View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16555_low_7 (Length: 411)

Name: NF16555_low_7
Description: NF16555
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16555_low_7
NF16555_low_7
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (175-411)||(18855549-18855786)
chr4 (153-411)||(51520257-51520516)
chr4 (175-411)||(9224433-9224668)
chr4 (175-411)||(9229220-9229455)
chr4 (153-411)||(56146737-56146996)
chr4 (175-411)||(5732486-5732724)
chr4 (175-411)||(3813846-3814083)
chr4 (175-411)||(45347843-45348079)
chr4 (175-411)||(45357322-45357558)
chr4 (154-411)||(24741748-24741999)
chr4 (154-411)||(29760449-29760700)
chr4 (353-411)||(28468567-28468625)
chr4 (352-411)||(10047378-10047438)
chr4 (352-411)||(36315267-36315327)
chr4 (352-411)||(36329476-36329536)
chr4 (352-411)||(38152477-38152537)
chr4 (352-411)||(39245993-39246053)
chr4 (353-411)||(5396709-5396768)
chr4 (354-411)||(5143260-5143318)
chr4 (352-411)||(5269229-5269289)
chr4 (352-411)||(16623331-16623391)
chr4 (353-411)||(31985672-31985730)
chr4 (354-411)||(5147678-5147736)
chr4 (353-409)||(3796559-3796616)
chr4 (352-411)||(24333808-24333868)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (175-411)||(39445322-39445559)
chr1 (175-411)||(25445115-25445352)
chr1 (175-411)||(44023899-44024135)
chr1 (175-411)||(1055037-1055274)
chr1 (175-411)||(41398060-41398295)
chr1 (193-411)||(43988490-43988709)
chr1 (190-411)||(24787402-24787624)
chr1 (249-411)||(41390483-41390640)
chr1 (175-253)||(41386571-41386650)
chr1 (154-411)||(24202807-24203054)
chr1 (353-411)||(19358881-19358939)
chr1 (353-411)||(19361470-19361528)
chr1 (353-411)||(19380110-19380168)
chr1 (352-411)||(47703974-47704034)
chr1 (353-411)||(19072928-19072987)
chr1 (353-411)||(19120818-19120877)
chr1 (353-411)||(26644935-26644994)
chr1 (352-411)||(9476260-9476320)
chr1 (353-411)||(3281708-3281767)
chr1 (352-405)||(13598397-13598451)
chr1 (353-410)||(37069770-37069828)
chr1 (352-411)||(775671-775731)
chr1 (352-411)||(16124554-16124614)
chr1 (352-411)||(27104410-27104470)
chr1 (352-411)||(29651810-29651870)
chr1 (352-411)||(47098862-47098922)
chr1 (353-411)||(13604661-13604720)
chr1 (353-411)||(21536607-21536666)
chr1 (154-210)||(19359079-19359132)
chr1 (356-405)||(47102885-47102935)
chr1 (352-411)||(32889438-32889498)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (175-411)||(6438324-6438560)
chr6 (175-411)||(28155595-28155832)
chr6 (175-411)||(14737602-14737838)
chr6 (175-411)||(14742462-14742697)
chr6 (175-411)||(22010723-22010958)
chr6 (175-411)||(28184325-28184564)
chr6 (175-411)||(11856795-11857033)
chr6 (175-411)||(6005239-6005476)
chr6 (175-411)||(16838566-16838803)
chr6 (193-411)||(33330471-33330690)
chr6 (175-411)||(33335968-33336207)
chr6 (193-398)||(5343322-5343527)
chr6 (154-300)||(30125940-30126084)
chr6 (154-411)||(5674808-5675057)
chr6 (353-411)||(5757516-5757575)
chr6 (353-411)||(21356036-21356095)
chr6 (352-411)||(10077203-10077263)
chr6 (352-411)||(31086511-31086571)
chr6 (352-411)||(31979512-31979572)
chr6 (353-411)||(4629954-4630013)
chr6 (352-411)||(5572279-5572339)
chr6 (352-411)||(31936586-31936646)
chr6 (365-411)||(21801382-21801429)
chr6 (352-403)||(5017515-5017567)
chr6 (375-411)||(22709041-22709077)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (175-411)||(185-422)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (175-411)||(19992135-19992372)
chr7 (175-411)||(21812264-21812501)
chr7 (175-411)||(24024352-24024589)
chr7 (175-411)||(12396735-12396970)
chr7 (175-411)||(12406155-12406390)
chr7 (175-411)||(31109609-31109844)
chr7 (175-411)||(4866553-4866789)
chr7 (152-411)||(2057763-2058024)
chr7 (154-411)||(20357585-20357837)
chr7 (175-411)||(16879894-16880132)
chr7 (175-411)||(16884750-16884988)
chr7 (175-411)||(24261349-24261587)
chr7 (175-411)||(24266228-24266466)
chr7 (154-411)||(1533482-1533730)
chr7 (353-411)||(18408764-18408822)
chr7 (353-411)||(21639809-21639867)
chr7 (353-411)||(18413641-18413698)
chr7 (353-411)||(21646007-21646065)
chr7 (354-411)||(21983285-21983343)
chr7 (352-411)||(9190046-9190106)
chr7 (352-411)||(20284088-20284148)
chr7 (352-411)||(29159802-29159862)
chr7 (352-411)||(2580389-2580449)
chr7 (352-411)||(33332488-33332548)
chr7 (352-411)||(46516348-46516408)
chr7 (352-411)||(49091660-49091720)
chr7 (353-411)||(44848722-44848781)
chr7 (352-411)||(2647734-2647794)
chr7 (352-411)||(9185203-9185263)
chr7 (356-411)||(28617263-28617319)
chr7 (352-411)||(35960815-35960875)
chr7 (154-210)||(21645818-21645871)
chr7 (352-411)||(55947-56006)
chr7 (353-400)||(8153466-8153514)
chr7 (353-411)||(47263678-47263735)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (175-411)||(28807598-28807837)
chr5 (154-411)||(43592080-43592338)
chr5 (175-411)||(37556648-37556887)
chr5 (175-411)||(37561470-37561709)
chr5 (153-411)||(1457188-1457446)
chr5 (154-411)||(27444771-27445029)
chr5 (154-411)||(27449615-27449873)
chr5 (154-411)||(43598525-43598783)
chr5 (154-411)||(43604017-43604275)
chr5 (154-411)||(43609509-43609767)
chr5 (175-411)||(2785197-2785434)
chr5 (175-411)||(31397019-31397256)
chr5 (175-411)||(31401876-31402113)
chr5 (193-411)||(33791158-33791375)
chr5 (171-411)||(30631227-30631465)
chr5 (175-411)||(15044512-15044745)
chr5 (193-411)||(33768021-33768238)
chr5 (274-411)||(31180138-31180273)
chr5 (353-411)||(38192174-38192232)
chr5 (353-411)||(38219399-38219457)
chr5 (353-411)||(24135849-24135907)
chr5 (353-411)||(35387663-35387721)
chr5 (353-411)||(9353370-9353429)
chr5 (353-411)||(36932388-36932447)
chr5 (154-219)||(31180079-31180142)
chr5 (352-408)||(17004001-17004058)
chr5 (353-411)||(10281751-10281810)
chr5 (353-411)||(15464532-15464591)
chr5 (354-411)||(11917010-11917068)
chr5 (352-411)||(28832258-28832318)
chr5 (154-210)||(38191983-38192036)
chr5 (154-210)||(38219208-38219261)
chr5 (352-405)||(42127454-42127508)
chr5 (353-408)||(14520230-14520286)
chr5 (357-411)||(4410246-4410301)
chr5 (357-410)||(27910675-27910729)
chr5 (154-210)||(35387474-35387527)
chr5 (352-411)||(3880298-3880358)
chr5 (356-411)||(12084213-12084269)
chr5 (352-411)||(31300634-31300694)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (151-411)||(6311097-6311356)
chr8 (175-411)||(39784848-39785086)
chr8 (153-411)||(7289952-7290211)
chr8 (175-411)||(25328304-25328540)
chr8 (175-411)||(35745213-35745450)
chr8 (8-154)||(38613611-38613757)
chr8 (154-411)||(4760113-4760366)
chr8 (154-411)||(36979184-36979436)
chr8 (154-411)||(30655448-30655705)
chr8 (175-411)||(10684290-10684528)
chr8 (145-411)||(10689181-10689442)
chr8 (190-411)||(33037844-33038063)
chr8 (154-411)||(18853206-18853457)
chr8 (154-411)||(18870600-18870849)
chr8 (353-411)||(26287902-26287960)
chr8 (353-411)||(26301159-26301217)
chr8 (353-411)||(26313153-26313211)
chr8 (353-411)||(1261992-1262050)
chr8 (352-411)||(26403268-26403328)
chr8 (355-411)||(9765857-9765914)
chr8 (352-411)||(4696634-4696694)
chr8 (353-411)||(4456028-4456087)
chr8 (353-411)||(31071267-31071326)
chr8 (356-411)||(7412344-7412400)
chr8 (353-411)||(19175792-19175851)
chr8 (352-403)||(5702529-5702581)
chr8 (352-411)||(19752432-19752492)
chr8 (352-411)||(23799615-23799675)
chr8 (356-411)||(6127224-6127280)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (175-411)||(35088-35323)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (175-411)||(22173221-22173456)
chr3 (175-411)||(18656256-18656494)
chr3 (152-411)||(7167049-7167303)
chr3 (175-411)||(2677113-2677351)
chr3 (175-411)||(2672957-2673195)
chr3 (175-411)||(8512037-8512276)
chr3 (175-411)||(8516917-8517156)
chr3 (175-401)||(10207755-10207983)
chr3 (154-411)||(2671624-2671876)
chr3 (154-411)||(28503902-28504145)
chr3 (201-411)||(24967957-24968166)
chr3 (175-411)||(32475306-32475544)
chr3 (175-411)||(32480163-32480402)
chr3 (154-411)||(8739101-8739354)
chr3 (154-411)||(9091339-9091592)
chr3 (335-411)||(40372833-40372908)
chr3 (333-411)||(8477343-8477421)
chr3 (353-411)||(1305949-1306007)
chr3 (353-411)||(26928629-26928687)
chr3 (154-262)||(40372981-40373085)
chr3 (353-411)||(8370514-8370573)
chr3 (353-411)||(27974980-27975039)
chr3 (353-411)||(27986474-27986533)
chr3 (352-409)||(21711222-21711280)
chr3 (352-411)||(18552911-18552971)
chr3 (353-411)||(16264350-16264409)
chr3 (353-411)||(25795781-25795840)
chr3 (353-411)||(30709818-30709877)
chr3 (353-411)||(32143321-32143380)
chr3 (353-411)||(33386694-33386753)
chr3 (354-411)||(36029094-36029152)
chr3 (352-403)||(1417526-1417578)
chr3 (356-411)||(1736333-1736389)
chr3 (352-411)||(3716030-3716090)
chr3 (352-411)||(40592810-40592870)
chr3 (353-411)||(27452958-27453017)
chr3 (352-405)||(47923940-47923994)
chr3 (352-411)||(6794741-6794801)
chr3 (352-411)||(26298987-26299047)
chr3 (352-411)||(37466290-37466350)
chr3 (352-411)||(48438213-48438273)
chr3 (352-405)||(3328390-3328444)
chr3 (153-227)||(8477170-8477242)
chr3 (353-400)||(39153357-39153405)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (175-411)||(9668-9902)
scaffold0355 (175-322)||(3-143)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (175-411)||(44312650-44312885)
chr2 (175-411)||(39812014-39812250)
chr2 (175-411)||(19344243-19344480)
chr2 (175-411)||(19349101-19349338)
chr2 (175-411)||(32246607-32246847)
chr2 (152-411)||(11098965-11099219)
chr2 (154-411)||(14291295-14291547)
chr2 (154-411)||(9296439-9296691)
chr2 (353-411)||(3491751-3491809)
chr2 (353-411)||(25398496-25398554)
chr2 (353-411)||(25403634-25403692)
chr2 (352-411)||(8040059-8040119)
chr2 (353-411)||(40738844-40738901)
chr2 (352-411)||(10445482-10445542)
chr2 (356-411)||(13569331-13569387)
chr2 (352-411)||(14699045-14699105)
chr2 (352-411)||(21629943-21630002)
chr2 (352-411)||(34682372-34682432)
chr2 (353-411)||(28259215-28259274)
chr2 (352-403)||(17865202-17865254)
chr2 (352-403)||(20522219-20522271)
chr2 (154-210)||(25403443-25403496)
chr2 (354-411)||(34388859-34388917)
chr2 (356-411)||(8390188-8390244)
chr2 (356-410)||(1345580-1345635)
chr2 (353-411)||(31056044-31056103)
chr2 (354-411)||(10707290-10707348)
chr2 (154-210)||(25398305-25398358)
chr2 (352-404)||(39482930-39482983)
chr2 (353-409)||(42039709-42039766)
chr2 (356-403)||(2838076-2838124)
chr2 (383-411)||(25407653-25407681)
chr2 (352-411)||(33118135-33118195)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (175-411)||(19191-19428)
scaffold0197 (175-411)||(14335-14573)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (175-411)||(148982-149219)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (175-411)||(2277-2514)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (175-411)||(181990-182228)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (153-385)||(300-528)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (175-253)||(34132-34211)
[»] scaffold0188 (3 HSPs)
scaffold0188 (353-411)||(17990-18048)
scaffold0188 (353-411)||(24083-24141)
scaffold0188 (154-210)||(24278-24331)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (175-236)||(13171-13233)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (353-411)||(8457-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (354-411)||(85684-85742)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (352-405)||(5682-5736)
scaffold0006 (352-411)||(2491-2551)
scaffold0006 (353-411)||(133318-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (352-411)||(10728-10788)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (353-411)||(45253-45312)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (353-411)||(43999-44058)
scaffold0087 (353-407)||(36874-36929)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 18855549 - 18855786
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855549 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 18855648  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855649 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 18855748  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855749 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 18855786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 411
Target Start/End: Original strand, 51520257 - 51520516
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51520257 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 51520356  T
Q  252 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  51520357 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccg 51520455  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520456 ag-aagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 51520516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9224668 - 9224433
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  9224668 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9224569  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9224568 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 9224472  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224471 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 9224433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9229455 - 9229220
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  9229455 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 9229356  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9229355 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttaacccagttca 9229259  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229258 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 9229220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 56146996 - 56146737
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  56146996 ctgttgtgaatccggttccaaattcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaa 56146897  T
Q  252 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  56146896 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccg 56146798  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146797 ag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 56146737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 5732486 - 5732724
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5732486 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 5732584  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaa----caccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    ||| || |||||||||||||||||    
T  5732585 tagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaa-ggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccag 5732681  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732682 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 5732724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 3813846 - 3814083
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||      
T  3813846 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctaga 3813945  T
Q  273 ctagtgtatagc-aaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3813946 ctagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttc 3814043  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814044 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 3814083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45348079 - 45347843
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||  |    
T  45348079 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45347980  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45347979 tagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 45347882  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45347881 gccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctcca 45347843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45357558 - 45357322
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||  |    
T  45357558 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagac 45357459  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45357458 tagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 45357361  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45357360 gccaatatggcataatctgggggagagagcagctctcca 45357322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 24741748 - 24741999
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagca--a 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||  |    
T  24741748 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaaca 24741843  T
Q  252 acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||  |  | || | |||||||||||||| |    
T  24741844 acaacaa-aaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccaa 24741939  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741940 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 24741999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 29760449 - 29760700
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |  |||||| |||||||| |||    
T  29760449 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaat-aaacaaaatggtttccaagc-aac 29760544  T
Q  254 aacaac-aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag 351  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||  |  | || | |||||||||||||| ||    
T  29760545 aacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccaag 29760641  T
Q  352 caagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760642 -aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 29760700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468567
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctcca 28468567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047438
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 10047438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315267
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 36315267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329476
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 36329476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152477
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctcca 38152477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246053
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 39246053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396709
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctcca 5396709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143318
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 5143318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5269289 - 5269229
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5269289 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 5269229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623331
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctcca 16623331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985672
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctcca 31985672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147736
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctcca 5147736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796559
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctc 409  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctc 3796559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24333868
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcca 24333868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 39445322 - 39445559
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445322 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 39445421  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445422 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 39445521  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445522 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 39445559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25445352 - 25445115
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445352 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 25445253  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445252 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 25445153  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445152 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 25445115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44024135 - 44023899
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024135 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 44024036  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024035 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 44023937  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023936 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 44023899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1055274 - 1055037
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1055274 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 1055175  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055174 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 1055075  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1055074 ccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctcca 1055037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 41398060 - 41398295
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac----aaacagccct 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    ||||||||||    
T  41398060 tcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccct 41398159  T
Q  270 aagctagtgtatagc--aaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 366  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||      | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41398160 aa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagata------agaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgaccc 41398250  T
Q  367 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398251 aggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 41398295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 193 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43988709 - 43988490
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaacc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||    
T  43988709 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaacc 43988611  T
Q  291 acacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 388  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43988610 acactaagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaat 43988513  T
Q  389 ctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43988512 ctgggggagagagcagctctcca 43988490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24787624 - 24787402
Alignment:
Q  190 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa-----acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagc 284  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||||  ||  |||| |||    
T  24787624 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagc 24787526  T
Q  285 aaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggc 383  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |   |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787525 aaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggc 24787430  T
Q  384 ctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24787429 ctaatctgggggggagagcagctctcca 24787402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 249 - 411
Target Start/End: Original strand, 41390483 - 41390640
Alignment:
Q  249 caaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaa 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||       |||||| ||||||||    
T  41390483 caaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaa-gaacaaaa 41390574  T
Q  345 caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390575 catcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 41390640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 253
Target Start/End: Original strand, 41386571 - 41386650
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41386571 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24203054 - 24202807
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |  |||| ||||| ||| | | || || || ||||||||||    
T  24203054 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgtgta-aagtgtct-ccaagcaaac 24202960  T
Q  254 aacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaa-acaccgag 351  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||  ||  |||||  |||||||||| |   ||| |  ||||||||| ||||| |     
T  24202959 aacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca-agagaa-tacaaagca--aacaagataagcaagaaagg--aagaacaaacacaccaaa 24202866  T
Q  352 caagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202865 -aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 24202807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358881
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 19358881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361470
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 19361470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19380110
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 19380110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703974
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 47703974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19072987
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 19072987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120877
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 19120877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644935
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 26644935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476320
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctcca 9476320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281767
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 3281767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 405
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598451
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagc 405  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 13598451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 410
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069828
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctcc 37069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775731
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctcca 775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124554
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 16124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104410
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctcca 27104410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651870
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactcca 29651870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098862
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctcca 47098862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604661
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 13604661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536607
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 21536607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19359132 - 19359079
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  19359132 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 19359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102885
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagc 405  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagc 47102885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 32889438 - 32889498
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32889438 caagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctcca 32889498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 6438324 - 6438560
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagct 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438324 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagct 6438423  T
Q  275 agtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagc 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6438424 agtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagc 6438523  T
Q  375 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438524 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 6438560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28155832 - 28155595
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag- 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||| ||||| || |     
T  28155832 tcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcc-tatga 28155734  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28155733 cttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 28155634  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155633 gccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 28155595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14737838 - 14737602
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  14737838 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 14737739  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaa-gagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14737738 tagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgatccagttc 14737642  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737641 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 14737602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14742697 - 14742462
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  |    
T  14742697 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagac 14742598  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14742597 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 14742501  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14742500 gccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcca 14742462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22010958 - 22010723
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  22010958 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 22010859  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22010858 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 22010762  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010761 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 22010723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 28184325 - 28184564
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaa--tggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28184325 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 28184424  T
Q  271 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28184425 gactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 28184522  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184523 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 28184564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 11856795 - 11857033
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  11856795 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 11856894  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaagga--aagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| || || ||||||||  || || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11856895 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagtt 11856992  T
Q  371 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11856993 cagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctcca 11857033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 6005239 - 6005476
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  6005239 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 6005337  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaagg-aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005338 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagt 6005434  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005435 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 6005476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 16838566 - 16838803
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16838566 tcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 16838664  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838665 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagt 16838761  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16838762 tcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctcca 16838803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33330690 - 33330471
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-c 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  33330690 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaac 33330592  T
Q  290 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggt-aaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33330591 cacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 33330494  T
Q  389 ctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33330493 ctgggggagagagcagctctcca 33330471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33336207 - 33335968
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  33336207 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcc-taa 33336109  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggt-aaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    || || ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33336108 gcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccag 33336011  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336010 ttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctcca 33335968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 5343322 - 5343527
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaa-c 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||| |    
T  5343322 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaaagtatagcaaaaac 5343420  T
Q  290 cacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5343421 cacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 5343517  T
Q  389 ctgggggaga 398  Q
    || |||||||    
T  5343518 ctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30126084 - 30125940
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||| |||    
T  30126084 tgttgtgaatccggttgaaaatcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 30125989  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagag 300  Q
     ||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30125988 tacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5675057 - 5674808
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| | ||| |  | |||||| |||    
T  5675057 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatga---aaacaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaaagagta-aaaagtttcccaagc-aac 5674963  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaa-acaccga 350  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |||||| | |||  ||  ||||  |||||| ||||  |  | || ||||||||||| ||||| |    
T  5674962 aacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccacaaagaga-atacaaagc--aaacaatataa--gcaagaaagaaagaacaaacacacc-a 5674869  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674868 aagagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 5674808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757516
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 5757516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356095
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctcca 21356095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077203
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 10077203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086511
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctcca 31086511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979572
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctcca 31979572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630013
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctcca 4630013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572279
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctcca 5572279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936646
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctcca 31936646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 365 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801382
Alignment:
Q  365 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctcca 21801382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017515
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagca 403  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagca 5017515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 411
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709077
Alignment:
Q  375 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctcca 22709077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 185 - 422
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  185 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 284  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  285 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 384  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  385 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 19992135 - 19992372
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19992135 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaacagccctaagc 19992234  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992235 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 19992334  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992335 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 19992372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21812501 - 21812264
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21812501 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaagc 21812402  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812401 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 21812302  T
Q  374 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21812301 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttcca 21812264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24024589 - 24024352
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag- 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |     
T  24024589 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc-tatga 24024491  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaa-caccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24024490 ctagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 24024392  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024391 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 24024352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 12396735 - 12396970
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  12396735 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12396834  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12396835 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggt-aaagggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 12396931  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12396932 gccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctcca 12396970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 12406155 - 12406390
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  12406155 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 12406254  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12406255 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 12406351  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12406352 gccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctcca 12406390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31109844 - 31109609
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  31109844 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-c 31109746  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31109745 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaagg-aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 31109648  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31109647 gccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctcca 31109609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 4866553 - 4866789
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  4866553 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagac 4866652  T
Q  274 tagtgtatagc-aaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4866653 tagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 4866749  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866750 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 4866789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 411
Target Start/End: Original strand, 2057763 - 2058024
Alignment:
Q  152 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  2057763 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaa 2057859  T
Q  252 acaacaac--aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagc----ataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaa 344  Q
    ||||||||  |||| ||||||  || || || ||||||||||||||||||| || | ||||    | ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  2057860 acaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaagg-aagaacaaaa 2057958  T
Q  345 caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057959 caccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 2058024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20357837 - 20357585
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||    
T  20357837 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaac 20357742  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |   |||||||| |||||||| ||| |    
T  20357741 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaaataccaa 20357645  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20357644 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctcca 20357585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 16879894 - 16880132
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  16879894 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-ta 16879992  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16879993 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 16880089  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880090 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 16880132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 16884750 - 16884988
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  16884750 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-ta 16884848  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16884849 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 16884945  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884946 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 16884988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24261587 - 24261349
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  24261587 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-ta 24261489  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24261488 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 24261392  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261391 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 24261349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24266466 - 24266228
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  24266466 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-ta 24266368  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24266367 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 24266271  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266270 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 24266228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1533730 - 1533482
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |    
T  1533730 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagcaa-c 1533637  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaa-acaccga 350  Q
    |||||||||  |||||| |  |||||||| ||||| |||||| | |||  ||  |||||  ||||| |||| |   |||  ||||||||||| ||||| |    
T  1533636 aacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccacaaagagaa-tacaaagca--aacaatataagcaagaaa--gaaagaacaaacacaccaa 1533542  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1533541 t-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctcca 1533482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 18408764 - 18408822
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408764 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 18408822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 21639809 - 21639867
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639809 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 21639867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413698
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctcca 18413698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 21646007 - 21646065
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21646007 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctcca 21646065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983343
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 21983343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190046
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcca 9190046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284148
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 20284148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159862
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctcca 29159862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580449
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctcca 2580449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332488
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 33332488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516348
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctcca 46516348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091720
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctcca 49091720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848722
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctcca 44848722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647734
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctcca 2647734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185203
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctcca 9185203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617263
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctcca 28617263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35960875
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 35960875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 21645818 - 21645871
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  21645818 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 21645871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56006
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatct-ggggagagagcagccctcca 56006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263735
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggg--gagagcagctctcca 47263735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28807837 - 28807598
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807837 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagc 28807738  T
Q  274 tagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807737 tagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 28807638  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807637 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 28807598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 43592080 - 43592338
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43592080 tgttgtgaatccggttccaaagtcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaa 43592179  T
Q  253 caacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  43592180 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccga 43592278  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592279 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 43592338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37556887 - 37556648
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||     
T  37556887 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-tat 37556789  T
Q  272 g-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 370  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556788 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 37556689  T
Q  371 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556688 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 37556648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37561709 - 37561470
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||     
T  37561709 tcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-tat 37561611  T
Q  272 g-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 370  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561610 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 37561511  T
Q  371 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561510 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 37561470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1457446 - 1457188
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1457446 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaa 1457347  T
Q  252 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  | || | |||||||||||||||    
T  1457346 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataa--gaaagaaaggaagaacaaaacaccg 1457249  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457248 ag-aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 1457188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 27444771 - 27445029
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  27444771 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27444870  T
Q  253 caacaaca-aacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  27444871 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccga 27444969  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444970 g-aagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctcca 27445029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 27449615 - 27449873
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  27449615 tgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaa 27449714  T
Q  253 caacaaca-aacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  27449715 caacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccga 27449813  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449814 g-aagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctcca 27449873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 43598525 - 43598783
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  43598525 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43598624  T
Q  253 caacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  43598625 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccga 43598723  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598724 g-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 43598783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 43604017 - 43604275
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  43604017 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43604116  T
Q  253 caacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  43604117 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccga 43604215  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604216 g-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 43604275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 43609509 - 43609767
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa 252  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  43609509 tgttgtgaatccggttccaaagtcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaa 43609608  T
Q  253 caacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  43609609 caacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccga 43609707  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609708 g-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 43609767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 2785197 - 2785434
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  2785197 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 2785295  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaagg-aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785296 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagt 2785392  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785393 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 2785434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31397256 - 31397019
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaag 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||||    
T  31397256 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcctaag 31397157  T
Q  273 c-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397156 cctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 31397059  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397058 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 31397019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31402113 - 31401876
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  31402113 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 31402015  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31402014 gcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagt 31401918  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31401917 tcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctcca 31401876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 411
Target Start/End: Original strand, 33791158 - 33791375
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaacc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  33791158 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaacc 33791256  T
Q  291 acacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaagg-aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 389  Q
    ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33791257 acatatagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 33791353  T
Q  390 tgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  33791354 tgggggaaagagcagctctcca 33791375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 411
Target Start/End: Original strand, 30631227 - 30631465
Alignment:
Q  171 aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccct 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30631227 aaactcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccct 30631325  T
Q  270 aagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaa-aaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 367  Q
    |  |||||||||||||||| |||| | | || |||| |||||||||||||||||   |||| || | |||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  30631326 agactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataa---gtaagaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgactca 30631421  T
Q  368 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631422 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 30631465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 15044512 - 15044745
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||  |    
T  15044512 tcacaccaatgaaata--caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagac 15044609  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15044610 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaagg-aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttca 15044706  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15044707 gccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctcca 15044745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 411
Target Start/End: Original strand, 33768021 - 33768238
Alignment:
Q  193 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaacc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  33768021 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaacc 33768119  T
Q  291 acacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 389  Q
    ||| | ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33768120 acatatagagctaacaagcata--caggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatc 33768216  T
Q  390 tgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  33768217 tgggggggagagcagctctcca 33768238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 274 - 411
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180273
Alignment:
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataa--gaaagaaagaaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttca 31180234  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180235 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 31180273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 38192174 - 38192232
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192174 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 38192232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 38219399 - 38219457
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219399 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 38219457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 24135849 - 24135907
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24135849 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatcca 24135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387721
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 35387721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353370
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 9353370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932388
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 36932388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 31180079 - 31180142
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtg 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31180079 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--taacaatgatgtgtggagcaagagatagtg 31180142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17004001
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctct 408  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctct 17004001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281810
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctcca 10281810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464591
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctcca 15464591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11917010
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 11917010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832318
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 28832318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 38191983 - 38192036
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  38191983 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 38192036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 38219208 - 38219261
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  38219208 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 38219261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127454
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagc 405  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagc 42127454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 408
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520286
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctct 408  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctct 14520286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 357 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410246
Alignment:
Q  357 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctcca 4410246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  357 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 410  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 35387474 - 35387527
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  35387474 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 35387527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880358
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctcca 3880358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084213
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctcca 12084213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300634
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctcca 31300634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 151 - 411
Target Start/End: Original strand, 6311097 - 6311356
Alignment:
Q  151 ttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagca 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6311097 ttctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagca 6311196  T
Q  251 aacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacacc 348  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||    
T  6311197 aacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacacc 6311294  T
Q  349 gagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311295 gag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 6311356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39785086 - 39784848
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 272  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  39785086 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaag 39784987  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784986 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 39784888  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784887 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 39784848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 153 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7290211 - 7289952
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttg-aaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa 251  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  7290211 ctgttgtgaatccggttccaaactcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaa 7290112  T
Q  252 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  7290111 acaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaagg-aagaacaaaacaccg 7290013  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290012 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 7289952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25328540 - 25328304
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 272  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||     
T  25328540 tcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaa- 25328442  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaag-cataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25328441 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 25328344  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328343 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 25328304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 35745213 - 35745450
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  35745213 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 35745311  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaagg-aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745312 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagt 35745408  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745409 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 35745450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 38613611 - 38613757
Alignment:
Q  8 catcatcatcatctctggtcccaggtttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613611 catcatcatcttctctggtcccagctttcaaaattatgagtaattttaaacttgatactcattgtaatctccgttttcacctgcagggtcttaaatacat 38613710  T
Q  108 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatctgctgaattttgcttct 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38613711 tgcacaaacaccgttgccaaggtttgaatcagctcgattttgcttct 38613757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4760366 - 4760113
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |    
T  4760366 tgttgtgaatccggttgaaactcacatcaatgaaa--aacaaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagcaa-c 4760271  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  | || | |||||||||||| | |    
T  4760270 aacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacatcaa 4760173  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4760172 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctcca 4760113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 36979184 - 36979436
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagca--a 251  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||  |    
T  36979184 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaaca 36979280  T
Q  252 acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||  |  | || | |||||||||||||| |    
T  36979281 acaacaa-aaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccaa 36979376  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979377 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 36979436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 30655448 - 30655705
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa-- 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||      
T  30655448 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaaca 30655543  T
Q  252 acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaa--aggaaagaacaaaacacc 348  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |   |||  | |||  || ||||||||    
T  30655544 acaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacacc 30655643  T
Q  349 gagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655644 aag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 30655705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10684528 - 10684290
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  10684528 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-ta 10684430  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10684429 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 10684333  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684332 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 10684290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10689442 - 10689181
Alignment:
Q  145 ttttgcttctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttc 244  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| |||    
T  10689442 ttttgattgtgttgtgttttcggttgaaactcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttc 10689346  T
Q  245 caagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaa-aaggaaagaac 340  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||   |||| || | ||||||    
T  10689345 caagcaa-caacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataa---gtaagaaaggaagaac 10689251  T
Q  341 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689250 aaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 10689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33038063 - 33037844
Alignment:
Q  190 aaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa--acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  33038063 aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaa 33037965  T
Q  288 accacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggccta 386  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |   |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037964 accacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaag--aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggccta 33037869  T
Q  387 atctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33037868 atctgggggagagagcagctctcca 33037844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18853457 - 18853206
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  18853457 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaacgaaacaaa----gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaac 18853363  T
Q  254 aacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    ||||| ||| |  ||||||  || || || ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |   ||| |  |||||||||||||| |    
T  18853362 aacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccaa 18853266  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853265 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 18853206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18870849 - 18870600
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||    
T  18870849 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaac 18870754  T
Q  254 aacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagc 352  Q
    ||||| |||| ||||||  || || || ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |   ||| |  |||||||||||||| ||     
T  18870753 aacaaaaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccaag- 18870659  T
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870658 aagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 18870600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287960
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 26287960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301217
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 26301217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313211
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 26313211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261992
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 1261992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403268
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 26403268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765857
Alignment:
Q  355 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 9765857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696634
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 4696634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456087
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 4456087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071267
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 31071267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412400
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 7412400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175792
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctcca 19175792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702529
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 403  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagca 5702529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752432
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctcca 19752432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799615
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctcca 23799615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127280
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctcca 6127280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 35323 - 35088
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  35323 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 35224  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35223 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttaacccagttca 35127  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35126 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 35088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22173456 - 22173221
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  22173456 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 22173357  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22173356 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 22173260  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173259 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 22173221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 18656256 - 18656494
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18656256 tcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagc 18656354  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaa----caccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    ||| || |||||||||||||||||    
T  18656355 tagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaa-ggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccag 18656451  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656452 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 18656494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 411
Target Start/End: Original strand, 7167049 - 7167303
Alignment:
Q  152 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||| |    
T  7167049 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-a 7167144  T
Q  252 acaacaac-aaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||     
T  7167145 acaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacacca 7167242  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167243 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 7167303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2677351 - 2677113
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  2677351 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 2677253  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggt-aaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2677252 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagt 2677155  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677154 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 2677113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2673195 - 2672957
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  2673195 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 2673097  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggt-aaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2673096 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagt 2672999  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672998 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 2672957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 8512037 - 8512276
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  8512037 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 8512135  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa-cggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    || || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512136 gcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 8512233  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512234 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 8512276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 8516917 - 8517156
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  8516917 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 8517015  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa-cggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    || || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517016 gcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 8517113  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517114 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 8517156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 175 - 401
Target Start/End: Original strand, 10207755 - 10207983
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  10207755 tcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 10207853  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggt-aaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10207854 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagt 10207951  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagag 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207952 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2671876 - 2671624
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||  |||||||||||    
T  2671876 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaac 2671781  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |  | || | |||||||||||||| |    
T  2671780 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccaa 2671684  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671683 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 2671624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28504145 - 28503902
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  28504145 tgttgtgaatccggtcttaactcacaccaatgaat--aacaatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaa-c 28504050  T
Q  254 aacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag 351  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||          ||||| |||||||||||||||||    
T  28504049 aacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag----------aaagg-aagaacaaaacaccgag 28503961  T
Q  352 caagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28503960 -aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctcca 28503902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 201 - 411
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968166
Alignment:
Q  201 tgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaag 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  299 agctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggag 397  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  24968056 agctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggag 24968152  T
Q  398 agagcagctctcca 411  Q
    |||| |||||||||    
T  24968153 agagtagctctcca 24968166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 32475306 - 32475544
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| ||    
T  32475306 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcc-ta 32475404  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32475405 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 32475501  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475502 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 32475544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 32480163 - 32480402
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa--caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccct 269  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |    
T  32480163 tcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcc-t 32480261  T
Q  270 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 367  Q
    |||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32480262 aagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgaccca 32480358  T
Q  368 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480359 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 32480402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8739354 - 8739101
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||     
T  8739354 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 8739259  T
Q  254 aacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    ||||||||| |  ||||||  || || || | ||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||     
T  8739258 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacacca 8739162  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739161 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 8739101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9091592 - 9091339
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||     
T  9091592 tgttgtgaattcggttgagactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaat 9091497  T
Q  254 aacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    ||||||||| |  ||||||  || || || | ||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |   ||| |  ||||||||||||||     
T  9091496 aacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacacca 9091400  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091399 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 9091339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 335 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372833
Alignment:
Q  335 aagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 40372833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 333 - 411
Target Start/End: Original strand, 8477343 - 8477421
Alignment:
Q  333 gaaagaacaaa-acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477343 gaaagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 8477421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306007
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctcca 1306007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928629
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctcca 26928629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40373085 - 40372981
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  40373085 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatga---aaacaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 40372990  T
Q  254 aacaacaaa 262  Q
    |||| ||||    
T  40372989 aacatcaaa 40372981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370514
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 8370514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974980
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 27974980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986474
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 27986474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 409
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711280
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctc 409  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctc 21711280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552911
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 18552911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264409
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 16264409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795840
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 25795840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709818
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 30709818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143380
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 32143380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386694
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 33386694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029152
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctcca 36029152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417526
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 403  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 1417526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736333
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 1736333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3716030
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctcca 3716030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592810
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctcca 40592810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453017
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctcca 27453017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923940
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagc 405  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagc 47923940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794741
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 6794741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299047
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctcca 26299047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466350
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctcca 37466350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438273
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 48438273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328390
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttca-gccaatatggcctaatctgggggagagagcagc 405  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagc 3328390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Original strand, 8477170 - 8477242
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggt-tgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaa 227  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8477170 ctgttgtgaatccggtataaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaa 8477242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 400
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9902 - 9668
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9902 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaag 9803  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9802 ctagtatatagcaaaaccacac-aagagctaacaagcataaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 9707  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 9668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 3
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 272  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  143 tcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaag 50  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  49 ctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44312885 - 44312650
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  44312885 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagac 44312786  T
Q  274 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 372  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44312785 aagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaagg-aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 44312689  T
Q  373 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312688 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 44312650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39812250 - 39812014
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 272  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39812250 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaag 39812151  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 371  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39812150 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgaaccagttc 39812054  T
Q  372 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812053 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 39812014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 19344243 - 19344480
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 272  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  19344243 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taag 19344341  T
Q  273 c-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 370  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344342 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 19344439  T
Q  371 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19344440 cagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctcca 19344480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 19349101 - 19349338
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 272  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  19349101 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taag 19349199  T
Q  273 c-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 370  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349200 cctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 19349297  T
Q  371 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19349298 cagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctcca 19349338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Original strand, 32246607 - 32246847
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||      
T  32246607 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctaga 32246706  T
Q  273 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataa--acggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||  | |  |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  32246707 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgt 32246805  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246806 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 32246847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11099219 - 11098965
Alignment:
Q  152 tctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagca- 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||||     
T  11099219 tctgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatgaa--aaacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaa 11099123  T
Q  251 -aacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacacc 348  Q
     |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||  || | || | ||||||||||||||    
T  11099122 caacaacaa-aaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataa--ggaagaaaggaagaacaaaacacc 11099027  T
Q  349 gagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11099026 aag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 11098965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Original strand, 14291295 - 14291547
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  14291295 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaac 14291390  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||  ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |  | || | |||||||||||||| |    
T  14291391 aacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataa--gcaagaaaggaagaacaaaacaccaa 14291487  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291488 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 14291547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9296691 - 9296439
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9296691 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaac 9296596  T
Q  254 aacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccga 350  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||| |  | || | |||||||||||||| |    
T  9296595 aacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaag--aaaagcaagaaaggaagaacaaaacaccaa 9296499  T
Q  351 gcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9296498 g-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctcca 9296439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491809
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 3491809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 25398496 - 25398554
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398496 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 25398554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 25403634 - 25403692
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403634 aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 25403692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040119
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 8040119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738901
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctcca 40738901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445482
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 10445482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569387
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 13569387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699045
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctcca 14699045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630002
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatct-ggggagagagcagctctcca 21630002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682372
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctcca 34682372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259215
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcca 28259215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 403
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865254
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagca 403  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagca 17865254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 403
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522271
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 403  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagca 20522271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 25403443 - 25403496
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  25403443 tgttgtgaatccggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 25403496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388917
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctcca 34388917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390188
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctcca 8390188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345580
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 410  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctcc 1345580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056103
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctcca 31056103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707290
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctcca 10707290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 25398305 - 25398358
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  25398305 tgttgtgaatctggttgaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 25398358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 404
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39482983
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcag 404  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcag 39482983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039709
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctc 409  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctc 42039709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838076
Alignment:
Q  356 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagca 403  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagca 2838076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 383 - 411
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407681
Alignment:
Q  383 cctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctcca 25407681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118195
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctcca 33118195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19428 - 19191
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  19428 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 19330  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19329 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagt 19233  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19232 tcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 19191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14573 - 14335
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  14573 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-ta 14475  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14474 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 14378  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14377 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 14335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 149219 - 148982
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  149219 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 149121  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  149120 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagt 149024  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  149023 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctcca 148982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2514 - 2277
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 271  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  2514 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taa 2416  T
Q  272 gc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 369  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2415 gcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagt 2319  T
Q  370 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2318 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctcca 2277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 182228 - 181990
Alignment:
Q  175 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcccta 270  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||    
T  182228 tcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc-ta 182130  T
Q  271 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 368  Q
    ||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  182129 agcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 182033  T
Q  369 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182032 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcca 181990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 153 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 300
Alignment:
Q  153 ctgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagca-- 250  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||      
T  528 ctgttgtgaatccatttaaaactcacaccaatgaaa---acaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaac 432  T
Q  251 aacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaa-caagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 349  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||  | || || ||||||||||||||||     
T  431 aacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataa--gctagaaagaaagaacaaaacacca 335  T
Q  350 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 385  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  334 ag-aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34211 - 34132
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34211 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17990
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18048 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 17990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 24083
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 24083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24331 - 24278
Alignment:
Q  154 tgttgtgattccggttgaaactcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaa 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  24331 tgttgtgaatccggttaaaactcacaccaatg---taaacaaagatgtgtggagcaa 24278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13233
Alignment:
Q  175 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13171 tcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8457
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 8457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85742
Alignment:
Q  354 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctcca 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 405
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5736
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagc 405  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 5736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2551
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctcca 2551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133318
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctcca 133318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10788
Alignment:
Q  352 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctcca 10788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45312
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcca 45312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43999
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 411  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctcca 43999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36874
Alignment:
Q  353 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctc 407  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctc 36874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University