac 4908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University