View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16521_low_6 (Length: 603)

Name: NF16521_low_6
Description: NF16521
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16521_low_6
NF16521_low_6
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (21-198)||(7883-8060)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (12-197)||(30055498-30055684)
chr7 (21-196)||(18797302-18797475)
chr7 (21-194)||(37109847-37110020)
chr7 (21-196)||(17842599-17842774)
chr7 (21-194)||(27283719-27283892)
chr7 (21-198)||(38258516-38258693)
chr7 (21-195)||(31579077-31579256)
chr7 (21-194)||(7334769-7334942)
chr7 (23-193)||(24211717-24211887)
chr7 (15-194)||(5657488-5657667)
chr7 (23-194)||(37346997-37347168)
chr7 (24-197)||(12390646-12390819)
chr7 (23-196)||(10481576-10481751)
chr7 (21-200)||(21991605-21991784)
chr7 (23-201)||(31520739-31520916)
chr7 (21-196)||(32821066-32821241)
chr7 (23-193)||(33688277-33688446)
chr7 (23-192)||(44413394-44413564)
chr7 (24-192)||(23111167-23111335)
chr7 (21-169)||(29173540-29173688)
chr7 (21-193)||(48928577-48928748)
chr7 (21-180)||(22687228-22687387)
chr7 (21-192)||(27421393-27421563)
chr7 (25-196)||(41765095-41765266)
chr7 (21-195)||(43686015-43686188)
chr7 (15-194)||(4582894-4583073)
chr7 (21-196)||(9355839-9356014)
chr7 (21-199)||(8861255-8861433)
chr7 (21-194)||(6546494-6546667)
chr7 (21-194)||(15612772-15612944)
chr7 (24-167)||(26980325-26980468)
chr7 (21-195)||(32432431-32432600)
chr7 (21-170)||(48928310-48928458)
chr7 (21-192)||(11071182-11071354)
chr7 (45-196)||(26524364-26524515)
chr7 (24-194)||(12165727-12165897)
chr7 (21-192)||(25691557-25691729)
chr7 (23-154)||(38053501-38053624)
chr7 (23-194)||(10359229-10359400)
chr7 (21-194)||(37704143-37704305)
chr7 (21-76)||(15672775-15672830)
chr7 (64-194)||(34362205-34362334)
chr7 (24-90)||(44598745-44598811)
chr7 (23-104)||(43925167-43925247)
chr7 (23-147)||(32593204-32593327)
chr7 (23-61)||(37703513-37703551)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (12-194)||(19089482-19089664)
chr4 (12-195)||(37663770-37663951)
chr4 (21-204)||(25701095-25701278)
chr4 (21-195)||(25184112-25184286)
chr4 (21-195)||(879586-879760)
chr4 (21-196)||(55477929-55478108)
chr4 (23-196)||(34361532-34361704)
chr4 (23-194)||(19440688-19440860)
chr4 (23-195)||(42199728-42199900)
chr4 (21-192)||(34948135-34948306)
chr4 (23-196)||(32912620-32912793)
chr4 (21-192)||(17173292-17173463)
chr4 (21-194)||(28003024-28003197)
chr4 (24-204)||(29584241-29584419)
chr4 (23-192)||(36493728-36493897)
chr4 (21-192)||(17167715-17167886)
chr4 (21-197)||(50764732-50764903)
chr4 (21-198)||(50697238-50697414)
chr4 (24-192)||(27396618-27396786)
chr4 (21-203)||(4597984-4598165)
chr4 (21-196)||(9139245-9139418)
chr4 (21-197)||(35021073-35021249)
chr4 (23-152)||(23761114-23761243)
chr4 (24-197)||(38011851-38012024)
chr4 (24-194)||(49375966-49376137)
chr4 (23-191)||(6864038-6864206)
chr4 (21-191)||(32592096-32592266)
chr4 (23-205)||(3042600-3042790)
chr4 (21-194)||(39397918-39398082)
chr4 (26-169)||(54499281-54499425)
chr4 (21-156)||(46888195-46888330)
chr4 (23-194)||(55241145-55241315)
chr4 (24-133)||(4934243-4934353)
chr4 (21-180)||(5048003-5048162)
chr4 (21-199)||(32579439-32579619)
chr4 (66-195)||(37287732-37287862)
chr4 (24-193)||(37775670-37775837)
chr4 (21-192)||(47253751-47253913)
chr4 (24-194)||(7703517-7703679)
chr4 (21-199)||(30002670-30002840)
chr4 (21-192)||(33341397-33341571)
chr4 (92-197)||(4205113-4205218)
chr4 (110-196)||(4396324-4396410)
chr4 (21-192)||(33816571-33816742)
chr4 (21-86)||(1815409-1815474)
chr4 (110-194)||(53124287-53124371)
chr4 (64-195)||(35025669-35025800)
chr4 (136-192)||(52516599-52516655)
chr4 (130-196)||(17272009-17272075)
chr4 (24-74)||(17272084-17272134)
chr4 (112-196)||(7152235-7152319)
chr4 (146-188)||(52195645-52195687)
chr4 (105-153)||(23518425-23518473)
chr4 (146-194)||(52102915-52102963)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (21-204)||(32267020-32267203)
chr1 (21-196)||(15382927-15383102)
chr1 (23-184)||(28564790-28564951)
chr1 (23-193)||(10922724-10922894)
chr1 (21-195)||(18422646-18422820)
chr1 (21-195)||(30254419-30254592)
chr1 (21-192)||(15752027-15752198)
chr1 (21-197)||(37618899-37619079)
chr1 (21-195)||(2959743-2959917)
chr1 (23-168)||(9903063-9903208)
chr1 (23-195)||(19899778-19899950)
chr1 (21-196)||(16415639-16415815)
chr1 (22-197)||(34012385-34012560)
chr1 (16-194)||(38823210-38823388)
chr1 (15-197)||(48620630-48620812)
chr1 (21-194)||(30326959-30327132)
chr1 (23-184)||(37451292-37451452)
chr1 (23-194)||(23999343-23999514)
chr1 (23-154)||(51128895-51129026)
chr1 (23-205)||(27763320-27763500)
chr1 (23-192)||(28769651-28769819)
chr1 (21-194)||(42721035-42721208)
chr1 (21-181)||(4330288-4330450)
chr1 (21-194)||(7079070-7079254)
chr1 (23-197)||(11742360-11742533)
chr1 (21-196)||(8222125-8222297)
chr1 (15-192)||(41926161-41926338)
chr1 (26-194)||(3309144-3309311)
chr1 (21-188)||(47279191-47279358)
chr1 (21-195)||(10182015-10182189)
chr1 (23-192)||(46931406-46931578)
chr1 (21-193)||(14758038-14758210)
chr1 (27-194)||(27267212-27267376)
chr1 (26-198)||(39393375-39393547)
chr1 (21-154)||(32216091-32216224)
chr1 (21-178)||(27532988-27533144)
chr1 (21-194)||(31621560-31621733)
chr1 (24-194)||(47682504-47682673)
chr1 (21-192)||(27563912-27564084)
chr1 (21-194)||(27227492-27227657)
chr1 (15-197)||(1547280-1547454)
chr1 (21-154)||(3534968-3535101)
chr1 (95-195)||(30254853-30254952)
chr1 (24-199)||(238523-238697)
chr1 (21-198)||(15168081-15168265)
chr1 (21-154)||(40884849-40884982)
chr1 (21-107)||(25160715-25160801)
chr1 (25-192)||(33725611-33725778)
chr1 (46-194)||(21289661-21289816)
chr1 (130-199)||(22170745-22170814)
chr1 (21-95)||(22170806-22170880)
chr1 (161-201)||(4964062-4964102)
chr1 (23-71)||(38759652-38759700)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (21-195)||(1150123-1150297)
chr8 (21-194)||(10555220-10555393)
chr8 (21-196)||(43643613-43643788)
chr8 (21-185)||(37970537-37970701)
chr8 (23-195)||(27082858-27083030)
chr8 (22-198)||(34894962-34895138)
chr8 (23-197)||(1204923-1205097)
chr8 (21-195)||(16446893-16447067)
chr8 (25-195)||(30654605-30654775)
chr8 (21-196)||(36694984-36695159)
chr8 (23-181)||(31933906-31934064)
chr8 (21-201)||(6098536-6098716)
chr8 (23-182)||(23854451-23854610)
chr8 (21-196)||(38643975-38644150)
chr8 (16-194)||(13307622-13307800)
chr8 (23-192)||(465843-466012)
chr8 (21-194)||(12876108-12876281)
chr8 (22-194)||(5299965-5300137)
chr8 (21-196)||(16222860-16223035)
chr8 (21-180)||(11727037-11727196)
chr8 (23-133)||(1149652-1149762)
chr8 (21-197)||(9864144-9864320)
chr8 (15-195)||(34952043-34952223)
chr8 (23-194)||(41362517-41362685)
chr8 (26-194)||(44869495-44869664)
chr8 (15-105)||(35459723-35459813)
chr8 (23-195)||(8803837-8803998)
chr8 (15-196)||(40862416-40862597)
chr8 (23-192)||(7890977-7891137)
chr8 (23-194)||(33906223-33906382)
chr8 (23-198)||(39099139-39099304)
chr8 (130-194)||(15009241-15009305)
chr8 (21-167)||(41911006-41911153)
chr8 (110-196)||(24823379-24823465)
chr8 (24-68)||(4132706-4132750)
chr8 (21-154)||(43025741-43025874)
chr8 (26-76)||(7998411-7998461)
chr8 (141-194)||(4133146-4133199)
chr8 (146-203)||(34685728-34685785)
chr8 (23-90)||(1954009-1954077)
chr8 (158-206)||(4108924-4108972)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (21-195)||(3655214-3655388)
chr3 (21-194)||(37203058-37203231)
chr3 (21-195)||(26941272-26941446)
chr3 (21-194)||(20373308-20373481)
chr3 (21-194)||(37157699-37157871)
chr3 (24-197)||(47481510-47481683)
chr3 (23-195)||(40552273-40552445)
chr3 (12-148)||(42506078-42506214)
chr3 (21-194)||(51212993-51213166)
chr3 (21-196)||(48354930-48355105)
chr3 (23-201)||(21009816-21009997)
chr3 (26-201)||(35844310-35844485)
chr3 (21-195)||(52040934-52041109)
chr3 (21-196)||(4761661-4761838)
chr3 (21-194)||(4015451-4015624)
chr3 (21-195)||(11466814-11466988)
chr3 (21-211)||(54828713-54828902)
chr3 (21-195)||(7327494-7327669)
chr3 (21-179)||(11357376-11357535)
chr3 (23-184)||(29099356-29099517)
chr3 (23-192)||(43975902-43976068)
chr3 (23-194)||(54505799-54505969)
chr3 (21-195)||(44186513-44186687)
chr3 (21-206)||(53229164-53229350)
chr3 (21-194)||(27480391-27480564)
chr3 (25-196)||(22450957-22451128)
chr3 (21-196)||(39282642-39282816)
chr3 (21-192)||(46297774-46297945)
chr3 (21-197)||(33378797-33378970)
chr3 (21-197)||(34132923-34133099)
chr3 (21-196)||(21193595-21193770)
chr3 (22-181)||(40935995-40936154)
chr3 (26-194)||(45174494-45174664)
chr3 (21-154)||(2007964-2008097)
chr3 (21-201)||(46994673-46994842)
chr3 (21-192)||(24708127-24708295)
chr3 (21-191)||(22446076-22446247)
chr3 (22-166)||(53176074-53176217)
chr3 (21-198)||(32373459-32373634)
chr3 (21-154)||(3362284-3362419)
chr3 (21-194)||(44891498-44891661)
chr3 (23-154)||(24488976-24489107)
chr3 (21-152)||(38591727-38591862)
chr3 (21-193)||(25579731-25579903)
chr3 (21-123)||(43348320-43348421)
chr3 (21-90)||(29163913-29163982)
chr3 (21-73)||(33698265-33698317)
chr3 (21-74)||(14586682-14586735)
chr3 (23-71)||(22622732-22622780)
chr3 (130-198)||(55343405-55343473)
chr3 (159-202)||(53175706-53175749)
chr3 (110-151)||(41585408-41585449)
chr3 (21-76)||(11835639-11835695)
chr3 (110-154)||(33698219-33698263)
chr3 (113-168)||(2613907-2613962)
chr3 (146-201)||(19606914-19606969)
chr3 (26-77)||(36012245-36012296)
chr3 (146-197)||(47870211-47870262)
chr3 (99-193)||(11835701-11835790)
chr3 (42-76)||(53811695-53811729)
chr3 (137-193)||(29163839-29163895)
chr3 (146-198)||(42665541-42665593)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (21-198)||(24886098-24886277)
chr5 (23-192)||(699152-699321)
chr5 (21-197)||(22974084-22974260)
chr5 (23-205)||(31705616-31705797)
chr5 (23-196)||(38528241-38528413)
chr5 (21-198)||(14919530-14919708)
chr5 (21-203)||(22980784-22980966)
chr5 (23-196)||(5112317-5112490)
chr5 (15-154)||(30969320-30969459)
chr5 (21-195)||(9200232-9200406)
chr5 (26-197)||(8741893-8742065)
chr5 (25-196)||(22255179-22255351)
chr5 (22-194)||(35511480-35511652)
chr5 (21-195)||(1429147-1429321)
chr5 (24-194)||(15724490-15724658)
chr5 (21-182)||(27318489-27318650)
chr5 (21-194)||(31786648-31786821)
chr5 (21-196)||(12910348-12910528)
chr5 (21-197)||(19119856-19120032)
chr5 (21-193)||(32563150-32563322)
chr5 (23-194)||(7693230-7693401)
chr5 (21-194)||(23116224-23116397)
chr5 (24-196)||(27330304-27330474)
chr5 (21-192)||(5837557-5837728)
chr5 (21-194)||(22019632-22019805)
chr5 (21-192)||(7208866-7209037)
chr5 (24-196)||(35826489-35826660)
chr5 (21-196)||(36860421-36860596)
chr5 (24-194)||(14409332-14409501)
chr5 (23-200)||(17158035-17158214)
chr5 (21-195)||(39572818-39572992)
chr5 (23-186)||(43308656-43308819)
chr5 (21-128)||(35504431-35504538)
chr5 (23-181)||(26268087-26268245)
chr5 (24-201)||(8466738-8466914)
chr5 (21-194)||(36866762-36866935)
chr5 (21-192)||(25500928-25501099)
chr5 (21-194)||(40133385-40133558)
chr5 (23-182)||(33908245-33908404)
chr5 (24-154)||(28416532-28416662)
chr5 (24-115)||(15992545-15992636)
chr5 (23-137)||(6824483-6824599)
chr5 (21-123)||(23954791-23954894)
chr5 (26-195)||(35933901-35934063)
chr5 (21-123)||(21088768-21088870)
chr5 (21-181)||(8436979-8437138)
chr5 (23-194)||(5829897-5830063)
chr5 (23-152)||(42342775-42342902)
chr5 (99-196)||(13956425-13956522)
chr5 (39-154)||(25668690-25668804)
chr5 (110-194)||(26317775-26317859)
chr5 (110-161)||(22255608-22255659)
chr5 (57-192)||(11898004-11898139)
chr5 (24-72)||(13956367-13956415)
chr5 (146-193)||(21320752-21320799)
chr5 (117-194)||(16004474-16004552)
chr5 (110-151)||(5748478-5748519)
chr5 (158-207)||(12081285-12081334)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (21-194)||(33551016-33551189)
chr2 (21-194)||(37905709-37905881)
chr2 (23-163)||(43648277-43648416)
chr2 (21-197)||(19289353-19289524)
chr2 (21-195)||(17071767-17071941)
chr2 (23-195)||(11366413-11366585)
chr2 (21-194)||(26357577-26357750)
chr2 (23-195)||(19424660-19424832)
chr2 (21-195)||(17054126-17054300)
chr2 (23-192)||(3176941-3177110)
chr2 (21-196)||(29242168-29242343)
chr2 (21-195)||(4264107-4264281)
chr2 (26-192)||(36641988-36642154)
chr2 (24-196)||(39167396-39167568)
chr2 (21-197)||(2325408-2325576)
chr2 (21-192)||(43770869-43771039)
chr2 (23-193)||(13711465-13711635)
chr2 (22-195)||(27349970-27350143)
chr2 (26-194)||(4478368-4478537)
chr2 (23-196)||(31570766-31570939)
chr2 (23-192)||(41463882-41464051)
chr2 (24-194)||(4763628-4763801)
chr2 (21-192)||(33660398-33660569)
chr2 (21-196)||(4166920-4167095)
chr2 (21-194)||(33902068-33902239)
chr2 (25-194)||(19313852-19314020)
chr2 (82-194)||(35958909-35959021)
chr2 (21-154)||(33709262-33709395)
chr2 (23-194)||(44913662-44913834)
chr2 (21-97)||(45327817-45327893)
chr2 (27-195)||(5881533-5881706)
chr2 (21-95)||(41960939-41961013)
chr2 (21-197)||(18494310-18494474)
chr2 (25-90)||(31861956-31862021)
chr2 (24-192)||(44285951-44286119)
chr2 (130-196)||(41960881-41960947)
chr2 (23-123)||(7006953-7007053)
chr2 (112-194)||(41465509-41465591)
chr2 (15-75)||(19501764-19501823)
chr2 (128-194)||(31861895-31861961)
chr2 (146-194)||(18514771-18514819)
chr2 (159-195)||(39788590-39788626)
chr2 (159-194)||(22963400-22963435)
chr2 (159-194)||(22998042-22998077)
chr2 (49-167)||(41051263-41051382)
chr2 (146-200)||(19093407-19093461)
chr2 (27-68)||(35959023-35959064)
chr2 (147-195)||(43446463-43446511)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (26-197)||(4318839-4319010)
chr6 (23-196)||(1945831-1946005)
chr6 (23-196)||(5627389-5627562)
chr6 (23-195)||(7055228-7055400)
chr6 (21-194)||(7235046-7235218)
chr6 (21-201)||(29182156-29182336)
chr6 (26-195)||(8513232-8513401)
chr6 (21-194)||(33893014-33893186)
chr6 (21-195)||(3879950-3880124)
chr6 (21-178)||(15491631-15491788)
chr6 (26-192)||(6088910-6089076)
chr6 (23-192)||(30353371-30353540)
chr6 (21-168)||(21017123-21017270)
chr6 (23-140)||(6091196-6091313)
chr6 (21-154)||(33618874-33619007)
chr6 (15-193)||(20768087-20768261)
chr6 (63-197)||(18498430-18498565)
chr6 (146-196)||(19631747-19631797)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (23-192)||(43959-44128)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (23-192)||(154659-154828)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (23-192)||(146030-146199)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (24-168)||(94398-94542)
scaffold0002 (21-195)||(133-307)
scaffold0002 (21-140)||(408441-408559)
scaffold0002 (142-196)||(408702-408756)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (21-192)||(11908-12082)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (21-146)||(267331-267457)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (110-195)||(42347-42432)
scaffold0009 (130-197)||(100818-100885)


Alignment Details
Target: scaffold0291 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8060 - 7883
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8060 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 7961  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7960 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttttcttta 7883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30055684 - 30055498
Alignment:
Q  12 tagcaaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattg 111  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30055684 tagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg 30055585  T
Q  112 gggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc-caaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30055584 gggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttccttt 30055498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18797475 - 18797302
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18797475 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 18797376  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  18797375 tcattacattttttatgt--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 18797302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37110020 - 37109847
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37110020 aggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttac 37109921  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37109920 tcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37109847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 17842599 - 17842774
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17842599 aggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttac 17842698  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17842699 tcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcctt 17842774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27283892 - 27283719
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  27283892 aggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttac 27283793  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27283792 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcc 27283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38258693 - 38258516
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  38258693 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgttac 38258594  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  38258593 tcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttctttta 38258516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 31579077 - 31579256
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgta-----caaacattggggt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||      ||||| ||||||    
T  31579077 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggt 31579176  T
Q  116 gttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31579177 gttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattttcct 31579256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7334942 - 7334769
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7334942 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 7334843  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  7334842 tcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgacttcaccgtagaattttcc 7334769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24211887 - 24211717
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||    
T  24211887 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactc 24211788  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24211787 attacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 5657488 - 5657667
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  5657488 caaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggg 5657587  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5657588 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37347168 - 37346997
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37347168 gataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactc 37347069  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||| | |||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37347068 attatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccataaaattttcc 37346997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Original strand, 12390646 - 12390819
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||   ||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  12390646 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactca 12390745  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  12390746 ttacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattttccttt 12390819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10481751 - 10481576
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaaca-ttggggtgttact 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10481751 gataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttact 10481652  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttca-tccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  10481651 cattatattttttatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattctcctaactttaccatagaattttcctt 10481576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21991784 - 21991605
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  21991784 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttac 21991685  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttatt 200  Q
    ||   |||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||    
T  21991684 tcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcctatatt 21991605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 31520739 - 31520916
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  31520739 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatgg-gactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactc 31520837  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    | || | |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31520838 actatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcataaaattttccgttattt 31520916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 32821066 - 32821241
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  32821066 aggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttac 32821165  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  32821166 tcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 32821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Original strand, 33688277 - 33688446
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| || || ||||||| | || ||||||||    
T  33688277 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactc 33688376  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33688377 ataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaagtcattctcataacttcaccatataattttc 33688446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 44413394 - 44413564
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44413394 gataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactc 44413493  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttca-tccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || |||| |||||| ||||||    
T  44413494 actatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactttaccatagaatttt 44413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23111335 - 23111167
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  23111335 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactca 23111236  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| | || ||||||||| | ||||||    
T  23111235 caatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcaccacagaatttt 23111167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29173688 - 29173540
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29173688 aggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttac 29173589  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattc 169  Q
    |||  ||| |||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  29173588 tcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Original strand, 48928577 - 48928748
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||||| |||    
T  48928577 aggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgg-gactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctac 48928675  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48928676 tcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttc 48928748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22687387 - 22687228
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||  || || ||||||| ||| |||||||    
T  22687387 aggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttac 22687288  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttca 180  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  22687287 tcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttca 22687228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 27421393 - 27421563
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27421393 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttac 27421491  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  27421492 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttt 27421563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 41765095 - 41765266
Alignment:
Q  25 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||     
T  41765095 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcac 41765194  T
Q  125 tacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  41765195 tacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattttcctt 41765266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43686188 - 43686015
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||   || ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  43686188 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttac 43686090  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||    
T  43686089 tcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 43686015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4583073 - 4582894
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  4583073 caaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtgggg 4582974  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||||  ||| |||||||  |||||| ||||||||| |  |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||    
T  4582973 tgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 4582894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 9355839 - 9356014
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||  | | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |    
T  9355839 aggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgc 9355938  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||| | |||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9355939 tcactacattttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcctt 9356014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8861433 - 8861255
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  || | ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||     
T  8861433 aggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttat 8861334  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttat 199  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||     |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  8861333 tcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccattat 8861255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6546667 - 6546494
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   | | ||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||    
T  6546667 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttac 6546568  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6546567 tcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 6546494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 15612772 - 15612944
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||   || ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||    
T  15612772 aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttac 15612871  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15612872 tcataac-actttgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcc 15612944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26980468 - 26980325
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||    
T  26980468 ataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactca 26980369  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcat 167  Q
      ||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  26980368 caacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32432600 - 32432431
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32432600 aggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttac 32432501  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| |||||     ||||||||||||||| |  |||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||    
T  32432500 tcacaacatttttg-----atagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 32432431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 48928310 - 48928458
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||||| |||    
T  48928310 aggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctac 48928408  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattct 170  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  48928409 tcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattct 48928458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11071354 - 11071182
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  11071354 aggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttac 11071255  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagt-cattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||  || | |||||||| ||||||  |||||| | | ||||| | |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  11071254 tcgctatatttttgatgatatagtactaactttaccaaaaaaatacattttcatgacttcaccatagaatttt 11071182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524515
Alignment:
Q  45 tcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagt 144  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||| || || ||||||| ||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  145 gttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 26524515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12165897 - 12165727
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     || | ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  12165897 ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactca 12165798  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
      ||| ||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||| | |  |||||||| || ||||||||    
T  12165797 caacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaacgacttcaccgtagaattttcc 12165727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 25691557 - 25691729
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggt-gtta 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||| || ||| || |||||||||| || |||  |||    
T  25691557 aggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaatta 25691656  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||||  | | |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25691657 ctcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 25691729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38053624 - 38053501
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  38053624 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggttttactc 38053533  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  38053532 attacattttttatgttatagtattaacttca 38053501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Original strand, 10359229 - 10359400
Alignment:
Q  23 gataaaattagatt-aagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||| ||| | | || |||||||    
T  10359229 gataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttact 10359327  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    || |||| |||||||| ||||   |||| || | |  |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  10359328 cactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 10359400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37704305 - 37704143
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||         ||  |||||||||| |||||||||||    
T  37704305 aggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggactgaa---------tc--tgtacaaacaatggggtgttac 37704217  T
Q  121 tcattaca-attttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  37704216 tcactacatttttttatgctatagtgttaacttcat-aaaaaaatcatttttataatttcatcatagaattttcc 37704143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 15672775 - 15672830
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatg 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15672775 aggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatg 15672830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362334
Alignment:
Q  64 tgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaag 163  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||      |||||    
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaactttga-tgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  164 tcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  34362304 tcattctcataatttcaccatagaattttcc 34362334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 44598811 - 44598745
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaactttt 90  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  44598811 ataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaattttt 44598745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 43925247 - 43925167
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||    
T  43925247 gataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 32593204 - 32593327
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||| |||||    
T  32593204 gataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgataccaccatataaacagtggggtgctactc 32593302  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgtt 147  Q
    | |||| |||| ||| |||||||||    
T  32593303 actacacttttaatgctatagtgtt 32593327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 61
Target Start/End: Original strand, 37703513 - 37703551
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatga 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37703513 gataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 19089482 - 19089664
Alignment:
Q  12 tagcaaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattg 111  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19089482 tagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtg 19089581  T
Q  112 gggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19089582 gggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 37663770 - 37663951
Alignment:
Q  12 tagcaaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattg 111  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  37663770 tagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg 37663869  T
Q  112 gggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37663870 gggtgttactcattacagttttaatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 37663951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Original strand, 25701095 - 25701278
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  25701095 aggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttac 25701194  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttat 204  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701195 tcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccataaaattttcctttattttat 25701278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25184286 - 25184112
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||    
T  25184286 aggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttac 25184187  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  25184186 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 25184112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 879586 - 879760
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  879586 aggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttac 879685  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  879686 tcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgacttcaccttaaaattttcct 879760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 55477929 - 55478108
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacat----tggggtg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||     ||| |||    
T  55477929 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtg 55478028  T
Q  117 ttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  55478029 ttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 55478108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 34361532 - 34361704
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||   ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34361532 gataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgaggct-gaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactc 34361630  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34361631 attacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 34361704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Original strand, 19440688 - 19440860
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  19440688 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatc 19440787  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataac-ttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  19440788 attacatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactttcaccatagaattttcc 19440860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42199900 - 42199728
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  42199900 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactc 42199801  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  42199800 attacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttcaccatagatttttcct 42199728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 34948135 - 34948306
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||    
T  34948135 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttac 34948234  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34948235 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 34948306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 32912620 - 32912793
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    ||||||||| || ||||| |||||| | | |||||||||||    
T  32912620 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactc 32912719  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32912720 attacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 32912793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17173463 - 17173292
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17173463 aggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 17173364  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  17173363 tcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17173292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 28003024 - 28003197
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||  |||    
T  28003024 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactac 28003123  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    | | |||| |||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  28003124 tgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 28003197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 204
Target Start/End: Original strand, 29584241 - 29584419
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  29584241 ataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactca 29584340  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttat 204  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29584341 --acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttccttttttttat 29584419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 36493728 - 36493897
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36493728 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactc 36493827  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    | || | |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||    
T  36493828 actatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttt 36493897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17167886 - 17167715
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17167886 aggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 17167787  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  17167786 tcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17167715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50764903 - 50764732
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  50764903 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttac 50764804  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||  ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||||    
T  50764803 tcacaacacttttgatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgactt---cataaaattttccttt 50764732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50697414 - 50697238
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||    
T  50697414 aggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttac 50697316  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    || ||| | |||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  50697315 tcgttatattttttatgttatagtgtttacttcactaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttccttta 50697238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27396786 - 27396618
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27396786 ataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactca 27396687  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    | ||| |||| ||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  27396686 taacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 27396618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4598165 - 4597984
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |  || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  4598165 aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttac 4598066  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttatttta 203  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4598065 tcacaacacttt-gatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccataaaattttcatttctttta 4597984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9139418 - 9139245
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  9139418 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttac 9139319  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||| |  | |||| ||| ||||  |||||||||| | ||||||||| | | || ||||||||||| ||||||||||    
T  9139318 tcact--attttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttcctt 9139245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 35021073 - 35021249
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || ||   ||||||| | | || |||||||||| ||| |||||||    
T  35021073 aggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttac 35021172  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  35021173 tcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttccttt 35021249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23761243 - 23761114
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||    
T  23761243 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactc 23761144  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaactt 152  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23761143 acaacacttttgatgttatagtgttaactt 23761114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38012024 - 38011851
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  || ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| || |||    
T  38012024 ataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattca 38011925  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  38011924 ctacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttccttt 38011851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 49376137 - 49375966
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  49376137 ataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactca 49376038  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatc-caaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
      ||| |||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  49376037 cgacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 49375966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6864206 - 6864038
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||  |||||||||| | | || ||||| ||    
T  6864206 gataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattc 6864107  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattt 191  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  6864106 attaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgacatcaccatacaattt 6864038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32592266 - 32592096
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  32592266 aggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttac 32592167  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattt 191  Q
    ||   ||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| |||||||||    
T  32592166 tctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaataaaattt 32592096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3042790 - 3042600
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgat--------gattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||        || |||| |||| ||||||||||| ||||  |||||    
T  3042790 gataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactctaatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtgggg 3042691  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttatt 205  Q
    | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3042690 tattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgatttcaccatagaattttccttttttttatt 3042600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39398082 - 39397918
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||  || || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39398082 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttac 39397992  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39397991 tcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 39397918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 169
Target Start/End: Original strand, 54499281 - 54499425
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcatt-gtacaaacattggggtgttactcat 124  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  54499281 aaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcac 54499380  T
Q  125 tacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattc 169  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  54499381 aacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 46888195 - 46888330
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||  || ||||||||| ||| |  |||||||| | |||||| ||||    
T  46888195 aggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattac 46888294  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc 156  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46888295 tcactacaattttgatgttatagtattaacttcatc 46888330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Original strand, 55241145 - 55241315
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  55241145 gataaaattagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 55241243  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
       |||||||||||  |||||| |||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  55241244 gcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55241315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Original strand, 4934243 - 4934353
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaac-attggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  4934243 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgttactc 4934342  T
Q  123 attacaatttt 133  Q
    | |||| ||||    
T  4934343 actacattttt 4934353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 5048003 - 5048162
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||   | ||||||||| || |||| ||||||||| || |||  |||    
T  5048003 aggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctac 5048102  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttca 180  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |  |||| ||||||| |||||||||    
T  5048103 tcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataacttca 5048162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32579619 - 32579439
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgt---acaaacattggggtgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| || | ||||||| ||| ||  ||   ||||||| |||||||     
T  32579619 aggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgc 32579521  T
Q  118 tactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttat 199  Q
    |||||| | || ||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32579520 tactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctcagaacttcaccataaaattttcctttat 32579439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37287862 - 37287732
Alignment:
Q  66 atgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc-caaaaagt 164  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  37287862 atgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagt 37287763  T
Q  165 cattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  37287762 cattctcattacttcaccatagaattttcct 37287732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37775837 - 37775670
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |   |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  37775837 ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactca 37775740  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
      ||| |||| || |||||||| |||||||| | ||||| ||||| | || |||||||| || |||||||    
T  37775739 caacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcaccgtagaattttc 37775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47253913 - 47253751
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||        |||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  47253913 aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggg-tgttac 47253823  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  47253822 tcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7703679 - 7703517
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||        |||||||  || ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| |    
T  7703679 ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactga 7703588  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||| | |||| ||||||||    
T  7703587 caacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaacatagaattttcc 7703517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 30002670 - 30002840
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        ||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  30002670 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat--------gatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttac 30002761  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttat 199  Q
    |||  ||| |||||||| || ||||||||||||| |  |||| ||||| | || ||||||||||| | |||||||||||    
T  30002762 tcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccatagagttttcctttat 30002840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33341571 - 33341397
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  33341571 aggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcc 33341473  T
Q  121 tcatta----caattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||   |    ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  33341472 tcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatttt 33341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4205218 - 4205113
Alignment:
Q  92 atgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattt 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||| |||||    
T  4205218 atgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattt 4205119  T
Q  192 tccttt 197  Q
    ||||||    
T  4205118 tccttt 4205113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4396410 - 4396324
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  4396410 tggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcctt 4396324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 33816571 - 33816742
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||  ||| ||| | || |||| |||    
T  33816571 aggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgctac 33816670  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||| |||| |||||||| || | |||| |||||| |  |||| ||||||| || |||| | |||| ||||||    
T  33816671 tcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttaagcatataatttt 33816742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1815474 - 1815409
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaac 86  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1815474 aggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53124371 - 53124287
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | || |||||| |||| ||||||||    
T  53124371 tggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcatcatataattttcc 53124287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 35025669 - 35025800
Alignment:
Q  64 tgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaag 163  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |  ||||     
T  35025669 tgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaa 35025768  T
Q  164 tcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||||| | || |||||| |||| |||||||||    
T  35025769 tcattttcatgacttcagcatagaattttcct 35025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52516655 - 52516599
Alignment:
Q  136 tgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  52516655 tgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 52516599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17272075 - 17272009
Alignment:
Q  130 ttttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||    
T  17272075 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctt 17272009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17272134 - 17272084
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatacta 74  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  17272134 ataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 196
Target Start/End: Original strand, 7152235 - 7152319
Alignment:
Q  112 gggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  7152235 gggtgttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcctt 7152319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 188
Target Start/End: Original strand, 52195645 - 52195687
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaa 188  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52195645 ttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttcaccataaaa 52195687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Original strand, 23518425 - 23518473
Alignment:
Q  105 aacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttc 153  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23518425 aacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaacttc 23518473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52102963 - 52102915
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  52102963 ttaacttcaccaaaaaagtcattcttaaatcttcacaataaaattttcc 52102915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32267203 - 32267020
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32267203 aggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 32267104  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttat 204  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32267103 tcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcctttattttat 32267020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15383102 - 15382927
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  15383102 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttac 15383003  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15383002 tcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcctt 15382927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 28564790 - 28564951
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  28564790 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactc 28564889  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccat 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  28564890 attacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccat 28564951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10922894 - 10922724
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10922894 gataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactc 10922795  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  10922794 attacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgatttcaccataaaattttc 10922724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18422820 - 18422646
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18422820 aggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttac 18422721  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18422720 tcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcct 18422646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30254592 - 30254419
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | | || ||||    
T  30254592 aggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattac 30254494  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30254493 tcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcct 30254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15752198 - 15752027
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  15752198 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttac 15752099  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||| || | |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  15752098 tcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 15752027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 37618899 - 37619079
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgata--ctatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  37618899 aggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgtt 37618998  T
Q  119 --actcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37618999 ttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttccttt 37619079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2959917 - 2959743
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  2959917 aggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttac 2959818  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  2959817 ttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 2959743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Original strand, 9903063 - 9903208
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  9903063 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactc 9903162  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcatt 168  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9903163 actacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 9903208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 19899778 - 19899950
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  19899778 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactc 19899877  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  19899878 gttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcct 19899950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16415815 - 16415639
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaaca-ttggggtgtta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||    
T  16415815 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgtta 16415716  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  16415715 ctcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcctt 16415639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Original strand, 34012385 - 34012560
Alignment:
Q  22 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| ||||||||    
T  34012385 ggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttact 34012484  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  34012485 cactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttccttt 34012560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38823388 - 38823210
Alignment:
Q  16 aaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggt 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||    
T  38823388 aaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggt 38823289  T
Q  116 gttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||   |||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  38823288 gttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38823210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48620812 - 48620630
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  48620812 caaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggg 48620713  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  48620712 tgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaacatagaattttccttt 48620630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 30326959 - 30327132
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||  | |||| ||||    
T  30326959 aggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattac 30327058  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  30327059 tcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 30327132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37451452 - 37451292
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  37451452 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactt 37451354  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccat 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37451353 attacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccat 37451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23999514 - 23999343
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  23999514 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactc 23999415  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
     ||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23999414 gttatattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcc 23999343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51129026 - 51128895
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  51129026 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactc 51128927  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51128926 attacattttttatgttatagtgttaacttca 51128895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 27763320 - 27763500
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  27763320 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaac-tatgggtgttactc 27763418  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttatt 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||    
T  27763419 attacatttttgatgttatagtgttaacttca-caaaaaaatcattcttataactttaccataaattttttcttatttttatt 27763500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28769819 - 28769651
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  28769819 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactc 28769721  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  28769720 attacatttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaatttt 28769651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42721208 - 42721035
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  42721208 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttac 42721109  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| || | |||| ||| ||||| | |||||||| | ||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  42721108 tcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 42721035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4330450 - 4330288
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacatt-ggggtgtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||    
T  4330450 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgtta 4330351  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtg-ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcac 181  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  4330350 ctcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataacttcac 4330288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 7079070 - 7079254
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaac-----------at 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||           |     
T  7079070 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttag 7079169  T
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  7079170 tggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactttaccataaaattttcc 7079254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Original strand, 11742360 - 11742533
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  11742360 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactt 11742458  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11742459 acaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcacgataaaattttccttt 11742533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8222297 - 8222125
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||   ||  || ||||||||    
T  8222297 aggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgta---acggtgtggtgttac 8222201  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  8222200 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttcctt 8222125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41926338 - 41926161
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||| | ||| || |||||||||| ||||     
T  41926338 caaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtggga 41926239  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    | ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  41926238 tattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3309311 - 3309144
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||| | ||||||||||||      
T  3309311 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcaca 3309213  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  3309212 acacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 3309144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 47279358 - 47279191
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  47279358 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttac 47279259  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaa 188  Q
    |||  ||| |||||||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  47279258 tcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccaaaaaa 47279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 10182015 - 10182189
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  10182015 aggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttac 10182114  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
     || || | |||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  10182115 gcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 10182189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46931578 - 46931406
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| | || |||||||| |||||| ||||||    
T  46931578 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactc 46931479  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttc---atccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46931478 attacatttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaaaaattcattcttataacttcaccatagaatttt 46931406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14758210 - 14758038
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||| ||  ||||||||| | | ||| |||    
T  14758210 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctac 14758111  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14758110 tcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttc 14758038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Original strand, 27267212 - 27267376
Alignment:
Q  27 aaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatta 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27267212 aaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcacta 27267311  T
Q  127 caattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    || |||| |||   |||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  27267312 cattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca-catataattttcc 27267376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39393547 - 39393375
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||| || |||||||||| ||  || |||||||      
T  39393547 aaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcaca 39393448  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  39393447 acacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttccttta 39393375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32216224 - 32216091
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  32216224 aggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttac 32216125  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32216124 tcactacatttttgatgttatagtgttaacttca 32216091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Original strand, 27532988 - 27533144
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| ||||||    
T  27532988 aggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttac 27533086  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataactt 178  Q
     ||  | | |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||    
T  27533087 ccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactt 27533144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 31621560 - 31621733
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||| ||  ||||||| |  |||||| |||    
T  31621560 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctac 31621659  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  31621660 tcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 31621733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 47682504 - 47682673
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggg-gtgttactc 122  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  || ||||||| || |||| |||||||||    
T  47682504 ataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactc 47682603  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |  ||| |||| |||   |||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  47682604 acaacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgacttcaccataaaattttcc 47682673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 27563912 - 27564084
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    | ||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  27563912 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttac 27564011  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttca-tccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||| || | |||| | |||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  27564012 tcactatatttttaaagttatagtgttaacttcactaaaaaaaatcattttcataacttcaccgtagaatttt 27564084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 27227492 - 27227657
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||        
T  27227492 aggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg---- 27227587  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
      | |||| |||| |||   |||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27227588 --agtacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 27227657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1547454 - 1547280
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||        ||||||||  | ||||||||| ||| || || ||||||| ||| |    
T  1547454 caaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga--------tactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggag 1547363  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  1547362 tgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttt 1547280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3535101 - 3534968
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| || |  || ||||||||| |||||| || ||||||| |  ||||||||    
T  3535101 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttac 3535002  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3535001 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 3534968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30254952 - 30254853
Alignment:
Q  95 tcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  30254952 tcattgtacaaacagtggg-tgttatccattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttcaccatagaattttcc 30254854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Original strand, 238523 - 238697
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  238523 ataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactca 238621  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttat 199  Q
      ||| |||| ||  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |  | ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  238622 caacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttttctttat 238697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15168265 - 15168081
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatg-------tcattgtacaaacattggg 113  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||        ||  ||||||||| ||||    
T  15168265 aggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggg 15168166  T
Q  114 gtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  15168165 gtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaattttccttta 15168081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40884982 - 40884849
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||   || ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| |||    
T  40884982 aggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctac 40884883  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  40884882 tcactacacttttgatgttatggtgttgacttca 40884849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25160801 - 25160715
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaac 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25160801 aggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaac 25160715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 33725611 - 33725778
Alignment:
Q  25 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||    | ||| | |||| || ||||||     
T  33725611 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaa 33725710  T
Q  125 tacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| ||||||    ||||||||||||  | |||| |||||| ||||||    
T  33725711 tacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccatagaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289661
Alignment:
Q  46 cttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaatt-------ttgatgt 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||       || |||     
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  139 tatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaatagatttttcc 21289661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22170814 - 22170745
Alignment:
Q  130 ttttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||    
T  22170814 ttttgatgttatagtgttaacttcattagaaaagtcattttcatgatttcaccatagaattttcctttat 22170745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22170880 - 22170806
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||    
T  22170880 aggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatgt 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Original strand, 4964062 - 4964102
Alignment:
Q  161 aagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4964062 aagtaattctcataacttcaccatagaattttcctttattt 4964102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 38759700 - 38759652
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgata 71  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  38759700 gataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgata 38759652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 1150123 - 1150297
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1150123 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttac 1150222  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1150223 tcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcct 1150297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 10555220 - 10555393
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10555220 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttac 10555319  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  10555320 tcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 10555393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 43643613 - 43643788
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||    
T  43643613 aggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttac 43643712  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  43643713 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 43643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 37970537 - 37970701
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37970537 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttac 37970636  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccata 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  37970637 tcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccata 37970701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 27082858 - 27083030
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  27082858 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactc 27082957  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  27082958 actacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcct 27083030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34895138 - 34894962
Alignment:
Q  22 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||| ||||||||    
T  34895138 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttact 34895039  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||    
T  34895038 cactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttccttta 34894962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1205097 - 1204923
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  1205097 gataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactc 1204998  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  1204997 actacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttccttt 1204923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 16446893 - 16447067
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || | ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  16446893 aggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttac 16446992  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  16446993 tcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcct 16447067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Original strand, 30654605 - 30654775
Alignment:
Q  25 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcat 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  30654605 taaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcat 30654704  T
Q  125 tacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30654705 tacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcct 30654775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 36694984 - 36695159
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36694984 aggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 36695083  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||    
T  36695084 tcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcctt 36695159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Original strand, 31933906 - 31934064
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31933906 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactc 31934005  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcac 181  Q
    |||| | ||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  31934006 attatatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcac 31934064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 6098536 - 6098716
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6098536 aggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttac 6098635  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    ||| || | |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6098636 tcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttccattattt 6098716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 23854451 - 23854610
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  23854451 gataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactc 23854550  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcacc 182  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  23854551 attacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 23854610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38644150 - 38643975
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  38644150 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttac 38644051  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  38644050 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcctt 38643975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13307800 - 13307622
Alignment:
Q  16 aaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggt 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| | || |||    
T  13307800 aaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggt 13307701  T
Q  116 gttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13307700 gttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 13307622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 466012 - 465843
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  466012 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 465913  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  465912 acaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttcaccataaaatttt 465843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12876281 - 12876108
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12876281 aggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttac 12876182  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| |||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| |  | |||| |||||| ||||||||    
T  12876181 tcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttcc 12876108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 5299965 - 5300137
Alignment:
Q  22 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| || |||||||||| | | ||| ||||    
T  5299965 ggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctact 5300064  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
     |  ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5300065 tacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 5300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16223035 - 16222860
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||   |||    
T  16223035 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactac 16222936  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||| || | |||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| || | |||||| || ||||||||||    
T  16222935 tcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcctt 16222860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11727196 - 11727037
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||    
T  11727196 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttac 11727097  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttca 180  Q
    | |  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||    
T  11727096 ttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttca 11727037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 133
Target Start/End: Original strand, 1149652 - 1149762
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1149652 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactc 1149751  T
Q  123 attacaatttt 133  Q
    |||||| ||||    
T  1149752 attacattttt 1149762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9864320 - 9864144
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9864320 aggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 9864221  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||  ||| |||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| |  | ||||||  ||| |||||||||||    
T  9864220 tcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttccttt 9864144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 34952043 - 34952223
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||     
T  34952043 caaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggc 34952142  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||| | || |||| || ||| |||||||||    
T  34952143 tgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattttcct 34952223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41362685 - 41362517
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||    
T  41362685 gataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcactatacaaatagtggggtgttactc 41362586  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    | ||| ||||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  41362585 actac-atttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44869664 - 44869495
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact--ca 123  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | |||  ||    
T  44869664 aaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg-atcactcaca 44869566  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
      | | |||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||    
T  44869565 aaatacttttaatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattcttataatttcaccgtagaattttcc 44869495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 35459723 - 35459813
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaa 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35459723 caaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaa 35459813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 8803837 - 8803998
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||       |  ||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  8803837 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactc 8803929  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||    
T  8803930 attacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtca----tatgacttcaccatagaattttcct 8803998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40862597 - 40862416
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||  |||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  40862597 caaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgggg 40862499  T
Q  115 tgttactcattaca-attttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||| |  | ||||||| ||| ||||||||||    
T  40862498 tgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattttcctt 40862416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 7890977 - 7891137
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||        
T  7890977 gataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtt---- 7891072  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
         | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7891073 -----atttttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 7891137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33906382 - 33906223
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||            || ||||| ||||||| |||||    
T  33906382 gataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaactt------------tataaacagtggggtgctactc 33906295  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    | |||| |||| ||  ||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  33906294 actacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttcc 33906223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 39099139 - 39099304
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||  | |||||||| | |||||||||||      
T  39099139 gataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttac-- 39099236  T
Q  123 attacaa-ttttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
     || ||| ||||||||||||||        |||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  39099237 -ttgcaacttttgatgttatag--------tcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttta 39099304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15009305 - 15009241
Alignment:
Q  130 ttttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15009305 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 15009241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 41911006 - 41911153
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattg-tacaaacattggggtgtta 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||  | || || ||   | |||||||||    
T  41911006 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgtta 41911105  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcat 167  Q
    ||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  41911106 ctcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 196
Target Start/End: Original strand, 24823379 - 24823465
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  24823379 tggggtgttacacttaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataactttaccatagtattttcctt 24823465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 4132706 - 4132750
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4132706 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43025874 - 43025741
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatg-attgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgtta 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||    
T  43025874 aggataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattat-atgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtatta 43025776  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
     |||  ||| |||||||  ||||  ||||||||||    
T  43025775 atcacaacacttttgatactatatcgttaacttca 43025741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7998461 - 7998411
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatg 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7998461 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatg 7998411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Original strand, 4133146 - 4133199
Alignment:
Q  141 tagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  4133146 tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctgatgacttgaccataaaattttcc 4133199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34685785 - 34685728
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttatttta 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  34685785 ttaacttcatcaaaaaattcattctcataacttcatcatagaattttccttcatttta 34685728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Original strand, 1954009 - 1954077
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgat-gatactatgatgattgaactttt 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  1954009 gataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaactttt 1954077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 206
Target Start/End: Original strand, 4108924 - 4108972
Alignment:
Q  158 aaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttattg 206  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4108924 aaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcctttcttttattg 4108972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 3655214 - 3655388
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3655214 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttac 3655313  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3655314 tcattacattttttatgttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataaaattttcct 3655388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37203231 - 37203058
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  37203231 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttac 37203132  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37203131 tcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 37203058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 26941272 - 26941446
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26941272 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttac 26941371  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26941372 tcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcct 26941446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 20373308 - 20373481
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20373308 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 20373407  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20373408 tcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcactataaaattttcc 20373481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37157871 - 37157699
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||    
T  37157871 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgtacaa-cagtggggtgttac 37157773  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  37157772 tcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcc 37157699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47481683 - 47481510
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47481683 ataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactca 47481584  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47481583 ttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattttccttt 47481510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 40552273 - 40552445
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  40552273 gataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactc 40552372  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  40552373 attacatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 40552445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Original strand, 42506078 - 42506214
Alignment:
Q  12 tagcaaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattg 111  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42506078 tagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtg 42506177  T
Q  112 gggtgttactcattacaattttgatgttatagtgtta 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506178 gggtattactcattacaattttgatgttatagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 51212993 - 51213166
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  51212993 aggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgc 51213092  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  51213093 tcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 51213166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 48355105 - 48354930
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48355105 aggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttac 48355006  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  48355005 tcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 48354930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Original strand, 21009816 - 21009997
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  21009816 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactc 21009915  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttc---atccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||   |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21009916 attacatttttgatgttatagtgtcaaattcacaaaaaaaaaaatcattcttataacttcaccataaaattttccttaattt 21009997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35844485 - 35844310
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || | ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||      
T  35844485 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcaca 35844386  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35844385 acatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctttattt 35844310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 52040934 - 52041109
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaaca-ttggggtgtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||    
T  52040934 aggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagtta 52041033  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||  | |||||||||    
T  52041034 ctcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacctcagaattttcct 52041109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 4761661 - 4761838
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4761661 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttac 4761760  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc--caaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |   ||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  4761761 tcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcctt 4761838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4015624 - 4015451
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||    
T  4015624 aggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttac 4015525  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4015524 tcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4015451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11466988 - 11466814
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || | ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  11466988 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttac 11466889  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  11466888 tcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcct 11466814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Original strand, 54828713 - 54828902
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||| ||||  ||||  |||||||||||    
T  54828713 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttac 54828812  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttattgtatgt 211  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  54828813 tcattac-atttttatgttatagtgttaactttaccaaaaaaattatttttatgacttcaccataaaatttttcttaatattattatatgt 54828902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 7327494 - 7327669
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  7327494 aggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttac 7327593  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtg-ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7327594 tcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcct 7327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 11357376 - 11357535
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaaca-ttggggtgtta 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||||| | |||||||||    
T  11357376 aggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgtta 11357475  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttc 179  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||    
T  11357476 ctcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29099517 - 29099356
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29099517 gataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 29099418  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccat 184  Q
    |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||    
T  29099417 acgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccat 29099356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 43975902 - 43976068
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||| ||| |||||    
T  43975902 gataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactc 43976001  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43976002 actacacttttgatgctatagtgttgacttca---aaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 43976068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54505969 - 54505799
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||| | | ||| |||| |||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  54505969 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgaggct-gaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactc 54505871  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  54505870 attacatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattcttgcgacttcatcataaaattttcc 54505799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 44186513 - 44186687
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  44186513 aggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttac 44186612  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||    |||||| |||| |||||||||    
T  44186613 tcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaattttcct 44186687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 53229164 - 53229350
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattg-gggtgtta 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||     
T  53229164 aggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttg 53229263  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttattg 206  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| | ||| | || |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||    
T  53229264 ctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgacttcaccttaaaatttttctttttttaattg 53229350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 27480391 - 27480564
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||  ||||||||| | || || |||    
T  27480391 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgctac 27480490  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  27480491 tcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaattttcc 27480564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22451128 - 22450957
Alignment:
Q  25 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||   |||||||| || |||| ||||||     
T  22451128 taaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcac 22451029  T
Q  125 tacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22451028 tacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcctt 22450957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39282816 - 39282642
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||| || |||| ||||| |||||| ||||    
T  39282816 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattac 39282717  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  39282716 tca-cacagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 39282642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 46297774 - 46297945
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  46297774 aggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttac 46297873  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  46297874 tcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 33378797 - 33378970
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  33378797 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactac 33378896  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  33378897 tcactacacttttgatactatagtgttgacttca---caaaagtcattctcataactttgccatagaattttccttt 33378970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34133099 - 34132923
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34133099 aggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 34133000  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||  ||| |||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||| |  | ||||||  ||| |||||||||||    
T  34132999 tcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttccttt 34132923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21193770 - 21193595
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  || ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21193770 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttac 21193671  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||  ||| |||||||   | ||||||||||||| |  |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  21193670 tcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcctt 21193595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40936154 - 40935995
Alignment:
Q  22 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  40936154 ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttact 40936055  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcac 181  Q
    |   ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||| || |||||||    
T  40936054 cgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 40935995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45174664 - 45174494
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||  | |||||||||| ||  ||||||||||      
T  45174664 aaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcaca 45174565  T
Q  126 --acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45174564 caacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattctcacaacttcaccataaaattttcc 45174494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2008097 - 2007964
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  2008097 aggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttac 2007998  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    |||  ||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  2007997 tcacaacacttttaacgctatagtgttaacttca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 46994673 - 46994842
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||           |||||||    
T  46994673 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgta----------tgtgttac 46994762  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||    
T  46994763 tcattac-attttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttacgacttcaccgtagaattttccttcattt 46994842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 24708127 - 24708295
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaa--gtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgtt 118  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||||    
T  24708127 aggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtac--acagtgaggtgtt 24708224  T
Q  119 actcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||||| | || |||||||||||  |||||||| |||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24708225 actcactgcagttttgatgtta-cgtgttaacatca--aaaaaagtcattttgataacttcaccataaaatttt 24708295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 191
Target Start/End: Original strand, 22446076 - 22446247
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatga-tgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgtta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||    
T  22446076 aggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgtta 22446174  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc-caaaaagtcattcttataacttcaccataaaattt 191  Q
    |||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||| | || |||||||| || |||||    
T  22446175 ctcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattt 22446247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53176217 - 53176074
Alignment:
Q  22 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| | ||   |||||    
T  53176217 ggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagt-ggacattact 53176119  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtca 166  Q
     |  ||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  53176118 tacaacatttttgatgttatgatgttaacttcatcagaaaagtca 53176074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32373634 - 32373459
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||   | | |||||||| ||| || ||||||||||  | || |||||    
T  32373634 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaaca--gtggagttac 32373537  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||    
T  32373536 tcacaacacttttgatgctatagtgttaactttattggaaaagtcattctcatgacttcatcatagaatttcccttta 32373459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3362419 - 3362284
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaa--gtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgtt 118  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| || |||||||| | |||| ||||    
T  3362419 aggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgtt 3362320  T
Q  119 actcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    ||||| || | || ||||| ||||||||||||||||    
T  3362319 actcactatatttctgatgctatagtgttaacttca 3362284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44891661 - 44891498
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  || | ||||||| ||| |         ||| |||| ||||||    
T  44891661 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttac 44891571  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||    
T  44891570 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaagtcattttcatgacttcaccgtataattttcc 44891498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Original strand, 24488976 - 24489107
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  24488976 gataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactc 24489075  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    |  ||| |||| ||  |||||| |||||||||    
T  24489076 acaacatttttaatactatagtcttaacttca 24489107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38591862 - 38591727
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaa----acattggggtg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  || | ||||||| ||| ||||||||||    ||| || | ||    
T  38591862 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtacaacaatacaatgagatg 38591763  T
Q  117 ttactcattacaattttgatgttatagtgttaactt 152  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  38591762 ttactccctataattttgatgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25579903 - 25579731
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || || |||||||| ||||  || ||||||||| |||||| |||| ||| | | |  |||||     
T  25579903 aggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttat 25579804  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    |||  ||| |||||||| |||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25579803 tcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataacttaaccataaaattttc 25579731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43348421 - 43348320
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||| || |  ||||||| ||||||||| |    
T  43348421 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgc 43348323  T
Q  121 tca 123  Q
    |||    
T  43348322 tca 43348320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 29163982 - 29163913
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaactttt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  29163982 aggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaactttt 29163913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 33698317 - 33698265
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatact 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33698317 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 14586682 - 14586735
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatacta 74  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14586682 aggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 14586735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 22622732 - 22622780
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgata 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22622732 gataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 55343405 - 55343473
Alignment:
Q  130 ttttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  55343405 ttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccttta 55343473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53175749 - 53175706
Alignment:
Q  159 aaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttatttt 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53175749 aaaagtcattctcataacttcaccataaaattttcctttttttt 53175706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 41585408 - 41585449
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaact 151  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41585408 tggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 41585449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 11835639 - 11835695
Alignment:
Q  21 aggataaa-attagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatg 76  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11835639 aggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatg 11835695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698219
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttca 33698219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2613962 - 2613907
Alignment:
Q  113 ggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcatt 168  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2613962 ggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcatt 2613907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 201
Target Start/End: Original strand, 19606914 - 19606969
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19606914 ttaacttcaccagaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcatttattt 19606969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36012296 - 36012245
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatga 77  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  36012296 aaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatga 36012245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47870262 - 47870211
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  47870262 ttaacttcatcgaaaaagtcattctcataacttcagtatagaattttccttt 47870211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 11835701 - 11835790
Alignment:
Q  99 tgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||| |||||     ||||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  11835701 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttg-----atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 76
Target Start/End: Original strand, 53811695 - 53811729
Alignment:
Q  42 tagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatg 76  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53811695 tagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 53811729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29163895 - 29163839
Alignment:
Q  137 gttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  29163895 gttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccataaaattttc 29163839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Original strand, 42665541 - 42665593
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42665541 ttaacttcaccaaaaaaatcattatcataacttcaccatagaattttccttta 42665593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24886277 - 24886098
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24886277 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 24886178  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc--caaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  24886177 tcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttcaccataaaattttccttta 24886098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 699321 - 699152
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  699321 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 699222  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    | || | |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  699221 actagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttcaccataaaatttt 699152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 22974084 - 22974260
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22974084 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttac 22974183  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22974184 tcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttccttt 22974260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 31705616 - 31705797
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  31705616 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 31705714  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttatt 205  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31705715 gttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcttttattttatt 31705797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 38528241 - 38528413
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  38528241 gataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactc 38528339  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  38528340 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 38528413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 14919530 - 14919708
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  14919530 aggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttac 14919629  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc-caaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttta 198  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  14919630 tcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttccttta 14919708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22980966 - 22980784
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  22980966 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattac 22980867  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttatttta 203  Q
    ||| |  | |||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  22980866 tcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcataaaattttctattatttta 22980784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 5112317 - 5112490
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  5112317 gataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 5112416  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    | || | |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  5112417 actatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcctt 5112490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 30969320 - 30969459
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  30969320 caaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtgggg 30969419  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30969420 tgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca 30969459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9200406 - 9200232
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  9200406 aggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttac 9200307  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  9200306 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcct 9200232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 197
Target Start/End: Original strand, 8741893 - 8742065
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaac-attggggtgttactcat 124  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||     
T  8741893 aaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcac 8741992  T
Q  125 tacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  8741993 aacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttt 8742065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22255351 - 22255179
Alignment:
Q  25 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22255351 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcat 22255252  T
Q  125 taca-attttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||| || | ||||||||    
T  22255251 tacattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgacttcaccgtagagttttcctt 22255179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 35511480 - 35511652
Alignment:
Q  22 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||    
T  35511480 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttact 35511579  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    || |||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| | || |||||||||||  |||||||    
T  35511580 cactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttcaccataggattttcc 35511652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 1429147 - 1429321
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  1429147 aggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttac 1429246  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| | || ||||||||||| | |||||||    
T  1429247 tcactatatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaagagtcattttcatgacttcaccatagatttttcct 1429321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15724658 - 15724490
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15724658 ataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaactttga-tgtcattgtataaacagtggggtgttactca 15724561  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15724560 caaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 15724490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Original strand, 27318489 - 27318650
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27318489 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttac 27318588  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcacc 182  Q
    ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||| || ||||||||    
T  27318589 tcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcacc 27318650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 31786648 - 31786821
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||   | |    
T  31786648 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgc 31786747  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  31786748 tcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttcc 31786821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12910528 - 12910348
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtc-----attgtacaaacattggggt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||     | |||||||||| ||||||    
T  12910528 aggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggt 12910429  T
Q  116 gttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  12910428 gttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctt 12910348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19120032 - 19119856
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19120032 aggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttac 19119933  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |    ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19119932 tagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttt 19119856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32563322 - 32563150
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  32563322 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttac 32563223  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  32563222 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7693401 - 7693230
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  7693401 gataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactc 7693302  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  7693301 acaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcc 7693230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 23116224 - 23116397
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||  || |||||||||| ||||||| |||    
T  23116224 aggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctac 23116323  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | || || |||||||| ||||||||    
T  23116324 tcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatagaattttcc 23116397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27330474 - 27330304
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  27330474 ataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactca 27330375  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||    
T  27330374 --acacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcctt 27330304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5837728 - 5837557
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5837728 aggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttac 5837629  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||| || | |||||| || ||||||    
T  5837628 tcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatgaattcaccgtagaatttt 5837557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22019805 - 22019632
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  || | ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22019805 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttac 22019706  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| |||||||  |||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22019705 tcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattctaataacttcaccatagaaatttcc 22019632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 7208866 - 7209037
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||    
T  7208866 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttac 7208964  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc-caaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    || || || |||| |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  7208965 tcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcaccaaaaaaagtcatttttatgacttcaccgtagaatttt 7209037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Original strand, 35826489 - 35826660
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  35826489 ataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactca 35826587  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  35826588 gtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcctt 35826660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36860596 - 36860421
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36860596 aggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 36860497  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||  ||| |||| ||  |||||||||||||||| |  |||| ||||| |  | ||||||||||| ||||||||||    
T  36860496 tcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 36860421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 14409332 - 14409501
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||  |||  || | ||||||| ||||||    
T  14409332 ataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactca 14409430  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14409431 ctacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 14409501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Original strand, 17158035 - 17158214
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  17158035 gatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactc 17158133  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttc---atccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttatt 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||   |   ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17158134 attacattttttatgttatagtgttaacttcacaaaaaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcctatatt 17158214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39572992 - 39572818
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  39572992 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttac 39572893  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| |||| || ||||||| ||||||| |    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  39572892 tcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 39572818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Original strand, 43308656 - 43308819
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||| ||    
T  43308656 gataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattc 43308754  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttca-tccaaaaagtcattcttataacttcaccataa 186  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43308755 attacatttttgatgttataatgttaactttactaaaaaaagtcattctcatgacttcaccataa 43308819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35504538 - 35504431
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  35504538 aggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttac 35504439  T
Q  121 tcattaca 128  Q
    ||||||||    
T  35504438 tcattaca 35504431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26268245 - 26268087
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  26268245 gataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactc 26268146  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcac 181  Q
    |  ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||| || |||||||    
T  26268145 aaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 26268087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8466914 - 8466738
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  || |||||||| |  ||||||||| |||    
T  8466914 ataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaaga-gggggtgttattca 8466816  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| || || ||| |||| |||||||||| ||||    
T  8466815 caacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattttccttaattt 8466738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36866935 - 36866762
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||   || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36866935 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttac 36866836  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  | | ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||| |  | ||||||||||| ||||||||    
T  36866835 tcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 25500928 - 25501099
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||   || | ||||||| ||| || |||||||||| || |||||||     
T  25500928 aggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttat 25501027  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  25501028 tcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40133558 - 40133385
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  40133558 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttac 40133459  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| |||||||  |||| ||||||||||| |  |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||    
T  40133458 tcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 40133385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33908404 - 33908245
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||| ||| |||||    
T  33908404 gataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactc 33908305  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaag-tcattcttataacttcacc 182  Q
    | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  33908304 actacacttttgatgatatagtgttgacttca-ccagaaagttcattctcatgacttcacc 33908245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Original strand, 28416532 - 28416662
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||  || |||||||||| |||| |||||||||    
T  28416532 ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactca 28416631  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
      | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  28416632 caatacttttgatattatagtgttaacttca 28416662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Original strand, 15992545 - 15992636
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  15992545 ataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 6824483 - 6824599
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattga--acttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||  |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  6824483 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttac 6824582  T
Q  121 tcattacaattttgatg 137  Q
    |||  ||| ||||||||    
T  6824583 tcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 23954791 - 23954894
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtca-ttgtacaaacattggggtgtta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| || | ||| ||||| ||||||||||    
T  23954791 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgtta 23954890  T
Q  120 ctca 123  Q
    ||||    
T  23954891 ctca 23954894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35934063 - 35933901
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| || |        | || |||||||||||      
T  35934063 aaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccacta-------agtgaggtgttactcaca 35933971  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  35933970 acacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcct 35933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 21088768 - 21088870
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21088768 aggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcac 21088867  T
Q  121 tca 123  Q
    |||    
T  21088868 tca 21088870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8437138 - 8436979
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||  |||||||||  |||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  8437138 aggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatgg-ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttac 8437040  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcac 181  Q
    ||| |||| ||| || | ||||||||||| |||| | ||||| ||||||| || |||||||    
T  8437039 tcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcac 8436979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5830063 - 5829897
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  5830063 gataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat---------tgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 5829973  T
Q  123 attacaattttgatg----ttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||| |||| |||    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||  |||||||| || ||||||||    
T  5829972 attacattttttatgttaattataatgttaacttcaccaaaaaaatcatttttacgacttcaccctagaattttcc 5829897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42342902 - 42342775
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||   |  |||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  42342902 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga--aattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactc 42342805  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaactt 152  Q
    |  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42342804 acaacatttttgatgttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956522
Alignment:
Q  99 tgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | || |||||||| || ||||||||||    
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttcctt 13956522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668690
Alignment:
Q  39 gtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgt 138  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  139 tatagtgttaacttca 154  Q
    || |||||||||||||    
T  25668704 ta-agtgttaacttca 25668690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 26317775 - 26317859
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||    
T  26317775 tggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcc 26317859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22255659 - 22255608
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaa 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22255659 tggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaa 22255608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898004
Alignment:
Q  57 gatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatc 156  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||| |||||||  | | |||||||||||| | || |||||||| |||| | ||||||| | |    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  157 caaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
      |||||| ||| | || |||||||| |||||||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgacttcaccctaaaatttt 11898004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 13956367 - 13956415
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatac 72  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13956367 ataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21320799 - 21320752
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  21320799 ttaacttcatcaaaaaagtcatttttattacttcaccatagaattttc 21320752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004552
Alignment:
Q  117 ttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtc-attcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttcc 16004552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5748519 - 5748478
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaact 151  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  5748519 tggggtgttactcattatatttttgacgttatagtgttaact 5748478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Original strand, 12081285 - 12081334
Alignment:
Q  158 aaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattttattgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  12081285 aaaaagtcattctcataacttcaccatataatttttctttaattaattgt 12081334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 33551016 - 33551189
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33551016 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttac 33551115  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  33551116 tcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcc 33551189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37905881 - 37905709
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37905881 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttac 37905782  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37905781 tcgttacattttttatgttatagtgttaacttca-ccaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcc 37905709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 43648277 - 43648416
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  43648277 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactc 43648376  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaag 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43648377 attacatttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaag 43648416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 19289353 - 19289524
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||  | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19289353 aggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttac 19289452  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     | ||||||||||| |||||||||||    
T  19289453 tcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcat-----tgacttcaccatagaattttccttt 19289524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 17071767 - 17071941
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||    
T  17071767 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaataatgagatgttac 17071866  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    | | |||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  17071867 ttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17071941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 11366413 - 11366585
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| | || | ||||||||    
T  11366413 gataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactc 11366512  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  11366513 attacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattttcct 11366585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26357750 - 26357577
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  |||| |  | ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  26357750 aggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttac 26357651  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  26357650 tcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcc 26357577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 19424660 - 19424832
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||    
T  19424660 gataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactc 19424759  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19424760 acaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttcaccataaaattttcct 19424832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 17054126 - 17054300
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |  | |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||    
T  17054126 aggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaacaatgagatgttac 17054225  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    | | |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  17054226 ttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcct 17054300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3177110 - 3176941
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  3177110 gataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactc 3177011  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  3177010 aaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 3176941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 29242168 - 29242343
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||    
T  29242168 aggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttac 29242267  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
     || || | |||| |||||||||| ||||||||| | |||||  |||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  29242268 gcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcctt 29242343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 4264107 - 4264281
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  4264107 aggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttac 4264206  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  4264207 tcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcct 4264281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36642154 - 36641988
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||       
T  36642154 aaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgca 36642055  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||| |||||||| |||||| |||| |||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  36642054 acacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 36641988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Original strand, 39167396 - 39167568
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39167396 ataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactca 39167495  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
      | | |||||||  |||  ||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  39167496 caatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcctt 39167568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 2325408 - 2325576
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  2325408 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttac 2325499  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||| |||| || |||||||||| |||||||||||    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  2325500 tcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttcaccatagaattttccttt 2325576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 43770869 - 43771039
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  43770869 aggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttac 43770968  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  43770969 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttca-ccaaaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13711635 - 13711465
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  || | ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  13711635 gataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactc 13711536  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    |  ||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  13711535 acaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 195
Target Start/End: Original strand, 27349970 - 27350143
Alignment:
Q  22 ggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  27349970 ggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttact 27350068  T
Q  122 cattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaa-gtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||  ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||  | ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  27350069 cacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaatattattttaatgacttcaccataaaattttcct 27350143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4478537 - 4478368
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||      
T  4478537 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcaca 4478438  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattct-tataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  4478437 acacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttcc 4478368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Original strand, 31570766 - 31570939
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||| | || ||| | ||||||||||||     
T  31570766 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttactt 31570865  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |  ||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31570866 acaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattttcctt 31570939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 41463882 - 41464051
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  41463882 gataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactc 41463981  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |  ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  41463982 acaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4763801 - 4763628
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4763801 ataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactca 4763702  T
Q  124 ttacaattttgatgttatag---tgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
     |||| ||||| || |||||   |||||||||||||  |||||||||| | || |||||| |||| ||||||||    
T  4763701 ctacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcc 4763628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 33660398 - 33660569
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||    
T  33660398 aggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttac 33660497  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  33660498 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4167095 - 4166920
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4167095 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttac 4166996  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||  | | |||||||  |||| ||||||||||| |  |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||    
T  4166995 tcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcctt 4166920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33902239 - 33902068
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  33902239 aggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattac 33902140  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||| |||| ||||  |||||||||||||| |  |||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||    
T  33902139 tcactacattttttatgt--tagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaacgacttcatcatagaattttcc 33902068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19314020 - 19313852
Alignment:
Q  25 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcat 124  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||| ||| | |  |||||||||||     
T  19314020 taaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcac 19313922  T
Q  125 tacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
     ||| |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19313921 aacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttcc 19313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35959021 - 35958909
Alignment:
Q  82 tgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcac 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||     
T  35959021 tgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcat 35958922  T
Q  182 cataaaattttcc 194  Q
    |||| ||||||||    
T  35958921 catagaattttcc 35958909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 33709262 - 33709395
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  33709262 aggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttac 33709361  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    ||   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33709362 tcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttca 33709395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44913834 - 44913662
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactat-gatgattgaacttttaatgtcattgtacaaac-attggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  44913834 gataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttac 44913735  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| |||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||    
T  44913734 tcacaacatttttgatactacagtgttaacttca-cataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 44913662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45327893 - 45327817
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtca 97  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45327893 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5881706 - 5881533
Alignment:
Q  27 aaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatta 126  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || | ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  |    
T  5881706 aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaa 5881607  T
Q  127 ca-----attttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||      ||||||||||||| | | ||||||| |  |||||||||| | || ||||||| |||||||||||||    
T  5881606 cacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcacaataaaattttcct 5881533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41961013 - 41960939
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  41961013 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatgt 41960939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 18494310 - 18494474
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||             |||||||||||    
T  18494310 aggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttac 18494397  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||    
T  18494398 tcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccacagaattttccttt 18494474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 31862021 - 31861956
Alignment:
Q  25 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaactttt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  31862021 taaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaatttt 31861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44286119 - 44285951
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  || | ||||||| ||| || | |||||||| || | | || |||     
T  44286119 ataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcg 44286020  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
      ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||  || |||||||| || ||||||    
T  44286019 caacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaatcattcgcatgacttcaccgtataatttt 44285951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41960947 - 41960881
Alignment:
Q  130 ttttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41960947 ttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatttctatgacttcaccatagaattttcctt 41960881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 7006953 - 7007053
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||   | | ||||||| |||  | |||||||||| |||| ||||||||    
T  7006953 gataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgttactc 7007052  T
Q  123 a 123  Q
    |    
T  7007053 a 7007053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41465591 - 41465509
Alignment:
Q  112 gggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  41465591 gggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 41465509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Original strand, 19501764 - 19501823
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactat 75  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19501764 caaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactat 19501823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31861961 - 31861895
Alignment:
Q  128 aattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||| | ||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31861961 aattttgatatcataatattaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 31861895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Original strand, 18514771 - 18514819
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  18514771 ttaacttcatcaaaaaagtcattctcatgacttcactataaaattttcc 18514819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 195
Target Start/End: Original strand, 39788590 - 39788626
Alignment:
Q  159 aaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39788590 aaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcct 39788626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22963435 - 22963400
Alignment:
Q  159 aaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22963435 aaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcc 22963400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 194
Target Start/End: Original strand, 22998042 - 22998077
Alignment:
Q  159 aaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22998042 aaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcc 22998077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  49 gttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtca-ttgtacaaacattggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgtt 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| || | ||||||| | ||  ||||||  ||  ||| |||||||| |||||| ||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  148 aacttcatccaaaaagtcat 167  Q
    | |||||||  |||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19093461 - 19093407
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttatt 200  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19093461 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccataaaattttcctttatt 19093407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 35959064 - 35959023
Alignment:
Q  27 aaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatg 68  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35959064 aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatg 35959023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 43446463 - 43446511
Alignment:
Q  147 taacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  43446463 taacttcaccgaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 43446511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 197
Target Start/End: Original strand, 4318839 - 4319010
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  4318839 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcata 4318938  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  4318939 acacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccttt 4319010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1946005 - 1945831
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1946005 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactc 1945906  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatc-caaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  1945905 attacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcctt 1945831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5627562 - 5627389
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  5627562 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactc 5627463  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  5627462 attatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcctt 5627389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 7055228 - 7055400
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| | || |||||||||     
T  7055228 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttacta 7055327  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7055328 attatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcct 7055400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 7235046 - 7235218
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||| |||    
T  7235046 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatga-gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctac 7235144  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7235145 tcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 7235218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29182336 - 29182156
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  29182336 aggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttac 29182237  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctttattt 201  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29182236 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttttcttaattt 29182156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8513401 - 8513232
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||      
T  8513401 aaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcaca 8513302  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  8513301 acacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcct 8513232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 33893014 - 33893186
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  33893014 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagg-gactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttac 33893112  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcc 194  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  33893113 tcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcc 33893186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 3879950 - 3880124
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3879950 aggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttac 3880049  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| |||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  3880050 tcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcct 3880124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15491788 - 15491631
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  15491788 aggataaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttac 15491689  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataactt 178  Q
    |||  ||| ||||||||||| | |||||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  15491688 tcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctcataactt 15491631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6089076 - 6088910
Alignment:
Q  26 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactcatt 125  Q
    |||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || | |||||||| ||||| ||||||||      
T  6089076 aaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcaca 6088977  T
Q  126 acaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  6088976 acacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 30353371 - 30353540
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||| |  ||| || |||||||||| || | | ||||||    
T  30353371 gataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaacagtgagatattactc 30353470  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
       ||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  30353471 gcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 21017123 - 21017270
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  21017123 aggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttac 21017222  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcatt 168  Q
    |||  ||| |||| ||  || | ||||||||||| | |||||||||||    
T  21017223 tcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcatt 21017270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 6091196 - 6091313
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6091196 gataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactc 6091295  T
Q  123 attacaattttgatgtta 140  Q
    | |||| |||| ||||||    
T  6091296 actacattttttatgtta 6091313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33619007 - 33618874
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||  ||||||| | |||| || |||    
T  33619007 aggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctac 33618908  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttca 154  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  33618907 tcactacacttttgatgcgatagtgttgacttca 33618874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20768261 - 20768087
Alignment:
Q  15 caaaggaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| || |  ||||||| | ||     
T  20768261 caaagtaggataaaattagattaagt--aatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccact-aacaaacaat-gga 20768166  T
Q  115 tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttc 193  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  20768165 tgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498430
Alignment:
Q  63 ttgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattgggg-tgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||| || |||||||||  ||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |   ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  162 agtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||    
T  18498465 agtcattctcatgacttcactatagatttttccttt 18498430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19631797 - 19631747
Alignment:
Q  146 ttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19631797 ttaacttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcctt 19631747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44128 - 43959
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  44128 gataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactc 44029  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  44028 attacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 43959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 154659 - 154828
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  154659 gataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactc 154758  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  154759 attacatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 154828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 146030 - 146199
Alignment:
Q  23 gataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  146030 gataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactc 146129  T
Q  123 attacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  146130 attacattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccgtagaatttt 146199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Original strand, 94398 - 94542
Alignment:
Q  24 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttactca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  ||   ||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  94398 ataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactca 94497  T
Q  124 ttacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcatt 168  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  94498 ctacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 94542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 133
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  307 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttac 208  T
Q  121 tcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    |||  ||| |||| ||  || ||||||||||||| |  |||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||    
T  207 tcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcct 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 408441 - 408559
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtacaaacattggggtgttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||| |||||||  |  ||||||||    
T  408441 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttac 408539  T
Q  121 tcattacaattttgatgtta 140  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  408540 tcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Original strand, 408702 - 408756
Alignment:
Q  142 agtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcctt 196  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  408702 agtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcctt 408756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12082 - 11908
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattg-tacaaac-attggggtgtt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||  || || ||||||| || ||||||||    
T  12082 aggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgtt 11983  T
Q  119 actcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtca-ttcttataacttcaccataaaatttt 192  Q
    |||||  ||| |||| ||||||| ||||||| |||| |  |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  11982 actcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 267457 - 267331
Alignment:
Q  21 aggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatgtgatgaattgatgatactatgatgattgaacttttaatgtcattgtac-aaacattggggtgtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||   || ||||||||| ||| || ||||| ||||| | || |||||    
T  267457 aggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgtta 267358  T
Q  120 ctcattacaattttgatgttatagtgt 146  Q
    |||| || | |||||||| ||||||||    
T  267357 ctcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42432 - 42347
Alignment:
Q  110 tggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttcct 195  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42432 tggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcct 42347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 100885 - 100818
Alignment:
Q  130 ttttgatgttatagtgttaacttcatccaaaaagtcattcttataacttcaccataaaattttccttt 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  100885 ttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccttt 100818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University