View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16543_low_9 (Length: 592)

Name: NF16543_low_9
Description: NF16543
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16543_low_9
NF16543_low_9
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (16-592)||(2553348-2553924)
chr6 (19-454)||(24767285-24767715)
chr6 (16-307)||(21168194-21168486)
chr6 (103-454)||(18651174-18651525)
chr6 (188-454)||(12733974-12734240)
chr6 (47-380)||(15958697-15959030)
chr6 (46-381)||(14372874-14373209)
chr6 (31-446)||(20882901-20883316)
chr6 (332-454)||(21168074-21168196)
chr6 (31-446)||(21629975-21630392)
chr6 (196-446)||(17579114-17579364)
chr6 (361-454)||(5734439-5734532)
chr6 (196-446)||(17573688-17573938)
chr6 (31-278)||(10577117-10577364)
chr6 (196-446)||(17606367-17606617)
chr6 (30-295)||(13937708-13937973)
chr6 (337-446)||(11462270-11462378)
chr6 (20-60)||(26513967-26514007)
chr6 (20-67)||(649923-649970)
chr6 (46-93)||(11462617-11462664)
chr6 (20-67)||(18051306-18051353)
chr6 (31-66)||(25318091-25318126)
chr6 (31-66)||(26205585-26205620)
chr6 (30-84)||(18682401-18682455)
chr6 (552-585)||(6940575-6940608)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (16-454)||(34332668-34333106)
chr3 (18-454)||(40930383-40930819)
chr3 (16-454)||(2364126-2364564)
chr3 (16-454)||(7312626-7313063)
chr3 (20-450)||(19920086-19920516)
chr3 (16-454)||(10323424-10323862)
chr3 (16-454)||(7032167-7032593)
chr3 (103-416)||(26770929-26771242)
chr3 (196-446)||(35214404-35214654)
chr3 (31-381)||(48569907-48570257)
chr3 (30-295)||(963030-963295)
chr3 (196-278)||(29523778-29523860)
chr3 (201-446)||(7031055-7031300)
chr3 (101-302)||(17097814-17098015)
chr3 (196-278)||(11203844-11203926)
chr3 (197-278)||(33496572-33496653)
chr3 (30-322)||(2755823-2756115)
chr3 (196-278)||(12342259-12342340)
chr3 (31-248)||(19890733-19890950)
chr3 (172-296)||(16178955-16179079)
chr3 (328-446)||(36801240-36801358)
chr3 (100-257)||(15312629-15312786)
chr3 (30-253)||(3140902-3141125)
chr3 (349-446)||(33496404-33496501)
chr3 (23-66)||(26010284-26010327)
chr3 (20-67)||(47537504-47537551)
chr3 (196-278)||(36801108-36801190)
chr3 (145-218)||(20532031-20532104)
chr3 (31-60)||(31675173-31675202)
chr3 (31-60)||(31921218-31921247)
chr3 (20-60)||(9509997-9510037)
chr3 (20-60)||(9517972-9518012)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (16-454)||(11277105-11277543)
chr7 (16-454)||(47876832-47877270)
chr7 (20-452)||(29967826-29968257)
chr7 (16-454)||(37919393-37919831)
chr7 (22-451)||(235296-235727)
chr7 (16-454)||(4937981-4938419)
chr7 (16-454)||(17720484-17720922)
chr7 (285-454)||(31177427-31177596)
chr7 (31-422)||(37254639-37255030)
chr7 (196-422)||(25619340-25619566)
chr7 (196-278)||(18532653-18532735)
chr7 (361-446)||(18530367-18530452)
chr7 (31-116)||(25619652-25619737)
chr7 (31-66)||(45943088-45943123)
chr7 (31-93)||(31422814-31422876)
chr7 (31-89)||(36363738-36363796)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (16-454)||(13396237-13396675)
chr8 (16-454)||(41665222-41665660)
chr8 (20-452)||(32266415-32266845)
chr8 (16-454)||(7924235-7924673)
chr8 (17-454)||(8299652-8300089)
chr8 (16-454)||(9922450-9922888)
chr8 (16-454)||(171952-172390)
chr8 (140-422)||(13200004-13200286)
chr8 (31-446)||(2170197-2170614)
chr8 (196-446)||(43270307-43270557)
chr8 (335-454)||(20496933-20497052)
chr8 (31-381)||(13879355-13879705)
chr8 (196-446)||(20824153-20824403)
chr8 (211-380)||(34137011-34137180)
chr8 (196-446)||(5181527-5181777)
chr8 (196-446)||(37433989-37434239)
chr8 (31-254)||(25090436-25090659)
chr8 (378-452)||(32567480-32567554)
chr8 (231-380)||(2529809-2529958)
chr8 (196-278)||(17699507-17699589)
chr8 (328-446)||(17699339-17699457)
chr8 (21-66)||(12134565-12134610)
chr8 (557-591)||(26087797-26087831)
chr8 (31-72)||(13200296-13200337)
chr8 (45-94)||(42177471-42177520)
chr8 (31-67)||(37039877-37039913)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (16-454)||(15740070-15740508)
chr4 (16-450)||(1828393-1828827)
chr4 (16-454)||(19755111-19755554)
chr4 (16-454)||(19784252-19784695)
chr4 (17-454)||(47685749-47686186)
chr4 (16-454)||(23642444-23642882)
chr4 (43-454)||(7403762-7404177)
chr4 (16-454)||(47418654-47419091)
chr4 (103-454)||(13270831-13271182)
chr4 (43-294)||(55725566-55725817)
chr4 (196-446)||(12697670-12697920)
chr4 (335-454)||(159863-159982)
chr4 (47-380)||(11587082-11587415)
chr4 (43-278)||(2821917-2822152)
chr4 (196-422)||(20002599-20002832)
chr4 (196-278)||(45472742-45472824)
chr4 (31-117)||(54483027-54483113)
chr4 (34-117)||(48312281-48312364)
chr4 (196-446)||(8360957-8361207)
chr4 (384-454)||(20788501-20788571)
chr4 (30-254)||(46145724-46145948)
chr4 (202-296)||(5790131-5790225)
chr4 (20-67)||(20395832-20395879)
chr4 (349-446)||(4548405-4548502)
chr4 (20-60)||(4640536-4640576)
chr4 (22-66)||(29553599-29553643)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (32-452)||(23238234-23238655)
chr5 (20-454)||(28535532-28535966)
chr5 (16-454)||(35983644-35984082)
chr5 (16-454)||(30732167-30732605)
chr5 (16-454)||(12825048-12825486)
chr5 (16-454)||(27117014-27117452)
chr5 (17-454)||(42927980-42928417)
chr5 (16-454)||(42513569-42514007)
chr5 (181-452)||(8227877-8228148)
chr5 (16-302)||(31641513-31641798)
chr5 (196-454)||(19255155-19255414)
chr5 (249-454)||(12820035-12820240)
chr5 (335-454)||(3418632-3418751)
chr5 (196-446)||(25857457-25857707)
chr5 (31-381)||(27795405-27795755)
chr5 (22-238)||(24407993-24408209)
chr5 (31-446)||(8300050-8300465)
chr5 (196-282)||(27767063-27767149)
chr5 (196-398)||(33385407-33385609)
chr5 (30-295)||(33169666-33169931)
chr5 (106-297)||(26072898-26073089)
chr5 (197-398)||(10776669-10776870)
chr5 (403-454)||(25824860-25824911)
chr5 (145-381)||(27165934-27166170)
chr5 (196-422)||(18359125-18359350)
chr5 (200-278)||(18089798-18089876)
chr5 (31-60)||(476456-476485)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (20-446)||(3109-3535)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (16-454)||(11908958-11909396)
chr1 (16-454)||(6050452-6050890)
chr1 (17-454)||(35540898-35541335)
chr1 (85-454)||(51052329-51052698)
chr1 (31-380)||(47622945-47623292)
chr1 (362-454)||(6259666-6259758)
chr1 (368-454)||(4842253-4842339)
chr1 (196-422)||(37191243-37191469)
chr1 (196-292)||(16917842-16917938)
chr1 (31-446)||(43388224-43388639)
chr1 (337-446)||(16917983-16918092)
chr1 (22-86)||(2491429-2491493)
chr1 (16-60)||(22191634-22191678)
chr1 (155-241)||(28351776-28351862)
chr1 (20-66)||(48265575-48265621)
chr1 (16-60)||(3073993-3074037)
chr1 (205-257)||(22191823-22191875)
chr1 (20-64)||(30110782-30110826)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (16-454)||(105696-106134)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (19-446)||(41206873-41207300)
chr2 (113-454)||(4552018-4552359)
chr2 (46-381)||(28252642-28252977)
chr2 (35-445)||(12645394-12645804)
chr2 (196-446)||(15917511-15917761)
chr2 (196-380)||(17764995-17765179)
chr2 (31-381)||(40176591-40176940)
chr2 (198-446)||(14439610-14439857)
chr2 (196-446)||(10999984-11000233)
chr2 (196-376)||(38604407-38604587)
chr2 (31-66)||(22052864-22052899)
chr2 (31-90)||(38604247-38604306)
chr2 (20-66)||(36804149-36804195)
chr2 (20-60)||(18844490-18844530)
chr2 (31-67)||(44547716-44547752)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (144-454)||(11186-11496)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (467-590)||(6432-6554)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (20-67)||(182365-182412)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (31-60)||(7911-7940)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (31-60)||(34477-34506)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 500; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 2553924 - 2553348
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2553924 aggcggttgtgggcttgggagtagaagttggtaaaggagtgtagggctttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttgat 2553825  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553824 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 2553725  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553724 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 2553625  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553624 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 2553525  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactttttgcttttaaactacgaagctgtcctgattatgtaatccgaaaactattgggaatttccg 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2553524 catggctaggagtgataggggtcgattctcaatcaactttttgcttttaaactacgaagctgtccggattatgtaatccaaaaactattgggaatttcct 2553425  T
Q  516 gattttgttttccaaagggctattttgtannnnnnngcagagcgcgtgagaagggcatagggtgggaaaaataatag 592  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553424 gattttgttttccaaaaggctattttgtatttttctgcaggtcgtgtgagaagggcatagggtgggaaaaataatag 2553348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 454
Target Start/End: Original strand, 24767285 - 24767715
Alignment:
Q  19 cggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttac 118  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||     ||||||| | |||||||| |||||||    
T  24767285 cggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttgtattactaacagtttccttgaag-----agtgacaaatagatggctatggttac 24767379  T
Q  119 ctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataa 218  Q
    | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  24767380 caaatcaggatgataggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccctagttacatcaaaatatggagttaattttgcataa 24767479  T
Q  219 acaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggag 318  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24767480 acaggttcctatcaaagtctctatccttgcttgacgacttcttagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaatcgtggcattttacctttggag 24767579  T
Q  319 gcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcat 418  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24767580 gcgcggttgtgtgtttttggttgcgggaacgttgaagatgttaataatttgtttttgtcttgtccaacttttagtgccttatgaccattggtgcgggcat 24767679  T
Q  419 ggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24767680 ggctcggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 24767715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21168486 - 21168194
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168486 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 21168387  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21168386 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgttgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 21168287  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaa-aaaataatttggcaaaccgtggcattt 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  21168286 taaataggttcctctcaaagtatctatcctagcttggagacttttgcaagatcgattacctacaaaaaaaaaaattggcaaaccgtggcattt 21168194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 103 - 454
Target Start/End: Original strand, 18651174 - 18651525
Alignment:
Q  103 agatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatgg 202  Q
    |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  18651174 agatggttgtggttaccaaatcaggatggtgggtattctgtacatggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttagatcaaaatatgg 18651273  T
Q  203 agttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18651274 agttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtctctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggaaaaccgtgg 18651373  T
Q  303 cattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtt-tttgtcttgtgtaacttttagtgcattatg 401  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||  ||||||||| || ||||     
T  18651374 gattttacctttggatgcgcggttgtgtgtctctggatgcgggaccgttgaagatgtcaatcacttgttctttgt-gtgtccaacttttagcgccttatt 18651472  T
Q  402 accaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18651473 gccattggtgcgagcatggctaggagtggtcggggtcgactctcaatcaactt 18651525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 188 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12734240 - 12733974
Alignment:
Q  188 tacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataa 287  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||    
T  12734240 tacatcataatatggatttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaa 12734141  T
Q  288 tttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaact 387  Q
    ||||| || |||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  12734140 tttggtaacccgtggcattctatctctggaggagcggttatgtgtttctagatgtgggaatgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaact 12734041  T
Q  388 tttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||| | |||||||| || ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12734040 tttggagcattatggccgatggtgcaggattggttaggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 12733974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 380
Target Start/End: Original strand, 15958697 - 15959030
Alignment:
Q  47 tagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacg 146  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | || |||||| | ||||||||  |||| | |||||||||||| || ||    
T  15958697 tagaggaatgtagggttttattactgacagtttctttgcaggaatcattgcctgatagatggttgtggttaccggatcaaggtggtgggtattcagttcg 15958796  T
Q  147 tggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatcctt 246  Q
     || || | ||| |||||||||||||| || || |  |||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15958797 cggtgtgtctgacatgctgacatcacaggaacaacttcagttacatccaaatatgaagttaatatggcataaacaggttcctcttaaagtctctattctt 15958896  T
Q  247 gcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtggga 346  Q
    |||||||| |||||||  ||||  |||||||| |||   ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||     
T  15958897 gcttggcggcttttgagggatcatttacctacgaaagcaaatttggcaaaccatggtatcattcctttggaggtgcagttgtgtgtcactgattgtgggc 15958996  T
Q  347 acgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 380  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15958997 acgtggaagatgtgaatcacttgtttttatcttg 15959030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Original strand, 14372874 - 14373209
Alignment:
Q  46 gtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtac 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  | || |||||| | ||||||||  |||| |  ||||| || || || |    
T  14372874 gtagaggagtgtagggctttattactgacagtttctttgcaggaatctgtttccgatagatggttgtggttaccggatcagggaggtggttactcagtcc 14372973  T
Q  146 gtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatcct 245  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||   |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  14372974 gtggggtgtatgacatgctgacatcccaggaacagcctcagttacattcttctatggatttaatttggcataaacaggtacctctaaaagtatctattct 14373073  T
Q  246 tgcttggcgacttttgaaagatcgg-ttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgg 344  Q
    ||||||||  |||||||  || ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |  || |||||| || |||||||||||| || | |||    
T  14373074 tgcttggcagcttttgag-gaacggcttacctacgaaaggaaatttggcaaaccgtggcattatttctatggaggggcggttgtgtgtttccggttatgg 14373172  T
Q  345 gaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgt 381  Q
    | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14373173 gcatgatgaagatgtaaatcatttgtttttgtcttgt 14373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 446
Target Start/End: Original strand, 20882901 - 20883316
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||  ||||   |     
T  20882901 tgggaggaggacctggtagaagggtgtagggatttattactaacagtctctttgcaggaatcagaaacagacaggtggttgtggttaccggatcagatta 20883000  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    | || |||  ||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| || || || ||  | || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  20883001 gaggctatattgttcgtggtgtatatgacatgttgacatcacaggaacaaccacatgttcatcaaaatatggagttaatctggcataaataggttccttt 20883100  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||| | |||||||| |||   || |||| | | ||||||||| || || ||||||| | ||| |||    
T  20883101 aaaagtttctatccttgcttggcggctgttgagggattgtttacctactaaatcgaacttggtagatcgtggcattatatctgtggaggctcggttttgt 20883200  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtgg 430  Q
    ||  | ||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||  || |||  ||||||| || || ||||||||| ||||||| || || |    
T  20883201 gtcacgggatgtgggcatgttgaagatatgaatcatatgtttttgtcttgtccaattttcggtgcattgtggcctatggtgcggacatggcttggtgtcg 20883300  T
Q  431 taggggtcgattctca 446  Q
     |||||| ||||||||    
T  20883301 aaggggtagattctca 20883316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21168196 - 21168074
Alignment:
Q  332 tttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggt 431  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  21168196 tttctgggtgtgggaatgttgaagatgttaatcatatgtttttgtcttgtgtaacttttggtgctttatggccattgatgcgagcatggctaggagtggt 21168097  T
Q  432 aggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  21168096 gggggtcgattctcaatcaactt 21168074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 446
Target Start/End: Original strand, 21629975 - 21630392
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| | ||||| ||  ||||   |     
T  21629975 tgggaggaggaattgttagtagagtgtagggatttattactgacagttactttgcaggaaacagaaacagacaggtggatatggttgccggatcagattt 21630074  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
     ||| ||| |||| ||||| || |||||  || |||||||||| || || || ||  | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21630075 ctggttatactgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaccaggttccttt 21630174  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaa--aataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgt 328  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || |||||||   | ||||| ||| || || ||||    | ||| |    
T  21630175 aaaagtttctatccttgtttggcgactattgagggatcgtttacctacaaaatcaaaaatttggtggaacgtgggattatatctgtggaaaatcggtttt 21630274  T
Q  329 gtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagt 428  Q
    ||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| |||| || || ||  |||||||||| ||||| || ||    
T  21630275 gtgtaacgggatgcgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgctttgtggcctttggtgcgggcttggcttggtgt 21630374  T
Q  429 ggtaggggtcgattctca 446  Q
     | |||||||||||||||    
T  21630375 cgaaggggtcgattctca 21630392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Original strand, 17579114 - 17579364
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||       
T  17579114 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctactaaatctaatttggtgg 17579213  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
      || || ||| || || ||||    | ||| |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| ||||    
T  17579214 cacgagggattatagctgtggaaaaccggttttgtgtaacgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccgacttttggtgc 17579313  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
     || || ||  |||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  17579314 cttgtggcctctggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 17579364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 454
Target Start/End: Original strand, 5734439 - 5734532
Alignment:
Q  361 aatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  5734439 aatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgctttatgatcattggtgcgagcatggcttggagtggtaagggttgactctcaatcaactt 5734532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Original strand, 17573688 - 17573938
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||       
T  17573688 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagattctatccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctactaaatctaatttggtgg 17573787  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
      || || ||| || || ||||    | ||| |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| ||||    
T  17573788 cacgagggattatagctgtggaaaaccggttttgtgtaacgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccgacttttggtgc 17573887  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
     || || ||  |||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  17573888 cttgtggcctctggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 17573938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 278
Target Start/End: Original strand, 10577117 - 10577364
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||| | ||||| ||  |||||  |     
T  10577117 tgggaggaggaattgctagtagagtgtagggatttattactgacagtctctttgcaggaaacagaaacagacaggtggttgtggttgccggatcatattt 10577216  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
     ||| ||| ||||  |||| || |||||  |  |||||||||| || || || ||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10577217 ctggttatactgtttgtggtgtatatgactttttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatagagttaatttggcataaacaggttccttt 10577316  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
     ||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  10577317 aaaagtttatatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 10577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Original strand, 17606367 - 17606617
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||   |||||||       
T  17606367 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcatttacctactaaatcaaatttggtgg 17606466  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||||| ||| || || ||||    |  || |||||  | ||||  ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||    
T  17606467 aacgtggaattatagctgtggaaaatcgattttgtgtaacgggatacgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgc 17606566  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||| ||  |  |||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  17606567 attgtggtctttggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 17606617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13937973 - 13937708
Alignment:
Q  30 ttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||| ||       ||||| ||||||||||||||  ||||   |    
T  13937973 ttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggaattattacttacagttactttgcaggattcctcttttgacaggtggctttggttaccagatcagact 13937874  T
Q  130 ggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctc 229  Q
    ||||||||| | ||   ||| || ||||||||| |||| || || || || |||  |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  13937873 ggtgggtatacggttaatggtgtgtatgatatgttgacttcgcaggaacaacccatgttacatcaaaatatggagttgatttggcacaaacaggtgcctt 13937774  T
Q  230 tcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    | ||||| |||||  ||||||||||  |  |||  || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13937773 tgaaagtgtctatttttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctactaaacaaaatttggcaa 13937708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11462378 - 11462270
Alignment:
Q  337 ggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtagggg 436  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||  ||||||| || || ||||||||||||||||| || || | |||||    
T  11462378 ggatgtgggcatgttgaagatgtgaatcatatgtttttgtcttgtccaattttcggtgcattgtg-cctatggtgcgggcatggcttggtgtcgaagggg 11462280  T
Q  437 tcgattctca 446  Q
    | ||||||||    
T  11462279 tagattctca 11462270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26514007 - 26513967
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26514007 ggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 26513967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Original strand, 649923 - 649970
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  649923 ggttgtgggcttgggaggaggaggagttagaggagtgtagggctttat 649970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11462664 - 11462617
Alignment:
Q  46 gtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatca 93  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11462664 gtagaagagtgtagggatttattactaacagtctctttgcaggaatca 11462617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Original strand, 18051306 - 18051353
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  18051306 ggttgtgggcttgggaggaggaggagttagaggagtgtagggctttat 18051353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25318126 - 25318091
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25318126 tgggaggaggagttgctagaggagtgtagggcttta 25318091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 26205620 - 26205585
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26205620 tgggaggaggagttgctagaggagtgtagggcttta 26205585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 18682401 - 18682455
Alignment:
Q  30 ttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttg 84  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  18682401 ttgggaggaagagttggcagaggagtgtagggctctattactcacagttactttg 18682455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 6940608 - 6940575
Alignment:
Q  552 gcagagcgcgtgagaagggcatagggtgggaaaa 585  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6940608 gcagtgcgcgtgagaagggcatagggtgggaaaa 6940575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 34332668 - 34333106
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34332668 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgtcagacagatggctttggt 34332767  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34332768 tacctaatcaggatggtgggtattatgtacgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacatcataatatggagttaatttggca 34332867  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34332868 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcaacttctgagagatcgattacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 34332967  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34332968 gaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcggg 34333067  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34333068 catggctaggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 34333106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 18 - 454
Target Start/End: Original strand, 40930383 - 40930819
Alignment:
Q  18 gcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtta 117  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40930383 gcggtggtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttctttgcaagaatcagtgacaaatagatggctttggtta 40930482  T
Q  118 cctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcata 217  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||| |||| ||||    
T  40930483 ccaaatcaggatggtgtgtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcaacctcagttgcatcaaaacatggagttagtttgacata 40930582  T
Q  218 aacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttgga 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40930583 aacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgagggattggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggccttttacctttgga 40930682  T
Q  318 ggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggca 417  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40930683 ggcgcggttgtgtgtttctggttgtgggaacgtcgaagatgtcaatcatttgtttttgtcttgttcaacttttagtgccttatggccaatggtgcgggca 40930782  T
Q  418 tggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40930783 tggcttggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 40930819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2364564 - 2364126
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  2364564 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgttagacagatggctctggt 2364465  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2364464 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttggca 2364365  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  2364364 taaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 2364265  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  2364264 gaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 2364165  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2364164 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 2364126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7313063 - 7312626
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7313063 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctctggt 7312964  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7312963 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttggca 7312864  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |  || ||    
T  7312863 taaacaggtacctctcaaagtatctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctgtctgtg 7312764  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || | | |||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  7312763 gaggagcggctttgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattaag-ccgatggtgcggg 7312665  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  7312664 attggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaactt 7312626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 450
Target Start/End: Original strand, 19920086 - 19920516
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacc 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19920086 ggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctctggttacc 19920185  T
Q  120 taatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaa 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19920186 taatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgttgacatcacaggagaagccccagttacaccatcatatggacttaatttggcataaa 19920285  T
Q  220 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||| || || ||||||    
T  19920286 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggtaaatcgaggcattctatctgtggagg 19920385  T
Q  320 cgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatg 419  Q
     || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||    
T  19920386 agcggttatgtgtttctggatgtgggaatgtcgaagatgcttctcatttgtttttgtcttgtgtaacttttggtgcattatggccgatggtgcgggattg 19920485  T
Q  420 gctaggagtggtaggggtcgattctcaatca 450  Q
    | |||| |||||||| ||||| |||| ||||    
T  19920486 gttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatca 19920516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 10323424 - 10323862
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| | ||    
T  10323424 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggattcagtgttagatagatggctctagt 10323523  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10323524 tacctaatcaagctgatgggtattcagtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccatagtatggacttaatttggca 10323623  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| || ||  |    
T  10323624 taaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaactcgtggcattctatctggg 10323723  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    || | || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  10323724 gatgagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 10323823  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10323824 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 10323862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7032593 - 7032167
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  7032593 aggcgtttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagttacattgcaggaatcggtgatagatagatggctttggt 7032494  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||   | ||  || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||            |||| |||||||  |||||||    
T  7032493 tattaattctggacggtgggtattttgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagcc------------taatttggagttggtttggca 7032406  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||  |||||||||||    
T  7032405 caaacaggttcctctcaaaatttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaacaatctggcgaattgtggtcttttacctttg 7032306  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    || |||| || |||||| || || || |||  ||| |||||||||| ||||||||| |||   ||    ||||| || || |||||  |   ||||||||    
T  7032305 gatgcgcggtcgtgtgtctcaggttgcggggccgtcgaagatgttactcatttgttcttggtgtgcccgactttcagcgctttatggtctgcggtgcggg 7032206  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7032205 catggctcggagtggtgggggtcgactctcaatctactt 7032167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 416
Target Start/End: Original strand, 26770929 - 26771242
Alignment:
Q  103 agatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatgg 202  Q
    |||||| | ||||||||  |||| | ||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| ||| || || ||  ||||||| |  |||||||    
T  26770929 agatggttgtggttaccagatcagggtggcgggtattcagttcgtggtgtgtatgacatgctaacattacaggaacatccttagttacatccaaatatgg 26771028  T
Q  203 agttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgg 302  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||    
T  26771029 agttaatgtggcataaacaggctcctcttaaagtctctattcttacttggcggcttttgagggatcgtttacctacgaaagcaaatttggcaaaccgtgg 26771128  T
Q  303 cattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatga 402  Q
     ||  | |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   || ||||||||| |||||     
T  26771129 tatcattcctttggaggtgcagttgtgtgtcactggttgtgggcacgtggaagatgtgaatcacttgtttttgtcttgcccaatttttagtgccttatgg 26771228  T
Q  403 ccaatggtgcgggc 416  Q
    ||| ||||| ||||    
T  26771229 ccattggtgagggc 26771242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Original strand, 35214404 - 35214654
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||  | ||||  ||||| || ||||| |||   |||||| ||     
T  35214404 aatatggagttaatctggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgtttggcggatgttgagggatcgtttgcctactaaatcaaatttgccag 35214503  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||||| ||| ||  | |||| || ||||| |||||  | |||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||| ||||    
T  35214504 aacgtgggattctatatgtggaagctcagttttgtgtaacgggatgttggcatgttgaagatgtgaatcatttgttcttgtcttgtccaatttttggtgc 35214603  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||    
T  35214604 attgtggcctatggtgcgggcatggcttggtgtcgaaggggtagattctca 35214654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 381
Target Start/End: Original strand, 48569907 - 48570257
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| | ||||||||  |||    ||    
T  48569907 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttactactaacagtctctttgcaggaatccgatactgacagatgggtgtggttaccggatccgattg 48570006  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    |||| ||| |||| ||||| || |||||  || |||||||||| || || || ||  | || || |||||||||||||| | ||| |||||| | |||||    
T  48570007 gtggctatactgttcgtggggtatatgacttgttgacatcacatgaacaacctcatattcatcaaaatatggagttaatctagcacaaacagatacctct 48570106  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
     ||||| ||  ||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||||| |||  |||| || |||| || |||||||||||  |||||||   | | |||    
T  48570107 aaaagtttcagtccttgcttagcggttgttgagggatcgtttacctactaaagctaatctgacaaatcgcggcattttaccgatggaggctaggctttgt 48570206  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgt 381  Q
    ||  | ||||||||| | |||||||||||   |||| |||||||| |||||    
T  48570207 gtcacgggatgtgggcatgttgaagatgtgtctcatatgtttttgacttgt 48570257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Original strand, 963030 - 963295
Alignment:
Q  30 ttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgat 129  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||| ||     | ||||| ||||||||||||||  ||||   |    
T  963030 ttgggaggaagaattggtagaggagtgtagggaattattacttacagttactttgcaggattcctcttctgacaggtggctttggttaccagatcagact 963129  T
Q  130 ggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctc 229  Q
    ||||||||| | || ||||| || |||||||||||||| || || || || |||  |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  963130 ggtgggtatacggttcgtggtgtgtatgatatgctgacttcgcaggaacaacccatgttacatcaaaatatggagttgatttggcacaaacaggtgcctt 963229  T
Q  230 tcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    | ||||| |||||  ||||||||||  |  |||  || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  963230 tgaaagtgtctatttttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctactaaacaaaatttggcaa 963295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Original strand, 29523778 - 29523860
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  29523778 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 29523860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 446
Target Start/End: Original strand, 7031055 - 7031300
Alignment:
Q  201 ggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||     ||     
T  7031055 ggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaactttctatccttgcttggcgtctgttgagggatcgcttacctactaaatctaatttggtggcacga 7031154  T
Q  301 ggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattat 400  Q
    || |||||| || ||||    | ||| |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| |||| || |    
T  7031155 gggattttagctgtggaaaaccggttttgtgtaacgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccgacttttggtgctttgt 7031254  T
Q  401 gaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    | ||  |||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  7031255 ggcctctggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 7031300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 302
Target Start/End: Original strand, 17097814 - 17098015
Alignment:
Q  101 acagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatat 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||  | || ||||| || |||||  || ||||||| || || || ||||| ||||| || ||| |    
T  17097814 acaggtggctttggttacctgatcagactggtgggtacacggtccgtggtgtgtatgacttgttgacatcgcatgaacaaccccatttacatcaaaatgt 17097913  T
Q  201 ggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||    | | ||||| |||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17097914 ggagttaatttggcataaacaggcatatgtgaaagtctctatctttgcttagcgactgttgatggatcggttacctactaaagaaaatttggcaaaccgt 17098013  T
Q  301 gg 302  Q
    ||    
T  17098014 gg 17098015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11203926 - 11203844
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  11203926 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatacttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 11203844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33496653 - 33496572
Alignment:
Q  197 atatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  33496653 atatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatcattgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 33496572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2756115 - 2755823
Alignment:
Q  30 ttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgat 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||| || |||||||||| ||     | ||||| ||||||||||||||  ||||   |    
T  2756115 ttgggaggaagagtttgtagaggagtgtagggaactattacttacacttactttgcaggattcctcttctgacaggtggctttggttaccggatcagact 2756016  T
Q  130 ggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctc 229  Q
    ||||||||| |  | ||||| || ||||||||| ||||||| || || || |||  |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  2756015 ggtgggtatacgattcgtggtgtgtatgatatgttgacatcgcaggaacaacccatgttacatcaaaatatggagttgatttggcacaaacaggtacctt 2755916  T
Q  230 tcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgc 322  Q
    | ||||| |||||  ||||||||||  |  |||  || ||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||  | ||| ||||||||||||    
T  2755915 tgaaagtgtctatatttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctactaaataaaatttggcaagtcgtggggtcttatctttggaggcgc 2755823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Original strand, 12342259 - 12342340
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  12342259 aatatggagttaatttggcataaacaggtt-ctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 12342340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19890950 - 19890733
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||| | |||||| |  ||||   |     
T  19890950 tgggaggaggacctggtagaagagtgtggggatttattactaacagtctctttgcaggaattagaaacagacaggtggatgtggttatcggatcagatta 19890851  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    | || ||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||  | || ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19890850 gaggttatactgttcgtggtgtatatgacatgttgacatcacaggaataacctcatgttcatcaaaatatggagttaatctggcataaacaggttccttt 19890751  T
Q  231 caaagtatctatccttgc 248  Q
     ||||| || ||||||||    
T  19890750 aaaagtttccatccttgc 19890733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16179079 - 16178955
Alignment:
Q  172 caagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggt 271  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| ||  |||| |||||      
T  16179079 caagaacagccccatttacgtcaaaatttagagttaatttggcataaacaggtacctcttaaagtatctatttttgcgtggcgcctgatgaaggatcgtc 16178980  T
Q  272 tacctacaaaaaataatttggcaaa 296  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||    
T  16178979 tacctactaaagagaatttggcaaa 16178955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 446
Target Start/End: Original strand, 36801240 - 36801358
Alignment:
Q  328 tgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggag 427  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||| || |    
T  36801240 tgtgtatcgggatgtgggcaggttgaagatgtaaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgcattgtggcctttggtgcgggcttggcttggtg 36801339  T
Q  428 tggtaggggtcgattctca 446  Q
    | | |||||| ||||||||    
T  36801340 tcgaaggggtagattctca 36801358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15312786 - 15312629
Alignment:
Q  100 gacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataata 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||||| || ||| |||| || |||||  | |||||||| || || ||  |||| ||||| || |||     
T  15312786 gacaggtggctttagttaccagatcagaatggtgggtactcggtatgtggtgtgtatgacttactgacatcgcaggaacatacccatttacatcaaaatt 15312687  T
Q  200 tggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||  |||||||| ||||    
T  15312686 tggagttaatttggcataaacaggtacctctaaaagtctatatatttgcttggtgact 15312629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3141125 - 3140902
Alignment:
Q  30 ttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||||||||| ||     | | ||| ||||||||||||||  || |   |    
T  3141125 ttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggaactattacttacagttactttgcaggattcctcttctggcaggtggctttggttaccggattagact 3141026  T
Q  130 ggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctc 229  Q
    ||||||||| |  | ||||| || ||||||||| | ||||| || || || |||  |||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||| |||     
T  3141025 ggtgggtatacgtttcgtggtgtgtatgatatgttcacatcgcaggaacaacccatgttacatcaaaatatggagttgatttggtacaaacaggtgcctt 3140926  T
Q  230 tcaaagtatctatccttgcttggc 253  Q
    | ||||| |||||  |||||||||    
T  3140925 tgaaagtgtctatatttgcttggc 3140902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 33496501 - 33496404
Alignment:
Q  349 gttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||    
T  33496501 gttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgcattgtggcctttggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtagattctca 33496404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 26010327 - 26010284
Alignment:
Q  23 tgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26010327 tgtgggcttgggaggaggaattggtagaggagtgtaggacttta 26010284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 47537551 - 47537504
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  47537551 ggttgtgggcttgggaggaggaggagttagaggagtgtagggctttat 47537504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Original strand, 36801108 - 36801190
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||| | |||||||||||||| |||  |||  ||||| ||||||||    
T  36801108 aatatggagttaatttagcataaataggttcccttaaaagtttatatccttgcttggcaactgctgagggatcgtttacctac 36801190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Original strand, 20532031 - 20532104
Alignment:
Q  145 cgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataa 218  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  20532031 cgtggtgtttatgacatgctgacatcccatgagcatcctcatttacatcaaaatatggaattaatttggcataa 20532104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 31675202 - 31675173
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31675202 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 31675173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Original strand, 31921218 - 31921247
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31921218 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 31921247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9510037 - 9509997
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9510037 ggttgtgggcatgggaggaggagttggtagcggagtgtagg 9509997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9518012 - 9517972
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9518012 ggttgtgggcatgggaggaggagttggtagcggagtgtagg 9517972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 11277105 - 11277543
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11277105 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggg 11277204  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11277205 tacctaatcatgatgatgggtactctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcaaccccagttacaccataatatggagttaatttggca 11277304  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11277305 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgagagatcggttacctacgaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 11277404  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11277405 gaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgttttagtcttgtgtaaattttagtgcattatggccaatggtgcgag 11277504  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  11277505 catggctaggagtggtgggagtcgattctcattcaactt 11277543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 47877270 - 47876832
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47877270 aggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtggggttttattactaacagtttccttgcaggaatcagtgacagacagatgactttggt 47877171  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  47877170 tacctaatcaggatggtgggtattatgtacgtggagtttatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacatcaaaatagggagttaatttggca 47877071  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47877070 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagagatcagttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 47876971  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  47876970 gaggcgcggttgtgtgtttctggatgcgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgttcaacttttagtgcattatgacaattgatgcggg 47876871  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47876870 catggctaggagtggtaggggtcgactcttaatcaactt 47876832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 29968257 - 29967826
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacc 119  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29968257 ggttatgggcttgagaggaggaattggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttgggtacc 29968158  T
Q  120 taatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaa 219  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29968157 taatcatgatgatgg-tactctgtacgtggagcctatgatatgctgacatcacaggagcaaccccagttacaccatagtatggagttaatttggcataaa 29968059  T
Q  220 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29968058 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttgaggacttttgagagatcggttacctacgaaaagtaatttggcaaaccatggcattttacctttggagg 29967959  T
Q  320 cgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatg 419  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29967958 cgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgctttatggccaatggtgcgagcatg 29967859  T
Q  420 gctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaac 452  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  29967858 gctaggagtggtgggagtagattctcattcaac 29967826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 37919831 - 37919393
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  37919831 aggcggttgtgggcttgggaggagaagttggtagaggagtgtagagttttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacaaacatatggctttgat 37919732  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |    
T  37919731 tacctaaacaggagggtgggtattctgtgcgtggagtatatgacatgctgacatcacaggagcagccccaattacatcatcatatgaagttaatttggta 37919632  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37919631 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagattggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgttgcattttacctttg 37919532  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37919531 gaggcgcggttgtgtgtttctagttgtgggaacgttgaagatgttaatcatttatttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcggg 37919432  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37919431 catggctaggagtggtaggggtcgaatctcaatcaactt 37919393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 451
Target Start/End: Original strand, 235296 - 235727
Alignment:
Q  22 ttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttaccta 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  235296 ttgtgggcttgggaggaaaagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttccttacaggaatcagtgacagatagatgactttggttaccaa 235395  T
Q  122 atcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaaca 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  235396 atcaggatggtgggtattctgtacgtggagtctatgacatgttgacatcacaggagcagccccagttacatcaaaatatggagttaatttggcataaaca 235495  T
Q  222 ggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac--aaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 319  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  235496 ggttcatctcaaagtctctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaaaatcatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 235595  T
Q  320 cgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatg 419  Q
    ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  235596 cgcggttgtgtgtttctggttgcgagaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgttcaacttttagtgccttatggccaatggtgcgggcatg 235695  T
Q  420 gctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaa 451  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  235696 gctcggagtggtaggggtcgactctcaatcaa 235727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 4937981 - 4938419
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  4937981 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctctggt 4938080  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4938081 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaatttggca 4938180  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  4938181 taaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 4938280  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  4938281 gaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 4938380  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4938381 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 4938419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17720922 - 17720484
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17720922 aggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtttanggctttattactaacagtttcattgcaggaatcagtgacagatagatggatttggt 17720823  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  17720822 taccaactcaggatgatgggtattccgttcgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcacttacatcaaaacttggagttaatttggca 17720723  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17720722 tacacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatggcgacttctgagggatcggttacctacaaaagataatttggcaaaccgtggcattttacctctg 17720623  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| | ||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||  |    
T  17720622 gaggcgcggatgtgtgtttctagttgtgggaatgaagaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccattggtgcaag 17720523  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17720522 catggcttggagtggtaggggttgactctcaatcaactt 17720484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 285 - 454
Target Start/End: Original strand, 31177427 - 31177596
Alignment:
Q  285 taatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgta 384  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  31177427 taatttgacaaatcgtggcattctatatgtggaggagcggttatgtgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgca 31177526  T
Q  385 acttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31177527 acttttggtgcattatggccgatggtgcggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 31177596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37255030 - 37254639
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||| | ||||||||  ||||   |     
T  37255030 tgggaggaggacttggtagaagagtgtagggatttattactaacaaactctttgcaggaattagaaacagacaggtggttgtggttaccggatcagatta 37254931  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    | || ||| |||| ||||| || || || ||| |||||||||  || || || ||  | || || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  37254930 gaggctatcctgttcgtggtgtatacgacatgttgacatcacgggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatctggcataaacaggttacttt 37254831  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
     ||||| || ||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||| |||   || |||||| |  |||||||| || || ||||| | | ||| |||    
T  37254830 aaaagtttcaatccttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctactaaatccaacttggcagattgtggcattatatctgtggagactcggttttgt 37254731  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggct 422  Q
    ||  | | ||||||  |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||  ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  37254730 gtcacggaatgtggacattttgaagatgtgaatcatatgtttttgtcttgtccaattttcggtgcattgtggcctatggtgcgggcatggct 37254639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25619566 - 25619340
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  | ||||  || || |||||||| |||   || ||||||     
T  25619566 aatatggagttaatatggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcggttgttgagggaacgattacctactaaatccaacttggcag 25619467  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | |||||||||  | || ||||||  |  || |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||  ||||    
T  25619466 atcgtggcattgcatctgtggaggaccgattttgtgtcacaggatgtgggcatgttgaagatgtgaatcatatgtttttgtcttgtccaattttcggtgc 25619367  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggct 422  Q
    ||| || || | |||||||| ||||||    
T  25619366 attgtggcctaaggtgcgggaatggct 25619340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18532735 - 18532653
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  18532735 aatatggagttaatctcgcataaacaggttcctttaaaagtttatatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctac 18532653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18530452 - 18530367
Alignment:
Q  361 aatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||    
T  18530452 aatcatttgtttttgtcttgtccaatttttggtgcattgtggcctatggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtagattctca 18530367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25619737 - 25619652
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtt 116  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||    
T  25619737 tgggaggaggacctggtagaagagtgtaaggatttattactaacagactctttgcaggaatcagaaacagacaggtggatgtggtt 25619652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 45943123 - 45943088
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45943123 tgggaggaggagttgctagaggagtgtagggcttta 45943088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 31422876 - 31422814
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatca 93  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  31422876 tgggaggatgacttggtagaggagtgtatgaatttattactaacagactctttgcaggaatca 31422814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36363796 - 36363738
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcagga 89  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  36363796 tgggaggaagagctgctagaggagtgtagggcattattacttactgtttctttgcagga 36363738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13396675 - 13396237
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13396675 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaacaatttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 13396576  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13396575 tacctaatcaggagggtgggtattctgtacgtggggtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccaattacatcatcatatggagttaatttggca 13396476  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13396475 taaacaagttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 13396376  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13396375 gaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcggg 13396276  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13396275 catggctaggagtggtaggggtcgaatctcaatcaactt 13396237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 41665222 - 41665660
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41665222 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaacagtttctttacaggaatcagtgacagacagatgactttggt 41665321  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41665322 tacctaattaggagggtgggtattctgtatgtggggtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccaattacatcatcatatggagttaatttggca 41665421  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41665422 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgattcctaagagatcagttacctacaaaaaataatttggcaaaccatgacattttacctttg 41665521  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41665522 gaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcggg 41665621  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41665622 catggctaggagtggtaggggttgaatctcaatcaactt 41665660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 32266845 - 32266415
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacc 119  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32266845 ggttgtgggcctgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgtcagacagatggctttgggtacc 32266746  T
Q  120 taatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaa 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32266745 taatcatgatgatgggtattctgtacgtggagcctatgat--gctgacttcacaagagcaaccacagttacaccataatttggagttaatttggcataaa 32266648  T
Q  220 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32266647 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacgaaaagtaatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 32266548  T
Q  320 cgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatg 419  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  32266547 cgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattgtggccaatggtgcgagcatg 32266448  T
Q  420 gctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaac 452  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  32266447 gctaggagtggtgggagtcgattctcattcaac 32266415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7924673 - 7924235
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  7924673 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctctggt 7924574  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7924573 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaatttggca 7924474  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  7924473 taaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 7924374  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  7924373 gaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 7924274  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7924273 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 7924235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8300089 - 8299652
Alignment:
Q  17 ggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  8300089 ggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgttagacagatggctctggtt 8299990  T
Q  117 acctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcat 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8299989 acctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagtagccccaattacaccataatttggacttaatttggcat 8299890  T
Q  217 aaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttgg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || |||    
T  8299889 aaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtgg 8299790  T
Q  317 aggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggc 416  Q
    ||| ||  || |||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||      
T  8299789 aggagcgattatgtgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcctgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggca 8299690  T
Q  417 atggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8299689 ttggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 8299652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9922888 - 9922450
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9922888 aggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtctagggctttattactaacagtttcattgcaggaatcagtgacagatagatggatttggt 9922789  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||| | ||| |||| ||||| ||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  9922788 taccaactcaggatgatgggttttccgttcgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcacttacatcaaaacttggagttaatttggca 9922689  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9922688 tacacaggttcctctcaaagtttctatccttgcatgacgacttctgagggatcggttacctacaaaagataatttggcaaaccgtggcattttacctctg 9922589  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  9922588 gaggcgcggatgtgtgtttctggttgtgggaatgtagaagatgtcaatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccattggtgcgag 9922489  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9922488 catggcttggagtggtaggggttgactctcaatcaactt 9922450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 172390 - 171952
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  172390 aggcggttgtgggcctgggaggagaagttggtagaggagtgtagggctttgttactaatagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctatggt 172291  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  172290 tacctaataatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagaaccagttacaccataaaatggacttaatttggca 172191  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| || || ||    
T  172190 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggaccggttacccacaaaacttaatttggtaaaccgtgacattctatctatg 172091  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| || ||||||||||    
T  172090 gaggagcggttatgtgtttctggctgtggtaatgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttgacgcattatggccgatggtgcggg 171991  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  171990 attggttaggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 171952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13200286 - 13200004
Alignment:
Q  140 ctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatc 239  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || || || ||  | || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13200286 ctgttcgtggtgtgtatgatatgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttagtttggcataaacaggttcctctaaaagtttc 13200187  T
Q  240 tatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctgga 339  Q
     |||||||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||  | ||| ||||| ||||||| | ||| |||||| ||||     
T  13200186 aatccttgcttggcagctattgagggatcgtttacctacaaaatacaatttggcagagcgcagaattctacctatggaggctcggttttgtgttactggg 13200087  T
Q  340 tgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggct 422  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||||   || |||| | ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  13200086 tgtgggcatgttgaagatgtgactcatatgtttttgtcttgcccaatttttggcgcattgtggcctatggtgcgggcttggct 13200004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2170614 - 2170197
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||  ||| | ||||| ||  ||||   |     
T  2170614 tgggaggaggaattgctagtagagtgtagggatttattactaacagtctctttgtaggaaacagaaacagacatgtggttgtggttgccggatcagatta 2170515  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
     ||| ||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| || || || ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2170514 ctggttatactgtccgtggtgtatatgacatgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatctggcataaacaggttccttt 2170415  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttgg--aggcgcagttgt 328  Q
     ||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| |||   ||||||| | | ||||| ||| || || |||  |  ||  ||| |    
T  2170414 aaaagtttctatccttgcttggcgaccgttgagggatcgtttacctactaaatcaaatttggtagaacgtgggattctatctgtggaaaatcggtgtttt 2170315  T
Q  329 gtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagt 428  Q
    ||||  | || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||    
T  2170314 gtgtaacggggtgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttgtttttgtcttgtccaatttttggtgcattgtggcctatggtgcgggcttggcttggtgt 2170215  T
Q  429 ggtaggggtcgattctca 446  Q
     | |||||| ||||||||    
T  2170214 cgaaggggtagattctca 2170197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 43270557 - 43270307
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| |     
T  43270557 aatatggagttcatctggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttacttggcgactgttgaaggatcgtttgcctactaaaacaaatttggtag 43270458  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||||  ||| || || |||| || | ||| |||||  | || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
T  43270457 aacgtgagattctatctgtggaagctcggttttgtgtaacgggttgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttgtttttgtcttgtccaatttttggtgc 43270358  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||| ||  | ||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||    
T  43270357 attgtggtctatggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtagattctca 43270307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 335 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20497052 - 20496933
Alignment:
Q  335 ctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtagg 434  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||||||    
T  20497052 ctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggcattggttaggagtggtagg 20496953  T
Q  435 ggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  20496952 tgtcgactctcaatcaactt 20496933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 381
Target Start/End: Original strand, 13879355 - 13879705
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| | ||||||    | |    ||    
T  13879355 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtctctttgcaggaatccgttactgatagatgggtgtggttattggacccgattg 13879454  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||  |  ||||||| || || || || ||| | || || | |||||||||| | ||||| ||| |||| |||||    
T  13879455 gtggctattctgttcgtggggtatatgacttattgacatcgcatgaacaacctcagattcatcaaagtatggagttagtctggcacaaataggtacctct 13879554  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
    ||||||  |  || ||||||||||  | ||||  ||||| |||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   | | |||    
T  13879555 caaagttacagtctttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctactaaagccaatttggcaaatcgtggcattttaccgttggaggctaggctttgt 13879654  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgt 381  Q
    ||  | ||||||||| | |||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  13879655 gtcacgggatgtgggcatgttgaagatgtgtctcatctgtttttgtcttgt 13879705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 20824403 - 20824153
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||       
T  20824403 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctactaaatctaatttggtgg 20824304  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
      || || ||| || || ||||    | ||| |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| ||||    
T  20824303 cacgagggattatagctgtggaaaaccggttttgtgtaacgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccgacttttggtgc 20824204  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
     || || ||  |||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  20824203 tttgtggcctctggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 20824153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 380
Target Start/End: Original strand, 34137011 - 34137180
Alignment:
Q  211 tggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttac 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||  | |    
T  34137011 tggcataaacaggtacctctcaaagtctctattcttgcttggcggcttatgatggatcgtttacctacgaaagaaaatttggcaaaccgcggtatcattc 34137110  T
Q  311 ctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 380  Q
    || |||||| || |||||||| | |||| ||||||  |||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34137111 ctgtggaggggcggttgtgtgctactggttgtgggtgcgttcaaaatgtgaatcacttgtttttgtcttg 34137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5181777 - 5181527
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||| |||||| |   |||  ||||  ||||| |||||| ||||||||  ||    
T  5181777 aatatggagataatttggcataaacaggtgcctctaaaagtctatattcttgtttggcggcggctgagggatcatttaccaacaaaagataatttgataa 5181678  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    ||||| |  |  | ||||||||||||| ||||||| |  || |||| ||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||    
T  5181677 accgtcgagtcattcctttggaggcgcggttgtgtatcactagatgcgggcaagttgaagatgagaatcatatgtttttgtcttgcccaacttttggtgc 5181578  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
     || || ||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5181577 cttgtggccattggtgtaggcatggctcggtgtggtaggggtcgactctca 5181527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37434239 - 37433989
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||   |||||||       
T  37434239 aatatggagttaatttggcataaacatgttcctttaaaagtctctattcttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctactaaatcaaatttggtgg 37434140  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||||| ||| || || ||||    | ||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||    
T  37434139 aacgtgggattatatctgtggaaaatcggttttgtgtaacgggatgcgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgc 37434040  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||| || ||  |||||||||| |||||  | || | |||||||||||||||    
T  37434039 attgtggcctttggtgcgggcttggctttgtgtcgaaggggtcgattctca 37433989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25090659 - 25090436
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| | ||||||||  |||    ||    
T  25090659 tgggaggagaaattggtagaggagtgtagggctttattactaacagtctctttgcaggaatctgatactgacagatgggtgtggttaccggatccgattg 25090560  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    |||| |||| ||| ||||| || |||||  |  |||||||||| || ||  | ||  | || || |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||    
T  25090559 gtggctattatgttcgtggggtatatgacttattgacatcacatgaacactctcatcttcatcacaatatggagttagtctagcacaaacaggtacctct 25090460  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcg 254  Q
     ||||| || ||||||||||||||    
T  25090459 aaaagtttcaatccttgcttggcg 25090436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 452
Target Start/End: Original strand, 32567480 - 32567554
Alignment:
Q  378 ttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaac 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  32567480 ttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgccagcatggctaggagtggtgggagtcgattctcattcaac 32567554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2529958 - 2529809
Alignment:
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||| | ||||||| | | ||||| ||| ||| ||||||||| | ||| |||    
T  2529958 caaagtttcaatccttgcttggcggctattgagggatcgcttacctacaaaatacaatttggtagatcgtggaattctacttttggaggctcggttttgt 2529859  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 380  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2529858 gttacagggtgtgggcatgttgaagatgtgactcatttgtttttgtcttg 2529809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17699589 - 17699507
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||    
T  17699589 aatatggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttctatccttgcttggcgactgctgagggatcgtttacctac 17699507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17699457 - 17699339
Alignment:
Q  328 tgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggag 427  Q
    ||||| || |||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |    
T  17699457 tgtgtatcgggatgtaggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgcattgtgacctttggtgcgggcttggcttggtg 17699358  T
Q  428 tggtaggggtcgattctca 446  Q
    | | |||||| ||||||||    
T  17699357 tcgaaggggtagattctca 17699339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12134610 - 12134565
Alignment:
Q  21 gttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12134610 gttgtgggcgtgggaggaggacttggtagaggagtgtagggcttta 12134565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 557 - 591
Target Start/End: Original strand, 26087797 - 26087831
Alignment:
Q  557 gcgcgtgagaagggcatagggtgggaaaaataata 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26087797 gcgcgtgagaagggcatagggtgggaaaagtaata 26087831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13200337 - 13200296
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataacta 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  13200337 tgggaggaggagttggtagaggagtgtatggatttattacta 13200296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Original strand, 42177471 - 42177520
Alignment:
Q  45 ggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcag 94  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42177471 ggtagaagagtgtagggatttattactaatagtctctttgcaggaatcag 42177520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 37039913 - 37039877
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttat 67  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37039913 tgggaggaggagttggtaggggagtgtaggactttat 37039877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15740508 - 15740070
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740508 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 15740409  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740408 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgttgacatcataggagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 15740309  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15740308 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagacttttgcgagatcggttacctacaaaaaataatttgacaagccgtggcattttacctttg 15740209  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |    
T  15740208 gaggcgcggttgtgtgtttctgggtgtgggaatgttaaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtctaacttttggtgccttatggccattggtgcgag 15740109  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740108 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 15740070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 450
Target Start/End: Original strand, 1828393 - 1828827
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  1828393 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtggagggctttattactaacagtttctttgcaggattcagtgactgacaaatggctttggt 1828492  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1828493 tacctaatcatgatggtgggtattccgtacgtggagcctatgatatgttgacatcacaggagcagccccagttacatcataatatggagttaatttggca 1828592  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1828593 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagactattgcgagataggttacctacaaaaactaatttggcaaaccgtggcattttacctttg 1828692  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |    
T  1828693 gaggcgcggttgtgtgtttctgggtgtgggaatgttgaagatgttgatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgctttatgaccattggtgcgag 1828792  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatca 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1828793 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatca 1828827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19755554 - 19755111
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19755554 aggcggttgtgggcttaggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaatagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 19755455  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  19755454 tacctaatcaggagggtgggtattctgtacgtggggtctatgacatgctgacatcacaagagcagccccaatttcatcatcatatggagttaatttggca 19755355  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcatt---ttacct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  19755354 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgacattttattacct 19755255  T
Q  313 ttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19755254 ttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggagcgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggtcaatggtgc 19755155  T
Q  413 gggcatggctaggagtgg--taggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  19755154 gggcatggctaggagtggtataggggtcgaatctcaatcaactt 19755111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 19784252 - 19784695
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19784252 aggcggttgtgggcttaggaggaggagttggtagaggagtgtagggttttattactaatagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 19784351  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  19784352 tacctaatcaggagggtgggtattctgtacgtggggtctatgacatgctgacatcacaagagcagccccaatttcatcatcatatggagttaatttggca 19784451  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcatt---ttacct 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  19784452 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgactcctgagagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgacattttattacct 19784551  T
Q  313 ttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgc 412  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19784552 ttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgggagcgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggtcaatggtgc 19784651  T
Q  413 gggcatggctaggagtgg--taggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  19784652 gggcatggctaggagtggtataggggtcgaatctcaatcaactt 19784695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Original strand, 47685749 - 47686186
Alignment:
Q  17 ggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtt 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47685749 ggcggctgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcggtgatagacagatggctttggtt 47685848  T
Q  117 acctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcat 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  47685849 acctaatcatgatgatgggtattctgttcgtggagtctacgacatgctgacatcacaagagcagcccaagttacaccataatctggacttaatttgacat 47685948  T
Q  217 aaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttgg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  47685949 aaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgagagatcggttacctacaaaacataatttggcaaaccgtggcattttatctgtgg 47686048  T
Q  317 aggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggc 416  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  47686049 aggagcggttatgtgtttctggatgtgggaatgtcgaagatgtttctcgtttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgcattatggccgatggtgcggga 47686148  T
Q  417 atggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47686149 ttggttaggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 47686186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 23642444 - 23642882
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  23642444 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctctggt 23642543  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23642544 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaatttggca 23642643  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  23642644 taaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 23642743  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  23642744 gaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 23642843  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23642844 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 23642882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 43 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7404177 - 7403762
Alignment:
Q  43 ttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg----gtgggtat 138  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||| ||||    ||||||||    
T  7404177 ttggtagagaagtgtagggttttattacttacagtttccttgcaagaatcagtgacaaatagatggttatggttaccaaatcaggatgcatggtgggtat 7404078  T
Q  139 tctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtat 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  7404077 tctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacatcaaaatatgaagttaatttggcataaacaagttcatttcaaagtct 7403978  T
Q  239 ctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctgg 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7403977 ctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaagaatttggcaaaccgtggcattttacgtttggaggcgcggttgtgtgtctctgg 7403878  T
Q  339 atgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtc 438  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7403877 atgcgggaacgttgaagatgtcaatcatttgtttttgtcttgtccaacttttagtgccttatggccattggtgtgggcatggctcggagtggtaggggtc 7403778  T
Q  439 gattctcaatcaactt 454  Q
    || |||||||||||||    
T  7403777 gactctcaatcaactt 7403762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 47419091 - 47418654
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||    
T  47419091 aggcggttgtgggcttgggaggaggaggtggtagaggagtgtagggctttgttactaacaatttctttgcaggattcagtgttagatagatggctctggt 47418992  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47418991 tacctaatcaagctgatgggtattcagtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccatagtatggacttaatttggca 47418892  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| || ||  |    
T  47418891 taaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaactcgtggcattctatctggg 47418792  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| | ||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  47418791 gaggagcggttatgcgttgcaggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 47418692  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  47418691 attggttaggagt-gtaggtgtcgactctcaatcaactt 47418654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 103 - 454
Target Start/End: Original strand, 13270831 - 13271182
Alignment:
Q  103 agatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatgg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13270831 agatggctctggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtgg 13270930  T
Q  203 agttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgg 302  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  13270931 acttaatttggcataaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtgg 13271030  T
Q  303 cattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatga 402  Q
    |||| || || |||||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  13271031 cattctatctgtggaggagcggttatgagttactggatgtgggattgtcgaagatgttactaatttatttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatgg 13271130  T
Q  403 ccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    || |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13271131 ccgatggtgcggcattggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 13271182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Original strand, 55725566 - 55725817
Alignment:
Q  43 ttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctg 142  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||| |||  || ||||| ||| | ||||||||  ||||   ||| || ||| |||    
T  55725566 ttggtagaggagtgtagcgatttattactaacaatctctttgcaggaaacagaaactgacaggtggttgtggttaccggatcagactggaggatatactg 55725665  T
Q  143 tacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctat 242  Q
    | | ||| || ||||||||| |||||||||| || || || ||  |  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  55725666 ttcatggtgtgtatgatatgttgacatcacaggaacaacctcatgtttatcaaaatatggagttaatttggcataaacaagttcctctaaaagtttcaat 55725765  T
Q  243 ccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggca 294  Q
    |||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  55725766 ccttgcttggcggctattgagggatcgcttacctacaaaatacaatttggca 55725817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 12697920 - 12697670
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||   |||||||       
T  12697920 aatatgaaattaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctactaaatcaaatttggtgg 12697821  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||||| ||| || || ||||    | ||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||    
T  12697820 aacgtgggattatagctgtggaaaatcggttttgtgtaacgggatgcgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgc 12697721  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    |||||| ||  |||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  12697720 attatggcctttggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 12697670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 454
Target Start/End: Original strand, 159863 - 159982
Alignment:
Q  335 ctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtagg 434  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||   ||| ||| |||||||||    
T  159863 ctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggcattggttagaagtggtagg 159962  T
Q  435 ggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  159963 tgtcgactctcaatcaactt 159982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 380
Target Start/End: Original strand, 11587082 - 11587415
Alignment:
Q  47 tagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacg 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     || | || |||||| | ||||||||   ||| |  || || ||||| ||  |    
T  11587082 tagaggaatgtagggctttattactgacagtttctttgcaggatgatttgcctgatagatggttgtggttaccgggtcagggaggcggatattcagtctg 11587181  T
Q  147 tggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttaca-ccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatcct 245  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||    
T  11587182 tggtgtgtatgacatgctgacatcacaggaacagcctcagttgcatccatc-tatggagttaatttggcataaatagatacctatcaaagtatctattct 11587280  T
Q  246 tgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtggg 345  Q
    ||||||||| ||| |||   |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  | |   | ||| |||||| || |||||||  | |||| || | |    
T  11587281 tgcttggcggcttctgaggaatcgtttacctacgaaagaaaatttggcaaaccgcagtaacattcctatggaggggcggttgtgtactactggttgcgag 11587380  T
Q  346 aacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 380  Q
     |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  11587381 cacgttgaaaatgtgaatcacttgtttttgtcttg 11587415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Original strand, 2821917 - 2822152
Alignment:
Q  43 ttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||  |||    |||||| ||| |||    
T  2821917 ttggtagaggagtgtagggctttaatactaacagtctctttgcaggaatctgttactgacagatgggtgtggttaccggatccgattggtggctatactg 2822016  T
Q  143 tacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctat 242  Q
    | | ||| || |||||  || |||||||| | || || || ||  | || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |    
T  2822017 ttcatggggtatatgacttgttgacatcataggaacaacctcatattcatcaaaatatggagttaatctggcacaaacaggtacctctaaaagtttcagt 2822116  T
Q  243 ccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    || |||||||||| | ||||  ||||| ||||||||    
T  2822117 ccatgcttggcgattgttgagggatcgcttacctac 2822152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20002832 - 20002599
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||||||||| || ||||  ||||| |||||||| |||   || ||||||     
T  20002832 aatatggagttaatttggcataaacaggttcttttaaaagtttctatcattgcttggcggctgttgagggatcgtttacctactaaatccaacttggcag 20002733  T
Q  296 accgtggcatt-------ttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaactt 388  Q
    |||||||||||       |   || ||||||| | ||| |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |  ||    
T  20002732 accgtggcattacatctgtggactgtggaggctcggttttgtgtcacgggatgtgggcatgttgaagatgtgaatcatatgtttttgtcttgtccatttt 20002633  T
Q  389 ttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggct 422  Q
    |  ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20002632 tcggtgcattgtggcctatggtgcgggcatggct 20002599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Original strand, 45472742 - 45472824
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  45472742 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgtttggcgactgttgagggatcgtttacctac 45472824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Original strand, 54483027 - 54483113
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtta 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| | ||||||    
T  54483027 tgggaggaggatttggtagaggagtgtaggggtttattactaacagtctctttgcaggaatccgttactgatagatgggtgtggtta 54483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 48312364 - 48312281
Alignment:
Q  34 gaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtta 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  || || ||||||||| | ||||||    
T  48312364 gaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtctatttgcaggaattcgttactgacagatgggtgtggtta 48312281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8361207 - 8360957
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||  |||   |||| |||||||  |||   |||||||       
T  8361207 aatatggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttctatccttgtttggcgactgctgaggaatcgtttacctagtaaatcaaatttggtgg 8361108  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
      ||||| ||| || || | ||    | ||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||    
T  8361107 cacgtggaattatatctgttgaaaatcggttttgtgtatcgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgc 8361008  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||| || ||  |||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||    
T  8361007 attgtggcctttggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtagattctca 8360957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 454
Target Start/End: Original strand, 20788501 - 20788571
Alignment:
Q  384 aacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20788501 aacttttagcgccttatggccattggtgcgagcatggctaggagtggtcggggtcgactctcaatcaactt 20788571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46145948 - 46145724
Alignment:
Q  30 ttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgat 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||||||||| ||     | ||||| |||||||||||||   ||||        
T  46145948 ttgggaggaagagttggcagaggagtgtagggaactattacttacagttactttgcaggattcctcttctgacaggtggctttggttactagatcagacc 46145849  T
Q  130 ggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctc 229  Q
    ||||||||| | || ||||| || ||||||||| |||| || || || || |||  |||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||     
T  46145848 ggtgggtatacggttcgtggtgtgtatgatatgttgacttcgcaggaacaacccatgttacatcaaaatatggagttgatttggcacaaataggtgcctt 46145749  T
Q  230 tcaaagtatctatccttgcttggcg 254  Q
    | ||||| |||||  ||||||||||    
T  46145748 tgaaagtgtctatttttgcttggcg 46145724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 296
Target Start/End: Original strand, 5790131 - 5790225
Alignment:
Q  202 gagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||| ||| | ||  |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||    
T  5790131 gagttaatttggcataaacaagtacctcttaaagtatctatttttgcgtggtgcctgatgaaggatcgtttacctactaaagagaatttggcaaa 5790225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20395879 - 20395832
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20395879 ggttgtgggcttgggaggaggaggagttagaggagtgtagggctttat 20395832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 446
Target Start/End: Original strand, 4548405 - 4548502
Alignment:
Q  349 gttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||   || |||| ||||||| || ||  ||||| |||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  4548405 gttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgcccaatttttggtgcattgtggcctctggtgtgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 4548502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 4640536 - 4640576
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4640536 ggttgtgggcttgggaggaggacttgttagaggagtgtagg 4640576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 29553599 - 29553643
Alignment:
Q  22 ttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29553599 ttgtgggcgtgggaggaggagttgttagaggagtgtaggacttta 29553643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23238655 - 23238234
Alignment:
Q  32 gggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23238655 gggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattgctaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttgggtacctaatcatgatga 23238556  T
Q  132 tgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctc 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23238555 tgggtactctgtacgtggagtctatgatatgctaacatcacaggagcaaccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaataggttcctctc 23238456  T
Q  232 aaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23238455 aaagtttctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacgaaaagtaatttggcaaaccgtggcattttagctttggaggcgcggttgtgtg 23238356  T
Q  332 tttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23238355 tttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcgagcatggctaggagtggt 23238256  T
Q  432 aggg-gtcgattctcaatcaac 452  Q
     ||| ||||||||||| |||||    
T  23238255 ggggagtcgattctcattcaac 23238234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 454
Target Start/End: Original strand, 28535532 - 28535966
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacc 119  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28535532 ggttgtgggcttgagaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagtttcattgcaggaatcaatgacagatagatggctttggttacc 28535631  T
Q  120 taatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaa 219  Q
     | ||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  28535632 aactcaggatggtaggtactctgtacatggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcagttacatcaaaacatggagttaatttggcataca 28535731  T
Q  220 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28535732 caggttcctctcaaagtttctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 28535831  T
Q  320 cgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatg 419  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28535832 cgcagatgtgtgtttctggttgtgggaatgtagaagatgtcgatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccaatggtgcgggcatg 28535931  T
Q  420 gctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28535932 gcttggagtggtaggggttgactctcaatcaactt 28535966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 35983644 - 35984082
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35983644 aggcggttgtgggcttaggaggaggagttggtagaggagtttagggctttattactaacagtttcattacaggaatcagtgacagatagatagctttggt 35983743  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||     
T  35983744 taccaaatcaggatggtgggtactctgtacgtggagcctatgacatgctgacatcacaggagcagcctcagttacatcaaaacatggagttaatttggct 35983843  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35983844 tacacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgaggaatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccatgacattttacctttg 35983943  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35983944 gaggcgcggttgtgtgtttttggttgtgggaatgtagaagttgtcaatcatttgtttttgtcttgtgcaacttttagtgccttatggccaatggtgcggg 35984043  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35984044 catgacttggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 35984082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 30732167 - 30732605
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30732167 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctctggt 30732266  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30732267 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttggca 30732366  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  30732367 taaacaggttcctctcaaagtatctatctttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 30732466  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  30732467 gaggagcggttatgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtacaacttttggtgcattatagccgatggtgcggg 30732566  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  30732567 attggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaactt 30732605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12825486 - 12825048
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12825486 aggcggttgtgggcttgggatgaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctctggt 12825387  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12825386 tacctaatcatgatgatgggtattctgcacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttggca 12825287  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  12825286 taaacaagttcctctcaaagtatgtatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 12825187  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  12825186 gaggagcggttatgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggg 12825087  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12825086 attggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaactt 12825048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 27117014 - 27117452
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27117014 aggcggttgtgggcctgggaggaggggttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctatggt 27117113  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27117114 tacctaataatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagatccagttacaccataatatggacttaatttggca 27117213  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  27117214 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggaccggttacccacaaaacttaatttggtaaaccgtggcattctatctatg 27117313  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||||| |||    
T  27117314 gaggagcggttatgtgtttctggctgtgggaatgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggagcattatggccgatggtgtggg 27117413  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27117414 attggttaggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 27117452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 42928417 - 42927980
Alignment:
Q  17 ggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtt 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  42928417 ggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttttattacttaccgtttttttacaggaatcagtgacagatagatggttgtggtt 42928318  T
Q  117 acctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcat 216  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||    
T  42928317 accaaatcaggatggtgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcgcaggaacagccccagttacatccaaatatggagttaatttggtat 42928218  T
Q  217 aaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttgg 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42928217 aaacaggttcctctcaaagtctctatccttgtttggcggcttctgagggatcggttaactacaaaaaataatttgacaaactgtggcattttacccttgg 42928118  T
Q  317 aggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggc 416  Q
    ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42928117 aggtgcggttgtgtgtctctggatgcgggaacgttgaagatgtcaatcatttgttcttgtcatgtccaacttttagtgccttatgaccattggtgcgggc 42928018  T
Q  417 atggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42928017 atggctcggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 42927980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 42514007 - 42513569
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  42514007 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctctggt 42513908  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42513907 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaatttggca 42513808  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| || || ||    
T  42513807 taaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtgacattctatctgtg 42513708  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  42513707 gaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttttttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 42513608  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42513607 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 42513569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 181 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8228148 - 8227877
Alignment:
Q  181 ccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8228148 ccccagttacaccataatatggagttaatttgacataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacga 8228049  T
Q  281 aaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 380  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8228048 aaagtaatttggcaaaccgtgacattttacctttggaggcgcggttgtgtgtttctggatgtgagaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 8227949  T
Q  381 tgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaac 452  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  8227948 tgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcgagcatggctaggagtggtgggagtcgattctcattcaac 8227877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31641798 - 31641513
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31641798 aggcggttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtttagggctttattactaacagtttcattgcaggaatcagtgacagatagatggatttggt 31641699  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    |||| | ||| |||| ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  31641698 taccaactcaggatgatggatattccgttcgtggagcatatgacatgctgacatcacaggagcagcctcacttacatcaaaacatggagttaatttggca 31641599  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgg 302  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31641598 tacacaggttcctct-aaagtttctatccttgcatggagactactgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtgg 31641513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 196 - 454
Target Start/End: Original strand, 19255155 - 19255414
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19255155 aatatggagttaatttggcataaacagatttctctcaaagtatctatccttgcttggcggtttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 19255254  T
Q  296 accgtggcattttacctttggag-gcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtg 394  Q
    |  |||||||| | || |||||| |||| |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  19255255 attgtggcattattcccttggagcgcgcggttgtgtgtcactggatgcgggcacgttgaagatgtcaatcatttgttcttgtcttgtccaacttttggtg 19255354  T
Q  395 cattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    | |||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19255355 ccttatggacattggtgcgggcatggctcggagtggtaggggtcgattctcaaacaactt 19255414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 249 - 454
Target Start/End: Original strand, 12820035 - 12820240
Alignment:
Q  249 ttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaac 348  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || |||||| || ||| |||||||||||||||||||      
T  12820035 ttggcgacttatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtggaggagcggttatgtgtttctggatgtgggatt 12820134  T
Q  349 gttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaat 448  Q
    || ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  12820135 gtcgaagatgtctctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcgggattggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgat 12820234  T
Q  449 caactt 454  Q
    ||||||    
T  12820235 caactt 12820240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 335 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3418751 - 3418632
Alignment:
Q  335 ctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtagg 434  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||||||    
T  3418751 ctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggcattggttaggagtggtagg 3418652  T
Q  435 ggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  3418651 tgtcgactctcaatcaactt 3418632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Original strand, 25857457 - 25857707
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||       
T  25857457 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctactaaatctaatttggtgg 25857556  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
      || || ||| || || ||||    |  || |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  25857557 cacgagggattatagctgtggaaaaccgattttgtgtaacgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtttgacttttggtgc 25857656  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
     || || ||  |||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||    
T  25857657 cttgtggcctctggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtcgattctca 25857707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 27795755 - 27795405
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || || || |||||| | ||||||    | |    ||    
T  27795755 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttggaggaatccgttactgatagatgggtgtggttattggacccgattg 27795656  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||  |  ||||||| || || || || ||| | || |  | |||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  27795655 gtggctattctgttcgtggggtatatgacttattgacatcgcatgaacaacctcagattcatccaagtatggagttagtctggcacaaacaggtacctct 27795556  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
    ||||||  |  || ||||||||||  | ||||  ||||| || ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   | | |||    
T  27795555 caaagttacagtctttgcttggcggttgttgagggatcgtttgcctactaaagccaatttggcaaatcgtggcattttaccgttggaggctaggctatgt 27795456  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgt 381  Q
    ||  | || |||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27795455 gtcacgggctgtgggcatgttgaagatgtgtctcatttgtttttgtcttgt 27795405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24408209 - 24407993
Alignment:
Q  22 ttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttaccta 121  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||||||||| ||     | ||||| ||||||||||||||      
T  24408209 ttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggaactattacttacagttactttgcaggattcctcttctgacaggtggctttggttaccgg 24408110  T
Q  122 atcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaaca 221  Q
    ||||   |||||||||| | || ||||| || ||||||||| ||||||| || || || |||  |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  24408109 atcagattggtgggtatacggttcgtggtgtgtatgatatgttgacatcgcaggaacaacccatgttacatcaaagtatggagttgatttggcataaaca 24408010  T
Q  222 ggttcctctcaaagtat 238  Q
    ||| ||| | |||||||    
T  24408009 ggtacctttgaaagtat 24407993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 446
Target Start/End: Original strand, 8300050 - 8300465
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||  || ||||| ||| | ||||| ||  ||||   |     
T  8300050 tgggaggaggaattgttagtagagtgtagggatttattactgacagtcactttgcaggaatcagaaactgacaggtggatgtggttgccggatcagattt 8300149  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
     ||| ||| |||| ||||| |  |||||  || |||||||||| || || || ||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8300150 ctggttatactgttcgtggtgcatatgacctgttgacatcacaggaacaacctcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttccttt 8300249  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||     || || ||| || || ||||    | ||| |||    
T  8300250 aaaagtttctatccttgtttggcgactgttgagggatcgcttacctactaaatctaatttggtggcacgagggattatagctgtggaaaaccggttttgt 8300349  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtgg 430  Q
    ||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| |||| || || ||  || ||||||| ||||| || || |    
T  8300350 gtaacgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccgacttttggtgccttgtggcctctgatgcgggcttggcttggtgtcg 8300449  T
Q  431 taggggtcgattctca 446  Q
     |||||||||||||||    
T  8300450 aaggggtcgattctca 8300465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27767149 - 27767063
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  27767149 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttatatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctacaaaa 27767063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 398
Target Start/End: Original strand, 33385407 - 33385609
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||   |||||||       
T  33385407 aatatggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgtttacctactaaatcaaatttggtgg 33385506  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
      ||||| ||| || || ||||    | ||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||    
T  33385507 cacgtggaattatatctgtggaaaatcggttttgtgtatcgggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgc 33385606  T
Q  396 att 398  Q
    |||    
T  33385607 att 33385609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33169931 - 33169666
Alignment:
Q  30 ttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||| ||     | ||||| ||||||||||||||  ||||   |    
T  33169931 ttgggaggacgagttggtagaggagtgtagggaattattacttacagttactttgcaggattcctcttctgacaggtggctttggttaccagatcagact 33169832  T
Q  130 ggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctc 229  Q
    ||||||||| | || ||||| || |||||||||||||| ||  | ||  | |||  |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||     
T  33169831 ggtgggtatacggttcgtggtgtgtatgatatgctgacttcgtaggaaaaacccatgttacatcaaaatatggagttgatttggcacaaacaggtgcctt 33169732  T
Q  230 tcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    | ||||| |||||  ||||||||||  |  |||  || ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  33169731 tgaaagtgtctatttttgcttggcgtttgctgagggaccggttacctactaaacaaaatttggcaa 33169666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26073089 - 26072898
Alignment:
Q  106 tggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagt 205  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||| | || ||||| || |||||  |||||||||| || || |||||||| || || || ||| ||||||    
T  26073089 tggctttggttaccgaatcagaatgttgggtatacggtccgtggtgtgtatgacttgctgacatcgcaggaacagccccatttgcatcaaaatttggagt 26072990  T
Q  206 taatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaac 297  Q
    |||||||||||||| | |||||| | |||||  ||||| ||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||| | || |||||||||    
T  26072989 taatttggcataaatatgttcctttgaaagtccctatctttgtttggcgactgttgagggatcgattacctactaaagagaaattggcaaac 26072898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10776870 - 10776669
Alignment:
Q  197 atatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||| |||   |||||||        
T  10776870 atatggagttaatttggcataaacaggttcccttaaaagtttctatccttgcttggcgactgctgagggatcgtttacctactaaatcaaatttggtggc 10776771  T
Q  297 ccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgca 396  Q
     ||||| ||| || || ||||    | ||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| |||||    
T  10776770 acgtgggattatatctgtggaaaatcggttttgtgtatcgggatgtgggcaagttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgca 10776671  T
Q  397 tt 398  Q
    ||    
T  10776670 tt 10776669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 403 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25824911 - 25824860
Alignment:
Q  403 ccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25824911 ccaatggtgcgggcatggcttggagtggtaggggtcgactctcaatcaactt 25824860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 381
Target Start/End: Original strand, 27165934 - 27166170
Alignment:
Q  145 cgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatcc 244  Q
    ||||| || ||||| ||| || ||||||| || || ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  27165934 cgtggtgtttatgacatgttggcatcacaggaacaacccaatttacatcaaaatatggaattaatttggcaccaacaggtacctctaaaagtctctatct 27166033  T
Q  245 ttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgg 344  Q
    | | |||||||    |||| ||||| ||||||| ||||   ||||||||||  ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||    
T  27166034 tcgtttggcgaacgctgaaggatcgtttacctataaaagcaaatttggcaagtcgtggaattcttcctttggaagcgcagttgtgtgtggctggttatgg 27166133  T
Q  345 gaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgt 381  Q
    | | ||||| |||   | |||||||||| ||||||||    
T  27166134 gcatgttgaggattcgactcatttgtttctgtcttgt 27166170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 422
Target Start/End: Original strand, 18359125 - 18359350
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||| |||   || ||||||     
T  18359125 aatatggagttaatctagcataaacaggttcctttaaaagtttcaatccttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctactaaatccaacttggcag 18359224  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||| ||||| ||  | ||||||  | ||| |||||  | |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||   | |||  ||||    
T  18359225 atcgt-gcattatatatgtggaggatcggttttgtgtcacgggatctgggcatgttgaagatgtgaatcatatgtttttgtcttgtccgattttcggtgc 18359323  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggct 422  Q
    ||| || || |||| ||||||||||||    
T  18359324 attgtggcctatggggcgggcatggct 18359350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Original strand, 18089798 - 18089876
Alignment:
Q  200 tggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctac 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  18089798 tggagttaatttggcacaaacaggtaccgttgaaagtctctatctttgcttgacgactattgagagatcgtttacctac 18089876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 476485 - 476456
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  476485 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 476456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 20 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3109
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacc 119  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3535 ggttgtgggcctgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtttctttacaggaatcagtgacagacagatggctttgggtacc 3436  T
Q  120 taatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaa 219  Q
    ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435 taaccatgatgatgggtactcagtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaggagcaaccctagttacaccataatatggagttaatttggcataaa 3336  T
Q  220 caggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggagg 319  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3335 caggttcctcttaaagtttctatccttgcttggagacttttgagagatcggttacctacgaaaagcaatttggcaaaccatggcattttacctttggagg 3236  T
Q  320 cgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatg 419  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3235 cgcggttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatggccaatggtgcgagcatg 3136  T
Q  420 gctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    | |||||||||| || ||||| |||||    
T  3135 gttaggagtggtgggagtcgactctca 3109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 11908958 - 11909396
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11908958 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggaatcagtgatagacagatggctctggt 11909057  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11909058 tacctaatcatgatgatgggtattctatacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttggca 11909157  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  11909158 taaacaggttcctctcaaagtatctatcattgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 11909257  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || | | |||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||    
T  11909258 gaggagcggctatgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcagg 11909357  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  11909358 attggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaactt 11909396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6050890 - 6050452
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  6050890 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctctggt 6050791  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6050790 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaatttggca 6050691  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| || || ||    
T  6050690 taaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaattgtggcattctatctgtg 6050591  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  6050590 gaggagcggttctgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 6050491  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6050490 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 6050452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 35541335 - 35540898
Alignment:
Q  17 ggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggtt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  35541335 ggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttttttgcaggaatcagtgttagacagatggctctggtt 35541236  T
Q  117 acctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcat 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35541235 acctaatcatgatgatgggtattctgttcgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttggcat 35541136  T
Q  217 aaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttgg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||    
T  35541135 aaacaggtccctctcaaagtatctatccttgcttggcgactactgagggatcggttacccacaaaacataatttggcaaatcgtggcattctatctgtgg 35541036  T
Q  317 aggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggc 416  Q
    |||  |  || || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||      
T  35541035 aggaacgattatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggca 35540936  T
Q  417 atggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
     ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35540935 ttggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 35540898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 85 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 51052698 - 51052329
Alignment:
Q  85 caggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagcccc 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51052698 caggaatcagtgatagacagatggctctggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagcccc 51052599  T
Q  185 agttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||      
T  51052598 agttacaccataatatggacttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaact 51052499  T
Q  285 taatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgta 384  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || |||||| || ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  51052498 taatttggcaaatcgtggcattctatctgtggaggagcggttatgtgtttctggatgtgggattgtcgaagatgtttctcatttgtttttgtcttgtgca 51052399  T
Q  385 acttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  51052398 acttttggtgcattatggccgatggtgcgggattggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaactt 51052329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 380
Target Start/End: Original strand, 47622945 - 47623292
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||  || |||| || ||| | |||||| |  |||| |  |    
T  47622945 tgggaggaggacctggtagaggagtgtaaggctttattactgacagcttttttgcaggaatctttgtcagataggtggttgtggttatcggatcagggag 47623044  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacac-cataatatggagttaatttggcataaacaggttcctc 229  Q
    | |||||||| || | ||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  47623045 gcgggtattcagtccatggggtgtatgacatgctgacatcacaggaacaacctcagttacattcata-tatggaattaatttggcataaacaggtacctc 47623143  T
Q  230 tcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || || |||||||| ||    |||||||||||||||| |||| | ||| |||||| || ||  ||    
T  47623144 tcaaagtatctattcttgcttggcggcttttgagggaccgcttacctacgaagggaaatttggcaaaccgtgacattattcctatggaggggcggt--tg 47623241  T
Q  330 tgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 380  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  47623242 tgtttctggttgtgggcatgatgaagatgtgaatcacttgtttctgtcttg 47623292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 362 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6259758 - 6259666
Alignment:
Q  362 atcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259758 atcatttgtttttgtcttgtgtaacttttggtgctttatggccattggtgcgagcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 6259666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 368 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 4842339 - 4842253
Alignment:
Q  368 tgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4842339 tgtttttgtcttgtgtaacttttaatgcattatggcctatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgaatctcaatcaactt 4842253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 422
Target Start/End: Original strand, 37191243 - 37191469
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | | ||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| |||   || ||||||     
T  37191243 aatatggagttaatctggcataaactggttcatttaaaagtttatatccttgcttggcggctgttgagagatcgattacctactaaatccaacttggcag 37191342  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | |||||||||  | || ||||||  |  || |||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||  ||||    
T  37191343 atcgtggcattacatctgtggaggatcgattttgtgtcacgggatgtgggcatgttgaagatgtgaatcatatgtttttgtcttgtccaattttcggtgc 37191442  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggct 422  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||    
T  37191443 attatggcctatggtgcgggaatggct 37191469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Original strand, 16917842 - 16917938
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttgg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  16917842 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctttaaaagtttctatccttgcttggcgactgttgagggatcgcttacctactaaatctaatttgg 16917938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 43388639 - 43388224
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||| |||  |||||||| ||| | ||||| ||  ||||   |     
T  43388639 tgggaggaggaattgctagtagagtgtagggatttattactgacagtcactttgcaggaaacagaaacagacaggtggatgtggttgccggatcagattt 43388540  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
     ||| ||| |||| ||||| || |||||  || |||||||||| || || |  ||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43388539 ctggttatactgttcgtggtgtatatgacttgttgacatcacaggaacaacttcatgttcatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggttccttt 43388440  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
     ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| |||   || ||||   | ||||| ||| || || ||||    | ||| |||    
T  43388439 aaaagtttctatccttgcttggcgattgttgagggatcgtttacctactaaatcaaaattggtggaacgtgggattatagctgtggaaaatcggttttgt 43388340  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtgg 430  Q
    ||  | |||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || |    
T  43388339 gtaacgggatgcaggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccaatttttggtgcattgtggcctttggtgcgggcttggcttggtgtcg 43388240  T
Q  431 taggggtcgattctca 446  Q
     |||||||||||||||    
T  43388239 aaggggtcgattctca 43388224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 446
Target Start/End: Original strand, 16917983 - 16918092
Alignment:
Q  337 ggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtagggg 436  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| |||| || || ||  |||||||||| ||||| || || | |||||    
T  16917983 ggatgtgggcaggttgaagatgtgaatcatttatttttgtcttgtccgacttttggtgctttgtggcctctggtgcgggcttggcttggtgtcgaagggg 16918082  T
Q  437 tcgattctca 446  Q
    ||||||||||    
T  16918083 tcgattctca 16918092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2491493 - 2491429
Alignment:
Q  22 ttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgca 86  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||||||    
T  2491493 ttgtgggcttgggaggaagagttggtagaggagtgtagggtactattacttacagttactttgca 2491429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Original strand, 22191634 - 22191678
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22191634 aggcggttgtgggcatgggaggaggagttggtaggggagtgtagg 22191678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28351862 - 28351776
Alignment:
Q  155 atgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatcta 241  Q
    |||| ||| |||||||||  ||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  28351862 atgacatgttgacatcactggagtatccccattcacatcaaaatatggagttaatttggcataaaccggtccctctgaaagtctcta 28351776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Original strand, 48265575 - 48265621
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48265575 ggttgtggcagtgggaggaggagttgttagcggagtgtagggcttta 48265621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3074037 - 3073993
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3074037 aggcggttgtgggcctgggaggaggagttgttaggggagtgtagg 3073993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 22191823 - 22191875
Alignment:
Q  205 ttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgact 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||| ||||    
T  22191823 ttaatttggcataaacaggttcctttgaaggtttctattcttgcttggagact 22191875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 30110782 - 30110826
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctt 64  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  30110782 ggttgtgggcttgggaggaggaggagttagaggagtgtagggctt 30110826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 454
Target Start/End: Original strand, 105696 - 106134
Alignment:
Q  16 aggcggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||    
T  105696 aggcggttgtgggcttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttgttactaacagtttctttgcaggactcagtgttagacagatggctctggt 105795  T
Q  116 tacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  105796 tacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatgtggacttaatttggca 105895  T
Q  216 taaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttg 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || || ||    
T  105896 taaacaggtccctctcaaagtctctatccttgcttggcgactaatgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatctgtg 105995  T
Q  316 gaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcggg 415  Q
    |||| || ||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  105996 gaggagcggttatgcgttgctggatgtgggattgtcgaagatgttactcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatggccgatggtgcggc 106095  T
Q  416 catggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
      ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  106096 attggttaggagtggtaggtgtcgactctcaatcaactt 106134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41207300 - 41206873
Alignment:
Q  19 cggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttac 118  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||    
T  41207300 cggttgtgggcatgggaggaagagttggtagaggagtgtagggttttattatttacagtttccttgcaggaatcagtggcagatagatggttgtggttac 41207201  T
Q  119 ctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataa 218  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  41207200 cagatcaggatggtgggtattcagtatgtggagtttatgacatgctgacatcgcaggaacatcctcagttacatccaaatatggagttaatttggcataa 41207101  T
Q  219 acaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggag 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||    
T  41207100 acaggttcctctcaaagtctctatccttgcttggcggcttctgagggatcggttacctacaaaaaataatttggcaaatcgtggcattattcccttggag 41207001  T
Q  319 gcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcat 418  Q
    |||| |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||| ||| || |||||||||    
T  41207000 gcgcggttgtgtgtcactggatgcgggcacgttgaagatgtcaatcatttgttcttgtcttgtccaacttttggtgccttatggccattgatgcgggcat 41206901  T
Q  419 ggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||    
T  41206900 ggctcggagtggtaggggttgactctca 41206873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 113 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 4552359 - 4552018
Alignment:
Q  113 ggttacctaatcatgatggtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttg 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4552359 ggttacctaatcatgatgatgggtattctgtacgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagccccagttacaccataatatggacttaatttg 4552260  T
Q  213 gcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacct 312  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || ||    
T  4552259 gcataaataggttcctcttaaagtatctatccttgcttggcgacttctgagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaatcgtggcattctatct 4552160  T
Q  313 ttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgc 412  Q
     |||||| || ||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4552159 gtggaggagcggttatgtgtttctggatgtgggattgtcgaaaatgtttctcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggtgcattatgaccgatggtgc 4552060  T
Q  413 gggcatggctaggagtggtaggggtcgattctcaatcaactt 454  Q
    |||  ||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  4552059 gggattggttaggcgtggtaggtgtcgactctcgatcaactt 4552018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28252977 - 28252642
Alignment:
Q  46 gtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgggtattctgtac 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||| | ||| ||||  |||| |  || || ||||| || |    
T  28252977 gtagaggagtgtagggctttattactgacagtttttttgcaggaatctgtttcagatagatggttgtggctaccggatcagggaggcggttattcagtcc 28252878  T
Q  146 gtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacac-cataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatcc 244  Q
    || | || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  28252877 gtagggtgtatgacatgctgacatcacaggaacagcctcagttacattcatc-tatggaattaatttggcataaacaggtacctctaaaagtatctattc 28252779  T
Q  245 ttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgg 344  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||    ||||||||||||| ||||||| | | | |||||| || ||| |||||||| || |||||    
T  28252778 ttgcttggcggcttttgagggatcgcttacctacgaagggaaatttggcaaaccatggcattattcatatggaggggcggttatgtgtttccggttgtgg 28252679  T
Q  345 gaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgt 381  Q
      | | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28252678 tcatgatgaagatgtgaatcatttgtttttgtcttgt 28252642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 12645804 - 12645394
Alignment:
Q  35 aggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatggtgg 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||  || ||||| ||| | |||||||   ||||   ||| ||    
T  12645804 aggaggatttggtagaggagtgtagggatttattactaacaatctctttgcaggaaacagaaactgacaggtggttgtggttactggatcagactggagg 12645705  T
Q  135 gtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaa 234  Q
     ||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||  | || ||  |  | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12645704 atatactgttcgtggtgtgtatgatatgttgacatcacaggaaaaccctcatgtttatcaaaatatggagttaatttggcataaacaggtttctctaaaa 12645605  T
Q  235 gtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgttt 334  Q
    || || |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||| | |||||| || | ||  | ||| ||||||||||||| | ||| ||||||     
T  12645604 gtttcaatccttgcttggcggctattgagggatcgcttacctacaaaatacaatttgacagatcgcagaattctacctttggaggctcggttttgtgtta 12645505  T
Q  335 ctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtagg 434  Q
    | || |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||   || |||| | ||||| || || ||||||||||| ||||| || || | |||    
T  12645504 cagggtgtgggcatgttgaagatgtgactcatttgtttttgtcttgcccaatttttggcgcattgtggcctatggtgcgggcttggcttggtgtcgaagg 12645405  T
Q  435 ggtcgattctc 445  Q
    ||| |||||||    
T  12645404 ggtagattctc 12645394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15917761 - 15917511
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||  |||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  15917761 aatattgagttaatttcgcataaataggttcctctgaaagtctgtatccttgcttggggactgctgagggatcgtttacctacaaaagttaatttggcaa 15917662  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||||| ||| | |||||||| | || |||||||||  |||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  15917661 atcgtggtattattcctttggaagtgcggttgtgtgtcactggttgtgggcatgttgaagatgtgaatcatatgtttttgtcttgtccaacttttggcgc 15917562  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
     || || ||| |||||| |||||||||  | || |||||||||| ||||||    
T  15917561 gttgtggccattggtgcaggcatggctcagtgttgtaggggtcggttctca 15917511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 380
Target Start/End: Original strand, 17764995 - 17765179
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||| |||   ||||||||||    
T  17764995 aatatggagttaatatggcataaacaggctcctcttaaagtctctattcttgcttggcggctattgagggatcatttacctacgaaagcaaatttggcaa 17765094  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttg 380  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17765095 accgtggtatcattcctttggaggcgcggttgtgtgtcactggttgtggtcacgtggaagatgtgaatcacttgtttttgtcttg 17765179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40176940 - 40176591
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaatcagtgacagacagatggctttggttacctaatcatgatg 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| |  |||||||  |||    |     
T  40176940 tgggaggaggacttggtagaggagtgtagggctttattactaacagtctctttgcaggaatctgatactgacagatgggtgcggttaccggatccgattt 40176841  T
Q  131 gtgggtattctgtacgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctct 230  Q
    |||| |||||||| | ||| || |||||  |  |||||||||| || || || ||  | || || |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  40176840 gtggctattctgttcatggggtatatgacttattgacatcacaggaacaacctcatattcatcaaaatatggagttagtctggcacaaacaggtacctct 40176741  T
Q  231 caaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgt 330  Q
     ||||| ||  |||||||||||||  | ||||  ||||| |||||||| |||   |||||| |||| || ||| |||||||  |||||||   | | |||    
T  40176740 aaaagtttcagtccttgcttggcggttgttgagggatcgtttacctactaaagtcaatttgacaaatcgcggc-ttttaccgatggaggctaggctttgt 40176642  T
Q  331 gtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgt 381  Q
    ||  | ||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  40176641 gtcacgggatgtgggcatgttgaagatgtgtctcatttgtttttgttttgt 40176591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14439857 - 14439610
Alignment:
Q  198 tatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaac 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||   ||||||| | |     
T  14439857 tatggagttaatctggcataaacaggttcctttaaaagtttctatcttggcttgacgactgttgagggatcgtttacctactaaatcaaatttggtagaa 14439758  T
Q  298 cgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcat 397  Q
    ||||| ||| || || |||| || | ||| | |||  | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||  |||||    
T  14439757 cgtgggattctatctgtggaagctcggttttatgtaacgggatgtgggtaggttgaagatgtgaatcatttg-ttttgtcttgtccaatttttgatgcat 14439659  T
Q  398 tatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    | || || ||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||    
T  14439658 tgtggcctatggtgcgggcttggcttggtgtcgaaggggtagattctca 14439610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 446
Target Start/End: Original strand, 10999984 - 11000233
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| | || || |  ||||| || ||||| |||   |||||||||     
T  10999984 aatatggagttaatctgccataaacaggtttctttaaaagtttctatccttgcttggtggctgtt-agggatcgtttgcctactaaatcaaatttggcag 11000082  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgc 395  Q
    | ||||| ||| || || |||| || | ||| |||||  | | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||  || |||| ||||    
T  11000083 aacgtgggattctatctgtggaagctcggttttgtgtaacggaatgtgggcatgttgaagatgtgaatcatttgttcttatcttgtccaatttttggtgc 11000182  T
Q  396 attatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattctca 446  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||    
T  11000183 attgtggcctatggtgcgggcatggcttggtgtcgaaggggtagattctca 11000233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 376
Target Start/End: Original strand, 38604407 - 38604587
Alignment:
Q  196 aatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatccttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaa 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||  || || | |||||| |||||||||| |   |||||||||     
T  38604407 aatatggagttaatctggcataaacaagtacctctaaaagtttcaatccttgcatggctgctgttaagagatcgtttacctacaatagtcaatttggcat 38604506  T
Q  296 accgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtgggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgt 376  Q
    | ||||||||  | |   ||||||| | ||| ||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38604507 atcgtggcatccttctcatggaggctcggttatgtgtctcaggctgtgggcatgttgaagatgtaaatcatgtgtttttgt 38604587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22052899 - 22052864
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22052899 tgggaggaggagttgctagaggagtgtagggcttta 22052864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 38604247 - 38604306
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttataactaacagtttctttgcaggaa 90  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  38604247 tgggaggaagacttggtagaggagtgtaggaatttagtacttacagtttctttgcaggaa 38604306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 36804195 - 36804149
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggcttta 66  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36804195 ggttgtgggcgtgggaggaggacttgttagaggagtgtagggcttta 36804149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 60
Target Start/End: Original strand, 18844490 - 18844530
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18844490 ggttgtgggcgtgggaggaggagttggtggaggagtgtagg 18844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 67
Target Start/End: Original strand, 44547716 - 44547752
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44547716 tgggaggaggagttggtagaggagtgtatgactttat 44547752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 144 - 454
Target Start/End: Original strand, 11186 - 11496
Alignment:
Q  144 acgtggagtctatgatatgctgacatcacaagagcagccccagttacaccataatatggagttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatc 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11186 acgtggagtctatgacatgctgacatcacaggagcagacccagctacaccataatctggacttaatttggcataaacaggttcctctcaaagtatctatc 11285  T
Q  244 cttgcttggcgacttttgaaagatcggttacctacaaaaaataatttggcaaaccgtggcattttacctttggaggcgcagttgtgtgtttctggatgtg 343  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  11286 cttgcttggcgacttctcagggatcggttacctacaaaacttaatttggcaaaccgtggcattctatctgtggaggagcggttatgtgtttctggatgtg 11385  T
Q  344 ggaacgttgaagatgttaatcatttgtttttgtcttgtgtaacttttagtgcattatgaccaatggtgcgggcatggctaggagtggtaggggtcgattc 443  Q
    |||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11386 ggaatgtcgaaaatgtttttcatttgtttttgtcttgtgcaacttttggagcattatggccgatggtgcgggattggttaggagtggtaggggtcgactc 11485  T
Q  444 tcaatcaactt 454  Q
    |||||||||||    
T  11486 tcaatcaactt 11496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 590
Target Start/End: Original strand, 6432 - 6554
Alignment:
Q  467 ctacgaagctgtcctgattatgtaatccgaaaactattgggaatttccggattttgttttccaaagggctattttgtannnnnnngcagagcgcgtgaga 566  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||| |||  |  ||||||||||||       |||| || |||||||    
T  6432 ctacgaagctgtccggattatgtaatccggaaacgattttgaatttacggattttgtattctgataggctattttgta-atttttgcagggcacgtgaga 6530  T
Q  567 agggcatagggtgggaaaaataat 590  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  6531 agggcatagggtgggaaaagtaat 6554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 182412 - 182365
Alignment:
Q  20 ggttgtggccttgggaggaggagttggtagaggagtgtagggctttat 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  182412 ggttgtgggcttgggaggaggaggagttagaggagtgtagggctttat 182365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7940 - 7911
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 60
Target Start/End: Original strand, 34477 - 34506
Alignment:
Q  31 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477 tgggaggaggagttggtagaggagtgtagg 34506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University