View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16555_high_17 (Length: 294)

Name: NF16555_high_17
Description: NF16555
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16555_high_17
NF16555_high_17
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (6-283)||(36557465-36557742)
chr2 (6-284)||(14700583-14700861)
chr2 (48-284)||(28457819-28458055)
chr2 (35-284)||(29223687-29223933)
chr2 (35-284)||(29336986-29337232)
chr2 (54-284)||(27257375-27257603)
chr2 (35-284)||(36040206-36040452)
chr2 (46-284)||(24663073-24663311)
chr2 (47-284)||(13230285-13230518)
chr2 (54-284)||(36667812-36668041)
chr2 (50-284)||(23924975-23925207)
chr2 (46-282)||(32522911-32523145)
chr2 (54-258)||(42702175-42702378)
chr2 (35-238)||(5784513-5784714)
chr2 (51-284)||(43991518-43991743)
chr2 (55-284)||(9787048-9787279)
chr2 (62-284)||(21159959-21160184)
chr2 (62-130)||(8687769-8687837)
chr2 (180-284)||(41977710-41977813)
chr2 (62-126)||(492737-492800)
chr2 (49-156)||(31758259-31758365)
chr2 (59-130)||(11651811-11651882)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (8-284)||(20948689-20948965)
chr4 (8-273)||(30218344-30218610)
chr4 (35-284)||(21677610-21677859)
chr4 (35-284)||(4839079-4839326)
chr4 (35-284)||(323410-323657)
chr4 (35-284)||(22047653-22047900)
chr4 (54-284)||(19247771-19247999)
chr4 (35-280)||(55326746-55326991)
chr4 (62-284)||(33110645-33110867)
chr4 (54-284)||(26069715-26069946)
chr4 (35-284)||(46691980-46692226)
chr4 (82-284)||(53895397-53895596)
chr4 (54-284)||(1187955-1188183)
chr4 (48-284)||(42532830-42533065)
chr4 (35-280)||(5273509-5273741)
chr4 (35-284)||(52618486-52618721)
chr4 (35-284)||(40995490-40995739)
chr4 (53-284)||(26373573-26373802)
chr4 (35-204)||(44432075-44432243)
chr4 (55-284)||(6639968-6640196)
chr4 (35-284)||(35416639-35416873)
chr4 (62-238)||(8894929-8895105)
chr4 (49-156)||(9417507-9417613)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (8-283)||(16416-16691)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (51-284)||(2477645-2477878)
chr7 (35-284)||(2631368-2631615)
chr7 (35-284)||(10346248-10346495)
chr7 (55-284)||(3544822-3545051)
chr7 (35-284)||(8107831-8108078)
chr7 (35-284)||(31158219-31158466)
chr7 (62-284)||(2797506-2797727)
chr7 (35-284)||(12183838-12184084)
chr7 (35-284)||(31878573-31878818)
chr7 (35-284)||(12190815-12191061)
chr7 (35-284)||(31664438-31664684)
chr7 (55-284)||(24482735-24482965)
chr7 (35-280)||(23795066-23795309)
chr7 (46-284)||(12090404-12090640)
chr7 (46-279)||(22321748-22321980)
chr7 (64-284)||(22909118-22909336)
chr7 (64-284)||(1274588-1274806)
chr7 (48-284)||(22818396-22818630)
chr7 (64-284)||(29032726-29032945)
chr7 (59-287)||(1953952-1954178)
chr7 (35-284)||(6172499-6172734)
chr7 (35-284)||(45500654-45500900)
chr7 (46-204)||(19472285-19472443)
chr7 (140-284)||(19472133-19472275)
chr7 (64-202)||(19063514-19063651)
chr7 (35-125)||(33160154-33160243)
chr7 (37-156)||(28958516-28958632)
chr7 (253-284)||(29864599-29864630)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (47-284)||(16958534-16958770)
chr8 (35-284)||(8743226-8743473)
chr8 (35-284)||(9068110-9068357)
chr8 (35-284)||(22180573-22180820)
chr8 (64-284)||(22243186-22243406)
chr8 (35-284)||(16580057-16580304)
chr8 (35-284)||(28370065-28370312)
chr8 (35-284)||(28926086-28926333)
chr8 (35-284)||(41577274-41577521)
chr8 (64-284)||(22233794-22234012)
chr8 (35-284)||(27347998-27348245)
chr8 (35-284)||(11308930-11309175)
chr8 (64-284)||(13509964-13510182)
chr8 (64-284)||(13599494-13599712)
chr8 (35-284)||(3298772-3299020)
chr8 (62-284)||(4861894-4862114)
chr8 (54-284)||(12538147-12538376)
chr8 (62-255)||(17992892-17993085)
chr8 (64-241)||(22222650-22222828)
chr8 (64-241)||(22228992-22229170)
chr8 (37-284)||(1607258-1607504)
chr8 (46-284)||(34006715-34006940)
chr8 (46-284)||(24040698-24040933)
chr8 (49-156)||(21692152-21692258)
chr8 (60-101)||(36737110-36737151)
chr8 (37-81)||(1643751-1643795)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (54-284)||(5988945-5989174)
chr6 (35-284)||(24878837-24879084)
chr6 (35-284)||(3539019-3539266)
chr6 (35-284)||(26515371-26515618)
chr6 (46-284)||(34006484-34006721)
chr6 (35-284)||(9932748-9932995)
chr6 (64-284)||(25976950-25977168)
chr6 (35-284)||(24161199-24161445)
chr6 (64-284)||(1454796-1455015)
chr6 (64-284)||(1466488-1466707)
chr6 (35-284)||(32806706-32806954)
chr6 (62-284)||(14270670-14270891)
chr6 (48-284)||(21596471-21596709)
chr6 (62-284)||(21631178-21631401)
chr6 (54-238)||(14479550-14479733)
chr6 (46-284)||(15642400-15642636)
chr6 (48-284)||(26604323-26604558)
chr6 (105-279)||(9518391-9518565)
chr6 (74-284)||(32821812-32822018)
chr6 (68-284)||(13173767-13173973)
chr6 (68-284)||(13182300-13182506)
chr6 (35-146)||(26510392-26510502)
chr6 (35-274)||(6868005-6868242)
chr6 (179-284)||(34913803-34913907)
chr6 (64-174)||(34913449-34913558)
chr6 (221-284)||(25541255-25541317)
chr6 (103-156)||(14354983-14355035)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (35-284)||(28842-29089)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (35-284)||(7314937-7315184)
chr5 (35-284)||(9404396-9404643)
chr5 (35-284)||(11723219-11723466)
chr5 (35-284)||(34456269-34456516)
chr5 (35-284)||(27167041-27167287)
chr5 (35-284)||(30607019-30607266)
chr5 (35-284)||(16904552-16904799)
chr5 (35-284)||(11766727-11766973)
chr5 (35-284)||(24835707-24835954)
chr5 (35-284)||(31845952-31846198)
chr5 (35-284)||(33434575-33434821)
chr5 (48-284)||(34869689-34869924)
chr5 (64-284)||(37251848-37252065)
chr5 (46-284)||(14344451-14344680)
chr5 (62-287)||(39655977-39656201)
chr5 (35-284)||(6269862-6270108)
chr5 (64-146)||(32226833-32226914)
chr5 (219-284)||(7315358-7315423)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (35-284)||(3588372-3588619)
chr3 (35-284)||(7653165-7653412)
chr3 (35-284)||(8615475-8615722)
chr3 (35-284)||(10386013-10386260)
chr3 (50-284)||(33247974-33248208)
chr3 (22-284)||(26335077-26335326)
chr3 (35-284)||(9989368-9989614)
chr3 (35-284)||(52308028-52308275)
chr3 (35-284)||(36469379-36469624)
chr3 (48-284)||(20837078-20837312)
chr3 (35-284)||(22097639-22097885)
chr3 (35-284)||(23385368-23385615)
chr3 (62-284)||(23193921-23194141)
chr3 (62-284)||(45527645-45527865)
chr3 (64-284)||(2357161-2357380)
chr3 (53-284)||(37471630-37471859)
chr3 (51-284)||(27850494-27850724)
chr3 (35-284)||(48168137-48168383)
chr3 (35-238)||(27030672-27030873)
chr3 (62-284)||(1232434-1232659)
chr3 (62-284)||(49434095-49434315)
chr3 (91-284)||(4742945-4743135)
chr3 (54-168)||(20963711-20963825)
chr3 (35-94)||(23411649-23411707)
chr3 (55-156)||(25804973-25805073)
chr3 (55-151)||(17405135-17405231)
chr3 (35-89)||(4755002-4755053)
chr3 (253-284)||(23411714-23411745)
chr3 (243-284)||(37022867-37022907)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (35-284)||(38121875-38122122)
chr1 (35-284)||(12168159-12168406)
chr1 (35-284)||(39001124-39001371)
chr1 (35-284)||(33492141-33492388)
chr1 (64-284)||(8996205-8996423)
chr1 (47-284)||(16832726-16832961)
chr1 (35-284)||(44505211-44505460)
chr1 (54-284)||(11738741-11738969)
chr1 (35-284)||(41000047-41000293)
chr1 (55-284)||(432284-432511)
chr1 (48-284)||(9667639-9667873)
chr1 (35-284)||(49249044-49249283)
chr1 (46-284)||(13217989-13218225)
chr1 (46-254)||(16129641-16129848)
chr1 (39-284)||(13830263-13830506)
chr1 (62-258)||(15161101-15161296)
chr1 (79-284)||(9268650-9268854)
chr1 (35-284)||(6244171-6244414)
chr1 (55-284)||(39454094-39454325)
chr1 (83-254)||(16130232-16130402)
chr1 (137-284)||(36083831-36083976)
chr1 (62-126)||(36080218-36080281)
chr1 (49-148)||(7612368-7612466)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (35-284)||(8714-8961)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (35-284)||(25593-25840)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (64-283)||(14185-14402)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (54-284)||(116511-116739)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (64-284)||(12147-12363)
scaffold0298 (64-284)||(15917-16133)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (64-284)||(12195-12411)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (55-284)||(6723-6950)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (62-284)||(927-1147)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (35-238)||(1536-1737)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (46-284)||(76395-76631)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (65-284)||(35225-35443)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (49-195)||(1-147)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (55-284)||(9393-9624)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (216-284)||(12423-12491)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (207-284)||(7205-7281)
scaffold0447 (207-284)||(11819-11895)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (207-284)||(9814-9890)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36557742 - 36557465
Alignment:
Q  6 actactgttttattcatttttctgcatacttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaaccca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36557742 actattgttttattcatttttctgcatacttagagggagaactaaggcttttctagagagagaaacacatagcaaggtagttaggagtagattcaaccca 36557643  T
Q  106 agatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtg 205  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36557642 agatttgttgagacatcatggatctaggcatttaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtg 36557543  T
Q  206 ggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatat 283  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36557542 gattttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctaacttatttattcaatat 36557465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 14700583 - 14700861
Alignment:
Q  6 actactgttttattcattttt-ctgcatacttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaaccc 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14700583 actactgttttattcattttttctgcatacttagagagaga-ctagggcttttatagagagaaaaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaaccc 14700681  T
Q  105 aagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgt 204  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14700682 aagatttgttgagacatcttgagtctaggcaaggaaacttcatattttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagttacatctacccttgt 14700781  T
Q  205 gggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700782 gggttttgaggtattcaaactaactattatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 14700861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28458055 - 28457819
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28458055 tagggcatttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaactcaagatttgttaagacatcatggatctaggcattgaatcttcat 28457956  T
Q  148 cttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgat 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  28457955 cttttcttcatcctttgcaatgctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatttcttgat 28457856  T
Q  248 cttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28457855 cttttaatatatagttctagcttatttatttaatatt 28457819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 29223687 - 29223933
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  29223687 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 29223785  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  29223786 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag--tttgaggtattcaaacaagctattat 29223883  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29223884 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 29223933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 29336986 - 29337232
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  29336986 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 29337084  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  29337085 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag--tttgaggtattcaaacaagctattat 29337182  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337183 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 29337232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Original strand, 27257375 - 27257603
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27257375 ttttctagagagagaaacacaaaacaaggtagtttggaggagatttaacccaagattcattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 27257474  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27257475 ttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatctttta 27257573  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27257574 atatatagttctagc-tatttattcaatatt 27257603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36040452 - 36040206
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  36040452 ttagagagaga-ctatggcttttgtagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 36040354  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36040353 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 36040255  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36040254 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 36040206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24663311 - 24663073
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  24663311 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggttgttaggagtagtttcataccaagatttgttgagacatcatgaatcttagcattgaatcttc 24663212  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24663211 atctttctttcatcctttgcgaagcttgcatagacatatgtagctacatctacgcttgtgagttttgaggtattcaaacaagctattacgtaaactcttg 24663112  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24663111 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 24663073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13230518 - 13230285
Alignment:
Q  47 ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttca 146  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13230518 ctagggcttttctagagaga--aacacaaagcaaggtagttatgagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttca 13230421  T
Q  147 tcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttga 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  13230420 tcttttcttcatcctttacaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttctgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttga 13230322  T
Q  247 tcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13230321 tcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 13230285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36668041 - 36667812
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||    
T  36668041 ttttttagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagacttaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatctcttc 36667942  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  36667941 ttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcattta 36667842  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36667841 atatatggttctagc-tatttattcaatatt 36667812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23925207 - 23924975
Alignment:
Q  50 gggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatct 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  23925207 gggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagcgaagatttgttgagacatcatggatcatgtcatggaatcttcatct 23925108  T
Q  150 tttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatct 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||      
T  23925107 tttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtatctacatctactcttgt-tgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataa 23925009  T
Q  250 tttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23925008 tttaatatatggttatagc-tatttattcaatatt 23924975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 32522911 - 32523145
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  32522911 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttattgagacatcatggatcttgtcattgaatcttc 32523010  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    || | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  32523011 atttcttcttcgtcctttgcaaagctatcatggacatatgtagctatttctacccttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttg 32523109  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaata 282  Q
    ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32523110 atcatttaatatatggttatagc-gatttattcaata 32523145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42702378 - 42702175
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  42702378 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttc 42702279  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||    
T  42702278 ttcctcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaataagctattatgtaatcttttgatcattta 42702180  T
Q  254 atata 258  Q
    |||||    
T  42702179 atata 42702175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5784714 - 5784513
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  5784714 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggaagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 5784616  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5784615 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 5784517  T
Q  235 gtaa 238  Q
    ||||    
T  5784516 gtaa 5784513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 284
Target Start/End: Original strand, 43991518 - 43991743
Alignment:
Q  51 ggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctt 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||      |    
T  43991518 ggcttttctagagatagaaacacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatct------t 43991611  T
Q  151 ttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  43991612 ttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcat 43991710  T
Q  251 ttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43991711 ttaatatatggtgctagc-tatttattcaatatt 43991743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9787279 - 9787048
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaaca---caaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttt 151  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9787279 tttctagagagagacacaaagcaaagcaagat-gttaggagtagattcttatcaagatttgttgagatatcatgaatctaggcatgaaatcttcatattt 9787181  T
Q  152 tcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  9787180 tcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtaagtatatctaccattgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaacttttgatcatt 9787081  T
Q  252 taatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9787080 taatatatggttatagcttatttattcaatatt 9787048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Original strand, 21159959 - 21160184
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggta----gttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttca 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21159959 agagagacacacaaagcaaagtaaggtgttaggagtagattcttatcaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatctcttcttca 21160058  T
Q  158 tcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatat 257  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||||| || |||||    
T  21160059 tcttttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatttcttgatcattcaatat 21160158  T
Q  258 atggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21160159 atgattctagc-tatttattcaatatt 21160184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8687837 - 8687769
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8687837 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatct 8687769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 284
Target Start/End: Original strand, 41977710 - 41977813
Alignment:
Q  180 catatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattca 279  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  41977710 catatatagctacatctaccattgtgggttttaaggtattcaaacaagccattatgtaaacttttgatattttaatatacgattttagc-tatttattca 41977808  T
Q  280 atatt 284  Q
    |||||    
T  41977809 atatt 41977813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 126
Target Start/End: Original strand, 492737 - 492800
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatga 126  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  492737 agagagaaacacaaatcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatga 492800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 156
Target Start/End: Original strand, 31758259 - 31758365
Alignment:
Q  49 agggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatc 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  31758259 agggcatttctagagagagaaacatgaagcaagagtgttagaagtggattctttccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcat-gaatcttcatc 31758357  T
Q  149 ttttcttc 156  Q
    ||||||||    
T  31758358 ttttcttc 31758365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 130
Target Start/End: Original strand, 11651811 - 11651882
Alignment:
Q  59 tagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  11651811 tagagagagaaacacaaagcaagggtgttatgagtagattcttcccaagatttgtagagaaatcatgaatct 11651882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 20948689 - 20948965
Alignment:
Q  8 tactgttttattcatttttctgcatacttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaag 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20948689 tactattttattcatttttctgcatacttagagggagaactagggtttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaaaagtagattcaacccaag 20948788  T
Q  108 atttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtggg 207  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20948789 atttgtcgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgtcaagctatcataaatatatgtagctacatctatccttgtggg 20948888  T
Q  208 ttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20948889 ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 20948965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30218610 - 30218344
Alignment:
Q  8 tactgttttattcattttt--ctgcatacttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaaccca 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30218610 tactgttttattcatttttttctgcatacttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaaccca 30218512  T
Q  106 agatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtg 205  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30218511 agatttgttgagacgtcatgagtctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttagcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtg 30218412  T
Q  206 ggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatt 273  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30218411 gattttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatt 30218344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21677859 - 21677610
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagaga--aacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctag 132  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21677859 ttagagagaga-ctagggattttctagagagagagaaacacaaagcaaagtagttaggaatagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatctag 21677761  T
Q  133 gcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactatt 232  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21677760 gcataaaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaaactatt 21677662  T
Q  233 atgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677661 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 21677610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4839326 - 4839079
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  4839326 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 4839228  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4839227 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 4839129  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4839128 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 4839079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 323410 - 323657
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  323410 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaagatagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 323508  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  323509 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgatgtattcaaacaagctattat 323607  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323608 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 323657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 22047653 - 22047900
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| | |    
T  22047653 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagaagattcaagccaagatttgttgagacattatggatcttgtc 22047751  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22047752 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 22047850  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047851 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 22047900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19247999 - 19247771
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19247999 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttgggagtagattcaaaccaatatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttc 19247900  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  19247899 ttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcattta 19247801  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19247800 atatatggttctagc-tatttattcaatatt 19247771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 280
Target Start/End: Original strand, 55326746 - 55326991
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagat--tcaacccaagatttattgagacatcatgaatctag 132  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55326746 ttagagagaga-ctagggcatttctagagagagaaacacatagcaagatagttaggagtagatattcaacccaagattcattgagacatcatgaatctag 55326844  T
Q  133 gcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactatt 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  55326845 gcatgaaatcttcatcttttcttcatccattccaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgt-ggttttgaggtattcaagcaagctatt 55326943  T
Q  233 atgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaa 280  Q
    ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55326944 atgcaatcttttgatcatttaatatatggttctagcttatttattcaa 55326991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33110867 - 33110645
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  33110867 agagagaaacacaaggcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgaatttaggcatgacatcttcatctttttttcatcct 33110768  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33110767 ttgcaaagctatcgtagacatatgtagttatatatacccttgtgggttttgaggtattcacacaagccattatgtaaacttttgatcttttaatatatgg 33110668  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33110667 ttctagcttatttattcaatatt 33110645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Original strand, 26069715 - 26069946
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| || |||    
T  26069715 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttagaagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcaactcttc 26069814  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctac--atctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  26069815 ttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatt 26069914  T
Q  252 taatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26069915 taatatatggttctagc-tatttattcaatatt 26069946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 46692226 - 46691980
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  46692226 ttagagagaga-ctagggcttttctagagatagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtc 46692128  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  46692127 attgaatcttcatttcttcctcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagttatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 46692029  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46692028 gtaatcttttgataatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 46691980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 284
Target Start/End: Original strand, 53895397 - 53895596
Alignment:
Q  82 gtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaaca 181  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53895397 gtagttaaaagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggagtcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagaca 53895496  T
Q  182 tatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaat 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53895497 tatgtagctacatctacccttctgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactct---tattttaatatatggttctagcttatttattcaat 53895593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Original strand, 1187955 - 1188183
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  1187955 ttttctagacagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagtcaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatgaaatcttcatcttttc 1188054  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  1188055 ttcatcctttgcaaagctatcataggcatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcattta 1188153  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  1188154 atatatgattctag-ttatttatttaatatt 1188183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42533065 - 42532830
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcat 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  42533065 tagggcatttctagagagagaaacacaaagcaaggtggttaggagtagattcaagcctagatttgttgagacgtcatggatcttgtcatggaatcttcat 42532966  T
Q  148 cttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgat 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  42532965 cttttcttcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgat 42532867  T
Q  248 cttttaatatat-ggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42532866 catttaatatatgggttctagc-tatttattcaatatt 42532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5273741 - 5273509
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  5273741 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 5273643  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||           ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5273642 atgga-----------ttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag-ttttgaggtattcaaacaagctattat 5273555  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaa 280  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273554 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaa 5273509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 52618486 - 52618721
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  52618486 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtc 52618584  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52618585 atggaa-----------tcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactattgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 52618672  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52618673 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 52618721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40995739 - 40995490
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||   |    
T  40995739 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaatcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatc 40995641  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  40995640 attgaatcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaaaaagctattat 40995542  T
Q  235 gtaaactcttgatcttt---taatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40995541 gtaatcttttgatcatttaataatatatggttctagc-tatttattcaatatt 40995490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26373802 - 26373573
Alignment:
Q  53 cttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctttt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||   ||| |||||||||| | ||    
T  26373802 cttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaatatttgttgagatatcatggatcttatcattgaatcttcatttctt 26373703  T
Q  153 cttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttt 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  | | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||    
T  26373702 ctttatcctttgcaaagctatcatagacatatatagctatatcacctcatgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcattt 26373604  T
Q  253 aatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26373603 aatatatggttctagc-tatttattcaatatt 26373573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44432243 - 44432075
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  44432243 ttagagagaga-ctagggattttctagagagagaaactcaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttcttgagacatcatggatcttgcc 44432145  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgt 204  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44432144 atggaatcttcaccctttcttcatcctttacaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt 44432075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Original strand, 6639968 - 6640196
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||    
T  6639968 tttctagtgagagaaacacaaagcaagggtgttaggagtagattcttcccaaaatttgttgagacatcttgaatcttagcatgtaatcttcatc-tttct 6640066  T
Q  155 tc-atcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    || ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||    
T  6640067 tctatcttttccaaagctttcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatggaatct-ttgatcattta 6640165  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  6640166 atataaggttctaatttatttattcattatt 6640196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35416873 - 35416639
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  35416873 ttagagagaga-ctagggcttttttagagagagaaacacaaagaaagatagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 35416775  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||| |||||||||||           |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  35416774 atgaaatcttcatct-----------tttgcacaactatcatagacatatgtagttacatctactcttgt-ggttttgatgtattc-aacaagctattat 35416688  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35416687 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-aatttattcaatatt 35416639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 238
Target Start/End: Original strand, 8894929 - 8895105
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||  | |||| |    
T  8894929 agagagaaacacaatgcaagggtgttagaagtagattcttcccaagatttgtagagaaatcatgaatcttgtcatgaaatcttcatctttcttccatctt 8895028  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaa 238  Q
    |||||| ||||  || |  ||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| | || ||| |||||||||||    
T  8895029 ttgcaaggctactatgagaatatgtagctaaatctgcccttgtgggtttagaggtacttaagcaagctattatgtaa 8895105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9417613 - 9417507
Alignment:
Q  49 agggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatc 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  9417613 agggcgtttctagagagagaaacatgaagcaagagtgttagaagtggattatttccaagatttgttgagacatcatgaatcttttcat-gaatcttcatc 9417515  T
Q  149 ttttcttc 156  Q
    ||| ||||    
T  9417514 tttccttc 9417507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16691 - 16416
Alignment:
Q  8 tactgttttattcatttttctgcatacttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16691 tactgttttatttatttttctgcatacttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagtaaggtagttaagagtagattctacccaag 16592  T
Q  108 atttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtggg 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16591 atttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatcttttcttcatcctttgccaagctatcttagacatatgtatctacatatacccttgtggg 16492  T
Q  208 ttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatat 283  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16491 ttttgaggtatttaaataagctattatgtaaacccttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatat 16416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 51 - 284
Target Start/End: Original strand, 2477645 - 2477878
Alignment:
Q  51 ggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2477645 ggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatctt 2477744  T
Q  151 ttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctt 250  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2477745 ttcctcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctccatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatctt 2477844  T
Q  251 ttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2477845 ttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 2477878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 2631368 - 2631615
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  2631368 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 2631466  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2631467 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 2631565  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631566 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 2631615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10346495 - 10346248
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  10346495 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 10346397  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10346396 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 10346298  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10346297 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 10346248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3545051 - 3544822
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  3545051 tttctagagagagaaacaaaaagaaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattaaatcttcatctcttct 3544952  T
Q  155 tcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaa 254  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  3544951 ccatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaattacttgatcttttaa 3544852  T
Q  255 tatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3544851 tatatggttctagcttatttattcaatatt 3544822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8108078 - 8107831
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  8108078 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 8107980  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8107979 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-aattttgaggtattcaaacaagctattat 8107881  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8107880 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 8107831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31158466 - 31158219
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  | |    
T  31158466 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcatgtc 31158368  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31158367 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 31158269  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31158268 gtaaccttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 31158219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2797727 - 2797506
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2797727 agagagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcct 2797628  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  2797627 ttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaattttttgatcatttaatatatgg 2797528  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  2797527 ttctagc-tatttattcaatatt 2797506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 12183838 - 12184084
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| | |    
T  12183838 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcttgtc 12183936  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12183937 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacttttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 12184035  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12184036 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttgttcaatatt 12184084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 31878573 - 31878818
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  31878573 ttagagagaga-ctagagcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtc 31878671  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31878672 atggaatcttcatctttt-ttcatcctttgcaaaactatcaaagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 31878769  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31878770 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 31878818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 12190815 - 12191061
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  12190815 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 12190913  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12190914 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtatttacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 12191012  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12191013 gtaatcttttgatcatttaatatatggttct-ggatatttattcaatatt 12191061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31664684 - 31664438
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  31664684 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 31664586  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  31664585 atggaatcttcatcttttcttaatcctttacaaagctatcataaacatatctagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcgaacaggctattat 31664487  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31664486 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 31664438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Original strand, 24482735 - 24482965
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  24482735 tttctagagagagaaacacaaagcaagggagttatgagtagatcaaacccaagatttgttgagacatcatggatctagacattgaatcttcatctcttct 24482834  T
Q  155 tcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggtttt-gtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24482835 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtggattttagaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatctttta 24482934  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24482935 aaatatggttctagtttatttattcaatatt 24482965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 280
Target Start/End: Original strand, 23795066 - 23795309
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  23795066 ttagagagaga-ctagggattttctagagagagaaactcaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 23795164  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23795165 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctattatagacatatgtagctccatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 23795263  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaa 280  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23795264 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaa 23795309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12090640 - 12090404
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  12090640 actaaggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtaaattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttc 12090541  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  | |||    
T  12090540 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaatcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctaatatgtaatattttg 12090442  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12090441 atcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 12090404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22321980 - 22321748
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| ||||||||    
T  22321980 actagggcttttctagagagagaaatacaaagcaagttagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttttcattgaatcttc 22321881  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  22321880 atcctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttg 22321782  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattca 279  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321781 atcctttaatatatggttctagcttatttattca 22321748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 22909118 - 22909336
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22909118 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaatctaagatttgttgagacatcatggatctagtcattgaatcttcatcttttcttcatccttt 22909216  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22909217 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggtt 22909316  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  22909317 ctagc-tatatattcaatatt 22909336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 1274588 - 1274806
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |    
T  1274588 agagaaacacaaagtaaggt-gttatgagtagatttaactcaagatttgttgagacatcatggatctcggcattgaatctttatctcttcttcatcctat 1274686  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1274687 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttctgggttttgaggtattcaaacaagttattatgtaaactcttgatcatttaatatatggtt 1274786  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  1274787 ctagc-tatttattcaatatt 1274806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Original strand, 22818396 - 22818630
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  22818396 tagggcatttctagagagagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatgaaatcttcat 22818495  T
Q  148 cttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgat 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  22818496 cttttcttcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgat 22818594  T
Q  248 cttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
      |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22818595 aatttaatgtatggttctagc-tatttattcaatatt 22818630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29032945 - 29032726
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  29032945 agagaaacacaaagtaaggt-gttaggagtagattctattcaagatttgttgagacatcatgagtctagacatggaatcttcatctttctttcatcattt 29032847  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    || |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29032846 gccaagcttgcatagacatatgtagctacatctaaccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaacttttgatcttttaatatatggtt 29032747  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29032746 ctagcttatttattcaatatt 29032726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 287
Target Start/End: Original strand, 1953952 - 1954178
Alignment:
Q  59 tagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcat 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| | ||| |||||||||  | ||||||||    
T  1953952 tagagagagaaacacaaagcaatgtagttaggagtagattcaagccaagatttgttaagacatcatggatcttgtcattgaatcttcaattcttcttcat 1954051  T
Q  159 cctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatata 258  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  1954052 cctttgaaaagctatcatagacatatgtagctatatctactattgt-ggttttgaggtatttaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatata 1954150  T
Q  259 tggttctagcttatttattcaatattctt 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1954151 tggttctagc-tatttattcaatattctt 1954178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 6172499 - 6172734
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||  | |    
T  6172499 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcctgtc 6172597  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6172598 atggaatcttcatc-----------ctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgtag-ttttgaggtattcaaacaagctattat 6172685  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6172686 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 6172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45500900 - 45500654
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| | |    
T  45500900 ttagagagaga-ctatgacttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttatgagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcttgtc 45500802  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45500801 attgaatcttcatttcttcttcatcatttgcaaagctatcacagacatatgtagttatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 45500703  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||  | |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45500702 gtaatattttgaccatttaatatatggttatag-ttatttattcaatatt 45500654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19472443 - 19472285
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||    
T  19472443 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcttggaatcttc 19472344  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgt 204  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19472343 atcctttctgcatcctttgtaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt 19472285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19472275 - 19472133
Alignment:
Q  140 atcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaa 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  19472275 atcttcatcctttcttcatcctttgtaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaat 19472177  T
Q  240 ctcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19472176 cttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 19472133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 202
Target Start/End: Original strand, 19063514 - 19063651
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| || |    
T  19063514 agagaaacacaaagtaaggt-gttaggagtagattcaacctaaaatttgttgagacatcatggatctaagcattgaatcttcatctcttcttcattctat 19063612  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctaccctt 202  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  19063613 gtaaagctatcatagacatatgtagttatatctaccctt 19063651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 33160154 - 33160243
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatg 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33160154 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatg 33160243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28958632 - 28958516
Alignment:
Q  37 agagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcat 136  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||| |||||  |||||||||| | |||| || |||||||| | |||    
T  28958632 agagagagaa--agggcatttctagagagagaaacatgaagcaagagtgttagaagtggattcttcccaagatttgtagagaaattatgaatcttgtcat 28958535  T
Q  137 ggaatcttcatcttttcttc 156  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  28958534 -gaatcttcatattttcttc 28958516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 284
Target Start/End: Original strand, 29864599 - 29864630
Alignment:
Q  253 aatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29864599 aatatatggttctagcttatttattcaatatt 29864630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Original strand, 16958534 - 16958770
Alignment:
Q  47 ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttca 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16958534 ctagggctttt-tagagagagaaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttca 16958632  T
Q  147 tcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||    
T  16958633 tcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatttaatttcttga 16958732  T
Q  247 tcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16958733 tcttttaatatatggttctagcttatttattcactatt 16958770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8743473 - 8743226
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  8743473 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 8743375  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8743374 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 8743276  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743275 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 8743226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9068357 - 9068110
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  9068357 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 9068259  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9068258 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 9068160  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9068159 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 9068110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 22180573 - 22180820
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  22180573 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacaaaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 22180671  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22180672 atggaatcttcatcctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattat 22180771  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22180772 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 22180820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22243406 - 22243186
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22243406 agagaaacacaaaacaaggtagttagaagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatccttt 22243307  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22243306 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacctttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatttcttgatcttttaatatatggtt 22243207  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22243206 ctagcttatttattcaatatt 22243186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 16580057 - 16580304
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  16580057 ttagagagaga-ctagggattttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 16580155  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16580156 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 16580254  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16580255 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 16580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 28370065 - 28370312
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  28370065 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 28370163  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28370164 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatttactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 28370262  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370263 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 28370312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28926333 - 28926086
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  28926333 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 28926235  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28926234 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 28926136  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28926135 gtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 28926086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41577521 - 41577274
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  41577521 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 41577423  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  41577422 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agctttgaggtattcaaacaagctattat 41577324  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577323 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 41577274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22234012 - 22233794
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22234012 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 22233914  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22233913 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatgatt 22233814  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  22233813 ctagc-tgtttattcaatatt 22233794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 27347998 - 27348245
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  27347998 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 27348096  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  27348097 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agtcttgaggtattcaaacaagctattat 27348195  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348196 gtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 27348245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11309175 - 11308930
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  11309175 ttagagagaga-ctagggcttttctagagaga--aacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 11309079  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11309078 atggaatctccaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 11308980  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308979 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 11308930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 13509964 - 13510182
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13509964 agagaaacacaaagcaagat-gttagaagtagattcaacctaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatccttt 13510062  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13510063 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggtt 13510162  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13510163 ctagc-tatttattcaatatt 13510182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 13599494 - 13599712
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13599494 agagaaacacaaagcaagat-gttagaagtagattcaacctaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatccttt 13599592  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13599593 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggtt 13599692  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  13599693 ctagc-tatttattcaatatt 13599712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 3298772 - 3299020
Alignment:
Q  35 ttagagagaga-actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctagg 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |     
T  3298772 ttagagagagagactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgt 3298871  T
Q  134 catggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactatta 233  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3298872 catagaatcttcaccctttcttcatccattgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctatta 3298970  T
Q  234 tgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3298971 tgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatatt 3299020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4862114 - 4861894
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4862114 agagagaaacacaaggtaaggtagttaagagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcct 4862015  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  4862014 ttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatgg 4861916  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  4861915 ttctagc-tatttattcaatatt 4861894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Original strand, 12538147 - 12538376
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||    
T  12538147 ttttctagagagagaaacacaaatcaaggtagttaggattagattcaagctatgatttgttgagacatcatgaatcttgtcattgaatcttcatctcttc 12538246  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  12538247 ttcatcatttgcaaagctatcttagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaaactattatgtaattttttgatcattta 12538346  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12538347 atatatggttctagc-tatttattcaatatt 12538376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 17992892 - 17993085
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992892 agagagaaacacaaggcaaggtagttaagagtagattcaatccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcct 17992991  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaat 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||    
T  17992992 ttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaat 17993085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22222828 - 22222650
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatct--tttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22222828 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctcttttcttcatcct 22222730  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaact 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22222729 ttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaact 22222650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22229170 - 22228992
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatct--tttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22229170 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctcttttcttcatcct 22229072  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaact 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22229071 ttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaact 22228992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 284
Target Start/End: Original strand, 1607258 - 1607504
Alignment:
Q  37 agagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcat 136  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  1607258 agagagagaaataaggcatttctagatagagaaacacaaagcaagggtgttaagagtatattcttcctaagatttgttgagacatcatgaatcttagcat 1607357  T
Q  137 ggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgt 236  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1607358 ggaatcttcatctttctttcatcctttgcaaagctttcataggcatatgtagctacatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaaactattatgt 1607457  T
Q  237 aaactcttgatct-tttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||  |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1607458 aa--tctttatttatttaatatatggttctaccttatttattaaatatt 1607504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34006940 - 34006715
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  34006940 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattaaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttc 34006841  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    |||           |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  34006840 atc-----------ctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttg 34006753  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34006752 atcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 34006715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Original strand, 24040698 - 24040933
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  24040698 actagagcttttctagagagagaaacataaatcaatgtagttagaagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttc 24040797  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  24040798 atttcttcctcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttat-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttg 24040896  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24040897 at-atttaatatatggttttagc-tatttattcaatatt 24040933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 156
Target Start/End: Original strand, 21692152 - 21692258
Alignment:
Q  49 agggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatc 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21692152 agggcatttctagagagagaaacatgaagcaagagtgttagaagtggattctttccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcat-gaatcttcatc 21692250  T
Q  149 ttttcttc 156  Q
    ||||||||    
T  21692251 ttttcttc 21692258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 36737151 - 36737110
Alignment:
Q  60 agagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36737151 agagagagaaacacaaagcaagatagttaggagtagattcaa 36737110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Original strand, 1643751 - 1643795
Alignment:
Q  37 agagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaag 81  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1643751 agagagagaaatagggcatttctagagtgagaaacacaaagcaag 1643795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5989174 - 5988945
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  5989174 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatctttt- 5989076  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5989075 ttcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatttacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatctttta 5988976  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5988975 atatatggttctagcttatttattcaatatt 5988945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 24878837 - 24879084
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24878837 ttagagaga-aactaggacttttctagagagagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatctaggc 24878935  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24878936 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatatactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 24879034  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24879035 gtaatcttttgatcttttaatatatggctatagcttatttattcaatatt 24879084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 3539019 - 3539266
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  3539019 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 3539117  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3539118 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 3539216  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539217 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 3539266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26515618 - 26515371
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  26515618 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 26515520  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26515519 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 26515421  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515420 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 26515371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Original strand, 34006484 - 34006721
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  34006484 actagagcttttctagaaagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaaaccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttc 34006583  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  34006584 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttg 34006682  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34006683 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 34006721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9932995 - 9932748
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  9932995 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaaggcaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 9932897  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9932896 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatatacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 9932798  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932797 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 9932748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 25976950 - 25977168
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25976950 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgttatggaatcttcatcttttcttcatc-ttt 25977047  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25977048 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 25977147  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  25977148 ctagcttgtttattcaatatt 25977168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24161445 - 24161199
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  24161445 ttagagagaga-ctatggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagcaaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 24161347  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24161346 atggaatcttcatcttttcttcattcttggcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 24161248  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24161247 gtaatattttgatcatttaatatatggttctag-ttatttattcaatatt 24161199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 1454796 - 1455015
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1454796 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatctttctttcatccttt 1454894  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    || |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1454895 gccaagcttgcatagacatatgtaactacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 1454994  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  1454995 ctagcttgtttattcaatatt 1455015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 1466488 - 1466707
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1466488 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatctttctttcatccttt 1466586  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    || |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1466587 gccaagcttgcatagacatatgtaactacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 1466686  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  1466687 ctagcttgtttattcaatatt 1466707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32806954 - 32806706
Alignment:
Q  35 ttagagagaga-actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctagg 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |     
T  32806954 ttagagagagatactagggctttcctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgt 32806855  T
Q  134 catggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactatta 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32806854 catgaaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtatctacacctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctatta 32806756  T
Q  234 tgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| || |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32806755 tgtaatcttttgataatttaatatatggttatagc-tatttattcaatatt 32806706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Original strand, 14270670 - 14270891
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  14270670 agagagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatagatctaggcagtgaatcttcatcttttcttcatctt 14270768  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  14270769 ttgcaaaactatcatagacatatgtagctatatatacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagcaattatgtaatttcttgattttttaatatatgg 14270868  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14270869 ttctagcttatttattcaatatt 14270891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21596709 - 21596471
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctag----gcatggaatct 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| |    |||||||||||    
T  21596709 tagggcatttctagagagagaaacacaaagcatggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcttgtcatgcatggaatct 21596610  T
Q  144 tcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  21596609 tcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaaacttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttt 21596511  T
Q  244 tgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21596510 tgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 21596471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Original strand, 21631178 - 21631401
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatct--tttcttcatc 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  21631178 agagagaaacataaagcaaggtagttaagagtagatttaacacaagatttgttgagacatcatggatctagacatagaatcttcatctcttttcttcatc 21631277  T
Q  160 ctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatat 259  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21631278 ctttgtaaagctatcatagacatatgtagttacatctactcttgtggattt-gaggtattcaaacaagctattacgtaaactcttgatcttttaatacat 21631376  T
Q  260 ggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21631377 ggttctagcttatttattcaatatt 21631401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 238
Target Start/End: Original strand, 14479550 - 14479733
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14479550 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttc 14479649  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14479650 ttcatcctttgcaaatctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 14479733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Original strand, 15642400 - 15642636
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    || || |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  15642400 actagggcttgtctagagagagaaacacatg--aaagttgttaggagtagattcttaccaagatttgttgagacatcatgaatcttagcatgaaatcttc 15642497  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15642498 atctttctttcatcctttgctaagcttgcatagacatatgtagctaaatctacccttgtgggttttgaggtattcaaataagctattatgtaaactcttg 15642597  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15642598 atcttttaatatatggttctagcttatttattgaatatt 15642636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Original strand, 26604323 - 26604558
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcat 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26604323 tagggcatttctagagagagaaacacaaagcaagggtgttagaagtagattcttcccaagatttgttgagacatcatgaatcttagcatggaatcttcat 26604422  T
Q  148 cttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgat 247  Q
    ||||  | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  26604423 ctttcttccatcttttgcaaagctttcatagacatatgtagctacatctatccttgtgggtattgaggtattcaaaaaagctattatgtaatct-ttgat 26604521  T
Q  248 cttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26604522 catttaatataagattctagcttatttattcaatatt 26604558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9518565 - 9518391
Alignment:
Q  105 aagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgt 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9518565 aagatttgttgagacatcatgaattttagcatgaaatcttcatctttctttcatcctttgccaagtttgcatagacatatgtagctacatctacccttgt 9518466  T
Q  205 gggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattca 279  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9518465 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagtttatttattca 9518391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 284
Target Start/End: Original strand, 32821812 - 32822018
Alignment:
Q  74 aaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctat 173  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  32821812 aaagcaaggta-ttaggaatagattcaacccaagatttgttgataaatcatggatctatgcattgaatcttcatctcttctccatccttttaaaagctat 32821910  T
Q  174 cataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatt 273  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32821911 catagacaaatgtagctacatcta--cttgtgggttttgaggtattcaaataagcaattatgtaatctttagat-ttttaatatatggttctagcttatt 32822007  T
Q  274 tattcaatatt 284  Q
    |||||||||||    
T  32822008 tattcaatatt 32822018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13173973 - 13173767
Alignment:
Q  68 aaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatct--tttcttcatcctttgc 165  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13173973 aaacacaaagtaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagatatcatgagtc--ggcatggaatcttcatctcttttcttcatcctttgc 13173877  T
Q  166 aaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttct 265  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||    
T  13173876 aaagctatcatagaca--------tacatctacccttgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaatatatgattct 13173785  T
Q  266 agcttatttattcaatatt 284  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  13173784 agc-tatttattcaatatt 13173767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13182506 - 13182300
Alignment:
Q  68 aaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatct--tttcttcatcctttgc 165  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13182506 aaacacaaagtaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagatatcatgagtc--ggcatggaatcttcatctcttttcttcatcctttgc 13182410  T
Q  166 aaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttct 265  Q
    |||||||||||| |||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||    
T  13182409 aaagctatcatagaca--------tacatctacccttgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaatatatgattct 13182318  T
Q  266 agcttatttattcaatatt 284  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  13182317 agc-tatttattcaatatt 13182300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26510502 - 26510392
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  26510502 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 26510404  T
Q  135 atggaatcttca 146  Q
    ||||||||||||    
T  26510403 atggaatcttca 26510392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6868242 - 6868005
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||  |||||||| | | || | ||||||||||| | |    
T  6868242 ttagagagagat-tagggcatttcaagagtgagaaacacaaaacaagggtgttagaagtagattcctcccaagatatgtaga-atatcatgaatcttgtc 6868145  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||| ||||||| |||  | |||| ||||||| ||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  6868144 atggagtcttcatatttcttccatcttttgcaaggctactatgaaaatttgtagctacatctacccttgtgggttttaaggtattcaaacaagctattat 6868045  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttattt 274  Q
    |||| || |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  6868044 gtaatcttttgataatttaatatatggttctagctcattt 6868005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 284
Target Start/End: Original strand, 34913803 - 34913907
Alignment:
Q  179 acatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34913803 acatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctatc-tatttattc 34913901  T
Q  279 aatatt 284  Q
    ||||||    
T  34913902 aatatt 34913907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 174
Target Start/End: Original strand, 34913449 - 34913558
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  34913449 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacattatggatttaggcattgaatcttcatctcttcatcatcctat 34913547  T
Q  164 gcaaagctatc 174  Q
    |||||||||||    
T  34913548 gcaaagctatc 34913558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 284
Target Start/End: Original strand, 25541255 - 25541317
Alignment:
Q  221 aaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25541255 aaacaagctattatgtaatct-ttgatcatttcatataaggttctagcttatttattaaatatt 25541317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14355035 - 14354983
Alignment:
Q  103 ccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttc 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  14355035 ccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtca-cgaatcttcatcttttcttc 14354983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29089 - 28842
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  29089 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 28991  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28990 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 28892  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28891 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 28842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 7314937 - 7315184
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  7314937 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 7315035  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7315036 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 7315134  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315135 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 7315184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 9404396 - 9404643
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  9404396 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 9404494  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9404495 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 9404593  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9404594 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 9404643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11723466 - 11723219
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  11723466 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 11723368  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11723367 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 11723269  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11723268 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 11723219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 34456269 - 34456516
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  34456269 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 34456367  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34456368 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 34456466  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456467 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 34456516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27167287 - 27167041
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| | |    
T  27167287 ttagagagaga-ctatggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgggacatcatggatcttgtc 27167189  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27167188 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaaactattat 27167090  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27167089 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 27167041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30607266 - 30607019
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| | |    
T  30607266 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaatatttgttgagacatcatggatcttgtc 30607168  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30607167 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 30607069  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30607068 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 30607019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16904799 - 16904552
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  16904799 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggggtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 16904701  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16904700 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 16904602  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16904601 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcctatttattcaatatt 16904552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 11766727 - 11766973
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  11766727 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 11766825  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11766826 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 11766924  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11766925 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatatt 11766973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 24835707 - 24835954
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  24835707 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaatcaaggtagttaggagtagattcaagtcaggatttgttgagacatcatggatcttgtc 24835805  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24835806 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 24835904  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24835905 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 24835954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 31845952 - 31846198
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  31845952 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 31846050  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31846051 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatttaatcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 31846149  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31846150 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatatt 31846198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 33434575 - 33434821
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  33434575 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 33434673  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  33434674 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctcctcttgt-agttttgaggtactcaaacaagctattat 33434772  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33434773 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatatt 33434821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34869924 - 34869689
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  34869924 tagggcatttctagagagagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcat 34869825  T
Q  148 cttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgat 247  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||    
T  34869824 ctcttattcattctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttcgat 34869725  T
Q  248 cttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34869724 catttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 34869689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37252065 - 37251848
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37252065 agagagacacaaaacaaggt-gttaggtgtagattcaacccaagatttattgagacatcatgagtcaagg-atggaatcttcatcttttcttcatccttt 37251968  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37251967 gcaaagctatcatagatatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggtt 37251868  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  37251867 ctagc-tatttattcaatatt 37251848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Original strand, 14344451 - 14344680
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  14344451 actagggcttttctagagagagaaactcaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttc 14344550  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||            
T  14344551 accctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgta-------- 14344641  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14344642 atcttttaatatatggttctaacttatttattcaatatt 14344680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 62 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39656201 - 39655977
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  39656201 agagagaaacacaacgtaaggt-gttaggagtagattctacaaaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatctttctttcatcct 39656103  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    |||  |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39656102 ttgtcaagcttgcaaagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 39656003  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatattctt 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  39656002 ttctagcttatttattcaatcttctt 39655977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 6269862 - 6270108
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||| | |    
T  6269862 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagaaatgtagttatgagtagattcaagccaagatttgttgtgacaacatggatcttgtc 6269960  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6269961 aaggaatcttcatattttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 6270059  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||  | |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  6270060 gtaatattttgatcatttaatatatatttctagc-tatttattcaatatt 6270108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 32226833 - 32226914
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttca 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32226833 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacctaaaatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttca 32226914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 284
Target Start/End: Original strand, 7315358 - 7315423
Alignment:
Q  219 tcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315358 tcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 7315423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 3588372 - 3588619
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  3588372 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 3588470  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3588471 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 3588569  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3588570 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 3588619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7653412 - 7653165
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  7653412 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 7653314  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7653313 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcttagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 7653215  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7653214 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 7653165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 8615475 - 8615722
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||   |    
T  8615475 ttagagaga-aactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatc 8615573  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8615574 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 8615672  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615673 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 8615722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10386260 - 10386013
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  10386260 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcgagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 10386162  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10386161 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 10386063  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10386062 gtaatcctttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 10386013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 284
Target Start/End: Original strand, 33247974 - 33248208
Alignment:
Q  50 gggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatct 149  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33247974 gggcatttttagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgaatttaggcattgaatcttcatct 33248073  T
Q  150 tttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatct 249  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |    
T  33248074 ctttttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctgcatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttcgatat 33248173  T
Q  250 tttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33248174 tttaatatatgattctagctaatttattcaatatt 33248208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 284
Target Start/End: Original strand, 26335077 - 26335326
Alignment:
Q  22 tttttctgcatacttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26335077 tttttttgcatacttagagagagacat--ggcttttctagagagaaaaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacat 26335174  T
Q  122 catgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattca 221  Q
    ||||| |||||||||| ||||||           |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26335175 catgagtctaggcatgaaatctt-----------catcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattca 26335263  T
Q  222 aacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26335264 aacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatgattttagcttatttattcaatatt 26335326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 9989368 - 9989614
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  9989368 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 9989466  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9989467 atagaatcttcaccctttcttcaacctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 9989565  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9989566 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagc-aatttattcaatatt 9989614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52308275 - 52308028
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || |||||||||| |||| | |    
T  52308275 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattctagccaatatttgtttagacatcatggatcttgtc 52308177  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52308176 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcttagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 52308078  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52308077 gtaatcttttgatcttttaatacatggttctagcttatttattcaatatt 52308028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36469624 - 36469379
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  36469624 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaa-gcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 36469527  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36469526 atagaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacaactactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 36469428  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || | |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  36469427 gtaatctttagatcttttaatacatggttctagc-aatttattcaatatt 36469379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Original strand, 20837078 - 20837312
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  20837078 tagggcatttctagagagagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcat 20837177  T
Q  148 cttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20837178 cttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgat 20837276  T
Q  248 cttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20837277 catttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 20837312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 22097639 - 22097885
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  22097639 ttagagaga-aactaggacttttctagagagagaaacacaaagtaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 22097737  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22097738 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 22097836  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||  | |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22097837 gtaatattttgatcatttaatatatggttctagc-catttattcaatatt 22097885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 23385368 - 23385615
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  23385368 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacaaaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 23385466  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||  |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23385467 atagaatctacaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatttagctacatctattcttgt-agtttttaggtattcaaacaagctattat 23385565  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23385566 gtaattttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 23385615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Original strand, 23193921 - 23194141
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193921 agagagaaacacaaggcaaggtagttaagagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcct 23194020  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| || |||||| ||||||||||||    
T  23194021 ttgcaaa-ctatcagagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattacgtaatcttttgatcatttaatatatgg 23194119  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  23194120 ttctatc-tatttattcaatatt 23194141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Original strand, 45527645 - 45527865
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45527645 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcatcatcct 45527744  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  45527745 ttgcaaagctatcatagacatatctagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatacatgg 45527843  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  45527844 ttctagc-tatttattcaatatt 45527865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 2357161 - 2357380
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  2357161 agagaaacacaaagcaagat-gttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatgaaatcttcatctttctttcatccttt 2357259  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    || |||||   ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2357260 gccaagcttgtatagacatatgtagctacatctaacattgtgggttttgaggtattcaaacaaaccatgatgtaaactcttgatcttctaatatatggtt 2357359  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2357360 ctagcttatttattcaatatt 2357380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 53 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37471859 - 37471630
Alignment:
Q  53 cttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctttt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  37471859 cttttctagagagagaaacacaaagcaaagtagttaggagtagattcaagccaaaatttgttgagacgacatggatcttgtcatggaatcttcatctttt 37471760  T
Q  153 cttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||    
T  37471759 cttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgatgtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcattt 37471661  T
Q  253 aatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37471660 aatatatggttctagc-tatttattcaatatt 37471630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27850724 - 27850494
Alignment:
Q  51 ggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  27850724 ggcttttctagagagagaaacacaa-gcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcat 27850626  T
Q  151 ttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctt 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||  | |||||| |    
T  27850625 ttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccaatcttgt-ggttttgaggtatttaaacaagctattatgtaattttttgatcat 27850527  T
Q  251 ttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27850526 ttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 27850494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48168383 - 48168137
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||   |    
T  48168383 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacgaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcagggatcttatc 48168285  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48168284 atggaatctgcatcttcacttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 48168186  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  48168185 gtaatcttttgatcatttaatatattgttttagc-tatttattcaatatt 48168137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27030873 - 27030672
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  27030873 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 27030775  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27030774 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 27030676  T
Q  235 gtaa 238  Q
    ||||    
T  27030675 gtaa 27030672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1232659 - 1232434
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggta----gttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttca 157  Q
    |||||||||||||||||||  ||    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  1232659 agagagaaacacaaagcaaaataaggtgttaggagtagattcttatcaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatctttatctcttcttca 1232560  T
Q  158 tcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatat 257  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  1232559 tcctttgcaaagctattatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaaaccattatgtaatttcttgatcatttaatat 1232460  T
Q  258 atggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1232459 atggttctagc-tatttattcaatatt 1232434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Original strand, 49434095 - 49434315
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| | |||| ||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  49434095 agagagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagatattatgagtttaggtatgtaatctttatctttctttcatcct 49434193  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    |||| |||||  |||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  49434194 ttgccaagcttgcatagacatatgtagctacatttatc-ttgtgcgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttcatcttttaatatatag 49434292  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||| ||||||    
T  49434293 ttctaacttatttatttaatatt 49434315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 91 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4743135 - 4742945
Alignment:
Q  91 agtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagct 190  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4743135 agtagattcaagccaagatttgttgagagatcatggatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatcgtttgcaaagctatcatagacatatgtagct 4743036  T
Q  191 acatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4743035 acatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatc-attaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 4742945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20963825 - 20963711
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||    
T  20963825 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcgtggaatcttcatcttctc 20963726  T
Q  154 ttcatcctttgcaaa 168  Q
    |||||| ||||||||    
T  20963725 ttcatcatttgcaaa 20963711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 23411649 - 23411707
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagta 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411649 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagta 23411707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 156
Target Start/End: Original strand, 25804973 - 25805073
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||| |||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  25804973 tttctagagagagaaacatgaagcaagagtgttagaagttgattcttcccaagatttgtagagaaatcatgaatcttgtcat-gaatcttcatcttttct 25805071  T
Q  155 tc 156  Q
    ||    
T  25805072 tc 25805073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17405231 - 17405135
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    |||||||| | |||| ||||||| ||| | |||| ||| |||||||||    
T  17405231 tttcaagagagagaaacacaaagcaagggtgttaggagtagattcttttcaagatttgtagagatatcatgagtcttgacatgtaatattcatcttt 17405135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 4755053 - 4755002
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttag 89  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4755053 ttagagagaga-ctagggcttttctagagaga--aacacaaagcaaggtagttag 4755002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 284
Target Start/End: Original strand, 23411714 - 23411745
Alignment:
Q  253 aatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23411714 aatatatggttctagcttatttattcaatatt 23411745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Original strand, 37022867 - 37022907
Alignment:
Q  243 ttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37022867 ttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 37022907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38122122 - 38121875
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  38122122 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 38122024  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38122023 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 38121925  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38121924 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 38121875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12168406 - 12168159
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  12168406 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggtgtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 12168308  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12168307 atggaatcttcaccatttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 12168209  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12168208 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 12168159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39001371 - 39001124
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  39001371 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 39001273  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  39001272 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttaaggtattcaaacaagctattat 39001174  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39001173 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 39001124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33492388 - 33492141
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  33492388 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 33492290  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33492289 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagccacatctactcttgt-agttctgaggtattcaaacaagctattat 33492191  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33492190 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 33492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8996423 - 8996205
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8996423 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacccaagatttgttgcgacatcatggatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatccttt 8996325  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8996324 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgatgtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatgatt 8996225  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  8996224 ctagc-tatttattcaatatt 8996205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16832961 - 16832726
Alignment:
Q  47 ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||    
T  16832961 ctagggcttttctagagagagaaacacaaagtaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatcatgaaatcttca 16832862  T
Q  147 tcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  16832861 tcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagatatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttga 16832763  T
Q  247 tcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16832762 tcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 16832726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44505460 - 44505211
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||  | |    
T  44505460 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaaaatttgttgagacatcatggatcatgtc 44505362  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattc-aaacaaactatta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  44505361 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaaacttgtggtttttgaggtattcaaaacaagctatta 44505262  T
Q  234 tgtaaactcttgatcttttaatatat-ggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| || |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44505261 tgtaatcttttgattatttaatatatgggttctagc-tatttattcaatatt 44505211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11738969 - 11738741
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  11738969 ttttctatagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtaaattcaagccaagatttgttgacacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttc 11738870  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||    
T  11738869 ttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgcaatcttttgatcattta 11738771  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11738770 atatatggttctagc-tatttattcaatatt 11738741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41000293 - 41000047
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  41000293 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 41000195  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41000194 attgaatcttcatttcttcctcatcctttgcaaatctatcatagacatatgtagttatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattat 41000096  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41000095 gtaatcttttgatcatttaatatatggttctagc-tatttattcaatatt 41000047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 432511 - 432284
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  432511 tttctagagagagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagactcaagccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttct 432412  T
Q  155 tcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  432411 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaa 432313  T
Q  255 tatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  432312 tatatggttctagc-aatttattcaatatt 432284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9667873 - 9667639
Alignment:
Q  48 tagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  9667873 tagggcatttctagagagagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcat 9667774  T
Q  148 cttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  9667773 cttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatacattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgat 9667675  T
Q  248 cttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9667674 catttaatatatggttctagc-aatttattcaatatt 9667639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 49249044 - 49249283
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  49249044 ttagagagaga-ctggggcttttctaaagagagaaacacaaagtaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 49249142  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  49249143 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 49249241  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49249242 gta--------atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 49249283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13218225 - 13217989
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  13218225 actaggccttttttagagagagaaacacaaagcaaggtggttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggaacttgtcatggaatcttc 13218126  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||||| || |||    
T  13218125 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggcattcaaacaagatattatgtaatcttttg 13218027  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13218026 ataatttaatatacggttctagc-tatttattcaatatt 13217989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 254
Target Start/End: Original strand, 16129641 - 16129848
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  16129641 actagggcttttatagagagagaaacacaaagcaagatagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttc 16129740  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  16129741 atttcttcttcatcatttgcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaatctattatgtaatcttttg 16129839  T
Q  246 atcttttaa 254  Q
    ||| |||||    
T  16129840 atcatttaa 16129848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 13830263 - 13830506
Alignment:
Q  39 agagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatgg 138  Q
    |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||     
T  13830263 agagagaaatagggcgtttataaagagagaaacacaaggaagggt-gttaggagtagattcttcctaagatttgttgagacgtcatgaatcttagcatga 13830361  T
Q  139 aatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaa 238  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||     
T  13830362 aatcttcatttttctttcatcctttgcaaagttttcatagacatatgtagctacatttacccttgtgggtttttaggtattcaaacaagctattatgtat 13830461  T
Q  239 actcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13830462 ta-cttgatcatttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 13830506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Original strand, 15161101 - 15161296
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||    
T  15161101 agagagaaacacaaagcaagata-ttaggagtagattcttcccaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcatattttcttcatcct 15161199  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatata 258  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15161200 ctgcaaagctatcatagacatatgtagttacatctactcttatgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgattttttaatata 15161296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 284
Target Start/End: Original strand, 9268650 - 9268854
Alignment:
Q  79 aaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataa 178  Q
    ||||| |||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||| || ||  || |     
T  9268650 aaggttgttaagagtagattcttcctaatatttattgagacatcatgagtctagacatgaaatcttcatctttcttttatcctttgccaaacttgcaaag 9268749  T
Q  179 acatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9268750 acatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaccaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatgtttctagc-tatttattc 9268848  T
Q  279 aatatt 284  Q
    ||||||    
T  9268849 aatatt 9268854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 6244171 - 6244414
Alignment:
Q  35 ttagagagaga-actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctagg 133  Q
    ||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||| | |||| ||||||||| | |     
T  6244171 ttagagagagagattaggacatttctagtgagagaaacacaaagcaagggtgttaggagtagattcttctaaagatttgtagagatatcatgaatattgt 6244270  T
Q  134 catggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactatta 233  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||  || || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |    
T  6244271 catggaatcttcatccttcttccatcttttgcaaagctactatgaaaacatatagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaaca-------a 6244363  T
Q  234 tgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  6244364 tgtaaactcttgatcatttaatatatggttccagctcttttattcaatatt 6244414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Original strand, 39454094 - 39454325
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||  || | ||||| | |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  |    
T  39454094 tttctagtgagagaaacacaaatcaagcatgttagaagtagattcttcctaggatttgtagagatatcatgaatcttagtatggaatcttcatctttctt 39454193  T
Q  155 tcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactatta---tgtaaactcttgatcttt 251  Q
     |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||   ||||| || |||||| ||    
T  39454194 ccatcttttgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctacgcttgtggtttttaaggtattcaaacaagctattaatttgtaatct-ttgatcatt 39454292  T
Q  252 taatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39454293 taatttaaggttctagcttatttattcaatatt 39454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 254
Target Start/End: Original strand, 16130232 - 16130402
Alignment:
Q  83 tagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacat 182  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  16130232 tagttaggagtagattcaagtcaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcatcatttgcaaagttatcatagacat 16130331  T
Q  183 atgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaa 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  16130332 atgtagctatatctactcttgt-gattttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaa 16130402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 284
Target Start/End: Original strand, 36083831 - 36083976
Alignment:
Q  137 ggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgt 236  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||  |||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  36083831 ggaatctttatctttctttcatcctttgtcaagcttgcatagacatatgtagttacatctacc-ttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgt 36083929  T
Q  237 aaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36083930 aaactctt-atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 36083976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 126
Target Start/End: Original strand, 36080218 - 36080281
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatga 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  36080218 agagagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctatccaagacttgttgagacatcatga 36080281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7612466 - 7612368
Alignment:
Q  49 agggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatc 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  7612466 agggcatttctagagagagaaacatgaagcaagagtgttagaagtggattctttccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcat-gaatcttcatc 7612368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Original strand, 8714 - 8961
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  8714 ttagagagaga-ctagggcttttctagagagagaaacacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 8812  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8813 atagaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 8911  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8912 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25840 - 25593
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |    
T  25840 ttagagagaga-ctagtgcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtc 25742  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25741 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagatatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 25643  T
Q  235 gtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25642 gtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 25593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 283
Target Start/End: Original strand, 14185 - 14402
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14185 agagagacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaactcaagatttgttgagacatcatgagtttagggatggaatcttcatctttttttcatccttt 14283  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14284 gcaaagctatcatatacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccatta-gtaaactcttgatcttttaatatatggtt 14382  T
Q  264 ctagcttatttattcaatat 283  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  14383 ctagtttatttattcaatat 14402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 116739 - 116511
Alignment:
Q  54 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  116739 ttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcctcatcttttc 116640  T
Q  154 ttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatctttta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  116639 ttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtatttaaacaagctattatgtaatcttttgatcattta 116541  T
Q  254 atatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  116540 atatatggttctagc-tattaattcaatatt 116511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12363 - 12147
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12363 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatccttt 12265  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  12264 gcaaagctatcatagacata--tagctgcatctacccttgtgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggta 12167  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12166 ctagc-tatttattcaatatt 12147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16133 - 15917
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16133 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatccttt 16035  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  16034 gcaaagctatcatagacata--tagctgcatctacccttgtgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggta 15937  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  15936 ctagc-tatttattcaatatt 15917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 64 - 284
Target Start/End: Original strand, 12195 - 12411
Alignment:
Q  64 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12195 agagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatccttt 12293  T
Q  164 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 263  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  12294 gcaaagctatcatagacata--tagctgcatctacccttgtgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggta 12391  T
Q  264 ctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12392 ctagc-tatttattcaatatt 12411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Original strand, 6723 - 6950
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  6723 tttctagagagagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttct 6822  T
Q  155 tcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||    
T  6823 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaa 6921  T
Q  255 tatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6922 tatatggttctagc-tatttattcaatatt 6950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 927
Alignment:
Q  62 agagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcct 161  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||    
T  1147 agagagaaacacaaagtaaggt-gttaggagtagattctatccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaattttcatatcttcttcgtcct 1049  T
Q  162 ttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 261  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048 ttgcaaagttatcacagacatatgtagctacatctacctttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatgg 949  T
Q  262 ttctagcttatttattcaatatt 284  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  948 -tgtagcttatttattcaatatt 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 1536 - 1737
Alignment:
Q  35 ttagagagagaactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggc 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||   |    
T  1536 ttagagaga-aactagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatc 1634  T
Q  135 atggaatcttcatcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattat 234  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1635 atggaatcttcaccctttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattat 1733  T
Q  235 gtaa 238  Q
    ||||    
T  1734 gtaa 1737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 76631 - 76395
Alignment:
Q  46 actagggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttc 145  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  76631 actatggcttctctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttc 76532  T
Q  146 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttg 245  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||  |||||||||| || |||    
T  76531 aacaattcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagatacatctactcttgt-gattttgaggtattcaaacaagttattatgtaatcttttg 76433  T
Q  246 atcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  76432 atcatttaatgtatggttctagc-tatttattcaatatt 76395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35443 - 35225
Alignment:
Q  65 gagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctttg 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  35443 gagaaacacaaagcaaggt-gttaggagtagattctacccaagatttgttgagacattatgagtctcggtatgaaatcttcatttttctttcatcctttg 35345  T
Q  165 caaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttc 264  Q
    | |||||  |||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||     
T  35344 ccaagcttgcatagacatatgtaggtacatccaccattgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatttcttgattttttaatatatggtta 35245  T
Q  265 tagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35244 tagcttatttattcaatatt 35225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  49 agggcttttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatc 148  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  147 agggcatttctagagagagaaagacaaagcaaggtagttgggagtagattcaacacaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcctc 48  T
Q  149 ttttcttcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatc 195  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47 tcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9624 - 9393
Alignment:
Q  55 tttctagagagagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttct 154  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||  || | ||||| | |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  |    
T  9624 tttctagtgagagaaacacaaatcaagcatgttagaagtagattcttcctaggatttgtagagatatcatgaatcttagtatggaatcttcatctttctt 9525  T
Q  155 tcatcctttgcaaagctatcataaacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgtggtattcaaacaaactatta---tgtaaactcttgatcttt 251  Q
     |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||   ||||| || |||||| ||    
T  9524 ccatcttttgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctacgcttgtggtttttaaggtattcaaacaagctattaatttgtaatct-ttgatcatt 9426  T
Q  252 taatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9425 taatttaaggttctagcttatttattcaatatt 9393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12491 - 12423
Alignment:
Q  216 tattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491 tattcaaacaagctattatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 12423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Original strand, 7205 - 7281
Alignment:
Q  207 gttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7205 gttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagc-tatctattcaatatt 7281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Original strand, 11819 - 11895
Alignment:
Q  207 gttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11819 gttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagc-tatctattcaatatt 11895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Original strand, 9814 - 9890
Alignment:
Q  207 gttttgtggtattcaaacaaactattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatatt 284  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9814 gttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagc-tatctattcaatatt 9890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University