View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF16557_low_19 (Length: 355)

Name: NF16557_low_19
Description: NF16557
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF16557_low_19
NF16557_low_19
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (11-263)||(25175563-25175815)
chr6 (11-263)||(27653983-27654235)
chr6 (11-263)||(16825752-16826006)
chr6 (22-349)||(23153458-23153786)
chr6 (15-348)||(14626045-14626377)
chr6 (15-350)||(1650020-1650352)
chr6 (22-275)||(1657748-1657999)
chr6 (11-275)||(35009439-35009702)
chr6 (22-275)||(15862484-15862734)
chr6 (280-349)||(23148266-23148335)
chr6 (79-275)||(29665941-29666137)
chr6 (190-275)||(27751603-27751688)
chr6 (175-259)||(29605612-29605696)
chr6 (317-355)||(19983186-19983224)
chr6 (317-355)||(35015051-35015089)
chr6 (317-349)||(18002395-18002427)
chr6 (317-349)||(23995247-23995279)
chr6 (317-349)||(26090059-26090091)
chr6 (317-348)||(4991396-4991427)
chr6 (177-259)||(18629608-18629691)
chr6 (319-349)||(15742120-15742150)
chr6 (175-257)||(17083200-17083282)
chr6 (317-355)||(18583640-18583678)
chr6 (317-349)||(1657661-1657693)
chr6 (317-349)||(15862789-15862821)
chr6 (218-258)||(18399144-18399184)
chr6 (317-349)||(18823283-18823315)
chr6 (317-349)||(18839138-18839170)
chr6 (317-349)||(27751742-27751774)
chr6 (317-349)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (11-263)||(25426628-25426880)
chr5 (11-263)||(12374-12626)
chr5 (11-263)||(19499899-19500151)
chr5 (11-263)||(22366481-22366733)
chr5 (11-260)||(18777995-18778244)
chr5 (11-263)||(21073595-21073847)
chr5 (11-349)||(23506965-23507302)
chr5 (11-260)||(43443398-43443647)
chr5 (11-349)||(27182471-27182810)
chr5 (11-263)||(4199985-4200237)
chr5 (11-259)||(27009841-27010089)
chr5 (11-349)||(22053753-22054096)
chr5 (11-349)||(18530988-18531330)
chr5 (63-263)||(29188284-29188483)
chr5 (22-275)||(34939289-34939540)
chr5 (128-275)||(20623085-20623232)
chr5 (128-275)||(21233528-21233675)
chr5 (129-273)||(25900408-25900552)
chr5 (128-275)||(16536313-16536460)
chr5 (128-275)||(37052860-37053007)
chr5 (175-259)||(29918127-29918212)
chr5 (179-268)||(32950862-32950951)
chr5 (317-349)||(16105967-16105999)
chr5 (317-349)||(20623286-20623318)
chr5 (317-349)||(21233442-21233474)
chr5 (317-349)||(25900320-25900352)
chr5 (15-55)||(29190482-29190522)
chr5 (317-349)||(37053061-37053093)
chr5 (177-259)||(21310709-21310792)
chr5 (177-258)||(5450844-5450926)
chr5 (11-52)||(17471803-17471844)
chr5 (317-349)||(108728-108760)
chr5 (317-349)||(9730278-9730310)
chr5 (317-349)||(16536514-16536546)
chr5 (218-258)||(16595713-16595753)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (11-263)||(19886661-19886913)
chr2 (16-349)||(462743-463075)
chr2 (11-349)||(8891242-8891581)
chr2 (11-355)||(20627232-20627576)
chr2 (11-355)||(19794623-19794967)
chr2 (11-349)||(36982364-36982704)
chr2 (11-275)||(17396653-17396916)
chr2 (11-355)||(43642875-43643220)
chr2 (11-349)||(24341309-24341652)
chr2 (11-275)||(25265390-25265653)
chr2 (11-225)||(7507894-7508107)
chr2 (128-275)||(19689401-19689548)
chr2 (128-275)||(23820187-23820334)
chr2 (128-275)||(14906440-14906587)
chr2 (253-349)||(22863169-22863267)
chr2 (128-275)||(20015127-20015274)
chr2 (317-355)||(22284278-22284316)
chr2 (177-258)||(68156-68238)
chr2 (317-355)||(22275045-22275083)
chr2 (318-355)||(15633538-15633575)
chr2 (317-350)||(19689314-19689347)
chr2 (317-349)||(9652796-9652828)
chr2 (317-349)||(14906354-14906386)
chr2 (317-349)||(23820388-23820420)
chr2 (317-348)||(25213372-25213403)
chr2 (177-258)||(22775206-22775288)
chr2 (177-258)||(22780584-22780666)
chr2 (317-349)||(7507757-7507789)
chr2 (317-349)||(17396567-17396599)
chr2 (317-349)||(20015328-20015360)
chr2 (317-349)||(28031134-28031166)
chr2 (283-349)||(31146073-31146138)
chr2 (317-349)||(33128372-33128404)
chr2 (179-258)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (13-349)||(3508-3843)
scaffold0266 (11-349)||(1124-1462)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (11-263)||(47357654-47357906)
chr4 (11-349)||(13246430-13246769)
chr4 (11-355)||(54118162-54118507)
chr4 (11-259)||(10644219-10644467)
chr4 (111-349)||(121989-122226)
chr4 (19-275)||(13048221-13048477)
chr4 (11-349)||(15675009-15675352)
chr4 (79-349)||(10104170-10104445)
chr4 (11-275)||(26680201-26680463)
chr4 (11-248)||(31115629-31115865)
chr4 (128-275)||(10488678-10488825)
chr4 (128-275)||(16327926-16328073)
chr4 (212-349)||(33240900-33241043)
chr4 (11-108)||(111395-111492)
chr4 (243-349)||(31132545-31132657)
chr4 (79-259)||(40885570-40885749)
chr4 (177-258)||(15044992-15045074)
chr4 (11-55)||(10104450-10104494)
chr4 (317-349)||(14952085-14952117)
chr4 (317-349)||(15135907-15135939)
chr4 (317-349)||(15272211-15272243)
chr4 (317-349)||(16327840-16327872)
chr4 (317-349)||(16609013-16609045)
chr4 (317-349)||(26680517-26680549)
chr4 (317-355)||(5682422-5682460)
chr4 (177-258)||(15109350-15109432)
chr4 (317-355)||(25119101-25119139)
chr4 (317-349)||(8045272-8045304)
chr4 (317-349)||(16523146-16523178)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (11-349)||(14842487-14842824)
chr3 (11-263)||(55316219-55316471)
chr3 (11-263)||(41270075-41270327)
chr3 (11-349)||(2049810-2050147)
chr3 (11-349)||(12030073-12030410)
chr3 (22-349)||(13838905-13839232)
chr3 (11-238)||(16821139-16821366)
chr3 (11-275)||(13975722-13975985)
chr3 (11-312)||(15858986-15859287)
chr3 (11-275)||(45860805-45861068)
chr3 (10-285)||(51158008-51158282)
chr3 (11-275)||(13954890-13955153)
chr3 (11-268)||(15936634-15936890)
chr3 (11-355)||(16744035-16744377)
chr3 (14-268)||(15938476-15938729)
chr3 (15-350)||(15614838-15615170)
chr3 (11-275)||(17912483-17912744)
chr3 (212-355)||(19231981-19232127)
chr3 (229-349)||(19260749-19260869)
chr3 (128-275)||(2449238-2449385)
chr3 (317-355)||(17955878-17955916)
chr3 (314-355)||(15857157-15857198)
chr3 (11-124)||(47984650-47984763)
chr3 (11-124)||(47993937-47994050)
chr3 (11-124)||(48003224-48003337)
chr3 (11-124)||(48012510-48012623)
chr3 (317-355)||(2844514-2844552)
chr3 (317-355)||(3992873-3992911)
chr3 (317-355)||(54038018-54038056)
chr3 (317-355)||(55513193-55513231)
chr3 (179-268)||(11986173-11986262)
chr3 (218-259)||(14080715-14080756)
chr3 (11-52)||(15468555-15468596)
chr3 (317-349)||(2449152-2449184)
chr3 (175-259)||(4145814-4145898)
chr3 (317-349)||(16261777-16261809)
chr3 (317-349)||(16933869-16933901)
chr3 (317-349)||(17912398-17912430)
chr3 (317-349)||(23492696-23492728)
chr3 (317-349)||(38168237-38168269)
chr3 (317-349)||(53771365-53771397)
chr3 (317-355)||(7854305-7854343)
chr3 (177-258)||(30207380-30207462)
chr3 (175-259)||(6228625-6228710)
chr3 (11-52)||(22275209-22275250)
chr3 (317-349)||(11986080-11986112)
chr3 (317-349)||(13954804-13954836)
chr3 (218-258)||(14059214-14059254)
chr3 (317-349)||(14285289-14285321)
chr3 (317-349)||(19947026-19947058)
chr3 (317-349)||(30153265-30153297)
chr3 (317-349)||(33342204-33342236)
chr3 (317-349)||(45861122-45861154)
chr3 (317-349)||(51961031-51961063)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (11-355)||(41394222-41394565)
chr1 (11-349)||(20931345-20931682)
chr1 (11-349)||(20913037-20913367)
chr1 (11-263)||(5072388-5072640)
chr1 (11-263)||(18601118-18601370)
chr1 (11-349)||(20893551-20893889)
chr1 (11-349)||(37844374-37844714)
chr1 (11-349)||(20445679-20446019)
chr1 (11-349)||(20531444-20531783)
chr1 (11-348)||(22227809-22228146)
chr1 (11-348)||(22232506-22232843)
chr1 (15-263)||(2116258-2116506)
chr1 (77-350)||(45051489-45051759)
chr1 (128-275)||(51452608-51452755)
chr1 (317-355)||(21860334-21860372)
chr1 (317-355)||(44034865-44034903)
chr1 (317-348)||(15861327-15861358)
chr1 (283-355)||(27675086-27675156)
chr1 (218-258)||(16646118-16646158)
chr1 (15-55)||(45051446-45051486)
chr1 (317-349)||(51452809-51452841)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (11-349)||(48598-48935)
scaffold0023 (11-238)||(36093-36320)
scaffold0023 (317-349)||(61122-61154)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (11-263)||(10989410-10989661)
chr7 (11-264)||(2437457-2437710)
chr7 (13-349)||(16211768-16212103)
chr7 (11-355)||(3059966-3060309)
chr7 (11-349)||(13036938-13037277)
chr7 (11-263)||(13911024-13911277)
chr7 (16-349)||(11580661-11580997)
chr7 (11-349)||(36052667-36053003)
chr7 (11-259)||(13572676-13572924)
chr7 (11-268)||(18253842-18254098)
chr7 (17-275)||(25292338-25292595)
chr7 (11-275)||(47481031-47481294)
chr7 (11-238)||(16478987-16479213)
chr7 (11-275)||(7293017-7293279)
chr7 (11-274)||(13321014-13321278)
chr7 (128-275)||(11516343-11516490)
chr7 (128-275)||(15441564-15441711)
chr7 (128-275)||(30262129-30262276)
chr7 (154-347)||(295893-296087)
chr7 (243-349)||(36024372-36024485)
chr7 (317-355)||(126738-126776)
chr7 (177-258)||(13377693-13377775)
chr7 (317-355)||(32493940-32493978)
chr7 (317-349)||(2029244-2029276)
chr7 (317-349)||(7293333-7293365)
chr7 (317-349)||(11516544-11516576)
chr7 (317-349)||(14113903-14113935)
chr7 (317-349)||(15441478-15441510)
chr7 (280-349)||(15709428-15709501)
chr7 (317-349)||(30262043-30262075)
chr7 (317-349)||(42056188-42056220)
chr7 (177-259)||(16914928-16915011)
chr7 (317-355)||(111163-111201)
chr7 (317-355)||(1936911-1936949)
chr7 (318-355)||(7283950-7283987)
chr7 (317-349)||(371417-371449)
chr7 (317-349)||(3049905-3049937)
chr7 (317-349)||(13321334-13321366)
chr7 (243-275)||(14113989-14114021)
chr7 (243-275)||(14423639-14423671)
chr7 (317-345)||(15516765-15516793)
chr7 (317-349)||(25124450-25124482)
chr7 (317-349)||(47480944-47480976)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (10-349)||(16193643-16193980)
chr8 (11-263)||(30120722-30120974)
chr8 (11-349)||(43373392-43373731)
chr8 (11-201)||(222753-222943)
chr8 (11-201)||(736376-736566)
chr8 (11-201)||(860271-860461)
chr8 (11-263)||(16674392-16674644)
chr8 (22-349)||(24928716-24929043)
chr8 (11-259)||(21844576-21844824)
chr8 (11-259)||(21851969-21852217)
chr8 (11-355)||(16404894-16405235)
chr8 (15-263)||(6774258-6774505)
chr8 (15-263)||(24548986-24549233)
chr8 (11-275)||(22907214-22907476)
chr8 (22-275)||(17345581-17345832)
chr8 (128-275)||(5238203-5238350)
chr8 (128-275)||(24661248-24661395)
chr8 (128-275)||(43685662-43685809)
chr8 (139-201)||(691908-691970)
chr8 (317-355)||(24716756-24716794)
chr8 (317-355)||(274766-274804)
chr8 (317-355)||(641045-641083)
chr8 (317-355)||(826851-826889)
chr8 (317-349)||(5238404-5238436)
chr8 (317-349)||(22907128-22907160)
chr8 (317-349)||(24385652-24385684)
chr8 (317-349)||(24661162-24661194)
chr8 (317-349)||(43685863-43685895)
chr8 (177-259)||(26011658-26011741)
chr8 (317-349)||(2545265-2545297)
chr8 (317-349)||(3431176-3431208)
chr8 (317-349)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (11-349)||(5990-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (11-349)||(882-1218)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (11-349)||(8878-9215)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (11-349)||(12115-12450)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (22-349)||(171916-172242)
scaffold0001 (22-349)||(177619-177945)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (11-238)||(42997-43224)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (15-349)||(41733-42066)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (11-350)||(36836-37176)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (22-349)||(247366-247694)
scaffold0012 (317-349)||(34075-34107)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (11-346)||(19206-19543)
scaffold0195 (11-275)||(21290-21553)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (11-349)||(26340-26678)
scaffold0162 (128-275)||(8180-8327)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (11-349)||(128095-128431)
scaffold0008 (11-238)||(31700-31928)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (11-339)||(4996-5324)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-349)||(123087-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (35-268)||(5552-5785)
scaffold0772 (317-349)||(5846-5878)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-259)||(35-283)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-349)||(272031-272362)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (11-268)||(48187-48443)
scaffold0049 (318-355)||(20493-20530)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (11-259)||(64527-64780)
scaffold0026 (11-268)||(107747-108003)
scaffold0026 (218-260)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (129-347)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (11-264)||(21115-21367)
scaffold0139 (11-238)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (11-301)||(148721-149012)
scaffold0025 (11-349)||(8849-9192)
scaffold0025 (249-349)||(146838-146938)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-225)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (11-225)||(3722-3936)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (129-349)||(89378-89600)
scaffold0028 (224-349)||(107708-107835)
scaffold0028 (317-348)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (15-238)||(9374-9596)
scaffold0215 (15-238)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (117-263)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (11-275)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (11-275)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (11-275)||(37066-37328)
scaffold0078 (317-349)||(36980-37012)
scaffold0078 (317-355)||(41632-41670)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (11-275)||(41648-41911)
scaffold0125 (309-349)||(41957-41997)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (15-264)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (11-275)||(13506-13769)
scaffold0132 (317-349)||(13824-13856)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (11-117)||(9-115)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (11-117)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (107-263)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (128-275)||(26911-27058)
scaffold0141 (128-268)||(22656-22796)
scaffold0141 (317-349)||(22857-22889)
scaffold0141 (317-349)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (128-275)||(1582-1729)
scaffold0124 (317-349)||(1496-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (11-108)||(9382-9479)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (182-275)||(3360-3453)
scaffold0361 (13-67)||(3210-3264)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (317-355)||(80187-80225)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (179-268)||(56106-56195)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (177-259)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (177-258)||(2317-2399)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (317-350)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (317-349)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (317-349)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (317-349)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (317-349)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (317-349)||(57392-57424)
scaffold0058 (218-259)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (317-349)||(55904-55936)
scaffold0032 (317-349)||(108075-108107)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (316-355)||(346-385)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (306-349)||(18015-18058)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (316-355)||(162072-162111)
scaffold0016 (316-355)||(166158-166197)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (317-355)||(5771-5809)
scaffold0686 (317-355)||(5977-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (317-355)||(31174-31212)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (179-225)||(45198-45244)
scaffold0066 (317-349)||(45338-45370)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (318-355)||(1701-1738)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (318-355)||(94-131)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (218-259)||(1546-1587)
scaffold0456 (218-259)||(8691-8732)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (318-355)||(4-41)
scaffold0310 (318-355)||(6298-6335)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (318-355)||(19844-19881)
scaffold0122 (318-355)||(24148-24185)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (218-258)||(8011-8051)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (317-349)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (317-349)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (317-349)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (317-349)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (317-349)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (317-349)||(34308-34340)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (218-258)||(3525-3565)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (317-349)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 208  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  209 taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153786
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 23153756  T
Q  320 attatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23153757 attatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626045
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatttgtaaagtga 14626079  T
Q  315 tgatgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
     ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626078 agatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650020
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 1650056  T
Q  314 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 350  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650055 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 349
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  280 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 275
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  79 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  178 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  190 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  175 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983186
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 19983186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015051
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 35015051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995279
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 348
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18629691 - 18629608
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  18629691 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 18629608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742120
Alignment:
Q  319 gattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17083282 - 17083200
Alignment:
Q  175 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaat 257  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||    
T  17083282 tatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat 17083200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583678
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 18583678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657661
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 1657661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862821
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 18399144 - 18399184
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18399144 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 18399184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823283
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18823283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839138
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18839138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751774
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 27751774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276659
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 32276659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18777995
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507302
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaatcttacaaa 23507263  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507264 atggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443398
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182471
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 27182512  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27182511 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4199985
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010089
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053753
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaatttca 22053798  T
Q  309 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053797 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18530988
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaaattgca 18531032  T
Q  309 aaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531031 aaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  63 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 162  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  163 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagc 262  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  129 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 228  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  229 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 273  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  175 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105999
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 55  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21310792 - 21310709
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  21310792 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5450926 - 5450844
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  5450926 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 5450844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 52  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108728
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 108728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730278
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 9730278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536546
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatctta 16536546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 16595713 - 16595753
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16595713 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16595753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463075
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  116 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 215  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  216 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 315  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgat 463041  T
Q  316 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463042 gatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891581
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 8891540  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8891541 aaatgatgatgattatgataaagactaacccctttacctta 8891581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627232
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaa 309  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaattttacaa 20627278  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20627277 aatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatc 20627232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794623
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttaca 19794670  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19794669 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc 19794623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982364
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 307  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 36982406  T
Q  308 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982405 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642875
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 43642922  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43642921 aaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatc 43642875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341309
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 24341354  T
Q  309 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341353 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
Q  110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  210 aacatcaattcatgca 225  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 349
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863267
Alignment:
Q  253 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284316
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 22284316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275083
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatc 22275083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633575
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatc 15633575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652796
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 348
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22775288 - 22775206
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22775288 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22775206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22780666 - 22780584
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22780666 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 22780584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507757
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 7507757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396567
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 17396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015360
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttacctta 20015360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031134
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 28031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146073
Alignment:
Q  283 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttacctta 31146073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128404
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 33128404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 258
Target Start/End: Original strand, 43646059 - 43646139
Alignment:
Q  179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  43646059 aacatgaaatttcaccaacaacaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaatt 43646139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3508
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  113 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 212  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  213 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaat 3545  T
Q  313 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3544 gaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1462
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 309  Q
      |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 1422  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1423 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246769
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13246728  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246729 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118162
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 54118209  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54118208 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc 54118162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644467
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 111 - 349
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122226
Alignment:
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 122187  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  122188 atgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  19 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  119 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 218  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  219 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675009
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgca 15675054  T
Q  309 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675053 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104170
Alignment:
Q  79 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 178  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--ta 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  277 atcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
       ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg 248  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33241043
Alignment:
Q  212 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaa 33240999  T
Q  310 a----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33241000 aaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 349
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  243 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  337 cccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
Q  79 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  178 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 55  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952117
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135907
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272211
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682422
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatc 5682422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15109432 - 15109350
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  15109432 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaatt 15109350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119101
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatc 25119101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045304
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 8045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523178
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16523178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842487
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 14842526  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842525 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050147
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaatttcacaaa 2050108  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050109 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030073
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaa 12030112  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12030111 atgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839232
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 320  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatga 13839203  T
Q  321 ttatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13839204 ttatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858986
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttaca 15858990  T
Q  309 aaat 312  Q
    ||||    
T  15858989 aaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  210 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 285  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744035
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
      ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 16744080  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16744079 atgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatc 16744035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  14 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  114 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 213  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  214 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615170
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatg 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | ||||||     
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatt 15615134  T
Q  314 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 350  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615135 a-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 355
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232127
Alignment:
Q  212 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-aca 308  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcaca 19232080  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19232081 aaatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatc 19232127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 229 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  229 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 328  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  329 aagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955878
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 17955878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857157
Alignment:
Q  314 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc 15857157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  111 taacaacaacttag 124  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844552
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 2844552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992911
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 3992911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54038018
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 54038018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513231
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 55513231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 52  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  175 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261809
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492728
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168269
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771397
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854343
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 7854343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 30207380 - 30207462
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30207380 tgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 30207462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6228710 - 6228625
Alignment:
Q  175 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| |||||| || |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  6228710 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 6228625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 52  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986080
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 11986080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954804
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 13954804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14059254 - 14059214
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14059254 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 14059214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285321
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 14285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947058
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153297
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342236
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861154
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 45861154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961031
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394565
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 41394520  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394521 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 41394565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931682
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20931643  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931644 atgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913367
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaa 20913328  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20913329 atgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601118
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||| ||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893551
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||      
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttaca 20893592  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20893591 aaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844374
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  210 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcac 37844416  T
Q  308 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844415 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20446019
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattt-ac 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcac 20445977  T
Q  308 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20445978 aaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531783
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcaca 20531742  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20531743 aaatgatgatgattatgataaagactaatttccttacctta 20531783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 348
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228146
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 309  Q
     |||||||||||||| |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||    
T  22228008 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22228107  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
    | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22228108 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22228146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 348
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232843
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 309  Q
     |||||||||||||| |  || |||||| || ||   ||||||||||||||||| |||  | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | ||    
T  22232705 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaa 22232804  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
    | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22232805 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 22232843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116506
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  114 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 213  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  214 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||| |||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 350
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051759
Alignment:
Q  77 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 176  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat- 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  || ||||||| |||||  |||  | |||     
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatc 45051687  T
Q  276 aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 350  Q
    || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45051688 aacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860372
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 21860372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034865
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 44034865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 355
Target Start/End: Original strand, 27675086 - 27675156
Alignment:
Q  283 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27675086 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--acgattatgataaattctaacccccttaccttaattatc 27675156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 16646118 - 16646158
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16646118 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 16646158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 55  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452841
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttacctta 51452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48935
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 48896  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48897 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61122
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 61122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437710
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212103
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 112  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  113 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 212  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  213 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaat 16212066  T
Q  313 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212067 gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060309
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaa 3060264  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3060265 atgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatc 3060309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036938
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||      
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 13036979  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13036978 aaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911024
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  111 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  210 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580661
Alignment:
Q  16 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  116 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 215  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  216 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaa 11580699  T
Q  312 tgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580698 tgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36053003
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36052962  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052963 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572924
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
Alignment:
Q  17 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  117 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 216  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  217 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
      || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  111 taacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 207  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  208 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca 274  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295893
Alignment:
Q  154 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcac 253  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || || |||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  254 gaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 347  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 349
Target Start/End: Original strand, 36024372 - 36024485
Alignment:
Q  243 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 336  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36024372 agttggagcacgaatttagaaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaa 36024471  T
Q  337 -cccccttacctta 349  Q
     |||||||||||||    
T  36024472 ccccccttacctta 36024485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126776
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 126776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493940
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 32493940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029276
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 349
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709501
Alignment:
Q  280 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctta 15709501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056188
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16915011 - 16914928
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  16915011 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 16914928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111163
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 111163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936911
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatc 1936911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283950
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 7283950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371449
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 371449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049937
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321366
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13321366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14114021 - 14113989
Alignment:
Q  243 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14114021 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14423671 - 14423639
Alignment:
Q  243 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14423671 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124482
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480944
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 47480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193643
Alignment:
Q  10 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  210 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatttacca 16193682  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16193681 aatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373392
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 43373433  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373432 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928716
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatga 320  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatga 24928745  T
Q  321 ttatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24928744 ttatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844576
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851969
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404894
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac- 16404941  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16404940 aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatc 16404894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  139 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716756
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 24716756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274804
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 274804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641045
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826851
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatc 826851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385652
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 26011658 - 26011741
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  26011658 tgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattt 26011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545297
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 2545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431176
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 3431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886686
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttacctta 22886686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 5990
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t 6228  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgcaaa 6029  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6028 gtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 882
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-t 1120  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatttgtaaa 921  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  920 gtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9215
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaa 9176  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9177 atgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12450
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
      |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12215 --acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaa 309  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttg-aaagttacaa 12410  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12411 aattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172242
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 321  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 172214  T
Q  322 tatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  172215 tatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177945
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 321  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 177917  T
Q  322 tatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  177918 tatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 349
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42066
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatga 42031  T
Q  315 tgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42032 tgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36836
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||      
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaatttcaca 36878  T
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36877 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247366
Alignment:
Q  22 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  122 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 221  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  222 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 319  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatg 247396  T
Q  320 attatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247395 attatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34075
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 346
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19543
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 19504  T
Q  308 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 346  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19505 aaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26340
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 309  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 26380  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26379 aatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128095
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-t 128333  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaa 128134  T
Q  311 atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128133 atgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  111 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  210 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 4996
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 309  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaa 5026  T
Q  310 aatgatgatgattatgataaagactaaccc 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5025 aatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123087
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttac- 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatttaca 123129  T
Q  308 aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  123128 aaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 268
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  35 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  135 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 234  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  235 aacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5878
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 35 - 283
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 349
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272362
Alignment:
Q  17 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  117 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 216  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  217 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatg 316  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatg 272329  T
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20530
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 20530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64527
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 64581  T
Q  211 acatc-----aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
     ||||     |||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||    
T  64580 tcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattta 260  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51110
Alignment:
Q  129 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 228  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  229 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 328  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 51129  T
Q  329 aagactaacccccttacct 347  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  51128 aagactaatctccttacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21115
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 264  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||| || |    |||||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataaca 238  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 301  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 349
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9192
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttaca 308  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaatacataccacatttgaaaaattgca 9147  T
Q  309 aa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9148 aaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttacctta 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 249 - 349
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146938
Alignment:
Q  249 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
Q  349 a 349  Q
    |    
T  146938 a 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  211 acatcaattcatgca 225  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  210 aacatcaattcatgca 225  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89378
Alignment:
Q  129 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 228  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  229 aaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatga 326  Q
    ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatga 89401  T
Q  327 taaagactaacccccttacctta 349  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  89400 tgaagactaacccccttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  224 catacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 321  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  322 tatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 348
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  115 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 214  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  215 caattcatgcatacaaacataaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  117 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  217 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||      
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  110 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 209  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  210 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||      
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41670
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatc 41670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 349
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41997
Alignment:
Q  309 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctta 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  15 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  114 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 213  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  214 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaa 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13769
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  111 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 210  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| |  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13606 caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13704  T
Q  211 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13705 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13856
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  111 taacaac 117  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  111 taacaac 117  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13325
Alignment:
Q  107 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 206  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  207 actaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagca 263  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagca 13325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  128 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 227  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  228 caaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
Q  11 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  182 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  13 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 67  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80225
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 80225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56106
Alignment:
Q  179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatttagcaacaat 268  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  56195 aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 259
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  177 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193396
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6443
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 878
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9882
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13285
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57392
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55936
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108075
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 346
Alignment:
Q  316 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatc 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 349
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18058
Alignment:
Q  306 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162072
Alignment:
Q  316 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 162072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166158
Alignment:
Q  316 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 166158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5771
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 5771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5977
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatc 5977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31174
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatc 31174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  179 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 225  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45370
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 45370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1738
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 1738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Original strand, 94 - 131
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaattt 259  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6298
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 6298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19844
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 19844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24148
Alignment:
Q  318 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 24148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 8011 - 8051
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8011 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17209
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5476
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4346
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17304
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5581
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34308
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 258
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3565
Alignment:
Q  218 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacgaatt 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3525 ttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University